src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_ScotchGraph.cxx

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  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
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  12 //
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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MEDPARTITIONER_Graph.hxx"
  21 #include "MEDPARTITIONER_ScotchGraph.hxx"
  22 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  23
  24 #include <cstdio>
  25
  26 #ifdef MED_ENABLE_SCOTCH
  27 extern "C"
  28 {
  29 #define restrict
  30 #include "scotch.h"
  31 }
  32 #endif
  33
  34 using namespace MEDPARTITIONER;
  35
  36 SCOTCHGraph::SCOTCHGraph():Graph()
  37 {
  38 }
  39
  40 SCOTCHGraph::SCOTCHGraph(MEDPARTITIONER::SkyLineArray* graph, int* edgeweight):Graph(graph,edgeweight)
  41 {
  42 }
  43
  44 SCOTCHGraph::~SCOTCHGraph()
  45 {
  46 }
  47
  48 void SCOTCHGraph::partGraph(int ndomain, const std::string& options_string, ParaDomainSelector* sel)
  49 {
  50   if (MyGlobals::_Verbose>10)
  51     std::cout << "proc " << MyGlobals::_Rank << " : SCOTCHGraph::partGraph" << std::endl;
  52
  53   //number of graph vertices
  54   int n = _graph->getNumberOf();
  55   //graph
  56   int * xadj=const_cast<int*>(_graph->getIndex());
  57   int * adjncy=const_cast<int*>(_graph->getValue());
  58   //ndomain
  59   int nparts=ndomain;
  60
  61 #if !defined(MED_ENABLE_SCOTCH)
  62   throw INTERP_KERNEL::Exception("SCOTCHGraph::partGraph : SCOTCH is not available. Check your products, please.");
  63 #else
  64   //output parameters
  65   int* partition = new int[n+1];
  66
  67   SCOTCH_Graph scotch_graph;
  68   SCOTCH_graphInit(&scotch_graph);
  69   SCOTCH_graphBuild(&scotch_graph,
  70                     0, //base first indice 0
  71                     n, //nb of graph nodes
  72                     xadj,
  73                     0,
  74                     _cell_weight, //graph vertices loads
  75                     0,
  76                     xadj[n], //number of edges
  77                     adjncy,
  78                     _edge_weight);
  79   SCOTCH_Strat scotch_strategy;
  80   SCOTCH_stratInit(&scotch_strategy);
  81
  82   //!user-defined options for the strategy
  83   if (options_string!="")
  84     SCOTCH_stratGraphMap(&scotch_strategy,options_string.c_str());
  85
  86   if (nparts>1)
  87     {
  88       if (MyGlobals::_Verbose>10) std::cout << "SCOTCHGraph::graphPart SCOTCH_graphPart" << std::endl;
  89       SCOTCH_graphPart(&scotch_graph,nparts,&scotch_strategy,partition);
  90     }
  91   else  //partition for 1 subdomain
  92     {
  93     for (int i=0; i<n+1; i++)
  94       partition[i]=0;
  95     }
  96
  97   SCOTCH_stratExit(&scotch_strategy);
  98   SCOTCH_graphExit(&scotch_graph);
  99
 100   std::vector<int> index(n+1);
 101   std::vector<int> value(n);
 102   index[0]=0;
 103   for (int i=0; i<n; i++)
 104     {
 105       index[i+1]=index[i]+1;
 106       value[i]=partition[i];
 107     }
 108   delete [] partition;
 109
 110   //creating a skylinearray with no copy of the index and partition array
 111   //the fifth argument true specifies that only the pointers are passed
 112   //to the object
 113   _partition = new MEDPARTITIONER::SkyLineArray(index,value);
 114 #endif
 115 }