src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_MetisGraph.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2016  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "MEDPARTITIONER_MetisGraph.hxx"
  21 #include "MEDPARTITIONER_ParaDomainSelector.hxx"
  22 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  23
  24 #include "MEDCouplingSkyLineArray.hxx"
  25 #include "InterpKernelException.hxx"
  26
  27 #include <iostream>
  28
  29 extern "C"
  30 {
  31 #include "MEDPARTITIONER_metis.h"
  32 }
  33
  34 using namespace MEDPARTITIONER;
  35
  36 METISGraph::METISGraph():Graph()
  37 {
  38 }
  39
  40 METISGraph::METISGraph(MEDCoupling::MEDCouplingSkyLineArray* graph, int* edgeweight)
  41   :Graph(graph,edgeweight)
  42 {
  43 }
  44
  45 METISGraph::~METISGraph()
  46 {
  47 }
  48
  49 void METISGraph::partGraph(int ndomain,
  50                            const std::string& options_string,
  51                            ParaDomainSelector *parallelizer)
  52 {
  53   using std::vector;
  54   if (MyGlobals::_Verbose>10)
  55     std::cout << "proc " << MyGlobals::_Rank << " : METISGraph::partGraph" << std::endl;
  56
  57   //number of graph vertices
  58   int n=_graph->getNumberOf();
  59   //graph
  60   int * xadj=const_cast<int*>(_graph->getIndex());
  61   int * adjncy=const_cast<int*>(_graph->getValues());
  62   //constraints
  63   int * vwgt=_cell_weight;
  64   int * adjwgt=_edge_weight;
  65   int wgtflag=(_edge_weight!=0)?1:0+(_cell_weight!=0)?2:0;
  66   //base 0 or 1
  67   int base=0;
  68   //ndomain
  69   int nparts=ndomain;
  70   //options
  71   /*
  72     (0=default_option,option,random_seed) see defs.h
  73     #define PMV3_OPTION_DBGLVL 1
  74     #define PMV3_OPTION_SEED 2
  75     #define PMV3_OPTION_IPART 3
  76     #define PMV3_OPTION_PSR 3
  77     seems no changes int options[4]={1,0,33,0}; //test for a random seed of 33
  78   */
  79   int options[20]={0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0};
  80 #if !defined(MED_ENABLE_METIS)
  81   throw INTERP_KERNEL::Exception("METISGraph::partGraph : METIS is not available. Check your products, please.");
  82 #else
  83   //output parameters
  84   int edgecut;
  85   int* partition=new int[n];
  86
  87   if(nparts >1)
  88     {
  89       if (MyGlobals::_Verbose>10)
  90         std::cout << "METISGraph::partGraph METIS_PartGraph METIS_PartGraph(RecursiveOrKway)" << std::endl;
  91       if (options_string != "k")
  92         MEDPARTITIONER_METIS_PartGraphRecursive(&n, xadj, adjncy, vwgt, adjwgt, &wgtflag,
  93                                                 &base, &nparts, options, &edgecut, partition);
  94       else
  95         MEDPARTITIONER_METIS_PartGraphKway(&n, xadj, adjncy, vwgt, adjwgt, &wgtflag,
  96                                            &base, &nparts, options, &edgecut, partition);
  97     }
  98   else  //force this case because METIS send all 1 in value
  99     {
 100       for (int i=0; i<n; i++)
 101         partition[i]=0;
 102     }
 103   vector<int> index(n+1);
 104   vector<int> value(n);
 105   index[0]=0;
 106   for (int i=0; i<n; i++)
 107     {
 108       index[i+1]=index[i]+1;
 109       value[i]=partition[i];
 110     }
 111   delete [] partition;
 112
 113   //creating a skylinearray with no copy of the index and partition array
 114   //the fifth argument true specifies that only the pointers are passed
 115   //to the object
 116   _partition = MEDCoupling::MEDCouplingSkyLineArray::New(index,value);
 117 #endif
 118 }
 119