src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_MeshCollection.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2012  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
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  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
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  12 //
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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #ifndef __MEDPARTITIONER_MESHCOLLECTION_HXX__
  21 #define __MEDPARTITIONER_MESHCOLLECTION_HXX__
  22
  23 #include "MEDPARTITIONER.hxx"
  24 #include "MEDPARTITIONER_Graph.hxx"
  25 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  26
  27 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  28
  29 #include <map>
  30 #include <vector>
  31 #include <string>
  32
  33 #include "BBTree.txx"
  34
  35 namespace ParaMEDMEM
  36 {
  37   class MEDCouplingUMesh;
  38   class DataArrayInt;
  39 }
  40
  41 namespace MEDPARTITIONER
  42 {
  43   class Topology;
  44   class MeshCollectionDriver;
  45   class ParaDomainSelector;
  46   class SkyLineArray;
  47   class ConnectZone;
  48   class JointFinder;
  49
  50   typedef enum{MedAscii, MedXml, Undefined} DriverType;
  51   typedef std::multimap<std::pair<int,int>, std::pair<int,int> > NodeMapping ;
  52   typedef std::vector<std::pair<int,int> >  NodeList;
  53
  54   class MEDPARTITIONER_EXPORT MeshCollection
  55   {
  56   public:
  57     MeshCollection();
  58     //Constructing from an existing mesh and a new topology
  59     MeshCollection(MeshCollection&, Topology*, bool family_splitting=false, bool create_empty_groups=false);
  60     //Constructing the mesh collection from a file
  61     MeshCollection(const std::string& filename);
  62     //Constructing the mesh collection from a file
  63     MeshCollection(const std::string& filename, ParaDomainSelector& domainSelector);
  64     //Constructing the mesh collection from a file
  65     MeshCollection(const std::string& filename, const std::string& meshname);
  66     ~MeshCollection();
  67     bool isParallelMode() const { return _domain_selector; }
  68
  69     //writing to a distributed file
  70     void write(const std::string& filename);
  71
  72     //getting the driver
  73     MeshCollectionDriver *retrieveDriver();
  74     MeshCollectionDriver *getDriver() const;
  75     void setDriverType(MEDPARTITIONER::DriverType type) { _driver_type=type; }
  76
  77     //creation of the cell graph
  78     void buildCellGraph(MEDPARTITIONER::SkyLineArray* & array,int *& edgeweights );
  79     //creation and partition of the associated graph
  80     Topology* createPartition(int nbdomain, Graph::splitter_type type = Graph::METIS,
  81                               const std::string& ="", int* edgeweights=0, int* verticesweights=0);
  82
  83     //creation of a user specified partition
  84     Topology* createPartition(const int* partition);
  85
  86     //getting mesh dimension
  87     int getMeshDimension() const;
  88     int getNbOfLocalMeshes() const;
  89     int getNbOfGlobalMeshes() const { return _mesh.size(); }
  90     int getNbOfLocalCells() const;
  91     int getNbOfLocalFaces() const;
  92
  93     //getting a reference to mesh vector
  94     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& getMesh();
  95     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& getFaceMesh();
  96     std::vector<std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> >& getGroupMeshes();
  97
  98     ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* getMesh(int idomain) const;
  99     ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* getFaceMesh(int idomain);
 100     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& getGroupMeshes(int idomain);
 101
 102     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& getCellFamilyIds() { return _cell_family_ids; }
 103     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& getFaceFamilyIds() { return _face_family_ids; }
 104
 105     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& getMapDataArrayInt() { return _map_dataarray_int; }
 106     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayDouble*>& getMapDataArrayDouble() { return _map_dataarray_double; }
 107
 108     std::map<std::string,int>& getFamilyInfo() { return _family_info; }
 109     std::map<std::string, std::vector<std::string> >& getGroupInfo() { return _group_info; }
 110
 111     ParaMEDMEM::DataArrayDouble* getField(std::string descriptionField, int iold);
 112     std::vector<std::string>&  getFieldDescriptions() { return _field_descriptions; }
 113     void prepareFieldDescriptions();
 114     void filterFaceOnCell();
 115
 116     //getting a reference to connect zones vector
 117     std::vector<MEDPARTITIONER::ConnectZone*>& getCZ();
 118
 119     //getting a pointer to topology
 120     Topology* getTopology() const ;
 121     ParaDomainSelector* getParaDomainSelector() const { return _domain_selector; }
 122     //setting a new topology
 123     void setTopology(Topology* topology);
 124
 125     //getting/setting the name of the global mesh (as opposed
 126     //to the name of a subdomain \a nn, which is name_nn)
 127     std::string getName() const { return _name; }
 128     void setName(const std::string& name) { _name=name; }
 129     void setDomainNames(const std::string& name);
 130
 131     //getting/setting the description of the global mesh
 132     std::string getDescription() const { return _description; }
 133     void setDescription(const std::string& name) { _description=name; }
 134
 135     //creates the node mapping between an old collection and the present one
 136     void createNodeMapping(MeshCollection& initialCollection,
 137                            std::multimap<std::pair<int,int>,std::pair<int,int> >& nodeMapping);
 138
 139     void castCellMeshes(MeshCollection& initialCollection,
 140                         std::vector<std::vector<std::vector<int> > >& new2oldIds);
 141
 142     //creates faces on the new collection
 143     void castFaceMeshes(MeshCollection& initialCollection,
 144                         const std::multimap<std::pair<int,int>, std::pair<int,int> >& nodeMapping,
 145                         std::vector<std::vector<std::vector<int> > >& new2oldIds);
 146
 147     //constructing connect zones
 148     void buildConnectZones();
 149
 150   private:
 151     void castIntField(std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& meshesCastFrom,
 152                        std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& meshesCastTo,
 153                        std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& arrayFrom,
 154                        std::string nameArrayTo);
 155
 156     void castAllFields(MeshCollection& initialCollection,
 157                        std::string nameArrayTo);
 158
 159     void findCommonDistantNodes(std::vector<std::vector<std::multimap<int,int> > >& commonDistantNodes);
 160
 161
 162     void remapIntField(int inew, int iold,
 163                        const ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh& sourceMesh,
 164                        const ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh& targetMesh,
 165                        const int* fromArray,
 166                        std::string nameArrayTo,
 167                        const BBTreeOfDim* tree);
 168
 169     void remapDoubleField(int inew, int iold,
 170                            ParaMEDMEM::DataArrayDouble* fromArray,
 171                            std::string nameArrayTo,
 172                            std::string descriptionField);
 173
 174     void createJointGroup( const std::vector< int >& faces,
 175                            const int                 inew1,
 176                            const int                 inew2,
 177                            const bool                is2nd );
 178   private:
 179
 180     //link to mesh_collection topology
 181     Topology* _topology;
 182
 183     //control over topology
 184     bool _owns_topology;
 185
 186     //Driver for read/write operations
 187     MeshCollectionDriver* _driver;
 188
 189     //Parallelizer - mark of parallel execution mode
 190     ParaDomainSelector* _domain_selector;
 191
 192     //links to meshes
 193     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> _mesh;
 194     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> _face_mesh;
 195
 196     //index of a non empty mesh within _mesh (in parallel mode all of meshes can be empty)
 197     int _i_non_empty_mesh;
 198
 199     //links to connectzones
 200     std::vector<MEDPARTITIONER::ConnectZone*> _connect_zones;
 201
 202     //family ids storages
 203     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*> _cell_family_ids;
 204     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*> _face_family_ids;
 205
 206     //DataArrayInt* storages
 207     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayInt*> _map_dataarray_int;
 208     //DataArrayDouble* storages
 209     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayDouble*> _map_dataarray_double;
 210
 211     //fields to be partitioned
 212     std::vector<std::string> _field_descriptions;
 213
 214     //group family conversion
 215     std::map<std::string, int> _family_info;
 216     std::map<std::string, std::vector<std::string> > _group_info;
 217
 218     //list of groups that are not to be splitted
 219     std::vector<std::string> _indivisible_regions;
 220
 221     //name of global mesh
 222     std::string _name;
 223
 224     //description of global mesh
 225     std::string _description;
 226
 227     //specifies the driver associated to the collection
 228     DriverType _driver_type;
 229
 230     //flag specifying that the splitter should create boundary constituent entity
 231     //so that they are written in joints
 232     bool _subdomain_boundary_creates;
 233
 234     //flag specifying that families must be preserved by the splitting
 235     bool _family_splitting;
 236
 237     //flag specifying that groups must be created on all domains, even if they are empty
 238     bool _create_empty_groups;
 239
 240     JointFinder* _joint_finder;
 241   };
 242 }
 243 #endif