src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_MeshCollection.hxx

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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #ifndef __MEDPARTITIONER_MESHCOLLECTION_HXX__
  21 #define __MEDPARTITIONER_MESHCOLLECTION_HXX__
  22
  23 #include "MEDPARTITIONER.hxx"
  24 #include "MEDPARTITIONER_Graph.hxx"
  25 #include "MEDPARTITIONER_Utils.hxx"
  26
  27 #include <map>
  28 #include <vector>
  29 #include <string>
  30
  31 #include "BBTree.txx"
  32
  33 namespace MEDCoupling
  34 {
  35   class MEDCouplingUMesh;
  36   class DataArrayInt;
  37   class MEDCouplingSkyLineArray;
  38 }
  39
  40 namespace MEDPARTITIONER
  41 {
  42   class Topology;
  43   class MeshCollectionDriver;
  44   class ParaDomainSelector;
  45   class ConnectZone;
  46   class JointFinder;
  47
  48   typedef enum{MedAscii, MedXml, Undefined} DriverType;
  49   typedef std::multimap<std::pair<int,int>, std::pair<int,int> > NodeMapping ;
  50   typedef std::vector<std::pair<int,int> >  NodeList;
  51
  52   class MEDPARTITIONER_EXPORT MeshCollection
  53   {
  54   public:
  55     MeshCollection();
  56     //Constructing from an existing mesh and a new topology
  57     MeshCollection(MeshCollection&, Topology*, bool family_splitting=false, bool create_empty_groups=false);
  58     //Constructing the mesh collection from a file
  59     MeshCollection(const std::string& filename);
  60     //Constructing the mesh collection from a file
  61     MeshCollection(const std::string& filename, ParaDomainSelector& domainSelector);
  62     //Constructing the mesh collection from a file
  63     MeshCollection(const std::string& filename, const std::string& meshname);
  64     ~MeshCollection();
  65     bool isParallelMode() const { return _domain_selector; }
  66
  67     //writing to a distributed file
  68     void write(const std::string& filename);
  69
  70     //getting the driver
  71     MeshCollectionDriver *retrieveDriver();
  72     MeshCollectionDriver *getDriver() const;
  73     void setDriverType(MEDPARTITIONER::DriverType type) { _driver_type=type; }
  74
  75     //creation of the cell graph
  76     void buildCellGraph(MEDCoupling::MEDCouplingSkyLineArray* & array,int *& edgeweights );
  77    //creation of the cell graph
  78     void buildParallelCellGraph(MEDCoupling::MEDCouplingSkyLineArray* & array,int *& edgeweights );
  79
  80     //creation and partition of the associated graph
  81     Topology* createPartition(int nbdomain, Graph::splitter_type type = Graph::METIS,
  82                               const std::string& ="", int* edgeweights=0, int* verticesweights=0);
  83
  84     //creation of a user specified partition
  85     Topology* createPartition(const int* partition);
  86
  87     //getting mesh dimension
  88     int getMeshDimension() const;
  89     int getNbOfLocalMeshes() const;
  90     int getNbOfGlobalMeshes() const { return _mesh.size(); }
  91     int getNbOfLocalCells() const;
  92     int getNbOfLocalFaces() const;
  93
  94     //getting a reference to mesh vector
  95     std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>& getMesh();
  96     std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>& getFaceMesh();
  97     std::vector<std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*> >& getGroupMeshes();
  98
  99     MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* getMesh(int idomain) const;
 100     MEDCoupling::MEDCouplingUMesh* getFaceMesh(int idomain);
 101     std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>& getGroupMeshes(int idomain);
 102
 103     std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*>& getCellFamilyIds() { return _cell_family_ids; }
 104     std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*>& getFaceFamilyIds() { return _face_family_ids; }
 105
 106     std::map<std::string, MEDCoupling::DataArrayInt*>& getMapDataArrayInt() { return _map_dataarray_int; }
 107     std::map<std::string, MEDCoupling::DataArrayDouble*>& getMapDataArrayDouble() { return _map_dataarray_double; }
 108
 109     std::map<std::string,int>& getFamilyInfo() { return _family_info; }
 110     std::map<std::string, std::vector<std::string> >& getGroupInfo() { return _group_info; }
 111
 112     MEDCoupling::DataArrayDouble* getField(std::string descriptionField, int iold);
 113     std::vector<std::string>&  getFieldDescriptions() { return _field_descriptions; }
 114     void prepareFieldDescriptions();
 115     void filterFaceOnCell();
 116
 117     //getting a reference to connect zones vector
 118     std::vector<MEDPARTITIONER::ConnectZone*>& getCZ();
 119
 120     //getting a pointer to topology
 121     Topology* getTopology() const ;
 122     ParaDomainSelector* getParaDomainSelector() const { return _domain_selector; }
 123     void setParaDomainSelector(ParaDomainSelector* pds) { _domain_selector = pds; }
 124     //setting a new topology
 125     void setTopology(Topology* topology, bool takeOwneship);
 126
 127     //getting/setting the name of the global mesh (as opposed
 128     //to the name of a subdomain \a nn, which is name_nn)
 129     std::string getName() const { return _name; }
 130     void setName(const std::string& name) { _name=name; }
 131     void setDomainNames(const std::string& name);
 132
 133     void setNonEmptyMesh(int number) { _i_non_empty_mesh=number;}
 134
 135     //getting/setting the description of the global mesh
 136     std::string getDescription() const { return _description; }
 137     void setDescription(const std::string& name) { _description=name; }
 138
 139     //creates the node mapping between an old collection and the present one
 140     void createNodeMapping(MeshCollection& initialCollection,
 141                            std::multimap<std::pair<int,int>,std::pair<int,int> >& nodeMapping);
 142
 143     void castCellMeshes(MeshCollection& initialCollection,
 144                         std::vector<std::vector<std::vector<int> > >& new2oldIds,
 145                         std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*> & o2nRenumber);
 146
 147     //creates faces on the new collection
 148     void castFaceMeshes(MeshCollection& initialCollection,
 149                         const std::multimap<std::pair<int,int>, std::pair<int,int> >& nodeMapping,
 150                         std::vector<std::vector<std::vector<int> > >& new2oldIds);
 151
 152     //constructing connect zones
 153     void buildConnectZones( const NodeMapping& nodeMapping,
 154                             const std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*> & o2nRenumber,
 155                             int nbInitialDomains );
 156
 157     // Find faces common with neighbor domains and put them in groups
 158     void buildBoundaryFaces();
 159
 160   private:
 161     void castIntField(std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>& meshesCastFrom,
 162                        std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*>& meshesCastTo,
 163                        std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*>& arrayFrom,
 164                        std::string nameArrayTo);
 165
 166     void castAllFields(MeshCollection& initialCollection,
 167                        std::string nameArrayTo);
 168
 169     void findCommonDistantNodes(std::vector<std::vector<std::multimap<int,int> > >& commonDistantNodes);
 170
 171
 172     void remapIntField(int inew, int iold,
 173                        const MEDCoupling::MEDCouplingUMesh& sourceMesh,
 174                        const MEDCoupling::MEDCouplingUMesh& targetMesh,
 175                        const int* fromArray,
 176                        std::string nameArrayTo,
 177                        const BBTreeOfDim* tree);
 178
 179     void remapDoubleField(int inew, int iold,
 180                            MEDCoupling::DataArrayDouble* fromArray,
 181                            std::string nameArrayTo,
 182                            std::string descriptionField);
 183
 184     void createJointGroup( const std::vector< int >& faces,
 185                            const int                 inew1,
 186                            const int                 inew2,
 187                            const bool                is2nd );
 188   private:
 189
 190     //link to mesh_collection topology
 191     Topology* _topology;
 192
 193     //control over topology
 194     bool _owns_topology;
 195
 196     //Driver for read/write operations
 197     MeshCollectionDriver* _driver;
 198
 199     //Parallelizer - mark of parallel execution mode
 200     ParaDomainSelector* _domain_selector;
 201
 202     //links to meshes
 203     std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*> _mesh;
 204     std::vector<MEDCoupling::MEDCouplingUMesh*> _face_mesh;
 205
 206     //index of a non empty mesh within _mesh (in parallel mode all of meshes can be empty)
 207     int _i_non_empty_mesh;
 208
 209     //family ids storages
 210     std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*> _cell_family_ids;
 211     std::vector<MEDCoupling::DataArrayInt*> _face_family_ids;
 212
 213     //DataArrayInt* storages
 214     std::map<std::string, MEDCoupling::DataArrayInt*> _map_dataarray_int;
 215     //DataArrayDouble* storages
 216     std::map<std::string, MEDCoupling::DataArrayDouble*> _map_dataarray_double;
 217
 218     //fields to be partitioned
 219     std::vector<std::string> _field_descriptions;
 220
 221     //group family conversion
 222     std::map<std::string, int> _family_info;
 223     std::map<std::string, std::vector<std::string> > _group_info;
 224
 225     //list of groups that are not to be split
 226     std::vector<std::string> _indivisible_regions;
 227
 228     //name of global mesh
 229     std::string _name;
 230
 231     //description of global mesh
 232     std::string _description;
 233
 234     //specifies the driver associated to the collection
 235     DriverType _driver_type;
 236
 237     //flag specifying that the splitter should create boundary constituent entity
 238     //so that they are written in joints
 239     bool _subdomain_boundary_creates;
 240
 241     //flag specifying that families must be preserved by the splitting
 242     bool _family_splitting;
 243
 244     //flag specifying that groups must be created on all domains, even if they are empty
 245     bool _create_empty_groups;
 246
 247     JointFinder* _joint_finder;
 248   };
 249 }
 250 #endif