src/MEDPartitioner/MEDPARTITIONER_MeshCollection.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2012  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
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  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
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  12 //
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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #ifndef __MEDPARTITIONER_MESHCOLLECTION_HXX__
  21 #define __MEDPARTITIONER_MESHCOLLECTION_HXX__
  22
  23 #include "MEDPARTITIONER.hxx"
  24 #include "MEDPARTITIONER_Graph.hxx"
  25
  26 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  27
  28 #include <map>
  29 #include <vector>
  30 #include <string>
  31
  32 #include "BBTree.txx"
  33
  34 namespace ParaMEDMEM
  35 {
  36   class MEDCouplingUMesh;
  37   class DataArrayInt;
  38 }
  39
  40 namespace MEDPARTITIONER
  41 {
  42   class Topology;
  43   class MeshCollectionDriver;
  44   class ParaDomainSelector;
  45   class SkyLineArray;
  46   class ConnectZone;
  47   class JointFinder;
  48
  49   typedef enum{MedAscii, MedXml, Undefined} DriverType;
  50   typedef std::multimap<std::pair<int,int>, std::pair<int,int> > NodeMapping ;
  51   typedef std::vector<std::pair<int,int> >  NodeList;
  52
  53   class MEDPARTITIONER_EXPORT MeshCollection
  54   {
  55   public:
  56     MeshCollection();
  57     //Constructing from an existing mesh and a new topology
  58     MeshCollection(MeshCollection&, Topology*, bool family_splitting=false, bool create_empty_groups=false);
  59     //Constructing the mesh collection from a file
  60     MeshCollection(const std::string& filename);
  61     //Constructing the mesh collection from a file
  62     MeshCollection(const std::string& filename, ParaDomainSelector& domainSelector);
  63     //Constructing the mesh collection from a file
  64     MeshCollection(const std::string& filename, const std::string& meshname);
  65     ~MeshCollection();
  66     bool isParallelMode() const { return _domain_selector; }
  67
  68     //writing to a distributed file
  69     void write(const std::string& filename);
  70
  71     //getting the driver
  72     MeshCollectionDriver *retrieveDriver();
  73     MeshCollectionDriver *getDriver() const;
  74     void setDriverType(MEDPARTITIONER::DriverType type) { _driver_type=type; }
  75
  76     //creation of the cell graph
  77     void buildCellGraph(MEDPARTITIONER::SkyLineArray* & array,int *& edgeweights );
  78     //creation and partition of the associated graph
  79     Topology* createPartition(int nbdomain, Graph::splitter_type type = Graph::METIS,
  80                               const std::string& ="", int* edgeweights=0, int* verticesweights=0);
  81
  82     //creation of a user specified partition
  83     Topology* createPartition(const int* partition);
  84
  85     //getting mesh dimension
  86     int getMeshDimension() const;
  87     int getNbOfLocalMeshes() const;
  88     int getNbOfGlobalMeshes() const { return _mesh.size(); }
  89     int getNbOfLocalCells() const;
  90     int getNbOfLocalFaces() const;
  91
  92     //getting a reference to mesh vector
  93     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& getMesh();
  94     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& getFaceMesh();
  95     std::vector<std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> >& getGroupMeshes();
  96
  97     ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* getMesh(int idomain) const;
  98     ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh* getFaceMesh(int idomain);
  99     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& getGroupMeshes(int idomain);
 100
 101     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& getCellFamilyIds() { return _cell_family_ids; }
 102     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& getFaceFamilyIds() { return _face_family_ids; }
 103
 104     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& getMapDataArrayInt() { return _map_dataarray_int; }
 105     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayDouble*>& getMapDataArrayDouble() { return _map_dataarray_double; }
 106
 107     std::map<std::string,int>& getFamilyInfo() { return _family_info; }
 108     std::map<std::string, std::vector<std::string> >& getGroupInfo() { return _group_info; }
 109
 110     ParaMEDMEM::DataArrayDouble* getField(std::string descriptionField, int iold);
 111     std::vector<std::string>&  getFieldDescriptions() { return _field_descriptions; }
 112     void prepareFieldDescriptions();
 113     void filterFaceOnCell();
 114
 115     //getting a reference to connect zones vector
 116     std::vector<MEDPARTITIONER::ConnectZone*>& getCZ();
 117
 118     //getting a pointer to topology
 119     Topology* getTopology() const ;
 120     ParaDomainSelector* getParaDomainSelector() const { return _domain_selector; }
 121     //setting a new topology
 122     void setTopology(Topology* topology);
 123
 124     //getting/setting the name of the global mesh (as opposed
 125     //to the name of a subdomain \a nn, which is name_nn)
 126     std::string getName() const { return _name; }
 127     void setName(const std::string& name) { _name=name; }
 128     void setDomainNames(const std::string& name);
 129
 130     //getting/setting the description of the global mesh
 131     std::string getDescription() const { return _description; }
 132     void setDescription(const std::string& name) { _description=name; }
 133
 134     //creates the node mapping between an old collection and the present one
 135     void createNodeMapping(MeshCollection& initialCollection,
 136                            std::multimap<std::pair<int,int>,std::pair<int,int> >& nodeMapping);
 137
 138     void castCellMeshes(MeshCollection& initialCollection,
 139                         std::vector<std::vector<std::vector<int> > >& new2oldIds);
 140
 141     //creates faces on the new collection
 142     void castFaceMeshes(MeshCollection& initialCollection,
 143                         const std::multimap<std::pair<int,int>, std::pair<int,int> >& nodeMapping,
 144                         std::vector<std::vector<std::vector<int> > >& new2oldIds);
 145
 146   private:
 147     void castIntField(std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& meshesCastFrom,
 148                        std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>& meshesCastTo,
 149                        std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*>& arrayFrom,
 150                        std::string nameArrayTo);
 151
 152     void castAllFields(MeshCollection& initialCollection,
 153                        std::string nameArrayTo);
 154
 155     void findCommonDistantNodes(std::vector<std::vector<std::multimap<int,int> > >& commonDistantNodes);
 156
 157
 158     void remapIntField(int inew, int iold,
 159                         const ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh& sourceMesh,
 160                         const ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh& targetMesh,
 161                         const int* fromArray,
 162                         std::string nameArrayTo,
 163                        const BBTree<3,int>* tree);
 164
 165     void remapDoubleField(int inew, int iold,
 166                            ParaMEDMEM::DataArrayDouble* fromArray,
 167                            std::string nameArrayTo,
 168                            std::string descriptionField);
 169   private:
 170
 171     //link to mesh_collection topology
 172     Topology* _topology;
 173
 174     //control over topology
 175     bool _owns_topology;
 176
 177     //Driver for read/write operations
 178     MeshCollectionDriver* _driver;
 179
 180     //Parallelizer - mark of parallel execution mode
 181     ParaDomainSelector* _domain_selector;
 182
 183     //links to meshes
 184     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> _mesh;
 185     std::vector<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*> _face_mesh;
 186
 187     //index of a non empty mesh within _mesh (in parallel mode all of meshes can be empty)
 188     int _i_non_empty_mesh;
 189
 190     //links to connectzones
 191     std::vector<MEDPARTITIONER::ConnectZone*> _connect_zones;
 192
 193     //family ids storages
 194     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*> _cell_family_ids;
 195     std::vector<ParaMEDMEM::DataArrayInt*> _face_family_ids;
 196
 197     //DataArrayInt* storages
 198     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayInt*> _map_dataarray_int;
 199     //DataArrayDouble* storages
 200     std::map<std::string, ParaMEDMEM::DataArrayDouble*> _map_dataarray_double;
 201
 202     //fields to be partitioned
 203     std::vector<std::string> _field_descriptions;
 204
 205     //group family conversion
 206     std::map<std::string, int> _family_info;
 207     std::map<std::string, std::vector<std::string> > _group_info;
 208
 209     //list of groups that are not to be splitted
 210     std::vector<std::string> _indivisible_regions;
 211
 212     //name of global mesh
 213     std::string _name;
 214
 215     //description of global mesh
 216     std::string _description;
 217
 218     //specifies the driver associated to the collection
 219     DriverType _driver_type;
 220
 221     //flag specifying that the splitter should create boundary constituent entity
 222     //so that they are written in joints
 223     bool _subdomain_boundary_creates;
 224
 225     //flag specifying that families must be preserved by the splitting
 226     bool _family_splitting;
 227
 228     //flag specifying that groups must be created on all domains, even if they are empty
 229     bool _create_empty_groups;
 230
 231     JointFinder* _joint_finder;
 232   };
 233 }
 234 #endif