src/MEDMEM/MEDMEM_GibiMeshDriver.cxx

   1 using namespace std;
   2
   3 #include <algorithm>
   4
   5 #include "MEDMEM_GibiMeshDriver.hxx"
   6
   7 #include "MEDMEM_DriversDef.hxx"
   8
   9 #include "MEDMEM_Family.hxx"
  10 #include "MEDMEM_Group.hxx"
  11 #include "MEDMEM_Coordinate.hxx"
  12 #include "MEDMEM_Connectivity.hxx"
  13 #include "MEDMEM_Mesh.hxx"
  14 #include "MEDMEM_CellModel.hxx"
  15 #include "MEDMEM_define.hxx"
  16 #include "MEDMEM_DriverTools.hxx"
  17
  18 /////
  19 using namespace MED_EN;
  20 /////
  21
  22
  23 /////
  24 const size_t GIBI_MESH_DRIVER::nb_geometrie_gibi;
  25 const medGeometryElement GIBI_MESH_DRIVER::geomGIBItoMED[nb_geometrie_gibi];
  26 /////
  27
  28 // Every memory allocation made in the MedDriver members function are desallocated in the Mesh destructor
  29
  30 GIBI_MESH_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER():
  31   GENDRIVER(),
  32   _ptrMesh(( MESH *)MED_NULL),
  33   // A VOIR _medIdt(MED_INVALID),
  34   _meshName("")
  35 {
  36 }
  37
  38 GIBI_MESH_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER(const string & fileName,
  39                                    MESH * ptrMesh,
  40                                    MED_EN::med_mode_acces accessMode):
  41   GENDRIVER(fileName,accessMode),
  42   _ptrMesh(ptrMesh)
  43   // A VOIR _medIdt(MED_INVALID),
  44 {
  45   _meshName=fileName.substr(0,fileName.rfind("."));
  46 }
  47
  48 GIBI_MESH_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER(const GIBI_MESH_DRIVER & driver):
  49   GENDRIVER(driver),
  50   _ptrMesh(driver._ptrMesh),
  51   // A VOIR _medIdt(MED_INVALID),
  52   _meshName(driver._meshName)
  53 {
  54 }
  55
  56 GIBI_MESH_DRIVER::~GIBI_MESH_DRIVER()
  57 {
  58 }
  59
  60 void GIBI_MESH_DRIVER::open()
  61   throw (MEDEXCEPTION)
  62 {
  63     const char * LOC = "GIBI_MESH_DRIVER::open()" ;
  64     BEGIN_OF(LOC);
  65
  66     _gibi.open(_fileName.c_str(), ios::in);
  67     if(_gibi)
  68         _status = MED_OPENED;
  69     else
  70     {
  71         _status = MED_CLOSED;
  72         throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC)<<" Could not open file "<<_fileName<<" in mode ios::in"));
  73     }
  74   END_OF(LOC);
  75 }
  76
  77 void GIBI_MESH_DRIVER::close()
  78   throw (MEDEXCEPTION)
  79 {
  80     const char * LOC = "GIBI_MESH_DRIVER::close() " ;
  81     BEGIN_OF(LOC);
  82     if ( _status == MED_OPENED)
  83     {
  84         _gibi.close();
  85         _status = MED_CLOSED;
  86     }
  87     END_OF(LOC);
  88 }
  89
  90 void    GIBI_MESH_DRIVER::setMeshName(const string & meshName) { _meshName = meshName; };
  91 string  GIBI_MESH_DRIVER::getMeshName() const { return _meshName; };
  92
  93
  94 //---------------------------------- RDONLY PART -------------------------------------------------------------
  95
  96 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(): GIBI_MESH_DRIVER()
  97 {
  98 }
  99
 100 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(const string & fileName,
 101         MESH * ptrMesh):
 102 GIBI_MESH_DRIVER(fileName,ptrMesh,MED_RDONLY)
 103 {
 104     MESSAGE("GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been created");
 105 }
 106
 107     GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(const GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER & driver):
 108 GIBI_MESH_DRIVER(driver)
 109 {
 110 }
 111
 112 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::~GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER()
 113 {
 114     //MESSAGE("GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::~GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER() has been destroyed");
 115 }
 116
 117 GENDRIVER * GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::copy(void) const
 118 {
 119     return new GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(*this);
 120 }
 121
 122 void GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read(void) throw (MEDEXCEPTION)
 123 {
 124     const char * LOC = "GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read() : " ;
 125     BEGIN_OF(LOC);
 126
 127     if (_status!=MED_OPENED)
 128         throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "The _idt of file " << _fileName << " is : "
 129                                                  <<  " (the file is not opened)." )) ;
 130
 131     // LECTURE DES DONNEES DS FICHIER GIBI
 132
 133     _intermediateMED medi; // structure de données intermédiaire pour conversion gibi->med
 134     string buf_ligne; // pour lire une ligne
 135     const char* enregistrement_type="ENREGISTREMENT DE TYPE";
 136     std::vector<int> numero_noeuds; // tableau de travail (indices)
 137
 138
 139     while ( getline(_gibi, buf_ligne) ) // boucle externe de recherche de "ENREGISTREMENT DE TYPE"
 140     {
 141         string::size_type pos = buf_ligne.find(enregistrement_type);
 142         if ( pos==string::npos )
 143             continue; // "ENREGISTREMENT DE TYPE" non trouvé -> on lit la ligne suivante
 144
 145         // lecture du numéro d'enregistrement
 146         int numero_enregistrement;
 147         istringstream buf(buf_ligne.c_str()+strlen(enregistrement_type)+1);
 148         buf >> numero_enregistrement;
 149
 150         enum { ENREG_TYPE_2=2, ENREG_TYPE_4=4}; // énumération des types d'enregistrement traités
 151         int niveau, niveau_erreur;
 152         unsigned space_dimension,nb_reels;
 153         int numero_pile, nb_objets_nommes, nb_objets, nb_indices;
 154         string s1,s2,s3,s4,s5,s6,s7; // temporary strings
 155         int i1; //temporary int
 156         double d1; //temporary double
 157         vector<int> indices_objets_nommes;
 158         vector<string> objets_nommes;
 159
 160         switch (numero_enregistrement)
 161           {
 162           case ENREG_TYPE_4:
 163             MESSAGE(LOC << "---- Traitement enregistrement de type 4");
 164             _gibi >> s1 >> niveau >> s2 >> s3 >> niveau_erreur >> s4 >> space_dimension;
 165             if ( !_gibi || s1!="NIVEAU" || s3!="ERREUR" || s4!="DIMENSION" ) // verification mots -cles
 166               throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
 167                                            << " : syntax error in type 4 record"));
 168             break;
 169
 170           case ENREG_TYPE_2:
 171             {
 172               MESSAGE(LOC << "---- Traitement enregistrement de type 2");
 173               _gibi >> s1 >> s2 >> numero_pile >> s3 >> s4 >> s5 >> nb_objets_nommes >> s6 >> s7 >> nb_objets;
 174               if ( !_gibi || s1!="PILE"   || s2!="NUMERO"       || s3!="NBRE"  // verification mots -cles
 175                    || s4!="OBJETS" || s5!="NOMMES"       || s6!="NBRE"
 176                    || s7!="OBJETS" || nb_objets_nommes<0 || nb_objets<0  )
 177                 {
 178                   throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
 179                                                << " : error in type 2 record"));
 180                 }
 181
 182               // lecture des objets nommés et de leurs indices
 183               objets_nommes.resize(nb_objets_nommes);
 184               indices_objets_nommes.resize(nb_objets_nommes);
 185               for (int i=0; i!=nb_objets_nommes; ++i)
 186                 _gibi >> objets_nommes[i];
 187
 188               for (int i=0; i!=nb_objets_nommes; ++i)
 189                 _gibi >> indices_objets_nommes[i];
 190
 191               // boucle interne : lecture de la pile
 192               enum {PILE_SOUS_MAILLAGE=1, PILE_NOEUDS=32, PILE_COORDONNEES=33};
 193               switch(numero_pile)
 194                 {
 195                 case PILE_SOUS_MAILLAGE:
 196                   {
 197                     medi.groupes.reserve(nb_objets);
 198                     for (int objet=0; objet!=nb_objets; ++objet) // pour chaque groupe
 199                       {
 200                         unsigned type_geom_castem, nb_reference,nb_noeud,nb_elements, nb_sous_maillage;
 201                         _gibi >> type_geom_castem >> nb_sous_maillage >> nb_reference >> nb_noeud >> nb_elements;
 202
 203                         // le cas type_geom_castem=0 correspond aux maillages composites
 204                         if (type_geom_castem<0 || (type_geom_castem>0 && geomGIBItoMED[type_geom_castem-1]==MED_NONE) )
 205                           throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Error while reading file " << _fileName
 206                                                        << "\nCastem geometric type " << type_geom_castem
 207                                                        << " does not have a correspondant MED geometric type!" ));
 208
 209                         // lecture des references (non utilisé pour MED)
 210                         for( unsigned i=0; i!=nb_reference; ++i)
 211                           _gibi >> i1;
 212
 213                         // lecture des couleurs (non utilisé pour MED)
 214                         for( unsigned i=0; i!=nb_elements; ++i)
 215                           _gibi >> i1;
 216
 217                         _groupe groupe;
 218                         // si le groupe se compose de sous-maillages (ie groupe composite)
 219                         if (type_geom_castem==0 && nb_sous_maillage>0)
 220                           {
 221                             // lecture des indices des sous-maillages, stockage.
 222                             // les mailles correspondant a ces sous_maillages seront inserees a la fin du case
 223                             for (unsigned i=0; i!=nb_sous_maillage; ++i)
 224                               {
 225                                 _gibi >> i1;
 226                                 groupe.groupes.push_back(i1);
 227                               }
 228                           }
 229                         else
 230                           {
 231                             pair<set<_maille>::iterator,bool> p;
 232                             pair<map<int,_noeud>::iterator,bool> p_no;
 233                             _noeud no;
 234                             no.coord.reserve(space_dimension);
 235                             no.coord.resize(space_dimension);
 236                             _maille ma(geomGIBItoMED[type_geom_castem-1], nb_noeud);
 237                             ma.sommets.resize(nb_noeud);
 238
 239                             // lecture pour chaque maille des sommets et insertions
 240                             for( unsigned i=0; i!=nb_elements; ++i)
 241                               {
 242                                 for (unsigned n=0; n!=nb_noeud; ++n)
 243                                   {
 244                                     _gibi >> i1;
 245                                     no.number=i1;
 246                                     p_no=medi.points.insert(make_pair(i1, no));
 247                                     ma.sommets[n]=p_no.first;
 248                                   }
 249
 250                                 p=medi.maillage.insert(ma);
 251                                 groupe.mailles.insert(p.first); // on stocke dans le groupe un iterateur sur la maille
 252
 253 //                                  cout << "   " << p.second << ": ";
 254 //                                  for (unsigned n=0; n!=nb_noeud; ++n)
 255 //                                      cout <<  ma.sommets[n]->second.number << " ";
 256 //                                  cout << endl;
 257
 258                               }
 259                           }
 260                         medi.groupes.push_back(groupe);
 261                       }
 262
 263                     for (int i=0; i!=nb_objets_nommes; ++i)
 264                       medi.groupes[indices_objets_nommes[i]-1].nom=objets_nommes[i];
 265
 266                     // scanne les groupes à la recherche de groupes composites
 267                     for( std::vector<_groupe>::iterator i=medi.groupes.begin(); i!=medi.groupes.end(); ++i)
 268                       {
 269                         if( i->groupes.size() ) // le groupe i contient des sous-maillages
 270                           {
 271                             for( std::list<int>::iterator j=i->groupes.begin(); j!=i->groupes.end(); ++j)
 272                               {
 273                                 // pour chacun des sous-maillages j, on recupere les iterateurs *k sur les  maille
 274                                 // contenues et on les insere dans le groupe i
 275                                 std::set< std::set<_maille>::iterator >::const_iterator k=medi.groupes[*j-1].mailles.begin();
 276                                 for( ; k!=medi.groupes[*j-1].mailles.end(); ++k)
 277                                   i->mailles.insert(*k);
 278                               }
 279                             i->groupes.clear(); // après avoir insere leur mailles, on efface les groupes composites
 280                           }
 281                       }
 282
 283                     break;
 284                   }// Fin case PILE_SOUS_MAILLAGE
 285
 286                 case PILE_NOEUDS:
 287                   {
 288                     std::vector<int> place_noeuds;
 289                     _gibi >> nb_indices;
 290                     if (nb_indices != nb_objets)
 291                       {
 292                         throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
 293                                                      << "Erreur de lecture dans enregistrement de type " << ENREG_TYPE_2
 294                                                      << " (pile " << PILE_NOEUDS << ")" ));
 295                       }
 296
 297                     place_noeuds.resize(nb_objets);
 298                     for (unsigned i=0; i!=place_noeuds.size(); ++i)
 299                       _gibi >> place_noeuds[i];
 300                     int max=(* std::max_element(place_noeuds.begin(),place_noeuds.end()));
 301
 302                     // numero_noeuds contient pour chacun des max noeuds qu'on va lire dans le case PILE_COORDONNEES
 303                     // son indice dans la connectivite du maillage. Cet indice correspond egalement a la cle du map
 304                     // medi.points ou l'on stocke les noeuds.
 305                     numero_noeuds.resize(max,-1);
 306                     for (unsigned i=0; i!=place_noeuds.size(); ++i)
 307                       numero_noeuds[place_noeuds[i]-1]=i+1;
 308                     break;
 309                   }
 310
 311                 case PILE_COORDONNEES:
 312                   _gibi >> nb_reels;
 313                   // PROVISOIRE : certains fichier gibi n'ont
 314                   if (nb_reels < numero_noeuds.size()*(space_dimension))
 315                     throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
 316                                                  << "Erreur de lecture dans enregistrement de type " << ENREG_TYPE_2
 317                                                  << " (pile " << PILE_COORDONNEES << ")" ));
 318
 319                   for (unsigned i=0; i!=numero_noeuds.size(); ++i)
 320                     {
 321                       // si le noeud est utilisé dans le maillage, on lit ses coordonnées et on les stocke dans la structure
 322                       if ( (numero_noeuds[i] != -1) && (medi.points.find(numero_noeuds[i])!=medi.points.end()) )
 323                         {
 324                           for (unsigned j=0; j!=space_dimension; ++j)
 325                             _gibi >> medi.points[numero_noeuds[i]].coord[j];
 326                           _gibi >> d1; // on ne conserve pas la densite
 327                         }
 328                       else // sinon, on passe au noeud suivant
 329                         {
 330                           for (unsigned j=0; j!=space_dimension+1; ++j)
 331                             _gibi >> d1;
 332                         }
 333                     }
 334                   break;
 335
 336                 } // Fin switch numero_pile
 337               break;
 338             } // Fin case ENREG_TYPE_2
 339           }
 340
 341     } //  fin de la boucle while de lecture externe
 342
 343     // impression résultats
 344     MESSAGE(LOC << "GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read : RESULTATS STRUCTURE INTERMEDIAIRES : ");
 345     MESSAGE(LOC <<  medi );
 346
 347             // TRANSFORMATION EN STRUCTURES MED
 348     if ( ! _ptrMesh->isEmpty() )
 349     {
 350         throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC)<<"Mesh object not empty : can't fill it!"));
 351     }
 352     else if ( medi.maillage.size()==0 || medi.groupes.size()==0 || medi.points.size()==0)
 353     {
 354         throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Error while reading file " << _fileName
 355                     << " The data read are not completed " ) ) ;
 356     }
 357     else
 358     {
 359         _ptrMesh->_name = _meshName;
 360         _ptrMesh->_spaceDimension = medi.points.begin()->second.coord.size();
 361         _ptrMesh->_meshDimension = medi.maillage.rbegin()->dimension();
 362         _ptrMesh->_numberOfNodes = medi.points.size();
 363         _ptrMesh->_isAGrid = 0;
 364         _ptrMesh->_coordinate = medi.getCoordinate();
 365
 366         //Construction des groupes
 367         vector<GROUP *> groupCell, groupFace, groupEdge, groupNode;
 368         medi.getGroups(groupCell, groupFace, groupEdge, groupNode, _ptrMesh);
 369         _ptrMesh->_groupCell = groupCell;
 370         _ptrMesh->_groupFace = groupFace;
 371         _ptrMesh->_groupEdge = groupEdge;
 372         _ptrMesh->_groupNode = groupNode;
 373
 374         //Affectation derniers attributs objet Mesh
 375         _ptrMesh->_numberOfCellsGroups = _ptrMesh->_groupCell.size();
 376         _ptrMesh->_numberOfFacesGroups = _ptrMesh->_groupFace.size();
 377         _ptrMesh->_numberOfEdgesGroups = _ptrMesh->_groupEdge.size();
 378         _ptrMesh->_numberOfNodesGroups = _ptrMesh->_groupNode.size();
 379
 380         // appele en dernier car cette fonction detruit le maillage intermediaire!
 381         _ptrMesh->_connectivity = medi.getConnectivity();
 382
 383         // calcul de la connectivite d-1 complete, avec renumerotation des groupes
 384         if (_ptrMesh->_spaceDimension==3)
 385             _ptrMesh->_connectivity->updateGroup(_ptrMesh->_groupFace) ;
 386         else if (_ptrMesh->_spaceDimension==2)
 387             _ptrMesh->_connectivity->updateGroup(_ptrMesh->_groupEdge) ;
 388
 389     }
 390
 391
 392
 393     END_OF(LOC);
 394 }
 395
 396 void GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::write( void ) const
 397   throw (MEDEXCEPTION)
 398 {
 399   throw MEDEXCEPTION("GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::write : Can't write with a RDONLY driver !");
 400 }
 401
 402
 403 /*--------------------- WRONLY PART -------------------------------*/
 404
 405 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER():GIBI_MESH_DRIVER()
 406 {
 407 }
 408
 409 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const string & fileName,
 410                                                  MESH * ptrMesh):
 411   GIBI_MESH_DRIVER(fileName,ptrMesh,MED_WRONLY)
 412 {
 413   MESSAGE("GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been created");
 414 }
 415
 416 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER & driver):
 417   GIBI_MESH_DRIVER(driver)
 418 {
 419 }
 420
 421 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::~GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER()
 422 {
 423   //MESSAGE("GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been destroyed");
 424 }
 425
 426 GENDRIVER * GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::copy(void) const
 427 {
 428   return new GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(*this);
 429 }
 430
 431 void GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::read (void)
 432   throw (MEDEXCEPTION)
 433 {
 434   throw MEDEXCEPTION("GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::read : Can't read with a WRONLY driver !");
 435 }
 436
 437 void GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::write(void) const
 438   throw (MEDEXCEPTION)
 439 {
 440   const char * LOC = "void GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::write(void) const : ";
 441   BEGIN_OF(LOC);
 442
 443   throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC)<< "Write Driver isn\'t implemented"));
 444
 445   END_OF(LOC);
 446 }
 447
 448
 449
 450 /*--------------------- RDWR PART -------------------------------*/
 451
 452 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER():GIBI_MESH_DRIVER()
 453 {
 454 }
 455
 456 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const string & fileName,
 457                                            MESH * ptrMesh):
 458   GIBI_MESH_DRIVER(fileName,ptrMesh,MED_RDWR)
 459 {
 460   MESSAGE("GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been created");
 461 }
 462
 463 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const GIBI_MESH_RDWR_DRIVER & driver):
 464   GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER(driver)
 465 {
 466 }
 467
 468 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::~GIBI_MESH_RDWR_DRIVER() {
 469   //MESSAGE("GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been destroyed");
 470 }
 471
 472 GENDRIVER * GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::copy(void) const
 473 {
 474   return new GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(*this);
 475 }
 476
 477 void GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::write(void) const
 478   throw (MEDEXCEPTION)
 479 {
 480   GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::write();
 481 }
 482 void GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::read (void)
 483   throw (MEDEXCEPTION)
 484 {
 485   GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read();
 486 }