5 #include "MEDMEM_GibiMeshDriver.hxx"
7 #include "MEDMEM_DriversDef.hxx"
9 #include "MEDMEM_Family.hxx"
10 #include "MEDMEM_Group.hxx"
11 #include "MEDMEM_Coordinate.hxx"
12 #include "MEDMEM_Connectivity.hxx"
13 #include "MEDMEM_Mesh.hxx"
14 #include "MEDMEM_CellModel.hxx"
15 #include "MEDMEM_define.hxx"
16 #include "MEDMEM_DriverTools.hxx"
19 using namespace MED_EN;
24 const size_t GIBI_MESH_DRIVER::nb_geometrie_gibi;
25 const medGeometryElement GIBI_MESH_DRIVER::geomGIBItoMED[nb_geometrie_gibi];
28 // Every memory allocation made in the MedDriver members function are desallocated in the Mesh destructor
30 GIBI_MESH_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER():
32 _ptrMesh(( MESH *)MED_NULL),
33 // A VOIR _medIdt(MED_INVALID),
38 GIBI_MESH_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER(const string & fileName,
40 MED_EN::med_mode_acces accessMode):
41 GENDRIVER(fileName,accessMode),
43 // A VOIR _medIdt(MED_INVALID),
45 _meshName=fileName.substr(0,fileName.rfind("."));
48 GIBI_MESH_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER(const GIBI_MESH_DRIVER & driver):
50 _ptrMesh(driver._ptrMesh),
51 // A VOIR _medIdt(MED_INVALID),
52 _meshName(driver._meshName)
56 GIBI_MESH_DRIVER::~GIBI_MESH_DRIVER()
60 void GIBI_MESH_DRIVER::open()
63 const char * LOC = "GIBI_MESH_DRIVER::open()" ;
66 _gibi.open(_fileName.c_str(), ios::in);
72 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC)<<" Could not open file "<<_fileName<<" in mode ios::in"));
77 void GIBI_MESH_DRIVER::close()
80 const char * LOC = "GIBI_MESH_DRIVER::close() " ;
82 if ( _status == MED_OPENED)
90 void GIBI_MESH_DRIVER::setMeshName(const string & meshName) { _meshName = meshName; };
91 string GIBI_MESH_DRIVER::getMeshName() const { return _meshName; };
94 //---------------------------------- RDONLY PART -------------------------------------------------------------
96 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(): GIBI_MESH_DRIVER()
100 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(const string & fileName,
102 GIBI_MESH_DRIVER(fileName,ptrMesh,MED_RDONLY)
104 MESSAGE("GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been created");
107 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(const GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER & driver):
108 GIBI_MESH_DRIVER(driver)
112 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::~GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER()
114 //MESSAGE("GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::~GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER() has been destroyed");
117 GENDRIVER * GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::copy(void) const
119 return new GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER(*this);
122 void GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read(void) throw (MEDEXCEPTION)
124 const char * LOC = "GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read() : " ;
127 if (_status!=MED_OPENED)
128 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "The _idt of file " << _fileName << " is : "
129 << " (the file is not opened)." )) ;
131 // LECTURE DES DONNEES DS FICHIER GIBI
133 _intermediateMED medi; // structure de données intermédiaire pour conversion gibi->med
134 string buf_ligne; // pour lire une ligne
135 const char* enregistrement_type="ENREGISTREMENT DE TYPE";
136 std::vector<int> numero_noeuds; // tableau de travail (indices)
139 while ( getline(_gibi, buf_ligne) ) // boucle externe de recherche de "ENREGISTREMENT DE TYPE"
141 string::size_type pos = buf_ligne.find(enregistrement_type);
142 if ( pos==string::npos )
143 continue; // "ENREGISTREMENT DE TYPE" non trouvé -> on lit la ligne suivante
145 // lecture du numéro d'enregistrement
146 int numero_enregistrement;
147 istringstream buf(buf_ligne.c_str()+strlen(enregistrement_type)+1);
148 buf >> numero_enregistrement;
150 enum { ENREG_TYPE_2=2, ENREG_TYPE_4=4}; // énumération des types d'enregistrement traités
151 int niveau, niveau_erreur;
152 unsigned space_dimension,nb_reels;
153 int numero_pile, nb_objets_nommes, nb_objets, nb_indices;
154 string s1,s2,s3,s4,s5,s6,s7; // temporary strings
155 int i1; //temporary int
156 double d1; //temporary double
157 vector<int> indices_objets_nommes;
158 vector<string> objets_nommes;
160 switch (numero_enregistrement)
163 MESSAGE(LOC << "---- Traitement enregistrement de type 4");
164 _gibi >> s1 >> niveau >> s2 >> s3 >> niveau_erreur >> s4 >> space_dimension;
165 if ( !_gibi || s1!="NIVEAU" || s3!="ERREUR" || s4!="DIMENSION" ) // verification mots -cles
166 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
167 << " : syntax error in type 4 record"));
172 MESSAGE(LOC << "---- Traitement enregistrement de type 2");
173 _gibi >> s1 >> s2 >> numero_pile >> s3 >> s4 >> s5 >> nb_objets_nommes >> s6 >> s7 >> nb_objets;
174 if ( !_gibi || s1!="PILE" || s2!="NUMERO" || s3!="NBRE" // verification mots -cles
175 || s4!="OBJETS" || s5!="NOMMES" || s6!="NBRE"
176 || s7!="OBJETS" || nb_objets_nommes<0 || nb_objets<0 )
178 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
179 << " : error in type 2 record"));
182 // lecture des objets nommés et de leurs indices
183 objets_nommes.resize(nb_objets_nommes);
184 indices_objets_nommes.resize(nb_objets_nommes);
185 for (int i=0; i!=nb_objets_nommes; ++i)
186 _gibi >> objets_nommes[i];
188 for (int i=0; i!=nb_objets_nommes; ++i)
189 _gibi >> indices_objets_nommes[i];
191 // boucle interne : lecture de la pile
192 enum {PILE_SOUS_MAILLAGE=1, PILE_NOEUDS=32, PILE_COORDONNEES=33};
195 case PILE_SOUS_MAILLAGE:
197 medi.groupes.reserve(nb_objets);
198 for (int objet=0; objet!=nb_objets; ++objet) // pour chaque groupe
200 unsigned type_geom_castem, nb_reference,nb_noeud,nb_elements, nb_sous_maillage;
201 _gibi >> type_geom_castem >> nb_sous_maillage >> nb_reference >> nb_noeud >> nb_elements;
203 // le cas type_geom_castem=0 correspond aux maillages composites
204 if (type_geom_castem<0 || (type_geom_castem>0 && geomGIBItoMED[type_geom_castem-1]==MED_NONE) )
205 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Error while reading file " << _fileName
206 << "\nCastem geometric type " << type_geom_castem
207 << " does not have a correspondant MED geometric type!" ));
209 // lecture des references (non utilisé pour MED)
210 for( unsigned i=0; i!=nb_reference; ++i)
213 // lecture des couleurs (non utilisé pour MED)
214 for( unsigned i=0; i!=nb_elements; ++i)
218 // si le groupe se compose de sous-maillages (ie groupe composite)
219 if (type_geom_castem==0 && nb_sous_maillage>0)
221 // lecture des indices des sous-maillages, stockage.
222 // les mailles correspondant a ces sous_maillages seront inserees a la fin du case
223 for (unsigned i=0; i!=nb_sous_maillage; ++i)
226 groupe.groupes.push_back(i1);
231 pair<set<_maille>::iterator,bool> p;
232 pair<map<int,_noeud>::iterator,bool> p_no;
234 no.coord.reserve(space_dimension);
235 no.coord.resize(space_dimension);
236 _maille ma(geomGIBItoMED[type_geom_castem-1], nb_noeud);
237 ma.sommets.resize(nb_noeud);
239 // lecture pour chaque maille des sommets et insertions
240 for( unsigned i=0; i!=nb_elements; ++i)
242 for (unsigned n=0; n!=nb_noeud; ++n)
246 p_no=medi.points.insert(make_pair(i1, no));
247 ma.sommets[n]=p_no.first;
250 p=medi.maillage.insert(ma);
251 groupe.mailles.insert(p.first); // on stocke dans le groupe un iterateur sur la maille
253 // cout << " " << p.second << ": ";
254 // for (unsigned n=0; n!=nb_noeud; ++n)
255 // cout << ma.sommets[n]->second.number << " ";
260 medi.groupes.push_back(groupe);
263 for (int i=0; i!=nb_objets_nommes; ++i)
264 medi.groupes[indices_objets_nommes[i]-1].nom=objets_nommes[i];
266 // scanne les groupes à la recherche de groupes composites
267 for( std::vector<_groupe>::iterator i=medi.groupes.begin(); i!=medi.groupes.end(); ++i)
269 if( i->groupes.size() ) // le groupe i contient des sous-maillages
271 for( std::list<int>::iterator j=i->groupes.begin(); j!=i->groupes.end(); ++j)
273 // pour chacun des sous-maillages j, on recupere les iterateurs *k sur les maille
274 // contenues et on les insere dans le groupe i
275 std::set< std::set<_maille>::iterator >::const_iterator k=medi.groupes[*j-1].mailles.begin();
276 for( ; k!=medi.groupes[*j-1].mailles.end(); ++k)
277 i->mailles.insert(*k);
279 i->groupes.clear(); // après avoir insere leur mailles, on efface les groupes composites
284 }// Fin case PILE_SOUS_MAILLAGE
288 std::vector<int> place_noeuds;
290 if (nb_indices != nb_objets)
292 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
293 << "Erreur de lecture dans enregistrement de type " << ENREG_TYPE_2
294 << " (pile " << PILE_NOEUDS << ")" ));
297 place_noeuds.resize(nb_objets);
298 for (unsigned i=0; i!=place_noeuds.size(); ++i)
299 _gibi >> place_noeuds[i];
300 int max=(* std::max_element(place_noeuds.begin(),place_noeuds.end()));
302 // numero_noeuds contient pour chacun des max noeuds qu'on va lire dans le case PILE_COORDONNEES
303 // son indice dans la connectivite du maillage. Cet indice correspond egalement a la cle du map
304 // medi.points ou l'on stocke les noeuds.
305 numero_noeuds.resize(max,-1);
306 for (unsigned i=0; i!=place_noeuds.size(); ++i)
307 numero_noeuds[place_noeuds[i]-1]=i+1;
311 case PILE_COORDONNEES:
313 // PROVISOIRE : certains fichier gibi n'ont
314 if (nb_reels < numero_noeuds.size()*(space_dimension))
315 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Could not read file " << _fileName
316 << "Erreur de lecture dans enregistrement de type " << ENREG_TYPE_2
317 << " (pile " << PILE_COORDONNEES << ")" ));
319 for (unsigned i=0; i!=numero_noeuds.size(); ++i)
321 // si le noeud est utilisé dans le maillage, on lit ses coordonnées et on les stocke dans la structure
322 if ( (numero_noeuds[i] != -1) && (medi.points.find(numero_noeuds[i])!=medi.points.end()) )
324 for (unsigned j=0; j!=space_dimension; ++j)
325 _gibi >> medi.points[numero_noeuds[i]].coord[j];
326 _gibi >> d1; // on ne conserve pas la densite
328 else // sinon, on passe au noeud suivant
330 for (unsigned j=0; j!=space_dimension+1; ++j)
336 } // Fin switch numero_pile
338 } // Fin case ENREG_TYPE_2
341 } // fin de la boucle while de lecture externe
343 // impression résultats
344 MESSAGE(LOC << "GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read : RESULTATS STRUCTURE INTERMEDIAIRES : ");
345 MESSAGE(LOC << medi );
347 // TRANSFORMATION EN STRUCTURES MED
348 if ( ! _ptrMesh->isEmpty() )
350 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC)<<"Mesh object not empty : can't fill it!"));
352 else if ( medi.maillage.size()==0 || medi.groupes.size()==0 || medi.points.size()==0)
354 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << " Error while reading file " << _fileName
355 << " The data read are not completed " ) ) ;
359 _ptrMesh->_name = _meshName;
360 _ptrMesh->_spaceDimension = medi.points.begin()->second.coord.size();
361 _ptrMesh->_meshDimension = medi.maillage.rbegin()->dimension();
362 _ptrMesh->_numberOfNodes = medi.points.size();
363 _ptrMesh->_isAGrid = 0;
364 _ptrMesh->_coordinate = medi.getCoordinate();
366 //Construction des groupes
367 vector<GROUP *> groupCell, groupFace, groupEdge, groupNode;
368 medi.getGroups(groupCell, groupFace, groupEdge, groupNode, _ptrMesh);
369 _ptrMesh->_groupCell = groupCell;
370 _ptrMesh->_groupFace = groupFace;
371 _ptrMesh->_groupEdge = groupEdge;
372 _ptrMesh->_groupNode = groupNode;
374 //Affectation derniers attributs objet Mesh
375 _ptrMesh->_numberOfCellsGroups = _ptrMesh->_groupCell.size();
376 _ptrMesh->_numberOfFacesGroups = _ptrMesh->_groupFace.size();
377 _ptrMesh->_numberOfEdgesGroups = _ptrMesh->_groupEdge.size();
378 _ptrMesh->_numberOfNodesGroups = _ptrMesh->_groupNode.size();
380 // appele en dernier car cette fonction detruit le maillage intermediaire!
381 _ptrMesh->_connectivity = medi.getConnectivity();
383 // calcul de la connectivite d-1 complete, avec renumerotation des groupes
384 if (_ptrMesh->_spaceDimension==3)
385 _ptrMesh->_connectivity->updateGroup(_ptrMesh->_groupFace) ;
386 else if (_ptrMesh->_spaceDimension==2)
387 _ptrMesh->_connectivity->updateGroup(_ptrMesh->_groupEdge) ;
396 void GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::write( void ) const
399 throw MEDEXCEPTION("GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::write : Can't write with a RDONLY driver !");
403 /*--------------------- WRONLY PART -------------------------------*/
405 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER():GIBI_MESH_DRIVER()
409 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const string & fileName,
411 GIBI_MESH_DRIVER(fileName,ptrMesh,MED_WRONLY)
413 MESSAGE("GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been created");
416 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER & driver):
417 GIBI_MESH_DRIVER(driver)
421 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::~GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER()
423 //MESSAGE("GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been destroyed");
426 GENDRIVER * GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::copy(void) const
428 return new GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER(*this);
431 void GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::read (void)
434 throw MEDEXCEPTION("GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::read : Can't read with a WRONLY driver !");
437 void GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::write(void) const
440 const char * LOC = "void GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::write(void) const : ";
443 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC)<< "Write Driver isn\'t implemented"));
450 /*--------------------- RDWR PART -------------------------------*/
452 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER():GIBI_MESH_DRIVER()
456 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const string & fileName,
458 GIBI_MESH_DRIVER(fileName,ptrMesh,MED_RDWR)
460 MESSAGE("GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been created");
463 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const GIBI_MESH_RDWR_DRIVER & driver):
464 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::GIBI_MESH_DRIVER(driver)
468 GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::~GIBI_MESH_RDWR_DRIVER() {
469 //MESSAGE("GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(const string & fileName, MESH * ptrMesh) has been destroyed");
472 GENDRIVER * GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::copy(void) const
474 return new GIBI_MESH_RDWR_DRIVER(*this);
477 void GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::write(void) const
480 GIBI_MESH_WRONLY_DRIVER::write();
482 void GIBI_MESH_RDWR_DRIVER::read (void)
485 GIBI_MESH_RDONLY_DRIVER::read();