2 #include "MEDMEM_DriverTools.hxx"
3 #include "MEDMEM_STRING.hxx"
4 #include "MEDMEM_Exception.hxx"
5 #include "MEDMEM_Mesh.hxx"
6 #include "MEDMEM_Group.hxx"
10 // Cet opérateur permet d'ordonner les mailles dans un set suivant l'ordre requis par MED
11 bool _maille::operator < (const _maille& ma) const
13 // si le type géométrique differe, la comparaison est basée dessus
14 // sinon on se base sur une comparaison des numéros de sommets
15 if(geometricType==ma.geometricType)
17 // construction de deux vecteur temporaire contenant les numeros de sommets
18 // pour faire le tri et les comparaisons
19 size_t l=sommets.size();
20 std::vector<int> v1(l);
21 std::vector<int> v2(l);
22 for (unsigned int i=0; i!=l; ++i)
24 v1[i]=sommets[i]->second.number;
25 v2[i]=ma.sommets[i]->second.number;
27 std::sort(v1.begin(), v1.end());
28 std::sort(v2.begin(), v2.end());
29 for(std::vector<int>::const_iterator i1=v1.begin(), i2=v2.begin(); i1!=v1.end(); ++i1, ++i2)
32 return false; // cas d'égalité
35 return geometricType<ma.geometricType;
39 // retourne l'entité d'une maille en fonction de la dimension du maillage.
40 MED_EN::medEntityMesh _maille::getEntity(const int meshDimension) const throw (MEDEXCEPTION)
42 const char * LOC = "_maille::getEntity(const int meshDimension)" ;
45 int mailleDimension = this->dimension();
47 if (mailleDimension == meshDimension)
50 switch (mailleDimension)
62 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "Impossible de determiner l'entite de la maille."));
69 std::ostream& operator << (std::ostream& os, const _maille& ma)
71 os << "maille " << ma.ordre << " (" << ma.geometricType << ") : < ";
72 std::vector< std::map<int,_noeud>::iterator >::const_iterator i=ma.sommets.begin();
73 os << (*i++)->second.number ;
74 for( ; i!=ma.sommets.end(); ++i)
75 os << ", " << (*i)->second.number;
80 std::ostream& operator << (std::ostream& os, const _groupe& gr)
82 os << "--- Groupe " << gr.nom << " --- " << std::endl ;
83 os << " -> liste des sous-groupes : ";
84 for( std::list<int>::const_iterator i=gr.groupes.begin(); i!=gr.groupes.end(); ++i)
86 os << std::endl << " -> liste des mailles : " << std::endl;
87 for( _groupe::mailleIter i=gr.mailles.begin(); i!=gr.mailles.end(); i++)
88 os << " " << *(*i) << std::endl;
92 std::ostream& operator << (std::ostream& os, const _noeud& no)
94 os << "noeud " << no.number << " : < ";
95 std::vector<double>::const_iterator i=no.coord.begin();
97 for( ; i!=no.coord.end(); ++i)
103 std::ostream& operator << (std::ostream& os, const _intermediateMED& mi)
105 os << "Set des mailles : " << std::endl;
106 for( std::set<_maille>::const_iterator i=mi.maillage.begin(); i!=mi.maillage.end(); ++i)
107 os << *i << std::endl;
109 os << std::endl << "Vector des groupes : " << std::endl;
110 // for( std::vector<_groupe>::const_iterator i=mi.groupes.begin(); i!=mi.groupes.end(); ++i)
111 for (unsigned int i=0; i!=mi.groupes.size(); i++)
112 os << std::setw(3) << i << " " << mi.groupes[i] << std::endl;
114 os << std::endl << "map des noeuds : " << std::endl;
115 for( std::map<int,_noeud>::const_iterator i=mi.points.begin(); i!=mi.points.end(); ++i)
116 os << i->second << std::endl;
120 void _intermediateMED::numerotationMaillage()
122 // numerotation des mailles par entité
124 std::set<_maille>::iterator i=maillage.begin();
125 int dimension=i->dimension();
126 for( ; i!=maillage.end(); ++i)
128 if ( dimension!=i->dimension() ) // on change d'entite
130 dimension=i->dimension();
133 (*i).ordre=++i_maille;
137 void _intermediateMED::numerotationPoints()
139 // Fonction de renumerotation des noeuds (necessaire quand il y a des trous dans la numerotation.
141 for( std::map<int,_noeud>::const_iterator i=points.begin(); i!=points.end(); ++i)
142 i->second.number = ++i_noeud ;
148 * create a MED COORDINATE from the intermediate structure.
152 _intermediateMED::getCoordinate()
154 const medModeSwitch mode=MED_FULL_INTERLACE;
155 const string coordinateSystem="CARTESIAN";
157 int spaceDimension=points.begin()->second.coord.size();
158 int numberOfNodes=points.size();
161 // creation du tableau des coordonnees en mode MED_FULL_INTERLACE
162 double * coord = new double[spaceDimension*numberOfNodes];
164 for( std::map<int,_noeud>::const_iterator i=points.begin(); i!=points.end(); ++i, ++k)
165 std::copy(i->second.coord.begin(), i->second.coord.end(), coord+k*spaceDimension);
167 // creation de l'objet COORDINATE
168 COORDINATE * coordinate = new COORDINATE(spaceDimension, numberOfNodes, mode);
169 coordinate->setCoordinates(mode,coord);
171 coordinate->setCoordinatesSystem(coordinateSystem);
178 * create a MED CONNECTIVITY from the intermediate structure.
179 * for memory optimisation, clear the intermediate structure (the "maillage" set )
183 _intermediateMED::getConnectivity()
185 const char * LOC = "_intermediateMED::getConnectivity() : ";
187 int numberOfNodes=points.size(); // number of nodes in the mesh
189 medEntityMesh entity;
190 medGeometryElement * types=NULL; // pointeurs pour allouer les structures MED
192 int * connectivity=NULL;
193 CONNECTIVITY *Connectivity, *Constituent;
195 medGeometryElement type=0; // variables de travail
200 std::vector<medGeometryElement> vtype; // tableau de travail : stockage des types geometriques pour UNE entite
201 std::vector<int> vcount; // tableau de travail : nombre d'elements pour chaque type geometrique de vtype
203 std::set<_maille>::const_iterator i=maillage.begin(); // iterateurs sur les mailles
204 std::set<_maille>::const_iterator j=maillage.begin();
206 // renumerote les points de 1 a n (pour le cas ou certains points ne sont pas presents dans le maillage d'origine)
207 numerotationPoints();
211 // boucle sur les entites de la structure maillage :
212 // - on parcourt une premiere fois avec i les mailles d'une entite pour récupérer
213 // des infos sur les types geometriques, leur nombre et le nombre d'elements.
214 // - on alloue la connectivite
215 // - on parcourt une deuxieme fois avec j pour lire les noeuds.
218 type=i->geometricType; // init boucle for
219 dimension=i->dimension();
221 vtype.push_back(type);
222 // Boucle sur i de parcours des mailles d'une entite
223 // Une entite se termine lorsqu'on atteint la fin de maillage ou lorsque la dimension des mailles change
224 for( ; i!=maillage.end() && dimension==i->dimension() ; ++i)
226 if (type != i->geometricType) // si changement de type geometrique
228 vcount.push_back(nbtype); // stocke le nombre d'elements de type nbtype
230 type=i->geometricType;
231 vtype.push_back(type); // stocke le nouveau type geometrique rencontre
236 vcount.push_back(nbtype); // n'a pas été stocké dans la boucle
239 // Pour l'entite qu'on vient de parcourir, allocation des tableau et creation de la connectivite
240 // cout << "Dimension = " << dimension << endl;
241 // cout << "Nombre de type geometriques : " << vtype.size() << endl;
242 // for (unsigned k=0; k!=vtype.size(); ++k )
243 // cout << " -> " << vtype[k] << " : " << vcount[k] << endl;
245 numberOfTypes=vtype.size(); // nombre de types de l'entite
247 if ( i==maillage.end() ) // cas de l'entite de plus haut niveau
249 else if (dimension==2 )
251 else if (dimension==1 )
253 else if (dimension==0 )
256 Connectivity = new CONNECTIVITY(numberOfTypes,entity);
257 Connectivity->setEntityDimension(dimension);
258 Connectivity->setNumberOfNodes(numberOfNodes);
260 types = new medGeometryElement[numberOfTypes];
261 std::copy(vtype.begin(),vtype.end(),types);
262 Connectivity->setGeometricTypes(types,entity);
265 count = new int[numberOfTypes+1];
267 for (unsigned int k=0; k!=vcount.size(); ++k )
268 count[k+1]=count[k]+vcount[k];
269 Connectivity->setCount (count, entity);
272 for (int k=0; k!=numberOfTypes; ++k )
274 // pour chaque type geometrique k, copie des sommets dans connectivity et set dans Connectivity
275 int nbSommetsParMaille = j->sommets.size();
276 int nbSommets = vcount[k] * j->sommets.size();
277 connectivity = new int[ nbSommets ];
278 for (int l=0; l!=vcount[k]; ++l, ++j)
280 for ( unsigned n=0; n != j->sommets.size(); ++n)
281 connectivity[nbSommetsParMaille*l+n] = j->sommets[n]->second.number;
282 maillage.erase(j); ; // dangereux, mais optimise la mémoire consommée!
285 Connectivity->setNodal (connectivity, entity, vtype[k]);
286 delete [] connectivity;
290 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "Erreur de lecture des mailles ."));
293 Connectivity->setConstituent (Constituent);
296 Constituent = Connectivity; // stocke Connectivity pour utilisation dans setConstituent lors de la boucle suivante
302 while ( i != maillage.end() );
311 * fill the arguments vector of groups from the intermediate structure.
312 * This function must be called before getConnectivity()
316 _intermediateMED::getGroups(std::vector<GROUP *> & _groupCell, std::vector<GROUP *> & _groupFace, std::vector<GROUP *> & _groupEdge, std::vector<GROUP *> & _groupNode, MESH * _ptrMesh)
318 const char * LOC = "_intermediateMED::getGroups() : ";
320 if (maillage.size() == 0)
321 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "Erreur : il n'y a plus de mailles (appeler getConnectivity apres getGroups!)."));
323 int dimension_maillage=maillage.rbegin()->dimension();
325 numerotationMaillage(); // Renumerotation des mailles par entite
327 for (unsigned int i=0; i!=this->groupes.size(); ++i)
329 if (groupes[i].mailles.size()==0)
330 continue; // si le groupe est vide, on passe au suivant
332 int nb_geometric_types=1;
333 _groupe::mailleIter j=groupes[i].mailles.begin();
334 // initialise groupe_entity a l'entite de la premiere maille du groupe
335 medEntityMesh groupe_entity = (**j).getEntity(dimension_maillage);
336 medGeometryElement geometrictype=(**j).geometricType;
338 //Parcours des mailles (a partir de la deuxieme) pour compter les types geometriques
339 for ( ++j ; j!=groupes[i].mailles.end(); ++j )
341 //Compte nombre de types geometriques
342 if ( (**j).geometricType != geometrictype ) // si on change de type geometrique
344 nb_geometric_types++;
345 geometrictype=(**j).geometricType;
348 //Test si groupe valide : le groupe doit pointer vers des entites de meme dimension
349 if ((**j).dimension() != dimension_maillage)
353 // le groupe est valide -> on le traite
354 MED_EN::medGeometryElement * tab_types_geometriques = new MED_EN::medGeometryElement[nb_geometric_types];
355 int * tab_index_types_geometriques = new int[nb_geometric_types+1];
356 int * tab_numeros_elements = new int[groupes[i].mailles.size()];
357 int * tab_nombres_elements = new int[nb_geometric_types];
359 //Remplit tableaux entree des methodes set
360 int indice_mailles=0;
361 j=groupes[i].mailles.begin();
362 geometrictype=(**j).geometricType;
363 tab_index_types_geometriques[0]=1;
364 int indice_types_geometriques=1;
365 tab_types_geometriques[0]=geometrictype;
366 //parcours des mailles du groupe
367 for ( ; j!=groupes[i].mailles.end(); ++j , ++indice_mailles)
369 tab_numeros_elements[indice_mailles]=((**j).ordre);
370 if ((**j).geometricType != geometrictype)
372 tab_index_types_geometriques[indice_types_geometriques]=indice_mailles+1;
373 geometrictype=(**j).geometricType;
374 tab_types_geometriques[indice_types_geometriques]=geometrictype;
375 ++indice_types_geometriques;
378 tab_index_types_geometriques[indice_types_geometriques]=indice_mailles+1;
379 for (int k=0; k != nb_geometric_types; ++k)
381 tab_nombres_elements[k] = tab_index_types_geometriques[k+1]-tab_index_types_geometriques[k];
384 //Determination type entite du groupe
385 vector <GROUP *> * vect_group;
386 switch ( groupe_entity )
389 vect_group= & _groupCell;
392 vect_group= & _groupFace;
395 vect_group= & _groupEdge;
398 vect_group= & _groupNode;
401 //Creation nouveau groupe MED
402 GROUP * new_group = new GROUP();
404 new_group->setTotalNumberOfElements(groupes[i].mailles.size());
405 new_group->setName(groupes[i].nom);
406 new_group->setMesh(_ptrMesh);
407 new_group->setNumberOfGeometricType(nb_geometric_types);
408 new_group->setGeometricType(tab_types_geometriques);
409 new_group->setNumberOfElements(tab_nombres_elements);
410 new_group->setNumber(tab_index_types_geometriques,tab_numeros_elements);
411 new_group->setEntity(groupe_entity);
412 new_group->setAll(groupes[i].mailles.size() == maillage.size());
413 vect_group->push_back(new_group);
414 delete [] tab_types_geometriques;
415 delete [] tab_index_types_geometriques;
416 delete [] tab_numeros_elements;
417 delete [] tab_nombres_elements;