2 #include "MEDMEM_DriverTools.hxx"
3 #include "MEDMEM_STRING.hxx"
4 #include "MEDMEM_Exception.hxx"
5 #include "MEDMEM_Mesh.hxx"
6 #include "MEDMEM_Group.hxx"
8 using namespace MEDMEM;
11 // Cet opérateur permet d'ordonner les mailles dans un set suivant l'ordre requis par MED
12 bool _maille::operator < (const _maille& ma) const
14 // si le type géométrique differe, la comparaison est basée dessus
15 // sinon on se base sur une comparaison des numéros de sommets
16 if(geometricType==ma.geometricType)
18 // construction de deux vecteur temporaire contenant les numeros de sommets
19 // pour faire le tri et les comparaisons
20 size_t l=sommets.size();
21 std::vector<int> v1(l);
22 std::vector<int> v2(l);
23 for (unsigned int i=0; i!=l; ++i)
25 v1[i]=sommets[i]->second.number;
26 v2[i]=ma.sommets[i]->second.number;
28 std::sort(v1.begin(), v1.end());
29 std::sort(v2.begin(), v2.end());
30 for(std::vector<int>::const_iterator i1=v1.begin(), i2=v2.begin(); i1!=v1.end(); ++i1, ++i2)
33 return false; // cas d'égalité
36 return geometricType<ma.geometricType;
40 // retourne l'entité d'une maille en fonction de la dimension du maillage.
41 MED_EN::medEntityMesh _maille::getEntity(const int meshDimension) const throw (MEDEXCEPTION)
43 const char * LOC = "_maille::getEntity(const int meshDimension)" ;
46 int mailleDimension = this->dimension();
48 if (mailleDimension == meshDimension)
51 switch (mailleDimension)
63 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "Impossible de determiner l'entite de la maille."));
70 std::ostream& MEDMEM::operator << (std::ostream& os, const _maille& ma)
72 os << "maille " << ma.ordre << " (" << ma.geometricType << ") : < ";
73 std::vector< std::map<int,_noeud>::iterator >::const_iterator i=ma.sommets.begin();
74 os << (*i++)->second.number ;
75 for( ; i!=ma.sommets.end(); ++i)
76 os << ", " << (*i)->second.number;
81 std::ostream& MEDMEM::operator << (std::ostream& os, const _groupe& gr)
83 os << "--- Groupe " << gr.nom << " --- " << std::endl ;
84 os << " -> liste des sous-groupes : ";
85 for( std::vector<int>::const_iterator i=gr.groupes.begin(); i!=gr.groupes.end(); ++i)
87 os << std::endl << " -> liste des mailles : " << std::endl;
88 for( _groupe::mailleIter i=gr.mailles.begin(); i!=gr.mailles.end(); i++)
89 os << " " << *(*i) << std::endl;
93 std::ostream& MEDMEM::operator << (std::ostream& os, const _noeud& no)
95 os << "noeud " << no.number << " : < ";
96 std::vector<double>::const_iterator i=no.coord.begin();
98 for( ; i!=no.coord.end(); ++i)
104 std::ostream& MEDMEM::operator << (std::ostream& os, const _intermediateMED& mi)
106 os << "Set des mailles : " << std::endl;
107 for( std::set<_maille>::const_iterator i=mi.maillage.begin(); i!=mi.maillage.end(); ++i)
108 os << *i << std::endl;
110 os << std::endl << "Vector des groupes : " << std::endl;
111 // for( std::vector<_groupe>::const_iterator i=mi.groupes.begin(); i!=mi.groupes.end(); ++i)
112 for (unsigned int i=0; i!=mi.groupes.size(); i++)
113 os << std::setw(3) << i << " " << mi.groupes[i] << std::endl;
115 os << std::endl << "map des noeuds : " << std::endl;
116 for( std::map<int,_noeud>::const_iterator i=mi.points.begin(); i!=mi.points.end(); ++i)
117 os << i->second << std::endl;
121 void _intermediateMED::numerotationMaillage()
123 // numerotation des mailles par entité
125 std::set<_maille>::iterator i=maillage.begin();
126 int dimension=i->dimension();
127 for( ; i!=maillage.end(); ++i)
129 if ( dimension!=i->dimension() ) // on change d'entite
131 dimension=i->dimension();
134 (*i).ordre=++i_maille;
138 void _intermediateMED::numerotationPoints()
140 // Fonction de renumerotation des noeuds (necessaire quand il y a des trous dans la numerotation.
142 for( std::map<int,_noeud>::const_iterator i=points.begin(); i!=points.end(); ++i)
143 i->second.number = ++i_noeud ;
149 * create a MED COORDINATE from the intermediate structure.
153 _intermediateMED::getCoordinate(const string & coordinateSystem)
155 const medModeSwitch mode=MED_FULL_INTERLACE;
156 int spaceDimension=points.begin()->second.coord.size();
157 int numberOfNodes=points.size();
160 // creation du tableau des coordonnees en mode MED_FULL_INTERLACE
161 double * coord = new double[spaceDimension*numberOfNodes];
163 for( std::map<int,_noeud>::const_iterator i=points.begin(); i!=points.end(); ++i, ++k)
164 std::copy(i->second.coord.begin(), i->second.coord.end(), coord+k*spaceDimension);
166 // creation de l'objet COORDINATE
167 COORDINATE * coordinate = new COORDINATE(spaceDimension, numberOfNodes, mode);
168 coordinate->setCoordinates(mode,coord);
170 coordinate->setCoordinatesSystem(coordinateSystem);
177 * create a MED CONNECTIVITY from the intermediate structure.
178 * for memory optimisation, clear the intermediate structure (the "maillage" set )
182 _intermediateMED::getConnectivity()
184 const char * LOC = "_intermediateMED::getConnectivity() : ";
186 int numberOfNodes=points.size(); // number of nodes in the mesh
188 medEntityMesh entity;
189 medGeometryElement * types=NULL; // pointeurs pour allouer les structures MED
191 int * connectivity=NULL;
192 CONNECTIVITY *Connectivity, *Constituent;
194 medGeometryElement type=0; // variables de travail
199 std::vector<medGeometryElement> vtype; // tableau de travail : stockage des types geometriques pour UNE entite
200 std::vector<int> vcount; // tableau de travail : nombre d'elements pour chaque type geometrique de vtype
202 std::set<_maille>::const_iterator i=maillage.begin(); // iterateurs sur les mailles
203 std::set<_maille>::const_iterator j=maillage.begin();
205 // renumerote les points de 1 a n (pour le cas ou certains points ne sont pas presents dans le maillage d'origine)
206 numerotationPoints();
210 // boucle sur les entites de la structure maillage :
211 // - on parcourt une premiere fois avec i les mailles d'une entite pour récupérer
212 // des infos sur les types geometriques, leur nombre et le nombre d'elements.
213 // - on alloue la connectivite
214 // - on parcourt une deuxieme fois avec j pour lire les noeuds.
217 type=i->geometricType; // init boucle for
218 dimension=i->dimension();
220 vtype.push_back(type);
221 // Boucle sur i de parcours des mailles d'une entite
222 // Une entite se termine lorsqu'on atteint la fin de maillage ou lorsque la dimension des mailles change
223 for( ; i!=maillage.end() && dimension==i->dimension() ; ++i)
225 if (type != i->geometricType) // si changement de type geometrique
227 vcount.push_back(nbtype); // stocke le nombre d'elements de type nbtype
229 type=i->geometricType;
230 vtype.push_back(type); // stocke le nouveau type geometrique rencontre
235 vcount.push_back(nbtype); // n'a pas été stocké dans la boucle
238 // Pour l'entite qu'on vient de parcourir, allocation des tableau et creation de la connectivite
239 // cout << "Dimension = " << dimension << endl;
240 // cout << "Nombre de type geometriques : " << vtype.size() << endl;
241 // for (unsigned k=0; k!=vtype.size(); ++k )
242 // cout << " -> " << vtype[k] << " : " << vcount[k] << endl;
244 numberOfTypes=vtype.size(); // nombre de types de l'entite
246 if ( i==maillage.end() ) // cas de l'entite de plus haut niveau
248 else if (dimension==2 )
250 else if (dimension==1 )
252 else if (dimension==0 )
255 Connectivity = new CONNECTIVITY(numberOfTypes,entity);
256 Connectivity->setEntityDimension(dimension);
257 Connectivity->setNumberOfNodes(numberOfNodes);
259 types = new medGeometryElement[numberOfTypes];
260 std::copy(vtype.begin(),vtype.end(),types);
261 Connectivity->setGeometricTypes(types,entity);
264 count = new int[numberOfTypes+1];
266 for (unsigned int k=0; k!=vcount.size(); ++k )
267 count[k+1]=count[k]+vcount[k];
268 Connectivity->setCount (count, entity);
271 for (int k=0; k!=numberOfTypes; ++k )
273 // pour chaque type géometrique k, copie des sommets dans connectivity et set dans Connectivity
274 int nbSommetsParMaille = j->sommets.size();
275 int nbSommets = vcount[k] * j->sommets.size();
276 connectivity = new int[ nbSommets ];
277 for (int l=0; l!=vcount[k]; ++l, ++j)
279 for ( unsigned n=0; n != j->sommets.size(); ++n)
280 connectivity[nbSommetsParMaille*l+n] = j->sommets[n]->second.number;
281 maillage.erase(j); ; // dangereux, mais optimise la mémoire consommée!
284 Connectivity->setNodal (connectivity, entity, vtype[k]);
285 delete [] connectivity;
289 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "Erreur de lecture des mailles ."));
292 Connectivity->setConstituent (Constituent);
295 Constituent = Connectivity; // stocke Connectivity pour utilisation dans setConstituent lors de la boucle suivante
301 while ( i != maillage.end() );
310 * fill the arguments vector of groups from the intermediate structure.
311 * This function must be called before getConnectivity()
315 _intermediateMED::getGroups(std::vector<GROUP *> & _groupCell, std::vector<GROUP *> & _groupFace, std::vector<GROUP *> & _groupEdge, std::vector<GROUP *> & _groupNode, MESH * _ptrMesh)
317 const char * LOC = "_intermediateMED::getGroups() : ";
319 if (maillage.size() == 0)
320 throw MEDEXCEPTION(LOCALIZED(STRING(LOC) << "Erreur : il n'y a plus de mailles (appeler getConnectivity apres getGroups!)."));
322 int dimension_maillage=maillage.rbegin()->dimension();
324 numerotationMaillage(); // Renumerotation des mailles par entite
326 for (unsigned int i=0; i!=this->groupes.size(); ++i)
328 // si le groupe est vide, ou si le groupe n'est pas nommé : on passe au suivant
329 if (groupes[i].mailles.empty() || groupes[i].nom.empty())
332 int nb_geometric_types=1;
333 _groupe::mailleIter j=groupes[i].mailles.begin();
334 // initialise groupe_entity a l'entite de la premiere maille du groupe
335 medEntityMesh groupe_entity = (**j).getEntity(dimension_maillage);
336 medGeometryElement geometrictype=(**j).geometricType;
338 //Parcours des mailles (a partir de la deuxieme) pour compter les types geometriques
339 for ( ++j ; j!=groupes[i].mailles.end(); ++j )
341 //Compte nombre de types geometriques
342 if ( (**j).geometricType != geometrictype ) // si on change de type geometrique
344 nb_geometric_types++;
345 geometrictype=(**j).geometricType;
348 //Test si groupe valide : le groupe doit pointer vers des entites de meme dimension
349 if ((**j).dimension() != dimension_maillage)
353 // le groupe est valide -> on le traite
354 MED_EN::medGeometryElement * tab_types_geometriques = new MED_EN::medGeometryElement[nb_geometric_types];
355 int * tab_index_types_geometriques = new int[nb_geometric_types+1];
356 int * tab_numeros_elements = new int[groupes[i].mailles.size()];
357 int * tab_nombres_elements = new int[nb_geometric_types];
359 //Remplit tableaux entree des methodes set
360 int indice_mailles=0;
361 j=groupes[i].mailles.begin();
362 geometrictype=(**j).geometricType;
363 tab_index_types_geometriques[0]=1;
364 int indice_types_geometriques=1;
365 tab_types_geometriques[0]=geometrictype;
366 //parcours des mailles du groupe
367 for ( ; j!=groupes[i].mailles.end(); ++j , ++indice_mailles)
369 tab_numeros_elements[indice_mailles]=((**j).ordre);
370 if ((**j).geometricType != geometrictype)
372 tab_index_types_geometriques[indice_types_geometriques]=indice_mailles+1;
373 geometrictype=(**j).geometricType;
374 tab_types_geometriques[indice_types_geometriques]=geometrictype;
375 ++indice_types_geometriques;
378 tab_index_types_geometriques[indice_types_geometriques]=indice_mailles+1;
379 for (int k=0; k != nb_geometric_types; ++k)
381 tab_nombres_elements[k] = tab_index_types_geometriques[k+1]-tab_index_types_geometriques[k];
384 //Determination type entite du groupe
385 vector <GROUP *> * vect_group;
386 switch ( groupe_entity )
389 vect_group= & _groupCell;
392 vect_group= & _groupFace;
395 vect_group= & _groupEdge;
398 vect_group= & _groupNode;
401 //Creation nouveau groupe MED
402 GROUP * new_group = new GROUP();
404 new_group->setTotalNumberOfElements(groupes[i].mailles.size());
405 new_group->setName(groupes[i].nom);
406 new_group->setMesh(_ptrMesh);
407 new_group->setNumberOfGeometricType(nb_geometric_types);
408 new_group->setGeometricType(tab_types_geometriques);
409 new_group->setNumberOfElements(tab_nombres_elements);
410 new_group->setNumber(tab_index_types_geometriques,tab_numeros_elements);
411 new_group->setEntity(groupe_entity);
412 new_group->setAll(groupes[i].mailles.size() == maillage.size());
413 vect_group->push_back(new_group);
414 delete [] tab_types_geometriques;
415 delete [] tab_index_types_geometriques;
416 delete [] tab_numeros_elements;
417 delete [] tab_nombres_elements;