src/MEDLoader/Test/SauvLoaderTest.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2019  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19
  20 #include "SauvLoaderTest.hxx"
  21
  22 #include "SauvReader.hxx"
  23 #include "SauvWriter.hxx"
  24 #include "MEDFileData.hxx"
  25 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  26 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  27 #include "TestInterpKernelUtils.hxx"  // getResourceFile()
  28
  29 #ifdef WIN32
  30 #include <windows.h>
  31 #else
  32 # include <unistd.h>
  33 #endif
  34
  35 #include <vector>
  36 #include <string>
  37
  38 using namespace MEDCoupling;
  39
  40 void SauvLoaderTest::testSauv2Med()
  41 {
  42   // read a file containing all types of readable piles
  43   std::string file = INTERP_TEST::getResourceFile("allPillesTest.sauv", 3);
  44   MCAuto<SauvReader> sr=SauvReader::New(file.c_str());
  45   MCAuto<MEDFileData> d2=sr->loadInMEDFileDS();
  46   // write MED
  47   d2->write("allPillesTest.med",0);
  48   // check
  49   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,d2->getNumberOfMeshes());
  50   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(8+97,d2->getNumberOfFields());
  51   MEDFileMesh * m = d2->getMeshes()->getMeshAtPos(0);
  52   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(17,int(m->getGroupsNames().size()));
  53 }
  54
  55 void SauvLoaderTest::testMed2SauvOnAMeshWithVoidFamily()
  56 {
  57   // Create a mesh with 2 quads.
  58   const int spaceDim = 2;
  59   const int nbOfNodes = 6;
  60   double coords[nbOfNodes*spaceDim] = {0,0, 1,0, 1,1, 0,1, 2,0, 2,1};
  61   int conn[8]={0,1,2,3, 1,4,5,2};
  62   MCAuto<MEDCouplingUMesh> mesh2d=MEDCouplingUMesh::New("Mesh",spaceDim);
  63   mesh2d->allocateCells(2);
  64   mesh2d->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,conn);
  65   mesh2d->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4,4,conn+4);
  66   mesh2d->finishInsertingCells();
  67   MCAuto<DataArrayDouble> myCoords=DataArrayDouble::New();
  68   myCoords->alloc(nbOfNodes,spaceDim);
  69   std::copy(coords,coords+nbOfNodes*spaceDim,myCoords->getPointer());
  70   mesh2d->setCoords(myCoords);
  71
  72   // create a MedFileUMesh
  73   MCAuto<MEDFileUMesh> m= MEDFileUMesh::New();
  74   m->setMeshAtLevel(0,mesh2d);
  75
  76   // Create families and groups
  77
  78   MCAuto<DataArrayInt> fam = DataArrayInt::New();
  79   fam->alloc(2,1);
  80   int elemsFams[2] = {-2,-3};
  81   std::copy(elemsFams,elemsFams+2,fam->getPointer());
  82
  83   m->setFamilyFieldArr(0,fam);
  84
  85   std::map<std::string,int> theFamilies;
  86   theFamilies["FAM_-1"]=-1;
  87   theFamilies["FAM_-2"]=-2;
  88   theFamilies["FAM_-3"]=-3;
  89
  90   std::map<std::string, std::vector<std::string> > theGroups;
  91   theGroups["Group1"].push_back("FAM_-2");
  92   theGroups["Group2"].push_back("FAM_-3");
  93   theGroups["Grouptot"].push_back("FAM_-1");
  94   theGroups["Grouptot"].push_back("FAM_-2");
  95   theGroups["Grouptot"].push_back("FAM_-3");
  96   m->setFamilyInfo(theFamilies);
  97   m->setGroupInfo(theGroups);
  98
  99   // write to MED for visual check
 100   //const char* medFile = "mesh_with_void_family.med";
 101   //m->write(medFile, 2);
 102
 103   // write to SAUV
 104   const char* sauvFile = "mesh_with_void_family.sauv";
 105   MCAuto<MEDFileData> medData = MEDFileData::New();
 106   MCAuto<MEDFileMeshes> medMeshes = MEDFileMeshes::New();
 107   MCAuto<SauvWriter> sw=SauvWriter::New();
 108   medMeshes->setMeshAtPos(0, m);
 109   medData->setMeshes(medMeshes);
 110   sw->setMEDFileDS(medData);
 111   sw->write(sauvFile);
 112
 113   // read SAUV and check groups
 114   MCAuto<SauvReader> sr=SauvReader::New(sauvFile);
 115   MCAuto<MEDFileData> d2=sr->loadInMEDFileDS();
 116   MEDFileUMesh* m2 = static_cast<MEDFileUMesh*>( d2->getMeshes()->getMeshAtPos(0) );
 117   MCAuto<MEDCouplingUMesh> group1 = m2->getGroup(0, "Group1");
 118   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,(int)group1->getNumberOfCells());
 119   MCAuto<MEDCouplingUMesh> group2 = m2->getGroup(0, "Group2");
 120   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,(int)group2->getNumberOfCells());
 121   MCAuto<MEDCouplingUMesh> grptot = m2->getGroup(0, "Grouptot");
 122   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(2,(int)grptot->getNumberOfCells());
 123 }
 124
 125 void SauvLoaderTest::testSauv2MedOnA3SubsField()
 126 {
 127   // read SAUV
 128   std::string sauvFile = INTERP_TEST::getResourceFile("portico_3subs.sauv", 3);
 129   MCAuto<SauvReader> sr=SauvReader::New(sauvFile.c_str());
 130   MCAuto<MEDFileData> d2=sr->loadInMEDFileDS();
 131   // check mesh
 132   MEDFileUMesh* m2 = static_cast<MEDFileUMesh*>(d2->getMeshes()->getMeshAtPos(0));
 133   MCAuto<MEDCouplingUMesh> mesh1d = m2->getMeshAtLevel(0);
 134   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> length1dField = mesh1d->getMeasureField(0);
 135   std::cout << "Length of 1d elements: " << length1dField->accumulate(0) << std::endl;
 136   CPPUNIT_ASSERT_DOUBLES_EQUAL(3, length1dField->accumulate(0), 1e-12);
 137   // check field
 138   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> field =
 139     dynamic_cast<MEDFileFieldMultiTS *>(d2->getFields()->getFieldWithName("CHAM1D"));
 140   std::cout << "Number of components in field: " << field->getInfo().size() << std::endl;
 141   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(6,(int)field->getInfo().size());
 142   std::vector< std::pair<int,int> > timesteps = field->getIterations();
 143
 144   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> field1d =
 145     field->getFieldOnMeshAtLevel(ON_GAUSS_NE, timesteps[0].first, timesteps[0].second, 0, m2);
 146
 147   // Check first component of the field
 148   // 2 gauss points per element => 12 values
 149   double values[12] = {
 150       -7.687500000000e-03,
 151       -7.687500000000e-03,
 152       -4.562500000000e-03,
 153       -4.562500000000e-03,
 154       -8.208333333333e-03,
 155       -8.208333333333e-03,
 156       -6.125000000000e-03,
 157       -6.125000000000e-03,
 158       -4.041666666666e-03,
 159       -4.041666666666e-03,
 160       -6.111413346910e-07,
 161       -6.111413346910e-07};
 162
 163   for (int i=0; i < field1d->getNumberOfTuples(); i++)
 164   {
 165     CPPUNIT_ASSERT_DOUBLES_EQUAL( values[i], field1d->getIJ(i, 0), 1e-12 );
 166   }
 167 }
 168
 169 void SauvLoaderTest::testMed2Sauv()
 170 {
 171   // read pointe.med
 172   std::string file = INTERP_TEST::getResourceFile("pointe.med", 3);
 173   MCAuto<MEDFileData> pointeMed=MEDFileData::New(file.c_str());
 174
 175   // add 3 faces to pointeMed
 176   MEDFileUMesh* pointeMedMesh = static_cast<MEDFileUMesh*>(pointeMed->getMeshes()->getMeshAtPos(0));
 177   MCAuto<MEDCouplingUMesh> pointeM1D = MEDCouplingUMesh::New();
 178   DataArrayDouble     *coords = pointeMedMesh->getCoords();
 179   pointeM1D->setCoords( coords );
 180   pointeM1D->setMeshDimension( 2 );
 181   pointeM1D->allocateCells( 3 );
 182   int conn[]=
 183     {
 184       0,1,2, 0,1,3, 10,11,12,13
 185     };
 186   pointeM1D->insertNextCell( INTERP_KERNEL::NORM_TRI3, 3, conn);
 187   pointeM1D->insertNextCell( INTERP_KERNEL::NORM_TRI3, 3, conn+3);
 188   pointeM1D->insertNextCell( INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4, 4, conn+6);
 189   pointeM1D->finishInsertingCells();
 190   pointeMedMesh->setMeshAtLevel( -1, pointeM1D );
 191   pointeMed->getMeshes()->setMeshAtPos( 0, pointeMedMesh );
 192
 193   // add a field on 2 faces to pointeMed
 194   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> ff1=MEDFileFieldMultiTS::New();
 195   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> f1=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_GAUSS_NE,ONE_TIME);
 196   f1->setMesh( pointeM1D );
 197   f1->setName("Field on 2 faces");
 198   MCAuto<DataArrayDouble> d=DataArrayDouble::New();
 199   d->alloc(3+4,2);
 200   d->setInfoOnComponent(0,"sigX [MPa]");
 201   d->setInfoOnComponent(1,"sigY [GPa]");
 202   double vals[2*(3+4)] =
 203     {
 204       311,312,321,322,331,332,411,412,421,422,431,432,441,442
 205     };
 206   std::copy(vals,vals+d->getNbOfElems(),d->getPointer());
 207   f1->setArray(d);
 208   MCAuto<DataArrayInt> da=DataArrayInt::New();
 209   int ids[] =
 210     {
 211       0,2
 212     };
 213   da->alloc(2,1);
 214   std::copy(ids,ids+da->getNbOfElems(),da->getPointer());
 215   da->setName("sup2");
 216   ff1->appendFieldProfile(f1,pointeMedMesh,-1,da);
 217   pointeMed->getFields()->pushField( ff1 );
 218
 219   // remove "fieldnodeint"
 220   MEDFileFields* pointeFields = pointeMed->getFields();
 221   for ( int i = 0; i < pointeFields->getNumberOfFields(); ++i )
 222     {
 223       MCAuto<MEDFileAnyTypeFieldMultiTS> ts = pointeFields->getFieldAtPos(i);
 224       if ( std::string("fieldnodeint") == ts->getName())
 225         {
 226           pointeFields->destroyFieldAtPos( i );
 227           break;
 228         }
 229     }
 230   // write pointeMed to SAUV
 231   const char* sauvFile = "pointe.sauv";
 232   MCAuto<SauvWriter> sw=SauvWriter::New();
 233   sw->setMEDFileDS(pointeMed);
 234   sw->write(sauvFile);
 235
 236   // read SAUV and check
 237   MCAuto<SauvReader> sr=SauvReader::New(sauvFile);
 238   MCAuto<MEDFileData> d2=sr->loadInMEDFileDS();
 239   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1,d2->getNumberOfMeshes());
 240   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(4,d2->getNumberOfFields());
 241   MEDFileUMesh * m = static_cast<MEDFileUMesh*>( d2->getMeshes()->getMeshAtPos(0) );
 242   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(std::string("maa1"),std::string(m->getName() ));
 243   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3,m->getMeshDimension());
 244   std::vector<std::string > groups = m->getGroupsNames();
 245   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(6,(int)groups.size());
 246   CPPUNIT_ASSERT( std::find(groups.begin(),groups.end(),"groupe1") != groups.end() );
 247   CPPUNIT_ASSERT( std::find(groups.begin(),groups.end(),"groupe2") != groups.end() );
 248   CPPUNIT_ASSERT( std::find(groups.begin(),groups.end(),"groupe3") != groups.end() );
 249   CPPUNIT_ASSERT( std::find(groups.begin(),groups.end(),"groupe4") != groups.end() );
 250   CPPUNIT_ASSERT( std::find(groups.begin(),groups.end(),"groupe5") != groups.end() );
 251   CPPUNIT_ASSERT( std::find(groups.begin(),groups.end(),"maa1") != groups.end() );
 252   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(16,m->getSizeAtLevel(0));
 253   MCAuto<MEDCouplingMesh> um0 = m->getMeshAtLevel(0);
 254   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(12, (int)um0->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_TETRA4 ));
 255   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(2,  (int)um0->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_PYRA5 ));
 256   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(2,  (int)um0->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8 ));
 257   MCAuto<MEDCouplingMesh> um1 = m->getMeshAtLevel(-1);
 258   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(1, (int)um1->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_TRI3 ));
 259   //CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(2, um1->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_TRI3 ));
 260   MCAuto<MEDCouplingUMesh> pointeUM0 =
 261     static_cast<MEDCouplingUMesh*>( pointeMedMesh->getMeshAtLevel(0));
 262   DataArrayDouble *coo = m->getCoords();
 263   DataArrayDouble *pointeCoo = pointeMedMesh->getCoords();
 264   CPPUNIT_ASSERT(coo->isEqualWithoutConsideringStr(*pointeCoo,1e-12));
 265   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> vol = um0->getMeasureField(0);
 266   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> pointeVol = pointeUM0->getMeasureField(0);
 267   CPPUNIT_ASSERT_DOUBLES_EQUAL( vol->accumulate(0), pointeVol->accumulate(0),1e-12);
 268   // check fields
 269   // fieldnodedouble
 270   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> fieldnodedoubleTS1 =
 271     dynamic_cast<MEDFileFieldMultiTS *>(pointeMed->getFields()->getFieldWithName("fieldnodedouble"));
 272   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> fieldnodedoubleTS2 =
 273     dynamic_cast<MEDFileFieldMultiTS *>(d2->getFields()->getFieldWithName("fieldnodedouble"));
 274   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( fieldnodedoubleTS1->getInfo().size(), fieldnodedoubleTS2->getInfo().size());
 275   for ( size_t i = 0; i < fieldnodedoubleTS1->getInfo().size(); ++i )
 276     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( fieldnodedoubleTS1->getInfo()[i], fieldnodedoubleTS2->getInfo()[i]);
 277   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( fieldnodedoubleTS1->getNumberOfTS(), fieldnodedoubleTS2->getNumberOfTS());
 278   std::vector< std::pair<int,int> > io1 = fieldnodedoubleTS1->getIterations();
 279   std::vector< std::pair<int,int> > io2 = fieldnodedoubleTS2->getIterations();
 280   for ( int i =0; i < fieldnodedoubleTS1->getNumberOfTS(); ++i )
 281     {
 282       MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> fnd1 =
 283         fieldnodedoubleTS1->getFieldOnMeshAtLevel(ON_NODES, io1[i].first,io1[i].second,pointeUM0);
 284       MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> fnd2 =
 285         fieldnodedoubleTS2->getFieldOnMeshAtLevel(ON_NODES, io2[i].first,io2[i].second,um0);
 286       CPPUNIT_ASSERT( fnd1->getArray()->isEqual( *fnd2->getArray(), 1e-12 ));
 287     }
 288   // fieldcelldoublevector
 289   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> fieldcelldoublevectorTS1 =
 290     dynamic_cast<MEDFileFieldMultiTS *>(pointeMed->getFields()->getFieldWithName("fieldcelldoublevector"));
 291   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> fieldcelldoublevectorTS2 =
 292     dynamic_cast<MEDFileFieldMultiTS *>(d2->getFields()->getFieldWithName("fieldcelldoublevector"));
 293   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( fieldcelldoublevectorTS1->getInfo().size(), fieldcelldoublevectorTS2->getInfo().size());
 294   for ( size_t i = 0; i < fieldcelldoublevectorTS1->getInfo().size(); ++i )
 295     CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( fieldcelldoublevectorTS1->getInfo()[i], fieldcelldoublevectorTS2->getInfo()[i]);
 296   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL( fieldcelldoublevectorTS1->getNumberOfTS(), fieldcelldoublevectorTS2->getNumberOfTS());
 297   io1 = fieldcelldoublevectorTS1->getIterations();
 298   io2 = fieldcelldoublevectorTS2->getIterations();
 299   for ( int i =0; i < fieldcelldoublevectorTS1->getNumberOfTS(); ++i )
 300     {
 301       MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> fnd1 =
 302         fieldcelldoublevectorTS1->getFieldOnMeshAtLevel(ON_CELLS, io1[i].first,io1[i].second,pointeUM0);
 303       MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> fnd2 =
 304         fieldcelldoublevectorTS2->getFieldOnMeshAtLevel(ON_CELLS, io2[i].first,io2[i].second,um0);
 305       CPPUNIT_ASSERT_DOUBLES_EQUAL( fnd1->accumulate(0), fnd2->accumulate(0), 1e-12 );
 306       CPPUNIT_ASSERT_DOUBLES_EQUAL( fnd1->accumulate(1), fnd2->accumulate(1), 1e-12 );
 307       CPPUNIT_ASSERT_DOUBLES_EQUAL( fnd1->accumulate(2), fnd2->accumulate(2), 1e-12 );
 308     }
 309   // "Field on 2 faces"
 310   MCAuto<MEDFileFieldMultiTS> fieldOnFaces =
 311     dynamic_cast<MEDFileFieldMultiTS *>(d2->getFields()->getFieldWithName(f1->getName().c_str()));
 312   io1 = fieldOnFaces->getIterations();
 313   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> fof =
 314     fieldOnFaces->getFieldOnMeshAtLevel(f1->getTypeOfField(),io1[0].first,io1[0].second,um1);
 315   CPPUNIT_ASSERT( d->isEqual( *fof->getArray(), 1e-12 ));
 316 }
 317
 318 void SauvLoaderTest::testCellsWithLingNames()
 319 {
 320   // test IMP 3285: [CEA 1778] SauvReader: only keep the meshes named in the table MED_MAIL
 321   std::string file = INTERP_TEST::getResourceFile("test_MED_MAIL.sauv", 3);
 322   MCAuto<SauvReader> sr=SauvReader::New(file.c_str());
 323   MCAuto<MEDFileData> d2=sr->loadInMEDFileDS();
 324   // check that the mesh contains
 325   // - Nombre de noeuds : 74
 326   // - Nombre de mailles de type MED_TRIA3 : 6
 327   // - Nombre de mailles de type MED_QUAD4 : 43
 328   // - Nombre de mailles de type MED_HEXA8 : 24
 329   // - Nombre de mailles de type MED_PENTA6 : 3
 330   MEDFileUMesh* m = static_cast<MEDFileUMesh*>( d2->getMeshes()->getMeshAtPos(0));
 331   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(6,  m->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_TRI3 ));
 332   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(43, m->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4 ));
 333   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(24, m->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8 ));
 334   CPPUNIT_ASSERT_EQUAL(3,  m->getNumberOfCellsWithType( INTERP_KERNEL::NORM_PENTA6 ));
 335 }
 336
 337 void SauvLoaderTest::tearDown()
 338 {
 339   const int nbFilesToRemove = 3;
 340   const char* fileToRemove[nbFilesToRemove] = { "allPillesTest.med", "pointe.sauv", "mesh_with_void_family.sauv" };
 341   for ( int i = 0; i < nbFilesToRemove; ++i )
 342   {
 343 #ifdef WIN32
 344     if (GetFileAttributes(fileToRemove[i]) != INVALID_FILE_ATTRIBUTES)
 345 #else
 346       if (access(fileToRemove[i], F_OK) == 0)
 347 #endif
 348         remove(fileToRemove[i]);
 349   }
 350 }