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22606: [CEA 1183] sauv2med returns an error if a field is scattered in two tables...
[tools/medcoupling.git] / src / MEDLoader / SauvMedConvertor.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // File      : SauvMedConvertor.cxx
20 // Created   : Tue Aug 16 14:43:20 2011
21 // Author    : Edward AGAPOV (eap)
22 //
23
24 #include "SauvMedConvertor.hxx"
25
26 #include "CellModel.hxx"
27 #include "MEDFileMesh.hxx"
28 #include "MEDFileField.hxx"
29 #include "MEDFileData.hxx"
30 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
31
32 #include <iostream>
33 #include <cassert>
34 #include <cmath>
35 #include <queue>
36 #include <limits>
37
38 #include <cstdlib>
39 #include <cstring>
40 #include <fcntl.h>
41
42 #ifdef WIN32
43 #include <io.h>
44 #else
45 #include <unistd.h>
46 #endif
47
48 #ifdef HAS_XDR
49 #include <rpc/xdr.h>
50 #endif
51
52 using namespace SauvUtilities;
53 using namespace ParaMEDMEM;
54
55 namespace
56 {
57   // for ASCII file reader
58   const int GIBI_MaxOutputLen = 150; // max length of a line in the sauve file
59   const int GIBI_BufferSize   = 16184; // for buffered reading
60
61   using namespace INTERP_KERNEL;
62
63   const size_t MaxMedCellType = NORM_ERROR;
64   const size_t NbGibiCellTypes = 47;
65   const TCellType GibiTypeToMed[NbGibiCellTypes] =
66     {
67       /*1 */ NORM_POINT1 ,/*2 */ NORM_SEG2   ,/*3 */ NORM_SEG3   ,/*4 */ NORM_TRI3   ,/*5 */ NORM_ERROR  ,
68       /*6 */ NORM_TRI6   ,/*7 */ NORM_ERROR  ,/*8 */ NORM_QUAD4  ,/*9 */ NORM_ERROR  ,/*10*/ NORM_QUAD8  ,
69       /*11*/ NORM_ERROR  ,/*12*/ NORM_ERROR  ,/*13*/ NORM_ERROR  ,/*14*/ NORM_HEXA8  ,/*15*/ NORM_HEXA20 ,
70       /*16*/ NORM_PENTA6 ,/*17*/ NORM_PENTA15,/*18*/ NORM_ERROR  ,/*19*/ NORM_ERROR  ,/*20*/ NORM_ERROR  ,
71       /*21*/ NORM_ERROR  ,/*22*/ NORM_ERROR  ,/*23*/ NORM_TETRA4 ,/*24*/ NORM_TETRA10,/*25*/ NORM_PYRA5  ,
72       /*26*/ NORM_PYRA13 ,/*27*/ NORM_ERROR  ,/*28*/ NORM_ERROR  ,/*29*/ NORM_ERROR  ,/*30*/ NORM_ERROR  ,
73       /*31*/ NORM_ERROR  ,/*32*/ NORM_ERROR  ,/*33*/ NORM_ERROR  ,/*34*/ NORM_ERROR  ,/*35*/ NORM_ERROR  ,
74       /*36*/ NORM_ERROR  ,/*37*/ NORM_ERROR  ,/*38*/ NORM_ERROR  ,/*39*/ NORM_ERROR  ,/*40*/ NORM_ERROR  ,
75       /*41*/ NORM_ERROR  ,/*42*/ NORM_ERROR  ,/*43*/ NORM_ERROR  ,/*44*/ NORM_ERROR  ,/*45*/ NORM_ERROR  ,
76       /*46*/ NORM_ERROR  ,/*47*/ NORM_ERROR
77     };
78
79   //================================================================================
80   /*!
81    * \brief Return dimension of a group
82    */
83   //================================================================================
84
85   unsigned getDim( const Group* grp )
86   {
87     return SauvUtilities::getDimension( grp->_groups.empty() ? grp->_cellType : grp->_groups[0]->_cellType );
88   }
89
90   //================================================================================
91   /*!
92    * \brief Converts connectivity of quadratic elements
93    */
94   //================================================================================
95
96   inline void ConvertQuadratic( const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type,
97                                 const Cell &                            aCell )
98   {
99     if ( const int * conn = getGibi2MedQuadraticInterlace( type ))
100       {
101         Cell* ma = const_cast<Cell*>(&aCell);
102         std::vector< Node* > new_nodes( ma->_nodes.size() );
103         for (std:: size_t i = 0; i < new_nodes.size(); ++i )
104           new_nodes[ i ] = ma->_nodes[ conn[ i ]];
105         ma->_nodes.swap( new_nodes );
106       }
107   }
108
109   //================================================================================
110   /*!
111    * \brief Returns a vector of pairs of node indices to inverse a med volume element
112    */
113   //================================================================================
114
115   void getReverseVector (const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type,
116                          std::vector<std::pair<int,int> > &                swapVec )
117   {
118     swapVec.clear();
119
120     switch ( type )
121       {
122       case NORM_TETRA4:
123         swapVec.resize(1);
124         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 2 );
125         break;
126       case NORM_PYRA5:
127         swapVec.resize(1);
128         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 3 );
129         break;
130       case NORM_PENTA6:
131         swapVec.resize(2);
132         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 2 );
133         swapVec[1] = std::make_pair( 4, 5 );
134         break;
135       case NORM_HEXA8:
136         swapVec.resize(2);
137         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 3 );
138         swapVec[1] = std::make_pair( 5, 7 );
139         break;
140       case NORM_TETRA10:
141         swapVec.resize(3);
142         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 2 );
143         swapVec[1] = std::make_pair( 4, 6 );
144         swapVec[2] = std::make_pair( 8, 9 );
145         break;
146       case NORM_PYRA13:
147         swapVec.resize(4);
148         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 3 );
149         swapVec[1] = std::make_pair( 5, 8 );
150         swapVec[2] = std::make_pair( 6, 7 );
151         swapVec[3] = std::make_pair( 10, 12 );
152         break;
153       case NORM_PENTA15:
154         swapVec.resize(4);
155         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 2 );
156         swapVec[1] = std::make_pair( 4, 5 );
157         swapVec[2] = std::make_pair( 6, 8 );
158         swapVec[3] = std::make_pair( 9, 11 );
159         break;
160       case NORM_HEXA20:
161         swapVec.resize(7);
162         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 3 );
163         swapVec[1] = std::make_pair( 5, 7 );
164         swapVec[2] = std::make_pair( 8, 11 );
165         swapVec[3] = std::make_pair( 9, 10 );
166         swapVec[4] = std::make_pair( 12, 15 );
167         swapVec[5] = std::make_pair( 13, 14 );
168         swapVec[6] = std::make_pair( 17, 19 );
169         break;
170         //   case NORM_SEG3: no need to reverse edges
171         //     swapVec.resize(1);
172         //     swapVec[0] = std::make_pair( 1, 2 );
173         //     break;
174       case NORM_TRI6:
175         swapVec.resize(2);
176         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 2 );
177         swapVec[1] = std::make_pair( 3, 5 );
178         break;
179       case NORM_QUAD8:
180         swapVec.resize(3);
181         swapVec[0] = std::make_pair( 1, 3 );
182         swapVec[1] = std::make_pair( 4, 7 );
183         swapVec[2] = std::make_pair( 5, 6 );
184         break;
185       default:;
186       }
187   }
188
189   //================================================================================
190   /*!
191    * \brief Inverses element orientation using vector of indices to swap
192    */
193   //================================================================================
194
195   inline void reverse(const Cell & aCell, const std::vector<std::pair<int,int> > & swapVec )
196   {
197     Cell* ma = const_cast<Cell*>(&aCell);
198     for ( unsigned i = 0; i < swapVec.size(); ++i )
199       std::swap( ma->_nodes[ swapVec[i].first ],
200                  ma->_nodes[ swapVec[i].second ]);
201     if ( swapVec.empty() )
202       ma->_reverse = true;
203     else
204       ma->_reverse = false;
205   }
206   //================================================================================
207   /*!
208    * \brief Comparator of cells by number used for ordering cells within a med group
209    */
210   struct TCellByIDCompare
211   {
212     bool operator () (const Cell* i1, const Cell* i2)
213     {
214       return i1->_number < i2->_number;
215     }
216   };
217   typedef std::map< const Cell*, unsigned, TCellByIDCompare > TCellToOrderMap;
218
219   //================================================================================
220   /*!
221    * \brief Fill Group::_relocTable if necessary
222    */
223   //================================================================================
224
225   void setRelocationTable( Group* grp, TCellToOrderMap& cell2order )
226   {
227     if ( !grp->_isProfile ) return;
228
229     // check if relocation table is necessary
230     bool isRelocated = false;
231     unsigned newOrder = 0;
232     TCellToOrderMap::iterator c2oIt = cell2order.begin(), c2oEnd = cell2order.end();
233     for ( ; !isRelocated && c2oIt != c2oEnd; ++c2oIt, ++newOrder )
234       isRelocated = ( c2oIt->second != newOrder );
235
236     if ( isRelocated )
237     {
238       grp->_relocTable.resize( cell2order.size() );
239       for ( newOrder = 0, c2oIt = cell2order.begin(); c2oIt != c2oEnd; ++c2oIt, ++newOrder )
240         grp->_relocTable[ c2oIt->second ] = newOrder;
241     }
242   }
243 }
244
245 namespace // define default GAUSS points
246 {
247   typedef std::vector<double> TDoubleVector;
248   typedef double*             TCoordSlice;
249   typedef int                 TInt;
250   //---------------------------------------------------------------
251   //! Shape function definitions
252   //---------------------------------------------------------------
253   struct TShapeFun
254   {
255     TInt myDim;
256     TInt myNbRef;
257     TDoubleVector myRefCoord;
258
259     TShapeFun(TInt theDim = 0, TInt theNbRef = 0)
260       :myDim(theDim),myNbRef(theNbRef),myRefCoord(theNbRef*theDim) {}
261
262     TInt GetNbRef() const { return myNbRef; }
263
264     TCoordSlice GetCoord(TInt theRefId) { return &myRefCoord[0] + theRefId * myDim; }
265   };
266   //---------------------------------------------------------------
267   /*!
268    * \brief Description of family of integration points
269    */
270   //---------------------------------------------------------------
271   struct TGaussDef
272   {
273     int           myType;      //!< element geometry (EGeometrieElement or med_geometrie_element)
274     TDoubleVector myRefCoords; //!< description of reference points
275     TDoubleVector myCoords;    //!< coordinates of Gauss points
276     TDoubleVector myWeights;   //!< weights, len(weights)==<nb of gauss points>
277
278     /*!
279      * \brief Creates definition of gauss points family
280      *  \param geomType - element geometry (EGeometrieElement or med_geometrie_element)
281      *  \param nbPoints - nb gauss point
282      *  \param variant - [1-3] to choose the variant of definition
283      * 
284      * Throws in case of invalid parameters
285      * variant == 1 refers to "Fonctions de forme et points d'integration 
286      *              des elements finis" v7.4 by J. PELLET, X. DESROCHES, 15/09/05
287      * variant == 2 refers to the same doc v6.4 by J.P. LEFEBVRE, X. DESROCHES, 03/07/03
288      * variant == 3 refers to the same doc v6.4, second variant for 2D elements
289      */
290     TGaussDef(const int geomType, const int nbPoints, const int variant=1);
291
292     int dim() const { return SauvUtilities::getDimension( NormalizedCellType( myType )); }
293     int nbPoints() const { return myWeights.capacity(); }
294
295   private:
296     void add(const double x, const double weight);
297     void add(const double x, const double y, const double weight);
298     void add(const double x, const double y, const double z, const double weight);
299     void setRefCoords(const TShapeFun& aShapeFun) { myRefCoords = aShapeFun.myRefCoord; }
300   };
301   struct TSeg2a: TShapeFun {
302     TSeg2a();
303   };
304   struct TSeg3a: TShapeFun {
305     TSeg3a();
306   };
307   struct TTria3a: TShapeFun {
308     TTria3a();
309   };
310   struct TTria6a: TShapeFun {
311     TTria6a();
312   };
313   struct TTria3b: TShapeFun {
314     TTria3b();
315   };
316   struct TTria6b: TShapeFun {
317     TTria6b();
318   };
319   struct TQuad4a: TShapeFun {
320     TQuad4a();
321   };
322   struct TQuad8a: TShapeFun {
323     TQuad8a();
324   };
325   struct TQuad4b: TShapeFun {
326     TQuad4b();
327   };
328   struct TQuad8b: TShapeFun {
329     TQuad8b();
330   };
331   struct TTetra4a: TShapeFun {
332     TTetra4a();
333   };
334   struct TTetra10a: TShapeFun {
335     TTetra10a();
336   };
337   struct TTetra4b: TShapeFun {
338     TTetra4b();
339   };
340   struct TTetra10b: TShapeFun {
341     TTetra10b();
342   };
343   struct THexa8a: TShapeFun {
344     THexa8a();
345   };
346   struct THexa20a: TShapeFun {
347     THexa20a(TInt theDim = 3, TInt theNbRef = 20);
348   };
349   struct THexa27a: THexa20a {
350     THexa27a();
351   };
352   struct THexa8b: TShapeFun {
353     THexa8b();
354   };
355   struct THexa20b: TShapeFun {
356     THexa20b(TInt theDim = 3, TInt theNbRef = 20);
357   };
358   struct TPenta6a: TShapeFun {
359     TPenta6a();
360   };
361   struct TPenta6b: TShapeFun {
362     TPenta6b();
363   };
364   struct TPenta15a: TShapeFun {
365     TPenta15a();
366   };
367   struct TPenta15b: TShapeFun {
368     TPenta15b();
369   };
370   struct TPyra5a: TShapeFun {
371     TPyra5a();
372   };
373   struct TPyra5b: TShapeFun {
374     TPyra5b();
375   };
376   struct TPyra13a: TShapeFun {
377     TPyra13a();
378   };
379   struct TPyra13b: TShapeFun {
380     TPyra13b();
381   };
382
383   void TGaussDef::add(const double x, const double weight)
384   {
385     if ( dim() != 1 )
386       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: dim() != 1");
387     if ( myWeights.capacity() == myWeights.size() )
388       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Extra gauss point");
389     myCoords.push_back( x );
390     myWeights.push_back( weight );
391   }
392   void TGaussDef::add(const double x, const double y, const double weight)
393   {
394     if ( dim() != 2 )
395       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: dim() != 2");
396     if ( myWeights.capacity() == myWeights.size() )
397       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Extra gauss point");
398     myCoords.push_back( x );
399     myCoords.push_back( y );
400     myWeights.push_back( weight );
401   }
402   void TGaussDef::add(const double x, const double y, const double z, const double weight)
403   {
404     if ( dim() != 3 )
405       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: dim() != 3");
406     if ( myWeights.capacity() == myWeights.size() )
407       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Extra gauss point");
408     myCoords.push_back( x );
409     myCoords.push_back( y );
410     myCoords.push_back( z );
411     myWeights.push_back( weight );
412   }
413
414   //---------------------------------------------------------------
415   TSeg2a::TSeg2a():TShapeFun(1,2)
416   {
417     TInt aNbRef = GetNbRef();
418     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
419       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
420       switch(aRefId){
421       case  0: aCoord[0] = -1.0; break;
422       case  1: aCoord[0] =  1.0; break;
423       }
424     }
425   }
426   //---------------------------------------------------------------
427   TSeg3a::TSeg3a():TShapeFun(1,3)
428   {
429     TInt aNbRef = GetNbRef();
430     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
431       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
432       switch(aRefId){
433       case  0: aCoord[0] = -1.0; break;
434       case  1: aCoord[0] =  1.0; break;
435       case  2: aCoord[0] =  0.0; break;
436       }
437     }
438   }
439   //---------------------------------------------------------------
440   TTria3a::TTria3a():
441     TShapeFun(2,3)
442   {
443     TInt aNbRef = GetNbRef();
444     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
445       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
446       switch(aRefId){
447       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
448       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
449       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
450       }
451     }
452   }
453   //---------------------------------------------------------------
454   TTria6a::TTria6a():TShapeFun(2,6)
455   {
456     TInt aNbRef = GetNbRef();
457     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
458       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
459       switch(aRefId){
460       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
461       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
462       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
463
464       case  3: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
465       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
466       case  5: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
467       }
468     }
469   }
470   //---------------------------------------------------------------
471   TTria3b::TTria3b():
472     TShapeFun(2,3)
473   {
474     TInt aNbRef = GetNbRef();
475     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
476       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
477       switch(aRefId){
478       case  0: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
479       case  1: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
480       case  2: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
481       }
482     }
483   }
484   //---------------------------------------------------------------
485   TTria6b::TTria6b():
486     TShapeFun(2,6)
487   {
488     TInt aNbRef = GetNbRef();
489     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
490       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
491       switch(aRefId){
492       case  0: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
493       case  1: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
494       case  2: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
495
496       case  3: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0; break;
497       case  4: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.5; break;
498       case  5: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5; break;
499       }
500     }
501   }
502   //---------------------------------------------------------------
503   TQuad4a::TQuad4a():
504     TShapeFun(2,4)
505   {
506     TInt aNbRef = GetNbRef();
507     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
508       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
509       switch(aRefId){
510       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
511       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
512       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
513       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
514       }
515     }
516   }
517   //---------------------------------------------------------------
518   TQuad8a::TQuad8a():
519     TShapeFun(2,8)
520   {
521     TInt aNbRef = GetNbRef();
522     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
523       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
524       switch(aRefId){
525       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
526       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
527       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
528       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
529
530       case  4: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
531       case  5: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
532       case  6: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
533       case  7: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
534       }
535     }
536   }
537   //---------------------------------------------------------------
538   TQuad4b::TQuad4b():
539     TShapeFun(2,4)
540   {
541     TInt aNbRef = GetNbRef();
542     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
543       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
544       switch(aRefId){
545       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
546       case  1: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
547       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
548       case  3: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
549       }
550     }
551   }
552   //---------------------------------------------------------------
553   TQuad8b::TQuad8b():
554     TShapeFun(2,8)
555   {
556     TInt aNbRef = GetNbRef();
557     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
558       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
559       switch(aRefId){
560       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
561       case  1: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
562       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
563       case  3: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
564
565       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0; break;
566       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
567       case  6: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0; break;
568       case  7: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0; break;
569       }
570     }
571   }
572   //---------------------------------------------------------------
573   TTetra4a::TTetra4a():
574     TShapeFun(3,4)
575   {
576     TInt aNbRef = GetNbRef();
577     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
578       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
579       switch(aRefId){
580       case  0: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
581       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
582       case  2: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
583       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
584       }
585     }
586   }
587   //---------------------------------------------------------------
588   TTetra10a::TTetra10a():
589     TShapeFun(3,10)
590   {
591     TInt aNbRef = GetNbRef();
592     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
593       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
594       switch(aRefId){
595       case  0: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
596       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
597       case  2: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
598       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
599
600       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
601       case  5: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
602       case  6: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
603
604       case  7: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
605       case  8: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
606       case  9: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
607       }
608     }
609   }
610   //---------------------------------------------------------------
611   TTetra4b::TTetra4b():
612     TShapeFun(3,4)
613   {
614     TInt aNbRef = GetNbRef();
615     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
616       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
617       switch(aRefId){
618       case  0: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
619       case  2: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
620       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
621       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
622       }
623     }
624   }
625   //---------------------------------------------------------------
626   TTetra10b::TTetra10b():
627     TShapeFun(3,10)
628   {
629     TInt aNbRef = GetNbRef();
630     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
631       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
632       switch(aRefId){
633       case  0: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
634       case  2: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
635       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
636       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
637
638       case  6: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
639       case  5: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
640       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
641
642       case  7: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
643       case  9: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
644       case  8: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
645       }
646     }
647   }
648   //---------------------------------------------------------------
649   THexa8a::THexa8a():
650     TShapeFun(3,8)
651   {
652     TInt aNbRef = GetNbRef();
653     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
654       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
655       switch(aRefId){
656       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
657       case  1: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
658       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
659       case  3: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
660       case  4: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
661       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
662       case  6: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
663       case  7: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
664       }
665     }
666   }
667   //---------------------------------------------------------------
668   THexa20a::THexa20a(TInt theDim, TInt theNbRef):
669     TShapeFun(theDim,theNbRef)
670   {
671     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
672     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
673       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
674       switch(aRefId){
675       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
676       case  1: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
677       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
678       case  3: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
679       case  4: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
680       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
681       case  6: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
682       case  7: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
683
684       case  8: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
685       case  9: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
686       case 10: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
687       case 11: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
688       case 12: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
689       case 13: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
690       case 14: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
691       case 15: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
692       case 16: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
693       case 17: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
694       case 18: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
695       case 19: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
696       }
697     }
698   }
699   //---------------------------------------------------------------
700   THexa27a::THexa27a():
701     THexa20a(3,27)
702   {
703     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
704     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
705       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
706       switch(aRefId){
707       case 20: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
708       case 21: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
709       case 22: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
710       case 23: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
711       case 24: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
712       case 25: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
713       case 26: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
714       }
715     }
716   }
717   //---------------------------------------------------------------
718   THexa8b::THexa8b():
719     TShapeFun(3,8)
720   {
721     TInt aNbRef = GetNbRef();
722     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
723       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
724       switch(aRefId){
725       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
726       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
727       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
728       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
729       case  4: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
730       case  7: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
731       case  6: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
732       case  5: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
733       }
734     }
735   }
736   //---------------------------------------------------------------
737   THexa20b::THexa20b(TInt theDim, TInt theNbRef):
738     TShapeFun(theDim,theNbRef)
739   {
740     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
741     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
742       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
743       switch(aRefId){
744       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
745       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
746       case  2: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
747       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
748       case  4: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
749       case  7: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
750       case  6: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
751       case  5: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
752
753       case 11: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
754       case 10: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
755       case  9: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
756       case  8: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] = -1.0; break;
757       case 16: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
758       case 19: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
759       case 18: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
760       case 17: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
761       case 15: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
762       case 14: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
763       case 13: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
764       case 12: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
765       }
766     }
767   }
768   //---------------------------------------------------------------
769   TPenta6a::TPenta6a():
770     TShapeFun(3,6)
771   {
772     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
773     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
774       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
775       switch(aRefId){
776       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
777       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
778       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
779       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
780       case  4: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
781       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
782       }
783     }
784   }
785   //---------------------------------------------------------------
786   TPenta6b::TPenta6b():
787     TShapeFun(3,6)
788   {
789     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
790     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
791       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
792       switch(aRefId){
793       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
794       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
795       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
796       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
797       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
798       case  4: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
799       }
800     }
801   }
802   //---------------------------------------------------------------
803   TPenta15a::TPenta15a():
804     TShapeFun(3,15)
805   {
806     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
807     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
808       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
809       switch(aRefId){
810       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
811       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
812       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
813       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
814       case  4: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
815       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
816
817       case  6: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
818       case  7: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
819       case  8: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
820       case  9: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
821       case 10: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
822       case 11: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
823       case 12: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
824       case 13: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
825       case 14: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
826       }
827     }
828   }
829   //---------------------------------------------------------------
830   TPenta15b::TPenta15b():
831     TShapeFun(3,15)
832   {
833     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
834     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
835       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
836       switch(aRefId){
837       case  0: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
838       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] = -0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
839       case  1: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
840       case  3: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
841       case  5: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
842       case  4: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
843
844       case  8: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
845       case  7: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
846       case  6: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
847       case 12: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
848       case 14: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
849       case 13: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
850       case 11: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
851       case 10: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
852       case  9: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
853       }
854     }
855   }
856   //---------------------------------------------------------------
857   TPyra5a::TPyra5a():
858     TShapeFun(3,5)
859   {
860     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
861     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
862       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
863       switch(aRefId){
864       case  0: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
865       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
866       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
867       case  3: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
868       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
869       }
870     }
871   }
872   //---------------------------------------------------------------
873   TPyra5b::TPyra5b():
874     TShapeFun(3,5)
875   {
876     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
877     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
878       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
879       switch(aRefId){        
880       case  0: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
881       case  3: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
882       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
883       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
884       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
885       }
886     }
887   }
888   //---------------------------------------------------------------
889   TPyra13a::TPyra13a():
890     TShapeFun(3,13)
891   {
892     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
893     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
894       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
895       switch(aRefId){
896       case  0: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
897       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
898       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
899       case  3: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
900       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
901
902       case  5: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
903       case  6: aCoord[0] = -0.5;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
904       case  7: aCoord[0] = -0.5;  aCoord[1] = -0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
905       case  8: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] = -0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
906       case  9: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
907       case 10: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
908       case 11: aCoord[0] = -0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
909       case 12: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
910       }
911     }
912   }
913   //---------------------------------------------------------------
914   TPyra13b::TPyra13b():
915     TShapeFun(3,13)
916   {
917     TInt aNbRef = myRefCoord.size();
918     for(TInt aRefId = 0; aRefId < aNbRef; aRefId++){
919       TCoordSlice aCoord = GetCoord(aRefId);
920       switch(aRefId){
921       case  0: aCoord[0] =  1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
922       case  3: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
923       case  2: aCoord[0] = -1.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
924       case  1: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -1.0;  aCoord[2] =  0.0; break;
925       case  4: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  1.0; break;
926
927       case  8: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
928       case  7: aCoord[0] = -0.5;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
929       case  6: aCoord[0] = -0.5;  aCoord[1] = -0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
930       case  5: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] = -0.5;  aCoord[2] =  0.0; break;
931       case  9: aCoord[0] =  0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
932       case 12: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] =  0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
933       case 11: aCoord[0] = -0.5;  aCoord[1] =  0.0;  aCoord[2] =  0.5; break;
934       case 10: aCoord[0] =  0.0;  aCoord[1] = -0.5;  aCoord[2] =  0.5; break;
935       }
936     }
937   }
938   /*!
939    * \brief Fill definition of gauss points family
940    */
941
942   TGaussDef::TGaussDef(const int geom, const int nbGauss, const int variant)
943   {
944     myType = geom;
945     myCoords .reserve( nbGauss * dim() );
946     myWeights.reserve( nbGauss );
947
948     switch ( geom ) {
949
950     case NORM_SEG2:
951     case NORM_SEG3:
952       if (geom == NORM_SEG2) setRefCoords( TSeg2a() );
953       else                   setRefCoords( TSeg3a() );
954       switch ( nbGauss ) {
955       case 1: {
956         add( 0.0, 2.0 ); break;
957       }
958       case 2: {
959         const double a = 0.577350269189626;
960         add(  a,  1.0 );
961         add( -a,  1.0 ); break;
962       }
963       case 3: {
964         const double a = 0.774596669241;
965         const double P1 = 1./1.8;
966         const double P2 = 1./1.125;
967         add( -a,  P1 );
968         add(  0,  P2 ); 
969         add(  a,  P1 ); break;
970       }
971       case 4: {
972         const double a  = 0.339981043584856, b  = 0.861136311594053;
973         const double P1 = 0.652145154862546, P2 = 0.347854845137454 ;
974         add(  a,  P1 );
975         add( -a,  P1 );
976         add(  b,  P2 ); 
977         add( -b,  P2 ); break;
978       }
979       default:
980         THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for SEG"<<nbGauss);
981       }
982       break;
983
984     case NORM_TRI3:
985     case NORM_TRI6:
986       if ( variant == 1 ) {
987         if (geom == NORM_TRI3) setRefCoords( TTria3b() );
988         else                   setRefCoords( TTria6b() );
989         switch ( nbGauss ) {
990         case 1: { // FPG1
991           add( 1/3., 1/3., 1/2. ); break;
992         }
993         case 3: { // FPG3
994           // what about COT3 ???
995           add( 1/6., 1/6., 1/6. );
996           add( 2/3., 1/6., 1/6. );
997           add( 1/6., 2/3., 1/6. ); break;
998         }
999         case 4: { // FPG4
1000           add( 1/5., 1/5.,  25/(24*4.) );
1001           add( 3/5., 1/5.,  25/(24*4.) );
1002           add( 1/5., 3/5.,  25/(24*4.) );
1003           add( 1/3., 1/3., -27/(24*4.) ); break;
1004         }
1005         case 6: { // FPG6
1006           const double P1 = 0.11169079483905, P2 = 0.0549758718227661;
1007           const double a  = 0.445948490915965, b = 0.091576213509771;
1008           add(     b,     b, P2 ); 
1009           add( 1-2*b,     b, P2 );
1010           add(     b, 1-2*b, P2 );
1011           add(     a, 1-2*a, P1 );
1012           add(     a,     a, P1 ); 
1013           add( 1-2*a,     a, P1 ); break;
1014         }
1015         case 7: { // FPG7
1016           const double A  = 0.470142064105115;
1017           const double B  = 0.101286507323456;
1018           const double P1 = 0.066197076394253;
1019           const double P2 = 0.062969590272413;
1020           add(  1/3.,  1/3., 9/80. ); 
1021           add(     A,     A, P1 ); 
1022           add( 1-2*A,     A, P1 );
1023           add(     A, 1-2*A, P1 );
1024           add(     B,     B, P2 ); 
1025           add( 1-2*B,     B, P2 );
1026           add(     B, 1-2*B, P2 ); break;
1027         }
1028         case 12: { // FPG12
1029           const double A  = 0.063089014491502;
1030           const double B  = 0.249286745170910;
1031           const double C  = 0.310352451033785;
1032           const double D  = 0.053145049844816;
1033           const double P1 = 0.025422453185103;
1034           const double P2 = 0.058393137863189;
1035           const double P3 = 0.041425537809187;
1036           add(     A,     A, P1 ); 
1037           add( 1-2*A,     A, P1 );
1038           add(     A, 1-2*A, P1 );
1039           add(     B,     B, P2 ); 
1040           add( 1-2*B,     B, P2 );
1041           add(     B, 1-2*B, P2 );
1042           add(     C,     D, P3 );
1043           add(     D,     C, P3 );
1044           add( 1-C-D,     C, P3 );
1045           add( 1-C-D,     D, P3 );
1046           add(     C, 1-C-D, P3 );
1047           add(     D, 1-C-D, P3 ); break;
1048         }
1049         default:
1050           THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for TRIA, variant 1: "
1051                      <<nbGauss);
1052         }
1053       }
1054       else if ( variant == 2 ) {
1055         if (geom == NORM_TRI3) setRefCoords( TTria3a() );
1056         else                   setRefCoords( TTria6a() );
1057         switch ( nbGauss ) {
1058         case 1: {
1059           add( -1/3., -1/3., 2. ); break;
1060         }
1061         case 3: {
1062           add( -2/3.,  1/3., 2/3. );
1063           add( -2/3., -2/3., 2/3. );
1064           add(  1/3., -2/3., 2/3. ); break;
1065         }
1066         case 6: {
1067           const double P1 = 0.11169079483905, P2 = 0.0549758718227661;
1068           const double A  = 0.445948490915965, B = 0.091576213509771;
1069           add( 2*B-1, 1-4*B, 4*P2 ); 
1070           add( 2*B-1, 2*B-1, 4*P2 );
1071           add( 1-4*B, 2*B-1, 4*P2 );
1072           add( 1-4*A, 2*A-1, 4*P1 );
1073           add( 2*A-1, 1-4*A, 4*P1 ); 
1074           add( 2*A-1, 2*A-1, 4*P1 ); break;
1075         }
1076         default:
1077           THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for TRIA, variant 2: "
1078                      <<nbGauss);
1079         }
1080       }
1081       else if ( variant == 3 ) {
1082         if (geom == NORM_TRI3) setRefCoords( TTria3b() );
1083         else                   setRefCoords( TTria6b() );
1084         switch ( nbGauss ) {
1085         case 4: {
1086           add( 1/3., 1/3., -27/96 );
1087           add( 0.2 , 0.2 ,  25/96 );
1088           add( 0.6 , 0.2 ,  25/96 );
1089           add( 0.2 , 0.6 ,  25/96 ); break;
1090         }
1091         default:
1092           THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for TRIA, variant 3: "
1093                      <<nbGauss);
1094         }
1095       }
1096       break;
1097
1098     case NORM_QUAD4:
1099     case NORM_QUAD8:
1100       if ( variant == 1 ) {
1101         if (geom == NORM_QUAD4) setRefCoords( TQuad4b() );
1102         else                    setRefCoords( TQuad8b() );
1103         switch ( nbGauss ) {
1104         case 1: { // FPG1
1105           add(  0,  0,  4 ); break;
1106         }
1107         case 4: { // FPG4
1108           const double a = 1/sqrt(3.);
1109           add( -a, -a,  1 );
1110           add(  a, -a,  1 );
1111           add(  a,  a,  1 );
1112           add( -a,  a,  1 ); break;
1113         }
1114         case 5: { // out from the 3 specs
1115           const double a = 0.774596669241483;
1116           add( -a, -a,  0.5 );
1117           add(  a, -a,  0.5 );
1118           add(  a,  a,  0.5 );
1119           add( -a,  a,  0.5 );
1120           add(  0,  0,  2.0 ); break;
1121         }
1122         case 9: { // FPG9
1123           const double a = 0.774596669241483;
1124           add( -a, -a,  25/81. );
1125           add(  a, -a,  25/81. );
1126           add(  a,  a,  25/81. );
1127           add( -a,  a,  25/81. );
1128           add( 0., -a,  40/81. );
1129           add(  a, 0.,  40/81. );
1130           add( 0.,  a,  40/81. );
1131           add( -a, 0.,  40/81. );
1132           add( 0., 0.,  64/81. ); break;
1133         }
1134         default:
1135           THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for QUAD, variant 1: "
1136                      <<nbGauss);
1137         }
1138       }
1139       else if ( variant == 2 ) {
1140         if (geom == NORM_QUAD4) setRefCoords( TQuad4a() );
1141         else                    setRefCoords( TQuad8a() );
1142         switch ( nbGauss ) {
1143         case 4: {
1144           const double a = 1/sqrt(3.);
1145           add( -a,  a,  1 );
1146           add( -a, -a,  1 );
1147           add(  a, -a,  1 );
1148           add(  a,  a,  1 ); break;
1149         }
1150         case 9: {
1151           const double a = 0.774596669241483;
1152           add( -a,  a,  25/81. );
1153           add( -a, -a,  25/81. );
1154           add(  a, -a,  25/81. );
1155           add(  a,  a,  25/81. );
1156           add( -a, 0.,  40/81. );
1157           add( 0., -a,  40/81. );
1158           add(  a, 0.,  40/81. );
1159           add( 0.,  a,  40/81. );
1160           add( 0., 0.,  64/81. ); break;
1161         }
1162         default:
1163           THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for QUAD, variant 1: "
1164                      <<nbGauss);
1165         }
1166       }
1167       else if ( variant == 3 ) {
1168         if (geom == NORM_QUAD4) setRefCoords( TQuad4b() );
1169         else                    setRefCoords( TQuad8b() );
1170         switch ( nbGauss ) {
1171         case 4: {
1172           const double a = 3/sqrt(3.);
1173           add( -a, -a,  1 );
1174           add( -a,  a,  1 );
1175           add(  a, -a,  1 );
1176           add(  a,  a,  1 ); break;
1177         }
1178         case 9: {
1179           const double a = sqrt(3/5.), c1 = 5/9., c2 = 8/9.;
1180           const double c12 = c1*c2, c22 = c2*c2, c1c2 = c1*c2;
1181           add( -a, -a,  c12  );
1182           add( -a, 0.,  c1c2 );
1183           add( -a,  a,  c12  );
1184           add( 0., -a,  c1c2 );
1185           add( 0., 0.,  c22  );
1186           add( 0.,  a,  c1c2 );
1187           add(  a, -a,  c12  );
1188           add(  a, 0.,  c1c2 );
1189           add(  a,  a,  c12  ); break;
1190         }
1191         default:
1192           THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for QUAD, variant 3: "
1193                      <<nbGauss);
1194         }
1195       }
1196       break;
1197
1198     case NORM_TETRA4:
1199     case NORM_TETRA10:
1200       if (geom == NORM_TETRA4) setRefCoords( TTetra4a() );
1201       else                 setRefCoords( TTetra10a() );
1202       switch ( nbGauss ) {
1203       case 4: { // FPG4
1204         const double a = (5 - sqrt(5.))/20., b = (5 + 3*sqrt(5.))/20.;
1205         add(  a,  a,  a,  1/24. );
1206         add(  a,  a,  b,  1/24. );
1207         add(  a,  b,  a,  1/24. );
1208         add(  b,  a,  a,  1/24. ); break;
1209       }
1210       case 5: { // FPG5
1211         const double a = 0.25, b = 1/6., c = 0.5;
1212         add(  a,  a,  a, -2/15. );
1213         add(  b,  b,  b,  3/40. );
1214         add(  b,  b,  c,  3/40. );
1215         add(  b,  c,  b,  3/40. );
1216         add(  c,  b,  b,  3/40. ); break;
1217       }
1218       case 15: { // FPG15
1219         const double a = 0.25;
1220         const double b1 = (7 + sqrt(15.))/34., c1 = (13 + 3*sqrt(15.))/34., d = (5 - sqrt(15.))/20.;
1221         const double b2 = (7 - sqrt(15.))/34., c2 = (13 - 3*sqrt(15.))/34., e = (5 + sqrt(15.))/20.;
1222         const double P1 = (2665 - 14*sqrt(15.))/226800.;
1223         const double P2 = (2665 + 14*sqrt(15.))/226800.;
1224         add(  a,  a,  a,  8/405.);//_____
1225         add( b1, b1, b1,  P1    );
1226         add( b1, b1, c1,  P1    );
1227         add( b1, c1, b1,  P1    );
1228         add( c1, b1, b1,  P1    );//_____
1229         add( b2, b2, b2,  P2    );
1230         add( b2, b2, c2,  P2    );
1231         add( b2, c2, b2,  P2    );
1232         add( c2, b2, b2,  P2    );//_____
1233         add(  d,  d,  e,  5/567.);
1234         add(  d,  e,  d,  5/567.);
1235         add(  e,  d,  d,  5/567.);
1236         add(  d,  e,  e,  5/567.);
1237         add(  e,  d,  e,  5/567.);
1238         add(  e,  e,  d,  5/567.);
1239         break;
1240       }
1241       default:
1242         THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for TETRA: "<<nbGauss);
1243       }
1244       break;
1245
1246     case NORM_PYRA5:
1247     case NORM_PYRA13:
1248       if (geom == NORM_PYRA5) setRefCoords( TPyra5a() );
1249       else                setRefCoords( TPyra13a() );
1250       switch ( nbGauss ) {
1251       case 5: { // FPG5
1252         const double h1 = 0.1531754163448146;
1253         const double h2 = 0.6372983346207416;
1254         add(  .5,  0.,  h1,  2/15. );
1255         add(  0.,  .5,  h1,  2/15. );
1256         add( -.5,  0.,  h1,  2/15. );
1257         add(  0., -.5,  h1,  2/15. );
1258         add(  0.,  0.,  h2,  2/15. ); break;
1259       }
1260       case 6: { // FPG6
1261         const double p1 = 0.1024890634400000 ;
1262         const double p2 = 0.1100000000000000 ;
1263         const double p3 = 0.1467104129066667 ;
1264         const double a  = 0.5702963741068025 ;
1265         const double h1 = 0.1666666666666666 ;
1266         const double h2 = 0.08063183038464675;
1267         const double h3 = 0.6098484849057127 ;
1268         add(  a, 0.,  h1,  p1 );
1269         add( 0.,  a,  h1,  p1 );
1270         add( -a, 0.,  h1,  p1 );
1271         add( 0., -a,  h1,  p1 );
1272         add( 0., 0.,  h2,  p2 );
1273         add( 0., 0.,  h3,  p3 ); break;
1274       }
1275       case 27: { // FPG27
1276         const double a1  = 0.788073483; 
1277         const double b6  = 0.499369002; 
1278         const double b1  = 0.848418011; 
1279         const double c8  = 0.478508449; 
1280         const double c1  = 0.652816472; 
1281         const double d12 = 0.032303742; 
1282         const double d1  = 1.106412899;
1283         double z = 1/2., fz = b1/2*(1 - z);
1284         add(  0.,  0.,   z,  a1 ); // 1
1285         add(  fz,  fz,   z,  b6 ); // 2
1286         add( -fz,  fz,   z,  b6 ); // 3
1287         add( -fz, -fz,   z,  b6 ); // 4
1288         add(  fz, -fz,   z,  b6 ); // 5
1289         z = (1 - b1)/2.;
1290         add(  0.,  0.,   z,  b6 ); // 6
1291         z = (1 + b1)/2.;
1292         add(  0.,  0.,   z,  b6 ); // 7
1293         z = (1 - c1)/2.; fz = c1*(1 - z);
1294         add(  fz,  0.,   z,  c8 ); // 8
1295         add(  0.,  fz,   z,  c8 ); // 9
1296         add( -fz,  0.,   z,  c8 ); // 10
1297         add(  0., -fz,   z,  c8 ); // 11
1298         z = (1 + c1)/2.; fz = c1*(1 - z);
1299         add(  fz,  0.,   z,  c8 ); // 12
1300         add(  0.,  fz,   z,  c8 ); // 13
1301         add( -fz,  0.,   z,  c8 ); // 14
1302         add(  0., -fz,   z,  c8 ); // 15
1303         z = (1 - d1)/2., fz = d1/2*(1 - z);
1304         add(  fz,  fz,   z,  d12); // 16
1305         add( -fz,  fz,   z,  d12); // 17
1306         add( -fz, -fz,   z,  d12); // 18
1307         add(  fz, -fz,   z,  d12); // 19
1308         z = 1/2.; fz = d1*(1 - z);
1309         add(  fz,  0.,   z,  d12); // 20
1310         add(  0.,  fz,   z,  d12); // 21
1311         add( -fz,  0.,   z,  d12); // 22
1312         add(  0., -fz,   z,  d12); // 23
1313         z = (1 + d1)/2., fz = d1/2*(1 - z);
1314         add(  fz,  fz,   z,  d12); // 24
1315         add( -fz,  fz,   z,  d12); // 25
1316         add( -fz, -fz,   z,  d12); // 26
1317         add(  fz, -fz,   z,  d12); // 27
1318         break;
1319       }
1320       default:
1321         THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for PYRA: "<<nbGauss);
1322       }
1323       break;
1324     case NORM_PENTA6:
1325     case NORM_PENTA15:
1326       if (geom == NORM_PENTA6) setRefCoords( TPenta6a() );
1327       else                 setRefCoords( TPenta15a() );
1328       switch ( nbGauss ) {
1329       case 6: { // FPG6
1330         const double a = sqrt(3.)/3.;
1331         add( -a, .5, .5,  1/6. );
1332         add( -a, 0., .5,  1/6. );
1333         add( -a, .5, 0.,  1/6. );
1334         add(  a, .5, .5,  1/6. );
1335         add(  a, 0., .5,  1/6. );
1336         add(  a, .5, 0.,  1/6. ); break;
1337       }
1338       case 8: { // FPG8
1339         const double a = 0.577350269189626;
1340         add( -a, 1/3., 1/3., -27/96. );
1341         add( -a,  0.6,  0.2,  25/96. );
1342         add( -a,  0.2,  0.6,  25/96. );
1343         add( -a,  0.2,  0.2,  25/96. );
1344         add( +a, 1/3., 1/3., -27/96. );
1345         add( +a,  0.6,  0.2,  25/96. );
1346         add( +a,  0.2,  0.6,  25/96. );
1347         add( +a,  0.2,  0.2,  25/96. ); break;
1348       }
1349       case 21: { // FPG21
1350         const double d = sqrt(3/5.), c1 = 5/9., c2 = 8/9.; // d <=> alfa
1351         const double a = (6 + sqrt(15.))/21.;
1352         const double b = (6 - sqrt(15.))/21.;
1353         const double P1 = (155 + sqrt(15.))/2400.;
1354         const double P2 = (155 - sqrt(15.))/2400.;  //___
1355         add( -d,  1/3.,  1/3., c1*9/80. );//___
1356         add( -d,     a,     a, c1*P1    );
1357         add( -d, 1-2*a,     a, c1*P1    );
1358         add( -d,     a, 1-2*a, c1*P1    );//___
1359         add( -d,     b,     b, c1*P2    );
1360         add( -d, 1-2*b,     b, c1*P2    );
1361         add( -d,     b, 1-2*b, c1*P2    );//___
1362         add( 0.,  1/3.,  1/3., c2*9/80. );//___
1363         add( 0.,     a,     a, c2*P1    );
1364         add( 0., 1-2*a,     a, c2*P1    );
1365         add( 0.,     a, 1-2*a, c2*P1    );//___
1366         add( 0.,     b,     b, c2*P2    );
1367         add( 0., 1-2*b,     b, c2*P2    );
1368         add( 0.,     b, 1-2*b, c2*P2    );//___
1369         add(  d,  1/3.,  1/3., c1*9/80. );//___
1370         add(  d,     a,     a, c1*P1    );
1371         add(  d, 1-2*a,     a, c1*P1    );
1372         add(  d,     a, 1-2*a, c1*P1    );//___
1373         add(  d,     b,     b, c1*P2    );
1374         add(  d, 1-2*b,     b, c1*P2    );
1375         add(  d,     b, 1-2*b, c1*P2    );//___
1376         break;
1377       }
1378       default:
1379         THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for PENTA: " <<nbGauss);
1380       }
1381       break;
1382
1383     case NORM_HEXA8:
1384     case NORM_HEXA20:
1385       if (geom == NORM_HEXA8) setRefCoords( THexa8a() );
1386       else                    setRefCoords( THexa20a() );
1387       switch ( nbGauss ) {
1388       case 8: { // FPG8
1389         const double a = sqrt(3.)/3.;
1390         add( -a, -a, -a,  1. );
1391         add( -a, -a,  a,  1. );
1392         add( -a,  a, -a,  1. );
1393         add( -a,  a,  a,  1. );
1394         add(  a, -a, -a,  1. );
1395         add(  a, -a,  a,  1. );
1396         add(  a,  a, -a,  1. );
1397         add(  a,  a,  a,  1. ); break;
1398       }
1399       case 27: { // FPG27
1400         const double a = sqrt(3/5.), c1 = 5/9., c2 = 8/9.;
1401         const double c12 = c1*c1, c13 = c1*c1*c1;
1402         const double c22 = c2*c2, c23 = c2*c2*c2;
1403         add( -a, -a, -a,   c13  ); // 1
1404         add( -a, -a, 0., c12*c2 ); // 2
1405         add( -a, -a,  a,   c13  ); // 3
1406         add( -a, 0., -a, c12*c2 ); // 4
1407         add( -a, 0., 0., c1*c22 ); // 5
1408         add( -a, 0.,  a, c12*c2 ); // 6
1409         add( -a,  a, -a,   c13  ); // 7
1410         add( -a,  a, 0., c12*c2 ); // 8
1411         add( -a,  a,  a,   c13  ); // 9
1412         add( 0., -a, -a, c12*c2 ); // 10
1413         add( 0., -a, 0., c1*c22 ); // 11
1414         add( 0., -a,  a, c12*c2 ); // 12
1415         add( 0., 0., -a, c1*c22 ); // 13
1416         add( 0., 0., 0.,   c23  ); // 14
1417         add( 0., 0.,  a, c1*c22 ); // 15
1418         add( 0.,  a, -a, c12*c2 ); // 16
1419         add( 0.,  a, 0., c1*c22 ); // 17
1420         add( 0.,  a,  a, c12*c2 ); // 18
1421         add(  a, -a, -a,   c13  ); // 19
1422         add(  a, -a, 0., c12*c2 ); // 20
1423         add(  a, -a,  a,   c13  ); // 21
1424         add(  a, 0., -a, c12*c2 ); // 22
1425         add(  a, 0., 0., c1*c22 ); // 23
1426         add(  a, 0.,  a, c12*c2 ); // 24
1427         add(  a,  a, -a,   c13  ); // 25
1428         add(  a,  a, 0., c12*c2 ); // 26
1429         add(  a,  a,  a,   c13  ); // 27
1430         break;
1431       }
1432       default:
1433         THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Invalid nb of gauss points for PENTA: " <<nbGauss);
1434       }
1435       break;
1436
1437     default:
1438       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: unexpected EGeometrieElement: "<< geom);
1439     }
1440
1441     if ( myWeights.capacity() != myWeights.size() )
1442       THROW_IK_EXCEPTION("TGaussDef: Not all gauss points defined");
1443   }
1444 }
1445   
1446 //================================================================================
1447 /*!
1448  * \brief Return dimension for the given cell type
1449  */
1450 //================================================================================
1451
1452 unsigned SauvUtilities::getDimension( INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type )
1453 {
1454   return type == NORM_ERROR ? -1 : INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel( type ).getDimension();
1455 }
1456
1457 //================================================================================
1458 /*!
1459  * \brief Returns interlace array to transform a quadratic GIBI element to a MED one.
1460  *        i-th array item gives node index in GIBI connectivity for i-th MED node
1461  */
1462 //================================================================================
1463
1464 const int * SauvUtilities::getGibi2MedQuadraticInterlace( INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type )
1465 {
1466   static std::vector<const int*> conn;
1467   static const int hexa20 [] = {0,6,4,2, 12,18,16,14, 7,5,3,1, 19,17,15,13, 8,11,10,9};
1468   static const int penta15[] = {0,2,4, 9,11,13, 1,3,5, 10,12,14, 6,8,7};
1469   static const int pyra13 [] = {0,2,4,6, 12, 1,3,5,7, 8,9,10,11};
1470   static const int tetra10[] = {0,2,4, 9, 1,3,5, 6,7,8};
1471   static const int quad8  [] = {0,2,4,6, 1,3,5,7};
1472   static const int tria6  [] = {0,2,4, 1,3,5};
1473   static const int seg3   [] = {0,2,1};
1474   if ( conn.empty() )
1475   {
1476     conn.resize( MaxMedCellType + 1, 0 );
1477     conn[ NORM_HEXA20 ] = hexa20;
1478     conn[ NORM_PENTA15] = penta15;
1479     conn[ NORM_PYRA13 ] = pyra13;
1480     conn[ NORM_TETRA10] = tetra10;
1481     conn[ NORM_SEG3   ] = seg3;
1482     conn[ NORM_TRI6   ] = tria6;
1483     conn[ NORM_QUAD8  ] = quad8;
1484   }
1485   return conn[ type ];
1486 }
1487
1488 //================================================================================
1489 /*!
1490  * \brief Avoid coping sortedNodeIDs
1491  */
1492 //================================================================================
1493
1494 Cell::Cell(const Cell& ma)
1495   : _nodes(ma._nodes), _reverse(ma._reverse), _sortedNodeIDs(0), _number(ma._number)
1496 {
1497   if ( ma._sortedNodeIDs )
1498     {
1499       _sortedNodeIDs = new int[ _nodes.size() ];
1500       std::copy( ma._sortedNodeIDs, ma._sortedNodeIDs + _nodes.size(), _sortedNodeIDs );
1501     }
1502 }
1503
1504 //================================================================================
1505 /*!
1506  * \brief Rerturn the i-th link of face
1507  */
1508 //================================================================================
1509
1510 SauvUtilities::Link Cell::link(int i) const
1511 {
1512   int i2 = ( i + 1 ) % _nodes.size();
1513   if ( _reverse )
1514     return std::make_pair( _nodes[i2]->_number, _nodes[i]->_number );
1515   else
1516     return std::make_pair( _nodes[i]->_number, _nodes[i2]->_number );
1517 }
1518
1519 //================================================================================
1520 /*!
1521  * \brief creates if needed and return _sortedNodeIDs
1522  */
1523 //================================================================================
1524
1525 const TID* Cell::getSortedNodes() const
1526 {
1527   if ( !_sortedNodeIDs )
1528   {
1529     size_t l=_nodes.size();
1530     _sortedNodeIDs = new int[ l ];
1531
1532     for (size_t i=0; i!=l; ++i)
1533       _sortedNodeIDs[i]=_nodes[i]->_number;
1534     std::sort( _sortedNodeIDs, _sortedNodeIDs + l );
1535   }
1536   return _sortedNodeIDs;
1537 }
1538
1539 //================================================================================
1540 /*!
1541  * \brief Compare sorted ids of cell nodes
1542  */
1543 //================================================================================
1544
1545 bool Cell::operator< (const Cell& ma) const
1546 {
1547   if ( _nodes.size() == 1 )
1548     return _nodes[0] < ma._nodes[0];
1549
1550   const int* v1 = getSortedNodes();
1551   const int* v2 = ma.getSortedNodes();
1552   for ( const int* vEnd = v1 + _nodes.size(); v1 < vEnd; ++v1, ++v2 )
1553     if(*v1 != *v2)
1554       return *v1 < *v2;
1555   return false;
1556 }
1557
1558 //================================================================================
1559 /*!
1560  * \brief Dump a Cell
1561  */
1562 //================================================================================
1563
1564 std::ostream& SauvUtilities::operator<< (std::ostream& os, const SauvUtilities::Cell& ma)
1565 {
1566   os << "cell " << ma._number << " (" << ma._nodes.size() << " nodes) : < " << ma._nodes[0]->_number;
1567   for( size_t i=1; i!=ma._nodes.size(); ++i)
1568     os << ", " << ma._nodes[i]->_number;
1569 #ifdef _DEBUG_
1570   os << " > sortedNodes: ";
1571   if ( ma._sortedNodeIDs ) {
1572     os << "< ";
1573     for( size_t i=0; i!=ma._nodes.size(); ++i)
1574       os << ( i ? ", " : "" ) << ma._sortedNodeIDs[i];
1575     os << " >";
1576   }
1577   else {
1578     os << "NULL";
1579   }
1580 #endif
1581   return os;
1582 }
1583
1584 //================================================================================
1585 /*!
1586  * \brief Return nb of elements in the group
1587  */
1588 //================================================================================
1589
1590 int Group::size() const
1591 {
1592   int sizze = 0;
1593   if ( !_relocTable.empty() )
1594     sizze =  _relocTable.size();
1595   else if ( _medGroup )
1596     sizze = _medGroup->getNumberOfTuples();
1597   else if ( !_cells.empty() )
1598     sizze = _cells.size();
1599   else
1600     for ( size_t i = 0; i < _groups.size(); ++i )
1601       sizze += _groups[i]->size();
1602   return sizze;
1603 }
1604
1605 //================================================================================
1606 /*!
1607  * \brief Conver gibi element type to med one
1608  */
1609 //================================================================================
1610
1611 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType SauvUtilities::gibi2medGeom( size_t gibiType )
1612 {
1613   if ( gibiType < 1 || gibiType > NbGibiCellTypes )
1614     return NORM_ERROR;
1615
1616   return GibiTypeToMed[ gibiType - 1 ];
1617 }
1618
1619 //================================================================================
1620 /*!
1621  * \brief Conver med element type to gibi one
1622  */
1623 //================================================================================
1624
1625 int SauvUtilities::med2gibiGeom( INTERP_KERNEL::NormalizedCellType medGeomType )
1626 {
1627   for ( unsigned int i = 0; i < NbGibiCellTypes; i++ )
1628     if ( GibiTypeToMed[ i ] == medGeomType )
1629       return i + 1;
1630
1631   return -1;
1632 }
1633
1634 //================================================================================
1635 /*!
1636  * \brief Remember the file name
1637  */
1638 //================================================================================
1639
1640 FileReader::FileReader(const char* fileName):_fileName(fileName),_iRead(0),_nbToRead(0)
1641 {
1642 }
1643
1644 //================================================================================
1645 /*!
1646  * \brief Constructor of ASCII sauve file reader
1647  */
1648 //================================================================================
1649
1650 ASCIIReader::ASCIIReader(const char* fileName)
1651   :FileReader(fileName),
1652    _file(-1)
1653 {
1654 }
1655
1656 //================================================================================
1657 /*!
1658  * \brief Return true
1659  */
1660 //================================================================================
1661
1662 bool ASCIIReader::isASCII() const
1663 {
1664   return true;
1665 }
1666
1667 //================================================================================
1668 /*!
1669  * \brief Try to open an ASCII file
1670  */
1671 //================================================================================
1672
1673 bool ASCIIReader::open()
1674 {
1675 #ifdef WIN32
1676   _file = ::_open (_fileName.c_str(), _O_RDONLY|_O_BINARY);
1677 #else
1678   _file = ::open (_fileName.c_str(), O_RDONLY);
1679 #endif
1680   if (_file >= 0)
1681     {
1682       _start  = new char [GIBI_BufferSize]; // working buffer beginning
1683       //_tmpBuf = new char [GIBI_MaxOutputLen];
1684       _ptr    = _start;
1685       _eptr   = _start;
1686       _lineNb = 0;
1687     }
1688   else
1689     {
1690       //THROW_IK_EXCEPTION("Can't open file "<<_fileName << " fd: " << _file);
1691     }
1692   return (_file >= 0);
1693 }
1694
1695 //================================================================================
1696 /*!
1697  * \brief Close the file
1698  */
1699 //================================================================================
1700
1701 ASCIIReader::~ASCIIReader()
1702 {
1703   if (_file >= 0)
1704     {
1705       ::close (_file);
1706       if (_start != 0L)
1707         {
1708           delete [] _start;
1709           //delete [] _tmpBuf;
1710           _start = 0;
1711         }
1712       _file = -1;
1713     }
1714 }
1715
1716 //================================================================================
1717 /*!
1718  * \brief Return a next line of the file
1719  */
1720 //================================================================================
1721
1722 bool ASCIIReader::getNextLine (char* & line, bool raiseOEF /*= true*/ )
1723 {
1724   if ( getLine( line )) return true;
1725   if ( raiseOEF )
1726     THROW_IK_EXCEPTION("Unexpected EOF on ln "<<_lineNb);
1727   return false;
1728 }
1729
1730 //================================================================================
1731 /*!
1732  * \brief Read a next line of the file if necessary
1733  */
1734 //================================================================================
1735
1736 bool ASCIIReader::getLine(char* & line)
1737 {
1738   bool aResult = true;
1739   // Check the state of the buffer;
1740   // if there is too little left, read the next portion of data
1741   int nBytesRest = _eptr - _ptr;
1742   if (nBytesRest < GIBI_MaxOutputLen)
1743     {
1744       if (nBytesRest > 0)
1745         {
1746           // move the remaining portion to the buffer beginning
1747           for ( int i = 0; i < nBytesRest; ++i )
1748             _start[i] = _ptr[i];
1749           //memcpy (_tmpBuf, _ptr, nBytesRest);
1750           //memcpy (_start, _tmpBuf, nBytesRest);
1751         }
1752       else
1753         {
1754           nBytesRest = 0;
1755         }
1756       _ptr = _start;
1757       const int nBytesRead = ::read (_file,
1758                                      &_start [nBytesRest],
1759                                      GIBI_BufferSize - nBytesRest);
1760       nBytesRest += nBytesRead;
1761       _eptr = &_start [nBytesRest];
1762     }
1763   // Check the buffer for the end-of-line
1764   char * ptr = _ptr;
1765   while (true)
1766     {
1767       // Check for end-of-the-buffer, the ultimate criterion for termination
1768       if (ptr >= _eptr)
1769         {
1770           if (nBytesRest <= 0)
1771             aResult = false;
1772           else
1773             _eptr[-1] = '\0';
1774           break;
1775         }
1776       // seek the line-feed character
1777       if (ptr[0] == '\n')
1778         {
1779           if (ptr[-1] == '\r')
1780             ptr[-1] = '\0';
1781           ptr[0] = '\0';
1782           ++ptr;
1783           break;
1784         }
1785       ++ptr;
1786     }
1787   // Output the result
1788   line = _ptr;
1789   _ptr = ptr;
1790   _lineNb++;
1791
1792   return aResult;
1793 }
1794
1795 //================================================================================
1796 /*!
1797  * \brief Prepare for iterating over given nb of values
1798  *  \param nbToRead - nb of fields to read
1799  *  \param nbPosInLine - nb of fields in one line
1800  *  \param width - field width
1801  *  \param shift - shift from line beginning to the field start
1802  */
1803 //================================================================================
1804
1805 void ASCIIReader::init( int nbToRead, int nbPosInLine, int width, int shift /*= 0*/ )
1806 {
1807   _nbToRead    = nbToRead;
1808   _nbPosInLine = nbPosInLine;
1809   _width       = width;
1810   _shift       = shift;
1811   _iPos = _iRead = 0;
1812   if ( _nbToRead )
1813     {
1814       getNextLine( _curPos );
1815       _curPos = _curPos + _shift;
1816     }
1817   else
1818     {
1819       _curPos = 0;
1820     }
1821   _curLocale.clear();
1822 }
1823
1824 //================================================================================
1825 /*!
1826  * \brief Prepare for iterating over given nb of string values
1827  */
1828 //================================================================================
1829
1830 void ASCIIReader::initNameReading(int nbValues, int width /*= 8*/)
1831 {
1832   init( nbValues, 72 / ( width + 1 ), width, 1 );
1833 }
1834
1835 //================================================================================
1836 /*!
1837  * \brief Prepare for iterating over given nb of integer values
1838  */
1839 //================================================================================
1840
1841 void ASCIIReader::initIntReading(int nbValues)
1842 {
1843   init( nbValues, 10, 8 );
1844 }
1845
1846 //================================================================================
1847 /*!
1848  * \brief Prepare for iterating over given nb of real values
1849  */
1850 //================================================================================
1851
1852 void ASCIIReader::initDoubleReading(int nbValues)
1853 {
1854   init( nbValues, 3, 22 );
1855
1856   // Correction 2 of getDouble(): set "C" numeric locale to read numbers
1857   // with dot decimal point separator, as it is in SAUVE files
1858   _curLocale = setlocale(LC_NUMERIC, "C");
1859 }
1860
1861 //================================================================================
1862 /*!
1863  * \brief Return true if not all values have been read
1864  */
1865 //================================================================================
1866
1867 bool ASCIIReader::more() const
1868 {
1869   bool result = false;
1870   if ( _iRead < _nbToRead)
1871     {
1872       if ( _curPos ) result = true;
1873     }
1874   return result;
1875 }
1876
1877 //================================================================================
1878 /*!
1879  * \brief Go to the nex value
1880  */
1881 //================================================================================
1882
1883 void ASCIIReader::next()
1884 {
1885   if ( !more() )
1886     THROW_IK_EXCEPTION("SauvUtilities::ASCIIReader::next(): no more() values to read");
1887   ++_iRead;
1888   ++_iPos;
1889   if ( _iRead < _nbToRead )
1890     {
1891       if ( _iPos >= _nbPosInLine )
1892         {
1893           getNextLine( _curPos );
1894           _curPos = _curPos + _shift;
1895           _iPos = 0;
1896         }
1897       else
1898         {
1899           _curPos = _curPos + _width + _shift;
1900         }
1901     }
1902   else
1903     {
1904       _curPos = 0;
1905       if ( !_curLocale.empty() )
1906         {
1907           setlocale(LC_NUMERIC, _curLocale.c_str());
1908           _curLocale.clear();
1909         }
1910     }
1911 }
1912
1913 //================================================================================
1914 /*!
1915  * \brief Return the current integer value
1916  */
1917 //================================================================================
1918
1919 int ASCIIReader::getInt() const
1920 {
1921   // fix for two glued ints (issue 0021009):
1922   // Line nb    |   File contents
1923   // ------------------------------------------------------------------------------------
1924   // 53619905   |       1       2       6       8
1925   // 53619906   |                                                                SCALAIRE
1926   // 53619907   |    -63312600499       1       0       0       0      -2       0       2
1927   //   where -63312600499 is actualy -633 and 12600499
1928   char hold=_curPos[_width];
1929   _curPos[_width] = '\0';
1930   int result = atoi( _curPos );
1931   _curPos[_width] = hold;
1932   return result;
1933   //return atoi(str());
1934 }
1935
1936 //================================================================================
1937 /*!
1938  * \brief Return the current float value
1939  */
1940 //================================================================================
1941
1942 float ASCIIReader::getFloat() const
1943 {
1944   return getDouble();
1945 }
1946
1947 //================================================================================
1948 /*!
1949  * \brief Return the current double value
1950  */
1951 //================================================================================
1952
1953 double ASCIIReader::getDouble() const
1954 {
1955   //std::string aStr (_curPos);
1956
1957   // Correction: add missing 'E' specifier
1958   // int aPosStart = aStr.find_first_not_of(" \t");
1959   // if (aPosStart < (int)aStr.length()) {
1960   //   int aPosSign = aStr.find_first_of("+-", aPosStart + 1); // pass the leading symbol, as it can be a sign
1961   //   if (aPosSign < (int)aStr.length()) {
1962   //     if (aStr[aPosSign - 1] != 'e' && aStr[aPosSign - 1] != 'E')
1963   //       aStr.insert(aPosSign, "E", 1);
1964   //   }
1965   // }
1966
1967   // Different Correction (more optimal)
1968   // Sample:
1969   //  0.00000000000000E+00 -2.37822406690632E+01  6.03062748797469E+01
1970   //  7.70000000000000-100  7.70000000000000+100  7.70000000000000+100
1971   //0123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890123456789
1972   const size_t posE = 18;
1973   std::string aStr (_curPos);
1974   if ( aStr.find('E') < 0 && aStr.find('e') < 0 )
1975     {
1976       if ( aStr.size() < posE+1 )
1977         THROW_IK_EXCEPTION("No more doubles (line #" << lineNb() << ")");
1978       aStr.insert( posE, "E", 1 );
1979       return atof(aStr.c_str());
1980     }
1981   return atof( _curPos );
1982 }
1983
1984 //================================================================================
1985 /*!
1986  * \brief Return the current string value
1987  */
1988 //================================================================================
1989
1990 std::string ASCIIReader::getName() const
1991 {
1992   int len = _width;
1993   while (( _curPos[len-1] == ' ' || _curPos[len-1] == 0) && len > 0 )
1994     len--;
1995   return std::string( _curPos, len );
1996 }
1997
1998 //================================================================================
1999 /*!
2000  * \brief Constructor of a binary sauve file reader
2001  */
2002 //================================================================================
2003
2004 XDRReader::XDRReader(const char* fileName) :FileReader(fileName), _xdrs_file(NULL)
2005 {
2006 }
2007
2008 //================================================================================
2009 /*!
2010  * \brief Close the XDR sauve file
2011  */
2012 //================================================================================
2013
2014 XDRReader::~XDRReader()
2015 {
2016 #ifdef HAS_XDR  
2017   if ( _xdrs_file )
2018     {
2019       xdr_destroy((XDR*)_xdrs);
2020       free((XDR*)_xdrs);
2021       ::fclose(_xdrs_file);
2022       _xdrs_file = NULL;
2023     }
2024 #endif
2025 }
2026
2027 //================================================================================
2028 /*!
2029  * \brief Return false
2030  */
2031 //================================================================================
2032
2033 bool XDRReader::isASCII() const
2034 {
2035   return false;
2036 }
2037
2038 //================================================================================
2039 /*!
2040  * \brief Try to open an XRD file
2041  */
2042 //================================================================================
2043
2044 bool XDRReader::open()
2045 {
2046   bool xdr_ok = false;
2047 #ifdef HAS_XDR
2048 #ifdef WIN32
2049   if ((_xdrs_file = ::fopen(_fileName.c_str(), "rb")))
2050 #else 
2051   if ((_xdrs_file = ::fopen(_fileName.c_str(), "r")))
2052 #endif
2053     {
2054       _xdrs = (XDR *)malloc(sizeof(XDR));
2055       xdrstdio_create((XDR*)_xdrs, _xdrs_file, XDR_DECODE);
2056
2057       const int maxsize = 10;
2058       char icha[maxsize+1];
2059       char* icha2 = icha;
2060       if (( xdr_ok = xdr_string((XDR*)_xdrs, &icha2, maxsize)))
2061         {
2062           icha[maxsize] = '\0';
2063           xdr_ok = (strcmp(icha, "CASTEM XDR") == 0);
2064         }
2065       if ( !xdr_ok )
2066         {
2067           xdr_destroy((XDR*)_xdrs);
2068           free((XDR*)_xdrs);
2069           fclose(_xdrs_file);
2070           _xdrs_file = NULL;
2071         }
2072     }
2073 #endif
2074   return xdr_ok;
2075 }
2076
2077 //================================================================================
2078 /*!
2079  * \brief A stub
2080  */
2081 //================================================================================
2082
2083 bool XDRReader::getNextLine (char* &, bool )
2084 {
2085   return true;
2086 }
2087
2088 //================================================================================
2089 /*!
2090  * \brief Prepare for iterating over given nb of values
2091  *  \param nbToRead - nb of fields to read
2092  *  \param width - field width
2093  */
2094 //================================================================================
2095
2096 void XDRReader::init( int nbToRead, int width/*=0*/ )
2097 {
2098   if(_iRead < _nbToRead)
2099     {
2100       std::cout << "_iRead, _nbToRead : " << _iRead << " " << _nbToRead << std::endl;
2101       std::cout << "Unfinished iteration before new one !" << std::endl;
2102       THROW_IK_EXCEPTION("SauvUtilities::XDRReader::init(): Unfinished iteration before new one !");
2103     }
2104   _iRead    = 0;
2105   _nbToRead = nbToRead;
2106   _width    = width;
2107 }
2108
2109 //================================================================================
2110 /*!
2111  * \brief Prepare for iterating over given nb of string values
2112  */
2113 //================================================================================
2114
2115 void XDRReader::initNameReading(int nbValues, int width)
2116 {
2117   init( nbValues, width );
2118   _xdr_kind = _xdr_kind_char;
2119   if(nbValues*width)
2120     {
2121       unsigned int nels = nbValues*width;
2122       _xdr_cvals = (char*)malloc((nels+1)*sizeof(char));
2123 #ifdef HAS_XDR
2124       xdr_string((XDR*)_xdrs, &_xdr_cvals, nels);
2125 #endif
2126       _xdr_cvals[nels] = '\0';
2127     }
2128 }
2129
2130 //================================================================================
2131 /*!
2132  * \brief Prepare for iterating over given nb of integer values
2133  */
2134 //================================================================================
2135
2136 void XDRReader::initIntReading(int nbValues)
2137 {
2138   init( nbValues );
2139   _xdr_kind = _xdr_kind_int;
2140   if(nbValues)
2141     {
2142 #ifdef HAS_XDR
2143       unsigned int nels = nbValues;
2144       unsigned int actual_nels;
2145       _xdr_ivals = (int*)malloc(nels*sizeof(int));
2146       xdr_array((XDR*)_xdrs, (char **)&_xdr_ivals, &actual_nels, nels, sizeof(int), (xdrproc_t)xdr_int);
2147 #endif
2148     }
2149 }
2150
2151 //================================================================================
2152 /*!
2153  * \brief Prepare for iterating over given nb of real values
2154  */
2155 //================================================================================
2156
2157 void XDRReader::initDoubleReading(int nbValues)
2158 {
2159   init( nbValues );
2160   _xdr_kind = _xdr_kind_double;
2161   if(nbValues)
2162     {
2163 #ifdef HAS_XDR
2164       unsigned int nels = nbValues;
2165       unsigned int actual_nels;
2166       _xdr_dvals = (double*)malloc(nels*sizeof(double));
2167       xdr_array((XDR*)_xdrs, (char **)&_xdr_dvals, &actual_nels, nels, sizeof(double), (xdrproc_t)xdr_double);
2168 #endif
2169     }
2170 }
2171
2172 //================================================================================
2173 /*!
2174  * \brief Return true if not all values have been read
2175  */
2176 //================================================================================
2177
2178 bool XDRReader::more() const
2179 {
2180   return _iRead < _nbToRead;
2181 }
2182
2183 //================================================================================
2184 /*!
2185  * \brief Go to the nex value
2186  */
2187 //================================================================================
2188
2189 void XDRReader::next()
2190 {
2191   if ( !more() )
2192     THROW_IK_EXCEPTION("SauvUtilities::XDRReader::next(): no more() values to read");
2193
2194   ++_iRead;
2195   if ( _iRead < _nbToRead )
2196     {
2197     }
2198   else
2199     {
2200       if(_xdr_kind == _xdr_kind_char) free(_xdr_cvals);
2201       if(_xdr_kind == _xdr_kind_int) free(_xdr_ivals);
2202       if(_xdr_kind == _xdr_kind_double) free(_xdr_dvals);
2203       _xdr_kind = _xdr_kind_null;
2204     }
2205 }
2206
2207 //================================================================================
2208 /*!
2209  * \brief Return the current integer value
2210  */
2211 //================================================================================
2212
2213 int XDRReader::getInt() const
2214 {
2215   if(_iRead < _nbToRead)
2216     {
2217       return _xdr_ivals[_iRead];
2218     }
2219   else
2220     {
2221       int result = 0;
2222 #ifdef HAS_XDR
2223       xdr_int((XDR*)_xdrs, &result);
2224 #endif
2225       return result;
2226     }
2227 }
2228
2229 //================================================================================
2230 /*!
2231  * \brief Return the current float value
2232  */
2233 //================================================================================
2234
2235 float  XDRReader::getFloat() const
2236 {
2237   float result = 0;
2238 #ifdef HAS_XDR
2239   xdr_float((XDR*)_xdrs, &result);
2240 #endif
2241   return result;
2242 }
2243
2244 //================================================================================
2245 /*!
2246  * \brief Return the current double value
2247  */
2248 //================================================================================
2249
2250 double XDRReader::getDouble() const
2251 {
2252   if(_iRead < _nbToRead)
2253     {
2254       return _xdr_dvals[_iRead];
2255     }
2256   else
2257     {
2258       double result = 0;
2259 #ifdef HAS_XDR
2260       xdr_double((XDR*)_xdrs, &result);
2261 #endif
2262       return result;
2263     }
2264 }
2265
2266 //================================================================================
2267 /*!
2268  * \brief Return the current string value
2269  */
2270 //================================================================================
2271
2272 std::string XDRReader::getName() const
2273 {
2274   int len = _width;
2275   char* s = _xdr_cvals + _iRead*_width;
2276   while (( s[len-1] == ' ' || s[len-1] == 0) && len > 0 )
2277     len--;
2278   return std::string( s, len );
2279 }
2280
2281 //================================================================================
2282 /*!
2283  * \brief Throw an exception if not all needed data is present
2284  */
2285 //================================================================================
2286
2287 void IntermediateMED::checkDataAvailability() const
2288 {
2289   if ( _spaceDim == 0 )
2290     THROW_IK_EXCEPTION("Wrong file format"); // it is the first record in the sauve file
2291
2292   if ( _groups.empty() )
2293     THROW_IK_EXCEPTION("No elements have been read");
2294
2295   if ( _points.empty() || _nbNodes == 0 )
2296     THROW_IK_EXCEPTION("Nodes of elements are not filled");
2297
2298   if ( _coords.empty() )
2299     THROW_IK_EXCEPTION("Node coordinates are missing");
2300
2301   if ( _coords.size() < _nbNodes * _spaceDim )
2302     THROW_IK_EXCEPTION("Nodes and coordinates mismatch");
2303 }
2304
2305 //================================================================================
2306 /*!
2307  * \brief Safely adds a new Group
2308  */
2309 //================================================================================
2310
2311 Group* IntermediateMED::addNewGroup(std::vector<SauvUtilities::Group*>* groupsToFix)
2312 {
2313   if ( _groups.size() == _groups.capacity() ) // re-allocation would occure
2314     {
2315       std::vector<Group> newGroups( _groups.size() );
2316       newGroups.push_back( Group() );
2317
2318       for ( size_t i = 0; i < _groups.size(); ++i )
2319         {
2320           // avoid copying _cells
2321           std::vector<const Cell*> cells;
2322           cells.swap( _groups[i]._cells );
2323           newGroups[i] = _groups[i];
2324           newGroups[i]._cells.swap( cells );
2325
2326           // correct pointers to sub-groups
2327           for ( size_t j = 0; j < _groups[i]._groups.size(); ++j )
2328             {
2329               int iG = _groups[i]._groups[j] - &_groups[0];
2330               newGroups[i]._groups[j] = & newGroups[ iG ];
2331             }
2332         }
2333
2334       // fix given groups
2335       if ( groupsToFix )
2336         for ( size_t i = 0; i < groupsToFix->size(); ++i )
2337           if ( (*groupsToFix)[i] )
2338             {
2339               int iG = (*groupsToFix)[i] - &_groups[0];
2340               (*groupsToFix)[i] = & newGroups[ iG ];
2341             }
2342
2343       // fix field supports
2344       for ( int isNode = 0; isNode < 2; ++isNode )
2345         {
2346           std::vector<DoubleField* >& fields = isNode ? _nodeFields : _cellFields;
2347           for ( size_t i = 0; i < fields.size(); ++i )
2348             {
2349               if ( !fields[i] ) continue;
2350               for ( size_t j = 0; j < fields[i]->_sub.size(); ++j )
2351                 if ( fields[i]->_sub[j]._support )
2352                   {
2353                     int iG = fields[i]->_sub[j]._support - &_groups[0];
2354                     fields[i]->_sub[j]._support = & newGroups[ iG ];
2355                   }
2356               if ( fields[i]->_group )
2357                 {
2358                   int iG = fields[i]->_group - &_groups[0];
2359                   fields[i]->_group = & newGroups[ iG ];
2360                 }
2361             }
2362         }
2363
2364       _groups.swap( newGroups );
2365     }
2366   else
2367     {
2368       _groups.push_back( Group() );
2369     }
2370   return &_groups.back();
2371 }
2372
2373 //================================================================================
2374 /*!
2375  * \brief Makes ParaMEDMEM::MEDFileData from self
2376  */
2377 //================================================================================
2378
2379 ParaMEDMEM::MEDFileData* IntermediateMED::convertInMEDFileDS()
2380 {
2381   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr< MEDFileUMesh >  mesh   = makeMEDFileMesh();
2382   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr< MEDFileFields > fields = makeMEDFileFields(mesh);
2383
2384   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr< MEDFileMeshes > meshes = MEDFileMeshes::New();
2385   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr< MEDFileData >  medData = MEDFileData::New();
2386   meshes->pushMesh( mesh );
2387   medData->setMeshes( meshes );
2388   if ( fields ) medData->setFields( fields );
2389
2390   return medData.retn();
2391 }
2392
2393 //================================================================================
2394 /*!
2395  * \brief Creates ParaMEDMEM::MEDFileUMesh from its data
2396  */
2397 //================================================================================
2398
2399 ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* IntermediateMED::makeMEDFileMesh()
2400 {
2401   // check if all needed piles are present
2402   checkDataAvailability();
2403
2404   // set long names
2405   setGroupLongNames();
2406
2407   // fix element orientation
2408   if ( _spaceDim == 2 || _spaceDim == 1 )
2409     orientElements2D();
2410   else if ( _spaceDim == 3 )
2411     orientElements3D();
2412
2413   // process groups
2414   decreaseHierarchicalDepthOfSubgroups();
2415   eraseUselessGroups();
2416   //detectMixDimGroups();
2417
2418   // assign IDs
2419   _points.numberNodes();
2420   numberElements();
2421
2422   // make the med mesh
2423
2424   MEDFileUMesh* mesh = MEDFileUMesh::New();
2425
2426   DataArrayDouble *coords = getCoords();
2427   setConnectivity( mesh, coords );
2428   setGroups( mesh );
2429
2430   coords->decrRef();
2431
2432   if ( !mesh->getName().c_str() || strlen( mesh->getName().c_str() ) == 0 )
2433     mesh->setName( "MESH" );
2434
2435   return mesh;
2436 }
2437
2438 //================================================================================
2439 /*!
2440  * \brief Set long names to groups
2441  */
2442 //================================================================================
2443
2444 void IntermediateMED::setGroupLongNames()
2445 {
2446   // IMP 0020434: mapping GIBI names to MED names
2447   // set med names to objects (mesh, fields, support, group or other)
2448
2449   std::set<int> treatedGroups;
2450
2451   std::list<nameGIBItoMED>::iterator itGIBItoMED = _listGIBItoMED_mail.begin();
2452   for (; itGIBItoMED != _listGIBItoMED_mail.end(); itGIBItoMED++)
2453     {
2454       if ( (int)_groups.size() < itGIBItoMED->gibi_id ) continue;
2455
2456       SauvUtilities::Group & grp = _groups[itGIBItoMED->gibi_id - 1];
2457
2458       // if there are several names for grp then the 1st name is the name
2459       // of grp and the rest ones are names of groups referring grp (issue 0021311)
2460       const bool isRefName = !treatedGroups.insert( itGIBItoMED->gibi_id ).second;
2461       if ( !isRefName )
2462         {
2463           grp._name = _mapStrings[ itGIBItoMED->med_id ];
2464         }
2465       else if ( !grp._refNames.empty() && grp._refNames.back().empty() )
2466         {
2467           for ( unsigned i = 0; i < grp._refNames.size(); ++i )
2468             if ( grp._refNames[i].empty() )
2469               grp._refNames[i] = _mapStrings[ (*itGIBItoMED).med_id ];
2470         }
2471       else
2472         {
2473           grp._refNames.push_back( _mapStrings[ (*itGIBItoMED).med_id ]);
2474         }
2475     }
2476 }
2477
2478 //================================================================================
2479 /*!
2480  * \brief Set long names to fields
2481  */
2482 //================================================================================
2483
2484 void IntermediateMED::setFieldLongNames(std::set< std::string >& usedNames)
2485 {
2486   std::list<nameGIBItoMED>::iterator itGIBItoMED = _listGIBItoMED_cham.begin();
2487   for (; itGIBItoMED != _listGIBItoMED_cham.end(); itGIBItoMED++)
2488     {
2489       if (itGIBItoMED->gibi_pile == PILE_FIELD)
2490         {
2491           _cellFields[itGIBItoMED->gibi_id - 1]->_name = _mapStrings[itGIBItoMED->med_id];
2492         }
2493       else if (itGIBItoMED->gibi_pile == PILE_NODES_FIELD)
2494         {
2495           _nodeFields[itGIBItoMED->gibi_id - 1]->_name = _mapStrings[itGIBItoMED->med_id];
2496         }
2497     } // iterate on _listGIBItoMED_cham
2498
2499   for (itGIBItoMED =_listGIBItoMED_comp.begin(); itGIBItoMED != _listGIBItoMED_comp.end(); itGIBItoMED++)
2500     {
2501       std::string medName  = _mapStrings[itGIBItoMED->med_id];
2502       std::string gibiName = _mapStrings[itGIBItoMED->gibi_id];
2503
2504       bool name_found = false;
2505       for ( int isNodal = 0; isNodal < 2 && !name_found; ++isNodal )
2506         {
2507           std::vector<DoubleField* > & fields = isNodal ? _nodeFields : _cellFields;
2508           for ( size_t ifi = 0; ifi < fields.size() && !name_found; ifi++)
2509             {
2510               if (medName.find( fields[ifi]->_name + "." ) == 0 )
2511                 {
2512                   std::vector<DoubleField::_Sub_data>& aSubDs = fields[ifi]->_sub;
2513                   int nbSub = aSubDs.size();
2514                   for (int isu = 0; isu < nbSub; isu++)
2515                     for (int ico = 0; ico < aSubDs[isu].nbComponents(); ico++)
2516                       {
2517                         if (aSubDs[isu].compName(ico) == gibiName)
2518                           {
2519                             std::string medNameCompo = medName.substr( fields[ifi]->_name.size() + 1 );
2520                             fields[ifi]->_sub[isu].compName(ico) = medNameCompo;
2521                           }
2522                       }
2523                 }
2524             }
2525         }
2526     } // iterate on _listGIBItoMED_comp
2527
2528   for ( size_t i = 0; i < _nodeFields.size() ; i++)
2529     usedNames.insert( _nodeFields[i]->_name );
2530   for ( size_t i = 0; i < _cellFields.size() ; i++)
2531     usedNames.insert( _cellFields[i]->_name );
2532 }
2533
2534 //================================================================================
2535 /*!
2536  * \brief Decrease hierarchical depth of subgroups
2537  */
2538 //================================================================================
2539
2540 void IntermediateMED::decreaseHierarchicalDepthOfSubgroups()
2541 {
2542   for (size_t i=0; i!=_groups.size(); ++i)
2543   {
2544     Group& grp = _groups[i];
2545     for (size_t j = 0; j < grp._groups.size(); ++j )
2546     {
2547       Group & sub_grp = *grp._groups[j];
2548       if ( !sub_grp._groups.empty() )
2549       {
2550         // replace j with its 1st subgroup
2551         grp._groups[j] = sub_grp._groups[0];
2552         // push back the rest subs
2553         grp._groups.insert( grp._groups.end(), ++sub_grp._groups.begin(), sub_grp._groups.end() );
2554       }
2555     }
2556     // remove empty sub-_groups
2557     std::vector< Group* > newSubGroups;
2558     newSubGroups.reserve( grp._groups.size() );
2559     for (size_t j = 0; j < grp._groups.size(); ++j )
2560       if ( !grp._groups[j]->empty() )
2561         newSubGroups.push_back( grp._groups[j] );
2562     if ( newSubGroups.size() < grp._groups.size() )
2563       grp._groups.swap( newSubGroups );
2564   }
2565 }
2566
2567 //================================================================================
2568 /*!
2569  * \brief Erase _groups that won't be converted
2570  */
2571 //================================================================================
2572
2573 void IntermediateMED::eraseUselessGroups()
2574 {
2575   // propagate _isProfile=true to sub-groups of composite groups
2576   // for (size_t int i=0; i!=_groups.size(); ++i)
2577   // {
2578   //   Group* grp = _groups[i];
2579   //   if ( grp->_isProfile && !grp->_groups.empty() )
2580   //     for (size_t j = 0; j < grp->_groups.size(); ++j )
2581   //       grp->_groups[j]->_isProfile=true;
2582   // }
2583   std::set<Group*> groups2convert;
2584   // keep not named sub-groups of field supports
2585   for (size_t i=0; i!=_groups.size(); ++i)
2586   {
2587     Group& grp = _groups[i];
2588     if ( grp._isProfile && !grp._groups.empty() )
2589       groups2convert.insert( grp._groups.begin(), grp._groups.end() );
2590   }
2591
2592   // keep named groups and their subgroups
2593   for (size_t i=0; i!=_groups.size(); ++i)
2594   {
2595     Group& grp = _groups[i];
2596     if ( !grp._name.empty() && !grp.empty() )
2597     {
2598       groups2convert.insert( &grp );
2599       groups2convert.insert( grp._groups.begin(), grp._groups.end() );
2600     }
2601   }
2602   // erase groups that are not in groups2convert and not _isProfile
2603   for (size_t i=0; i!=_groups.size(); ++i)
2604   {
2605     Group* grp = &_groups[i];
2606     if ( !grp->_isProfile && !groups2convert.count( grp ) )
2607     {
2608       grp->_cells.clear();
2609       grp->_groups.clear();
2610     }
2611   }
2612 }
2613
2614 //================================================================================
2615 /*!
2616  * \brief Detect _groups of mixed dimension
2617  */
2618 //================================================================================
2619
2620 void IntermediateMED::detectMixDimGroups()
2621 {
2622   //hasMixedCells = false;
2623   for ( size_t i=0; i < _groups.size(); ++i )
2624   {
2625     Group& grp = _groups[i];
2626     if ( grp._groups.size() < 2 )
2627       continue;
2628
2629     // check if sub-groups have different dimension
2630     unsigned dim1 = getDim( &grp );
2631     for ( size_t j = 1; j  < grp._groups.size(); ++j )
2632     {
2633       unsigned dim2 = getDim( grp._groups[j] );
2634       if ( dim1 != dim2 )
2635       {
2636         grp._cells.clear();
2637         grp._groups.clear();
2638         if ( !grp._name.empty() )
2639           std::cout << "Erase a group with elements of different dim |" << grp._name << "|"<< std::endl;
2640         break;
2641       }
2642     }
2643   }
2644 }
2645
2646 //================================================================================
2647 /*!
2648  * \brief Fix connectivity of elements in 2D space
2649  */
2650 //================================================================================
2651
2652 void IntermediateMED::orientElements2D()
2653 {
2654   std::set<Cell>::const_iterator elemIt, elemEnd;
2655   std::vector< std::pair<int,int> > swapVec;
2656
2657   // ------------------------------------
2658   // fix connectivity of quadratic edges
2659   // ------------------------------------
2660   std::set<Cell>& quadEdges = _cellsByType[ INTERP_KERNEL::NORM_SEG3 ];
2661   if ( !quadEdges.empty() )
2662     {
2663       elemIt = quadEdges.begin(), elemEnd = quadEdges.end();
2664       for ( ; elemIt != elemEnd; ++elemIt )
2665         ConvertQuadratic( INTERP_KERNEL::NORM_SEG3, *elemIt );
2666     }
2667
2668   CellsByDimIterator faceIt( *this, 2 );
2669   while ( const std::set<Cell > * faces = faceIt.nextType() )
2670     {
2671       TCellType cellType = faceIt.type();
2672       bool isQuadratic = getGibi2MedQuadraticInterlace( cellType );
2673
2674       getReverseVector( cellType, swapVec );
2675
2676       // ------------------------------------
2677       // fix connectivity of quadratic faces
2678       // ------------------------------------
2679       if ( isQuadratic )
2680         for ( elemIt = faces->begin(), elemEnd = faces->end(); elemIt != elemEnd; elemIt++ )
2681           ConvertQuadratic( cellType, *elemIt );
2682
2683       // --------------------------
2684       // orient faces clockwise
2685       // --------------------------
2686       int iQuad = isQuadratic ? 2 : 1;
2687       for ( elemIt = faces->begin(), elemEnd = faces->end(); elemIt != elemEnd; elemIt++ )
2688         {
2689           // look for index of the most left node
2690           int iLeft = 0, iNode, nbNodes = elemIt->_nodes.size() / iQuad;
2691           double x, minX = nodeCoords( elemIt->_nodes[0] )[0];
2692           for ( iNode = 1; iNode < nbNodes; ++iNode )
2693             if (( x = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iNode ])[ 0 ]) < minX )
2694               minX = x, iLeft = iNode;
2695
2696           // indeces of the nodes neighboring the most left one
2697           int iPrev = ( iLeft - 1 < 0 ) ? nbNodes - 1 : iLeft - 1;
2698           int iNext = ( iLeft + 1 == nbNodes ) ? 0 : iLeft + 1;
2699           // find components of prev-left and left-next vectors
2700           double xP = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iPrev ])[ 0 ];
2701           double yP = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iPrev ])[ 1 ];
2702           double xN = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iNext ])[ 0 ];
2703           double yN = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iNext ])[ 1 ];
2704           double xL = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iLeft ])[ 0 ];
2705           double yL = nodeCoords( elemIt->_nodes[ iLeft ])[ 1 ];
2706           double xPL = xL - xP, yPL = yL - yP; // components of prev-left vector
2707           double xLN = xN - xL, yLN = yN - yL; // components of left-next vector
2708           // normalise y of the vectors
2709           double modPL = sqrt ( xPL * xPL + yPL * yPL );
2710           double modLN = sqrt ( xLN * xLN + yLN * yLN );
2711           if ( modLN > std::numeric_limits<double>::min() &&
2712                modPL > std::numeric_limits<double>::min() )
2713             {
2714               yPL /= modPL;
2715               yLN /= modLN;
2716               // summary direction of neighboring links must be positive
2717               bool clockwise = ( yPL + yLN > 0 );
2718               if ( !clockwise )
2719                 reverse( *elemIt, swapVec );
2720             }
2721         }
2722     }
2723 }
2724
2725 //================================================================================
2726 /*!
2727  * \brief Fix connectivity of elements in 3D space
2728  */
2729 //================================================================================
2730
2731 void IntermediateMED::orientElements3D()
2732 {
2733   // set _reverse flags of faces
2734   orientFaces3D();
2735
2736   // -----------------
2737   // fix connectivity
2738   // -----------------
2739
2740   std::set<Cell>::const_iterator elemIt, elemEnd;
2741   std::vector< std::pair<int,int> > swapVec;
2742
2743   for ( int dim = 1; dim <= 3; ++dim )
2744   {
2745     CellsByDimIterator cellsIt( *this, dim );
2746     while ( const std::set<Cell > * elems = cellsIt.nextType() )
2747     {
2748       TCellType cellType = cellsIt.type();
2749       bool isQuadratic = getGibi2MedQuadraticInterlace( cellType );
2750       getReverseVector( cellType, swapVec );
2751
2752       elemIt = elems->begin(), elemEnd = elems->end();
2753       for ( ; elemIt != elemEnd; elemIt++ )
2754       {
2755         // GIBI connectivity -> MED one
2756         if( isQuadratic )
2757           ConvertQuadratic( cellType, *elemIt );
2758
2759         // reverse faces
2760         if ( elemIt->_reverse )
2761           reverse ( *elemIt, swapVec );
2762       }
2763     }
2764   }
2765
2766   orientVolumes();
2767 }
2768
2769 //================================================================================
2770 /*!
2771  * \brief Orient equally (by setting _reverse flag) all connected faces in 3D space
2772  */
2773 //================================================================================
2774
2775 void IntermediateMED::orientFaces3D()
2776 {
2777   // fill map of links and their faces
2778   std::set<const Cell*> faces;
2779   std::map<const Cell*, Group*> fgm;
2780   std::map<Link, std::list<const Cell*> > linkFacesMap;
2781   std::map<Link, std::list<const Cell*> >::iterator lfIt, lfIt2;
2782
2783   for (size_t i=0; i!=_groups.size(); ++i)
2784     {
2785       Group& grp = _groups[i];
2786       if ( !grp._cells.empty() && getDimension( grp._cellType ) == 2 )
2787         for ( size_t j = 0; j < grp._cells.size(); ++j )
2788           if ( faces.insert( grp._cells[j] ).second )
2789             {
2790               for ( size_t k = 0; k < grp._cells[j]->_nodes.size(); ++k )
2791                 linkFacesMap[ grp._cells[j]->link( k ) ].push_back( grp._cells[j] );
2792               fgm.insert( std::make_pair( grp._cells[j], &grp ));
2793             }
2794     }
2795   // dump linkFacesMap
2796   //     for ( lfIt = linkFacesMap.begin(); lfIt!=linkFacesMap.end(); lfIt++) {
2797   //       cout<< "LINK: " << lfIt->first.first << "-" << lfIt->first.second << std::endl;
2798   //       std::list<const Cell*> & fList = lfIt->second;
2799   //       std::list<const Cell*>::iterator fIt = fList.begin();
2800   //       for ( ; fIt != fList.end(); fIt++ )
2801   //         cout << "\t" << **fIt << fgm[*fIt]->nom << std::endl;
2802   //     }
2803
2804   // Each oriented link must appear in one face only, else a face is reversed.
2805
2806   std::queue<const Cell*> faceQueue; /* the queue contains well oriented faces
2807                                      whose neighbors orientation is to be checked */
2808   bool manifold = true;
2809   while ( !linkFacesMap.empty() )
2810     {
2811       if ( faceQueue.empty() )
2812         {
2813           assert( !linkFacesMap.begin()->second.empty() );
2814           faceQueue.push( linkFacesMap.begin()->second.front() );
2815         }
2816       while ( !faceQueue.empty() )
2817         {
2818           const Cell* face = faceQueue.front();
2819           faceQueue.pop();
2820
2821           // loop on links of <face>
2822           for ( int i = 0; i < (int)face->_nodes.size(); ++i )
2823             {
2824               Link link = face->link( i );
2825               // find the neighbor faces
2826               lfIt = linkFacesMap.find( link );
2827               int nbFaceByLink = 0;
2828               std::list< const Cell* > ml;
2829               if ( lfIt != linkFacesMap.end() )
2830                 {
2831                   std::list<const Cell*> & fList = lfIt->second;
2832                   std::list<const Cell*>::iterator fIt = fList.begin();
2833                   assert( fIt != fList.end() );
2834                   for ( ; fIt != fList.end(); fIt++, nbFaceByLink++ )
2835                     {
2836                       ml.push_back( *fIt );
2837                       if ( *fIt != face ) // wrongly oriented neighbor face
2838                         {
2839                           const Cell* badFace = *fIt;
2840                           // reverse and remove badFace from linkFacesMap
2841                           for ( int j = 0; j < (int)badFace->_nodes.size(); ++j )
2842                             {
2843                               Link badlink = badFace->link( j );
2844                               if ( badlink == link ) continue;
2845                               lfIt2 = linkFacesMap.find( badlink );
2846                               if ( lfIt2 != linkFacesMap.end() )
2847                                 {
2848                                   std::list<const Cell*> & ff = lfIt2->second;
2849                                   std::list<const Cell*>::iterator lfIt3 = find( ff.begin(), ff.end(), badFace );
2850                                   // check if badFace has been found,
2851                                   // else we can't erase it
2852                                   // case of degenerated face in edge
2853                                   if (lfIt3 != ff.end())
2854                                     {
2855                                       ff.erase( lfIt3 );
2856                                       if ( ff.empty() )
2857                                         linkFacesMap.erase( lfIt2 );
2858                                     }
2859                                 }
2860                             }
2861                           badFace->_reverse = true; // reverse
2862                           //INFOS_MED( "REVERSE " << *badFace );
2863                           faceQueue.push( badFace );
2864                         }
2865                     }
2866                   linkFacesMap.erase( lfIt );
2867                 }
2868               // add good neighbors to the queue
2869               Link revLink( link.second, link.first );
2870               lfIt = linkFacesMap.find( revLink );
2871               if ( lfIt != linkFacesMap.end() )
2872                 {
2873                   std::list<const Cell*> & fList = lfIt->second;
2874                   std::list<const Cell*>::iterator fIt = fList.begin();
2875                   for ( ; fIt != fList.end(); fIt++, nbFaceByLink++ )
2876                     {
2877                       ml.push_back( *fIt );
2878                       if ( *fIt != face )
2879                         faceQueue.push( *fIt );
2880                     }
2881                   linkFacesMap.erase( lfIt );
2882                 }
2883               if ( nbFaceByLink > 2 )
2884                 {
2885                   if ( manifold )
2886                     {
2887                       std::list<const Cell*>::iterator ii = ml.begin();
2888                       std::cout << nbFaceByLink << " faces by 1 link:" << std::endl;
2889                       for( ; ii!= ml.end(); ii++ )
2890                         std::cout << "in sub-mesh <" << fgm[ *ii ]->_name << "> " << **ii << std::endl;
2891                     }
2892                   manifold = false;
2893                 }
2894             } // loop on links of the being checked face
2895         } // loop on the face queue
2896     } // while ( !linkFacesMap.empty() )
2897
2898   if ( !manifold )
2899     std::cout << " -> Non manifold mesh, faces orientation may be incorrect" << std::endl;
2900 }
2901
2902 //================================================================================
2903 /*!
2904  * \brief Orient volumes according to MED conventions:
2905  * normal of a bottom (first) face should be outside
2906  */
2907 //================================================================================
2908
2909 void IntermediateMED::orientVolumes()
2910 {
2911   std::set<Cell>::const_iterator elemIt, elemEnd;
2912   std::vector< std::pair<int,int> > swapVec;
2913
2914   CellsByDimIterator cellsIt( *this, 3 );
2915   while ( const std::set<Cell > * elems = cellsIt.nextType() )
2916     {
2917       TCellType cellType = cellsIt.type();
2918       elemIt = elems->begin(), elemEnd = elems->end();
2919       int nbBottomNodes = 0;
2920       switch ( cellType )
2921         {
2922         case NORM_TETRA4:
2923         case NORM_TETRA10:
2924         case NORM_PENTA6:
2925         case NORM_PENTA15:
2926           nbBottomNodes = 3; break;
2927         case NORM_PYRA5:
2928         case NORM_PYRA13:
2929         case NORM_HEXA8:
2930         case NORM_HEXA20:
2931           nbBottomNodes = 4; break;
2932         default: continue;
2933         }
2934       getReverseVector( cellType, swapVec );
2935
2936       for ( ; elemIt != elemEnd; elemIt++ )
2937         {
2938           // find a normal to the bottom face
2939           const double* n[4];
2940           n[0] = nodeCoords( elemIt->_nodes[0]); // 3 bottom nodes
2941           n[1] = nodeCoords( elemIt->_nodes[1]);
2942           n[2] = nodeCoords( elemIt->_nodes[2]);
2943           n[3] = nodeCoords( elemIt->_nodes[nbBottomNodes]); // a top node
2944           double vec01[3]; // vector n[0]-n[1]
2945           vec01[0] = n[1][0] - n[0][0];
2946           vec01[1] = n[1][1] - n[0][1];
2947           vec01[2] = n[1][2] - n[0][2];
2948           double vec02 [3]; // vector n[0]-n[2]
2949           vec02[0] = n[2][0] - n[0][0];
2950           vec02[1] = n[2][1] - n[0][1];
2951           vec02[2] = n[2][2] - n[0][2];
2952           double normal [3]; // vec01 ^ vec02
2953           normal[0] = vec01[1] * vec02[2] - vec01[2] * vec02[1];
2954           normal[1] = vec01[2] * vec02[0] - vec01[0] * vec02[2];
2955           normal[2] = vec01[0] * vec02[1] - vec01[1] * vec02[0];
2956           // check if the 102 angle is convex
2957           if ( nbBottomNodes > 3 )
2958             {
2959               const double* n3 = nodeCoords( elemIt->_nodes[nbBottomNodes-1] );// last bottom node
2960               double vec03 [3];  // vector n[0]-n3
2961               vec03[0] = n3[0] - n[0][0];
2962               vec03[1] = n3[1] - n[0][1];
2963               vec03[2] = n3[2] - n[0][2];
2964               if ( fabs( normal[0]+normal[1]+normal[2] ) <= std::numeric_limits<double>::max() ) // vec01 || vec02
2965                 {
2966                   normal[0] = vec01[1] * vec03[2] - vec01[2] * vec03[1]; // vec01 ^ vec03
2967                   normal[1] = vec01[2] * vec03[0] - vec01[0] * vec03[2];
2968                   normal[2] = vec01[0] * vec03[1] - vec01[1] * vec03[0];
2969                 }
2970               else
2971                 {
2972                   double vec [3]; // normal ^ vec01
2973                   vec[0] = normal[1] * vec01[2] - normal[2] * vec01[1];
2974                   vec[1] = normal[2] * vec01[0] - normal[0] * vec01[2];
2975                   vec[2] = normal[0] * vec01[1] - normal[1] * vec01[0];
2976                   double dot2 = vec[0]*vec03[0] + vec[1]*vec03[1] + vec[2]*vec03[2]; // vec*vec03
2977                   if ( dot2 < 0 ) // concave -> reverse normal
2978                     {
2979                       normal[0] *= -1;
2980                       normal[1] *= -1;
2981                       normal[2] *= -1;
2982                     }
2983                 }
2984             }
2985           // direction from top to bottom
2986           double tbDir[3];
2987           tbDir[0] = n[0][0] - n[3][0];
2988           tbDir[1] = n[0][1] - n[3][1];
2989           tbDir[2] = n[0][2] - n[3][2];
2990
2991           // compare 2 directions: normal and top-bottom
2992           double dot = normal[0]*tbDir[0] + normal[1]*tbDir[1] + normal[2]*tbDir[2];
2993           if ( dot < 0. ) // need reverse
2994             reverse( *elemIt, swapVec );
2995
2996         } // loop on volumes of one geometry
2997     } // loop on 3D geometry types
2998
2999 }
3000
3001 //================================================================================
3002 /*!
3003  * \brief Assign new IDs to nodes by skipping not used nodes and return their number
3004  */
3005 //================================================================================
3006
3007 int NodeContainer::numberNodes()
3008 {
3009   int id = 1;
3010   for ( size_t i = 0; i < _nodes.size(); ++i )
3011     for ( size_t j = 0; j < _nodes[i].size(); ++j )
3012       if ( _nodes[i][j].isUsed() )
3013         _nodes[i][j]._number = id++;
3014   return id-1;
3015 }
3016
3017
3018 //================================================================================
3019 /*!
3020  * \brief Assign new IDs to elements
3021  */
3022 //================================================================================
3023
3024 void IntermediateMED::numberElements()
3025 {
3026   std::set<Cell>::const_iterator elemIt, elemEnd;
3027
3028   // numbering _cells of type NORM_POINT1 by node number
3029   {
3030     const std::set<Cell>& points = _cellsByType[ INTERP_KERNEL::NORM_POINT1 ];
3031     elemIt = points.begin(), elemEnd = points.end();
3032     for ( ; elemIt != elemEnd; ++elemIt )
3033       elemIt->_number = elemIt->_nodes[0]->_number;
3034   }
3035
3036   // numbering 1D-3D _cells
3037   for ( int dim = 1; dim <= 3; ++dim )
3038     {
3039       // check if re-numeration is needed (to try to keep elem oreder as in sauve file )
3040       bool ok = true, renumEntity = false;
3041       CellsByDimIterator cellsIt( *this, dim );
3042       int prevNbElems = 0;
3043       while ( const std::set<Cell> * typeCells = cellsIt.nextType() )
3044         {
3045           TID minNumber = std::numeric_limits<TID>::max(), maxNumber = 0;
3046           for ( elemIt = typeCells->begin(), elemEnd = typeCells->end(); elemIt!=elemEnd; ++elemIt)
3047             {
3048               if ( elemIt->_number < minNumber ) minNumber = elemIt->_number;
3049               if ( elemIt->_number > maxNumber ) maxNumber = elemIt->_number;
3050             }
3051           TID typeSize = typeCells->size();
3052           if ( typeSize != maxNumber - minNumber + 1 )
3053             ok = false;
3054           if ( prevNbElems != 0 ) {
3055             if ( minNumber == 1 )
3056               renumEntity = true;
3057             else if ( prevNbElems+1 != (int)minNumber )
3058               ok = false;
3059           }
3060           prevNbElems += typeSize;
3061         }
3062
3063       if ( ok && renumEntity ) // each geom type was numerated separately
3064         {
3065           cellsIt.init( dim );
3066           prevNbElems = cellsIt.nextType()->size(); // no need to renumber the first type
3067           while ( const std::set<Cell> * typeCells = cellsIt.nextType() )
3068             {
3069               for ( elemIt = typeCells->begin(), elemEnd = typeCells->end(); elemIt!=elemEnd; ++elemIt)
3070                 elemIt->_number += prevNbElems;
3071               prevNbElems += typeCells->size();
3072             }
3073         }
3074       if ( !ok )
3075         {
3076           int cellID=1;
3077           cellsIt.init( dim );
3078           while ( const std::set<Cell> * typeCells = cellsIt.nextType() )
3079             for ( elemIt = typeCells->begin(), elemEnd = typeCells->end(); elemIt!=elemEnd; ++elemIt)
3080               elemIt->_number = cellID++;
3081         }
3082     }
3083 }
3084
3085 //================================================================================
3086 /*!
3087  * \brief Creates coord array
3088  */
3089 //================================================================================
3090
3091 ParaMEDMEM::DataArrayDouble * IntermediateMED::getCoords()
3092 {
3093   DataArrayDouble* coordArray = DataArrayDouble::New();
3094   coordArray->alloc( _nbNodes, _spaceDim );
3095   double * coordPrt = coordArray->getPointer();
3096   for ( int i = 0, nb = _points.size(); i < nb; ++i )
3097     {
3098       Node* n = getNode( i+1 );
3099       if ( n->isUsed() )
3100         {
3101           const double* nCoords = nodeCoords( n );
3102           std::copy( nCoords, nCoords+_spaceDim, coordPrt );
3103           coordPrt += _spaceDim;
3104         }
3105     }
3106   return coordArray;
3107 }
3108
3109 //================================================================================
3110 /*!
3111  * \brief Sets connectivity of elements to the mesh
3112  *  \param mesh - mesh to fill in
3113  *  \param coords - coordinates that must be shared by all meshes of different dim
3114  */
3115 //================================================================================
3116
3117 void IntermediateMED::setConnectivity( ParaMEDMEM::MEDFileUMesh*    mesh,
3118                                        ParaMEDMEM::DataArrayDouble* coords )
3119 {
3120   int meshDim = 0;
3121
3122   mesh->setCoords( coords );
3123
3124   std::set<Cell>::const_iterator elemIt, elemEnd;
3125   for ( int dim = 3; dim > 0; --dim )
3126   {
3127     CellsByDimIterator dimCells( *this, dim );
3128
3129     int nbOfCells = 0;
3130     while ( const std::set<Cell > * cells = dimCells.nextType() )
3131       nbOfCells += cells->size();
3132     if ( nbOfCells == 0 )
3133       continue;
3134
3135     if ( !meshDim ) meshDim = dim;
3136
3137     MEDCouplingUMesh* dimMesh = MEDCouplingUMesh::New();
3138     dimMesh->setCoords( coords );
3139     dimMesh->setMeshDimension( dim );
3140     dimMesh->allocateCells( nbOfCells );
3141
3142     int prevNbCells = 0;
3143     dimCells.init( dim );
3144     while ( const std::set<Cell > * cells = dimCells.nextType() )
3145       {
3146         // fill connectivity array to take into account order of elements in the sauv file
3147         const int nbCellNodes = cells->begin()->_nodes.size();
3148         std::vector< TID > connectivity( cells->size() * nbCellNodes );
3149         int * nodalConnOfCell;
3150         for ( elemIt = cells->begin(), elemEnd = cells->end(); elemIt != elemEnd; ++elemIt )
3151           {
3152             const Cell& cell = *elemIt;
3153             const int index = cell._number - 1 - prevNbCells;
3154             nodalConnOfCell = &connectivity[ index * nbCellNodes ];
3155             if ( cell._reverse )
3156               for ( int i = nbCellNodes-1; i >= 0; --i )
3157                 *nodalConnOfCell++ = cell._nodes[i]->_number - 1;
3158             else
3159               for ( int i = 0; i < nbCellNodes; ++i )
3160                 *nodalConnOfCell++ = cell._nodes[i]->_number - 1;
3161           }
3162         prevNbCells += cells->size();
3163
3164         // fill dimMesh
3165         TCellType cellType = dimCells.type();
3166         nodalConnOfCell = &connectivity[0];
3167         for ( size_t i = 0; i < cells->size(); ++i, nodalConnOfCell += nbCellNodes )
3168           dimMesh->insertNextCell( cellType, nbCellNodes, nodalConnOfCell );
3169       }
3170     dimMesh->finishInsertingCells();
3171     mesh->setMeshAtLevel( dim - meshDim, dimMesh );
3172     dimMesh->decrRef();
3173   }
3174 }
3175
3176 //================================================================================
3177 /*!
3178  * \brief Fill in the mesh with groups
3179  *  \param mesh - mesh to fill in
3180  */
3181 //================================================================================
3182
3183 void IntermediateMED::setGroups( ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* mesh )
3184 {
3185   bool isMeshNameSet = false;
3186   const int meshDim = mesh->getMeshDimension();
3187   for ( int dim = 0; dim <= meshDim; ++dim )
3188     {
3189       const int meshDimRelToMaxExt = ( dim == 0 ? 1 : dim - meshDim );
3190
3191       std::vector<const DataArrayInt *> medGroups;
3192       std::vector<MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > refGroups;
3193       for ( size_t i = 0; i < _groups.size(); ++i )
3194         {
3195           Group& grp = _groups[i];
3196           if ( (int)getDim( &grp ) != dim &&
3197                grp._groups.empty() ) // to allow groups on diff dims
3198             continue;
3199           // convert only named groups or field supports
3200           if ( grp.empty() || (grp._name.empty() && !grp._isProfile ))
3201             continue;
3202           //if ( grp._medGroup ) continue; // already converted
3203
3204           // sort cells by ID and remember their initial order in the group
3205           TCellToOrderMap cell2order;
3206           unsigned orderInGroup = 0;
3207           std::vector< Group* > groupVec;
3208           if ( grp._groups.empty() ) groupVec.push_back( & grp );
3209           else                       groupVec = grp._groups;
3210           for ( size_t iG = 0; iG < groupVec.size(); ++iG )
3211             {
3212               Group* aG = groupVec[ iG ];
3213               if ( (int)getDim( aG ) != dim )
3214                 continue;
3215               for ( size_t iC = 0; iC < aG->_cells.size(); ++iC )
3216                 cell2order.insert( cell2order.end(), std::make_pair( aG->_cells[iC], orderInGroup++ ));
3217             }
3218           if ( cell2order.empty() )
3219             continue;
3220           bool isSelfIntersect = ( orderInGroup != cell2order.size() );
3221           if ( isSelfIntersect ) // self intersecting group
3222             {
3223               std::ostringstream msg;
3224               msg << "Self intersecting sub-mesh: id = " << i+1
3225                   << ", name = |" << grp._name << "|" << std::endl
3226                   << " nb unique elements = " << cell2order.size() << std::endl
3227                   << " total nb elements  = " << orderInGroup;
3228               if ( grp._isProfile )
3229                 {
3230                   THROW_IK_EXCEPTION( msg.str() );
3231                 }
3232               else
3233                 {
3234                   std::cout << msg.str() << std::endl;
3235                 }
3236             }
3237           // create a med group
3238           grp._medGroup = DataArrayInt::New();
3239           grp._medGroup->setName( grp._name.c_str() );
3240           grp._medGroup->alloc( cell2order.size(), /*nbOfCompo=*/1 );
3241           int * idsPtr = grp._medGroup->getPointer();
3242           TCellToOrderMap::iterator cell2orderIt, cell2orderEnd = cell2order.end();
3243           for ( cell2orderIt = cell2order.begin(); cell2orderIt != cell2orderEnd; ++cell2orderIt )
3244             *idsPtr++ = (*cell2orderIt).first->_number - 1;
3245
3246           // try to set the mesh name
3247           if ( !isMeshNameSet &&
3248                dim == meshDim &&
3249                !grp._name.empty() &&
3250                grp.size() == mesh->getSizeAtLevel( meshDimRelToMaxExt ))
3251             {
3252               mesh->setName( grp._name.c_str() );
3253               isMeshNameSet = true;
3254             }
3255           if ( !grp._name.empty() )
3256             {
3257               medGroups.push_back( grp._medGroup );
3258             }
3259           // set relocation table
3260           setRelocationTable( &grp, cell2order );
3261
3262           // Issue 0021311. Use case: a gibi group has references (recorded in pile 1)
3263           // and several names (pile 27) refer (pile 10) to this group.
3264           // We create a copy of this group per each named reference
3265           for ( unsigned iRef = 0 ; iRef < grp._refNames.size(); ++iRef )
3266             if ( !grp._refNames[ iRef ].empty() )
3267               {
3268                 refGroups.push_back( grp._medGroup->deepCpy() );
3269                 refGroups.back()->setName( grp._refNames[ iRef ].c_str() );
3270                 medGroups.push_back( refGroups.back() );
3271               }
3272         }
3273       mesh->setGroupsAtLevel( meshDimRelToMaxExt, medGroups );
3274     }
3275 }
3276
3277 //================================================================================
3278 /*!
3279  * \brief Return true if the group is on all elements and return its relative dimension
3280  */
3281 //================================================================================
3282
3283 bool IntermediateMED::isOnAll( const Group* grp, int & dimRel ) const
3284 {
3285   int dim = getDim( grp );
3286
3287   int nbElems = 0;
3288   if ( dim == 0 )
3289     {
3290       nbElems = _nbNodes;
3291       dimRel  = 0;
3292     }
3293   else
3294     {
3295       CellsByDimIterator dimCells( *this, dim );
3296       while ( const std::set<Cell > * cells = dimCells.nextType() )
3297         nbElems += cells->size();
3298
3299       int meshDim = 3;
3300       for ( ; meshDim > 0; --meshDim )
3301         {
3302           dimCells.init( meshDim );
3303           if ( dimCells.nextType() )
3304             break;
3305         }
3306       dimRel = dim - meshDim;
3307     }
3308
3309   bool onAll = ( nbElems == grp->size() );
3310   return onAll;
3311 }
3312
3313 //================================================================================
3314 /*!
3315  * \brief Makes fields from own data
3316  */
3317 //================================================================================
3318
3319 ParaMEDMEM::MEDFileFields * IntermediateMED::makeMEDFileFields(ParaMEDMEM::MEDFileUMesh* mesh)
3320 {
3321   if ( _nodeFields.empty() && _cellFields.empty() ) return 0;
3322
3323   // set long names
3324   std::set< std::string > usedFieldNames;
3325   setFieldLongNames(usedFieldNames);
3326
3327   MEDFileFields* fields = MEDFileFields::New();
3328
3329   for ( size_t i = 0; i < _nodeFields.size(); ++i )
3330     setFields( _nodeFields[i], fields, mesh, i+1, usedFieldNames );
3331
3332   for ( size_t i = 0; i < _cellFields.size(); ++i )
3333     setFields( _cellFields[i], fields, mesh, i+1, usedFieldNames );
3334
3335   return fields;
3336 }
3337
3338 //================================================================================
3339 /*!
3340  * \brief Make med fields from a SauvUtilities::DoubleField
3341  */
3342 //================================================================================
3343
3344 void IntermediateMED::setFields( SauvUtilities::DoubleField* fld,
3345                                  ParaMEDMEM::MEDFileFields*  medFields,
3346                                  ParaMEDMEM::MEDFileUMesh*   mesh,
3347                                  const TID                   castemID,
3348                                  std::set< std::string >&    usedFieldNames)
3349 {
3350   bool sameNbGauss = true;
3351   if ( !fld || !fld->isMedCompatible( sameNbGauss )) return;
3352
3353   if ( !sameNbGauss )
3354     fld->splitSubWithDiffNbGauss();
3355
3356   // if ( !fld->hasCommonSupport() ):
3357   //     each sub makes MEDFileFieldMultiTS
3358   // else:
3359   //     unite several subs into a MEDCouplingFieldDouble
3360
3361   const bool uniteSubs = fld->hasCommonSupport() && sameNbGauss;
3362   if ( !uniteSubs )
3363     std::cout << "Castem field #" << castemID << " <" << fld->_name
3364               << "> is incompatible with MED format, so we split it into several fields:" << std::endl;
3365
3366   for ( size_t iSub = 0; iSub < fld->_sub.size(); )
3367     {
3368       // set field name
3369       if ( !uniteSubs || fld->_name.empty() )
3370         makeFieldNewName( usedFieldNames, fld );
3371
3372       // allocate values
3373       DataArrayDouble * values = DataArrayDouble::New();
3374       values->alloc( fld->getNbTuples(iSub), fld->_sub[iSub].nbComponents() );
3375
3376       // set values
3377       double * valPtr = values->getPointer();
3378       if ( uniteSubs )
3379         {
3380           int nbElems = fld->_group->size();
3381           for ( int elemShift = 0; elemShift < nbElems && iSub < fld->_sub.size(); )
3382             elemShift += fld->setValues( valPtr, iSub++, elemShift );
3383           setTS( fld, values, medFields, mesh );
3384         }
3385       else
3386         {
3387           fld->setValues( valPtr, iSub );
3388           setTS( fld, values, medFields, mesh, iSub++ );
3389
3390           std::cout << fld->_name << " with compoments";
3391           for ( size_t i = 0; i < (size_t)fld->_sub[iSub-1].nbComponents(); ++i )
3392             std::cout << " " << fld->_sub[iSub-1]._comp_names[ i ];
3393           std::cout << std::endl;
3394         }
3395     }
3396 }
3397
3398 //================================================================================
3399 /*!
3400  * \brief Store value array of a field into med fields
3401  */
3402 //================================================================================
3403
3404 void IntermediateMED::setTS( SauvUtilities::DoubleField*  fld,
3405                              ParaMEDMEM::DataArrayDouble* values,
3406                              ParaMEDMEM::MEDFileFields*   medFields,
3407                              ParaMEDMEM::MEDFileUMesh*    mesh,
3408                              const int                    iSub)
3409 {
3410   // treat a field support
3411   const Group* support = fld->getSupport( iSub );
3412   int dimRel;
3413   const bool onAll = isOnAll( support, dimRel );
3414   if ( !onAll && support->_name.empty() )
3415     {
3416       const_cast<Group*>(support)->_name += "PFL_" + fld->_name;
3417       support->_medGroup->setName( support->_name.c_str() );
3418     }
3419
3420   // make and fill a time-stamp
3421
3422   MEDCouplingFieldDouble * timeStamp = MEDCouplingFieldDouble::New( fld->getMedType( iSub ),
3423                                                                     fld->getMedTimeDisc() );
3424   timeStamp->setName( fld->_name.c_str() );
3425   timeStamp->setDescription( fld->_description.c_str() );
3426   // set the mesh
3427   if ( onAll )
3428     {
3429       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr
3430         < MEDCouplingUMesh > dimMesh = mesh->getMeshAtLevel( dimRel );
3431       timeStamp->setMesh( dimMesh );
3432     }
3433   else if ( timeStamp->getTypeOfField() == ParaMEDMEM::ON_NODES )
3434     {
3435       DataArrayDouble * coo = mesh->getCoords();
3436       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr
3437         <DataArrayDouble> subCoo = coo->selectByTupleId(support->_medGroup->begin(),
3438                                                         support->_medGroup->end());
3439       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr< MEDCouplingUMesh > nodeSubMesh =
3440         MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords( subCoo );
3441       timeStamp->setMesh( nodeSubMesh );
3442     }
3443   else
3444     {
3445       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr
3446         < MEDCouplingUMesh > dimMesh = mesh->getMeshAtLevel( dimRel );
3447       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr
3448         <MEDCouplingMesh> subMesh = dimMesh->buildPart(support->_medGroup->begin(),
3449                                                        support->_medGroup->end());
3450       timeStamp->setMesh( subMesh);
3451     }
3452   // set values
3453   for ( size_t i = 0; i < (size_t)fld->_sub[iSub].nbComponents(); ++i )
3454     values->setInfoOnComponent( i, fld->_sub[iSub]._comp_names[ i ].c_str() );
3455   timeStamp->setArray( values );
3456   values->decrRef();
3457   // set gauss points
3458   if ( timeStamp->getTypeOfField() == ParaMEDMEM::ON_GAUSS_PT )
3459     {
3460       TGaussDef gaussDef( fld->_sub[iSub]._support->_cellType,
3461                           fld->_sub[iSub].nbGauss() );
3462       timeStamp->setGaussLocalizationOnType( fld->_sub[iSub]._support->_cellType,
3463                                              gaussDef.myRefCoords,
3464                                              gaussDef.myCoords,
3465                                              gaussDef.myWeights );
3466     }
3467   // get a field to add the time-stamp
3468   bool isNewMedField = false;
3469   if ( !fld->_curMedField || fld->_name != fld->_curMedField->getName() )
3470     {
3471       fld->_curMedField = MEDFileFieldMultiTS::New();
3472       isNewMedField = true;
3473     }
3474
3475   // set an order
3476   const int nbTS = fld->_curMedField->getNumberOfTS();
3477   if ( nbTS > 0 )
3478     timeStamp->setOrder( nbTS );
3479
3480   // add the time-stamp
3481   timeStamp->checkCoherency();
3482   if ( onAll )
3483     fld->_curMedField->appendFieldNoProfileSBT( timeStamp );
3484   else
3485     fld->_curMedField->appendFieldProfile( timeStamp, mesh, dimRel, support->_medGroup );
3486   timeStamp->decrRef();
3487
3488   if ( isNewMedField ) // timeStamp must be added before this
3489     {
3490       medFields->pushField( fld->_curMedField );
3491     }
3492 }
3493
3494 //================================================================================
3495 /*!
3496  * \brief Make a new unique name for a field
3497  */
3498 //================================================================================
3499
3500 void IntermediateMED::makeFieldNewName(std::set< std::string >&    usedNames,
3501                                        SauvUtilities::DoubleField* fld )
3502 {
3503   std::string base = fld->_name;
3504   if ( base.empty() )
3505     {
3506       base = "F_";
3507     }
3508   else
3509     {
3510       std::string::size_type pos = base.rfind('_');
3511       if ( pos != std::string::npos )
3512         base = base.substr( 0, pos+1 );
3513       else
3514         base += '_';
3515     }
3516
3517   int i = 1;
3518   do
3519     {
3520       fld->_name = base + SauvUtilities::toString( i++ );
3521     }
3522   while( !usedNames.insert( fld->_name ).second );
3523 }
3524
3525 //================================================================================
3526 /*!
3527  * \brief Split sub-components with different nb of gauss points into several sub-components
3528  *  \param [in,out] fld - a field to split if necessary
3529  */
3530 //================================================================================
3531
3532 void DoubleField::splitSubWithDiffNbGauss()
3533 {
3534   for ( size_t iSub = 0; iSub < _sub.size(); ++iSub )
3535     {
3536       if ( _sub[iSub].isSameNbGauss() ) continue;
3537
3538       _sub.insert( _sub.begin() + iSub + 1, 1, _Sub_data() );
3539       _Sub_data & subToSplit = _sub[iSub];
3540       _Sub_data & subNew     = _sub[iSub+1];
3541       size_t iDiff = 1;
3542       while ( subToSplit._nb_gauss[ 0 ] == subToSplit._nb_gauss[ iDiff ] )
3543         ++iDiff;
3544       subNew._support = subToSplit._support;
3545       subNew._comp_names.assign( subToSplit._comp_names.begin() + iDiff,
3546                                  subToSplit._comp_names.end() );
3547       subNew._nb_gauss.assign  ( subToSplit._nb_gauss.begin() + iDiff,
3548                                  subToSplit._nb_gauss.end() );
3549       subToSplit._comp_names.resize( iDiff );
3550       subToSplit._nb_gauss.resize  ( iDiff );
3551     }
3552 }
3553
3554 //================================================================================
3555 /*!
3556  * \brief Return a vector ready to fill in
3557  */
3558 //================================================================================
3559
3560 std::vector< double >& DoubleField::addComponent( int nb_values )
3561 {
3562   _comp_values.push_back( std::vector< double >() );
3563   std::vector< double >& res = _comp_values.back();
3564   res.resize( nb_values );
3565   return res;
3566 }
3567
3568 DoubleField::~DoubleField()
3569 {
3570   if(_curMedField)
3571     _curMedField->decrRef();
3572 }
3573
3574 //================================================================================
3575 /*!
3576  * \brief Returns a supporting group
3577  */
3578 //================================================================================
3579
3580 const Group* DoubleField::getSupport( const int iSub ) const
3581 {
3582   return _group ? _group : _sub[iSub]._support;
3583 }
3584
3585 //================================================================================
3586 /*!
3587  * \brief Return true if each sub-component is a time stamp
3588  */
3589 //================================================================================
3590
3591 bool DoubleField::isMultiTimeStamps() const
3592 {
3593   if ( _sub.size() < 2 )
3594     return false;
3595   bool sameSupports = true;
3596   Group* grpp1 = _sub[0]._support;// grpp NOT grp because XDR under Windows defines grp...
3597   for ( size_t i = 1; i < _sub.size() && sameSupports; ++i )
3598     sameSupports = ( grpp1 == _sub[i]._support );
3599
3600   return sameSupports;
3601 }
3602
3603 //================================================================================
3604 /*!
3605  * \brief True if the field can be converted into the med field
3606  */
3607 //================================================================================
3608
3609 bool DoubleField::isMedCompatible(bool& sameNbGauss) const
3610 {
3611   for ( size_t iSub = 0; iSub < _sub.size(); ++iSub )
3612     {
3613       if ( !getSupport(iSub) || !getSupport(iSub)->_medGroup )
3614         THROW_IK_EXCEPTION("SauvReader INTERNAL ERROR: NULL field support");
3615
3616       sameNbGauss = true;
3617       if ( !_sub[iSub].isSameNbGauss() )
3618         {
3619           std::cout << "Field <" << _name << "> : different nb of gauss points in components" << std::endl;
3620           sameNbGauss = false;
3621           //return false;
3622         }
3623     }
3624   return true;
3625 }
3626
3627 //================================================================================
3628 /*!
3629  * \brief return true if all sub-components has same components and same nbGauss
3630  */
3631 //================================================================================
3632
3633 bool DoubleField::hasSameComponentsBySupport() const
3634 {
3635   std::vector< _Sub_data >::const_iterator sub_data = _sub.begin();
3636   const _Sub_data& first_sub_data = *sub_data;
3637   for ( ++sub_data ; sub_data != _sub.end(); ++sub_data )
3638   {
3639     if ( first_sub_data._comp_names != sub_data->_comp_names )
3640       return false; // diff names of components
3641
3642     if ( first_sub_data._nb_gauss != sub_data->_nb_gauss &&
3643          first_sub_data._support->_cellType == sub_data->_support->_cellType)
3644       return false; // diff nb of gauss points on same cell type
3645   }
3646   return true;
3647 }
3648
3649 //================================================================================
3650 /*!
3651  * \brief Return type of MEDCouplingFieldDouble
3652  */
3653 //================================================================================
3654
3655 ParaMEDMEM::TypeOfField DoubleField::getMedType( const int iSub ) const
3656 {
3657   using namespace INTERP_KERNEL;
3658
3659   const Group* grp = hasCommonSupport() ? _group : _sub[iSub]._support;
3660   if ( _sub[iSub].nbGauss() > 1 )
3661     {
3662       const CellModel& cm = CellModel::GetCellModel( _sub[iSub]._support->_cellType );
3663       return (int) cm.getNumberOfNodes() == _sub[iSub].nbGauss() ? ON_GAUSS_NE : ON_GAUSS_PT;
3664     }
3665   else
3666     {
3667       return getDim( grp ) == 0 ? ON_NODES : ON_CELLS;
3668     }
3669 }
3670
3671 //================================================================================
3672 /*!
3673  * \brief Return TypeOfTimeDiscretization
3674  */
3675 //================================================================================
3676
3677 ParaMEDMEM::TypeOfTimeDiscretization DoubleField::getMedTimeDisc() const
3678 {
3679   return ONE_TIME;
3680   // NO_TIME = 4,
3681   // ONE_TIME = 5,
3682   // LINEAR_TIME = 6,
3683   // CONST_ON_TIME_INTERVAL = 7
3684 }
3685
3686 //================================================================================
3687 /*!
3688  * \brief Return nb tuples to be used to allocate DataArrayDouble
3689  */
3690 //================================================================================
3691
3692 int DoubleField::getNbTuples( const int iSub ) const
3693 {
3694   int nb = 0;
3695   if ( hasCommonSupport() && !_group->_groups.empty() )
3696     for ( size_t i = 0; i < _group->_groups.size(); ++i )
3697       nb += _sub[i].nbGauss() * _sub[i]._support->size();
3698   else
3699     nb = _sub[iSub].nbGauss() * getSupport(iSub)->size();
3700   return nb;
3701 }
3702
3703 //================================================================================
3704 /*!
3705  * \brief Store values of a sub-component and return nb of elements in the iSub
3706  */
3707 //================================================================================
3708
3709 int DoubleField::setValues( double * valPtr, const int iSub, const int elemShift ) const
3710 {
3711   // find values for iSub
3712   int iComp = 0;
3713   for ( int iS = 0; iS < iSub; ++iS )
3714     iComp += _sub[iS].nbComponents();
3715   const std::vector< double > * compValues = &_comp_values[ iComp ];
3716
3717   // Set values
3718
3719   const std::vector< unsigned >& relocTable = getSupport( iSub )->_relocTable;
3720
3721   const int nbElems      = _sub[iSub]._support->size();
3722   const int nbGauss      = _sub[iSub].nbGauss();
3723   const int nbComponents = _sub[iSub].nbComponents();
3724   const int nbValsByElem = nbComponents * nbGauss;
3725
3726   // check nb values
3727   int nbVals = 0;
3728   for ( iComp = 0; iComp < nbComponents; ++iComp )
3729     nbVals += compValues[iComp].size();
3730   const bool isConstField = ( nbVals == nbComponents ); // one value per component (issue 22321)
3731   if ( !isConstField && nbVals != nbElems * nbValsByElem )
3732     THROW_IK_EXCEPTION("SauvMedConvertor.cxx: support size mismatches field size");
3733
3734   // compute nb values in previous subs
3735   int valsShift = 0;
3736   for ( int iS = iSub-1, shift = elemShift; shift > 0; --iS)
3737     {
3738       int nbE = _sub[iS]._support->size();
3739       shift -= nbE;
3740       valsShift += nbE * _sub[iS].nbComponents() * _sub[iS].nbGauss();
3741     }
3742
3743   if ( isConstField )
3744     for ( int iE = 0; iE < nbElems; ++iE )
3745       {
3746         int iMed = valsShift + nbValsByElem * ( relocTable.empty() ? iE : relocTable[iE+elemShift]-elemShift );
3747         for ( iComp = 0; iComp < nbComponents; ++iComp )
3748           valPtr[ iMed + iComp ] = compValues[iComp][ 0 ];
3749       }
3750   else
3751     for ( int iE = 0; iE < nbElems; ++iE )
3752       {
3753         int iMed = valsShift + nbValsByElem * ( relocTable.empty() ? iE : relocTable[iE+elemShift]-elemShift );
3754         for ( iComp = 0; iComp < nbComponents; ++iComp )
3755           for ( int iG = 0; iG < nbGauss; ++iG )
3756             valPtr[ iMed + iG * nbComponents + iComp ] = compValues[iComp][ iE * nbGauss + iG ];
3757       }
3758   return nbElems;
3759 }
3760
3761 //================================================================================
3762 /*!
3763  * \brief Destructor of IntermediateMED
3764  */
3765 //================================================================================
3766
3767 IntermediateMED::~IntermediateMED()
3768 {
3769   for ( size_t i = 0; i < _nodeFields.size(); ++i )
3770     if ( _nodeFields[i] )
3771       delete _nodeFields[i];
3772   _nodeFields.clear();
3773
3774   for ( size_t i = 0; i < _cellFields.size(); ++i )
3775     if ( _cellFields[i] )
3776       delete _cellFields[i];
3777   _cellFields.clear();
3778
3779   for ( size_t i = 0; i < _groups.size(); ++i )
3780     if ( _groups[i]._medGroup )
3781       _groups[i]._medGroup->decrRef();
3782 }
3783
3784 //================================================================================
3785 /*!
3786  * \brief CellsByDimIterator constructor
3787  */
3788 CellsByDimIterator::CellsByDimIterator( const IntermediateMED & medi, int dimm)
3789 {
3790   myImed = & medi;
3791   init( dimm );
3792 }
3793 /*!
3794  * \brief Initialize iteration on cells of given dimention
3795  */
3796 void CellsByDimIterator::init(const int  dimm)
3797 {
3798   myCurType = -1;
3799   myTypeEnd = INTERP_KERNEL::NORM_HEXA20 + 1;
3800   myDim = dimm;
3801 }
3802 /*!
3803  * \brief return next set of Cell's of required dimension
3804  */
3805 const std::set< Cell > * CellsByDimIterator::nextType()
3806 {
3807   while ( ++myCurType < myTypeEnd )
3808     if ( !myImed->_cellsByType[myCurType].empty() && ( myDim < 0 || dim(false) == myDim ))
3809       return & myImed->_cellsByType[myCurType];
3810   return 0;
3811 }
3812 /*!
3813  * \brief return dimension of cells returned by the last or further next()
3814  */
3815 int CellsByDimIterator::dim(const bool last) const
3816 {
3817   int typp = myCurType;
3818   if ( !last )
3819     while ( typp < myTypeEnd && myImed->_cellsByType[typp].empty() )
3820       ++typp;
3821   return typp < myTypeEnd ? getDimension( TCellType( typp )) : 4;
3822 }
3823 // END CellsByDimIterator ========================================================
3824