src/MEDLoader/MEDFileMeshLL.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDFileMeshLL.hxx"
  22 #include "MEDFileMesh.hxx"
  23 #include "MEDLoaderBase.hxx"
  24 #include "MEDFileMeshReadSelector.hxx"
  25
  26 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  27
  28 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
  29 #include "CellModel.hxx"
  30
  31 #include <set>
  32
  33 extern med_geometry_type typmai[MED_N_CELL_FIXED_GEO];
  34 extern INTERP_KERNEL::NormalizedCellType typmai2[MED_N_CELL_FIXED_GEO];
  35 extern med_geometry_type typmainoeud[1];
  36
  37 using namespace ParaMEDMEM;
  38
  39 MEDFileMeshL2::MEDFileMeshL2():_name(MED_NAME_SIZE),_description(MED_COMMENT_SIZE),_univ_name(MED_LNAME_SIZE),_dt_unit(MED_LNAME_SIZE)
  40 {
  41 }
  42
  43 std::size_t MEDFileMeshL2::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  44 {
  45   return 0;
  46 }
  47
  48 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshL2::getDirectChildrenWithNull() const
  49 {
  50   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
  51 }
  52
  53 int MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(med_idt fid, const std::string& mname, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& dt, int& it, std::string& dtunit1)
  54 {
  55   med_mesh_type type_maillage;
  56   char maillage_description[MED_COMMENT_SIZE+1];
  57   char dtunit[MED_LNAME_SIZE+1];
  58   med_int spaceDim,dim;
  59   char nommaa[MED_NAME_SIZE+1];
  60   med_int n=MEDnMesh(fid);
  61   bool found=false;
  62   int ret=-1;
  63   med_sorting_type stype;
  64   std::vector<std::string> ms;
  65   int nstep;
  66   med_axis_type axistype;
  67   for(int i=0;i<n && !found;i++)
  68     {
  69       int naxis=MEDmeshnAxis(fid,i+1);
  70       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisname=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
  71       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
  72       MEDmeshInfo(fid,i+1,nommaa,&spaceDim,&dim,&type_maillage,maillage_description,dtunit,&stype,&nstep,&axistype,axisname,axisunit);
  73       dtunit1=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(dtunit,sizeof(dtunit));
  74       std::string cur=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(nommaa,sizeof(nommaa));
  75       ms.push_back(cur);
  76       if(cur==mname)
  77         {
  78           found=true;
  79           ret=i+1;
  80         }
  81     }
  82   if(!found)
  83     {
  84       std::ostringstream oss;
  85       oss << "No such meshname (" << mname <<  ") in file ! Must be in : ";
  86       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss,", "));
  87       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
  88     }
  89   switch(type_maillage)
  90   {
  91     case MED_UNSTRUCTURED_MESH:
  92       meshType=UNSTRUCTURED;
  93       break;
  94     case MED_STRUCTURED_MESH:
  95       {
  96         med_grid_type gt;
  97         MEDmeshGridTypeRd(fid,mname.c_str(),&gt);
  98         switch(gt)
  99         {
 100           case MED_CARTESIAN_GRID:
 101             meshType=CARTESIAN;
 102             break;
 103           case MED_CURVILINEAR_GRID:
 104             meshType=CURVE_LINEAR;
 105             break;
 106           default:
 107             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getMeshIdFromName : unrecognized structured mesh type ! Supported are :\n - cartesian\n - curve linear\n");
 108         }
 109         break;
 110       }
 111     default:
 112       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getMeshIdFromName : unrecognized mesh type !");
 113   }
 114   med_int numdt,numit;
 115   med_float dtt;
 116   MEDmeshComputationStepInfo(fid,mname.c_str(),1,&numdt,&numit,&dtt);
 117   dt=numdt; it=numit;
 118   return ret;
 119 }
 120
 121 double MEDFileMeshL2::CheckMeshTimeStep(med_idt fid, const std::string& mName, int nstep, int dt, int it)
 122 {
 123   bool found=false;
 124   med_int numdt,numit;
 125   med_float dtt;
 126   std::vector< std::pair<int,int> > p(nstep);
 127   for(int i=0;i<nstep;i++)
 128     {
 129       MEDmeshComputationStepInfo(fid,mName.c_str(),i+1,&numdt,&numit,&dtt);
 130       p[i]=std::make_pair<int,int>(numdt,numit);
 131       found=(numdt==dt) && (numit==numit);
 132     }
 133   if(!found)
 134     {
 135       std::ostringstream oss; oss << "No such iteration=" << dt << ",order=" << it << " numbers found for mesh '" << mName << "' ! ";
 136       oss << "Possibilities are : ";
 137       for(int i=0;i<nstep;i++)
 138         oss << "(" << p[i].first << "," << p[i].second << "), ";
 139       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 140     }
 141   return dtt;
 142 }
 143
 144 std::vector<std::string> MEDFileMeshL2::getAxisInfoOnMesh(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& nstep, int& Mdim)
 145 {
 146   med_mesh_type type_maillage;
 147   med_int spaceDim;
 148   med_sorting_type stype;
 149   med_axis_type axistype;
 150   int naxis=MEDmeshnAxis(fid,mId);
 151   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> nameTmp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
 152   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisname=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
 153   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
 154   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> univTmp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
 155   if(MEDmeshInfo(fid,mId,nameTmp,&spaceDim,&Mdim,&type_maillage,_description.getPointer(),_dt_unit.getPointer(),
 156       &stype,&nstep,&axistype,axisname,axisunit)!=0)
 157     throw INTERP_KERNEL::Exception("A problem has been detected when trying to get info on mesh !");
 158   MEDmeshUniversalNameRd(fid,nameTmp,_univ_name.getPointer());
 159   switch(type_maillage)
 160   {
 161     case MED_UNSTRUCTURED_MESH:
 162       meshType=UNSTRUCTURED;
 163       break;
 164     case MED_STRUCTURED_MESH:
 165       {
 166         med_grid_type gt;
 167         MEDmeshGridTypeRd(fid,mName.c_str(),&gt);
 168         switch(gt)
 169         {
 170           case MED_CARTESIAN_GRID:
 171             meshType=CARTESIAN;
 172             break;
 173           case MED_CURVILINEAR_GRID:
 174             meshType=CURVE_LINEAR;
 175             break;
 176           default:
 177             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getAxisInfoOnMesh : unrecognized structured mesh type ! Supported are :\n - cartesian\n - curve linear\n");
 178         }
 179         break;
 180       }
 181     default:
 182       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getMeshIdFromName : unrecognized mesh type !");
 183   }
 184   //
 185   std::vector<std::string> infosOnComp(naxis);
 186   for(int i=0;i<naxis;i++)
 187     {
 188       std::string info=MEDLoaderBase::buildUnionUnit(((char *)axisname)+i*MED_SNAME_SIZE,MED_SNAME_SIZE,((char *)axisunit)+i*MED_SNAME_SIZE,MED_SNAME_SIZE);
 189       infosOnComp[i]=info;
 190     }
 191   return infosOnComp;
 192 }
 193
 194 void MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(med_idt fid, const std::string& meshName, std::map<std::string,int>& fams, std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 195 {
 196   if(mrs && !(mrs->isCellFamilyFieldReading() || mrs->isNodeFamilyFieldReading()))
 197     return ;
 198   char nomfam[MED_NAME_SIZE+1];
 199   med_int numfam;
 200   int nfam=MEDnFamily(fid,meshName.c_str());
 201   for(int i=0;i<nfam;i++)
 202     {
 203       int ngro=MEDnFamilyGroup(fid,meshName.c_str(),i+1);
 204       med_int natt=MEDnFamily23Attribute(fid,meshName.c_str(),i+1);
 205       INTERP_KERNEL::AutoPtr<med_int> attide=new med_int[natt];
 206       INTERP_KERNEL::AutoPtr<med_int> attval=new med_int[natt];
 207       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> attdes=new char[MED_COMMENT_SIZE*natt+1];
 208       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> gro=new char[MED_LNAME_SIZE*ngro+1];
 209       MEDfamily23Info(fid,meshName.c_str(),i+1,nomfam,attide,attval,attdes,&numfam,gro);
 210       std::string famName=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(nomfam,MED_NAME_SIZE);
 211       fams[famName]=numfam;
 212       for(int j=0;j<ngro;j++)
 213         {
 214           std::string groupname=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
 215           grps[groupname].push_back(famName);
 216         }
 217     }
 218 }
 219
 220 void MEDFileMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(med_idt fid, const std::string& mname, const std::map<std::string,int>& fams, const std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, int tooLongStrPol)
 221 {
 222   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++)
 223     {
 224       std::vector<std::string> grpsOfFam;
 225       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=grps.begin();it1!=grps.end();it1++)
 226         {
 227           if(std::find((*it1).second.begin(),(*it1).second.end(),(*it).first)!=(*it1).second.end())
 228             grpsOfFam.push_back((*it1).first);
 229         }
 230       int ngro=grpsOfFam.size();
 231       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> groName=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE*ngro);
 232       int i=0;
 233       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOfFam.begin();it2!=grpsOfFam.end();it2++,i++)
 234         MEDLoaderBase::safeStrCpy2((*it2).c_str(),MED_LNAME_SIZE-1,groName+i*MED_LNAME_SIZE,tooLongStrPol);
 235       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> famName=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
 236       MEDLoaderBase::safeStrCpy((*it).first.c_str(),MED_NAME_SIZE,famName,tooLongStrPol);
 237       int ret=MEDfamilyCr(fid,mname.c_str(),famName,(*it).second,ngro,groName);
 238       ret++;
 239     }
 240 }
 241
 242 MEDFileUMeshL2::MEDFileUMeshL2()
 243 {
 244 }
 245
 246 void MEDFileUMeshL2::loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 247 {
 248   _name.set(mName.c_str());
 249   int nstep;
 250   int Mdim;
 251   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
 252   std::vector<std::string> infosOnComp=getAxisInfoOnMesh(fid,mId,mName.c_str(),meshType,nstep,Mdim);
 253   if(nstep==0)
 254     return ;
 255   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
 256     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh type ! You are expected an unstructured one whereas in file it is not an unstructured !");
 257   _time=CheckMeshTimeStep(fid,mName,nstep,dt,it);
 258   _iteration=dt;
 259   _order=it;
 260   loadConnectivity(fid,Mdim,mName,dt,it,mrs);//to improve check (dt,it) coherency
 261   loadCoords(fid,mId,infosOnComp,mName,dt,it);
 262 }
 263
 264 void MEDFileUMeshL2::loadConnectivity(med_idt fid, int mdim, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 265 {
 266   _per_type_mesh.resize(1);
 267   _per_type_mesh[0].clear();
 268   for(int j=0;j<MED_N_CELL_FIXED_GEO;j++)
 269     {
 270       MEDFileUMeshPerType *tmp=MEDFileUMeshPerType::New(fid,mName.c_str(),dt,it,mdim,typmai[j],typmai2[j],mrs);
 271       if(tmp)
 272         _per_type_mesh[0].push_back(tmp);
 273     }
 274   sortTypes();
 275 }
 276
 277 void MEDFileUMeshL2::loadCoords(med_idt fid, int mId, const std::vector<std::string>& infosOnComp, const std::string& mName, int dt, int it)
 278 {
 279   int spaceDim=infosOnComp.size();
 280   med_bool changement,transformation;
 281   int nCoords=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&changement,&transformation);
 282   _coords=DataArrayDouble::New();
 283   _coords->alloc(nCoords,spaceDim);
 284   double *coordsPtr=_coords->getPointer();
 285   MEDmeshNodeCoordinateRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_FULL_INTERLACE,coordsPtr);
 286   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 287     {
 288       _fam_coords=DataArrayInt::New();
 289       _fam_coords->alloc(nCoords,1);
 290       MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,_fam_coords->getPointer());
 291     }
 292   else
 293     _fam_coords=0;
 294   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 295     {
 296       _num_coords=DataArrayInt::New();
 297       _num_coords->alloc(nCoords,1);
 298       MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,_num_coords->getPointer());
 299     }
 300   else
 301     _num_coords=0;
 302   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_NAME,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 303     {
 304       _name_coords=DataArrayAsciiChar::New();
 305       _name_coords->alloc(nCoords+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
 306       MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,_name_coords->getPointer());
 307       _name_coords->reAlloc(nCoords);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
 308     }
 309   else
 310     _name_coords=0;
 311   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
 312     _coords->setInfoOnComponent(i,infosOnComp[i]);
 313 }
 314
 315 void MEDFileUMeshL2::sortTypes()
 316 {
 317   std::set<int> mdims;
 318   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> > tmp(_per_type_mesh[0]);
 319   _per_type_mesh.clear();
 320   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=tmp.begin();it!=tmp.end();it++)
 321     mdims.insert((*it)->getDim());
 322   if(mdims.empty())
 323     return;
 324   int mdim=*mdims.rbegin();
 325   _per_type_mesh.resize(mdim+1);
 326   for(int dim=mdim+1;dim!=0;dim--)
 327     {
 328       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >& elt=_per_type_mesh[mdim+1-dim];
 329       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=tmp.begin();it!=tmp.end();it++)
 330         if((*it)->getDim()==dim-1)
 331           elt.push_back(*it);
 332     }
 333   // suppression of contiguous empty levels at the end of _per_type_mesh.
 334   int nbOfUselessLev=0;
 335   bool isFirst=true;
 336   for(std::vector< std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> > >::reverse_iterator it2=_per_type_mesh.rbegin();it2!=_per_type_mesh.rend();it2++)
 337     {
 338       if((*it2).empty() && isFirst)
 339         {
 340           nbOfUselessLev++;
 341         }
 342       else
 343         isFirst=false;
 344     }
 345   _per_type_mesh.resize(_per_type_mesh.size()-nbOfUselessLev);
 346 }
 347
 348 void MEDFileUMeshL2::WriteCoords(med_idt fid, const std::string& mname, int dt, int it, double time, const DataArrayDouble *coords, const DataArrayInt *famCoords, const DataArrayInt *numCoords, const DataArrayAsciiChar *nameCoords)
 349 {
 350   if(!coords)
 351     return ;
 352   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,mname.c_str(),dt,it,time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->getConstPointer());
 353   if(famCoords)
 354     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,mname.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,famCoords->getNumberOfTuples(),famCoords->getConstPointer());
 355   if(numCoords)
 356     MEDmeshEntityNumberWr(fid,mname.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,numCoords->getNumberOfTuples(),numCoords->getConstPointer());
 357   if(nameCoords)
 358     {
 359       if(nameCoords->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
 360         {
 361           std::ostringstream oss; oss << " MEDFileUMeshL2::WriteCoords : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
 362           oss << " ! The array has " << nameCoords->getNumberOfComponents() << " components !";
 363           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 364         }
 365       MEDmeshEntityNameWr(fid,mname.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,nameCoords->getNumberOfTuples(),nameCoords->getConstPointer());
 366     }
 367 }
 368
 369 bool MEDFileUMeshL2::isFamDefinedOnLev(int levId) const
 370 {
 371   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=_per_type_mesh[levId].begin();it!=_per_type_mesh[levId].end();it++)
 372     if((*it)->getFam()==0)
 373       return false;
 374   return true;
 375 }
 376
 377 bool MEDFileUMeshL2::isNumDefinedOnLev(int levId) const
 378 {
 379   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=_per_type_mesh[levId].begin();it!=_per_type_mesh[levId].end();it++)
 380     if((*it)->getNum()==0)
 381       return false;
 382   return true;
 383 }
 384
 385 bool MEDFileUMeshL2::isNamesDefinedOnLev(int levId) const
 386 {
 387   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=_per_type_mesh[levId].begin();it!=_per_type_mesh[levId].end();it++)
 388     if((*it)->getNames()==0)
 389       return false;
 390   return true;
 391 }
 392
 393 MEDFileCMeshL2::MEDFileCMeshL2()
 394 {
 395 }
 396
 397 void MEDFileCMeshL2::loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it)
 398 {
 399   _name.set(mName.c_str());
 400   int nstep;
 401   int Mdim;
 402   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
 403   std::vector<std::string> infosOnComp=getAxisInfoOnMesh(fid,mId,mName.c_str(),meshType,nstep,Mdim);
 404   if(meshType!=CARTESIAN)
 405     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh type ! You are expected a structured one whereas in file it is not a structured !");
 406   _time=CheckMeshTimeStep(fid,mName,nstep,dt,it);
 407   _iteration=dt;
 408   _order=it;
 409   //
 410   med_grid_type gridtype;
 411   MEDmeshGridTypeRd(fid,mName.c_str(),&gridtype);
 412   if(gridtype!=MED_CARTESIAN_GRID)
 413     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid structured mesh ! Expected cartesian mesh type !");
 414   _cmesh=MEDCouplingCMesh::New();
 415   for(int i=0;i<Mdim;i++)
 416     {
 417       med_data_type dataTypeReq=GetDataTypeCorrespondingToSpaceId(i);
 418       med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
 419       int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,dataTypeReq,MED_NO_CMODE,&chgt,&trsf);
 420       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> da=DataArrayDouble::New();
 421       da->alloc(nbOfElt,1);
 422       da->setInfoOnComponent(0,infosOnComp[i]);
 423       MEDmeshGridIndexCoordinateRd(fid,mName.c_str(),dt,it,i+1,da->getPointer());
 424       _cmesh->setCoordsAt(i,da);
 425     }
 426 }
 427
 428 med_data_type MEDFileCMeshL2::GetDataTypeCorrespondingToSpaceId(int id)
 429 {
 430   switch(id)
 431   {
 432     case 0:
 433       return MED_COORDINATE_AXIS1;
 434     case 1:
 435       return MED_COORDINATE_AXIS2;
 436     case 2:
 437       return MED_COORDINATE_AXIS3;
 438     default:
 439       throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid meshdim detected in Cartesian Grid !");
 440   }
 441 }
 442
 443 MEDFileCLMeshL2::MEDFileCLMeshL2()
 444 {
 445 }
 446
 447 void MEDFileCLMeshL2::loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it)
 448 {
 449   _name.set(mName.c_str());
 450   int nstep;
 451   int Mdim;
 452   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
 453   std::vector<std::string> infosOnComp=getAxisInfoOnMesh(fid,mId,mName,meshType,nstep,Mdim);
 454   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
 455     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh type ! You are expected a structured one whereas in file it is not a structured !");
 456   _time=CheckMeshTimeStep(fid,mName,nstep,dt,it);
 457   _iteration=dt;
 458   _order=it;
 459   //
 460   _clmesh=MEDCouplingCurveLinearMesh::New();
 461   INTERP_KERNEL::AutoPtr<int> stGrid=new int[Mdim];
 462   MEDmeshGridStructRd(fid,mName.c_str(),dt,it,stGrid);
 463   _clmesh->setNodeGridStructure(stGrid,((int *)stGrid)+Mdim);
 464   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
 465   int nbNodes=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&chgt,&trsf);
 466   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> da=DataArrayDouble::New();
 467   da->alloc(nbNodes,infosOnComp.size());
 468   da->setInfoOnComponents(infosOnComp);
 469   MEDmeshNodeCoordinateRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_FULL_INTERLACE,da->getPointer());
 470   _clmesh->setCoords(da);
 471 }
 472
 473 MEDFileUMeshPermCompute::MEDFileUMeshPermCompute(const MEDFileUMeshSplitL1* st):_st(st),_mpt_time(0),_num_time(0)
 474 {
 475 }
 476
 477 /*!
 478  * Warning it returns an instance to deallocate !!!!
 479  */
 480 MEDFileUMeshPermCompute::operator MEDCouplingUMesh *() const
 481 {
 482   _st->_num->updateTime();
 483   if((MEDCouplingUMesh *)_m==0)
 484     {
 485       updateTime();
 486       _m=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(_st->_m_by_types.getUmesh()->deepCpy());
 487       _m->renumberCells(_st->_num->getConstPointer(),true);
 488       return _m.retn();
 489     }
 490   else
 491     {
 492       if(_mpt_time==_st->_m_by_types.getTimeOfThis() && _num_time==_st->_num->getTimeOfThis())
 493         return _m.retn();
 494       else
 495         {
 496           updateTime();
 497           _m=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(_st->_m_by_types.getUmesh()->deepCpy());
 498           _m->renumberCells(_st->_num->getConstPointer(),true);
 499           return _m.retn();
 500         }
 501     }
 502 }
 503
 504 void MEDFileUMeshPermCompute::operator=(MEDCouplingUMesh *m)
 505 {
 506   _m=m;
 507 }
 508
 509 void MEDFileUMeshPermCompute::updateTime() const
 510 {
 511   _mpt_time=_st->_m_by_types.getTimeOfThis();
 512   _num_time=_st->_num->getTimeOfThis();
 513 }
 514
 515 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMeshPermCompute::getDirectChildrenWithNull() const
 516 {
 517   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
 518   ret.push_back((const MEDCouplingUMesh *)_m);
 519   return ret;
 520 }
 521
 522 std::size_t MEDFileUMeshPermCompute::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 523 {
 524   return sizeof(MEDFileUMeshPermCompute);
 525 }
 526
 527 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshSplitL1& other):RefCountObject(other),_m_by_types(other._m_by_types),_fam(other._fam),_num(other._num),_names(other._names),_rev_num(other._rev_num),_m(this)
 528 {
 529 }
 530
 531 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshL2& l2, const std::string& mName, int id):_m(this)
 532 {
 533   const std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >& v=l2.getLev(id);
 534   if(v.empty())
 535     return;
 536   int sz=v.size();
 537   std::vector<const MEDCoupling1GTUMesh *> ms(sz);
 538   std::vector<const DataArrayInt *> fams(sz),nums(sz);
 539   std::vector<const DataArrayChar *> names(sz);
 540   for(int i=0;i<sz;i++)
 541     {
 542       MEDCoupling1GTUMesh *elt(v[i]->getMesh());
 543       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp2=l2.getCoords();
 544       elt->setCoords(tmp2);
 545       ms[i]=elt;
 546     }
 547   _m_by_types.assignParts(ms);
 548   if(l2.isFamDefinedOnLev(id))
 549     {
 550       for(int i=0;i<sz;i++)
 551         fams[i]=v[i]->getFam();
 552       if(sz!=1)
 553         _fam=DataArrayInt::Aggregate(fams);
 554       else
 555         {
 556           fams[0]->incrRef();
 557           _fam=const_cast<DataArrayInt *>(fams[0]);
 558         }
 559     }
 560   if(l2.isNumDefinedOnLev(id))
 561     {
 562       for(int i=0;i<sz;i++)
 563         nums[i]=v[i]->getNum();
 564       if(sz!=1)
 565         _num=DataArrayInt::Aggregate(nums);
 566       else
 567         {
 568           nums[0]->incrRef();
 569           _num=const_cast<DataArrayInt *>(nums[0]);
 570         }
 571       computeRevNum();
 572     }
 573   if(l2.isNamesDefinedOnLev(id))
 574     {
 575       for(int i=0;i<sz;i++)
 576         names[i]=v[i]->getNames();
 577       _names=dynamic_cast<DataArrayAsciiChar *>(DataArrayChar::Aggregate(names));
 578     }
 579 }
 580
 581 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(MEDCoupling1GTUMesh *m):_m(this)
 582 {
 583   std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * > v(1);
 584   v[0]=m;
 585   assignParts(v);
 586 }
 587
 588 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(MEDCouplingUMesh *m):_m(this)
 589 {
 590   assignMesh(m,true);
 591 }
 592
 593 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld):_m(this)
 594 {
 595   assignMesh(m,newOrOld);
 596 }
 597
 598 void MEDFileUMeshSplitL1::setName(const std::string& name)
 599 {
 600   _m_by_types.setName(name);
 601 }
 602
 603 std::size_t MEDFileUMeshSplitL1::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 604 {
 605   return 0;
 606 }
 607
 608 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMeshSplitL1::getDirectChildrenWithNull() const
 609 {
 610   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
 611   ret.push_back(&_m_by_types);
 612   ret.push_back(&_m);
 613   ret.push_back((const DataArrayInt*)_fam);
 614   ret.push_back((const DataArrayInt*)_num);
 615   ret.push_back((const DataArrayInt*)_rev_num);
 616   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar*)_names);
 617   return ret;
 618 }
 619
 620 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMeshSplitL1::deepCpy(DataArrayDouble *coords) const
 621 {
 622   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> ret=new MEDFileUMeshSplitL1(*this);
 623   ret->_m_by_types=_m_by_types.deepCpy(coords);
 624   if((const DataArrayInt *)_fam)
 625     ret->_fam=_fam->deepCpy();
 626   if((const DataArrayInt *)_num)
 627     ret->_num=_num->deepCpy();
 628   if((const DataArrayInt *)_rev_num)
 629     ret->_rev_num=_rev_num->deepCpy();
 630   if((const DataArrayAsciiChar *)_names)
 631     ret->_names=_names->deepCpy();
 632   return ret.retn();
 633 }
 634
 635 bool MEDFileUMeshSplitL1::isEqual(const MEDFileUMeshSplitL1 *other, double eps, std::string& what) const
 636 {
 637   if(!_m_by_types.isEqual(other->_m_by_types,eps,what))
 638     return false;
 639   const DataArrayInt *d1=_fam;
 640   const DataArrayInt *d2=other->_fam;
 641   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
 642     {
 643       what="Presence of family arr in one sublevel and not in other!";
 644       return false;
 645     }
 646   if(d1)
 647     if(!d1->isEqual(*d2))
 648       {
 649         what="family arr at a sublevel are not deeply equal !";
 650         return false;
 651       }
 652   d1=_num;
 653   d2=other->_num;
 654   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
 655     {
 656       what="Presence of cell numbering arr in one sublevel and not in other!";
 657       return false;
 658     }
 659   if(d1)
 660     if(!d1->isEqual(*d2))
 661       {
 662         what="Numbering cell arr at a sublevel are not deeply equal !";
 663         return false;
 664       }
 665   const DataArrayAsciiChar *e1=_names;
 666   const DataArrayAsciiChar *e2=other->_names;
 667   if((e1==0 && e2!=0) || (e1!=0 && e2==0))
 668     {
 669       what="Presence of cell names arr in one sublevel and not in other!";
 670       return false;
 671     }
 672   if(e1)
 673     if(!e1->isEqual(*e2))
 674       {
 675         what="Name cell arr at a sublevel are not deeply equal !";
 676         return false;
 677       }
 678   return true;
 679 }
 680
 681 void MEDFileUMeshSplitL1::synchronizeTinyInfo(const MEDFileMesh& master) const
 682 {
 683   _m_by_types.synchronizeTinyInfo(master);
 684 }
 685
 686 void MEDFileUMeshSplitL1::clearNonDiscrAttributes() const
 687 {
 688   _m_by_types.clearNonDiscrAttributes();
 689 }
 690
 691 void MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(const MEDCouplingMesh *tmp)
 692 {
 693   if(!tmp)
 694     return ;
 695   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setName("");
 696   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setDescription("");
 697   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setTime(0.,-1,-1);
 698   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setTimeUnit("");
 699 }
 700
 701 void MEDFileUMeshSplitL1::setCoords(DataArrayDouble *coords)
 702 {
 703   _m_by_types.setCoords(coords);
 704 }
 705
 706 void MEDFileUMeshSplitL1::assignMesh(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld)
 707 {
 708   if(newOrOld)
 709     {
 710       m->incrRef();
 711       _m=m;
 712       _m_by_types.assignUMesh(dynamic_cast<MEDCouplingUMesh *>(m->deepCpy()));
 713       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da=_m_by_types.getUmesh()->getRenumArrForConsecutiveCellTypesSpec(typmai2,typmai2+MED_N_CELL_FIXED_GEO);
 714       if(!da->isIdentity())
 715         {
 716           _num=da->invertArrayO2N2N2O(m->getNumberOfCells());
 717           _m.updateTime();
 718           computeRevNum();
 719           _m_by_types.getUmesh()->renumberCells(da->getConstPointer(),false);
 720         }
 721     }
 722   else
 723     {
 724       if(!m->checkConsecutiveCellTypesAndOrder(typmai2,typmai2+MED_N_CELL_FIXED_GEO))
 725         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshSplitL1::assignMesh : the mode of mesh setting expects to follow the MED file numbering convention ! it is not the case !");
 726       m->incrRef();
 727       _m_by_types.assignUMesh(m);
 728     }
 729   assignCommonPart();
 730 }
 731
 732 void MEDFileUMeshSplitL1::forceComputationOfParts() const
 733 {
 734   _m_by_types.forceComputationOfPartsFromUMesh();
 735 }
 736
 737 void MEDFileUMeshSplitL1::assignParts(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * >& mParts)
 738 {
 739   _m_by_types.assignParts(mParts);
 740   assignCommonPart();
 741 }
 742
 743 void MEDFileUMeshSplitL1::assignCommonPart()
 744 {
 745   _fam=DataArrayInt::New();
 746   _fam->alloc(_m_by_types.getSize(),1);
 747   _fam->fillWithValue(0);
 748 }
 749
 750 bool MEDFileUMeshSplitL1::empty() const
 751 {
 752   return _m_by_types.empty();
 753 }
 754
 755 bool MEDFileUMeshSplitL1::presenceOfOneFams(const std::vector<int>& ids) const
 756 {
 757   const DataArrayInt *fam=_fam;
 758   if(!fam)
 759     return false;
 760   return fam->presenceOfValue(ids);
 761 }
 762
 763 int MEDFileUMeshSplitL1::getMeshDimension() const
 764 {
 765   return _m_by_types.getMeshDimension();
 766 }
 767
 768 void MEDFileUMeshSplitL1::simpleRepr(std::ostream& oss) const
 769 {
 770   std::vector<int> code=_m_by_types.getDistributionOfTypes();
 771   int nbOfTypes=code.size()/3;
 772   for(int i=0;i<nbOfTypes;i++)
 773     {
 774       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType typ=(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType) code[3*i];
 775       oss << "    - Number of cells with type " << INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(typ).getRepr() << " : " << code[3*i+1] << std::endl;
 776     }
 777 }
 778
 779 int MEDFileUMeshSplitL1::getSize() const
 780 {
 781   return _m_by_types.getSize();
 782 }
 783
 784 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::getFamilyPart(const int *idsBg, const int *idsEnd, bool renum) const
 785 {
 786   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> eltsToKeep=_fam->getIdsEqualList(idsBg,idsEnd);
 787   MEDCouplingUMesh *m=(MEDCouplingUMesh *)_m_by_types.getUmesh()->buildPartOfMySelf(eltsToKeep->getConstPointer(),eltsToKeep->getConstPointer()+eltsToKeep->getNumberOfTuples(),true);
 788   if(renum)
 789     return renumIfNeeded(m,eltsToKeep->getConstPointer());
 790   return m;
 791 }
 792
 793 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getFamilyPartArr(const int *idsBg, const int *idsEnd, bool renum) const
 794 {
 795   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da=_fam->getIdsEqualList(idsBg,idsEnd);
 796   if(renum)
 797     return renumIfNeededArr(da);
 798   return da.retn();
 799 }
 800
 801 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMeshSplitL1::getGeoTypes() const
 802 {
 803   return _m_by_types.getGeoTypes();
 804 }
 805
 806 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::getWholeMesh(bool renum) const
 807 {
 808   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp;
 809   if(renum && ((const DataArrayInt *)_num))
 810     tmp=_m;
 811   else
 812     { tmp=_m_by_types.getUmesh(); if(tmp) tmp->incrRef(); }
 813   return tmp.retn();
 814 }
 815
 816 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
 817 {
 818   const DataArrayInt *fam(_fam);
 819   if(!fam)
 820     return 0;
 821   int start(0),stop(0);
 822   _m_by_types.getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(gt,start,stop);
 823   return fam->selectByTupleId2(start,stop,1);
 824 }
 825
 826 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
 827 {
 828   const DataArrayInt *num(_num);
 829   if(!num)
 830     return 0;
 831   int start(0),stop(0);
 832   _m_by_types.getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(gt,start,stop);
 833   return num->selectByTupleId2(start,stop,1);
 834 }
 835
 836 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getOrCreateAndGetFamilyField()
 837 {
 838   if((DataArrayInt *)_fam)
 839     return _fam;
 840   int nbOfTuples=_m_by_types.getSize();
 841   _fam=DataArrayInt::New(); _fam->alloc(nbOfTuples,1); _fam->fillWithZero();
 842   return _fam;
 843 }
 844
 845 const DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getFamilyField() const
 846 {
 847   return _fam;
 848 }
 849
 850 const DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getNumberField() const
 851 {
 852   return _num;
 853 }
 854
 855 const DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getRevNumberField() const
 856 {
 857   return _rev_num;
 858 }
 859
 860 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMeshSplitL1::getNameField() const
 861 {
 862   return _names;
 863 }
 864
 865 void MEDFileUMeshSplitL1::eraseFamilyField()
 866 {
 867   _fam->fillWithZero();
 868 }
 869
 870 /*!
 871  * This method ignores _m and _m_by_types.
 872  */
 873 void MEDFileUMeshSplitL1::setGroupsFromScratch(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, std::map<std::string,int>& familyIds,
 874                                                std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups)
 875 {
 876   std::vector< DataArrayInt * > corr;
 877   _m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,0,corr);
 878   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corrMSafe(corr.begin(),corr.end());
 879   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
 880   std::vector< const DataArrayInt * > corr2(corr.begin(),corr.end());
 881   _fam=DataArrayInt::MakePartition(corr2,((MEDCouplingUMesh *)_m)->getNumberOfCells(),fidsOfGroups);
 882   int nbOfCells=((MEDCouplingUMesh *)_m)->getNumberOfCells();
 883   std::map<int,std::string> newfams;
 884   std::map<int,int> famIdTrad;
 885   TraduceFamilyNumber(fidsOfGroups,familyIds,famIdTrad,newfams);
 886   int *w=_fam->getPointer();
 887   for(int i=0;i<nbOfCells;i++,w++)
 888     *w=famIdTrad[*w];
 889 }
 890
 891 void MEDFileUMeshSplitL1::write(med_idt fid, const std::string& mName, int mdim) const
 892 {
 893   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ms(_m_by_types.getParts());
 894   int start=0;
 895   for(std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
 896     {
 897       int nbCells=(*it)->getNumberOfCells();
 898       int end=start+nbCells;
 899       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam,num;
 900       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> names;
 901       if((const DataArrayInt *)_fam)
 902         fam=_fam->substr(start,end);
 903       if((const DataArrayInt *)_num)
 904         num=_num->substr(start,end);
 905       if((const DataArrayAsciiChar *)_names)
 906         names=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_names->substr(start,end));
 907       MEDFileUMeshPerType::Write(fid,mName,mdim,(*it),fam,num,names);
 908       start=end;
 909     }
 910 }
 911
 912 void MEDFileUMeshSplitL1::renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N)
 913 {
 914   MEDCouplingUMesh *m(_m_by_types.getUmesh());
 915   if(!m)
 916     return;
 917   m->renumberNodesInConn(newNodeNumbersO2N);
 918 }
 919
 920 void MEDFileUMeshSplitL1::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
 921 {
 922   DataArrayInt *arr=_fam;
 923   if(arr)
 924     arr->changeValue(oldId,newId);
 925 }
 926
 927 void MEDFileUMeshSplitL1::setFamilyArr(DataArrayInt *famArr)
 928 {
 929   if(!famArr)
 930     {
 931       _fam=0;
 932       return ;
 933     }
 934   int sz(_m_by_types.getSize());
 935   famArr->checkNbOfTuplesAndComp(sz,1,"MEDFileUMeshSplitL1::setFamilyArr : Problem in size of Family arr ! ");
 936   famArr->incrRef();
 937   _fam=famArr;
 938 }
 939
 940 void MEDFileUMeshSplitL1::setRenumArr(DataArrayInt *renumArr)
 941 {
 942   if(!renumArr)
 943     {
 944       _num=0;
 945       _rev_num=0;
 946       return ;
 947     }
 948   int sz(_m_by_types.getSize());
 949   renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(sz,1,"MEDFileUMeshSplitL1::setRenumArr : Problem in size of numbering arr ! ");
 950   renumArr->incrRef();
 951   _num=renumArr;
 952   computeRevNum();
 953 }
 954
 955 void MEDFileUMeshSplitL1::setNameArr(DataArrayAsciiChar *nameArr)
 956 {
 957   if(!nameArr)
 958     {
 959       _names=0;
 960       return ;
 961     }
 962   int sz(_m_by_types.getSize());
 963   nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(sz,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMeshSplitL1::setNameArr : Problem in size of name arr ! ");
 964   nameArr->incrRef();
 965   _names=nameArr;
 966 }
 967
 968 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::Renumber2(const DataArrayInt *renum, MEDCouplingUMesh *m, const int *cellIds)
 969 {
 970   if(renum==0)
 971     return m;
 972   if(cellIds==0)
 973     m->renumberCells(renum->getConstPointer(),true);
 974   else
 975     {
 976       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> locnum=renum->selectByTupleId(cellIds,cellIds+m->getNumberOfCells());
 977       m->renumberCells(locnum->getConstPointer(),true);
 978     }
 979   return m;
 980 }
 981
 982 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::renumIfNeeded(MEDCouplingUMesh *m, const int *cellIds) const
 983 {
 984   return Renumber2(_num,m,cellIds);
 985 }
 986
 987 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(const DataArrayInt *renum, const DataArrayInt *da)
 988 {
 989   if((const DataArrayInt *)renum==0)
 990     {
 991       da->incrRef();
 992       return const_cast<DataArrayInt *>(da);
 993     }
 994   return renum->selectByTupleId(da->getConstPointer(),da->getConstPointer()+da->getNumberOfTuples());
 995 }
 996
 997 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::renumIfNeededArr(const DataArrayInt *da) const
 998 {
 999   return Renumber(_num,da);
1000 }
1001
1002 std::vector<int> MEDFileUMeshSplitL1::GetNewFamiliesNumber(int nb, const std::map<std::string,int>& families)
1003 {
1004   int id=-1;
1005   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++)
1006     id=std::max(id,(*it).second);
1007   if(id==-1)
1008     id=0;
1009   std::vector<int> ret(nb);
1010   for(int i=1;i<=nb;i++)
1011     ret[i]=id+i;
1012   return ret;
1013 }
1014
1015 void MEDFileUMeshSplitL1::TraduceFamilyNumber(const std::vector< std::vector<int> >& fidsGrps, std::map<std::string,int>& familyIds,
1016                                               std::map<int,int>& famIdTrad, std::map<int,std::string>& newfams)
1017 {
1018   std::set<int> allfids;
1019   //tony
1020 }
1021
1022 void MEDFileUMeshSplitL1::computeRevNum() const
1023 {
1024   int pos;
1025   int maxValue=_num->getMaxValue(pos);
1026   _rev_num=_num->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
1027 }
1028
1029 //=
1030
1031 MEDFileUMeshAggregateCompute::MEDFileUMeshAggregateCompute():_mp_time(0),_m_time(0)
1032 {
1033 }
1034
1035 void MEDFileUMeshAggregateCompute::setName(const std::string& name)
1036 {
1037   if(_m_time>=_mp_time)
1038     {
1039       MEDCouplingUMesh *um(_m);
1040       if(um)
1041         um->setName(name);
1042     }
1043   if(_mp_time>=_m_time)
1044     {
1045       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1046         {
1047           MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1048           if(tmp)
1049             tmp->setName(name);
1050         }
1051     }
1052 }
1053
1054 void MEDFileUMeshAggregateCompute::assignParts(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * >& mParts)
1055 {
1056   std::size_t sz(mParts.size());
1057   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> > ret(sz);
1058   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1059     {
1060       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(mParts[i]);
1061       if(!elt)
1062         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::assignParts : presence of null pointer !");
1063       ret[i]=const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(elt); elt->incrRef();
1064     }
1065   _m_parts=ret;
1066   _mp_time=std::max(_mp_time,_m_time)+1;
1067   _m=0;
1068 }
1069
1070 void MEDFileUMeshAggregateCompute::assignUMesh(MEDCouplingUMesh *m)
1071 {
1072   _m=m;
1073   _m_parts.clear();
1074   _m_time=std::max(_mp_time,_m_time)+1;
1075 }
1076
1077 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshAggregateCompute::getUmesh() const
1078 {
1079   if(_mp_time<=_m_time)
1080     return _m;
1081   std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh *> mp(_m_parts.size());
1082   std::copy(_m_parts.begin(),_m_parts.end(),mp.begin());
1083   _m=MEDCoupling1GTUMesh::AggregateOnSameCoordsToUMesh(mp);
1084   _m_parts.clear();//to avoid memory peak !
1085   _m_time=_mp_time+1;//+1 is important ! That is to say that only _m is OK not _m_parts because cleared !
1086   return _m;
1087 }
1088
1089 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMeshAggregateCompute::getGeoTypes() const
1090 {
1091   if(_mp_time>=_m_time)
1092     {
1093       std::size_t sz(_m_parts.size());
1094       std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(sz);
1095       for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1096         ret[i]=_m_parts[i]->getCellModelEnum();
1097       return ret;
1098     }
1099   else
1100     return _m->getAllGeoTypesSorted();
1101 }
1102
1103 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartsWithoutComputation() const
1104 {
1105   if(_mp_time<_m_time)
1106     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartsWithoutComputation : the parts require a computation !");
1107   //
1108   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ret(_m_parts.size());
1109   std::size_t i(0);
1110   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++,i++)
1111     {
1112       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(*it);
1113       ret[i]=const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(elt);
1114     }
1115   return ret;
1116 }
1117
1118 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMeshAggregateCompute::getParts() const
1119 {
1120   if(_mp_time<_m_time)
1121     forceComputationOfPartsFromUMesh();
1122   return getPartsWithoutComputation();
1123 }
1124
1125 MEDCoupling1GTUMesh *MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
1126 {
1127   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> v(getPartsWithoutComputation());
1128   std::size_t sz(v.size());
1129   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1130     {
1131       if(v[i])
1132         if(v[i]->getCellModelEnum()==gt)
1133           return v[i];
1134     }
1135   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartWithoutComputation : the geometric type is not existing !");
1136 }
1137
1138 void MEDFileUMeshAggregateCompute::getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt, int& start, int& stop) const
1139 {
1140   start=0; stop=0;
1141   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> v(getPartsWithoutComputation());
1142   std::size_t sz(v.size());
1143   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1144     {
1145       if(v[i])
1146         {
1147           if(v[i]->getCellModelEnum()==gt)
1148             {
1149               stop=start+v[i]->getNumberOfCells();
1150               return;
1151             }
1152           else
1153             start+=v[i]->getNumberOfCells();
1154         }
1155     }
1156   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation : the geometric type is not existing !");
1157 }
1158
1159 void MEDFileUMeshAggregateCompute::forceComputationOfPartsFromUMesh() const
1160 {
1161   const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1162   if(!m)
1163     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::forceComputationOfPartsFromUMesh : null UMesh !");
1164   std::vector<MEDCouplingUMesh *> ms(m->splitByType());
1165   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> > msMSafe(ms.begin(),ms.end());
1166   std::size_t sz(msMSafe.size());
1167   _m_parts.resize(sz);
1168   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1169     _m_parts[i]=MEDCoupling1GTUMesh::New(ms[i]);
1170   _mp_time=std::max(_mp_time,_m_time);
1171 }
1172
1173 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfThis() const
1174 {
1175   if(_mp_time>_m_time)
1176     return getTimeOfParts();
1177   if(_m_time>_mp_time)
1178     return getTimeOfUMesh();
1179   return std::max(getTimeOfParts(),getTimeOfUMesh());
1180 }
1181
1182 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfParts() const
1183 {
1184   std::size_t ret(0);
1185   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1186     {
1187       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(*it);
1188       if(!elt)
1189         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfParts : null obj in parts !");
1190       ret=std::max(ret,elt->getTimeOfThis());
1191     }
1192   if(ret==0)
1193     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfParts : parts is empty !");
1194   return ret;
1195 }
1196
1197 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfUMesh() const
1198 {
1199   const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1200   if(!m)
1201     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfUMesh : unmesh is null !");
1202   return m->getTimeOfThis();
1203 }
1204
1205 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1206 {
1207   std::size_t ret(_m_parts.size()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh>));
1208   return ret;
1209 }
1210
1211 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMeshAggregateCompute::getDirectChildrenWithNull() const
1212 {
1213   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
1214   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1215     ret.push_back((const MEDCoupling1GTUMesh *)*it);
1216   ret.push_back((const MEDCouplingUMesh *)_m);
1217   return ret;
1218 }
1219
1220 MEDFileUMeshAggregateCompute MEDFileUMeshAggregateCompute::deepCpy(DataArrayDouble *coords) const
1221 {
1222   MEDFileUMeshAggregateCompute ret;
1223   ret._m_parts.resize(_m_parts.size());
1224   for(std::size_t i=0;i<_m_parts.size();i++)
1225     {
1226       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(_m_parts[i]);
1227       if(elt)
1228         {
1229           ret._m_parts[i]=static_cast<ParaMEDMEM::MEDCoupling1GTUMesh*>(elt->deepCpy());
1230           ret._m_parts[i]->setCoords(coords);
1231         }
1232     }
1233   ret._mp_time=_mp_time; ret._m_time=_m_time;
1234   if((const MEDCouplingUMesh *)_m)
1235     {
1236       ret._m=static_cast<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>(_m->deepCpy());
1237       ret._m->setCoords(coords);
1238     }
1239   return ret;
1240 }
1241
1242 bool MEDFileUMeshAggregateCompute::isEqual(const MEDFileUMeshAggregateCompute& other, double eps, std::string& what) const
1243 {
1244   const MEDCouplingUMesh *m1(getUmesh());
1245   const MEDCouplingUMesh *m2(other.getUmesh());
1246   if((m1==0 && m2!=0) || (m1!=0 && m2==0))
1247     {
1248       what="Presence of mesh in one sublevel and not in other!";
1249       return false;
1250     }
1251   if(m1)
1252     {
1253       std::string what2;
1254       if(!m1->isEqualIfNotWhy(m2,eps,what2))
1255         {
1256           what=std::string("meshes at a sublevel are not deeply equal (")+what2+std::string(")!");
1257           return false;
1258         }
1259     }
1260   return true;
1261 }
1262
1263 void MEDFileUMeshAggregateCompute::clearNonDiscrAttributes() const
1264 {
1265   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1266     MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(*it);
1267   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_m);
1268 }
1269
1270 void MEDFileUMeshAggregateCompute::synchronizeTinyInfo(const MEDFileMesh& master) const
1271 {
1272   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1273     {
1274       const MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1275       if(tmp)
1276         {
1277           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setName(master.getName().c_str());
1278           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setDescription(master.getDescription().c_str());
1279           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setTime(master.getTimeValue(),master.getIteration(),master.getOrder());
1280           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setTimeUnit(master.getTimeUnit());
1281         }
1282     }
1283   const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1284   if(m)
1285     {
1286       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setName(master.getName().c_str());
1287       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setDescription(master.getDescription().c_str());
1288       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setTime(master.getTimeValue(),master.getIteration(),master.getOrder());
1289       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setTimeUnit(master.getTimeUnit());
1290     }
1291 }
1292
1293 bool MEDFileUMeshAggregateCompute::empty() const
1294 {
1295   if(_mp_time<_m_time)
1296     return ((const MEDCouplingUMesh *)_m)==0;
1297   //else _mp_time>=_m_time)
1298   return _m_parts.empty();
1299 }
1300
1301 int MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension() const
1302 {
1303   if(_mp_time<_m_time)
1304     {
1305       const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1306       if(!m)
1307         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension : no umesh in this !");
1308       return m->getMeshDimension();
1309     }
1310   else
1311     {
1312       if(_m_parts.empty())
1313         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension : part mesh is empty !");
1314       const MEDCoupling1GTUMesh *m(_m_parts[0]);
1315       if(!m)
1316         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension : part mesh contains null instance !");
1317       return m->getMeshDimension();
1318     }
1319 }
1320
1321 std::vector<int> MEDFileUMeshAggregateCompute::getDistributionOfTypes() const
1322 {
1323   if(_mp_time<_m_time)
1324     {
1325       const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1326       if(!m)
1327         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getDistributionOfTypes : no umesh in this !");
1328       return m->getDistributionOfTypes();
1329     }
1330   else
1331     {
1332       std::vector<int> ret;
1333       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1334         {
1335           const MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1336           if(!tmp)
1337             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getDistributionOfTypes : part mesh contains null instance !");
1338           std::vector<int> ret0(tmp->getDistributionOfTypes());
1339           ret.insert(ret.end(),ret0.begin(),ret0.end());
1340         }
1341       return ret;
1342     }
1343 }
1344
1345 int MEDFileUMeshAggregateCompute::getSize() const
1346 {
1347   if(_mp_time<_m_time)
1348     {
1349       const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1350       if(!m)
1351         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getSize : no umesh in this !");
1352       return m->getNumberOfCells();
1353     }
1354   else
1355     {
1356       int ret=0;
1357       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1358         {
1359           const MEDCoupling1GTUMesh *m(*it);
1360           if(!m)
1361             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getSize : part mesh contains null instance !");
1362           ret+=m->getNumberOfCells();
1363         }
1364       return ret;
1365     }
1366 }
1367
1368 void MEDFileUMeshAggregateCompute::setCoords(DataArrayDouble *coords)
1369 {
1370   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1371     {
1372       MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1373       if(tmp)
1374         (*it)->setCoords(coords);
1375     }
1376   MEDCouplingUMesh *m(_m);
1377   if(m)
1378     m->setCoords(coords);
1379 }