src/MEDLoader/MEDFileMeshLL.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDFileMeshLL.hxx"
  22 #include "MEDFileMesh.hxx"
  23 #include "MEDLoaderBase.hxx"
  24 #include "MEDFileMeshReadSelector.hxx"
  25
  26 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  27
  28 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
  29 #include "CellModel.hxx"
  30
  31 #include <set>
  32
  33 extern med_geometry_type typmai[MED_N_CELL_FIXED_GEO];
  34 extern INTERP_KERNEL::NormalizedCellType typmai2[MED_N_CELL_FIXED_GEO];
  35 extern med_geometry_type typmainoeud[1];
  36
  37 using namespace ParaMEDMEM;
  38
  39 MEDFileMeshL2::MEDFileMeshL2():_name(MED_NAME_SIZE),_description(MED_COMMENT_SIZE),_univ_name(MED_LNAME_SIZE),_dt_unit(MED_LNAME_SIZE)
  40 {
  41 }
  42
  43 std::size_t MEDFileMeshL2::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  44 {
  45   return 0;
  46 }
  47
  48 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshL2::getDirectChildrenWithNull() const
  49 {
  50   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
  51 }
  52
  53 int MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(med_idt fid, const std::string& mname, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& dt, int& it, std::string& dtunit1)
  54 {
  55   med_mesh_type type_maillage;
  56   char maillage_description[MED_COMMENT_SIZE+1];
  57   char dtunit[MED_LNAME_SIZE+1];
  58   med_int spaceDim,dim;
  59   char nommaa[MED_NAME_SIZE+1];
  60   med_int n=MEDnMesh(fid);
  61   bool found=false;
  62   int ret=-1;
  63   med_sorting_type stype;
  64   std::vector<std::string> ms;
  65   int nstep;
  66   med_axis_type axistype;
  67   for(int i=0;i<n && !found;i++)
  68     {
  69       int naxis=MEDmeshnAxis(fid,i+1);
  70       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisname=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
  71       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
  72       MEDmeshInfo(fid,i+1,nommaa,&spaceDim,&dim,&type_maillage,maillage_description,dtunit,&stype,&nstep,&axistype,axisname,axisunit);
  73       dtunit1=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(dtunit,sizeof(dtunit));
  74       std::string cur=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(nommaa,sizeof(nommaa));
  75       ms.push_back(cur);
  76       if(cur==mname)
  77         {
  78           found=true;
  79           ret=i+1;
  80         }
  81     }
  82   if(!found)
  83     {
  84       std::ostringstream oss;
  85       oss << "No such meshname (" << mname <<  ") in file ! Must be in : ";
  86       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss,", "));
  87       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
  88     }
  89   switch(type_maillage)
  90   {
  91     case MED_UNSTRUCTURED_MESH:
  92       meshType=UNSTRUCTURED;
  93       break;
  94     case MED_STRUCTURED_MESH:
  95       {
  96         med_grid_type gt;
  97         MEDmeshGridTypeRd(fid,mname.c_str(),&gt);
  98         switch(gt)
  99         {
 100           case MED_CARTESIAN_GRID:
 101             meshType=CARTESIAN;
 102             break;
 103           case MED_CURVILINEAR_GRID:
 104             meshType=CURVE_LINEAR;
 105             break;
 106           default:
 107             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getMeshIdFromName : unrecognized structured mesh type ! Supported are :\n - cartesian\n - curve linear\n");
 108         }
 109         break;
 110       }
 111     default:
 112       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getMeshIdFromName : unrecognized mesh type !");
 113   }
 114   med_int numdt,numit;
 115   med_float dtt;
 116   MEDmeshComputationStepInfo(fid,mname.c_str(),1,&numdt,&numit,&dtt);
 117   dt=numdt; it=numit;
 118   return ret;
 119 }
 120
 121 double MEDFileMeshL2::CheckMeshTimeStep(med_idt fid, const std::string& mName, int nstep, int dt, int it)
 122 {
 123   bool found=false;
 124   med_int numdt,numit;
 125   med_float dtt;
 126   std::vector< std::pair<int,int> > p(nstep);
 127   for(int i=0;i<nstep;i++)
 128     {
 129       MEDmeshComputationStepInfo(fid,mName.c_str(),i+1,&numdt,&numit,&dtt);
 130       p[i]=std::make_pair<int,int>(numdt,numit);
 131       found=(numdt==dt) && (numit==numit);
 132     }
 133   if(!found)
 134     {
 135       std::ostringstream oss; oss << "No such iteration=" << dt << ",order=" << it << " numbers found for mesh '" << mName << "' ! ";
 136       oss << "Possibilities are : ";
 137       for(int i=0;i<nstep;i++)
 138         oss << "(" << p[i].first << "," << p[i].second << "), ";
 139       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 140     }
 141   return dtt;
 142 }
 143
 144 std::vector<std::string> MEDFileMeshL2::getAxisInfoOnMesh(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType& meshType, int& nstep, int& Mdim)
 145 {
 146   med_mesh_type type_maillage;
 147   med_int spaceDim;
 148   med_sorting_type stype;
 149   med_axis_type axistype;
 150   int naxis=MEDmeshnAxis(fid,mId);
 151   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> nameTmp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
 152   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisname=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
 153   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> axisunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(naxis*MED_SNAME_SIZE);
 154   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> univTmp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
 155   if(MEDmeshInfo(fid,mId,nameTmp,&spaceDim,&Mdim,&type_maillage,_description.getPointer(),_dt_unit.getPointer(),
 156       &stype,&nstep,&axistype,axisname,axisunit)!=0)
 157     throw INTERP_KERNEL::Exception("A problem has been detected when trying to get info on mesh !");
 158   MEDmeshUniversalNameRd(fid,nameTmp,_univ_name.getPointer());
 159   switch(type_maillage)
 160   {
 161     case MED_UNSTRUCTURED_MESH:
 162       meshType=UNSTRUCTURED;
 163       break;
 164     case MED_STRUCTURED_MESH:
 165       {
 166         med_grid_type gt;
 167         MEDmeshGridTypeRd(fid,mName.c_str(),&gt);
 168         switch(gt)
 169         {
 170           case MED_CARTESIAN_GRID:
 171             meshType=CARTESIAN;
 172             break;
 173           case MED_CURVILINEAR_GRID:
 174             meshType=CURVE_LINEAR;
 175             break;
 176           default:
 177             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getAxisInfoOnMesh : unrecognized structured mesh type ! Supported are :\n - cartesian\n - curve linear\n");
 178         }
 179         break;
 180       }
 181     default:
 182       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::getMeshIdFromName : unrecognized mesh type !");
 183   }
 184   //
 185   std::vector<std::string> infosOnComp(naxis);
 186   for(int i=0;i<naxis;i++)
 187     {
 188       std::string info=MEDLoaderBase::buildUnionUnit(((char *)axisname)+i*MED_SNAME_SIZE,MED_SNAME_SIZE,((char *)axisunit)+i*MED_SNAME_SIZE,MED_SNAME_SIZE);
 189       infosOnComp[i]=info;
 190     }
 191   return infosOnComp;
 192 }
 193
 194 void MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(med_idt fid, const std::string& meshName, std::map<std::string,int>& fams, std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 195 {
 196   if(mrs && !(mrs->isCellFamilyFieldReading() || mrs->isNodeFamilyFieldReading()))
 197     return ;
 198   char nomfam[MED_NAME_SIZE+1];
 199   med_int numfam;
 200   int nfam=MEDnFamily(fid,meshName.c_str());
 201   for(int i=0;i<nfam;i++)
 202     {
 203       int ngro=MEDnFamilyGroup(fid,meshName.c_str(),i+1);
 204       med_int natt=MEDnFamily23Attribute(fid,meshName.c_str(),i+1);
 205       INTERP_KERNEL::AutoPtr<med_int> attide=new med_int[natt];
 206       INTERP_KERNEL::AutoPtr<med_int> attval=new med_int[natt];
 207       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> attdes=new char[MED_COMMENT_SIZE*natt+1];
 208       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> gro=new char[MED_LNAME_SIZE*ngro+1];
 209       MEDfamily23Info(fid,meshName.c_str(),i+1,nomfam,attide,attval,attdes,&numfam,gro);
 210       std::string famName=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(nomfam,MED_NAME_SIZE);
 211       fams[famName]=numfam;
 212       for(int j=0;j<ngro;j++)
 213         {
 214           std::string groupname=MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
 215           grps[groupname].push_back(famName);
 216         }
 217     }
 218 }
 219
 220 void MEDFileMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(med_idt fid, const std::string& mname, const std::map<std::string,int>& fams, const std::map<std::string, std::vector<std::string> >& grps, int tooLongStrPol)
 221 {
 222   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++)
 223     {
 224       std::vector<std::string> grpsOfFam;
 225       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=grps.begin();it1!=grps.end();it1++)
 226         {
 227           if(std::find((*it1).second.begin(),(*it1).second.end(),(*it).first)!=(*it1).second.end())
 228             grpsOfFam.push_back((*it1).first);
 229         }
 230       int ngro=grpsOfFam.size();
 231       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> groName=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE*ngro);
 232       int i=0;
 233       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOfFam.begin();it2!=grpsOfFam.end();it2++,i++)
 234         MEDLoaderBase::safeStrCpy2((*it2).c_str(),MED_LNAME_SIZE-1,groName+i*MED_LNAME_SIZE,tooLongStrPol);
 235       INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> famName=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
 236       MEDLoaderBase::safeStrCpy((*it).first.c_str(),MED_NAME_SIZE,famName,tooLongStrPol);
 237       int ret=MEDfamilyCr(fid,mname.c_str(),famName,(*it).second,ngro,groName);
 238       ret++;
 239     }
 240 }
 241
 242 MEDFileUMeshL2::MEDFileUMeshL2()
 243 {
 244 }
 245
 246 std::vector<std::string> MEDFileUMeshL2::loadCommonPart(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it, int& Mdim)
 247 {
 248   Mdim=-3;
 249   _name.set(mName.c_str());
 250   int nstep;
 251   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
 252   std::vector<std::string> ret(getAxisInfoOnMesh(fid,mId,mName.c_str(),meshType,nstep,Mdim));
 253   if(nstep==0)
 254     {
 255       Mdim=-4;
 256       return std::vector<std::string>();
 257     }
 258   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
 259     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh type ! You are expected an unstructured one whereas in file it is not an unstructured !");
 260   _time=CheckMeshTimeStep(fid,mName,nstep,dt,it);
 261   _iteration=dt;
 262   _order=it;
 263   return ret;
 264 }
 265
 266 void MEDFileUMeshL2::loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 267 {
 268   int Mdim;
 269   std::vector<std::string> infosOnComp(loadCommonPart(fid,mId,mName,dt,it,Mdim));
 270   if(Mdim==-4)
 271     return ;
 272   loadConnectivity(fid,Mdim,mName,dt,it,mrs);//to improve check (dt,it) coherency
 273   loadCoords(fid,mId,infosOnComp,mName,dt,it);
 274 }
 275
 276 void MEDFileUMeshL2::loadPart(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 277 {
 278   int Mdim;
 279   std::vector<std::string> infosOnComp(loadCommonPart(fid,mId,mName,dt,it,Mdim));
 280   if(Mdim==-4)
 281     return ;
 282   loadPartOfConnectivity(fid,Mdim,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
 283   med_bool changement,transformation;
 284   int nCoords(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&changement,&transformation));
 285   std::vector<bool> fetchedNodeIds(nCoords,false);
 286   for(std::vector< std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> > >::const_iterator it0=_per_type_mesh.begin();it0!=_per_type_mesh.end();it0++)
 287     for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it1=(*it0).begin();it1!=(*it0).end();it1++)
 288       (*it1)->getMesh()->computeNodeIdsAlg(fetchedNodeIds);
 289   int nMin(std::distance(fetchedNodeIds.begin(),std::find(fetchedNodeIds.begin(),fetchedNodeIds.end(),true)));
 290   int nMax(std::distance(fetchedNodeIds.rbegin(),std::find(fetchedNodeIds.rbegin(),fetchedNodeIds.rend(),true)));
 291   nMax=nCoords-nMax;
 292   for(std::vector< std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> > >::const_iterator it0=_per_type_mesh.begin();it0!=_per_type_mesh.end();it0++)
 293     for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it1=(*it0).begin();it1!=(*it0).end();it1++)
 294       (*it1)->getMesh()->renumberNodesWithOffsetInConn(-nMin);
 295   loadPartCoords(fid,mId,infosOnComp,mName,dt,it,nMin,nMax);
 296 }
 297
 298 void MEDFileUMeshL2::loadConnectivity(med_idt fid, int mdim, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 299 {
 300   _per_type_mesh.resize(1);
 301   _per_type_mesh[0].clear();
 302   for(int j=0;j<MED_N_CELL_FIXED_GEO;j++)
 303     {
 304       MEDFileUMeshPerType *tmp(MEDFileUMeshPerType::New(fid,mName.c_str(),dt,it,mdim,typmai[j],typmai2[j],mrs));
 305       if(tmp)
 306         _per_type_mesh[0].push_back(tmp);
 307     }
 308   sortTypes();
 309 }
 310
 311 void MEDFileUMeshL2::loadPartOfConnectivity(med_idt fid, int mdim, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
 312 {
 313   std::size_t nbOfTypes(types.size());
 314   if(slicPerTyp.size()!=3*nbOfTypes)
 315     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::loadPartOfConnectivity : The size of slicPerTyp array is expected to be equal to 3 times size of array types !");
 316   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> types2(types.begin(),types.end());
 317   if(types2.size()!=nbOfTypes)
 318     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshL2::loadPartOfConnectivity : the geometric types in types array must appear once !");
 319   _per_type_mesh.resize(1);
 320   _per_type_mesh[0].clear();
 321   for(std::size_t ii=0;ii<nbOfTypes;ii++)
 322     {
 323       int strt(slicPerTyp[3*ii+0]),stp(slicPerTyp[3*ii+1]),step(slicPerTyp[3*ii+2]);
 324       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> tmp(MEDFileUMeshPerType::NewPart(fid,mName.c_str(),dt,it,mdim,types[ii],strt,stp,step,mrs));
 325       _per_type_mesh[0].push_back(tmp);
 326     }
 327   sortTypes();
 328 }
 329
 330 void MEDFileUMeshL2::loadCoords(med_idt fid, int mId, const std::vector<std::string>& infosOnComp, const std::string& mName, int dt, int it)
 331 {
 332   int spaceDim((int)infosOnComp.size());
 333   med_bool changement,transformation;
 334   int nCoords(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&changement,&transformation));
 335   _coords=DataArrayDouble::New();
 336   _coords->alloc(nCoords,spaceDim);
 337   double *coordsPtr(_coords->getPointer());
 338   MEDmeshNodeCoordinateRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_FULL_INTERLACE,coordsPtr);
 339   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 340     {
 341       _fam_coords=DataArrayInt::New();
 342       _fam_coords->alloc(nCoords,1);
 343       MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,_fam_coords->getPointer());
 344     }
 345   else
 346     _fam_coords=0;
 347   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 348     {
 349       _num_coords=DataArrayInt::New();
 350       _num_coords->alloc(nCoords,1);
 351       MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,_num_coords->getPointer());
 352     }
 353   else
 354     _num_coords=0;
 355   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_NAME,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 356     {
 357       _name_coords=DataArrayAsciiChar::New();
 358       _name_coords->alloc(nCoords+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
 359       MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,_name_coords->getPointer());
 360       _name_coords->reAlloc(nCoords);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
 361     }
 362   else
 363     _name_coords=0;
 364   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
 365     _coords->setInfoOnComponent(i,infosOnComp[i]);
 366 }
 367
 368 void MEDFileUMeshL2::loadPartCoords(med_idt fid, int mId, const std::vector<std::string>& infosOnComp, const std::string& mName, int dt, int it, int nMin, int nMax)
 369 {
 370   med_bool changement,transformation;
 371   int spaceDim((int)infosOnComp.size()),nCoords(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&changement,&transformation));
 372   _coords=DataArrayDouble::New();
 373   int nbNodesToLoad(nMax-nMin);
 374   _coords->alloc(nbNodesToLoad,spaceDim);
 375   med_filter filter=MED_FILTER_INIT,filter2=MED_FILTER_INIT;
 376   MEDfilterBlockOfEntityCr(fid,/*nentity*/nCoords,/*nvaluesperentity*/1,/*nconstituentpervalue*/spaceDim,
 377                            MED_ALL_CONSTITUENT,MED_FULL_INTERLACE,MED_COMPACT_STMODE,MED_NO_PROFILE,
 378                            /*start*/nMin+1,/*stride*/1,/*count*/1,/*blocksize*/nbNodesToLoad,
 379                            /*lastblocksize=useless because count=1*/0,&filter);
 380   MEDmeshNodeCoordinateAdvancedRd(fid,mName.c_str(),dt,it,&filter,_coords->getPointer());
 381   _part_coords=PartDefinition::New(nMin,nMax,1);
 382   MEDfilterClose(&filter);
 383   MEDfilterBlockOfEntityCr(fid,nCoords,1,1,MED_ALL_CONSTITUENT,MED_FULL_INTERLACE,MED_COMPACT_STMODE,
 384                            MED_NO_PROFILE,nMin+1,1,1,nbNodesToLoad,0,&filter2);
 385   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 386     {
 387       _fam_coords=DataArrayInt::New();
 388       _fam_coords->alloc(nbNodesToLoad,1);
 389       MEDmeshEntityAttributeAdvancedRd(fid,mName.c_str(),MED_FAMILY_NUMBER,dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,&filter2,_fam_coords->getPointer());
 390     }
 391   else
 392     _fam_coords=0;
 393   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 394     {
 395       _num_coords=DataArrayInt::New();
 396       _num_coords->alloc(nbNodesToLoad,1);
 397       MEDmeshEntityAttributeAdvancedRd(fid,mName.c_str(),MED_NUMBER,dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,&filter2,_num_coords->getPointer());
 398     }
 399   else
 400     _num_coords=0;
 401   if(MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,MED_NAME,MED_NODAL,&changement,&transformation)>0)
 402     {
 403       _name_coords=DataArrayAsciiChar::New();
 404       _name_coords->alloc(nbNodesToLoad+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
 405       MEDmeshEntityAttributeAdvancedRd(fid,mName.c_str(),MED_NAME,dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,&filter2,_name_coords->getPointer());
 406       _name_coords->reAlloc(nbNodesToLoad);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
 407     }
 408   else
 409     _name_coords=0;
 410   MEDfilterClose(&filter2);
 411   _coords->setInfoOnComponents(infosOnComp);
 412 }
 413
 414 void MEDFileUMeshL2::sortTypes()
 415 {
 416   std::set<int> mdims;
 417   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> > tmp(_per_type_mesh[0]);
 418   _per_type_mesh.clear();
 419   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=tmp.begin();it!=tmp.end();it++)
 420     mdims.insert((*it)->getDim());
 421   if(mdims.empty())
 422     return;
 423   int mdim=*mdims.rbegin();
 424   _per_type_mesh.resize(mdim+1);
 425   for(int dim=mdim+1;dim!=0;dim--)
 426     {
 427       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >& elt=_per_type_mesh[mdim+1-dim];
 428       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=tmp.begin();it!=tmp.end();it++)
 429         if((*it)->getDim()==dim-1)
 430           elt.push_back(*it);
 431     }
 432   // suppression of contiguous empty levels at the end of _per_type_mesh.
 433   int nbOfUselessLev=0;
 434   bool isFirst=true;
 435   for(std::vector< std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> > >::reverse_iterator it2=_per_type_mesh.rbegin();it2!=_per_type_mesh.rend();it2++)
 436     {
 437       if((*it2).empty() && isFirst)
 438         {
 439           nbOfUselessLev++;
 440         }
 441       else
 442         isFirst=false;
 443     }
 444   _per_type_mesh.resize(_per_type_mesh.size()-nbOfUselessLev);
 445 }
 446
 447 void MEDFileUMeshL2::WriteCoords(med_idt fid, const std::string& mname, int dt, int it, double time, const DataArrayDouble *coords, const DataArrayInt *famCoords, const DataArrayInt *numCoords, const DataArrayAsciiChar *nameCoords)
 448 {
 449   if(!coords)
 450     return ;
 451   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,mname.c_str(),dt,it,time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->getConstPointer());
 452   if(famCoords)
 453     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,mname.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,famCoords->getNumberOfTuples(),famCoords->getConstPointer());
 454   if(numCoords)
 455     MEDmeshEntityNumberWr(fid,mname.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,numCoords->getNumberOfTuples(),numCoords->getConstPointer());
 456   if(nameCoords)
 457     {
 458       if(nameCoords->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
 459         {
 460           std::ostringstream oss; oss << " MEDFileUMeshL2::WriteCoords : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
 461           oss << " ! The array has " << nameCoords->getNumberOfComponents() << " components !";
 462           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 463         }
 464       MEDmeshEntityNameWr(fid,mname.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NO_GEOTYPE,nameCoords->getNumberOfTuples(),nameCoords->getConstPointer());
 465     }
 466 }
 467
 468 bool MEDFileUMeshL2::isFamDefinedOnLev(int levId) const
 469 {
 470   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=_per_type_mesh[levId].begin();it!=_per_type_mesh[levId].end();it++)
 471     if((*it)->getFam()==0)
 472       return false;
 473   return true;
 474 }
 475
 476 bool MEDFileUMeshL2::isNumDefinedOnLev(int levId) const
 477 {
 478   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=_per_type_mesh[levId].begin();it!=_per_type_mesh[levId].end();it++)
 479     if((*it)->getNum()==0)
 480       return false;
 481   return true;
 482 }
 483
 484 bool MEDFileUMeshL2::isNamesDefinedOnLev(int levId) const
 485 {
 486   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >::const_iterator it=_per_type_mesh[levId].begin();it!=_per_type_mesh[levId].end();it++)
 487     if((*it)->getNames()==0)
 488       return false;
 489   return true;
 490 }
 491
 492 MEDFileCMeshL2::MEDFileCMeshL2()
 493 {
 494 }
 495
 496 void MEDFileCMeshL2::loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it)
 497 {
 498   _name.set(mName.c_str());
 499   int nstep;
 500   int Mdim;
 501   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
 502   std::vector<std::string> infosOnComp=getAxisInfoOnMesh(fid,mId,mName.c_str(),meshType,nstep,Mdim);
 503   if(meshType!=CARTESIAN)
 504     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh type ! You are expected a structured one whereas in file it is not a structured !");
 505   _time=CheckMeshTimeStep(fid,mName,nstep,dt,it);
 506   _iteration=dt;
 507   _order=it;
 508   //
 509   med_grid_type gridtype;
 510   MEDmeshGridTypeRd(fid,mName.c_str(),&gridtype);
 511   if(gridtype!=MED_CARTESIAN_GRID)
 512     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid structured mesh ! Expected cartesian mesh type !");
 513   _cmesh=MEDCouplingCMesh::New();
 514   for(int i=0;i<Mdim;i++)
 515     {
 516       med_data_type dataTypeReq=GetDataTypeCorrespondingToSpaceId(i);
 517       med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
 518       int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,dataTypeReq,MED_NO_CMODE,&chgt,&trsf);
 519       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> da=DataArrayDouble::New();
 520       da->alloc(nbOfElt,1);
 521       da->setInfoOnComponent(0,infosOnComp[i]);
 522       MEDmeshGridIndexCoordinateRd(fid,mName.c_str(),dt,it,i+1,da->getPointer());
 523       _cmesh->setCoordsAt(i,da);
 524     }
 525 }
 526
 527 med_data_type MEDFileCMeshL2::GetDataTypeCorrespondingToSpaceId(int id)
 528 {
 529   switch(id)
 530   {
 531     case 0:
 532       return MED_COORDINATE_AXIS1;
 533     case 1:
 534       return MED_COORDINATE_AXIS2;
 535     case 2:
 536       return MED_COORDINATE_AXIS3;
 537     default:
 538       throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid meshdim detected in Cartesian Grid !");
 539   }
 540 }
 541
 542 MEDFileCLMeshL2::MEDFileCLMeshL2()
 543 {
 544 }
 545
 546 void MEDFileCLMeshL2::loadAll(med_idt fid, int mId, const std::string& mName, int dt, int it)
 547 {
 548   _name.set(mName.c_str());
 549   int nstep;
 550   int Mdim;
 551   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
 552   std::vector<std::string> infosOnComp=getAxisInfoOnMesh(fid,mId,mName,meshType,nstep,Mdim);
 553   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
 554     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh type ! You are expected a structured one whereas in file it is not a structured !");
 555   _time=CheckMeshTimeStep(fid,mName,nstep,dt,it);
 556   _iteration=dt;
 557   _order=it;
 558   //
 559   _clmesh=MEDCouplingCurveLinearMesh::New();
 560   INTERP_KERNEL::AutoPtr<int> stGrid=new int[Mdim];
 561   MEDmeshGridStructRd(fid,mName.c_str(),dt,it,stGrid);
 562   _clmesh->setNodeGridStructure(stGrid,((int *)stGrid)+Mdim);
 563   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
 564   int nbNodes=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_COORDINATE,MED_NO_CMODE,&chgt,&trsf);
 565   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> da=DataArrayDouble::New();
 566   da->alloc(nbNodes,infosOnComp.size());
 567   da->setInfoOnComponents(infosOnComp);
 568   MEDmeshNodeCoordinateRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_FULL_INTERLACE,da->getPointer());
 569   _clmesh->setCoords(da);
 570 }
 571
 572 MEDFileUMeshPermCompute::MEDFileUMeshPermCompute(const MEDFileUMeshSplitL1* st):_st(st),_mpt_time(0),_num_time(0)
 573 {
 574 }
 575
 576 /*!
 577  * Warning it returns an instance to deallocate !!!!
 578  */
 579 MEDFileUMeshPermCompute::operator MEDCouplingUMesh *() const
 580 {
 581   _st->_num->updateTime();
 582   if((MEDCouplingUMesh *)_m==0)
 583     {
 584       updateTime();
 585       _m=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(_st->_m_by_types.getUmesh()->deepCpy());
 586       _m->renumberCells(_st->_num->getConstPointer(),true);
 587       return _m.retn();
 588     }
 589   else
 590     {
 591       if(_mpt_time==_st->_m_by_types.getTimeOfThis() && _num_time==_st->_num->getTimeOfThis())
 592         return _m.retn();
 593       else
 594         {
 595           updateTime();
 596           _m=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(_st->_m_by_types.getUmesh()->deepCpy());
 597           _m->renumberCells(_st->_num->getConstPointer(),true);
 598           return _m.retn();
 599         }
 600     }
 601 }
 602
 603 void MEDFileUMeshPermCompute::operator=(MEDCouplingUMesh *m)
 604 {
 605   _m=m;
 606 }
 607
 608 void MEDFileUMeshPermCompute::updateTime() const
 609 {
 610   _mpt_time=_st->_m_by_types.getTimeOfThis();
 611   _num_time=_st->_num->getTimeOfThis();
 612 }
 613
 614 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMeshPermCompute::getDirectChildrenWithNull() const
 615 {
 616   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
 617   ret.push_back((const MEDCouplingUMesh *)_m);
 618   return ret;
 619 }
 620
 621 std::size_t MEDFileUMeshPermCompute::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 622 {
 623   return sizeof(MEDFileUMeshPermCompute);
 624 }
 625
 626 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshSplitL1& other):RefCountObject(other),_m_by_types(other._m_by_types),_fam(other._fam),_num(other._num),_names(other._names),_rev_num(other._rev_num),_m(this)
 627 {
 628 }
 629
 630 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(const MEDFileUMeshL2& l2, const std::string& mName, int id):_m(this)
 631 {
 632   const std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshPerType> >& v=l2.getLev(id);
 633   if(v.empty())
 634     return;
 635   int sz=v.size();
 636   std::vector<const MEDCoupling1GTUMesh *> ms(sz);
 637   std::vector<const DataArrayInt *> fams(sz),nums(sz);
 638   std::vector<const DataArrayChar *> names(sz);
 639   std::vector<const PartDefinition *> pds(sz);
 640   for(int i=0;i<sz;i++)
 641     {
 642       MEDCoupling1GTUMesh *elt(v[i]->getMesh());
 643       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp2=l2.getCoords();
 644       elt->setCoords(tmp2);
 645       ms[i]=elt;
 646       pds[i]=v[i]->getPartDef();
 647     }
 648   _m_by_types.assignParts(ms);
 649   _m_by_types.assignDefParts(pds);
 650   if(l2.isFamDefinedOnLev(id))
 651     {
 652       for(int i=0;i<sz;i++)
 653         fams[i]=v[i]->getFam();
 654       if(sz!=1)
 655         _fam=DataArrayInt::Aggregate(fams);
 656       else
 657         {
 658           fams[0]->incrRef();
 659           _fam=const_cast<DataArrayInt *>(fams[0]);
 660         }
 661     }
 662   if(l2.isNumDefinedOnLev(id))
 663     {
 664       for(int i=0;i<sz;i++)
 665         nums[i]=v[i]->getNum();
 666       if(sz!=1)
 667         _num=DataArrayInt::Aggregate(nums);
 668       else
 669         {
 670           nums[0]->incrRef();
 671           _num=const_cast<DataArrayInt *>(nums[0]);
 672         }
 673       computeRevNum();
 674     }
 675   if(l2.isNamesDefinedOnLev(id))
 676     {
 677       for(int i=0;i<sz;i++)
 678         names[i]=v[i]->getNames();
 679       _names=dynamic_cast<DataArrayAsciiChar *>(DataArrayChar::Aggregate(names));
 680     }
 681 }
 682
 683 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(MEDCoupling1GTUMesh *m):_m(this)
 684 {
 685   std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * > v(1);
 686   v[0]=m;
 687   assignParts(v);
 688 }
 689
 690 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(MEDCouplingUMesh *m):_m(this)
 691 {
 692   assignMesh(m,true);
 693 }
 694
 695 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld):_m(this)
 696 {
 697   assignMesh(m,newOrOld);
 698 }
 699
 700 void MEDFileUMeshSplitL1::setName(const std::string& name)
 701 {
 702   _m_by_types.setName(name);
 703 }
 704
 705 std::size_t MEDFileUMeshSplitL1::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 706 {
 707   return 0;
 708 }
 709
 710 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMeshSplitL1::getDirectChildrenWithNull() const
 711 {
 712   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
 713   ret.push_back(&_m_by_types);
 714   ret.push_back(&_m);
 715   ret.push_back((const DataArrayInt*)_fam);
 716   ret.push_back((const DataArrayInt*)_num);
 717   ret.push_back((const DataArrayInt*)_rev_num);
 718   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar*)_names);
 719   return ret;
 720 }
 721
 722 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMeshSplitL1::deepCpy(DataArrayDouble *coords) const
 723 {
 724   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> ret=new MEDFileUMeshSplitL1(*this);
 725   ret->_m_by_types=_m_by_types.deepCpy(coords);
 726   if((const DataArrayInt *)_fam)
 727     ret->_fam=_fam->deepCpy();
 728   if((const DataArrayInt *)_num)
 729     ret->_num=_num->deepCpy();
 730   if((const DataArrayInt *)_rev_num)
 731     ret->_rev_num=_rev_num->deepCpy();
 732   if((const DataArrayAsciiChar *)_names)
 733     ret->_names=_names->deepCpy();
 734   return ret.retn();
 735 }
 736
 737 bool MEDFileUMeshSplitL1::isEqual(const MEDFileUMeshSplitL1 *other, double eps, std::string& what) const
 738 {
 739   if(!_m_by_types.isEqual(other->_m_by_types,eps,what))
 740     return false;
 741   const DataArrayInt *d1=_fam;
 742   const DataArrayInt *d2=other->_fam;
 743   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
 744     {
 745       what="Presence of family arr in one sublevel and not in other!";
 746       return false;
 747     }
 748   if(d1)
 749     if(!d1->isEqual(*d2))
 750       {
 751         what="family arr at a sublevel are not deeply equal !";
 752         return false;
 753       }
 754   d1=_num;
 755   d2=other->_num;
 756   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
 757     {
 758       what="Presence of cell numbering arr in one sublevel and not in other!";
 759       return false;
 760     }
 761   if(d1)
 762     if(!d1->isEqual(*d2))
 763       {
 764         what="Numbering cell arr at a sublevel are not deeply equal !";
 765         return false;
 766       }
 767   const DataArrayAsciiChar *e1=_names;
 768   const DataArrayAsciiChar *e2=other->_names;
 769   if((e1==0 && e2!=0) || (e1!=0 && e2==0))
 770     {
 771       what="Presence of cell names arr in one sublevel and not in other!";
 772       return false;
 773     }
 774   if(e1)
 775     if(!e1->isEqual(*e2))
 776       {
 777         what="Name cell arr at a sublevel are not deeply equal !";
 778         return false;
 779       }
 780   return true;
 781 }
 782
 783 void MEDFileUMeshSplitL1::synchronizeTinyInfo(const MEDFileMesh& master) const
 784 {
 785   _m_by_types.synchronizeTinyInfo(master);
 786 }
 787
 788 void MEDFileUMeshSplitL1::clearNonDiscrAttributes() const
 789 {
 790   _m_by_types.clearNonDiscrAttributes();
 791 }
 792
 793 void MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(const MEDCouplingMesh *tmp)
 794 {
 795   if(!tmp)
 796     return ;
 797   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setName("");
 798   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setDescription("");
 799   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setTime(0.,-1,-1);
 800   (const_cast<MEDCouplingMesh *>(tmp))->setTimeUnit("");
 801 }
 802
 803 void MEDFileUMeshSplitL1::setCoords(DataArrayDouble *coords)
 804 {
 805   _m_by_types.setCoords(coords);
 806 }
 807
 808 void MEDFileUMeshSplitL1::assignMesh(MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld)
 809 {
 810   if(newOrOld)
 811     {
 812       m->incrRef();
 813       _m=m;
 814       _m_by_types.assignUMesh(dynamic_cast<MEDCouplingUMesh *>(m->deepCpy()));
 815       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da=_m_by_types.getUmesh()->getRenumArrForConsecutiveCellTypesSpec(typmai2,typmai2+MED_N_CELL_FIXED_GEO);
 816       if(!da->isIdentity())
 817         {
 818           _num=da->invertArrayO2N2N2O(m->getNumberOfCells());
 819           _m.updateTime();
 820           computeRevNum();
 821           _m_by_types.getUmesh()->renumberCells(da->getConstPointer(),false);
 822         }
 823     }
 824   else
 825     {
 826       if(!m->checkConsecutiveCellTypesAndOrder(typmai2,typmai2+MED_N_CELL_FIXED_GEO))
 827         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshSplitL1::assignMesh : the mode of mesh setting expects to follow the MED file numbering convention ! it is not the case !");
 828       m->incrRef();
 829       _m_by_types.assignUMesh(m);
 830     }
 831   assignCommonPart();
 832 }
 833
 834 void MEDFileUMeshSplitL1::forceComputationOfParts() const
 835 {
 836   _m_by_types.forceComputationOfPartsFromUMesh();
 837 }
 838
 839 void MEDFileUMeshSplitL1::assignParts(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * >& mParts)
 840 {
 841   _m_by_types.assignParts(mParts);
 842   assignCommonPart();
 843 }
 844
 845 MEDFileUMeshSplitL1::MEDFileUMeshSplitL1():_m(this)
 846 {
 847 }
 848
 849 void MEDFileUMeshSplitL1::assignCommonPart()
 850 {
 851   _fam=DataArrayInt::New();
 852   _fam->alloc(_m_by_types.getSize(),1);
 853   _fam->fillWithValue(0);
 854 }
 855
 856 bool MEDFileUMeshSplitL1::empty() const
 857 {
 858   return _m_by_types.empty();
 859 }
 860
 861 bool MEDFileUMeshSplitL1::presenceOfOneFams(const std::vector<int>& ids) const
 862 {
 863   const DataArrayInt *fam=_fam;
 864   if(!fam)
 865     return false;
 866   return fam->presenceOfValue(ids);
 867 }
 868
 869 int MEDFileUMeshSplitL1::getMeshDimension() const
 870 {
 871   return _m_by_types.getMeshDimension();
 872 }
 873
 874 void MEDFileUMeshSplitL1::simpleRepr(std::ostream& oss) const
 875 {
 876   std::vector<int> code=_m_by_types.getDistributionOfTypes();
 877   int nbOfTypes=code.size()/3;
 878   for(int i=0;i<nbOfTypes;i++)
 879     {
 880       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType typ=(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType) code[3*i];
 881       oss << "    - Number of cells with type " << INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(typ).getRepr() << " : " << code[3*i+1] << std::endl;
 882     }
 883 }
 884
 885 int MEDFileUMeshSplitL1::getSize() const
 886 {
 887   return _m_by_types.getSize();
 888 }
 889
 890 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::getFamilyPart(const int *idsBg, const int *idsEnd, bool renum) const
 891 {
 892   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> eltsToKeep=_fam->getIdsEqualList(idsBg,idsEnd);
 893   MEDCouplingUMesh *m=(MEDCouplingUMesh *)_m_by_types.getUmesh()->buildPartOfMySelf(eltsToKeep->getConstPointer(),eltsToKeep->getConstPointer()+eltsToKeep->getNumberOfTuples(),true);
 894   if(renum)
 895     return renumIfNeeded(m,eltsToKeep->getConstPointer());
 896   return m;
 897 }
 898
 899 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getFamilyPartArr(const int *idsBg, const int *idsEnd, bool renum) const
 900 {
 901   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da=_fam->getIdsEqualList(idsBg,idsEnd);
 902   if(renum)
 903     return renumIfNeededArr(da);
 904   return da.retn();
 905 }
 906
 907 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMeshSplitL1::getGeoTypes() const
 908 {
 909   return _m_by_types.getGeoTypes();
 910 }
 911
 912 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::getWholeMesh(bool renum) const
 913 {
 914   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp;
 915   if(renum && ((const DataArrayInt *)_num))
 916     tmp=_m;
 917   else
 918     { tmp=_m_by_types.getUmesh(); if(tmp) tmp->incrRef(); }
 919   return tmp.retn();
 920 }
 921
 922 int MEDFileUMeshSplitL1::getNumberOfCells() const
 923 {
 924   return _m_by_types.getNumberOfCells();
 925 }
 926
 927 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
 928 {
 929   const DataArrayInt *fam(_fam);
 930   if(!fam)
 931     return 0;
 932   int start(0),stop(0);
 933   _m_by_types.getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(gt,start,stop);
 934   return fam->selectByTupleId2(start,stop,1);
 935 }
 936
 937 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
 938 {
 939   const DataArrayInt *num(_num);
 940   if(!num)
 941     return 0;
 942   int start(0),stop(0);
 943   _m_by_types.getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(gt,start,stop);
 944   return num->selectByTupleId2(start,stop,1);
 945 }
 946
 947 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getOrCreateAndGetFamilyField()
 948 {
 949   if((DataArrayInt *)_fam)
 950     return _fam;
 951   int nbOfTuples=_m_by_types.getSize();
 952   _fam=DataArrayInt::New(); _fam->alloc(nbOfTuples,1); _fam->fillWithZero();
 953   return _fam;
 954 }
 955
 956 const DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getFamilyField() const
 957 {
 958   return _fam;
 959 }
 960
 961 const DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getNumberField() const
 962 {
 963   return _num;
 964 }
 965
 966 const DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::getRevNumberField() const
 967 {
 968   return _rev_num;
 969 }
 970
 971 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMeshSplitL1::getNameField() const
 972 {
 973   return _names;
 974 }
 975
 976 const PartDefinition *MEDFileUMeshSplitL1::getPartDef(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
 977 {
 978   return _m_by_types.getPartDefOfWithoutComputation(gt);
 979 }
 980
 981 void MEDFileUMeshSplitL1::eraseFamilyField()
 982 {
 983   _fam->fillWithZero();
 984 }
 985
 986 /*!
 987  * This method ignores _m and _m_by_types.
 988  */
 989 void MEDFileUMeshSplitL1::setGroupsFromScratch(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, std::map<std::string,int>& familyIds,
 990                                                std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups)
 991 {
 992   std::vector< DataArrayInt * > corr;
 993   _m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,0,corr);
 994   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corrMSafe(corr.begin(),corr.end());
 995   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
 996   std::vector< const DataArrayInt * > corr2(corr.begin(),corr.end());
 997   _fam=DataArrayInt::MakePartition(corr2,((MEDCouplingUMesh *)_m)->getNumberOfCells(),fidsOfGroups);
 998   int nbOfCells=((MEDCouplingUMesh *)_m)->getNumberOfCells();
 999   std::map<int,std::string> newfams;
1000   std::map<int,int> famIdTrad;
1001   TraduceFamilyNumber(fidsOfGroups,familyIds,famIdTrad,newfams);
1002   int *w=_fam->getPointer();
1003   for(int i=0;i<nbOfCells;i++,w++)
1004     *w=famIdTrad[*w];
1005 }
1006
1007 void MEDFileUMeshSplitL1::write(med_idt fid, const std::string& mName, int mdim) const
1008 {
1009   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ms(_m_by_types.getParts());
1010   int start=0;
1011   for(std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
1012     {
1013       int nbCells=(*it)->getNumberOfCells();
1014       int end=start+nbCells;
1015       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam,num;
1016       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> names;
1017       if((const DataArrayInt *)_fam)
1018         fam=_fam->substr(start,end);
1019       if((const DataArrayInt *)_num)
1020         num=_num->substr(start,end);
1021       if((const DataArrayAsciiChar *)_names)
1022         names=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_names->substr(start,end));
1023       MEDFileUMeshPerType::Write(fid,mName,mdim,(*it),fam,num,names);
1024       start=end;
1025     }
1026 }
1027
1028 void MEDFileUMeshSplitL1::renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N)
1029 {
1030   _m_by_types.renumberNodesInConnWithoutComputation(newNodeNumbersO2N);
1031 }
1032
1033 void MEDFileUMeshSplitL1::serialize(std::vector<int>& tinyInt, std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >& bigArraysI) const
1034 {
1035   bigArraysI.push_back(_fam);
1036   bigArraysI.push_back(_num);
1037   _m_by_types.serialize(tinyInt,bigArraysI);
1038 }
1039
1040 void MEDFileUMeshSplitL1::unserialize(const std::string& name, DataArrayDouble *coo, std::vector<int>& tinyInt, std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >& bigArraysI)
1041 {
1042   _fam=bigArraysI.back(); bigArraysI.pop_back();
1043   _num=bigArraysI.back(); bigArraysI.pop_back();
1044   _m_by_types.unserialize(name,coo,tinyInt,bigArraysI);
1045 }
1046
1047 void MEDFileUMeshSplitL1::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
1048 {
1049   DataArrayInt *arr=_fam;
1050   if(arr)
1051     arr->changeValue(oldId,newId);
1052 }
1053
1054 void MEDFileUMeshSplitL1::setFamilyArr(DataArrayInt *famArr)
1055 {
1056   if(!famArr)
1057     {
1058       _fam=0;
1059       return ;
1060     }
1061   int sz(_m_by_types.getSize());
1062   famArr->checkNbOfTuplesAndComp(sz,1,"MEDFileUMeshSplitL1::setFamilyArr : Problem in size of Family arr ! ");
1063   famArr->incrRef();
1064   _fam=famArr;
1065 }
1066
1067 void MEDFileUMeshSplitL1::setRenumArr(DataArrayInt *renumArr)
1068 {
1069   if(!renumArr)
1070     {
1071       _num=0;
1072       _rev_num=0;
1073       return ;
1074     }
1075   int sz(_m_by_types.getSize());
1076   renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(sz,1,"MEDFileUMeshSplitL1::setRenumArr : Problem in size of numbering arr ! ");
1077   renumArr->incrRef();
1078   _num=renumArr;
1079   computeRevNum();
1080 }
1081
1082 void MEDFileUMeshSplitL1::setNameArr(DataArrayAsciiChar *nameArr)
1083 {
1084   if(!nameArr)
1085     {
1086       _names=0;
1087       return ;
1088     }
1089   int sz(_m_by_types.getSize());
1090   nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(sz,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMeshSplitL1::setNameArr : Problem in size of name arr ! ");
1091   nameArr->incrRef();
1092   _names=nameArr;
1093 }
1094
1095 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::Renumber2(const DataArrayInt *renum, MEDCouplingUMesh *m, const int *cellIds)
1096 {
1097   if(renum==0)
1098     return m;
1099   if(cellIds==0)
1100     m->renumberCells(renum->getConstPointer(),true);
1101   else
1102     {
1103       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> locnum=renum->selectByTupleId(cellIds,cellIds+m->getNumberOfCells());
1104       m->renumberCells(locnum->getConstPointer(),true);
1105     }
1106   return m;
1107 }
1108
1109 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMeshSplitL1::Unserialize(const std::string& name, DataArrayDouble *coo, std::vector<int>& tinyInt, std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >& bigArraysI)
1110 {
1111   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> ret(new MEDFileUMeshSplitL1);
1112   ret->unserialize(name,coo,tinyInt,bigArraysI);
1113   return ret.retn();
1114 }
1115
1116 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshSplitL1::renumIfNeeded(MEDCouplingUMesh *m, const int *cellIds) const
1117 {
1118   return Renumber2(_num,m,cellIds);
1119 }
1120
1121 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(const DataArrayInt *renum, const DataArrayInt *da)
1122 {
1123   if((const DataArrayInt *)renum==0)
1124     {
1125       da->incrRef();
1126       return const_cast<DataArrayInt *>(da);
1127     }
1128   return renum->selectByTupleId(da->getConstPointer(),da->getConstPointer()+da->getNumberOfTuples());
1129 }
1130
1131 DataArrayInt *MEDFileUMeshSplitL1::renumIfNeededArr(const DataArrayInt *da) const
1132 {
1133   return Renumber(_num,da);
1134 }
1135
1136 std::vector<int> MEDFileUMeshSplitL1::GetNewFamiliesNumber(int nb, const std::map<std::string,int>& families)
1137 {
1138   int id=-1;
1139   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++)
1140     id=std::max(id,(*it).second);
1141   if(id==-1)
1142     id=0;
1143   std::vector<int> ret(nb);
1144   for(int i=1;i<=nb;i++)
1145     ret[i]=id+i;
1146   return ret;
1147 }
1148
1149 void MEDFileUMeshSplitL1::TraduceFamilyNumber(const std::vector< std::vector<int> >& fidsGrps, std::map<std::string,int>& familyIds,
1150                                               std::map<int,int>& famIdTrad, std::map<int,std::string>& newfams)
1151 {
1152   std::set<int> allfids;
1153   //tony
1154 }
1155
1156 void MEDFileUMeshSplitL1::computeRevNum() const
1157 {
1158   int pos;
1159   int maxValue=_num->getMaxValue(pos);
1160   _rev_num=_num->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
1161 }
1162
1163 //=
1164
1165 MEDFileUMeshAggregateCompute::MEDFileUMeshAggregateCompute():_mp_time(0),_m_time(0)
1166 {
1167 }
1168
1169 void MEDFileUMeshAggregateCompute::setName(const std::string& name)
1170 {
1171   if(_m_time>=_mp_time)
1172     {
1173       MEDCouplingUMesh *um(_m);
1174       if(um)
1175         um->setName(name);
1176     }
1177   if(_mp_time>=_m_time)
1178     {
1179       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1180         {
1181           MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1182           if(tmp)
1183             tmp->setName(name);
1184         }
1185     }
1186 }
1187
1188 void MEDFileUMeshAggregateCompute::assignParts(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh * >& mParts)
1189 {
1190   std::size_t sz(mParts.size());
1191   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> > ret(sz);
1192   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1193     {
1194       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(mParts[i]);
1195       if(!elt)
1196         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::assignParts : presence of null pointer !");
1197       ret[i]=const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(elt); elt->incrRef();
1198     }
1199   _m_parts=ret;
1200   _part_def.clear(); _part_def.resize(sz);
1201   _mp_time=std::max(_mp_time,_m_time)+1;
1202   _m=0;
1203 }
1204
1205 void MEDFileUMeshAggregateCompute::assignDefParts(const std::vector<const PartDefinition *>& partDefs)
1206 {
1207   if(_mp_time<_m_time)
1208     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::assignDefParts : the parts require a computation !");
1209   std::size_t sz(partDefs.size());
1210   if(_part_def.size()!=partDefs.size() || _part_def.size()!=_m_parts.size())
1211     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::assignDefParts : sizes of vectors of part definition mismatch !");
1212   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1213     {
1214       const PartDefinition *elt(partDefs[i]);
1215       if(elt)
1216         elt->incrRef();
1217       _part_def[i]=const_cast<PartDefinition*>(elt);
1218     }
1219 }
1220
1221 void MEDFileUMeshAggregateCompute::assignUMesh(MEDCouplingUMesh *m)
1222 {
1223   _m=m;
1224   _m_parts.clear();
1225   _m_time=std::max(_mp_time,_m_time)+1;
1226 }
1227
1228 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMeshAggregateCompute::getUmesh() const
1229 {
1230   if(_mp_time<=_m_time)
1231     return _m;
1232   std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh *> mp(_m_parts.size());
1233   std::copy(_m_parts.begin(),_m_parts.end(),mp.begin());
1234   _m=MEDCoupling1GTUMesh::AggregateOnSameCoordsToUMesh(mp);
1235   _m_parts.clear();//to avoid memory peak !
1236   _m_time=_mp_time+1;//+1 is important ! That is to say that only _m is OK not _m_parts because cleared !
1237   return _m;
1238 }
1239
1240 int MEDFileUMeshAggregateCompute::getNumberOfCells() const
1241 {
1242   if(_mp_time<=_m_time)
1243     return _m->getNumberOfCells();
1244   int ret(0);
1245   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1246     ret+=(*it)->getNumberOfCells();
1247   return ret;
1248 }
1249
1250 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMeshAggregateCompute::getGeoTypes() const
1251 {
1252   if(_mp_time>=_m_time)
1253     {
1254       std::size_t sz(_m_parts.size());
1255       std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(sz);
1256       for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1257         ret[i]=_m_parts[i]->getCellModelEnum();
1258       return ret;
1259     }
1260   else
1261     return _m->getAllGeoTypesSorted();
1262 }
1263
1264 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMeshAggregateCompute::retrievePartsWithoutComputation() const
1265 {
1266   if(_mp_time<_m_time)
1267     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartsWithoutComputation : the parts require a computation !");
1268   //
1269   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ret(_m_parts.size());
1270   std::size_t i(0);
1271   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++,i++)
1272     {
1273       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(*it);
1274       ret[i]=const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(elt);
1275     }
1276   return ret;
1277 }
1278
1279 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMeshAggregateCompute::getParts() const
1280 {
1281   if(_mp_time<_m_time)
1282     forceComputationOfPartsFromUMesh();
1283   return retrievePartsWithoutComputation();
1284 }
1285
1286 MEDCoupling1GTUMesh *MEDFileUMeshAggregateCompute::retrievePartWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
1287 {
1288   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> v(retrievePartsWithoutComputation());
1289   std::size_t sz(v.size());
1290   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1291     {
1292       if(v[i])
1293         if(v[i]->getCellModelEnum()==gt)
1294           return v[i];
1295     }
1296   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartWithoutComputation : the geometric type is not existing !");
1297 }
1298
1299 void MEDFileUMeshAggregateCompute::getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt, int& start, int& stop) const
1300 {
1301   start=0; stop=0;
1302   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> v(retrievePartsWithoutComputation());
1303   std::size_t sz(v.size());
1304   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1305     {
1306       if(v[i])
1307         {
1308           if(v[i]->getCellModelEnum()==gt)
1309             {
1310               stop=start+v[i]->getNumberOfCells();
1311               return;
1312             }
1313           else
1314             start+=v[i]->getNumberOfCells();
1315         }
1316     }
1317   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getStartStopOfGeoTypeWithoutComputation : the geometric type is not existing !");
1318 }
1319
1320 void MEDFileUMeshAggregateCompute::renumberNodesInConnWithoutComputation(const int *newNodeNumbersO2N)
1321 {
1322   if(_mp_time>_m_time)
1323     {
1324       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1325         {
1326           MEDCoupling1GTUMesh *m(*it);
1327           if(m)
1328             m->renumberNodesInConn(newNodeNumbersO2N);
1329         }
1330     }
1331   else
1332     {
1333       MEDCouplingUMesh *m(getUmesh());
1334       if(!m)
1335         return;
1336       m->renumberNodesInConn(newNodeNumbersO2N);
1337     }
1338 }
1339
1340 void MEDFileUMeshAggregateCompute::forceComputationOfPartsFromUMesh() const
1341 {
1342   const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1343   if(!m)
1344     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::forceComputationOfPartsFromUMesh : null UMesh !");
1345   std::vector<MEDCouplingUMesh *> ms(m->splitByType());
1346   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> > msMSafe(ms.begin(),ms.end());
1347   std::size_t sz(msMSafe.size());
1348   _m_parts.resize(sz);
1349   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1350     _m_parts[i]=MEDCoupling1GTUMesh::New(ms[i]);
1351   _part_def.clear();
1352   _part_def.resize(_m_parts.size());
1353   _mp_time=std::max(_mp_time,_m_time);
1354 }
1355
1356 const PartDefinition *MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartDefOfWithoutComputation(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
1357 {
1358   if(_mp_time<_m_time)
1359     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartDefOfWithoutComputation : the parts require a computation !");
1360   if(_m_parts.size()!=_part_def.size())
1361     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartDefOfWithoutComputation : size of arrays are expected to be the same !");
1362   std::size_t sz(_m_parts.size());
1363   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1364     {
1365       const MEDCoupling1GTUMesh *mesh(_m_parts[i]);
1366       if(mesh)
1367         if(mesh->getCellModelEnum()==gt)
1368           return _part_def[i];
1369     }
1370   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getPartDefOfWithoutComputation : The input geo type is not existing in this !");
1371 }
1372
1373 void MEDFileUMeshAggregateCompute::serialize(std::vector<int>& tinyInt, std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >& bigArraysI) const
1374 {
1375   if(_mp_time<_m_time)
1376     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::serialize : the parts require a computation !");
1377   std::size_t sz(_m_parts.size());
1378   tinyInt.push_back((int)sz);
1379   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1380     {
1381       const MEDCoupling1GTUMesh *mesh(_m_parts[i]);
1382       if(!mesh)
1383         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::serialize : one part is empty !");
1384       tinyInt.push_back(mesh->getCellModelEnum());
1385       const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh1(dynamic_cast<const MEDCoupling1SGTUMesh *>(mesh));
1386       const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh2(dynamic_cast<const MEDCoupling1DGTUMesh *>(mesh));
1387       if(mesh1)
1388         {
1389           DataArrayInt *elt(mesh1->getNodalConnectivity());
1390           if(elt)
1391             elt->incrRef();
1392           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> elt1(elt);
1393           bigArraysI.push_back(elt1);
1394         }
1395       else if(mesh2)
1396         {
1397           DataArrayInt *elt1(mesh2->getNodalConnectivity()),*elt2(mesh2->getNodalConnectivityIndex());
1398           if(elt1)
1399             elt1->incrRef();
1400           if(elt2)
1401             elt2->incrRef();
1402           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> elt11(elt1),elt22(elt2);
1403           bigArraysI.push_back(elt11); bigArraysI.push_back(elt22);
1404         }
1405       else
1406         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::serialize : unrecognized single geo type mesh !");
1407       const PartDefinition *pd(_part_def[i]);
1408       if(!pd)
1409         tinyInt.push_back(-1);
1410       else
1411         {
1412           std::vector<int> tinyTmp;
1413           pd->serialize(tinyTmp,bigArraysI);
1414           tinyInt.push_back((int)tinyTmp.size());
1415           tinyInt.insert(tinyInt.end(),tinyTmp.begin(),tinyTmp.end());
1416         }
1417     }
1418 }
1419
1420 void MEDFileUMeshAggregateCompute::unserialize(const std::string& name, DataArrayDouble *coo, std::vector<int>& tinyInt, std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >& bigArraysI)
1421 {
1422   int nbParts(tinyInt.back()); tinyInt.pop_back();
1423   _part_def.clear(); _part_def.resize(nbParts);
1424   _m_parts.clear(); _m_parts.resize(nbParts);
1425   for(int i=0;i<nbParts;i++)
1426     {
1427       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType tp((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType) tinyInt.back()); tinyInt.pop_back();
1428       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> mesh(MEDCoupling1GTUMesh::New(name,tp));
1429       mesh->setCoords(coo);
1430       MEDCoupling1SGTUMesh *mesh1(dynamic_cast<MEDCoupling1SGTUMesh *>((MEDCoupling1GTUMesh *) mesh));
1431       MEDCoupling1DGTUMesh *mesh2(dynamic_cast<MEDCoupling1DGTUMesh *>((MEDCoupling1GTUMesh *) mesh));
1432       if(mesh1)
1433         {
1434           mesh1->setNodalConnectivity(bigArraysI.back()); bigArraysI.pop_back();
1435         }
1436       else if(mesh2)
1437         {
1438           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> elt0,elt1;
1439           elt0=bigArraysI.back(); bigArraysI.pop_back();
1440           elt1=bigArraysI.back(); bigArraysI.pop_back();
1441           mesh2->setNodalConnectivity(elt0,elt1);
1442         }
1443       else
1444         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::unserialize : unrecognized single geo type mesh !");
1445       _m_parts[i]=mesh;
1446       int pdid(tinyInt.back()); tinyInt.pop_back();
1447       if(pdid!=-1)
1448         _part_def[i]=PartDefinition::Unserialize(tinyInt,bigArraysI);
1449       _mp_time=std::max(_mp_time,_m_time)+1;
1450     }
1451 }
1452
1453 /*!
1454  * This method returns true if \a this is stored split by type false if stored in a merged unstructured mesh.
1455  */
1456 bool MEDFileUMeshAggregateCompute::isStoredSplitByType() const
1457 {
1458   return _mp_time>=_m_time;
1459 }
1460
1461 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfThis() const
1462 {
1463   if(_mp_time>_m_time)
1464     return getTimeOfParts();
1465   if(_m_time>_mp_time)
1466     return getTimeOfUMesh();
1467   return std::max(getTimeOfParts(),getTimeOfUMesh());
1468 }
1469
1470 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfParts() const
1471 {
1472   std::size_t ret(0);
1473   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1474     {
1475       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(*it);
1476       if(!elt)
1477         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfParts : null obj in parts !");
1478       ret=std::max(ret,elt->getTimeOfThis());
1479     }
1480   if(ret==0)
1481     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfParts : parts is empty !");
1482   return ret;
1483 }
1484
1485 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfUMesh() const
1486 {
1487   const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1488   if(!m)
1489     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getTimeOfUMesh : unmesh is null !");
1490   return m->getTimeOfThis();
1491 }
1492
1493 std::size_t MEDFileUMeshAggregateCompute::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1494 {
1495   std::size_t ret(_m_parts.size()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh>));
1496   return ret;
1497 }
1498
1499 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMeshAggregateCompute::getDirectChildrenWithNull() const
1500 {
1501   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
1502   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1503     ret.push_back((const MEDCoupling1GTUMesh *)*it);
1504   ret.push_back((const MEDCouplingUMesh *)_m);
1505   return ret;
1506 }
1507
1508 MEDFileUMeshAggregateCompute MEDFileUMeshAggregateCompute::deepCpy(DataArrayDouble *coords) const
1509 {
1510   MEDFileUMeshAggregateCompute ret;
1511   ret._m_parts.resize(_m_parts.size());
1512   for(std::size_t i=0;i<_m_parts.size();i++)
1513     {
1514       const MEDCoupling1GTUMesh *elt(_m_parts[i]);
1515       if(elt)
1516         {
1517           ret._m_parts[i]=static_cast<ParaMEDMEM::MEDCoupling1GTUMesh*>(elt->deepCpy());
1518           ret._m_parts[i]->setCoords(coords);
1519         }
1520     }
1521   ret._mp_time=_mp_time; ret._m_time=_m_time;
1522   if((const MEDCouplingUMesh *)_m)
1523     {
1524       ret._m=static_cast<ParaMEDMEM::MEDCouplingUMesh*>(_m->deepCpy());
1525       ret._m->setCoords(coords);
1526     }
1527   std::size_t sz(_part_def.size());
1528   ret._part_def.clear(); ret._part_def.resize(sz);
1529   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1530     {
1531       const PartDefinition *elt(_part_def[i]);
1532       if(elt)
1533         ret._part_def[i]=elt->deepCpy();
1534     }
1535   return ret;
1536 }
1537
1538 bool MEDFileUMeshAggregateCompute::isEqual(const MEDFileUMeshAggregateCompute& other, double eps, std::string& what) const
1539 {
1540   const MEDCouplingUMesh *m1(getUmesh());
1541   const MEDCouplingUMesh *m2(other.getUmesh());
1542   if((m1==0 && m2!=0) || (m1!=0 && m2==0))
1543     {
1544       what="Presence of mesh in one sublevel and not in other!";
1545       return false;
1546     }
1547   if(m1)
1548     {
1549       std::string what2;
1550       if(!m1->isEqualIfNotWhy(m2,eps,what2))
1551         {
1552           what=std::string("meshes at a sublevel are not deeply equal (")+what2+std::string(")!");
1553           return false;
1554         }
1555     }
1556   std::size_t sz(_part_def.size());
1557   if(sz!=other._part_def.size())
1558     {
1559       what=std::string("number of subdivision per geo type for part definition is not the same !");
1560       return false;
1561     }
1562   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1563     {
1564       const PartDefinition *pd0(_part_def[i]),*pd1(other._part_def[i]);
1565       if(!pd0 && !pd1)
1566         continue;
1567       if((!pd0 && pd1) || (pd0 && !pd1))
1568         {
1569           what=std::string("a cell part def is defined only for one among this or other !");
1570           return false;
1571         }
1572       bool ret(pd0->isEqual(pd1,what));
1573       if(!ret)
1574         return false;
1575     }
1576   return true;
1577 }
1578
1579 void MEDFileUMeshAggregateCompute::clearNonDiscrAttributes() const
1580 {
1581   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1582     MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(*it);
1583   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_m);
1584 }
1585
1586 void MEDFileUMeshAggregateCompute::synchronizeTinyInfo(const MEDFileMesh& master) const
1587 {
1588   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1589     {
1590       const MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1591       if(tmp)
1592         {
1593           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setName(master.getName().c_str());
1594           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setDescription(master.getDescription().c_str());
1595           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setTime(master.getTimeValue(),master.getIteration(),master.getOrder());
1596           (const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(tmp))->setTimeUnit(master.getTimeUnit());
1597         }
1598     }
1599   const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1600   if(m)
1601     {
1602       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setName(master.getName().c_str());
1603       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setDescription(master.getDescription().c_str());
1604       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setTime(master.getTimeValue(),master.getIteration(),master.getOrder());
1605       (const_cast<MEDCouplingUMesh *>(m))->setTimeUnit(master.getTimeUnit());
1606     }
1607 }
1608
1609 bool MEDFileUMeshAggregateCompute::empty() const
1610 {
1611   if(_mp_time<_m_time)
1612     return ((const MEDCouplingUMesh *)_m)==0;
1613   //else _mp_time>=_m_time)
1614   return _m_parts.empty();
1615 }
1616
1617 int MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension() const
1618 {
1619   if(_mp_time<_m_time)
1620     {
1621       const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1622       if(!m)
1623         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension : no umesh in this !");
1624       return m->getMeshDimension();
1625     }
1626   else
1627     {
1628       if(_m_parts.empty())
1629         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension : part mesh is empty !");
1630       const MEDCoupling1GTUMesh *m(_m_parts[0]);
1631       if(!m)
1632         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getMeshDimension : part mesh contains null instance !");
1633       return m->getMeshDimension();
1634     }
1635 }
1636
1637 std::vector<int> MEDFileUMeshAggregateCompute::getDistributionOfTypes() const
1638 {
1639   if(_mp_time<_m_time)
1640     {
1641       const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1642       if(!m)
1643         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getDistributionOfTypes : no umesh in this !");
1644       return m->getDistributionOfTypes();
1645     }
1646   else
1647     {
1648       std::vector<int> ret;
1649       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1650         {
1651           const MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1652           if(!tmp)
1653             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getDistributionOfTypes : part mesh contains null instance !");
1654           std::vector<int> ret0(tmp->getDistributionOfTypes());
1655           ret.insert(ret.end(),ret0.begin(),ret0.end());
1656         }
1657       return ret;
1658     }
1659 }
1660
1661 int MEDFileUMeshAggregateCompute::getSize() const
1662 {
1663   if(_mp_time<_m_time)
1664     {
1665       const MEDCouplingUMesh *m(_m);
1666       if(!m)
1667         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getSize : no umesh in this !");
1668       return m->getNumberOfCells();
1669     }
1670   else
1671     {
1672       int ret=0;
1673       for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1674         {
1675           const MEDCoupling1GTUMesh *m(*it);
1676           if(!m)
1677             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMeshAggregateCompute::getSize : part mesh contains null instance !");
1678           ret+=m->getNumberOfCells();
1679         }
1680       return ret;
1681     }
1682 }
1683
1684 void MEDFileUMeshAggregateCompute::setCoords(DataArrayDouble *coords)
1685 {
1686   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::iterator it=_m_parts.begin();it!=_m_parts.end();it++)
1687     {
1688       MEDCoupling1GTUMesh *tmp(*it);
1689       if(tmp)
1690         (*it)->setCoords(coords);
1691     }
1692   MEDCouplingUMesh *m(_m);
1693   if(m)
1694     m->setCoords(coords);
1695 }