Salome HOME
c27093263fafe189400ea0842a4411afa27fb397
[modules/med.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.hxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #ifndef __MEDFILEMESH_HXX__
22 #define __MEDFILEMESH_HXX__
23
24 #include "MEDLoaderDefines.hxx"
25 #include "MEDFileMeshLL.hxx"
26 #include "MEDFileUtilities.hxx"
27 #include "MEDFileMeshReadSelector.hxx"
28
29 #include <map>
30 #include <list>
31
32 namespace ParaMEDMEM
33 {
34   class MEDFileFieldGlobsReal;
35   class MEDFileField1TSStructItem;
36   
37   class MEDFileMesh : public RefCountObject, public MEDFileWritable
38   {
39   public:
40     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMesh *New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
41     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMesh *New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
42     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
43     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
44     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDFileMesh *createNewEmpty() const = 0;
45     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDFileMesh *deepCpy() const = 0;
46     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDFileMesh *shallowCpy() const = 0;
47     MEDLOADER_EXPORT virtual bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
48     MEDLOADER_EXPORT virtual void clearNonDiscrAttributes() const;
49     MEDLOADER_EXPORT virtual void setName(const std::string& name);
50     MEDLOADER_EXPORT bool changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab);
51     MEDLOADER_EXPORT std::string getName() const { return _name; }
52     MEDLOADER_EXPORT std::string getUnivName() const { return _univ_name; }
53     MEDLOADER_EXPORT bool getUnivNameWrStatus() const { return _univ_wr_status; }
54     MEDLOADER_EXPORT void setUnivNameWrStatus(bool newStatus) { _univ_wr_status=newStatus; }
55     MEDLOADER_EXPORT void setDescription(const std::string& name) { _desc_name=name; }
56     MEDLOADER_EXPORT std::string getDescription() const { return _desc_name; }
57     MEDLOADER_EXPORT void setOrder(int order) { _order=order; }
58     MEDLOADER_EXPORT int getOrder() const { return _order; }
59     MEDLOADER_EXPORT void setIteration(int it) { _iteration=it; }
60     MEDLOADER_EXPORT int getIteration() const { return _iteration; }
61     MEDLOADER_EXPORT void setTimeValue(double time) { _time=time; }
62     MEDLOADER_EXPORT void setTime(int dt, int it, double time) { _time=time; _iteration=dt; _order=it; }
63     MEDLOADER_EXPORT double getTime(int& dt, int& it) { dt=_iteration; it=_order; return _time; }
64     MEDLOADER_EXPORT double getTimeValue() const { return _time; }
65     MEDLOADER_EXPORT void setTimeUnit(const std::string& unit) { _dt_unit=unit; }
66     MEDLOADER_EXPORT std::string getTimeUnit() const { return _dt_unit; }
67     MEDLOADER_EXPORT std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getAllGeoTypes() const;
68     MEDLOADER_EXPORT virtual int getNumberOfNodes() const = 0;
69     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const = 0;
70     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNonEmptyLevels() const = 0;
71     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNonEmptyLevelsExt() const = 0;
72     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getFamArrNonEmptyLevelsExt() const = 0;
73     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNumArrNonEmptyLevelsExt() const = 0;
74     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNameArrNonEmptyLevelsExt() const = 0;
75     MEDLOADER_EXPORT virtual void write(const std::string& fileName, int mode) const;
76     MEDLOADER_EXPORT virtual void write(med_idt fid) const;
77     MEDLOADER_EXPORT virtual int getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
78     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDCouplingMesh *getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum=false) const = 0;
79     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const;
80     MEDLOADER_EXPORT virtual void whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const = 0;
81     //
82     MEDLOADER_EXPORT bool areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const;
83     MEDLOADER_EXPORT bool areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const;
84     MEDLOADER_EXPORT bool existsGroup(const std::string& groupName) const;
85     MEDLOADER_EXPORT bool existsFamily(int famId) const;
86     MEDLOADER_EXPORT bool existsFamily(const std::string& familyName) const;
87     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyId(const std::string& familyName, int id);
88     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyIdUnique(const std::string& familyName, int id);
89     MEDLOADER_EXPORT virtual void addFamily(const std::string& familyName, int id);
90     MEDLOADER_EXPORT virtual void createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& groupName);
91     MEDLOADER_EXPORT virtual bool keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& levs);
92     MEDLOADER_EXPORT void addFamilyOnGrp(const std::string& grpName, const std::string& famName);
93     MEDLOADER_EXPORT std::string findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created);
94     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info);
95     MEDLOADER_EXPORT void setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info);
96     MEDLOADER_EXPORT void copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other);
97     MEDLOADER_EXPORT void clearGrpMap();
98     MEDLOADER_EXPORT void clearFamMap();
99     MEDLOADER_EXPORT void clearFamGrpMaps();
100     MEDLOADER_EXPORT const std::map<std::string,int>& getFamilyInfo() const { return _families; }
101     MEDLOADER_EXPORT const std::map<std::string, std::vector<std::string> >& getGroupInfo() const { return _groups; }
102     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getFamiliesOnGroup(const std::string& name) const;
103     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const;
104     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name) const;
105     MEDLOADER_EXPORT void setFamiliesOnGroup(const std::string& name, const std::vector<std::string>& fams);
106     MEDLOADER_EXPORT void setFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name, const std::vector<int>& famIds);
107     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getGroupsOnFamily(const std::string& name) const;
108     MEDLOADER_EXPORT void setGroupsOnFamily(const std::string& famName, const std::vector<std::string>& grps);
109     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getGroupsNames() const;
110     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getFamiliesNames() const;
111     MEDLOADER_EXPORT void assignFamilyNameWithGroupName();
112     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> removeEmptyGroups();
113     MEDLOADER_EXPORT void removeGroup(const std::string& name);
114     MEDLOADER_EXPORT void removeFamily(const std::string& name);
115     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> removeOrphanGroups();
116     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> removeOrphanFamilies();
117     MEDLOADER_EXPORT void changeGroupName(const std::string& oldName, const std::string& newName);
118     MEDLOADER_EXPORT void changeFamilyName(const std::string& oldName, const std::string& newName);
119     MEDLOADER_EXPORT void changeFamilyId(int oldId, int newId);
120     MEDLOADER_EXPORT void changeAllGroupsContainingFamily(const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames);
121     MEDLOADER_EXPORT int getFamilyId(const std::string& name) const;
122     MEDLOADER_EXPORT int getMaxAbsFamilyId() const;
123     MEDLOADER_EXPORT int getMaxFamilyId() const;
124     MEDLOADER_EXPORT int getMinFamilyId() const;
125     MEDLOADER_EXPORT int getTheMaxAbsFamilyId() const;
126     MEDLOADER_EXPORT int getTheMaxFamilyId() const;
127     MEDLOADER_EXPORT int getTheMinFamilyId() const;
128     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMaxAbsFamilyIdInArrays() const = 0;
129     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMaxFamilyIdInArrays() const = 0;
130     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMinFamilyIdInArrays() const = 0;
131     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *getAllFamiliesIdsReferenced() const;
132     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *computeAllFamilyIdsInUse() const;
133     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& famNames) const;
134     MEDLOADER_EXPORT std::string getFamilyNameGivenId(int id) const;
135     MEDLOADER_EXPORT bool ensureDifferentFamIdsPerLevel();
136     MEDLOADER_EXPORT void normalizeFamIdsTrio();
137     MEDLOADER_EXPORT void normalizeFamIdsMEDFile();
138     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMeshDimension() const = 0;
139     MEDLOADER_EXPORT virtual std::string simpleRepr() const;
140     MEDLOADER_EXPORT virtual std::string advancedRepr() const = 0;
141     //
142     MEDLOADER_EXPORT virtual void setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum=false);
143     MEDLOADER_EXPORT virtual void setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr) = 0;
144     MEDLOADER_EXPORT virtual void setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr) = 0;
145     MEDLOADER_EXPORT virtual void setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr) = 0;
146     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayInt *getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
147     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayInt *getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
148     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayInt *getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
149     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayAsciiChar *getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
150     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const = 0;
151     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum=false) const;
152     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum=false) const;
153     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum=false) const;
154     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeGroupArr(const std::string& grp, bool renum=false) const;
155     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum=false) const;
156     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeFamilyArr(const std::string& fam, bool renum=false) const;
157     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
158     // tools
159     MEDLOADER_EXPORT virtual bool unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell) = 0;
160   protected:
161     MEDFileMesh();
162     //! protected because no way in MED file API to specify this name
163     void setUnivName(const std::string& name) { _univ_name=name; }
164     void addFamilyOnAllGroupsHaving(const std::string& famName, const std::string& otherFamName);
165     virtual void writeLL(med_idt fid) const = 0;
166     void dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m);
167     virtual void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const = 0;
168     void getFamilyRepr(std::ostream& oss) const;
169     virtual void appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames);
170     virtual void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) = 0;
171     static void TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp);
172     static void ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames);
173     static std::string FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created);
174     static std::string CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid);
175     static int PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt);
176   protected:
177     int _order;
178     int _iteration;
179     double _time;
180     std::string _dt_unit;
181     std::string _name;
182     //! this attribute do not impact the state of instance -> mutable
183     mutable std::string _univ_name;
184     bool _univ_wr_status;
185     std::string _desc_name;
186   protected:
187     std::map<std::string, std::vector<std::string> > _groups;
188     std::map<std::string,int> _families;
189   public:
190     MEDLOADER_EXPORT static const char DFT_FAM_NAME[];
191   };
192
193   class MEDFileUMesh : public MEDFileMesh
194   {
195     friend class MEDFileMesh;
196   public:
197     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileUMesh *New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
198     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileUMesh *New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
199     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileUMesh *New();
200     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
201     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
202     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *createNewEmpty() const;
203     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *deepCpy() const;
204     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *shallowCpy() const;
205     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
206     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
207     MEDLOADER_EXPORT void setName(const std::string& name);
208     MEDLOADER_EXPORT ~MEDFileUMesh();
209     //
210     MEDLOADER_EXPORT int getMaxAbsFamilyIdInArrays() const;
211     MEDLOADER_EXPORT int getMaxFamilyIdInArrays() const;
212     MEDLOADER_EXPORT int getMinFamilyIdInArrays() const;
213     MEDLOADER_EXPORT int getMeshDimension() const;
214     MEDLOADER_EXPORT int getSpaceDimension() const;
215     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
216     MEDLOADER_EXPORT std::string advancedRepr() const;
217     MEDLOADER_EXPORT int getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
218     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
219     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
220     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
221     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayAsciiChar *getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
222     MEDLOADER_EXPORT int getNumberOfNodes() const;
223     MEDLOADER_EXPORT std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const;
224     MEDLOADER_EXPORT void whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const;
225     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevels() const;
226     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevelsExt() const;
227     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamArrNonEmptyLevelsExt() const;
228     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNumArrNonEmptyLevelsExt() const;
229     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNameArrNonEmptyLevelsExt() const;
230     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpNonEmptyLevels(const std::string& grp) const;
231     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpNonEmptyLevelsExt(const std::string& grp) const;
232     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamNonEmptyLevels(const std::string& fam) const;
233     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamNonEmptyLevelsExt(const std::string& fam) const;
234     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const;
235     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const;
236     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const;
237     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const;
238     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const;
239     MEDLOADER_EXPORT DataArrayDouble *getCoords() const;
240     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum=false) const;
241     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum=false) const;
242     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum=false) const;
243     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
244     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
245     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum=false) const;
246     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingMesh *getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum=false) const;
247     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const;
248     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevel0Mesh(bool renum=false) const;
249     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevelM1Mesh(bool renum=false) const;
250     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevelM2Mesh(bool renum=false) const;
251     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevelM3Mesh(bool renum=false) const;
252     MEDLOADER_EXPORT void forceComputationOfParts() const;
253     MEDLOADER_EXPORT std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(int meshDimRelToMax) const;
254     MEDLOADER_EXPORT MEDCoupling1GTUMesh *getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
255     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
256     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
257     //
258     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName);
259     MEDLOADER_EXPORT void setCoords(DataArrayDouble *coords);
260     MEDLOADER_EXPORT void eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt);
261     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr);
262     MEDLOADER_EXPORT void setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr);
263     MEDLOADER_EXPORT void setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr);
264     MEDLOADER_EXPORT void addNodeGroup(const DataArrayInt *ids);
265     MEDLOADER_EXPORT void addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids);
266     MEDLOADER_EXPORT void removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax);
267     MEDLOADER_EXPORT void setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCoupling1GTUMesh *m);
268     MEDLOADER_EXPORT void setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld=false);
269     MEDLOADER_EXPORT void setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum=false);
270     MEDLOADER_EXPORT void setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum=false);
271     MEDLOADER_EXPORT void setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum=false);
272     MEDLOADER_EXPORT void optimizeFamilies();
273     // tools
274     MEDLOADER_EXPORT void duplicateNodesOnM1Group(const std::string& grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified);
275     MEDLOADER_EXPORT bool unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell);
276     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *zipCoords();
277   private:
278     void writeLL(med_idt fid) const;
279     MEDFileUMesh();
280     MEDFileUMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
281     void loadUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
282     const MEDFileUMeshSplitL1 *getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const;
283     MEDFileUMeshSplitL1 *getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt);
284     void checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const;
285     DataArrayDouble *checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const;
286     void computeRevNum() const;
287     void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const;
288     void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId);
289     std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > getAllNonNullFamilyIds() const;
290     void addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr);
291     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>& checkAndGiveEntryInSplitL1(int meshDimRelToMax, MEDCouplingPointSet *m);
292   private:
293     std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> > _ms;
294     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> _coords;
295     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _fam_coords;
296     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _num_coords;
297     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> _name_coords;
298     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _rev_num_coords;
299   };
300
301   class MEDFileStructuredMesh : public MEDFileMesh
302   {
303     friend class MEDFileMesh;
304   public:
305     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
306     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
307     MEDLOADER_EXPORT int getMaxAbsFamilyIdInArrays() const;
308     MEDLOADER_EXPORT int getMaxFamilyIdInArrays() const;
309     MEDLOADER_EXPORT int getMinFamilyIdInArrays() const;
310     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
311     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
312     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
313     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
314     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr);
315     MEDLOADER_EXPORT void setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr);
316     MEDLOADER_EXPORT void setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr);
317     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
318     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
319     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayAsciiChar *getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
320     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevels() const;
321     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevelsExt() const;
322     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamArrNonEmptyLevelsExt() const;
323     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNumArrNonEmptyLevelsExt() const;
324     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNameArrNonEmptyLevelsExt() const;
325     MEDCouplingMesh *getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum=false) const;
326     MEDLOADER_EXPORT int getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
327     MEDLOADER_EXPORT int getNumberOfNodes() const;
328     MEDLOADER_EXPORT std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const;
329     MEDLOADER_EXPORT void whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const;
330     // tools
331     MEDLOADER_EXPORT bool unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell);
332   protected:
333     void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId);
334     void deepCpyAttributes();
335     void loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
336     void writeStructuredLL(med_idt fid, const std::string& maa) const;
337     virtual const MEDCouplingStructuredMesh *getStructuredMesh() const = 0;
338     static med_geometry_type GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim);
339   private:
340     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _fam_nodes;
341     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _num_nodes;
342     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> _names_nodes;
343     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _fam_cells;
344     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _num_cells;
345     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> _names_cells;
346     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _rev_num_nodes;
347     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _rev_num_cells;
348   };
349
350   class MEDFileCMesh : public MEDFileStructuredMesh
351   {
352     friend class MEDFileMesh;
353   public:
354     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCMesh *New();
355     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCMesh *New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
356     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCMesh *New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
357     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
358     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
359     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *createNewEmpty() const;
360     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *deepCpy() const;
361     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *shallowCpy() const;
362     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
363     MEDLOADER_EXPORT int getMeshDimension() const;
364     MEDLOADER_EXPORT int getSpaceDimension() const;
365     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
366     MEDLOADER_EXPORT std::string advancedRepr() const;
367     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
368     MEDLOADER_EXPORT const MEDCouplingCMesh *getMesh() const;
369     MEDLOADER_EXPORT void setMesh(MEDCouplingCMesh *m);
370   private:
371     const MEDCouplingStructuredMesh *getStructuredMesh() const;
372     void writeLL(med_idt fid) const;
373     MEDFileCMesh();
374     void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const;
375     MEDFileCMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
376     void loadCMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
377   private:
378     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCMesh> _cmesh;
379   };
380
381   class MEDFileCurveLinearMesh : public MEDFileStructuredMesh
382   {
383     friend class MEDFileMesh;
384   public:
385     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCurveLinearMesh *New();
386     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCurveLinearMesh *New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
387     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCurveLinearMesh *New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
388     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
389     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
390     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *createNewEmpty() const;
391     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *deepCpy() const;
392     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *shallowCpy() const;
393     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
394     MEDLOADER_EXPORT int getMeshDimension() const;
395     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
396     MEDLOADER_EXPORT std::string advancedRepr() const;
397     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
398     MEDLOADER_EXPORT const MEDCouplingCurveLinearMesh *getMesh() const;
399     MEDLOADER_EXPORT void setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m);
400   private:
401     MEDFileCurveLinearMesh();
402     MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
403     const MEDCouplingStructuredMesh *getStructuredMesh() const;
404     void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const;
405     void writeLL(med_idt fid) const;
406     void loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);//to imp
407   private:
408     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCurveLinearMesh> _clmesh;
409   };
410
411   class MEDFileMeshMultiTS : public RefCountObject, public MEDFileWritable
412   {
413   public:
414     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshMultiTS *New();
415     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshMultiTS *New(const std::string& fileName);
416     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshMultiTS *New(const std::string& fileName, const std::string& mName);
417     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshMultiTS *deepCpy() const;
418     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
419     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
420     MEDLOADER_EXPORT std::string getName() const;
421     MEDLOADER_EXPORT void setName(const std::string& newMeshName);
422     MEDLOADER_EXPORT bool changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab);
423     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *getOneTimeStep() const;
424     MEDLOADER_EXPORT void write(med_idt fid) const;
425     MEDLOADER_EXPORT void write(const std::string& fileName, int mode) const;
426     MEDLOADER_EXPORT void setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep);
427   private:
428     void loadFromFile(const std::string& fileName, const std::string& mName);
429     MEDFileMeshMultiTS();
430     MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName);
431     MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName, const std::string& mName);
432   private:
433     std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > _mesh_one_ts;
434   };
435
436   class MEDFileMeshesIterator;
437
438   class MEDFileMeshes : public RefCountObject, public MEDFileWritable
439   {
440   public:
441     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshes *New();
442     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshes *New(const std::string& fileName);
443     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshes *deepCpy() const;
444     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
445     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
446     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
447     MEDLOADER_EXPORT void simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const;
448     MEDLOADER_EXPORT void write(const std::string& fileName, int mode) const;
449     MEDLOADER_EXPORT void write(med_idt fid) const;
450     MEDLOADER_EXPORT int getNumberOfMeshes() const;
451     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshesIterator *iterator();
452     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *getMeshAtPos(int i) const;
453     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *getMeshWithName(const std::string& mname) const;
454     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getMeshesNames() const;
455     MEDLOADER_EXPORT bool changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab);
456     //
457     MEDLOADER_EXPORT void resize(int newSize);
458     MEDLOADER_EXPORT void pushMesh(MEDFileMesh *mesh);
459     MEDLOADER_EXPORT void setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh);
460     MEDLOADER_EXPORT void destroyMeshAtPos(int i);
461   private:
462     void checkCoherency() const;
463     void loadFromFile(const std::string& fileName);
464     MEDFileMeshes();
465     MEDFileMeshes(const std::string& fileName);
466   private:
467     std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > _meshes;
468   };
469
470   class MEDFileMeshesIterator
471   {
472   public:
473     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms);
474     MEDLOADER_EXPORT ~MEDFileMeshesIterator();
475     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *nextt();
476   private:
477     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> _ms;
478      int _iter_id;
479      int _nb_iter;
480   };
481 }
482
483 #endif