src/MEDLoader/MEDFileMesh.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #ifndef __MEDFILEMESH_HXX__
  22 #define __MEDFILEMESH_HXX__
  23
  24 #include "MEDLoaderDefines.hxx"
  25 #include "MEDFileMeshLL.hxx"
  26 #include "MEDFileUtilities.hxx"
  27 #include "MEDFileMeshReadSelector.hxx"
  28
  29 #include <map>
  30 #include <list>
  31
  32 namespace ParaMEDMEM
  33 {
  34   class MEDFileFieldGlobsReal;
  35   class MEDFileField1TSStructItem;
  36
  37   class MEDFileMesh : public RefCountObject, public MEDFileWritable
  38   {
  39   public:
  40     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMesh *New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
  41     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMesh *New(const char *fileName, const char *mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
  42     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
  43     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
  44     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDFileMesh *createNewEmpty() const = 0;
  45     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDFileMesh *deepCpy() const = 0;
  46     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDFileMesh *shallowCpy() const = 0;
  47     MEDLOADER_EXPORT virtual bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
  48     MEDLOADER_EXPORT virtual void clearNonDiscrAttributes() const;
  49     MEDLOADER_EXPORT void setName(const char *name) { _name=name; }
  50     MEDLOADER_EXPORT bool changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab);
  51     MEDLOADER_EXPORT std::string getName() const { return _name; }
  52     MEDLOADER_EXPORT const char *getUnivName() const { return _univ_name.c_str(); }
  53     MEDLOADER_EXPORT bool getUnivNameWrStatus() const { return _univ_wr_status; }
  54     MEDLOADER_EXPORT void setUnivNameWrStatus(bool newStatus) { _univ_wr_status=newStatus; }
  55     MEDLOADER_EXPORT void setDescription(const char *name) { _desc_name=name; }
  56     MEDLOADER_EXPORT std::string getDescription() const { return _desc_name; }
  57     MEDLOADER_EXPORT void setOrder(int order) { _order=order; }
  58     MEDLOADER_EXPORT int getOrder() const { return _order; }
  59     MEDLOADER_EXPORT void setIteration(int it) { _iteration=it; }
  60     MEDLOADER_EXPORT int getIteration() const { return _iteration; }
  61     MEDLOADER_EXPORT void setTimeValue(double time) { _time=time; }
  62     MEDLOADER_EXPORT void setTime(int dt, int it, double time) { _time=time; _iteration=dt; _order=it; }
  63     MEDLOADER_EXPORT double getTime(int& dt, int& it) { dt=_iteration; it=_order; return _time; }
  64     MEDLOADER_EXPORT double getTimeValue() const { return _time; }
  65     MEDLOADER_EXPORT void setTimeUnit(const char *unit) { _dt_unit=unit; }
  66     MEDLOADER_EXPORT const char *getTimeUnit() const { return _dt_unit.c_str(); }
  67     MEDLOADER_EXPORT virtual int getNumberOfNodes() const = 0;
  68     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNonEmptyLevels() const = 0;
  69     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNonEmptyLevelsExt() const = 0;
  70     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getFamArrNonEmptyLevelsExt() const = 0;
  71     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNumArrNonEmptyLevelsExt() const = 0;
  72     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getNameArrNonEmptyLevelsExt() const = 0;
  73     MEDLOADER_EXPORT virtual void write(const char *fileName, int mode) const;
  74     MEDLOADER_EXPORT virtual void write(med_idt fid) const;
  75     MEDLOADER_EXPORT virtual int getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
  76     MEDLOADER_EXPORT virtual MEDCouplingMesh *getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum=false) const = 0;
  77     MEDLOADER_EXPORT virtual std::vector<int> getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const;
  78     MEDLOADER_EXPORT virtual void whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const = 0;
  79     //
  80     MEDLOADER_EXPORT bool areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const;
  81     MEDLOADER_EXPORT bool areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const;
  82     MEDLOADER_EXPORT bool existsGroup(const char *groupName) const;
  83     MEDLOADER_EXPORT bool existsFamily(int famId) const;
  84     MEDLOADER_EXPORT bool existsFamily(const char *familyName) const;
  85     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyId(const char *familyName, int id);
  86     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyIdUnique(const char *familyName, int id);
  87     MEDLOADER_EXPORT virtual void addFamily(const char *familyName, int id);
  88     MEDLOADER_EXPORT virtual void createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const char *groupName);
  89     MEDLOADER_EXPORT virtual bool keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& levs);
  90     MEDLOADER_EXPORT void addFamilyOnGrp(const char *grpName, const char *famName);
  91     MEDLOADER_EXPORT std::string findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created);
  92     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info);
  93     MEDLOADER_EXPORT void setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info);
  94     MEDLOADER_EXPORT void copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other);
  95     MEDLOADER_EXPORT const std::map<std::string,int>& getFamilyInfo() const { return _families; }
  96     MEDLOADER_EXPORT const std::map<std::string, std::vector<std::string> >& getGroupInfo() const { return _groups; }
  97     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getFamiliesOnGroup(const char *name) const;
  98     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const;
  99     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamiliesIdsOnGroup(const char *name) const;
 100     MEDLOADER_EXPORT void setFamiliesOnGroup(const char *name, const std::vector<std::string>& fams);
 101     MEDLOADER_EXPORT void setFamiliesIdsOnGroup(const char *name, const std::vector<int>& famIds);
 102     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getGroupsOnFamily(const char *name) const;
 103     MEDLOADER_EXPORT void setGroupsOnFamily(const char *famName, const std::vector<std::string>& grps);
 104     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getGroupsNames() const;
 105     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getFamiliesNames() const;
 106     MEDLOADER_EXPORT void assignFamilyNameWithGroupName();
 107     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> removeEmptyGroups();
 108     MEDLOADER_EXPORT void removeGroup(const char *name);
 109     MEDLOADER_EXPORT void removeFamily(const char *name);
 110     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> removeOrphanGroups();
 111     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> removeOrphanFamilies();
 112     MEDLOADER_EXPORT void changeGroupName(const char *oldName, const char *newName);
 113     MEDLOADER_EXPORT void changeFamilyName(const char *oldName, const char *newName);
 114     MEDLOADER_EXPORT void changeFamilyId(int oldId, int newId);
 115     MEDLOADER_EXPORT void changeAllGroupsContainingFamily(const char *familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames);
 116     MEDLOADER_EXPORT int getFamilyId(const char *name) const;
 117     MEDLOADER_EXPORT int getMaxAbsFamilyId() const;
 118     MEDLOADER_EXPORT int getMaxFamilyId() const;
 119     MEDLOADER_EXPORT int getMinFamilyId() const;
 120     MEDLOADER_EXPORT int getTheMaxAbsFamilyId() const;
 121     MEDLOADER_EXPORT int getTheMaxFamilyId() const;
 122     MEDLOADER_EXPORT int getTheMinFamilyId() const;
 123     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMaxAbsFamilyIdInArrays() const = 0;
 124     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMaxFamilyIdInArrays() const = 0;
 125     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMinFamilyIdInArrays() const = 0;
 126     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *getAllFamiliesIdsReferenced() const;
 127     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *computeAllFamilyIdsInUse() const;
 128     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& famNames) const;
 129     MEDLOADER_EXPORT std::string getFamilyNameGivenId(int id) const;
 130     MEDLOADER_EXPORT bool ensureDifferentFamIdsPerLevel();
 131     MEDLOADER_EXPORT void normalizeFamIdsTrio();
 132     MEDLOADER_EXPORT void normalizeFamIdsMEDFile();
 133     MEDLOADER_EXPORT virtual int getMeshDimension() const = 0;
 134     MEDLOADER_EXPORT virtual std::string simpleRepr() const;
 135     MEDLOADER_EXPORT virtual std::string advancedRepr() const = 0;
 136     //
 137     MEDLOADER_EXPORT virtual void setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum=false);
 138     MEDLOADER_EXPORT virtual void setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr) = 0;
 139     MEDLOADER_EXPORT virtual void setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr) = 0;
 140     MEDLOADER_EXPORT virtual void setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr) = 0;
 141     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayInt *getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
 142     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayInt *getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
 143     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayInt *getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
 144     MEDLOADER_EXPORT virtual const DataArrayAsciiChar *getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const = 0;
 145     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const = 0;
 146     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum=false) const;
 147     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const char *grp, bool renum=false) const;
 148     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const char *fam, bool renum=false) const;
 149     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeGroupArr(const char *grp, bool renum=false) const;
 150     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum=false) const;
 151     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeFamilyArr(const char *fam, bool renum=false) const;
 152     MEDLOADER_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
 153     // tools
 154     MEDLOADER_EXPORT virtual bool unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell) = 0;
 155   protected:
 156     MEDFileMesh();
 157     //! protected because no way in MED file API to specify this name
 158     void setUnivName(const char *name) { _univ_name=name; }
 159     void addFamilyOnAllGroupsHaving(const char *famName, const char *otherFamName);
 160     virtual void writeLL(med_idt fid) const = 0;
 161     void dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m);
 162     virtual void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const = 0;
 163     void getFamilyRepr(std::ostream& oss) const;
 164     virtual void appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames);
 165     virtual void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) = 0;
 166     static void TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp);
 167     static void ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const char *familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames);
 168     static std::string FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created);
 169     static std::string CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid);
 170     static int PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt);
 171   protected:
 172     int _order;
 173     int _iteration;
 174     double _time;
 175     std::string _dt_unit;
 176     std::string _name;
 177     //! this attribute do not impact the state of instance -> mutable
 178     mutable std::string _univ_name;
 179     bool _univ_wr_status;
 180     std::string _desc_name;
 181   protected:
 182     std::map<std::string, std::vector<std::string> > _groups;
 183     std::map<std::string,int> _families;
 184   public:
 185     MEDLOADER_EXPORT static const char DFT_FAM_NAME[];
 186   };
 187
 188   class MEDFileUMesh : public MEDFileMesh
 189   {
 190     friend class MEDFileMesh;
 191   public:
 192     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileUMesh *New(const char *fileName, const char *mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
 193     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileUMesh *New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
 194     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileUMesh *New();
 195     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 196     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
 197     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *createNewEmpty() const;
 198     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *deepCpy() const;
 199     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *shallowCpy() const;
 200     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
 201     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
 202     MEDLOADER_EXPORT ~MEDFileUMesh();
 203     //
 204     MEDLOADER_EXPORT int getMaxAbsFamilyIdInArrays() const;
 205     MEDLOADER_EXPORT int getMaxFamilyIdInArrays() const;
 206     MEDLOADER_EXPORT int getMinFamilyIdInArrays() const;
 207     MEDLOADER_EXPORT int getMeshDimension() const;
 208     MEDLOADER_EXPORT int getSpaceDimension() const;
 209     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 210     MEDLOADER_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 211     MEDLOADER_EXPORT int getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 212     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 213     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 214     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 215     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayAsciiChar *getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 216     MEDLOADER_EXPORT int getNumberOfNodes() const;
 217     MEDLOADER_EXPORT void whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const;
 218     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevels() const;
 219     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevelsExt() const;
 220     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamArrNonEmptyLevelsExt() const;
 221     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNumArrNonEmptyLevelsExt() const;
 222     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNameArrNonEmptyLevelsExt() const;
 223     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpNonEmptyLevels(const char *grp) const;
 224     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpNonEmptyLevelsExt(const char *grp) const;
 225     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamNonEmptyLevels(const char *fam) const;
 226     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamNonEmptyLevelsExt(const char *fam) const;
 227     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const;
 228     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const;
 229     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const;
 230     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const;
 231     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const;
 232     MEDLOADER_EXPORT DataArrayDouble *getCoords() const;
 233     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const char *grp, bool renum=false) const;
 234     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum=false) const;
 235     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const char *fam, bool renum=false) const;
 236     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
 237     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
 238     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum=false) const;
 239     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingMesh *getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum=false) const;
 240     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const;
 241     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevel0Mesh(bool renum=false) const;
 242     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevelM1Mesh(bool renum=false) const;
 243     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevelM2Mesh(bool renum=false) const;
 244     MEDLOADER_EXPORT MEDCouplingUMesh *getLevelM3Mesh(bool renum=false) const;
 245     MEDLOADER_EXPORT std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(int meshDimRelToMax) const;
 246     MEDLOADER_EXPORT MEDCoupling1GTUMesh *getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
 247     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
 248     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const;
 249     //
 250     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName);
 251     MEDLOADER_EXPORT void setCoords(DataArrayDouble *coords);
 252     MEDLOADER_EXPORT void eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt);
 253     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr);
 254     MEDLOADER_EXPORT void setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr);
 255     MEDLOADER_EXPORT void setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr);
 256     MEDLOADER_EXPORT void addNodeGroup(const DataArrayInt *ids);
 257     MEDLOADER_EXPORT void addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids);
 258     MEDLOADER_EXPORT void removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax);
 259     MEDLOADER_EXPORT void setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCoupling1GTUMesh *m);
 260     MEDLOADER_EXPORT void setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld=false);
 261     MEDLOADER_EXPORT void setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum=false);
 262     MEDLOADER_EXPORT void setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum=false);
 263     MEDLOADER_EXPORT void setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum=false);
 264     MEDLOADER_EXPORT void optimizeFamilies();
 265     // tools
 266     MEDLOADER_EXPORT void duplicateNodesOnM1Group(const char *grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified);
 267     MEDLOADER_EXPORT bool unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell);
 268     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *zipCoords();
 269   private:
 270     void writeLL(med_idt fid) const;
 271     MEDFileUMesh();
 272     MEDFileUMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
 273     void loadUMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
 274     const MEDFileUMeshSplitL1 *getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const;
 275     MEDFileUMeshSplitL1 *getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt);
 276     void checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const;
 277     DataArrayDouble *checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const;
 278     void computeRevNum() const;
 279     void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const;
 280     void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId);
 281     std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > getAllNonNullFamilyIds() const;
 282     void addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr);
 283     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>& checkAndGiveEntryInSplitL1(int meshDimRelToMax, MEDCouplingPointSet *m);
 284   private:
 285     std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> > _ms;
 286     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> _coords;
 287     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _fam_coords;
 288     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _num_coords;
 289     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> _name_coords;
 290     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _rev_num_coords;
 291   };
 292
 293   class MEDFileStructuredMesh : public MEDFileMesh
 294   {
 295     friend class MEDFileMesh;
 296   public:
 297     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 298     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
 299     MEDLOADER_EXPORT int getMaxAbsFamilyIdInArrays() const;
 300     MEDLOADER_EXPORT int getMaxFamilyIdInArrays() const;
 301     MEDLOADER_EXPORT int getMinFamilyIdInArrays() const;
 302     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
 303     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
 304     MEDLOADER_EXPORT DataArrayInt *getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum=false) const;
 305     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 306     MEDLOADER_EXPORT void setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr);
 307     MEDLOADER_EXPORT void setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr);
 308     MEDLOADER_EXPORT void setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr);
 309     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 310     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayInt *getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 311     MEDLOADER_EXPORT const DataArrayAsciiChar *getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 312     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevels() const;
 313     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNonEmptyLevelsExt() const;
 314     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getFamArrNonEmptyLevelsExt() const;
 315     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNumArrNonEmptyLevelsExt() const;
 316     MEDLOADER_EXPORT std::vector<int> getNameArrNonEmptyLevelsExt() const;
 317     MEDCouplingMesh *getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum=false) const;
 318     MEDLOADER_EXPORT int getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const;
 319     MEDLOADER_EXPORT int getNumberOfNodes() const;
 320     MEDLOADER_EXPORT void whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const;
 321     // tools
 322     MEDLOADER_EXPORT bool unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell);
 323   protected:
 324     void changeFamilyIdArr(int oldId, int newId);
 325     void deepCpyAttributes();
 326     void loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
 327     void writeStructuredLL(med_idt fid, const char *maa) const;
 328     virtual const MEDCouplingStructuredMesh *getStructuredMesh() const = 0;
 329     static med_geometry_type GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim);
 330   private:
 331     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _fam_nodes;
 332     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _num_nodes;
 333     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> _names_nodes;
 334     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _fam_cells;
 335     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _num_cells;
 336     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> _names_cells;
 337     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _rev_num_nodes;
 338     mutable MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _rev_num_cells;
 339   };
 340
 341   class MEDFileCMesh : public MEDFileStructuredMesh
 342   {
 343     friend class MEDFileMesh;
 344   public:
 345     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCMesh *New();
 346     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCMesh *New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
 347     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCMesh *New(const char *fileName, const char *mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
 348     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 349     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
 350     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *createNewEmpty() const;
 351     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *deepCpy() const;
 352     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *shallowCpy() const;
 353     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
 354     MEDLOADER_EXPORT int getMeshDimension() const;
 355     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 356     MEDLOADER_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 357     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
 358     MEDLOADER_EXPORT const MEDCouplingCMesh *getMesh() const;
 359     MEDLOADER_EXPORT void setMesh(MEDCouplingCMesh *m);
 360   private:
 361     const MEDCouplingStructuredMesh *getStructuredMesh() const;
 362     void writeLL(med_idt fid) const;
 363     MEDFileCMesh();
 364     void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const;
 365     MEDFileCMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
 366     void loadCMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
 367   private:
 368     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCMesh> _cmesh;
 369   };
 370
 371   class MEDFileCurveLinearMesh : public MEDFileStructuredMesh
 372   {
 373     friend class MEDFileMesh;
 374   public:
 375     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCurveLinearMesh *New();
 376     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCurveLinearMesh *New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
 377     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileCurveLinearMesh *New(const char *fileName, const char *mName, int dt=-1, int it=-1, MEDFileMeshReadSelector *mrs=0);
 378     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 379     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
 380     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *createNewEmpty() const;
 381     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *deepCpy() const;
 382     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *shallowCpy() const;
 383     MEDLOADER_EXPORT bool isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const;
 384     MEDLOADER_EXPORT int getMeshDimension() const;
 385     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 386     MEDLOADER_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 387     MEDLOADER_EXPORT void clearNonDiscrAttributes() const;
 388     MEDLOADER_EXPORT const MEDCouplingCurveLinearMesh *getMesh() const;
 389     MEDLOADER_EXPORT void setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m);
 390   private:
 391     MEDFileCurveLinearMesh();
 392     MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);
 393     const MEDCouplingStructuredMesh *getStructuredMesh() const;
 394     void synchronizeTinyInfoOnLeaves() const;
 395     void writeLL(med_idt fid) const;
 396     void loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs);//to imp
 397   private:
 398     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCurveLinearMesh> _clmesh;
 399   };
 400
 401   class MEDFileMeshMultiTS : public RefCountObject, public MEDFileWritable
 402   {
 403   public:
 404     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshMultiTS *New();
 405     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshMultiTS *New(const char *fileName);
 406     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshMultiTS *New(const char *fileName, const char *mName);
 407     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshMultiTS *deepCpy() const;
 408     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 409     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
 410     MEDLOADER_EXPORT std::string getName() const;
 411     MEDLOADER_EXPORT void setName(const char *newMeshName);
 412     MEDLOADER_EXPORT bool changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab);
 413     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *getOneTimeStep() const;
 414     MEDLOADER_EXPORT void write(med_idt fid) const;
 415     MEDLOADER_EXPORT void write(const char *fileName, int mode) const;
 416     MEDLOADER_EXPORT void setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep);
 417   private:
 418     void loadFromFile(const char *fileName, const char *mName);
 419     MEDFileMeshMultiTS();
 420     MEDFileMeshMultiTS(const char *fileName);
 421     MEDFileMeshMultiTS(const char *fileName, const char *mName);
 422   private:
 423     std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > _mesh_one_ts;
 424   };
 425
 426   class MEDFileMeshesIterator;
 427
 428   class MEDFileMeshes : public RefCountObject, public MEDFileWritable
 429   {
 430   public:
 431     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshes *New();
 432     MEDLOADER_EXPORT static MEDFileMeshes *New(const char *fileName);
 433     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshes *deepCpy() const;
 434     MEDLOADER_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 435     MEDLOADER_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildren() const;
 436     MEDLOADER_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 437     MEDLOADER_EXPORT void simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const;
 438     MEDLOADER_EXPORT void write(const char *fileName, int mode) const;
 439     MEDLOADER_EXPORT void write(med_idt fid) const;
 440     MEDLOADER_EXPORT int getNumberOfMeshes() const;
 441     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshesIterator *iterator();
 442     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *getMeshAtPos(int i) const;
 443     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *getMeshWithName(const char *mname) const;
 444     MEDLOADER_EXPORT std::vector<std::string> getMeshesNames() const;
 445     MEDLOADER_EXPORT bool changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab);
 446     //
 447     MEDLOADER_EXPORT void resize(int newSize);
 448     MEDLOADER_EXPORT void pushMesh(MEDFileMesh *mesh);
 449     MEDLOADER_EXPORT void setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh);
 450     MEDLOADER_EXPORT void destroyMeshAtPos(int i);
 451   private:
 452     void checkCoherency() const;
 453     void loadFromFile(const char *fileName);
 454     MEDFileMeshes();
 455     MEDFileMeshes(const char *fileName);
 456   private:
 457     std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > _meshes;
 458   };
 459
 460   class MEDFileMeshesIterator
 461   {
 462   public:
 463     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms);
 464     MEDLOADER_EXPORT ~MEDFileMeshesIterator();
 465     MEDLOADER_EXPORT MEDFileMesh *nextt();
 466   private:
 467     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> _ms;
 468      int _iter_id;
 469      int _nb_iter;
 470   };
 471 }
 472
 473 #endif