]> SALOME platform Git repositories - tools/medcoupling.git/blob - src/MEDLoader/MEDFileMesh.cxx
Salome HOME
On the road of last imps for MEDReader
[tools/medcoupling.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDFileMesh.hxx"
22 #include "MEDFileUtilities.hxx"
23 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
24 #include "MEDFileField.hxx"
25 #include "MEDLoader.hxx"
26 #include "MEDLoaderBase.hxx"
27
28 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
29
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31
32 #include <limits>
33 #include <cmath>
34
35 using namespace ParaMEDMEM;
36
37 const char MEDFileMesh::DFT_FAM_NAME[]="FAMILLE_ZERO";
38
39 MEDFileMesh::MEDFileMesh():_order(-1),_iteration(-1),_time(0.),_univ_wr_status(true)
40 {
41 }
42
43 std::size_t MEDFileMesh::getHeapMemorySize() const
44 {
45   std::size_t ret=_dt_unit.capacity()+_name.capacity()+_univ_name.capacity()+_desc_name.capacity();
46   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
47     {
48       ret+=(*it).first.capacity()+(*it).second.capacity()*sizeof(std::string);
49       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
50         ret+=(*it2).capacity();
51     }
52   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
53     ret+=(*it).first.capacity()+sizeof(int);
54   return ret;
55 }
56
57 /*!
58  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
59  * file. The first mesh in the file is loaded.
60  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
61  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
62  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
63  *  \throw If the file is not readable.
64  *  \throw If there is no meshes in the file.
65  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
66  */
67 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
68 {
69   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
70   if(ms.empty())
71     {
72       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
73       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
74     }
75   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
76   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
77   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
78   int dt,it;
79   std::string dummy2;
80   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
81   switch(meshType)
82     {
83     case UNSTRUCTURED:
84       {
85         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
86         ret->loadUMeshFromFile(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
87         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
88       }
89     case CARTESIAN:
90       {
91         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
92         ret->loadCMeshFromFile(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
93         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
94       }
95     case CURVE_LINEAR:
96       {
97         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
98         ret->loadCLMeshFromFile(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
99         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
100       }
101     default:
102       {
103         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << ms.front() << "' exists but unsupported type yet !";
104         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
105       }
106     }
107 }
108
109 /*!
110  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
111  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
112  * iteration.
113  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
114  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
115  *  \param [in] dt - the number of a time step.
116  *  \param [in] it - the number of an iteration.
117  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
118  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
119  *  \throw If the file is not readable.
120  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
121  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
122  */
123 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
124 {
125   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
126   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
127   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
128   int dummy0,dummy1;
129   std::string dummy2;
130   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
131   switch(meshType)
132     {
133     case UNSTRUCTURED:
134       {
135         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
136         ret->loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
137         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
138       }
139     case CARTESIAN:
140       {
141         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
142         ret->loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
143         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
144       }
145     case CURVE_LINEAR:
146       {
147         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
148         ret->loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
149         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
150       }
151     default:
152       {
153         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << mName << "' exists but unsupported type yet !";
154         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
155       }
156     }
157 }
158
159 /*!
160  * Writes \a this mesh into an open MED file specified by its descriptor.
161  *  \param [in] fid - the MED file descriptor.
162  *  \throw If the mesh name is not set.
163  *  \throw If the file is open for reading only.
164  *  \throw If the writing mode == 1 and the same data is present in an existing file.
165  */
166 void MEDFileMesh::write(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
167 {
168   if(!existsFamily(0))
169     const_cast<MEDFileMesh *>(this)->addFamily(DFT_FAM_NAME,0);
170   if(_name.empty())
171     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh : name is empty. MED file ask for a NON EMPTY name !");
172   writeLL(fid);
173 }
174
175 /*!
176  * Writes \a this mesh into a MED file specified by its name.
177  *  \param [in] fileName - the MED file name.
178  *  \param [in] mode - the writing mode. For more on \a mode, see \ref AdvMEDLoaderBasics.
179  * - 2 - erase; an existing file is removed.
180  * - 1 - append; same data should not be present in an existing file.
181  * - 0 - overwrite; same data present in an existing file is overwritten.
182  *  \throw If the mesh name is not set.
183  *  \throw If \a mode == 1 and the same data is present in an existing file.
184  */
185 void MEDFileMesh::write(const char *fileName, int mode) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
186 {
187   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
188   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,medmod);
189   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
190   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str().c_str());
191   write(fid);
192 }
193
194 /*!
195  * Checks if \a this and another mesh are equal.
196  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
197  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
198  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
199  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
200  */
201 bool MEDFileMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
202 {
203   if(_order!=other->_order)
204     {
205       what="Orders differ !";
206       return false;
207     }
208   if(_iteration!=other->_iteration)
209     {
210       what="Iterations differ !";
211       return false;
212     }
213   if(fabs(_time-other->_time)>eps)
214     {
215       what="Time values differ !";
216       return false;
217     }
218   if(_dt_unit!=other->_dt_unit)
219     {
220       what="Time units differ !";
221       return false;
222     }
223   if(_name!=other->_name)
224     {
225       what="Names differ !";
226       return false;
227     }
228   //univ_name has been ignored -> not a bug because it is a mutable attribute
229   if(_desc_name!=other->_desc_name)
230     {
231       what="Description names differ !";
232       return false;
233     }
234   if(!areGrpsEqual(other,what))
235     return false;
236   if(!areFamsEqual(other,what))
237     return false;
238   return true;
239 }
240
241 /*!
242  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
243  */
244 void MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes() const
245 {
246   
247 }
248
249 bool MEDFileMesh::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
250 {
251   for(std::vector< std::pair<std::string,std::string> >::const_iterator it=modifTab.begin();it!=modifTab.end();it++)
252     {
253       if((*it).first==_name)
254         {
255           _name=(*it).second;
256           return true;
257         }
258     }
259   return false;
260 }
261
262 /*!
263  * Copies data on groups and families from another mesh.
264  *  \param [in] other - the mesh to copy the data from.
265  */
266 void MEDFileMesh::copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other)
267 {
268   _groups=other._groups;
269   _families=other._families;
270 }
271
272 /*!
273  * Returns names of families constituting a group.
274  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
275  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
276  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
277  */
278 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroup(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
279 {
280   std::string oname(name);
281   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
282   if(it==_groups.end())
283     {
284       std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
285       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
286       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
287       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
288     }
289   return (*it).second;
290 }
291
292 /*!
293  * Returns names of families constituting some groups.
294  *  \param [in] grps - a sequence of names of groups of interest.
295  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
296  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
297  */
298 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
299 {
300   std::set<std::string> fams;
301   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++)
302     {
303       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=_groups.find(*it);
304       if(it2==_groups.end())
305         {
306           std::ostringstream oss; oss << "No such group in mesh \"" << _name << "\" : " << *it; 
307           std::vector<std::string> grps2=getGroupsNames(); oss << "\" !\nAvailable groups are :";
308           std::copy(grps2.begin(),grps2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
309           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
310         }
311       fams.insert((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
312     }
313   std::vector<std::string> fams2(fams.begin(),fams.end());
314   return fams2;
315 }
316
317 /*!
318  * Returns ids of families constituting a group.
319  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
320  *  \return std::vector<int> - sequence of ids of the families.
321  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
322  */
323 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIdsOnGroup(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
324 {
325   std::string oname(name);
326   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
327   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
328   if(it==_groups.end())
329     {
330       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
331       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
332       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
333     }
334   return getFamiliesIds((*it).second);
335 }
336
337 /*!
338  * Sets names of families constituting a group. If data on families of this group is
339  * already present, it is overwritten. Every family in \a fams is checked, and if a
340  family is not yet in \a this mesh, the default group id \c 0 is assigned to it.
341  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
342  *  \param [in] fams - a sequence of names of families constituting the group.
343  */
344 void MEDFileMesh::setFamiliesOnGroup(const char *name, const std::vector<std::string>& fams) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
345 {
346   std::string oname(name);
347   _groups[oname]=fams;
348   for(std::vector<std::string>::const_iterator it1=fams.begin();it1!=fams.end();it1++)
349     {
350       std::map<std::string,int>::iterator it2=_families.find(*it1);
351       if(it2==_families.end())
352         _families[*it1]=0;
353     }
354 }
355
356 /*!
357  * Sets families constituting a group. The families are specified by their ids.
358  * If a family name is not found by its id, an exception is thrown.
359  * If several families have same id, the first one in lexical order is taken.
360  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
361  *  \param [in] famIds - a sequence of ids of families constituting the group.
362  *  \throw If a family name is not found by its id.
363  */
364 void MEDFileMesh::setFamiliesIdsOnGroup(const char *name, const std::vector<int>& famIds) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
365 {
366   std::string oname(name);
367   std::vector<std::string> fams(famIds.size());
368   int i=0;
369   for(std::vector<int>::const_iterator it1=famIds.begin();it1!=famIds.end();it1++,i++)
370     {
371       std::string name2=getFamilyNameGivenId(*it1);
372       fams[i]=name2;
373     }
374   _groups[oname]=fams;
375 }
376
377 /*!
378  * Returns names of groups including a given family.
379  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
380  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of groups including the family.
381  */
382 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsOnFamily(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
383 {
384   std::vector<std::string> ret;
385   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();it1!=_groups.end();it1++)
386     {
387       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it1).second.begin();it2!=(*it1).second.end();it2++)
388         if((*it2)==name)
389           {
390             ret.push_back((*it1).first);
391             break;
392           }
393     }
394   return ret;
395 }
396
397 /*!
398  * Adds an existing family to groups.
399  *  \param [in] famName - a name of family to add to \a grps.
400  *  \param [in] grps - a sequence of group names to add the family in.
401  *  \throw If a family named \a famName not yet exists.
402  */
403 void MEDFileMesh::setGroupsOnFamily(const char *famName, const std::vector<std::string>& grps) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
404 {
405   std::string fName(famName);
406   const std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fName);
407   if(it==_families.end())
408     {
409       std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
410       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << fName << "\" !\nAvailable families are :";
411       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
412       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
413     }
414   for(std::vector<std::string>::const_iterator it3=grps.begin();it3!=grps.end();it3++)
415     {
416       std::map< std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(*it3);
417       if(it2!=_groups.end())
418         (*it2).second.push_back(fName);
419       else
420         {
421           std::vector<std::string> grps2(1,fName);
422           _groups[*it3]=grps2;
423         }
424     }
425 }
426
427 /*!
428  * Returns names of all groups of \a this mesh.
429  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names.
430  */
431 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsNames() const
432 {
433   std::vector<std::string> ret(_groups.size());
434   int i=0;
435   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++,i++)
436     ret[i]=(*it).first;
437   return ret;
438 }
439
440 /*!
441  * Returns names of all families of \a this mesh.
442  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of family names.
443  */
444 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesNames() const
445 {
446   std::vector<std::string> ret(_families.size());
447   int i=0;
448   for(std::map<std::string, int >::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++,i++)
449     ret[i]=(*it).first;
450   return ret;
451 }
452
453 /*!
454  * Changes a name of every family, included in one group only, to be same as the group name.
455  *  \throw If there are families with equal names in \a this mesh.
456  */
457 void MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
458 {
459   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
460   std::map<std::string,int> newFams;
461   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
462     {
463       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first.c_str());
464       if(grps.size()==1 && groups[grps[0]].size()==1)
465         {
466           if(newFams.find(grps[0])!=newFams.end())
467             {
468               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << grps[0] << "\" already exists !";
469               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
470             }
471           newFams[grps[0]]=(*it).second;
472           std::vector<std::string>& grps2=groups[grps[0]];
473           std::size_t pos=std::distance(grps2.begin(),std::find(grps2.begin(),grps2.end(),(*it).first));
474           grps2[pos]=grps[0];
475         }
476       else
477         {
478           if(newFams.find((*it).first)!=newFams.end())
479             {
480               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << (*it).first << "\" already exists !";
481               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
482             }
483           newFams[(*it).first]=(*it).second;
484         }
485     }
486   _families=newFams;
487   _groups=groups;
488 }
489
490 /*!
491  * Removes all groups lying on no family. If there is no empty groups, \a this is let untouched.
492  * 
493  * \return the removed groups.
494  */
495 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeEmptyGroups() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
496 {
497   std::vector<std::string> ret;
498   std::map<std::string, std::vector<std::string> > newGrps;
499   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
500     {
501       if((*it).second.empty())
502         ret.push_back((*it).first);
503       else
504         newGrps[(*it).first]=(*it).second;
505     }
506   if(!ret.empty())
507     _groups=newGrps;
508   return ret;
509 }
510
511 /*!
512  * Removes a group from \a this mesh.
513  *  \param [in] name - the name of the group to remove.
514  *  \throw If no group with such a \a name exists.
515  */
516 void MEDFileMesh::removeGroup(const char *name) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
517 {
518   std::string oname(name);
519   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
520   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
521   if(it==_groups.end())
522     {
523       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
524       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
525       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
526     }
527   _groups.erase(it);
528 }
529
530 /*!
531  * Removes a family from \a this mesh.
532  *  \param [in] name - the name of the family to remove.
533  *  \throw If no family with such a \a name exists.
534  */
535 void MEDFileMesh::removeFamily(const char *name) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
536 {
537   std::string oname(name);
538   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
539   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
540   if(it==_families.end())
541     {
542       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
543       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
544       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
545     }
546   _families.erase(it);
547   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
548     {
549       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
550       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
551       if(it4!=v.end())
552         v.erase(it4);
553     }
554 }
555
556 /*!
557  * Removes all groups in \a this that are orphan. A group is orphan if this group lies on
558  * a set of families, themselves orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
559  * family field whatever its level. This method also suppresses the orphan families.
560  * 
561  * \return - The list of removed groups names. 
562  *
563  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanFamilies.
564  */
565 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanGroups() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
566 {
567   removeOrphanFamilies();
568   return removeEmptyGroups();
569 }
570
571 /*!
572  * Removes all families in \a this that are orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
573  * family field whatever its level. Groups are updated in consequence, that is to say all groups lying on orphan family, will see their families list modified.
574  * 
575  * \return - The list of removed families names.
576  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanGroups.
577  */
578 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanFamilies() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
579 {
580   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allFamIdsInUse=computeAllFamilyIdsInUse();
581   std::vector<std::string> ret;
582   if(!((DataArrayInt*)allFamIdsInUse))
583     {
584       ret=getFamiliesNames();
585       _families.clear(); _groups.clear();
586       return ret;
587     }
588   std::map<std::string,int> famMap;
589   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grps(_groups);
590   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
591     {
592       if(allFamIdsInUse->presenceOfValue((*it).second))
593         famMap[(*it).first]=(*it).second;
594       else
595         {
596           ret.push_back((*it).first);
597           std::vector<std::string> grpsOnEraseFam=getGroupsOnFamily((*it).first.c_str());
598           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOnEraseFam.begin();it2!=grpsOnEraseFam.end();it2++)
599             {
600               std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=grps.find(*it2);//it3!=grps.empty() thanks to copy
601               std::vector<std::string>& famv=(*it3).second;
602               std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(famv.begin(),famv.end(),(*it).first);//it4!=famv.end() thanks to copy
603               famv.erase(it4);
604             }
605         }
606     }
607   if(!ret.empty())
608     { _families=famMap; _groups=grps; }
609   return ret;
610 }
611
612 /*!
613  * Renames a group in \a this mesh.
614  *  \param [in] oldName - a current name of the group to rename.
615  *  \param [in] newName - a new group name.
616  *  \throw If no group named \a oldName exists in \a this mesh.
617  *  \throw If a group named \a newName already exists.
618  */
619 void MEDFileMesh::changeGroupName(const char *oldName, const char *newName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
620 {
621   std::string oname(oldName);
622   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
623   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
624   if(it==_groups.end())
625     {
626       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << oldName << "\" !\nAvailable groups are :";
627       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
628       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
629     }
630   std::string nname(newName);
631   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(nname);
632   if(it2!=_groups.end())
633     {
634       std::ostringstream oss; oss << "Such groupname \"" << newName << "\" already exists ! Kill it before !";
635       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
636     }
637   std::vector<std::string> cpy=(*it).second;
638   _groups.erase(it);
639   _groups[newName]=cpy;
640 }
641
642 /*!
643  * Changes an id of a family in \a this mesh. 
644  * This method calls changeFamilyIdArr().
645  *  \param [in] oldId - a current id of the family.
646  *  \param [in] newId - a new family id.
647  */
648 void MEDFileMesh::changeFamilyId(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
649 {
650   changeFamilyIdArr(oldId,newId);
651   std::map<std::string,int> fam2;
652   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
653     {
654       if((*it).second==oldId)
655         fam2[(*it).first]=newId;
656       else
657         fam2[(*it).first]=(*it).second;
658     }
659   _families=fam2;
660 }
661
662 /*!
663  * Renames a family in \a this mesh.
664  *  \param [in] oldName - a current name of the family to rename.
665  *  \param [in] newName - a new family name.
666  *  \throw If no family named \a oldName exists in \a this mesh.
667  *  \throw If a family named \a newName already exists.
668  */
669 void MEDFileMesh::changeFamilyName(const char *oldName, const char *newName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
670 {
671   std::string oname(oldName);
672   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
673   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
674   if(it==_families.end())
675     {
676       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << oldName << "\" !\nAvailable families are :";
677       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
678       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
679     }
680   std::string nname(newName);
681   std::map<std::string, int >::iterator it2=_families.find(nname);
682   if(it2!=_families.end())
683     {
684       std::ostringstream oss; oss << "Such familyname \"" << newName << " already exists ! Kill it before !";
685       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
686     }
687   int cpy=(*it).second;
688   _families.erase(it);
689   _families[newName]=cpy;
690   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
691     {
692       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
693       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
694       if(it4!=v.end())
695         (*it4)=nname;
696     }
697 }
698
699 /*!
700  * Checks if \a this and another mesh contains the same families.
701  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
702  *  \param [in,out] what - an unused parameter.
703  *  \return bool - \c true if number of families and their ids are the same in the two
704  *          meshes. Families with the id == \c 0 are not considered.
705  */
706 bool MEDFileMesh::areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
707 {
708   if(_families==other->_families)
709     return true;
710   std::map<std::string,int> fam0;
711   std::map<std::string,int> fam1;
712   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
713     if((*it).second!=0)
714       fam0[(*it).first]=(*it).second;
715   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=other->_families.begin();it!=other->_families.end();it++)
716     if((*it).second!=0)
717       fam1[(*it).first]=(*it).second;
718   return fam0==fam1;
719 }
720
721 /*!
722  * Checks if \a this and another mesh contains the same groups.
723  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
724  *  \param [in,out] what - a string describing a difference of groups of the two meshes
725  *          in case if this method returns \c false.
726  *  \return bool - \c true if number of groups and families constituting them are the
727  *          same in the two meshes.
728  */
729 bool MEDFileMesh::areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
730 {
731   if(_groups==other->_groups)
732     return true;
733   bool ret=true;
734   std::size_t sz=_groups.size();
735   if(sz!=other->_groups.size())
736     {
737       what="Groups differ because not same number !\n";
738       ret=false;
739     }
740   if(ret)
741     {
742       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();
743       for(std::size_t i=0;i<sz && ret;i++,it1++)
744         {
745           std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=other->_groups.find((*it1).first);
746           if(it2!=other->_groups.end())
747             {
748               std::set<std::string> s1((*it1).second.begin(),(*it1).second.end());
749               std::set<std::string> s2((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
750               ret=(s1==s2);
751             }
752           else
753             {
754               ret=false;
755               what="A group in first mesh exists not in other !\n";
756             }
757         }
758     }
759   if(!ret)
760     {
761       std::ostringstream oss; oss << "Groups description differs :\n";
762       oss << "First group description :\n";
763       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
764         {
765           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
766           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
767         oss << "    \"" << *it2 << "\n";
768         }
769       oss << "Second group description :\n";
770       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=other->_groups.begin();it!=other->_groups.end();it++)
771         {
772           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
773           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
774             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
775         }
776       what+=oss.str();
777     }
778   return ret;
779 }
780
781 /*!
782  * Checks if a group with a given name exists in \a this mesh.
783  *  \param [in] groupName - the group name.
784  *  \return bool - \c true the group \a groupName exists in \a this mesh.
785  */
786 bool MEDFileMesh::existsGroup(const char *groupName) const
787 {
788   std::string grpName(groupName);
789   return _groups.find(grpName)!=_groups.end();
790 }
791
792 /*!
793  * Checks if a family with a given id exists in \a this mesh.
794  *  \param [in] famId - the family id.
795  *  \return bool - \c true the family with the id \a famId exists in \a this mesh.
796  */
797 bool MEDFileMesh::existsFamily(int famId) const
798 {
799   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
800     if((*it2).second==famId)
801       return true;
802   return false;
803 }
804
805 /*!
806  * Checks if a family with a given name exists in \a this mesh.
807  *  \param [in] familyName - the family name.
808  *  \return bool - \c true the family \a familyName exists in \a this mesh.
809  */
810 bool MEDFileMesh::existsFamily(const char *familyName) const
811 {
812   std::string fname(familyName);
813   return _families.find(fname)!=_families.end();
814 }
815
816 /*!
817  * Sets an id of a family.
818  *  \param [in] familyName - the family name.
819  *  \param [in] id - a new id of the family.
820  */
821 void MEDFileMesh::setFamilyId(const char *familyName, int id)
822 {
823   std::string fname(familyName);
824   _families[fname]=id;
825 }
826
827 void MEDFileMesh::setFamilyIdUnique(const char *familyName, int id) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
828 {
829   std::string fname(familyName);
830   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
831     if((*it).second==id)
832       {
833         if((*it).first!=familyName)
834           {
835             std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::setFamilyIdUnique : Family id #" << id << " is already belonging to family with name \"" << (*it).first << "\" !";
836             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
837           }
838       }
839   _families[fname]=id;
840 }
841
842 /*!
843  * Adds a family to \a this mesh.
844  *  \param [in] familyName - a name of the family.
845  *  \param [in] famId - an id of the family.
846  *  \throw If a family with the same name or id already exists in \a this mesh.
847  */
848 void MEDFileMesh::addFamily(const char *familyName, int famId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
849 {
850   std::string fname(familyName);
851   std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fname);
852   if(it==_families.end())
853     {
854        for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
855          if((*it2).second==famId)
856            {
857              std::ostringstream oss;
858              oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << (*it2).first << "\" already exists with specified id : " << famId << " !";
859              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
860            }
861        _families[fname]=famId;
862     }
863   else
864     {
865       if((*it).second!=famId)
866         {
867           std::ostringstream oss;
868           oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << fname << "\" already exists but has id set to " << (*it).second << " different from asked famId " << famId << " !";
869           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
870         }
871     }
872 }
873
874 /*!
875  * Creates a group including all mesh entities of given dimension.
876  * \warning This method does \b not guarantee that the created group includes mesh
877  * entities of only \a meshDimRelToMaxExt dimension in the case if some family id is
878  * present in family fields of different dimensions. To assure this, call
879  * ensureDifferentFamIdsPerLevel() \b before calling this method.
880  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of mesh entities to include to
881  *          the group.
882  *  \param [in] groupName - a name of the new group.
883  *  \throw If a group named \a groupName already exists.
884  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt exist in \a this mesh.
885  *  \throw If no family field of dimension \a meshDimRelToMaxExt is present in \a this mesh.
886  */
887 void MEDFileMesh::createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const char *groupName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
888 {
889   std::string grpName(groupName);
890   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
891   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
892     {
893       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The relative ext dimension " << meshDimRelToMaxExt << " is not available !" << std::endl;
894       oss << "Available relative ext levels are : ";
895       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
896       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
897     }
898   if(existsGroup(groupName))
899     {
900       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The groups \"" << grpName << "\" already exists in this !" << std::endl;
901       oss << "Already existing groups are : ";
902       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
903       oss << std::endl << "Please choose an another group name or call removeGroup(\"" << grpName << "\") method !";
904       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
905     }
906   const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
907   if(fieldFamIds==0)
908     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::createGroupOnAll : Family field arr ids is not defined for this level !");
909   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=fieldFamIds->getDifferentValues();
910   std::vector<std::string> familiesOnWholeGroup;
911   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
912     {
913       bool tmp;
914       familiesOnWholeGroup.push_back(findOrCreateAndGiveFamilyWithId(*it,tmp));
915     }
916   _groups[grpName]=familiesOnWholeGroup;
917 }
918
919 /*!
920  * Ensures that given family ids do not present in family fields of dimensions different
921  * than given ones. If a family id is present in the family fields of dimensions different
922  * than the given ones, a new family is created and the whole data is updated accordingly.
923  *  \param [in] famIds - a sequence of family ids to check.
924  *  \param [in] vMeshDimRelToMaxExt - a sequence of relative dimensions to which the \a
925  *          famIds should exclusively belong.
926  *  \return bool - \c true if no modification is done in \a this mesh by this method.
927  */
928 bool MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& vMeshDimRelToMaxExt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
929 {
930   std::set<int> levsInput(vMeshDimRelToMaxExt.begin(),vMeshDimRelToMaxExt.end());
931   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
932   std::set<int> levs2(levs.begin(),levs.end());
933   std::vector<int> levsToTest;
934   std::set_difference(levs2.begin(),levs2.end(),levsInput.begin(),levsInput.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(levsToTest));
935   std::set<int> famIds2(famIds.begin(),famIds.end());
936   bool ret=true;
937   int maxFamId=1;
938   if(!_families.empty())
939     maxFamId=getMaxFamilyId()+1;
940   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
941   for(std::vector<int>::const_iterator it=levsToTest.begin();it!=levsToTest.end();it++)
942     {
943       const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(*it);
944       if(fieldFamIds)
945         {
946           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds3=fieldFamIds->getDifferentValues();
947           std::vector<int> tmp;
948           std::set_intersection(famIds3->begin(),famIds3->end(),famIds2.begin(),famIds2.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(tmp));
949           for(std::vector<int>::const_iterator it2=tmp.begin();it2!=tmp.end();it2++)
950             {
951               ret=false;
952               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it2);
953               std::ostringstream oss; oss << "Family_" << maxFamId;
954               std::string zeName=CreateNameNotIn(oss.str(),allFams);
955               addFamilyOnAllGroupsHaving(famName.c_str(),zeName.c_str());
956               _families[zeName]=maxFamId;
957               (const_cast<DataArrayInt *>(fieldFamIds))->changeValue(*it2,maxFamId);
958               maxFamId++;
959             }
960         }
961     }
962   return ret;
963 }
964
965 /*!
966  * Adds a family to a given group in \a this mesh. If the group with a given name does
967  * not exist, it is created.
968  *  \param [in] grpName - the name of the group to add the family in.
969  *  \param [in] famName - the name of the family to add to the group named \a grpName.
970  *  \throw If \a grpName or \a famName is an empty string.
971  *  \throw If no family named \a famName is present in \a this mesh.
972  */
973 void MEDFileMesh::addFamilyOnGrp(const char *grpName, const char *famName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
974 {
975   std::string grpn(grpName);
976   std::string famn(famName);
977   if(grpn.empty() || famn.empty())
978     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : input strings must be non null !");
979   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
980   if(std::find(fams.begin(),fams.end(),famn)==fams.end())
981     {
982       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : Family \"" << famn << "\" does not exist !" << std::endl;
983       oss << "Create this family or choose an existing one ! Existing fams are : ";
984       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," ")); oss << ".";
985       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
986     }
987   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(grpn);
988   if(it==_groups.end())
989     {
990       _groups[grpn].push_back(famn);
991     }
992   else
993     {
994       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find((*it).second.begin(),(*it).second.end(),famn);
995       if(it2==(*it).second.end())
996         (*it).second.push_back(famn);
997     }
998 }
999
1000 /*!
1001  * This method adds to all groups lying on family with name 'famName' the other family name 'otherFamName'.
1002  * This method is quite underground because it can lead to unconsistency because family 'otherFamName' is \b not added into _families.
1003  * This method is used by MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs method.
1004  */
1005 void MEDFileMesh::addFamilyOnAllGroupsHaving(const char *famName, const char *otherFamName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1006 {
1007   std::string famNameCpp(famName);
1008   std::string otherCpp(otherFamName);
1009   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
1010     {
1011       std::vector<std::string>& v=(*it).second;
1012       if(std::find(v.begin(),v.end(),famNameCpp)!=v.end())
1013         {
1014           v.push_back(otherCpp);
1015         }
1016     }
1017 }
1018
1019 void MEDFileMesh::changeAllGroupsContainingFamily(const char *familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1020 {
1021   ChangeAllGroupsContainingFamily(_groups,familyNameToChange,newFamiliesNames);
1022 }
1023
1024 void MEDFileMesh::ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const char *familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1025 {
1026   std::string fam(familyNameToChange);
1027   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=groups.begin();it!=groups.end();it++)
1028     {
1029       std::vector<std::string>& fams((*it).second);
1030       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find(fams.begin(),fams.end(),fam);
1031       if(it2!=fams.end())
1032         {
1033           fams.erase(it2);
1034           fams.insert(fams.end(),newFamiliesNames.begin(),newFamiliesNames.end());
1035         }
1036     }
1037 }
1038
1039 /*!
1040  * Returns a name of the family having a given id or, if no such a family exists, creates
1041  * a new uniquely named family and returns its name.
1042  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1043  *  \param [out] created - returns \c true if the new family has been created, \c false, else.
1044  *  \return std::string - the name of the existing or the created family.
1045  *  \throw If it is not possible to create a unique family name.
1046  */
1047 std::string MEDFileMesh::findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1048 {
1049   return FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(_families,id,created);
1050 }
1051
1052 /*!
1053  * If it exists a family whose family id is equal to 'id' this method behaves as MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId.
1054  * In this case, 'this' internal states remains unchanged and 'created' out parameter will be set to false.
1055  * If there is no family whose family id is equal to 'id' a family is created with a name different from those
1056  * already existing. In this case 'created' will be returned with a value set to true, and internal state
1057  * will be modified.
1058  * This method will throws an exception if it is not possible to create a unique family name.
1059  */
1060 std::string MEDFileMesh::FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1061 {
1062   std::vector<std::string> famAlreadyExisting(families.size());
1063   int ii=0;
1064   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++,ii++)
1065     {
1066       if((*it).second!=id)
1067         {
1068           famAlreadyExisting[ii]=(*it).first;
1069         }
1070       else
1071         {
1072           created=false;
1073           return (*it).first;
1074         }
1075     }
1076   created=true;
1077   std::ostringstream oss; oss << "Family_" << id;
1078   std::string ret=CreateNameNotIn(oss.str(),famAlreadyExisting);
1079   families[ret]=id;
1080   return ret;
1081 }
1082
1083 /*!
1084  * Sets names and ids of all families in \a this mesh.
1085  *  \param [in] info - a map of a family name to a family id.
1086  */
1087 void MEDFileMesh::setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info)
1088 {
1089   _families=info;
1090 }
1091
1092 /*!
1093  * Sets names of all groups and families constituting them in \a this mesh.
1094  *  \param [in] info - a map of a group name to a vector of names of families
1095  *          constituting the group.
1096  */
1097 void MEDFileMesh::setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info)
1098 {
1099   _groups=info;
1100 }
1101
1102 /*!
1103  * Returns an id of the family having a given name.
1104  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
1105  *  \return int - the id of the family of interest.
1106  *  \throw If no family with such a \a name exists.
1107  */
1108 int MEDFileMesh::getFamilyId(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1109 {
1110   std::string oname(name);
1111   std::map<std::string, int>::const_iterator it=_families.find(oname);
1112   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1113   if(it==_families.end())
1114     {
1115       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
1116       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1117       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1118     }
1119   return (*it).second;
1120 }
1121
1122 /*!
1123  * Returns ids of the families having given names.
1124  *  \param [in] fams - a sequence of the names of families of interest.
1125  *  \return std::vector<int> - a sequence of the ids of families of interest.
1126  *  \throw If \a fams contains a name of an inexistent family.
1127  */
1128 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& fams) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1129 {
1130   std::vector<int> ret(fams.size());
1131   int i=0;
1132   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++,i++)
1133     {
1134       std::map<std::string, int>::const_iterator it2=_families.find(*it);
1135       if(it2==_families.end())
1136         {
1137           std::vector<std::string> fams2=getFamiliesNames();
1138           std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << *it << "\" in input list !\nAvailable families are :";
1139           std::copy(fams2.begin(),fams2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1140           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1141         }
1142       ret[i]=(*it2).second;
1143     }
1144   return ret;
1145 }
1146
1147 /*!
1148  * Returns a maximal abs(id) of families in \a this mesh.
1149  *  \return int - the maximal norm of family id.
1150  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1151  */
1152 int MEDFileMesh::getMaxAbsFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1153 {
1154   if(_families.empty())
1155     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1156   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1157   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1158     {
1159       ret=std::max(std::abs((*it).second),ret);
1160     }
1161   return ret;
1162 }
1163
1164 /*!
1165  * Returns a maximal id of families in \a this mesh.
1166  *  \return int - the maximal family id.
1167  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1168  */
1169 int MEDFileMesh::getMaxFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1170 {
1171   if(_families.empty())
1172     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1173   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1174   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1175     {
1176       ret=std::max((*it).second,ret);
1177     }
1178   return ret;
1179 }
1180
1181 /*!
1182  * Returns a minimal id of families in \a this mesh.
1183  *  \return int - the minimal family id.
1184  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1185  */
1186 int MEDFileMesh::getMinFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1187 {
1188   if(_families.empty())
1189     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMinFamilyId : no families set !");
1190   int ret=std::numeric_limits<int>::max();
1191   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1192     {
1193       ret=std::min((*it).second,ret);
1194     }
1195   return ret;
1196 }
1197
1198 /*!
1199  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1200  * considered but all family fields as well.
1201  *  \return int - the maximal family id.
1202  */
1203 int MEDFileMesh::getTheMaxAbsFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1204 {
1205   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1206   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1207     m1=std::max(std::abs((*it).second),m1);
1208   int m2=getMaxAbsFamilyIdInArrays();
1209   return std::max(m1,m2);
1210 }
1211
1212 /*!
1213  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1214  * considered but all family fields as well.
1215  *  \return int - the maximal family id.
1216  */
1217 int MEDFileMesh::getTheMaxFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1218 {
1219   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1220   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1221     m1=std::max((*it).second,m1);
1222   int m2=getMaxFamilyIdInArrays();
1223   return std::max(m1,m2);
1224 }
1225
1226 /*!
1227  * Returns a minimal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1228  * considered but all family fields as well.
1229  *  \return int - the minimal family id.
1230  */
1231 int MEDFileMesh::getTheMinFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1232 {
1233   int m1=std::numeric_limits<int>::max();
1234   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1235     m1=std::min((*it).second,m1);
1236   int m2=getMinFamilyIdInArrays();
1237   return std::min(m1,m2);
1238 }
1239
1240 /*!
1241  * This method only considers the maps. The contain of family array is ignored here.
1242  * 
1243  * \sa MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse
1244  */
1245 DataArrayInt *MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1246 {
1247   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1248   std::set<int> v;
1249   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1250     v.insert((*it).second);
1251   ret->alloc((int)v.size(),1);
1252   std::copy(v.begin(),v.end(),ret->getPointer());
1253   return ret.retn();
1254 }
1255
1256 /*!
1257  * This method does not consider map of family name, family id. Only family field array on different levels is considered.
1258  * 
1259  * \sa MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced
1260  */
1261 DataArrayInt *MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1262 {
1263   std::vector<int> famLevs=getFamArrNonEmptyLevelsExt();
1264   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret;
1265   for(std::vector<int>::const_iterator it=famLevs.begin();it!=famLevs.end();it++)
1266     {
1267       const DataArrayInt *arr=getFamilyFieldAtLevel(*it);//arr not null due to spec of getFamArrNonEmptyLevelsExt
1268       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> dv=arr->getDifferentValues();
1269       if((DataArrayInt *) ret)
1270         ret=dv->buildUnion(ret);
1271       else
1272         ret=dv;
1273     }
1274   return ret.retn();
1275 }
1276
1277 /*!
1278  * true is returned if no modification has been needed. false if family
1279  * renumbering has been needed.       
1280  */
1281 bool MEDFileMesh::ensureDifferentFamIdsPerLevel() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1282 {
1283   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1284   std::set<int> allFamIds;
1285   int maxId=getMaxFamilyId()+1;
1286   std::map<int,std::vector<int> > famIdsToRenum;
1287   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1288     {
1289       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it);
1290       if(fam)
1291         {
1292           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1293           std::set<int> r2;
1294           std::set_intersection(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r2,r2.end()));
1295           if(!r2.empty())
1296             famIdsToRenum[*it].insert(famIdsToRenum[*it].end(),r2.begin(),r2.end());
1297           std::set<int> r3;
1298           std::set_union(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r3,r3.end()));
1299         }
1300     }
1301   if(famIdsToRenum.empty())
1302     return true;
1303   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1304   for(std::map<int,std::vector<int> >::const_iterator it2=famIdsToRenum.begin();it2!=famIdsToRenum.end();it2++)
1305     {
1306       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt *>(getFamilyFieldAtLevel((*it2).first));
1307       int *famIdsToChange=fam->getPointer();
1308       std::map<int,int> ren;
1309       for(std::vector<int>::const_iterator it3=(*it2).second.begin();it3!=(*it2).second.end();it3++,maxId++)
1310         {
1311           if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1312             {
1313               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1314               std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily(famName.c_str());
1315               ren[*it3]=maxId;
1316               bool dummy;
1317               std::string newFam=findOrCreateAndGiveFamilyWithId(maxId,dummy);
1318               for(std::vector<std::string>::const_iterator it4=grps.begin();it4!=grps.end();it4++)
1319                 addFamilyOnGrp((*it4).c_str(),newFam.c_str());
1320             }
1321         }
1322       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getIdsEqualList(&(*it2).second[0],&(*it2).second[0]+(*it2).second.size());
1323       for(const int *id=ids->begin();id!=ids->end();id++)
1324         famIdsToChange[*id]=ren[famIdsToChange[*id]];
1325     }
1326   return false;
1327 }
1328
1329 /*!
1330  * This method normalizes fam id with the policy explained underneath. This policy is close to those implemented in SMESH.
1331  * Level #0 famids > 0, Level #-1 famids < 0, Level #-2 famids=0, Level #1 famids=0
1332  * This policy is those used by SMESH and Trio and that is the opposite of those in MED file.
1333  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1334  * \warning This policy is the opposite of those in MED file documentation ...
1335  */
1336 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsTrio() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1337 {
1338   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1339   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1340   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1341   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1342   std::set<std::string> famsFetched;
1343   std::map<std::string,int> families;
1344   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)!=levs.end())
1345     {
1346       levsS.erase(0);
1347       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(0);
1348       if(fam)
1349         {
1350           int refId=1;
1351           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1352           std::map<int,int> ren;
1353           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1354             ren[*it]=refId;
1355           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1356           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1357           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1358             *w=ren[*w];
1359           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1360             {
1361               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1362                 {
1363                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1364                   families[famName]=ren[*it];
1365                   famsFetched.insert(famName);
1366                 }
1367             }
1368         }
1369     }
1370   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)!=levs.end())
1371     {
1372       levsS.erase(-1);
1373       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
1374       if(fam)
1375         {
1376           int refId=-1;
1377           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1378           std::map<int,int> ren;
1379           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1380             ren[*it]=refId;
1381           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1382           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1383           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1384             *w=ren[*w];
1385           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1386             {
1387               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1388                 {
1389                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1390                   families[famName]=ren[*it];
1391                   famsFetched.insert(famName);
1392                 }
1393             }
1394         }
1395     }
1396   for(std::set<int>::const_iterator it2=levsS.begin();it2!=levsS.end();it2++)
1397     {
1398       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt*>(getFamilyFieldAtLevel(*it2));
1399       if(fam)
1400         {
1401           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1402           fam->fillWithZero();
1403           for(const int *it3=tmp->begin();it3!=tmp->end();it3++)
1404             if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1405               {
1406                 std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1407                 families[famName]=0;
1408                 famsFetched.insert(famName);
1409               }
1410         }
1411     }
1412   //
1413   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1414   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1415   std::set<std::string> unFetchedIds;
1416   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1417   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1418     families[*it4]=_families[*it4];
1419   _families=families;
1420 }
1421
1422 /*!
1423  * This method normalizes fam id with the following policy.
1424  * Level #0 famids < 0, Level #-1 famids < 0 and for Level #1 famids >= 0
1425  * This policy is those defined in the MED file format but is the opposite of those implemented in SMESH and Trio.
1426  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1427  */
1428 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsMEDFile() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1429 {
1430   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1431   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1432   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1433   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1434   std::set<std::string> famsFetched;
1435   std::map<std::string,int> families;
1436   int refId=1;
1437   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),1)!=levs.end())
1438     {
1439       levsS.erase(1);
1440       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(1);
1441       if(fam)
1442         {
1443           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1444           std::map<int,int> ren;
1445           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1446             ren[*it]=refId;
1447           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1448           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1449           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1450             *w=ren[*w];
1451           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1452             {
1453               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1454                 {
1455                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1456                   families[famName]=ren[*it];
1457                   famsFetched.insert(famName);
1458                 }
1459             }
1460         }
1461     }
1462   refId=-1;
1463   for(std::set<int>::const_reverse_iterator it2=levsS.rbegin();it2!=levsS.rend();it2++)
1464     {
1465       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it2);
1466       if(fam)
1467         {
1468           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1469           std::map<int,int> ren;
1470           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1471             ren[*it]=refId;
1472           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1473           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1474           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1475             *w=ren[*w];
1476           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1477             {
1478               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1479                 {
1480                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1481                   families[famName]=ren[*it];
1482                   famsFetched.insert(famName);
1483                 }
1484             }
1485         }
1486     }
1487   //
1488   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1489   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1490   std::set<std::string> unFetchedIds;
1491   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1492   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1493     families[*it4]=_families[*it4];
1494   _families=families;
1495 }
1496
1497 /*!
1498  * Returns a name of the family by its id. If there are several families having the given
1499  * id, the name first in lexical order is returned.
1500  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1501  *  \return std::string - the name of the found family.
1502  *  \throw If no family with the given \a id exists.
1503  */
1504 std::string MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId(int id) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1505 {
1506   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1507     if((*it).second==id)
1508       return (*it).first;
1509   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::getFamilyNameGivenId : no such family id : " << id;
1510   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1511 }
1512
1513 /*!
1514  * Returns a string describing \a this mesh. This description includes the mesh name and
1515  * the mesh description string.
1516  *  \return std::string - the mesh information string.
1517  */
1518 std::string MEDFileMesh::simpleRepr() const
1519 {
1520   std::ostringstream oss;
1521   oss << "(*************************************)\n(* GENERAL INFORMATION ON THE MESH : *)\n(*************************************)\n";
1522   oss << "- Name of the mesh : <<" << getName() << ">>\n";
1523   oss << "- Description associated to the mesh : " << getDescription() << std::endl;
1524   return oss.str();
1525 }
1526
1527 /*!
1528  * Returns ids of mesh entities contained in a given group of a given dimension.
1529  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1530  *          are required.
1531  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1532  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1533  *          returned instead of ids. 
1534  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1535  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the group. The caller
1536  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1537  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1538  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1539  */
1540 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const char *grp, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1541 {
1542   std::vector<std::string> tmp(1);
1543   tmp[0]=grp;
1544   DataArrayInt *ret=getGroupsArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1545   ret->setName(grp);
1546   return ret;
1547 }
1548
1549 /*!
1550  * Returns ids of mesh entities contained in given groups of a given dimension.
1551  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1552  *          are required.
1553  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1554  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1555  *          returned instead of ids.
1556  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1557  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the groups. The caller
1558  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1559  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1560  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1561  */
1562 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1563 {
1564   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
1565   return getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
1566 }
1567
1568 /*!
1569  * Returns ids of mesh entities contained in a given family of a given dimension.
1570  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1571  *          are required.
1572  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
1573  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1574  *          returned instead of ids. 
1575  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1576  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the family. The caller
1577  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1578  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1579  */
1580 DataArrayInt *MEDFileMesh::getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const char *fam, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1581 {
1582   std::vector<std::string> tmp(1);
1583   tmp[0]=fam;
1584   DataArrayInt *ret=getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1585   ret->setName(fam);
1586   return ret;
1587 }
1588
1589 /*!
1590  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1591  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1592  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1593  *          returned instead of ids. 
1594  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1595  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1596  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1597  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1598  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1599  */
1600 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupArr(const char *grp, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1601 {
1602   std::vector<std::string> tmp(1);
1603   tmp[0]=grp;
1604   DataArrayInt *ret=getNodeGroupsArr(tmp,renum);
1605   ret->setName(grp);
1606   return ret;
1607 }
1608
1609 /*!
1610  * Returns ids of nodes contained in given groups.
1611  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1612  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1613  *          returned instead of ids. 
1614  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1615  *          numbers, if available and required, of nodes of the groups. The caller
1616  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1617  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1618  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1619  */
1620 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1621 {
1622   return getGroupsArr(1,grps,renum);
1623 }
1624
1625 /*!
1626  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1627  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1628  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1629  *          returned instead of ids. 
1630  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1631  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1632  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1633  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1634  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1635  */
1636 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamilyArr(const char *fam, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1637 {
1638   std::vector<std::string> tmp(1);
1639   tmp[0]=fam;
1640   DataArrayInt *ret=getNodeFamiliesArr(tmp,renum);
1641   ret->setName(fam);
1642   return ret;
1643 }
1644
1645 /*!
1646  * Returns ids of nodes contained in given families.
1647  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
1648  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1649  *          returned instead of ids. 
1650  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1651  *          numbers, if available and required, of nodes of the families. The caller
1652  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1653  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1654  */
1655 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1656 {
1657   return getFamiliesArr(1,fams,renum);
1658 }
1659
1660 /*!
1661  * Adds groups of given dimension and creates corresponding families and family fields
1662  * given ids of mesh entities of each group.
1663  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative mesh dimension of given mesh entities.
1664  *  \param [in] grps - a sequence of arrays of ids each describing a group.
1665  *  \param [in] renum - \c true means that \a grps contains not ids but optional numbers
1666  *          of mesh entities.
1667  *  \throw If names of some groups in \a grps are equal.
1668  *  \throw If \a grps includes a group with an empty name.
1669  *  \throw If \a grps includes invalid ids (or numbers if \a renum == \c true ).
1670  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
1671  */
1672 void MEDFileMesh::setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1673 {
1674   if(grps.empty())
1675     return ;
1676   std::set<std::string> grpsName;
1677   std::vector<std::string> grpsName2(grps.size());
1678   int i=0;
1679
1680   for(std::vector<const DataArrayInt *>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++,i++)
1681     {
1682       grpsName.insert((*it)->getName());
1683       grpsName2[i]=(*it)->getName();
1684     }
1685   if(grpsName.size()!=grps.size())
1686     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different each other !");
1687   if(grpsName.find(std::string(""))!=grpsName.end())
1688     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different empty string !");
1689   int sz=getSizeAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
1690   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam;
1691   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
1692   if(!renum)
1693     {
1694       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps,sz,fidsOfGroups);
1695     }
1696   else
1697     {
1698       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grps2(grps.size());
1699       for(unsigned int ii=0;ii<grps.size();ii++)
1700         {
1701           grps2[ii]=MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(getRevNumberFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt),grps[ii]);
1702           grps2[ii]->setName(grps[ii]->getName().c_str());
1703         }
1704       std::vector<const DataArrayInt *> grps3(grps2.begin(),grps2.end());
1705       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps3,sz,fidsOfGroups);
1706     }
1707   int offset=1;
1708   if(!_families.empty())
1709     offset=getMaxAbsFamilyId()+1;
1710   TranslateFamilyIds(meshDimRelToMaxExt==1?offset:-offset,fam,fidsOfGroups);
1711   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getDifferentValues();
1712   appendFamilyEntries(ids,fidsOfGroups,grpsName2);
1713   setFamilyFieldArr(meshDimRelToMaxExt,fam);
1714 }
1715
1716 /*!
1717  * This method append into '_families' attribute the families whose ids are in 'famIds'. Warning 'famIds' are expected to be ids
1718  * not in '_families'. Groups information are given in parameters in order to give to families representative names.
1719  * For the moment, the two last input parameters are not taken into account.
1720  */
1721 void MEDFileMesh::appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames)
1722 {
1723   std::map<int,std::string> famInv;
1724   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
1725     {
1726       std::ostringstream oss;
1727       oss << "Family_" << (*it);
1728       _families[oss.str()]=(*it);
1729       famInv[*it]=oss.str();
1730     }
1731   int i=0;
1732   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=fidsOfGrps.begin();it1!=fidsOfGrps.end();it1++,i++)
1733     {
1734       for(std::vector<int>::const_iterator it2=(*it1).begin();it2!=(*it1).end();it2++)
1735         {
1736           _groups[grpNames[i]].push_back(famInv[*it2]);
1737         }
1738     }
1739 }
1740
1741 void MEDFileMesh::TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp)
1742 {
1743   famArr->applyLin(offset>0?1:-1,offset,0);
1744   for(std::vector< std::vector<int> >::iterator it1=famIdsPerGrp.begin();it1!=famIdsPerGrp.end();it1++)
1745     {
1746       if(offset<0)
1747         std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::negate<int>());
1748       std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),offset));
1749     }
1750 }
1751
1752 /*!
1753  * Warning no check is done on 'nameTry' in parameter. It should be non empty.
1754  * This method returns a name close to 'nameTry' so that it is not already into 'namesToAvoid'.
1755  * If this method fails to find such a name it will throw an exception.
1756  */
1757 std::string MEDFileMesh::CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1758 {
1759   //attempt #0
1760   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),nameTry)==namesToAvoid.end())
1761     return nameTry;
1762   //attempt #1
1763   std::size_t len=nameTry.length();
1764   for(std::size_t ii=1;ii<len;ii++)
1765     {
1766       std::string tmp=nameTry.substr(ii,len-ii);
1767       if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp)==namesToAvoid.end())
1768         return tmp;
1769     }
1770   //attempt #2
1771   if(len>=1)
1772     {
1773       for(std::size_t i=1;i<30;i++)
1774         {
1775           std::string tmp1(nameTry.at(0),i);
1776           tmp1+=nameTry;
1777           if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp1)==namesToAvoid.end())
1778             return tmp1;
1779         }
1780     }
1781   //attempt #3
1782   std::string tmp2;
1783   for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=namesToAvoid.begin();it2!=namesToAvoid.end();it2++)
1784     tmp2+=(*it2);
1785   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp2)==namesToAvoid.end())
1786     return tmp2;
1787   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::CreateNameNotIn : impossible to find a not already used name !");
1788 }
1789
1790 int MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1791 {
1792   std::size_t nbOfChunks=code.size()/3;
1793   if(code.size()%3!=0)
1794     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset : code has invalid size : should be of size 3*x !");
1795   int ret=strt;
1796   for(std::size_t i=0;i<nbOfChunks;i++)
1797     {
1798       code[3*i+2]=ret;
1799       ret+=code[3*i+1];
1800     }
1801   return ret;
1802 }
1803
1804 /*!
1805  * This method should be called by any set* method of subclasses to deal automatically with _name attribute.
1806  * If _name attribute is empty the name of 'm' if taken as _name attribute.
1807  * If _name is not empty and that 'm' has the same name nothing is done.
1808  * If _name is not emplt and that 'm' has \b NOT the same name an exception is thrown.
1809  */
1810 void MEDFileMesh::dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1811 {
1812   if(!m)
1813     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : input mesh in NULL !");
1814   if(_name.empty())
1815     _name=m->getName();
1816   else
1817     {
1818       std::string name(m->getName());
1819       if(!name.empty())
1820         {
1821           if(_name!=name)
1822             {
1823               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : name of current MEDfile mesh is '" << _name << "' whereas name of input mesh is : '";
1824               oss << name << "' ! Names must match !";
1825               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1826             }
1827         }
1828     }
1829   if(_desc_name.empty())
1830     _desc_name=m->getDescription();
1831   else
1832     {
1833       std::string name(m->getDescription());
1834       if(!name.empty())
1835         {
1836           if(_desc_name!=name)
1837             {
1838               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : description of current MEDfile mesh is '" << _desc_name << "' whereas name of input mesh is : '";
1839               oss << name << "' ! Names must match !";
1840               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1841             }
1842         }
1843     }
1844 }
1845
1846 void MEDFileMesh::getFamilyRepr(std::ostream& oss) const
1847 {
1848   oss << "(**************************)\n(* FAMILIES OF THE MESH : *)\n(**************************)\n";
1849   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1850     {
1851       oss << "- Family with name \"" << (*it).first << "\" with number " << (*it).second << std::endl;
1852       oss << "  - Groups lying on this family : ";
1853       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first.c_str());
1854       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1855       oss << std::endl << std::endl;
1856     }
1857 }
1858
1859 /*!
1860  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1861  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
1862  * iteration.
1863  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1864  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
1865  *  \param [in] dt - the number of a time step.
1866  *  \param [in] it - the number of an iteration.
1867  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1868  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1869  *  \throw If the file is not readable.
1870  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
1871  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1872  */
1873 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1874 {
1875   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1876   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
1877   return new MEDFileUMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
1878 }
1879
1880 /*!
1881  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1882  * file. The first mesh in the file is loaded.
1883  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1884  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1885  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1886  *  \throw If the file is not readable.
1887  *  \throw If there is no meshes in the file.
1888  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1889  */
1890 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1891 {
1892   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
1893   if(ms.empty())
1894     {
1895       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
1896       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1897     }
1898   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1899   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
1900   int dt,it;
1901   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
1902   std::string dummy2;
1903   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
1904   return new MEDFileUMesh(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
1905 }
1906
1907 /*!
1908  * Returns an empty instance of MEDFileUMesh.
1909  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1910  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1911  */
1912 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New()
1913 {
1914   return new MEDFileUMesh;
1915 }
1916
1917 std::size_t MEDFileUMesh::getHeapMemorySize() const
1918 {
1919   std::size_t ret=MEDFileMesh::getHeapMemorySize();
1920   if((const DataArrayDouble*)_coords)
1921     ret+=_coords->getHeapMemorySize();
1922   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
1923     ret+=_fam_coords->getHeapMemorySize();
1924   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
1925     ret+=_num_coords->getHeapMemorySize();
1926   if((const DataArrayInt *)_rev_num_coords)
1927     ret+=_rev_num_coords->getHeapMemorySize();
1928   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
1929     ret+=_name_coords->getHeapMemorySize();
1930   ret+=_ms.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>));
1931   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
1932     if((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it)
1933       ret+=(*it)->getHeapMemorySize();
1934   return ret;
1935 }
1936
1937 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::shallowCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1938 {
1939   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
1940   return ret.retn();
1941 }
1942
1943 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::createNewEmpty() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1944 {
1945   return new MEDFileUMesh;
1946 }
1947
1948 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1949 {
1950   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
1951   if((const DataArrayDouble*)_coords)
1952     ret->_coords=_coords->deepCpy();
1953   if((const DataArrayInt*)_fam_coords)
1954     ret->_fam_coords=_fam_coords->deepCpy();
1955   if((const DataArrayInt*)_num_coords)
1956     ret->_num_coords=_num_coords->deepCpy();
1957   if((const DataArrayInt*)_rev_num_coords)
1958     ret->_rev_num_coords=_rev_num_coords->deepCpy();
1959   if((const DataArrayAsciiChar*)_name_coords)
1960     ret->_name_coords=_name_coords->deepCpy();
1961   std::size_t i=0;
1962   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
1963     {
1964       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
1965         ret->_ms[i]=(*it)->deepCpy();
1966     }
1967   return ret.retn();
1968 }
1969
1970 /*!
1971  * Checks if \a this and another mesh are equal.
1972  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
1973  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
1974  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
1975  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
1976  */
1977 bool MEDFileUMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
1978 {
1979   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
1980     return false;
1981   const MEDFileUMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(other);
1982   if(!otherC)
1983     {
1984       what="Mesh types differ ! This is unstructured and other is NOT !";
1985       return false;
1986     }
1987   clearNonDiscrAttributes();
1988   otherC->clearNonDiscrAttributes();
1989   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
1990   const DataArrayDouble *coo2=otherC->_coords;
1991   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
1992     {
1993       what="Mismatch of coordinates ! One is defined and not other !";
1994       return false;
1995     }
1996   if(coo1)
1997     {
1998       bool ret=coo1->isEqual(*coo2,eps);
1999       if(!ret)
2000         {
2001           what="Coords differ !";
2002           return false;
2003         }
2004     }
2005   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2006   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_coords;
2007   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
2008     {
2009       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
2010       return false;
2011     }
2012   if(famc1)
2013     {
2014       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
2015       if(!ret)
2016         {
2017           what="Families arr on node differ !";
2018           return false;
2019         }
2020     }
2021   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2022   const DataArrayInt *numc2=otherC->_num_coords;
2023   if((numc1==0 && numc2!=0) || (numc1!=0 && numc2==0))
2024     {
2025       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
2026       return false;
2027     }
2028   if(numc1)
2029     {
2030       bool ret=numc1->isEqual(*numc2);
2031       if(!ret)
2032         {
2033           what="Numbering arr on node differ !";
2034           return false;
2035         }
2036     }
2037   const DataArrayAsciiChar *namec1=_name_coords;
2038   const DataArrayAsciiChar *namec2=otherC->_name_coords;
2039   if((namec1==0 && namec2!=0) || (namec1!=0 && namec2==0))
2040     {
2041       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
2042       return false;
2043     }
2044   if(namec1)
2045     {
2046       bool ret=namec1->isEqual(*namec2);
2047       if(!ret)
2048         {
2049           what="Names arr on node differ !";
2050           return false;
2051         }
2052     }
2053   if(_ms.size()!=otherC->_ms.size())
2054     {
2055       what="Number of levels differs !";
2056       return false;
2057     }
2058   std::size_t sz=_ms.size();
2059   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2060     {
2061       const MEDFileUMeshSplitL1 *s1=_ms[i];
2062       const MEDFileUMeshSplitL1 *s2=otherC->_ms[i];
2063       if((s1==0 && s2!=0) || (s1!=0 && s2==0))
2064         {
2065           what="Mismatch of presence of sub levels !";
2066           return false;
2067         }
2068       if(s1)
2069         {
2070           bool ret=s1->isEqual(s2,eps,what);
2071           if(!ret)
2072             return false;
2073         }
2074     }
2075   return true;
2076 }
2077
2078 /*!
2079  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
2080  */
2081 void MEDFileUMesh::clearNonDiscrAttributes() const
2082 {
2083   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
2084   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2085   if(coo1)
2086     (const_cast<DataArrayDouble *>(coo1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2087   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2088   if(famc1)
2089     (const_cast<DataArrayInt *>(famc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2090   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2091   if(numc1)
2092     (const_cast<DataArrayInt *>(numc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2093   const DataArrayAsciiChar *namc1=_name_coords;
2094   if(namc1)
2095     (const_cast<DataArrayAsciiChar *>(namc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2096   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2097     {
2098       const MEDFileUMeshSplitL1 *tmp=(*it);
2099       if(tmp)
2100         tmp->clearNonDiscrAttributes();
2101     }
2102 }
2103
2104 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh()
2105 {
2106 }
2107
2108 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2109 try
2110   {
2111     loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
2112   }
2113 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2114   {
2115     throw e;
2116   }
2117
2118 void MEDFileUMesh::loadUMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2119 {
2120   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2121   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2122   int dummy0,dummy1;
2123   std::string dummy2;
2124   int mid=MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
2125   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2126     {
2127       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2128       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2129     }
2130   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it,mrs);
2131   int lev=loaderl2.getNumberOfLevels();
2132   _ms.resize(lev);
2133   for(int i=0;i<lev;i++)
2134     {
2135       if(!loaderl2.emptyLev(i))
2136         _ms[i]=new MEDFileUMeshSplitL1(loaderl2,mName,i);
2137       else
2138         _ms[i]=0;
2139     }
2140   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
2141   //
2142   setName(loaderl2.getName());
2143   setDescription(loaderl2.getDescription());
2144   setUnivName(loaderl2.getUnivName());
2145   setIteration(loaderl2.getIteration());
2146   setOrder(loaderl2.getOrder());
2147   setTimeValue(loaderl2.getTime());
2148   setTimeUnit(loaderl2.getTimeUnit());
2149   _coords=loaderl2.getCoords();
2150   if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
2151     _fam_coords=loaderl2.getCoordsFamily();
2152   if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
2153     _num_coords=loaderl2.getCoordsNum();
2154   if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
2155     _name_coords=loaderl2.getCoordsName();
2156   computeRevNum();
2157 }
2158
2159 MEDFileUMesh::~MEDFileUMesh()
2160 {
2161 }
2162
2163 void MEDFileUMesh::writeLL(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2164 {
2165   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2166   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
2167   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
2168   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
2169   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
2170   int spaceDim=coo?coo->getNumberOfComponents():0;
2171   int mdim=getMeshDimension();
2172   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2173   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2174   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
2175     {
2176       std::string info=coo->getInfoOnComponent(i);
2177       std::string c,u;
2178       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
2179       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2180       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2181     }
2182   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,mdim,MED_UNSTRUCTURED_MESH,desc,"",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
2183   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
2184   MEDFileUMeshL2::WriteCoords(fid,maa,_iteration,_order,_time,_coords,_fam_coords,_num_coords,_name_coords);
2185   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2186     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2187       (*it)->write(fid,maa,mdim);
2188   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa,_families,_groups,_too_long_str);
2189 }
2190
2191 /*!
2192  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
2193  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2194  */
2195 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevels() const
2196 {
2197   std::vector<int> ret;
2198   int lev=0;
2199   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2200     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2201       if(!(*it)->empty())
2202         ret.push_back(lev);
2203   return ret;
2204 }
2205
2206 /*!
2207  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
2208  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2209  */
2210 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
2211 {
2212   std::vector<int> ret0=getNonEmptyLevels();
2213   if((const DataArrayDouble *) _coords)
2214     {
2215       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2216       ret[0]=1;
2217       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2218       return ret;
2219     }
2220   return ret0;
2221 }
2222
2223 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
2224 {
2225   std::vector<int> ret;
2226   const DataArrayInt *famCoo(_fam_coords);
2227   if(famCoo)
2228     ret.push_back(1);
2229   int lev=0;
2230   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2231     {
2232       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2233       if(cur)
2234         if(cur->getFamilyField())
2235           ret.push_back(lev);
2236     }
2237   return ret;
2238 }
2239
2240 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
2241 {
2242   std::vector<int> ret;
2243   const DataArrayInt *numCoo(_num_coords);
2244   if(numCoo)
2245     ret.push_back(1);
2246   int lev=0;
2247   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2248     {
2249       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2250       if(cur)
2251         if(cur->getNumberField())
2252           ret.push_back(lev);
2253     }
2254   return ret;
2255 }
2256
2257 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
2258 {
2259   std::vector<int> ret;
2260   const DataArrayAsciiChar *nameCoo(_name_coords);
2261   if(nameCoo)
2262     ret.push_back(1);
2263   int lev=0;
2264   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2265     {
2266       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2267       if(cur)
2268         if(cur->getNameField())
2269           ret.push_back(lev);
2270     }
2271   return ret;
2272 }
2273
2274 /*!
2275  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given group is defined.
2276  * To include nodes, call getGrpNonEmptyLevelsExt() method.
2277  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2278  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2279  */
2280 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevels(const char *grp) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2281 {
2282   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2283   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2284 }
2285
2286 /*!
2287  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given group is defined.
2288  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2289  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2290  */
2291 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevelsExt(const char *grp) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2292 {
2293   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2294   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2295 }
2296
2297 /*!
2298  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given family is defined.
2299  * To include nodes, call getFamNonEmptyLevelsExt() method.
2300  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2301  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2302  */
2303 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevels(const char *fam) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2304 {
2305   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2306   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2307 }
2308
2309 /*!
2310  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given family is defined.
2311  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2312  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2313  */
2314 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevelsExt(const char *fam) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2315 {
2316   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2317   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2318 }
2319
2320 /*!
2321  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given groups are defined.
2322  * To include nodes, call getGrpsNonEmptyLevelsExt() method.
2323  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2324  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2325  */
2326 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2327 {
2328   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2329   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2330 }
2331
2332 /*!
2333  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given groups are defined.
2334  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2335  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2336  */
2337 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2338 {
2339   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2340   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2341 }
2342
2343 /*!
2344  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given families are defined.
2345  * To include nodes, call getFamsNonEmptyLevelsExt() method.
2346  *  \param [in] fams - the name of the family of interest.
2347  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2348  */
2349 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2350 {
2351   std::vector<int> ret;
2352   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
2353   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2354   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
2355     if(_ms[-(*it)]->presenceOfOneFams(famIds))
2356       ret.push_back(*it);
2357   return ret;
2358 }
2359
2360 /*!
2361  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given families are defined.
2362  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2363  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2364  */
2365 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2366 {
2367   std::vector<int> ret0=getFamsNonEmptyLevels(fams);
2368   const DataArrayInt *famCoords=_fam_coords;
2369   if(!famCoords)
2370     return ret0;
2371   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2372   if(famCoords->presenceOfValue(famIds))
2373     {
2374       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2375       ret[0]=1;
2376       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2377       return ret;
2378     }
2379   else
2380     return ret0;
2381 }
2382
2383 /*!
2384  * Returns names of groups that partly or fully appear on the level \a meshDimRelToMaxExt.
2385  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of interest.
2386  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names at \a meshDimRelToMaxExt
2387  *          level. 
2388  */
2389 std::vector<std::string> MEDFileUMesh::getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2390 {
2391   std::vector<std::string> ret;
2392   std::vector<std::string> allGrps=getGroupsNames();
2393   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=allGrps.begin();it!=allGrps.end();it++)
2394     {
2395       std::vector<int> levs=getGrpNonEmptyLevelsExt((*it).c_str());
2396       if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)!=levs.end())
2397         ret.push_back(*it);
2398     }
2399   return ret;
2400 }
2401
2402 int MEDFileUMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2403 {
2404   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2405   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2406     {
2407       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2408       ret=std::max(ret,std::abs(val));
2409     }
2410   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2411     {
2412       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2413         {
2414           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2415           if(da)
2416             {
2417               int val=da->getMaxValue(tmp);
2418               ret=std::max(ret,std::abs(val));
2419             }
2420         }
2421     }
2422   return ret;
2423 }
2424
2425 int MEDFileUMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2426 {
2427   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2428   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2429     {
2430       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2431       ret=std::max(ret,val);
2432     }
2433   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2434     {
2435       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2436         {
2437           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2438           if(da)
2439             {
2440               int val=da->getMaxValue(tmp);
2441               ret=std::max(ret,val);
2442             }
2443         }
2444     }
2445   return ret;
2446 }
2447
2448 int MEDFileUMesh::getMinFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2449 {
2450   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2451   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2452     {
2453       int val=_fam_coords->getMinValue(tmp);
2454       ret=std::min(ret,val);
2455     }
2456   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2457     {
2458       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2459         {
2460           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2461           if(da)
2462             {
2463               int val=da->getMinValue(tmp);
2464               ret=std::min(ret,val);
2465             }
2466         }
2467     }
2468   return ret;
2469 }
2470
2471 /*!
2472  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
2473  *  \return int - the mesh dimension.
2474  *  \throw If there are no cells in this mesh.
2475  */
2476 int MEDFileUMesh::getMeshDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2477 {
2478   int lev=0;
2479   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev++)
2480     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2481       return (*it)->getMeshDimension()+lev;
2482   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getMeshDimension : impossible to find a mesh dimension !");
2483 }
2484
2485 /*!
2486  * Returns the space dimension of \a this mesh that is equal to number of components in
2487  * the node coordinates array.
2488  *  \return int - the space dimension of \a this mesh.
2489  *  \throw If the node coordinates array is not available.
2490  */
2491 int MEDFileUMesh::getSpaceDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2492 {
2493   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2494   if(!coo)
2495     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getSpaceDimension : no coords set !");
2496   return coo->getNumberOfComponents();
2497 }
2498
2499 /*!
2500  * Returns a string describing \a this mesh.
2501  *  \return std::string - the mesh information string.
2502  */
2503 std::string MEDFileUMesh::simpleRepr() const
2504 {
2505   std::ostringstream oss;
2506   oss << MEDFileMesh::simpleRepr();
2507   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2508   oss << "- The dimension of the space is ";
2509   static const char MSG1[]= "*** NO COORDS SET ***";
2510   static const char MSG2[]= "*** NO CONNECTIVITY SET FOR THIS LEVEL***";
2511   if(coo)
2512     oss << _coords->getNumberOfComponents() << std::endl;
2513   else
2514     oss << MSG1 << std::endl;
2515   oss << "- Type of the mesh : UNSTRUCTURED\n";
2516   oss << "- Number of nodes : ";
2517   if(coo)
2518     oss << _coords->getNumberOfTuples() << std::endl;
2519   else
2520     oss << MSG1 << std::endl;
2521   std::size_t nbOfLev=_ms.size();
2522   oss << "- Number of levels allocated : " << nbOfLev << std::endl;
2523   for(std::size_t i=0;i<nbOfLev;i++)
2524     {
2525       const MEDFileUMeshSplitL1 *lev=_ms[i];
2526       oss << "  - Level #" << -((int) i) << " has dimension : ";
2527       if(lev)
2528         {
2529           oss << lev->getMeshDimension() << std::endl;
2530           lev->simpleRepr(oss);
2531         }
2532       else
2533         oss << MSG2 << std::endl;
2534     }
2535   oss << "- Number of families : " << _families.size() << std::endl << std::endl;
2536   if(coo)
2537     {
2538       oss << "(***********************)\n(* NODES OF THE MESH : *)\n(***********************)\n";
2539       oss << "- Names of coordinates :" << std::endl;
2540       std::vector<std::string> vars=coo->getVarsOnComponent();
2541       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2542       oss << std::endl << "- Units of coordinates : " << std::endl;
2543       std::vector<std::string> units=coo->getUnitsOnComponent();
2544       std::copy(units.begin(),units.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2545     }
2546   oss << std::endl << std::endl;
2547   getFamilyRepr(oss);
2548   return oss.str();
2549 }
2550
2551 /*!
2552  * Returns a full textual description of \a this mesh.
2553  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
2554  */
2555 std::string MEDFileUMesh::advancedRepr() const
2556 {
2557   return simpleRepr();
2558 }
2559
2560 /*!
2561  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
2562  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2563  *  \return int - the number of entities.
2564  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
2565  */
2566 int MEDFileUMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2567 {
2568   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2569     {
2570       if(!((const DataArrayDouble *)_coords))
2571         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getSizeAtLevel : no coordinates specified !");
2572       return _coords->getNumberOfTuples();
2573     }
2574   return getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt)->getSize();
2575 }
2576
2577 /*!
2578  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
2579  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2580  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
2581  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
2582  */
2583 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2584 {
2585   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2586     return _fam_coords;
2587   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2588   return l1->getFamilyField();
2589 }
2590
2591 /*!
2592  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
2593  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2594  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
2595  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2596  */
2597 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2598 {
2599   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2600     return _num_coords;
2601   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2602   return l1->getNumberField();
2603 }
2604
2605 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2606 {
2607   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2608     return _name_coords;
2609   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2610   return l1->getNameField();
2611 }
2612
2613 int MEDFileUMesh::getNumberOfNodes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2614 {
2615   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2616   if(!coo)
2617     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getNumberOfNodes : no coords set !");
2618   return coo->getNumberOfTuples();
2619 }
2620
2621 void MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobs *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2622 {
2623   /*if(st.getNumberOfItems()!=1)
2624     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
2625   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
2626     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
2627   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
2628     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
2629   if(st.getPflName().empty())
2630     {
2631       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
2632       return ;
2633     }
2634   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st.getPflName().c_str()));
2635   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
2636   int sz(nodesFetched.size());
2637   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
2638     {
2639       std::vector<int> conn;
2640       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
2641       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
2642         if(*it>=0 && *it<sz)
2643           nodesFetched[*it]=true;
2644         else
2645           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
2646           }*/
2647 }
2648
2649 /*!
2650  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
2651  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2652  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2653  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
2654  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2655  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2656  */
2657 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2658 {
2659   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2660     {
2661       if(!((const DataArrayInt *)_num_coords))
2662         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no coordinates renum specified !");
2663       return _rev_num_coords;
2664     }
2665   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2666   return l1->getRevNumberField();
2667 }
2668
2669 /*!
2670  * Returns a pointer to the node coordinates array of \a this mesh \b without
2671  * incrementing its reference counter, thus there is no need to decrRef() it by the caller.
2672  */
2673 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::getCoords() const
2674 {
2675   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp(_coords);
2676   if((DataArrayDouble *)tmp)
2677     {
2678       return tmp;
2679     }
2680   return 0;
2681 }
2682
2683 /*!
2684  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2685  * group of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2686  * new mesh.
2687  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2688  *  \param [in] grp - the name of the group whose mesh entities are included in the
2689  *          new mesh.
2690  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2691  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2692  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2693  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2694  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
2695  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2696  */
2697 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const char *grp, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2698 {
2699   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2700   std::vector<std::string> tmp(1);
2701   tmp[0]=grp;
2702   return getGroups(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2703 }
2704
2705 /*!
2706  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2707  * groups of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2708  * new mesh.
2709  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2710  *  \param [in] grps - a sequence of group names whose mesh entities are included in the
2711  *          new mesh.
2712  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2713  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2714  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2715  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2716  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
2717  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2718  */
2719 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2720 {
2721   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2722   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
2723   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet=getFamilies(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
2724   if(grps.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2725     zeRet->setName(grps[0].c_str());
2726   return zeRet.retn();
2727 }
2728
2729 /*!
2730  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2731  * family of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2732  * new mesh.
2733  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2734  *  \param [in] fam - the name of the family whose mesh entities are included in the
2735  *          new mesh.
2736  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2737  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2738  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2739  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2740  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a grps.
2741  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2742  */
2743 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const char *fam, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2744 {
2745   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2746   std::vector<std::string> tmp(1);
2747   tmp[0]=fam;
2748   return getFamilies(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2749 }
2750
2751 /*!
2752  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2753  * families of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2754  * new mesh.
2755  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2756  *  \param [in] fams - a sequence of family names whose mesh entities are included in the
2757  *          new mesh.
2758  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2759  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2760  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2761  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2762  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a fams.
2763  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2764  */
2765 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2766 {
2767   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2768   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2769     {
2770       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr=getFamiliesArr(1,fams,renum);
2771       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New();
2772       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> c=_coords->selectByTupleId(arr->getConstPointer(),arr->getConstPointer()+arr->getNbOfElems());
2773       ret->setCoords(c);
2774       return ret.retn();
2775     }
2776   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2777   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2778   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet;
2779   if(!famIds.empty())
2780     zeRet=l1->getFamilyPart(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2781   else
2782     zeRet=l1->getFamilyPart(0,0,renum);
2783   if(fams.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2784     zeRet->setName(fams[0].c_str());
2785   return zeRet.retn();
2786 }
2787
2788 /*!
2789  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
2790  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
2791  *          are required.
2792  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2793  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
2794  *          returned instead of ids.
2795  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
2796  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
2797  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
2798  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
2799  */
2800 DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2801 {
2802   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2803   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2804     {
2805       if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2806         {
2807           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
2808           if(!famIds.empty())
2809             da=_fam_coords->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
2810           else
2811             da=_fam_coords->getIdsEqualList(0,0);
2812           if(renum)
2813             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_coords,da);
2814           else
2815             return da.retn();
2816         }
2817       else
2818         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
2819     }
2820   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2821   if(!famIds.empty())
2822     return l1->getFamilyPartArr(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2823   else
2824     return l1->getFamilyPartArr(0,0,renum);
2825 }
2826
2827 /*!
2828  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2829  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2830  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2831  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
2832  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
2833  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
2834  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2835  *          optional numbers of mesh entities.
2836  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2837  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2838  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2839  * \sa getGenMeshAtLevel()
2840  */
2841 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2842 {
2843   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2844   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2845     {
2846       if(!renum)
2847         {
2848           MEDCouplingUMesh *umesh=MEDCouplingUMesh::New();
2849           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> cc=_coords->deepCpy();
2850           umesh->setCoords(cc);
2851           MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(umesh);
2852           umesh->setName(getName());
2853           return umesh;
2854         }
2855     }
2856   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2857   return l1->getWholeMesh(renum);
2858 }
2859
2860 /*!
2861  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2862  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2863  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2864  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
2865  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
2866  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
2867  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2868  *          optional numbers of mesh entities.
2869  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2870  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2871  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMax dimension in \a this mesh.
2872  * \sa getMeshAtLevel()
2873  */
2874 MEDCouplingMesh *MEDFileUMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2875 {
2876   return getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
2877 }
2878
2879 /*!
2880  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == 0.
2881  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2882  *          optional numbers of mesh entities.
2883  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2884  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2885  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == 0 in \a this mesh.
2886  */
2887 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevel0Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2888 {
2889   return getMeshAtLevel(0,renum);
2890 }
2891
2892 /*!
2893  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -1.
2894  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2895  *          optional numbers of mesh entities.
2896  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2897  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2898  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -1 in \a this mesh.
2899  */
2900 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM1Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2901 {
2902   return getMeshAtLevel(-1,renum);
2903 }
2904
2905 /*!
2906  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -2.
2907  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2908  *          optional numbers of mesh entities.
2909  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2910  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2911  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -2 in \a this mesh.
2912  */
2913 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM2Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2914 {
2915   return getMeshAtLevel(-2,renum);
2916 }
2917
2918 /*!
2919  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -3.
2920  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2921  *          optional numbers of mesh entities.
2922  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2923  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2924  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -3 in \a this mesh.
2925  */
2926 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM3Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2927 {
2928   return getMeshAtLevel(-3,renum);
2929 }
2930
2931 const MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2932 {
2933   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2934     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
2935   if(meshDimRelToMaxExt>1)
2936     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
2937   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
2938   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
2939     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
2940   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
2941     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
2942   return _ms[tracucedRk];
2943 }
2944
2945 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2946 {
2947    if(meshDimRelToMaxExt==1)
2948     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
2949   if(meshDimRelToMaxExt>1)
2950     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
2951   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
2952   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
2953     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
2954   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
2955     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
2956   return _ms[tracucedRk];
2957 }
2958
2959 void MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2960 {
2961   if(-meshDimRelToMax>=(int)_ms.size())
2962     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : The meshdim of mesh is not managed by 'this' !");
2963   int i=0;
2964   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
2965     {
2966       if(((const MEDFileUMeshSplitL1*) (*it))!=0)
2967         {
2968           int ref=(*it)->getMeshDimension();
2969           if(ref+i!=meshDim-meshDimRelToMax)
2970             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : no coherency between levels !");
2971         }
2972     }
2973 }
2974
2975 /*!
2976  * Sets the node coordinates array of \a this mesh.
2977  *  \param [in] coords - the new node coordinates array.
2978  *  \throw If \a coords == \c NULL.
2979  */
2980
2981 void MEDFileUMesh::setCoords(DataArrayDouble *coords) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2982 {
2983   if(!coords)
2984     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setCoords : null pointer in input !");
2985   coords->checkAllocated();
2986   int nbOfTuples=coords->getNumberOfTuples();
2987   _coords=coords;
2988   coords->incrRef();
2989   _fam_coords=DataArrayInt::New();
2990   _fam_coords->alloc(nbOfTuples,1);
2991   _fam_coords->fillWithZero();
2992 }
2993
2994 /*!
2995  * Removes all groups of a given dimension in \a this mesh.
2996  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2997  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2998  */
2999 void MEDFileUMesh::eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3000 {
3001   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3002     {
3003       if((DataArrayInt *)_fam_coords)
3004         _fam_coords->fillWithZero();
3005       return ;
3006     }
3007   MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3008   l1->eraseFamilyField();
3009   optimizeFamilies();
3010 }
3011
3012 /*!
3013  * Removes all families with ids not present in the family fields of \a this mesh.
3014  */
3015 void MEDFileUMesh::optimizeFamilies() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3016 {
3017   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3018   std::set<int> allFamsIds;
3019   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
3020     {
3021       const DataArrayInt *ffield=getFamilyFieldAtLevel(*it);
3022       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=ffield->getDifferentValues();
3023       std::set<int> res;
3024       std::set_union(ids->begin(),ids->end(),allFamsIds.begin(),allFamsIds.end(),std::inserter(res,res.begin()));
3025       allFamsIds=res;
3026     }
3027   std::set<std::string> famNamesToKill;
3028   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
3029     {
3030       if(allFamsIds.find((*it).second)!=allFamsIds.end())
3031         famNamesToKill.insert((*it).first);
3032     }
3033   for(std::set<std::string>::const_iterator it=famNamesToKill.begin();it!=famNamesToKill.end();it++)
3034     _families.erase(*it);
3035   std::vector<std::string> grpNamesToKill;
3036   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
3037     {
3038       std::vector<std::string> tmp;
3039       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
3040         {
3041           if(famNamesToKill.find(*it2)==famNamesToKill.end())
3042             tmp.push_back(*it2);
3043         }
3044       if(!tmp.empty())
3045         (*it).second=tmp;
3046       else
3047         tmp.push_back((*it).first);
3048     }
3049   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grpNamesToKill.begin();it!=grpNamesToKill.end();it++)
3050     _groups.erase(*it);
3051 }
3052
3053 void MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group(const char *grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3054 {
3055   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3056   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)==levs.end() || std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)==levs.end())
3057     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : This method works only for mesh definied on level 0 and -1 !");
3058   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m0=getMeshAtLevel(0);
3059   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1=getMeshAtLevel(-1);
3060   int nbNodes=m0->getNumberOfNodes();
3061   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m11=getGroup(-1,grpNameM1);
3062   DataArrayInt *tmp00=0,*tmp11=0,*tmp22=0;
3063   m0->findNodesToDuplicate(*m11,tmp00,tmp11,tmp22);
3064   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nodeIdsToDuplicate(tmp00);
3065   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn0(tmp11);
3066   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn1(tmp22);
3067   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m0->buildPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),true));
3068   // node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group 'grpNameM1' on level -1
3069   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> descTmp0=DataArrayInt::New(),descITmp0=DataArrayInt::New(),revDescTmp0=DataArrayInt::New(),revDescITmp0=DataArrayInt::New();
3070   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0Desc=tmp0->buildDescendingConnectivity(descTmp0,descITmp0,revDescTmp0,revDescITmp0);
3071   descTmp0=0; descITmp0=0; revDescTmp0=0; revDescITmp0=0;
3072   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW2=tmp0Desc->getCellIdsLyingOnNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),false);
3073   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> cellsInM1ToRenumW3=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(tmp0Desc->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenumW2->begin(),cellsInM1ToRenumW2->end(),true));
3074   DataArrayInt *cellsInM1ToRenumW4Tmp=0;
3075   m1->areCellsIncludedIn(cellsInM1ToRenumW3,2,cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3076   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW4(cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3077   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW5=cellsInM1ToRenumW4->getIdsInRange(0,m1->getNumberOfCells());
3078   cellsInM1ToRenumW5->transformWithIndArr(cellsInM1ToRenumW4->begin(),cellsInM1ToRenumW4->end());
3079   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpIds=getGroupArr(-1,grpNameM1);
3080   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenum=cellsInM1ToRenumW5->buildSubstraction(grpIds);
3081   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1Part=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),true));
3082   m1Part->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes);
3083   m1->setPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),*m1Part);
3084   // end of node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group of level -1 'grpNameM1'
3085   tmp0->duplicateNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end());
3086   m0->setCoords(tmp0->getCoords());
3087   m0->setPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),*tmp0);
3088   m1->setCoords(m0->getCoords());
3089   _coords=m0->getCoords(); _coords->incrRef();
3090   // duplication of cells in group 'grpNameM1' on level -1
3091   m11->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes); m11->setCoords(m0->getCoords());
3092   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> v(2); v[0]=m1; v[1]=m11;
3093   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> newm1=MEDCouplingUMesh::AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(v,tmp00,tmp11);
3094   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> szOfCellGrpOfSameType(tmp00);
3095   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idInMsOfCellGrpOfSameType(tmp11);
3096   //
3097   newm1->setName(getName());
3098   const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
3099   if(!fam)
3100     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : internal problem !");
3101   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFam=DataArrayInt::New();
3102   newFam->alloc(newm1->getNumberOfCells(),1);
3103   int idd=getMaxFamilyId()+1;
3104   int globStart=0,start=0,end,globEnd;
3105   int nbOfChunks=szOfCellGrpOfSameType->getNumberOfTuples();
3106   for(int i=0;i<nbOfChunks;i++)
3107     {
3108       globEnd=globStart+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3109       if(idInMsOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0)==0)
3110         {
3111           end=start+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3112           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> part=fam->selectByTupleId2(start,end,1);
3113           newFam->setPartOfValues1(part,globStart,globEnd,1,0,1,1,true);
3114           start=end;
3115         }
3116       else
3117         {
3118           newFam->setPartOfValuesSimple1(idd,globStart,globEnd,1,0,1,1);
3119         }
3120       globStart=globEnd;
3121     }
3122   newm1->setCoords(getCoords());
3123   setMeshAtLevel(-1,newm1);
3124   setFamilyFieldArr(-1,newFam);
3125   std::string grpName2(grpNameM1); grpName2+="_dup";
3126   addFamily(grpName2.c_str(),idd);
3127   addFamilyOnGrp(grpName2.c_str(),grpName2.c_str());
3128   //
3129   fam=_fam_coords;
3130   if(fam)
3131     {
3132       int newNbOfNodes=getCoords()->getNumberOfTuples();
3133       newFam=DataArrayInt::New(); newFam->alloc(newNbOfNodes,1);
3134       newFam->setPartOfValues1(fam,0,nbNodes,1,0,1,1,true);
3135       newFam->setPartOfValuesSimple1(0,nbNodes,newNbOfNodes,1,0,1,1);
3136       _fam_coords=newFam;
3137     }
3138   nodesDuplicated=nodeIdsToDuplicate.retn();
3139   cellsModified=cellsToModifyConn0.retn();
3140   cellsNotModified=cellsToModifyConn1.retn();
3141 }
3142
3143 /*!
3144  * \param [out] oldCode retrieves the distribution of types before the call if true is returned
3145  * \param [out] newCode etrieves the distribution of types after the call if true is returned
3146  * \param [out] o2nRenumCell tells for **all levels** the old 2 new renumbering of cells.
3147  * 
3148  * \return false if no modification has been performed linked to the unpolyzation. Neither cell type, not cell numbers. When false is returned no need of field on cells or on gauss renumbering.
3149  * Inversely, if true is returned, it means that distribution of cell by geometric type has changed and field on cell and field on gauss point must be renumbered.
3150  */
3151 bool MEDFileUMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3152 {
3153   o2nRenumCell=0; oldCode.clear(); newCode.clear();
3154   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3155   bool ret=false;
3156   std::vector< const DataArrayInt* > renumCellsSplited;//same than memorySaverIfThrow
3157   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > memorySaverIfThrow;//same than renumCellsSplited only in case of throw
3158   int start=0;
3159   int end=0;
3160   for(std::vector<int>::reverse_iterator it=levs.rbegin();it!=levs.rend();it++)
3161     {
3162       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*it);
3163       std::vector<int> code1=m->getDistributionOfTypes();
3164       end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code1,start);
3165       oldCode.insert(oldCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3166       bool hasChanged=m->unPolyze();
3167       DataArrayInt *fake=0;
3168       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart=m->getLevArrPerCellTypes(MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER,
3169                                                                                            MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER+MEDCouplingUMesh::N_MEDMEM_ORDER,fake);
3170       fake->decrRef();
3171       renumCellsSplited.push_back(o2nCellsPart); memorySaverIfThrow.push_back(o2nCellsPart);
3172       if(hasChanged)
3173         {
3174           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart2=o2nCellsPart->buildPermArrPerLevel();
3175           m->renumberCells(o2nCellsPart2->getConstPointer(),false);
3176           ret=true;
3177           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famField2,numField2;
3178           const DataArrayInt *famField=getFamilyFieldAtLevel(*it); if(famField) { famField->incrRef(); famField2=const_cast<DataArrayInt *>(famField); }
3179           const DataArrayInt *numField=getNumberFieldAtLevel(*it); if(numField) { numField->incrRef(); numField2=const_cast<DataArrayInt *>(numField); }
3180           setMeshAtLevel(*it,m);
3181           std::vector<int> code2=m->getDistributionOfTypes();
3182           end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code2,start);
3183           newCode.insert(newCode.end(),code2.begin(),code2.end());
3184           //
3185           if(o2nCellsPart2->isIdentity())
3186             continue;
3187           if(famField)
3188             {
3189               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamField=famField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3190               setFamilyFieldArr(*it,newFamField);
3191             }
3192           if(numField)
3193             {
3194               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumField=numField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3195               setRenumFieldArr(*it,newNumField);
3196             }
3197         }
3198       else
3199         {
3200           newCode.insert(newCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3201         }
3202       start=end;
3203     }
3204   if(ret)
3205     {
3206       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> renumCells=DataArrayInt::Aggregate(renumCellsSplited);
3207       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nRenumCellRet=renumCells->buildPermArrPerLevel();
3208       o2nRenumCell=o2nRenumCellRet.retn();
3209     }
3210   return ret;
3211 }
3212
3213 struct MEDLoaderAccVisit1
3214 {
3215   MEDLoaderAccVisit1():_new_nb_of_nodes(0) { }
3216   int operator()(bool val) { return val?_new_nb_of_nodes++:-1; }
3217   int _new_nb_of_nodes;
3218 };
3219
3220 /*!
3221  * Array returned is the correspondance in \b old \b to \b new format. The returned array is newly created and should be dealt by the caller.
3222  * The maximum value stored in returned array is the number of nodes of \a this minus 1 after call of this method.
3223  * The size of returned array is the number of nodes of the old (previous to the call of this method) number of nodes.
3224  * -1 values in returned array means that the corresponding old node is no more used.
3225  *
3226  * \return newly allocated array containing correspondance in \b old \b to \b new format. If all nodes in \a this are fetched \c NULL pointer is returned and nothing
3227  *         is modified in \a this.
3228  * \throw If no coordinates are set in \a this or if there is in any available mesh in \a this a cell having a nodal connectivity containing a node id not in the range of
3229  *  set coordinates.
3230  */
3231 DataArrayInt *MEDFileUMesh::zipCoords() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3232 {
3233   const DataArrayDouble *coo=getCoords();
3234   if(!coo)
3235     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::zipCoords : no coordinates set in this !");
3236   int nbOfNodes=coo->getNumberOfTuples();
3237   std::vector<bool> nodeIdsInUse(nbOfNodes,false);
3238   std::vector<int> neLevs=getNonEmptyLevels();
3239   for(std::vector<int>::const_iterator lev=neLevs.begin();lev!=neLevs.end();lev++)
3240     {
3241       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*lev);
3242       m->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3243     }
3244   int nbrOfNodesInUse=(int)std::count(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),true);
3245   if(nbrOfNodesInUse==nbOfNodes)
3246     return 0;
3247   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New(); ret->alloc(nbOfNodes,1);
3248   std::transform(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),ret->getPointer(),MEDLoaderAccVisit1());
3249   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2=ret->invertArrayO2N2N2OBis(nbrOfNodesInUse);
3250   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> newCoords=coo->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3251   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamCoords;
3252   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> newNameCoords;
3253   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
3254     newFamCoords=_fam_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3255   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumCoords;
3256   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3257     newNumCoords=_num_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3258   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
3259     newNameCoords=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_name_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3260   _coords=newCoords; _fam_coords=newFamCoords; _num_coords=newNumCoords; _name_coords=newNameCoords; _rev_num_coords=0;
3261   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3262     {
3263       if((MEDFileUMeshSplitL1*)*it)
3264         (*it)->renumberNodesInConn(ret->begin());
3265     }
3266   return ret.retn();
3267 }
3268
3269 /*!
3270  * Adds a group of nodes to \a this mesh.
3271  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3272  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3273  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3274  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3275  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3276  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3277  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3278  */
3279 void MEDFileUMesh::addNodeGroup(const DataArrayInt *ids) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3280 {
3281   const DataArrayDouble *coords=_coords;
3282   if(!coords)
3283     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addNodeGroup : no coords set !");
3284   int nbOfNodes=coords->getNumberOfTuples();
3285   if(!((DataArrayInt *)_fam_coords))
3286     { _fam_coords=DataArrayInt::New(); _fam_coords->alloc(nbOfNodes,1); _fam_coords->fillWithZero(); }
3287   //
3288   addGroupUnderground(true,ids,_fam_coords);
3289 }
3290
3291 /*!
3292  * Adds a group of nodes/cells/faces/edges to \a this mesh.
3293  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3294  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3295  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3296  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3297  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3298  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3299  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3300  */
3301 void MEDFileUMesh::addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3302 {
3303   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3304   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
3305     { 
3306       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : level " << meshDimRelToMaxExt << " not available ! Should be in ";
3307       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," ")); oss << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3308     }
3309   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3310     { addNodeGroup(ids); return ; }
3311   MEDFileUMeshSplitL1 *lev=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3312   DataArrayInt *fam=lev->getOrCreateAndGetFamilyField();
3313   addGroupUnderground(false,ids,fam);
3314 }
3315
3316 /*!
3317  * \param [in] ids ids and group name of the new group to add. The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3318  * \parma [in,out] famArr family array on level of interest to be renumbered. The input pointer should be not \c NULL (no check of that will be performed)
3319  */
3320 void MEDFileUMesh::addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3321 {
3322   if(!ids)
3323     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : NULL pointer in input !");
3324   std::string grpName(ids->getName());
3325   if(grpName.empty())
3326     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : empty group name ! MED file format do not accept empty group name !");
3327   ids->checkStrictlyMonotonic(true);
3328   famArr->incrRef(); MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famArrTmp(famArr);
3329   std::vector<std::string> grpsNames=getGroupsNames();
3330   if(std::find(grpsNames.begin(),grpsNames.end(),grpName)!=grpsNames.end())
3331     {
3332       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : Group with name \"" << grpName << "\" already exists ! Destroy it before calling this method !";
3333       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3334     }
3335   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > allFamIds=getAllNonNullFamilyIds();
3336   allFamIds.erase(std::find(allFamIds.begin(),allFamIds.end(),famArrTmp));
3337   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=famArr->selectByTupleIdSafe(ids->begin(),ids->end());
3338   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diffFamIds=famIds->getDifferentValues();
3339   std::vector<int> familyIds;
3340   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > idsPerfamiliyIds;
3341   int maxVal=getTheMaxAbsFamilyId()+1;
3342   std::map<std::string,int> families(_families);
3343   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
3344   std::vector<std::string> fams;
3345   bool created(false);
3346   for(const int *famId=diffFamIds->begin();famId!=diffFamIds->end();famId++)
3347     {
3348       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2Tmp=famIds->getIdsEqual(*famId);
3349       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->selectByTupleId(ids2Tmp->begin(),ids2Tmp->end());
3350       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids1=famArr->getIdsEqual(*famId);
3351       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret0(ids1->buildSubstractionOptimized(ids2));
3352       if(ret0->empty())
3353         {
3354           bool isFamPresent=false;
3355           for(std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >::const_iterator itl=allFamIds.begin();itl!=allFamIds.end() && !isFamPresent;itl++)
3356             isFamPresent=(*itl)->presenceOfValue(*famId);
3357           if(!isFamPresent)
3358             { familyIds.push_back(*famId); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); fams.push_back(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,*famId,created)); } // adding *famId in grp
3359           else
3360             {
3361               familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);
3362               std::string locFamName=FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created);
3363               fams.push_back(locFamName);
3364               if(existsFamily(*famId))
3365                 {
3366                   std::string locFamName2=getFamilyNameGivenId(*famId); std::vector<std::string> v(2); v[0]=locFamName2; v[1]=locFamName;
3367                   ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId).c_str(),v);
3368                 }
3369               maxVal++;
3370             } // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and lie the grp on maxVal
3371         }
3372       else
3373         {
3374           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and on maxVal+1
3375           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);//grp lie only on maxVal+1
3376           std::string n2(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1,created)); fams.push_back(n2);
3377           if(existsFamily(*famId))
3378             {
3379               std::string n1(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created)); std::vector<std::string> v(2); v[0]=n1; v[1]=n2;
3380               ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId).c_str(),v);
3381             }
3382           maxVal+=2;
3383         }
3384     }
3385   for(std::size_t i=0;i<familyIds.size();i++)
3386     {
3387       DataArrayInt *da=idsPerfamiliyIds[i];
3388       famArr->setPartOfValuesSimple3(familyIds[i],da->begin(),da->end(),0,1,1);
3389     }
3390   _families=families;
3391   _groups=groups;
3392   _groups[grpName]=fams;
3393 }
3394
3395 /*!
3396  * Changes a name of a family specified by its id.
3397  *  \param [in] id - the id of the family of interest.
3398  *  \param [in] newFamName - the new family name.
3399  *  \throw If no family with the given \a id exists.
3400  */
3401 void MEDFileUMesh::setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3402 {
3403   std::string oldName=getFamilyNameGivenId(id);
3404   _families.erase(oldName);
3405   _families[newFamName]=id;
3406 }
3407
3408 /*!
3409  * Removes a mesh of a given dimension.
3410  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3411  *  \throw If there is no mesh at level \a meshDimRelToMax in \a this mesh.
3412  */
3413 void MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3414 {
3415   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3416   std::vector<int>::const_iterator it=std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax);
3417   if(it==levSet.end())
3418     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel : the requested level is not existing !");
3419   int pos=(-meshDimRelToMax);
3420   _ms[pos]=0;
3421 }
3422
3423 /*!
3424  * Sets a new MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh.
3425  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3426  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3427  *  \param [in] newOrOld - if \c true, cells in \a m are sorted by type to be ready for 
3428  *         writing \a this mesh in a MED file.
3429  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3430  *         different. 
3431  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3432  *         another node coordinates array.
3433  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3434  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3435  */
3436 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3437 {
3438   dealWithTinyInfo(m);
3439   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3440   if(std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax)==levSet.end())
3441     {
3442       if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3443         {
3444           DataArrayDouble *c=m->getCoords();
3445           if(c)
3446             c->incrRef();
3447           _coords=c;
3448         }
3449       if(m->getCoords()!=_coords)
3450         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshAtLevel : Invalid Given Mesh ! The coordinates are not the same ! try to use tryToShareSameCoords !");
3451       int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3452       if(sz>=(int)_ms.size())
3453         _ms.resize(sz);
3454       checkMeshDimCoherency(m->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3455       _ms[sz-1]=new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld);
3456     }
3457   else
3458     _ms[-meshDimRelToMax]=new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld);
3459 }
3460
3461 /*!
3462  * This method allows to set at once the content of different levels in \a this.
3463  * This method is equivalent to a series of call to MEDFileUMesh::setMeshAtLevel.
3464  *
3465  * \param [in] ms - List of unstructured meshes lying on the same coordinates and having different mesh dimesnion.
3466  * \param [in] renum - the parameter (set to false by default) that tells the beheviour if there is a mesh on \a ms that is not geo type sorted.
3467  *                     If false, an exception ois thrown. If true the mesh is reordered automatically. It is highly recommanded to let this parameter to false.
3468  *
3469  * \throw If \a there is a null pointer in \a ms.
3470  * \sa MEDFileUMesh::setMeshAtLevel
3471  */
3472 void MEDFileUMesh::setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3473 {
3474   if(ms.empty())
3475     return ;
3476   const MEDCouplingUMesh *mRef=ms[0];
3477   if(!mRef)
3478     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in the first element of input meshes !");
3479   std::string name(mRef->getName());
3480   const DataArrayDouble *coo(mRef->getCoords());
3481   std::set<int> s;
3482   int zeDim=-1;
3483   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3484     {
3485       const MEDCouplingUMesh *cur(*it);
3486       if(!cur)
3487         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in input vector of meshes !");
3488       if(coo!=cur->getCoords())
3489         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes do not share the same coordinates !");
3490       int mdim=cur->getMeshDimension();
3491       zeDim=std::max(zeDim,mdim);
3492       if(s.find(mdim)!=s.end())
3493         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes must share the same coordinates pointer, and should have different mesh dimension each other !");
3494     }
3495   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3496     {
3497       int mdim=(*it)->getMeshDimension();
3498       setName((*it)->getName());
3499       setMeshAtLevel(mdim-zeDim,const_cast<MEDCouplingUMesh *>(*it),renum);
3500     }
3501   setName(name.c_str());
3502 }
3503
3504 /*!
3505  * Creates one MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh from a sequence of
3506  * meshes each representing a group, and creates corresponding groups in \a this mesh.
3507  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3508  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the mesh and groups at.
3509  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3510  *          create in \a this mesh.
3511  *  \throw If \a ms is empty.
3512  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3513  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3514  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3515  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3516  *         of the given meshes.
3517  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3518  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3519  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3520  */
3521 void MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3522 {
3523   if(ms.empty())
3524     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : expecting a non empty vector !");
3525   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3526   if(sz>=(int)_ms.size())
3527     _ms.resize(sz);
3528   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3529   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3530   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3531     {
3532       coo->incrRef();
3533       _coords=coo;
3534     }
3535   else
3536     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3537       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : coordinates mismatches !");
3538   std::vector<DataArrayInt *> corr;
3539   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,_zipconn_pol,corr);
3540   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr3(corr.begin(),corr.end());
3541   setMeshAtLevel(meshDimRelToMax,m,renum);
3542   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3543   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,true);
3544 }
3545
3546 /*!
3547  * Creates groups at a given level in \a this mesh from a sequence of
3548  * meshes each representing a group.
3549  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3550  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the groups at.
3551  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3552  *         create in \a this mesh.
3553  *  \param [in] renum - if \c true, then the optional numbers of entities are taken into
3554  *         account. 
3555  *  \throw If \a ms is empty.
3556  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3557  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3558  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3559  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3560  *         of the given meshes.
3561  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3562  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3563  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3564  */
3565 void MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3566 {
3567   if(ms.empty())
3568     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : expecting a non empty vector !");
3569   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3570   if(sz>=(int)_ms.size())
3571     _ms.resize(sz);
3572   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3573   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3574   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3575     {
3576       coo->incrRef();
3577       _coords=coo;
3578     }
3579   else
3580     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3581       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : coordinates mismatches !");
3582   MEDCouplingUMesh *m=getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3583   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr(ms.size());
3584   int i=0;
3585   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
3586     {
3587       DataArrayInt *arr=0;
3588       bool test=m->areCellsIncludedIn(*it,_zipconn_pol,arr);
3589       corr[i]=arr;
3590       if(!test)
3591         {
3592           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : mesh #" << i << " is not part of whole mesh !";
3593           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3594         }
3595     }
3596   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3597   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,renum);
3598 }
3599
3600 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3601 {
3602   const DataArrayDouble *ret=ms[0]->getCoords();
3603   int mdim=ms[0]->getMeshDimension();
3604   for(unsigned int i=1;i<ms.size();i++)
3605     {
3606       ms[i]->checkCoherency();
3607       if(ms[i]->getCoords()!=ret)
3608         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes must share the same coords !");
3609       if(ms[i]->getMeshDimension()!=mdim)
3610         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes have not same mesh dimension !");
3611     }
3612   return const_cast<DataArrayDouble *>(ret);
3613 }
3614
3615 /*!
3616  * Sets the family field of a given relative dimension.
3617  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
3618  *          the family field is set.
3619  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
3620  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3621  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
3622  */
3623 void MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3624 {
3625   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3626     {
3627       if(!famArr)
3628         {
3629           _fam_coords=0;
3630           return ;
3631         }
3632       DataArrayDouble *coo(_coords);
3633       if(!coo)
3634         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : the coordinates have not been set !");
3635       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of node family arr ! ");
3636       famArr->incrRef();
3637       _fam_coords=famArr;
3638       return ;
3639     }
3640   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3641     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3642   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3643   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3644     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3645   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3646     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3647   return _ms[traducedRk]->setFamilyArr(famArr);
3648 }
3649
3650 /*!
3651  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
3652  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3653  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
3654  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3655  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
3656  */
3657 void MEDFileUMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3658 {
3659   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3660     {
3661       if(!renumArr)
3662         {
3663           _num_coords=0;
3664           _rev_num_coords=0;
3665           return ;
3666         }
3667       DataArrayDouble *coo(_coords);
3668       if(!coo)
3669         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumFieldArr : the coordinates have not been set !");
3670       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setRenumArr : Problem in size of node numbering arr ! ");
3671       renumArr->incrRef();
3672       _num_coords=renumArr;
3673       computeRevNum();
3674       return ;
3675     }
3676   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3677     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3678   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3679   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3680     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3681   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3682     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3683   return _ms[traducedRk]->setRenumArr(renumArr);
3684 }
3685
3686 /*!
3687  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
3688  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3689  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
3690  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3691  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
3692  */
3693 void MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3694 {
3695   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3696     {
3697       if(!nameArr)
3698         {
3699           _name_coords=0;
3700           return ;
3701         }
3702       DataArrayDouble *coo(_coords);
3703       if(!coo)
3704         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : the coordinates have not been set !");
3705       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of node numbering arr ! ");
3706       nameArr->incrRef();
3707       _name_coords=nameArr;
3708       return ;
3709     }
3710   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3711     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Dimension request is invalid (>1) !");
3712   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3713   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3714     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3715   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3716     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3717   return _ms[traducedRk]->setNameArr(nameArr);
3718 }
3719
3720 void MEDFileUMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
3721 {
3722   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3723     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3724       (*it)->synchronizeTinyInfo(*this);
3725 }
3726
3727 /*!
3728  * This method is called by MEDFileMesh::changeFamilyId. It performs only one part of the family id modification.
3729  */
3730 void MEDFileUMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3731 {
3732   DataArrayInt *arr=_fam_coords;
3733   if(arr)
3734     arr->changeValue(oldId,newId);
3735   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3736     {
3737       MEDFileUMeshSplitL1 *sp=(*it);
3738       if(sp)
3739         {
3740           sp->changeFamilyIdArr(oldId,newId);
3741         }
3742     }
3743 }
3744
3745 std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > MEDFileUMesh::getAllNonNullFamilyIds() const
3746 {
3747   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ret;
3748   const DataArrayInt *da(_fam_coords);
3749   if(da)
3750     { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
3751   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3752     {
3753       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3754       if(elt)
3755         {
3756           da=elt->getFamilyField();
3757           if(da)
3758             { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
3759         }
3760     }
3761   return ret;
3762 }
3763
3764 void MEDFileUMesh::computeRevNum() const
3765 {
3766   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3767     {
3768       int pos;
3769       int maxValue=_num_coords->getMaxValue(pos);
3770       _rev_num_coords=_num_coords->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
3771     }
3772 }
3773
3774 std::size_t MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySize() const
3775 {
3776   std::size_t ret=MEDFileMesh::getHeapMemorySize();
3777   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
3778     ret+=_fam_nodes->getHeapMemorySize();
3779   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
3780     ret+=_num_nodes->getHeapMemorySize();
3781   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
3782     ret+=_fam_cells->getHeapMemorySize();
3783   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
3784     ret+=_num_cells->getHeapMemorySize();
3785   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
3786     ret+=_rev_num_nodes->getHeapMemorySize();
3787   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
3788     ret+=_rev_num_cells->getHeapMemorySize();
3789   return ret;
3790 }
3791
3792 int MEDFileStructuredMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3793 {
3794   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3795   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3796     {
3797       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
3798       ret=std::max(ret,std::abs(val));
3799     }
3800   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3801     {
3802       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
3803       ret=std::max(ret,std::abs(val));
3804     }
3805   return ret;
3806 }
3807
3808 int MEDFileStructuredMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3809 {
3810   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3811   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3812     {
3813       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
3814       ret=std::max(ret,val);
3815     }
3816   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3817     {
3818       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
3819       ret=std::max(ret,val);
3820     }
3821   return ret;
3822 }
3823
3824 int MEDFileStructuredMesh::getMinFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3825 {
3826   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3827   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3828     {
3829       int val=_fam_nodes->getMinValue(tmp);
3830       ret=std::min(ret,val);
3831     }
3832   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3833     {
3834       int val=_fam_cells->getMinValue(tmp);
3835       ret=std::min(ret,val);
3836     }
3837   return ret;
3838 }
3839
3840 bool MEDFileStructuredMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
3841 {
3842   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
3843     return false;
3844   const MEDFileStructuredMesh *otherC=dynamic_cast<const  MEDFileStructuredMesh *>(other);
3845   if(!otherC)
3846     {
3847       what="Mesh types differ ! This is structured and other is NOT !";
3848       return false;
3849     }
3850   const DataArrayInt *famc1=_fam_nodes;
3851   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_nodes;
3852   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3853     {
3854       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
3855       return false;
3856     }
3857   if(famc1)
3858     {
3859       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3860       if(!ret)
3861         {
3862           what="Families arr on nodes differ !";
3863           return false;
3864         }
3865     }
3866   famc1=_fam_cells;
3867   famc2=otherC->_fam_cells;
3868   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3869     {
3870       what="Mismatch of families arr on cells ! One is defined and not other !";
3871       return false;
3872     }
3873   if(famc1)
3874     {
3875       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3876       if(!ret)
3877         {
3878           what="Families arr on cells differ !";
3879           return false;
3880         }
3881     }
3882   famc1=_num_nodes;
3883   famc2=otherC->_num_nodes;
3884   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3885     {
3886       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
3887       return false;
3888     }
3889   if(famc1)
3890     {
3891       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3892       if(!ret)
3893         {
3894           what="Numbering arr on nodes differ !";
3895           return false;
3896         }
3897     }
3898   famc1=_num_cells;
3899   famc2=otherC->_num_cells;
3900   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3901     {
3902       what="Mismatch of numbering arr on cells ! One is defined and not other !";
3903       return false;
3904     }
3905   if(famc1)
3906     {
3907       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3908       if(!ret)
3909         {
3910           what="Numbering arr on cells differ !";
3911           return false;
3912         }
3913     }
3914   const DataArrayAsciiChar *d1=_names_cells;
3915   const DataArrayAsciiChar *d2=otherC->_names_cells;
3916   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
3917     {
3918       what="Mismatch of naming arr on cells ! One is defined and not other !";
3919       return false;
3920     }
3921   if(d1)
3922     {
3923       bool ret=d1->isEqual(*d2);
3924       if(!ret)
3925         {
3926           what="Naming arr on cells differ !";
3927           return false;
3928         }
3929     }
3930   d1=_names_nodes;
3931   d2=otherC->_names_nodes;
3932   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
3933     {
3934       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
3935       return false;
3936     }
3937   if(d1)
3938     {
3939       bool ret=d1->isEqual(*d2);
3940       if(!ret)
3941         {
3942           what="Naming arr on nodes differ !";
3943           return false;
3944         }
3945     }
3946   return true;
3947 }
3948
3949 void MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes() const
3950 {
3951   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
3952   const DataArrayInt *tmp=_fam_nodes;
3953   if(tmp)
3954     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3955   tmp=_num_nodes;
3956   if(tmp)
3957     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3958   tmp=_fam_cells;
3959   if(tmp)
3960     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3961   tmp=_num_cells;
3962   if(tmp)
3963     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3964 }
3965
3966 /*!
3967  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
3968  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
3969  *          are required.
3970  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
3971  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
3972  *          returned instead of ids.
3973  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
3974  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
3975  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
3976  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
3977  */
3978 DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3979 {
3980   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
3981     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : Only available for levels 0 or 1 !");
3982   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
3983   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3984     {
3985       if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3986         {
3987           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
3988           if(!famIds.empty())
3989             da=_fam_nodes->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
3990           else
3991             da=_fam_nodes->getIdsEqualList(0,0);
3992           if(renum)
3993             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_nodes,da);
3994           else
3995             return da.retn();
3996         }
3997       else
3998         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
3999     }
4000   else
4001     {
4002       if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4003         {
4004           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4005           if(!famIds.empty())
4006             da=_fam_cells->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4007           else
4008             da=_fam_cells->getIdsEqualList(0,0);
4009           if(renum)
4010             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_cells,da);
4011           else
4012             return da.retn();
4013         }
4014       else
4015         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on cells !");
4016     }
4017 }
4018
4019 /*!
4020  * Sets the family field of a given relative dimension.
4021  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4022  *          the family field is set.
4023  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4024  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4025  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4026  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4027  */
4028 void MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4029 {
4030   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4031     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 !");
4032   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4033   if(!mesh)
4034     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set family array !");
4035   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4036     {
4037       int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4038       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4039       _fam_cells=famArr;
4040     }
4041   else
4042     {
4043       int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4044       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4045       _fam_nodes=famArr;
4046     }
4047   if(famArr)
4048     famArr->incrRef();
4049 }
4050
4051 /*!
4052  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4053  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4054  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4055  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4056  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4057  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4058  */
4059 void MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4060 {
4061   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4062     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 !");
4063   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4064   if(!mesh)
4065     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set number array !");
4066   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4067     {
4068       int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4069       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4070       _num_cells=renumArr;
4071     }
4072   else
4073     {
4074       int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4075       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4076       _num_nodes=renumArr;
4077     }
4078   if(renumArr)
4079     renumArr->incrRef();
4080 }
4081
4082 /*!
4083  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4084  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4085  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4086  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4087  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4088  */
4089 void MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4090 {
4091   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4092     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4093   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4094   if(!mesh)
4095     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : no structured mesh specified ! Impossible to set names array !");
4096   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4097     {
4098       int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4099       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4100       _names_cells=nameArr;
4101     }
4102   else
4103     {
4104       int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4105       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4106       _names_nodes=nameArr;
4107     }
4108   if(nameArr)
4109     nameArr->incrRef();
4110 }
4111
4112 /*!
4113  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
4114  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4115  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
4116  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
4117  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4118  */
4119 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4120 {
4121   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4122     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4123   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4124     return _fam_cells;
4125   else
4126     return _fam_nodes;
4127 }
4128
4129 /*!
4130  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4131  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4132  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
4133  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4134  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4135  */
4136 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4137 {
4138   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4139     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4140   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4141     return _num_cells;
4142   else
4143     return _num_nodes;
4144 }
4145
4146 /*!
4147  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
4148  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4149  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4150  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
4151  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4152  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4153  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4154  */
4155 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4156 {
4157   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4158     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4159   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4160     {
4161       if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4162         {
4163           int pos;
4164           int maxValue=_num_cells->getMaxValue(pos);
4165           _rev_num_cells=_num_cells->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4166           return _rev_num_cells;
4167         }
4168       else
4169         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no cell renumbering for a request on reverse numbering !");
4170     }
4171   else
4172     {
4173       if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4174         {
4175           int pos;
4176           int maxValue=_num_nodes->getMaxValue(pos);
4177           _rev_num_nodes=_num_nodes->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4178           return _rev_num_nodes;
4179         }
4180       else
4181         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no node renumbering for a request on reverse numbering !");
4182     }
4183 }
4184
4185 const DataArrayAsciiChar *MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4186 {
4187   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4188     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4189   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4190     return _names_cells;
4191   else
4192     return _names_nodes;
4193 }
4194
4195 /*!
4196  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
4197  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [0].
4198  */
4199 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevels() const
4200 {
4201   std::vector<int> ret(1);
4202   return ret;
4203 }
4204
4205 /*!
4206  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
4207  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [1,0].
4208  */
4209 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
4210 {
4211   std::vector<int> ret(2);
4212   ret[0]=1;
4213   return ret;
4214 }
4215
4216 /*!
4217  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL family arr are defined.
4218  */
4219 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
4220 {
4221   std::vector<int> ret;
4222   const DataArrayInt *famNodes(_fam_nodes),*famCells(_fam_cells);
4223   if(famNodes)
4224     ret.push_back(1);
4225   if(famCells)
4226     ret.push_back(0);
4227   return ret;
4228 }
4229
4230 /*!
4231  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL numbering arr are defined.
4232  */
4233 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
4234 {
4235   std::vector<int> ret;
4236   const DataArrayInt *numNodes(_num_nodes),*numCells(_num_cells);
4237   if(numNodes)
4238     ret.push_back(1);
4239   if(numCells)
4240     ret.push_back(0);
4241   return ret;
4242 }
4243
4244 /*!
4245  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL naming arr are defined.
4246  */
4247 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
4248 {
4249   std::vector<int> ret;
4250   const DataArrayAsciiChar *namesCells(_names_cells);
4251   if(namesCells)
4252     ret.push_back(0);
4253   return ret;
4254 }
4255
4256 /*!
4257  * no implementation here, it is not a bug, but intresically no polyhedra in \a this.
4258  */
4259 bool MEDFileStructuredMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4260 {
4261   oldCode.clear(); newCode.clear(); o2nRenumCell=0;
4262   return false;
4263 }
4264
4265 void MEDFileStructuredMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4266 {
4267   DataArrayInt *arr=_fam_nodes;
4268   if(arr)
4269     arr->changeValue(oldId,newId);
4270   arr=_fam_cells;
4271   if(arr)
4272     arr->changeValue(oldId,newId);
4273 }
4274
4275 void MEDFileStructuredMesh::deepCpyAttributes() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4276 {
4277   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
4278     _fam_nodes=_fam_nodes->deepCpy();
4279   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
4280     _num_nodes=_num_nodes->deepCpy();
4281   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
4282     _fam_cells=_fam_cells->deepCpy();
4283   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
4284     _num_cells=_num_cells->deepCpy();
4285   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
4286     _rev_num_nodes=_rev_num_nodes->deepCpy();
4287   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
4288     _rev_num_cells=_rev_num_cells->deepCpy();
4289 }
4290
4291 /*!
4292  * Returns a pointer to mesh at the specified level (here 0 is compulsary for cartesian mesh).
4293  * 
4294  * \return a pointer to cartesian mesh that need to be managed by the caller.
4295  * \warning the returned pointer has to be managed by the caller.
4296  */
4297
4298 /*!
4299  * Returns a pointer to MEDCouplingStructuredMesh held by \a this. 
4300  *  \param [in] meshDimRelToMax - it must be \c 0.
4301  *  \param [in] renum - it must be \c false.
4302  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingMesh that the caller is to
4303  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
4304  */
4305 MEDCouplingMesh *MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4306 {
4307   if(renum)
4308     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support renumbering ! To do it perform request of renum array directly !");
4309   if(meshDimRelToMax!=0)
4310     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support multi level for mesh 0 expected as input !");
4311   const MEDCouplingStructuredMesh *m=getStructuredMesh();
4312   if(m)
4313     m->incrRef();
4314   return const_cast<MEDCouplingStructuredMesh *>(m);
4315 }
4316
4317 /*!
4318  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
4319  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
4320  *  \return int - the number of entities.
4321  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
4322  */
4323 int MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4324 {
4325   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4326     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4327   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();
4328   if(!cmesh)
4329     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : No structured mesh set !");
4330   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4331     return cmesh->getNumberOfCells();
4332   else
4333     return cmesh->getNumberOfNodes();
4334 }
4335
4336 int MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4337 {
4338   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();
4339   if(!cmesh)
4340     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes : no cartesian mesh set !");
4341   return cmesh->getNumberOfNodes();
4342 }
4343
4344 void MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobs *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4345 {
4346   if(st.getNumberOfItems()!=1)
4347     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
4348   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
4349     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
4350   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
4351     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
4352   if(st[0].getPflName().empty())
4353     {
4354       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
4355       return ;
4356     }
4357   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[0].getPflName().c_str()));
4358   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
4359   int sz(nodesFetched.size());
4360   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
4361     {
4362       std::vector<int> conn;
4363       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
4364       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
4365         if(*it>=0 && *it<sz)
4366           nodesFetched[*it]=true;
4367         else
4368           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
4369     }
4370 }
4371
4372 med_geometry_type MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4373 {
4374   med_geometry_type geoTypeReq=MED_NONE;
4375   switch(meshDim)
4376     {
4377     case 3:
4378       geoTypeReq=MED_HEXA8;
4379       break;
4380     case 2:
4381       geoTypeReq=MED_QUAD4;
4382       break;
4383     case 1:
4384       geoTypeReq=MED_SEG2;
4385       break;
4386     case 0:
4387       geoTypeReq=MED_POINT1;
4388       break;
4389     default:
4390       throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid meshdim detected for structured mesh ! Must be in (1,2,3) !");
4391     }
4392   return geoTypeReq;
4393 }
4394
4395 void MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4396 {
4397   setName(strm->getName());
4398   setDescription(strm->getDescription());
4399   setUnivName(strm->getUnivName());
4400   setIteration(strm->getIteration());
4401   setOrder(strm->getOrder());
4402   setTimeValue(strm->getTime());
4403   setTimeUnit(strm->getTimeUnit());
4404   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
4405   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
4406   int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4407   if(nbOfElt>0)
4408     {
4409       if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
4410         {
4411           _fam_nodes=DataArrayInt::New();
4412           _fam_nodes->alloc(nbOfElt,1);
4413           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getPointer());
4414         }
4415     }
4416   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4417   if(nbOfElt>0)
4418     {
4419       if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
4420         {
4421           _num_nodes=DataArrayInt::New();
4422           _num_nodes->alloc(nbOfElt,1);
4423           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getPointer());
4424         }
4425     }
4426   int meshDim=getStructuredMesh()->getMeshDimension();
4427   med_geometry_type geoTypeReq=GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4428   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4429   if(nbOfElt>0)
4430     {
4431       if(!mrs || mrs->isCellFamilyFieldReading())
4432         {
4433           _fam_cells=DataArrayInt::New();
4434           _fam_cells->alloc(nbOfElt,1);
4435           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getPointer());
4436         }
4437     }
4438   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4439   if(nbOfElt>0)
4440     {
4441       if(!mrs || mrs->isCellNumFieldReading())
4442         {
4443           _num_cells=DataArrayInt::New();
4444           _num_cells->alloc(nbOfElt,1);
4445           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getPointer());
4446         }
4447     }
4448   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4449   if(nbOfElt>0)
4450     {
4451       if(!mrs || mrs->isCellNameFieldReading())
4452         {
4453           _names_cells=DataArrayAsciiChar::New();
4454           _names_cells->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4455           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getPointer());
4456           _names_cells->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4457         }
4458     }
4459   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4460   if(nbOfElt>0)
4461     {
4462       if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
4463         {
4464           _names_nodes=DataArrayAsciiChar::New();
4465           _names_nodes->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4466           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getPointer());
4467           _names_nodes->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4468         }
4469     }
4470 }
4471
4472 void MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(med_idt fid, const char *maa) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4473 {
4474   int meshDim=getStructuredMesh()->getMeshDimension();
4475   med_geometry_type geoTypeReq=GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4476   //
4477   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4478     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getNumberOfTuples(),_fam_cells->getConstPointer());
4479   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4480     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getNumberOfTuples(),_fam_nodes->getConstPointer());
4481   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4482     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getNumberOfTuples(),_num_cells->getConstPointer());
4483   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4484     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getNumberOfTuples(),_num_nodes->getConstPointer());
4485   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
4486     {
4487       if(_names_cells->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4488         {
4489           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on cells with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4490           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
4491           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4492         }
4493       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getNumberOfTuples(),_names_cells->getConstPointer());
4494     }
4495   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
4496     {
4497       if(_names_nodes->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4498         {
4499           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4500           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
4501           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4502         }
4503       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getNumberOfTuples(),_names_nodes->getConstPointer());
4504     }
4505   //
4506   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa,_families,_groups,_too_long_str);
4507 }
4508
4509 /*!
4510  * Returns an empty instance of MEDFileCMesh.
4511  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4512  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4513  */
4514 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New()
4515 {
4516   return new MEDFileCMesh;
4517 }
4518
4519 /*!
4520  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
4521  * file. The first mesh in the file is loaded.
4522  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
4523  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4524  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4525  *  \throw If the file is not readable.
4526  *  \throw If there is no meshes in the file.
4527  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
4528  */
4529 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4530 {
4531   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
4532   if(ms.empty())
4533     {
4534       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
4535       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4536     }
4537   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4538   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4539   int dt,it;
4540   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4541   std::string dummy2;
4542   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
4543   return new MEDFileCMesh(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
4544 }
4545
4546 /*!
4547  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
4548  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
4549  * iteration.
4550  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
4551  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
4552  *  \param [in] dt - the number of a time step.
4553  *  \param [in] it - the number of an iteration.
4554  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4555  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4556  *  \throw If the file is not readable.
4557  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
4558  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
4559  */
4560 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4561 {
4562   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4563   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4564   return new MEDFileCMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
4565 }
4566
4567 std::size_t MEDFileCMesh::getHeapMemorySize() const
4568 {
4569   std::size_t ret=MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySize();
4570   if((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh)
4571     ret+=_cmesh->getHeapMemorySize();
4572   return ret;
4573 }
4574
4575 /*!
4576  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
4577  *  \return int - the mesh dimension.
4578  *  \throw If there are no cells in this mesh.
4579  */
4580 int MEDFileCMesh::getMeshDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4581 {
4582   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
4583     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
4584   return _cmesh->getMeshDimension();
4585 }
4586
4587 /*!
4588  * Returns a string describing \a this mesh.
4589  *  \return std::string - the mesh information string.
4590  */
4591 std::string MEDFileCMesh::simpleRepr() const
4592 {
4593   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
4594 }
4595
4596 /*!
4597  * Returns a full textual description of \a this mesh.
4598  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
4599  */
4600 std::string MEDFileCMesh::advancedRepr() const
4601 {
4602   return simpleRepr();
4603 }
4604
4605 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::shallowCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4606 {
4607   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
4608   return ret.retn();
4609 }
4610
4611 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::createNewEmpty() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4612 {
4613   return new MEDFileCMesh;
4614 }
4615
4616 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4617 {
4618   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
4619   if((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh)
4620     ret->_cmesh=static_cast<MEDCouplingCMesh*>(_cmesh->deepCpy());
4621   ret->deepCpyAttributes();
4622   return ret.retn();
4623 }
4624
4625 /*!
4626  * Checks if \a this and another mesh are equal.
4627  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
4628  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
4629  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
4630  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
4631  */
4632 bool MEDFileCMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4633 {
4634   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
4635     return false;
4636   const MEDFileCMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(other);
4637   if(!otherC)
4638     {
4639       what="Mesh types differ ! This is cartesian and other is NOT !";
4640       return false;
4641     }
4642   clearNonDiscrAttributes();
4643   otherC->clearNonDiscrAttributes();
4644   const MEDCouplingCMesh *coo1=_cmesh;
4645   const MEDCouplingCMesh *coo2=otherC->_cmesh;
4646   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
4647     {
4648       what="Mismatch of cartesian meshes ! One is defined and not other !";
4649       return false;
4650     }
4651   if(coo1)
4652     {
4653       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
4654       if(!ret)
4655         {
4656           what="cartesian meshes differ !";
4657           return false;
4658         }
4659     }
4660   return true;
4661 }
4662
4663 /*!
4664  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
4665  */
4666 void MEDFileCMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4667 {
4668   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
4669   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_cmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
4670 }
4671
4672 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh()
4673 {
4674 }
4675
4676 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4677 try
4678   {
4679     loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
4680   }
4681 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
4682   {
4683     throw e;
4684   }
4685
4686 void MEDFileCMesh::loadCMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4687 {
4688   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4689   int dummy0,dummy1;
4690   std::string dtunit;
4691   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
4692   if(meshType!=CARTESIAN)
4693     {
4694       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as cartesian an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT cartesian !";
4695       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4696     }
4697   MEDFileCMeshL2 loaderl2;
4698   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
4699   MEDCouplingCMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
4700   mesh->incrRef();
4701   _cmesh=mesh;
4702   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
4703 }
4704
4705 /*!
4706  * Returns a const pointer to MEDCouplingCMesh held by \a this mesh.
4707  *  \return const MEDCouplingCMesh * - a pointer to the held MEDCouplingCMesh.
4708  */
4709 const MEDCouplingCMesh *MEDFileCMesh::getMesh() const
4710 {
4711   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4712   return _cmesh;
4713 }
4714
4715 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCMesh::getStructuredMesh() const
4716 {
4717   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4718   return _cmesh;
4719 }
4720
4721 /*!
4722  * Sets the MEDCouplingCMesh holding the data of \a this mesh.
4723  *  \param [in] m - the new MEDCouplingCMesh to refer to.
4724  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
4725  *         different. 
4726  */
4727 void MEDFileCMesh::setMesh(MEDCouplingCMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4728 {
4729   dealWithTinyInfo(m);
4730   if(m)
4731     m->incrRef();
4732   _cmesh=m;
4733 }
4734
4735 void MEDFileCMesh::writeLL(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4736 {
4737   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
4738   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
4739   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
4740   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
4741   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
4742   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
4743   int spaceDim=_cmesh->getSpaceDimension();
4744   int meshDim=_cmesh->getMeshDimension();
4745   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4746   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4747   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
4748     {
4749       std::string info(_cmesh->getCoordsAt(i)->getInfoOnComponent(0));
4750       std::string c,u;
4751       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
4752       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4753       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4754     }
4755   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
4756   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
4757   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CARTESIAN_GRID);
4758   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
4759     {
4760       const DataArrayDouble *da=_cmesh->getCoordsAt(i);
4761       MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,i+1,da->getNumberOfTuples(),da->getConstPointer());
4762     }
4763   //
4764   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,maa);
4765 }
4766
4767 void MEDFileCMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4768 {
4769   const MEDCouplingCMesh *cmesh=_cmesh;
4770   if(!cmesh)
4771     return;
4772   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setName(_name.c_str());
4773   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setDescription(_desc_name.c_str());
4774   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
4775   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTimeUnit(_dt_unit.c_str());
4776 }
4777
4778 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New()
4779 {
4780   return new MEDFileCurveLinearMesh;
4781 }
4782
4783 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4784 {
4785   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
4786   if(ms.empty())
4787     {
4788       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
4789       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4790     }
4791   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4792   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4793   int dt,it;
4794   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4795   std::string dummy2;
4796   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
4797   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
4798 }
4799
4800 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4801 {
4802   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4803   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4804   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
4805 }
4806
4807 std::size_t MEDFileCurveLinearMesh::getHeapMemorySize() const
4808 {
4809   std::size_t ret=MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySize();
4810   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh)
4811     ret+=_clmesh->getHeapMemorySize();
4812   return ret;
4813 }
4814
4815 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::shallowCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4816 {
4817   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
4818   return ret.retn();
4819 }
4820
4821 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::createNewEmpty() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4822 {
4823   return new MEDFileCurveLinearMesh;
4824 }
4825
4826 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4827 {
4828   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
4829   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh)
4830     ret->_clmesh=static_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh*>(_clmesh->deepCpy());
4831   ret->deepCpyAttributes();
4832   return ret.retn();
4833 }
4834
4835 int MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4836 {
4837   if(!((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh))
4838     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
4839   return _clmesh->getMeshDimension();
4840 }
4841
4842 std::string MEDFileCurveLinearMesh::simpleRepr() const
4843 {
4844   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
4845 }
4846
4847 std::string MEDFileCurveLinearMesh::advancedRepr() const
4848 {
4849   return simpleRepr();
4850 }
4851
4852 bool MEDFileCurveLinearMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4853 {
4854   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
4855     return false;
4856   const MEDFileCurveLinearMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(other);
4857   if(!otherC)
4858     {
4859       what="Mesh types differ ! This is curve linear and other is NOT !";
4860       return false;
4861     }
4862   clearNonDiscrAttributes();
4863   otherC->clearNonDiscrAttributes();
4864   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo1=_clmesh;
4865   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo2=otherC->_clmesh;
4866   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
4867     {
4868       what="Mismatch of curve linear meshes ! One is defined and not other !";
4869       return false;
4870     }
4871   if(coo1)
4872     {
4873       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
4874       if(!ret)
4875         {
4876           what="curve linear meshes differ !";
4877           return false;
4878         }
4879     }
4880   return true;
4881 }
4882
4883 void MEDFileCurveLinearMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4884 {
4885   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
4886   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_clmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
4887 }
4888
4889 void MEDFileCurveLinearMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4890 {
4891   const MEDCouplingCurveLinearMesh *clmesh=_clmesh;
4892   if(!clmesh)
4893     return;
4894   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setName(_name.c_str());
4895   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setDescription(_desc_name.c_str());
4896   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
4897   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTimeUnit(_dt_unit.c_str());
4898 }
4899
4900 const MEDCouplingCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getMesh() const
4901 {
4902   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4903   return _clmesh;
4904 }
4905
4906 void MEDFileCurveLinearMesh::setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4907 {
4908   dealWithTinyInfo(m);
4909   if(m)
4910     m->incrRef();
4911   _clmesh=m;
4912 }
4913
4914 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getStructuredMesh() const
4915 {
4916   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4917   return _clmesh;
4918 }
4919
4920 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh()
4921 {
4922 }
4923
4924 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4925 try
4926   {
4927     loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
4928   }
4929 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
4930   {
4931     throw e;
4932   }
4933
4934 void MEDFileCurveLinearMesh::writeLL(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4935 {
4936   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
4937   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
4938   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
4939   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
4940   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
4941   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
4942   int spaceDim=_clmesh->getSpaceDimension();
4943   int meshDim=_clmesh->getMeshDimension();
4944   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4945   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4946   const DataArrayDouble *coords=_clmesh->getCoords();
4947   if(!coords)
4948     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::writeLL : no coordinates set !");
4949   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
4950     {
4951       std::string info(_clmesh->getCoords()->getInfoOnComponent(i));
4952       std::string c,u;
4953       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
4954       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4955       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4956     }
4957   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
4958   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
4959   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CURVILINEAR_GRID);
4960   std::vector<int> nodeGridSt=_clmesh->getNodeGridStructure();
4961   MEDmeshGridStructWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,&nodeGridSt[0]);
4962   
4963   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->begin());
4964   //
4965   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,maa);
4966 }
4967
4968 void MEDFileCurveLinearMesh::loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4969 {
4970   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4971   int dummy0,dummy1;
4972   std::string dtunit;
4973   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
4974   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
4975     {
4976       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as curve linear an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT curve linear !";
4977       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4978     }
4979   MEDFileCLMeshL2 loaderl2;
4980   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
4981   MEDCouplingCurveLinearMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
4982   mesh->incrRef();
4983   _clmesh=mesh;
4984   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
4985 }
4986
4987 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New()
4988 {
4989   return new MEDFileMeshMultiTS;
4990 }
4991
4992 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4993 {
4994   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName);
4995 }
4996
4997 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const char *fileName, const char *mName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4998 {
4999   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName,mName);
5000 }
5001
5002 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5003 {
5004   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> ret=MEDFileMeshMultiTS::New();
5005   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > meshOneTs(_mesh_one_ts.size());
5006   std::size_t i=0;
5007   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++,i++)
5008     if((const MEDFileMesh *)*it)
5009       meshOneTs[i]=(*it)->deepCpy();
5010   ret->_mesh_one_ts=meshOneTs;
5011   return ret.retn();
5012 }
5013
5014 std::size_t MEDFileMeshMultiTS::getHeapMemorySize() const
5015 {
5016   std::size_t ret=_mesh_one_ts.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh>);
5017   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5018     ret+=(*it)->getHeapMemorySize();
5019   return ret;
5020 }
5021
5022 const char *MEDFileMeshMultiTS::getName() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5023 {
5024   if(_mesh_one_ts.empty())
5025     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getName : no time steps set !");
5026   return _mesh_one_ts[0]->getName();
5027 }
5028
5029 void MEDFileMeshMultiTS::setName(const char *newMeshName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5030 {
5031   std::string oldName(getName());
5032   std::vector< std::pair<std::string,std::string> > v(1);
5033   v[0].first=oldName; v[0].second=newMeshName;
5034   changeNames(v);
5035 }
5036
5037 bool MEDFileMeshMultiTS::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5038 {
5039   bool ret=false;
5040   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5041     {
5042       MEDFileMesh *cur(*it);
5043       if(cur)
5044         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5045     }
5046   return ret;
5047 }
5048
5049 MEDFileMesh *MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5050 {
5051   if(_mesh_one_ts.empty())
5052     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep : empty time step set !");
5053   return const_cast<MEDFileMesh *>(static_cast<const MEDFileMesh *>(_mesh_one_ts[0]));
5054 }
5055
5056 void MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5057 {
5058   if(!mesh1TimeStep)
5059     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep : input pointer should be different from 0 !");
5060   _mesh_one_ts.resize(1);
5061   mesh1TimeStep->incrRef();
5062   //MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> toto=mesh1TimeStep;
5063   _mesh_one_ts[0]=mesh1TimeStep;
5064 }
5065
5066 void MEDFileMeshMultiTS::write(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5067 {
5068   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5069     {
5070       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5071       (*it)->write(fid);
5072     }
5073 }
5074
5075 void MEDFileMeshMultiTS::write(const char *fileName, int mode) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5076 {
5077   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5078   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,medmod);
5079   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5080   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str().c_str());
5081   write(fid);
5082 }
5083
5084 void MEDFileMeshMultiTS::loadFromFile(const char *fileName, const char *mName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5085 {//for the moment to be improved
5086   _mesh_one_ts.resize(1);
5087   _mesh_one_ts[0]=MEDFileMesh::New(fileName,mName,-1,-1);
5088 }
5089
5090 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS()
5091 {
5092 }
5093
5094 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5095 try
5096   {
5097     std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5098     if(ms.empty())
5099     {
5100       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5101       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5102     }
5103     MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5104     MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
5105     int dt,it;
5106     ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5107     std::string dummy2;
5108     MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
5109     loadFromFile(fileName,ms.front().c_str());
5110   }
5111 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5112   {
5113     throw e;
5114   }
5115
5116 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const char *fileName, const char *mName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5117 try
5118   {
5119     loadFromFile(fileName,mName);
5120   }
5121 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5122   {
5123     throw e;
5124   }
5125
5126 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New()
5127 {
5128   return new MEDFileMeshes;
5129 }
5130
5131 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5132 {
5133   return new MEDFileMeshes(fileName);
5134 }
5135
5136 void MEDFileMeshes::write(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5137 {
5138   checkCoherency();
5139   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5140     {
5141       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5142       (*it)->write(fid);
5143     }
5144 }
5145
5146 void MEDFileMeshes::write(const char *fileName, int mode) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5147 {
5148   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5149   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,medmod);
5150   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5151   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str().c_str());
5152   checkCoherency();
5153   write(fid);
5154 }
5155
5156 int MEDFileMeshes::getNumberOfMeshes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5157 {
5158   return _meshes.size();
5159 }
5160
5161 MEDFileMeshesIterator *MEDFileMeshes::iterator() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5162 {
5163   return new MEDFileMeshesIterator(this);
5164 }
5165
5166 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshAtPos(int i) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5167 {
5168   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5169     {
5170       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshAtPos : invalid mesh id given in parameter ! Should be in [0;" << _meshes.size() << ") !";
5171       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5172     }
5173   return _meshes[i]->getOneTimeStep();
5174 }
5175
5176 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshWithName(const char *mname) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5177 {
5178   std::vector<std::string> ms=getMeshesNames();
5179   std::vector<std::string>::iterator it=std::find(ms.begin(),ms.end(),mname);
5180   if(it==ms.end())
5181     {
5182       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshWithName : Mesh  \"" << mname << "\" does not exist in this ! Existing are : ";
5183       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
5184       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5185     }
5186   return getMeshAtPos((int)std::distance(ms.begin(),it));
5187 }
5188
5189 std::vector<std::string> MEDFileMeshes::getMeshesNames() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5190 {
5191   std::vector<std::string> ret(_meshes.size());
5192   int i=0;
5193   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5194     {
5195       const MEDFileMeshMultiTS *f=(*it);
5196       if(f)
5197         {
5198           ret[i]=f->getName();
5199         }
5200       else
5201         {
5202           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshesNames : At rank #" << i << " mesh is not defined !";
5203           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5204         }
5205     }
5206   return ret;
5207 }
5208
5209 bool MEDFileMeshes::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5210 {
5211   bool ret=false;
5212   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5213     {
5214       MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5215       if(cur)
5216         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5217     }
5218   return ret;
5219 }
5220
5221 void MEDFileMeshes::resize(int newSize) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5222 {
5223   _meshes.resize(newSize);
5224 }
5225
5226 void MEDFileMeshes::pushMesh(MEDFileMesh *mesh) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5227 {
5228   if(!mesh)
5229     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::pushMesh : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5230   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5231   elt->setOneTimeStep(mesh);
5232   _meshes.push_back(elt);
5233 }
5234
5235 void MEDFileMeshes::setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5236 {
5237   if(!mesh)
5238     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::setMeshAtPos : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5239   if(i>=(int)_meshes.size())
5240     _meshes.resize(i+1);
5241   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5242   elt->setOneTimeStep(mesh);
5243   _meshes[i]=elt;
5244 }
5245
5246 void MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos(int i) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5247 {
5248   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5249     {
5250       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos : Invalid given id in input (" << i << ") should be in [0," << _meshes.size() << ") !";
5251       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5252     }
5253   _meshes.erase(_meshes.begin()+i);
5254 }
5255
5256 void MEDFileMeshes::loadFromFile(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5257 {
5258   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5259   int i=0;
5260   _meshes.resize(ms.size());
5261   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
5262     _meshes[i]=MEDFileMeshMultiTS::New(fileName,(*it).c_str());
5263 }
5264
5265 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes()
5266 {
5267 }
5268
5269 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5270 try
5271   {
5272     loadFromFile(fileName);
5273   }
5274 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5275   {
5276   }
5277
5278 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5279 {
5280   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > meshes(_meshes.size());
5281   std::size_t i=0;
5282   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5283     if((const MEDFileMeshMultiTS *)*it)
5284       meshes[i]=(*it)->deepCpy();
5285   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> ret=MEDFileMeshes::New();
5286   ret->_meshes=meshes;
5287   return ret.retn();
5288 }
5289
5290 std::size_t MEDFileMeshes::getHeapMemorySize() const
5291 {
5292   std::size_t ret=_meshes.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS>));
5293   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5294     if((const MEDFileMeshMultiTS*)*it)
5295       ret+=(*it)->getHeapMemorySize();
5296   return ret; 
5297 }
5298
5299 std::string MEDFileMeshes::simpleRepr() const
5300 {
5301   std::ostringstream oss;
5302   oss << "(*****************)\n(* MEDFileMeshes *)\n(*****************)\n\n";
5303   simpleReprWithoutHeader(oss);
5304   return oss.str();
5305 }
5306
5307 void MEDFileMeshes::simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const
5308 {
5309   int nbOfMeshes=getNumberOfMeshes();
5310   oss << "There are " << nbOfMeshes << " meshes with the following names : \n";
5311   std::vector<std::string> mns=getMeshesNames();
5312   for(int i=0;i<nbOfMeshes;i++)
5313     oss << "  - #" << i << " \"" << mns[i] << "\"\n";
5314 }
5315
5316 void MEDFileMeshes::checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5317 {
5318   static const char MSG[]="MEDFileMeshes::checkCoherency : mesh at rank ";
5319   int i=0;
5320   std::set<std::string> s;
5321   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5322     {
5323       const MEDFileMeshMultiTS *elt=(*it);
5324       if(!elt)
5325         {
5326           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << "/" << _meshes.size() << " is empty !";
5327           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5328         }
5329       std::size_t sz=s.size();
5330       s.insert(std::string((*it)->getName()));
5331       if(s.size()==sz)
5332         {
5333           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << " has a name (\"" << (*it)->getName() << "\") already used by an another mesh in list !";
5334           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5335         }
5336     }
5337 }
5338
5339 MEDFileMeshesIterator::MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms):_ms(ms),_iter_id(0),_nb_iter(0)
5340 {
5341   if(ms)
5342     {
5343       ms->incrRef();
5344       _nb_iter=ms->getNumberOfMeshes();
5345     }
5346 }
5347
5348 MEDFileMeshesIterator::~MEDFileMeshesIterator()
5349 {
5350 }
5351
5352 MEDFileMesh *MEDFileMeshesIterator::nextt()
5353 {
5354   if(_iter_id<_nb_iter)
5355     {
5356       MEDFileMeshes *ms(_ms);
5357       if(ms)
5358         return ms->getMeshAtPos(_iter_id++);
5359       else
5360         return 0;
5361     }
5362   else
5363     return 0;
5364 }