Salome HOME
Bug correction of MEDFileUMesh.zipCoords seen in // context.
[modules/med.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDFileMesh.hxx"
22 #include "MEDFileUtilities.hxx"
23 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
24 #include "MEDFileField.hxx"
25 #include "MEDLoader.hxx"
26 #include "MEDLoaderBase.hxx"
27
28 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
29
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31
32 #include <limits>
33 #include <cmath>
34
35 extern med_geometry_type typmai3[34];
36
37 using namespace ParaMEDMEM;
38
39 const char MEDFileMesh::DFT_FAM_NAME[]="FAMILLE_ZERO";
40
41 MEDFileMesh::MEDFileMesh():_order(-1),_iteration(-1),_time(0.),_univ_wr_status(true)
42 {
43 }
44
45 std::size_t MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
46 {
47   std::size_t ret(_dt_unit.capacity()+_name.capacity()+_univ_name.capacity()+_desc_name.capacity());
48   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
49     {
50       ret+=(*it).first.capacity()+(*it).second.capacity()*sizeof(std::string);
51       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
52         ret+=(*it2).capacity();
53     }
54   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
55     ret+=(*it).first.capacity()+sizeof(int);
56   return ret;
57 }
58
59 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull() const
60 {
61   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
62 }
63
64 /*!
65  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
66  * file. The first mesh in the file is loaded.
67  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
68  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
69  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
70  *  \throw If the file is not readable.
71  *  \throw If there is no meshes in the file.
72  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
73  */
74 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
75 {
76   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
77   if(ms.empty())
78     {
79       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
80       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
81     }
82   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
83   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
84   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
85   int dt,it;
86   std::string dummy2;
87   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
88   switch(meshType)
89   {
90     case UNSTRUCTURED:
91       {
92         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
93         ret->loadUMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
94         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
95       }
96     case CARTESIAN:
97       {
98         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
99         ret->loadCMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
100         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
101       }
102     case CURVE_LINEAR:
103       {
104         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
105         ret->loadCLMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
106         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
107       }
108     default:
109       {
110         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << ms.front() << "' exists but unsupported type yet !";
111         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
112       }
113   }
114 }
115
116 /*!
117  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
118  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
119  * iteration.
120  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
121  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
122  *  \param [in] dt - the number of a time step.
123  *  \param [in] it - the number of an iteration.
124  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
125  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
126  *  \throw If the file is not readable.
127  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
128  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
129  */
130 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
131 {
132   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
133   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
134   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
135   int dummy0,dummy1;
136   std::string dummy2;
137   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
138   switch(meshType)
139   {
140     case UNSTRUCTURED:
141       {
142         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
143         ret->loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
144         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
145       }
146     case CARTESIAN:
147       {
148         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
149         ret->loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
150         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
151       }
152     case CURVE_LINEAR:
153       {
154         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
155         ret->loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
156         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
157       }
158     default:
159       {
160         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << mName << "' exists but unsupported type yet !";
161         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
162       }
163   }
164 }
165
166 /*!
167  * Writes \a this mesh into an open MED file specified by its descriptor.
168  *  \param [in] fid - the MED file descriptor.
169  *  \throw If the mesh name is not set.
170  *  \throw If the file is open for reading only.
171  *  \throw If the writing mode == 1 and the same data is present in an existing file.
172  */
173 void MEDFileMesh::write(med_idt fid) const
174 {
175   if(!existsFamily(0))
176     const_cast<MEDFileMesh *>(this)->addFamily(DFT_FAM_NAME,0);
177   if(_name.empty())
178     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh : name is empty. MED file ask for a NON EMPTY name !");
179   writeLL(fid);
180 }
181
182 /*!
183  * Writes \a this mesh into a MED file specified by its name.
184  *  \param [in] fileName - the MED file name.
185  *  \param [in] mode - the writing mode. For more on \a mode, see \ref AdvMEDLoaderBasics.
186  * - 2 - erase; an existing file is removed.
187  * - 1 - append; same data should not be present in an existing file.
188  * - 0 - overwrite; same data present in an existing file is overwritten.
189  *  \throw If the mesh name is not set.
190  *  \throw If \a mode == 1 and the same data is present in an existing file.
191  */
192 void MEDFileMesh::write(const std::string& fileName, int mode) const
193 {
194   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
195   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
196   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
197   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
198   write(fid);
199 }
200
201 /*!
202  * Checks if \a this and another mesh are equal.
203  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
204  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
205  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
206  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
207  */
208 bool MEDFileMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
209 {
210   if(_order!=other->_order)
211     {
212       what="Orders differ !";
213       return false;
214     }
215   if(_iteration!=other->_iteration)
216     {
217       what="Iterations differ !";
218       return false;
219     }
220   if(fabs(_time-other->_time)>eps)
221     {
222       what="Time values differ !";
223       return false;
224     }
225   if(_dt_unit!=other->_dt_unit)
226     {
227       what="Time units differ !";
228       return false;
229     }
230   if(_name!=other->_name)
231     {
232       what="Names differ !";
233       return false;
234     }
235   //univ_name has been ignored -> not a bug because it is a mutable attribute
236   if(_desc_name!=other->_desc_name)
237     {
238       what="Description names differ !";
239       return false;
240     }
241   if(!areGrpsEqual(other,what))
242     return false;
243   if(!areFamsEqual(other,what))
244     return false;
245   return true;
246 }
247
248 void MEDFileMesh::setName(const std::string& name)
249 {
250   _name=name;
251 }
252
253 /*!
254  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
255  */
256 void MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes() const
257 {
258
259 }
260
261 bool MEDFileMesh::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
262 {
263   for(std::vector< std::pair<std::string,std::string> >::const_iterator it=modifTab.begin();it!=modifTab.end();it++)
264     {
265       if((*it).first==_name)
266         {
267           _name=(*it).second;
268           return true;
269         }
270     }
271   return false;
272 }
273
274 /*!
275  * Copies data on groups and families from another mesh.
276  *  \param [in] other - the mesh to copy the data from.
277  */
278 void MEDFileMesh::copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other)
279 {
280   _groups=other._groups;
281   _families=other._families;
282 }
283
284
285 /*!
286  * This method clear all the groups in the map.
287  * So this method does not operate at all on arrays.
288  * So this method can lead to orphan families.
289  * 
290  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
291  */
292 void MEDFileMesh::clearGrpMap()
293 {
294   _groups.clear();
295 }
296
297 /*!
298  * This method clear all the families in the map.
299  * So this method does not operate at all on arrays.
300  * WARNING ! if there are some groups lying on cleared families, those groups will be impacted !
301  *
302  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
303  */
304 void MEDFileMesh::clearFamMap()
305 {
306   _families.clear();
307 }
308
309 /*!
310  * This method clear all the families and groups in the map.
311  * So this method does not operate at all on arrays.
312  * As all groups and families entry will be removed after 
313  * the call of MEDFileMesh::setFamilyFieldArr method with 0 or None (python) in the 2nd parameter can be useful to reduce the size of the object.
314  *
315  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamMap
316  */
317 void MEDFileMesh::clearFamGrpMaps()
318 {
319   clearGrpMap();
320   clearFamMap();
321 }
322
323 /*!
324  * Returns names of families constituting a group.
325  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
326  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
327  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
328  */
329 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroup(const std::string& name) const
330 {
331   std::string oname(name);
332   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
333   if(it==_groups.end())
334     {
335       std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
336       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
337       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
338       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
339     }
340   return (*it).second;
341 }
342
343 /*!
344  * Returns names of families constituting some groups.
345  *  \param [in] grps - a sequence of names of groups of interest.
346  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
347  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
348  */
349 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const
350 {
351   std::set<std::string> fams;
352   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++)
353     {
354       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=_groups.find(*it);
355       if(it2==_groups.end())
356         {
357           std::ostringstream oss; oss << "No such group in mesh \"" << _name << "\" : " << *it; 
358           std::vector<std::string> grps2=getGroupsNames(); oss << "\" !\nAvailable groups are :";
359           std::copy(grps2.begin(),grps2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
360           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
361         }
362       fams.insert((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
363     }
364   std::vector<std::string> fams2(fams.begin(),fams.end());
365   return fams2;
366 }
367
368 /*!
369  * Returns ids of families constituting a group.
370  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
371  *  \return std::vector<int> - sequence of ids of the families.
372  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
373  */
374 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name) const
375 {
376   std::string oname(name);
377   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
378   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
379   if(it==_groups.end())
380     {
381       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
382       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
383       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
384     }
385   return getFamiliesIds((*it).second);
386 }
387
388 /*!
389  * Sets names of families constituting a group. If data on families of this group is
390  * already present, it is overwritten. Every family in \a fams is checked, and if a
391  family is not yet in \a this mesh, the default group id \c 0 is assigned to it.
392  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
393  *  \param [in] fams - a sequence of names of families constituting the group.
394  */
395 void MEDFileMesh::setFamiliesOnGroup(const std::string& name, const std::vector<std::string>& fams)
396 {
397   std::string oname(name);
398   _groups[oname]=fams;
399   for(std::vector<std::string>::const_iterator it1=fams.begin();it1!=fams.end();it1++)
400     {
401       std::map<std::string,int>::iterator it2=_families.find(*it1);
402       if(it2==_families.end())
403         _families[*it1]=0;
404     }
405 }
406
407 /*!
408  * Sets families constituting a group. The families are specified by their ids.
409  * If a family name is not found by its id, an exception is thrown.
410  * If several families have same id, the first one in lexical order is taken.
411  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
412  *  \param [in] famIds - a sequence of ids of families constituting the group.
413  *  \throw If a family name is not found by its id.
414  */
415 void MEDFileMesh::setFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name, const std::vector<int>& famIds)
416 {
417   std::string oname(name);
418   std::vector<std::string> fams(famIds.size());
419   int i=0;
420   for(std::vector<int>::const_iterator it1=famIds.begin();it1!=famIds.end();it1++,i++)
421     {
422       std::string name2=getFamilyNameGivenId(*it1);
423       fams[i]=name2;
424     }
425   _groups[oname]=fams;
426 }
427
428 /*!
429  * Returns names of groups including a given family.
430  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
431  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of groups including the family.
432  */
433 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsOnFamily(const std::string& name) const
434 {
435   std::vector<std::string> ret;
436   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();it1!=_groups.end();it1++)
437     {
438       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it1).second.begin();it2!=(*it1).second.end();it2++)
439         if((*it2)==name)
440           {
441             ret.push_back((*it1).first);
442             break;
443           }
444     }
445   return ret;
446 }
447
448 /*!
449  * Adds an existing family to groups.
450  *  \param [in] famName - a name of family to add to \a grps.
451  *  \param [in] grps - a sequence of group names to add the family in.
452  *  \throw If a family named \a famName not yet exists.
453  */
454 void MEDFileMesh::setGroupsOnFamily(const std::string& famName, const std::vector<std::string>& grps)
455 {
456   std::string fName(famName);
457   const std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fName);
458   if(it==_families.end())
459     {
460       std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
461       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << fName << "\" !\nAvailable families are :";
462       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
463       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
464     }
465   for(std::vector<std::string>::const_iterator it3=grps.begin();it3!=grps.end();it3++)
466     {
467       std::map< std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(*it3);
468       if(it2!=_groups.end())
469         (*it2).second.push_back(fName);
470       else
471         {
472           std::vector<std::string> grps2(1,fName);
473           _groups[*it3]=grps2;
474         }
475     }
476 }
477
478 /*!
479  * Returns names of all groups of \a this mesh.
480  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names.
481  */
482 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsNames() const
483 {
484   std::vector<std::string> ret(_groups.size());
485   int i=0;
486   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++,i++)
487     ret[i]=(*it).first;
488   return ret;
489 }
490
491 /*!
492  * Returns names of all families of \a this mesh.
493  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of family names.
494  */
495 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesNames() const
496 {
497   std::vector<std::string> ret(_families.size());
498   int i=0;
499   for(std::map<std::string, int >::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++,i++)
500     ret[i]=(*it).first;
501   return ret;
502 }
503
504 /*!
505  * Changes a name of every family, included in one group only, to be same as the group name.
506  *  \throw If there are families with equal names in \a this mesh.
507  */
508 void MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName()
509 {
510   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
511   std::map<std::string,int> newFams;
512   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
513     {
514       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
515       if(grps.size()==1 && groups[grps[0]].size()==1)
516         {
517           if(newFams.find(grps[0])!=newFams.end())
518             {
519               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << grps[0] << "\" already exists !";
520               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
521             }
522           newFams[grps[0]]=(*it).second;
523           std::vector<std::string>& grps2=groups[grps[0]];
524           std::size_t pos=std::distance(grps2.begin(),std::find(grps2.begin(),grps2.end(),(*it).first));
525           grps2[pos]=grps[0];
526         }
527       else
528         {
529           if(newFams.find((*it).first)!=newFams.end())
530             {
531               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << (*it).first << "\" already exists !";
532               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
533             }
534           newFams[(*it).first]=(*it).second;
535         }
536     }
537   _families=newFams;
538   _groups=groups;
539 }
540
541 /*!
542  * Removes all groups lying on no family. If there is no empty groups, \a this is let untouched.
543  * 
544  * \return the removed groups.
545  */
546 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeEmptyGroups()
547 {
548   std::vector<std::string> ret;
549   std::map<std::string, std::vector<std::string> > newGrps;
550   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
551     {
552       if((*it).second.empty())
553         ret.push_back((*it).first);
554       else
555         newGrps[(*it).first]=(*it).second;
556     }
557   if(!ret.empty())
558     _groups=newGrps;
559   return ret;
560 }
561
562 /*!
563  * Removes a group from \a this mesh.
564  *  \param [in] name - the name of the group to remove.
565  *  \throw If no group with such a \a name exists.
566  */
567 void MEDFileMesh::removeGroup(const std::string& name)
568 {
569   std::string oname(name);
570   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
571   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
572   if(it==_groups.end())
573     {
574       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
575       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
576       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
577     }
578   _groups.erase(it);
579 }
580
581 /*!
582  * Removes a family from \a this mesh.
583  *  \param [in] name - the name of the family to remove.
584  *  \throw If no family with such a \a name exists.
585  */
586 void MEDFileMesh::removeFamily(const std::string& name)
587 {
588   std::string oname(name);
589   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
590   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
591   if(it==_families.end())
592     {
593       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
594       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
595       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
596     }
597   _families.erase(it);
598   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
599     {
600       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
601       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
602       if(it4!=v.end())
603         v.erase(it4);
604     }
605 }
606
607 /*!
608  * Removes all groups in \a this that are orphan. A group is orphan if this group lies on
609  * a set of families, themselves orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
610  * family field whatever its level. This method also suppresses the orphan families.
611  * 
612  * \return - The list of removed groups names. 
613  *
614  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanFamilies.
615  */
616 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanGroups()
617 {
618   removeOrphanFamilies();
619   return removeEmptyGroups();
620 }
621
622 /*!
623  * Removes all families in \a this that are orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
624  * family field whatever its level. Groups are updated in consequence, that is to say all groups lying on orphan family, will see their families list modified.
625  * 
626  * \return - The list of removed families names.
627  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanGroups.
628  */
629 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanFamilies()
630 {
631   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allFamIdsInUse=computeAllFamilyIdsInUse();
632   std::vector<std::string> ret;
633   if(!((DataArrayInt*)allFamIdsInUse))
634     {
635       ret=getFamiliesNames();
636       _families.clear(); _groups.clear();
637       return ret;
638     }
639   std::map<std::string,int> famMap;
640   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grps(_groups);
641   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
642     {
643       if(allFamIdsInUse->presenceOfValue((*it).second))
644         famMap[(*it).first]=(*it).second;
645       else
646         {
647           ret.push_back((*it).first);
648           std::vector<std::string> grpsOnEraseFam=getGroupsOnFamily((*it).first);
649           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOnEraseFam.begin();it2!=grpsOnEraseFam.end();it2++)
650             {
651               std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=grps.find(*it2);//it3!=grps.empty() thanks to copy
652               std::vector<std::string>& famv=(*it3).second;
653               std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(famv.begin(),famv.end(),(*it).first);//it4!=famv.end() thanks to copy
654               famv.erase(it4);
655             }
656         }
657     }
658   if(!ret.empty())
659     { _families=famMap; _groups=grps; }
660   return ret;
661 }
662
663 /*!
664  * Renames a group in \a this mesh.
665  *  \param [in] oldName - a current name of the group to rename.
666  *  \param [in] newName - a new group name.
667  *  \throw If no group named \a oldName exists in \a this mesh.
668  *  \throw If a group named \a newName already exists.
669  */
670 void MEDFileMesh::changeGroupName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
671 {
672   std::string oname(oldName);
673   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
674   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
675   if(it==_groups.end())
676     {
677       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << oldName << "\" !\nAvailable groups are :";
678       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
679       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
680     }
681   std::string nname(newName);
682   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(nname);
683   if(it2!=_groups.end())
684     {
685       std::ostringstream oss; oss << "Such groupname \"" << newName << "\" already exists ! Kill it before !";
686       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
687     }
688   std::vector<std::string> cpy=(*it).second;
689   _groups.erase(it);
690   _groups[newName]=cpy;
691 }
692
693 /*!
694  * Changes an id of a family in \a this mesh. 
695  * This method calls changeFamilyIdArr().
696  *  \param [in] oldId - a current id of the family.
697  *  \param [in] newId - a new family id.
698  */
699 void MEDFileMesh::changeFamilyId(int oldId, int newId)
700 {
701   changeFamilyIdArr(oldId,newId);
702   std::map<std::string,int> fam2;
703   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
704     {
705       if((*it).second==oldId)
706         fam2[(*it).first]=newId;
707       else
708         fam2[(*it).first]=(*it).second;
709     }
710   _families=fam2;
711 }
712
713 /*!
714  * Renames a family in \a this mesh.
715  *  \param [in] oldName - a current name of the family to rename.
716  *  \param [in] newName - a new family name.
717  *  \throw If no family named \a oldName exists in \a this mesh.
718  *  \throw If a family named \a newName already exists.
719  */
720 void MEDFileMesh::changeFamilyName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
721 {
722   std::string oname(oldName);
723   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
724   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
725   if(it==_families.end())
726     {
727       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << oldName << "\" !\nAvailable families are :";
728       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
729       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
730     }
731   std::string nname(newName);
732   std::map<std::string, int >::iterator it2=_families.find(nname);
733   if(it2!=_families.end())
734     {
735       std::ostringstream oss; oss << "Such familyname \"" << newName << " already exists ! Kill it before !";
736       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
737     }
738   int cpy=(*it).second;
739   _families.erase(it);
740   _families[newName]=cpy;
741   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
742     {
743       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
744       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
745       if(it4!=v.end())
746         (*it4)=nname;
747     }
748 }
749
750 /*!
751  * Checks if \a this and another mesh contains the same families.
752  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
753  *  \param [in,out] what - an unused parameter.
754  *  \return bool - \c true if number of families and their ids are the same in the two
755  *          meshes. Families with the id == \c 0 are not considered.
756  */
757 bool MEDFileMesh::areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
758 {
759   if(_families==other->_families)
760     return true;
761   std::map<std::string,int> fam0;
762   std::map<std::string,int> fam1;
763   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
764     if((*it).second!=0)
765       fam0[(*it).first]=(*it).second;
766   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=other->_families.begin();it!=other->_families.end();it++)
767     if((*it).second!=0)
768       fam1[(*it).first]=(*it).second;
769   return fam0==fam1;
770 }
771
772 /*!
773  * Checks if \a this and another mesh contains the same groups.
774  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
775  *  \param [in,out] what - a string describing a difference of groups of the two meshes
776  *          in case if this method returns \c false.
777  *  \return bool - \c true if number of groups and families constituting them are the
778  *          same in the two meshes.
779  */
780 bool MEDFileMesh::areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
781 {
782   if(_groups==other->_groups)
783     return true;
784   bool ret=true;
785   std::size_t sz=_groups.size();
786   if(sz!=other->_groups.size())
787     {
788       what="Groups differ because not same number !\n";
789       ret=false;
790     }
791   if(ret)
792     {
793       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();
794       for(std::size_t i=0;i<sz && ret;i++,it1++)
795         {
796           std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=other->_groups.find((*it1).first);
797           if(it2!=other->_groups.end())
798             {
799               std::set<std::string> s1((*it1).second.begin(),(*it1).second.end());
800               std::set<std::string> s2((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
801               ret=(s1==s2);
802             }
803           else
804             {
805               ret=false;
806               what="A group in first mesh exists not in other !\n";
807             }
808         }
809     }
810   if(!ret)
811     {
812       std::ostringstream oss; oss << "Groups description differs :\n";
813       oss << "First group description :\n";
814       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
815         {
816           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
817           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
818             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
819         }
820       oss << "Second group description :\n";
821       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=other->_groups.begin();it!=other->_groups.end();it++)
822         {
823           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
824           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
825             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
826         }
827       what+=oss.str();
828     }
829   return ret;
830 }
831
832 /*!
833  * Checks if a group with a given name exists in \a this mesh.
834  *  \param [in] groupName - the group name.
835  *  \return bool - \c true the group \a groupName exists in \a this mesh.
836  */
837 bool MEDFileMesh::existsGroup(const std::string& groupName) const
838 {
839   std::string grpName(groupName);
840   return _groups.find(grpName)!=_groups.end();
841 }
842
843 /*!
844  * Checks if a family with a given id exists in \a this mesh.
845  *  \param [in] famId - the family id.
846  *  \return bool - \c true the family with the id \a famId exists in \a this mesh.
847  */
848 bool MEDFileMesh::existsFamily(int famId) const
849 {
850   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
851     if((*it2).second==famId)
852       return true;
853   return false;
854 }
855
856 /*!
857  * Checks if a family with a given name exists in \a this mesh.
858  *  \param [in] familyName - the family name.
859  *  \return bool - \c true the family \a familyName exists in \a this mesh.
860  */
861 bool MEDFileMesh::existsFamily(const std::string& familyName) const
862 {
863   std::string fname(familyName);
864   return _families.find(fname)!=_families.end();
865 }
866
867 /*!
868  * Sets an id of a family.
869  *  \param [in] familyName - the family name.
870  *  \param [in] id - a new id of the family.
871  */
872 void MEDFileMesh::setFamilyId(const std::string& familyName, int id)
873 {
874   std::string fname(familyName);
875   _families[fname]=id;
876 }
877
878 void MEDFileMesh::setFamilyIdUnique(const std::string& familyName, int id)
879 {
880   std::string fname(familyName);
881   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
882     if((*it).second==id)
883       {
884         if((*it).first!=familyName)
885           {
886             std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::setFamilyIdUnique : Family id #" << id << " is already belonging to family with name \"" << (*it).first << "\" !";
887             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
888           }
889       }
890   _families[fname]=id;
891 }
892
893 /*!
894  * Adds a family to \a this mesh.
895  *  \param [in] familyName - a name of the family.
896  *  \param [in] famId - an id of the family.
897  *  \throw If a family with the same name or id already exists in \a this mesh.
898  */
899 void MEDFileMesh::addFamily(const std::string& familyName, int famId)
900 {
901   std::string fname(familyName);
902   std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fname);
903   if(it==_families.end())
904     {
905       for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
906         if((*it2).second==famId)
907           {
908             std::ostringstream oss;
909             oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << (*it2).first << "\" already exists with specified id : " << famId << " !";
910             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
911           }
912       _families[fname]=famId;
913     }
914   else
915     {
916       if((*it).second!=famId)
917         {
918           std::ostringstream oss;
919           oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << fname << "\" already exists but has id set to " << (*it).second << " different from asked famId " << famId << " !";
920           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
921         }
922     }
923 }
924
925 /*!
926  * Creates a group including all mesh entities of given dimension.
927  * \warning This method does \b not guarantee that the created group includes mesh
928  * entities of only \a meshDimRelToMaxExt dimension in the case if some family id is
929  * present in family fields of different dimensions. To assure this, call
930  * ensureDifferentFamIdsPerLevel() \b before calling this method.
931  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of mesh entities to include to
932  *          the group.
933  *  \param [in] groupName - a name of the new group.
934  *  \throw If a group named \a groupName already exists.
935  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt exist in \a this mesh.
936  *  \throw If no family field of dimension \a meshDimRelToMaxExt is present in \a this mesh.
937  */
938 void MEDFileMesh::createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& groupName)
939 {
940   std::string grpName(groupName);
941   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
942   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
943     {
944       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The relative ext dimension " << meshDimRelToMaxExt << " is not available !" << std::endl;
945       oss << "Available relative ext levels are : ";
946       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
947       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
948     }
949   if(existsGroup(groupName))
950     {
951       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The groups \"" << grpName << "\" already exists in this !" << std::endl;
952       oss << "Already existing groups are : ";
953       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
954       oss << std::endl << "Please choose an another group name or call removeGroup(\"" << grpName << "\") method !";
955       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
956     }
957   const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
958   if(fieldFamIds==0)
959     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::createGroupOnAll : Family field arr ids is not defined for this level !");
960   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=fieldFamIds->getDifferentValues();
961   std::vector<std::string> familiesOnWholeGroup;
962   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
963     {
964       bool tmp;
965       familiesOnWholeGroup.push_back(findOrCreateAndGiveFamilyWithId(*it,tmp));
966     }
967   _groups[grpName]=familiesOnWholeGroup;
968 }
969
970 /*!
971  * Ensures that given family ids do not present in family fields of dimensions different
972  * than given ones. If a family id is present in the family fields of dimensions different
973  * than the given ones, a new family is created and the whole data is updated accordingly.
974  *  \param [in] famIds - a sequence of family ids to check.
975  *  \param [in] vMeshDimRelToMaxExt - a sequence of relative dimensions to which the \a
976  *          famIds should exclusively belong.
977  *  \return bool - \c true if no modification is done in \a this mesh by this method.
978  */
979 bool MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& vMeshDimRelToMaxExt)
980 {
981   std::set<int> levsInput(vMeshDimRelToMaxExt.begin(),vMeshDimRelToMaxExt.end());
982   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
983   std::set<int> levs2(levs.begin(),levs.end());
984   std::vector<int> levsToTest;
985   std::set_difference(levs2.begin(),levs2.end(),levsInput.begin(),levsInput.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(levsToTest));
986   std::set<int> famIds2(famIds.begin(),famIds.end());
987   bool ret=true;
988   int maxFamId=1;
989   if(!_families.empty())
990     maxFamId=getMaxFamilyId()+1;
991   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
992   for(std::vector<int>::const_iterator it=levsToTest.begin();it!=levsToTest.end();it++)
993     {
994       const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(*it);
995       if(fieldFamIds)
996         {
997           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds3=fieldFamIds->getDifferentValues();
998           std::vector<int> tmp;
999           std::set_intersection(famIds3->begin(),famIds3->end(),famIds2.begin(),famIds2.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(tmp));
1000           for(std::vector<int>::const_iterator it2=tmp.begin();it2!=tmp.end();it2++)
1001             {
1002               ret=false;
1003               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it2);
1004               std::ostringstream oss; oss << "Family_" << maxFamId;
1005               std::string zeName=CreateNameNotIn(oss.str(),allFams);
1006               addFamilyOnAllGroupsHaving(famName,zeName);
1007               _families[zeName]=maxFamId;
1008               (const_cast<DataArrayInt *>(fieldFamIds))->changeValue(*it2,maxFamId);
1009               maxFamId++;
1010             }
1011         }
1012     }
1013   return ret;
1014 }
1015
1016 /*!
1017  * Adds a family to a given group in \a this mesh. If the group with a given name does
1018  * not exist, it is created.
1019  *  \param [in] grpName - the name of the group to add the family in.
1020  *  \param [in] famName - the name of the family to add to the group named \a grpName.
1021  *  \throw If \a grpName or \a famName is an empty string.
1022  *  \throw If no family named \a famName is present in \a this mesh.
1023  */
1024 void MEDFileMesh::addFamilyOnGrp(const std::string& grpName, const std::string& famName)
1025 {
1026   std::string grpn(grpName);
1027   std::string famn(famName);
1028   if(grpn.empty() || famn.empty())
1029     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : input strings must be non null !");
1030   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1031   if(std::find(fams.begin(),fams.end(),famn)==fams.end())
1032     {
1033       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : Family \"" << famn << "\" does not exist !" << std::endl;
1034       oss << "Create this family or choose an existing one ! Existing fams are : ";
1035       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," ")); oss << ".";
1036       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1037     }
1038   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(grpn);
1039   if(it==_groups.end())
1040     {
1041       _groups[grpn].push_back(famn);
1042     }
1043   else
1044     {
1045       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find((*it).second.begin(),(*it).second.end(),famn);
1046       if(it2==(*it).second.end())
1047         (*it).second.push_back(famn);
1048     }
1049 }
1050
1051 /*!
1052  * This method adds to all groups lying on family with name 'famName' the other family name 'otherFamName'.
1053  * This method is quite underground because it can lead to unconsistency because family 'otherFamName' is \b not added into _families.
1054  * This method is used by MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs method.
1055  */
1056 void MEDFileMesh::addFamilyOnAllGroupsHaving(const std::string& famName, const std::string& otherFamName)
1057 {
1058   std::string famNameCpp(famName);
1059   std::string otherCpp(otherFamName);
1060   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
1061     {
1062       std::vector<std::string>& v=(*it).second;
1063       if(std::find(v.begin(),v.end(),famNameCpp)!=v.end())
1064         {
1065           v.push_back(otherCpp);
1066         }
1067     }
1068 }
1069
1070 void MEDFileMesh::changeAllGroupsContainingFamily(const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1071 {
1072   ChangeAllGroupsContainingFamily(_groups,familyNameToChange,newFamiliesNames);
1073 }
1074
1075 void MEDFileMesh::ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1076 {
1077   std::string fam(familyNameToChange);
1078   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=groups.begin();it!=groups.end();it++)
1079     {
1080       std::vector<std::string>& fams((*it).second);
1081       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find(fams.begin(),fams.end(),fam);
1082       if(it2!=fams.end())
1083         {
1084           fams.erase(it2);
1085           fams.insert(fams.end(),newFamiliesNames.begin(),newFamiliesNames.end());
1086         }
1087     }
1088 }
1089
1090 /*!
1091  * Returns a name of the family having a given id or, if no such a family exists, creates
1092  * a new uniquely named family and returns its name.
1093  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1094  *  \param [out] created - returns \c true if the new family has been created, \c false, else.
1095  *  \return std::string - the name of the existing or the created family.
1096  *  \throw If it is not possible to create a unique family name.
1097  */
1098 std::string MEDFileMesh::findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created)
1099 {
1100   return FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(_families,id,created);
1101 }
1102
1103 /*!
1104  * If it exists a family whose family id is equal to 'id' this method behaves as MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId.
1105  * In this case, 'this' internal states remains unchanged and 'created' out parameter will be set to false.
1106  * If there is no family whose family id is equal to 'id' a family is created with a name different from those
1107  * already existing. In this case 'created' will be returned with a value set to true, and internal state
1108  * will be modified.
1109  * This method will throws an exception if it is not possible to create a unique family name.
1110  */
1111 std::string MEDFileMesh::FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created)
1112 {
1113   std::vector<std::string> famAlreadyExisting(families.size());
1114   int ii=0;
1115   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++,ii++)
1116     {
1117       if((*it).second!=id)
1118         {
1119           famAlreadyExisting[ii]=(*it).first;
1120         }
1121       else
1122         {
1123           created=false;
1124           return (*it).first;
1125         }
1126     }
1127   created=true;
1128   std::ostringstream oss; oss << "Family_" << id;
1129   std::string ret=CreateNameNotIn(oss.str(),famAlreadyExisting);
1130   families[ret]=id;
1131   return ret;
1132 }
1133
1134 /*!
1135  * Sets names and ids of all families in \a this mesh.
1136  *  \param [in] info - a map of a family name to a family id.
1137  */
1138 void MEDFileMesh::setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info)
1139 {
1140   _families=info;
1141 }
1142
1143 /*!
1144  * Sets names of all groups and families constituting them in \a this mesh.
1145  *  \param [in] info - a map of a group name to a vector of names of families
1146  *          constituting the group.
1147  */
1148 void MEDFileMesh::setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info)
1149 {
1150   _groups=info;
1151 }
1152
1153 /*!
1154  * Returns an id of the family having a given name.
1155  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
1156  *  \return int - the id of the family of interest.
1157  *  \throw If no family with such a \a name exists.
1158  */
1159 int MEDFileMesh::getFamilyId(const std::string& name) const
1160 {
1161   std::string oname(name);
1162   std::map<std::string, int>::const_iterator it=_families.find(oname);
1163   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1164   if(it==_families.end())
1165     {
1166       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
1167       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1168       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1169     }
1170   return (*it).second;
1171 }
1172
1173 /*!
1174  * Returns ids of the families having given names.
1175  *  \param [in] fams - a sequence of the names of families of interest.
1176  *  \return std::vector<int> - a sequence of the ids of families of interest.
1177  *  \throw If \a fams contains a name of an inexistent family.
1178  */
1179 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& fams) const
1180 {
1181   std::vector<int> ret(fams.size());
1182   int i=0;
1183   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++,i++)
1184     {
1185       std::map<std::string, int>::const_iterator it2=_families.find(*it);
1186       if(it2==_families.end())
1187         {
1188           std::vector<std::string> fams2=getFamiliesNames();
1189           std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << *it << "\" in input list !\nAvailable families are :";
1190           std::copy(fams2.begin(),fams2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1191           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1192         }
1193       ret[i]=(*it2).second;
1194     }
1195   return ret;
1196 }
1197
1198 /*!
1199  * Returns a maximal abs(id) of families in \a this mesh.
1200  *  \return int - the maximal norm of family id.
1201  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1202  */
1203 int MEDFileMesh::getMaxAbsFamilyId() const
1204 {
1205   if(_families.empty())
1206     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1207   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1208   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1209     {
1210       ret=std::max(std::abs((*it).second),ret);
1211     }
1212   return ret;
1213 }
1214
1215 /*!
1216  * Returns a maximal id of families in \a this mesh.
1217  *  \return int - the maximal family id.
1218  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1219  */
1220 int MEDFileMesh::getMaxFamilyId() const
1221 {
1222   if(_families.empty())
1223     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1224   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1225   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1226     {
1227       ret=std::max((*it).second,ret);
1228     }
1229   return ret;
1230 }
1231
1232 /*!
1233  * Returns a minimal id of families in \a this mesh.
1234  *  \return int - the minimal family id.
1235  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1236  */
1237 int MEDFileMesh::getMinFamilyId() const
1238 {
1239   if(_families.empty())
1240     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMinFamilyId : no families set !");
1241   int ret=std::numeric_limits<int>::max();
1242   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1243     {
1244       ret=std::min((*it).second,ret);
1245     }
1246   return ret;
1247 }
1248
1249 /*!
1250  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1251  * considered but all family fields as well.
1252  *  \return int - the maximal family id.
1253  */
1254 int MEDFileMesh::getTheMaxAbsFamilyId() const
1255 {
1256   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1257   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1258     m1=std::max(std::abs((*it).second),m1);
1259   int m2=getMaxAbsFamilyIdInArrays();
1260   return std::max(m1,m2);
1261 }
1262
1263 /*!
1264  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1265  * considered but all family fields as well.
1266  *  \return int - the maximal family id.
1267  */
1268 int MEDFileMesh::getTheMaxFamilyId() const
1269 {
1270   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1271   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1272     m1=std::max((*it).second,m1);
1273   int m2=getMaxFamilyIdInArrays();
1274   return std::max(m1,m2);
1275 }
1276
1277 /*!
1278  * Returns a minimal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1279  * considered but all family fields as well.
1280  *  \return int - the minimal family id.
1281  */
1282 int MEDFileMesh::getTheMinFamilyId() const
1283 {
1284   int m1=std::numeric_limits<int>::max();
1285   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1286     m1=std::min((*it).second,m1);
1287   int m2=getMinFamilyIdInArrays();
1288   return std::min(m1,m2);
1289 }
1290
1291 /*!
1292  * This method only considers the maps. The contain of family array is ignored here.
1293  * 
1294  * \sa MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse
1295  */
1296 DataArrayInt *MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced() const
1297 {
1298   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1299   std::set<int> v;
1300   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1301     v.insert((*it).second);
1302   ret->alloc((int)v.size(),1);
1303   std::copy(v.begin(),v.end(),ret->getPointer());
1304   return ret.retn();
1305 }
1306
1307 /*!
1308  * This method does not consider map of family name, family id. Only family field array on different levels is considered.
1309  * 
1310  * \sa MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced
1311  */
1312 DataArrayInt *MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse() const
1313 {
1314   std::vector<int> famLevs=getFamArrNonEmptyLevelsExt();
1315   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret;
1316   for(std::vector<int>::const_iterator it=famLevs.begin();it!=famLevs.end();it++)
1317     {
1318       const DataArrayInt *arr=getFamilyFieldAtLevel(*it);//arr not null due to spec of getFamArrNonEmptyLevelsExt
1319       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> dv=arr->getDifferentValues();
1320       if((DataArrayInt *) ret)
1321         ret=dv->buildUnion(ret);
1322       else
1323         ret=dv;
1324     }
1325   return ret.retn();
1326 }
1327
1328 /*!
1329  * true is returned if no modification has been needed. false if family
1330  * renumbering has been needed.       
1331  */
1332 bool MEDFileMesh::ensureDifferentFamIdsPerLevel()
1333 {
1334   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1335   std::set<int> allFamIds;
1336   int maxId=getMaxFamilyId()+1;
1337   std::map<int,std::vector<int> > famIdsToRenum;
1338   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1339     {
1340       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it);
1341       if(fam)
1342         {
1343           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1344           std::set<int> r2;
1345           std::set_intersection(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r2,r2.end()));
1346           if(!r2.empty())
1347             famIdsToRenum[*it].insert(famIdsToRenum[*it].end(),r2.begin(),r2.end());
1348           std::set<int> r3;
1349           std::set_union(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r3,r3.end()));
1350         }
1351     }
1352   if(famIdsToRenum.empty())
1353     return true;
1354   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1355   for(std::map<int,std::vector<int> >::const_iterator it2=famIdsToRenum.begin();it2!=famIdsToRenum.end();it2++)
1356     {
1357       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt *>(getFamilyFieldAtLevel((*it2).first));
1358       int *famIdsToChange=fam->getPointer();
1359       std::map<int,int> ren;
1360       for(std::vector<int>::const_iterator it3=(*it2).second.begin();it3!=(*it2).second.end();it3++,maxId++)
1361         {
1362           if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1363             {
1364               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1365               std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily(famName);
1366               ren[*it3]=maxId;
1367               bool dummy;
1368               std::string newFam=findOrCreateAndGiveFamilyWithId(maxId,dummy);
1369               for(std::vector<std::string>::const_iterator it4=grps.begin();it4!=grps.end();it4++)
1370                 addFamilyOnGrp((*it4),newFam);
1371             }
1372         }
1373       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getIdsEqualList(&(*it2).second[0],&(*it2).second[0]+(*it2).second.size());
1374       for(const int *id=ids->begin();id!=ids->end();id++)
1375         famIdsToChange[*id]=ren[famIdsToChange[*id]];
1376     }
1377   return false;
1378 }
1379
1380 /*!
1381  * This method normalizes fam id with the policy explained underneath. This policy is close to those implemented in SMESH.
1382  * Level #0 famids > 0, Level #-1 famids < 0, Level #-2 famids=0, Level #1 famids=0
1383  * This policy is those used by SMESH and Trio and that is the opposite of those in MED file.
1384  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1385  * \warning This policy is the opposite of those in MED file documentation ...
1386  */
1387 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsTrio()
1388 {
1389   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1390   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1391   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1392   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1393   std::set<std::string> famsFetched;
1394   std::map<std::string,int> families;
1395   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)!=levs.end())
1396     {
1397       levsS.erase(0);
1398       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(0);
1399       if(fam)
1400         {
1401           int refId=1;
1402           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1403           std::map<int,int> ren;
1404           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1405             ren[*it]=refId;
1406           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1407           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1408           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1409             *w=ren[*w];
1410           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1411             {
1412               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1413                 {
1414                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1415                   families[famName]=ren[*it];
1416                   famsFetched.insert(famName);
1417                 }
1418             }
1419         }
1420     }
1421   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)!=levs.end())
1422     {
1423       levsS.erase(-1);
1424       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
1425       if(fam)
1426         {
1427           int refId=-1;
1428           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1429           std::map<int,int> ren;
1430           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1431             ren[*it]=refId;
1432           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1433           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1434           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1435             *w=ren[*w];
1436           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1437             {
1438               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1439                 {
1440                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1441                   families[famName]=ren[*it];
1442                   famsFetched.insert(famName);
1443                 }
1444             }
1445         }
1446     }
1447   for(std::set<int>::const_iterator it2=levsS.begin();it2!=levsS.end();it2++)
1448     {
1449       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt*>(getFamilyFieldAtLevel(*it2));
1450       if(fam)
1451         {
1452           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1453           fam->fillWithZero();
1454           for(const int *it3=tmp->begin();it3!=tmp->end();it3++)
1455             if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1456               {
1457                 std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1458                 families[famName]=0;
1459                 famsFetched.insert(famName);
1460               }
1461         }
1462     }
1463   //
1464   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1465   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1466   std::set<std::string> unFetchedIds;
1467   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1468   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1469     families[*it4]=_families[*it4];
1470   _families=families;
1471 }
1472
1473 /*!
1474  * This method normalizes fam id with the following policy.
1475  * Level #0 famids < 0, Level #-1 famids < 0 and for Level #1 famids >= 0
1476  * This policy is those defined in the MED file format but is the opposite of those implemented in SMESH and Trio.
1477  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1478  */
1479 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsMEDFile()
1480 {
1481   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1482   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1483   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1484   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1485   std::set<std::string> famsFetched;
1486   std::map<std::string,int> families;
1487   int refId=1;
1488   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),1)!=levs.end())
1489     {
1490       levsS.erase(1);
1491       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(1);
1492       if(fam)
1493         {
1494           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1495           std::map<int,int> ren;
1496           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1497             ren[*it]=refId;
1498           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1499           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1500           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1501             *w=ren[*w];
1502           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1503             {
1504               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1505                 {
1506                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1507                   families[famName]=ren[*it];
1508                   famsFetched.insert(famName);
1509                 }
1510             }
1511         }
1512     }
1513   refId=-1;
1514   for(std::set<int>::const_reverse_iterator it2=levsS.rbegin();it2!=levsS.rend();it2++)
1515     {
1516       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it2);
1517       if(fam)
1518         {
1519           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1520           std::map<int,int> ren;
1521           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1522             ren[*it]=refId;
1523           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1524           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1525           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1526             *w=ren[*w];
1527           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1528             {
1529               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1530                 {
1531                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1532                   families[famName]=ren[*it];
1533                   famsFetched.insert(famName);
1534                 }
1535             }
1536         }
1537     }
1538   //
1539   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1540   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1541   std::set<std::string> unFetchedIds;
1542   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1543   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1544     families[*it4]=_families[*it4];
1545   _families=families;
1546 }
1547
1548 /*!
1549  * Returns a name of the family by its id. If there are several families having the given
1550  * id, the name first in lexical order is returned.
1551  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1552  *  \return std::string - the name of the found family.
1553  *  \throw If no family with the given \a id exists.
1554  */
1555 std::string MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId(int id) const
1556 {
1557   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1558     if((*it).second==id)
1559       return (*it).first;
1560   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::getFamilyNameGivenId : no such family id : " << id;
1561   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1562 }
1563
1564 /*!
1565  * Returns a string describing \a this mesh. This description includes the mesh name and
1566  * the mesh description string.
1567  *  \return std::string - the mesh information string.
1568  */
1569 std::string MEDFileMesh::simpleRepr() const
1570 {
1571   std::ostringstream oss;
1572   oss << "(*************************************)\n(* GENERAL INFORMATION ON THE MESH : *)\n(*************************************)\n";
1573   oss << "- Name of the mesh : <<" << getName() << ">>\n";
1574   oss << "- Description associated to the mesh : " << getDescription() << std::endl;
1575   return oss.str();
1576 }
1577
1578 /*!
1579  * Returns ids of mesh entities contained in a given group of a given dimension.
1580  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1581  *          are required.
1582  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1583  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1584  *          returned instead of ids. 
1585  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1586  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the group. The caller
1587  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1588  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1589  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1590  */
1591 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
1592 {
1593   std::vector<std::string> tmp(1);
1594   tmp[0]=grp;
1595   DataArrayInt *ret=getGroupsArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1596   ret->setName(grp);
1597   return ret;
1598 }
1599
1600 /*!
1601  * Returns ids of mesh entities contained in given groups of a given dimension.
1602  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1603  *          are required.
1604  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1605  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1606  *          returned instead of ids.
1607  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1608  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the groups. The caller
1609  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1610  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1611  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1612  */
1613 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1614 {
1615   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
1616   return getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
1617 }
1618
1619 /*!
1620  * Returns ids of mesh entities contained in a given family of a given dimension.
1621  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1622  *          are required.
1623  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
1624  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1625  *          returned instead of ids. 
1626  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1627  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the family. The caller
1628  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1629  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1630  */
1631 DataArrayInt *MEDFileMesh::getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
1632 {
1633   std::vector<std::string> tmp(1);
1634   tmp[0]=fam;
1635   DataArrayInt *ret=getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1636   ret->setName(fam);
1637   return ret;
1638 }
1639
1640 /*!
1641  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1642  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1643  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1644  *          returned instead of ids. 
1645  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1646  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1647  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1648  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1649  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1650  */
1651 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupArr(const std::string& grp, bool renum) const
1652 {
1653   std::vector<std::string> tmp(1);
1654   tmp[0]=grp;
1655   DataArrayInt *ret=getNodeGroupsArr(tmp,renum);
1656   ret->setName(grp);
1657   return ret;
1658 }
1659
1660 /*!
1661  * Returns ids of nodes contained in given groups.
1662  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1663  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1664  *          returned instead of ids. 
1665  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1666  *          numbers, if available and required, of nodes of the groups. The caller
1667  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1668  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1669  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1670  */
1671 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1672 {
1673   return getGroupsArr(1,grps,renum);
1674 }
1675
1676 /*!
1677  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1678  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1679  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1680  *          returned instead of ids. 
1681  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1682  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1683  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1684  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1685  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1686  */
1687 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamilyArr(const std::string& fam, bool renum) const
1688 {
1689   std::vector<std::string> tmp(1);
1690   tmp[0]=fam;
1691   DataArrayInt *ret=getNodeFamiliesArr(tmp,renum);
1692   ret->setName(fam);
1693   return ret;
1694 }
1695
1696 /*!
1697  * Returns ids of nodes contained in given families.
1698  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
1699  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1700  *          returned instead of ids. 
1701  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1702  *          numbers, if available and required, of nodes of the families. The caller
1703  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1704  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1705  */
1706 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
1707 {
1708   return getFamiliesArr(1,fams,renum);
1709 }
1710
1711 /*!
1712  * Adds groups of given dimension and creates corresponding families and family fields
1713  * given ids of mesh entities of each group.
1714  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative mesh dimension of given mesh entities.
1715  *  \param [in] grps - a sequence of arrays of ids each describing a group.
1716  *  \param [in] renum - \c true means that \a grps contains not ids but optional numbers
1717  *          of mesh entities.
1718  *  \throw If names of some groups in \a grps are equal.
1719  *  \throw If \a grps includes a group with an empty name.
1720  *  \throw If \a grps includes invalid ids (or numbers if \a renum == \c true ).
1721  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
1722  */
1723 void MEDFileMesh::setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum)
1724 {
1725   if(grps.empty())
1726     return ;
1727   std::set<std::string> grpsName;
1728   std::vector<std::string> grpsName2(grps.size());
1729   int i=0;
1730
1731   for(std::vector<const DataArrayInt *>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++,i++)
1732     {
1733       grpsName.insert((*it)->getName());
1734       grpsName2[i]=(*it)->getName();
1735     }
1736   if(grpsName.size()!=grps.size())
1737     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different each other !");
1738   if(grpsName.find(std::string(""))!=grpsName.end())
1739     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different empty string !");
1740   int sz=getSizeAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
1741   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam;
1742   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
1743   if(!renum)
1744     {
1745       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps,sz,fidsOfGroups);
1746     }
1747   else
1748     {
1749       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grps2(grps.size());
1750       for(unsigned int ii=0;ii<grps.size();ii++)
1751         {
1752           grps2[ii]=MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(getRevNumberFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt),grps[ii]);
1753           grps2[ii]->setName(grps[ii]->getName());
1754         }
1755       std::vector<const DataArrayInt *> grps3(grps2.begin(),grps2.end());
1756       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps3,sz,fidsOfGroups);
1757     }
1758   int offset=1;
1759   if(!_families.empty())
1760     offset=getMaxAbsFamilyId()+1;
1761   TranslateFamilyIds(meshDimRelToMaxExt==1?offset:-offset,fam,fidsOfGroups);
1762   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getDifferentValues();
1763   appendFamilyEntries(ids,fidsOfGroups,grpsName2);
1764   setFamilyFieldArr(meshDimRelToMaxExt,fam);
1765 }
1766
1767 /*!
1768  * This method append into '_families' attribute the families whose ids are in 'famIds'. Warning 'famIds' are expected to be ids
1769  * not in '_families'. Groups information are given in parameters in order to give to families representative names.
1770  * For the moment, the two last input parameters are not taken into account.
1771  */
1772 void MEDFileMesh::appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames)
1773 {
1774   std::map<int,std::string> famInv;
1775   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
1776     {
1777       std::ostringstream oss;
1778       oss << "Family_" << (*it);
1779       _families[oss.str()]=(*it);
1780       famInv[*it]=oss.str();
1781     }
1782   int i=0;
1783   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=fidsOfGrps.begin();it1!=fidsOfGrps.end();it1++,i++)
1784     {
1785       for(std::vector<int>::const_iterator it2=(*it1).begin();it2!=(*it1).end();it2++)
1786         {
1787           _groups[grpNames[i]].push_back(famInv[*it2]);
1788         }
1789     }
1790 }
1791
1792 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileMesh::getAllGeoTypes() const
1793 {
1794   std::vector<int> levs(getNonEmptyLevels());
1795   std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
1796   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1797     {
1798       std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> elts(getGeoTypesAtLevel(*it));
1799       ret.insert(ret.end(),elts.begin(),elts.end());
1800     }
1801   return ret;
1802 }
1803
1804 std::vector<int> MEDFileMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
1805 {
1806   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> mLev(getGenMeshAtLevel(meshDimRelToMax));
1807   return mLev->getDistributionOfTypes();
1808 }
1809
1810 void MEDFileMesh::TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp)
1811 {
1812   famArr->applyLin(offset>0?1:-1,offset,0);
1813   for(std::vector< std::vector<int> >::iterator it1=famIdsPerGrp.begin();it1!=famIdsPerGrp.end();it1++)
1814     {
1815       if(offset<0)
1816         std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::negate<int>());
1817       std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),offset));
1818     }
1819 }
1820
1821 /*!
1822  * Warning no check is done on 'nameTry' in parameter. It should be non empty.
1823  * This method returns a name close to 'nameTry' so that it is not already into 'namesToAvoid'.
1824  * If this method fails to find such a name it will throw an exception.
1825  */
1826 std::string MEDFileMesh::CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid)
1827 {
1828   //attempt #0
1829   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),nameTry)==namesToAvoid.end())
1830     return nameTry;
1831   //attempt #1
1832   std::size_t len=nameTry.length();
1833   for(std::size_t ii=1;ii<len;ii++)
1834     {
1835       std::string tmp=nameTry.substr(ii,len-ii);
1836       if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp)==namesToAvoid.end())
1837         return tmp;
1838     }
1839   //attempt #2
1840   if(len>=1)
1841     {
1842       for(std::size_t i=1;i<30;i++)
1843         {
1844           std::string tmp1(nameTry.at(0),i);
1845           tmp1+=nameTry;
1846           if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp1)==namesToAvoid.end())
1847             return tmp1;
1848         }
1849     }
1850   //attempt #3
1851   std::string tmp2;
1852   for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=namesToAvoid.begin();it2!=namesToAvoid.end();it2++)
1853     tmp2+=(*it2);
1854   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp2)==namesToAvoid.end())
1855     return tmp2;
1856   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::CreateNameNotIn : impossible to find a not already used name !");
1857 }
1858
1859 int MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt)
1860 {
1861   std::size_t nbOfChunks=code.size()/3;
1862   if(code.size()%3!=0)
1863     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset : code has invalid size : should be of size 3*x !");
1864   int ret=strt;
1865   for(std::size_t i=0;i<nbOfChunks;i++)
1866     {
1867       code[3*i+2]=ret;
1868       ret+=code[3*i+1];
1869     }
1870   return ret;
1871 }
1872
1873 /*!
1874  * This method should be called by any set* method of subclasses to deal automatically with _name attribute.
1875  * If _name attribute is empty the name of 'm' if taken as _name attribute.
1876  * If _name is not empty and that 'm' has the same name nothing is done.
1877  * If _name is not emplt and that 'm' has \b NOT the same name an exception is thrown.
1878  */
1879 void MEDFileMesh::dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m)
1880 {
1881   if(!m)
1882     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : input mesh in NULL !");
1883   if(_name.empty())
1884     _name=m->getName();
1885   else
1886     {
1887       std::string name(m->getName());
1888       if(!name.empty())
1889         {
1890           if(_name!=name)
1891             {
1892               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : name of current MEDfile mesh is '" << _name << "' whereas name of input mesh is : '";
1893               oss << name << "' ! Names must match !";
1894               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1895             }
1896         }
1897     }
1898   if(_desc_name.empty())
1899     _desc_name=m->getDescription();
1900   else
1901     {
1902       std::string name(m->getDescription());
1903       if(!name.empty())
1904         {
1905           if(_desc_name!=name)
1906             {
1907               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : description of current MEDfile mesh is '" << _desc_name << "' whereas name of input mesh is : '";
1908               oss << name << "' ! Names must match !";
1909               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1910             }
1911         }
1912     }
1913 }
1914
1915 void MEDFileMesh::getFamilyRepr(std::ostream& oss) const
1916 {
1917   oss << "(**************************)\n(* FAMILIES OF THE MESH : *)\n(**************************)\n";
1918   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1919     {
1920       oss << "- Family with name \"" << (*it).first << "\" with number " << (*it).second << std::endl;
1921       oss << "  - Groups lying on this family : ";
1922       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
1923       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1924       oss << std::endl << std::endl;
1925     }
1926 }
1927
1928 /*!
1929  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1930  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
1931  * iteration.
1932  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1933  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
1934  *  \param [in] dt - the number of a time step.
1935  *  \param [in] it - the number of an iteration.
1936  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1937  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1938  *  \throw If the file is not readable.
1939  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
1940  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1941  */
1942 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1943 {
1944   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1945   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1946   return new MEDFileUMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
1947 }
1948
1949 /*!
1950  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1951  * file. The first mesh in the file is loaded.
1952  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1953  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1954  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1955  *  \throw If the file is not readable.
1956  *  \throw If there is no meshes in the file.
1957  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1958  */
1959 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1960 {
1961   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
1962   if(ms.empty())
1963     {
1964       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
1965       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1966     }
1967   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1968   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1969   int dt,it;
1970   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
1971   std::string dummy2;
1972   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
1973   return new MEDFileUMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
1974 }
1975
1976 /*!
1977  * Returns an empty instance of MEDFileUMesh.
1978  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1979  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1980  */
1981 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New()
1982 {
1983   return new MEDFileUMesh;
1984 }
1985
1986 /*!
1987  * This method loads from file with name \a fileName the mesh called \a mName as New does. The difference is that
1988  * here only a part of cells contained in the file will be loaded. The selection of cell is specified using the two consecutive parameters
1989  * \a types and \a slicPerTyp. This method allows to load from a mesh (typically huge) in a MED file a part of cells of that mesh.
1990  * The part of cells is specified using triplet (start,stop,step) for each geometric type. Only nodes lying on selected cells will be loaded to reduce
1991  * at most the memory consumtion.
1992  *
1993  * \param [in] fileName - the name of the file.
1994  * \param [in] mName - the name of the mesh to be read.
1995  * \param [in] types - the list of the geo types of which some part will be taken. A geometric type in \a types must appear only once at most.
1996  * \param [in] slicPerType - an array of size 3 times larger than \a types that specifies for each type in \a types (in the same order) resp the start, the stop and the step.
1997  * \param [in] dt - the iteration, that is to say the first element of the pair that locates the asked time step.
1998  * \param [in] it - the order, that is to say the second element of the pair that locates the asked time step.
1999  * \param [in] mrs - the request for what to be loaded.
2000  * \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2001  */
2002 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::LoadPartOf(const std::string& fileName, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2003 {
2004   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
2005   MEDFileUtilities::AutoFid fid(MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY));
2006   return MEDFileUMesh::LoadPartOf(fid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2007 }
2008
2009 /*!
2010  * Please refer to the other MEDFileUMesh::LoadPartOf method that has the same semantic and the same parameter (excepted the first).
2011  * This method is \b NOT wrapped into python.
2012  */
2013 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::LoadPartOf(med_idt fid, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2014 {
2015   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret(MEDFileUMesh::New());
2016   ret->loadPartUMeshFromFile(fid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2017   return ret.retn();
2018 }
2019
2020 std::size_t MEDFileUMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
2021 {
2022   std::size_t ret(MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren());
2023   ret+=_ms.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>));
2024   return ret;
2025 }
2026
2027 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMesh::getDirectChildrenWithNull() const
2028 {
2029   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull());
2030   ret.push_back((const DataArrayDouble*)_coords);
2031   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_coords);
2032   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_coords);
2033   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_coords);
2034   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords);
2035   ret.push_back((const PartDefinition *)_part_coords);
2036   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2037     ret.push_back((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it);
2038   return ret;
2039 }
2040
2041 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::shallowCpy() const
2042 {
2043   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2044   return ret.retn();
2045 }
2046
2047 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::createNewEmpty() const
2048 {
2049   return new MEDFileUMesh;
2050 }
2051
2052 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::deepCpy() const
2053 {
2054   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2055   if((const DataArrayDouble*)_coords)
2056     ret->_coords=_coords->deepCpy();
2057   if((const DataArrayInt*)_fam_coords)
2058     ret->_fam_coords=_fam_coords->deepCpy();
2059   if((const DataArrayInt*)_num_coords)
2060     ret->_num_coords=_num_coords->deepCpy();
2061   if((const DataArrayInt*)_rev_num_coords)
2062     ret->_rev_num_coords=_rev_num_coords->deepCpy();
2063   if((const DataArrayAsciiChar*)_name_coords)
2064     ret->_name_coords=_name_coords->deepCpy();
2065   std::size_t i=0;
2066   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
2067     {
2068       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2069         ret->_ms[i]=(*it)->deepCpy(ret->_coords);
2070     }
2071   return ret.retn();
2072 }
2073
2074 /*!
2075  * Checks if \a this and another mesh are equal.
2076  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
2077  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
2078  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
2079  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
2080  */
2081 bool MEDFileUMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
2082 {
2083   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
2084     return false;
2085   const MEDFileUMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(other);
2086   if(!otherC)
2087     {
2088       what="Mesh types differ ! This is unstructured and other is NOT !";
2089       return false;
2090     }
2091   clearNonDiscrAttributes();
2092   otherC->clearNonDiscrAttributes();
2093   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2094   const DataArrayDouble *coo2=otherC->_coords;
2095   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
2096     {
2097       what="Mismatch of coordinates ! One is defined and not other !";
2098       return false;
2099     }
2100   if(coo1)
2101     {
2102       bool ret=coo1->isEqual(*coo2,eps);
2103       if(!ret)
2104         {
2105           what="Coords differ !";
2106           return false;
2107         }
2108     }
2109   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2110   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_coords;
2111   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
2112     {
2113       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
2114       return false;
2115     }
2116   if(famc1)
2117     {
2118       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
2119       if(!ret)
2120         {
2121           what="Families arr on node differ !";
2122           return false;
2123         }
2124     }
2125   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2126   const DataArrayInt *numc2=otherC->_num_coords;
2127   if((numc1==0 && numc2!=0) || (numc1!=0 && numc2==0))
2128     {
2129       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
2130       return false;
2131     }
2132   if(numc1)
2133     {
2134       bool ret=numc1->isEqual(*numc2);
2135       if(!ret)
2136         {
2137           what="Numbering arr on node differ !";
2138           return false;
2139         }
2140     }
2141   const DataArrayAsciiChar *namec1=_name_coords;
2142   const DataArrayAsciiChar *namec2=otherC->_name_coords;
2143   if((namec1==0 && namec2!=0) || (namec1!=0 && namec2==0))
2144     {
2145       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
2146       return false;
2147     }
2148   if(namec1)
2149     {
2150       bool ret=namec1->isEqual(*namec2);
2151       if(!ret)
2152         {
2153           what="Names arr on node differ !";
2154           return false;
2155         }
2156     }
2157   if(_ms.size()!=otherC->_ms.size())
2158     {
2159       what="Number of levels differs !";
2160       return false;
2161     }
2162   std::size_t sz=_ms.size();
2163   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2164     {
2165       const MEDFileUMeshSplitL1 *s1=_ms[i];
2166       const MEDFileUMeshSplitL1 *s2=otherC->_ms[i];
2167       if((s1==0 && s2!=0) || (s1!=0 && s2==0))
2168         {
2169           what="Mismatch of presence of sub levels !";
2170           return false;
2171         }
2172       if(s1)
2173         {
2174           bool ret=s1->isEqual(s2,eps,what);
2175           if(!ret)
2176             return false;
2177         }
2178     }
2179   return true;
2180 }
2181
2182 /*!
2183  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
2184  */
2185 void MEDFileUMesh::clearNonDiscrAttributes() const
2186 {
2187   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
2188   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2189   if(coo1)
2190     (const_cast<DataArrayDouble *>(coo1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2191   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2192   if(famc1)
2193     (const_cast<DataArrayInt *>(famc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2194   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2195   if(numc1)
2196     (const_cast<DataArrayInt *>(numc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2197   const DataArrayAsciiChar *namc1=_name_coords;
2198   if(namc1)
2199     (const_cast<DataArrayAsciiChar *>(namc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2200   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2201     {
2202       const MEDFileUMeshSplitL1 *tmp=(*it);
2203       if(tmp)
2204         tmp->clearNonDiscrAttributes();
2205     }
2206 }
2207
2208 void MEDFileUMesh::setName(const std::string& name)
2209 {
2210   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2211     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2212       (*it)->setName(name);
2213   MEDFileMesh::setName(name);
2214 }
2215
2216 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh()
2217 {
2218 }
2219
2220 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2221 try
2222 {
2223     loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
2224 }
2225 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2226 {
2227     throw e;
2228 }
2229
2230 /*!
2231  * This method loads only a part of specified cells (given by range of cell ID per geometric type)
2232  * See MEDFileUMesh::LoadPartOf for detailed description.
2233  *
2234  * \sa loadUMeshFromFile
2235  */
2236 void MEDFileUMesh::loadPartUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2237 {
2238   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2239   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2240   int dummy0,dummy1;
2241   std::string dummy2;
2242   int mid(MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2));
2243   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2244     {
2245       std::ostringstream oss; oss << "loadPartUMeshFromFile : Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2246       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2247     }
2248   loaderl2.loadPart(fid,mid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2249   dispatchLoadedPart(fid,loaderl2,mName,mrs);
2250 }
2251
2252 /*!
2253  * This method loads \b all \b the \b mesh \a mName in the file with \a fid descriptor.
2254  *
2255  * \sa loadPartUMeshFromFile
2256  */
2257 void MEDFileUMesh::loadUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2258 {
2259   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2260   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2261   int dummy0,dummy1;
2262   std::string dummy2;
2263   int mid(MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2));
2264   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2265     {
2266       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2267       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2268     }
2269   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it,mrs);
2270   dispatchLoadedPart(fid,loaderl2,mName,mrs);
2271
2272 }
2273
2274 void MEDFileUMesh::dispatchLoadedPart(med_idt fid, const MEDFileUMeshL2& loaderl2, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2275 {
2276   int lev=loaderl2.getNumberOfLevels();
2277   _ms.resize(lev);
2278   for(int i=0;i<lev;i++)
2279     {
2280       if(!loaderl2.emptyLev(i))
2281         _ms[i]=new MEDFileUMeshSplitL1(loaderl2,mName,i);
2282       else
2283         _ms[i]=0;
2284     }
2285   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
2286   //
2287   setName(loaderl2.getName());
2288   setDescription(loaderl2.getDescription());
2289   setUnivName(loaderl2.getUnivName());
2290   setIteration(loaderl2.getIteration());
2291   setOrder(loaderl2.getOrder());
2292   setTimeValue(loaderl2.getTime());
2293   setTimeUnit(loaderl2.getTimeUnit());
2294   _coords=loaderl2.getCoords();
2295   if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
2296     _fam_coords=loaderl2.getCoordsFamily();
2297   if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
2298     _num_coords=loaderl2.getCoordsNum();
2299   if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
2300     _name_coords=loaderl2.getCoordsName();
2301   _part_coords=loaderl2.getPartDefOfCoo();
2302   computeRevNum();
2303 }
2304
2305 MEDFileUMesh::~MEDFileUMesh()
2306 {
2307 }
2308
2309 void MEDFileUMesh::writeLL(med_idt fid) const
2310 {
2311   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2312   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
2313   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
2314   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
2315   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
2316   int spaceDim=coo?coo->getNumberOfComponents():0;
2317   int mdim(0);
2318   if(!_ms.empty())
2319     mdim=getMeshDimension();
2320   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2321   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2322   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
2323     {
2324       std::string info=coo->getInfoOnComponent(i);
2325       std::string c,u;
2326       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
2327       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2328       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2329     }
2330   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,mdim,MED_UNSTRUCTURED_MESH,desc,"",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
2331   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
2332   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
2333   MEDFileUMeshL2::WriteCoords(fid,meshName,_iteration,_order,_time,_coords,_fam_coords,_num_coords,_name_coords);
2334   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2335     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2336       (*it)->write(fid,meshName,mdim);
2337   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,meshName,_families,_groups,_too_long_str);
2338 }
2339
2340 /*!
2341  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
2342  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2343  */
2344 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevels() const
2345 {
2346   std::vector<int> ret;
2347   int lev=0;
2348   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2349     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2350       if(!(*it)->empty())
2351         ret.push_back(lev);
2352   return ret;
2353 }
2354
2355 /*!
2356  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
2357  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2358  */
2359 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
2360 {
2361   std::vector<int> ret0=getNonEmptyLevels();
2362   if((const DataArrayDouble *) _coords)
2363     {
2364       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2365       ret[0]=1;
2366       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2367       return ret;
2368     }
2369   return ret0;
2370 }
2371
2372 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
2373 {
2374   std::vector<int> ret;
2375   const DataArrayInt *famCoo(_fam_coords);
2376   if(famCoo)
2377     ret.push_back(1);
2378   int lev=0;
2379   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2380     {
2381       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2382       if(cur)
2383         if(cur->getFamilyField())
2384           ret.push_back(lev);
2385     }
2386   return ret;
2387 }
2388
2389 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
2390 {
2391   std::vector<int> ret;
2392   const DataArrayInt *numCoo(_num_coords);
2393   if(numCoo)
2394     ret.push_back(1);
2395   int lev=0;
2396   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2397     {
2398       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2399       if(cur)
2400         if(cur->getNumberField())
2401           ret.push_back(lev);
2402     }
2403   return ret;
2404 }
2405
2406 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
2407 {
2408   std::vector<int> ret;
2409   const DataArrayAsciiChar *nameCoo(_name_coords);
2410   if(nameCoo)
2411     ret.push_back(1);
2412   int lev=0;
2413   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2414     {
2415       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2416       if(cur)
2417         if(cur->getNameField())
2418           ret.push_back(lev);
2419     }
2420   return ret;
2421 }
2422
2423 /*!
2424  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given group is defined.
2425  * To include nodes, call getGrpNonEmptyLevelsExt() method.
2426  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2427  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2428  */
2429 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevels(const std::string& grp) const
2430 {
2431   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2432   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2433 }
2434
2435 /*!
2436  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given group is defined.
2437  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2438  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2439  */
2440 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevelsExt(const std::string& grp) const
2441 {
2442   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2443   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2444 }
2445
2446 /*!
2447  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given family is defined.
2448  * To include nodes, call getFamNonEmptyLevelsExt() method.
2449  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2450  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2451  */
2452 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevels(const std::string& fam) const
2453 {
2454   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2455   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2456 }
2457
2458 /*!
2459  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given family is defined.
2460  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2461  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2462  */
2463 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevelsExt(const std::string& fam) const
2464 {
2465   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2466   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2467 }
2468
2469 /*!
2470  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given groups are defined.
2471  * To include nodes, call getGrpsNonEmptyLevelsExt() method.
2472  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2473  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2474  */
2475 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const
2476 {
2477   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2478   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2479 }
2480
2481 /*!
2482  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given groups are defined.
2483  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2484  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2485  */
2486 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const
2487 {
2488   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2489   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2490 }
2491
2492 /*!
2493  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given families are defined.
2494  * To include nodes, call getFamsNonEmptyLevelsExt() method.
2495  *  \param [in] fams - the name of the family of interest.
2496  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2497  */
2498 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const
2499 {
2500   std::vector<int> ret;
2501   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
2502   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2503   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
2504     if(_ms[-(*it)]->presenceOfOneFams(famIds))
2505       ret.push_back(*it);
2506   return ret;
2507 }
2508
2509 /*!
2510  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given families are defined.
2511  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2512  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2513  */
2514 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const
2515 {
2516   std::vector<int> ret0=getFamsNonEmptyLevels(fams);
2517   const DataArrayInt *famCoords=_fam_coords;
2518   if(!famCoords)
2519     return ret0;
2520   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2521   if(famCoords->presenceOfValue(famIds))
2522     {
2523       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2524       ret[0]=1;
2525       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2526       return ret;
2527     }
2528   else
2529     return ret0;
2530 }
2531
2532 /*!
2533  * Returns names of groups that partly or fully appear on the level \a meshDimRelToMaxExt.
2534  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of interest.
2535  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names at \a meshDimRelToMaxExt
2536  *          level. 
2537  */
2538 std::vector<std::string> MEDFileUMesh::getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const
2539 {
2540   std::vector<std::string> ret;
2541   std::vector<std::string> allGrps=getGroupsNames();
2542   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=allGrps.begin();it!=allGrps.end();it++)
2543     {
2544       std::vector<int> levs=getGrpNonEmptyLevelsExt((*it));
2545       if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)!=levs.end())
2546         ret.push_back(*it);
2547     }
2548   return ret;
2549 }
2550
2551 int MEDFileUMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
2552 {
2553   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2554   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2555     {
2556       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2557       ret=std::max(ret,std::abs(val));
2558     }
2559   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2560     {
2561       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2562         {
2563           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2564           if(da)
2565             {
2566               int val=da->getMaxValue(tmp);
2567               ret=std::max(ret,std::abs(val));
2568             }
2569         }
2570     }
2571   return ret;
2572 }
2573
2574 int MEDFileUMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
2575 {
2576   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2577   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2578     {
2579       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2580       ret=std::max(ret,val);
2581     }
2582   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2583     {
2584       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2585         {
2586           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2587           if(da)
2588             {
2589               int val=da->getMaxValue(tmp);
2590               ret=std::max(ret,val);
2591             }
2592         }
2593     }
2594   return ret;
2595 }
2596
2597 int MEDFileUMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
2598 {
2599   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2600   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2601     {
2602       int val=_fam_coords->getMinValue(tmp);
2603       ret=std::min(ret,val);
2604     }
2605   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2606     {
2607       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2608         {
2609           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2610           if(da)
2611             {
2612               int val=da->getMinValue(tmp);
2613               ret=std::min(ret,val);
2614             }
2615         }
2616     }
2617   return ret;
2618 }
2619
2620 /*!
2621  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
2622  *  \return int - the mesh dimension.
2623  *  \throw If there are no cells in this mesh.
2624  */
2625 int MEDFileUMesh::getMeshDimension() const
2626 {
2627   int lev=0;
2628   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev++)
2629     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2630       return (*it)->getMeshDimension()+lev;
2631   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getMeshDimension : impossible to find a mesh dimension !");
2632 }
2633
2634 /*!
2635  * Returns the space dimension of \a this mesh that is equal to number of components in
2636  * the node coordinates array.
2637  *  \return int - the space dimension of \a this mesh.
2638  *  \throw If the node coordinates array is not available.
2639  */
2640 int MEDFileUMesh::getSpaceDimension() const
2641 {
2642   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2643   if(!coo)
2644     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getSpaceDimension : no coords set !");
2645   return coo->getNumberOfComponents();
2646 }
2647
2648 /*!
2649  * Returns a string describing \a this mesh.
2650  *  \return std::string - the mesh information string.
2651  */
2652 std::string MEDFileUMesh::simpleRepr() const
2653 {
2654   std::ostringstream oss;
2655   oss << MEDFileMesh::simpleRepr();
2656   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2657   oss << "- The dimension of the space is ";
2658   static const char MSG1[]= "*** NO COORDS SET ***";
2659   static const char MSG2[]= "*** NO CONNECTIVITY SET FOR THIS LEVEL***";
2660   if(coo)
2661     oss << _coords->getNumberOfComponents() << std::endl;
2662   else
2663     oss << MSG1 << std::endl;
2664   oss << "- Type of the mesh : UNSTRUCTURED\n";
2665   oss << "- Number of nodes : ";
2666   if(coo)
2667     oss << _coords->getNumberOfTuples() << std::endl;
2668   else
2669     oss << MSG1 << std::endl;
2670   std::size_t nbOfLev=_ms.size();
2671   oss << "- Number of levels allocated : " << nbOfLev << std::endl;
2672   for(std::size_t i=0;i<nbOfLev;i++)
2673     {
2674       const MEDFileUMeshSplitL1 *lev=_ms[i];
2675       oss << "  - Level #" << -((int) i) << " has dimension : ";
2676       if(lev)
2677         {
2678           oss << lev->getMeshDimension() << std::endl;
2679           lev->simpleRepr(oss);
2680         }
2681       else
2682         oss << MSG2 << std::endl;
2683     }
2684   oss << "- Number of families : " << _families.size() << std::endl << std::endl;
2685   if(coo)
2686     {
2687       oss << "(***********************)\n(* NODES OF THE MESH : *)\n(***********************)\n";
2688       oss << "- Names of coordinates :" << std::endl;
2689       std::vector<std::string> vars=coo->getVarsOnComponent();
2690       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2691       oss << std::endl << "- Units of coordinates : " << std::endl;
2692       std::vector<std::string> units=coo->getUnitsOnComponent();
2693       std::copy(units.begin(),units.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2694     }
2695   oss << std::endl << std::endl;
2696   getFamilyRepr(oss);
2697   return oss.str();
2698 }
2699
2700 /*!
2701  * Returns a full textual description of \a this mesh.
2702  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
2703  */
2704 std::string MEDFileUMesh::advancedRepr() const
2705 {
2706   return simpleRepr();
2707 }
2708
2709 /*!
2710  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
2711  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2712  *  \return int - the number of entities.
2713  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
2714  */
2715 int MEDFileUMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2716 {
2717   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2718     {
2719       if(!((const DataArrayDouble *)_coords))
2720         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getSizeAtLevel : no coordinates specified !");
2721       return _coords->getNumberOfTuples();
2722     }
2723   return getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt)->getSize();
2724 }
2725
2726 /*!
2727  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
2728  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2729  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
2730  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
2731  */
2732 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2733 {
2734   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2735     return _fam_coords;
2736   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2737   return l1->getFamilyField();
2738 }
2739
2740 /*!
2741  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
2742  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2743  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
2744  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2745  */
2746 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2747 {
2748   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2749     return _num_coords;
2750   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2751   return l1->getNumberField();
2752 }
2753
2754 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2755 {
2756   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2757     return _name_coords;
2758   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2759   return l1->getNameField();
2760 }
2761
2762 /*!
2763  * This method returns for a specified relative level \a meshDimRelToMaxExt the part effectively read (if the instance is the result of the read of a file).
2764  *
2765  * \param [in] meshDimRelToMaxExt - the extended relative level for which the part definition is requested.
2766  * \param [in] gt - The input geometric type for which the part definition is requested.
2767  * \return the part definition owned by \a this. So no need to deallocate the returned instance.
2768  */
2769 const PartDefinition *MEDFileUMesh::getPartDefAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
2770 {
2771   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2772     return _part_coords;
2773   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt));
2774   return l1->getPartDef(gt);
2775 }
2776
2777 int MEDFileUMesh::getNumberOfNodes() const
2778 {
2779   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2780   if(!coo)
2781     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getNumberOfNodes : no coords set !");
2782   return coo->getNumberOfTuples();
2783 }
2784
2785 bool MEDFileUMesh::hasImplicitPart() const
2786 {
2787   return false;
2788 }
2789
2790 int MEDFileUMesh::buildImplicitPartIfAny(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
2791 {
2792   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::buildImplicitPartIfAny : unstructured meshes do not have implicit part !");
2793 }
2794
2795 void MEDFileUMesh::releaseImplicitPartIfAny() const
2796 {
2797 }
2798
2799 void MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
2800 {
2801   std::size_t sz(st.getNumberOfItems());
2802   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2803     {
2804       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType curGt(st[i].getGeo());
2805       const MEDCoupling1GTUMesh *m(getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(curGt));
2806       if(st[i].getPflName().empty())
2807         m->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2808       else
2809         {
2810           const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[i].getPflName()));
2811           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m2(dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(m->buildPartOfMySelf(arr->begin(),arr->end(),true)));
2812           m2->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2813         }
2814     }
2815 }
2816
2817 /*!
2818  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
2819  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2820  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2821  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
2822  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2823  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2824  */
2825 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2826 {
2827   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2828     {
2829       if(!((const DataArrayInt *)_num_coords))
2830         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no coordinates renum specified !");
2831       return _rev_num_coords;
2832     }
2833   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2834   return l1->getRevNumberField();
2835 }
2836
2837 /*!
2838  * Returns a pointer to the node coordinates array of \a this mesh \b without
2839  * incrementing its reference counter, thus there is no need to decrRef() it by the caller.
2840  */
2841 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::getCoords() const
2842 {
2843   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp(_coords);
2844   if((DataArrayDouble *)tmp)
2845     {
2846       return tmp;
2847     }
2848   return 0;
2849 }
2850
2851 /*!
2852  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2853  * group of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2854  * new mesh.
2855  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2856  *  \param [in] grp - the name of the group whose mesh entities are included in the
2857  *          new mesh.
2858  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2859  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2860  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2861  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2862  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
2863  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2864  */
2865 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
2866 {
2867   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2868   std::vector<std::string> tmp(1);
2869   tmp[0]=grp;
2870   return getGroups(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2871 }
2872
2873 /*!
2874  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2875  * groups of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2876  * new mesh.
2877  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2878  *  \param [in] grps - a sequence of group names whose mesh entities are included in the
2879  *          new mesh.
2880  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2881  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2882  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2883  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2884  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
2885  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2886  */
2887 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
2888 {
2889   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2890   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
2891   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet=getFamilies(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
2892   if(grps.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2893     zeRet->setName(grps[0]);
2894   return zeRet.retn();
2895 }
2896
2897 /*!
2898  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2899  * family of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2900  * new mesh.
2901  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2902  *  \param [in] fam - the name of the family whose mesh entities are included in the
2903  *          new mesh.
2904  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2905  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2906  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2907  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2908  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a grps.
2909  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2910  */
2911 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
2912 {
2913   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2914   std::vector<std::string> tmp(1);
2915   tmp[0]=fam;
2916   return getFamilies(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2917 }
2918
2919 /*!
2920  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2921  * families of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2922  * new mesh.
2923  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2924  *  \param [in] fams - a sequence of family names whose mesh entities are included in the
2925  *          new mesh.
2926  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2927  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2928  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2929  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2930  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a fams.
2931  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2932  */
2933 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2934 {
2935   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2936   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2937     {
2938       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr=getFamiliesArr(1,fams,renum);
2939       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New();
2940       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> c=_coords->selectByTupleId(arr->getConstPointer(),arr->getConstPointer()+arr->getNbOfElems());
2941       ret->setCoords(c);
2942       return ret.retn();
2943     }
2944   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2945   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2946   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet;
2947   if(!famIds.empty())
2948     zeRet=l1->getFamilyPart(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2949   else
2950     zeRet=l1->getFamilyPart(0,0,renum);
2951   if(fams.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2952     zeRet->setName(fams[0]);
2953   return zeRet.retn();
2954 }
2955
2956 /*!
2957  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
2958  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
2959  *          are required.
2960  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2961  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
2962  *          returned instead of ids.
2963  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
2964  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
2965  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
2966  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
2967  */
2968 DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2969 {
2970   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2971   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2972     {
2973       if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2974         {
2975           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
2976           if(!famIds.empty())
2977             da=_fam_coords->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
2978           else
2979             da=_fam_coords->getIdsEqualList(0,0);
2980           if(renum)
2981             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_coords,da);
2982           else
2983             return da.retn();
2984         }
2985       else
2986         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
2987     }
2988   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2989   if(!famIds.empty())
2990     return l1->getFamilyPartArr(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2991   else
2992     return l1->getFamilyPartArr(0,0,renum);
2993 }
2994
2995 /*!
2996  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2997  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2998  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2999  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
3000  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
3001  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3002  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3003  *          optional numbers of mesh entities.
3004  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3005  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3006  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3007  * \sa getGenMeshAtLevel()
3008  */
3009 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum) const
3010 {
3011   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
3012   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3013     {
3014       if(!renum)
3015         {
3016           MEDCouplingUMesh *umesh=MEDCouplingUMesh::New();
3017           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> cc=_coords->deepCpy();
3018           umesh->setCoords(cc);
3019           MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(umesh);
3020           umesh->setName(getName());
3021           return umesh;
3022         }
3023     }
3024   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3025   return l1->getWholeMesh(renum);
3026 }
3027
3028 /*!
3029  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
3030  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
3031  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
3032  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
3033  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
3034  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3035  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3036  *          optional numbers of mesh entities.
3037  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3038  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3039  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMax dimension in \a this mesh.
3040  * \sa getMeshAtLevel()
3041  */
3042 MEDCouplingMesh *MEDFileUMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
3043 {
3044   return getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3045 }
3046
3047 std::vector<int> MEDFileUMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
3048 {
3049   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3050   return l1->getDistributionOfTypes();
3051 }
3052
3053 /*!
3054  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == 0.
3055  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3056  *          optional numbers of mesh entities.
3057  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3058  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3059  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == 0 in \a this mesh.
3060  */
3061 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevel0Mesh(bool renum) const
3062 {
3063   return getMeshAtLevel(0,renum);
3064 }
3065
3066 /*!
3067  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -1.
3068  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3069  *          optional numbers of mesh entities.
3070  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3071  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3072  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -1 in \a this mesh.
3073  */
3074 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM1Mesh(bool renum) const
3075 {
3076   return getMeshAtLevel(-1,renum);
3077 }
3078
3079 /*!
3080  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -2.
3081  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3082  *          optional numbers of mesh entities.
3083  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3084  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3085  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -2 in \a this mesh.
3086  */
3087 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM2Mesh(bool renum) const
3088 {
3089   return getMeshAtLevel(-2,renum);
3090 }
3091
3092 /*!
3093  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -3.
3094  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3095  *          optional numbers of mesh entities.
3096  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3097  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3098  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -3 in \a this mesh.
3099  */
3100 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM3Mesh(bool renum) const
3101 {
3102   return getMeshAtLevel(-3,renum);
3103 }
3104
3105 /*!
3106  * This method is for advanced users. There is two storing strategy of mesh in \a this.
3107  * Either MEDCouplingUMesh, or vector of MEDCoupling1GTUMesh instances.
3108  * When assignement is done the first one is done, which is not optimal in write mode for MED file.
3109  * This method allows to switch from MEDCouplingUMesh mode to MEDCoupling1GTUMesh mode.
3110  */
3111 void MEDFileUMesh::forceComputationOfParts() const
3112 {
3113   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3114     {
3115       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3116       if(elt)
3117         elt->forceComputationOfParts();
3118     }
3119 }
3120
3121 /*!
3122  * This method returns a vector of mesh parts containing each exactly one geometric type.
3123  * This method will never launch an automatic computation of split by type (an INTERP_KERNEL::Exception will be then thrown).
3124  * This method is only for memory aware users.
3125  * The returned pointers are **NOT** new object pointer. No need to mange them.
3126  */
3127 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(int meshDimRelToMax) const
3128 {
3129   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3130   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes();
3131 }
3132
3133 /*!
3134  * This method returns the part of \a this having the geometric type \a gt.
3135  * If such part is not existing an exception will be thrown.
3136  * The returned pointer is **NOT** new object pointer. No need to mange it.
3137  */
3138 MEDCoupling1GTUMesh *MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3139 {
3140   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3141   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3142   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3143   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(gt);
3144 }
3145
3146 /*!
3147  * Given a relative level \a meshDimRelToMax it returns the sorted vector of geometric types present in \a this.
3148  * \throw if the reqsuested \a meshDimRelToMax does not exist.
3149  */
3150 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
3151 {
3152   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3153   return sp->getGeoTypes();
3154 }
3155
3156 /*!
3157  * This method extracts from whole family field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3158  * \param [in] gt - the geometric type for which the family field is asked.
3159  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3160  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3161  * \sa MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType
3162  */
3163 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3164 {
3165   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3166   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3167   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3168   return sp->extractFamilyFieldOnGeoType(gt);
3169 }
3170
3171 /*!
3172  * This method extracts from whole number field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3173  * \param [in] gt - the geometric type for which the number field is asked.
3174  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3175  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3176  * \sa MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType
3177  */
3178 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3179 {
3180   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3181   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3182   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3183   return sp->extractNumberFieldOnGeoType(gt);
3184 }
3185
3186 /*!
3187  * This method returns for specified geometric type \a gt the relative level to \a this.
3188  * If the relative level is empty an exception will be thrown.
3189  */
3190 int MEDFileUMesh::getRelativeLevOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3191 {
3192   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3193   int ret((int)cm.getDimension()-getMeshDimension());
3194   getMeshAtLevSafe(ret);//To test that returned value corresponds to a valid level.
3195   return ret;
3196 }
3197
3198 const MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const
3199 {
3200   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3201     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3202   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3203     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3204   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3205   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3206     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3207   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3208     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3209   return _ms[tracucedRk];
3210 }
3211
3212 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt)
3213 {
3214   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3215     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3216   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3217     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3218   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3219   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3220     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3221   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3222     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3223   return _ms[tracucedRk];
3224 }
3225
3226 void MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const
3227 {
3228   if(-meshDimRelToMax>=(int)_ms.size())
3229     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : The meshdim of mesh is not managed by 'this' !");
3230   int i=0;
3231   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
3232     {
3233       if(((const MEDFileUMeshSplitL1*) (*it))!=0)
3234         {
3235           int ref=(*it)->getMeshDimension();
3236           if(ref+i!=meshDim-meshDimRelToMax)
3237             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : no coherency between levels !");
3238         }
3239     }
3240 }
3241
3242 /*!
3243  * Sets the node coordinates array of \a this mesh.
3244  *  \param [in] coords - the new node coordinates array.
3245  *  \throw If \a coords == \c NULL.
3246  */
3247 void MEDFileUMesh::setCoords(DataArrayDouble *coords)
3248 {
3249   if(!coords)
3250     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setCoords : null pointer in input !");
3251   coords->checkAllocated();
3252   int nbOfTuples=coords->getNumberOfTuples();
3253   _coords=coords;
3254   coords->incrRef();
3255   _fam_coords=DataArrayInt::New();
3256   _fam_coords->alloc(nbOfTuples,1);
3257   _fam_coords->fillWithZero();
3258   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3259     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3260       (*it)->setCoords(coords);
3261 }
3262
3263 /*!
3264  * Removes all groups of a given dimension in \a this mesh.
3265  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
3266  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3267  */
3268 void MEDFileUMesh::eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt)
3269 {
3270   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3271     {
3272       if((DataArrayInt *)_fam_coords)
3273         _fam_coords->fillWithZero();
3274       return ;
3275     }
3276   MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3277   l1->eraseFamilyField();
3278   optimizeFamilies();
3279 }
3280
3281 /*!
3282  * Removes all families with ids not present in the family fields of \a this mesh.
3283  */
3284 void MEDFileUMesh::optimizeFamilies()
3285 {
3286   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3287   std::set<int> allFamsIds;
3288   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
3289     {
3290       const DataArrayInt *ffield=getFamilyFieldAtLevel(*it);
3291       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=ffield->getDifferentValues();
3292       std::set<int> res;
3293       std::set_union(ids->begin(),ids->end(),allFamsIds.begin(),allFamsIds.end(),std::inserter(res,res.begin()));
3294       allFamsIds=res;
3295     }
3296   std::set<std::string> famNamesToKill;
3297   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
3298     {
3299       if(allFamsIds.find((*it).second)!=allFamsIds.end())
3300         famNamesToKill.insert((*it).first);
3301     }
3302   for(std::set<std::string>::const_iterator it=famNamesToKill.begin();it!=famNamesToKill.end();it++)
3303     _families.erase(*it);
3304   std::vector<std::string> grpNamesToKill;
3305   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
3306     {
3307       std::vector<std::string> tmp;
3308       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
3309         {
3310           if(famNamesToKill.find(*it2)==famNamesToKill.end())
3311             tmp.push_back(*it2);
3312         }
3313       if(!tmp.empty())
3314         (*it).second=tmp;
3315       else
3316         tmp.push_back((*it).first);
3317     }
3318   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grpNamesToKill.begin();it!=grpNamesToKill.end();it++)
3319     _groups.erase(*it);
3320 }
3321
3322 void MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group(const std::string& grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified)
3323 {
3324   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3325   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)==levs.end() || std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)==levs.end())
3326     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : This method works only for mesh definied on level 0 and -1 !");
3327   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m0=getMeshAtLevel(0);
3328   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1=getMeshAtLevel(-1);
3329   int nbNodes=m0->getNumberOfNodes();
3330   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m11=getGroup(-1,grpNameM1);
3331   DataArrayInt *tmp00=0,*tmp11=0,*tmp22=0;
3332   m0->findNodesToDuplicate(*m11,tmp00,tmp11,tmp22);
3333   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nodeIdsToDuplicate(tmp00);
3334   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn0(tmp11);
3335   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn1(tmp22);
3336   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m0->buildPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),true));
3337   // node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group 'grpNameM1' on level -1
3338   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> descTmp0=DataArrayInt::New(),descITmp0=DataArrayInt::New(),revDescTmp0=DataArrayInt::New(),revDescITmp0=DataArrayInt::New();
3339   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0Desc=tmp0->buildDescendingConnectivity(descTmp0,descITmp0,revDescTmp0,revDescITmp0);
3340   descTmp0=0; descITmp0=0; revDescTmp0=0; revDescITmp0=0;
3341   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW2=tmp0Desc->getCellIdsLyingOnNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),false);
3342   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> cellsInM1ToRenumW3=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(tmp0Desc->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenumW2->begin(),cellsInM1ToRenumW2->end(),true));
3343   DataArrayInt *cellsInM1ToRenumW4Tmp=0;
3344   m1->areCellsIncludedIn(cellsInM1ToRenumW3,2,cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3345   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW4(cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3346   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW5=cellsInM1ToRenumW4->getIdsInRange(0,m1->getNumberOfCells());
3347   cellsInM1ToRenumW5->transformWithIndArr(cellsInM1ToRenumW4->begin(),cellsInM1ToRenumW4->end());
3348   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpIds=getGroupArr(-1,grpNameM1);
3349   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenum=cellsInM1ToRenumW5->buildSubstraction(grpIds);
3350   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1Part=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),true));
3351   m1Part->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes);
3352   m1->setPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),*m1Part);
3353   // end of node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group of level -1 'grpNameM1'
3354   tmp0->duplicateNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end());
3355   m0->setCoords(tmp0->getCoords());
3356   m0->setPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),*tmp0);
3357   m1->setCoords(m0->getCoords());
3358   _coords=m0->getCoords(); _coords->incrRef();
3359   // duplication of cells in group 'grpNameM1' on level -1
3360   m11->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes); m11->setCoords(m0->getCoords());
3361   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> v(2); v[0]=m1; v[1]=m11;
3362   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> newm1=MEDCouplingUMesh::AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(v,tmp00,tmp11);
3363   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> szOfCellGrpOfSameType(tmp00);
3364   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idInMsOfCellGrpOfSameType(tmp11);
3365   //
3366   newm1->setName(getName());
3367   const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
3368   if(!fam)
3369     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : internal problem !");
3370   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFam=DataArrayInt::New();
3371   newFam->alloc(newm1->getNumberOfCells(),1);
3372   int idd=getMaxFamilyId()+1;
3373   int globStart=0,start=0,end,globEnd;
3374   int nbOfChunks=szOfCellGrpOfSameType->getNumberOfTuples();
3375   for(int i=0;i<nbOfChunks;i++)
3376     {
3377       globEnd=globStart+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3378       if(idInMsOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0)==0)
3379         {
3380           end=start+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3381           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> part=fam->selectByTupleId2(start,end,1);
3382           newFam->setPartOfValues1(part,globStart,globEnd,1,0,1,1,true);
3383           start=end;
3384         }
3385       else
3386         {
3387           newFam->setPartOfValuesSimple1(idd,globStart,globEnd,1,0,1,1);
3388         }
3389       globStart=globEnd;
3390     }
3391   newm1->setCoords(getCoords());
3392   setMeshAtLevel(-1,newm1);
3393   setFamilyFieldArr(-1,newFam);
3394   std::string grpName2(grpNameM1); grpName2+="_dup";
3395   addFamily(grpName2,idd);
3396   addFamilyOnGrp(grpName2,grpName2);
3397   //
3398   fam=_fam_coords;
3399   if(fam)
3400     {
3401       int newNbOfNodes=getCoords()->getNumberOfTuples();
3402       newFam=DataArrayInt::New(); newFam->alloc(newNbOfNodes,1);
3403       newFam->setPartOfValues1(fam,0,nbNodes,1,0,1,1,true);
3404       newFam->setPartOfValuesSimple1(0,nbNodes,newNbOfNodes,1,0,1,1);
3405       _fam_coords=newFam;
3406     }
3407   nodesDuplicated=nodeIdsToDuplicate.retn();
3408   cellsModified=cellsToModifyConn0.retn();
3409   cellsNotModified=cellsToModifyConn1.retn();
3410 }
3411
3412 /*!
3413  * \param [out] oldCode retrieves the distribution of types before the call if true is returned
3414  * \param [out] newCode etrieves the distribution of types after the call if true is returned
3415  * \param [out] o2nRenumCell tells for **all levels** the old 2 new renumbering of cells.
3416  * 
3417  * \return false if no modification has been performed linked to the unpolyzation. Neither cell type, not cell numbers. When false is returned no need of field on cells or on gauss renumbering.
3418  * Inversely, if true is returned, it means that distribution of cell by geometric type has changed and field on cell and field on gauss point must be renumbered.
3419  */
3420 bool MEDFileUMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
3421 {
3422   o2nRenumCell=0; oldCode.clear(); newCode.clear();
3423   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3424   bool ret=false;
3425   std::vector< const DataArrayInt* > renumCellsSplited;//same than memorySaverIfThrow
3426   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > memorySaverIfThrow;//same than renumCellsSplited only in case of throw
3427   int start=0;
3428   int end=0;
3429   for(std::vector<int>::reverse_iterator it=levs.rbegin();it!=levs.rend();it++)
3430     {
3431       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*it);
3432       std::vector<int> code1=m->getDistributionOfTypes();
3433       end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code1,start);
3434       oldCode.insert(oldCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3435       bool hasChanged=m->unPolyze();
3436       DataArrayInt *fake=0;
3437       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart=m->getLevArrPerCellTypes(MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER,
3438           MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER+MEDCouplingUMesh::N_MEDMEM_ORDER,fake);
3439       fake->decrRef();
3440       renumCellsSplited.push_back(o2nCellsPart); memorySaverIfThrow.push_back(o2nCellsPart);
3441       if(hasChanged)
3442         {
3443           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart2=o2nCellsPart->buildPermArrPerLevel();
3444           m->renumberCells(o2nCellsPart2->getConstPointer(),false);
3445           ret=true;
3446           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famField2,numField2;
3447           const DataArrayInt *famField=getFamilyFieldAtLevel(*it); if(famField) { famField->incrRef(); famField2=const_cast<DataArrayInt *>(famField); }
3448           const DataArrayInt *numField=getNumberFieldAtLevel(*it); if(numField) { numField->incrRef(); numField2=const_cast<DataArrayInt *>(numField); }
3449           setMeshAtLevel(*it,m);
3450           std::vector<int> code2=m->getDistributionOfTypes();
3451           end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code2,start);
3452           newCode.insert(newCode.end(),code2.begin(),code2.end());
3453           //
3454           if(o2nCellsPart2->isIdentity())
3455             continue;
3456           if(famField)
3457             {
3458               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamField=famField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3459               setFamilyFieldArr(*it,newFamField);
3460             }
3461           if(numField)
3462             {
3463               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumField=numField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3464               setRenumFieldArr(*it,newNumField);
3465             }
3466         }
3467       else
3468         {
3469           newCode.insert(newCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3470         }
3471       start=end;
3472     }
3473   if(ret)
3474     {
3475       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> renumCells=DataArrayInt::Aggregate(renumCellsSplited);
3476       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nRenumCellRet=renumCells->buildPermArrPerLevel();
3477       o2nRenumCell=o2nRenumCellRet.retn();
3478     }
3479   return ret;
3480 }
3481
3482 struct MEDLoaderAccVisit1
3483 {
3484   MEDLoaderAccVisit1():_new_nb_of_nodes(0) { }
3485   int operator()(bool val) { return val?_new_nb_of_nodes++:-1; }
3486   int _new_nb_of_nodes;
3487 };
3488
3489 /*!
3490  * Array returned is the correspondance in \b old \b to \b new format. The returned array is newly created and should be dealt by the caller.
3491  * The maximum value stored in returned array is the number of nodes of \a this minus 1 after call of this method.
3492  * The size of returned array is the number of nodes of the old (previous to the call of this method) number of nodes.
3493  * -1 values in returned array means that the corresponding old node is no more used.
3494  *
3495  * \return newly allocated array containing correspondance in \b old \b to \b new format. If all nodes in \a this are fetched \c NULL pointer is returned and nothing
3496  *         is modified in \a this.
3497  * \throw If no coordinates are set in \a this or if there is in any available mesh in \a this a cell having a nodal connectivity containing a node id not in the range of
3498  *  set coordinates.
3499  */
3500 DataArrayInt *MEDFileUMesh::zipCoords()
3501 {
3502   const DataArrayDouble *coo(getCoords());
3503   if(!coo)
3504     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::zipCoords : no coordinates set in this !");
3505   int nbOfNodes(coo->getNumberOfTuples());
3506   std::vector<bool> nodeIdsInUse(nbOfNodes,false);
3507   std::vector<int> neLevs(getNonEmptyLevels());
3508   for(std::vector<int>::const_iterator lev=neLevs.begin();lev!=neLevs.end();lev++)
3509     {
3510       const MEDFileUMeshSplitL1 *zeLev(getMeshAtLevSafe(*lev));
3511       if(zeLev->isMeshStoredSplitByType())
3512         {
3513           std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ms(zeLev->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes());
3514           for(std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3515             if(*it)
3516               (*it)->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3517         }
3518       else
3519         {
3520           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> mesh(zeLev->getWholeMesh(false));
3521           mesh->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3522         }
3523     }
3524   int nbrOfNodesInUse((int)std::count(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),true));
3525   if(nbrOfNodesInUse==nbOfNodes)
3526     return 0;//no need to update _part_coords
3527   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New()); ret->alloc(nbOfNodes,1);
3528   std::transform(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),ret->getPointer(),MEDLoaderAccVisit1());
3529   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2(ret->invertArrayO2N2N2OBis(nbrOfNodesInUse));
3530   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> newCoords(coo->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3531   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamCoords;
3532   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> newNameCoords;
3533   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
3534     newFamCoords=_fam_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3535   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumCoords;
3536   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3537     newNumCoords=_num_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3538   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
3539     newNameCoords=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_name_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3540   _coords=newCoords; _fam_coords=newFamCoords; _num_coords=newNumCoords; _name_coords=newNameCoords; _rev_num_coords=0;
3541   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3542     {
3543       if((MEDFileUMeshSplitL1*)*it)
3544         {
3545           (*it)->renumberNodesInConn(ret->begin());
3546           (*it)->setCoords(_coords);
3547         }
3548     }
3549   // updates _part_coords
3550   const PartDefinition *pc(_part_coords);
3551   if(pc)
3552     {
3553       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<PartDefinition> tmpPD(DataArrayPartDefinition::New(ret2));
3554       _part_coords=tmpPD->composeWith(pc);
3555     }
3556   return ret.retn();
3557 }
3558
3559 /*!
3560  * Adds a group of nodes to \a this mesh.
3561  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3562  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3563  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3564  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3565  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3566  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3567  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3568  */
3569 void MEDFileUMesh::addNodeGroup(const DataArrayInt *ids)
3570 {
3571   const DataArrayDouble *coords=_coords;
3572   if(!coords)
3573     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addNodeGroup : no coords set !");
3574   int nbOfNodes=coords->getNumberOfTuples();
3575   if(!((DataArrayInt *)_fam_coords))
3576     { _fam_coords=DataArrayInt::New(); _fam_coords->alloc(nbOfNodes,1); _fam_coords->fillWithZero(); }
3577   //
3578   addGroupUnderground(true,ids,_fam_coords);
3579 }
3580
3581 /*!
3582  * Adds a group of nodes/cells/faces/edges to \a this mesh.
3583  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3584  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3585  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3586  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3587  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3588  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3589  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3590  */
3591 void MEDFileUMesh::addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids)
3592 {
3593   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3594   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
3595     { 
3596       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : level " << meshDimRelToMaxExt << " not available ! Should be in ";
3597       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," ")); oss << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3598     }
3599   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3600     { addNodeGroup(ids); return ; }
3601   MEDFileUMeshSplitL1 *lev=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3602   DataArrayInt *fam=lev->getOrCreateAndGetFamilyField();
3603   addGroupUnderground(false,ids,fam);
3604 }
3605
3606 /*!
3607  * \param [in] ids ids and group name of the new group to add. The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3608  * \parma [in,out] famArr family array on level of interest to be renumbered. The input pointer should be not \c NULL (no check of that will be performed)
3609  */
3610 void MEDFileUMesh::addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr)
3611 {
3612   if(!ids)
3613     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : NULL pointer in input !");
3614   std::string grpName(ids->getName());
3615   if(grpName.empty())
3616     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : empty group name ! MED file format do not accept empty group name !");
3617   ids->checkStrictlyMonotonic(true);
3618   famArr->incrRef(); MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famArrTmp(famArr);
3619   std::vector<std::string> grpsNames=getGroupsNames();
3620   if(std::find(grpsNames.begin(),grpsNames.end(),grpName)!=grpsNames.end())
3621     {
3622       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : Group with name \"" << grpName << "\" already exists ! Destroy it before calling this method !";
3623       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3624     }
3625   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > allFamIds=getAllNonNullFamilyIds();
3626   allFamIds.erase(std::find(allFamIds.begin(),allFamIds.end(),famArrTmp));
3627   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=famArr->selectByTupleIdSafe(ids->begin(),ids->end());
3628   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diffFamIds=famIds->getDifferentValues();
3629   std::vector<int> familyIds;
3630   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > idsPerfamiliyIds;
3631   int maxVal=getTheMaxAbsFamilyId()+1;
3632   std::map<std::string,int> families(_families);
3633   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
3634   std::vector<std::string> fams;
3635   bool created(false);
3636   for(const int *famId=diffFamIds->begin();famId!=diffFamIds->end();famId++)
3637     {
3638       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2Tmp=famIds->getIdsEqual(*famId);
3639       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->selectByTupleId(ids2Tmp->begin(),ids2Tmp->end());
3640       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids1=famArr->getIdsEqual(*famId);
3641       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret0(ids1->buildSubstractionOptimized(ids2));
3642       if(ret0->empty())
3643         {
3644           bool isFamPresent=false;
3645           for(std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >::const_iterator itl=allFamIds.begin();itl!=allFamIds.end() && !isFamPresent;itl++)
3646             isFamPresent=(*itl)->presenceOfValue(*famId);
3647           if(!isFamPresent)
3648             { familyIds.push_back(*famId); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); fams.push_back(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,*famId,created)); } // adding *famId in grp
3649           else
3650             {
3651               familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);
3652               std::string locFamName=FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created);
3653               fams.push_back(locFamName);
3654               if(existsFamily(*famId))
3655                 {
3656                   std::string locFamName2=getFamilyNameGivenId(*famId); std::vector<std::string> v(2); v[0]=locFamName2; v[1]=locFamName;
3657                   ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3658                 }
3659               maxVal++;
3660             } // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and lie the grp on maxVal
3661         }
3662       else
3663         {
3664           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and on maxVal+1
3665           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);//grp lie only on maxVal+1
3666           std::string n2(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1,created)); fams.push_back(n2);
3667           if(existsFamily(*famId))
3668             {
3669               std::string n1(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created)); std::vector<std::string> v(2); v[0]=n1; v[1]=n2;
3670               ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3671             }
3672           maxVal+=2;
3673         }
3674     }
3675   for(std::size_t i=0;i<familyIds.size();i++)
3676     {
3677       DataArrayInt *da=idsPerfamiliyIds[i];
3678       famArr->setPartOfValuesSimple3(familyIds[i],da->begin(),da->end(),0,1,1);
3679     }
3680   _families=families;
3681   _groups=groups;
3682   _groups[grpName]=fams;
3683 }
3684
3685 /*!
3686  * Changes a name of a family specified by its id.
3687  *  \param [in] id - the id of the family of interest.
3688  *  \param [in] newFamName - the new family name.
3689  *  \throw If no family with the given \a id exists.
3690  */
3691 void MEDFileUMesh::setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName)
3692 {
3693   std::string oldName=getFamilyNameGivenId(id);
3694   _families.erase(oldName);
3695   _families[newFamName]=id;
3696 }
3697
3698 /*!
3699  * Removes a mesh of a given dimension.
3700  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3701  *  \throw If there is no mesh at level \a meshDimRelToMax in \a this mesh.
3702  */
3703 void MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax)
3704 {
3705   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3706   std::vector<int>::const_iterator it=std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax);
3707   if(it==levSet.end())
3708     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel : the requested level is not existing !");
3709   int pos=(-meshDimRelToMax);
3710   _ms[pos]=0;
3711 }
3712
3713 /*!
3714  * Sets a new MEDCoupling1GTUMesh at a given level in \a this mesh.
3715  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3716  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3717  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3718  *         different. 
3719  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3720  *         another node coordinates array.
3721  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3722  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3723  */
3724 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCoupling1GTUMesh *m)
3725 {
3726   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m));
3727   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3728 }
3729
3730 /*!
3731  * Sets a new MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh.
3732  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3733  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3734  *  \param [in] newOrOld - if \c true, cells in \a m are sorted by type to be ready for 
3735  *         writing \a this mesh in a MED file.
3736  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3737  *         different. 
3738  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3739  *         another node coordinates array.
3740  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3741  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3742  */
3743 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld)
3744 {
3745   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld));
3746   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3747 }
3748
3749 MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>& MEDFileUMesh::checkAndGiveEntryInSplitL1(int meshDimRelToMax, MEDCouplingPointSet *m)
3750 {
3751   dealWithTinyInfo(m);
3752   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3753   if(std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax)==levSet.end())
3754     {
3755       if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3756         {
3757           DataArrayDouble *c=m->getCoords();
3758           if(c)
3759             c->incrRef();
3760           _coords=c;
3761         }
3762       if(m->getCoords()!=_coords)
3763         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshAtLevel : Invalid Given Mesh ! The coordinates are not the same ! try to use tryToShareSameCoords !");
3764       int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3765       if(sz>=(int)_ms.size())
3766         _ms.resize(sz);
3767       checkMeshDimCoherency(m->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3768       return _ms[sz-1];
3769     }
3770   else
3771     return _ms[-meshDimRelToMax];
3772 }
3773
3774 /*!
3775  * This method allows to set at once the content of different levels in \a this.
3776  * This method is equivalent to a series of call to MEDFileUMesh::setMeshAtLevel.
3777  *
3778  * \param [in] ms - List of unstructured meshes lying on the same coordinates and having different mesh dimesnion.
3779  * \param [in] renum - the parameter (set to false by default) that tells the beheviour if there is a mesh on \a ms that is not geo type sorted.
3780  *                     If false, an exception ois thrown. If true the mesh is reordered automatically. It is highly recommanded to let this parameter to false.
3781  *
3782  * \throw If \a there is a null pointer in \a ms.
3783  * \sa MEDFileUMesh::setMeshAtLevel
3784  */
3785 void MEDFileUMesh::setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3786 {
3787   if(ms.empty())
3788     return ;
3789   const MEDCouplingUMesh *mRef=ms[0];
3790   if(!mRef)
3791     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in the first element of input meshes !");
3792   std::string name(mRef->getName());
3793   const DataArrayDouble *coo(mRef->getCoords());
3794   std::set<int> s;
3795   int zeDim=-1;
3796   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3797     {
3798       const MEDCouplingUMesh *cur(*it);
3799       if(!cur)
3800         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in input vector of meshes !");
3801       if(coo!=cur->getCoords())
3802         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes do not share the same coordinates !");
3803       int mdim=cur->getMeshDimension();
3804       zeDim=std::max(zeDim,mdim);
3805       if(s.find(mdim)!=s.end())
3806         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes must share the same coordinates pointer, and should have different mesh dimension each other !");
3807     }
3808   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3809     {
3810       int mdim=(*it)->getMeshDimension();
3811       setName((*it)->getName());
3812       setMeshAtLevel(mdim-zeDim,const_cast<MEDCouplingUMesh *>(*it),renum);
3813     }
3814   setName(name);
3815 }
3816
3817 /*!
3818  * Creates one MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh from a sequence of
3819  * meshes each representing a group, and creates corresponding groups in \a this mesh.
3820  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3821  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the mesh and groups at.
3822  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3823  *          create in \a this mesh.
3824  *  \throw If \a ms is empty.
3825  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3826  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3827  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3828  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3829  *         of the given meshes.
3830  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3831  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3832  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3833  */
3834 void MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3835 {
3836   if(ms.empty())
3837     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : expecting a non empty vector !");
3838   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3839   if(sz>=(int)_ms.size())
3840     _ms.resize(sz);
3841   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3842   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3843   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3844     {
3845       coo->incrRef();
3846       _coords=coo;
3847     }
3848   else
3849     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3850       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : coordinates mismatches !");
3851   std::vector<DataArrayInt *> corr;
3852   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,_zipconn_pol,corr);
3853   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr3(corr.begin(),corr.end());
3854   setMeshAtLevel(meshDimRelToMax,m,renum);
3855   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3856   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,true);
3857 }
3858
3859 /*!
3860  * Creates groups at a given level in \a this mesh from a sequence of
3861  * meshes each representing a group.
3862  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3863  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the groups at.
3864  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3865  *         create in \a this mesh.
3866  *  \param [in] renum - if \c true, then the optional numbers of entities are taken into
3867  *         account. 
3868  *  \throw If \a ms is empty.
3869  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3870  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3871  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3872  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3873  *         of the given meshes.
3874  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3875  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3876  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3877  */
3878 void MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3879 {
3880   if(ms.empty())
3881     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : expecting a non empty vector !");
3882   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3883   if(sz>=(int)_ms.size())
3884     _ms.resize(sz);
3885   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3886   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3887   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3888     {
3889       coo->incrRef();
3890       _coords=coo;
3891     }
3892   else
3893     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3894       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : coordinates mismatches !");
3895   MEDCouplingUMesh *m=getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3896   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr(ms.size());
3897   int i=0;
3898   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
3899     {
3900       DataArrayInt *arr=0;
3901       bool test=m->areCellsIncludedIn(*it,_zipconn_pol,arr);
3902       corr[i]=arr;
3903       if(!test)
3904         {
3905           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : mesh #" << i << " is not part of whole mesh !";
3906           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3907         }
3908     }
3909   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3910   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,renum);
3911 }
3912
3913 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const
3914 {
3915   const DataArrayDouble *ret=ms[0]->getCoords();
3916   int mdim=ms[0]->getMeshDimension();
3917   for(unsigned int i=1;i<ms.size();i++)
3918     {
3919       ms[i]->checkCoherency();
3920       if(ms[i]->getCoords()!=ret)
3921         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes must share the same coords !");
3922       if(ms[i]->getMeshDimension()!=mdim)
3923         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes have not same mesh dimension !");
3924     }
3925   return const_cast<DataArrayDouble *>(ret);
3926 }
3927
3928 /*!
3929  * Sets the family field of a given relative dimension.
3930  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
3931  *          the family field is set.
3932  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
3933  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3934  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
3935  */
3936 void MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
3937 {
3938   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3939     {
3940       if(!famArr)
3941         {
3942           _fam_coords=0;
3943           return ;
3944         }
3945       DataArrayDouble *coo(_coords);
3946       if(!coo)
3947         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : the coordinates have not been set !");
3948       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of node family arr ! ");
3949       famArr->incrRef();
3950       _fam_coords=famArr;
3951       return ;
3952     }
3953   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3954     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3955   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3956   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3957     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3958   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3959     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3960   return _ms[traducedRk]->setFamilyArr(famArr);
3961 }
3962
3963 /*!
3964  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
3965  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3966  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
3967  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3968  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
3969  */
3970 void MEDFileUMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
3971 {
3972   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3973     {
3974       if(!renumArr)
3975         {
3976           _num_coords=0;
3977           _rev_num_coords=0;
3978           return ;
3979         }
3980       DataArrayDouble *coo(_coords);
3981       if(!coo)
3982         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumFieldArr : the coordinates have not been set !");
3983       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setRenumArr : Problem in size of node numbering arr ! ");
3984       renumArr->incrRef();
3985       _num_coords=renumArr;
3986       computeRevNum();
3987       return ;
3988     }
3989   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3990     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3991   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3992   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3993     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3994   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3995     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3996   return _ms[traducedRk]->setRenumArr(renumArr);
3997 }
3998
3999 /*!
4000  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4001  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4002  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4003  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4004  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4005  */
4006 void MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4007 {
4008   if(meshDimRelToMaxExt==1)
4009     {
4010       if(!nameArr)
4011         {
4012           _name_coords=0;
4013           return ;
4014         }
4015       DataArrayDouble *coo(_coords);
4016       if(!coo)
4017         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : the coordinates have not been set !");
4018       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of node numbering arr ! ");
4019       nameArr->incrRef();
4020       _name_coords=nameArr;
4021       return ;
4022     }
4023   if(meshDimRelToMaxExt>1)
4024     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Dimension request is invalid (>1) !");
4025   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
4026   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
4027     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
4028   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
4029     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
4030   return _ms[traducedRk]->setNameArr(nameArr);
4031 }
4032
4033 void MEDFileUMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4034 {
4035   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4036     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
4037       (*it)->synchronizeTinyInfo(*this);
4038 }
4039
4040 /*!
4041  * This method is called by MEDFileMesh::changeFamilyId. It performs only one part of the family id modification.
4042  */
4043 void MEDFileUMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4044 {
4045   DataArrayInt *arr=_fam_coords;
4046   if(arr)
4047     arr->changeValue(oldId,newId);
4048   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4049     {
4050       MEDFileUMeshSplitL1 *sp=(*it);
4051       if(sp)
4052         {
4053           sp->changeFamilyIdArr(oldId,newId);
4054         }
4055     }
4056 }
4057
4058 std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > MEDFileUMesh::getAllNonNullFamilyIds() const
4059 {
4060   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ret;
4061   const DataArrayInt *da(_fam_coords);
4062   if(da)
4063     { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
4064   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4065     {
4066       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
4067       if(elt)
4068         {
4069           da=elt->getFamilyField();
4070           if(da)
4071             { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
4072         }
4073     }
4074   return ret;
4075 }
4076
4077 void MEDFileUMesh::computeRevNum() const
4078 {
4079   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
4080     {
4081       int pos;
4082       int maxValue=_num_coords->getMaxValue(pos);
4083       _rev_num_coords=_num_coords->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4084     }
4085 }
4086
4087 std::size_t MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
4088 {
4089   return MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
4090 }
4091
4092 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull() const
4093 {
4094   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull());
4095   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_nodes);
4096   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_nodes);
4097   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes);
4098   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_cells);
4099   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_cells);
4100   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells);
4101   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_faces);
4102   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_faces);
4103   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_nodes);
4104   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces);
4105   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_cells);
4106   ret.push_back((const MEDCoupling1SGTUMesh*)_faces_if_necessary);
4107   return ret;
4108 }
4109
4110 int MEDFileStructuredMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
4111 {
4112   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4113   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4114     {
4115       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4116       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4117     }
4118   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4119     {
4120       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4121       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4122     }
4123   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4124     {
4125       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4126       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4127     }
4128   return ret;
4129 }
4130
4131 int MEDFileStructuredMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
4132 {
4133   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4134   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4135     {
4136       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4137       ret=std::max(ret,val);
4138     }
4139   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4140     {
4141       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4142       ret=std::max(ret,val);
4143     }
4144   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4145     {
4146       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4147       ret=std::max(ret,val);
4148     }
4149   return ret;
4150 }
4151
4152 int MEDFileStructuredMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
4153 {
4154   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4155   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4156     {
4157       int val=_fam_nodes->getMinValue(tmp);
4158       ret=std::min(ret,val);
4159     }
4160   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4161     {
4162       int val=_fam_cells->getMinValue(tmp);
4163       ret=std::min(ret,val);
4164     }
4165   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4166     {
4167       int val=_fam_faces->getMinValue(tmp);
4168       ret=std::min(ret,val);
4169     }
4170   return ret;
4171 }
4172
4173 bool MEDFileStructuredMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4174 {
4175   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
4176     return false;
4177   const MEDFileStructuredMesh *otherC=dynamic_cast<const  MEDFileStructuredMesh *>(other);
4178   if(!otherC)
4179     {
4180       what="Mesh types differ ! This is structured and other is NOT !";
4181       return false;
4182     }
4183   const DataArrayInt *famc1=_fam_nodes;
4184   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_nodes;
4185   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4186     {
4187       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
4188       return false;
4189     }
4190   if(famc1)
4191     {
4192       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4193       if(!ret)
4194         {
4195           what="Families arr on nodes differ !";
4196           return false;
4197         }
4198     }
4199   famc1=_fam_cells;
4200   famc2=otherC->_fam_cells;
4201   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4202     {
4203       what="Mismatch of families arr on cells ! One is defined and not other !";
4204       return false;
4205     }
4206   if(famc1)
4207     {
4208       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4209       if(!ret)
4210         {
4211           what="Families arr on cells differ !";
4212           return false;
4213         }
4214     }
4215   famc1=_fam_faces;
4216   famc2=otherC->_fam_faces;
4217   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4218     {
4219       what="Mismatch of families arr on faces ! One is defined and not other !";
4220       return false;
4221     }
4222   if(famc1)
4223     {
4224       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4225       if(!ret)
4226         {
4227           what="Families arr on faces differ !";
4228           return false;
4229         }
4230     }
4231   famc1=_num_nodes;
4232   famc2=otherC->_num_nodes;
4233   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4234     {
4235       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
4236       return false;
4237     }
4238   if(famc1)
4239     {
4240       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4241       if(!ret)
4242         {
4243           what="Numbering arr on nodes differ !";
4244           return false;
4245         }
4246     }
4247   famc1=_num_cells;
4248   famc2=otherC->_num_cells;
4249   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4250     {
4251       what="Mismatch of numbering arr on cells ! One is defined and not other !";
4252       return false;
4253     }
4254   if(famc1)
4255     {
4256       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4257       if(!ret)
4258         {
4259           what="Numbering arr on cells differ !";
4260           return false;
4261         }
4262     }
4263   famc1=_num_faces;
4264   famc2=otherC->_num_faces;
4265   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4266     {
4267       what="Mismatch of numbering arr on faces ! One is defined and not other !";
4268       return false;
4269     }
4270   if(famc1)
4271     {
4272       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4273       if(!ret)
4274         {
4275           what="Numbering arr on faces differ !";
4276           return false;
4277         }
4278     }
4279   const DataArrayAsciiChar *d1=_names_cells;
4280   const DataArrayAsciiChar *d2=otherC->_names_cells;
4281   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4282     {
4283       what="Mismatch of naming arr on cells ! One is defined and not other !";
4284       return false;
4285     }
4286   if(d1)
4287     {
4288       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4289       if(!ret)
4290         {
4291           what="Naming arr on cells differ !";
4292           return false;
4293         }
4294     }
4295   d1=_names_faces;
4296   d2=otherC->_names_faces;
4297   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4298     {
4299       what="Mismatch of naming arr on faces ! One is defined and not other !";
4300       return false;
4301     }
4302   if(d1)
4303     {
4304       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4305       if(!ret)
4306         {
4307           what="Naming arr on faces differ !";
4308           return false;
4309         }
4310     }
4311   d1=_names_nodes;
4312   d2=otherC->_names_nodes;
4313   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4314     {
4315       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
4316       return false;
4317     }
4318   if(d1)
4319     {
4320       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4321       if(!ret)
4322         {
4323           what="Naming arr on nodes differ !";
4324           return false;
4325         }
4326     }
4327   return true;
4328 }
4329
4330 void MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4331 {
4332   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
4333   const DataArrayInt *tmp=_fam_nodes;
4334   if(tmp)
4335     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4336   tmp=_num_nodes;
4337   if(tmp)
4338     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4339   tmp=_fam_cells;
4340   if(tmp)
4341     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4342   tmp=_num_cells;
4343   if(tmp)
4344     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4345   tmp=_fam_faces;
4346   if(tmp)
4347     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4348   tmp=_num_faces;
4349   if(tmp)
4350     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4351 }
4352
4353 /*!
4354  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
4355  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
4356  *          are required.
4357  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
4358  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
4359  *          returned instead of ids.
4360  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
4361  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
4362  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
4363  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
4364  */
4365 DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
4366 {
4367   std::vector<int> famIds(getFamiliesIds(fams));
4368   switch(meshDimRelToMaxExt)
4369   {
4370     case 1:
4371       {
4372         if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4373           {
4374             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4375             if(!famIds.empty())
4376               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4377             else
4378               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(0,0);
4379             if(renum)
4380               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_nodes,da);
4381             else
4382               return da.retn();
4383           }
4384         else
4385           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
4386         break;
4387       }
4388     case 0:
4389       {
4390         if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4391           {
4392             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4393             if(!famIds.empty())
4394               da=_fam_cells->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4395             else
4396               da=_fam_cells->getIdsEqualList(0,0);
4397             if(renum)
4398               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_cells,da);
4399             else
4400               return da.retn();
4401           }
4402         else
4403           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on cells !");
4404         break;
4405       }
4406     case -1:
4407       {
4408         if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4409           {
4410             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4411             if(!famIds.empty())
4412               da=_fam_faces->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4413             else
4414               da=_fam_faces->getIdsEqualList(0,0);
4415             if(renum)
4416               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_faces,da);
4417             else
4418               return da.retn();
4419           }
4420         else
4421           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on faces !");
4422         break;
4423       }
4424     default:
4425       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : input meshDimRelative must be in [0,1,-1] !");
4426   }
4427   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : unmanaged case !");
4428 }
4429
4430 /*!
4431  * Sets the family field of a given relative dimension.
4432  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4433  *          the family field is set.
4434  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4435  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4436  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4437  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1 and \a meshDimRelToMaxExt != -1.
4438  */
4439 void MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
4440 {
4441   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4442   if(!mesh)
4443     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set family array !");
4444   switch(meshDimRelToMaxExt)
4445   {
4446     case 0:
4447       {
4448         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4449         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4450         _fam_cells=famArr;
4451         break;
4452       }
4453     case 1:
4454       {
4455         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4456         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4457         _fam_nodes=famArr;
4458         break;
4459       }
4460     case -1:
4461       {
4462         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4463         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4464         _fam_faces=famArr;
4465         break;
4466       }
4467     default:
4468       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4469   }
4470   if(famArr)
4471     famArr->incrRef();
4472 }
4473
4474 /*!
4475  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4476  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4477  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4478  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4479  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4480  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4481  */
4482 void MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
4483 {
4484   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4485   if(!mesh)
4486     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set number array !");
4487   switch(meshDimRelToMaxExt)
4488   {
4489     case 0:
4490       {
4491         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4492         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4493         _num_cells=renumArr;
4494         break;
4495       }
4496     case 1:
4497       {
4498         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4499         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4500         _num_nodes=renumArr;
4501         break;
4502       }
4503     case -1:
4504       {
4505         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4506         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4507         _num_faces=renumArr;
4508         break;
4509       }
4510     default:
4511       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4512   }
4513   if(renumArr)
4514     renumArr->incrRef();
4515 }
4516
4517 /*!
4518  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4519  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4520  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4521  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4522  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4523  */
4524 void MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4525 {
4526   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4527   if(!mesh)
4528     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : no structured mesh specified ! Impossible to set names array !");
4529   switch(meshDimRelToMaxExt)
4530   {
4531     case 0:
4532       {
4533         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4534         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4535         _names_cells=nameArr;
4536         break;
4537       }
4538     case 1:
4539       {
4540         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4541         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4542         _names_nodes=nameArr;
4543         break;
4544       }
4545     case -1:
4546       {
4547         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4548         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4549         _names_cells=nameArr;
4550       }
4551     default:
4552       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4553   }
4554   if(nameArr)
4555     nameArr->incrRef();
4556 }
4557
4558 /*!
4559  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
4560  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4561  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
4562  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
4563  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4564  */
4565 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4566 {
4567   switch(meshDimRelToMaxExt)
4568   {
4569     case 0:
4570       return _fam_cells;
4571     case 1:
4572       return _fam_nodes;
4573     case -1:
4574       return _fam_faces;
4575     default:
4576       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4577   }
4578 }
4579
4580 /*!
4581  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4582  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4583  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
4584  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4585  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4586  */
4587 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4588 {
4589   switch(meshDimRelToMaxExt)
4590   {
4591     case 0:
4592       return _num_cells;
4593     case 1:
4594       return _num_nodes;
4595     case -1:
4596       return _num_faces;
4597     default:
4598       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4599   }
4600 }
4601
4602 /*!
4603  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
4604  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4605  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4606  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
4607  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4608  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4609  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4610  */
4611 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4612 {
4613   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4614     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4615   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4616     {
4617       if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4618         {
4619           int pos;
4620           int maxValue=_num_cells->getMaxValue(pos);
4621           _rev_num_cells=_num_cells->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4622           return _rev_num_cells;
4623         }
4624       else
4625         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no cell renumbering for a request on reverse numbering !");
4626     }
4627   else
4628     {
4629       if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4630         {
4631           int pos;
4632           int maxValue=_num_nodes->getMaxValue(pos);
4633           _rev_num_nodes=_num_nodes->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4634           return _rev_num_nodes;
4635         }
4636       else
4637         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no node renumbering for a request on reverse numbering !");
4638     }
4639 }
4640
4641 const DataArrayAsciiChar *MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4642 {
4643   switch(meshDimRelToMaxExt)
4644   {
4645     case 0:
4646       return _names_cells;
4647     case 1:
4648       return _names_nodes;
4649     case -1:
4650       return _names_faces;
4651     default:
4652       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4653   }
4654 }
4655
4656 /*!
4657  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
4658  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [0].
4659  */
4660 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevels() const
4661 {
4662   std::vector<int> ret(1);
4663   return ret;
4664 }
4665
4666 /*!
4667  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
4668  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [1,0].
4669  */
4670 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
4671 {
4672   std::vector<int> ret(2);
4673   ret[0]=1;
4674   return ret;
4675 }
4676
4677 /*!
4678  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL family arr are defined.
4679  */
4680 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
4681 {
4682   std::vector<int> ret;
4683   const DataArrayInt *famNodes(_fam_nodes),*famCells(_fam_cells),*famFaces(_fam_faces);
4684   if(famNodes)
4685     ret.push_back(1);
4686   if(famCells)
4687     ret.push_back(0);
4688   if(famFaces)
4689     ret.push_back(-1);
4690   return ret;
4691 }
4692
4693 /*!
4694  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL numbering arr are defined.
4695  */
4696 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
4697 {
4698   std::vector<int> ret;
4699   const DataArrayInt *numNodes(_num_nodes),*numCells(_num_cells),*numFaces(_num_faces);
4700   if(numNodes)
4701     ret.push_back(1);
4702   if(numCells)
4703     ret.push_back(0);
4704   if(numFaces)
4705     ret.push_back(-1);
4706   return ret;
4707 }
4708
4709 /*!
4710  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL naming arr are defined.
4711  */
4712 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
4713 {
4714   std::vector<int> ret;
4715   const DataArrayAsciiChar *namesNodes(_names_nodes),*namesCells(_names_cells),*namesFaces(_names_faces);
4716   if(namesNodes)
4717     ret.push_back(1);
4718   if(namesCells)
4719     ret.push_back(0);
4720   if(namesFaces)
4721     ret.push_back(-1);
4722   return ret;
4723 }
4724
4725 /*!
4726  * no implementation here, it is not a bug, but intresically no polyhedra in \a this.
4727  */
4728 bool MEDFileStructuredMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
4729 {
4730   oldCode.clear(); newCode.clear(); o2nRenumCell=0;
4731   return false;
4732 }
4733
4734 void MEDFileStructuredMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4735 {
4736   DataArrayInt *arr=_fam_nodes;
4737   if(arr)
4738     arr->changeValue(oldId,newId);
4739   arr=_fam_cells;
4740   if(arr)
4741     arr->changeValue(oldId,newId);
4742   arr=_fam_faces;
4743   if(arr)
4744     arr->changeValue(oldId,newId);
4745 }
4746
4747 void MEDFileStructuredMesh::deepCpyAttributes()
4748 {
4749   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
4750     _fam_nodes=_fam_nodes->deepCpy();
4751   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
4752     _num_nodes=_num_nodes->deepCpy();
4753   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_nodes)
4754     _names_nodes=_names_nodes->deepCpy();
4755   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
4756     _fam_cells=_fam_cells->deepCpy();
4757   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
4758     _num_cells=_num_cells->deepCpy();
4759   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_cells)
4760     _names_cells=_names_cells->deepCpy();
4761   if((const DataArrayInt*)_fam_faces)
4762     _fam_faces=_fam_faces->deepCpy();
4763   if((const DataArrayInt*)_num_faces)
4764     _num_faces=_num_faces->deepCpy();
4765   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_faces)
4766     _names_faces=_names_faces->deepCpy();
4767   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
4768     _rev_num_nodes=_rev_num_nodes->deepCpy();
4769   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
4770     _rev_num_cells=_rev_num_cells->deepCpy();
4771 }
4772
4773 /*!
4774  * Returns a pointer to mesh at the specified level (here 0 is compulsary for cartesian mesh).
4775  * 
4776  * \return a pointer to cartesian mesh that need to be managed by the caller.
4777  * \warning the returned pointer has to be managed by the caller.
4778  */
4779
4780 /*!
4781  * Returns a pointer to MEDCouplingStructuredMesh held by \a this. 
4782  *  \param [in] meshDimRelToMax - it must be \c 0 or \c -1.
4783  *  \param [in] renum - it must be \c false.
4784  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingMesh that the caller is to
4785  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
4786  */
4787 MEDCouplingMesh *MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
4788 {
4789   if(renum)
4790     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support renumbering ! To do it perform request of renum array directly !");
4791   const MEDCouplingStructuredMesh *m(getStructuredMesh());
4792   switch(meshDimRelToMax)
4793   {
4794     case 0:
4795       {
4796         if(m)
4797           m->incrRef();
4798         return const_cast<MEDCouplingStructuredMesh *>(m);
4799       }
4800     case -1:
4801       {
4802         if(!m)
4803           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel : level -1 requested must be non empty to be able to compute unstructured sub mesh !");
4804         buildMinusOneImplicitPartIfNeeded();
4805         MEDCouplingMesh *ret(_faces_if_necessary);
4806         if(ret)
4807           ret->incrRef();
4808         return ret;
4809       }
4810     default:
4811       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support multi level for mesh 0 expected as input !");
4812   }
4813 }
4814
4815 /*!
4816  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
4817  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
4818  *  \return int - the number of entities.
4819  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
4820  */
4821 int MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4822 {
4823   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4824   if(!cmesh)
4825     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : No structured mesh set !");
4826   switch(meshDimRelToMaxExt)
4827   {
4828     case 0:
4829       return cmesh->getNumberOfCells();
4830     case 1:
4831       return cmesh->getNumberOfNodes();
4832     case -1:
4833       return cmesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4834     default:
4835       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4836   }
4837 }
4838
4839 int MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes() const
4840 {
4841   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4842   if(!cmesh)
4843     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes : no cartesian mesh set !");
4844   return cmesh->getNumberOfNodes();
4845 }
4846
4847 bool MEDFileStructuredMesh::hasImplicitPart() const
4848 {
4849   return true;
4850 }
4851
4852 /*!
4853  * \sa MEDFileStructuredMesh::getImplicitFaceMesh
4854  */
4855 int MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
4856 {
4857   static const char MSG[]="MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny : the given geo type is not manageable by a structured mesh !";
4858   const MEDCoupling1SGTUMesh *zeFaceMesh(_faces_if_necessary);
4859   if(!zeFaceMesh)
4860     {
4861       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension())));
4862       if(cm.getReverseExtrudedType()!=gt)
4863         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
4864       buildImplicitPart();
4865       return getStructuredMesh()->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4866     }
4867   else
4868     {
4869       if(gt!=zeFaceMesh->getCellModelEnum())
4870         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
4871       return zeFaceMesh->getNumberOfCells();
4872     }
4873 }
4874
4875 void MEDFileStructuredMesh::buildMinusOneImplicitPartIfNeeded() const
4876 {
4877   const MEDCoupling1SGTUMesh *zeFaceMesh(_faces_if_necessary);
4878   if(!zeFaceMesh)
4879     buildImplicitPart();
4880 }
4881
4882 void MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPart() const
4883 {
4884   const MEDCouplingStructuredMesh *mcmesh(getStructuredMesh());
4885   if(!mcmesh)
4886     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPart : Unable to build the implicit part of structured mesh because no structured mesh at level 0 defined !");
4887   _faces_if_necessary=mcmesh->build1SGTSubLevelMesh();
4888 }
4889
4890 void MEDFileStructuredMesh::releaseImplicitPartIfAny() const
4891 {
4892   _faces_if_necessary=0;
4893 }
4894
4895 /*!
4896  * Retrieves the internal pointer (no decrRef requested) of the implicit face mesh if any.
4897  * To force to build it you can invoke MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny method.
4898  * 
4899  * \sa MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny
4900  */
4901 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDFileStructuredMesh::getImplicitFaceMesh() const
4902 {
4903   return _faces_if_necessary;
4904 }
4905
4906 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
4907 {
4908   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4909   if(!cmesh)
4910     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : No structured mesh set !");
4911   switch(meshDimRelToMax)
4912   {
4913     case 0:
4914       {
4915         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,cmesh->getTypeOfCell(0));
4916         return ret;
4917       }
4918     case -1:
4919       {
4920         int mdim(cmesh->getMeshDimension());
4921         if(mdim<1)
4922           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only one level available for structured meshes ! Input 0 is mandatory or 0D mesh !");
4923         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(mdim-1));
4924         return ret;
4925       }
4926     default:
4927       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only 2 levels available at most : 0 and -1 !");
4928   }
4929 }
4930
4931 void MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
4932 {
4933   if(st.getNumberOfItems()!=1)
4934     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
4935   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
4936     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
4937   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
4938     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
4939   if(st[0].getPflName().empty())
4940     {
4941       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
4942       return ;
4943     }
4944   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[0].getPflName()));
4945   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
4946   int sz(nodesFetched.size());
4947   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
4948     {
4949       std::vector<int> conn;
4950       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
4951       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
4952         if(*it>=0 && *it<sz)
4953           nodesFetched[*it]=true;
4954         else
4955           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
4956     }
4957 }
4958
4959 med_geometry_type MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim)
4960 {
4961   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ct(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim));
4962   return typmai3[ct];
4963 }
4964
4965 void MEDFileStructuredMesh::LoadStrMeshDAFromFile(med_idt fid, int meshDim, int dt, int it, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs,
4966                                                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& famCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& numCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar>& namesCells)
4967 {
4968   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
4969   med_geometry_type geoTypeReq=MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4970   int nbOfElt(0);
4971   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4972   if(nbOfElt>0)
4973     {
4974       if(!mrs || mrs->isCellFamilyFieldReading())
4975         {
4976           famCells=DataArrayInt::New();
4977           famCells->alloc(nbOfElt,1);
4978           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,famCells->getPointer());
4979         }
4980     }
4981   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4982   if(nbOfElt>0)
4983     {
4984       if(!mrs || mrs->isCellNumFieldReading())
4985         {
4986           numCells=DataArrayInt::New();
4987           numCells->alloc(nbOfElt,1);
4988           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,numCells->getPointer());
4989         }
4990     }
4991   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4992   if(nbOfElt>0)
4993     {
4994       if(!mrs || mrs->isCellNameFieldReading())
4995         {
4996           namesCells=DataArrayAsciiChar::New();
4997           namesCells->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4998           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,namesCells->getPointer());
4999           namesCells->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5000         }
5001     }
5002 }
5003
5004 void MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5005 {
5006   setName(strm->getName());
5007   setDescription(strm->getDescription());
5008   setUnivName(strm->getUnivName());
5009   setIteration(strm->getIteration());
5010   setOrder(strm->getOrder());
5011   setTimeValue(strm->getTime());
5012   setTimeUnit(strm->getTimeUnit());
5013   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
5014   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
5015   int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5016   if(nbOfElt>0)
5017     {
5018       if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
5019         {
5020           int nbNodes(getNumberOfNodes());
5021           if(nbOfElt>nbNodes)
5022             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile : invalid size of family node array regarding number of nodes in this ! File seems to be corrupted !");
5023           _fam_nodes=DataArrayInt::New();
5024           _fam_nodes->alloc(nbNodes,1);//yes nbNodes and not nbOfElt see next line.
5025           if(nbNodes>nbOfElt)//yes it appends some times... It explains surely the mdump implementation. Bug revealed by PARAVIS EDF #2475 on structured.med file where only 12 first nodes are !=0 so nbOfElt=12 and nbOfNodes=378...
5026             _fam_nodes->fillWithZero();
5027           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getPointer());
5028         }
5029     }
5030   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5031   if(nbOfElt>0)
5032     {
5033       if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
5034         {
5035           _num_nodes=DataArrayInt::New();
5036           _num_nodes->alloc(nbOfElt,1);
5037           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getPointer());
5038         }
5039     }
5040   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5041   if(nbOfElt>0)
5042     {
5043       if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
5044         {
5045           _names_nodes=DataArrayAsciiChar::New();
5046           _names_nodes->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5047           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getPointer());
5048           _names_nodes->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5049         }
5050     }
5051   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
5052   LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim,dt,it,mName,mrs,_fam_cells,_num_cells,_names_cells);
5053   if(meshDim>=1)
5054     LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim-1,dt,it,mName,mrs,_fam_faces,_num_faces,_names_faces);
5055 }
5056
5057 void MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(med_idt fid, const std::string& maa) const
5058 {
5059   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
5060   med_geometry_type geoTypeReq(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim)),geoTypeReq2(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim-1));
5061   //
5062   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
5063     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getNumberOfTuples(),_fam_cells->getConstPointer());
5064   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
5065     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_fam_faces->getNumberOfTuples(),_fam_faces->getConstPointer());
5066   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
5067     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getNumberOfTuples(),_fam_nodes->getConstPointer());
5068   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
5069     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getNumberOfTuples(),_num_cells->getConstPointer());
5070   if((const DataArrayInt *)_num_faces)
5071     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_num_faces->getNumberOfTuples(),_num_faces->getConstPointer());
5072   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
5073     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getNumberOfTuples(),_num_nodes->getConstPointer());
5074   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
5075     {
5076       if(_names_cells->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5077         {
5078           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on cells with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5079           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
5080           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5081         }
5082       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getNumberOfTuples(),_names_cells->getConstPointer());
5083     }
5084   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces)
5085     {
5086       if(_names_faces->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5087         {
5088           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on faces with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5089           oss << " ! The array has " << _names_faces->getNumberOfComponents() << " components !";
5090           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5091         }
5092       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_names_faces->getNumberOfTuples(),_names_faces->getConstPointer());
5093     }
5094   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
5095     {
5096       if(_names_nodes->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5097         {
5098           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5099           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
5100           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5101         }
5102       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getNumberOfTuples(),_names_nodes->getConstPointer());
5103     }
5104   //
5105   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa.c_str(),_families,_groups,_too_long_str);
5106 }
5107
5108 /*!
5109  * Returns an empty instance of MEDFileCMesh.
5110  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5111  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5112  */
5113 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New()
5114 {
5115   return new MEDFileCMesh;
5116 }
5117
5118 /*!
5119  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
5120  * file. The first mesh in the file is loaded.
5121  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
5122  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5123  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5124  *  \throw If the file is not readable.
5125  *  \throw If there is no meshes in the file.
5126  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
5127  */
5128 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5129 {
5130   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5131   if(ms.empty())
5132     {
5133       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5134       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5135     }
5136   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5137   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5138   int dt,it;
5139   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5140   std::string dummy2;
5141   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5142   return new MEDFileCMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5143 }
5144
5145 /*!
5146  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
5147  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
5148  * iteration.
5149  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
5150  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
5151  *  \param [in] dt - the number of a time step.
5152  *  \param [in] it - the number of an iteration.
5153  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5154  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5155  *  \throw If the file is not readable.
5156  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
5157  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
5158  */
5159 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5160 {
5161   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5162   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5163   return new MEDFileCMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5164 }
5165
5166 std::size_t MEDFileCMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5167 {
5168   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5169 }
5170
5171 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCMesh::getDirectChildrenWithNull() const
5172 {
5173   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull());
5174   ret.push_back((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh);
5175   return ret;
5176 }
5177
5178 /*!
5179  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
5180  *  \return int - the mesh dimension.
5181  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5182  */
5183 int MEDFileCMesh::getMeshDimension() const
5184 {
5185   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5186     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5187   return _cmesh->getMeshDimension();
5188 }
5189
5190 /*!
5191  * Returns the dimension on nodes in \a this mesh.
5192  *  \return int - the space dimension.
5193  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5194  */
5195 int MEDFileCMesh::getSpaceDimension() const
5196 {
5197   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5198     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getSpaceDimension : unable to get spacedimension because no mesh set !");
5199   return _cmesh->getSpaceDimension();
5200 }
5201
5202 /*!
5203  * Returns a string describing \a this mesh.
5204  *  \return std::string - the mesh information string.
5205  */
5206 std::string MEDFileCMesh::simpleRepr() const
5207 {
5208   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5209 }
5210
5211 /*!
5212  * Returns a full textual description of \a this mesh.
5213  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
5214  */
5215 std::string MEDFileCMesh::advancedRepr() const
5216 {
5217   return simpleRepr();
5218 }
5219
5220 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::shallowCpy() const
5221 {
5222   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5223   return ret.retn();
5224 }
5225
5226 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::createNewEmpty() const
5227 {
5228   return new MEDFileCMesh;
5229 }
5230
5231 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::deepCpy() const
5232 {
5233   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5234   if((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh)
5235     ret->_cmesh=static_cast<MEDCouplingCMesh*>(_cmesh->deepCpy());
5236   ret->deepCpyAttributes();
5237   return ret.retn();
5238 }
5239
5240 /*!
5241  * Checks if \a this and another mesh are equal.
5242  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
5243  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
5244  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
5245  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
5246  */
5247 bool MEDFileCMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5248 {
5249   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5250     return false;
5251   const MEDFileCMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(other);
5252   if(!otherC)
5253     {
5254       what="Mesh types differ ! This is cartesian and other is NOT !";
5255       return false;
5256     }
5257   clearNonDiscrAttributes();
5258   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5259   const MEDCouplingCMesh *coo1=_cmesh;
5260   const MEDCouplingCMesh *coo2=otherC->_cmesh;
5261   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5262     {
5263       what="Mismatch of cartesian meshes ! One is defined and not other !";
5264       return false;
5265     }
5266   if(coo1)
5267     {
5268       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5269       if(!ret)
5270         {
5271           what="cartesian meshes differ !";
5272           return false;
5273         }
5274     }
5275   return true;
5276 }
5277
5278 /*!
5279  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
5280  */
5281 void MEDFileCMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5282 {
5283   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5284   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_cmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5285 }
5286
5287 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh()
5288 {
5289 }
5290
5291 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5292 try
5293 {
5294     loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5295 }
5296 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5297 {
5298     throw e;
5299 }
5300
5301 void MEDFileCMesh::loadCMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5302 {
5303   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5304   int dummy0,dummy1;
5305   std::string dtunit;
5306   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5307   if(meshType!=CARTESIAN)
5308     {
5309       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as cartesian an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT cartesian !";
5310       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5311     }
5312   MEDFileCMeshL2 loaderl2;
5313   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5314   MEDCouplingCMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5315   mesh->incrRef();
5316   _cmesh=mesh;
5317   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5318 }
5319
5320 /*!
5321  * Returns a const pointer to MEDCouplingCMesh held by \a this mesh.
5322  *  \return const MEDCouplingCMesh * - a pointer to the held MEDCouplingCMesh.
5323  */
5324 const MEDCouplingCMesh *MEDFileCMesh::getMesh() const
5325 {
5326   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5327   return _cmesh;
5328 }
5329
5330 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCMesh::getStructuredMesh() const
5331 {
5332   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5333   return _cmesh;
5334 }
5335
5336 /*!
5337  * Sets the MEDCouplingCMesh holding the data of \a this mesh.
5338  *  \param [in] m - the new MEDCouplingCMesh to refer to.
5339  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
5340  *         different. 
5341  */
5342 void MEDFileCMesh::setMesh(MEDCouplingCMesh *m)
5343 {
5344   dealWithTinyInfo(m);
5345   if(m)
5346     m->incrRef();
5347   _cmesh=m;
5348 }
5349
5350 void MEDFileCMesh::writeLL(med_idt fid) const
5351 {
5352   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5353   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5354   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5355   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5356   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5357   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5358   int spaceDim(_cmesh->getSpaceDimension());
5359   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5360   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5361   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5362     {
5363       std::string info(_cmesh->getCoordsAt(i)->getInfoOnComponent(0));
5364       std::string c,u;
5365       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5366       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5367       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5368     }
5369   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,spaceDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5370   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5371   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CARTESIAN_GRID);
5372   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5373     {
5374       const DataArrayDouble *da=_cmesh->getCoordsAt(i);
5375       MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,i+1,da->getNumberOfTuples(),da->getConstPointer());
5376     }
5377   //
5378   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5379   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5380 }
5381
5382 void MEDFileCMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5383 {
5384   const MEDCouplingCMesh *cmesh=_cmesh;
5385   if(!cmesh)
5386     return;
5387   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setName(_name);
5388   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setDescription(_desc_name);
5389   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5390   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5391 }
5392
5393 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New()
5394 {
5395   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5396 }
5397
5398 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5399 {
5400   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5401   if(ms.empty())
5402     {
5403       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5404       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5405     }
5406   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5407   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5408   int dt,it;
5409   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5410   std::string dummy2;
5411   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5412   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5413 }
5414
5415 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5416 {
5417   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5418   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5419   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5420 }
5421
5422 std::size_t MEDFileCurveLinearMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5423 {
5424   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5425 }
5426
5427 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCurveLinearMesh::getDirectChildrenWithNull() const
5428 {
5429   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull());
5430   ret.push_back((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh);
5431   return ret;
5432 }
5433
5434 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::shallowCpy() const
5435 {
5436   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5437   return ret.retn();
5438 }
5439
5440 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::createNewEmpty() const
5441 {
5442   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5443 }
5444
5445 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::deepCpy() const
5446 {
5447   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5448   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh)
5449     ret->_clmesh=static_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh*>(_clmesh->deepCpy());
5450   ret->deepCpyAttributes();
5451   return ret.retn();
5452 }
5453
5454 int MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension() const
5455 {
5456   if(!((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh))
5457     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5458   return _clmesh->getMeshDimension();
5459 }
5460
5461 std::string MEDFileCurveLinearMesh::simpleRepr() const
5462 {
5463   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5464 }
5465
5466 std::string MEDFileCurveLinearMesh::advancedRepr() const
5467 {
5468   return simpleRepr();
5469 }
5470
5471 bool MEDFileCurveLinearMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5472 {
5473   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5474     return false;
5475   const MEDFileCurveLinearMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(other);
5476   if(!otherC)
5477     {
5478       what="Mesh types differ ! This is curve linear and other is NOT !";
5479       return false;
5480     }
5481   clearNonDiscrAttributes();
5482   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5483   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo1=_clmesh;
5484   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo2=otherC->_clmesh;
5485   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5486     {
5487       what="Mismatch of curve linear meshes ! One is defined and not other !";
5488       return false;
5489     }
5490   if(coo1)
5491     {
5492       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5493       if(!ret)
5494         {
5495           what="curve linear meshes differ !";
5496           return false;
5497         }
5498     }
5499   return true;
5500 }
5501
5502 void MEDFileCurveLinearMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5503 {
5504   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5505   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_clmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5506 }
5507
5508 void MEDFileCurveLinearMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5509 {
5510   const MEDCouplingCurveLinearMesh *clmesh=_clmesh;
5511   if(!clmesh)
5512     return;
5513   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setName(_name);
5514   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setDescription(_desc_name);
5515   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5516   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5517 }
5518
5519 const MEDCouplingCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getMesh() const
5520 {
5521   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5522   return _clmesh;
5523 }
5524
5525 void MEDFileCurveLinearMesh::setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m)
5526 {
5527   dealWithTinyInfo(m);
5528   if(m)
5529     m->incrRef();
5530   _clmesh=m;
5531 }
5532
5533 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getStructuredMesh() const
5534 {
5535   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5536   return _clmesh;
5537 }
5538
5539 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh()
5540 {
5541 }
5542
5543 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5544 try
5545 {
5546     loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5547 }
5548 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5549 {
5550     throw e;
5551 }
5552
5553 void MEDFileCurveLinearMesh::writeLL(med_idt fid) const
5554 {
5555   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5556   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5557   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5558   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5559   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5560   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5561   int spaceDim=_clmesh->getSpaceDimension();
5562   int meshDim=_clmesh->getMeshDimension();
5563   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5564   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5565   const DataArrayDouble *coords=_clmesh->getCoords();
5566   if(!coords)
5567     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::writeLL : no coordinates set !");
5568   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5569     {
5570       std::string info(_clmesh->getCoords()->getInfoOnComponent(i));
5571       std::string c,u;
5572       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5573       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5574       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5575     }
5576   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5577   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5578   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CURVILINEAR_GRID);
5579   std::vector<int> nodeGridSt=_clmesh->getNodeGridStructure();
5580   MEDmeshGridStructWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,&nodeGridSt[0]);
5581
5582   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->begin());
5583   //
5584   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5585   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5586 }
5587
5588 void MEDFileCurveLinearMesh::loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5589 {
5590   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5591   int dummy0,dummy1;
5592   std::string dtunit;
5593   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5594   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
5595     {
5596       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as curve linear an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT curve linear !";
5597       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5598     }
5599   MEDFileCLMeshL2 loaderl2;
5600   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5601   MEDCouplingCurveLinearMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5602   mesh->incrRef();
5603   _clmesh=mesh;
5604   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5605 }
5606
5607 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New()
5608 {
5609   return new MEDFileMeshMultiTS;
5610 }
5611
5612 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName)
5613 {
5614   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName);
5615 }
5616
5617 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5618 {
5619   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName,mName);
5620 }
5621
5622 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::deepCpy() const
5623 {
5624   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> ret=MEDFileMeshMultiTS::New();
5625   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > meshOneTs(_mesh_one_ts.size());
5626   std::size_t i=0;
5627   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++,i++)
5628     if((const MEDFileMesh *)*it)
5629       meshOneTs[i]=(*it)->deepCpy();
5630   ret->_mesh_one_ts=meshOneTs;
5631   return ret.retn();
5632 }
5633
5634 std::size_t MEDFileMeshMultiTS::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5635 {
5636   return _mesh_one_ts.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh>);
5637 }
5638
5639 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshMultiTS::getDirectChildrenWithNull() const
5640 {
5641   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5642   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5643     ret.push_back((const MEDFileMesh *)*it);
5644   return ret;
5645 }
5646
5647 std::string MEDFileMeshMultiTS::getName() const
5648 {
5649   if(_mesh_one_ts.empty())
5650     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getName : no time steps set !");
5651   return _mesh_one_ts[0]->getName();
5652 }
5653
5654 void MEDFileMeshMultiTS::setName(const std::string& newMeshName)
5655 {
5656   std::string oldName(getName());
5657   std::vector< std::pair<std::string,std::string> > v(1);
5658   v[0].first=oldName; v[0].second=newMeshName;
5659   changeNames(v);
5660 }
5661
5662 bool MEDFileMeshMultiTS::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5663 {
5664   bool ret=false;
5665   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5666     {
5667       MEDFileMesh *cur(*it);
5668       if(cur)
5669         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5670     }
5671   return ret;
5672 }
5673
5674 MEDFileMesh *MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep() const
5675 {
5676   if(_mesh_one_ts.empty())
5677     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep : empty time step set !");
5678   return const_cast<MEDFileMesh *>(static_cast<const MEDFileMesh *>(_mesh_one_ts[0]));
5679 }
5680
5681 void MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep)
5682 {
5683   if(!mesh1TimeStep)
5684     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep : input pointer should be different from 0 !");
5685   _mesh_one_ts.resize(1);
5686   mesh1TimeStep->incrRef();
5687   //MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> toto=mesh1TimeStep;
5688   _mesh_one_ts[0]=mesh1TimeStep;
5689 }
5690
5691 void MEDFileMeshMultiTS::write(med_idt fid) const
5692 {
5693   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5694     {
5695       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5696       (*it)->write(fid);
5697     }
5698 }
5699
5700 void MEDFileMeshMultiTS::write(const std::string& fileName, int mode) const
5701 {
5702   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5703   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5704   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5705   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5706   write(fid);
5707 }
5708
5709 void MEDFileMeshMultiTS::loadFromFile(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5710 {//for the moment to be improved
5711   _mesh_one_ts.resize(1);
5712   _mesh_one_ts[0]=MEDFileMesh::New(fileName,mName,-1,-1);
5713 }
5714
5715 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS()
5716 {
5717 }
5718
5719 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName)
5720 try
5721 {
5722     std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5723     if(ms.empty())
5724       {
5725         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5726         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5727       }
5728     MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5729     MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5730     int dt,it;
5731     ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5732     std::string dummy2;
5733     MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5734     loadFromFile(fileName,ms.front());
5735 }
5736 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5737 {
5738     throw e;
5739 }
5740
5741 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5742 try
5743 {
5744     loadFromFile(fileName,mName);
5745 }
5746 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5747 {
5748     throw e;
5749 }
5750
5751 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New()
5752 {
5753   return new MEDFileMeshes;
5754 }
5755
5756 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New(const std::string& fileName)
5757 {
5758   return new MEDFileMeshes(fileName);
5759 }
5760
5761 void MEDFileMeshes::write(med_idt fid) const
5762 {
5763   checkCoherency();
5764   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5765     {
5766       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5767       (*it)->write(fid);
5768     }
5769 }
5770
5771 void MEDFileMeshes::write(const std::string& fileName, int mode) const
5772 {
5773   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5774   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5775   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5776   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5777   checkCoherency();
5778   write(fid);
5779 }
5780
5781 int MEDFileMeshes::getNumberOfMeshes() const
5782 {
5783   return _meshes.size();
5784 }
5785
5786 MEDFileMeshesIterator *MEDFileMeshes::iterator()
5787 {
5788   return new MEDFileMeshesIterator(this);
5789 }
5790
5791 /** Return a borrowed reference (caller is not responsible) */
5792 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshAtPos(int i) const
5793 {
5794   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5795     {
5796       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshAtPos : invalid mesh id given in parameter ! Should be in [0;" << _meshes.size() << ") !";
5797       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5798     }
5799   return _meshes[i]->getOneTimeStep();
5800 }
5801
5802 /** Return a borrowed reference (caller is not responsible) */
5803 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshWithName(const std::string& mname) const
5804 {
5805   std::vector<std::string> ms=getMeshesNames();
5806   std::vector<std::string>::iterator it=std::find(ms.begin(),ms.end(),mname);
5807   if(it==ms.end())
5808     {
5809       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshWithName : Mesh  \"" << mname << "\" does not exist in this ! Existing are : ";
5810       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
5811       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5812     }
5813   return getMeshAtPos((int)std::distance(ms.begin(),it));
5814 }
5815
5816 std::vector<std::string> MEDFileMeshes::getMeshesNames() const
5817 {
5818   std::vector<std::string> ret(_meshes.size());
5819   int i=0;
5820   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5821     {
5822       const MEDFileMeshMultiTS *f=(*it);
5823       if(f)
5824         {
5825           ret[i]=f->getName();
5826         }
5827       else
5828         {
5829           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshesNames : At rank #" << i << " mesh is not defined !";
5830           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5831         }
5832     }
5833   return ret;
5834 }
5835
5836 bool MEDFileMeshes::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5837 {
5838   bool ret=false;
5839   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5840     {
5841       MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5842       if(cur)
5843         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5844     }
5845   return ret;
5846 }
5847
5848 void MEDFileMeshes::resize(int newSize)
5849 {
5850   _meshes.resize(newSize);
5851 }
5852
5853 void MEDFileMeshes::pushMesh(MEDFileMesh *mesh)
5854 {
5855   if(!mesh)
5856     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::pushMesh : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5857   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5858   elt->setOneTimeStep(mesh);
5859   _meshes.push_back(elt);
5860 }
5861
5862 void MEDFileMeshes::setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh)
5863 {
5864   if(!mesh)
5865     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::setMeshAtPos : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5866   if(i>=(int)_meshes.size())
5867     _meshes.resize(i+1);
5868   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5869   elt->setOneTimeStep(mesh);
5870   _meshes[i]=elt;
5871 }
5872
5873 void MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos(int i)
5874 {
5875   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5876     {
5877       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos : Invalid given id in input (" << i << ") should be in [0," << _meshes.size() << ") !";
5878       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5879     }
5880   _meshes.erase(_meshes.begin()+i);
5881 }
5882
5883 void MEDFileMeshes::loadFromFile(const std::string& fileName)
5884 {
5885   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5886   int i=0;
5887   _meshes.resize(ms.size());
5888   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
5889     _meshes[i]=MEDFileMeshMultiTS::New(fileName,(*it));
5890 }
5891
5892 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes()
5893 {
5894 }
5895
5896 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes(const std::string& fileName)
5897 try
5898 {
5899     loadFromFile(fileName);
5900 }
5901 catch(INTERP_KERNEL::Exception& /*e*/)
5902 {
5903 }
5904
5905 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::deepCpy() const
5906 {
5907   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > meshes(_meshes.size());
5908   std::size_t i=0;
5909   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5910     if((const MEDFileMeshMultiTS *)*it)
5911       meshes[i]=(*it)->deepCpy();
5912   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> ret=MEDFileMeshes::New();
5913   ret->_meshes=meshes;
5914   return ret.retn();
5915 }
5916
5917 std::size_t MEDFileMeshes::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5918 {
5919   return _meshes.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS>));
5920 }
5921
5922 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshes::getDirectChildrenWithNull() const
5923 {
5924   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5925   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5926     ret.push_back((const MEDFileMeshMultiTS *)*it);
5927   return ret;
5928 }
5929
5930 std::string MEDFileMeshes::simpleRepr() const
5931 {
5932   std::ostringstream oss;
5933   oss << "(*****************)\n(* MEDFileMeshes *)\n(*****************)\n\n";
5934   simpleReprWithoutHeader(oss);
5935   return oss.str();
5936 }
5937
5938 void MEDFileMeshes::simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const
5939 {
5940   int nbOfMeshes=getNumberOfMeshes();
5941   oss << "There are " << nbOfMeshes << " meshes with the following names : \n";
5942   std::vector<std::string> mns=getMeshesNames();
5943   for(int i=0;i<nbOfMeshes;i++)
5944     oss << "  - #" << i << " \"" << mns[i] << "\"\n";
5945 }
5946
5947 void MEDFileMeshes::checkCoherency() const
5948 {
5949   static const char MSG[]="MEDFileMeshes::checkCoherency : mesh at rank ";
5950   int i=0;
5951   std::set<std::string> s;
5952   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5953     {
5954       const MEDFileMeshMultiTS *elt=(*it);
5955       if(!elt)
5956         {
5957           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << "/" << _meshes.size() << " is empty !";
5958           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5959         }
5960       std::size_t sz=s.size();
5961       s.insert(std::string((*it)->getName()));
5962       if(s.size()==sz)
5963         {
5964           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << " has a name (\"" << (*it)->getName() << "\") already used by an another mesh in list !";
5965           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5966         }
5967     }
5968 }
5969
5970 MEDFileMeshesIterator::MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms):_ms(ms),_iter_id(0),_nb_iter(0)
5971 {
5972   if(ms)
5973     {
5974       ms->incrRef();
5975       _nb_iter=ms->getNumberOfMeshes();
5976     }
5977 }
5978
5979 MEDFileMeshesIterator::~MEDFileMeshesIterator()
5980 {
5981 }
5982
5983 MEDFileMesh *MEDFileMeshesIterator::nextt()
5984 {
5985   if(_iter_id<_nb_iter)
5986     {
5987       MEDFileMeshes *ms(_ms);
5988       if(ms)
5989         return ms->getMeshAtPos(_iter_id++);
5990       else
5991         return 0;
5992     }
5993   else
5994     return 0;
5995 }