Salome HOME
Addition of MEDFileUMesh.buildExtrudedMesh method.
[modules/med.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDFileMesh.hxx"
22 #include "MEDFileUtilities.hxx"
23 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
24 #include "MEDFileField.hxx"
25 #include "MEDLoader.hxx"
26 #include "MEDLoaderBase.hxx"
27
28 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
29
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31
32 #include <limits>
33 #include <cmath>
34
35 extern med_geometry_type typmai3[34];
36
37 using namespace ParaMEDMEM;
38
39 const char MEDFileMesh::DFT_FAM_NAME[]="FAMILLE_ZERO";
40
41 MEDFileMesh::MEDFileMesh():_order(-1),_iteration(-1),_time(0.),_univ_wr_status(true)
42 {
43 }
44
45 std::size_t MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
46 {
47   std::size_t ret(_dt_unit.capacity()+_name.capacity()+_univ_name.capacity()+_desc_name.capacity());
48   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
49     {
50       ret+=(*it).first.capacity()+(*it).second.capacity()*sizeof(std::string);
51       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
52         ret+=(*it2).capacity();
53     }
54   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
55     ret+=(*it).first.capacity()+sizeof(int);
56   return ret;
57 }
58
59 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull() const
60 {
61   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
62 }
63
64 /*!
65  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
66  * file. The first mesh in the file is loaded.
67  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
68  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
69  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
70  *  \throw If the file is not readable.
71  *  \throw If there is no meshes in the file.
72  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
73  */
74 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
75 {
76   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
77   if(ms.empty())
78     {
79       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
80       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
81     }
82   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
83   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
84   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
85   int dt,it;
86   std::string dummy2;
87   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
88   switch(meshType)
89   {
90     case UNSTRUCTURED:
91       {
92         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
93         ret->loadUMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
94         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
95       }
96     case CARTESIAN:
97       {
98         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
99         ret->loadCMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
100         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
101       }
102     case CURVE_LINEAR:
103       {
104         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
105         ret->loadCLMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
106         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
107       }
108     default:
109       {
110         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << ms.front() << "' exists but unsupported type yet !";
111         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
112       }
113   }
114 }
115
116 /*!
117  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
118  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
119  * iteration.
120  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
121  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
122  *  \param [in] dt - the number of a time step.
123  *  \param [in] it - the number of an iteration.
124  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
125  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
126  *  \throw If the file is not readable.
127  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
128  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
129  */
130 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
131 {
132   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
133   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
134   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
135   int dummy0,dummy1;
136   std::string dummy2;
137   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
138   switch(meshType)
139   {
140     case UNSTRUCTURED:
141       {
142         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
143         ret->loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
144         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
145       }
146     case CARTESIAN:
147       {
148         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
149         ret->loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
150         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
151       }
152     case CURVE_LINEAR:
153       {
154         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
155         ret->loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
156         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
157       }
158     default:
159       {
160         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << mName << "' exists but unsupported type yet !";
161         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
162       }
163   }
164 }
165
166 /*!
167  * Writes \a this mesh into an open MED file specified by its descriptor.
168  *  \param [in] fid - the MED file descriptor.
169  *  \throw If the mesh name is not set.
170  *  \throw If the file is open for reading only.
171  *  \throw If the writing mode == 1 and the same data is present in an existing file.
172  */
173 void MEDFileMesh::write(med_idt fid) const
174 {
175   if(!existsFamily(0))
176     const_cast<MEDFileMesh *>(this)->addFamily(DFT_FAM_NAME,0);
177   if(_name.empty())
178     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh : name is empty. MED file ask for a NON EMPTY name !");
179   writeLL(fid);
180 }
181
182 /*!
183  * Writes \a this mesh into a MED file specified by its name.
184  *  \param [in] fileName - the MED file name.
185  *  \param [in] mode - the writing mode. For more on \a mode, see \ref AdvMEDLoaderBasics.
186  * - 2 - erase; an existing file is removed.
187  * - 1 - append; same data should not be present in an existing file.
188  * - 0 - overwrite; same data present in an existing file is overwritten.
189  *  \throw If the mesh name is not set.
190  *  \throw If \a mode == 1 and the same data is present in an existing file.
191  */
192 void MEDFileMesh::write(const std::string& fileName, int mode) const
193 {
194   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
195   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
196   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
197   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
198   write(fid);
199 }
200
201 /*!
202  * Checks if \a this and another mesh are equal.
203  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
204  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
205  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
206  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
207  */
208 bool MEDFileMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
209 {
210   if(_order!=other->_order)
211     {
212       what="Orders differ !";
213       return false;
214     }
215   if(_iteration!=other->_iteration)
216     {
217       what="Iterations differ !";
218       return false;
219     }
220   if(fabs(_time-other->_time)>eps)
221     {
222       what="Time values differ !";
223       return false;
224     }
225   if(_dt_unit!=other->_dt_unit)
226     {
227       what="Time units differ !";
228       return false;
229     }
230   if(_name!=other->_name)
231     {
232       what="Names differ !";
233       return false;
234     }
235   //univ_name has been ignored -> not a bug because it is a mutable attribute
236   if(_desc_name!=other->_desc_name)
237     {
238       what="Description names differ !";
239       return false;
240     }
241   if(!areGrpsEqual(other,what))
242     return false;
243   if(!areFamsEqual(other,what))
244     return false;
245   return true;
246 }
247
248 void MEDFileMesh::setName(const std::string& name)
249 {
250   _name=name;
251 }
252
253 /*!
254  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
255  */
256 void MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes() const
257 {
258
259 }
260
261 bool MEDFileMesh::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
262 {
263   for(std::vector< std::pair<std::string,std::string> >::const_iterator it=modifTab.begin();it!=modifTab.end();it++)
264     {
265       if((*it).first==_name)
266         {
267           _name=(*it).second;
268           return true;
269         }
270     }
271   return false;
272 }
273
274 /*!
275  * Copies data on groups and families from another mesh.
276  *  \param [in] other - the mesh to copy the data from.
277  */
278 void MEDFileMesh::copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other)
279 {
280   _groups=other._groups;
281   _families=other._families;
282 }
283
284
285 /*!
286  * This method clear all the groups in the map.
287  * So this method does not operate at all on arrays.
288  * So this method can lead to orphan families.
289  * 
290  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
291  */
292 void MEDFileMesh::clearGrpMap()
293 {
294   _groups.clear();
295 }
296
297 /*!
298  * This method clear all the families in the map.
299  * So this method does not operate at all on arrays.
300  * WARNING ! if there are some groups lying on cleared families, those groups will be impacted !
301  *
302  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
303  */
304 void MEDFileMesh::clearFamMap()
305 {
306   _families.clear();
307 }
308
309 /*!
310  * This method clear all the families and groups in the map.
311  * So this method does not operate at all on arrays.
312  * As all groups and families entry will be removed after 
313  * the call of MEDFileMesh::setFamilyFieldArr method with 0 or None (python) in the 2nd parameter can be useful to reduce the size of the object.
314  *
315  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamMap
316  */
317 void MEDFileMesh::clearFamGrpMaps()
318 {
319   clearGrpMap();
320   clearFamMap();
321 }
322
323 /*!
324  * Returns names of families constituting a group.
325  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
326  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
327  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
328  */
329 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroup(const std::string& name) const
330 {
331   std::string oname(name);
332   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
333   if(it==_groups.end())
334     {
335       std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
336       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
337       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
338       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
339     }
340   return (*it).second;
341 }
342
343 /*!
344  * Returns names of families constituting some groups.
345  *  \param [in] grps - a sequence of names of groups of interest.
346  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
347  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
348  */
349 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const
350 {
351   std::set<std::string> fams;
352   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++)
353     {
354       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=_groups.find(*it);
355       if(it2==_groups.end())
356         {
357           std::ostringstream oss; oss << "No such group in mesh \"" << _name << "\" : " << *it; 
358           std::vector<std::string> grps2=getGroupsNames(); oss << "\" !\nAvailable groups are :";
359           std::copy(grps2.begin(),grps2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
360           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
361         }
362       fams.insert((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
363     }
364   std::vector<std::string> fams2(fams.begin(),fams.end());
365   return fams2;
366 }
367
368 /*!
369  * Returns ids of families constituting a group.
370  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
371  *  \return std::vector<int> - sequence of ids of the families.
372  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
373  */
374 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name) const
375 {
376   std::string oname(name);
377   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
378   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
379   if(it==_groups.end())
380     {
381       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
382       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
383       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
384     }
385   return getFamiliesIds((*it).second);
386 }
387
388 /*!
389  * Sets names of families constituting a group. If data on families of this group is
390  * already present, it is overwritten. Every family in \a fams is checked, and if a
391  family is not yet in \a this mesh, the default group id \c 0 is assigned to it.
392  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
393  *  \param [in] fams - a sequence of names of families constituting the group.
394  */
395 void MEDFileMesh::setFamiliesOnGroup(const std::string& name, const std::vector<std::string>& fams)
396 {
397   std::string oname(name);
398   _groups[oname]=fams;
399   for(std::vector<std::string>::const_iterator it1=fams.begin();it1!=fams.end();it1++)
400     {
401       std::map<std::string,int>::iterator it2=_families.find(*it1);
402       if(it2==_families.end())
403         _families[*it1]=0;
404     }
405 }
406
407 /*!
408  * Sets families constituting a group. The families are specified by their ids.
409  * If a family name is not found by its id, an exception is thrown.
410  * If several families have same id, the first one in lexical order is taken.
411  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
412  *  \param [in] famIds - a sequence of ids of families constituting the group.
413  *  \throw If a family name is not found by its id.
414  */
415 void MEDFileMesh::setFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name, const std::vector<int>& famIds)
416 {
417   std::string oname(name);
418   std::vector<std::string> fams(famIds.size());
419   int i=0;
420   for(std::vector<int>::const_iterator it1=famIds.begin();it1!=famIds.end();it1++,i++)
421     {
422       std::string name2=getFamilyNameGivenId(*it1);
423       fams[i]=name2;
424     }
425   _groups[oname]=fams;
426 }
427
428 /*!
429  * Returns names of groups including a given family.
430  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
431  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of groups including the family.
432  */
433 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsOnFamily(const std::string& name) const
434 {
435   std::vector<std::string> ret;
436   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();it1!=_groups.end();it1++)
437     {
438       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it1).second.begin();it2!=(*it1).second.end();it2++)
439         if((*it2)==name)
440           {
441             ret.push_back((*it1).first);
442             break;
443           }
444     }
445   return ret;
446 }
447
448 /*!
449  * Adds an existing family to groups.
450  *  \param [in] famName - a name of family to add to \a grps.
451  *  \param [in] grps - a sequence of group names to add the family in.
452  *  \throw If a family named \a famName not yet exists.
453  */
454 void MEDFileMesh::setGroupsOnFamily(const std::string& famName, const std::vector<std::string>& grps)
455 {
456   std::string fName(famName);
457   const std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fName);
458   if(it==_families.end())
459     {
460       std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
461       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << fName << "\" !\nAvailable families are :";
462       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
463       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
464     }
465   for(std::vector<std::string>::const_iterator it3=grps.begin();it3!=grps.end();it3++)
466     {
467       std::map< std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(*it3);
468       if(it2!=_groups.end())
469         (*it2).second.push_back(fName);
470       else
471         {
472           std::vector<std::string> grps2(1,fName);
473           _groups[*it3]=grps2;
474         }
475     }
476 }
477
478 /*!
479  * Returns names of all groups of \a this mesh.
480  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names.
481  */
482 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsNames() const
483 {
484   std::vector<std::string> ret(_groups.size());
485   int i=0;
486   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++,i++)
487     ret[i]=(*it).first;
488   return ret;
489 }
490
491 /*!
492  * Returns names of all families of \a this mesh.
493  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of family names.
494  */
495 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesNames() const
496 {
497   std::vector<std::string> ret(_families.size());
498   int i=0;
499   for(std::map<std::string, int >::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++,i++)
500     ret[i]=(*it).first;
501   return ret;
502 }
503
504 /*!
505  * Changes a name of every family, included in one group only, to be same as the group name.
506  *  \throw If there are families with equal names in \a this mesh.
507  */
508 void MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName()
509 {
510   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
511   std::map<std::string,int> newFams;
512   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
513     {
514       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
515       if(grps.size()==1 && groups[grps[0]].size()==1)
516         {
517           if(newFams.find(grps[0])!=newFams.end())
518             {
519               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << grps[0] << "\" already exists !";
520               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
521             }
522           newFams[grps[0]]=(*it).second;
523           std::vector<std::string>& grps2=groups[grps[0]];
524           std::size_t pos=std::distance(grps2.begin(),std::find(grps2.begin(),grps2.end(),(*it).first));
525           grps2[pos]=grps[0];
526         }
527       else
528         {
529           if(newFams.find((*it).first)!=newFams.end())
530             {
531               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << (*it).first << "\" already exists !";
532               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
533             }
534           newFams[(*it).first]=(*it).second;
535         }
536     }
537   _families=newFams;
538   _groups=groups;
539 }
540
541 /*!
542  * Removes all groups lying on no family. If there is no empty groups, \a this is let untouched.
543  * 
544  * \return the removed groups.
545  */
546 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeEmptyGroups()
547 {
548   std::vector<std::string> ret;
549   std::map<std::string, std::vector<std::string> > newGrps;
550   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
551     {
552       if((*it).second.empty())
553         ret.push_back((*it).first);
554       else
555         newGrps[(*it).first]=(*it).second;
556     }
557   if(!ret.empty())
558     _groups=newGrps;
559   return ret;
560 }
561
562 /*!
563  * Removes a group from \a this mesh.
564  *  \param [in] name - the name of the group to remove.
565  *  \throw If no group with such a \a name exists.
566  */
567 void MEDFileMesh::removeGroup(const std::string& name)
568 {
569   std::string oname(name);
570   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
571   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
572   if(it==_groups.end())
573     {
574       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
575       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
576       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
577     }
578   _groups.erase(it);
579 }
580
581 /*!
582  * Removes a family from \a this mesh.
583  *  \param [in] name - the name of the family to remove.
584  *  \throw If no family with such a \a name exists.
585  */
586 void MEDFileMesh::removeFamily(const std::string& name)
587 {
588   std::string oname(name);
589   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
590   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
591   if(it==_families.end())
592     {
593       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
594       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
595       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
596     }
597   _families.erase(it);
598   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
599     {
600       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
601       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
602       if(it4!=v.end())
603         v.erase(it4);
604     }
605 }
606
607 /*!
608  * Removes all groups in \a this that are orphan. A group is orphan if this group lies on
609  * a set of families, themselves orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
610  * family field whatever its level. This method also suppresses the orphan families.
611  * 
612  * \return - The list of removed groups names. 
613  *
614  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanFamilies.
615  */
616 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanGroups()
617 {
618   removeOrphanFamilies();
619   return removeEmptyGroups();
620 }
621
622 /*!
623  * Removes all families in \a this that are orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
624  * family field whatever its level. Groups are updated in consequence, that is to say all groups lying on orphan family, will see their families list modified.
625  * 
626  * \return - The list of removed families names.
627  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanGroups.
628  */
629 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanFamilies()
630 {
631   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allFamIdsInUse=computeAllFamilyIdsInUse();
632   std::vector<std::string> ret;
633   if(!((DataArrayInt*)allFamIdsInUse))
634     {
635       ret=getFamiliesNames();
636       _families.clear(); _groups.clear();
637       return ret;
638     }
639   std::map<std::string,int> famMap;
640   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grps(_groups);
641   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
642     {
643       if(allFamIdsInUse->presenceOfValue((*it).second))
644         famMap[(*it).first]=(*it).second;
645       else
646         {
647           ret.push_back((*it).first);
648           std::vector<std::string> grpsOnEraseFam=getGroupsOnFamily((*it).first);
649           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOnEraseFam.begin();it2!=grpsOnEraseFam.end();it2++)
650             {
651               std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=grps.find(*it2);//it3!=grps.empty() thanks to copy
652               std::vector<std::string>& famv=(*it3).second;
653               std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(famv.begin(),famv.end(),(*it).first);//it4!=famv.end() thanks to copy
654               famv.erase(it4);
655             }
656         }
657     }
658   if(!ret.empty())
659     { _families=famMap; _groups=grps; }
660   return ret;
661 }
662
663 /*!
664  * Renames a group in \a this mesh.
665  *  \param [in] oldName - a current name of the group to rename.
666  *  \param [in] newName - a new group name.
667  *  \throw If no group named \a oldName exists in \a this mesh.
668  *  \throw If a group named \a newName already exists.
669  */
670 void MEDFileMesh::changeGroupName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
671 {
672   std::string oname(oldName);
673   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
674   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
675   if(it==_groups.end())
676     {
677       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << oldName << "\" !\nAvailable groups are :";
678       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
679       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
680     }
681   std::string nname(newName);
682   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(nname);
683   if(it2!=_groups.end())
684     {
685       std::ostringstream oss; oss << "Such groupname \"" << newName << "\" already exists ! Kill it before !";
686       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
687     }
688   std::vector<std::string> cpy=(*it).second;
689   _groups.erase(it);
690   _groups[newName]=cpy;
691 }
692
693 /*!
694  * Changes an id of a family in \a this mesh. 
695  * This method calls changeFamilyIdArr().
696  *  \param [in] oldId - a current id of the family.
697  *  \param [in] newId - a new family id.
698  */
699 void MEDFileMesh::changeFamilyId(int oldId, int newId)
700 {
701   changeFamilyIdArr(oldId,newId);
702   std::map<std::string,int> fam2;
703   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
704     {
705       if((*it).second==oldId)
706         fam2[(*it).first]=newId;
707       else
708         fam2[(*it).first]=(*it).second;
709     }
710   _families=fam2;
711 }
712
713 /*!
714  * Renames a family in \a this mesh.
715  *  \param [in] oldName - a current name of the family to rename.
716  *  \param [in] newName - a new family name.
717  *  \throw If no family named \a oldName exists in \a this mesh.
718  *  \throw If a family named \a newName already exists.
719  */
720 void MEDFileMesh::changeFamilyName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
721 {
722   std::string oname(oldName);
723   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
724   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
725   if(it==_families.end())
726     {
727       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << oldName << "\" !\nAvailable families are :";
728       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
729       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
730     }
731   std::string nname(newName);
732   std::map<std::string, int >::iterator it2=_families.find(nname);
733   if(it2!=_families.end())
734     {
735       std::ostringstream oss; oss << "Such familyname \"" << newName << " already exists ! Kill it before !";
736       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
737     }
738   int cpy=(*it).second;
739   _families.erase(it);
740   _families[newName]=cpy;
741   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
742     {
743       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
744       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
745       if(it4!=v.end())
746         (*it4)=nname;
747     }
748 }
749
750 /*!
751  * Checks if \a this and another mesh contains the same families.
752  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
753  *  \param [in,out] what - an unused parameter.
754  *  \return bool - \c true if number of families and their ids are the same in the two
755  *          meshes. Families with the id == \c 0 are not considered.
756  */
757 bool MEDFileMesh::areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
758 {
759   if(_families==other->_families)
760     return true;
761   std::map<std::string,int> fam0;
762   std::map<std::string,int> fam1;
763   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
764     if((*it).second!=0)
765       fam0[(*it).first]=(*it).second;
766   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=other->_families.begin();it!=other->_families.end();it++)
767     if((*it).second!=0)
768       fam1[(*it).first]=(*it).second;
769   return fam0==fam1;
770 }
771
772 /*!
773  * Checks if \a this and another mesh contains the same groups.
774  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
775  *  \param [in,out] what - a string describing a difference of groups of the two meshes
776  *          in case if this method returns \c false.
777  *  \return bool - \c true if number of groups and families constituting them are the
778  *          same in the two meshes.
779  */
780 bool MEDFileMesh::areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
781 {
782   if(_groups==other->_groups)
783     return true;
784   bool ret=true;
785   std::size_t sz=_groups.size();
786   if(sz!=other->_groups.size())
787     {
788       what="Groups differ because not same number !\n";
789       ret=false;
790     }
791   if(ret)
792     {
793       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();
794       for(std::size_t i=0;i<sz && ret;i++,it1++)
795         {
796           std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=other->_groups.find((*it1).first);
797           if(it2!=other->_groups.end())
798             {
799               std::set<std::string> s1((*it1).second.begin(),(*it1).second.end());
800               std::set<std::string> s2((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
801               ret=(s1==s2);
802             }
803           else
804             {
805               ret=false;
806               what="A group in first mesh exists not in other !\n";
807             }
808         }
809     }
810   if(!ret)
811     {
812       std::ostringstream oss; oss << "Groups description differs :\n";
813       oss << "First group description :\n";
814       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
815         {
816           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
817           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
818             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
819         }
820       oss << "Second group description :\n";
821       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=other->_groups.begin();it!=other->_groups.end();it++)
822         {
823           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
824           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
825             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
826         }
827       what+=oss.str();
828     }
829   return ret;
830 }
831
832 /*!
833  * Checks if a group with a given name exists in \a this mesh.
834  *  \param [in] groupName - the group name.
835  *  \return bool - \c true the group \a groupName exists in \a this mesh.
836  */
837 bool MEDFileMesh::existsGroup(const std::string& groupName) const
838 {
839   std::string grpName(groupName);
840   return _groups.find(grpName)!=_groups.end();
841 }
842
843 /*!
844  * Checks if a family with a given id exists in \a this mesh.
845  *  \param [in] famId - the family id.
846  *  \return bool - \c true the family with the id \a famId exists in \a this mesh.
847  */
848 bool MEDFileMesh::existsFamily(int famId) const
849 {
850   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
851     if((*it2).second==famId)
852       return true;
853   return false;
854 }
855
856 /*!
857  * Checks if a family with a given name exists in \a this mesh.
858  *  \param [in] familyName - the family name.
859  *  \return bool - \c true the family \a familyName exists in \a this mesh.
860  */
861 bool MEDFileMesh::existsFamily(const std::string& familyName) const
862 {
863   std::string fname(familyName);
864   return _families.find(fname)!=_families.end();
865 }
866
867 /*!
868  * Sets an id of a family.
869  *  \param [in] familyName - the family name.
870  *  \param [in] id - a new id of the family.
871  */
872 void MEDFileMesh::setFamilyId(const std::string& familyName, int id)
873 {
874   std::string fname(familyName);
875   _families[fname]=id;
876 }
877
878 void MEDFileMesh::setFamilyIdUnique(const std::string& familyName, int id)
879 {
880   std::string fname(familyName);
881   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
882     if((*it).second==id)
883       {
884         if((*it).first!=familyName)
885           {
886             std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::setFamilyIdUnique : Family id #" << id << " is already belonging to family with name \"" << (*it).first << "\" !";
887             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
888           }
889       }
890   _families[fname]=id;
891 }
892
893 /*!
894  * Adds a family to \a this mesh.
895  *  \param [in] familyName - a name of the family.
896  *  \param [in] famId - an id of the family.
897  *  \throw If a family with the same name or id already exists in \a this mesh.
898  */
899 void MEDFileMesh::addFamily(const std::string& familyName, int famId)
900 {
901   std::string fname(familyName);
902   std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fname);
903   if(it==_families.end())
904     {
905       for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
906         if((*it2).second==famId)
907           {
908             std::ostringstream oss;
909             oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << (*it2).first << "\" already exists with specified id : " << famId << " !";
910             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
911           }
912       _families[fname]=famId;
913     }
914   else
915     {
916       if((*it).second!=famId)
917         {
918           std::ostringstream oss;
919           oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << fname << "\" already exists but has id set to " << (*it).second << " different from asked famId " << famId << " !";
920           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
921         }
922     }
923 }
924
925 /*!
926  * Creates a group including all mesh entities of given dimension.
927  * \warning This method does \b not guarantee that the created group includes mesh
928  * entities of only \a meshDimRelToMaxExt dimension in the case if some family id is
929  * present in family fields of different dimensions. To assure this, call
930  * ensureDifferentFamIdsPerLevel() \b before calling this method.
931  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of mesh entities to include to
932  *          the group.
933  *  \param [in] groupName - a name of the new group.
934  *  \throw If a group named \a groupName already exists.
935  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt exist in \a this mesh.
936  *  \throw If no family field of dimension \a meshDimRelToMaxExt is present in \a this mesh.
937  */
938 void MEDFileMesh::createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& groupName)
939 {
940   std::string grpName(groupName);
941   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
942   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
943     {
944       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The relative ext dimension " << meshDimRelToMaxExt << " is not available !" << std::endl;
945       oss << "Available relative ext levels are : ";
946       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
947       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
948     }
949   if(existsGroup(groupName))
950     {
951       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The groups \"" << grpName << "\" already exists in this !" << std::endl;
952       oss << "Already existing groups are : ";
953       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
954       oss << std::endl << "Please choose an another group name or call removeGroup(\"" << grpName << "\") method !";
955       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
956     }
957   const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
958   if(fieldFamIds==0)
959     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::createGroupOnAll : Family field arr ids is not defined for this level !");
960   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=fieldFamIds->getDifferentValues();
961   std::vector<std::string> familiesOnWholeGroup;
962   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
963     {
964       bool tmp;
965       familiesOnWholeGroup.push_back(findOrCreateAndGiveFamilyWithId(*it,tmp));
966     }
967   _groups[grpName]=familiesOnWholeGroup;
968 }
969
970 /*!
971  * Ensures that given family ids do not present in family fields of dimensions different
972  * than given ones. If a family id is present in the family fields of dimensions different
973  * than the given ones, a new family is created and the whole data is updated accordingly.
974  *  \param [in] famIds - a sequence of family ids to check.
975  *  \param [in] vMeshDimRelToMaxExt - a sequence of relative dimensions to which the \a
976  *          famIds should exclusively belong.
977  *  \return bool - \c true if no modification is done in \a this mesh by this method.
978  */
979 bool MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& vMeshDimRelToMaxExt)
980 {
981   std::set<int> levsInput(vMeshDimRelToMaxExt.begin(),vMeshDimRelToMaxExt.end());
982   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
983   std::set<int> levs2(levs.begin(),levs.end());
984   std::vector<int> levsToTest;
985   std::set_difference(levs2.begin(),levs2.end(),levsInput.begin(),levsInput.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(levsToTest));
986   std::set<int> famIds2(famIds.begin(),famIds.end());
987   bool ret=true;
988   int maxFamId=1;
989   if(!_families.empty())
990     maxFamId=getMaxFamilyId()+1;
991   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
992   for(std::vector<int>::const_iterator it=levsToTest.begin();it!=levsToTest.end();it++)
993     {
994       const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(*it);
995       if(fieldFamIds)
996         {
997           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds3=fieldFamIds->getDifferentValues();
998           std::vector<int> tmp;
999           std::set_intersection(famIds3->begin(),famIds3->end(),famIds2.begin(),famIds2.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(tmp));
1000           for(std::vector<int>::const_iterator it2=tmp.begin();it2!=tmp.end();it2++)
1001             {
1002               ret=false;
1003               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it2);
1004               std::ostringstream oss; oss << "Family_" << maxFamId;
1005               std::string zeName=CreateNameNotIn(oss.str(),allFams);
1006               addFamilyOnAllGroupsHaving(famName,zeName);
1007               _families[zeName]=maxFamId;
1008               (const_cast<DataArrayInt *>(fieldFamIds))->changeValue(*it2,maxFamId);
1009               maxFamId++;
1010             }
1011         }
1012     }
1013   return ret;
1014 }
1015
1016 /*!
1017  * Adds a family to a given group in \a this mesh. If the group with a given name does
1018  * not exist, it is created.
1019  *  \param [in] grpName - the name of the group to add the family in.
1020  *  \param [in] famName - the name of the family to add to the group named \a grpName.
1021  *  \throw If \a grpName or \a famName is an empty string.
1022  *  \throw If no family named \a famName is present in \a this mesh.
1023  */
1024 void MEDFileMesh::addFamilyOnGrp(const std::string& grpName, const std::string& famName)
1025 {
1026   std::string grpn(grpName);
1027   std::string famn(famName);
1028   if(grpn.empty() || famn.empty())
1029     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : input strings must be non null !");
1030   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1031   if(std::find(fams.begin(),fams.end(),famn)==fams.end())
1032     {
1033       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : Family \"" << famn << "\" does not exist !" << std::endl;
1034       oss << "Create this family or choose an existing one ! Existing fams are : ";
1035       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," ")); oss << ".";
1036       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1037     }
1038   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(grpn);
1039   if(it==_groups.end())
1040     {
1041       _groups[grpn].push_back(famn);
1042     }
1043   else
1044     {
1045       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find((*it).second.begin(),(*it).second.end(),famn);
1046       if(it2==(*it).second.end())
1047         (*it).second.push_back(famn);
1048     }
1049 }
1050
1051 /*!
1052  * This method adds to all groups lying on family with name 'famName' the other family name 'otherFamName'.
1053  * This method is quite underground because it can lead to unconsistency because family 'otherFamName' is \b not added into _families.
1054  * This method is used by MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs method.
1055  */
1056 void MEDFileMesh::addFamilyOnAllGroupsHaving(const std::string& famName, const std::string& otherFamName)
1057 {
1058   std::string famNameCpp(famName);
1059   std::string otherCpp(otherFamName);
1060   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
1061     {
1062       std::vector<std::string>& v=(*it).second;
1063       if(std::find(v.begin(),v.end(),famNameCpp)!=v.end())
1064         {
1065           v.push_back(otherCpp);
1066         }
1067     }
1068 }
1069
1070 void MEDFileMesh::changeAllGroupsContainingFamily(const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1071 {
1072   ChangeAllGroupsContainingFamily(_groups,familyNameToChange,newFamiliesNames);
1073 }
1074
1075 void MEDFileMesh::ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1076 {
1077   std::string fam(familyNameToChange);
1078   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=groups.begin();it!=groups.end();it++)
1079     {
1080       std::vector<std::string>& fams((*it).second);
1081       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find(fams.begin(),fams.end(),fam);
1082       if(it2!=fams.end())
1083         {
1084           fams.erase(it2);
1085           fams.insert(fams.end(),newFamiliesNames.begin(),newFamiliesNames.end());
1086         }
1087     }
1088 }
1089
1090 /*!
1091  * Returns a name of the family having a given id or, if no such a family exists, creates
1092  * a new uniquely named family and returns its name.
1093  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1094  *  \param [out] created - returns \c true if the new family has been created, \c false, else.
1095  *  \return std::string - the name of the existing or the created family.
1096  *  \throw If it is not possible to create a unique family name.
1097  */
1098 std::string MEDFileMesh::findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created)
1099 {
1100   return FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(_families,id,created);
1101 }
1102
1103 /*!
1104  * If it exists a family whose family id is equal to 'id' this method behaves as MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId.
1105  * In this case, 'this' internal states remains unchanged and 'created' out parameter will be set to false.
1106  * If there is no family whose family id is equal to 'id' a family is created with a name different from those
1107  * already existing. In this case 'created' will be returned with a value set to true, and internal state
1108  * will be modified.
1109  * This method will throws an exception if it is not possible to create a unique family name.
1110  */
1111 std::string MEDFileMesh::FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created)
1112 {
1113   std::vector<std::string> famAlreadyExisting(families.size());
1114   int ii=0;
1115   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++,ii++)
1116     {
1117       if((*it).second!=id)
1118         {
1119           famAlreadyExisting[ii]=(*it).first;
1120         }
1121       else
1122         {
1123           created=false;
1124           return (*it).first;
1125         }
1126     }
1127   created=true;
1128   std::ostringstream oss; oss << "Family_" << id;
1129   std::string ret=CreateNameNotIn(oss.str(),famAlreadyExisting);
1130   families[ret]=id;
1131   return ret;
1132 }
1133
1134 /*!
1135  * Sets names and ids of all families in \a this mesh.
1136  *  \param [in] info - a map of a family name to a family id.
1137  */
1138 void MEDFileMesh::setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info)
1139 {
1140   _families=info;
1141 }
1142
1143 /*!
1144  * Sets names of all groups and families constituting them in \a this mesh.
1145  *  \param [in] info - a map of a group name to a vector of names of families
1146  *          constituting the group.
1147  */
1148 void MEDFileMesh::setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info)
1149 {
1150   _groups=info;
1151 }
1152
1153 /*!
1154  * Returns an id of the family having a given name.
1155  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
1156  *  \return int - the id of the family of interest.
1157  *  \throw If no family with such a \a name exists.
1158  */
1159 int MEDFileMesh::getFamilyId(const std::string& name) const
1160 {
1161   std::string oname(name);
1162   std::map<std::string, int>::const_iterator it=_families.find(oname);
1163   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1164   if(it==_families.end())
1165     {
1166       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
1167       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1168       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1169     }
1170   return (*it).second;
1171 }
1172
1173 /*!
1174  * Returns ids of the families having given names.
1175  *  \param [in] fams - a sequence of the names of families of interest.
1176  *  \return std::vector<int> - a sequence of the ids of families of interest.
1177  *  \throw If \a fams contains a name of an inexistent family.
1178  */
1179 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& fams) const
1180 {
1181   std::vector<int> ret(fams.size());
1182   int i=0;
1183   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++,i++)
1184     {
1185       std::map<std::string, int>::const_iterator it2=_families.find(*it);
1186       if(it2==_families.end())
1187         {
1188           std::vector<std::string> fams2=getFamiliesNames();
1189           std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << *it << "\" in input list !\nAvailable families are :";
1190           std::copy(fams2.begin(),fams2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1191           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1192         }
1193       ret[i]=(*it2).second;
1194     }
1195   return ret;
1196 }
1197
1198 /*!
1199  * Returns a maximal abs(id) of families in \a this mesh.
1200  *  \return int - the maximal norm of family id.
1201  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1202  */
1203 int MEDFileMesh::getMaxAbsFamilyId() const
1204 {
1205   if(_families.empty())
1206     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1207   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1208   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1209     {
1210       ret=std::max(std::abs((*it).second),ret);
1211     }
1212   return ret;
1213 }
1214
1215 /*!
1216  * Returns a maximal id of families in \a this mesh.
1217  *  \return int - the maximal family id.
1218  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1219  */
1220 int MEDFileMesh::getMaxFamilyId() const
1221 {
1222   if(_families.empty())
1223     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1224   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1225   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1226     {
1227       ret=std::max((*it).second,ret);
1228     }
1229   return ret;
1230 }
1231
1232 /*!
1233  * Returns a minimal id of families in \a this mesh.
1234  *  \return int - the minimal family id.
1235  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1236  */
1237 int MEDFileMesh::getMinFamilyId() const
1238 {
1239   if(_families.empty())
1240     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMinFamilyId : no families set !");
1241   int ret=std::numeric_limits<int>::max();
1242   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1243     {
1244       ret=std::min((*it).second,ret);
1245     }
1246   return ret;
1247 }
1248
1249 /*!
1250  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1251  * considered but all family fields as well.
1252  *  \return int - the maximal family id.
1253  */
1254 int MEDFileMesh::getTheMaxAbsFamilyId() const
1255 {
1256   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1257   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1258     m1=std::max(std::abs((*it).second),m1);
1259   int m2=getMaxAbsFamilyIdInArrays();
1260   return std::max(m1,m2);
1261 }
1262
1263 /*!
1264  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1265  * considered but all family fields as well.
1266  *  \return int - the maximal family id.
1267  */
1268 int MEDFileMesh::getTheMaxFamilyId() const
1269 {
1270   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1271   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1272     m1=std::max((*it).second,m1);
1273   int m2=getMaxFamilyIdInArrays();
1274   return std::max(m1,m2);
1275 }
1276
1277 /*!
1278  * Returns a minimal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1279  * considered but all family fields as well.
1280  *  \return int - the minimal family id.
1281  */
1282 int MEDFileMesh::getTheMinFamilyId() const
1283 {
1284   int m1=std::numeric_limits<int>::max();
1285   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1286     m1=std::min((*it).second,m1);
1287   int m2=getMinFamilyIdInArrays();
1288   return std::min(m1,m2);
1289 }
1290
1291 /*!
1292  * This method only considers the maps. The contain of family array is ignored here.
1293  * 
1294  * \sa MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse
1295  */
1296 DataArrayInt *MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced() const
1297 {
1298   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1299   std::set<int> v;
1300   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1301     v.insert((*it).second);
1302   ret->alloc((int)v.size(),1);
1303   std::copy(v.begin(),v.end(),ret->getPointer());
1304   return ret.retn();
1305 }
1306
1307 /*!
1308  * This method does not consider map of family name, family id. Only family field array on different levels is considered.
1309  * 
1310  * \sa MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced
1311  */
1312 DataArrayInt *MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse() const
1313 {
1314   std::vector<int> famLevs=getFamArrNonEmptyLevelsExt();
1315   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret;
1316   for(std::vector<int>::const_iterator it=famLevs.begin();it!=famLevs.end();it++)
1317     {
1318       const DataArrayInt *arr=getFamilyFieldAtLevel(*it);//arr not null due to spec of getFamArrNonEmptyLevelsExt
1319       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> dv=arr->getDifferentValues();
1320       if((DataArrayInt *) ret)
1321         ret=dv->buildUnion(ret);
1322       else
1323         ret=dv;
1324     }
1325   return ret.retn();
1326 }
1327
1328 /*!
1329  * true is returned if no modification has been needed. false if family
1330  * renumbering has been needed.       
1331  */
1332 bool MEDFileMesh::ensureDifferentFamIdsPerLevel()
1333 {
1334   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1335   std::set<int> allFamIds;
1336   int maxId=getMaxFamilyId()+1;
1337   std::map<int,std::vector<int> > famIdsToRenum;
1338   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1339     {
1340       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it);
1341       if(fam)
1342         {
1343           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1344           std::set<int> r2;
1345           std::set_intersection(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r2,r2.end()));
1346           if(!r2.empty())
1347             famIdsToRenum[*it].insert(famIdsToRenum[*it].end(),r2.begin(),r2.end());
1348           std::set<int> r3;
1349           std::set_union(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r3,r3.end()));
1350         }
1351     }
1352   if(famIdsToRenum.empty())
1353     return true;
1354   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1355   for(std::map<int,std::vector<int> >::const_iterator it2=famIdsToRenum.begin();it2!=famIdsToRenum.end();it2++)
1356     {
1357       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt *>(getFamilyFieldAtLevel((*it2).first));
1358       int *famIdsToChange=fam->getPointer();
1359       std::map<int,int> ren;
1360       for(std::vector<int>::const_iterator it3=(*it2).second.begin();it3!=(*it2).second.end();it3++,maxId++)
1361         {
1362           if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1363             {
1364               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1365               std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily(famName);
1366               ren[*it3]=maxId;
1367               bool dummy;
1368               std::string newFam=findOrCreateAndGiveFamilyWithId(maxId,dummy);
1369               for(std::vector<std::string>::const_iterator it4=grps.begin();it4!=grps.end();it4++)
1370                 addFamilyOnGrp((*it4),newFam);
1371             }
1372         }
1373       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getIdsEqualList(&(*it2).second[0],&(*it2).second[0]+(*it2).second.size());
1374       for(const int *id=ids->begin();id!=ids->end();id++)
1375         famIdsToChange[*id]=ren[famIdsToChange[*id]];
1376     }
1377   return false;
1378 }
1379
1380 /*!
1381  * This method normalizes fam id with the policy explained underneath. This policy is close to those implemented in SMESH.
1382  * Level #0 famids > 0, Level #-1 famids < 0, Level #-2 famids=0, Level #1 famids=0
1383  * This policy is those used by SMESH and Trio and that is the opposite of those in MED file.
1384  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1385  * \warning This policy is the opposite of those in MED file documentation ...
1386  */
1387 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsTrio()
1388 {
1389   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1390   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1391   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1392   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1393   std::set<std::string> famsFetched;
1394   std::map<std::string,int> families;
1395   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)!=levs.end())
1396     {
1397       levsS.erase(0);
1398       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(0);
1399       if(fam)
1400         {
1401           int refId=1;
1402           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1403           std::map<int,int> ren;
1404           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1405             ren[*it]=refId;
1406           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1407           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1408           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1409             *w=ren[*w];
1410           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1411             {
1412               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1413                 {
1414                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1415                   families[famName]=ren[*it];
1416                   famsFetched.insert(famName);
1417                 }
1418             }
1419         }
1420     }
1421   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)!=levs.end())
1422     {
1423       levsS.erase(-1);
1424       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
1425       if(fam)
1426         {
1427           int refId=-1;
1428           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1429           std::map<int,int> ren;
1430           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1431             ren[*it]=refId;
1432           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1433           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1434           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1435             *w=ren[*w];
1436           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1437             {
1438               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1439                 {
1440                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1441                   families[famName]=ren[*it];
1442                   famsFetched.insert(famName);
1443                 }
1444             }
1445         }
1446     }
1447   for(std::set<int>::const_iterator it2=levsS.begin();it2!=levsS.end();it2++)
1448     {
1449       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt*>(getFamilyFieldAtLevel(*it2));
1450       if(fam)
1451         {
1452           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1453           fam->fillWithZero();
1454           for(const int *it3=tmp->begin();it3!=tmp->end();it3++)
1455             if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1456               {
1457                 std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1458                 families[famName]=0;
1459                 famsFetched.insert(famName);
1460               }
1461         }
1462     }
1463   //
1464   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1465   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1466   std::set<std::string> unFetchedIds;
1467   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1468   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1469     families[*it4]=_families[*it4];
1470   _families=families;
1471 }
1472
1473 /*!
1474  * This method normalizes fam id with the following policy.
1475  * Level #0 famids < 0, Level #-1 famids < 0 and for Level #1 famids >= 0
1476  * This policy is those defined in the MED file format but is the opposite of those implemented in SMESH and Trio.
1477  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1478  */
1479 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsMEDFile()
1480 {
1481   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1482   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1483   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1484   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1485   std::set<std::string> famsFetched;
1486   std::map<std::string,int> families;
1487   int refId=1;
1488   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),1)!=levs.end())
1489     {
1490       levsS.erase(1);
1491       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(1);
1492       if(fam)
1493         {
1494           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1495           std::map<int,int> ren;
1496           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1497             ren[*it]=refId;
1498           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1499           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1500           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1501             *w=ren[*w];
1502           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1503             {
1504               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1505                 {
1506                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1507                   families[famName]=ren[*it];
1508                   famsFetched.insert(famName);
1509                 }
1510             }
1511         }
1512     }
1513   refId=-1;
1514   for(std::set<int>::const_reverse_iterator it2=levsS.rbegin();it2!=levsS.rend();it2++)
1515     {
1516       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it2);
1517       if(fam)
1518         {
1519           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1520           std::map<int,int> ren;
1521           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1522             ren[*it]=refId;
1523           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1524           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1525           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1526             *w=ren[*w];
1527           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1528             {
1529               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1530                 {
1531                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1532                   families[famName]=ren[*it];
1533                   famsFetched.insert(famName);
1534                 }
1535             }
1536         }
1537     }
1538   //
1539   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1540   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1541   std::set<std::string> unFetchedIds;
1542   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1543   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1544     families[*it4]=_families[*it4];
1545   _families=families;
1546 }
1547
1548 /*!
1549  * Returns a name of the family by its id. If there are several families having the given
1550  * id, the name first in lexical order is returned.
1551  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1552  *  \return std::string - the name of the found family.
1553  *  \throw If no family with the given \a id exists.
1554  */
1555 std::string MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId(int id) const
1556 {
1557   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1558     if((*it).second==id)
1559       return (*it).first;
1560   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::getFamilyNameGivenId : no such family id : " << id;
1561   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1562 }
1563
1564 /*!
1565  * Returns a string describing \a this mesh. This description includes the mesh name and
1566  * the mesh description string.
1567  *  \return std::string - the mesh information string.
1568  */
1569 std::string MEDFileMesh::simpleRepr() const
1570 {
1571   std::ostringstream oss;
1572   oss << "(*************************************)\n(* GENERAL INFORMATION ON THE MESH : *)\n(*************************************)\n";
1573   oss << "- Name of the mesh : <<" << getName() << ">>\n";
1574   oss << "- Description associated to the mesh : " << getDescription() << std::endl;
1575   return oss.str();
1576 }
1577
1578 /*!
1579  * Returns ids of mesh entities contained in a given group of a given dimension.
1580  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1581  *          are required.
1582  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1583  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1584  *          returned instead of ids. 
1585  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1586  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the group. The caller
1587  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1588  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1589  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1590  */
1591 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
1592 {
1593   std::vector<std::string> tmp(1);
1594   tmp[0]=grp;
1595   DataArrayInt *ret=getGroupsArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1596   ret->setName(grp);
1597   return ret;
1598 }
1599
1600 /*!
1601  * Returns ids of mesh entities contained in given groups of a given dimension.
1602  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1603  *          are required.
1604  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1605  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1606  *          returned instead of ids.
1607  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1608  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the groups. The caller
1609  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1610  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1611  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1612  */
1613 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1614 {
1615   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
1616   return getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
1617 }
1618
1619 /*!
1620  * Returns ids of mesh entities contained in a given family of a given dimension.
1621  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1622  *          are required.
1623  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
1624  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1625  *          returned instead of ids. 
1626  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1627  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the family. The caller
1628  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1629  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1630  */
1631 DataArrayInt *MEDFileMesh::getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
1632 {
1633   std::vector<std::string> tmp(1);
1634   tmp[0]=fam;
1635   DataArrayInt *ret=getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1636   ret->setName(fam);
1637   return ret;
1638 }
1639
1640 /*!
1641  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1642  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1643  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1644  *          returned instead of ids. 
1645  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1646  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1647  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1648  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1649  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1650  */
1651 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupArr(const std::string& grp, bool renum) const
1652 {
1653   std::vector<std::string> tmp(1);
1654   tmp[0]=grp;
1655   DataArrayInt *ret=getNodeGroupsArr(tmp,renum);
1656   ret->setName(grp);
1657   return ret;
1658 }
1659
1660 /*!
1661  * Returns ids of nodes contained in given groups.
1662  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1663  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1664  *          returned instead of ids. 
1665  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1666  *          numbers, if available and required, of nodes of the groups. The caller
1667  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1668  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1669  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1670  */
1671 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1672 {
1673   return getGroupsArr(1,grps,renum);
1674 }
1675
1676 /*!
1677  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1678  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1679  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1680  *          returned instead of ids. 
1681  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1682  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1683  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1684  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1685  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1686  */
1687 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamilyArr(const std::string& fam, bool renum) const
1688 {
1689   std::vector<std::string> tmp(1);
1690   tmp[0]=fam;
1691   DataArrayInt *ret=getNodeFamiliesArr(tmp,renum);
1692   ret->setName(fam);
1693   return ret;
1694 }
1695
1696 /*!
1697  * Returns ids of nodes contained in given families.
1698  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
1699  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1700  *          returned instead of ids. 
1701  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1702  *          numbers, if available and required, of nodes of the families. The caller
1703  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1704  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1705  */
1706 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
1707 {
1708   return getFamiliesArr(1,fams,renum);
1709 }
1710
1711 /*!
1712  * Adds groups of given dimension and creates corresponding families and family fields
1713  * given ids of mesh entities of each group.
1714  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative mesh dimension of given mesh entities.
1715  *  \param [in] grps - a sequence of arrays of ids each describing a group.
1716  *  \param [in] renum - \c true means that \a grps contains not ids but optional numbers
1717  *          of mesh entities.
1718  *  \throw If names of some groups in \a grps are equal.
1719  *  \throw If \a grps includes a group with an empty name.
1720  *  \throw If \a grps includes invalid ids (or numbers if \a renum == \c true ).
1721  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
1722  */
1723 void MEDFileMesh::setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum)
1724 {
1725   if(grps.empty())
1726     return ;
1727   std::set<std::string> grpsName;
1728   std::vector<std::string> grpsName2(grps.size());
1729   int i=0;
1730
1731   for(std::vector<const DataArrayInt *>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++,i++)
1732     {
1733       grpsName.insert((*it)->getName());
1734       grpsName2[i]=(*it)->getName();
1735     }
1736   if(grpsName.size()!=grps.size())
1737     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different each other !");
1738   if(grpsName.find(std::string(""))!=grpsName.end())
1739     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different empty string !");
1740   int sz=getSizeAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
1741   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam;
1742   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
1743   if(!renum)
1744     {
1745       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps,sz,fidsOfGroups);
1746     }
1747   else
1748     {
1749       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grps2(grps.size());
1750       for(unsigned int ii=0;ii<grps.size();ii++)
1751         {
1752           grps2[ii]=MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(getRevNumberFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt),grps[ii]);
1753           grps2[ii]->setName(grps[ii]->getName());
1754         }
1755       std::vector<const DataArrayInt *> grps3(grps2.begin(),grps2.end());
1756       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps3,sz,fidsOfGroups);
1757     }
1758   int offset=1;
1759   if(!_families.empty())
1760     offset=getMaxAbsFamilyId()+1;
1761   TranslateFamilyIds(meshDimRelToMaxExt==1?offset:-offset,fam,fidsOfGroups);
1762   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getDifferentValues();
1763   appendFamilyEntries(ids,fidsOfGroups,grpsName2);
1764   setFamilyFieldArr(meshDimRelToMaxExt,fam);
1765 }
1766
1767 /*!
1768  * This method append into '_families' attribute the families whose ids are in 'famIds'. Warning 'famIds' are expected to be ids
1769  * not in '_families'. Groups information are given in parameters in order to give to families representative names.
1770  * For the moment, the two last input parameters are not taken into account.
1771  */
1772 void MEDFileMesh::appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames)
1773 {
1774   std::map<int,std::string> famInv;
1775   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
1776     {
1777       std::ostringstream oss;
1778       oss << "Family_" << (*it);
1779       _families[oss.str()]=(*it);
1780       famInv[*it]=oss.str();
1781     }
1782   int i=0;
1783   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=fidsOfGrps.begin();it1!=fidsOfGrps.end();it1++,i++)
1784     {
1785       for(std::vector<int>::const_iterator it2=(*it1).begin();it2!=(*it1).end();it2++)
1786         {
1787           _groups[grpNames[i]].push_back(famInv[*it2]);
1788         }
1789     }
1790 }
1791
1792 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileMesh::getAllGeoTypes() const
1793 {
1794   std::vector<int> levs(getNonEmptyLevels());
1795   std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
1796   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1797     {
1798       std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> elts(getGeoTypesAtLevel(*it));
1799       ret.insert(ret.end(),elts.begin(),elts.end());
1800     }
1801   return ret;
1802 }
1803
1804 std::vector<int> MEDFileMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
1805 {
1806   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> mLev(getGenMeshAtLevel(meshDimRelToMax));
1807   return mLev->getDistributionOfTypes();
1808 }
1809
1810 void MEDFileMesh::TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp)
1811 {
1812   famArr->applyLin(offset>0?1:-1,offset,0);
1813   for(std::vector< std::vector<int> >::iterator it1=famIdsPerGrp.begin();it1!=famIdsPerGrp.end();it1++)
1814     {
1815       if(offset<0)
1816         std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::negate<int>());
1817       std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),offset));
1818     }
1819 }
1820
1821 /*!
1822  * Warning no check is done on 'nameTry' in parameter. It should be non empty.
1823  * This method returns a name close to 'nameTry' so that it is not already into 'namesToAvoid'.
1824  * If this method fails to find such a name it will throw an exception.
1825  */
1826 std::string MEDFileMesh::CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid)
1827 {
1828   //attempt #0
1829   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),nameTry)==namesToAvoid.end())
1830     return nameTry;
1831   //attempt #1
1832   std::size_t len=nameTry.length();
1833   for(std::size_t ii=1;ii<len;ii++)
1834     {
1835       std::string tmp=nameTry.substr(ii,len-ii);
1836       if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp)==namesToAvoid.end())
1837         return tmp;
1838     }
1839   //attempt #2
1840   if(len>=1)
1841     {
1842       for(std::size_t i=1;i<30;i++)
1843         {
1844           std::string tmp1(nameTry.at(0),i);
1845           tmp1+=nameTry;
1846           if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp1)==namesToAvoid.end())
1847             return tmp1;
1848         }
1849     }
1850   //attempt #3
1851   std::string tmp2;
1852   for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=namesToAvoid.begin();it2!=namesToAvoid.end();it2++)
1853     tmp2+=(*it2);
1854   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp2)==namesToAvoid.end())
1855     return tmp2;
1856   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::CreateNameNotIn : impossible to find a not already used name !");
1857 }
1858
1859 int MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt)
1860 {
1861   std::size_t nbOfChunks=code.size()/3;
1862   if(code.size()%3!=0)
1863     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset : code has invalid size : should be of size 3*x !");
1864   int ret=strt;
1865   for(std::size_t i=0;i<nbOfChunks;i++)
1866     {
1867       code[3*i+2]=ret;
1868       ret+=code[3*i+1];
1869     }
1870   return ret;
1871 }
1872
1873 /*!
1874  * This method should be called by any set* method of subclasses to deal automatically with _name attribute.
1875  * If _name attribute is empty the name of 'm' if taken as _name attribute.
1876  * If _name is not empty and that 'm' has the same name nothing is done.
1877  * If _name is not emplt and that 'm' has \b NOT the same name an exception is thrown.
1878  */
1879 void MEDFileMesh::dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m)
1880 {
1881   if(!m)
1882     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : input mesh in NULL !");
1883   if(_name.empty())
1884     _name=m->getName();
1885   else
1886     {
1887       std::string name(m->getName());
1888       if(!name.empty())
1889         {
1890           if(_name!=name)
1891             {
1892               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : name of current MEDfile mesh is '" << _name << "' whereas name of input mesh is : '";
1893               oss << name << "' ! Names must match !";
1894               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1895             }
1896         }
1897     }
1898   if(_desc_name.empty())
1899     _desc_name=m->getDescription();
1900   else
1901     {
1902       std::string name(m->getDescription());
1903       if(!name.empty())
1904         {
1905           if(_desc_name!=name)
1906             {
1907               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : description of current MEDfile mesh is '" << _desc_name << "' whereas name of input mesh is : '";
1908               oss << name << "' ! Names must match !";
1909               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1910             }
1911         }
1912     }
1913 }
1914
1915 void MEDFileMesh::getFamilyRepr(std::ostream& oss) const
1916 {
1917   oss << "(**************************)\n(* FAMILIES OF THE MESH : *)\n(**************************)\n";
1918   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1919     {
1920       oss << "- Family with name \"" << (*it).first << "\" with number " << (*it).second << std::endl;
1921       oss << "  - Groups lying on this family : ";
1922       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
1923       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1924       oss << std::endl << std::endl;
1925     }
1926 }
1927
1928 /*!
1929  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1930  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
1931  * iteration.
1932  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1933  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
1934  *  \param [in] dt - the number of a time step.
1935  *  \param [in] it - the number of an iteration.
1936  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1937  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1938  *  \throw If the file is not readable.
1939  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
1940  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1941  */
1942 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1943 {
1944   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1945   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1946   return new MEDFileUMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
1947 }
1948
1949 /*!
1950  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1951  * file. The first mesh in the file is loaded.
1952  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1953  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1954  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1955  *  \throw If the file is not readable.
1956  *  \throw If there is no meshes in the file.
1957  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1958  */
1959 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1960 {
1961   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
1962   if(ms.empty())
1963     {
1964       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
1965       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1966     }
1967   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1968   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1969   int dt,it;
1970   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
1971   std::string dummy2;
1972   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
1973   return new MEDFileUMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
1974 }
1975
1976 /*!
1977  * Returns an empty instance of MEDFileUMesh.
1978  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1979  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1980  */
1981 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New()
1982 {
1983   return new MEDFileUMesh;
1984 }
1985
1986 /*!
1987  * This method loads from file with name \a fileName the mesh called \a mName as New does. The difference is that
1988  * here only a part of cells contained in the file will be loaded. The selection of cell is specified using the two consecutive parameters
1989  * \a types and \a slicPerTyp. This method allows to load from a mesh (typically huge) in a MED file a part of cells of that mesh.
1990  * The part of cells is specified using triplet (start,stop,step) for each geometric type. Only nodes lying on selected cells will be loaded to reduce
1991  * at most the memory consumtion.
1992  *
1993  * \param [in] fileName - the name of the file.
1994  * \param [in] mName - the name of the mesh to be read.
1995  * \param [in] types - the list of the geo types of which some part will be taken. A geometric type in \a types must appear only once at most.
1996  * \param [in] slicPerType - an array of size 3 times larger than \a types that specifies for each type in \a types (in the same order) resp the start, the stop and the step.
1997  * \param [in] dt - the iteration, that is to say the first element of the pair that locates the asked time step.
1998  * \param [in] it - the order, that is to say the second element of the pair that locates the asked time step.
1999  * \param [in] mrs - the request for what to be loaded.
2000  * \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2001  */
2002 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::LoadPartOf(const std::string& fileName, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2003 {
2004   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
2005   MEDFileUtilities::AutoFid fid(MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY));
2006   return MEDFileUMesh::LoadPartOf(fid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2007 }
2008
2009 /*!
2010  * Please refer to the other MEDFileUMesh::LoadPartOf method that has the same semantic and the same parameter (excepted the first).
2011  * This method is \b NOT wrapped into python.
2012  */
2013 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::LoadPartOf(med_idt fid, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2014 {
2015   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret(MEDFileUMesh::New());
2016   ret->loadPartUMeshFromFile(fid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2017   return ret.retn();
2018 }
2019
2020 std::size_t MEDFileUMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
2021 {
2022   std::size_t ret(MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren());
2023   ret+=_ms.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>));
2024   return ret;
2025 }
2026
2027 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMesh::getDirectChildrenWithNull() const
2028 {
2029   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull());
2030   ret.push_back((const DataArrayDouble*)_coords);
2031   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_coords);
2032   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_coords);
2033   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_coords);
2034   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords);
2035   ret.push_back((const PartDefinition *)_part_coords);
2036   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2037     ret.push_back((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it);
2038   return ret;
2039 }
2040
2041 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::shallowCpy() const
2042 {
2043   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2044   return ret.retn();
2045 }
2046
2047 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::createNewEmpty() const
2048 {
2049   return new MEDFileUMesh;
2050 }
2051
2052 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::deepCpy() const
2053 {
2054   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2055   if((const DataArrayDouble*)_coords)
2056     ret->_coords=_coords->deepCpy();
2057   if((const DataArrayInt*)_fam_coords)
2058     ret->_fam_coords=_fam_coords->deepCpy();
2059   if((const DataArrayInt*)_num_coords)
2060     ret->_num_coords=_num_coords->deepCpy();
2061   if((const DataArrayInt*)_rev_num_coords)
2062     ret->_rev_num_coords=_rev_num_coords->deepCpy();
2063   if((const DataArrayAsciiChar*)_name_coords)
2064     ret->_name_coords=_name_coords->deepCpy();
2065   std::size_t i=0;
2066   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
2067     {
2068       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2069         ret->_ms[i]=(*it)->deepCpy(ret->_coords);
2070     }
2071   return ret.retn();
2072 }
2073
2074 /*!
2075  * Checks if \a this and another mesh are equal.
2076  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
2077  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
2078  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
2079  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
2080  */
2081 bool MEDFileUMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
2082 {
2083   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
2084     return false;
2085   const MEDFileUMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(other);
2086   if(!otherC)
2087     {
2088       what="Mesh types differ ! This is unstructured and other is NOT !";
2089       return false;
2090     }
2091   clearNonDiscrAttributes();
2092   otherC->clearNonDiscrAttributes();
2093   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2094   const DataArrayDouble *coo2=otherC->_coords;
2095   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
2096     {
2097       what="Mismatch of coordinates ! One is defined and not other !";
2098       return false;
2099     }
2100   if(coo1)
2101     {
2102       bool ret=coo1->isEqual(*coo2,eps);
2103       if(!ret)
2104         {
2105           what="Coords differ !";
2106           return false;
2107         }
2108     }
2109   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2110   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_coords;
2111   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
2112     {
2113       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
2114       return false;
2115     }
2116   if(famc1)
2117     {
2118       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
2119       if(!ret)
2120         {
2121           what="Families arr on node differ !";
2122           return false;
2123         }
2124     }
2125   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2126   const DataArrayInt *numc2=otherC->_num_coords;
2127   if((numc1==0 && numc2!=0) || (numc1!=0 && numc2==0))
2128     {
2129       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
2130       return false;
2131     }
2132   if(numc1)
2133     {
2134       bool ret=numc1->isEqual(*numc2);
2135       if(!ret)
2136         {
2137           what="Numbering arr on node differ !";
2138           return false;
2139         }
2140     }
2141   const DataArrayAsciiChar *namec1=_name_coords;
2142   const DataArrayAsciiChar *namec2=otherC->_name_coords;
2143   if((namec1==0 && namec2!=0) || (namec1!=0 && namec2==0))
2144     {
2145       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
2146       return false;
2147     }
2148   if(namec1)
2149     {
2150       bool ret=namec1->isEqual(*namec2);
2151       if(!ret)
2152         {
2153           what="Names arr on node differ !";
2154           return false;
2155         }
2156     }
2157   if(_ms.size()!=otherC->_ms.size())
2158     {
2159       what="Number of levels differs !";
2160       return false;
2161     }
2162   std::size_t sz=_ms.size();
2163   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2164     {
2165       const MEDFileUMeshSplitL1 *s1=_ms[i];
2166       const MEDFileUMeshSplitL1 *s2=otherC->_ms[i];
2167       if((s1==0 && s2!=0) || (s1!=0 && s2==0))
2168         {
2169           what="Mismatch of presence of sub levels !";
2170           return false;
2171         }
2172       if(s1)
2173         {
2174           bool ret=s1->isEqual(s2,eps,what);
2175           if(!ret)
2176             return false;
2177         }
2178     }
2179   return true;
2180 }
2181
2182 /*!
2183  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
2184  */
2185 void MEDFileUMesh::clearNonDiscrAttributes() const
2186 {
2187   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
2188   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2189   if(coo1)
2190     (const_cast<DataArrayDouble *>(coo1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2191   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2192   if(famc1)
2193     (const_cast<DataArrayInt *>(famc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2194   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2195   if(numc1)
2196     (const_cast<DataArrayInt *>(numc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2197   const DataArrayAsciiChar *namc1=_name_coords;
2198   if(namc1)
2199     (const_cast<DataArrayAsciiChar *>(namc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2200   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2201     {
2202       const MEDFileUMeshSplitL1 *tmp=(*it);
2203       if(tmp)
2204         tmp->clearNonDiscrAttributes();
2205     }
2206 }
2207
2208 void MEDFileUMesh::setName(const std::string& name)
2209 {
2210   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2211     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2212       (*it)->setName(name);
2213   MEDFileMesh::setName(name);
2214 }
2215
2216 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh()
2217 {
2218 }
2219
2220 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2221 try
2222 {
2223     loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
2224 }
2225 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2226 {
2227     throw e;
2228 }
2229
2230 /*!
2231  * This method loads only a part of specified cells (given by range of cell ID per geometric type)
2232  * See MEDFileUMesh::LoadPartOf for detailed description.
2233  *
2234  * \sa loadUMeshFromFile
2235  */
2236 void MEDFileUMesh::loadPartUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2237 {
2238   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2239   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2240   int dummy0,dummy1;
2241   std::string dummy2;
2242   int mid(MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2));
2243   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2244     {
2245       std::ostringstream oss; oss << "loadPartUMeshFromFile : Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2246       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2247     }
2248   loaderl2.loadPart(fid,mid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2249   dispatchLoadedPart(fid,loaderl2,mName,mrs);
2250 }
2251
2252 /*!
2253  * This method loads \b all \b the \b mesh \a mName in the file with \a fid descriptor.
2254  *
2255  * \sa loadPartUMeshFromFile
2256  */
2257 void MEDFileUMesh::loadUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2258 {
2259   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2260   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2261   int dummy0,dummy1;
2262   std::string dummy2;
2263   int mid(MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2));
2264   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2265     {
2266       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2267       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2268     }
2269   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it,mrs);
2270   dispatchLoadedPart(fid,loaderl2,mName,mrs);
2271
2272 }
2273
2274 void MEDFileUMesh::dispatchLoadedPart(med_idt fid, const MEDFileUMeshL2& loaderl2, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2275 {
2276   int lev=loaderl2.getNumberOfLevels();
2277   _ms.resize(lev);
2278   for(int i=0;i<lev;i++)
2279     {
2280       if(!loaderl2.emptyLev(i))
2281         _ms[i]=new MEDFileUMeshSplitL1(loaderl2,mName,i);
2282       else
2283         _ms[i]=0;
2284     }
2285   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
2286   //
2287   setName(loaderl2.getName());
2288   setDescription(loaderl2.getDescription());
2289   setUnivName(loaderl2.getUnivName());
2290   setIteration(loaderl2.getIteration());
2291   setOrder(loaderl2.getOrder());
2292   setTimeValue(loaderl2.getTime());
2293   setTimeUnit(loaderl2.getTimeUnit());
2294   _coords=loaderl2.getCoords();
2295   if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
2296     _fam_coords=loaderl2.getCoordsFamily();
2297   if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
2298     _num_coords=loaderl2.getCoordsNum();
2299   if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
2300     _name_coords=loaderl2.getCoordsName();
2301   _part_coords=loaderl2.getPartDefOfCoo();
2302   computeRevNum();
2303 }
2304
2305 MEDFileUMesh::~MEDFileUMesh()
2306 {
2307 }
2308
2309 void MEDFileUMesh::writeLL(med_idt fid) const
2310 {
2311   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2312   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
2313   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
2314   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
2315   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
2316   int spaceDim=coo?coo->getNumberOfComponents():0;
2317   int mdim(0);
2318   if(!_ms.empty())
2319     mdim=getMeshDimension();
2320   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2321   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2322   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
2323     {
2324       std::string info=coo->getInfoOnComponent(i);
2325       std::string c,u;
2326       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
2327       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2328       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2329     }
2330   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,mdim,MED_UNSTRUCTURED_MESH,desc,"",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
2331   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
2332   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
2333   MEDFileUMeshL2::WriteCoords(fid,meshName,_iteration,_order,_time,_coords,_fam_coords,_num_coords,_name_coords);
2334   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2335     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2336       (*it)->write(fid,meshName,mdim);
2337   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,meshName,_families,_groups,_too_long_str);
2338 }
2339
2340 /*!
2341  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
2342  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2343  */
2344 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevels() const
2345 {
2346   std::vector<int> ret;
2347   int lev=0;
2348   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2349     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2350       if(!(*it)->empty())
2351         ret.push_back(lev);
2352   return ret;
2353 }
2354
2355 /*!
2356  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
2357  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2358  */
2359 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
2360 {
2361   std::vector<int> ret0=getNonEmptyLevels();
2362   if((const DataArrayDouble *) _coords)
2363     {
2364       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2365       ret[0]=1;
2366       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2367       return ret;
2368     }
2369   return ret0;
2370 }
2371
2372 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
2373 {
2374   std::vector<int> ret;
2375   const DataArrayInt *famCoo(_fam_coords);
2376   if(famCoo)
2377     ret.push_back(1);
2378   int lev=0;
2379   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2380     {
2381       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2382       if(cur)
2383         if(cur->getFamilyField())
2384           ret.push_back(lev);
2385     }
2386   return ret;
2387 }
2388
2389 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
2390 {
2391   std::vector<int> ret;
2392   const DataArrayInt *numCoo(_num_coords);
2393   if(numCoo)
2394     ret.push_back(1);
2395   int lev=0;
2396   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2397     {
2398       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2399       if(cur)
2400         if(cur->getNumberField())
2401           ret.push_back(lev);
2402     }
2403   return ret;
2404 }
2405
2406 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
2407 {
2408   std::vector<int> ret;
2409   const DataArrayAsciiChar *nameCoo(_name_coords);
2410   if(nameCoo)
2411     ret.push_back(1);
2412   int lev=0;
2413   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2414     {
2415       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2416       if(cur)
2417         if(cur->getNameField())
2418           ret.push_back(lev);
2419     }
2420   return ret;
2421 }
2422
2423 /*!
2424  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given group is defined.
2425  * To include nodes, call getGrpNonEmptyLevelsExt() method.
2426  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2427  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2428  */
2429 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevels(const std::string& grp) const
2430 {
2431   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2432   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2433 }
2434
2435 /*!
2436  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given group is defined.
2437  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2438  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2439  */
2440 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevelsExt(const std::string& grp) const
2441 {
2442   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2443   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2444 }
2445
2446 /*!
2447  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given family is defined.
2448  * To include nodes, call getFamNonEmptyLevelsExt() method.
2449  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2450  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2451  */
2452 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevels(const std::string& fam) const
2453 {
2454   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2455   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2456 }
2457
2458 /*!
2459  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given family is defined.
2460  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2461  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2462  */
2463 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevelsExt(const std::string& fam) const
2464 {
2465   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2466   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2467 }
2468
2469 /*!
2470  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given groups are defined.
2471  * To include nodes, call getGrpsNonEmptyLevelsExt() method.
2472  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2473  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2474  */
2475 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const
2476 {
2477   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2478   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2479 }
2480
2481 /*!
2482  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given groups are defined.
2483  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2484  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2485  */
2486 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const
2487 {
2488   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2489   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2490 }
2491
2492 /*!
2493  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given families are defined.
2494  * To include nodes, call getFamsNonEmptyLevelsExt() method.
2495  *  \param [in] fams - the name of the family of interest.
2496  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2497  */
2498 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const
2499 {
2500   std::vector<int> ret;
2501   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
2502   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2503   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
2504     if(_ms[-(*it)]->presenceOfOneFams(famIds))
2505       ret.push_back(*it);
2506   return ret;
2507 }
2508
2509 /*!
2510  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given families are defined.
2511  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2512  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2513  */
2514 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const
2515 {
2516   std::vector<int> ret0=getFamsNonEmptyLevels(fams);
2517   const DataArrayInt *famCoords=_fam_coords;
2518   if(!famCoords)
2519     return ret0;
2520   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2521   if(famCoords->presenceOfValue(famIds))
2522     {
2523       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2524       ret[0]=1;
2525       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2526       return ret;
2527     }
2528   else
2529     return ret0;
2530 }
2531
2532 /*!
2533  * Returns names of groups that partly or fully appear on the level \a meshDimRelToMaxExt.
2534  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of interest.
2535  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names at \a meshDimRelToMaxExt
2536  *          level. 
2537  */
2538 std::vector<std::string> MEDFileUMesh::getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const
2539 {
2540   std::vector<std::string> ret;
2541   std::vector<std::string> allGrps=getGroupsNames();
2542   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=allGrps.begin();it!=allGrps.end();it++)
2543     {
2544       std::vector<int> levs=getGrpNonEmptyLevelsExt((*it));
2545       if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)!=levs.end())
2546         ret.push_back(*it);
2547     }
2548   return ret;
2549 }
2550
2551 int MEDFileUMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
2552 {
2553   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2554   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2555     {
2556       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2557       ret=std::max(ret,std::abs(val));
2558     }
2559   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2560     {
2561       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2562         {
2563           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2564           if(da)
2565             {
2566               int val=da->getMaxValue(tmp);
2567               ret=std::max(ret,std::abs(val));
2568             }
2569         }
2570     }
2571   return ret;
2572 }
2573
2574 int MEDFileUMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
2575 {
2576   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2577   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2578     {
2579       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2580       ret=std::max(ret,val);
2581     }
2582   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2583     {
2584       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2585         {
2586           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2587           if(da)
2588             {
2589               int val=da->getMaxValue(tmp);
2590               ret=std::max(ret,val);
2591             }
2592         }
2593     }
2594   return ret;
2595 }
2596
2597 int MEDFileUMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
2598 {
2599   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2600   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2601     {
2602       int val=_fam_coords->getMinValue(tmp);
2603       ret=std::min(ret,val);
2604     }
2605   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2606     {
2607       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2608         {
2609           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2610           if(da)
2611             {
2612               int val=da->getMinValue(tmp);
2613               ret=std::min(ret,val);
2614             }
2615         }
2616     }
2617   return ret;
2618 }
2619
2620 /*!
2621  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
2622  *  \return int - the mesh dimension.
2623  *  \throw If there are no cells in this mesh.
2624  */
2625 int MEDFileUMesh::getMeshDimension() const
2626 {
2627   int lev=0;
2628   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev++)
2629     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2630       return (*it)->getMeshDimension()+lev;
2631   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getMeshDimension : impossible to find a mesh dimension !");
2632 }
2633
2634 /*!
2635  * Returns the space dimension of \a this mesh that is equal to number of components in
2636  * the node coordinates array.
2637  *  \return int - the space dimension of \a this mesh.
2638  *  \throw If the node coordinates array is not available.
2639  */
2640 int MEDFileUMesh::getSpaceDimension() const
2641 {
2642   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2643   if(!coo)
2644     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getSpaceDimension : no coords set !");
2645   return coo->getNumberOfComponents();
2646 }
2647
2648 /*!
2649  * Returns a string describing \a this mesh.
2650  *  \return std::string - the mesh information string.
2651  */
2652 std::string MEDFileUMesh::simpleRepr() const
2653 {
2654   std::ostringstream oss;
2655   oss << MEDFileMesh::simpleRepr();
2656   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2657   oss << "- The dimension of the space is ";
2658   static const char MSG1[]= "*** NO COORDS SET ***";
2659   static const char MSG2[]= "*** NO CONNECTIVITY SET FOR THIS LEVEL***";
2660   if(coo)
2661     oss << _coords->getNumberOfComponents() << std::endl;
2662   else
2663     oss << MSG1 << std::endl;
2664   oss << "- Type of the mesh : UNSTRUCTURED\n";
2665   oss << "- Number of nodes : ";
2666   if(coo)
2667     oss << _coords->getNumberOfTuples() << std::endl;
2668   else
2669     oss << MSG1 << std::endl;
2670   std::size_t nbOfLev=_ms.size();
2671   oss << "- Number of levels allocated : " << nbOfLev << std::endl;
2672   for(std::size_t i=0;i<nbOfLev;i++)
2673     {
2674       const MEDFileUMeshSplitL1 *lev=_ms[i];
2675       oss << "  - Level #" << -((int) i) << " has dimension : ";
2676       if(lev)
2677         {
2678           oss << lev->getMeshDimension() << std::endl;
2679           lev->simpleRepr(oss);
2680         }
2681       else
2682         oss << MSG2 << std::endl;
2683     }
2684   oss << "- Number of families : " << _families.size() << std::endl << std::endl;
2685   if(coo)
2686     {
2687       oss << "(***********************)\n(* NODES OF THE MESH : *)\n(***********************)\n";
2688       oss << "- Names of coordinates :" << std::endl;
2689       std::vector<std::string> vars=coo->getVarsOnComponent();
2690       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2691       oss << std::endl << "- Units of coordinates : " << std::endl;
2692       std::vector<std::string> units=coo->getUnitsOnComponent();
2693       std::copy(units.begin(),units.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2694     }
2695   oss << std::endl << std::endl;
2696   getFamilyRepr(oss);
2697   return oss.str();
2698 }
2699
2700 /*!
2701  * Returns a full textual description of \a this mesh.
2702  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
2703  */
2704 std::string MEDFileUMesh::advancedRepr() const
2705 {
2706   return simpleRepr();
2707 }
2708
2709 /*!
2710  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
2711  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2712  *  \return int - the number of entities.
2713  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
2714  */
2715 int MEDFileUMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2716 {
2717   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2718     {
2719       if(!((const DataArrayDouble *)_coords))
2720         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getSizeAtLevel : no coordinates specified !");
2721       return _coords->getNumberOfTuples();
2722     }
2723   return getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt)->getSize();
2724 }
2725
2726 /*!
2727  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
2728  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2729  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
2730  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
2731  */
2732 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2733 {
2734   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2735     return _fam_coords;
2736   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2737   return l1->getFamilyField();
2738 }
2739
2740 /*!
2741  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
2742  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2743  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
2744  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2745  */
2746 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2747 {
2748   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2749     return _num_coords;
2750   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2751   return l1->getNumberField();
2752 }
2753
2754 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2755 {
2756   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2757     return _name_coords;
2758   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2759   return l1->getNameField();
2760 }
2761
2762 /*!
2763  * This method returns for a specified relative level \a meshDimRelToMaxExt the part effectively read (if the instance is the result of the read of a file).
2764  *
2765  * \param [in] meshDimRelToMaxExt - the extended relative level for which the part definition is requested.
2766  * \param [in] gt - The input geometric type for which the part definition is requested.
2767  * \return the part definition owned by \a this. So no need to deallocate the returned instance.
2768  */
2769 const PartDefinition *MEDFileUMesh::getPartDefAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
2770 {
2771   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2772     return _part_coords;
2773   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt));
2774   return l1->getPartDef(gt);
2775 }
2776
2777 int MEDFileUMesh::getNumberOfNodes() const
2778 {
2779   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2780   if(!coo)
2781     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getNumberOfNodes : no coords set !");
2782   return coo->getNumberOfTuples();
2783 }
2784
2785 int MEDFileUMesh::getNumberOfCellsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2786 {
2787   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2788   return l1->getNumberOfCells();
2789 }
2790
2791 bool MEDFileUMesh::hasImplicitPart() const
2792 {
2793   return false;
2794 }
2795
2796 int MEDFileUMesh::buildImplicitPartIfAny(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
2797 {
2798   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::buildImplicitPartIfAny : unstructured meshes do not have implicit part !");
2799 }
2800
2801 void MEDFileUMesh::releaseImplicitPartIfAny() const
2802 {
2803 }
2804
2805 void MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
2806 {
2807   std::size_t sz(st.getNumberOfItems());
2808   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2809     {
2810       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType curGt(st[i].getGeo());
2811       const MEDCoupling1GTUMesh *m(getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(curGt));
2812       if(st[i].getPflName().empty())
2813         m->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2814       else
2815         {
2816           const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[i].getPflName()));
2817           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m2(dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(m->buildPartOfMySelf(arr->begin(),arr->end(),true)));
2818           m2->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2819         }
2820     }
2821 }
2822
2823 /*!
2824  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
2825  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2826  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2827  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
2828  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2829  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2830  */
2831 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2832 {
2833   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2834     {
2835       if(!((const DataArrayInt *)_num_coords))
2836         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no coordinates renum specified !");
2837       return _rev_num_coords;
2838     }
2839   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2840   return l1->getRevNumberField();
2841 }
2842
2843 /*!
2844  * Returns a pointer to the node coordinates array of \a this mesh \b without
2845  * incrementing its reference counter, thus there is no need to decrRef() it by the caller.
2846  */
2847 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::getCoords() const
2848 {
2849   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp(_coords);
2850   if((DataArrayDouble *)tmp)
2851     {
2852       return tmp;
2853     }
2854   return 0;
2855 }
2856
2857 /*!
2858  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2859  * group of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2860  * new mesh.
2861  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2862  *  \param [in] grp - the name of the group whose mesh entities are included in the
2863  *          new mesh.
2864  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2865  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2866  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2867  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2868  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
2869  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2870  */
2871 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
2872 {
2873   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2874   std::vector<std::string> tmp(1);
2875   tmp[0]=grp;
2876   return getGroups(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2877 }
2878
2879 /*!
2880  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2881  * groups of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2882  * new mesh.
2883  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2884  *  \param [in] grps - a sequence of group names whose mesh entities are included in the
2885  *          new mesh.
2886  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2887  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2888  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2889  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2890  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
2891  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2892  */
2893 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
2894 {
2895   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2896   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
2897   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet=getFamilies(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
2898   if(grps.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2899     zeRet->setName(grps[0]);
2900   return zeRet.retn();
2901 }
2902
2903 /*!
2904  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2905  * family of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2906  * new mesh.
2907  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2908  *  \param [in] fam - the name of the family whose mesh entities are included in the
2909  *          new mesh.
2910  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2911  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2912  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2913  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2914  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a grps.
2915  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2916  */
2917 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
2918 {
2919   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2920   std::vector<std::string> tmp(1);
2921   tmp[0]=fam;
2922   return getFamilies(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2923 }
2924
2925 /*!
2926  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2927  * families of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2928  * new mesh.
2929  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2930  *  \param [in] fams - a sequence of family names whose mesh entities are included in the
2931  *          new mesh.
2932  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2933  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2934  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2935  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2936  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a fams.
2937  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2938  */
2939 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2940 {
2941   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2942   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2943     {
2944       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr=getFamiliesArr(1,fams,renum);
2945       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New();
2946       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> c=_coords->selectByTupleId(arr->getConstPointer(),arr->getConstPointer()+arr->getNbOfElems());
2947       ret->setCoords(c);
2948       return ret.retn();
2949     }
2950   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2951   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2952   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet;
2953   if(!famIds.empty())
2954     zeRet=l1->getFamilyPart(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2955   else
2956     zeRet=l1->getFamilyPart(0,0,renum);
2957   if(fams.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2958     zeRet->setName(fams[0]);
2959   return zeRet.retn();
2960 }
2961
2962 /*!
2963  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
2964  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
2965  *          are required.
2966  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2967  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
2968  *          returned instead of ids.
2969  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
2970  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
2971  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
2972  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
2973  */
2974 DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2975 {
2976   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2977   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2978     {
2979       if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2980         {
2981           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
2982           if(!famIds.empty())
2983             da=_fam_coords->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
2984           else
2985             da=_fam_coords->getIdsEqualList(0,0);
2986           if(renum)
2987             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_coords,da);
2988           else
2989             return da.retn();
2990         }
2991       else
2992         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
2993     }
2994   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2995   if(!famIds.empty())
2996     return l1->getFamilyPartArr(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2997   else
2998     return l1->getFamilyPartArr(0,0,renum);
2999 }
3000
3001 /*!
3002  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
3003  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
3004  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
3005  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
3006  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
3007  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3008  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3009  *          optional numbers of mesh entities.
3010  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3011  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3012  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3013  * \sa getGenMeshAtLevel()
3014  */
3015 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum) const
3016 {
3017   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
3018   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3019     {
3020       if(!renum)
3021         {
3022           MEDCouplingUMesh *umesh=MEDCouplingUMesh::New();
3023           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> cc=_coords->deepCpy();
3024           umesh->setCoords(cc);
3025           MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(umesh);
3026           umesh->setName(getName());
3027           return umesh;
3028         }
3029     }
3030   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3031   return l1->getWholeMesh(renum);
3032 }
3033
3034 /*!
3035  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
3036  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
3037  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
3038  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
3039  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
3040  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3041  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3042  *          optional numbers of mesh entities.
3043  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3044  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3045  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMax dimension in \a this mesh.
3046  * \sa getMeshAtLevel()
3047  */
3048 MEDCouplingMesh *MEDFileUMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
3049 {
3050   return getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3051 }
3052
3053 std::vector<int> MEDFileUMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
3054 {
3055   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3056   return l1->getDistributionOfTypes();
3057 }
3058
3059 /*!
3060  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == 0.
3061  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3062  *          optional numbers of mesh entities.
3063  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3064  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3065  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == 0 in \a this mesh.
3066  */
3067 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevel0Mesh(bool renum) const
3068 {
3069   return getMeshAtLevel(0,renum);
3070 }
3071
3072 /*!
3073  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -1.
3074  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3075  *          optional numbers of mesh entities.
3076  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3077  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3078  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -1 in \a this mesh.
3079  */
3080 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM1Mesh(bool renum) const
3081 {
3082   return getMeshAtLevel(-1,renum);
3083 }
3084
3085 /*!
3086  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -2.
3087  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3088  *          optional numbers of mesh entities.
3089  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3090  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3091  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -2 in \a this mesh.
3092  */
3093 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM2Mesh(bool renum) const
3094 {
3095   return getMeshAtLevel(-2,renum);
3096 }
3097
3098 /*!
3099  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -3.
3100  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3101  *          optional numbers of mesh entities.
3102  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3103  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3104  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -3 in \a this mesh.
3105  */
3106 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM3Mesh(bool renum) const
3107 {
3108   return getMeshAtLevel(-3,renum);
3109 }
3110
3111 /*!
3112  * This method is for advanced users. There is two storing strategy of mesh in \a this.
3113  * Either MEDCouplingUMesh, or vector of MEDCoupling1GTUMesh instances.
3114  * When assignement is done the first one is done, which is not optimal in write mode for MED file.
3115  * This method allows to switch from MEDCouplingUMesh mode to MEDCoupling1GTUMesh mode.
3116  */
3117 void MEDFileUMesh::forceComputationOfParts() const
3118 {
3119   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3120     {
3121       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3122       if(elt)
3123         elt->forceComputationOfParts();
3124     }
3125 }
3126
3127 /*!
3128  * This method returns a vector of mesh parts containing each exactly one geometric type.
3129  * This method will never launch an automatic computation of split by type (an INTERP_KERNEL::Exception will be then thrown).
3130  * This method is only for memory aware users.
3131  * The returned pointers are **NOT** new object pointer. No need to mange them.
3132  */
3133 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(int meshDimRelToMax) const
3134 {
3135   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3136   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes();
3137 }
3138
3139 /*!
3140  * This method returns the part of \a this having the geometric type \a gt.
3141  * If such part is not existing an exception will be thrown.
3142  * The returned pointer is **NOT** new object pointer. No need to mange it.
3143  */
3144 MEDCoupling1GTUMesh *MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3145 {
3146   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3147   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3148   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3149   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(gt);
3150 }
3151
3152 /*!
3153  * Given a relative level \a meshDimRelToMax it returns the sorted vector of geometric types present in \a this.
3154  * \throw if the reqsuested \a meshDimRelToMax does not exist.
3155  */
3156 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
3157 {
3158   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3159   return sp->getGeoTypes();
3160 }
3161
3162 /*!
3163  * This method extracts from whole family field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3164  * \param [in] gt - the geometric type for which the family field is asked.
3165  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3166  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3167  * \sa MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType
3168  */
3169 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3170 {
3171   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3172   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3173   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3174   return sp->extractFamilyFieldOnGeoType(gt);
3175 }
3176
3177 /*!
3178  * This method extracts from whole number field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3179  * \param [in] gt - the geometric type for which the number field is asked.
3180  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3181  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3182  * \sa MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType
3183  */
3184 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3185 {
3186   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3187   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3188   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3189   return sp->extractNumberFieldOnGeoType(gt);
3190 }
3191
3192 /*!
3193  * This method returns for specified geometric type \a gt the relative level to \a this.
3194  * If the relative level is empty an exception will be thrown.
3195  */
3196 int MEDFileUMesh::getRelativeLevOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3197 {
3198   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3199   int ret((int)cm.getDimension()-getMeshDimension());
3200   getMeshAtLevSafe(ret);//To test that returned value corresponds to a valid level.
3201   return ret;
3202 }
3203
3204 const MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const
3205 {
3206   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3207     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3208   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3209     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3210   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3211   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3212     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3213   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3214     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3215   return _ms[tracucedRk];
3216 }
3217
3218 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt)
3219 {
3220   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3221     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3222   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3223     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3224   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3225   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3226     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3227   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3228     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3229   return _ms[tracucedRk];
3230 }
3231
3232 void MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const
3233 {
3234   if(-meshDimRelToMax>=(int)_ms.size())
3235     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : The meshdim of mesh is not managed by 'this' !");
3236   int i=0;
3237   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
3238     {
3239       if(((const MEDFileUMeshSplitL1*) (*it))!=0)
3240         {
3241           int ref=(*it)->getMeshDimension();
3242           if(ref+i!=meshDim-meshDimRelToMax)
3243             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : no coherency between levels !");
3244         }
3245     }
3246 }
3247
3248 /*!
3249  * Sets the node coordinates array of \a this mesh.
3250  *  \param [in] coords - the new node coordinates array.
3251  *  \throw If \a coords == \c NULL.
3252  */
3253 void MEDFileUMesh::setCoords(DataArrayDouble *coords)
3254 {
3255   if(!coords)
3256     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setCoords : null pointer in input !");
3257   coords->checkAllocated();
3258   int nbOfTuples=coords->getNumberOfTuples();
3259   _coords=coords;
3260   coords->incrRef();
3261   _fam_coords=DataArrayInt::New();
3262   _fam_coords->alloc(nbOfTuples,1);
3263   _fam_coords->fillWithZero();
3264   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3265     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3266       (*it)->setCoords(coords);
3267 }
3268
3269 /*!
3270  * Removes all groups of a given dimension in \a this mesh.
3271  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
3272  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3273  */
3274 void MEDFileUMesh::eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt)
3275 {
3276   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3277     {
3278       if((DataArrayInt *)_fam_coords)
3279         _fam_coords->fillWithZero();
3280       return ;
3281     }
3282   MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3283   l1->eraseFamilyField();
3284   optimizeFamilies();
3285 }
3286
3287 /*!
3288  * Removes all families with ids not present in the family fields of \a this mesh.
3289  */
3290 void MEDFileUMesh::optimizeFamilies()
3291 {
3292   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3293   std::set<int> allFamsIds;
3294   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
3295     {
3296       const DataArrayInt *ffield=getFamilyFieldAtLevel(*it);
3297       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=ffield->getDifferentValues();
3298       std::set<int> res;
3299       std::set_union(ids->begin(),ids->end(),allFamsIds.begin(),allFamsIds.end(),std::inserter(res,res.begin()));
3300       allFamsIds=res;
3301     }
3302   std::set<std::string> famNamesToKill;
3303   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
3304     {
3305       if(allFamsIds.find((*it).second)!=allFamsIds.end())
3306         famNamesToKill.insert((*it).first);
3307     }
3308   for(std::set<std::string>::const_iterator it=famNamesToKill.begin();it!=famNamesToKill.end();it++)
3309     _families.erase(*it);
3310   std::vector<std::string> grpNamesToKill;
3311   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
3312     {
3313       std::vector<std::string> tmp;
3314       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
3315         {
3316           if(famNamesToKill.find(*it2)==famNamesToKill.end())
3317             tmp.push_back(*it2);
3318         }
3319       if(!tmp.empty())
3320         (*it).second=tmp;
3321       else
3322         tmp.push_back((*it).first);
3323     }
3324   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grpNamesToKill.begin();it!=grpNamesToKill.end();it++)
3325     _groups.erase(*it);
3326 }
3327
3328 void MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group(const std::string& grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified)
3329 {
3330   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3331   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)==levs.end() || std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)==levs.end())
3332     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : This method works only for mesh definied on level 0 and -1 !");
3333   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m0=getMeshAtLevel(0);
3334   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1=getMeshAtLevel(-1);
3335   int nbNodes=m0->getNumberOfNodes();
3336   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m11=getGroup(-1,grpNameM1);
3337   DataArrayInt *tmp00=0,*tmp11=0,*tmp22=0;
3338   m0->findNodesToDuplicate(*m11,tmp00,tmp11,tmp22);
3339   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nodeIdsToDuplicate(tmp00);
3340   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn0(tmp11);
3341   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn1(tmp22);
3342   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m0->buildPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),true));
3343   // node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group 'grpNameM1' on level -1
3344   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> descTmp0=DataArrayInt::New(),descITmp0=DataArrayInt::New(),revDescTmp0=DataArrayInt::New(),revDescITmp0=DataArrayInt::New();
3345   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0Desc=tmp0->buildDescendingConnectivity(descTmp0,descITmp0,revDescTmp0,revDescITmp0);
3346   descTmp0=0; descITmp0=0; revDescTmp0=0; revDescITmp0=0;
3347   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW2=tmp0Desc->getCellIdsLyingOnNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),false);
3348   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> cellsInM1ToRenumW3=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(tmp0Desc->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenumW2->begin(),cellsInM1ToRenumW2->end(),true));
3349   DataArrayInt *cellsInM1ToRenumW4Tmp=0;
3350   m1->areCellsIncludedIn(cellsInM1ToRenumW3,2,cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3351   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW4(cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3352   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW5=cellsInM1ToRenumW4->getIdsInRange(0,m1->getNumberOfCells());
3353   cellsInM1ToRenumW5->transformWithIndArr(cellsInM1ToRenumW4->begin(),cellsInM1ToRenumW4->end());
3354   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpIds=getGroupArr(-1,grpNameM1);
3355   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenum=cellsInM1ToRenumW5->buildSubstraction(grpIds);
3356   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1Part=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),true));
3357   m1Part->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes);
3358   m1->setPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),*m1Part);
3359   // end of node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group of level -1 'grpNameM1'
3360   tmp0->duplicateNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end());
3361   m0->setCoords(tmp0->getCoords());
3362   m0->setPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),*tmp0);
3363   m1->setCoords(m0->getCoords());
3364   _coords=m0->getCoords(); _coords->incrRef();
3365   // duplication of cells in group 'grpNameM1' on level -1
3366   m11->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes); m11->setCoords(m0->getCoords());
3367   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> v(2); v[0]=m1; v[1]=m11;
3368   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> newm1=MEDCouplingUMesh::AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(v,tmp00,tmp11);
3369   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> szOfCellGrpOfSameType(tmp00);
3370   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idInMsOfCellGrpOfSameType(tmp11);
3371   //
3372   newm1->setName(getName());
3373   const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
3374   if(!fam)
3375     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : internal problem !");
3376   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFam=DataArrayInt::New();
3377   newFam->alloc(newm1->getNumberOfCells(),1);
3378   int idd=getMaxFamilyId()+1;
3379   int globStart=0,start=0,end,globEnd;
3380   int nbOfChunks=szOfCellGrpOfSameType->getNumberOfTuples();
3381   for(int i=0;i<nbOfChunks;i++)
3382     {
3383       globEnd=globStart+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3384       if(idInMsOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0)==0)
3385         {
3386           end=start+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3387           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> part=fam->selectByTupleId2(start,end,1);
3388           newFam->setPartOfValues1(part,globStart,globEnd,1,0,1,1,true);
3389           start=end;
3390         }
3391       else
3392         {
3393           newFam->setPartOfValuesSimple1(idd,globStart,globEnd,1,0,1,1);
3394         }
3395       globStart=globEnd;
3396     }
3397   newm1->setCoords(getCoords());
3398   setMeshAtLevel(-1,newm1);
3399   setFamilyFieldArr(-1,newFam);
3400   std::string grpName2(grpNameM1); grpName2+="_dup";
3401   addFamily(grpName2,idd);
3402   addFamilyOnGrp(grpName2,grpName2);
3403   //
3404   fam=_fam_coords;
3405   if(fam)
3406     {
3407       int newNbOfNodes=getCoords()->getNumberOfTuples();
3408       newFam=DataArrayInt::New(); newFam->alloc(newNbOfNodes,1);
3409       newFam->setPartOfValues1(fam,0,nbNodes,1,0,1,1,true);
3410       newFam->setPartOfValuesSimple1(0,nbNodes,newNbOfNodes,1,0,1,1);
3411       _fam_coords=newFam;
3412     }
3413   nodesDuplicated=nodeIdsToDuplicate.retn();
3414   cellsModified=cellsToModifyConn0.retn();
3415   cellsNotModified=cellsToModifyConn1.retn();
3416 }
3417
3418 /*!
3419  * \param [out] oldCode retrieves the distribution of types before the call if true is returned
3420  * \param [out] newCode etrieves the distribution of types after the call if true is returned
3421  * \param [out] o2nRenumCell tells for **all levels** the old 2 new renumbering of cells.
3422  * 
3423  * \return false if no modification has been performed linked to the unpolyzation. Neither cell type, not cell numbers. When false is returned no need of field on cells or on gauss renumbering.
3424  * Inversely, if true is returned, it means that distribution of cell by geometric type has changed and field on cell and field on gauss point must be renumbered.
3425  */
3426 bool MEDFileUMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
3427 {
3428   o2nRenumCell=0; oldCode.clear(); newCode.clear();
3429   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3430   bool ret=false;
3431   std::vector< const DataArrayInt* > renumCellsSplited;//same than memorySaverIfThrow
3432   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > memorySaverIfThrow;//same than renumCellsSplited only in case of throw
3433   int start=0;
3434   int end=0;
3435   for(std::vector<int>::reverse_iterator it=levs.rbegin();it!=levs.rend();it++)
3436     {
3437       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*it);
3438       std::vector<int> code1=m->getDistributionOfTypes();
3439       end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code1,start);
3440       oldCode.insert(oldCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3441       bool hasChanged=m->unPolyze();
3442       DataArrayInt *fake=0;
3443       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart=m->getLevArrPerCellTypes(MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER,
3444           MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER+MEDCouplingUMesh::N_MEDMEM_ORDER,fake);
3445       fake->decrRef();
3446       renumCellsSplited.push_back(o2nCellsPart); memorySaverIfThrow.push_back(o2nCellsPart);
3447       if(hasChanged)
3448         {
3449           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart2=o2nCellsPart->buildPermArrPerLevel();
3450           m->renumberCells(o2nCellsPart2->getConstPointer(),false);
3451           ret=true;
3452           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famField2,numField2;
3453           const DataArrayInt *famField=getFamilyFieldAtLevel(*it); if(famField) { famField->incrRef(); famField2=const_cast<DataArrayInt *>(famField); }
3454           const DataArrayInt *numField=getNumberFieldAtLevel(*it); if(numField) { numField->incrRef(); numField2=const_cast<DataArrayInt *>(numField); }
3455           setMeshAtLevel(*it,m);
3456           std::vector<int> code2=m->getDistributionOfTypes();
3457           end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code2,start);
3458           newCode.insert(newCode.end(),code2.begin(),code2.end());
3459           //
3460           if(o2nCellsPart2->isIdentity())
3461             continue;
3462           if(famField)
3463             {
3464               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamField=famField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3465               setFamilyFieldArr(*it,newFamField);
3466             }
3467           if(numField)
3468             {
3469               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumField=numField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3470               setRenumFieldArr(*it,newNumField);
3471             }
3472         }
3473       else
3474         {
3475           newCode.insert(newCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3476         }
3477       start=end;
3478     }
3479   if(ret)
3480     {
3481       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> renumCells=DataArrayInt::Aggregate(renumCellsSplited);
3482       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nRenumCellRet=renumCells->buildPermArrPerLevel();
3483       o2nRenumCell=o2nRenumCellRet.retn();
3484     }
3485   return ret;
3486 }
3487
3488 struct MEDLoaderAccVisit1
3489 {
3490   MEDLoaderAccVisit1():_new_nb_of_nodes(0) { }
3491   int operator()(bool val) { return val?_new_nb_of_nodes++:-1; }
3492   int _new_nb_of_nodes;
3493 };
3494
3495 /*!
3496  * Array returned is the correspondance in \b old \b to \b new format. The returned array is newly created and should be dealt by the caller.
3497  * The maximum value stored in returned array is the number of nodes of \a this minus 1 after call of this method.
3498  * The size of returned array is the number of nodes of the old (previous to the call of this method) number of nodes.
3499  * -1 values in returned array means that the corresponding old node is no more used.
3500  *
3501  * \return newly allocated array containing correspondance in \b old \b to \b new format. If all nodes in \a this are fetched \c NULL pointer is returned and nothing
3502  *         is modified in \a this.
3503  * \throw If no coordinates are set in \a this or if there is in any available mesh in \a this a cell having a nodal connectivity containing a node id not in the range of
3504  *  set coordinates.
3505  */
3506 DataArrayInt *MEDFileUMesh::zipCoords()
3507 {
3508   const DataArrayDouble *coo(getCoords());
3509   if(!coo)
3510     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::zipCoords : no coordinates set in this !");
3511   int nbOfNodes(coo->getNumberOfTuples());
3512   std::vector<bool> nodeIdsInUse(nbOfNodes,false);
3513   std::vector<int> neLevs(getNonEmptyLevels());
3514   for(std::vector<int>::const_iterator lev=neLevs.begin();lev!=neLevs.end();lev++)
3515     {
3516       const MEDFileUMeshSplitL1 *zeLev(getMeshAtLevSafe(*lev));
3517       if(zeLev->isMeshStoredSplitByType())
3518         {
3519           std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ms(zeLev->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes());
3520           for(std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3521             if(*it)
3522               (*it)->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3523         }
3524       else
3525         {
3526           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> mesh(zeLev->getWholeMesh(false));
3527           mesh->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3528         }
3529     }
3530   int nbrOfNodesInUse((int)std::count(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),true));
3531   if(nbrOfNodesInUse==nbOfNodes)
3532     return 0;//no need to update _part_coords
3533   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New()); ret->alloc(nbOfNodes,1);
3534   std::transform(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),ret->getPointer(),MEDLoaderAccVisit1());
3535   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2(ret->invertArrayO2N2N2OBis(nbrOfNodesInUse));
3536   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> newCoords(coo->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3537   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamCoords;
3538   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> newNameCoords;
3539   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
3540     newFamCoords=_fam_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3541   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumCoords;
3542   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3543     newNumCoords=_num_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3544   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
3545     newNameCoords=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_name_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3546   _coords=newCoords; _fam_coords=newFamCoords; _num_coords=newNumCoords; _name_coords=newNameCoords; _rev_num_coords=0;
3547   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3548     {
3549       if((MEDFileUMeshSplitL1*)*it)
3550         {
3551           (*it)->renumberNodesInConn(ret->begin());
3552           (*it)->setCoords(_coords);
3553         }
3554     }
3555   // updates _part_coords
3556   const PartDefinition *pc(_part_coords);
3557   if(pc)
3558     {
3559       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<PartDefinition> tmpPD(DataArrayPartDefinition::New(ret2));
3560       _part_coords=tmpPD->composeWith(pc);
3561     }
3562   return ret.retn();
3563 }
3564
3565 /*!
3566  * This method performs an extrusion along a path defined by \a m1D.
3567  * \a this is expected to be a mesh with max mesh dimension equal to 2.
3568  * \a m1D is expected to be a mesh with space dimesion equal to 3 and mesh dimension equal to 1.
3569  * Mesh dimensions of returned mesh is incremented by one compared to thoose in \a this.
3570  * This method scans all levels in \a this
3571  * and put them in the returned mesh. All groups in \a this are also put in the returned mesh.
3572  *
3573  * \param [in] m1D - the mesh defining the extrusion path.
3574  * \param [in] policy - defines the policy of extrusion (see MEDCouplingUMesh::buildExtrudedMesh for more details)
3575  * \return - a new reference on mesh (you have to deal with using decrRef). The returned mesh will have the same name than \a this.
3576  *
3577  * \sa MEDCouplingUMesh::buildExtrudedMesh
3578  */
3579 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::buildExtrudedMesh(const MEDCouplingUMesh *m1D, int policy) const
3580 {
3581   if(getMeshDimension()!=2)
3582     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::buildExtrudedMesh : this is expected to be with mesh dimension equal to 2 !");
3583   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret(MEDFileUMesh::New());
3584   m1D->checkCoherency();
3585   if(m1D->getMeshDimension()!=1)
3586     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::buildExtrudedMesh : input mesh must have a mesh dimension equal to one !");
3587   int nbRep(m1D->getNumberOfCells());
3588   std::vector<int> levs(getNonEmptyLevels());
3589   std::vector<std::string> grps(getGroupsNames());
3590   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> > zeList;
3591   DataArrayDouble *coords(0);
3592   for(std::vector<int>::const_iterator lev=levs.begin();lev!=levs.end();lev++)
3593     {
3594       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> item(getMeshAtLevel(*lev));
3595       item->changeSpaceDimension(3+(*lev),0.);//no problem non const but change DataArrayDouble for coordinates do not alter data
3596       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp(static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1D->deepCpy()));
3597       tmp->changeSpaceDimension(3+(*lev),0.);
3598       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> elt(item->buildExtrudedMesh(tmp,policy));
3599       zeList.push_back(elt);
3600       if(*lev==0)
3601         coords=elt->getCoords();
3602     }
3603   if(!coords)
3604     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::buildExtrudedMesh : internal error !");
3605   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> >::iterator it=zeList.begin();it!=zeList.end();it++)
3606     {
3607       (*it)->setName(getName());
3608       (*it)->setCoords(coords);
3609     }
3610   for(std::size_t ii=0;ii!=zeList.size();ii++)
3611     {
3612       int lev(levs[ii]);
3613       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> elt(zeList[ii]);
3614       int nbCellsB4Extrusion(getNumberOfCellsAtLevel(lev));
3615       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2n(elt->sortCellsInMEDFileFrmt());
3616       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > outGrps;
3617       std::vector< const DataArrayInt * > outGrps2;
3618       for(std::vector<std::string>::const_iterator grp=grps.begin();grp!=grps.end();grp++)
3619         {
3620           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpArr(getGroupArr(lev,*grp));
3621           if(grpArr->empty())
3622             continue;
3623           std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grpArrs(nbRep);
3624           std::vector< const DataArrayInt *> grpArrs2(nbRep);
3625           for(int iii=0;iii<nbRep;iii++)
3626             {
3627               grpArrs[iii]=grpArr->deepCpy(); grpArrs[iii]->applyLin(1,iii*nbCellsB4Extrusion);
3628               grpArrs2[iii]=grpArrs[iii];
3629             }
3630           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpArrExt(DataArrayInt::Aggregate(grpArrs2));
3631           grpArrExt->transformWithIndArr(o2n->begin(),o2n->end());
3632           grpArrExt->setName(*grp);
3633           outGrps.push_back(grpArrExt);
3634           outGrps2.push_back(grpArrExt);
3635         }
3636       ret->setMeshAtLevel(lev,elt);
3637       ret->setGroupsAtLevel(lev,outGrps2);
3638     }
3639   return ret.retn();
3640 }
3641
3642 /*!
3643  * Adds a group of nodes to \a this mesh.
3644  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3645  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3646  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3647  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3648  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3649  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3650  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3651  */
3652 void MEDFileUMesh::addNodeGroup(const DataArrayInt *ids)
3653 {
3654   const DataArrayDouble *coords=_coords;
3655   if(!coords)
3656     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addNodeGroup : no coords set !");
3657   int nbOfNodes=coords->getNumberOfTuples();
3658   if(!((DataArrayInt *)_fam_coords))
3659     { _fam_coords=DataArrayInt::New(); _fam_coords->alloc(nbOfNodes,1); _fam_coords->fillWithZero(); }
3660   //
3661   addGroupUnderground(true,ids,_fam_coords);
3662 }
3663
3664 /*!
3665  * Adds a group of nodes/cells/faces/edges to \a this mesh.
3666  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3667  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3668  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3669  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3670  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3671  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3672  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3673  */
3674 void MEDFileUMesh::addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids)
3675 {
3676   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3677   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
3678     { 
3679       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : level " << meshDimRelToMaxExt << " not available ! Should be in ";
3680       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," ")); oss << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3681     }
3682   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3683     { addNodeGroup(ids); return ; }
3684   MEDFileUMeshSplitL1 *lev=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3685   DataArrayInt *fam=lev->getOrCreateAndGetFamilyField();
3686   addGroupUnderground(false,ids,fam);
3687 }
3688
3689 /*!
3690  * \param [in] ids ids and group name of the new group to add. The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3691  * \parma [in,out] famArr family array on level of interest to be renumbered. The input pointer should be not \c NULL (no check of that will be performed)
3692  */
3693 void MEDFileUMesh::addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr)
3694 {
3695   if(!ids)
3696     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : NULL pointer in input !");
3697   std::string grpName(ids->getName());
3698   if(grpName.empty())
3699     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : empty group name ! MED file format do not accept empty group name !");
3700   ids->checkStrictlyMonotonic(true);
3701   famArr->incrRef(); MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famArrTmp(famArr);
3702   std::vector<std::string> grpsNames=getGroupsNames();
3703   if(std::find(grpsNames.begin(),grpsNames.end(),grpName)!=grpsNames.end())
3704     {
3705       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : Group with name \"" << grpName << "\" already exists ! Destroy it before calling this method !";
3706       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3707     }
3708   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > allFamIds=getAllNonNullFamilyIds();
3709   allFamIds.erase(std::find(allFamIds.begin(),allFamIds.end(),famArrTmp));
3710   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=famArr->selectByTupleIdSafe(ids->begin(),ids->end());
3711   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diffFamIds=famIds->getDifferentValues();
3712   std::vector<int> familyIds;
3713   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > idsPerfamiliyIds;
3714   int maxVal=getTheMaxAbsFamilyId()+1;
3715   std::map<std::string,int> families(_families);
3716   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
3717   std::vector<std::string> fams;
3718   bool created(false);
3719   for(const int *famId=diffFamIds->begin();famId!=diffFamIds->end();famId++)
3720     {
3721       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2Tmp=famIds->getIdsEqual(*famId);
3722       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->selectByTupleId(ids2Tmp->begin(),ids2Tmp->end());
3723       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids1=famArr->getIdsEqual(*famId);
3724       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret0(ids1->buildSubstractionOptimized(ids2));
3725       if(ret0->empty())
3726         {
3727           bool isFamPresent=false;
3728           for(std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >::const_iterator itl=allFamIds.begin();itl!=allFamIds.end() && !isFamPresent;itl++)
3729             isFamPresent=(*itl)->presenceOfValue(*famId);
3730           if(!isFamPresent)
3731             { familyIds.push_back(*famId); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); fams.push_back(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,*famId,created)); } // adding *famId in grp
3732           else
3733             {
3734               familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);
3735               std::string locFamName=FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created);
3736               fams.push_back(locFamName);
3737               if(existsFamily(*famId))
3738                 {
3739                   std::string locFamName2=getFamilyNameGivenId(*famId); std::vector<std::string> v(2); v[0]=locFamName2; v[1]=locFamName;
3740                   ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3741                 }
3742               maxVal++;
3743             } // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and lie the grp on maxVal
3744         }
3745       else
3746         {
3747           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and on maxVal+1
3748           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);//grp lie only on maxVal+1
3749           std::string n2(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1,created)); fams.push_back(n2);
3750           if(existsFamily(*famId))
3751             {
3752               std::string n1(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created)); std::vector<std::string> v(2); v[0]=n1; v[1]=n2;
3753               ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3754             }
3755           maxVal+=2;
3756         }
3757     }
3758   for(std::size_t i=0;i<familyIds.size();i++)
3759     {
3760       DataArrayInt *da=idsPerfamiliyIds[i];
3761       famArr->setPartOfValuesSimple3(familyIds[i],da->begin(),da->end(),0,1,1);
3762     }
3763   _families=families;
3764   _groups=groups;
3765   _groups[grpName]=fams;
3766 }
3767
3768 /*!
3769  * Changes a name of a family specified by its id.
3770  *  \param [in] id - the id of the family of interest.
3771  *  \param [in] newFamName - the new family name.
3772  *  \throw If no family with the given \a id exists.
3773  */
3774 void MEDFileUMesh::setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName)
3775 {
3776   std::string oldName=getFamilyNameGivenId(id);
3777   _families.erase(oldName);
3778   _families[newFamName]=id;
3779 }
3780
3781 /*!
3782  * Removes a mesh of a given dimension.
3783  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3784  *  \throw If there is no mesh at level \a meshDimRelToMax in \a this mesh.
3785  */
3786 void MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax)
3787 {
3788   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3789   std::vector<int>::const_iterator it=std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax);
3790   if(it==levSet.end())
3791     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel : the requested level is not existing !");
3792   int pos=(-meshDimRelToMax);
3793   _ms[pos]=0;
3794 }
3795
3796 /*!
3797  * Sets a new MEDCoupling1GTUMesh at a given level in \a this mesh.
3798  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3799  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3800  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3801  *         different. 
3802  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3803  *         another node coordinates array.
3804  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3805  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3806  */
3807 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCoupling1GTUMesh *m)
3808 {
3809   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m));
3810   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3811 }
3812
3813 /*!
3814  * Sets a new MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh.
3815  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3816  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3817  *  \param [in] newOrOld - if \c true, cells in \a m are sorted by type to be ready for 
3818  *         writing \a this mesh in a MED file.
3819  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3820  *         different. 
3821  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3822  *         another node coordinates array.
3823  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3824  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3825  */
3826 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld)
3827 {
3828   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld));
3829   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3830 }
3831
3832 MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>& MEDFileUMesh::checkAndGiveEntryInSplitL1(int meshDimRelToMax, MEDCouplingPointSet *m)
3833 {
3834   dealWithTinyInfo(m);
3835   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3836   if(std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax)==levSet.end())
3837     {
3838       if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3839         {
3840           DataArrayDouble *c=m->getCoords();
3841           if(c)
3842             c->incrRef();
3843           _coords=c;
3844         }
3845       if(m->getCoords()!=_coords)
3846         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshAtLevel : Invalid Given Mesh ! The coordinates are not the same ! try to use tryToShareSameCoords !");
3847       int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3848       if(sz>=(int)_ms.size())
3849         _ms.resize(sz);
3850       checkMeshDimCoherency(m->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3851       return _ms[sz-1];
3852     }
3853   else
3854     return _ms[-meshDimRelToMax];
3855 }
3856
3857 /*!
3858  * This method allows to set at once the content of different levels in \a this.
3859  * This method is equivalent to a series of call to MEDFileUMesh::setMeshAtLevel.
3860  *
3861  * \param [in] ms - List of unstructured meshes lying on the same coordinates and having different mesh dimesnion.
3862  * \param [in] renum - the parameter (set to false by default) that tells the beheviour if there is a mesh on \a ms that is not geo type sorted.
3863  *                     If false, an exception ois thrown. If true the mesh is reordered automatically. It is highly recommanded to let this parameter to false.
3864  *
3865  * \throw If \a there is a null pointer in \a ms.
3866  * \sa MEDFileUMesh::setMeshAtLevel
3867  */
3868 void MEDFileUMesh::setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3869 {
3870   if(ms.empty())
3871     return ;
3872   const MEDCouplingUMesh *mRef=ms[0];
3873   if(!mRef)
3874     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in the first element of input meshes !");
3875   std::string name(mRef->getName());
3876   const DataArrayDouble *coo(mRef->getCoords());
3877   std::set<int> s;
3878   int zeDim=-1;
3879   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3880     {
3881       const MEDCouplingUMesh *cur(*it);
3882       if(!cur)
3883         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in input vector of meshes !");
3884       if(coo!=cur->getCoords())
3885         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes do not share the same coordinates !");
3886       int mdim=cur->getMeshDimension();
3887       zeDim=std::max(zeDim,mdim);
3888       if(s.find(mdim)!=s.end())
3889         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes must share the same coordinates pointer, and should have different mesh dimension each other !");
3890     }
3891   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3892     {
3893       int mdim=(*it)->getMeshDimension();
3894       setName((*it)->getName());
3895       setMeshAtLevel(mdim-zeDim,const_cast<MEDCouplingUMesh *>(*it),renum);
3896     }
3897   setName(name);
3898 }
3899
3900 /*!
3901  * Creates one MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh from a sequence of
3902  * meshes each representing a group, and creates corresponding groups in \a this mesh.
3903  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3904  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the mesh and groups at.
3905  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3906  *          create in \a this mesh.
3907  *  \throw If \a ms is empty.
3908  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3909  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3910  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3911  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3912  *         of the given meshes.
3913  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3914  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3915  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3916  */
3917 void MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3918 {
3919   if(ms.empty())
3920     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : expecting a non empty vector !");
3921   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3922   if(sz>=(int)_ms.size())
3923     _ms.resize(sz);
3924   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3925   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3926   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3927     {
3928       coo->incrRef();
3929       _coords=coo;
3930     }
3931   else
3932     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3933       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : coordinates mismatches !");
3934   std::vector<DataArrayInt *> corr;
3935   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,_zipconn_pol,corr);
3936   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr3(corr.begin(),corr.end());
3937   setMeshAtLevel(meshDimRelToMax,m,renum);
3938   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3939   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,true);
3940 }
3941
3942 /*!
3943  * Creates groups at a given level in \a this mesh from a sequence of
3944  * meshes each representing a group.
3945  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3946  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the groups at.
3947  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3948  *         create in \a this mesh.
3949  *  \param [in] renum - if \c true, then the optional numbers of entities are taken into
3950  *         account. 
3951  *  \throw If \a ms is empty.
3952  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3953  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3954  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3955  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3956  *         of the given meshes.
3957  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3958  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3959  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3960  */
3961 void MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3962 {
3963   if(ms.empty())
3964     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : expecting a non empty vector !");
3965   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3966   if(sz>=(int)_ms.size())
3967     _ms.resize(sz);
3968   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3969   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3970   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3971     {
3972       coo->incrRef();
3973       _coords=coo;
3974     }
3975   else
3976     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3977       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : coordinates mismatches !");
3978   MEDCouplingUMesh *m=getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3979   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr(ms.size());
3980   int i=0;
3981   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
3982     {
3983       DataArrayInt *arr=0;
3984       bool test=m->areCellsIncludedIn(*it,_zipconn_pol,arr);
3985       corr[i]=arr;
3986       if(!test)
3987         {
3988           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : mesh #" << i << " is not part of whole mesh !";
3989           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3990         }
3991     }
3992   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3993   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,renum);
3994 }
3995
3996 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const
3997 {
3998   const DataArrayDouble *ret=ms[0]->getCoords();
3999   int mdim=ms[0]->getMeshDimension();
4000   for(unsigned int i=1;i<ms.size();i++)
4001     {
4002       ms[i]->checkCoherency();
4003       if(ms[i]->getCoords()!=ret)
4004         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes must share the same coords !");
4005       if(ms[i]->getMeshDimension()!=mdim)
4006         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes have not same mesh dimension !");
4007     }
4008   return const_cast<DataArrayDouble *>(ret);
4009 }
4010
4011 /*!
4012  * Sets the family field of a given relative dimension.
4013  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4014  *          the family field is set.
4015  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4016  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4017  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4018  */
4019 void MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
4020 {
4021   if(meshDimRelToMaxExt==1)
4022     {
4023       if(!famArr)
4024         {
4025           _fam_coords=0;
4026           return ;
4027         }
4028       DataArrayDouble *coo(_coords);
4029       if(!coo)
4030         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : the coordinates have not been set !");
4031       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of node family arr ! ");
4032       famArr->incrRef();
4033       _fam_coords=famArr;
4034       return ;
4035     }
4036   if(meshDimRelToMaxExt>1)
4037     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Dimension request is invalid (>1) !");
4038   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
4039   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
4040     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
4041   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
4042     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
4043   return _ms[traducedRk]->setFamilyArr(famArr);
4044 }
4045
4046 /*!
4047  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4048  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4049  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4050  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4051  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4052  */
4053 void MEDFileUMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
4054 {
4055   if(meshDimRelToMaxExt==1)
4056     {
4057       if(!renumArr)
4058         {
4059           _num_coords=0;
4060           _rev_num_coords=0;
4061           return ;
4062         }
4063       DataArrayDouble *coo(_coords);
4064       if(!coo)
4065         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumFieldArr : the coordinates have not been set !");
4066       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setRenumArr : Problem in size of node numbering arr ! ");
4067       renumArr->incrRef();
4068       _num_coords=renumArr;
4069       computeRevNum();
4070       return ;
4071     }
4072   if(meshDimRelToMaxExt>1)
4073     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumArr : Dimension request is invalid (>1) !");
4074   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
4075   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
4076     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
4077   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
4078     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
4079   return _ms[traducedRk]->setRenumArr(renumArr);
4080 }
4081
4082 /*!
4083  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4084  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4085  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4086  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4087  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4088  */
4089 void MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4090 {
4091   if(meshDimRelToMaxExt==1)
4092     {
4093       if(!nameArr)
4094         {
4095           _name_coords=0;
4096           return ;
4097         }
4098       DataArrayDouble *coo(_coords);
4099       if(!coo)
4100         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : the coordinates have not been set !");
4101       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of node numbering arr ! ");
4102       nameArr->incrRef();
4103       _name_coords=nameArr;
4104       return ;
4105     }
4106   if(meshDimRelToMaxExt>1)
4107     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Dimension request is invalid (>1) !");
4108   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
4109   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
4110     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
4111   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
4112     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
4113   return _ms[traducedRk]->setNameArr(nameArr);
4114 }
4115
4116 void MEDFileUMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4117 {
4118   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4119     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
4120       (*it)->synchronizeTinyInfo(*this);
4121 }
4122
4123 /*!
4124  * This method is called by MEDFileMesh::changeFamilyId. It performs only one part of the family id modification.
4125  */
4126 void MEDFileUMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4127 {
4128   DataArrayInt *arr=_fam_coords;
4129   if(arr)
4130     arr->changeValue(oldId,newId);
4131   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4132     {
4133       MEDFileUMeshSplitL1 *sp=(*it);
4134       if(sp)
4135         {
4136           sp->changeFamilyIdArr(oldId,newId);
4137         }
4138     }
4139 }
4140
4141 std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > MEDFileUMesh::getAllNonNullFamilyIds() const
4142 {
4143   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ret;
4144   const DataArrayInt *da(_fam_coords);
4145   if(da)
4146     { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
4147   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4148     {
4149       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
4150       if(elt)
4151         {
4152           da=elt->getFamilyField();
4153           if(da)
4154             { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
4155         }
4156     }
4157   return ret;
4158 }
4159
4160 void MEDFileUMesh::computeRevNum() const
4161 {
4162   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
4163     {
4164       int pos;
4165       int maxValue=_num_coords->getMaxValue(pos);
4166       _rev_num_coords=_num_coords->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4167     }
4168 }
4169
4170 std::size_t MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
4171 {
4172   return MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
4173 }
4174
4175 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull() const
4176 {
4177   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull());
4178   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_nodes);
4179   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_nodes);
4180   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes);
4181   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_cells);
4182   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_cells);
4183   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells);
4184   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_faces);
4185   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_faces);
4186   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_nodes);
4187   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces);
4188   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_cells);
4189   ret.push_back((const MEDCoupling1SGTUMesh*)_faces_if_necessary);
4190   return ret;
4191 }
4192
4193 int MEDFileStructuredMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
4194 {
4195   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4196   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4197     {
4198       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4199       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4200     }
4201   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4202     {
4203       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4204       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4205     }
4206   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4207     {
4208       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4209       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4210     }
4211   return ret;
4212 }
4213
4214 int MEDFileStructuredMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
4215 {
4216   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4217   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4218     {
4219       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4220       ret=std::max(ret,val);
4221     }
4222   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4223     {
4224       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4225       ret=std::max(ret,val);
4226     }
4227   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4228     {
4229       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4230       ret=std::max(ret,val);
4231     }
4232   return ret;
4233 }
4234
4235 int MEDFileStructuredMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
4236 {
4237   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4238   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4239     {
4240       int val=_fam_nodes->getMinValue(tmp);
4241       ret=std::min(ret,val);
4242     }
4243   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4244     {
4245       int val=_fam_cells->getMinValue(tmp);
4246       ret=std::min(ret,val);
4247     }
4248   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4249     {
4250       int val=_fam_faces->getMinValue(tmp);
4251       ret=std::min(ret,val);
4252     }
4253   return ret;
4254 }
4255
4256 bool MEDFileStructuredMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4257 {
4258   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
4259     return false;
4260   const MEDFileStructuredMesh *otherC=dynamic_cast<const  MEDFileStructuredMesh *>(other);
4261   if(!otherC)
4262     {
4263       what="Mesh types differ ! This is structured and other is NOT !";
4264       return false;
4265     }
4266   const DataArrayInt *famc1=_fam_nodes;
4267   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_nodes;
4268   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4269     {
4270       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
4271       return false;
4272     }
4273   if(famc1)
4274     {
4275       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4276       if(!ret)
4277         {
4278           what="Families arr on nodes differ !";
4279           return false;
4280         }
4281     }
4282   famc1=_fam_cells;
4283   famc2=otherC->_fam_cells;
4284   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4285     {
4286       what="Mismatch of families arr on cells ! One is defined and not other !";
4287       return false;
4288     }
4289   if(famc1)
4290     {
4291       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4292       if(!ret)
4293         {
4294           what="Families arr on cells differ !";
4295           return false;
4296         }
4297     }
4298   famc1=_fam_faces;
4299   famc2=otherC->_fam_faces;
4300   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4301     {
4302       what="Mismatch of families arr on faces ! One is defined and not other !";
4303       return false;
4304     }
4305   if(famc1)
4306     {
4307       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4308       if(!ret)
4309         {
4310           what="Families arr on faces differ !";
4311           return false;
4312         }
4313     }
4314   famc1=_num_nodes;
4315   famc2=otherC->_num_nodes;
4316   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4317     {
4318       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
4319       return false;
4320     }
4321   if(famc1)
4322     {
4323       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4324       if(!ret)
4325         {
4326           what="Numbering arr on nodes differ !";
4327           return false;
4328         }
4329     }
4330   famc1=_num_cells;
4331   famc2=otherC->_num_cells;
4332   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4333     {
4334       what="Mismatch of numbering arr on cells ! One is defined and not other !";
4335       return false;
4336     }
4337   if(famc1)
4338     {
4339       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4340       if(!ret)
4341         {
4342           what="Numbering arr on cells differ !";
4343           return false;
4344         }
4345     }
4346   famc1=_num_faces;
4347   famc2=otherC->_num_faces;
4348   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4349     {
4350       what="Mismatch of numbering arr on faces ! One is defined and not other !";
4351       return false;
4352     }
4353   if(famc1)
4354     {
4355       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4356       if(!ret)
4357         {
4358           what="Numbering arr on faces differ !";
4359           return false;
4360         }
4361     }
4362   const DataArrayAsciiChar *d1=_names_cells;
4363   const DataArrayAsciiChar *d2=otherC->_names_cells;
4364   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4365     {
4366       what="Mismatch of naming arr on cells ! One is defined and not other !";
4367       return false;
4368     }
4369   if(d1)
4370     {
4371       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4372       if(!ret)
4373         {
4374           what="Naming arr on cells differ !";
4375           return false;
4376         }
4377     }
4378   d1=_names_faces;
4379   d2=otherC->_names_faces;
4380   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4381     {
4382       what="Mismatch of naming arr on faces ! One is defined and not other !";
4383       return false;
4384     }
4385   if(d1)
4386     {
4387       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4388       if(!ret)
4389         {
4390           what="Naming arr on faces differ !";
4391           return false;
4392         }
4393     }
4394   d1=_names_nodes;
4395   d2=otherC->_names_nodes;
4396   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4397     {
4398       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
4399       return false;
4400     }
4401   if(d1)
4402     {
4403       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4404       if(!ret)
4405         {
4406           what="Naming arr on nodes differ !";
4407           return false;
4408         }
4409     }
4410   return true;
4411 }
4412
4413 void MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4414 {
4415   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
4416   const DataArrayInt *tmp=_fam_nodes;
4417   if(tmp)
4418     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4419   tmp=_num_nodes;
4420   if(tmp)
4421     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4422   tmp=_fam_cells;
4423   if(tmp)
4424     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4425   tmp=_num_cells;
4426   if(tmp)
4427     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4428   tmp=_fam_faces;
4429   if(tmp)
4430     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4431   tmp=_num_faces;
4432   if(tmp)
4433     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4434 }
4435
4436 /*!
4437  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
4438  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
4439  *          are required.
4440  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
4441  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
4442  *          returned instead of ids.
4443  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
4444  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
4445  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
4446  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
4447  */
4448 DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
4449 {
4450   std::vector<int> famIds(getFamiliesIds(fams));
4451   switch(meshDimRelToMaxExt)
4452   {
4453     case 1:
4454       {
4455         if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4456           {
4457             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4458             if(!famIds.empty())
4459               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4460             else
4461               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(0,0);
4462             if(renum)
4463               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_nodes,da);
4464             else
4465               return da.retn();
4466           }
4467         else
4468           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
4469         break;
4470       }
4471     case 0:
4472       {
4473         if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4474           {
4475             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4476             if(!famIds.empty())
4477               da=_fam_cells->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4478             else
4479               da=_fam_cells->getIdsEqualList(0,0);
4480             if(renum)
4481               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_cells,da);
4482             else
4483               return da.retn();
4484           }
4485         else
4486           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on cells !");
4487         break;
4488       }
4489     case -1:
4490       {
4491         if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4492           {
4493             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4494             if(!famIds.empty())
4495               da=_fam_faces->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4496             else
4497               da=_fam_faces->getIdsEqualList(0,0);
4498             if(renum)
4499               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_faces,da);
4500             else
4501               return da.retn();
4502           }
4503         else
4504           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on faces !");
4505         break;
4506       }
4507     default:
4508       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : input meshDimRelative must be in [0,1,-1] !");
4509   }
4510   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : unmanaged case !");
4511 }
4512
4513 /*!
4514  * Sets the family field of a given relative dimension.
4515  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4516  *          the family field is set.
4517  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4518  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4519  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4520  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1 and \a meshDimRelToMaxExt != -1.
4521  */
4522 void MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
4523 {
4524   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4525   if(!mesh)
4526     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set family array !");
4527   switch(meshDimRelToMaxExt)
4528   {
4529     case 0:
4530       {
4531         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4532         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4533         _fam_cells=famArr;
4534         break;
4535       }
4536     case 1:
4537       {
4538         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4539         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4540         _fam_nodes=famArr;
4541         break;
4542       }
4543     case -1:
4544       {
4545         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4546         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4547         _fam_faces=famArr;
4548         break;
4549       }
4550     default:
4551       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4552   }
4553   if(famArr)
4554     famArr->incrRef();
4555 }
4556
4557 /*!
4558  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4559  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4560  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4561  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4562  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4563  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4564  */
4565 void MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
4566 {
4567   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4568   if(!mesh)
4569     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set number array !");
4570   switch(meshDimRelToMaxExt)
4571   {
4572     case 0:
4573       {
4574         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4575         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4576         _num_cells=renumArr;
4577         break;
4578       }
4579     case 1:
4580       {
4581         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4582         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4583         _num_nodes=renumArr;
4584         break;
4585       }
4586     case -1:
4587       {
4588         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4589         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4590         _num_faces=renumArr;
4591         break;
4592       }
4593     default:
4594       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4595   }
4596   if(renumArr)
4597     renumArr->incrRef();
4598 }
4599
4600 /*!
4601  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4602  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4603  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4604  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4605  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4606  */
4607 void MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4608 {
4609   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4610   if(!mesh)
4611     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : no structured mesh specified ! Impossible to set names array !");
4612   switch(meshDimRelToMaxExt)
4613   {
4614     case 0:
4615       {
4616         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4617         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4618         _names_cells=nameArr;
4619         break;
4620       }
4621     case 1:
4622       {
4623         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4624         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4625         _names_nodes=nameArr;
4626         break;
4627       }
4628     case -1:
4629       {
4630         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4631         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4632         _names_cells=nameArr;
4633       }
4634     default:
4635       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4636   }
4637   if(nameArr)
4638     nameArr->incrRef();
4639 }
4640
4641 /*!
4642  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
4643  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4644  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
4645  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
4646  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4647  */
4648 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4649 {
4650   switch(meshDimRelToMaxExt)
4651   {
4652     case 0:
4653       return _fam_cells;
4654     case 1:
4655       return _fam_nodes;
4656     case -1:
4657       return _fam_faces;
4658     default:
4659       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4660   }
4661 }
4662
4663 /*!
4664  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4665  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4666  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
4667  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4668  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4669  */
4670 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4671 {
4672   switch(meshDimRelToMaxExt)
4673   {
4674     case 0:
4675       return _num_cells;
4676     case 1:
4677       return _num_nodes;
4678     case -1:
4679       return _num_faces;
4680     default:
4681       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4682   }
4683 }
4684
4685 /*!
4686  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
4687  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4688  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4689  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
4690  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4691  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4692  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4693  */
4694 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4695 {
4696   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4697     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4698   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4699     {
4700       if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4701         {
4702           int pos;
4703           int maxValue=_num_cells->getMaxValue(pos);
4704           _rev_num_cells=_num_cells->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4705           return _rev_num_cells;
4706         }
4707       else
4708         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no cell renumbering for a request on reverse numbering !");
4709     }
4710   else
4711     {
4712       if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4713         {
4714           int pos;
4715           int maxValue=_num_nodes->getMaxValue(pos);
4716           _rev_num_nodes=_num_nodes->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4717           return _rev_num_nodes;
4718         }
4719       else
4720         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no node renumbering for a request on reverse numbering !");
4721     }
4722 }
4723
4724 const DataArrayAsciiChar *MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4725 {
4726   switch(meshDimRelToMaxExt)
4727   {
4728     case 0:
4729       return _names_cells;
4730     case 1:
4731       return _names_nodes;
4732     case -1:
4733       return _names_faces;
4734     default:
4735       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4736   }
4737 }
4738
4739 /*!
4740  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
4741  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [0].
4742  */
4743 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevels() const
4744 {
4745   std::vector<int> ret(1);
4746   return ret;
4747 }
4748
4749 /*!
4750  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
4751  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [1,0].
4752  */
4753 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
4754 {
4755   std::vector<int> ret(2);
4756   ret[0]=1;
4757   return ret;
4758 }
4759
4760 /*!
4761  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL family arr are defined.
4762  */
4763 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
4764 {
4765   std::vector<int> ret;
4766   const DataArrayInt *famNodes(_fam_nodes),*famCells(_fam_cells),*famFaces(_fam_faces);
4767   if(famNodes)
4768     ret.push_back(1);
4769   if(famCells)
4770     ret.push_back(0);
4771   if(famFaces)
4772     ret.push_back(-1);
4773   return ret;
4774 }
4775
4776 /*!
4777  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL numbering arr are defined.
4778  */
4779 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
4780 {
4781   std::vector<int> ret;
4782   const DataArrayInt *numNodes(_num_nodes),*numCells(_num_cells),*numFaces(_num_faces);
4783   if(numNodes)
4784     ret.push_back(1);
4785   if(numCells)
4786     ret.push_back(0);
4787   if(numFaces)
4788     ret.push_back(-1);
4789   return ret;
4790 }
4791
4792 /*!
4793  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL naming arr are defined.
4794  */
4795 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
4796 {
4797   std::vector<int> ret;
4798   const DataArrayAsciiChar *namesNodes(_names_nodes),*namesCells(_names_cells),*namesFaces(_names_faces);
4799   if(namesNodes)
4800     ret.push_back(1);
4801   if(namesCells)
4802     ret.push_back(0);
4803   if(namesFaces)
4804     ret.push_back(-1);
4805   return ret;
4806 }
4807
4808 /*!
4809  * no implementation here, it is not a bug, but intresically no polyhedra in \a this.
4810  */
4811 bool MEDFileStructuredMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
4812 {
4813   oldCode.clear(); newCode.clear(); o2nRenumCell=0;
4814   return false;
4815 }
4816
4817 void MEDFileStructuredMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4818 {
4819   DataArrayInt *arr=_fam_nodes;
4820   if(arr)
4821     arr->changeValue(oldId,newId);
4822   arr=_fam_cells;
4823   if(arr)
4824     arr->changeValue(oldId,newId);
4825   arr=_fam_faces;
4826   if(arr)
4827     arr->changeValue(oldId,newId);
4828 }
4829
4830 void MEDFileStructuredMesh::deepCpyAttributes()
4831 {
4832   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
4833     _fam_nodes=_fam_nodes->deepCpy();
4834   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
4835     _num_nodes=_num_nodes->deepCpy();
4836   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_nodes)
4837     _names_nodes=_names_nodes->deepCpy();
4838   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
4839     _fam_cells=_fam_cells->deepCpy();
4840   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
4841     _num_cells=_num_cells->deepCpy();
4842   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_cells)
4843     _names_cells=_names_cells->deepCpy();
4844   if((const DataArrayInt*)_fam_faces)
4845     _fam_faces=_fam_faces->deepCpy();
4846   if((const DataArrayInt*)_num_faces)
4847     _num_faces=_num_faces->deepCpy();
4848   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_faces)
4849     _names_faces=_names_faces->deepCpy();
4850   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
4851     _rev_num_nodes=_rev_num_nodes->deepCpy();
4852   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
4853     _rev_num_cells=_rev_num_cells->deepCpy();
4854 }
4855
4856 /*!
4857  * Returns a pointer to mesh at the specified level (here 0 is compulsary for cartesian mesh).
4858  * 
4859  * \return a pointer to cartesian mesh that need to be managed by the caller.
4860  * \warning the returned pointer has to be managed by the caller.
4861  */
4862
4863 /*!
4864  * Returns a pointer to MEDCouplingStructuredMesh held by \a this. 
4865  *  \param [in] meshDimRelToMax - it must be \c 0 or \c -1.
4866  *  \param [in] renum - it must be \c false.
4867  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingMesh that the caller is to
4868  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
4869  */
4870 MEDCouplingMesh *MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
4871 {
4872   if(renum)
4873     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support renumbering ! To do it perform request of renum array directly !");
4874   const MEDCouplingStructuredMesh *m(getStructuredMesh());
4875   switch(meshDimRelToMax)
4876   {
4877     case 0:
4878       {
4879         if(m)
4880           m->incrRef();
4881         return const_cast<MEDCouplingStructuredMesh *>(m);
4882       }
4883     case -1:
4884       {
4885         if(!m)
4886           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel : level -1 requested must be non empty to be able to compute unstructured sub mesh !");
4887         buildMinusOneImplicitPartIfNeeded();
4888         MEDCouplingMesh *ret(_faces_if_necessary);
4889         if(ret)
4890           ret->incrRef();
4891         return ret;
4892       }
4893     default:
4894       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support multi level for mesh 0 expected as input !");
4895   }
4896 }
4897
4898 /*!
4899  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
4900  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
4901  *  \return int - the number of entities.
4902  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
4903  */
4904 int MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4905 {
4906   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4907   if(!cmesh)
4908     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : No structured mesh set !");
4909   switch(meshDimRelToMaxExt)
4910   {
4911     case 0:
4912       return cmesh->getNumberOfCells();
4913     case 1:
4914       return cmesh->getNumberOfNodes();
4915     case -1:
4916       return cmesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4917     default:
4918       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4919   }
4920 }
4921
4922 int MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes() const
4923 {
4924   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4925   if(!cmesh)
4926     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes : no cartesian mesh set !");
4927   return cmesh->getNumberOfNodes();
4928 }
4929
4930 bool MEDFileStructuredMesh::hasImplicitPart() const
4931 {
4932   return true;
4933 }
4934
4935 /*!
4936  * \sa MEDFileStructuredMesh::getImplicitFaceMesh
4937  */
4938 int MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
4939 {
4940   static const char MSG[]="MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny : the given geo type is not manageable by a structured mesh !";
4941   const MEDCoupling1SGTUMesh *zeFaceMesh(_faces_if_necessary);
4942   if(!zeFaceMesh)
4943     {
4944       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension())));
4945       if(cm.getReverseExtrudedType()!=gt)
4946         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
4947       buildImplicitPart();
4948       return getStructuredMesh()->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4949     }
4950   else
4951     {
4952       if(gt!=zeFaceMesh->getCellModelEnum())
4953         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
4954       return zeFaceMesh->getNumberOfCells();
4955     }
4956 }
4957
4958 void MEDFileStructuredMesh::buildMinusOneImplicitPartIfNeeded() const
4959 {
4960   const MEDCoupling1SGTUMesh *zeFaceMesh(_faces_if_necessary);
4961   if(!zeFaceMesh)
4962     buildImplicitPart();
4963 }
4964
4965 void MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPart() const
4966 {
4967   const MEDCouplingStructuredMesh *mcmesh(getStructuredMesh());
4968   if(!mcmesh)
4969     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPart : Unable to build the implicit part of structured mesh because no structured mesh at level 0 defined !");
4970   _faces_if_necessary=mcmesh->build1SGTSubLevelMesh();
4971 }
4972
4973 void MEDFileStructuredMesh::releaseImplicitPartIfAny() const
4974 {
4975   _faces_if_necessary=0;
4976 }
4977
4978 /*!
4979  * Retrieves the internal pointer (no decrRef requested) of the implicit face mesh if any.
4980  * To force to build it you can invoke MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny method.
4981  * 
4982  * \sa MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny
4983  */
4984 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDFileStructuredMesh::getImplicitFaceMesh() const
4985 {
4986   return _faces_if_necessary;
4987 }
4988
4989 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
4990 {
4991   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4992   if(!cmesh)
4993     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : No structured mesh set !");
4994   switch(meshDimRelToMax)
4995   {
4996     case 0:
4997       {
4998         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,cmesh->getTypeOfCell(0));
4999         return ret;
5000       }
5001     case -1:
5002       {
5003         int mdim(cmesh->getMeshDimension());
5004         if(mdim<1)
5005           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only one level available for structured meshes ! Input 0 is mandatory or 0D mesh !");
5006         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(mdim-1));
5007         return ret;
5008       }
5009     default:
5010       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only 2 levels available at most : 0 and -1 !");
5011   }
5012 }
5013
5014 void MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
5015 {
5016   if(st.getNumberOfItems()!=1)
5017     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
5018   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
5019     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
5020   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
5021     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
5022   if(st[0].getPflName().empty())
5023     {
5024       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
5025       return ;
5026     }
5027   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[0].getPflName()));
5028   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
5029   int sz(nodesFetched.size());
5030   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
5031     {
5032       std::vector<int> conn;
5033       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
5034       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
5035         if(*it>=0 && *it<sz)
5036           nodesFetched[*it]=true;
5037         else
5038           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
5039     }
5040 }
5041
5042 med_geometry_type MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim)
5043 {
5044   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ct(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim));
5045   return typmai3[ct];
5046 }
5047
5048 void MEDFileStructuredMesh::LoadStrMeshDAFromFile(med_idt fid, int meshDim, int dt, int it, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs,
5049                                                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& famCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& numCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar>& namesCells)
5050 {
5051   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
5052   med_geometry_type geoTypeReq=MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
5053   int nbOfElt(0);
5054   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5055   if(nbOfElt>0)
5056     {
5057       if(!mrs || mrs->isCellFamilyFieldReading())
5058         {
5059           famCells=DataArrayInt::New();
5060           famCells->alloc(nbOfElt,1);
5061           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,famCells->getPointer());
5062         }
5063     }
5064   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5065   if(nbOfElt>0)
5066     {
5067       if(!mrs || mrs->isCellNumFieldReading())
5068         {
5069           numCells=DataArrayInt::New();
5070           numCells->alloc(nbOfElt,1);
5071           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,numCells->getPointer());
5072         }
5073     }
5074   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5075   if(nbOfElt>0)
5076     {
5077       if(!mrs || mrs->isCellNameFieldReading())
5078         {
5079           namesCells=DataArrayAsciiChar::New();
5080           namesCells->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5081           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,namesCells->getPointer());
5082           namesCells->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5083         }
5084     }
5085 }
5086
5087 void MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5088 {
5089   setName(strm->getName());
5090   setDescription(strm->getDescription());
5091   setUnivName(strm->getUnivName());
5092   setIteration(strm->getIteration());
5093   setOrder(strm->getOrder());
5094   setTimeValue(strm->getTime());
5095   setTimeUnit(strm->getTimeUnit());
5096   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
5097   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
5098   int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5099   if(nbOfElt>0)
5100     {
5101       if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
5102         {
5103           int nbNodes(getNumberOfNodes());
5104           if(nbOfElt>nbNodes)
5105             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile : invalid size of family node array regarding number of nodes in this ! File seems to be corrupted !");
5106           _fam_nodes=DataArrayInt::New();
5107           _fam_nodes->alloc(nbNodes,1);//yes nbNodes and not nbOfElt see next line.
5108           if(nbNodes>nbOfElt)//yes it appends some times... It explains surely the mdump implementation. Bug revealed by PARAVIS EDF #2475 on structured.med file where only 12 first nodes are !=0 so nbOfElt=12 and nbOfNodes=378...
5109             _fam_nodes->fillWithZero();
5110           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getPointer());
5111         }
5112     }
5113   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5114   if(nbOfElt>0)
5115     {
5116       if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
5117         {
5118           _num_nodes=DataArrayInt::New();
5119           _num_nodes->alloc(nbOfElt,1);
5120           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getPointer());
5121         }
5122     }
5123   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5124   if(nbOfElt>0)
5125     {
5126       if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
5127         {
5128           _names_nodes=DataArrayAsciiChar::New();
5129           _names_nodes->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5130           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getPointer());
5131           _names_nodes->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5132         }
5133     }
5134   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
5135   LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim,dt,it,mName,mrs,_fam_cells,_num_cells,_names_cells);
5136   if(meshDim>=1)
5137     LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim-1,dt,it,mName,mrs,_fam_faces,_num_faces,_names_faces);
5138 }
5139
5140 void MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(med_idt fid, const std::string& maa) const
5141 {
5142   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
5143   med_geometry_type geoTypeReq(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim)),geoTypeReq2(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim-1));
5144   //
5145   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
5146     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getNumberOfTuples(),_fam_cells->getConstPointer());
5147   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
5148     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_fam_faces->getNumberOfTuples(),_fam_faces->getConstPointer());
5149   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
5150     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getNumberOfTuples(),_fam_nodes->getConstPointer());
5151   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
5152     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getNumberOfTuples(),_num_cells->getConstPointer());
5153   if((const DataArrayInt *)_num_faces)
5154     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_num_faces->getNumberOfTuples(),_num_faces->getConstPointer());
5155   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
5156     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getNumberOfTuples(),_num_nodes->getConstPointer());
5157   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
5158     {
5159       if(_names_cells->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5160         {
5161           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on cells with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5162           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
5163           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5164         }
5165       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getNumberOfTuples(),_names_cells->getConstPointer());
5166     }
5167   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces)
5168     {
5169       if(_names_faces->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5170         {
5171           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on faces with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5172           oss << " ! The array has " << _names_faces->getNumberOfComponents() << " components !";
5173           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5174         }
5175       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_names_faces->getNumberOfTuples(),_names_faces->getConstPointer());
5176     }
5177   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
5178     {
5179       if(_names_nodes->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5180         {
5181           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5182           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
5183           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5184         }
5185       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getNumberOfTuples(),_names_nodes->getConstPointer());
5186     }
5187   //
5188   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa.c_str(),_families,_groups,_too_long_str);
5189 }
5190
5191 /*!
5192  * Returns an empty instance of MEDFileCMesh.
5193  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5194  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5195  */
5196 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New()
5197 {
5198   return new MEDFileCMesh;
5199 }
5200
5201 /*!
5202  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
5203  * file. The first mesh in the file is loaded.
5204  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
5205  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5206  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5207  *  \throw If the file is not readable.
5208  *  \throw If there is no meshes in the file.
5209  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
5210  */
5211 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5212 {
5213   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5214   if(ms.empty())
5215     {
5216       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5217       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5218     }
5219   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5220   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5221   int dt,it;
5222   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5223   std::string dummy2;
5224   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5225   return new MEDFileCMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5226 }
5227
5228 /*!
5229  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
5230  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
5231  * iteration.
5232  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
5233  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
5234  *  \param [in] dt - the number of a time step.
5235  *  \param [in] it - the number of an iteration.
5236  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5237  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5238  *  \throw If the file is not readable.
5239  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
5240  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
5241  */
5242 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5243 {
5244   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5245   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5246   return new MEDFileCMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5247 }
5248
5249 std::size_t MEDFileCMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5250 {
5251   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5252 }
5253
5254 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCMesh::getDirectChildrenWithNull() const
5255 {
5256   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull());
5257   ret.push_back((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh);
5258   return ret;
5259 }
5260
5261 /*!
5262  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
5263  *  \return int - the mesh dimension.
5264  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5265  */
5266 int MEDFileCMesh::getMeshDimension() const
5267 {
5268   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5269     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5270   return _cmesh->getMeshDimension();
5271 }
5272
5273 /*!
5274  * Returns the dimension on nodes in \a this mesh.
5275  *  \return int - the space dimension.
5276  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5277  */
5278 int MEDFileCMesh::getSpaceDimension() const
5279 {
5280   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5281     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getSpaceDimension : unable to get spacedimension because no mesh set !");
5282   return _cmesh->getSpaceDimension();
5283 }
5284
5285 /*!
5286  * Returns a string describing \a this mesh.
5287  *  \return std::string - the mesh information string.
5288  */
5289 std::string MEDFileCMesh::simpleRepr() const
5290 {
5291   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5292 }
5293
5294 /*!
5295  * Returns a full textual description of \a this mesh.
5296  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
5297  */
5298 std::string MEDFileCMesh::advancedRepr() const
5299 {
5300   return simpleRepr();
5301 }
5302
5303 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::shallowCpy() const
5304 {
5305   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5306   return ret.retn();
5307 }
5308
5309 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::createNewEmpty() const
5310 {
5311   return new MEDFileCMesh;
5312 }
5313
5314 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::deepCpy() const
5315 {
5316   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5317   if((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh)
5318     ret->_cmesh=static_cast<MEDCouplingCMesh*>(_cmesh->deepCpy());
5319   ret->deepCpyAttributes();
5320   return ret.retn();
5321 }
5322
5323 /*!
5324  * Checks if \a this and another mesh are equal.
5325  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
5326  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
5327  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
5328  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
5329  */
5330 bool MEDFileCMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5331 {
5332   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5333     return false;
5334   const MEDFileCMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(other);
5335   if(!otherC)
5336     {
5337       what="Mesh types differ ! This is cartesian and other is NOT !";
5338       return false;
5339     }
5340   clearNonDiscrAttributes();
5341   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5342   const MEDCouplingCMesh *coo1=_cmesh;
5343   const MEDCouplingCMesh *coo2=otherC->_cmesh;
5344   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5345     {
5346       what="Mismatch of cartesian meshes ! One is defined and not other !";
5347       return false;
5348     }
5349   if(coo1)
5350     {
5351       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5352       if(!ret)
5353         {
5354           what="cartesian meshes differ !";
5355           return false;
5356         }
5357     }
5358   return true;
5359 }
5360
5361 /*!
5362  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
5363  */
5364 void MEDFileCMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5365 {
5366   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5367   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_cmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5368 }
5369
5370 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh()
5371 {
5372 }
5373
5374 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5375 try
5376 {
5377     loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5378 }
5379 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5380 {
5381     throw e;
5382 }
5383
5384 void MEDFileCMesh::loadCMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5385 {
5386   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5387   int dummy0,dummy1;
5388   std::string dtunit;
5389   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5390   if(meshType!=CARTESIAN)
5391     {
5392       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as cartesian an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT cartesian !";
5393       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5394     }
5395   MEDFileCMeshL2 loaderl2;
5396   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5397   MEDCouplingCMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5398   mesh->incrRef();
5399   _cmesh=mesh;
5400   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5401 }
5402
5403 /*!
5404  * Returns a const pointer to MEDCouplingCMesh held by \a this mesh.
5405  *  \return const MEDCouplingCMesh * - a pointer to the held MEDCouplingCMesh.
5406  */
5407 const MEDCouplingCMesh *MEDFileCMesh::getMesh() const
5408 {
5409   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5410   return _cmesh;
5411 }
5412
5413 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCMesh::getStructuredMesh() const
5414 {
5415   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5416   return _cmesh;
5417 }
5418
5419 /*!
5420  * Sets the MEDCouplingCMesh holding the data of \a this mesh.
5421  *  \param [in] m - the new MEDCouplingCMesh to refer to.
5422  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
5423  *         different. 
5424  */
5425 void MEDFileCMesh::setMesh(MEDCouplingCMesh *m)
5426 {
5427   dealWithTinyInfo(m);
5428   if(m)
5429     m->incrRef();
5430   _cmesh=m;
5431 }
5432
5433 void MEDFileCMesh::writeLL(med_idt fid) const
5434 {
5435   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5436   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5437   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5438   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5439   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5440   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5441   int spaceDim(_cmesh->getSpaceDimension());
5442   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5443   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5444   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5445     {
5446       std::string info(_cmesh->getCoordsAt(i)->getInfoOnComponent(0));
5447       std::string c,u;
5448       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5449       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5450       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5451     }
5452   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,spaceDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5453   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5454   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CARTESIAN_GRID);
5455   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5456     {
5457       const DataArrayDouble *da=_cmesh->getCoordsAt(i);
5458       MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,i+1,da->getNumberOfTuples(),da->getConstPointer());
5459     }
5460   //
5461   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5462   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5463 }
5464
5465 void MEDFileCMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5466 {
5467   const MEDCouplingCMesh *cmesh=_cmesh;
5468   if(!cmesh)
5469     return;
5470   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setName(_name);
5471   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setDescription(_desc_name);
5472   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5473   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5474 }
5475
5476 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New()
5477 {
5478   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5479 }
5480
5481 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5482 {
5483   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5484   if(ms.empty())
5485     {
5486       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5487       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5488     }
5489   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5490   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5491   int dt,it;
5492   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5493   std::string dummy2;
5494   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5495   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5496 }
5497
5498 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5499 {
5500   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5501   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5502   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5503 }
5504
5505 std::size_t MEDFileCurveLinearMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5506 {
5507   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5508 }
5509
5510 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCurveLinearMesh::getDirectChildrenWithNull() const
5511 {
5512   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull());
5513   ret.push_back((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh);
5514   return ret;
5515 }
5516
5517 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::shallowCpy() const
5518 {
5519   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5520   return ret.retn();
5521 }
5522
5523 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::createNewEmpty() const
5524 {
5525   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5526 }
5527
5528 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::deepCpy() const
5529 {
5530   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5531   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh)
5532     ret->_clmesh=static_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh*>(_clmesh->deepCpy());
5533   ret->deepCpyAttributes();
5534   return ret.retn();
5535 }
5536
5537 int MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension() const
5538 {
5539   if(!((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh))
5540     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5541   return _clmesh->getMeshDimension();
5542 }
5543
5544 std::string MEDFileCurveLinearMesh::simpleRepr() const
5545 {
5546   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5547 }
5548
5549 std::string MEDFileCurveLinearMesh::advancedRepr() const
5550 {
5551   return simpleRepr();
5552 }
5553
5554 bool MEDFileCurveLinearMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5555 {
5556   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5557     return false;
5558   const MEDFileCurveLinearMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(other);
5559   if(!otherC)
5560     {
5561       what="Mesh types differ ! This is curve linear and other is NOT !";
5562       return false;
5563     }
5564   clearNonDiscrAttributes();
5565   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5566   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo1=_clmesh;
5567   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo2=otherC->_clmesh;
5568   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5569     {
5570       what="Mismatch of curve linear meshes ! One is defined and not other !";
5571       return false;
5572     }
5573   if(coo1)
5574     {
5575       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5576       if(!ret)
5577         {
5578           what="curve linear meshes differ !";
5579           return false;
5580         }
5581     }
5582   return true;
5583 }
5584
5585 void MEDFileCurveLinearMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5586 {
5587   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5588   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_clmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5589 }
5590
5591 void MEDFileCurveLinearMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5592 {
5593   const MEDCouplingCurveLinearMesh *clmesh=_clmesh;
5594   if(!clmesh)
5595     return;
5596   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setName(_name);
5597   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setDescription(_desc_name);
5598   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5599   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5600 }
5601
5602 const MEDCouplingCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getMesh() const
5603 {
5604   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5605   return _clmesh;
5606 }
5607
5608 void MEDFileCurveLinearMesh::setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m)
5609 {
5610   dealWithTinyInfo(m);
5611   if(m)
5612     m->incrRef();
5613   _clmesh=m;
5614 }
5615
5616 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getStructuredMesh() const
5617 {
5618   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5619   return _clmesh;
5620 }
5621
5622 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh()
5623 {
5624 }
5625
5626 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5627 try
5628 {
5629     loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5630 }
5631 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5632 {
5633     throw e;
5634 }
5635
5636 void MEDFileCurveLinearMesh::writeLL(med_idt fid) const
5637 {
5638   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5639   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5640   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5641   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5642   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5643   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5644   int spaceDim=_clmesh->getSpaceDimension();
5645   int meshDim=_clmesh->getMeshDimension();
5646   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5647   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5648   const DataArrayDouble *coords=_clmesh->getCoords();
5649   if(!coords)
5650     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::writeLL : no coordinates set !");
5651   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5652     {
5653       std::string info(_clmesh->getCoords()->getInfoOnComponent(i));
5654       std::string c,u;
5655       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5656       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5657       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5658     }
5659   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5660   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5661   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CURVILINEAR_GRID);
5662   std::vector<int> nodeGridSt=_clmesh->getNodeGridStructure();
5663   MEDmeshGridStructWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,&nodeGridSt[0]);
5664
5665   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->begin());
5666   //
5667   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5668   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5669 }
5670
5671 void MEDFileCurveLinearMesh::loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5672 {
5673   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5674   int dummy0,dummy1;
5675   std::string dtunit;
5676   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5677   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
5678     {
5679       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as curve linear an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT curve linear !";
5680       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5681     }
5682   MEDFileCLMeshL2 loaderl2;
5683   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5684   MEDCouplingCurveLinearMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5685   mesh->incrRef();
5686   _clmesh=mesh;
5687   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5688 }
5689
5690 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New()
5691 {
5692   return new MEDFileMeshMultiTS;
5693 }
5694
5695 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName)
5696 {
5697   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName);
5698 }
5699
5700 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5701 {
5702   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName,mName);
5703 }
5704
5705 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::deepCpy() const
5706 {
5707   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> ret=MEDFileMeshMultiTS::New();
5708   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > meshOneTs(_mesh_one_ts.size());
5709   std::size_t i=0;
5710   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++,i++)
5711     if((const MEDFileMesh *)*it)
5712       meshOneTs[i]=(*it)->deepCpy();
5713   ret->_mesh_one_ts=meshOneTs;
5714   return ret.retn();
5715 }
5716
5717 std::size_t MEDFileMeshMultiTS::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5718 {
5719   return _mesh_one_ts.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh>);
5720 }
5721
5722 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshMultiTS::getDirectChildrenWithNull() const
5723 {
5724   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5725   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5726     ret.push_back((const MEDFileMesh *)*it);
5727   return ret;
5728 }
5729
5730 std::string MEDFileMeshMultiTS::getName() const
5731 {
5732   if(_mesh_one_ts.empty())
5733     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getName : no time steps set !");
5734   return _mesh_one_ts[0]->getName();
5735 }
5736
5737 void MEDFileMeshMultiTS::setName(const std::string& newMeshName)
5738 {
5739   std::string oldName(getName());
5740   std::vector< std::pair<std::string,std::string> > v(1);
5741   v[0].first=oldName; v[0].second=newMeshName;
5742   changeNames(v);
5743 }
5744
5745 bool MEDFileMeshMultiTS::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5746 {
5747   bool ret=false;
5748   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5749     {
5750       MEDFileMesh *cur(*it);
5751       if(cur)
5752         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5753     }
5754   return ret;
5755 }
5756
5757 MEDFileMesh *MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep() const
5758 {
5759   if(_mesh_one_ts.empty())
5760     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep : empty time step set !");
5761   return const_cast<MEDFileMesh *>(static_cast<const MEDFileMesh *>(_mesh_one_ts[0]));
5762 }
5763
5764 void MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep)
5765 {
5766   if(!mesh1TimeStep)
5767     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep : input pointer should be different from 0 !");
5768   _mesh_one_ts.resize(1);
5769   mesh1TimeStep->incrRef();
5770   //MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> toto=mesh1TimeStep;
5771   _mesh_one_ts[0]=mesh1TimeStep;
5772 }
5773
5774 void MEDFileMeshMultiTS::write(med_idt fid) const
5775 {
5776   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5777     {
5778       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5779       (*it)->write(fid);
5780     }
5781 }
5782
5783 void MEDFileMeshMultiTS::write(const std::string& fileName, int mode) const
5784 {
5785   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5786   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5787   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5788   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5789   write(fid);
5790 }
5791
5792 void MEDFileMeshMultiTS::loadFromFile(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5793 {//for the moment to be improved
5794   _mesh_one_ts.resize(1);
5795   _mesh_one_ts[0]=MEDFileMesh::New(fileName,mName,-1,-1);
5796 }
5797
5798 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS()
5799 {
5800 }
5801
5802 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName)
5803 try
5804 {
5805     std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5806     if(ms.empty())
5807       {
5808         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5809         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5810       }
5811     MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5812     MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5813     int dt,it;
5814     ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5815     std::string dummy2;
5816     MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5817     loadFromFile(fileName,ms.front());
5818 }
5819 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5820 {
5821     throw e;
5822 }
5823
5824 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5825 try
5826 {
5827     loadFromFile(fileName,mName);
5828 }
5829 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5830 {
5831     throw e;
5832 }
5833
5834 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New()
5835 {
5836   return new MEDFileMeshes;
5837 }
5838
5839 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New(const std::string& fileName)
5840 {
5841   return new MEDFileMeshes(fileName);
5842 }
5843
5844 void MEDFileMeshes::write(med_idt fid) const
5845 {
5846   checkCoherency();
5847   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5848     {
5849       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5850       (*it)->write(fid);
5851     }
5852 }
5853
5854 void MEDFileMeshes::write(const std::string& fileName, int mode) const
5855 {
5856   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5857   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5858   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5859   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5860   checkCoherency();
5861   write(fid);
5862 }
5863
5864 int MEDFileMeshes::getNumberOfMeshes() const
5865 {
5866   return _meshes.size();
5867 }
5868
5869 MEDFileMeshesIterator *MEDFileMeshes::iterator()
5870 {
5871   return new MEDFileMeshesIterator(this);
5872 }
5873
5874 /** Return a borrowed reference (caller is not responsible) */
5875 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshAtPos(int i) const
5876 {
5877   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5878     {
5879       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshAtPos : invalid mesh id given in parameter ! Should be in [0;" << _meshes.size() << ") !";
5880       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5881     }
5882   return _meshes[i]->getOneTimeStep();
5883 }
5884
5885 /** Return a borrowed reference (caller is not responsible) */
5886 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshWithName(const std::string& mname) const
5887 {
5888   std::vector<std::string> ms=getMeshesNames();
5889   std::vector<std::string>::iterator it=std::find(ms.begin(),ms.end(),mname);
5890   if(it==ms.end())
5891     {
5892       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshWithName : Mesh  \"" << mname << "\" does not exist in this ! Existing are : ";
5893       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
5894       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5895     }
5896   return getMeshAtPos((int)std::distance(ms.begin(),it));
5897 }
5898
5899 std::vector<std::string> MEDFileMeshes::getMeshesNames() const
5900 {
5901   std::vector<std::string> ret(_meshes.size());
5902   int i=0;
5903   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5904     {
5905       const MEDFileMeshMultiTS *f=(*it);
5906       if(f)
5907         {
5908           ret[i]=f->getName();
5909         }
5910       else
5911         {
5912           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshesNames : At rank #" << i << " mesh is not defined !";
5913           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5914         }
5915     }
5916   return ret;
5917 }
5918
5919 bool MEDFileMeshes::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5920 {
5921   bool ret=false;
5922   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5923     {
5924       MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5925       if(cur)
5926         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5927     }
5928   return ret;
5929 }
5930
5931 void MEDFileMeshes::resize(int newSize)
5932 {
5933   _meshes.resize(newSize);
5934 }
5935
5936 void MEDFileMeshes::pushMesh(MEDFileMesh *mesh)
5937 {
5938   if(!mesh)
5939     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::pushMesh : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5940   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5941   elt->setOneTimeStep(mesh);
5942   _meshes.push_back(elt);
5943 }
5944
5945 void MEDFileMeshes::setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh)
5946 {
5947   if(!mesh)
5948     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::setMeshAtPos : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5949   if(i>=(int)_meshes.size())
5950     _meshes.resize(i+1);
5951   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5952   elt->setOneTimeStep(mesh);
5953   _meshes[i]=elt;
5954 }
5955
5956 void MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos(int i)
5957 {
5958   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5959     {
5960       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos : Invalid given id in input (" << i << ") should be in [0," << _meshes.size() << ") !";
5961       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5962     }
5963   _meshes.erase(_meshes.begin()+i);
5964 }
5965
5966 void MEDFileMeshes::loadFromFile(const std::string& fileName)
5967 {
5968   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5969   int i=0;
5970   _meshes.resize(ms.size());
5971   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
5972     _meshes[i]=MEDFileMeshMultiTS::New(fileName,(*it));
5973 }
5974
5975 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes()
5976 {
5977 }
5978
5979 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes(const std::string& fileName)
5980 try
5981 {
5982     loadFromFile(fileName);
5983 }
5984 catch(INTERP_KERNEL::Exception& /*e*/)
5985 {
5986 }
5987
5988 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::deepCpy() const
5989 {
5990   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > meshes(_meshes.size());
5991   std::size_t i=0;
5992   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5993     if((const MEDFileMeshMultiTS *)*it)
5994       meshes[i]=(*it)->deepCpy();
5995   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> ret=MEDFileMeshes::New();
5996   ret->_meshes=meshes;
5997   return ret.retn();
5998 }
5999
6000 std::size_t MEDFileMeshes::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
6001 {
6002   return _meshes.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS>));
6003 }
6004
6005 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshes::getDirectChildrenWithNull() const
6006 {
6007   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
6008   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
6009     ret.push_back((const MEDFileMeshMultiTS *)*it);
6010   return ret;
6011 }
6012
6013 std::string MEDFileMeshes::simpleRepr() const
6014 {
6015   std::ostringstream oss;
6016   oss << "(*****************)\n(* MEDFileMeshes *)\n(*****************)\n\n";
6017   simpleReprWithoutHeader(oss);
6018   return oss.str();
6019 }
6020
6021 void MEDFileMeshes::simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const
6022 {
6023   int nbOfMeshes=getNumberOfMeshes();
6024   oss << "There are " << nbOfMeshes << " meshes with the following names : \n";
6025   std::vector<std::string> mns=getMeshesNames();
6026   for(int i=0;i<nbOfMeshes;i++)
6027     oss << "  - #" << i << " \"" << mns[i] << "\"\n";
6028 }
6029
6030 void MEDFileMeshes::checkCoherency() const
6031 {
6032   static const char MSG[]="MEDFileMeshes::checkCoherency : mesh at rank ";
6033   int i=0;
6034   std::set<std::string> s;
6035   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
6036     {
6037       const MEDFileMeshMultiTS *elt=(*it);
6038       if(!elt)
6039         {
6040           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << "/" << _meshes.size() << " is empty !";
6041           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
6042         }
6043       std::size_t sz=s.size();
6044       s.insert(std::string((*it)->getName()));
6045       if(s.size()==sz)
6046         {
6047           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << " has a name (\"" << (*it)->getName() << "\") already used by an another mesh in list !";
6048           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
6049         }
6050     }
6051 }
6052
6053 MEDFileMeshesIterator::MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms):_ms(ms),_iter_id(0),_nb_iter(0)
6054 {
6055   if(ms)
6056     {
6057       ms->incrRef();
6058       _nb_iter=ms->getNumberOfMeshes();
6059     }
6060 }
6061
6062 MEDFileMeshesIterator::~MEDFileMeshesIterator()
6063 {
6064 }
6065
6066 MEDFileMesh *MEDFileMeshesIterator::nextt()
6067 {
6068   if(_iter_id<_nb_iter)
6069     {
6070       MEDFileMeshes *ms(_ms);
6071       if(ms)
6072         return ms->getMeshAtPos(_iter_id++);
6073       else
6074         return 0;
6075     }
6076   else
6077     return 0;
6078 }