Salome HOME
Merge remote branch 'origin/abn/checkDeepEquival' into V7_5_BR
[modules/med.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDFileMesh.hxx"
22 #include "MEDFileUtilities.hxx"
23 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
24 #include "MEDFileField.hxx"
25 #include "MEDLoader.hxx"
26 #include "MEDLoaderBase.hxx"
27
28 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
29
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31
32 #include <limits>
33 #include <cmath>
34
35 extern med_geometry_type typmai3[34];
36
37 using namespace ParaMEDMEM;
38
39 const char MEDFileMesh::DFT_FAM_NAME[]="FAMILLE_ZERO";
40
41 MEDFileMesh::MEDFileMesh():_order(-1),_iteration(-1),_time(0.),_univ_wr_status(true)
42 {
43 }
44
45 std::size_t MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
46 {
47   std::size_t ret(_dt_unit.capacity()+_name.capacity()+_univ_name.capacity()+_desc_name.capacity());
48   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
49     {
50       ret+=(*it).first.capacity()+(*it).second.capacity()*sizeof(std::string);
51       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
52         ret+=(*it2).capacity();
53     }
54   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
55     ret+=(*it).first.capacity()+sizeof(int);
56   return ret;
57 }
58
59 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull() const
60 {
61   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
62 }
63
64 /*!
65  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
66  * file. The first mesh in the file is loaded.
67  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
68  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
69  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
70  *  \throw If the file is not readable.
71  *  \throw If there is no meshes in the file.
72  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
73  */
74 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
75 {
76   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
77   if(ms.empty())
78     {
79       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
80       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
81     }
82   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
83   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
84   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
85   int dt,it;
86   std::string dummy2;
87   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
88   switch(meshType)
89   {
90     case UNSTRUCTURED:
91       {
92         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
93         ret->loadUMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
94         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
95       }
96     case CARTESIAN:
97       {
98         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
99         ret->loadCMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
100         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
101       }
102     case CURVE_LINEAR:
103       {
104         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
105         ret->loadCLMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
106         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
107       }
108     default:
109       {
110         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << ms.front() << "' exists but unsupported type yet !";
111         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
112       }
113   }
114 }
115
116 /*!
117  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
118  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
119  * iteration.
120  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
121  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
122  *  \param [in] dt - the number of a time step.
123  *  \param [in] it - the number of an iteration.
124  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
125  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
126  *  \throw If the file is not readable.
127  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
128  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
129  */
130 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
131 {
132   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
133   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
134   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
135   int dummy0,dummy1;
136   std::string dummy2;
137   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
138   switch(meshType)
139   {
140     case UNSTRUCTURED:
141       {
142         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
143         ret->loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
144         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
145       }
146     case CARTESIAN:
147       {
148         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
149         ret->loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
150         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
151       }
152     case CURVE_LINEAR:
153       {
154         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
155         ret->loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
156         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
157       }
158     default:
159       {
160         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << mName << "' exists but unsupported type yet !";
161         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
162       }
163   }
164 }
165
166 /*!
167  * Writes \a this mesh into an open MED file specified by its descriptor.
168  *  \param [in] fid - the MED file descriptor.
169  *  \throw If the mesh name is not set.
170  *  \throw If the file is open for reading only.
171  *  \throw If the writing mode == 1 and the same data is present in an existing file.
172  */
173 void MEDFileMesh::write(med_idt fid) const
174 {
175   if(!existsFamily(0))
176     const_cast<MEDFileMesh *>(this)->addFamily(DFT_FAM_NAME,0);
177   if(_name.empty())
178     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh : name is empty. MED file ask for a NON EMPTY name !");
179   writeLL(fid);
180 }
181
182 /*!
183  * Writes \a this mesh into a MED file specified by its name.
184  *  \param [in] fileName - the MED file name.
185  *  \param [in] mode - the writing mode. For more on \a mode, see \ref AdvMEDLoaderBasics.
186  * - 2 - erase; an existing file is removed.
187  * - 1 - append; same data should not be present in an existing file.
188  * - 0 - overwrite; same data present in an existing file is overwritten.
189  *  \throw If the mesh name is not set.
190  *  \throw If \a mode == 1 and the same data is present in an existing file.
191  */
192 void MEDFileMesh::write(const std::string& fileName, int mode) const
193 {
194   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
195   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
196   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
197   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
198   write(fid);
199 }
200
201 /*!
202  * Checks if \a this and another mesh are equal.
203  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
204  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
205  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
206  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
207  */
208 bool MEDFileMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
209 {
210   if(_order!=other->_order)
211     {
212       what="Orders differ !";
213       return false;
214     }
215   if(_iteration!=other->_iteration)
216     {
217       what="Iterations differ !";
218       return false;
219     }
220   if(fabs(_time-other->_time)>eps)
221     {
222       what="Time values differ !";
223       return false;
224     }
225   if(_dt_unit!=other->_dt_unit)
226     {
227       what="Time units differ !";
228       return false;
229     }
230   if(_name!=other->_name)
231     {
232       what="Names differ !";
233       return false;
234     }
235   //univ_name has been ignored -> not a bug because it is a mutable attribute
236   if(_desc_name!=other->_desc_name)
237     {
238       what="Description names differ !";
239       return false;
240     }
241   if(!areGrpsEqual(other,what))
242     return false;
243   if(!areFamsEqual(other,what))
244     return false;
245   return true;
246 }
247
248 void MEDFileMesh::setName(const std::string& name)
249 {
250   _name=name;
251 }
252
253 /*!
254  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
255  */
256 void MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes() const
257 {
258
259 }
260
261 bool MEDFileMesh::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
262 {
263   for(std::vector< std::pair<std::string,std::string> >::const_iterator it=modifTab.begin();it!=modifTab.end();it++)
264     {
265       if((*it).first==_name)
266         {
267           _name=(*it).second;
268           return true;
269         }
270     }
271   return false;
272 }
273
274 /*!
275  * Copies data on groups and families from another mesh.
276  *  \param [in] other - the mesh to copy the data from.
277  */
278 void MEDFileMesh::copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other)
279 {
280   _groups=other._groups;
281   _families=other._families;
282 }
283
284
285 /*!
286  * This method clear all the groups in the map.
287  * So this method does not operate at all on arrays.
288  * So this method can lead to orphan families.
289  * 
290  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
291  */
292 void MEDFileMesh::clearGrpMap()
293 {
294   _groups.clear();
295 }
296
297 /*!
298  * This method clear all the families in the map.
299  * So this method does not operate at all on arrays.
300  * WARNING ! if there are some groups lying on cleared families, those groups will be impacted !
301  *
302  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
303  */
304 void MEDFileMesh::clearFamMap()
305 {
306   _families.clear();
307 }
308
309 /*!
310  * This method clear all the families and groups in the map.
311  * So this method does not operate at all on arrays.
312  * As all groups and families entry will be removed after 
313  * the call of MEDFileMesh::setFamilyFieldArr method with 0 or None (python) in the 2nd parameter can be useful to reduce the size of the object.
314  *
315  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamMap
316  */
317 void MEDFileMesh::clearFamGrpMaps()
318 {
319   clearGrpMap();
320   clearFamMap();
321 }
322
323 /*!
324  * Returns names of families constituting a group.
325  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
326  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
327  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
328  */
329 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroup(const std::string& name) const
330 {
331   std::string oname(name);
332   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
333   if(it==_groups.end())
334     {
335       std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
336       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
337       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
338       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
339     }
340   return (*it).second;
341 }
342
343 /*!
344  * Returns names of families constituting some groups.
345  *  \param [in] grps - a sequence of names of groups of interest.
346  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
347  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
348  */
349 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const
350 {
351   std::set<std::string> fams;
352   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++)
353     {
354       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=_groups.find(*it);
355       if(it2==_groups.end())
356         {
357           std::ostringstream oss; oss << "No such group in mesh \"" << _name << "\" : " << *it; 
358           std::vector<std::string> grps2=getGroupsNames(); oss << "\" !\nAvailable groups are :";
359           std::copy(grps2.begin(),grps2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
360           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
361         }
362       fams.insert((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
363     }
364   std::vector<std::string> fams2(fams.begin(),fams.end());
365   return fams2;
366 }
367
368 /*!
369  * Returns ids of families constituting a group.
370  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
371  *  \return std::vector<int> - sequence of ids of the families.
372  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
373  */
374 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name) const
375 {
376   std::string oname(name);
377   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
378   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
379   if(it==_groups.end())
380     {
381       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
382       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
383       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
384     }
385   return getFamiliesIds((*it).second);
386 }
387
388 /*!
389  * Sets names of families constituting a group. If data on families of this group is
390  * already present, it is overwritten. Every family in \a fams is checked, and if a
391  family is not yet in \a this mesh, the default group id \c 0 is assigned to it.
392  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
393  *  \param [in] fams - a sequence of names of families constituting the group.
394  */
395 void MEDFileMesh::setFamiliesOnGroup(const std::string& name, const std::vector<std::string>& fams)
396 {
397   std::string oname(name);
398   _groups[oname]=fams;
399   for(std::vector<std::string>::const_iterator it1=fams.begin();it1!=fams.end();it1++)
400     {
401       std::map<std::string,int>::iterator it2=_families.find(*it1);
402       if(it2==_families.end())
403         _families[*it1]=0;
404     }
405 }
406
407 /*!
408  * Sets families constituting a group. The families are specified by their ids.
409  * If a family name is not found by its id, an exception is thrown.
410  * If several families have same id, the first one in lexical order is taken.
411  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
412  *  \param [in] famIds - a sequence of ids of families constituting the group.
413  *  \throw If a family name is not found by its id.
414  */
415 void MEDFileMesh::setFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name, const std::vector<int>& famIds)
416 {
417   std::string oname(name);
418   std::vector<std::string> fams(famIds.size());
419   int i=0;
420   for(std::vector<int>::const_iterator it1=famIds.begin();it1!=famIds.end();it1++,i++)
421     {
422       std::string name2=getFamilyNameGivenId(*it1);
423       fams[i]=name2;
424     }
425   _groups[oname]=fams;
426 }
427
428 /*!
429  * Returns names of groups including a given family.
430  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
431  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of groups including the family.
432  */
433 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsOnFamily(const std::string& name) const
434 {
435   std::vector<std::string> ret;
436   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();it1!=_groups.end();it1++)
437     {
438       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it1).second.begin();it2!=(*it1).second.end();it2++)
439         if((*it2)==name)
440           {
441             ret.push_back((*it1).first);
442             break;
443           }
444     }
445   return ret;
446 }
447
448 /*!
449  * Adds an existing family to groups.
450  *  \param [in] famName - a name of family to add to \a grps.
451  *  \param [in] grps - a sequence of group names to add the family in.
452  *  \throw If a family named \a famName not yet exists.
453  */
454 void MEDFileMesh::setGroupsOnFamily(const std::string& famName, const std::vector<std::string>& grps)
455 {
456   std::string fName(famName);
457   const std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fName);
458   if(it==_families.end())
459     {
460       std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
461       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << fName << "\" !\nAvailable families are :";
462       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
463       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
464     }
465   for(std::vector<std::string>::const_iterator it3=grps.begin();it3!=grps.end();it3++)
466     {
467       std::map< std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(*it3);
468       if(it2!=_groups.end())
469         (*it2).second.push_back(fName);
470       else
471         {
472           std::vector<std::string> grps2(1,fName);
473           _groups[*it3]=grps2;
474         }
475     }
476 }
477
478 /*!
479  * Returns names of all groups of \a this mesh.
480  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names.
481  */
482 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsNames() const
483 {
484   std::vector<std::string> ret(_groups.size());
485   int i=0;
486   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++,i++)
487     ret[i]=(*it).first;
488   return ret;
489 }
490
491 /*!
492  * Returns names of all families of \a this mesh.
493  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of family names.
494  */
495 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesNames() const
496 {
497   std::vector<std::string> ret(_families.size());
498   int i=0;
499   for(std::map<std::string, int >::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++,i++)
500     ret[i]=(*it).first;
501   return ret;
502 }
503
504 /*!
505  * Changes a name of every family, included in one group only, to be same as the group name.
506  *  \throw If there are families with equal names in \a this mesh.
507  */
508 void MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName()
509 {
510   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
511   std::map<std::string,int> newFams;
512   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
513     {
514       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
515       if(grps.size()==1 && groups[grps[0]].size()==1)
516         {
517           if(newFams.find(grps[0])!=newFams.end())
518             {
519               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << grps[0] << "\" already exists !";
520               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
521             }
522           newFams[grps[0]]=(*it).second;
523           std::vector<std::string>& grps2=groups[grps[0]];
524           std::size_t pos=std::distance(grps2.begin(),std::find(grps2.begin(),grps2.end(),(*it).first));
525           grps2[pos]=grps[0];
526         }
527       else
528         {
529           if(newFams.find((*it).first)!=newFams.end())
530             {
531               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << (*it).first << "\" already exists !";
532               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
533             }
534           newFams[(*it).first]=(*it).second;
535         }
536     }
537   _families=newFams;
538   _groups=groups;
539 }
540
541 /*!
542  * Removes all groups lying on no family. If there is no empty groups, \a this is let untouched.
543  * 
544  * \return the removed groups.
545  */
546 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeEmptyGroups()
547 {
548   std::vector<std::string> ret;
549   std::map<std::string, std::vector<std::string> > newGrps;
550   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
551     {
552       if((*it).second.empty())
553         ret.push_back((*it).first);
554       else
555         newGrps[(*it).first]=(*it).second;
556     }
557   if(!ret.empty())
558     _groups=newGrps;
559   return ret;
560 }
561
562 /*!
563  * Removes a group from \a this mesh.
564  *  \param [in] name - the name of the group to remove.
565  *  \throw If no group with such a \a name exists.
566  */
567 void MEDFileMesh::removeGroup(const std::string& name)
568 {
569   std::string oname(name);
570   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
571   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
572   if(it==_groups.end())
573     {
574       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
575       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
576       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
577     }
578   _groups.erase(it);
579 }
580
581 /*!
582  * Removes a family from \a this mesh.
583  *  \param [in] name - the name of the family to remove.
584  *  \throw If no family with such a \a name exists.
585  */
586 void MEDFileMesh::removeFamily(const std::string& name)
587 {
588   std::string oname(name);
589   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
590   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
591   if(it==_families.end())
592     {
593       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
594       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
595       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
596     }
597   _families.erase(it);
598   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
599     {
600       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
601       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
602       if(it4!=v.end())
603         v.erase(it4);
604     }
605 }
606
607 /*!
608  * Removes all groups in \a this that are orphan. A group is orphan if this group lies on
609  * a set of families, themselves orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
610  * family field whatever its level. This method also suppresses the orphan families.
611  * 
612  * \return - The list of removed groups names. 
613  *
614  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanFamilies.
615  */
616 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanGroups()
617 {
618   removeOrphanFamilies();
619   return removeEmptyGroups();
620 }
621
622 /*!
623  * Removes all families in \a this that are orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
624  * family field whatever its level. Groups are updated in consequence, that is to say all groups lying on orphan family, will see their families list modified.
625  * 
626  * \return - The list of removed families names.
627  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanGroups.
628  */
629 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanFamilies()
630 {
631   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allFamIdsInUse=computeAllFamilyIdsInUse();
632   std::vector<std::string> ret;
633   if(!((DataArrayInt*)allFamIdsInUse))
634     {
635       ret=getFamiliesNames();
636       _families.clear(); _groups.clear();
637       return ret;
638     }
639   std::map<std::string,int> famMap;
640   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grps(_groups);
641   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
642     {
643       if(allFamIdsInUse->presenceOfValue((*it).second))
644         famMap[(*it).first]=(*it).second;
645       else
646         {
647           ret.push_back((*it).first);
648           std::vector<std::string> grpsOnEraseFam=getGroupsOnFamily((*it).first);
649           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOnEraseFam.begin();it2!=grpsOnEraseFam.end();it2++)
650             {
651               std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=grps.find(*it2);//it3!=grps.empty() thanks to copy
652               std::vector<std::string>& famv=(*it3).second;
653               std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(famv.begin(),famv.end(),(*it).first);//it4!=famv.end() thanks to copy
654               famv.erase(it4);
655             }
656         }
657     }
658   if(!ret.empty())
659     { _families=famMap; _groups=grps; }
660   return ret;
661 }
662
663 /*!
664  * Renames a group in \a this mesh.
665  *  \param [in] oldName - a current name of the group to rename.
666  *  \param [in] newName - a new group name.
667  *  \throw If no group named \a oldName exists in \a this mesh.
668  *  \throw If a group named \a newName already exists.
669  */
670 void MEDFileMesh::changeGroupName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
671 {
672   std::string oname(oldName);
673   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
674   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
675   if(it==_groups.end())
676     {
677       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << oldName << "\" !\nAvailable groups are :";
678       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
679       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
680     }
681   std::string nname(newName);
682   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(nname);
683   if(it2!=_groups.end())
684     {
685       std::ostringstream oss; oss << "Such groupname \"" << newName << "\" already exists ! Kill it before !";
686       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
687     }
688   std::vector<std::string> cpy=(*it).second;
689   _groups.erase(it);
690   _groups[newName]=cpy;
691 }
692
693 /*!
694  * Changes an id of a family in \a this mesh. 
695  * This method calls changeFamilyIdArr().
696  *  \param [in] oldId - a current id of the family.
697  *  \param [in] newId - a new family id.
698  */
699 void MEDFileMesh::changeFamilyId(int oldId, int newId)
700 {
701   changeFamilyIdArr(oldId,newId);
702   std::map<std::string,int> fam2;
703   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
704     {
705       if((*it).second==oldId)
706         fam2[(*it).first]=newId;
707       else
708         fam2[(*it).first]=(*it).second;
709     }
710   _families=fam2;
711 }
712
713 /*!
714  * Renames a family in \a this mesh.
715  *  \param [in] oldName - a current name of the family to rename.
716  *  \param [in] newName - a new family name.
717  *  \throw If no family named \a oldName exists in \a this mesh.
718  *  \throw If a family named \a newName already exists.
719  */
720 void MEDFileMesh::changeFamilyName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
721 {
722   std::string oname(oldName);
723   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
724   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
725   if(it==_families.end())
726     {
727       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << oldName << "\" !\nAvailable families are :";
728       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
729       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
730     }
731   std::string nname(newName);
732   std::map<std::string, int >::iterator it2=_families.find(nname);
733   if(it2!=_families.end())
734     {
735       std::ostringstream oss; oss << "Such familyname \"" << newName << " already exists ! Kill it before !";
736       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
737     }
738   int cpy=(*it).second;
739   _families.erase(it);
740   _families[newName]=cpy;
741   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
742     {
743       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
744       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
745       if(it4!=v.end())
746         (*it4)=nname;
747     }
748 }
749
750 /*!
751  * Checks if \a this and another mesh contains the same families.
752  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
753  *  \param [in,out] what - an unused parameter.
754  *  \return bool - \c true if number of families and their ids are the same in the two
755  *          meshes. Families with the id == \c 0 are not considered.
756  */
757 bool MEDFileMesh::areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
758 {
759   if(_families==other->_families)
760     return true;
761   std::map<std::string,int> fam0;
762   std::map<std::string,int> fam1;
763   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
764     if((*it).second!=0)
765       fam0[(*it).first]=(*it).second;
766   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=other->_families.begin();it!=other->_families.end();it++)
767     if((*it).second!=0)
768       fam1[(*it).first]=(*it).second;
769   return fam0==fam1;
770 }
771
772 /*!
773  * Checks if \a this and another mesh contains the same groups.
774  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
775  *  \param [in,out] what - a string describing a difference of groups of the two meshes
776  *          in case if this method returns \c false.
777  *  \return bool - \c true if number of groups and families constituting them are the
778  *          same in the two meshes.
779  */
780 bool MEDFileMesh::areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
781 {
782   if(_groups==other->_groups)
783     return true;
784   bool ret=true;
785   std::size_t sz=_groups.size();
786   if(sz!=other->_groups.size())
787     {
788       what="Groups differ because not same number !\n";
789       ret=false;
790     }
791   if(ret)
792     {
793       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();
794       for(std::size_t i=0;i<sz && ret;i++,it1++)
795         {
796           std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=other->_groups.find((*it1).first);
797           if(it2!=other->_groups.end())
798             {
799               std::set<std::string> s1((*it1).second.begin(),(*it1).second.end());
800               std::set<std::string> s2((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
801               ret=(s1==s2);
802             }
803           else
804             {
805               ret=false;
806               what="A group in first mesh exists not in other !\n";
807             }
808         }
809     }
810   if(!ret)
811     {
812       std::ostringstream oss; oss << "Groups description differs :\n";
813       oss << "First group description :\n";
814       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
815         {
816           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
817           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
818             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
819         }
820       oss << "Second group description :\n";
821       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=other->_groups.begin();it!=other->_groups.end();it++)
822         {
823           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
824           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
825             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
826         }
827       what+=oss.str();
828     }
829   return ret;
830 }
831
832 /*!
833  * Checks if a group with a given name exists in \a this mesh.
834  *  \param [in] groupName - the group name.
835  *  \return bool - \c true the group \a groupName exists in \a this mesh.
836  */
837 bool MEDFileMesh::existsGroup(const std::string& groupName) const
838 {
839   std::string grpName(groupName);
840   return _groups.find(grpName)!=_groups.end();
841 }
842
843 /*!
844  * Checks if a family with a given id exists in \a this mesh.
845  *  \param [in] famId - the family id.
846  *  \return bool - \c true the family with the id \a famId exists in \a this mesh.
847  */
848 bool MEDFileMesh::existsFamily(int famId) const
849 {
850   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
851     if((*it2).second==famId)
852       return true;
853   return false;
854 }
855
856 /*!
857  * Checks if a family with a given name exists in \a this mesh.
858  *  \param [in] familyName - the family name.
859  *  \return bool - \c true the family \a familyName exists in \a this mesh.
860  */
861 bool MEDFileMesh::existsFamily(const std::string& familyName) const
862 {
863   std::string fname(familyName);
864   return _families.find(fname)!=_families.end();
865 }
866
867 /*!
868  * Sets an id of a family.
869  *  \param [in] familyName - the family name.
870  *  \param [in] id - a new id of the family.
871  */
872 void MEDFileMesh::setFamilyId(const std::string& familyName, int id)
873 {
874   std::string fname(familyName);
875   _families[fname]=id;
876 }
877
878 void MEDFileMesh::setFamilyIdUnique(const std::string& familyName, int id)
879 {
880   std::string fname(familyName);
881   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
882     if((*it).second==id)
883       {
884         if((*it).first!=familyName)
885           {
886             std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::setFamilyIdUnique : Family id #" << id << " is already belonging to family with name \"" << (*it).first << "\" !";
887             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
888           }
889       }
890   _families[fname]=id;
891 }
892
893 /*!
894  * Adds a family to \a this mesh.
895  *  \param [in] familyName - a name of the family.
896  *  \param [in] famId - an id of the family.
897  *  \throw If a family with the same name or id already exists in \a this mesh.
898  */
899 void MEDFileMesh::addFamily(const std::string& familyName, int famId)
900 {
901   std::string fname(familyName);
902   std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fname);
903   if(it==_families.end())
904     {
905       for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
906         if((*it2).second==famId)
907           {
908             std::ostringstream oss;
909             oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << (*it2).first << "\" already exists with specified id : " << famId << " !";
910             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
911           }
912       _families[fname]=famId;
913     }
914   else
915     {
916       if((*it).second!=famId)
917         {
918           std::ostringstream oss;
919           oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << fname << "\" already exists but has id set to " << (*it).second << " different from asked famId " << famId << " !";
920           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
921         }
922     }
923 }
924
925 /*!
926  * Creates a group including all mesh entities of given dimension.
927  * \warning This method does \b not guarantee that the created group includes mesh
928  * entities of only \a meshDimRelToMaxExt dimension in the case if some family id is
929  * present in family fields of different dimensions. To assure this, call
930  * ensureDifferentFamIdsPerLevel() \b before calling this method.
931  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of mesh entities to include to
932  *          the group.
933  *  \param [in] groupName - a name of the new group.
934  *  \throw If a group named \a groupName already exists.
935  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt exist in \a this mesh.
936  *  \throw If no family field of dimension \a meshDimRelToMaxExt is present in \a this mesh.
937  */
938 void MEDFileMesh::createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& groupName)
939 {
940   std::string grpName(groupName);
941   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
942   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
943     {
944       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The relative ext dimension " << meshDimRelToMaxExt << " is not available !" << std::endl;
945       oss << "Available relative ext levels are : ";
946       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
947       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
948     }
949   if(existsGroup(groupName))
950     {
951       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The groups \"" << grpName << "\" already exists in this !" << std::endl;
952       oss << "Already existing groups are : ";
953       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
954       oss << std::endl << "Please choose an another group name or call removeGroup(\"" << grpName << "\") method !";
955       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
956     }
957   const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
958   if(fieldFamIds==0)
959     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::createGroupOnAll : Family field arr ids is not defined for this level !");
960   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=fieldFamIds->getDifferentValues();
961   std::vector<std::string> familiesOnWholeGroup;
962   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
963     {
964       bool tmp;
965       familiesOnWholeGroup.push_back(findOrCreateAndGiveFamilyWithId(*it,tmp));
966     }
967   _groups[grpName]=familiesOnWholeGroup;
968 }
969
970 /*!
971  * Ensures that given family ids do not present in family fields of dimensions different
972  * than given ones. If a family id is present in the family fields of dimensions different
973  * than the given ones, a new family is created and the whole data is updated accordingly.
974  *  \param [in] famIds - a sequence of family ids to check.
975  *  \param [in] vMeshDimRelToMaxExt - a sequence of relative dimensions to which the \a
976  *          famIds should exclusively belong.
977  *  \return bool - \c true if no modification is done in \a this mesh by this method.
978  */
979 bool MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& vMeshDimRelToMaxExt)
980 {
981   std::set<int> levsInput(vMeshDimRelToMaxExt.begin(),vMeshDimRelToMaxExt.end());
982   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
983   std::set<int> levs2(levs.begin(),levs.end());
984   std::vector<int> levsToTest;
985   std::set_difference(levs2.begin(),levs2.end(),levsInput.begin(),levsInput.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(levsToTest));
986   std::set<int> famIds2(famIds.begin(),famIds.end());
987   bool ret=true;
988   int maxFamId=1;
989   if(!_families.empty())
990     maxFamId=getMaxFamilyId()+1;
991   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
992   for(std::vector<int>::const_iterator it=levsToTest.begin();it!=levsToTest.end();it++)
993     {
994       const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(*it);
995       if(fieldFamIds)
996         {
997           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds3=fieldFamIds->getDifferentValues();
998           std::vector<int> tmp;
999           std::set_intersection(famIds3->begin(),famIds3->end(),famIds2.begin(),famIds2.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(tmp));
1000           for(std::vector<int>::const_iterator it2=tmp.begin();it2!=tmp.end();it2++)
1001             {
1002               ret=false;
1003               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it2);
1004               std::ostringstream oss; oss << "Family_" << maxFamId;
1005               std::string zeName=CreateNameNotIn(oss.str(),allFams);
1006               addFamilyOnAllGroupsHaving(famName,zeName);
1007               _families[zeName]=maxFamId;
1008               (const_cast<DataArrayInt *>(fieldFamIds))->changeValue(*it2,maxFamId);
1009               maxFamId++;
1010             }
1011         }
1012     }
1013   return ret;
1014 }
1015
1016 /*!
1017  * Adds a family to a given group in \a this mesh. If the group with a given name does
1018  * not exist, it is created.
1019  *  \param [in] grpName - the name of the group to add the family in.
1020  *  \param [in] famName - the name of the family to add to the group named \a grpName.
1021  *  \throw If \a grpName or \a famName is an empty string.
1022  *  \throw If no family named \a famName is present in \a this mesh.
1023  */
1024 void MEDFileMesh::addFamilyOnGrp(const std::string& grpName, const std::string& famName)
1025 {
1026   std::string grpn(grpName);
1027   std::string famn(famName);
1028   if(grpn.empty() || famn.empty())
1029     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : input strings must be non null !");
1030   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1031   if(std::find(fams.begin(),fams.end(),famn)==fams.end())
1032     {
1033       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : Family \"" << famn << "\" does not exist !" << std::endl;
1034       oss << "Create this family or choose an existing one ! Existing fams are : ";
1035       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," ")); oss << ".";
1036       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1037     }
1038   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(grpn);
1039   if(it==_groups.end())
1040     {
1041       _groups[grpn].push_back(famn);
1042     }
1043   else
1044     {
1045       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find((*it).second.begin(),(*it).second.end(),famn);
1046       if(it2==(*it).second.end())
1047         (*it).second.push_back(famn);
1048     }
1049 }
1050
1051 /*!
1052  * This method adds to all groups lying on family with name 'famName' the other family name 'otherFamName'.
1053  * This method is quite underground because it can lead to unconsistency because family 'otherFamName' is \b not added into _families.
1054  * This method is used by MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs method.
1055  */
1056 void MEDFileMesh::addFamilyOnAllGroupsHaving(const std::string& famName, const std::string& otherFamName)
1057 {
1058   std::string famNameCpp(famName);
1059   std::string otherCpp(otherFamName);
1060   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
1061     {
1062       std::vector<std::string>& v=(*it).second;
1063       if(std::find(v.begin(),v.end(),famNameCpp)!=v.end())
1064         {
1065           v.push_back(otherCpp);
1066         }
1067     }
1068 }
1069
1070 void MEDFileMesh::changeAllGroupsContainingFamily(const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1071 {
1072   ChangeAllGroupsContainingFamily(_groups,familyNameToChange,newFamiliesNames);
1073 }
1074
1075 void MEDFileMesh::ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1076 {
1077   std::string fam(familyNameToChange);
1078   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=groups.begin();it!=groups.end();it++)
1079     {
1080       std::vector<std::string>& fams((*it).second);
1081       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find(fams.begin(),fams.end(),fam);
1082       if(it2!=fams.end())
1083         {
1084           fams.erase(it2);
1085           fams.insert(fams.end(),newFamiliesNames.begin(),newFamiliesNames.end());
1086         }
1087     }
1088 }
1089
1090 /*!
1091  * Returns a name of the family having a given id or, if no such a family exists, creates
1092  * a new uniquely named family and returns its name.
1093  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1094  *  \param [out] created - returns \c true if the new family has been created, \c false, else.
1095  *  \return std::string - the name of the existing or the created family.
1096  *  \throw If it is not possible to create a unique family name.
1097  */
1098 std::string MEDFileMesh::findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created)
1099 {
1100   return FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(_families,id,created);
1101 }
1102
1103 /*!
1104  * If it exists a family whose family id is equal to 'id' this method behaves as MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId.
1105  * In this case, 'this' internal states remains unchanged and 'created' out parameter will be set to false.
1106  * If there is no family whose family id is equal to 'id' a family is created with a name different from those
1107  * already existing. In this case 'created' will be returned with a value set to true, and internal state
1108  * will be modified.
1109  * This method will throws an exception if it is not possible to create a unique family name.
1110  */
1111 std::string MEDFileMesh::FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created)
1112 {
1113   std::vector<std::string> famAlreadyExisting(families.size());
1114   int ii=0;
1115   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++,ii++)
1116     {
1117       if((*it).second!=id)
1118         {
1119           famAlreadyExisting[ii]=(*it).first;
1120         }
1121       else
1122         {
1123           created=false;
1124           return (*it).first;
1125         }
1126     }
1127   created=true;
1128   std::ostringstream oss; oss << "Family_" << id;
1129   std::string ret=CreateNameNotIn(oss.str(),famAlreadyExisting);
1130   families[ret]=id;
1131   return ret;
1132 }
1133
1134 /*!
1135  * Sets names and ids of all families in \a this mesh.
1136  *  \param [in] info - a map of a family name to a family id.
1137  */
1138 void MEDFileMesh::setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info)
1139 {
1140   _families=info;
1141 }
1142
1143 /*!
1144  * Sets names of all groups and families constituting them in \a this mesh.
1145  *  \param [in] info - a map of a group name to a vector of names of families
1146  *          constituting the group.
1147  */
1148 void MEDFileMesh::setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info)
1149 {
1150   _groups=info;
1151 }
1152
1153 /*!
1154  * Returns an id of the family having a given name.
1155  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
1156  *  \return int - the id of the family of interest.
1157  *  \throw If no family with such a \a name exists.
1158  */
1159 int MEDFileMesh::getFamilyId(const std::string& name) const
1160 {
1161   std::string oname(name);
1162   std::map<std::string, int>::const_iterator it=_families.find(oname);
1163   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1164   if(it==_families.end())
1165     {
1166       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
1167       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1168       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1169     }
1170   return (*it).second;
1171 }
1172
1173 /*!
1174  * Returns ids of the families having given names.
1175  *  \param [in] fams - a sequence of the names of families of interest.
1176  *  \return std::vector<int> - a sequence of the ids of families of interest.
1177  *  \throw If \a fams contains a name of an inexistent family.
1178  */
1179 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& fams) const
1180 {
1181   std::vector<int> ret(fams.size());
1182   int i=0;
1183   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++,i++)
1184     {
1185       std::map<std::string, int>::const_iterator it2=_families.find(*it);
1186       if(it2==_families.end())
1187         {
1188           std::vector<std::string> fams2=getFamiliesNames();
1189           std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << *it << "\" in input list !\nAvailable families are :";
1190           std::copy(fams2.begin(),fams2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1191           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1192         }
1193       ret[i]=(*it2).second;
1194     }
1195   return ret;
1196 }
1197
1198 /*!
1199  * Returns a maximal abs(id) of families in \a this mesh.
1200  *  \return int - the maximal norm of family id.
1201  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1202  */
1203 int MEDFileMesh::getMaxAbsFamilyId() const
1204 {
1205   if(_families.empty())
1206     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1207   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1208   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1209     {
1210       ret=std::max(std::abs((*it).second),ret);
1211     }
1212   return ret;
1213 }
1214
1215 /*!
1216  * Returns a maximal id of families in \a this mesh.
1217  *  \return int - the maximal family id.
1218  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1219  */
1220 int MEDFileMesh::getMaxFamilyId() const
1221 {
1222   if(_families.empty())
1223     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1224   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1225   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1226     {
1227       ret=std::max((*it).second,ret);
1228     }
1229   return ret;
1230 }
1231
1232 /*!
1233  * Returns a minimal id of families in \a this mesh.
1234  *  \return int - the minimal family id.
1235  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1236  */
1237 int MEDFileMesh::getMinFamilyId() const
1238 {
1239   if(_families.empty())
1240     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMinFamilyId : no families set !");
1241   int ret=std::numeric_limits<int>::max();
1242   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1243     {
1244       ret=std::min((*it).second,ret);
1245     }
1246   return ret;
1247 }
1248
1249 /*!
1250  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1251  * considered but all family fields as well.
1252  *  \return int - the maximal family id.
1253  */
1254 int MEDFileMesh::getTheMaxAbsFamilyId() const
1255 {
1256   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1257   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1258     m1=std::max(std::abs((*it).second),m1);
1259   int m2=getMaxAbsFamilyIdInArrays();
1260   return std::max(m1,m2);
1261 }
1262
1263 /*!
1264  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1265  * considered but all family fields as well.
1266  *  \return int - the maximal family id.
1267  */
1268 int MEDFileMesh::getTheMaxFamilyId() const
1269 {
1270   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1271   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1272     m1=std::max((*it).second,m1);
1273   int m2=getMaxFamilyIdInArrays();
1274   return std::max(m1,m2);
1275 }
1276
1277 /*!
1278  * Returns a minimal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1279  * considered but all family fields as well.
1280  *  \return int - the minimal family id.
1281  */
1282 int MEDFileMesh::getTheMinFamilyId() const
1283 {
1284   int m1=std::numeric_limits<int>::max();
1285   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1286     m1=std::min((*it).second,m1);
1287   int m2=getMinFamilyIdInArrays();
1288   return std::min(m1,m2);
1289 }
1290
1291 /*!
1292  * This method only considers the maps. The contain of family array is ignored here.
1293  * 
1294  * \sa MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse
1295  */
1296 DataArrayInt *MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced() const
1297 {
1298   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1299   std::set<int> v;
1300   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1301     v.insert((*it).second);
1302   ret->alloc((int)v.size(),1);
1303   std::copy(v.begin(),v.end(),ret->getPointer());
1304   return ret.retn();
1305 }
1306
1307 /*!
1308  * This method does not consider map of family name, family id. Only family field array on different levels is considered.
1309  * 
1310  * \sa MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced
1311  */
1312 DataArrayInt *MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse() const
1313 {
1314   std::vector<int> famLevs=getFamArrNonEmptyLevelsExt();
1315   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret;
1316   for(std::vector<int>::const_iterator it=famLevs.begin();it!=famLevs.end();it++)
1317     {
1318       const DataArrayInt *arr=getFamilyFieldAtLevel(*it);//arr not null due to spec of getFamArrNonEmptyLevelsExt
1319       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> dv=arr->getDifferentValues();
1320       if((DataArrayInt *) ret)
1321         ret=dv->buildUnion(ret);
1322       else
1323         ret=dv;
1324     }
1325   return ret.retn();
1326 }
1327
1328 /*!
1329  * true is returned if no modification has been needed. false if family
1330  * renumbering has been needed.       
1331  */
1332 bool MEDFileMesh::ensureDifferentFamIdsPerLevel()
1333 {
1334   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1335   std::set<int> allFamIds;
1336   int maxId=getMaxFamilyId()+1;
1337   std::map<int,std::vector<int> > famIdsToRenum;
1338   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1339     {
1340       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it);
1341       if(fam)
1342         {
1343           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1344           std::set<int> r2;
1345           std::set_intersection(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r2,r2.end()));
1346           if(!r2.empty())
1347             famIdsToRenum[*it].insert(famIdsToRenum[*it].end(),r2.begin(),r2.end());
1348           std::set<int> r3;
1349           std::set_union(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r3,r3.end()));
1350         }
1351     }
1352   if(famIdsToRenum.empty())
1353     return true;
1354   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1355   for(std::map<int,std::vector<int> >::const_iterator it2=famIdsToRenum.begin();it2!=famIdsToRenum.end();it2++)
1356     {
1357       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt *>(getFamilyFieldAtLevel((*it2).first));
1358       int *famIdsToChange=fam->getPointer();
1359       std::map<int,int> ren;
1360       for(std::vector<int>::const_iterator it3=(*it2).second.begin();it3!=(*it2).second.end();it3++,maxId++)
1361         {
1362           if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1363             {
1364               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1365               std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily(famName);
1366               ren[*it3]=maxId;
1367               bool dummy;
1368               std::string newFam=findOrCreateAndGiveFamilyWithId(maxId,dummy);
1369               for(std::vector<std::string>::const_iterator it4=grps.begin();it4!=grps.end();it4++)
1370                 addFamilyOnGrp((*it4),newFam);
1371             }
1372         }
1373       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getIdsEqualList(&(*it2).second[0],&(*it2).second[0]+(*it2).second.size());
1374       for(const int *id=ids->begin();id!=ids->end();id++)
1375         famIdsToChange[*id]=ren[famIdsToChange[*id]];
1376     }
1377   return false;
1378 }
1379
1380 /*!
1381  * This method normalizes fam id with the policy explained underneath. This policy is close to those implemented in SMESH.
1382  * Level #0 famids > 0, Level #-1 famids < 0, Level #-2 famids=0, Level #1 famids=0
1383  * This policy is those used by SMESH and Trio and that is the opposite of those in MED file.
1384  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1385  * \warning This policy is the opposite of those in MED file documentation ...
1386  */
1387 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsTrio()
1388 {
1389   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1390   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1391   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1392   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1393   std::set<std::string> famsFetched;
1394   std::map<std::string,int> families;
1395   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)!=levs.end())
1396     {
1397       levsS.erase(0);
1398       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(0);
1399       if(fam)
1400         {
1401           int refId=1;
1402           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1403           std::map<int,int> ren;
1404           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1405             ren[*it]=refId;
1406           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1407           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1408           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1409             *w=ren[*w];
1410           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1411             {
1412               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1413                 {
1414                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1415                   families[famName]=ren[*it];
1416                   famsFetched.insert(famName);
1417                 }
1418             }
1419         }
1420     }
1421   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)!=levs.end())
1422     {
1423       levsS.erase(-1);
1424       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
1425       if(fam)
1426         {
1427           int refId=-1;
1428           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1429           std::map<int,int> ren;
1430           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1431             ren[*it]=refId;
1432           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1433           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1434           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1435             *w=ren[*w];
1436           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1437             {
1438               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1439                 {
1440                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1441                   families[famName]=ren[*it];
1442                   famsFetched.insert(famName);
1443                 }
1444             }
1445         }
1446     }
1447   for(std::set<int>::const_iterator it2=levsS.begin();it2!=levsS.end();it2++)
1448     {
1449       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt*>(getFamilyFieldAtLevel(*it2));
1450       if(fam)
1451         {
1452           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1453           fam->fillWithZero();
1454           for(const int *it3=tmp->begin();it3!=tmp->end();it3++)
1455             if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1456               {
1457                 std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1458                 families[famName]=0;
1459                 famsFetched.insert(famName);
1460               }
1461         }
1462     }
1463   //
1464   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1465   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1466   std::set<std::string> unFetchedIds;
1467   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1468   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1469     families[*it4]=_families[*it4];
1470   _families=families;
1471 }
1472
1473 /*!
1474  * This method normalizes fam id with the following policy.
1475  * Level #0 famids < 0, Level #-1 famids < 0 and for Level #1 famids >= 0
1476  * This policy is those defined in the MED file format but is the opposite of those implemented in SMESH and Trio.
1477  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1478  */
1479 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsMEDFile()
1480 {
1481   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1482   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1483   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1484   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1485   std::set<std::string> famsFetched;
1486   std::map<std::string,int> families;
1487   int refId=1;
1488   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),1)!=levs.end())
1489     {
1490       levsS.erase(1);
1491       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(1);
1492       if(fam)
1493         {
1494           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1495           std::map<int,int> ren;
1496           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1497             ren[*it]=refId;
1498           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1499           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1500           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1501             *w=ren[*w];
1502           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1503             {
1504               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1505                 {
1506                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1507                   families[famName]=ren[*it];
1508                   famsFetched.insert(famName);
1509                 }
1510             }
1511         }
1512     }
1513   refId=-1;
1514   for(std::set<int>::const_reverse_iterator it2=levsS.rbegin();it2!=levsS.rend();it2++)
1515     {
1516       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it2);
1517       if(fam)
1518         {
1519           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1520           std::map<int,int> ren;
1521           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1522             ren[*it]=refId;
1523           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1524           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1525           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1526             *w=ren[*w];
1527           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1528             {
1529               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1530                 {
1531                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1532                   families[famName]=ren[*it];
1533                   famsFetched.insert(famName);
1534                 }
1535             }
1536         }
1537     }
1538   //
1539   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1540   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1541   std::set<std::string> unFetchedIds;
1542   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1543   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1544     families[*it4]=_families[*it4];
1545   _families=families;
1546 }
1547
1548 /*!
1549  * Returns a name of the family by its id. If there are several families having the given
1550  * id, the name first in lexical order is returned.
1551  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1552  *  \return std::string - the name of the found family.
1553  *  \throw If no family with the given \a id exists.
1554  */
1555 std::string MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId(int id) const
1556 {
1557   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1558     if((*it).second==id)
1559       return (*it).first;
1560   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::getFamilyNameGivenId : no such family id : " << id;
1561   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1562 }
1563
1564 /*!
1565  * Returns a string describing \a this mesh. This description includes the mesh name and
1566  * the mesh description string.
1567  *  \return std::string - the mesh information string.
1568  */
1569 std::string MEDFileMesh::simpleRepr() const
1570 {
1571   std::ostringstream oss;
1572   oss << "(*************************************)\n(* GENERAL INFORMATION ON THE MESH : *)\n(*************************************)\n";
1573   oss << "- Name of the mesh : <<" << getName() << ">>\n";
1574   oss << "- Description associated to the mesh : " << getDescription() << std::endl;
1575   return oss.str();
1576 }
1577
1578 /*!
1579  * Returns ids of mesh entities contained in a given group of a given dimension.
1580  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1581  *          are required.
1582  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1583  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1584  *          returned instead of ids. 
1585  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1586  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the group. The caller
1587  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1588  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1589  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1590  */
1591 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
1592 {
1593   std::vector<std::string> tmp(1);
1594   tmp[0]=grp;
1595   DataArrayInt *ret=getGroupsArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1596   ret->setName(grp);
1597   return ret;
1598 }
1599
1600 /*!
1601  * Returns ids of mesh entities contained in given groups of a given dimension.
1602  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1603  *          are required.
1604  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1605  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1606  *          returned instead of ids.
1607  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1608  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the groups. The caller
1609  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1610  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1611  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1612  */
1613 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1614 {
1615   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
1616   return getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
1617 }
1618
1619 /*!
1620  * Returns ids of mesh entities contained in a given family of a given dimension.
1621  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1622  *          are required.
1623  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
1624  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1625  *          returned instead of ids. 
1626  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1627  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the family. The caller
1628  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1629  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1630  */
1631 DataArrayInt *MEDFileMesh::getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
1632 {
1633   std::vector<std::string> tmp(1);
1634   tmp[0]=fam;
1635   DataArrayInt *ret=getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1636   ret->setName(fam);
1637   return ret;
1638 }
1639
1640 /*!
1641  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1642  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1643  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1644  *          returned instead of ids. 
1645  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1646  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1647  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1648  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1649  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1650  */
1651 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupArr(const std::string& grp, bool renum) const
1652 {
1653   std::vector<std::string> tmp(1);
1654   tmp[0]=grp;
1655   DataArrayInt *ret=getNodeGroupsArr(tmp,renum);
1656   ret->setName(grp);
1657   return ret;
1658 }
1659
1660 /*!
1661  * Returns ids of nodes contained in given groups.
1662  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1663  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1664  *          returned instead of ids. 
1665  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1666  *          numbers, if available and required, of nodes of the groups. The caller
1667  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1668  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1669  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1670  */
1671 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1672 {
1673   return getGroupsArr(1,grps,renum);
1674 }
1675
1676 /*!
1677  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1678  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1679  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1680  *          returned instead of ids. 
1681  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1682  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1683  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1684  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1685  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1686  */
1687 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamilyArr(const std::string& fam, bool renum) const
1688 {
1689   std::vector<std::string> tmp(1);
1690   tmp[0]=fam;
1691   DataArrayInt *ret=getNodeFamiliesArr(tmp,renum);
1692   ret->setName(fam);
1693   return ret;
1694 }
1695
1696 /*!
1697  * Returns ids of nodes contained in given families.
1698  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
1699  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1700  *          returned instead of ids. 
1701  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1702  *          numbers, if available and required, of nodes of the families. The caller
1703  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1704  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1705  */
1706 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
1707 {
1708   return getFamiliesArr(1,fams,renum);
1709 }
1710
1711 /*!
1712  * Adds groups of given dimension and creates corresponding families and family fields
1713  * given ids of mesh entities of each group.
1714  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative mesh dimension of given mesh entities.
1715  *  \param [in] grps - a sequence of arrays of ids each describing a group.
1716  *  \param [in] renum - \c true means that \a grps contains not ids but optional numbers
1717  *          of mesh entities.
1718  *  \throw If names of some groups in \a grps are equal.
1719  *  \throw If \a grps includes a group with an empty name.
1720  *  \throw If \a grps includes invalid ids (or numbers if \a renum == \c true ).
1721  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
1722  */
1723 void MEDFileMesh::setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum)
1724 {
1725   if(grps.empty())
1726     return ;
1727   std::set<std::string> grpsName;
1728   std::vector<std::string> grpsName2(grps.size());
1729   int i=0;
1730
1731   for(std::vector<const DataArrayInt *>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++,i++)
1732     {
1733       grpsName.insert((*it)->getName());
1734       grpsName2[i]=(*it)->getName();
1735     }
1736   if(grpsName.size()!=grps.size())
1737     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different each other !");
1738   if(grpsName.find(std::string(""))!=grpsName.end())
1739     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different empty string !");
1740   int sz=getSizeAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
1741   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam;
1742   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
1743   if(!renum)
1744     {
1745       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps,sz,fidsOfGroups);
1746     }
1747   else
1748     {
1749       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grps2(grps.size());
1750       for(unsigned int ii=0;ii<grps.size();ii++)
1751         {
1752           grps2[ii]=MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(getRevNumberFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt),grps[ii]);
1753           grps2[ii]->setName(grps[ii]->getName());
1754         }
1755       std::vector<const DataArrayInt *> grps3(grps2.begin(),grps2.end());
1756       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps3,sz,fidsOfGroups);
1757     }
1758   int offset=1;
1759   if(!_families.empty())
1760     offset=getMaxAbsFamilyId()+1;
1761   TranslateFamilyIds(meshDimRelToMaxExt==1?offset:-offset,fam,fidsOfGroups);
1762   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getDifferentValues();
1763   appendFamilyEntries(ids,fidsOfGroups,grpsName2);
1764   setFamilyFieldArr(meshDimRelToMaxExt,fam);
1765 }
1766
1767 /*!
1768  * This method append into '_families' attribute the families whose ids are in 'famIds'. Warning 'famIds' are expected to be ids
1769  * not in '_families'. Groups information are given in parameters in order to give to families representative names.
1770  * For the moment, the two last input parameters are not taken into account.
1771  */
1772 void MEDFileMesh::appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames)
1773 {
1774   std::map<int,std::string> famInv;
1775   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
1776     {
1777       std::ostringstream oss;
1778       oss << "Family_" << (*it);
1779       _families[oss.str()]=(*it);
1780       famInv[*it]=oss.str();
1781     }
1782   int i=0;
1783   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=fidsOfGrps.begin();it1!=fidsOfGrps.end();it1++,i++)
1784     {
1785       for(std::vector<int>::const_iterator it2=(*it1).begin();it2!=(*it1).end();it2++)
1786         {
1787           _groups[grpNames[i]].push_back(famInv[*it2]);
1788         }
1789     }
1790 }
1791
1792 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileMesh::getAllGeoTypes() const
1793 {
1794   std::vector<int> levs(getNonEmptyLevels());
1795   std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
1796   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1797     {
1798       std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> elts(getGeoTypesAtLevel(*it));
1799       ret.insert(ret.end(),elts.begin(),elts.end());
1800     }
1801   return ret;
1802 }
1803
1804 std::vector<int> MEDFileMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
1805 {
1806   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> mLev(getGenMeshAtLevel(meshDimRelToMax));
1807   return mLev->getDistributionOfTypes();
1808 }
1809
1810 void MEDFileMesh::TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp)
1811 {
1812   famArr->applyLin(offset>0?1:-1,offset,0);
1813   for(std::vector< std::vector<int> >::iterator it1=famIdsPerGrp.begin();it1!=famIdsPerGrp.end();it1++)
1814     {
1815       if(offset<0)
1816         std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::negate<int>());
1817       std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),offset));
1818     }
1819 }
1820
1821 /*!
1822  * Warning no check is done on 'nameTry' in parameter. It should be non empty.
1823  * This method returns a name close to 'nameTry' so that it is not already into 'namesToAvoid'.
1824  * If this method fails to find such a name it will throw an exception.
1825  */
1826 std::string MEDFileMesh::CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid)
1827 {
1828   //attempt #0
1829   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),nameTry)==namesToAvoid.end())
1830     return nameTry;
1831   //attempt #1
1832   std::size_t len=nameTry.length();
1833   for(std::size_t ii=1;ii<len;ii++)
1834     {
1835       std::string tmp=nameTry.substr(ii,len-ii);
1836       if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp)==namesToAvoid.end())
1837         return tmp;
1838     }
1839   //attempt #2
1840   if(len>=1)
1841     {
1842       for(std::size_t i=1;i<30;i++)
1843         {
1844           std::string tmp1(nameTry.at(0),i);
1845           tmp1+=nameTry;
1846           if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp1)==namesToAvoid.end())
1847             return tmp1;
1848         }
1849     }
1850   //attempt #3
1851   std::string tmp2;
1852   for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=namesToAvoid.begin();it2!=namesToAvoid.end();it2++)
1853     tmp2+=(*it2);
1854   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp2)==namesToAvoid.end())
1855     return tmp2;
1856   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::CreateNameNotIn : impossible to find a not already used name !");
1857 }
1858
1859 int MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt)
1860 {
1861   std::size_t nbOfChunks=code.size()/3;
1862   if(code.size()%3!=0)
1863     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset : code has invalid size : should be of size 3*x !");
1864   int ret=strt;
1865   for(std::size_t i=0;i<nbOfChunks;i++)
1866     {
1867       code[3*i+2]=ret;
1868       ret+=code[3*i+1];
1869     }
1870   return ret;
1871 }
1872
1873 /*!
1874  * This method should be called by any set* method of subclasses to deal automatically with _name attribute.
1875  * If _name attribute is empty the name of 'm' if taken as _name attribute.
1876  * If _name is not empty and that 'm' has the same name nothing is done.
1877  * If _name is not emplt and that 'm' has \b NOT the same name an exception is thrown.
1878  */
1879 void MEDFileMesh::dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m)
1880 {
1881   if(!m)
1882     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : input mesh in NULL !");
1883   if(_name.empty())
1884     _name=m->getName();
1885   else
1886     {
1887       std::string name(m->getName());
1888       if(!name.empty())
1889         {
1890           if(_name!=name)
1891             {
1892               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : name of current MEDfile mesh is '" << _name << "' whereas name of input mesh is : '";
1893               oss << name << "' ! Names must match !";
1894               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1895             }
1896         }
1897     }
1898   if(_desc_name.empty())
1899     _desc_name=m->getDescription();
1900   else
1901     {
1902       std::string name(m->getDescription());
1903       if(!name.empty())
1904         {
1905           if(_desc_name!=name)
1906             {
1907               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : description of current MEDfile mesh is '" << _desc_name << "' whereas name of input mesh is : '";
1908               oss << name << "' ! Names must match !";
1909               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1910             }
1911         }
1912     }
1913 }
1914
1915 void MEDFileMesh::getFamilyRepr(std::ostream& oss) const
1916 {
1917   oss << "(**************************)\n(* FAMILIES OF THE MESH : *)\n(**************************)\n";
1918   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1919     {
1920       oss << "- Family with name \"" << (*it).first << "\" with number " << (*it).second << std::endl;
1921       oss << "  - Groups lying on this family : ";
1922       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
1923       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1924       oss << std::endl << std::endl;
1925     }
1926 }
1927
1928 /*!
1929  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1930  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
1931  * iteration.
1932  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1933  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
1934  *  \param [in] dt - the number of a time step.
1935  *  \param [in] it - the number of an iteration.
1936  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1937  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1938  *  \throw If the file is not readable.
1939  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
1940  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1941  */
1942 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1943 {
1944   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1945   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1946   return new MEDFileUMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
1947 }
1948
1949 /*!
1950  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1951  * file. The first mesh in the file is loaded.
1952  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1953  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1954  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1955  *  \throw If the file is not readable.
1956  *  \throw If there is no meshes in the file.
1957  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1958  */
1959 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1960 {
1961   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
1962   if(ms.empty())
1963     {
1964       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
1965       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1966     }
1967   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1968   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1969   int dt,it;
1970   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
1971   std::string dummy2;
1972   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
1973   return new MEDFileUMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
1974 }
1975
1976 /*!
1977  * Returns an empty instance of MEDFileUMesh.
1978  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1979  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1980  */
1981 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New()
1982 {
1983   return new MEDFileUMesh;
1984 }
1985
1986 /*!
1987  * This method loads from file with name \a fileName the mesh called \a mName as New does. The difference is that
1988  * here only a part of cells contained in the file will be loaded. The selection of cell is specified using the two consecutive parameters
1989  * \a types and \a slicPerTyp. This method allows to load from a mesh (typically huge) in a MED file a part of cells of that mesh.
1990  * The part of cells is specified using triplet (start,stop,step) for each geometric type. Only nodes lying on selected cells will be loaded to reduce
1991  * at most the memory consumtion.
1992  *
1993  * \param [in] fileName - the name of the file.
1994  * \param [in] mName - the name of the mesh to be read.
1995  * \param [in] types - the list of the geo types of which some part will be taken. A geometric type in \a types must appear only once at most.
1996  * \param [in] slicPerType - an array of size 3 times larger than \a types that specifies for each type in \a types (in the same order) resp the start, the stop and the step.
1997  * \param [in] dt - the iteration, that is to say the first element of the pair that locates the asked time step.
1998  * \param [in] it - the order, that is to say the second element of the pair that locates the asked time step.
1999  * \param [in] mrs - the request for what to be loaded.
2000  * \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2001  */
2002 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::LoadPartOf(const std::string& fileName, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2003 {
2004   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
2005   MEDFileUtilities::AutoFid fid(MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY));
2006   return MEDFileUMesh::LoadPartOf(fid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2007 }
2008
2009 /*!
2010  * Please refer to the other MEDFileUMesh::LoadPartOf method that has the same semantic and the same parameter (excepted the first).
2011  * This method is \b NOT wrapped into python.
2012  */
2013 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::LoadPartOf(med_idt fid, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2014 {
2015   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret(MEDFileUMesh::New());
2016   ret->loadPartUMeshFromFile(fid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2017   return ret.retn();
2018 }
2019
2020 std::size_t MEDFileUMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
2021 {
2022   std::size_t ret(MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren());
2023   ret+=_ms.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>));
2024   return ret;
2025 }
2026
2027 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMesh::getDirectChildrenWithNull() const
2028 {
2029   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull());
2030   ret.push_back((const DataArrayDouble*)_coords);
2031   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_coords);
2032   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_coords);
2033   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_coords);
2034   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords);
2035   ret.push_back((const PartDefinition *)_part_coords);
2036   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2037     ret.push_back((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it);
2038   return ret;
2039 }
2040
2041 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::shallowCpy() const
2042 {
2043   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2044   return ret.retn();
2045 }
2046
2047 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::createNewEmpty() const
2048 {
2049   return new MEDFileUMesh;
2050 }
2051
2052 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::deepCpy() const
2053 {
2054   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2055   if((const DataArrayDouble*)_coords)
2056     ret->_coords=_coords->deepCpy();
2057   if((const DataArrayInt*)_fam_coords)
2058     ret->_fam_coords=_fam_coords->deepCpy();
2059   if((const DataArrayInt*)_num_coords)
2060     ret->_num_coords=_num_coords->deepCpy();
2061   if((const DataArrayInt*)_rev_num_coords)
2062     ret->_rev_num_coords=_rev_num_coords->deepCpy();
2063   if((const DataArrayAsciiChar*)_name_coords)
2064     ret->_name_coords=_name_coords->deepCpy();
2065   std::size_t i=0;
2066   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
2067     {
2068       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2069         ret->_ms[i]=(*it)->deepCpy(ret->_coords);
2070     }
2071   return ret.retn();
2072 }
2073
2074 /*!
2075  * Checks if \a this and another mesh are equal.
2076  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
2077  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
2078  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
2079  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
2080  */
2081 bool MEDFileUMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
2082 {
2083   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
2084     return false;
2085   const MEDFileUMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(other);
2086   if(!otherC)
2087     {
2088       what="Mesh types differ ! This is unstructured and other is NOT !";
2089       return false;
2090     }
2091   clearNonDiscrAttributes();
2092   otherC->clearNonDiscrAttributes();
2093   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2094   const DataArrayDouble *coo2=otherC->_coords;
2095   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
2096     {
2097       what="Mismatch of coordinates ! One is defined and not other !";
2098       return false;
2099     }
2100   if(coo1)
2101     {
2102       bool ret=coo1->isEqual(*coo2,eps);
2103       if(!ret)
2104         {
2105           what="Coords differ !";
2106           return false;
2107         }
2108     }
2109   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2110   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_coords;
2111   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
2112     {
2113       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
2114       return false;
2115     }
2116   if(famc1)
2117     {
2118       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
2119       if(!ret)
2120         {
2121           what="Families arr on node differ !";
2122           return false;
2123         }
2124     }
2125   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2126   const DataArrayInt *numc2=otherC->_num_coords;
2127   if((numc1==0 && numc2!=0) || (numc1!=0 && numc2==0))
2128     {
2129       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
2130       return false;
2131     }
2132   if(numc1)
2133     {
2134       bool ret=numc1->isEqual(*numc2);
2135       if(!ret)
2136         {
2137           what="Numbering arr on node differ !";
2138           return false;
2139         }
2140     }
2141   const DataArrayAsciiChar *namec1=_name_coords;
2142   const DataArrayAsciiChar *namec2=otherC->_name_coords;
2143   if((namec1==0 && namec2!=0) || (namec1!=0 && namec2==0))
2144     {
2145       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
2146       return false;
2147     }
2148   if(namec1)
2149     {
2150       bool ret=namec1->isEqual(*namec2);
2151       if(!ret)
2152         {
2153           what="Names arr on node differ !";
2154           return false;
2155         }
2156     }
2157   if(_ms.size()!=otherC->_ms.size())
2158     {
2159       what="Number of levels differs !";
2160       return false;
2161     }
2162   std::size_t sz=_ms.size();
2163   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2164     {
2165       const MEDFileUMeshSplitL1 *s1=_ms[i];
2166       const MEDFileUMeshSplitL1 *s2=otherC->_ms[i];
2167       if((s1==0 && s2!=0) || (s1!=0 && s2==0))
2168         {
2169           what="Mismatch of presence of sub levels !";
2170           return false;
2171         }
2172       if(s1)
2173         {
2174           bool ret=s1->isEqual(s2,eps,what);
2175           if(!ret)
2176             return false;
2177         }
2178     }
2179   return true;
2180 }
2181
2182 /*!
2183  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
2184  */
2185 void MEDFileUMesh::clearNonDiscrAttributes() const
2186 {
2187   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
2188   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2189   if(coo1)
2190     (const_cast<DataArrayDouble *>(coo1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2191   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2192   if(famc1)
2193     (const_cast<DataArrayInt *>(famc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2194   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2195   if(numc1)
2196     (const_cast<DataArrayInt *>(numc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2197   const DataArrayAsciiChar *namc1=_name_coords;
2198   if(namc1)
2199     (const_cast<DataArrayAsciiChar *>(namc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2200   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2201     {
2202       const MEDFileUMeshSplitL1 *tmp=(*it);
2203       if(tmp)
2204         tmp->clearNonDiscrAttributes();
2205     }
2206 }
2207
2208 void MEDFileUMesh::setName(const std::string& name)
2209 {
2210   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2211     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2212       (*it)->setName(name);
2213   MEDFileMesh::setName(name);
2214 }
2215
2216 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh()
2217 {
2218 }
2219
2220 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2221 try
2222 {
2223     loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
2224 }
2225 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2226 {
2227     throw e;
2228 }
2229
2230 /*!
2231  * This method loads only a part of specified cells (given by range of cell ID per geometric type)
2232  * See MEDFileUMesh::LoadPartOf for detailed description.
2233  *
2234  * \sa loadUMeshFromFile
2235  */
2236 void MEDFileUMesh::loadPartUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types, const std::vector<int>& slicPerTyp, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2237 {
2238   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2239   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2240   int dummy0,dummy1;
2241   std::string dummy2;
2242   int mid(MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2));
2243   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2244     {
2245       std::ostringstream oss; oss << "loadPartUMeshFromFile : Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2246       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2247     }
2248   loaderl2.loadPart(fid,mid,mName,types,slicPerTyp,dt,it,mrs);
2249   dispatchLoadedPart(fid,loaderl2,mName,mrs);
2250 }
2251
2252 /*!
2253  * This method loads \b all \b the \b mesh \a mName in the file with \a fid descriptor.
2254  *
2255  * \sa loadPartUMeshFromFile
2256  */
2257 void MEDFileUMesh::loadUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2258 {
2259   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2260   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2261   int dummy0,dummy1;
2262   std::string dummy2;
2263   int mid(MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2));
2264   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2265     {
2266       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2267       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2268     }
2269   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it,mrs);
2270   dispatchLoadedPart(fid,loaderl2,mName,mrs);
2271
2272 }
2273
2274 void MEDFileUMesh::dispatchLoadedPart(med_idt fid, const MEDFileUMeshL2& loaderl2, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2275 {
2276   int lev=loaderl2.getNumberOfLevels();
2277   _ms.resize(lev);
2278   for(int i=0;i<lev;i++)
2279     {
2280       if(!loaderl2.emptyLev(i))
2281         _ms[i]=new MEDFileUMeshSplitL1(loaderl2,mName,i);
2282       else
2283         _ms[i]=0;
2284     }
2285   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
2286   //
2287   setName(loaderl2.getName());
2288   setDescription(loaderl2.getDescription());
2289   setUnivName(loaderl2.getUnivName());
2290   setIteration(loaderl2.getIteration());
2291   setOrder(loaderl2.getOrder());
2292   setTimeValue(loaderl2.getTime());
2293   setTimeUnit(loaderl2.getTimeUnit());
2294   _coords=loaderl2.getCoords();
2295   if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
2296     _fam_coords=loaderl2.getCoordsFamily();
2297   if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
2298     _num_coords=loaderl2.getCoordsNum();
2299   if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
2300     _name_coords=loaderl2.getCoordsName();
2301   _part_coords=loaderl2.getPartDefOfCoo();
2302   computeRevNum();
2303 }
2304
2305 MEDFileUMesh::~MEDFileUMesh()
2306 {
2307 }
2308
2309 void MEDFileUMesh::writeLL(med_idt fid) const
2310 {
2311   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2312   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
2313   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
2314   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
2315   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
2316   int spaceDim=coo?coo->getNumberOfComponents():0;
2317   int mdim(0);
2318   if(!_ms.empty())
2319     mdim=getMeshDimension();
2320   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2321   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2322   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
2323     {
2324       std::string info=coo->getInfoOnComponent(i);
2325       std::string c,u;
2326       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
2327       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2328       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2329     }
2330   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,mdim,MED_UNSTRUCTURED_MESH,desc,"",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
2331   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
2332   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
2333   MEDFileUMeshL2::WriteCoords(fid,meshName,_iteration,_order,_time,_coords,_fam_coords,_num_coords,_name_coords);
2334   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2335     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2336       (*it)->write(fid,meshName,mdim);
2337   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,meshName,_families,_groups,_too_long_str);
2338 }
2339
2340 /*!
2341  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
2342  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2343  */
2344 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevels() const
2345 {
2346   std::vector<int> ret;
2347   int lev=0;
2348   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2349     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2350       if(!(*it)->empty())
2351         ret.push_back(lev);
2352   return ret;
2353 }
2354
2355 /*!
2356  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
2357  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2358  */
2359 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
2360 {
2361   std::vector<int> ret0=getNonEmptyLevels();
2362   if((const DataArrayDouble *) _coords)
2363     {
2364       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2365       ret[0]=1;
2366       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2367       return ret;
2368     }
2369   return ret0;
2370 }
2371
2372 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
2373 {
2374   std::vector<int> ret;
2375   const DataArrayInt *famCoo(_fam_coords);
2376   if(famCoo)
2377     ret.push_back(1);
2378   int lev=0;
2379   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2380     {
2381       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2382       if(cur)
2383         if(cur->getFamilyField())
2384           ret.push_back(lev);
2385     }
2386   return ret;
2387 }
2388
2389 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
2390 {
2391   std::vector<int> ret;
2392   const DataArrayInt *numCoo(_num_coords);
2393   if(numCoo)
2394     ret.push_back(1);
2395   int lev=0;
2396   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2397     {
2398       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2399       if(cur)
2400         if(cur->getNumberField())
2401           ret.push_back(lev);
2402     }
2403   return ret;
2404 }
2405
2406 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
2407 {
2408   std::vector<int> ret;
2409   const DataArrayAsciiChar *nameCoo(_name_coords);
2410   if(nameCoo)
2411     ret.push_back(1);
2412   int lev=0;
2413   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2414     {
2415       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2416       if(cur)
2417         if(cur->getNameField())
2418           ret.push_back(lev);
2419     }
2420   return ret;
2421 }
2422
2423 /*!
2424  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given group is defined.
2425  * To include nodes, call getGrpNonEmptyLevelsExt() method.
2426  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2427  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2428  */
2429 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevels(const std::string& grp) const
2430 {
2431   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2432   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2433 }
2434
2435 /*!
2436  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given group is defined.
2437  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2438  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2439  */
2440 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevelsExt(const std::string& grp) const
2441 {
2442   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2443   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2444 }
2445
2446 /*!
2447  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given family is defined.
2448  * To include nodes, call getFamNonEmptyLevelsExt() method.
2449  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2450  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2451  */
2452 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevels(const std::string& fam) const
2453 {
2454   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2455   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2456 }
2457
2458 /*!
2459  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given family is defined.
2460  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2461  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2462  */
2463 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevelsExt(const std::string& fam) const
2464 {
2465   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2466   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2467 }
2468
2469 /*!
2470  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given groups are defined.
2471  * To include nodes, call getGrpsNonEmptyLevelsExt() method.
2472  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2473  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2474  */
2475 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const
2476 {
2477   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2478   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2479 }
2480
2481 /*!
2482  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given groups are defined.
2483  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2484  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2485  */
2486 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const
2487 {
2488   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2489   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2490 }
2491
2492 /*!
2493  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given families are defined.
2494  * To include nodes, call getFamsNonEmptyLevelsExt() method.
2495  *  \param [in] fams - the name of the family of interest.
2496  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2497  */
2498 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const
2499 {
2500   std::vector<int> ret;
2501   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
2502   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2503   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
2504     if(_ms[-(*it)]->presenceOfOneFams(famIds))
2505       ret.push_back(*it);
2506   return ret;
2507 }
2508
2509 /*!
2510  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given families are defined.
2511  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2512  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2513  */
2514 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const
2515 {
2516   std::vector<int> ret0=getFamsNonEmptyLevels(fams);
2517   const DataArrayInt *famCoords=_fam_coords;
2518   if(!famCoords)
2519     return ret0;
2520   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2521   if(famCoords->presenceOfValue(famIds))
2522     {
2523       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2524       ret[0]=1;
2525       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2526       return ret;
2527     }
2528   else
2529     return ret0;
2530 }
2531
2532 /*!
2533  * Returns names of groups that partly or fully appear on the level \a meshDimRelToMaxExt.
2534  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of interest.
2535  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names at \a meshDimRelToMaxExt
2536  *          level. 
2537  */
2538 std::vector<std::string> MEDFileUMesh::getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const
2539 {
2540   std::vector<std::string> ret;
2541   std::vector<std::string> allGrps=getGroupsNames();
2542   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=allGrps.begin();it!=allGrps.end();it++)
2543     {
2544       std::vector<int> levs=getGrpNonEmptyLevelsExt((*it));
2545       if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)!=levs.end())
2546         ret.push_back(*it);
2547     }
2548   return ret;
2549 }
2550
2551 int MEDFileUMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
2552 {
2553   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2554   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2555     {
2556       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2557       ret=std::max(ret,std::abs(val));
2558     }
2559   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2560     {
2561       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2562         {
2563           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2564           if(da)
2565             {
2566               int val=da->getMaxValue(tmp);
2567               ret=std::max(ret,std::abs(val));
2568             }
2569         }
2570     }
2571   return ret;
2572 }
2573
2574 int MEDFileUMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
2575 {
2576   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2577   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2578     {
2579       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2580       ret=std::max(ret,val);
2581     }
2582   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2583     {
2584       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2585         {
2586           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2587           if(da)
2588             {
2589               int val=da->getMaxValue(tmp);
2590               ret=std::max(ret,val);
2591             }
2592         }
2593     }
2594   return ret;
2595 }
2596
2597 int MEDFileUMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
2598 {
2599   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2600   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2601     {
2602       int val=_fam_coords->getMinValue(tmp);
2603       ret=std::min(ret,val);
2604     }
2605   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2606     {
2607       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2608         {
2609           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2610           if(da)
2611             {
2612               int val=da->getMinValue(tmp);
2613               ret=std::min(ret,val);
2614             }
2615         }
2616     }
2617   return ret;
2618 }
2619
2620 /*!
2621  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
2622  *  \return int - the mesh dimension.
2623  *  \throw If there are no cells in this mesh.
2624  */
2625 int MEDFileUMesh::getMeshDimension() const
2626 {
2627   int lev=0;
2628   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev++)
2629     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2630       return (*it)->getMeshDimension()+lev;
2631   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getMeshDimension : impossible to find a mesh dimension !");
2632 }
2633
2634 /*!
2635  * Returns the space dimension of \a this mesh that is equal to number of components in
2636  * the node coordinates array.
2637  *  \return int - the space dimension of \a this mesh.
2638  *  \throw If the node coordinates array is not available.
2639  */
2640 int MEDFileUMesh::getSpaceDimension() const
2641 {
2642   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2643   if(!coo)
2644     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getSpaceDimension : no coords set !");
2645   return coo->getNumberOfComponents();
2646 }
2647
2648 /*!
2649  * Returns a string describing \a this mesh.
2650  *  \return std::string - the mesh information string.
2651  */
2652 std::string MEDFileUMesh::simpleRepr() const
2653 {
2654   std::ostringstream oss;
2655   oss << MEDFileMesh::simpleRepr();
2656   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2657   oss << "- The dimension of the space is ";
2658   static const char MSG1[]= "*** NO COORDS SET ***";
2659   static const char MSG2[]= "*** NO CONNECTIVITY SET FOR THIS LEVEL***";
2660   if(coo)
2661     oss << _coords->getNumberOfComponents() << std::endl;
2662   else
2663     oss << MSG1 << std::endl;
2664   oss << "- Type of the mesh : UNSTRUCTURED\n";
2665   oss << "- Number of nodes : ";
2666   if(coo)
2667     oss << _coords->getNumberOfTuples() << std::endl;
2668   else
2669     oss << MSG1 << std::endl;
2670   std::size_t nbOfLev=_ms.size();
2671   oss << "- Number of levels allocated : " << nbOfLev << std::endl;
2672   for(std::size_t i=0;i<nbOfLev;i++)
2673     {
2674       const MEDFileUMeshSplitL1 *lev=_ms[i];
2675       oss << "  - Level #" << -((int) i) << " has dimension : ";
2676       if(lev)
2677         {
2678           oss << lev->getMeshDimension() << std::endl;
2679           lev->simpleRepr(oss);
2680         }
2681       else
2682         oss << MSG2 << std::endl;
2683     }
2684   oss << "- Number of families : " << _families.size() << std::endl << std::endl;
2685   if(coo)
2686     {
2687       oss << "(***********************)\n(* NODES OF THE MESH : *)\n(***********************)\n";
2688       oss << "- Names of coordinates :" << std::endl;
2689       std::vector<std::string> vars=coo->getVarsOnComponent();
2690       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2691       oss << std::endl << "- Units of coordinates : " << std::endl;
2692       std::vector<std::string> units=coo->getUnitsOnComponent();
2693       std::copy(units.begin(),units.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2694     }
2695   oss << std::endl << std::endl;
2696   getFamilyRepr(oss);
2697   return oss.str();
2698 }
2699
2700 /*!
2701  * Returns a full textual description of \a this mesh.
2702  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
2703  */
2704 std::string MEDFileUMesh::advancedRepr() const
2705 {
2706   return simpleRepr();
2707 }
2708
2709 /*!
2710  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
2711  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2712  *  \return int - the number of entities.
2713  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
2714  */
2715 int MEDFileUMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2716 {
2717   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2718     {
2719       if(!((const DataArrayDouble *)_coords))
2720         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getSizeAtLevel : no coordinates specified !");
2721       return _coords->getNumberOfTuples();
2722     }
2723   return getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt)->getSize();
2724 }
2725
2726 /*!
2727  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
2728  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2729  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
2730  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
2731  */
2732 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2733 {
2734   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2735     return _fam_coords;
2736   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2737   return l1->getFamilyField();
2738 }
2739
2740 /*!
2741  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
2742  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2743  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
2744  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2745  */
2746 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2747 {
2748   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2749     return _num_coords;
2750   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2751   return l1->getNumberField();
2752 }
2753
2754 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2755 {
2756   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2757     return _name_coords;
2758   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2759   return l1->getNameField();
2760 }
2761
2762 /*!
2763  * This method returns for a specified relative level \a meshDimRelToMaxExt the part effectively read (if the instance is the result of the read of a file).
2764  *
2765  * \param [in] meshDimRelToMaxExt - the extended relative level for which the part definition is requested.
2766  * \param [in] gt - The input geometric type for which the part definition is requested.
2767  * \return the part definition owned by \a this. So no need to deallocate the returned instance.
2768  */
2769 const PartDefinition *MEDFileUMesh::getPartDefAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
2770 {
2771   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2772     return _part_coords;
2773   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt));
2774   return l1->getPartDef(gt);
2775 }
2776
2777 int MEDFileUMesh::getNumberOfNodes() const
2778 {
2779   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2780   if(!coo)
2781     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getNumberOfNodes : no coords set !");
2782   return coo->getNumberOfTuples();
2783 }
2784
2785 bool MEDFileUMesh::hasImplicitPart() const
2786 {
2787   return false;
2788 }
2789
2790 int MEDFileUMesh::buildImplicitPartIfAny(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
2791 {
2792   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::buildImplicitPartIfAny : unstructured meshes do not have implicit part !");
2793 }
2794
2795 void MEDFileUMesh::releaseImplicitPartIfAny() const
2796 {
2797 }
2798
2799 void MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
2800 {
2801   std::size_t sz(st.getNumberOfItems());
2802   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2803     {
2804       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType curGt(st[i].getGeo());
2805       const MEDCoupling1GTUMesh *m(getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(curGt));
2806       if(st[i].getPflName().empty())
2807         m->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2808       else
2809         {
2810           const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[i].getPflName()));
2811           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m2(dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(m->buildPartOfMySelf(arr->begin(),arr->end(),true)));
2812           m2->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2813         }
2814     }
2815 }
2816
2817 /*!
2818  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
2819  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2820  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2821  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
2822  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2823  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2824  */
2825 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2826 {
2827   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2828     {
2829       if(!((const DataArrayInt *)_num_coords))
2830         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no coordinates renum specified !");
2831       return _rev_num_coords;
2832     }
2833   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2834   return l1->getRevNumberField();
2835 }
2836
2837 /*!
2838  * Returns a pointer to the node coordinates array of \a this mesh \b without
2839  * incrementing its reference counter, thus there is no need to decrRef() it by the caller.
2840  */
2841 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::getCoords() const
2842 {
2843   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp(_coords);
2844   if((DataArrayDouble *)tmp)
2845     {
2846       return tmp;
2847     }
2848   return 0;
2849 }
2850
2851 /*!
2852  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2853  * group of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2854  * new mesh.
2855  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2856  *  \param [in] grp - the name of the group whose mesh entities are included in the
2857  *          new mesh.
2858  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2859  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2860  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2861  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2862  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
2863  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2864  */
2865 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
2866 {
2867   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2868   std::vector<std::string> tmp(1);
2869   tmp[0]=grp;
2870   return getGroups(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2871 }
2872
2873 /*!
2874  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2875  * groups of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2876  * new mesh.
2877  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2878  *  \param [in] grps - a sequence of group names whose mesh entities are included in the
2879  *          new mesh.
2880  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2881  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2882  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2883  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2884  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
2885  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2886  */
2887 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
2888 {
2889   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2890   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
2891   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet=getFamilies(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
2892   if(grps.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2893     zeRet->setName(grps[0]);
2894   return zeRet.retn();
2895 }
2896
2897 /*!
2898  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2899  * family of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2900  * new mesh.
2901  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2902  *  \param [in] fam - the name of the family whose mesh entities are included in the
2903  *          new mesh.
2904  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2905  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2906  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2907  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2908  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a grps.
2909  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2910  */
2911 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
2912 {
2913   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2914   std::vector<std::string> tmp(1);
2915   tmp[0]=fam;
2916   return getFamilies(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2917 }
2918
2919 /*!
2920  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2921  * families of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2922  * new mesh.
2923  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2924  *  \param [in] fams - a sequence of family names whose mesh entities are included in the
2925  *          new mesh.
2926  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2927  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2928  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2929  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2930  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a fams.
2931  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2932  */
2933 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2934 {
2935   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2936   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2937     {
2938       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr=getFamiliesArr(1,fams,renum);
2939       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New();
2940       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> c=_coords->selectByTupleId(arr->getConstPointer(),arr->getConstPointer()+arr->getNbOfElems());
2941       ret->setCoords(c);
2942       return ret.retn();
2943     }
2944   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2945   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2946   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet;
2947   if(!famIds.empty())
2948     zeRet=l1->getFamilyPart(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2949   else
2950     zeRet=l1->getFamilyPart(0,0,renum);
2951   if(fams.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2952     zeRet->setName(fams[0]);
2953   return zeRet.retn();
2954 }
2955
2956 /*!
2957  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
2958  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
2959  *          are required.
2960  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2961  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
2962  *          returned instead of ids.
2963  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
2964  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
2965  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
2966  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
2967  */
2968 DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2969 {
2970   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2971   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2972     {
2973       if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2974         {
2975           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
2976           if(!famIds.empty())
2977             da=_fam_coords->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
2978           else
2979             da=_fam_coords->getIdsEqualList(0,0);
2980           if(renum)
2981             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_coords,da);
2982           else
2983             return da.retn();
2984         }
2985       else
2986         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
2987     }
2988   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2989   if(!famIds.empty())
2990     return l1->getFamilyPartArr(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2991   else
2992     return l1->getFamilyPartArr(0,0,renum);
2993 }
2994
2995 /*!
2996  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2997  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2998  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2999  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
3000  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
3001  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3002  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3003  *          optional numbers of mesh entities.
3004  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3005  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3006  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3007  * \sa getGenMeshAtLevel()
3008  */
3009 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum) const
3010 {
3011   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
3012   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3013     {
3014       if(!renum)
3015         {
3016           MEDCouplingUMesh *umesh=MEDCouplingUMesh::New();
3017           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> cc=_coords->deepCpy();
3018           umesh->setCoords(cc);
3019           MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(umesh);
3020           umesh->setName(getName());
3021           return umesh;
3022         }
3023     }
3024   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3025   return l1->getWholeMesh(renum);
3026 }
3027
3028 /*!
3029  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
3030  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
3031  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
3032  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
3033  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
3034  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3035  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3036  *          optional numbers of mesh entities.
3037  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3038  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3039  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMax dimension in \a this mesh.
3040  * \sa getMeshAtLevel()
3041  */
3042 MEDCouplingMesh *MEDFileUMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
3043 {
3044   return getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3045 }
3046
3047 std::vector<int> MEDFileUMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
3048 {
3049   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3050   return l1->getDistributionOfTypes();
3051 }
3052
3053 /*!
3054  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == 0.
3055  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3056  *          optional numbers of mesh entities.
3057  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3058  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3059  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == 0 in \a this mesh.
3060  */
3061 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevel0Mesh(bool renum) const
3062 {
3063   return getMeshAtLevel(0,renum);
3064 }
3065
3066 /*!
3067  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -1.
3068  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3069  *          optional numbers of mesh entities.
3070  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3071  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3072  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -1 in \a this mesh.
3073  */
3074 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM1Mesh(bool renum) const
3075 {
3076   return getMeshAtLevel(-1,renum);
3077 }
3078
3079 /*!
3080  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -2.
3081  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3082  *          optional numbers of mesh entities.
3083  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3084  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3085  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -2 in \a this mesh.
3086  */
3087 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM2Mesh(bool renum) const
3088 {
3089   return getMeshAtLevel(-2,renum);
3090 }
3091
3092 /*!
3093  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -3.
3094  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3095  *          optional numbers of mesh entities.
3096  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3097  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3098  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -3 in \a this mesh.
3099  */
3100 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM3Mesh(bool renum) const
3101 {
3102   return getMeshAtLevel(-3,renum);
3103 }
3104
3105 /*!
3106  * This method is for advanced users. There is two storing strategy of mesh in \a this.
3107  * Either MEDCouplingUMesh, or vector of MEDCoupling1GTUMesh instances.
3108  * When assignement is done the first one is done, which is not optimal in write mode for MED file.
3109  * This method allows to switch from MEDCouplingUMesh mode to MEDCoupling1GTUMesh mode.
3110  */
3111 void MEDFileUMesh::forceComputationOfParts() const
3112 {
3113   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3114     {
3115       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3116       if(elt)
3117         elt->forceComputationOfParts();
3118     }
3119 }
3120
3121 /*!
3122  * This method returns a vector of mesh parts containing each exactly one geometric type.
3123  * This method will never launch an automatic computation of split by type (an INTERP_KERNEL::Exception will be then thrown).
3124  * This method is only for memory aware users.
3125  * The returned pointers are **NOT** new object pointer. No need to mange them.
3126  */
3127 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(int meshDimRelToMax) const
3128 {
3129   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3130   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes();
3131 }
3132
3133 /*!
3134  * This method returns the part of \a this having the geometric type \a gt.
3135  * If such part is not existing an exception will be thrown.
3136  * The returned pointer is **NOT** new object pointer. No need to mange it.
3137  */
3138 MEDCoupling1GTUMesh *MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3139 {
3140   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3141   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3142   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3143   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(gt);
3144 }
3145
3146 /*!
3147  * Given a relative level \a meshDimRelToMax it returns the sorted vector of geometric types present in \a this.
3148  * \throw if the reqsuested \a meshDimRelToMax does not exist.
3149  */
3150 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
3151 {
3152   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3153   return sp->getGeoTypes();
3154 }
3155
3156 /*!
3157  * This method extracts from whole family field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3158  * \param [in] gt - the geometric type for which the family field is asked.
3159  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3160  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3161  * \sa MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType
3162  */
3163 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3164 {
3165   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3166   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3167   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3168   return sp->extractFamilyFieldOnGeoType(gt);
3169 }
3170
3171 /*!
3172  * This method extracts from whole number field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3173  * \param [in] gt - the geometric type for which the number field is asked.
3174  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3175  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3176  * \sa MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType
3177  */
3178 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3179 {
3180   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3181   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3182   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3183   return sp->extractNumberFieldOnGeoType(gt);
3184 }
3185
3186 /*!
3187  * This method returns for specified geometric type \a gt the relative level to \a this.
3188  * If the relative level is empty an exception will be thrown.
3189  */
3190 int MEDFileUMesh::getRelativeLevOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3191 {
3192   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3193   int ret((int)cm.getDimension()-getMeshDimension());
3194   getMeshAtLevSafe(ret);//To test that returned value corresponds to a valid level.
3195   return ret;
3196 }
3197
3198 const MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const
3199 {
3200   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3201     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3202   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3203     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3204   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3205   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3206     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3207   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3208     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3209   return _ms[tracucedRk];
3210 }
3211
3212 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt)
3213 {
3214   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3215     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3216   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3217     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3218   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3219   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3220     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3221   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3222     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3223   return _ms[tracucedRk];
3224 }
3225
3226 void MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const
3227 {
3228   if(-meshDimRelToMax>=(int)_ms.size())
3229     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : The meshdim of mesh is not managed by 'this' !");
3230   int i=0;
3231   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
3232     {
3233       if(((const MEDFileUMeshSplitL1*) (*it))!=0)
3234         {
3235           int ref=(*it)->getMeshDimension();
3236           if(ref+i!=meshDim-meshDimRelToMax)
3237             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : no coherency between levels !");
3238         }
3239     }
3240 }
3241
3242 /*!
3243  * Sets the node coordinates array of \a this mesh.
3244  *  \param [in] coords - the new node coordinates array.
3245  *  \throw If \a coords == \c NULL.
3246  */
3247 void MEDFileUMesh::setCoords(DataArrayDouble *coords)
3248 {
3249   if(!coords)
3250     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setCoords : null pointer in input !");
3251   coords->checkAllocated();
3252   int nbOfTuples=coords->getNumberOfTuples();
3253   _coords=coords;
3254   coords->incrRef();
3255   _fam_coords=DataArrayInt::New();
3256   _fam_coords->alloc(nbOfTuples,1);
3257   _fam_coords->fillWithZero();
3258   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3259     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3260       (*it)->setCoords(coords);
3261 }
3262
3263 /*!
3264  * Removes all groups of a given dimension in \a this mesh.
3265  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
3266  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3267  */
3268 void MEDFileUMesh::eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt)
3269 {
3270   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3271     {
3272       if((DataArrayInt *)_fam_coords)
3273         _fam_coords->fillWithZero();
3274       return ;
3275     }
3276   MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3277   l1->eraseFamilyField();
3278   optimizeFamilies();
3279 }
3280
3281 /*!
3282  * Removes all families with ids not present in the family fields of \a this mesh.
3283  */
3284 void MEDFileUMesh::optimizeFamilies()
3285 {
3286   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3287   std::set<int> allFamsIds;
3288   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
3289     {
3290       const DataArrayInt *ffield=getFamilyFieldAtLevel(*it);
3291       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=ffield->getDifferentValues();
3292       std::set<int> res;
3293       std::set_union(ids->begin(),ids->end(),allFamsIds.begin(),allFamsIds.end(),std::inserter(res,res.begin()));
3294       allFamsIds=res;
3295     }
3296   std::set<std::string> famNamesToKill;
3297   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
3298     {
3299       if(allFamsIds.find((*it).second)!=allFamsIds.end())
3300         famNamesToKill.insert((*it).first);
3301     }
3302   for(std::set<std::string>::const_iterator it=famNamesToKill.begin();it!=famNamesToKill.end();it++)
3303     _families.erase(*it);
3304   std::vector<std::string> grpNamesToKill;
3305   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
3306     {
3307       std::vector<std::string> tmp;
3308       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
3309         {
3310           if(famNamesToKill.find(*it2)==famNamesToKill.end())
3311             tmp.push_back(*it2);
3312         }
3313       if(!tmp.empty())
3314         (*it).second=tmp;
3315       else
3316         tmp.push_back((*it).first);
3317     }
3318   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grpNamesToKill.begin();it!=grpNamesToKill.end();it++)
3319     _groups.erase(*it);
3320 }
3321
3322 void MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group(const std::string& grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified)
3323 {
3324   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3325   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)==levs.end() || std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)==levs.end())
3326     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : This method works only for mesh definied on level 0 and -1 !");
3327   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m0=getMeshAtLevel(0);
3328   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1=getMeshAtLevel(-1);
3329   int nbNodes=m0->getNumberOfNodes();
3330   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m11=getGroup(-1,grpNameM1);
3331   DataArrayInt *tmp00=0,*tmp11=0,*tmp22=0;
3332   m0->findNodesToDuplicate(*m11,tmp00,tmp11,tmp22);
3333   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nodeIdsToDuplicate(tmp00);
3334   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn0(tmp11);
3335   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn1(tmp22);
3336   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m0->buildPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),true));
3337   // node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group 'grpNameM1' on level -1
3338   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> descTmp0=DataArrayInt::New(),descITmp0=DataArrayInt::New(),revDescTmp0=DataArrayInt::New(),revDescITmp0=DataArrayInt::New();
3339   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0Desc=tmp0->buildDescendingConnectivity(descTmp0,descITmp0,revDescTmp0,revDescITmp0);
3340   descTmp0=0; descITmp0=0; revDescTmp0=0; revDescITmp0=0;
3341   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW2=tmp0Desc->getCellIdsLyingOnNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),false);
3342   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> cellsInM1ToRenumW3=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(tmp0Desc->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenumW2->begin(),cellsInM1ToRenumW2->end(),true));
3343   DataArrayInt *cellsInM1ToRenumW4Tmp=0;
3344   m1->areCellsIncludedIn(cellsInM1ToRenumW3,2,cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3345   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW4(cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3346   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW5=cellsInM1ToRenumW4->getIdsInRange(0,m1->getNumberOfCells());
3347   cellsInM1ToRenumW5->transformWithIndArr(cellsInM1ToRenumW4->begin(),cellsInM1ToRenumW4->end());
3348   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpIds=getGroupArr(-1,grpNameM1);
3349   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenum=cellsInM1ToRenumW5->buildSubstraction(grpIds);
3350   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1Part=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),true));
3351   m1Part->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes);
3352   m1->setPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),*m1Part);
3353   // end of node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group of level -1 'grpNameM1'
3354   tmp0->duplicateNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end());
3355   m0->setCoords(tmp0->getCoords());
3356   m0->setPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),*tmp0);
3357   m1->setCoords(m0->getCoords());
3358   _coords=m0->getCoords(); _coords->incrRef();
3359   // duplication of cells in group 'grpNameM1' on level -1
3360   m11->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes); m11->setCoords(m0->getCoords());
3361   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> v(2); v[0]=m1; v[1]=m11;
3362   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> newm1=MEDCouplingUMesh::AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(v,tmp00,tmp11);
3363   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> szOfCellGrpOfSameType(tmp00);
3364   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idInMsOfCellGrpOfSameType(tmp11);
3365   //
3366   newm1->setName(getName());
3367   const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
3368   if(!fam)
3369     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : internal problem !");
3370   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFam=DataArrayInt::New();
3371   newFam->alloc(newm1->getNumberOfCells(),1);
3372   int idd=getMaxFamilyId()+1;
3373   int globStart=0,start=0,end,globEnd;
3374   int nbOfChunks=szOfCellGrpOfSameType->getNumberOfTuples();
3375   for(int i=0;i<nbOfChunks;i++)
3376     {
3377       globEnd=globStart+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3378       if(idInMsOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0)==0)
3379         {
3380           end=start+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3381           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> part=fam->selectByTupleId2(start,end,1);
3382           newFam->setPartOfValues1(part,globStart,globEnd,1,0,1,1,true);
3383           start=end;
3384         }
3385       else
3386         {
3387           newFam->setPartOfValuesSimple1(idd,globStart,globEnd,1,0,1,1);
3388         }
3389       globStart=globEnd;
3390     }
3391   newm1->setCoords(getCoords());
3392   setMeshAtLevel(-1,newm1);
3393   setFamilyFieldArr(-1,newFam);
3394   std::string grpName2(grpNameM1); grpName2+="_dup";
3395   addFamily(grpName2,idd);
3396   addFamilyOnGrp(grpName2,grpName2);
3397   //
3398   fam=_fam_coords;
3399   if(fam)
3400     {
3401       int newNbOfNodes=getCoords()->getNumberOfTuples();
3402       newFam=DataArrayInt::New(); newFam->alloc(newNbOfNodes,1);
3403       newFam->setPartOfValues1(fam,0,nbNodes,1,0,1,1,true);
3404       newFam->setPartOfValuesSimple1(0,nbNodes,newNbOfNodes,1,0,1,1);
3405       _fam_coords=newFam;
3406     }
3407   nodesDuplicated=nodeIdsToDuplicate.retn();
3408   cellsModified=cellsToModifyConn0.retn();
3409   cellsNotModified=cellsToModifyConn1.retn();
3410 }
3411
3412 /*!
3413  * \param [out] oldCode retrieves the distribution of types before the call if true is returned
3414  * \param [out] newCode etrieves the distribution of types after the call if true is returned
3415  * \param [out] o2nRenumCell tells for **all levels** the old 2 new renumbering of cells.
3416  * 
3417  * \return false if no modification has been performed linked to the unpolyzation. Neither cell type, not cell numbers. When false is returned no need of field on cells or on gauss renumbering.
3418  * Inversely, if true is returned, it means that distribution of cell by geometric type has changed and field on cell and field on gauss point must be renumbered.
3419  */
3420 bool MEDFileUMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
3421 {
3422   o2nRenumCell=0; oldCode.clear(); newCode.clear();
3423   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3424   bool ret=false;
3425   std::vector< const DataArrayInt* > renumCellsSplited;//same than memorySaverIfThrow
3426   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > memorySaverIfThrow;//same than renumCellsSplited only in case of throw
3427   int start=0;
3428   int end=0;
3429   for(std::vector<int>::reverse_iterator it=levs.rbegin();it!=levs.rend();it++)
3430     {
3431       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*it);
3432       std::vector<int> code1=m->getDistributionOfTypes();
3433       end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code1,start);
3434       oldCode.insert(oldCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3435       bool hasChanged=m->unPolyze();
3436       DataArrayInt *fake=0;
3437       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart=m->getLevArrPerCellTypes(MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER,
3438           MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER+MEDCouplingUMesh::N_MEDMEM_ORDER,fake);
3439       fake->decrRef();
3440       renumCellsSplited.push_back(o2nCellsPart); memorySaverIfThrow.push_back(o2nCellsPart);
3441       if(hasChanged)
3442         {
3443           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart2=o2nCellsPart->buildPermArrPerLevel();
3444           m->renumberCells(o2nCellsPart2->getConstPointer(),false);
3445           ret=true;
3446           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famField2,numField2;
3447           const DataArrayInt *famField=getFamilyFieldAtLevel(*it); if(famField) { famField->incrRef(); famField2=const_cast<DataArrayInt *>(famField); }
3448           const DataArrayInt *numField=getNumberFieldAtLevel(*it); if(numField) { numField->incrRef(); numField2=const_cast<DataArrayInt *>(numField); }
3449           setMeshAtLevel(*it,m);
3450           std::vector<int> code2=m->getDistributionOfTypes();
3451           end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code2,start);
3452           newCode.insert(newCode.end(),code2.begin(),code2.end());
3453           //
3454           if(o2nCellsPart2->isIdentity())
3455             continue;
3456           if(famField)
3457             {
3458               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamField=famField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3459               setFamilyFieldArr(*it,newFamField);
3460             }
3461           if(numField)
3462             {
3463               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumField=numField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3464               setRenumFieldArr(*it,newNumField);
3465             }
3466         }
3467       else
3468         {
3469           newCode.insert(newCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3470         }
3471       start=end;
3472     }
3473   if(ret)
3474     {
3475       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> renumCells=DataArrayInt::Aggregate(renumCellsSplited);
3476       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nRenumCellRet=renumCells->buildPermArrPerLevel();
3477       o2nRenumCell=o2nRenumCellRet.retn();
3478     }
3479   return ret;
3480 }
3481
3482 struct MEDLoaderAccVisit1
3483 {
3484   MEDLoaderAccVisit1():_new_nb_of_nodes(0) { }
3485   int operator()(bool val) { return val?_new_nb_of_nodes++:-1; }
3486   int _new_nb_of_nodes;
3487 };
3488
3489 /*!
3490  * Array returned is the correspondance in \b old \b to \b new format. The returned array is newly created and should be dealt by the caller.
3491  * The maximum value stored in returned array is the number of nodes of \a this minus 1 after call of this method.
3492  * The size of returned array is the number of nodes of the old (previous to the call of this method) number of nodes.
3493  * -1 values in returned array means that the corresponding old node is no more used.
3494  *
3495  * \return newly allocated array containing correspondance in \b old \b to \b new format. If all nodes in \a this are fetched \c NULL pointer is returned and nothing
3496  *         is modified in \a this.
3497  * \throw If no coordinates are set in \a this or if there is in any available mesh in \a this a cell having a nodal connectivity containing a node id not in the range of
3498  *  set coordinates.
3499  */
3500 DataArrayInt *MEDFileUMesh::zipCoords()
3501 {
3502   const DataArrayDouble *coo(getCoords());
3503   if(!coo)
3504     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::zipCoords : no coordinates set in this !");
3505   int nbOfNodes(coo->getNumberOfTuples());
3506   std::vector<bool> nodeIdsInUse(nbOfNodes,false);
3507   std::vector<int> neLevs(getNonEmptyLevels());
3508   for(std::vector<int>::const_iterator lev=neLevs.begin();lev!=neLevs.end();lev++)
3509     {
3510       const MEDFileUMeshSplitL1 *zeLev(getMeshAtLevSafe(*lev));
3511       if(zeLev->isMeshStoredSplitByType())
3512         {
3513           std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> ms(zeLev->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes());
3514           for(std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3515             if(*it)
3516               (*it)->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3517         }
3518       else
3519         {
3520           zeLev->getWholeMesh(false)->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3521         }
3522     }
3523   int nbrOfNodesInUse((int)std::count(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),true));
3524   if(nbrOfNodesInUse==nbOfNodes)
3525     return 0;//no need to update _part_coords
3526   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New()); ret->alloc(nbOfNodes,1);
3527   std::transform(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),ret->getPointer(),MEDLoaderAccVisit1());
3528   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2(ret->invertArrayO2N2N2OBis(nbrOfNodesInUse));
3529   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> newCoords(coo->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3530   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamCoords;
3531   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> newNameCoords;
3532   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
3533     newFamCoords=_fam_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3534   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumCoords;
3535   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3536     newNumCoords=_num_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3537   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
3538     newNameCoords=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_name_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3539   _coords=newCoords; _fam_coords=newFamCoords; _num_coords=newNumCoords; _name_coords=newNameCoords; _rev_num_coords=0;
3540   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3541     {
3542       if((MEDFileUMeshSplitL1*)*it)
3543         (*it)->renumberNodesInConn(ret->begin());
3544     }
3545   // updates _part_coords
3546   const PartDefinition *pc(_part_coords);
3547   if(pc)
3548     {
3549       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<PartDefinition> tmpPD(DataArrayPartDefinition::New(ret2));
3550       _part_coords=tmpPD->composeWith(pc);
3551     }
3552   return ret.retn();
3553 }
3554
3555 /*!
3556  * Adds a group of nodes to \a this mesh.
3557  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3558  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3559  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3560  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3561  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3562  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3563  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3564  */
3565 void MEDFileUMesh::addNodeGroup(const DataArrayInt *ids)
3566 {
3567   const DataArrayDouble *coords=_coords;
3568   if(!coords)
3569     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addNodeGroup : no coords set !");
3570   int nbOfNodes=coords->getNumberOfTuples();
3571   if(!((DataArrayInt *)_fam_coords))
3572     { _fam_coords=DataArrayInt::New(); _fam_coords->alloc(nbOfNodes,1); _fam_coords->fillWithZero(); }
3573   //
3574   addGroupUnderground(true,ids,_fam_coords);
3575 }
3576
3577 /*!
3578  * Adds a group of nodes/cells/faces/edges to \a this mesh.
3579  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3580  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3581  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3582  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3583  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3584  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3585  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3586  */
3587 void MEDFileUMesh::addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids)
3588 {
3589   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3590   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
3591     { 
3592       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : level " << meshDimRelToMaxExt << " not available ! Should be in ";
3593       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," ")); oss << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3594     }
3595   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3596     { addNodeGroup(ids); return ; }
3597   MEDFileUMeshSplitL1 *lev=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3598   DataArrayInt *fam=lev->getOrCreateAndGetFamilyField();
3599   addGroupUnderground(false,ids,fam);
3600 }
3601
3602 /*!
3603  * \param [in] ids ids and group name of the new group to add. The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3604  * \parma [in,out] famArr family array on level of interest to be renumbered. The input pointer should be not \c NULL (no check of that will be performed)
3605  */
3606 void MEDFileUMesh::addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr)
3607 {
3608   if(!ids)
3609     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : NULL pointer in input !");
3610   std::string grpName(ids->getName());
3611   if(grpName.empty())
3612     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : empty group name ! MED file format do not accept empty group name !");
3613   ids->checkStrictlyMonotonic(true);
3614   famArr->incrRef(); MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famArrTmp(famArr);
3615   std::vector<std::string> grpsNames=getGroupsNames();
3616   if(std::find(grpsNames.begin(),grpsNames.end(),grpName)!=grpsNames.end())
3617     {
3618       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : Group with name \"" << grpName << "\" already exists ! Destroy it before calling this method !";
3619       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3620     }
3621   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > allFamIds=getAllNonNullFamilyIds();
3622   allFamIds.erase(std::find(allFamIds.begin(),allFamIds.end(),famArrTmp));
3623   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=famArr->selectByTupleIdSafe(ids->begin(),ids->end());
3624   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diffFamIds=famIds->getDifferentValues();
3625   std::vector<int> familyIds;
3626   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > idsPerfamiliyIds;
3627   int maxVal=getTheMaxAbsFamilyId()+1;
3628   std::map<std::string,int> families(_families);
3629   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
3630   std::vector<std::string> fams;
3631   bool created(false);
3632   for(const int *famId=diffFamIds->begin();famId!=diffFamIds->end();famId++)
3633     {
3634       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2Tmp=famIds->getIdsEqual(*famId);
3635       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->selectByTupleId(ids2Tmp->begin(),ids2Tmp->end());
3636       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids1=famArr->getIdsEqual(*famId);
3637       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret0(ids1->buildSubstractionOptimized(ids2));
3638       if(ret0->empty())
3639         {
3640           bool isFamPresent=false;
3641           for(std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >::const_iterator itl=allFamIds.begin();itl!=allFamIds.end() && !isFamPresent;itl++)
3642             isFamPresent=(*itl)->presenceOfValue(*famId);
3643           if(!isFamPresent)
3644             { familyIds.push_back(*famId); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); fams.push_back(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,*famId,created)); } // adding *famId in grp
3645           else
3646             {
3647               familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);
3648               std::string locFamName=FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created);
3649               fams.push_back(locFamName);
3650               if(existsFamily(*famId))
3651                 {
3652                   std::string locFamName2=getFamilyNameGivenId(*famId); std::vector<std::string> v(2); v[0]=locFamName2; v[1]=locFamName;
3653                   ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3654                 }
3655               maxVal++;
3656             } // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and lie the grp on maxVal
3657         }
3658       else
3659         {
3660           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and on maxVal+1
3661           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);//grp lie only on maxVal+1
3662           std::string n2(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1,created)); fams.push_back(n2);
3663           if(existsFamily(*famId))
3664             {
3665               std::string n1(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created)); std::vector<std::string> v(2); v[0]=n1; v[1]=n2;
3666               ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3667             }
3668           maxVal+=2;
3669         }
3670     }
3671   for(std::size_t i=0;i<familyIds.size();i++)
3672     {
3673       DataArrayInt *da=idsPerfamiliyIds[i];
3674       famArr->setPartOfValuesSimple3(familyIds[i],da->begin(),da->end(),0,1,1);
3675     }
3676   _families=families;
3677   _groups=groups;
3678   _groups[grpName]=fams;
3679 }
3680
3681 /*!
3682  * Changes a name of a family specified by its id.
3683  *  \param [in] id - the id of the family of interest.
3684  *  \param [in] newFamName - the new family name.
3685  *  \throw If no family with the given \a id exists.
3686  */
3687 void MEDFileUMesh::setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName)
3688 {
3689   std::string oldName=getFamilyNameGivenId(id);
3690   _families.erase(oldName);
3691   _families[newFamName]=id;
3692 }
3693
3694 /*!
3695  * Removes a mesh of a given dimension.
3696  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3697  *  \throw If there is no mesh at level \a meshDimRelToMax in \a this mesh.
3698  */
3699 void MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax)
3700 {
3701   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3702   std::vector<int>::const_iterator it=std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax);
3703   if(it==levSet.end())
3704     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel : the requested level is not existing !");
3705   int pos=(-meshDimRelToMax);
3706   _ms[pos]=0;
3707 }
3708
3709 /*!
3710  * Sets a new MEDCoupling1GTUMesh at a given level in \a this mesh.
3711  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3712  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3713  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3714  *         different. 
3715  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3716  *         another node coordinates array.
3717  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3718  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3719  */
3720 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCoupling1GTUMesh *m)
3721 {
3722   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m));
3723   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3724 }
3725
3726 /*!
3727  * Sets a new MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh.
3728  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3729  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3730  *  \param [in] newOrOld - if \c true, cells in \a m are sorted by type to be ready for 
3731  *         writing \a this mesh in a MED file.
3732  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3733  *         different. 
3734  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3735  *         another node coordinates array.
3736  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3737  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3738  */
3739 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld)
3740 {
3741   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld));
3742   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3743 }
3744
3745 MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>& MEDFileUMesh::checkAndGiveEntryInSplitL1(int meshDimRelToMax, MEDCouplingPointSet *m)
3746 {
3747   dealWithTinyInfo(m);
3748   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3749   if(std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax)==levSet.end())
3750     {
3751       if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3752         {
3753           DataArrayDouble *c=m->getCoords();
3754           if(c)
3755             c->incrRef();
3756           _coords=c;
3757         }
3758       if(m->getCoords()!=_coords)
3759         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshAtLevel : Invalid Given Mesh ! The coordinates are not the same ! try to use tryToShareSameCoords !");
3760       int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3761       if(sz>=(int)_ms.size())
3762         _ms.resize(sz);
3763       checkMeshDimCoherency(m->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3764       return _ms[sz-1];
3765     }
3766   else
3767     return _ms[-meshDimRelToMax];
3768 }
3769
3770 /*!
3771  * This method allows to set at once the content of different levels in \a this.
3772  * This method is equivalent to a series of call to MEDFileUMesh::setMeshAtLevel.
3773  *
3774  * \param [in] ms - List of unstructured meshes lying on the same coordinates and having different mesh dimesnion.
3775  * \param [in] renum - the parameter (set to false by default) that tells the beheviour if there is a mesh on \a ms that is not geo type sorted.
3776  *                     If false, an exception ois thrown. If true the mesh is reordered automatically. It is highly recommanded to let this parameter to false.
3777  *
3778  * \throw If \a there is a null pointer in \a ms.
3779  * \sa MEDFileUMesh::setMeshAtLevel
3780  */
3781 void MEDFileUMesh::setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3782 {
3783   if(ms.empty())
3784     return ;
3785   const MEDCouplingUMesh *mRef=ms[0];
3786   if(!mRef)
3787     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in the first element of input meshes !");
3788   std::string name(mRef->getName());
3789   const DataArrayDouble *coo(mRef->getCoords());
3790   std::set<int> s;
3791   int zeDim=-1;
3792   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3793     {
3794       const MEDCouplingUMesh *cur(*it);
3795       if(!cur)
3796         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in input vector of meshes !");
3797       if(coo!=cur->getCoords())
3798         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes do not share the same coordinates !");
3799       int mdim=cur->getMeshDimension();
3800       zeDim=std::max(zeDim,mdim);
3801       if(s.find(mdim)!=s.end())
3802         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes must share the same coordinates pointer, and should have different mesh dimension each other !");
3803     }
3804   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3805     {
3806       int mdim=(*it)->getMeshDimension();
3807       setName((*it)->getName());
3808       setMeshAtLevel(mdim-zeDim,const_cast<MEDCouplingUMesh *>(*it),renum);
3809     }
3810   setName(name);
3811 }
3812
3813 /*!
3814  * Creates one MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh from a sequence of
3815  * meshes each representing a group, and creates corresponding groups in \a this mesh.
3816  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3817  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the mesh and groups at.
3818  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3819  *          create in \a this mesh.
3820  *  \throw If \a ms is empty.
3821  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3822  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3823  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3824  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3825  *         of the given meshes.
3826  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3827  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3828  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3829  */
3830 void MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3831 {
3832   if(ms.empty())
3833     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : expecting a non empty vector !");
3834   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3835   if(sz>=(int)_ms.size())
3836     _ms.resize(sz);
3837   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3838   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3839   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3840     {
3841       coo->incrRef();
3842       _coords=coo;
3843     }
3844   else
3845     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3846       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : coordinates mismatches !");
3847   std::vector<DataArrayInt *> corr;
3848   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,_zipconn_pol,corr);
3849   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr3(corr.begin(),corr.end());
3850   setMeshAtLevel(meshDimRelToMax,m,renum);
3851   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3852   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,true);
3853 }
3854
3855 /*!
3856  * Creates groups at a given level in \a this mesh from a sequence of
3857  * meshes each representing a group.
3858  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3859  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the groups at.
3860  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3861  *         create in \a this mesh.
3862  *  \param [in] renum - if \c true, then the optional numbers of entities are taken into
3863  *         account. 
3864  *  \throw If \a ms is empty.
3865  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3866  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3867  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3868  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3869  *         of the given meshes.
3870  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3871  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3872  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3873  */
3874 void MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3875 {
3876   if(ms.empty())
3877     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : expecting a non empty vector !");
3878   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3879   if(sz>=(int)_ms.size())
3880     _ms.resize(sz);
3881   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3882   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3883   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3884     {
3885       coo->incrRef();
3886       _coords=coo;
3887     }
3888   else
3889     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3890       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : coordinates mismatches !");
3891   MEDCouplingUMesh *m=getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3892   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr(ms.size());
3893   int i=0;
3894   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
3895     {
3896       DataArrayInt *arr=0;
3897       bool test=m->areCellsIncludedIn(*it,_zipconn_pol,arr);
3898       corr[i]=arr;
3899       if(!test)
3900         {
3901           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : mesh #" << i << " is not part of whole mesh !";
3902           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3903         }
3904     }
3905   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3906   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,renum);
3907 }
3908
3909 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const
3910 {
3911   const DataArrayDouble *ret=ms[0]->getCoords();
3912   int mdim=ms[0]->getMeshDimension();
3913   for(unsigned int i=1;i<ms.size();i++)
3914     {
3915       ms[i]->checkCoherency();
3916       if(ms[i]->getCoords()!=ret)
3917         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes must share the same coords !");
3918       if(ms[i]->getMeshDimension()!=mdim)
3919         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes have not same mesh dimension !");
3920     }
3921   return const_cast<DataArrayDouble *>(ret);
3922 }
3923
3924 /*!
3925  * Sets the family field of a given relative dimension.
3926  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
3927  *          the family field is set.
3928  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
3929  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3930  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
3931  */
3932 void MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
3933 {
3934   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3935     {
3936       if(!famArr)
3937         {
3938           _fam_coords=0;
3939           return ;
3940         }
3941       DataArrayDouble *coo(_coords);
3942       if(!coo)
3943         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : the coordinates have not been set !");
3944       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of node family arr ! ");
3945       famArr->incrRef();
3946       _fam_coords=famArr;
3947       return ;
3948     }
3949   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3950     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3951   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3952   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3953     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3954   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3955     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3956   return _ms[traducedRk]->setFamilyArr(famArr);
3957 }
3958
3959 /*!
3960  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
3961  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3962  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
3963  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3964  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
3965  */
3966 void MEDFileUMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
3967 {
3968   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3969     {
3970       if(!renumArr)
3971         {
3972           _num_coords=0;
3973           _rev_num_coords=0;
3974           return ;
3975         }
3976       DataArrayDouble *coo(_coords);
3977       if(!coo)
3978         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumFieldArr : the coordinates have not been set !");
3979       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setRenumArr : Problem in size of node numbering arr ! ");
3980       renumArr->incrRef();
3981       _num_coords=renumArr;
3982       computeRevNum();
3983       return ;
3984     }
3985   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3986     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3987   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3988   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3989     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3990   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3991     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3992   return _ms[traducedRk]->setRenumArr(renumArr);
3993 }
3994
3995 /*!
3996  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
3997  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3998  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
3999  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4000  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4001  */
4002 void MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4003 {
4004   if(meshDimRelToMaxExt==1)
4005     {
4006       if(!nameArr)
4007         {
4008           _name_coords=0;
4009           return ;
4010         }
4011       DataArrayDouble *coo(_coords);
4012       if(!coo)
4013         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : the coordinates have not been set !");
4014       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of node numbering arr ! ");
4015       nameArr->incrRef();
4016       _name_coords=nameArr;
4017       return ;
4018     }
4019   if(meshDimRelToMaxExt>1)
4020     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Dimension request is invalid (>1) !");
4021   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
4022   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
4023     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
4024   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
4025     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
4026   return _ms[traducedRk]->setNameArr(nameArr);
4027 }
4028
4029 void MEDFileUMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4030 {
4031   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4032     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
4033       (*it)->synchronizeTinyInfo(*this);
4034 }
4035
4036 /*!
4037  * This method is called by MEDFileMesh::changeFamilyId. It performs only one part of the family id modification.
4038  */
4039 void MEDFileUMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4040 {
4041   DataArrayInt *arr=_fam_coords;
4042   if(arr)
4043     arr->changeValue(oldId,newId);
4044   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4045     {
4046       MEDFileUMeshSplitL1 *sp=(*it);
4047       if(sp)
4048         {
4049           sp->changeFamilyIdArr(oldId,newId);
4050         }
4051     }
4052 }
4053
4054 std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > MEDFileUMesh::getAllNonNullFamilyIds() const
4055 {
4056   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ret;
4057   const DataArrayInt *da(_fam_coords);
4058   if(da)
4059     { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
4060   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
4061     {
4062       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
4063       if(elt)
4064         {
4065           da=elt->getFamilyField();
4066           if(da)
4067             { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
4068         }
4069     }
4070   return ret;
4071 }
4072
4073 void MEDFileUMesh::computeRevNum() const
4074 {
4075   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
4076     {
4077       int pos;
4078       int maxValue=_num_coords->getMaxValue(pos);
4079       _rev_num_coords=_num_coords->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4080     }
4081 }
4082
4083 std::size_t MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
4084 {
4085   return MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
4086 }
4087
4088 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull() const
4089 {
4090   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildrenWithNull());
4091   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_nodes);
4092   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_nodes);
4093   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes);
4094   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_cells);
4095   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_cells);
4096   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells);
4097   ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_faces);
4098   ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_faces);
4099   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_nodes);
4100   ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces);
4101   ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_cells);
4102   ret.push_back((const MEDCoupling1SGTUMesh*)_faces_if_necessary);
4103   return ret;
4104 }
4105
4106 int MEDFileStructuredMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
4107 {
4108   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4109   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4110     {
4111       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4112       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4113     }
4114   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4115     {
4116       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4117       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4118     }
4119   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4120     {
4121       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4122       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4123     }
4124   return ret;
4125 }
4126
4127 int MEDFileStructuredMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
4128 {
4129   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4130   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4131     {
4132       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4133       ret=std::max(ret,val);
4134     }
4135   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4136     {
4137       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4138       ret=std::max(ret,val);
4139     }
4140   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4141     {
4142       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4143       ret=std::max(ret,val);
4144     }
4145   return ret;
4146 }
4147
4148 int MEDFileStructuredMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
4149 {
4150   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4151   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4152     {
4153       int val=_fam_nodes->getMinValue(tmp);
4154       ret=std::min(ret,val);
4155     }
4156   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4157     {
4158       int val=_fam_cells->getMinValue(tmp);
4159       ret=std::min(ret,val);
4160     }
4161   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4162     {
4163       int val=_fam_faces->getMinValue(tmp);
4164       ret=std::min(ret,val);
4165     }
4166   return ret;
4167 }
4168
4169 bool MEDFileStructuredMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4170 {
4171   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
4172     return false;
4173   const MEDFileStructuredMesh *otherC=dynamic_cast<const  MEDFileStructuredMesh *>(other);
4174   if(!otherC)
4175     {
4176       what="Mesh types differ ! This is structured and other is NOT !";
4177       return false;
4178     }
4179   const DataArrayInt *famc1=_fam_nodes;
4180   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_nodes;
4181   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4182     {
4183       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
4184       return false;
4185     }
4186   if(famc1)
4187     {
4188       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4189       if(!ret)
4190         {
4191           what="Families arr on nodes differ !";
4192           return false;
4193         }
4194     }
4195   famc1=_fam_cells;
4196   famc2=otherC->_fam_cells;
4197   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4198     {
4199       what="Mismatch of families arr on cells ! One is defined and not other !";
4200       return false;
4201     }
4202   if(famc1)
4203     {
4204       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4205       if(!ret)
4206         {
4207           what="Families arr on cells differ !";
4208           return false;
4209         }
4210     }
4211   famc1=_fam_faces;
4212   famc2=otherC->_fam_faces;
4213   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4214     {
4215       what="Mismatch of families arr on faces ! One is defined and not other !";
4216       return false;
4217     }
4218   if(famc1)
4219     {
4220       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4221       if(!ret)
4222         {
4223           what="Families arr on faces differ !";
4224           return false;
4225         }
4226     }
4227   famc1=_num_nodes;
4228   famc2=otherC->_num_nodes;
4229   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4230     {
4231       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
4232       return false;
4233     }
4234   if(famc1)
4235     {
4236       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4237       if(!ret)
4238         {
4239           what="Numbering arr on nodes differ !";
4240           return false;
4241         }
4242     }
4243   famc1=_num_cells;
4244   famc2=otherC->_num_cells;
4245   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4246     {
4247       what="Mismatch of numbering arr on cells ! One is defined and not other !";
4248       return false;
4249     }
4250   if(famc1)
4251     {
4252       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4253       if(!ret)
4254         {
4255           what="Numbering arr on cells differ !";
4256           return false;
4257         }
4258     }
4259   famc1=_num_faces;
4260   famc2=otherC->_num_faces;
4261   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4262     {
4263       what="Mismatch of numbering arr on faces ! One is defined and not other !";
4264       return false;
4265     }
4266   if(famc1)
4267     {
4268       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4269       if(!ret)
4270         {
4271           what="Numbering arr on faces differ !";
4272           return false;
4273         }
4274     }
4275   const DataArrayAsciiChar *d1=_names_cells;
4276   const DataArrayAsciiChar *d2=otherC->_names_cells;
4277   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4278     {
4279       what="Mismatch of naming arr on cells ! One is defined and not other !";
4280       return false;
4281     }
4282   if(d1)
4283     {
4284       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4285       if(!ret)
4286         {
4287           what="Naming arr on cells differ !";
4288           return false;
4289         }
4290     }
4291   d1=_names_faces;
4292   d2=otherC->_names_faces;
4293   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4294     {
4295       what="Mismatch of naming arr on faces ! One is defined and not other !";
4296       return false;
4297     }
4298   if(d1)
4299     {
4300       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4301       if(!ret)
4302         {
4303           what="Naming arr on faces differ !";
4304           return false;
4305         }
4306     }
4307   d1=_names_nodes;
4308   d2=otherC->_names_nodes;
4309   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4310     {
4311       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
4312       return false;
4313     }
4314   if(d1)
4315     {
4316       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4317       if(!ret)
4318         {
4319           what="Naming arr on nodes differ !";
4320           return false;
4321         }
4322     }
4323   return true;
4324 }
4325
4326 void MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4327 {
4328   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
4329   const DataArrayInt *tmp=_fam_nodes;
4330   if(tmp)
4331     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4332   tmp=_num_nodes;
4333   if(tmp)
4334     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4335   tmp=_fam_cells;
4336   if(tmp)
4337     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4338   tmp=_num_cells;
4339   if(tmp)
4340     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4341   tmp=_fam_faces;
4342   if(tmp)
4343     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4344   tmp=_num_faces;
4345   if(tmp)
4346     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4347 }
4348
4349 /*!
4350  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
4351  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
4352  *          are required.
4353  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
4354  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
4355  *          returned instead of ids.
4356  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
4357  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
4358  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
4359  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
4360  */
4361 DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
4362 {
4363   std::vector<int> famIds(getFamiliesIds(fams));
4364   switch(meshDimRelToMaxExt)
4365   {
4366     case 1:
4367       {
4368         if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4369           {
4370             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4371             if(!famIds.empty())
4372               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4373             else
4374               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(0,0);
4375             if(renum)
4376               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_nodes,da);
4377             else
4378               return da.retn();
4379           }
4380         else
4381           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
4382         break;
4383       }
4384     case 0:
4385       {
4386         if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4387           {
4388             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4389             if(!famIds.empty())
4390               da=_fam_cells->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4391             else
4392               da=_fam_cells->getIdsEqualList(0,0);
4393             if(renum)
4394               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_cells,da);
4395             else
4396               return da.retn();
4397           }
4398         else
4399           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on cells !");
4400         break;
4401       }
4402     case -1:
4403       {
4404         if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4405           {
4406             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4407             if(!famIds.empty())
4408               da=_fam_faces->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4409             else
4410               da=_fam_faces->getIdsEqualList(0,0);
4411             if(renum)
4412               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_faces,da);
4413             else
4414               return da.retn();
4415           }
4416         else
4417           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on faces !");
4418         break;
4419       }
4420     default:
4421       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : input meshDimRelative must be in [0,1,-1] !");
4422   }
4423   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : unmanaged case !");
4424 }
4425
4426 /*!
4427  * Sets the family field of a given relative dimension.
4428  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4429  *          the family field is set.
4430  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4431  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4432  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4433  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1 and \a meshDimRelToMaxExt != -1.
4434  */
4435 void MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
4436 {
4437   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4438   if(!mesh)
4439     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set family array !");
4440   switch(meshDimRelToMaxExt)
4441   {
4442     case 0:
4443       {
4444         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4445         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4446         _fam_cells=famArr;
4447         break;
4448       }
4449     case 1:
4450       {
4451         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4452         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4453         _fam_nodes=famArr;
4454         break;
4455       }
4456     case -1:
4457       {
4458         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4459         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4460         _fam_faces=famArr;
4461         break;
4462       }
4463     default:
4464       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4465   }
4466   if(famArr)
4467     famArr->incrRef();
4468 }
4469
4470 /*!
4471  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4472  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4473  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4474  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4475  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4476  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4477  */
4478 void MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
4479 {
4480   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4481   if(!mesh)
4482     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set number array !");
4483   switch(meshDimRelToMaxExt)
4484   {
4485     case 0:
4486       {
4487         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4488         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4489         _num_cells=renumArr;
4490         break;
4491       }
4492     case 1:
4493       {
4494         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4495         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4496         _num_nodes=renumArr;
4497         break;
4498       }
4499     case -1:
4500       {
4501         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4502         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4503         _num_faces=renumArr;
4504         break;
4505       }
4506     default:
4507       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4508   }
4509   if(renumArr)
4510     renumArr->incrRef();
4511 }
4512
4513 /*!
4514  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4515  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4516  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4517  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4518  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4519  */
4520 void MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4521 {
4522   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4523   if(!mesh)
4524     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : no structured mesh specified ! Impossible to set names array !");
4525   switch(meshDimRelToMaxExt)
4526   {
4527     case 0:
4528       {
4529         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4530         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4531         _names_cells=nameArr;
4532         break;
4533       }
4534     case 1:
4535       {
4536         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4537         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4538         _names_nodes=nameArr;
4539         break;
4540       }
4541     case -1:
4542       {
4543         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4544         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4545         _names_cells=nameArr;
4546       }
4547     default:
4548       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4549   }
4550   if(nameArr)
4551     nameArr->incrRef();
4552 }
4553
4554 /*!
4555  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
4556  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4557  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
4558  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
4559  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4560  */
4561 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4562 {
4563   switch(meshDimRelToMaxExt)
4564   {
4565     case 0:
4566       return _fam_cells;
4567     case 1:
4568       return _fam_nodes;
4569     case -1:
4570       return _fam_faces;
4571     default:
4572       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4573   }
4574 }
4575
4576 /*!
4577  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4578  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4579  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
4580  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4581  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4582  */
4583 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4584 {
4585   switch(meshDimRelToMaxExt)
4586   {
4587     case 0:
4588       return _num_cells;
4589     case 1:
4590       return _num_nodes;
4591     case -1:
4592       return _num_faces;
4593     default:
4594       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4595   }
4596 }
4597
4598 /*!
4599  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
4600  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4601  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4602  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
4603  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4604  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4605  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4606  */
4607 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4608 {
4609   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4610     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4611   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4612     {
4613       if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4614         {
4615           int pos;
4616           int maxValue=_num_cells->getMaxValue(pos);
4617           _rev_num_cells=_num_cells->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4618           return _rev_num_cells;
4619         }
4620       else
4621         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no cell renumbering for a request on reverse numbering !");
4622     }
4623   else
4624     {
4625       if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4626         {
4627           int pos;
4628           int maxValue=_num_nodes->getMaxValue(pos);
4629           _rev_num_nodes=_num_nodes->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4630           return _rev_num_nodes;
4631         }
4632       else
4633         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no node renumbering for a request on reverse numbering !");
4634     }
4635 }
4636
4637 const DataArrayAsciiChar *MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4638 {
4639   switch(meshDimRelToMaxExt)
4640   {
4641     case 0:
4642       return _names_cells;
4643     case 1:
4644       return _names_nodes;
4645     case -1:
4646       return _names_faces;
4647     default:
4648       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4649   }
4650 }
4651
4652 /*!
4653  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
4654  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [0].
4655  */
4656 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevels() const
4657 {
4658   std::vector<int> ret(1);
4659   return ret;
4660 }
4661
4662 /*!
4663  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
4664  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [1,0].
4665  */
4666 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
4667 {
4668   std::vector<int> ret(2);
4669   ret[0]=1;
4670   return ret;
4671 }
4672
4673 /*!
4674  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL family arr are defined.
4675  */
4676 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
4677 {
4678   std::vector<int> ret;
4679   const DataArrayInt *famNodes(_fam_nodes),*famCells(_fam_cells),*famFaces(_fam_faces);
4680   if(famNodes)
4681     ret.push_back(1);
4682   if(famCells)
4683     ret.push_back(0);
4684   if(famFaces)
4685     ret.push_back(-1);
4686   return ret;
4687 }
4688
4689 /*!
4690  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL numbering arr are defined.
4691  */
4692 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
4693 {
4694   std::vector<int> ret;
4695   const DataArrayInt *numNodes(_num_nodes),*numCells(_num_cells),*numFaces(_num_faces);
4696   if(numNodes)
4697     ret.push_back(1);
4698   if(numCells)
4699     ret.push_back(0);
4700   if(numFaces)
4701     ret.push_back(-1);
4702   return ret;
4703 }
4704
4705 /*!
4706  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL naming arr are defined.
4707  */
4708 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
4709 {
4710   std::vector<int> ret;
4711   const DataArrayAsciiChar *namesNodes(_names_nodes),*namesCells(_names_cells),*namesFaces(_names_faces);
4712   if(namesNodes)
4713     ret.push_back(1);
4714   if(namesCells)
4715     ret.push_back(0);
4716   if(namesFaces)
4717     ret.push_back(-1);
4718   return ret;
4719 }
4720
4721 /*!
4722  * no implementation here, it is not a bug, but intresically no polyhedra in \a this.
4723  */
4724 bool MEDFileStructuredMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
4725 {
4726   oldCode.clear(); newCode.clear(); o2nRenumCell=0;
4727   return false;
4728 }
4729
4730 void MEDFileStructuredMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4731 {
4732   DataArrayInt *arr=_fam_nodes;
4733   if(arr)
4734     arr->changeValue(oldId,newId);
4735   arr=_fam_cells;
4736   if(arr)
4737     arr->changeValue(oldId,newId);
4738   arr=_fam_faces;
4739   if(arr)
4740     arr->changeValue(oldId,newId);
4741 }
4742
4743 void MEDFileStructuredMesh::deepCpyAttributes()
4744 {
4745   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
4746     _fam_nodes=_fam_nodes->deepCpy();
4747   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
4748     _num_nodes=_num_nodes->deepCpy();
4749   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_nodes)
4750     _names_nodes=_names_nodes->deepCpy();
4751   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
4752     _fam_cells=_fam_cells->deepCpy();
4753   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
4754     _num_cells=_num_cells->deepCpy();
4755   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_cells)
4756     _names_cells=_names_cells->deepCpy();
4757   if((const DataArrayInt*)_fam_faces)
4758     _fam_faces=_fam_faces->deepCpy();
4759   if((const DataArrayInt*)_num_faces)
4760     _num_faces=_num_faces->deepCpy();
4761   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_faces)
4762     _names_faces=_names_faces->deepCpy();
4763   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
4764     _rev_num_nodes=_rev_num_nodes->deepCpy();
4765   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
4766     _rev_num_cells=_rev_num_cells->deepCpy();
4767 }
4768
4769 /*!
4770  * Returns a pointer to mesh at the specified level (here 0 is compulsary for cartesian mesh).
4771  * 
4772  * \return a pointer to cartesian mesh that need to be managed by the caller.
4773  * \warning the returned pointer has to be managed by the caller.
4774  */
4775
4776 /*!
4777  * Returns a pointer to MEDCouplingStructuredMesh held by \a this. 
4778  *  \param [in] meshDimRelToMax - it must be \c 0 or \c -1.
4779  *  \param [in] renum - it must be \c false.
4780  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingMesh that the caller is to
4781  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
4782  */
4783 MEDCouplingMesh *MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
4784 {
4785   if(renum)
4786     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support renumbering ! To do it perform request of renum array directly !");
4787   const MEDCouplingStructuredMesh *m(getStructuredMesh());
4788   switch(meshDimRelToMax)
4789   {
4790     case 0:
4791       {
4792         if(m)
4793           m->incrRef();
4794         return const_cast<MEDCouplingStructuredMesh *>(m);
4795       }
4796     case -1:
4797       {
4798         if(!m)
4799           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel : level -1 requested must be non empty to be able to compute unstructured sub mesh !");
4800         buildMinusOneImplicitPartIfNeeded();
4801         MEDCouplingMesh *ret(_faces_if_necessary);
4802         if(ret)
4803           ret->incrRef();
4804         return ret;
4805       }
4806     default:
4807       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support multi level for mesh 0 expected as input !");
4808   }
4809 }
4810
4811 /*!
4812  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
4813  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
4814  *  \return int - the number of entities.
4815  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
4816  */
4817 int MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4818 {
4819   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4820   if(!cmesh)
4821     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : No structured mesh set !");
4822   switch(meshDimRelToMaxExt)
4823   {
4824     case 0:
4825       return cmesh->getNumberOfCells();
4826     case 1:
4827       return cmesh->getNumberOfNodes();
4828     case -1:
4829       return cmesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4830     default:
4831       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4832   }
4833 }
4834
4835 int MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes() const
4836 {
4837   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4838   if(!cmesh)
4839     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes : no cartesian mesh set !");
4840   return cmesh->getNumberOfNodes();
4841 }
4842
4843 bool MEDFileStructuredMesh::hasImplicitPart() const
4844 {
4845   return true;
4846 }
4847
4848 /*!
4849  * \sa MEDFileStructuredMesh::getImplicitFaceMesh
4850  */
4851 int MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
4852 {
4853   static const char MSG[]="MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny : the given geo type is not manageable by a structured mesh !";
4854   const MEDCoupling1SGTUMesh *zeFaceMesh(_faces_if_necessary);
4855   if(!zeFaceMesh)
4856     {
4857       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension())));
4858       if(cm.getReverseExtrudedType()!=gt)
4859         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
4860       buildImplicitPart();
4861       return getStructuredMesh()->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4862     }
4863   else
4864     {
4865       if(gt!=zeFaceMesh->getCellModelEnum())
4866         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
4867       return zeFaceMesh->getNumberOfCells();
4868     }
4869 }
4870
4871 void MEDFileStructuredMesh::buildMinusOneImplicitPartIfNeeded() const
4872 {
4873   const MEDCoupling1SGTUMesh *zeFaceMesh(_faces_if_necessary);
4874   if(!zeFaceMesh)
4875     buildImplicitPart();
4876 }
4877
4878 void MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPart() const
4879 {
4880   const MEDCouplingStructuredMesh *mcmesh(getStructuredMesh());
4881   if(!mcmesh)
4882     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPart : Unable to build the implicit part of structured mesh because no structured mesh at level 0 defined !");
4883   _faces_if_necessary=mcmesh->build1SGTSubLevelMesh();
4884 }
4885
4886 void MEDFileStructuredMesh::releaseImplicitPartIfAny() const
4887 {
4888   _faces_if_necessary=0;
4889 }
4890
4891 /*!
4892  * Retrieves the internal pointer (no decrRef requested) of the implicit face mesh if any.
4893  * To force to build it you can invoke MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny method.
4894  * 
4895  * \sa MEDFileStructuredMesh::buildImplicitPartIfAny
4896  */
4897 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDFileStructuredMesh::getImplicitFaceMesh() const
4898 {
4899   return _faces_if_necessary;
4900 }
4901
4902 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
4903 {
4904   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4905   if(!cmesh)
4906     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : No structured mesh set !");
4907   switch(meshDimRelToMax)
4908   {
4909     case 0:
4910       {
4911         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,cmesh->getTypeOfCell(0));
4912         return ret;
4913       }
4914     case -1:
4915       {
4916         int mdim(cmesh->getMeshDimension());
4917         if(mdim<1)
4918           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only one level available for structured meshes ! Input 0 is mandatory or 0D mesh !");
4919         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(mdim-1));
4920         return ret;
4921       }
4922     default:
4923       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only 2 levels available at most : 0 and -1 !");
4924   }
4925 }
4926
4927 void MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
4928 {
4929   if(st.getNumberOfItems()!=1)
4930     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
4931   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
4932     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
4933   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
4934     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
4935   if(st[0].getPflName().empty())
4936     {
4937       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
4938       return ;
4939     }
4940   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[0].getPflName()));
4941   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
4942   int sz(nodesFetched.size());
4943   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
4944     {
4945       std::vector<int> conn;
4946       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
4947       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
4948         if(*it>=0 && *it<sz)
4949           nodesFetched[*it]=true;
4950         else
4951           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
4952     }
4953 }
4954
4955 med_geometry_type MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim)
4956 {
4957   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ct(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim));
4958   return typmai3[ct];
4959 }
4960
4961 void MEDFileStructuredMesh::LoadStrMeshDAFromFile(med_idt fid, int meshDim, int dt, int it, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs,
4962                                                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& famCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& numCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar>& namesCells)
4963 {
4964   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
4965   med_geometry_type geoTypeReq=MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4966   int nbOfElt(0);
4967   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4968   if(nbOfElt>0)
4969     {
4970       if(!mrs || mrs->isCellFamilyFieldReading())
4971         {
4972           famCells=DataArrayInt::New();
4973           famCells->alloc(nbOfElt,1);
4974           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,famCells->getPointer());
4975         }
4976     }
4977   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4978   if(nbOfElt>0)
4979     {
4980       if(!mrs || mrs->isCellNumFieldReading())
4981         {
4982           numCells=DataArrayInt::New();
4983           numCells->alloc(nbOfElt,1);
4984           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,numCells->getPointer());
4985         }
4986     }
4987   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4988   if(nbOfElt>0)
4989     {
4990       if(!mrs || mrs->isCellNameFieldReading())
4991         {
4992           namesCells=DataArrayAsciiChar::New();
4993           namesCells->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4994           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,namesCells->getPointer());
4995           namesCells->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4996         }
4997     }
4998 }
4999
5000 void MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5001 {
5002   setName(strm->getName());
5003   setDescription(strm->getDescription());
5004   setUnivName(strm->getUnivName());
5005   setIteration(strm->getIteration());
5006   setOrder(strm->getOrder());
5007   setTimeValue(strm->getTime());
5008   setTimeUnit(strm->getTimeUnit());
5009   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
5010   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
5011   int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5012   if(nbOfElt>0)
5013     {
5014       if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
5015         {
5016           int nbNodes(getNumberOfNodes());
5017           if(nbOfElt>nbNodes)
5018             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile : invalid size of family node array regarding number of nodes in this ! File seems to be corrupted !");
5019           _fam_nodes=DataArrayInt::New();
5020           _fam_nodes->alloc(nbNodes,1);//yes nbNodes and not nbOfElt see next line.
5021           if(nbNodes>nbOfElt)//yes it appends some times... It explains surely the mdump implementation. Bug revealed by PARAVIS EDF #2475 on structured.med file where only 12 first nodes are !=0 so nbOfElt=12 and nbOfNodes=378...
5022             _fam_nodes->fillWithZero();
5023           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getPointer());
5024         }
5025     }
5026   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5027   if(nbOfElt>0)
5028     {
5029       if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
5030         {
5031           _num_nodes=DataArrayInt::New();
5032           _num_nodes->alloc(nbOfElt,1);
5033           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getPointer());
5034         }
5035     }
5036   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
5037   if(nbOfElt>0)
5038     {
5039       if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
5040         {
5041           _names_nodes=DataArrayAsciiChar::New();
5042           _names_nodes->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5043           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getPointer());
5044           _names_nodes->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
5045         }
5046     }
5047   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
5048   LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim,dt,it,mName,mrs,_fam_cells,_num_cells,_names_cells);
5049   if(meshDim>=1)
5050     LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim-1,dt,it,mName,mrs,_fam_faces,_num_faces,_names_faces);
5051 }
5052
5053 void MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(med_idt fid, const std::string& maa) const
5054 {
5055   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
5056   med_geometry_type geoTypeReq(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim)),geoTypeReq2(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim-1));
5057   //
5058   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
5059     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getNumberOfTuples(),_fam_cells->getConstPointer());
5060   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
5061     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_fam_faces->getNumberOfTuples(),_fam_faces->getConstPointer());
5062   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
5063     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getNumberOfTuples(),_fam_nodes->getConstPointer());
5064   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
5065     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getNumberOfTuples(),_num_cells->getConstPointer());
5066   if((const DataArrayInt *)_num_faces)
5067     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_num_faces->getNumberOfTuples(),_num_faces->getConstPointer());
5068   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
5069     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getNumberOfTuples(),_num_nodes->getConstPointer());
5070   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
5071     {
5072       if(_names_cells->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5073         {
5074           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on cells with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5075           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
5076           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5077         }
5078       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getNumberOfTuples(),_names_cells->getConstPointer());
5079     }
5080   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces)
5081     {
5082       if(_names_faces->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5083         {
5084           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on faces with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5085           oss << " ! The array has " << _names_faces->getNumberOfComponents() << " components !";
5086           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5087         }
5088       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_names_faces->getNumberOfTuples(),_names_faces->getConstPointer());
5089     }
5090   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
5091     {
5092       if(_names_nodes->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
5093         {
5094           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
5095           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
5096           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5097         }
5098       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getNumberOfTuples(),_names_nodes->getConstPointer());
5099     }
5100   //
5101   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa.c_str(),_families,_groups,_too_long_str);
5102 }
5103
5104 /*!
5105  * Returns an empty instance of MEDFileCMesh.
5106  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5107  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5108  */
5109 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New()
5110 {
5111   return new MEDFileCMesh;
5112 }
5113
5114 /*!
5115  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
5116  * file. The first mesh in the file is loaded.
5117  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
5118  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5119  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5120  *  \throw If the file is not readable.
5121  *  \throw If there is no meshes in the file.
5122  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
5123  */
5124 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5125 {
5126   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5127   if(ms.empty())
5128     {
5129       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5130       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5131     }
5132   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5133   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5134   int dt,it;
5135   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5136   std::string dummy2;
5137   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5138   return new MEDFileCMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5139 }
5140
5141 /*!
5142  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
5143  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
5144  * iteration.
5145  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
5146  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
5147  *  \param [in] dt - the number of a time step.
5148  *  \param [in] it - the number of an iteration.
5149  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
5150  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
5151  *  \throw If the file is not readable.
5152  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
5153  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
5154  */
5155 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5156 {
5157   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5158   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5159   return new MEDFileCMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5160 }
5161
5162 std::size_t MEDFileCMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5163 {
5164   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5165 }
5166
5167 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCMesh::getDirectChildrenWithNull() const
5168 {
5169   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull());
5170   ret.push_back((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh);
5171   return ret;
5172 }
5173
5174 /*!
5175  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
5176  *  \return int - the mesh dimension.
5177  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5178  */
5179 int MEDFileCMesh::getMeshDimension() const
5180 {
5181   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5182     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5183   return _cmesh->getMeshDimension();
5184 }
5185
5186 /*!
5187  * Returns the dimension on nodes in \a this mesh.
5188  *  \return int - the space dimension.
5189  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5190  */
5191 int MEDFileCMesh::getSpaceDimension() const
5192 {
5193   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5194     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getSpaceDimension : unable to get spacedimension because no mesh set !");
5195   return _cmesh->getSpaceDimension();
5196 }
5197
5198 /*!
5199  * Returns a string describing \a this mesh.
5200  *  \return std::string - the mesh information string.
5201  */
5202 std::string MEDFileCMesh::simpleRepr() const
5203 {
5204   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5205 }
5206
5207 /*!
5208  * Returns a full textual description of \a this mesh.
5209  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
5210  */
5211 std::string MEDFileCMesh::advancedRepr() const
5212 {
5213   return simpleRepr();
5214 }
5215
5216 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::shallowCpy() const
5217 {
5218   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5219   return ret.retn();
5220 }
5221
5222 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::createNewEmpty() const
5223 {
5224   return new MEDFileCMesh;
5225 }
5226
5227 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::deepCpy() const
5228 {
5229   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5230   if((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh)
5231     ret->_cmesh=static_cast<MEDCouplingCMesh*>(_cmesh->deepCpy());
5232   ret->deepCpyAttributes();
5233   return ret.retn();
5234 }
5235
5236 /*!
5237  * Checks if \a this and another mesh are equal.
5238  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
5239  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
5240  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
5241  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
5242  */
5243 bool MEDFileCMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5244 {
5245   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5246     return false;
5247   const MEDFileCMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(other);
5248   if(!otherC)
5249     {
5250       what="Mesh types differ ! This is cartesian and other is NOT !";
5251       return false;
5252     }
5253   clearNonDiscrAttributes();
5254   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5255   const MEDCouplingCMesh *coo1=_cmesh;
5256   const MEDCouplingCMesh *coo2=otherC->_cmesh;
5257   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5258     {
5259       what="Mismatch of cartesian meshes ! One is defined and not other !";
5260       return false;
5261     }
5262   if(coo1)
5263     {
5264       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5265       if(!ret)
5266         {
5267           what="cartesian meshes differ !";
5268           return false;
5269         }
5270     }
5271   return true;
5272 }
5273
5274 /*!
5275  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
5276  */
5277 void MEDFileCMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5278 {
5279   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5280   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_cmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5281 }
5282
5283 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh()
5284 {
5285 }
5286
5287 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5288 try
5289 {
5290     loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5291 }
5292 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5293 {
5294     throw e;
5295 }
5296
5297 void MEDFileCMesh::loadCMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5298 {
5299   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5300   int dummy0,dummy1;
5301   std::string dtunit;
5302   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5303   if(meshType!=CARTESIAN)
5304     {
5305       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as cartesian an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT cartesian !";
5306       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5307     }
5308   MEDFileCMeshL2 loaderl2;
5309   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5310   MEDCouplingCMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5311   mesh->incrRef();
5312   _cmesh=mesh;
5313   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5314 }
5315
5316 /*!
5317  * Returns a const pointer to MEDCouplingCMesh held by \a this mesh.
5318  *  \return const MEDCouplingCMesh * - a pointer to the held MEDCouplingCMesh.
5319  */
5320 const MEDCouplingCMesh *MEDFileCMesh::getMesh() const
5321 {
5322   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5323   return _cmesh;
5324 }
5325
5326 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCMesh::getStructuredMesh() const
5327 {
5328   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5329   return _cmesh;
5330 }
5331
5332 /*!
5333  * Sets the MEDCouplingCMesh holding the data of \a this mesh.
5334  *  \param [in] m - the new MEDCouplingCMesh to refer to.
5335  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
5336  *         different. 
5337  */
5338 void MEDFileCMesh::setMesh(MEDCouplingCMesh *m)
5339 {
5340   dealWithTinyInfo(m);
5341   if(m)
5342     m->incrRef();
5343   _cmesh=m;
5344 }
5345
5346 void MEDFileCMesh::writeLL(med_idt fid) const
5347 {
5348   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5349   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5350   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5351   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5352   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5353   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5354   int spaceDim(_cmesh->getSpaceDimension());
5355   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5356   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5357   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5358     {
5359       std::string info(_cmesh->getCoordsAt(i)->getInfoOnComponent(0));
5360       std::string c,u;
5361       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5362       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5363       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5364     }
5365   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,spaceDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5366   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5367   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CARTESIAN_GRID);
5368   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5369     {
5370       const DataArrayDouble *da=_cmesh->getCoordsAt(i);
5371       MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,i+1,da->getNumberOfTuples(),da->getConstPointer());
5372     }
5373   //
5374   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5375   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5376 }
5377
5378 void MEDFileCMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5379 {
5380   const MEDCouplingCMesh *cmesh=_cmesh;
5381   if(!cmesh)
5382     return;
5383   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setName(_name);
5384   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setDescription(_desc_name);
5385   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5386   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5387 }
5388
5389 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New()
5390 {
5391   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5392 }
5393
5394 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5395 {
5396   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5397   if(ms.empty())
5398     {
5399       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5400       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5401     }
5402   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5403   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5404   int dt,it;
5405   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5406   std::string dummy2;
5407   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5408   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5409 }
5410
5411 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5412 {
5413   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5414   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5415   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5416 }
5417
5418 std::size_t MEDFileCurveLinearMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5419 {
5420   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5421 }
5422
5423 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCurveLinearMesh::getDirectChildrenWithNull() const
5424 {
5425   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildrenWithNull());
5426   ret.push_back((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh);
5427   return ret;
5428 }
5429
5430 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::shallowCpy() const
5431 {
5432   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5433   return ret.retn();
5434 }
5435
5436 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::createNewEmpty() const
5437 {
5438   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5439 }
5440
5441 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::deepCpy() const
5442 {
5443   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5444   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh)
5445     ret->_clmesh=static_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh*>(_clmesh->deepCpy());
5446   ret->deepCpyAttributes();
5447   return ret.retn();
5448 }
5449
5450 int MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension() const
5451 {
5452   if(!((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh))
5453     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5454   return _clmesh->getMeshDimension();
5455 }
5456
5457 std::string MEDFileCurveLinearMesh::simpleRepr() const
5458 {
5459   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5460 }
5461
5462 std::string MEDFileCurveLinearMesh::advancedRepr() const
5463 {
5464   return simpleRepr();
5465 }
5466
5467 bool MEDFileCurveLinearMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5468 {
5469   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5470     return false;
5471   const MEDFileCurveLinearMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(other);
5472   if(!otherC)
5473     {
5474       what="Mesh types differ ! This is curve linear and other is NOT !";
5475       return false;
5476     }
5477   clearNonDiscrAttributes();
5478   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5479   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo1=_clmesh;
5480   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo2=otherC->_clmesh;
5481   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5482     {
5483       what="Mismatch of curve linear meshes ! One is defined and not other !";
5484       return false;
5485     }
5486   if(coo1)
5487     {
5488       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5489       if(!ret)
5490         {
5491           what="curve linear meshes differ !";
5492           return false;
5493         }
5494     }
5495   return true;
5496 }
5497
5498 void MEDFileCurveLinearMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5499 {
5500   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5501   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_clmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5502 }
5503
5504 void MEDFileCurveLinearMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5505 {
5506   const MEDCouplingCurveLinearMesh *clmesh=_clmesh;
5507   if(!clmesh)
5508     return;
5509   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setName(_name);
5510   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setDescription(_desc_name);
5511   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5512   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5513 }
5514
5515 const MEDCouplingCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getMesh() const
5516 {
5517   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5518   return _clmesh;
5519 }
5520
5521 void MEDFileCurveLinearMesh::setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m)
5522 {
5523   dealWithTinyInfo(m);
5524   if(m)
5525     m->incrRef();
5526   _clmesh=m;
5527 }
5528
5529 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getStructuredMesh() const
5530 {
5531   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5532   return _clmesh;
5533 }
5534
5535 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh()
5536 {
5537 }
5538
5539 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5540 try
5541 {
5542     loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5543 }
5544 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5545 {
5546     throw e;
5547 }
5548
5549 void MEDFileCurveLinearMesh::writeLL(med_idt fid) const
5550 {
5551   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5552   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5553   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5554   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5555   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5556   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5557   int spaceDim=_clmesh->getSpaceDimension();
5558   int meshDim=_clmesh->getMeshDimension();
5559   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5560   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5561   const DataArrayDouble *coords=_clmesh->getCoords();
5562   if(!coords)
5563     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::writeLL : no coordinates set !");
5564   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5565     {
5566       std::string info(_clmesh->getCoords()->getInfoOnComponent(i));
5567       std::string c,u;
5568       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5569       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5570       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5571     }
5572   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5573   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5574   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CURVILINEAR_GRID);
5575   std::vector<int> nodeGridSt=_clmesh->getNodeGridStructure();
5576   MEDmeshGridStructWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,&nodeGridSt[0]);
5577
5578   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->begin());
5579   //
5580   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5581   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5582 }
5583
5584 void MEDFileCurveLinearMesh::loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5585 {
5586   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5587   int dummy0,dummy1;
5588   std::string dtunit;
5589   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5590   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
5591     {
5592       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as curve linear an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT curve linear !";
5593       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5594     }
5595   MEDFileCLMeshL2 loaderl2;
5596   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5597   MEDCouplingCurveLinearMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5598   mesh->incrRef();
5599   _clmesh=mesh;
5600   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5601 }
5602
5603 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New()
5604 {
5605   return new MEDFileMeshMultiTS;
5606 }
5607
5608 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName)
5609 {
5610   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName);
5611 }
5612
5613 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5614 {
5615   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName,mName);
5616 }
5617
5618 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::deepCpy() const
5619 {
5620   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> ret=MEDFileMeshMultiTS::New();
5621   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > meshOneTs(_mesh_one_ts.size());
5622   std::size_t i=0;
5623   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++,i++)
5624     if((const MEDFileMesh *)*it)
5625       meshOneTs[i]=(*it)->deepCpy();
5626   ret->_mesh_one_ts=meshOneTs;
5627   return ret.retn();
5628 }
5629
5630 std::size_t MEDFileMeshMultiTS::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5631 {
5632   return _mesh_one_ts.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh>);
5633 }
5634
5635 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshMultiTS::getDirectChildrenWithNull() const
5636 {
5637   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5638   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5639     ret.push_back((const MEDFileMesh *)*it);
5640   return ret;
5641 }
5642
5643 std::string MEDFileMeshMultiTS::getName() const
5644 {
5645   if(_mesh_one_ts.empty())
5646     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getName : no time steps set !");
5647   return _mesh_one_ts[0]->getName();
5648 }
5649
5650 void MEDFileMeshMultiTS::setName(const std::string& newMeshName)
5651 {
5652   std::string oldName(getName());
5653   std::vector< std::pair<std::string,std::string> > v(1);
5654   v[0].first=oldName; v[0].second=newMeshName;
5655   changeNames(v);
5656 }
5657
5658 bool MEDFileMeshMultiTS::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5659 {
5660   bool ret=false;
5661   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5662     {
5663       MEDFileMesh *cur(*it);
5664       if(cur)
5665         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5666     }
5667   return ret;
5668 }
5669
5670 MEDFileMesh *MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep() const
5671 {
5672   if(_mesh_one_ts.empty())
5673     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep : empty time step set !");
5674   return const_cast<MEDFileMesh *>(static_cast<const MEDFileMesh *>(_mesh_one_ts[0]));
5675 }
5676
5677 void MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep)
5678 {
5679   if(!mesh1TimeStep)
5680     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep : input pointer should be different from 0 !");
5681   _mesh_one_ts.resize(1);
5682   mesh1TimeStep->incrRef();
5683   //MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> toto=mesh1TimeStep;
5684   _mesh_one_ts[0]=mesh1TimeStep;
5685 }
5686
5687 void MEDFileMeshMultiTS::write(med_idt fid) const
5688 {
5689   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5690     {
5691       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5692       (*it)->write(fid);
5693     }
5694 }
5695
5696 void MEDFileMeshMultiTS::write(const std::string& fileName, int mode) const
5697 {
5698   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5699   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5700   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5701   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5702   write(fid);
5703 }
5704
5705 void MEDFileMeshMultiTS::loadFromFile(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5706 {//for the moment to be improved
5707   _mesh_one_ts.resize(1);
5708   _mesh_one_ts[0]=MEDFileMesh::New(fileName,mName,-1,-1);
5709 }
5710
5711 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS()
5712 {
5713 }
5714
5715 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName)
5716 try
5717 {
5718     std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5719     if(ms.empty())
5720       {
5721         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5722         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5723       }
5724     MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5725     MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5726     int dt,it;
5727     ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5728     std::string dummy2;
5729     MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5730     loadFromFile(fileName,ms.front());
5731 }
5732 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5733 {
5734     throw e;
5735 }
5736
5737 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5738 try
5739 {
5740     loadFromFile(fileName,mName);
5741 }
5742 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5743 {
5744     throw e;
5745 }
5746
5747 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New()
5748 {
5749   return new MEDFileMeshes;
5750 }
5751
5752 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New(const std::string& fileName)
5753 {
5754   return new MEDFileMeshes(fileName);
5755 }
5756
5757 void MEDFileMeshes::write(med_idt fid) const
5758 {
5759   checkCoherency();
5760   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5761     {
5762       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5763       (*it)->write(fid);
5764     }
5765 }
5766
5767 void MEDFileMeshes::write(const std::string& fileName, int mode) const
5768 {
5769   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5770   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5771   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5772   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5773   checkCoherency();
5774   write(fid);
5775 }
5776
5777 int MEDFileMeshes::getNumberOfMeshes() const
5778 {
5779   return _meshes.size();
5780 }
5781
5782 MEDFileMeshesIterator *MEDFileMeshes::iterator()
5783 {
5784   return new MEDFileMeshesIterator(this);
5785 }
5786
5787 /** Return a borrowed reference (caller is not responsible) */
5788 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshAtPos(int i) const
5789 {
5790   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5791     {
5792       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshAtPos : invalid mesh id given in parameter ! Should be in [0;" << _meshes.size() << ") !";
5793       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5794     }
5795   return _meshes[i]->getOneTimeStep();
5796 }
5797
5798 /** Return a borrowed reference (caller is not responsible) */
5799 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshWithName(const std::string& mname) const
5800 {
5801   std::vector<std::string> ms=getMeshesNames();
5802   std::vector<std::string>::iterator it=std::find(ms.begin(),ms.end(),mname);
5803   if(it==ms.end())
5804     {
5805       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshWithName : Mesh  \"" << mname << "\" does not exist in this ! Existing are : ";
5806       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
5807       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5808     }
5809   return getMeshAtPos((int)std::distance(ms.begin(),it));
5810 }
5811
5812 std::vector<std::string> MEDFileMeshes::getMeshesNames() const
5813 {
5814   std::vector<std::string> ret(_meshes.size());
5815   int i=0;
5816   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5817     {
5818       const MEDFileMeshMultiTS *f=(*it);
5819       if(f)
5820         {
5821           ret[i]=f->getName();
5822         }
5823       else
5824         {
5825           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshesNames : At rank #" << i << " mesh is not defined !";
5826           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5827         }
5828     }
5829   return ret;
5830 }
5831
5832 bool MEDFileMeshes::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5833 {
5834   bool ret=false;
5835   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5836     {
5837       MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5838       if(cur)
5839         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5840     }
5841   return ret;
5842 }
5843
5844 void MEDFileMeshes::resize(int newSize)
5845 {
5846   _meshes.resize(newSize);
5847 }
5848
5849 void MEDFileMeshes::pushMesh(MEDFileMesh *mesh)
5850 {
5851   if(!mesh)
5852     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::pushMesh : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5853   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5854   elt->setOneTimeStep(mesh);
5855   _meshes.push_back(elt);
5856 }
5857
5858 void MEDFileMeshes::setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh)
5859 {
5860   if(!mesh)
5861     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::setMeshAtPos : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5862   if(i>=(int)_meshes.size())
5863     _meshes.resize(i+1);
5864   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5865   elt->setOneTimeStep(mesh);
5866   _meshes[i]=elt;
5867 }
5868
5869 void MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos(int i)
5870 {
5871   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5872     {
5873       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos : Invalid given id in input (" << i << ") should be in [0," << _meshes.size() << ") !";
5874       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5875     }
5876   _meshes.erase(_meshes.begin()+i);
5877 }
5878
5879 void MEDFileMeshes::loadFromFile(const std::string& fileName)
5880 {
5881   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5882   int i=0;
5883   _meshes.resize(ms.size());
5884   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
5885     _meshes[i]=MEDFileMeshMultiTS::New(fileName,(*it));
5886 }
5887
5888 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes()
5889 {
5890 }
5891
5892 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes(const std::string& fileName)
5893 try
5894 {
5895     loadFromFile(fileName);
5896 }
5897 catch(INTERP_KERNEL::Exception& /*e*/)
5898 {
5899 }
5900
5901 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::deepCpy() const
5902 {
5903   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > meshes(_meshes.size());
5904   std::size_t i=0;
5905   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5906     if((const MEDFileMeshMultiTS *)*it)
5907       meshes[i]=(*it)->deepCpy();
5908   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> ret=MEDFileMeshes::New();
5909   ret->_meshes=meshes;
5910   return ret.retn();
5911 }
5912
5913 std::size_t MEDFileMeshes::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5914 {
5915   return _meshes.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS>));
5916 }
5917
5918 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshes::getDirectChildrenWithNull() const
5919 {
5920   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5921   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5922     ret.push_back((const MEDFileMeshMultiTS *)*it);
5923   return ret;
5924 }
5925
5926 std::string MEDFileMeshes::simpleRepr() const
5927 {
5928   std::ostringstream oss;
5929   oss << "(*****************)\n(* MEDFileMeshes *)\n(*****************)\n\n";
5930   simpleReprWithoutHeader(oss);
5931   return oss.str();
5932 }
5933
5934 void MEDFileMeshes::simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const
5935 {
5936   int nbOfMeshes=getNumberOfMeshes();
5937   oss << "There are " << nbOfMeshes << " meshes with the following names : \n";
5938   std::vector<std::string> mns=getMeshesNames();
5939   for(int i=0;i<nbOfMeshes;i++)
5940     oss << "  - #" << i << " \"" << mns[i] << "\"\n";
5941 }
5942
5943 void MEDFileMeshes::checkCoherency() const
5944 {
5945   static const char MSG[]="MEDFileMeshes::checkCoherency : mesh at rank ";
5946   int i=0;
5947   std::set<std::string> s;
5948   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5949     {
5950       const MEDFileMeshMultiTS *elt=(*it);
5951       if(!elt)
5952         {
5953           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << "/" << _meshes.size() << " is empty !";
5954           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5955         }
5956       std::size_t sz=s.size();
5957       s.insert(std::string((*it)->getName()));
5958       if(s.size()==sz)
5959         {
5960           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << " has a name (\"" << (*it)->getName() << "\") already used by an another mesh in list !";
5961           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5962         }
5963     }
5964 }
5965
5966 MEDFileMeshesIterator::MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms):_ms(ms),_iter_id(0),_nb_iter(0)
5967 {
5968   if(ms)
5969     {
5970       ms->incrRef();
5971       _nb_iter=ms->getNumberOfMeshes();
5972     }
5973 }
5974
5975 MEDFileMeshesIterator::~MEDFileMeshesIterator()
5976 {
5977 }
5978
5979 MEDFileMesh *MEDFileMeshesIterator::nextt()
5980 {
5981   if(_iter_id<_nb_iter)
5982     {
5983       MEDFileMeshes *ms(_ms);
5984       if(ms)
5985         return ms->getMeshAtPos(_iter_id++);
5986       else
5987         return 0;
5988     }
5989   else
5990     return 0;
5991 }