Salome HOME
638681ece217df4fa087e3b6472d8e042721b061
[tools/medcoupling.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDFileMesh.hxx"
22 #include "MEDFileUtilities.hxx"
23 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
24 #include "MEDFileField.hxx"
25 #include "MEDLoader.hxx"
26 #include "MEDLoaderBase.hxx"
27
28 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
29
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31
32 #include <limits>
33 #include <cmath>
34
35 using namespace ParaMEDMEM;
36
37 const char MEDFileMesh::DFT_FAM_NAME[]="FAMILLE_ZERO";
38
39 MEDFileMesh::MEDFileMesh():_order(-1),_iteration(-1),_time(0.),_univ_wr_status(true)
40 {
41 }
42
43 std::size_t MEDFileMesh::getHeapMemorySize() const
44 {
45   std::size_t ret=_dt_unit.capacity()+_name.capacity()+_univ_name.capacity()+_desc_name.capacity();
46   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
47     {
48       ret+=(*it).first.capacity()+(*it).second.capacity()*sizeof(std::string);
49       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
50         ret+=(*it2).capacity();
51     }
52   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
53     ret+=(*it).first.capacity()+sizeof(int);
54   return ret;
55 }
56
57 /*!
58  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
59  * file. The first mesh in the file is loaded.
60  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
61  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
62  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
63  *  \throw If the file is not readable.
64  *  \throw If there is no meshes in the file.
65  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
66  */
67 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
68 {
69   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
70   if(ms.empty())
71     {
72       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
73       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
74     }
75   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
76   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
77   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
78   int dt,it;
79   std::string dummy2;
80   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
81   switch(meshType)
82     {
83     case UNSTRUCTURED:
84       {
85         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
86         ret->loadUMeshFromFile(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
87         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
88       }
89     case CARTESIAN:
90       {
91         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
92         ret->loadCMeshFromFile(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
93         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
94       }
95     case CURVE_LINEAR:
96       {
97         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
98         ret->loadCLMeshFromFile(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
99         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
100       }
101     default:
102       {
103         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << ms.front() << "' exists but unsupported type yet !";
104         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
105       }
106     }
107 }
108
109 /*!
110  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
111  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
112  * iteration.
113  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
114  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
115  *  \param [in] dt - the number of a time step.
116  *  \param [in] it - the number of an iteration.
117  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
118  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
119  *  \throw If the file is not readable.
120  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
121  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
122  */
123 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
124 {
125   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
126   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
127   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
128   int dummy0,dummy1;
129   std::string dummy2;
130   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
131   switch(meshType)
132     {
133     case UNSTRUCTURED:
134       {
135         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
136         ret->loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
137         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
138       }
139     case CARTESIAN:
140       {
141         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
142         ret->loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
143         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
144       }
145     case CURVE_LINEAR:
146       {
147         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
148         ret->loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
149         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
150       }
151     default:
152       {
153         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << mName << "' exists but unsupported type yet !";
154         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
155       }
156     }
157 }
158
159 /*!
160  * Writes \a this mesh into an open MED file specified by its descriptor.
161  *  \param [in] fid - the MED file descriptor.
162  *  \throw If the mesh name is not set.
163  *  \throw If the file is open for reading only.
164  *  \throw If the writing mode == 1 and the same data is present in an existing file.
165  */
166 void MEDFileMesh::write(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
167 {
168   if(!existsFamily(0))
169     const_cast<MEDFileMesh *>(this)->addFamily(DFT_FAM_NAME,0);
170   if(_name.empty())
171     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh : name is empty. MED file ask for a NON EMPTY name !");
172   writeLL(fid);
173 }
174
175 /*!
176  * Writes \a this mesh into a MED file specified by its name.
177  *  \param [in] fileName - the MED file name.
178  *  \param [in] mode - the writing mode. For more on \a mode, see \ref AdvMEDLoaderBasics.
179  * - 2 - erase; an existing file is removed.
180  * - 1 - append; same data should not be present in an existing file.
181  * - 0 - overwrite; same data present in an existing file is overwritten.
182  *  \throw If the mesh name is not set.
183  *  \throw If \a mode == 1 and the same data is present in an existing file.
184  */
185 void MEDFileMesh::write(const char *fileName, int mode) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
186 {
187   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
188   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,medmod);
189   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
190   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str().c_str());
191   write(fid);
192 }
193
194 /*!
195  * Checks if \a this and another mesh are equal.
196  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
197  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
198  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
199  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
200  */
201 bool MEDFileMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
202 {
203   if(_order!=other->_order)
204     {
205       what="Orders differ !";
206       return false;
207     }
208   if(_iteration!=other->_iteration)
209     {
210       what="Iterations differ !";
211       return false;
212     }
213   if(fabs(_time-other->_time)>eps)
214     {
215       what="Time values differ !";
216       return false;
217     }
218   if(_dt_unit!=other->_dt_unit)
219     {
220       what="Time units differ !";
221       return false;
222     }
223   if(_name!=other->_name)
224     {
225       what="Names differ !";
226       return false;
227     }
228   //univ_name has been ignored -> not a bug because it is a mutable attribute
229   if(_desc_name!=other->_desc_name)
230     {
231       what="Description names differ !";
232       return false;
233     }
234   if(!areGrpsEqual(other,what))
235     return false;
236   if(!areFamsEqual(other,what))
237     return false;
238   return true;
239 }
240
241 /*!
242  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
243  */
244 void MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes() const
245 {
246   
247 }
248
249 bool MEDFileMesh::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
250 {
251   for(std::vector< std::pair<std::string,std::string> >::const_iterator it=modifTab.begin();it!=modifTab.end();it++)
252     {
253       if((*it).first==_name)
254         {
255           _name=(*it).second;
256           return true;
257         }
258     }
259   return false;
260 }
261
262 /*!
263  * Copies data on groups and families from another mesh.
264  *  \param [in] other - the mesh to copy the data from.
265  */
266 void MEDFileMesh::copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other)
267 {
268   _groups=other._groups;
269   _families=other._families;
270 }
271
272 /*!
273  * Returns names of families constituting a group.
274  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
275  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
276  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
277  */
278 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroup(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
279 {
280   std::string oname(name);
281   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
282   if(it==_groups.end())
283     {
284       std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
285       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
286       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
287       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
288     }
289   return (*it).second;
290 }
291
292 /*!
293  * Returns names of families constituting some groups.
294  *  \param [in] grps - a sequence of names of groups of interest.
295  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
296  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
297  */
298 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
299 {
300   std::set<std::string> fams;
301   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++)
302     {
303       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=_groups.find(*it);
304       if(it2==_groups.end())
305         {
306           std::ostringstream oss; oss << "No such group in mesh \"" << _name << "\" : " << *it; 
307           std::vector<std::string> grps2=getGroupsNames(); oss << "\" !\nAvailable groups are :";
308           std::copy(grps2.begin(),grps2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
309           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
310         }
311       fams.insert((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
312     }
313   std::vector<std::string> fams2(fams.begin(),fams.end());
314   return fams2;
315 }
316
317 /*!
318  * Returns ids of families constituting a group.
319  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
320  *  \return std::vector<int> - sequence of ids of the families.
321  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
322  */
323 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIdsOnGroup(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
324 {
325   std::string oname(name);
326   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
327   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
328   if(it==_groups.end())
329     {
330       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
331       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
332       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
333     }
334   return getFamiliesIds((*it).second);
335 }
336
337 /*!
338  * Sets names of families constituting a group. If data on families of this group is
339  * already present, it is overwritten. Every family in \a fams is checked, and if a
340  family is not yet in \a this mesh, the default group id \c 0 is assigned to it.
341  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
342  *  \param [in] fams - a sequence of names of families constituting the group.
343  */
344 void MEDFileMesh::setFamiliesOnGroup(const char *name, const std::vector<std::string>& fams) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
345 {
346   std::string oname(name);
347   _groups[oname]=fams;
348   for(std::vector<std::string>::const_iterator it1=fams.begin();it1!=fams.end();it1++)
349     {
350       std::map<std::string,int>::iterator it2=_families.find(*it1);
351       if(it2==_families.end())
352         _families[*it1]=0;
353     }
354 }
355
356 /*!
357  * Sets families constituting a group. The families are specified by their ids.
358  * If a family name is not found by its id, an exception is thrown.
359  * If several families have same id, the first one in lexical order is taken.
360  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
361  *  \param [in] famIds - a sequence of ids of families constituting the group.
362  *  \throw If a family name is not found by its id.
363  */
364 void MEDFileMesh::setFamiliesIdsOnGroup(const char *name, const std::vector<int>& famIds) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
365 {
366   std::string oname(name);
367   std::vector<std::string> fams(famIds.size());
368   int i=0;
369   for(std::vector<int>::const_iterator it1=famIds.begin();it1!=famIds.end();it1++,i++)
370     {
371       std::string name2=getFamilyNameGivenId(*it1);
372       fams[i]=name2;
373     }
374   _groups[oname]=fams;
375 }
376
377 /*!
378  * Returns names of groups including a given family.
379  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
380  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of groups including the family.
381  */
382 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsOnFamily(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
383 {
384   std::vector<std::string> ret;
385   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();it1!=_groups.end();it1++)
386     {
387       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it1).second.begin();it2!=(*it1).second.end();it2++)
388         if((*it2)==name)
389           {
390             ret.push_back((*it1).first);
391             break;
392           }
393     }
394   return ret;
395 }
396
397 /*!
398  * Adds an existing family to groups.
399  *  \param [in] famName - a name of family to add to \a grps.
400  *  \param [in] grps - a sequence of group names to add the family in.
401  *  \throw If a family named \a famName not yet exists.
402  */
403 void MEDFileMesh::setGroupsOnFamily(const char *famName, const std::vector<std::string>& grps) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
404 {
405   std::string fName(famName);
406   const std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fName);
407   if(it==_families.end())
408     {
409       std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
410       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << fName << "\" !\nAvailable families are :";
411       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
412       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
413     }
414   for(std::vector<std::string>::const_iterator it3=grps.begin();it3!=grps.end();it3++)
415     {
416       std::map< std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(*it3);
417       if(it2!=_groups.end())
418         (*it2).second.push_back(fName);
419       else
420         {
421           std::vector<std::string> grps2(1,fName);
422           _groups[*it3]=grps2;
423         }
424     }
425 }
426
427 /*!
428  * Returns names of all groups of \a this mesh.
429  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names.
430  */
431 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsNames() const
432 {
433   std::vector<std::string> ret(_groups.size());
434   int i=0;
435   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++,i++)
436     ret[i]=(*it).first;
437   return ret;
438 }
439
440 /*!
441  * Returns names of all families of \a this mesh.
442  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of family names.
443  */
444 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesNames() const
445 {
446   std::vector<std::string> ret(_families.size());
447   int i=0;
448   for(std::map<std::string, int >::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++,i++)
449     ret[i]=(*it).first;
450   return ret;
451 }
452
453 /*!
454  * Changes a name of every family, included in one group only, to be same as the group name.
455  *  \throw If there are families with equal names in \a this mesh.
456  */
457 void MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
458 {
459   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
460   std::map<std::string,int> newFams;
461   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
462     {
463       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first.c_str());
464       if(grps.size()==1 && groups[grps[0]].size()==1)
465         {
466           if(newFams.find(grps[0])!=newFams.end())
467             {
468               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << grps[0] << "\" already exists !";
469               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
470             }
471           newFams[grps[0]]=(*it).second;
472           std::vector<std::string>& grps2=groups[grps[0]];
473           std::size_t pos=std::distance(grps2.begin(),std::find(grps2.begin(),grps2.end(),(*it).first));
474           grps2[pos]=grps[0];
475         }
476       else
477         {
478           if(newFams.find((*it).first)!=newFams.end())
479             {
480               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << (*it).first << "\" already exists !";
481               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
482             }
483           newFams[(*it).first]=(*it).second;
484         }
485     }
486   _families=newFams;
487   _groups=groups;
488 }
489
490 /*!
491  * Removes all groups lying on no family. If there is no empty groups, \a this is let untouched.
492  * 
493  * \return the removed groups.
494  */
495 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeEmptyGroups() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
496 {
497   std::vector<std::string> ret;
498   std::map<std::string, std::vector<std::string> > newGrps;
499   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
500     {
501       if((*it).second.empty())
502         ret.push_back((*it).first);
503       else
504         newGrps[(*it).first]=(*it).second;
505     }
506   if(!ret.empty())
507     _groups=newGrps;
508   return ret;
509 }
510
511 /*!
512  * Removes a group from \a this mesh.
513  *  \param [in] name - the name of the group to remove.
514  *  \throw If no group with such a \a name exists.
515  */
516 void MEDFileMesh::removeGroup(const char *name) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
517 {
518   std::string oname(name);
519   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
520   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
521   if(it==_groups.end())
522     {
523       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
524       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
525       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
526     }
527   _groups.erase(it);
528 }
529
530 /*!
531  * Removes a family from \a this mesh.
532  *  \param [in] name - the name of the family to remove.
533  *  \throw If no family with such a \a name exists.
534  */
535 void MEDFileMesh::removeFamily(const char *name) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
536 {
537   std::string oname(name);
538   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
539   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
540   if(it==_families.end())
541     {
542       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
543       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
544       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
545     }
546   _families.erase(it);
547   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
548     {
549       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
550       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
551       if(it4!=v.end())
552         v.erase(it4);
553     }
554 }
555
556 /*!
557  * Removes all groups in \a this that are orphan. A group is orphan if this group lies on
558  * a set of families, themselves orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
559  * family field whatever its level. This method also suppresses the orphan families.
560  * 
561  * \return - The list of removed groups names. 
562  *
563  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanFamilies.
564  */
565 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanGroups() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
566 {
567   removeOrphanFamilies();
568   return removeEmptyGroups();
569 }
570
571 /*!
572  * Removes all families in \a this that are orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
573  * family field whatever its level. Groups are updated in consequence, that is to say all groups lying on orphan family, will see their families list modified.
574  * 
575  * \return - The list of removed families names.
576  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanGroups.
577  */
578 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanFamilies() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
579 {
580   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allFamIdsInUse=computeAllFamilyIdsInUse();
581   std::vector<std::string> ret;
582   if(!((DataArrayInt*)allFamIdsInUse))
583     {
584       ret=getFamiliesNames();
585       _families.clear(); _groups.clear();
586       return ret;
587     }
588   std::map<std::string,int> famMap;
589   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grps(_groups);
590   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
591     {
592       if(allFamIdsInUse->presenceOfValue((*it).second))
593         famMap[(*it).first]=(*it).second;
594       else
595         {
596           ret.push_back((*it).first);
597           std::vector<std::string> grpsOnEraseFam=getGroupsOnFamily((*it).first.c_str());
598           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOnEraseFam.begin();it2!=grpsOnEraseFam.end();it2++)
599             {
600               std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=grps.find(*it2);//it3!=grps.empty() thanks to copy
601               std::vector<std::string>& famv=(*it3).second;
602               std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(famv.begin(),famv.end(),(*it).first);//it4!=famv.end() thanks to copy
603               famv.erase(it4);
604             }
605         }
606     }
607   if(!ret.empty())
608     { _families=famMap; _groups=grps; }
609   return ret;
610 }
611
612 /*!
613  * Renames a group in \a this mesh.
614  *  \param [in] oldName - a current name of the group to rename.
615  *  \param [in] newName - a new group name.
616  *  \throw If no group named \a oldName exists in \a this mesh.
617  *  \throw If a group named \a newName already exists.
618  */
619 void MEDFileMesh::changeGroupName(const char *oldName, const char *newName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
620 {
621   std::string oname(oldName);
622   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
623   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
624   if(it==_groups.end())
625     {
626       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << oldName << "\" !\nAvailable groups are :";
627       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
628       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
629     }
630   std::string nname(newName);
631   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(nname);
632   if(it2!=_groups.end())
633     {
634       std::ostringstream oss; oss << "Such groupname \"" << newName << "\" already exists ! Kill it before !";
635       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
636     }
637   std::vector<std::string> cpy=(*it).second;
638   _groups.erase(it);
639   _groups[newName]=cpy;
640 }
641
642 /*!
643  * Changes an id of a family in \a this mesh. 
644  * This method calls changeFamilyIdArr().
645  *  \param [in] oldId - a current id of the family.
646  *  \param [in] newId - a new family id.
647  */
648 void MEDFileMesh::changeFamilyId(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
649 {
650   changeFamilyIdArr(oldId,newId);
651   std::map<std::string,int> fam2;
652   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
653     {
654       if((*it).second==oldId)
655         fam2[(*it).first]=newId;
656       else
657         fam2[(*it).first]=(*it).second;
658     }
659   _families=fam2;
660 }
661
662 /*!
663  * Renames a family in \a this mesh.
664  *  \param [in] oldName - a current name of the family to rename.
665  *  \param [in] newName - a new family name.
666  *  \throw If no family named \a oldName exists in \a this mesh.
667  *  \throw If a family named \a newName already exists.
668  */
669 void MEDFileMesh::changeFamilyName(const char *oldName, const char *newName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
670 {
671   std::string oname(oldName);
672   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
673   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
674   if(it==_families.end())
675     {
676       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << oldName << "\" !\nAvailable families are :";
677       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
678       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
679     }
680   std::string nname(newName);
681   std::map<std::string, int >::iterator it2=_families.find(nname);
682   if(it2!=_families.end())
683     {
684       std::ostringstream oss; oss << "Such familyname \"" << newName << " already exists ! Kill it before !";
685       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
686     }
687   int cpy=(*it).second;
688   _families.erase(it);
689   _families[newName]=cpy;
690   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
691     {
692       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
693       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
694       if(it4!=v.end())
695         (*it4)=nname;
696     }
697 }
698
699 /*!
700  * Checks if \a this and another mesh contains the same families.
701  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
702  *  \param [in,out] what - an unused parameter.
703  *  \return bool - \c true if number of families and their ids are the same in the two
704  *          meshes. Families with the id == \c 0 are not considered.
705  */
706 bool MEDFileMesh::areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
707 {
708   if(_families==other->_families)
709     return true;
710   std::map<std::string,int> fam0;
711   std::map<std::string,int> fam1;
712   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
713     if((*it).second!=0)
714       fam0[(*it).first]=(*it).second;
715   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=other->_families.begin();it!=other->_families.end();it++)
716     if((*it).second!=0)
717       fam1[(*it).first]=(*it).second;
718   return fam0==fam1;
719 }
720
721 /*!
722  * Checks if \a this and another mesh contains the same groups.
723  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
724  *  \param [in,out] what - a string describing a difference of groups of the two meshes
725  *          in case if this method returns \c false.
726  *  \return bool - \c true if number of groups and families constituting them are the
727  *          same in the two meshes.
728  */
729 bool MEDFileMesh::areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
730 {
731   if(_groups==other->_groups)
732     return true;
733   bool ret=true;
734   std::size_t sz=_groups.size();
735   if(sz!=other->_groups.size())
736     {
737       what="Groups differ because not same number !\n";
738       ret=false;
739     }
740   if(ret)
741     {
742       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();
743       for(std::size_t i=0;i<sz && ret;i++,it1++)
744         {
745           std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=other->_groups.find((*it1).first);
746           if(it2!=other->_groups.end())
747             {
748               std::set<std::string> s1((*it1).second.begin(),(*it1).second.end());
749               std::set<std::string> s2((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
750               ret=(s1==s2);
751             }
752           else
753             {
754               ret=false;
755               what="A group in first mesh exists not in other !\n";
756             }
757         }
758     }
759   if(!ret)
760     {
761       std::ostringstream oss; oss << "Groups description differs :\n";
762       oss << "First group description :\n";
763       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
764         {
765           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
766           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
767         oss << "    \"" << *it2 << "\n";
768         }
769       oss << "Second group description :\n";
770       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=other->_groups.begin();it!=other->_groups.end();it++)
771         {
772           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
773           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
774             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
775         }
776       what+=oss.str();
777     }
778   return ret;
779 }
780
781 /*!
782  * Checks if a group with a given name exists in \a this mesh.
783  *  \param [in] groupName - the group name.
784  *  \return bool - \c true the group \a groupName exists in \a this mesh.
785  */
786 bool MEDFileMesh::existsGroup(const char *groupName) const
787 {
788   std::string grpName(groupName);
789   return _groups.find(grpName)!=_groups.end();
790 }
791
792 /*!
793  * Checks if a family with a given id exists in \a this mesh.
794  *  \param [in] famId - the family id.
795  *  \return bool - \c true the family with the id \a famId exists in \a this mesh.
796  */
797 bool MEDFileMesh::existsFamily(int famId) const
798 {
799   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
800     if((*it2).second==famId)
801       return true;
802   return false;
803 }
804
805 /*!
806  * Checks if a family with a given name exists in \a this mesh.
807  *  \param [in] familyName - the family name.
808  *  \return bool - \c true the family \a familyName exists in \a this mesh.
809  */
810 bool MEDFileMesh::existsFamily(const char *familyName) const
811 {
812   std::string fname(familyName);
813   return _families.find(fname)!=_families.end();
814 }
815
816 /*!
817  * Sets an id of a family.
818  *  \param [in] familyName - the family name.
819  *  \param [in] id - a new id of the family.
820  */
821 void MEDFileMesh::setFamilyId(const char *familyName, int id)
822 {
823   std::string fname(familyName);
824   _families[fname]=id;
825 }
826
827 void MEDFileMesh::setFamilyIdUnique(const char *familyName, int id) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
828 {
829   std::string fname(familyName);
830   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
831     if((*it).second==id)
832       {
833         if((*it).first!=familyName)
834           {
835             std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::setFamilyIdUnique : Family id #" << id << " is already belonging to family with name \"" << (*it).first << "\" !";
836             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
837           }
838       }
839   _families[fname]=id;
840 }
841
842 /*!
843  * Adds a family to \a this mesh.
844  *  \param [in] familyName - a name of the family.
845  *  \param [in] famId - an id of the family.
846  *  \throw If a family with the same name or id already exists in \a this mesh.
847  */
848 void MEDFileMesh::addFamily(const char *familyName, int famId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
849 {
850   std::string fname(familyName);
851   std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fname);
852   if(it==_families.end())
853     {
854        for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
855          if((*it2).second==famId)
856            {
857              std::ostringstream oss;
858              oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << (*it2).first << "\" already exists with specified id : " << famId << " !";
859              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
860            }
861        _families[fname]=famId;
862     }
863   else
864     {
865       if((*it).second!=famId)
866         {
867           std::ostringstream oss;
868           oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << fname << "\" already exists but has id set to " << (*it).second << " different from asked famId " << famId << " !";
869           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
870         }
871     }
872 }
873
874 /*!
875  * Creates a group including all mesh entities of given dimension.
876  * \warning This method does \b not guarantee that the created group includes mesh
877  * entities of only \a meshDimRelToMaxExt dimension in the case if some family id is
878  * present in family fields of different dimensions. To assure this, call
879  * ensureDifferentFamIdsPerLevel() \b before calling this method.
880  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of mesh entities to include to
881  *          the group.
882  *  \param [in] groupName - a name of the new group.
883  *  \throw If a group named \a groupName already exists.
884  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt exist in \a this mesh.
885  *  \throw If no family field of dimension \a meshDimRelToMaxExt is present in \a this mesh.
886  */
887 void MEDFileMesh::createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const char *groupName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
888 {
889   std::string grpName(groupName);
890   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
891   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
892     {
893       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The relative ext dimension " << meshDimRelToMaxExt << " is not available !" << std::endl;
894       oss << "Available relative ext levels are : ";
895       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
896       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
897     }
898   if(existsGroup(groupName))
899     {
900       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The groups \"" << grpName << "\" already exists in this !" << std::endl;
901       oss << "Already existing groups are : ";
902       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
903       oss << std::endl << "Please choose an another group name or call removeGroup(\"" << grpName << "\") method !";
904       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
905     }
906   const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
907   if(fieldFamIds==0)
908     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::createGroupOnAll : Family field arr ids is not defined for this level !");
909   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=fieldFamIds->getDifferentValues();
910   std::vector<std::string> familiesOnWholeGroup;
911   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
912     {
913       bool tmp;
914       familiesOnWholeGroup.push_back(findOrCreateAndGiveFamilyWithId(*it,tmp));
915     }
916   _groups[grpName]=familiesOnWholeGroup;
917 }
918
919 /*!
920  * Ensures that given family ids do not present in family fields of dimensions different
921  * than given ones. If a family id is present in the family fields of dimensions different
922  * than the given ones, a new family is created and the whole data is updated accordingly.
923  *  \param [in] famIds - a sequence of family ids to check.
924  *  \param [in] vMeshDimRelToMaxExt - a sequence of relative dimensions to which the \a
925  *          famIds should exclusively belong.
926  *  \return bool - \c true if no modification is done in \a this mesh by this method.
927  */
928 bool MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& vMeshDimRelToMaxExt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
929 {
930   std::set<int> levsInput(vMeshDimRelToMaxExt.begin(),vMeshDimRelToMaxExt.end());
931   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
932   std::set<int> levs2(levs.begin(),levs.end());
933   std::vector<int> levsToTest;
934   std::set_difference(levs2.begin(),levs2.end(),levsInput.begin(),levsInput.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(levsToTest));
935   std::set<int> famIds2(famIds.begin(),famIds.end());
936   bool ret=true;
937   int maxFamId=1;
938   if(!_families.empty())
939     maxFamId=getMaxFamilyId()+1;
940   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
941   for(std::vector<int>::const_iterator it=levsToTest.begin();it!=levsToTest.end();it++)
942     {
943       const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(*it);
944       if(fieldFamIds)
945         {
946           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds3=fieldFamIds->getDifferentValues();
947           std::vector<int> tmp;
948           std::set_intersection(famIds3->begin(),famIds3->end(),famIds2.begin(),famIds2.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(tmp));
949           for(std::vector<int>::const_iterator it2=tmp.begin();it2!=tmp.end();it2++)
950             {
951               ret=false;
952               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it2);
953               std::ostringstream oss; oss << "Family_" << maxFamId;
954               std::string zeName=CreateNameNotIn(oss.str(),allFams);
955               addFamilyOnAllGroupsHaving(famName.c_str(),zeName.c_str());
956               _families[zeName]=maxFamId;
957               (const_cast<DataArrayInt *>(fieldFamIds))->changeValue(*it2,maxFamId);
958               maxFamId++;
959             }
960         }
961     }
962   return ret;
963 }
964
965 /*!
966  * Adds a family to a given group in \a this mesh. If the group with a given name does
967  * not exist, it is created.
968  *  \param [in] grpName - the name of the group to add the family in.
969  *  \param [in] famName - the name of the family to add to the group named \a grpName.
970  *  \throw If \a grpName or \a famName is an empty string.
971  *  \throw If no family named \a famName is present in \a this mesh.
972  */
973 void MEDFileMesh::addFamilyOnGrp(const char *grpName, const char *famName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
974 {
975   std::string grpn(grpName);
976   std::string famn(famName);
977   if(grpn.empty() || famn.empty())
978     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : input strings must be non null !");
979   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
980   if(std::find(fams.begin(),fams.end(),famn)==fams.end())
981     {
982       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : Family \"" << famn << "\" does not exist !" << std::endl;
983       oss << "Create this family or choose an existing one ! Existing fams are : ";
984       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," ")); oss << ".";
985       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
986     }
987   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(grpn);
988   if(it==_groups.end())
989     {
990       _groups[grpn].push_back(famn);
991     }
992   else
993     {
994       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find((*it).second.begin(),(*it).second.end(),famn);
995       if(it2==(*it).second.end())
996         (*it).second.push_back(famn);
997     }
998 }
999
1000 /*!
1001  * This method adds to all groups lying on family with name 'famName' the other family name 'otherFamName'.
1002  * This method is quite underground because it can lead to unconsistency because family 'otherFamName' is \b not added into _families.
1003  * This method is used by MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs method.
1004  */
1005 void MEDFileMesh::addFamilyOnAllGroupsHaving(const char *famName, const char *otherFamName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1006 {
1007   std::string famNameCpp(famName);
1008   std::string otherCpp(otherFamName);
1009   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
1010     {
1011       std::vector<std::string>& v=(*it).second;
1012       if(std::find(v.begin(),v.end(),famNameCpp)!=v.end())
1013         {
1014           v.push_back(otherCpp);
1015         }
1016     }
1017 }
1018
1019 void MEDFileMesh::changeAllGroupsContainingFamily(const char *familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1020 {
1021   ChangeAllGroupsContainingFamily(_groups,familyNameToChange,newFamiliesNames);
1022 }
1023
1024 void MEDFileMesh::ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const char *familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1025 {
1026   std::string fam(familyNameToChange);
1027   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=groups.begin();it!=groups.end();it++)
1028     {
1029       std::vector<std::string>& fams((*it).second);
1030       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find(fams.begin(),fams.end(),fam);
1031       if(it2!=fams.end())
1032         {
1033           fams.erase(it2);
1034           fams.insert(fams.end(),newFamiliesNames.begin(),newFamiliesNames.end());
1035         }
1036     }
1037 }
1038
1039 /*!
1040  * Returns a name of the family having a given id or, if no such a family exists, creates
1041  * a new uniquely named family and returns its name.
1042  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1043  *  \param [out] created - returns \c true if the new family has been created, \c false, else.
1044  *  \return std::string - the name of the existing or the created family.
1045  *  \throw If it is not possible to create a unique family name.
1046  */
1047 std::string MEDFileMesh::findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1048 {
1049   return FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(_families,id,created);
1050 }
1051
1052 /*!
1053  * If it exists a family whose family id is equal to 'id' this method behaves as MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId.
1054  * In this case, 'this' internal states remains unchanged and 'created' out parameter will be set to false.
1055  * If there is no family whose family id is equal to 'id' a family is created with a name different from those
1056  * already existing. In this case 'created' will be returned with a value set to true, and internal state
1057  * will be modified.
1058  * This method will throws an exception if it is not possible to create a unique family name.
1059  */
1060 std::string MEDFileMesh::FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1061 {
1062   std::vector<std::string> famAlreadyExisting(families.size());
1063   int ii=0;
1064   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++,ii++)
1065     {
1066       if((*it).second!=id)
1067         {
1068           famAlreadyExisting[ii]=(*it).first;
1069         }
1070       else
1071         {
1072           created=false;
1073           return (*it).first;
1074         }
1075     }
1076   created=true;
1077   std::ostringstream oss; oss << "Family_" << id;
1078   std::string ret=CreateNameNotIn(oss.str(),famAlreadyExisting);
1079   families[ret]=id;
1080   return ret;
1081 }
1082
1083 /*!
1084  * Sets names and ids of all families in \a this mesh.
1085  *  \param [in] info - a map of a family name to a family id.
1086  */
1087 void MEDFileMesh::setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info)
1088 {
1089   _families=info;
1090 }
1091
1092 /*!
1093  * Sets names of all groups and families constituting them in \a this mesh.
1094  *  \param [in] info - a map of a group name to a vector of names of families
1095  *          constituting the group.
1096  */
1097 void MEDFileMesh::setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info)
1098 {
1099   _groups=info;
1100 }
1101
1102 /*!
1103  * Returns an id of the family having a given name.
1104  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
1105  *  \return int - the id of the family of interest.
1106  *  \throw If no family with such a \a name exists.
1107  */
1108 int MEDFileMesh::getFamilyId(const char *name) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1109 {
1110   std::string oname(name);
1111   std::map<std::string, int>::const_iterator it=_families.find(oname);
1112   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1113   if(it==_families.end())
1114     {
1115       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
1116       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1117       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1118     }
1119   return (*it).second;
1120 }
1121
1122 /*!
1123  * Returns ids of the families having given names.
1124  *  \param [in] fams - a sequence of the names of families of interest.
1125  *  \return std::vector<int> - a sequence of the ids of families of interest.
1126  *  \throw If \a fams contains a name of an inexistent family.
1127  */
1128 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& fams) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1129 {
1130   std::vector<int> ret(fams.size());
1131   int i=0;
1132   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++,i++)
1133     {
1134       std::map<std::string, int>::const_iterator it2=_families.find(*it);
1135       if(it2==_families.end())
1136         {
1137           std::vector<std::string> fams2=getFamiliesNames();
1138           std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << *it << "\" in input list !\nAvailable families are :";
1139           std::copy(fams2.begin(),fams2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1140           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1141         }
1142       ret[i]=(*it2).second;
1143     }
1144   return ret;
1145 }
1146
1147 /*!
1148  * Returns a maximal abs(id) of families in \a this mesh.
1149  *  \return int - the maximal norm of family id.
1150  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1151  */
1152 int MEDFileMesh::getMaxAbsFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1153 {
1154   if(_families.empty())
1155     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1156   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1157   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1158     {
1159       ret=std::max(std::abs((*it).second),ret);
1160     }
1161   return ret;
1162 }
1163
1164 /*!
1165  * Returns a maximal id of families in \a this mesh.
1166  *  \return int - the maximal family id.
1167  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1168  */
1169 int MEDFileMesh::getMaxFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1170 {
1171   if(_families.empty())
1172     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1173   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1174   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1175     {
1176       ret=std::max((*it).second,ret);
1177     }
1178   return ret;
1179 }
1180
1181 /*!
1182  * Returns a minimal id of families in \a this mesh.
1183  *  \return int - the minimal family id.
1184  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1185  */
1186 int MEDFileMesh::getMinFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1187 {
1188   if(_families.empty())
1189     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMinFamilyId : no families set !");
1190   int ret=std::numeric_limits<int>::max();
1191   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1192     {
1193       ret=std::min((*it).second,ret);
1194     }
1195   return ret;
1196 }
1197
1198 /*!
1199  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1200  * considered but all family fields as well.
1201  *  \return int - the maximal family id.
1202  */
1203 int MEDFileMesh::getTheMaxAbsFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1204 {
1205   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1206   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1207     m1=std::max(std::abs((*it).second),m1);
1208   int m2=getMaxAbsFamilyIdInArrays();
1209   return std::max(m1,m2);
1210 }
1211
1212 /*!
1213  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1214  * considered but all family fields as well.
1215  *  \return int - the maximal family id.
1216  */
1217 int MEDFileMesh::getTheMaxFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1218 {
1219   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1220   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1221     m1=std::max((*it).second,m1);
1222   int m2=getMaxFamilyIdInArrays();
1223   return std::max(m1,m2);
1224 }
1225
1226 /*!
1227  * Returns a minimal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1228  * considered but all family fields as well.
1229  *  \return int - the minimal family id.
1230  */
1231 int MEDFileMesh::getTheMinFamilyId() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1232 {
1233   int m1=std::numeric_limits<int>::max();
1234   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1235     m1=std::min((*it).second,m1);
1236   int m2=getMinFamilyIdInArrays();
1237   return std::min(m1,m2);
1238 }
1239
1240 /*!
1241  * This method only considers the maps. The contain of family array is ignored here.
1242  * 
1243  * \sa MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse
1244  */
1245 DataArrayInt *MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1246 {
1247   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1248   std::set<int> v;
1249   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1250     v.insert((*it).second);
1251   ret->alloc((int)v.size(),1);
1252   std::copy(v.begin(),v.end(),ret->getPointer());
1253   return ret.retn();
1254 }
1255
1256 /*!
1257  * This method does not consider map of family name, family id. Only family field array on different levels is considered.
1258  * 
1259  * \sa MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced
1260  */
1261 DataArrayInt *MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1262 {
1263   std::vector<int> famLevs=getFamArrNonEmptyLevelsExt();
1264   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret;
1265   for(std::vector<int>::const_iterator it=famLevs.begin();it!=famLevs.end();it++)
1266     {
1267       const DataArrayInt *arr=getFamilyFieldAtLevel(*it);//arr not null due to spec of getFamArrNonEmptyLevelsExt
1268       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> dv=arr->getDifferentValues();
1269       if((DataArrayInt *) ret)
1270         ret=dv->buildUnion(ret);
1271       else
1272         ret=dv;
1273     }
1274   return ret.retn();
1275 }
1276
1277 /*!
1278  * true is returned if no modification has been needed. false if family
1279  * renumbering has been needed.       
1280  */
1281 bool MEDFileMesh::ensureDifferentFamIdsPerLevel() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1282 {
1283   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1284   std::set<int> allFamIds;
1285   int maxId=getMaxFamilyId()+1;
1286   std::map<int,std::vector<int> > famIdsToRenum;
1287   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1288     {
1289       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it);
1290       if(fam)
1291         {
1292           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1293           std::set<int> r2;
1294           std::set_intersection(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r2,r2.end()));
1295           if(!r2.empty())
1296             famIdsToRenum[*it].insert(famIdsToRenum[*it].end(),r2.begin(),r2.end());
1297           std::set<int> r3;
1298           std::set_union(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r3,r3.end()));
1299         }
1300     }
1301   if(famIdsToRenum.empty())
1302     return true;
1303   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1304   for(std::map<int,std::vector<int> >::const_iterator it2=famIdsToRenum.begin();it2!=famIdsToRenum.end();it2++)
1305     {
1306       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt *>(getFamilyFieldAtLevel((*it2).first));
1307       int *famIdsToChange=fam->getPointer();
1308       std::map<int,int> ren;
1309       for(std::vector<int>::const_iterator it3=(*it2).second.begin();it3!=(*it2).second.end();it3++,maxId++)
1310         {
1311           if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1312             {
1313               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1314               std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily(famName.c_str());
1315               ren[*it3]=maxId;
1316               bool dummy;
1317               std::string newFam=findOrCreateAndGiveFamilyWithId(maxId,dummy);
1318               for(std::vector<std::string>::const_iterator it4=grps.begin();it4!=grps.end();it4++)
1319                 addFamilyOnGrp((*it4).c_str(),newFam.c_str());
1320             }
1321         }
1322       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getIdsEqualList(&(*it2).second[0],&(*it2).second[0]+(*it2).second.size());
1323       for(const int *id=ids->begin();id!=ids->end();id++)
1324         famIdsToChange[*id]=ren[famIdsToChange[*id]];
1325     }
1326   return false;
1327 }
1328
1329 /*!
1330  * This method normalizes fam id with the policy explained underneath. This policy is close to those implemented in SMESH.
1331  * Level #0 famids > 0, Level #-1 famids < 0, Level #-2 famids=0, Level #1 famids=0
1332  * This policy is those used by SMESH and Trio and that is the opposite of those in MED file.
1333  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1334  * \warning This policy is the opposite of those in MED file documentation ...
1335  */
1336 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsTrio() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1337 {
1338   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1339   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1340   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1341   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1342   std::set<std::string> famsFetched;
1343   std::map<std::string,int> families;
1344   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)!=levs.end())
1345     {
1346       levsS.erase(0);
1347       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(0);
1348       if(fam)
1349         {
1350           int refId=1;
1351           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1352           std::map<int,int> ren;
1353           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1354             ren[*it]=refId;
1355           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1356           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1357           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1358             *w=ren[*w];
1359           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1360             {
1361               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1362                 {
1363                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1364                   families[famName]=ren[*it];
1365                   famsFetched.insert(famName);
1366                 }
1367             }
1368         }
1369     }
1370   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)!=levs.end())
1371     {
1372       levsS.erase(-1);
1373       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
1374       if(fam)
1375         {
1376           int refId=-1;
1377           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1378           std::map<int,int> ren;
1379           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1380             ren[*it]=refId;
1381           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1382           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1383           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1384             *w=ren[*w];
1385           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1386             {
1387               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1388                 {
1389                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1390                   families[famName]=ren[*it];
1391                   famsFetched.insert(famName);
1392                 }
1393             }
1394         }
1395     }
1396   for(std::set<int>::const_iterator it2=levsS.begin();it2!=levsS.end();it2++)
1397     {
1398       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt*>(getFamilyFieldAtLevel(*it2));
1399       if(fam)
1400         {
1401           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1402           fam->fillWithZero();
1403           for(const int *it3=tmp->begin();it3!=tmp->end();it3++)
1404             if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1405               {
1406                 std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1407                 families[famName]=0;
1408                 famsFetched.insert(famName);
1409               }
1410         }
1411     }
1412   //
1413   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1414   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1415   std::set<std::string> unFetchedIds;
1416   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1417   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1418     families[*it4]=_families[*it4];
1419   _families=families;
1420 }
1421
1422 /*!
1423  * This method normalizes fam id with the following policy.
1424  * Level #0 famids < 0, Level #-1 famids < 0 and for Level #1 famids >= 0
1425  * This policy is those defined in the MED file format but is the opposite of those implemented in SMESH and Trio.
1426  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1427  */
1428 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsMEDFile() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1429 {
1430   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1431   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1432   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1433   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1434   std::set<std::string> famsFetched;
1435   std::map<std::string,int> families;
1436   int refId=1;
1437   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),1)!=levs.end())
1438     {
1439       levsS.erase(1);
1440       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(1);
1441       if(fam)
1442         {
1443           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1444           std::map<int,int> ren;
1445           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1446             ren[*it]=refId;
1447           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1448           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1449           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1450             *w=ren[*w];
1451           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1452             {
1453               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1454                 {
1455                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1456                   families[famName]=ren[*it];
1457                   famsFetched.insert(famName);
1458                 }
1459             }
1460         }
1461     }
1462   refId=-1;
1463   for(std::set<int>::const_reverse_iterator it2=levsS.rbegin();it2!=levsS.rend();it2++)
1464     {
1465       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it2);
1466       if(fam)
1467         {
1468           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1469           std::map<int,int> ren;
1470           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1471             ren[*it]=refId;
1472           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1473           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1474           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1475             *w=ren[*w];
1476           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1477             {
1478               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1479                 {
1480                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1481                   families[famName]=ren[*it];
1482                   famsFetched.insert(famName);
1483                 }
1484             }
1485         }
1486     }
1487   //
1488   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1489   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1490   std::set<std::string> unFetchedIds;
1491   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1492   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1493     families[*it4]=_families[*it4];
1494   _families=families;
1495 }
1496
1497 /*!
1498  * Returns a name of the family by its id. If there are several families having the given
1499  * id, the name first in lexical order is returned.
1500  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1501  *  \return std::string - the name of the found family.
1502  *  \throw If no family with the given \a id exists.
1503  */
1504 std::string MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId(int id) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1505 {
1506   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1507     if((*it).second==id)
1508       return (*it).first;
1509   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::getFamilyNameGivenId : no such family id : " << id;
1510   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1511 }
1512
1513 /*!
1514  * Returns a string describing \a this mesh. This description includes the mesh name and
1515  * the mesh description string.
1516  *  \return std::string - the mesh information string.
1517  */
1518 std::string MEDFileMesh::simpleRepr() const
1519 {
1520   std::ostringstream oss;
1521   oss << "(*************************************)\n(* GENERAL INFORMATION ON THE MESH : *)\n(*************************************)\n";
1522   oss << "- Name of the mesh : <<" << getName() << ">>\n";
1523   oss << "- Description associated to the mesh : " << getDescription() << std::endl;
1524   return oss.str();
1525 }
1526
1527 /*!
1528  * Returns ids of mesh entities contained in a given group of a given dimension.
1529  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1530  *          are required.
1531  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1532  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1533  *          returned instead of ids. 
1534  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1535  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the group. The caller
1536  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1537  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1538  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1539  */
1540 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const char *grp, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1541 {
1542   std::vector<std::string> tmp(1);
1543   tmp[0]=grp;
1544   DataArrayInt *ret=getGroupsArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1545   ret->setName(grp);
1546   return ret;
1547 }
1548
1549 /*!
1550  * Returns ids of mesh entities contained in given groups of a given dimension.
1551  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1552  *          are required.
1553  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1554  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1555  *          returned instead of ids.
1556  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1557  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the groups. The caller
1558  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1559  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1560  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1561  */
1562 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1563 {
1564   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
1565   return getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
1566 }
1567
1568 /*!
1569  * Returns ids of mesh entities contained in a given family of a given dimension.
1570  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1571  *          are required.
1572  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
1573  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1574  *          returned instead of ids. 
1575  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1576  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the family. The caller
1577  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1578  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1579  */
1580 DataArrayInt *MEDFileMesh::getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const char *fam, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1581 {
1582   std::vector<std::string> tmp(1);
1583   tmp[0]=fam;
1584   DataArrayInt *ret=getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1585   ret->setName(fam);
1586   return ret;
1587 }
1588
1589 /*!
1590  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1591  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1592  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1593  *          returned instead of ids. 
1594  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1595  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1596  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1597  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1598  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1599  */
1600 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupArr(const char *grp, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1601 {
1602   std::vector<std::string> tmp(1);
1603   tmp[0]=grp;
1604   DataArrayInt *ret=getNodeGroupsArr(tmp,renum);
1605   ret->setName(grp);
1606   return ret;
1607 }
1608
1609 /*!
1610  * Returns ids of nodes contained in given groups.
1611  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1612  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1613  *          returned instead of ids. 
1614  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1615  *          numbers, if available and required, of nodes of the groups. The caller
1616  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1617  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1618  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1619  */
1620 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1621 {
1622   return getGroupsArr(1,grps,renum);
1623 }
1624
1625 /*!
1626  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1627  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1628  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1629  *          returned instead of ids. 
1630  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1631  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1632  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1633  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1634  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1635  */
1636 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamilyArr(const char *fam, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1637 {
1638   std::vector<std::string> tmp(1);
1639   tmp[0]=fam;
1640   DataArrayInt *ret=getNodeFamiliesArr(tmp,renum);
1641   ret->setName(fam);
1642   return ret;
1643 }
1644
1645 /*!
1646  * Returns ids of nodes contained in given families.
1647  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
1648  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1649  *          returned instead of ids. 
1650  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1651  *          numbers, if available and required, of nodes of the families. The caller
1652  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1653  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1654  */
1655 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1656 {
1657   return getFamiliesArr(1,fams,renum);
1658 }
1659
1660 /*!
1661  * Adds groups of given dimension and creates corresponding families and family fields
1662  * given ids of mesh entities of each group.
1663  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative mesh dimension of given mesh entities.
1664  *  \param [in] grps - a sequence of arrays of ids each describing a group.
1665  *  \param [in] renum - \c true means that \a grps contains not ids but optional numbers
1666  *          of mesh entities.
1667  *  \throw If names of some groups in \a grps are equal.
1668  *  \throw If \a grps includes a group with an empty name.
1669  *  \throw If \a grps includes invalid ids (or numbers if \a renum == \c true ).
1670  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
1671  */
1672 void MEDFileMesh::setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1673 {
1674   if(grps.empty())
1675     return ;
1676   std::set<std::string> grpsName;
1677   std::vector<std::string> grpsName2(grps.size());
1678   int i=0;
1679
1680   for(std::vector<const DataArrayInt *>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++,i++)
1681     {
1682       grpsName.insert((*it)->getName());
1683       grpsName2[i]=(*it)->getName();
1684     }
1685   if(grpsName.size()!=grps.size())
1686     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different each other !");
1687   if(grpsName.find(std::string(""))!=grpsName.end())
1688     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different empty string !");
1689   int sz=getSizeAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
1690   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam;
1691   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
1692   if(!renum)
1693     {
1694       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps,sz,fidsOfGroups);
1695     }
1696   else
1697     {
1698       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grps2(grps.size());
1699       for(unsigned int ii=0;ii<grps.size();ii++)
1700         {
1701           grps2[ii]=MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(getRevNumberFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt),grps[ii]);
1702           grps2[ii]->setName(grps[ii]->getName().c_str());
1703         }
1704       std::vector<const DataArrayInt *> grps3(grps2.begin(),grps2.end());
1705       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps3,sz,fidsOfGroups);
1706     }
1707   int offset=1;
1708   if(!_families.empty())
1709     offset=getMaxAbsFamilyId()+1;
1710   TranslateFamilyIds(meshDimRelToMaxExt==1?offset:-offset,fam,fidsOfGroups);
1711   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getDifferentValues();
1712   appendFamilyEntries(ids,fidsOfGroups,grpsName2);
1713   setFamilyFieldArr(meshDimRelToMaxExt,fam);
1714 }
1715
1716 /*!
1717  * This method append into '_families' attribute the families whose ids are in 'famIds'. Warning 'famIds' are expected to be ids
1718  * not in '_families'. Groups information are given in parameters in order to give to families representative names.
1719  * For the moment, the two last input parameters are not taken into account.
1720  */
1721 void MEDFileMesh::appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames)
1722 {
1723   std::map<int,std::string> famInv;
1724   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
1725     {
1726       std::ostringstream oss;
1727       oss << "Family_" << (*it);
1728       _families[oss.str()]=(*it);
1729       famInv[*it]=oss.str();
1730     }
1731   int i=0;
1732   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=fidsOfGrps.begin();it1!=fidsOfGrps.end();it1++,i++)
1733     {
1734       for(std::vector<int>::const_iterator it2=(*it1).begin();it2!=(*it1).end();it2++)
1735         {
1736           _groups[grpNames[i]].push_back(famInv[*it2]);
1737         }
1738     }
1739 }
1740
1741 void MEDFileMesh::TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp)
1742 {
1743   famArr->applyLin(offset>0?1:-1,offset,0);
1744   for(std::vector< std::vector<int> >::iterator it1=famIdsPerGrp.begin();it1!=famIdsPerGrp.end();it1++)
1745     {
1746       if(offset<0)
1747         std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::negate<int>());
1748       std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),offset));
1749     }
1750 }
1751
1752 /*!
1753  * Warning no check is done on 'nameTry' in parameter. It should be non empty.
1754  * This method returns a name close to 'nameTry' so that it is not already into 'namesToAvoid'.
1755  * If this method fails to find such a name it will throw an exception.
1756  */
1757 std::string MEDFileMesh::CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1758 {
1759   //attempt #0
1760   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),nameTry)==namesToAvoid.end())
1761     return nameTry;
1762   //attempt #1
1763   std::size_t len=nameTry.length();
1764   for(std::size_t ii=1;ii<len;ii++)
1765     {
1766       std::string tmp=nameTry.substr(ii,len-ii);
1767       if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp)==namesToAvoid.end())
1768         return tmp;
1769     }
1770   //attempt #2
1771   if(len>=1)
1772     {
1773       for(std::size_t i=1;i<30;i++)
1774         {
1775           std::string tmp1(nameTry.at(0),i);
1776           tmp1+=nameTry;
1777           if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp1)==namesToAvoid.end())
1778             return tmp1;
1779         }
1780     }
1781   //attempt #3
1782   std::string tmp2;
1783   for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=namesToAvoid.begin();it2!=namesToAvoid.end();it2++)
1784     tmp2+=(*it2);
1785   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp2)==namesToAvoid.end())
1786     return tmp2;
1787   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::CreateNameNotIn : impossible to find a not already used name !");
1788 }
1789
1790 int MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1791 {
1792   std::size_t nbOfChunks=code.size()/3;
1793   if(code.size()%3!=0)
1794     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset : code has invalid size : should be of size 3*x !");
1795   int ret=strt;
1796   for(std::size_t i=0;i<nbOfChunks;i++)
1797     {
1798       code[3*i+2]=ret;
1799       ret+=code[3*i+1];
1800     }
1801   return ret;
1802 }
1803
1804 /*!
1805  * This method should be called by any set* method of subclasses to deal automatically with _name attribute.
1806  * If _name attribute is empty the name of 'm' if taken as _name attribute.
1807  * If _name is not empty and that 'm' has the same name nothing is done.
1808  * If _name is not emplt and that 'm' has \b NOT the same name an exception is thrown.
1809  */
1810 void MEDFileMesh::dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1811 {
1812   if(!m)
1813     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : input mesh in NULL !");
1814   if(_name.empty())
1815     _name=m->getName();
1816   else
1817     {
1818       std::string name(m->getName());
1819       if(!name.empty())
1820         {
1821           if(_name!=name)
1822             {
1823               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : name of current MEDfile mesh is '" << _name << "' whereas name of input mesh is : '";
1824               oss << name << "' ! Names must match !";
1825               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1826             }
1827         }
1828     }
1829   if(_desc_name.empty())
1830     _desc_name=m->getDescription();
1831   else
1832     {
1833       std::string name(m->getDescription());
1834       if(!name.empty())
1835         {
1836           if(_desc_name!=name)
1837             {
1838               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : description of current MEDfile mesh is '" << _desc_name << "' whereas name of input mesh is : '";
1839               oss << name << "' ! Names must match !";
1840               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1841             }
1842         }
1843     }
1844 }
1845
1846 void MEDFileMesh::getFamilyRepr(std::ostream& oss) const
1847 {
1848   oss << "(**************************)\n(* FAMILIES OF THE MESH : *)\n(**************************)\n";
1849   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1850     {
1851       oss << "- Family with name \"" << (*it).first << "\" with number " << (*it).second << std::endl;
1852       oss << "  - Groups lying on this family : ";
1853       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first.c_str());
1854       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1855       oss << std::endl << std::endl;
1856     }
1857 }
1858
1859 /*!
1860  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1861  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
1862  * iteration.
1863  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1864  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
1865  *  \param [in] dt - the number of a time step.
1866  *  \param [in] it - the number of an iteration.
1867  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1868  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1869  *  \throw If the file is not readable.
1870  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
1871  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1872  */
1873 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1874 {
1875   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1876   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
1877   return new MEDFileUMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
1878 }
1879
1880 /*!
1881  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1882  * file. The first mesh in the file is loaded.
1883  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1884  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1885  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1886  *  \throw If the file is not readable.
1887  *  \throw If there is no meshes in the file.
1888  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1889  */
1890 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1891 {
1892   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
1893   if(ms.empty())
1894     {
1895       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
1896       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1897     }
1898   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1899   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
1900   int dt,it;
1901   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
1902   std::string dummy2;
1903   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
1904   return new MEDFileUMesh(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
1905 }
1906
1907 /*!
1908  * Returns an empty instance of MEDFileUMesh.
1909  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1910  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1911  */
1912 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New()
1913 {
1914   return new MEDFileUMesh;
1915 }
1916
1917 std::size_t MEDFileUMesh::getHeapMemorySize() const
1918 {
1919   std::size_t ret=MEDFileMesh::getHeapMemorySize();
1920   if((const DataArrayDouble*)_coords)
1921     ret+=_coords->getHeapMemorySize();
1922   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
1923     ret+=_fam_coords->getHeapMemorySize();
1924   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
1925     ret+=_num_coords->getHeapMemorySize();
1926   if((const DataArrayInt *)_rev_num_coords)
1927     ret+=_rev_num_coords->getHeapMemorySize();
1928   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
1929     ret+=_name_coords->getHeapMemorySize();
1930   ret+=_ms.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>));
1931   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
1932     if((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it)
1933       ret+=(*it)->getHeapMemorySize();
1934   return ret;
1935 }
1936
1937 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::shallowCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1938 {
1939   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
1940   return ret.retn();
1941 }
1942
1943 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::createNewEmpty() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1944 {
1945   return new MEDFileUMesh;
1946 }
1947
1948 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1949 {
1950   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
1951   if((const DataArrayDouble*)_coords)
1952     ret->_coords=_coords->deepCpy();
1953   if((const DataArrayInt*)_fam_coords)
1954     ret->_fam_coords=_fam_coords->deepCpy();
1955   if((const DataArrayInt*)_num_coords)
1956     ret->_num_coords=_num_coords->deepCpy();
1957   if((const DataArrayInt*)_rev_num_coords)
1958     ret->_rev_num_coords=_rev_num_coords->deepCpy();
1959   if((const DataArrayAsciiChar*)_name_coords)
1960     ret->_name_coords=_name_coords->deepCpy();
1961   std::size_t i=0;
1962   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
1963     {
1964       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
1965         ret->_ms[i]=(*it)->deepCpy();
1966     }
1967   return ret.retn();
1968 }
1969
1970 /*!
1971  * Checks if \a this and another mesh are equal.
1972  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
1973  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
1974  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
1975  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
1976  */
1977 bool MEDFileUMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
1978 {
1979   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
1980     return false;
1981   const MEDFileUMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(other);
1982   if(!otherC)
1983     {
1984       what="Mesh types differ ! This is unstructured and other is NOT !";
1985       return false;
1986     }
1987   clearNonDiscrAttributes();
1988   otherC->clearNonDiscrAttributes();
1989   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
1990   const DataArrayDouble *coo2=otherC->_coords;
1991   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
1992     {
1993       what="Mismatch of coordinates ! One is defined and not other !";
1994       return false;
1995     }
1996   if(coo1)
1997     {
1998       bool ret=coo1->isEqual(*coo2,eps);
1999       if(!ret)
2000         {
2001           what="Coords differ !";
2002           return false;
2003         }
2004     }
2005   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2006   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_coords;
2007   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
2008     {
2009       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
2010       return false;
2011     }
2012   if(famc1)
2013     {
2014       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
2015       if(!ret)
2016         {
2017           what="Families arr on node differ !";
2018           return false;
2019         }
2020     }
2021   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2022   const DataArrayInt *numc2=otherC->_num_coords;
2023   if((numc1==0 && numc2!=0) || (numc1!=0 && numc2==0))
2024     {
2025       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
2026       return false;
2027     }
2028   if(numc1)
2029     {
2030       bool ret=numc1->isEqual(*numc2);
2031       if(!ret)
2032         {
2033           what="Numbering arr on node differ !";
2034           return false;
2035         }
2036     }
2037   const DataArrayAsciiChar *namec1=_name_coords;
2038   const DataArrayAsciiChar *namec2=otherC->_name_coords;
2039   if((namec1==0 && namec2!=0) || (namec1!=0 && namec2==0))
2040     {
2041       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
2042       return false;
2043     }
2044   if(namec1)
2045     {
2046       bool ret=namec1->isEqual(*namec2);
2047       if(!ret)
2048         {
2049           what="Names arr on node differ !";
2050           return false;
2051         }
2052     }
2053   if(_ms.size()!=otherC->_ms.size())
2054     {
2055       what="Number of levels differs !";
2056       return false;
2057     }
2058   std::size_t sz=_ms.size();
2059   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2060     {
2061       const MEDFileUMeshSplitL1 *s1=_ms[i];
2062       const MEDFileUMeshSplitL1 *s2=otherC->_ms[i];
2063       if((s1==0 && s2!=0) || (s1!=0 && s2==0))
2064         {
2065           what="Mismatch of presence of sub levels !";
2066           return false;
2067         }
2068       if(s1)
2069         {
2070           bool ret=s1->isEqual(s2,eps,what);
2071           if(!ret)
2072             return false;
2073         }
2074     }
2075   return true;
2076 }
2077
2078 /*!
2079  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
2080  */
2081 void MEDFileUMesh::clearNonDiscrAttributes() const
2082 {
2083   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
2084   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2085   if(coo1)
2086     (const_cast<DataArrayDouble *>(coo1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2087   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2088   if(famc1)
2089     (const_cast<DataArrayInt *>(famc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2090   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2091   if(numc1)
2092     (const_cast<DataArrayInt *>(numc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2093   const DataArrayAsciiChar *namc1=_name_coords;
2094   if(namc1)
2095     (const_cast<DataArrayAsciiChar *>(namc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2096   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2097     {
2098       const MEDFileUMeshSplitL1 *tmp=(*it);
2099       if(tmp)
2100         tmp->clearNonDiscrAttributes();
2101     }
2102 }
2103
2104 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh()
2105 {
2106 }
2107
2108 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2109 try
2110   {
2111     loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
2112   }
2113 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2114   {
2115     throw e;
2116   }
2117
2118 void MEDFileUMesh::loadUMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2119 {
2120   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2121   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2122   int dummy0,dummy1;
2123   std::string dummy2;
2124   int mid=MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
2125   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2126     {
2127       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2128       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2129     }
2130   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it,mrs);
2131   int lev=loaderl2.getNumberOfLevels();
2132   _ms.resize(lev);
2133   for(int i=0;i<lev;i++)
2134     {
2135       if(!loaderl2.emptyLev(i))
2136         _ms[i]=new MEDFileUMeshSplitL1(loaderl2,mName,i);
2137       else
2138         _ms[i]=0;
2139     }
2140   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
2141   //
2142   setName(loaderl2.getName());
2143   setDescription(loaderl2.getDescription());
2144   setUnivName(loaderl2.getUnivName());
2145   setIteration(loaderl2.getIteration());
2146   setOrder(loaderl2.getOrder());
2147   setTimeValue(loaderl2.getTime());
2148   setTimeUnit(loaderl2.getTimeUnit());
2149   _coords=loaderl2.getCoords();
2150   if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
2151     _fam_coords=loaderl2.getCoordsFamily();
2152   if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
2153     _num_coords=loaderl2.getCoordsNum();
2154   if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
2155     _name_coords=loaderl2.getCoordsName();
2156   computeRevNum();
2157 }
2158
2159 MEDFileUMesh::~MEDFileUMesh()
2160 {
2161 }
2162
2163 void MEDFileUMesh::writeLL(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2164 {
2165   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2166   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
2167   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
2168   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
2169   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
2170   int spaceDim=coo?coo->getNumberOfComponents():0;
2171   int mdim=getMeshDimension();
2172   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2173   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2174   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
2175     {
2176       std::string info=coo->getInfoOnComponent(i);
2177       std::string c,u;
2178       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
2179       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2180       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2181     }
2182   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,mdim,MED_UNSTRUCTURED_MESH,desc,"",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
2183   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
2184   MEDFileUMeshL2::WriteCoords(fid,maa,_iteration,_order,_time,_coords,_fam_coords,_num_coords,_name_coords);
2185   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2186     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2187       (*it)->write(fid,maa,mdim);
2188   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa,_families,_groups,_too_long_str);
2189 }
2190
2191 /*!
2192  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
2193  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2194  */
2195 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevels() const
2196 {
2197   std::vector<int> ret;
2198   int lev=0;
2199   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2200     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2201       if(!(*it)->empty())
2202         ret.push_back(lev);
2203   return ret;
2204 }
2205
2206 /*!
2207  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
2208  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2209  */
2210 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
2211 {
2212   std::vector<int> ret0=getNonEmptyLevels();
2213   if((const DataArrayDouble *) _coords)
2214     {
2215       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2216       ret[0]=1;
2217       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2218       return ret;
2219     }
2220   return ret0;
2221 }
2222
2223 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
2224 {
2225   std::vector<int> ret;
2226   const DataArrayInt *famCoo(_fam_coords);
2227   if(famCoo)
2228     ret.push_back(1);
2229   int lev=0;
2230   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2231     {
2232       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2233       if(cur)
2234         if(cur->getFamilyField())
2235           ret.push_back(lev);
2236     }
2237   return ret;
2238 }
2239
2240 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
2241 {
2242   std::vector<int> ret;
2243   const DataArrayInt *numCoo(_num_coords);
2244   if(numCoo)
2245     ret.push_back(1);
2246   int lev=0;
2247   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2248     {
2249       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2250       if(cur)
2251         if(cur->getNumberField())
2252           ret.push_back(lev);
2253     }
2254   return ret;
2255 }
2256
2257 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
2258 {
2259   std::vector<int> ret;
2260   const DataArrayAsciiChar *nameCoo(_name_coords);
2261   if(nameCoo)
2262     ret.push_back(1);
2263   int lev=0;
2264   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2265     {
2266       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2267       if(cur)
2268         if(cur->getNameField())
2269           ret.push_back(lev);
2270     }
2271   return ret;
2272 }
2273
2274 /*!
2275  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given group is defined.
2276  * To include nodes, call getGrpNonEmptyLevelsExt() method.
2277  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2278  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2279  */
2280 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevels(const char *grp) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2281 {
2282   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2283   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2284 }
2285
2286 /*!
2287  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given group is defined.
2288  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2289  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2290  */
2291 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevelsExt(const char *grp) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2292 {
2293   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2294   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2295 }
2296
2297 /*!
2298  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given family is defined.
2299  * To include nodes, call getFamNonEmptyLevelsExt() method.
2300  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2301  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2302  */
2303 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevels(const char *fam) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2304 {
2305   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2306   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2307 }
2308
2309 /*!
2310  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given family is defined.
2311  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2312  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2313  */
2314 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevelsExt(const char *fam) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2315 {
2316   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2317   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2318 }
2319
2320 /*!
2321  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given groups are defined.
2322  * To include nodes, call getGrpsNonEmptyLevelsExt() method.
2323  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2324  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2325  */
2326 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2327 {
2328   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2329   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2330 }
2331
2332 /*!
2333  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given groups are defined.
2334  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2335  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2336  */
2337 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2338 {
2339   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2340   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2341 }
2342
2343 /*!
2344  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given families are defined.
2345  * To include nodes, call getFamsNonEmptyLevelsExt() method.
2346  *  \param [in] fams - the name of the family of interest.
2347  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2348  */
2349 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2350 {
2351   std::vector<int> ret;
2352   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
2353   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2354   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
2355     if(_ms[-(*it)]->presenceOfOneFams(famIds))
2356       ret.push_back(*it);
2357   return ret;
2358 }
2359
2360 /*!
2361  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given families are defined.
2362  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2363  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2364  */
2365 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2366 {
2367   std::vector<int> ret0=getFamsNonEmptyLevels(fams);
2368   const DataArrayInt *famCoords=_fam_coords;
2369   if(!famCoords)
2370     return ret0;
2371   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2372   if(famCoords->presenceOfValue(famIds))
2373     {
2374       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2375       ret[0]=1;
2376       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2377       return ret;
2378     }
2379   else
2380     return ret0;
2381 }
2382
2383 /*!
2384  * Returns names of groups that partly or fully appear on the level \a meshDimRelToMaxExt.
2385  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of interest.
2386  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names at \a meshDimRelToMaxExt
2387  *          level. 
2388  */
2389 std::vector<std::string> MEDFileUMesh::getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2390 {
2391   std::vector<std::string> ret;
2392   std::vector<std::string> allGrps=getGroupsNames();
2393   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=allGrps.begin();it!=allGrps.end();it++)
2394     {
2395       std::vector<int> levs=getGrpNonEmptyLevelsExt((*it).c_str());
2396       if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)!=levs.end())
2397         ret.push_back(*it);
2398     }
2399   return ret;
2400 }
2401
2402 int MEDFileUMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2403 {
2404   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2405   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2406     {
2407       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2408       ret=std::max(ret,std::abs(val));
2409     }
2410   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2411     {
2412       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2413         {
2414           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2415           if(da)
2416             {
2417               int val=da->getMaxValue(tmp);
2418               ret=std::max(ret,std::abs(val));
2419             }
2420         }
2421     }
2422   return ret;
2423 }
2424
2425 int MEDFileUMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2426 {
2427   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2428   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2429     {
2430       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2431       ret=std::max(ret,val);
2432     }
2433   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2434     {
2435       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2436         {
2437           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2438           if(da)
2439             {
2440               int val=da->getMaxValue(tmp);
2441               ret=std::max(ret,val);
2442             }
2443         }
2444     }
2445   return ret;
2446 }
2447
2448 int MEDFileUMesh::getMinFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2449 {
2450   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2451   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2452     {
2453       int val=_fam_coords->getMinValue(tmp);
2454       ret=std::min(ret,val);
2455     }
2456   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2457     {
2458       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2459         {
2460           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2461           if(da)
2462             {
2463               int val=da->getMinValue(tmp);
2464               ret=std::min(ret,val);
2465             }
2466         }
2467     }
2468   return ret;
2469 }
2470
2471 /*!
2472  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
2473  *  \return int - the mesh dimension.
2474  *  \throw If there are no cells in this mesh.
2475  */
2476 int MEDFileUMesh::getMeshDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2477 {
2478   int lev=0;
2479   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev++)
2480     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2481       return (*it)->getMeshDimension()+lev;
2482   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getMeshDimension : impossible to find a mesh dimension !");
2483 }
2484
2485 /*!
2486  * Returns the space dimension of \a this mesh that is equal to number of components in
2487  * the node coordinates array.
2488  *  \return int - the space dimension of \a this mesh.
2489  *  \throw If the node coordinates array is not available.
2490  */
2491 int MEDFileUMesh::getSpaceDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2492 {
2493   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2494   if(!coo)
2495     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getSpaceDimension : no coords set !");
2496   return coo->getNumberOfComponents();
2497 }
2498
2499 /*!
2500  * Returns a string describing \a this mesh.
2501  *  \return std::string - the mesh information string.
2502  */
2503 std::string MEDFileUMesh::simpleRepr() const
2504 {
2505   std::ostringstream oss;
2506   oss << MEDFileMesh::simpleRepr();
2507   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2508   oss << "- The dimension of the space is ";
2509   static const char MSG1[]= "*** NO COORDS SET ***";
2510   static const char MSG2[]= "*** NO CONNECTIVITY SET FOR THIS LEVEL***";
2511   if(coo)
2512     oss << _coords->getNumberOfComponents() << std::endl;
2513   else
2514     oss << MSG1 << std::endl;
2515   oss << "- Type of the mesh : UNSTRUCTURED\n";
2516   oss << "- Number of nodes : ";
2517   if(coo)
2518     oss << _coords->getNumberOfTuples() << std::endl;
2519   else
2520     oss << MSG1 << std::endl;
2521   std::size_t nbOfLev=_ms.size();
2522   oss << "- Number of levels allocated : " << nbOfLev << std::endl;
2523   for(std::size_t i=0;i<nbOfLev;i++)
2524     {
2525       const MEDFileUMeshSplitL1 *lev=_ms[i];
2526       oss << "  - Level #" << -((int) i) << " has dimension : ";
2527       if(lev)
2528         {
2529           oss << lev->getMeshDimension() << std::endl;
2530           lev->simpleRepr(oss);
2531         }
2532       else
2533         oss << MSG2 << std::endl;
2534     }
2535   oss << "- Number of families : " << _families.size() << std::endl << std::endl;
2536   if(coo)
2537     {
2538       oss << "(***********************)\n(* NODES OF THE MESH : *)\n(***********************)\n";
2539       oss << "- Names of coordinates :" << std::endl;
2540       std::vector<std::string> vars=coo->getVarsOnComponent();
2541       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2542       oss << std::endl << "- Units of coordinates : " << std::endl;
2543       std::vector<std::string> units=coo->getUnitsOnComponent();
2544       std::copy(units.begin(),units.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2545     }
2546   oss << std::endl << std::endl;
2547   getFamilyRepr(oss);
2548   return oss.str();
2549 }
2550
2551 /*!
2552  * Returns a full textual description of \a this mesh.
2553  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
2554  */
2555 std::string MEDFileUMesh::advancedRepr() const
2556 {
2557   return simpleRepr();
2558 }
2559
2560 /*!
2561  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
2562  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2563  *  \return int - the number of entities.
2564  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
2565  */
2566 int MEDFileUMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2567 {
2568   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2569     {
2570       if(!((const DataArrayDouble *)_coords))
2571         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getSizeAtLevel : no coordinates specified !");
2572       return _coords->getNumberOfTuples();
2573     }
2574   return getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt)->getSize();
2575 }
2576
2577 /*!
2578  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
2579  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2580  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
2581  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
2582  */
2583 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2584 {
2585   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2586     return _fam_coords;
2587   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2588   return l1->getFamilyField();
2589 }
2590
2591 /*!
2592  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
2593  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2594  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
2595  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2596  */
2597 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2598 {
2599   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2600     return _num_coords;
2601   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2602   return l1->getNumberField();
2603 }
2604
2605 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2606 {
2607   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2608     return _name_coords;
2609   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2610   return l1->getNameField();
2611 }
2612
2613 int MEDFileUMesh::getNumberOfNodes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2614 {
2615   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2616   if(!coo)
2617     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getNumberOfNodes : no coords set !");
2618   return coo->getNumberOfTuples();
2619 }
2620
2621 void MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobs *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2622 {
2623   std::size_t sz(st.getNumberOfItems());
2624   int mdim(getMeshDimension());
2625   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2626     {
2627       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType curGt(st[i].getGeo());
2628       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(curGt);
2629       int relDim((int)cm.getDimension()-mdim);
2630       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> um(getMeshAtLevel(relDim));
2631       std::vector<int> d(um->getDistributionOfTypes());
2632       std::size_t nbOfTypes(d.size()/3);
2633       int offset=0,nbOfEltWT=-1;
2634       for(std::size_t j=0;j<nbOfTypes;j++)
2635         {
2636           if(d[3*j]!=(int)curGt)
2637             offset+=d[3*j+1];
2638           else
2639             { break; nbOfEltWT=d[3*j+1]; }
2640         }
2641       if(nbOfEltWT==-1)
2642         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched : asking for a geo type not present in this !");
2643       um=dynamic_cast<MEDCouplingUMesh *>(um->buildPartOfMySelf2(offset,offset+nbOfEltWT,1,true));
2644       if(st[i].getPflName().empty())
2645         um->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2646       else
2647         {
2648           const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[i].getPflName().c_str()));
2649           um=dynamic_cast<MEDCouplingUMesh *>(um->buildPartOfMySelf(arr->begin(),arr->end(),true));
2650           um->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2651         }
2652     }
2653 }
2654
2655 /*!
2656  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
2657  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2658  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2659  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
2660  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2661  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2662  */
2663 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2664 {
2665   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2666     {
2667       if(!((const DataArrayInt *)_num_coords))
2668         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no coordinates renum specified !");
2669       return _rev_num_coords;
2670     }
2671   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2672   return l1->getRevNumberField();
2673 }
2674
2675 /*!
2676  * Returns a pointer to the node coordinates array of \a this mesh \b without
2677  * incrementing its reference counter, thus there is no need to decrRef() it by the caller.
2678  */
2679 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::getCoords() const
2680 {
2681   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp(_coords);
2682   if((DataArrayDouble *)tmp)
2683     {
2684       return tmp;
2685     }
2686   return 0;
2687 }
2688
2689 /*!
2690  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2691  * group of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2692  * new mesh.
2693  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2694  *  \param [in] grp - the name of the group whose mesh entities are included in the
2695  *          new mesh.
2696  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2697  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2698  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2699  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2700  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
2701  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2702  */
2703 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const char *grp, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2704 {
2705   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2706   std::vector<std::string> tmp(1);
2707   tmp[0]=grp;
2708   return getGroups(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2709 }
2710
2711 /*!
2712  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2713  * groups of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2714  * new mesh.
2715  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2716  *  \param [in] grps - a sequence of group names whose mesh entities are included in the
2717  *          new mesh.
2718  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2719  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2720  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2721  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2722  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
2723  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2724  */
2725 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2726 {
2727   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2728   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
2729   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet=getFamilies(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
2730   if(grps.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2731     zeRet->setName(grps[0].c_str());
2732   return zeRet.retn();
2733 }
2734
2735 /*!
2736  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2737  * family of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2738  * new mesh.
2739  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2740  *  \param [in] fam - the name of the family whose mesh entities are included in the
2741  *          new mesh.
2742  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2743  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2744  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2745  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2746  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a grps.
2747  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2748  */
2749 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const char *fam, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2750 {
2751   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2752   std::vector<std::string> tmp(1);
2753   tmp[0]=fam;
2754   return getFamilies(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2755 }
2756
2757 /*!
2758  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2759  * families of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2760  * new mesh.
2761  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2762  *  \param [in] fams - a sequence of family names whose mesh entities are included in the
2763  *          new mesh.
2764  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2765  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2766  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2767  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2768  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a fams.
2769  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2770  */
2771 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2772 {
2773   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2774   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2775     {
2776       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr=getFamiliesArr(1,fams,renum);
2777       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New();
2778       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> c=_coords->selectByTupleId(arr->getConstPointer(),arr->getConstPointer()+arr->getNbOfElems());
2779       ret->setCoords(c);
2780       return ret.retn();
2781     }
2782   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2783   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2784   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet;
2785   if(!famIds.empty())
2786     zeRet=l1->getFamilyPart(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2787   else
2788     zeRet=l1->getFamilyPart(0,0,renum);
2789   if(fams.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2790     zeRet->setName(fams[0].c_str());
2791   return zeRet.retn();
2792 }
2793
2794 /*!
2795  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
2796  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
2797  *          are required.
2798  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2799  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
2800  *          returned instead of ids.
2801  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
2802  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
2803  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
2804  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
2805  */
2806 DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2807 {
2808   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2809   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2810     {
2811       if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2812         {
2813           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
2814           if(!famIds.empty())
2815             da=_fam_coords->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
2816           else
2817             da=_fam_coords->getIdsEqualList(0,0);
2818           if(renum)
2819             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_coords,da);
2820           else
2821             return da.retn();
2822         }
2823       else
2824         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
2825     }
2826   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2827   if(!famIds.empty())
2828     return l1->getFamilyPartArr(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2829   else
2830     return l1->getFamilyPartArr(0,0,renum);
2831 }
2832
2833 /*!
2834  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2835  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2836  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2837  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
2838  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
2839  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
2840  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2841  *          optional numbers of mesh entities.
2842  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2843  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2844  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2845  * \sa getGenMeshAtLevel()
2846  */
2847 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2848 {
2849   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2850   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2851     {
2852       if(!renum)
2853         {
2854           MEDCouplingUMesh *umesh=MEDCouplingUMesh::New();
2855           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> cc=_coords->deepCpy();
2856           umesh->setCoords(cc);
2857           MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(umesh);
2858           umesh->setName(getName());
2859           return umesh;
2860         }
2861     }
2862   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2863   return l1->getWholeMesh(renum);
2864 }
2865
2866 /*!
2867  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2868  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2869  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2870  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
2871  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
2872  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
2873  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2874  *          optional numbers of mesh entities.
2875  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2876  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2877  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMax dimension in \a this mesh.
2878  * \sa getMeshAtLevel()
2879  */
2880 MEDCouplingMesh *MEDFileUMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2881 {
2882   return getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
2883 }
2884
2885 /*!
2886  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == 0.
2887  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2888  *          optional numbers of mesh entities.
2889  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2890  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2891  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == 0 in \a this mesh.
2892  */
2893 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevel0Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2894 {
2895   return getMeshAtLevel(0,renum);
2896 }
2897
2898 /*!
2899  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -1.
2900  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2901  *          optional numbers of mesh entities.
2902  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2903  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2904  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -1 in \a this mesh.
2905  */
2906 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM1Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2907 {
2908   return getMeshAtLevel(-1,renum);
2909 }
2910
2911 /*!
2912  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -2.
2913  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2914  *          optional numbers of mesh entities.
2915  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2916  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2917  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -2 in \a this mesh.
2918  */
2919 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM2Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2920 {
2921   return getMeshAtLevel(-2,renum);
2922 }
2923
2924 /*!
2925  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -3.
2926  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2927  *          optional numbers of mesh entities.
2928  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2929  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2930  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -3 in \a this mesh.
2931  */
2932 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM3Mesh(bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2933 {
2934   return getMeshAtLevel(-3,renum);
2935 }
2936
2937 const MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2938 {
2939   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2940     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
2941   if(meshDimRelToMaxExt>1)
2942     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
2943   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
2944   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
2945     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
2946   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
2947     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
2948   return _ms[tracucedRk];
2949 }
2950
2951 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2952 {
2953    if(meshDimRelToMaxExt==1)
2954     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
2955   if(meshDimRelToMaxExt>1)
2956     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
2957   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
2958   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
2959     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
2960   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
2961     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
2962   return _ms[tracucedRk];
2963 }
2964
2965 void MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2966 {
2967   if(-meshDimRelToMax>=(int)_ms.size())
2968     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : The meshdim of mesh is not managed by 'this' !");
2969   int i=0;
2970   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
2971     {
2972       if(((const MEDFileUMeshSplitL1*) (*it))!=0)
2973         {
2974           int ref=(*it)->getMeshDimension();
2975           if(ref+i!=meshDim-meshDimRelToMax)
2976             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : no coherency between levels !");
2977         }
2978     }
2979 }
2980
2981 /*!
2982  * Sets the node coordinates array of \a this mesh.
2983  *  \param [in] coords - the new node coordinates array.
2984  *  \throw If \a coords == \c NULL.
2985  */
2986
2987 void MEDFileUMesh::setCoords(DataArrayDouble *coords) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
2988 {
2989   if(!coords)
2990     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setCoords : null pointer in input !");
2991   coords->checkAllocated();
2992   int nbOfTuples=coords->getNumberOfTuples();
2993   _coords=coords;
2994   coords->incrRef();
2995   _fam_coords=DataArrayInt::New();
2996   _fam_coords->alloc(nbOfTuples,1);
2997   _fam_coords->fillWithZero();
2998 }
2999
3000 /*!
3001  * Removes all groups of a given dimension in \a this mesh.
3002  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
3003  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3004  */
3005 void MEDFileUMesh::eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3006 {
3007   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3008     {
3009       if((DataArrayInt *)_fam_coords)
3010         _fam_coords->fillWithZero();
3011       return ;
3012     }
3013   MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3014   l1->eraseFamilyField();
3015   optimizeFamilies();
3016 }
3017
3018 /*!
3019  * Removes all families with ids not present in the family fields of \a this mesh.
3020  */
3021 void MEDFileUMesh::optimizeFamilies() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3022 {
3023   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3024   std::set<int> allFamsIds;
3025   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
3026     {
3027       const DataArrayInt *ffield=getFamilyFieldAtLevel(*it);
3028       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=ffield->getDifferentValues();
3029       std::set<int> res;
3030       std::set_union(ids->begin(),ids->end(),allFamsIds.begin(),allFamsIds.end(),std::inserter(res,res.begin()));
3031       allFamsIds=res;
3032     }
3033   std::set<std::string> famNamesToKill;
3034   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
3035     {
3036       if(allFamsIds.find((*it).second)!=allFamsIds.end())
3037         famNamesToKill.insert((*it).first);
3038     }
3039   for(std::set<std::string>::const_iterator it=famNamesToKill.begin();it!=famNamesToKill.end();it++)
3040     _families.erase(*it);
3041   std::vector<std::string> grpNamesToKill;
3042   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
3043     {
3044       std::vector<std::string> tmp;
3045       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
3046         {
3047           if(famNamesToKill.find(*it2)==famNamesToKill.end())
3048             tmp.push_back(*it2);
3049         }
3050       if(!tmp.empty())
3051         (*it).second=tmp;
3052       else
3053         tmp.push_back((*it).first);
3054     }
3055   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grpNamesToKill.begin();it!=grpNamesToKill.end();it++)
3056     _groups.erase(*it);
3057 }
3058
3059 void MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group(const char *grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3060 {
3061   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3062   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)==levs.end() || std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)==levs.end())
3063     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : This method works only for mesh definied on level 0 and -1 !");
3064   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m0=getMeshAtLevel(0);
3065   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1=getMeshAtLevel(-1);
3066   int nbNodes=m0->getNumberOfNodes();
3067   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m11=getGroup(-1,grpNameM1);
3068   DataArrayInt *tmp00=0,*tmp11=0,*tmp22=0;
3069   m0->findNodesToDuplicate(*m11,tmp00,tmp11,tmp22);
3070   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nodeIdsToDuplicate(tmp00);
3071   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn0(tmp11);
3072   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn1(tmp22);
3073   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m0->buildPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),true));
3074   // node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group 'grpNameM1' on level -1
3075   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> descTmp0=DataArrayInt::New(),descITmp0=DataArrayInt::New(),revDescTmp0=DataArrayInt::New(),revDescITmp0=DataArrayInt::New();
3076   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0Desc=tmp0->buildDescendingConnectivity(descTmp0,descITmp0,revDescTmp0,revDescITmp0);
3077   descTmp0=0; descITmp0=0; revDescTmp0=0; revDescITmp0=0;
3078   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW2=tmp0Desc->getCellIdsLyingOnNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),false);
3079   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> cellsInM1ToRenumW3=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(tmp0Desc->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenumW2->begin(),cellsInM1ToRenumW2->end(),true));
3080   DataArrayInt *cellsInM1ToRenumW4Tmp=0;
3081   m1->areCellsIncludedIn(cellsInM1ToRenumW3,2,cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3082   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW4(cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3083   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW5=cellsInM1ToRenumW4->getIdsInRange(0,m1->getNumberOfCells());
3084   cellsInM1ToRenumW5->transformWithIndArr(cellsInM1ToRenumW4->begin(),cellsInM1ToRenumW4->end());
3085   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpIds=getGroupArr(-1,grpNameM1);
3086   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenum=cellsInM1ToRenumW5->buildSubstraction(grpIds);
3087   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1Part=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),true));
3088   m1Part->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes);
3089   m1->setPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),*m1Part);
3090   // end of node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group of level -1 'grpNameM1'
3091   tmp0->duplicateNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end());
3092   m0->setCoords(tmp0->getCoords());
3093   m0->setPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),*tmp0);
3094   m1->setCoords(m0->getCoords());
3095   _coords=m0->getCoords(); _coords->incrRef();
3096   // duplication of cells in group 'grpNameM1' on level -1
3097   m11->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes); m11->setCoords(m0->getCoords());
3098   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> v(2); v[0]=m1; v[1]=m11;
3099   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> newm1=MEDCouplingUMesh::AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(v,tmp00,tmp11);
3100   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> szOfCellGrpOfSameType(tmp00);
3101   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idInMsOfCellGrpOfSameType(tmp11);
3102   //
3103   newm1->setName(getName());
3104   const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
3105   if(!fam)
3106     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : internal problem !");
3107   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFam=DataArrayInt::New();
3108   newFam->alloc(newm1->getNumberOfCells(),1);
3109   int idd=getMaxFamilyId()+1;
3110   int globStart=0,start=0,end,globEnd;
3111   int nbOfChunks=szOfCellGrpOfSameType->getNumberOfTuples();
3112   for(int i=0;i<nbOfChunks;i++)
3113     {
3114       globEnd=globStart+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3115       if(idInMsOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0)==0)
3116         {
3117           end=start+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3118           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> part=fam->selectByTupleId2(start,end,1);
3119           newFam->setPartOfValues1(part,globStart,globEnd,1,0,1,1,true);
3120           start=end;
3121         }
3122       else
3123         {
3124           newFam->setPartOfValuesSimple1(idd,globStart,globEnd,1,0,1,1);
3125         }
3126       globStart=globEnd;
3127     }
3128   newm1->setCoords(getCoords());
3129   setMeshAtLevel(-1,newm1);
3130   setFamilyFieldArr(-1,newFam);
3131   std::string grpName2(grpNameM1); grpName2+="_dup";
3132   addFamily(grpName2.c_str(),idd);
3133   addFamilyOnGrp(grpName2.c_str(),grpName2.c_str());
3134   //
3135   fam=_fam_coords;
3136   if(fam)
3137     {
3138       int newNbOfNodes=getCoords()->getNumberOfTuples();
3139       newFam=DataArrayInt::New(); newFam->alloc(newNbOfNodes,1);
3140       newFam->setPartOfValues1(fam,0,nbNodes,1,0,1,1,true);
3141       newFam->setPartOfValuesSimple1(0,nbNodes,newNbOfNodes,1,0,1,1);
3142       _fam_coords=newFam;
3143     }
3144   nodesDuplicated=nodeIdsToDuplicate.retn();
3145   cellsModified=cellsToModifyConn0.retn();
3146   cellsNotModified=cellsToModifyConn1.retn();
3147 }
3148
3149 /*!
3150  * \param [out] oldCode retrieves the distribution of types before the call if true is returned
3151  * \param [out] newCode etrieves the distribution of types after the call if true is returned
3152  * \param [out] o2nRenumCell tells for **all levels** the old 2 new renumbering of cells.
3153  * 
3154  * \return false if no modification has been performed linked to the unpolyzation. Neither cell type, not cell numbers. When false is returned no need of field on cells or on gauss renumbering.
3155  * Inversely, if true is returned, it means that distribution of cell by geometric type has changed and field on cell and field on gauss point must be renumbered.
3156  */
3157 bool MEDFileUMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3158 {
3159   o2nRenumCell=0; oldCode.clear(); newCode.clear();
3160   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3161   bool ret=false;
3162   std::vector< const DataArrayInt* > renumCellsSplited;//same than memorySaverIfThrow
3163   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > memorySaverIfThrow;//same than renumCellsSplited only in case of throw
3164   int start=0;
3165   int end=0;
3166   for(std::vector<int>::reverse_iterator it=levs.rbegin();it!=levs.rend();it++)
3167     {
3168       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*it);
3169       std::vector<int> code1=m->getDistributionOfTypes();
3170       end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code1,start);
3171       oldCode.insert(oldCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3172       bool hasChanged=m->unPolyze();
3173       DataArrayInt *fake=0;
3174       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart=m->getLevArrPerCellTypes(MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER,
3175                                                                                            MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER+MEDCouplingUMesh::N_MEDMEM_ORDER,fake);
3176       fake->decrRef();
3177       renumCellsSplited.push_back(o2nCellsPart); memorySaverIfThrow.push_back(o2nCellsPart);
3178       if(hasChanged)
3179         {
3180           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart2=o2nCellsPart->buildPermArrPerLevel();
3181           m->renumberCells(o2nCellsPart2->getConstPointer(),false);
3182           ret=true;
3183           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famField2,numField2;
3184           const DataArrayInt *famField=getFamilyFieldAtLevel(*it); if(famField) { famField->incrRef(); famField2=const_cast<DataArrayInt *>(famField); }
3185           const DataArrayInt *numField=getNumberFieldAtLevel(*it); if(numField) { numField->incrRef(); numField2=const_cast<DataArrayInt *>(numField); }
3186           setMeshAtLevel(*it,m);
3187           std::vector<int> code2=m->getDistributionOfTypes();
3188           end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code2,start);
3189           newCode.insert(newCode.end(),code2.begin(),code2.end());
3190           //
3191           if(o2nCellsPart2->isIdentity())
3192             continue;
3193           if(famField)
3194             {
3195               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamField=famField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3196               setFamilyFieldArr(*it,newFamField);
3197             }
3198           if(numField)
3199             {
3200               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumField=numField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3201               setRenumFieldArr(*it,newNumField);
3202             }
3203         }
3204       else
3205         {
3206           newCode.insert(newCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3207         }
3208       start=end;
3209     }
3210   if(ret)
3211     {
3212       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> renumCells=DataArrayInt::Aggregate(renumCellsSplited);
3213       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nRenumCellRet=renumCells->buildPermArrPerLevel();
3214       o2nRenumCell=o2nRenumCellRet.retn();
3215     }
3216   return ret;
3217 }
3218
3219 struct MEDLoaderAccVisit1
3220 {
3221   MEDLoaderAccVisit1():_new_nb_of_nodes(0) { }
3222   int operator()(bool val) { return val?_new_nb_of_nodes++:-1; }
3223   int _new_nb_of_nodes;
3224 };
3225
3226 /*!
3227  * Array returned is the correspondance in \b old \b to \b new format. The returned array is newly created and should be dealt by the caller.
3228  * The maximum value stored in returned array is the number of nodes of \a this minus 1 after call of this method.
3229  * The size of returned array is the number of nodes of the old (previous to the call of this method) number of nodes.
3230  * -1 values in returned array means that the corresponding old node is no more used.
3231  *
3232  * \return newly allocated array containing correspondance in \b old \b to \b new format. If all nodes in \a this are fetched \c NULL pointer is returned and nothing
3233  *         is modified in \a this.
3234  * \throw If no coordinates are set in \a this or if there is in any available mesh in \a this a cell having a nodal connectivity containing a node id not in the range of
3235  *  set coordinates.
3236  */
3237 DataArrayInt *MEDFileUMesh::zipCoords() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3238 {
3239   const DataArrayDouble *coo=getCoords();
3240   if(!coo)
3241     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::zipCoords : no coordinates set in this !");
3242   int nbOfNodes=coo->getNumberOfTuples();
3243   std::vector<bool> nodeIdsInUse(nbOfNodes,false);
3244   std::vector<int> neLevs=getNonEmptyLevels();
3245   for(std::vector<int>::const_iterator lev=neLevs.begin();lev!=neLevs.end();lev++)
3246     {
3247       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*lev);
3248       m->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3249     }
3250   int nbrOfNodesInUse=(int)std::count(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),true);
3251   if(nbrOfNodesInUse==nbOfNodes)
3252     return 0;
3253   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New(); ret->alloc(nbOfNodes,1);
3254   std::transform(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),ret->getPointer(),MEDLoaderAccVisit1());
3255   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2=ret->invertArrayO2N2N2OBis(nbrOfNodesInUse);
3256   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> newCoords=coo->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3257   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamCoords;
3258   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> newNameCoords;
3259   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
3260     newFamCoords=_fam_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3261   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumCoords;
3262   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3263     newNumCoords=_num_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3264   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
3265     newNameCoords=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_name_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3266   _coords=newCoords; _fam_coords=newFamCoords; _num_coords=newNumCoords; _name_coords=newNameCoords; _rev_num_coords=0;
3267   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3268     {
3269       if((MEDFileUMeshSplitL1*)*it)
3270         (*it)->renumberNodesInConn(ret->begin());
3271     }
3272   return ret.retn();
3273 }
3274
3275 /*!
3276  * Adds a group of nodes to \a this mesh.
3277  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3278  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3279  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3280  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3281  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3282  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3283  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3284  */
3285 void MEDFileUMesh::addNodeGroup(const DataArrayInt *ids) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3286 {
3287   const DataArrayDouble *coords=_coords;
3288   if(!coords)
3289     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addNodeGroup : no coords set !");
3290   int nbOfNodes=coords->getNumberOfTuples();
3291   if(!((DataArrayInt *)_fam_coords))
3292     { _fam_coords=DataArrayInt::New(); _fam_coords->alloc(nbOfNodes,1); _fam_coords->fillWithZero(); }
3293   //
3294   addGroupUnderground(true,ids,_fam_coords);
3295 }
3296
3297 /*!
3298  * Adds a group of nodes/cells/faces/edges to \a this mesh.
3299  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3300  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3301  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3302  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3303  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3304  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3305  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3306  */
3307 void MEDFileUMesh::addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3308 {
3309   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3310   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
3311     { 
3312       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : level " << meshDimRelToMaxExt << " not available ! Should be in ";
3313       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," ")); oss << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3314     }
3315   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3316     { addNodeGroup(ids); return ; }
3317   MEDFileUMeshSplitL1 *lev=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3318   DataArrayInt *fam=lev->getOrCreateAndGetFamilyField();
3319   addGroupUnderground(false,ids,fam);
3320 }
3321
3322 /*!
3323  * \param [in] ids ids and group name of the new group to add. The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3324  * \parma [in,out] famArr family array on level of interest to be renumbered. The input pointer should be not \c NULL (no check of that will be performed)
3325  */
3326 void MEDFileUMesh::addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3327 {
3328   if(!ids)
3329     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : NULL pointer in input !");
3330   std::string grpName(ids->getName());
3331   if(grpName.empty())
3332     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : empty group name ! MED file format do not accept empty group name !");
3333   ids->checkStrictlyMonotonic(true);
3334   famArr->incrRef(); MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famArrTmp(famArr);
3335   std::vector<std::string> grpsNames=getGroupsNames();
3336   if(std::find(grpsNames.begin(),grpsNames.end(),grpName)!=grpsNames.end())
3337     {
3338       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : Group with name \"" << grpName << "\" already exists ! Destroy it before calling this method !";
3339       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3340     }
3341   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > allFamIds=getAllNonNullFamilyIds();
3342   allFamIds.erase(std::find(allFamIds.begin(),allFamIds.end(),famArrTmp));
3343   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=famArr->selectByTupleIdSafe(ids->begin(),ids->end());
3344   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diffFamIds=famIds->getDifferentValues();
3345   std::vector<int> familyIds;
3346   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > idsPerfamiliyIds;
3347   int maxVal=getTheMaxAbsFamilyId()+1;
3348   std::map<std::string,int> families(_families);
3349   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
3350   std::vector<std::string> fams;
3351   bool created(false);
3352   for(const int *famId=diffFamIds->begin();famId!=diffFamIds->end();famId++)
3353     {
3354       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2Tmp=famIds->getIdsEqual(*famId);
3355       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->selectByTupleId(ids2Tmp->begin(),ids2Tmp->end());
3356       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids1=famArr->getIdsEqual(*famId);
3357       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret0(ids1->buildSubstractionOptimized(ids2));
3358       if(ret0->empty())
3359         {
3360           bool isFamPresent=false;
3361           for(std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >::const_iterator itl=allFamIds.begin();itl!=allFamIds.end() && !isFamPresent;itl++)
3362             isFamPresent=(*itl)->presenceOfValue(*famId);
3363           if(!isFamPresent)
3364             { familyIds.push_back(*famId); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); fams.push_back(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,*famId,created)); } // adding *famId in grp
3365           else
3366             {
3367               familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);
3368               std::string locFamName=FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created);
3369               fams.push_back(locFamName);
3370               if(existsFamily(*famId))
3371                 {
3372                   std::string locFamName2=getFamilyNameGivenId(*famId); std::vector<std::string> v(2); v[0]=locFamName2; v[1]=locFamName;
3373                   ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId).c_str(),v);
3374                 }
3375               maxVal++;
3376             } // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and lie the grp on maxVal
3377         }
3378       else
3379         {
3380           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and on maxVal+1
3381           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);//grp lie only on maxVal+1
3382           std::string n2(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1,created)); fams.push_back(n2);
3383           if(existsFamily(*famId))
3384             {
3385               std::string n1(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created)); std::vector<std::string> v(2); v[0]=n1; v[1]=n2;
3386               ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId).c_str(),v);
3387             }
3388           maxVal+=2;
3389         }
3390     }
3391   for(std::size_t i=0;i<familyIds.size();i++)
3392     {
3393       DataArrayInt *da=idsPerfamiliyIds[i];
3394       famArr->setPartOfValuesSimple3(familyIds[i],da->begin(),da->end(),0,1,1);
3395     }
3396   _families=families;
3397   _groups=groups;
3398   _groups[grpName]=fams;
3399 }
3400
3401 /*!
3402  * Changes a name of a family specified by its id.
3403  *  \param [in] id - the id of the family of interest.
3404  *  \param [in] newFamName - the new family name.
3405  *  \throw If no family with the given \a id exists.
3406  */
3407 void MEDFileUMesh::setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3408 {
3409   std::string oldName=getFamilyNameGivenId(id);
3410   _families.erase(oldName);
3411   _families[newFamName]=id;
3412 }
3413
3414 /*!
3415  * Removes a mesh of a given dimension.
3416  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3417  *  \throw If there is no mesh at level \a meshDimRelToMax in \a this mesh.
3418  */
3419 void MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3420 {
3421   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3422   std::vector<int>::const_iterator it=std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax);
3423   if(it==levSet.end())
3424     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel : the requested level is not existing !");
3425   int pos=(-meshDimRelToMax);
3426   _ms[pos]=0;
3427 }
3428
3429 /*!
3430  * Sets a new MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh.
3431  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3432  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3433  *  \param [in] newOrOld - if \c true, cells in \a m are sorted by type to be ready for 
3434  *         writing \a this mesh in a MED file.
3435  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3436  *         different. 
3437  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3438  *         another node coordinates array.
3439  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3440  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3441  */
3442 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3443 {
3444   dealWithTinyInfo(m);
3445   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3446   if(std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax)==levSet.end())
3447     {
3448       if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3449         {
3450           DataArrayDouble *c=m->getCoords();
3451           if(c)
3452             c->incrRef();
3453           _coords=c;
3454         }
3455       if(m->getCoords()!=_coords)
3456         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshAtLevel : Invalid Given Mesh ! The coordinates are not the same ! try to use tryToShareSameCoords !");
3457       int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3458       if(sz>=(int)_ms.size())
3459         _ms.resize(sz);
3460       checkMeshDimCoherency(m->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3461       _ms[sz-1]=new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld);
3462     }
3463   else
3464     _ms[-meshDimRelToMax]=new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld);
3465 }
3466
3467 /*!
3468  * This method allows to set at once the content of different levels in \a this.
3469  * This method is equivalent to a series of call to MEDFileUMesh::setMeshAtLevel.
3470  *
3471  * \param [in] ms - List of unstructured meshes lying on the same coordinates and having different mesh dimesnion.
3472  * \param [in] renum - the parameter (set to false by default) that tells the beheviour if there is a mesh on \a ms that is not geo type sorted.
3473  *                     If false, an exception ois thrown. If true the mesh is reordered automatically. It is highly recommanded to let this parameter to false.
3474  *
3475  * \throw If \a there is a null pointer in \a ms.
3476  * \sa MEDFileUMesh::setMeshAtLevel
3477  */
3478 void MEDFileUMesh::setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3479 {
3480   if(ms.empty())
3481     return ;
3482   const MEDCouplingUMesh *mRef=ms[0];
3483   if(!mRef)
3484     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in the first element of input meshes !");
3485   std::string name(mRef->getName());
3486   const DataArrayDouble *coo(mRef->getCoords());
3487   std::set<int> s;
3488   int zeDim=-1;
3489   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3490     {
3491       const MEDCouplingUMesh *cur(*it);
3492       if(!cur)
3493         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in input vector of meshes !");
3494       if(coo!=cur->getCoords())
3495         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes do not share the same coordinates !");
3496       int mdim=cur->getMeshDimension();
3497       zeDim=std::max(zeDim,mdim);
3498       if(s.find(mdim)!=s.end())
3499         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes must share the same coordinates pointer, and should have different mesh dimension each other !");
3500     }
3501   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3502     {
3503       int mdim=(*it)->getMeshDimension();
3504       setName((*it)->getName());
3505       setMeshAtLevel(mdim-zeDim,const_cast<MEDCouplingUMesh *>(*it),renum);
3506     }
3507   setName(name.c_str());
3508 }
3509
3510 /*!
3511  * Creates one MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh from a sequence of
3512  * meshes each representing a group, and creates corresponding groups in \a this mesh.
3513  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3514  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the mesh and groups at.
3515  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3516  *          create in \a this mesh.
3517  *  \throw If \a ms is empty.
3518  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3519  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3520  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3521  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3522  *         of the given meshes.
3523  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3524  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3525  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3526  */
3527 void MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3528 {
3529   if(ms.empty())
3530     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : expecting a non empty vector !");
3531   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3532   if(sz>=(int)_ms.size())
3533     _ms.resize(sz);
3534   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3535   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3536   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3537     {
3538       coo->incrRef();
3539       _coords=coo;
3540     }
3541   else
3542     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3543       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : coordinates mismatches !");
3544   std::vector<DataArrayInt *> corr;
3545   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,_zipconn_pol,corr);
3546   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr3(corr.begin(),corr.end());
3547   setMeshAtLevel(meshDimRelToMax,m,renum);
3548   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3549   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,true);
3550 }
3551
3552 /*!
3553  * Creates groups at a given level in \a this mesh from a sequence of
3554  * meshes each representing a group.
3555  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3556  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the groups at.
3557  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3558  *         create in \a this mesh.
3559  *  \param [in] renum - if \c true, then the optional numbers of entities are taken into
3560  *         account. 
3561  *  \throw If \a ms is empty.
3562  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3563  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3564  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3565  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3566  *         of the given meshes.
3567  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3568  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3569  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3570  */
3571 void MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3572 {
3573   if(ms.empty())
3574     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : expecting a non empty vector !");
3575   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3576   if(sz>=(int)_ms.size())
3577     _ms.resize(sz);
3578   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3579   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3580   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3581     {
3582       coo->incrRef();
3583       _coords=coo;
3584     }
3585   else
3586     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3587       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : coordinates mismatches !");
3588   MEDCouplingUMesh *m=getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3589   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr(ms.size());
3590   int i=0;
3591   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
3592     {
3593       DataArrayInt *arr=0;
3594       bool test=m->areCellsIncludedIn(*it,_zipconn_pol,arr);
3595       corr[i]=arr;
3596       if(!test)
3597         {
3598           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : mesh #" << i << " is not part of whole mesh !";
3599           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3600         }
3601     }
3602   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3603   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,renum);
3604 }
3605
3606 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3607 {
3608   const DataArrayDouble *ret=ms[0]->getCoords();
3609   int mdim=ms[0]->getMeshDimension();
3610   for(unsigned int i=1;i<ms.size();i++)
3611     {
3612       ms[i]->checkCoherency();
3613       if(ms[i]->getCoords()!=ret)
3614         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes must share the same coords !");
3615       if(ms[i]->getMeshDimension()!=mdim)
3616         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes have not same mesh dimension !");
3617     }
3618   return const_cast<DataArrayDouble *>(ret);
3619 }
3620
3621 /*!
3622  * Sets the family field of a given relative dimension.
3623  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
3624  *          the family field is set.
3625  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
3626  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3627  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
3628  */
3629 void MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3630 {
3631   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3632     {
3633       if(!famArr)
3634         {
3635           _fam_coords=0;
3636           return ;
3637         }
3638       DataArrayDouble *coo(_coords);
3639       if(!coo)
3640         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : the coordinates have not been set !");
3641       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of node family arr ! ");
3642       famArr->incrRef();
3643       _fam_coords=famArr;
3644       return ;
3645     }
3646   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3647     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3648   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3649   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3650     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3651   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3652     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3653   return _ms[traducedRk]->setFamilyArr(famArr);
3654 }
3655
3656 /*!
3657  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
3658  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3659  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
3660  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3661  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
3662  */
3663 void MEDFileUMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3664 {
3665   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3666     {
3667       if(!renumArr)
3668         {
3669           _num_coords=0;
3670           _rev_num_coords=0;
3671           return ;
3672         }
3673       DataArrayDouble *coo(_coords);
3674       if(!coo)
3675         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumFieldArr : the coordinates have not been set !");
3676       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setRenumArr : Problem in size of node numbering arr ! ");
3677       renumArr->incrRef();
3678       _num_coords=renumArr;
3679       computeRevNum();
3680       return ;
3681     }
3682   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3683     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3684   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3685   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3686     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3687   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3688     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3689   return _ms[traducedRk]->setRenumArr(renumArr);
3690 }
3691
3692 /*!
3693  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
3694  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3695  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
3696  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3697  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
3698  */
3699 void MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3700 {
3701   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3702     {
3703       if(!nameArr)
3704         {
3705           _name_coords=0;
3706           return ;
3707         }
3708       DataArrayDouble *coo(_coords);
3709       if(!coo)
3710         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : the coordinates have not been set !");
3711       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of node numbering arr ! ");
3712       nameArr->incrRef();
3713       _name_coords=nameArr;
3714       return ;
3715     }
3716   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3717     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Dimension request is invalid (>1) !");
3718   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3719   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3720     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3721   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3722     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3723   return _ms[traducedRk]->setNameArr(nameArr);
3724 }
3725
3726 void MEDFileUMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
3727 {
3728   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3729     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3730       (*it)->synchronizeTinyInfo(*this);
3731 }
3732
3733 /*!
3734  * This method is called by MEDFileMesh::changeFamilyId. It performs only one part of the family id modification.
3735  */
3736 void MEDFileUMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3737 {
3738   DataArrayInt *arr=_fam_coords;
3739   if(arr)
3740     arr->changeValue(oldId,newId);
3741   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3742     {
3743       MEDFileUMeshSplitL1 *sp=(*it);
3744       if(sp)
3745         {
3746           sp->changeFamilyIdArr(oldId,newId);
3747         }
3748     }
3749 }
3750
3751 std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > MEDFileUMesh::getAllNonNullFamilyIds() const
3752 {
3753   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ret;
3754   const DataArrayInt *da(_fam_coords);
3755   if(da)
3756     { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
3757   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3758     {
3759       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3760       if(elt)
3761         {
3762           da=elt->getFamilyField();
3763           if(da)
3764             { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
3765         }
3766     }
3767   return ret;
3768 }
3769
3770 void MEDFileUMesh::computeRevNum() const
3771 {
3772   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3773     {
3774       int pos;
3775       int maxValue=_num_coords->getMaxValue(pos);
3776       _rev_num_coords=_num_coords->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
3777     }
3778 }
3779
3780 std::size_t MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySize() const
3781 {
3782   std::size_t ret=MEDFileMesh::getHeapMemorySize();
3783   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
3784     ret+=_fam_nodes->getHeapMemorySize();
3785   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
3786     ret+=_num_nodes->getHeapMemorySize();
3787   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
3788     ret+=_fam_cells->getHeapMemorySize();
3789   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
3790     ret+=_num_cells->getHeapMemorySize();
3791   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
3792     ret+=_rev_num_nodes->getHeapMemorySize();
3793   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
3794     ret+=_rev_num_cells->getHeapMemorySize();
3795   return ret;
3796 }
3797
3798 int MEDFileStructuredMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3799 {
3800   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3801   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3802     {
3803       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
3804       ret=std::max(ret,std::abs(val));
3805     }
3806   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3807     {
3808       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
3809       ret=std::max(ret,std::abs(val));
3810     }
3811   return ret;
3812 }
3813
3814 int MEDFileStructuredMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3815 {
3816   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3817   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3818     {
3819       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
3820       ret=std::max(ret,val);
3821     }
3822   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3823     {
3824       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
3825       ret=std::max(ret,val);
3826     }
3827   return ret;
3828 }
3829
3830 int MEDFileStructuredMesh::getMinFamilyIdInArrays() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3831 {
3832   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3833   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3834     {
3835       int val=_fam_nodes->getMinValue(tmp);
3836       ret=std::min(ret,val);
3837     }
3838   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3839     {
3840       int val=_fam_cells->getMinValue(tmp);
3841       ret=std::min(ret,val);
3842     }
3843   return ret;
3844 }
3845
3846 bool MEDFileStructuredMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
3847 {
3848   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
3849     return false;
3850   const MEDFileStructuredMesh *otherC=dynamic_cast<const  MEDFileStructuredMesh *>(other);
3851   if(!otherC)
3852     {
3853       what="Mesh types differ ! This is structured and other is NOT !";
3854       return false;
3855     }
3856   const DataArrayInt *famc1=_fam_nodes;
3857   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_nodes;
3858   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3859     {
3860       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
3861       return false;
3862     }
3863   if(famc1)
3864     {
3865       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3866       if(!ret)
3867         {
3868           what="Families arr on nodes differ !";
3869           return false;
3870         }
3871     }
3872   famc1=_fam_cells;
3873   famc2=otherC->_fam_cells;
3874   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3875     {
3876       what="Mismatch of families arr on cells ! One is defined and not other !";
3877       return false;
3878     }
3879   if(famc1)
3880     {
3881       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3882       if(!ret)
3883         {
3884           what="Families arr on cells differ !";
3885           return false;
3886         }
3887     }
3888   famc1=_num_nodes;
3889   famc2=otherC->_num_nodes;
3890   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3891     {
3892       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
3893       return false;
3894     }
3895   if(famc1)
3896     {
3897       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3898       if(!ret)
3899         {
3900           what="Numbering arr on nodes differ !";
3901           return false;
3902         }
3903     }
3904   famc1=_num_cells;
3905   famc2=otherC->_num_cells;
3906   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
3907     {
3908       what="Mismatch of numbering arr on cells ! One is defined and not other !";
3909       return false;
3910     }
3911   if(famc1)
3912     {
3913       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
3914       if(!ret)
3915         {
3916           what="Numbering arr on cells differ !";
3917           return false;
3918         }
3919     }
3920   const DataArrayAsciiChar *d1=_names_cells;
3921   const DataArrayAsciiChar *d2=otherC->_names_cells;
3922   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
3923     {
3924       what="Mismatch of naming arr on cells ! One is defined and not other !";
3925       return false;
3926     }
3927   if(d1)
3928     {
3929       bool ret=d1->isEqual(*d2);
3930       if(!ret)
3931         {
3932           what="Naming arr on cells differ !";
3933           return false;
3934         }
3935     }
3936   d1=_names_nodes;
3937   d2=otherC->_names_nodes;
3938   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
3939     {
3940       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
3941       return false;
3942     }
3943   if(d1)
3944     {
3945       bool ret=d1->isEqual(*d2);
3946       if(!ret)
3947         {
3948           what="Naming arr on nodes differ !";
3949           return false;
3950         }
3951     }
3952   return true;
3953 }
3954
3955 void MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes() const
3956 {
3957   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
3958   const DataArrayInt *tmp=_fam_nodes;
3959   if(tmp)
3960     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3961   tmp=_num_nodes;
3962   if(tmp)
3963     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3964   tmp=_fam_cells;
3965   if(tmp)
3966     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3967   tmp=_num_cells;
3968   if(tmp)
3969     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
3970 }
3971
3972 /*!
3973  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
3974  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
3975  *          are required.
3976  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
3977  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
3978  *          returned instead of ids.
3979  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
3980  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
3981  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
3982  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
3983  */
3984 DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
3985 {
3986   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
3987     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : Only available for levels 0 or 1 !");
3988   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
3989   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3990     {
3991       if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3992         {
3993           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
3994           if(!famIds.empty())
3995             da=_fam_nodes->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
3996           else
3997             da=_fam_nodes->getIdsEqualList(0,0);
3998           if(renum)
3999             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_nodes,da);
4000           else
4001             return da.retn();
4002         }
4003       else
4004         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
4005     }
4006   else
4007     {
4008       if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4009         {
4010           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4011           if(!famIds.empty())
4012             da=_fam_cells->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4013           else
4014             da=_fam_cells->getIdsEqualList(0,0);
4015           if(renum)
4016             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_cells,da);
4017           else
4018             return da.retn();
4019         }
4020       else
4021         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on cells !");
4022     }
4023 }
4024
4025 /*!
4026  * Sets the family field of a given relative dimension.
4027  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4028  *          the family field is set.
4029  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4030  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4031  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4032  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4033  */
4034 void MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4035 {
4036   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4037     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 !");
4038   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4039   if(!mesh)
4040     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set family array !");
4041   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4042     {
4043       int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4044       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4045       _fam_cells=famArr;
4046     }
4047   else
4048     {
4049       int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4050       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4051       _fam_nodes=famArr;
4052     }
4053   if(famArr)
4054     famArr->incrRef();
4055 }
4056
4057 /*!
4058  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4059  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4060  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4061  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4062  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4063  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4064  */
4065 void MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4066 {
4067   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4068     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 !");
4069   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4070   if(!mesh)
4071     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set number array !");
4072   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4073     {
4074       int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4075       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4076       _num_cells=renumArr;
4077     }
4078   else
4079     {
4080       int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4081       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4082       _num_nodes=renumArr;
4083     }
4084   if(renumArr)
4085     renumArr->incrRef();
4086 }
4087
4088 /*!
4089  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4090  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4091  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4092  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4093  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4094  */
4095 void MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4096 {
4097   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4098     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4099   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4100   if(!mesh)
4101     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : no structured mesh specified ! Impossible to set names array !");
4102   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4103     {
4104       int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4105       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4106       _names_cells=nameArr;
4107     }
4108   else
4109     {
4110       int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4111       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4112       _names_nodes=nameArr;
4113     }
4114   if(nameArr)
4115     nameArr->incrRef();
4116 }
4117
4118 /*!
4119  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
4120  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4121  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
4122  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
4123  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4124  */
4125 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4126 {
4127   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4128     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4129   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4130     return _fam_cells;
4131   else
4132     return _fam_nodes;
4133 }
4134
4135 /*!
4136  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4137  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4138  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
4139  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4140  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4141  */
4142 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4143 {
4144   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4145     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4146   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4147     return _num_cells;
4148   else
4149     return _num_nodes;
4150 }
4151
4152 /*!
4153  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
4154  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4155  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4156  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
4157  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4158  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4159  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4160  */
4161 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4162 {
4163   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4164     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4165   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4166     {
4167       if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4168         {
4169           int pos;
4170           int maxValue=_num_cells->getMaxValue(pos);
4171           _rev_num_cells=_num_cells->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4172           return _rev_num_cells;
4173         }
4174       else
4175         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no cell renumbering for a request on reverse numbering !");
4176     }
4177   else
4178     {
4179       if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4180         {
4181           int pos;
4182           int maxValue=_num_nodes->getMaxValue(pos);
4183           _rev_num_nodes=_num_nodes->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4184           return _rev_num_nodes;
4185         }
4186       else
4187         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no node renumbering for a request on reverse numbering !");
4188     }
4189 }
4190
4191 const DataArrayAsciiChar *MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4192 {
4193   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4194     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4195   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4196     return _names_cells;
4197   else
4198     return _names_nodes;
4199 }
4200
4201 /*!
4202  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
4203  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [0].
4204  */
4205 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevels() const
4206 {
4207   std::vector<int> ret(1);
4208   return ret;
4209 }
4210
4211 /*!
4212  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
4213  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [1,0].
4214  */
4215 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
4216 {
4217   std::vector<int> ret(2);
4218   ret[0]=1;
4219   return ret;
4220 }
4221
4222 /*!
4223  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL family arr are defined.
4224  */
4225 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
4226 {
4227   std::vector<int> ret;
4228   const DataArrayInt *famNodes(_fam_nodes),*famCells(_fam_cells);
4229   if(famNodes)
4230     ret.push_back(1);
4231   if(famCells)
4232     ret.push_back(0);
4233   return ret;
4234 }
4235
4236 /*!
4237  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL numbering arr are defined.
4238  */
4239 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
4240 {
4241   std::vector<int> ret;
4242   const DataArrayInt *numNodes(_num_nodes),*numCells(_num_cells);
4243   if(numNodes)
4244     ret.push_back(1);
4245   if(numCells)
4246     ret.push_back(0);
4247   return ret;
4248 }
4249
4250 /*!
4251  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL naming arr are defined.
4252  */
4253 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
4254 {
4255   std::vector<int> ret;
4256   const DataArrayAsciiChar *namesCells(_names_cells);
4257   if(namesCells)
4258     ret.push_back(0);
4259   return ret;
4260 }
4261
4262 /*!
4263  * no implementation here, it is not a bug, but intresically no polyhedra in \a this.
4264  */
4265 bool MEDFileStructuredMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4266 {
4267   oldCode.clear(); newCode.clear(); o2nRenumCell=0;
4268   return false;
4269 }
4270
4271 void MEDFileStructuredMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4272 {
4273   DataArrayInt *arr=_fam_nodes;
4274   if(arr)
4275     arr->changeValue(oldId,newId);
4276   arr=_fam_cells;
4277   if(arr)
4278     arr->changeValue(oldId,newId);
4279 }
4280
4281 void MEDFileStructuredMesh::deepCpyAttributes() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4282 {
4283   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
4284     _fam_nodes=_fam_nodes->deepCpy();
4285   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
4286     _num_nodes=_num_nodes->deepCpy();
4287   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
4288     _fam_cells=_fam_cells->deepCpy();
4289   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
4290     _num_cells=_num_cells->deepCpy();
4291   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
4292     _rev_num_nodes=_rev_num_nodes->deepCpy();
4293   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
4294     _rev_num_cells=_rev_num_cells->deepCpy();
4295 }
4296
4297 /*!
4298  * Returns a pointer to mesh at the specified level (here 0 is compulsary for cartesian mesh).
4299  * 
4300  * \return a pointer to cartesian mesh that need to be managed by the caller.
4301  * \warning the returned pointer has to be managed by the caller.
4302  */
4303
4304 /*!
4305  * Returns a pointer to MEDCouplingStructuredMesh held by \a this. 
4306  *  \param [in] meshDimRelToMax - it must be \c 0.
4307  *  \param [in] renum - it must be \c false.
4308  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingMesh that the caller is to
4309  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
4310  */
4311 MEDCouplingMesh *MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4312 {
4313   if(renum)
4314     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support renumbering ! To do it perform request of renum array directly !");
4315   if(meshDimRelToMax!=0)
4316     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support multi level for mesh 0 expected as input !");
4317   const MEDCouplingStructuredMesh *m=getStructuredMesh();
4318   if(m)
4319     m->incrRef();
4320   return const_cast<MEDCouplingStructuredMesh *>(m);
4321 }
4322
4323 /*!
4324  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
4325  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
4326  *  \return int - the number of entities.
4327  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
4328  */
4329 int MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4330 {
4331   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4332     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4333   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();
4334   if(!cmesh)
4335     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : No structured mesh set !");
4336   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4337     return cmesh->getNumberOfCells();
4338   else
4339     return cmesh->getNumberOfNodes();
4340 }
4341
4342 int MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4343 {
4344   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();
4345   if(!cmesh)
4346     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes : no cartesian mesh set !");
4347   return cmesh->getNumberOfNodes();
4348 }
4349
4350 void MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobs *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4351 {
4352   if(st.getNumberOfItems()!=1)
4353     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
4354   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
4355     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
4356   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
4357     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
4358   if(st[0].getPflName().empty())
4359     {
4360       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
4361       return ;
4362     }
4363   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[0].getPflName().c_str()));
4364   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
4365   int sz(nodesFetched.size());
4366   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
4367     {
4368       std::vector<int> conn;
4369       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
4370       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
4371         if(*it>=0 && *it<sz)
4372           nodesFetched[*it]=true;
4373         else
4374           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
4375     }
4376 }
4377
4378 med_geometry_type MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4379 {
4380   med_geometry_type geoTypeReq=MED_NONE;
4381   switch(meshDim)
4382     {
4383     case 3:
4384       geoTypeReq=MED_HEXA8;
4385       break;
4386     case 2:
4387       geoTypeReq=MED_QUAD4;
4388       break;
4389     case 1:
4390       geoTypeReq=MED_SEG2;
4391       break;
4392     case 0:
4393       geoTypeReq=MED_POINT1;
4394       break;
4395     default:
4396       throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid meshdim detected for structured mesh ! Must be in (1,2,3) !");
4397     }
4398   return geoTypeReq;
4399 }
4400
4401 void MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4402 {
4403   setName(strm->getName());
4404   setDescription(strm->getDescription());
4405   setUnivName(strm->getUnivName());
4406   setIteration(strm->getIteration());
4407   setOrder(strm->getOrder());
4408   setTimeValue(strm->getTime());
4409   setTimeUnit(strm->getTimeUnit());
4410   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
4411   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
4412   int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4413   if(nbOfElt>0)
4414     {
4415       if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
4416         {
4417           _fam_nodes=DataArrayInt::New();
4418           _fam_nodes->alloc(nbOfElt,1);
4419           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getPointer());
4420         }
4421     }
4422   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4423   if(nbOfElt>0)
4424     {
4425       if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
4426         {
4427           _num_nodes=DataArrayInt::New();
4428           _num_nodes->alloc(nbOfElt,1);
4429           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getPointer());
4430         }
4431     }
4432   int meshDim=getStructuredMesh()->getMeshDimension();
4433   med_geometry_type geoTypeReq=GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4434   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4435   if(nbOfElt>0)
4436     {
4437       if(!mrs || mrs->isCellFamilyFieldReading())
4438         {
4439           _fam_cells=DataArrayInt::New();
4440           _fam_cells->alloc(nbOfElt,1);
4441           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getPointer());
4442         }
4443     }
4444   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4445   if(nbOfElt>0)
4446     {
4447       if(!mrs || mrs->isCellNumFieldReading())
4448         {
4449           _num_cells=DataArrayInt::New();
4450           _num_cells->alloc(nbOfElt,1);
4451           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getPointer());
4452         }
4453     }
4454   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4455   if(nbOfElt>0)
4456     {
4457       if(!mrs || mrs->isCellNameFieldReading())
4458         {
4459           _names_cells=DataArrayAsciiChar::New();
4460           _names_cells->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4461           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName,dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getPointer());
4462           _names_cells->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4463         }
4464     }
4465   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4466   if(nbOfElt>0)
4467     {
4468       if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
4469         {
4470           _names_nodes=DataArrayAsciiChar::New();
4471           _names_nodes->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4472           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName,dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getPointer());
4473           _names_nodes->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4474         }
4475     }
4476 }
4477
4478 void MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(med_idt fid, const char *maa) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4479 {
4480   int meshDim=getStructuredMesh()->getMeshDimension();
4481   med_geometry_type geoTypeReq=GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4482   //
4483   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4484     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getNumberOfTuples(),_fam_cells->getConstPointer());
4485   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4486     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getNumberOfTuples(),_fam_nodes->getConstPointer());
4487   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4488     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getNumberOfTuples(),_num_cells->getConstPointer());
4489   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4490     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getNumberOfTuples(),_num_nodes->getConstPointer());
4491   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
4492     {
4493       if(_names_cells->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4494         {
4495           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on cells with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4496           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
4497           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4498         }
4499       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getNumberOfTuples(),_names_cells->getConstPointer());
4500     }
4501   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
4502     {
4503       if(_names_nodes->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4504         {
4505           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4506           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
4507           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4508         }
4509       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa,_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getNumberOfTuples(),_names_nodes->getConstPointer());
4510     }
4511   //
4512   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa,_families,_groups,_too_long_str);
4513 }
4514
4515 /*!
4516  * Returns an empty instance of MEDFileCMesh.
4517  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4518  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4519  */
4520 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New()
4521 {
4522   return new MEDFileCMesh;
4523 }
4524
4525 /*!
4526  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
4527  * file. The first mesh in the file is loaded.
4528  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
4529  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4530  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4531  *  \throw If the file is not readable.
4532  *  \throw If there is no meshes in the file.
4533  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
4534  */
4535 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4536 {
4537   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
4538   if(ms.empty())
4539     {
4540       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
4541       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4542     }
4543   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4544   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4545   int dt,it;
4546   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4547   std::string dummy2;
4548   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
4549   return new MEDFileCMesh(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
4550 }
4551
4552 /*!
4553  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
4554  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
4555  * iteration.
4556  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
4557  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
4558  *  \param [in] dt - the number of a time step.
4559  *  \param [in] it - the number of an iteration.
4560  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4561  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4562  *  \throw If the file is not readable.
4563  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
4564  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
4565  */
4566 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4567 {
4568   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4569   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4570   return new MEDFileCMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
4571 }
4572
4573 std::size_t MEDFileCMesh::getHeapMemorySize() const
4574 {
4575   std::size_t ret=MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySize();
4576   if((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh)
4577     ret+=_cmesh->getHeapMemorySize();
4578   return ret;
4579 }
4580
4581 /*!
4582  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
4583  *  \return int - the mesh dimension.
4584  *  \throw If there are no cells in this mesh.
4585  */
4586 int MEDFileCMesh::getMeshDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4587 {
4588   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
4589     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
4590   return _cmesh->getMeshDimension();
4591 }
4592
4593 /*!
4594  * Returns a string describing \a this mesh.
4595  *  \return std::string - the mesh information string.
4596  */
4597 std::string MEDFileCMesh::simpleRepr() const
4598 {
4599   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
4600 }
4601
4602 /*!
4603  * Returns a full textual description of \a this mesh.
4604  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
4605  */
4606 std::string MEDFileCMesh::advancedRepr() const
4607 {
4608   return simpleRepr();
4609 }
4610
4611 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::shallowCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4612 {
4613   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
4614   return ret.retn();
4615 }
4616
4617 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::createNewEmpty() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4618 {
4619   return new MEDFileCMesh;
4620 }
4621
4622 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4623 {
4624   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
4625   if((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh)
4626     ret->_cmesh=static_cast<MEDCouplingCMesh*>(_cmesh->deepCpy());
4627   ret->deepCpyAttributes();
4628   return ret.retn();
4629 }
4630
4631 /*!
4632  * Checks if \a this and another mesh are equal.
4633  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
4634  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
4635  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
4636  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
4637  */
4638 bool MEDFileCMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4639 {
4640   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
4641     return false;
4642   const MEDFileCMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(other);
4643   if(!otherC)
4644     {
4645       what="Mesh types differ ! This is cartesian and other is NOT !";
4646       return false;
4647     }
4648   clearNonDiscrAttributes();
4649   otherC->clearNonDiscrAttributes();
4650   const MEDCouplingCMesh *coo1=_cmesh;
4651   const MEDCouplingCMesh *coo2=otherC->_cmesh;
4652   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
4653     {
4654       what="Mismatch of cartesian meshes ! One is defined and not other !";
4655       return false;
4656     }
4657   if(coo1)
4658     {
4659       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
4660       if(!ret)
4661         {
4662           what="cartesian meshes differ !";
4663           return false;
4664         }
4665     }
4666   return true;
4667 }
4668
4669 /*!
4670  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
4671  */
4672 void MEDFileCMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4673 {
4674   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
4675   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_cmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
4676 }
4677
4678 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh()
4679 {
4680 }
4681
4682 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4683 try
4684   {
4685     loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
4686   }
4687 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
4688   {
4689     throw e;
4690   }
4691
4692 void MEDFileCMesh::loadCMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4693 {
4694   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4695   int dummy0,dummy1;
4696   std::string dtunit;
4697   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
4698   if(meshType!=CARTESIAN)
4699     {
4700       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as cartesian an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT cartesian !";
4701       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4702     }
4703   MEDFileCMeshL2 loaderl2;
4704   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
4705   MEDCouplingCMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
4706   mesh->incrRef();
4707   _cmesh=mesh;
4708   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
4709 }
4710
4711 /*!
4712  * Returns a const pointer to MEDCouplingCMesh held by \a this mesh.
4713  *  \return const MEDCouplingCMesh * - a pointer to the held MEDCouplingCMesh.
4714  */
4715 const MEDCouplingCMesh *MEDFileCMesh::getMesh() const
4716 {
4717   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4718   return _cmesh;
4719 }
4720
4721 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCMesh::getStructuredMesh() const
4722 {
4723   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4724   return _cmesh;
4725 }
4726
4727 /*!
4728  * Sets the MEDCouplingCMesh holding the data of \a this mesh.
4729  *  \param [in] m - the new MEDCouplingCMesh to refer to.
4730  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
4731  *         different. 
4732  */
4733 void MEDFileCMesh::setMesh(MEDCouplingCMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4734 {
4735   dealWithTinyInfo(m);
4736   if(m)
4737     m->incrRef();
4738   _cmesh=m;
4739 }
4740
4741 void MEDFileCMesh::writeLL(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4742 {
4743   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
4744   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
4745   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
4746   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
4747   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
4748   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
4749   int spaceDim=_cmesh->getSpaceDimension();
4750   int meshDim=_cmesh->getMeshDimension();
4751   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4752   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4753   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
4754     {
4755       std::string info(_cmesh->getCoordsAt(i)->getInfoOnComponent(0));
4756       std::string c,u;
4757       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
4758       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4759       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4760     }
4761   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
4762   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
4763   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CARTESIAN_GRID);
4764   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
4765     {
4766       const DataArrayDouble *da=_cmesh->getCoordsAt(i);
4767       MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,i+1,da->getNumberOfTuples(),da->getConstPointer());
4768     }
4769   //
4770   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,maa);
4771 }
4772
4773 void MEDFileCMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4774 {
4775   const MEDCouplingCMesh *cmesh=_cmesh;
4776   if(!cmesh)
4777     return;
4778   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setName(_name.c_str());
4779   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setDescription(_desc_name.c_str());
4780   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
4781   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTimeUnit(_dt_unit.c_str());
4782 }
4783
4784 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New()
4785 {
4786   return new MEDFileCurveLinearMesh;
4787 }
4788
4789 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const char *fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4790 {
4791   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
4792   if(ms.empty())
4793     {
4794       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
4795       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4796     }
4797   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4798   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4799   int dt,it;
4800   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4801   std::string dummy2;
4802   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
4803   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,ms.front().c_str(),dt,it,mrs);
4804 }
4805
4806 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const char *fileName, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4807 {
4808   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4809   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
4810   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
4811 }
4812
4813 std::size_t MEDFileCurveLinearMesh::getHeapMemorySize() const
4814 {
4815   std::size_t ret=MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySize();
4816   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh)
4817     ret+=_clmesh->getHeapMemorySize();
4818   return ret;
4819 }
4820
4821 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::shallowCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4822 {
4823   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
4824   return ret.retn();
4825 }
4826
4827 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::createNewEmpty() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4828 {
4829   return new MEDFileCurveLinearMesh;
4830 }
4831
4832 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4833 {
4834   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
4835   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh)
4836     ret->_clmesh=static_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh*>(_clmesh->deepCpy());
4837   ret->deepCpyAttributes();
4838   return ret.retn();
4839 }
4840
4841 int MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4842 {
4843   if(!((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh))
4844     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
4845   return _clmesh->getMeshDimension();
4846 }
4847
4848 std::string MEDFileCurveLinearMesh::simpleRepr() const
4849 {
4850   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
4851 }
4852
4853 std::string MEDFileCurveLinearMesh::advancedRepr() const
4854 {
4855   return simpleRepr();
4856 }
4857
4858 bool MEDFileCurveLinearMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4859 {
4860   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
4861     return false;
4862   const MEDFileCurveLinearMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(other);
4863   if(!otherC)
4864     {
4865       what="Mesh types differ ! This is curve linear and other is NOT !";
4866       return false;
4867     }
4868   clearNonDiscrAttributes();
4869   otherC->clearNonDiscrAttributes();
4870   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo1=_clmesh;
4871   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo2=otherC->_clmesh;
4872   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
4873     {
4874       what="Mismatch of curve linear meshes ! One is defined and not other !";
4875       return false;
4876     }
4877   if(coo1)
4878     {
4879       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
4880       if(!ret)
4881         {
4882           what="curve linear meshes differ !";
4883           return false;
4884         }
4885     }
4886   return true;
4887 }
4888
4889 void MEDFileCurveLinearMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4890 {
4891   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
4892   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_clmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
4893 }
4894
4895 void MEDFileCurveLinearMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
4896 {
4897   const MEDCouplingCurveLinearMesh *clmesh=_clmesh;
4898   if(!clmesh)
4899     return;
4900   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setName(_name.c_str());
4901   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setDescription(_desc_name.c_str());
4902   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
4903   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTimeUnit(_dt_unit.c_str());
4904 }
4905
4906 const MEDCouplingCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getMesh() const
4907 {
4908   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4909   return _clmesh;
4910 }
4911
4912 void MEDFileCurveLinearMesh::setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4913 {
4914   dealWithTinyInfo(m);
4915   if(m)
4916     m->incrRef();
4917   _clmesh=m;
4918 }
4919
4920 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getStructuredMesh() const
4921 {
4922   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
4923   return _clmesh;
4924 }
4925
4926 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh()
4927 {
4928 }
4929
4930 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4931 try
4932   {
4933     loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
4934   }
4935 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
4936   {
4937     throw e;
4938   }
4939
4940 void MEDFileCurveLinearMesh::writeLL(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4941 {
4942   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
4943   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
4944   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
4945   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
4946   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
4947   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
4948   int spaceDim=_clmesh->getSpaceDimension();
4949   int meshDim=_clmesh->getMeshDimension();
4950   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4951   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
4952   const DataArrayDouble *coords=_clmesh->getCoords();
4953   if(!coords)
4954     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::writeLL : no coordinates set !");
4955   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
4956     {
4957       std::string info(_clmesh->getCoords()->getInfoOnComponent(i));
4958       std::string c,u;
4959       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
4960       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4961       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
4962     }
4963   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
4964   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
4965   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CURVILINEAR_GRID);
4966   std::vector<int> nodeGridSt=_clmesh->getNodeGridStructure();
4967   MEDmeshGridStructWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,&nodeGridSt[0]);
4968   
4969   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->begin());
4970   //
4971   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,maa);
4972 }
4973
4974 void MEDFileCurveLinearMesh::loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const char *mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4975 {
4976   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4977   int dummy0,dummy1;
4978   std::string dtunit;
4979   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
4980   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
4981     {
4982       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as curve linear an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT curve linear !";
4983       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4984     }
4985   MEDFileCLMeshL2 loaderl2;
4986   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
4987   MEDCouplingCurveLinearMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
4988   mesh->incrRef();
4989   _clmesh=mesh;
4990   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
4991 }
4992
4993 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New()
4994 {
4995   return new MEDFileMeshMultiTS;
4996 }
4997
4998 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
4999 {
5000   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName);
5001 }
5002
5003 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const char *fileName, const char *mName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5004 {
5005   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName,mName);
5006 }
5007
5008 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5009 {
5010   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> ret=MEDFileMeshMultiTS::New();
5011   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > meshOneTs(_mesh_one_ts.size());
5012   std::size_t i=0;
5013   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++,i++)
5014     if((const MEDFileMesh *)*it)
5015       meshOneTs[i]=(*it)->deepCpy();
5016   ret->_mesh_one_ts=meshOneTs;
5017   return ret.retn();
5018 }
5019
5020 std::size_t MEDFileMeshMultiTS::getHeapMemorySize() const
5021 {
5022   std::size_t ret=_mesh_one_ts.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh>);
5023   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5024     ret+=(*it)->getHeapMemorySize();
5025   return ret;
5026 }
5027
5028 const char *MEDFileMeshMultiTS::getName() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5029 {
5030   if(_mesh_one_ts.empty())
5031     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getName : no time steps set !");
5032   return _mesh_one_ts[0]->getName();
5033 }
5034
5035 void MEDFileMeshMultiTS::setName(const char *newMeshName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5036 {
5037   std::string oldName(getName());
5038   std::vector< std::pair<std::string,std::string> > v(1);
5039   v[0].first=oldName; v[0].second=newMeshName;
5040   changeNames(v);
5041 }
5042
5043 bool MEDFileMeshMultiTS::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5044 {
5045   bool ret=false;
5046   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5047     {
5048       MEDFileMesh *cur(*it);
5049       if(cur)
5050         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5051     }
5052   return ret;
5053 }
5054
5055 MEDFileMesh *MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5056 {
5057   if(_mesh_one_ts.empty())
5058     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep : empty time step set !");
5059   return const_cast<MEDFileMesh *>(static_cast<const MEDFileMesh *>(_mesh_one_ts[0]));
5060 }
5061
5062 void MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5063 {
5064   if(!mesh1TimeStep)
5065     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep : input pointer should be different from 0 !");
5066   _mesh_one_ts.resize(1);
5067   mesh1TimeStep->incrRef();
5068   //MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> toto=mesh1TimeStep;
5069   _mesh_one_ts[0]=mesh1TimeStep;
5070 }
5071
5072 void MEDFileMeshMultiTS::write(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5073 {
5074   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5075     {
5076       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5077       (*it)->write(fid);
5078     }
5079 }
5080
5081 void MEDFileMeshMultiTS::write(const char *fileName, int mode) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5082 {
5083   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5084   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,medmod);
5085   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5086   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str().c_str());
5087   write(fid);
5088 }
5089
5090 void MEDFileMeshMultiTS::loadFromFile(const char *fileName, const char *mName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5091 {//for the moment to be improved
5092   _mesh_one_ts.resize(1);
5093   _mesh_one_ts[0]=MEDFileMesh::New(fileName,mName,-1,-1);
5094 }
5095
5096 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS()
5097 {
5098 }
5099
5100 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5101 try
5102   {
5103     std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5104     if(ms.empty())
5105     {
5106       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5107       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5108     }
5109     MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5110     MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,MED_ACC_RDONLY);
5111     int dt,it;
5112     ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5113     std::string dummy2;
5114     MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front().c_str(),meshType,dt,it,dummy2);
5115     loadFromFile(fileName,ms.front().c_str());
5116   }
5117 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5118   {
5119     throw e;
5120   }
5121
5122 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const char *fileName, const char *mName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5123 try
5124   {
5125     loadFromFile(fileName,mName);
5126   }
5127 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5128   {
5129     throw e;
5130   }
5131
5132 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New()
5133 {
5134   return new MEDFileMeshes;
5135 }
5136
5137 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5138 {
5139   return new MEDFileMeshes(fileName);
5140 }
5141
5142 void MEDFileMeshes::write(med_idt fid) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5143 {
5144   checkCoherency();
5145   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5146     {
5147       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5148       (*it)->write(fid);
5149     }
5150 }
5151
5152 void MEDFileMeshes::write(const char *fileName, int mode) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5153 {
5154   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5155   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName,medmod);
5156   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5157   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str().c_str());
5158   checkCoherency();
5159   write(fid);
5160 }
5161
5162 int MEDFileMeshes::getNumberOfMeshes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5163 {
5164   return _meshes.size();
5165 }
5166
5167 MEDFileMeshesIterator *MEDFileMeshes::iterator() throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5168 {
5169   return new MEDFileMeshesIterator(this);
5170 }
5171
5172 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshAtPos(int i) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5173 {
5174   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5175     {
5176       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshAtPos : invalid mesh id given in parameter ! Should be in [0;" << _meshes.size() << ") !";
5177       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5178     }
5179   return _meshes[i]->getOneTimeStep();
5180 }
5181
5182 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshWithName(const char *mname) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5183 {
5184   std::vector<std::string> ms=getMeshesNames();
5185   std::vector<std::string>::iterator it=std::find(ms.begin(),ms.end(),mname);
5186   if(it==ms.end())
5187     {
5188       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshWithName : Mesh  \"" << mname << "\" does not exist in this ! Existing are : ";
5189       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
5190       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5191     }
5192   return getMeshAtPos((int)std::distance(ms.begin(),it));
5193 }
5194
5195 std::vector<std::string> MEDFileMeshes::getMeshesNames() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5196 {
5197   std::vector<std::string> ret(_meshes.size());
5198   int i=0;
5199   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5200     {
5201       const MEDFileMeshMultiTS *f=(*it);
5202       if(f)
5203         {
5204           ret[i]=f->getName();
5205         }
5206       else
5207         {
5208           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshesNames : At rank #" << i << " mesh is not defined !";
5209           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5210         }
5211     }
5212   return ret;
5213 }
5214
5215 bool MEDFileMeshes::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5216 {
5217   bool ret=false;
5218   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5219     {
5220       MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5221       if(cur)
5222         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5223     }
5224   return ret;
5225 }
5226
5227 void MEDFileMeshes::resize(int newSize) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5228 {
5229   _meshes.resize(newSize);
5230 }
5231
5232 void MEDFileMeshes::pushMesh(MEDFileMesh *mesh) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5233 {
5234   if(!mesh)
5235     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::pushMesh : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5236   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5237   elt->setOneTimeStep(mesh);
5238   _meshes.push_back(elt);
5239 }
5240
5241 void MEDFileMeshes::setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5242 {
5243   if(!mesh)
5244     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::setMeshAtPos : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5245   if(i>=(int)_meshes.size())
5246     _meshes.resize(i+1);
5247   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5248   elt->setOneTimeStep(mesh);
5249   _meshes[i]=elt;
5250 }
5251
5252 void MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos(int i) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5253 {
5254   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5255     {
5256       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos : Invalid given id in input (" << i << ") should be in [0," << _meshes.size() << ") !";
5257       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5258     }
5259   _meshes.erase(_meshes.begin()+i);
5260 }
5261
5262 void MEDFileMeshes::loadFromFile(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5263 {
5264   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5265   int i=0;
5266   _meshes.resize(ms.size());
5267   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
5268     _meshes[i]=MEDFileMeshMultiTS::New(fileName,(*it).c_str());
5269 }
5270
5271 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes()
5272 {
5273 }
5274
5275 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes(const char *fileName) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5276 try
5277   {
5278     loadFromFile(fileName);
5279   }
5280 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5281   {
5282   }
5283
5284 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::deepCpy() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5285 {
5286   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > meshes(_meshes.size());
5287   std::size_t i=0;
5288   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5289     if((const MEDFileMeshMultiTS *)*it)
5290       meshes[i]=(*it)->deepCpy();
5291   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> ret=MEDFileMeshes::New();
5292   ret->_meshes=meshes;
5293   return ret.retn();
5294 }
5295
5296 std::size_t MEDFileMeshes::getHeapMemorySize() const
5297 {
5298   std::size_t ret=_meshes.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS>));
5299   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5300     if((const MEDFileMeshMultiTS*)*it)
5301       ret+=(*it)->getHeapMemorySize();
5302   return ret; 
5303 }
5304
5305 std::string MEDFileMeshes::simpleRepr() const
5306 {
5307   std::ostringstream oss;
5308   oss << "(*****************)\n(* MEDFileMeshes *)\n(*****************)\n\n";
5309   simpleReprWithoutHeader(oss);
5310   return oss.str();
5311 }
5312
5313 void MEDFileMeshes::simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const
5314 {
5315   int nbOfMeshes=getNumberOfMeshes();
5316   oss << "There are " << nbOfMeshes << " meshes with the following names : \n";
5317   std::vector<std::string> mns=getMeshesNames();
5318   for(int i=0;i<nbOfMeshes;i++)
5319     oss << "  - #" << i << " \"" << mns[i] << "\"\n";
5320 }
5321
5322 void MEDFileMeshes::checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
5323 {
5324   static const char MSG[]="MEDFileMeshes::checkCoherency : mesh at rank ";
5325   int i=0;
5326   std::set<std::string> s;
5327   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5328     {
5329       const MEDFileMeshMultiTS *elt=(*it);
5330       if(!elt)
5331         {
5332           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << "/" << _meshes.size() << " is empty !";
5333           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5334         }
5335       std::size_t sz=s.size();
5336       s.insert(std::string((*it)->getName()));
5337       if(s.size()==sz)
5338         {
5339           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << " has a name (\"" << (*it)->getName() << "\") already used by an another mesh in list !";
5340           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5341         }
5342     }
5343 }
5344
5345 MEDFileMeshesIterator::MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms):_ms(ms),_iter_id(0),_nb_iter(0)
5346 {
5347   if(ms)
5348     {
5349       ms->incrRef();
5350       _nb_iter=ms->getNumberOfMeshes();
5351     }
5352 }
5353
5354 MEDFileMeshesIterator::~MEDFileMeshesIterator()
5355 {
5356 }
5357
5358 MEDFileMesh *MEDFileMeshesIterator::nextt()
5359 {
5360   if(_iter_id<_nb_iter)
5361     {
5362       MEDFileMeshes *ms(_ms);
5363       if(ms)
5364         return ms->getMeshAtPos(_iter_id++);
5365       else
5366         return 0;
5367     }
5368   else
5369     return 0;
5370 }