Salome HOME
Level -1 management in MEDFileStructuredMesh
[modules/med.git] / src / MEDLoader / MEDFileMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDFileMesh.hxx"
22 #include "MEDFileUtilities.hxx"
23 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
24 #include "MEDFileField.hxx"
25 #include "MEDLoader.hxx"
26 #include "MEDLoaderBase.hxx"
27
28 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
29
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31
32 #include <limits>
33 #include <cmath>
34
35 extern med_geometry_type typmai3[34];
36
37 using namespace ParaMEDMEM;
38
39 const char MEDFileMesh::DFT_FAM_NAME[]="FAMILLE_ZERO";
40
41 MEDFileMesh::MEDFileMesh():_order(-1),_iteration(-1),_time(0.),_univ_wr_status(true)
42 {
43 }
44
45 std::size_t MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
46 {
47   std::size_t ret(_dt_unit.capacity()+_name.capacity()+_univ_name.capacity()+_desc_name.capacity());
48   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
49     {
50       ret+=(*it).first.capacity()+(*it).second.capacity()*sizeof(std::string);
51       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
52         ret+=(*it2).capacity();
53     }
54   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
55     ret+=(*it).first.capacity()+sizeof(int);
56   return ret;
57 }
58
59 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMesh::getDirectChildren() const
60 {
61   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
62 }
63
64 /*!
65  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
66  * file. The first mesh in the file is loaded.
67  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
68  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
69  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
70  *  \throw If the file is not readable.
71  *  \throw If there is no meshes in the file.
72  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
73  */
74 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
75 {
76   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
77   if(ms.empty())
78     {
79       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
80       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
81     }
82   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
83   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
84   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
85   int dt,it;
86   std::string dummy2;
87   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
88   switch(meshType)
89     {
90     case UNSTRUCTURED:
91       {
92         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
93         ret->loadUMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
94         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
95       }
96     case CARTESIAN:
97       {
98         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
99         ret->loadCMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
100         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
101       }
102     case CURVE_LINEAR:
103       {
104         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
105         ret->loadCLMeshFromFile(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
106         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
107       }
108     default:
109       {
110         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << ms.front() << "' exists but unsupported type yet !";
111         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
112       }
113     }
114 }
115
116 /*!
117  * Returns a new MEDFileMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
118  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
119  * iteration.
120  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
121  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
122  *  \param [in] dt - the number of a time step.
123  *  \param [in] it - the number of an iteration.
124  *  \return MEDFileMesh * - a new instance of MEDFileMesh. The caller is to delete this
125  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
126  *  \throw If the file is not readable.
127  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
128  *  \throw If the mesh in the file is of a not supported type.
129  */
130 MEDFileMesh *MEDFileMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
131 {
132   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
133   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
134   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
135   int dummy0,dummy1;
136   std::string dummy2;
137   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
138   switch(meshType)
139     {
140     case UNSTRUCTURED:
141       {
142         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=MEDFileUMesh::New();
143         ret->loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
144         return (MEDFileUMesh *)ret.retn();
145       }
146     case CARTESIAN:
147       {
148         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=MEDFileCMesh::New();
149         ret->loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
150         return (MEDFileCMesh *)ret.retn();
151       }
152     case CURVE_LINEAR:
153       {
154         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=MEDFileCurveLinearMesh::New();
155         ret->loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
156         return (MEDFileCurveLinearMesh *)ret.retn();
157       }
158     default:
159       {
160         std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::New : MED file exists and has mesh '" << mName << "' exists but unsupported type yet !";
161         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
162       }
163     }
164 }
165
166 /*!
167  * Writes \a this mesh into an open MED file specified by its descriptor.
168  *  \param [in] fid - the MED file descriptor.
169  *  \throw If the mesh name is not set.
170  *  \throw If the file is open for reading only.
171  *  \throw If the writing mode == 1 and the same data is present in an existing file.
172  */
173 void MEDFileMesh::write(med_idt fid) const
174 {
175   if(!existsFamily(0))
176     const_cast<MEDFileMesh *>(this)->addFamily(DFT_FAM_NAME,0);
177   if(_name.empty())
178     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh : name is empty. MED file ask for a NON EMPTY name !");
179   writeLL(fid);
180 }
181
182 /*!
183  * Writes \a this mesh into a MED file specified by its name.
184  *  \param [in] fileName - the MED file name.
185  *  \param [in] mode - the writing mode. For more on \a mode, see \ref AdvMEDLoaderBasics.
186  * - 2 - erase; an existing file is removed.
187  * - 1 - append; same data should not be present in an existing file.
188  * - 0 - overwrite; same data present in an existing file is overwritten.
189  *  \throw If the mesh name is not set.
190  *  \throw If \a mode == 1 and the same data is present in an existing file.
191  */
192 void MEDFileMesh::write(const std::string& fileName, int mode) const
193 {
194   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
195   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
196   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
197   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
198   write(fid);
199 }
200
201 /*!
202  * Checks if \a this and another mesh are equal.
203  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
204  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
205  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
206  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
207  */
208 bool MEDFileMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
209 {
210   if(_order!=other->_order)
211     {
212       what="Orders differ !";
213       return false;
214     }
215   if(_iteration!=other->_iteration)
216     {
217       what="Iterations differ !";
218       return false;
219     }
220   if(fabs(_time-other->_time)>eps)
221     {
222       what="Time values differ !";
223       return false;
224     }
225   if(_dt_unit!=other->_dt_unit)
226     {
227       what="Time units differ !";
228       return false;
229     }
230   if(_name!=other->_name)
231     {
232       what="Names differ !";
233       return false;
234     }
235   //univ_name has been ignored -> not a bug because it is a mutable attribute
236   if(_desc_name!=other->_desc_name)
237     {
238       what="Description names differ !";
239       return false;
240     }
241   if(!areGrpsEqual(other,what))
242     return false;
243   if(!areFamsEqual(other,what))
244     return false;
245   return true;
246 }
247
248 void MEDFileMesh::setName(const std::string& name)
249 {
250   _name=name;
251 }
252
253 /*!
254  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
255  */
256 void MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes() const
257 {
258   
259 }
260
261 bool MEDFileMesh::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
262 {
263   for(std::vector< std::pair<std::string,std::string> >::const_iterator it=modifTab.begin();it!=modifTab.end();it++)
264     {
265       if((*it).first==_name)
266         {
267           _name=(*it).second;
268           return true;
269         }
270     }
271   return false;
272 }
273
274 /*!
275  * Copies data on groups and families from another mesh.
276  *  \param [in] other - the mesh to copy the data from.
277  */
278 void MEDFileMesh::copyFamGrpMapsFrom(const MEDFileMesh& other)
279 {
280   _groups=other._groups;
281   _families=other._families;
282 }
283
284
285 /*!
286  * This method clear all the groups in the map.
287  * So this method does not operate at all on arrays.
288  * So this method can lead to orphan families.
289  * 
290  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
291  */
292 void MEDFileMesh::clearGrpMap()
293 {
294   _groups.clear();
295 }
296
297 /*!
298  * This method clear all the families in the map.
299  * So this method does not operate at all on arrays.
300  * WARNING ! if there are some groups lying on cleared families, those groups will be impacted !
301  *
302  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamGrpMaps
303  */
304 void MEDFileMesh::clearFamMap()
305 {
306   _families.clear();
307 }
308
309 /*!
310  * This method clear all the families and groups in the map.
311  * So this method does not operate at all on arrays.
312  * As all groups and families entry will be removed after 
313  * the call of MEDFileMesh::setFamilyFieldArr method with 0 or None (python) in the 2nd parameter can be useful to reduce the size of the object.
314  *
315  * \sa MEDFileMesh::clearFamMap, MEDFileMesh::clearFamMap
316  */
317 void MEDFileMesh::clearFamGrpMaps()
318 {
319   clearGrpMap();
320   clearFamMap();
321 }
322
323 /*!
324  * Returns names of families constituting a group.
325  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
326  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
327  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
328  */
329 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroup(const std::string& name) const
330 {
331   std::string oname(name);
332   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
333   if(it==_groups.end())
334     {
335       std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
336       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
337       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
338       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
339     }
340   return (*it).second;
341 }
342
343 /*!
344  * Returns names of families constituting some groups.
345  *  \param [in] grps - a sequence of names of groups of interest.
346  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of the families.
347  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
348  */
349 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesOnGroups(const std::vector<std::string>& grps) const
350 {
351   std::set<std::string> fams;
352   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++)
353     {
354       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=_groups.find(*it);
355       if(it2==_groups.end())
356         {
357           std::ostringstream oss; oss << "No such group in mesh \"" << _name << "\" : " << *it; 
358           std::vector<std::string> grps2=getGroupsNames(); oss << "\" !\nAvailable groups are :";
359           std::copy(grps2.begin(),grps2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
360           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
361         }
362       fams.insert((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
363     }
364   std::vector<std::string> fams2(fams.begin(),fams.end());
365   return fams2;
366 }
367
368 /*!
369  * Returns ids of families constituting a group.
370  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
371  *  \return std::vector<int> - sequence of ids of the families.
372  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
373  */
374 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name) const
375 {
376   std::string oname(name);
377   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.find(oname);
378   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
379   if(it==_groups.end())
380     {
381       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
382       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
383       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
384     }
385   return getFamiliesIds((*it).second);
386 }
387
388 /*!
389  * Sets names of families constituting a group. If data on families of this group is
390  * already present, it is overwritten. Every family in \a fams is checked, and if a
391  family is not yet in \a this mesh, the default group id \c 0 is assigned to it.
392  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
393  *  \param [in] fams - a sequence of names of families constituting the group.
394  */
395 void MEDFileMesh::setFamiliesOnGroup(const std::string& name, const std::vector<std::string>& fams)
396 {
397   std::string oname(name);
398   _groups[oname]=fams;
399   for(std::vector<std::string>::const_iterator it1=fams.begin();it1!=fams.end();it1++)
400     {
401       std::map<std::string,int>::iterator it2=_families.find(*it1);
402       if(it2==_families.end())
403         _families[*it1]=0;
404     }
405 }
406
407 /*!
408  * Sets families constituting a group. The families are specified by their ids.
409  * If a family name is not found by its id, an exception is thrown.
410  * If several families have same id, the first one in lexical order is taken.
411  *  \param [in] name - the name of the group of interest.
412  *  \param [in] famIds - a sequence of ids of families constituting the group.
413  *  \throw If a family name is not found by its id.
414  */
415 void MEDFileMesh::setFamiliesIdsOnGroup(const std::string& name, const std::vector<int>& famIds)
416 {
417   std::string oname(name);
418   std::vector<std::string> fams(famIds.size());
419   int i=0;
420   for(std::vector<int>::const_iterator it1=famIds.begin();it1!=famIds.end();it1++,i++)
421     {
422       std::string name2=getFamilyNameGivenId(*it1);
423       fams[i]=name2;
424     }
425   _groups[oname]=fams;
426 }
427
428 /*!
429  * Returns names of groups including a given family.
430  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
431  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of names of groups including the family.
432  */
433 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsOnFamily(const std::string& name) const
434 {
435   std::vector<std::string> ret;
436   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();it1!=_groups.end();it1++)
437     {
438       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it1).second.begin();it2!=(*it1).second.end();it2++)
439         if((*it2)==name)
440           {
441             ret.push_back((*it1).first);
442             break;
443           }
444     }
445   return ret;
446 }
447
448 /*!
449  * Adds an existing family to groups.
450  *  \param [in] famName - a name of family to add to \a grps.
451  *  \param [in] grps - a sequence of group names to add the family in.
452  *  \throw If a family named \a famName not yet exists.
453  */
454 void MEDFileMesh::setGroupsOnFamily(const std::string& famName, const std::vector<std::string>& grps)
455 {
456   std::string fName(famName);
457   const std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fName);
458   if(it==_families.end())
459     {
460       std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
461       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << fName << "\" !\nAvailable families are :";
462       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
463       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
464     }
465   for(std::vector<std::string>::const_iterator it3=grps.begin();it3!=grps.end();it3++)
466     {
467       std::map< std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(*it3);
468       if(it2!=_groups.end())
469         (*it2).second.push_back(fName);
470       else
471         {
472           std::vector<std::string> grps2(1,fName);
473           _groups[*it3]=grps2;
474         }
475     }
476 }
477
478 /*!
479  * Returns names of all groups of \a this mesh.
480  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names.
481  */
482 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getGroupsNames() const
483 {
484   std::vector<std::string> ret(_groups.size());
485   int i=0;
486   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++,i++)
487     ret[i]=(*it).first;
488   return ret;
489 }
490
491 /*!
492  * Returns names of all families of \a this mesh.
493  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of family names.
494  */
495 std::vector<std::string> MEDFileMesh::getFamiliesNames() const
496 {
497   std::vector<std::string> ret(_families.size());
498   int i=0;
499   for(std::map<std::string, int >::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++,i++)
500     ret[i]=(*it).first;
501   return ret;
502 }
503
504 /*!
505  * Changes a name of every family, included in one group only, to be same as the group name.
506  *  \throw If there are families with equal names in \a this mesh.
507  */
508 void MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName()
509 {
510   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
511   std::map<std::string,int> newFams;
512   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
513     {
514       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
515       if(grps.size()==1 && groups[grps[0]].size()==1)
516         {
517           if(newFams.find(grps[0])!=newFams.end())
518             {
519               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << grps[0] << "\" already exists !";
520               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
521             }
522           newFams[grps[0]]=(*it).second;
523           std::vector<std::string>& grps2=groups[grps[0]];
524           std::size_t pos=std::distance(grps2.begin(),std::find(grps2.begin(),grps2.end(),(*it).first));
525           grps2[pos]=grps[0];
526         }
527       else
528         {
529           if(newFams.find((*it).first)!=newFams.end())
530             {
531               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::assignFamilyNameWithGroupName : Family \"" << (*it).first << "\" already exists !";
532               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
533             }
534           newFams[(*it).first]=(*it).second;
535         }
536     }
537   _families=newFams;
538   _groups=groups;
539 }
540
541 /*!
542  * Removes all groups lying on no family. If there is no empty groups, \a this is let untouched.
543  * 
544  * \return the removed groups.
545  */
546 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeEmptyGroups()
547 {
548   std::vector<std::string> ret;
549   std::map<std::string, std::vector<std::string> > newGrps;
550   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
551     {
552       if((*it).second.empty())
553         ret.push_back((*it).first);
554       else
555         newGrps[(*it).first]=(*it).second;
556     }
557   if(!ret.empty())
558     _groups=newGrps;
559   return ret;
560 }
561
562 /*!
563  * Removes a group from \a this mesh.
564  *  \param [in] name - the name of the group to remove.
565  *  \throw If no group with such a \a name exists.
566  */
567 void MEDFileMesh::removeGroup(const std::string& name)
568 {
569   std::string oname(name);
570   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
571   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
572   if(it==_groups.end())
573     {
574       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << name << "\" !\nAvailable groups are :";
575       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
576       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
577     }
578   _groups.erase(it);
579 }
580
581 /*!
582  * Removes a family from \a this mesh.
583  *  \param [in] name - the name of the family to remove.
584  *  \throw If no family with such a \a name exists.
585  */
586 void MEDFileMesh::removeFamily(const std::string& name)
587 {
588   std::string oname(name);
589   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
590   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
591   if(it==_families.end())
592     {
593       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
594       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
595       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
596     }
597   _families.erase(it);
598   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
599     {
600       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
601       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
602       if(it4!=v.end())
603         v.erase(it4);
604     }
605 }
606
607 /*!
608  * Removes all groups in \a this that are orphan. A group is orphan if this group lies on
609  * a set of families, themselves orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
610  * family field whatever its level. This method also suppresses the orphan families.
611  * 
612  * \return - The list of removed groups names. 
613  *
614  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanFamilies.
615  */
616 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanGroups()
617 {
618   removeOrphanFamilies();
619   return removeEmptyGroups();
620 }
621
622 /*!
623  * Removes all families in \a this that are orphan. A family is said orphan if its id appears nowhere in
624  * family field whatever its level. Groups are updated in consequence, that is to say all groups lying on orphan family, will see their families list modified.
625  * 
626  * \return - The list of removed families names.
627  * \sa MEDFileMesh::removeOrphanGroups.
628  */
629 std::vector<std::string> MEDFileMesh::removeOrphanFamilies()
630 {
631   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allFamIdsInUse=computeAllFamilyIdsInUse();
632   std::vector<std::string> ret;
633   if(!((DataArrayInt*)allFamIdsInUse))
634     {
635       ret=getFamiliesNames();
636       _families.clear(); _groups.clear();
637       return ret;
638     }
639   std::map<std::string,int> famMap;
640   std::map<std::string, std::vector<std::string> > grps(_groups);
641   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
642     {
643       if(allFamIdsInUse->presenceOfValue((*it).second))
644         famMap[(*it).first]=(*it).second;
645       else
646         {
647           ret.push_back((*it).first);
648           std::vector<std::string> grpsOnEraseFam=getGroupsOnFamily((*it).first);
649           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=grpsOnEraseFam.begin();it2!=grpsOnEraseFam.end();it2++)
650             {
651               std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=grps.find(*it2);//it3!=grps.empty() thanks to copy
652               std::vector<std::string>& famv=(*it3).second;
653               std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(famv.begin(),famv.end(),(*it).first);//it4!=famv.end() thanks to copy
654               famv.erase(it4);
655             }
656         }
657     }
658   if(!ret.empty())
659     { _families=famMap; _groups=grps; }
660   return ret;
661 }
662
663 /*!
664  * Renames a group in \a this mesh.
665  *  \param [in] oldName - a current name of the group to rename.
666  *  \param [in] newName - a new group name.
667  *  \throw If no group named \a oldName exists in \a this mesh.
668  *  \throw If a group named \a newName already exists.
669  */
670 void MEDFileMesh::changeGroupName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
671 {
672   std::string oname(oldName);
673   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(oname);
674   std::vector<std::string> grps=getGroupsNames();
675   if(it==_groups.end())
676     {
677       std::ostringstream oss; oss << "No such groupname \"" << oldName << "\" !\nAvailable groups are :";
678       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
679       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
680     }
681   std::string nname(newName);
682   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it2=_groups.find(nname);
683   if(it2!=_groups.end())
684     {
685       std::ostringstream oss; oss << "Such groupname \"" << newName << "\" already exists ! Kill it before !";
686       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
687     }
688   std::vector<std::string> cpy=(*it).second;
689   _groups.erase(it);
690   _groups[newName]=cpy;
691 }
692
693 /*!
694  * Changes an id of a family in \a this mesh. 
695  * This method calls changeFamilyIdArr().
696  *  \param [in] oldId - a current id of the family.
697  *  \param [in] newId - a new family id.
698  */
699 void MEDFileMesh::changeFamilyId(int oldId, int newId)
700 {
701   changeFamilyIdArr(oldId,newId);
702   std::map<std::string,int> fam2;
703   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
704     {
705       if((*it).second==oldId)
706         fam2[(*it).first]=newId;
707       else
708         fam2[(*it).first]=(*it).second;
709     }
710   _families=fam2;
711 }
712
713 /*!
714  * Renames a family in \a this mesh.
715  *  \param [in] oldName - a current name of the family to rename.
716  *  \param [in] newName - a new family name.
717  *  \throw If no family named \a oldName exists in \a this mesh.
718  *  \throw If a family named \a newName already exists.
719  */
720 void MEDFileMesh::changeFamilyName(const std::string& oldName, const std::string& newName)
721 {
722   std::string oname(oldName);
723   std::map<std::string, int >::iterator it=_families.find(oname);
724   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
725   if(it==_families.end())
726     {
727       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << oldName << "\" !\nAvailable families are :";
728       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
729       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
730     }
731   std::string nname(newName);
732   std::map<std::string, int >::iterator it2=_families.find(nname);
733   if(it2!=_families.end())
734     {
735       std::ostringstream oss; oss << "Such familyname \"" << newName << " already exists ! Kill it before !";
736       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
737     }
738   int cpy=(*it).second;
739   _families.erase(it);
740   _families[newName]=cpy;
741   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it3=_groups.begin();it3!=_groups.end();it3++)
742     {
743       std::vector<std::string>& v=(*it3).second;
744       std::vector<std::string>::iterator it4=std::find(v.begin(),v.end(),oname);
745       if(it4!=v.end())
746         (*it4)=nname;
747     }
748 }
749
750 /*!
751  * Checks if \a this and another mesh contains the same families.
752  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
753  *  \param [in,out] what - an unused parameter.
754  *  \return bool - \c true if number of families and their ids are the same in the two
755  *          meshes. Families with the id == \c 0 are not considered.
756  */
757 bool MEDFileMesh::areFamsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
758 {
759   if(_families==other->_families)
760     return true;
761   std::map<std::string,int> fam0;
762   std::map<std::string,int> fam1;
763   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
764     if((*it).second!=0)
765       fam0[(*it).first]=(*it).second;
766   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=other->_families.begin();it!=other->_families.end();it++)
767     if((*it).second!=0)
768       fam1[(*it).first]=(*it).second;
769   return fam0==fam1;
770 }
771
772 /*!
773  * Checks if \a this and another mesh contains the same groups.
774  *  \param [in] other - the mesh to compare with \a this one.
775  *  \param [in,out] what - a string describing a difference of groups of the two meshes
776  *          in case if this method returns \c false.
777  *  \return bool - \c true if number of groups and families constituting them are the
778  *          same in the two meshes.
779  */
780 bool MEDFileMesh::areGrpsEqual(const MEDFileMesh *other, std::string& what) const
781 {
782   if(_groups==other->_groups)
783     return true;
784   bool ret=true;
785   std::size_t sz=_groups.size();
786   if(sz!=other->_groups.size())
787     {
788       what="Groups differ because not same number !\n";
789       ret=false;
790     }
791   if(ret)
792     {
793       std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it1=_groups.begin();
794       for(std::size_t i=0;i<sz && ret;i++,it1++)
795         {
796           std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it2=other->_groups.find((*it1).first);
797           if(it2!=other->_groups.end())
798             {
799               std::set<std::string> s1((*it1).second.begin(),(*it1).second.end());
800               std::set<std::string> s2((*it2).second.begin(),(*it2).second.end());
801               ret=(s1==s2);
802             }
803           else
804             {
805               ret=false;
806               what="A group in first mesh exists not in other !\n";
807             }
808         }
809     }
810   if(!ret)
811     {
812       std::ostringstream oss; oss << "Groups description differs :\n";
813       oss << "First group description :\n";
814       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
815         {
816           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
817           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
818         oss << "    \"" << *it2 << "\n";
819         }
820       oss << "Second group description :\n";
821       for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::const_iterator it=other->_groups.begin();it!=other->_groups.end();it++)
822         {
823           oss << " Group \"" << (*it).first << "\" on following families :\n";
824           for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
825             oss << "    \"" << *it2 << "\n";
826         }
827       what+=oss.str();
828     }
829   return ret;
830 }
831
832 /*!
833  * Checks if a group with a given name exists in \a this mesh.
834  *  \param [in] groupName - the group name.
835  *  \return bool - \c true the group \a groupName exists in \a this mesh.
836  */
837 bool MEDFileMesh::existsGroup(const std::string& groupName) const
838 {
839   std::string grpName(groupName);
840   return _groups.find(grpName)!=_groups.end();
841 }
842
843 /*!
844  * Checks if a family with a given id exists in \a this mesh.
845  *  \param [in] famId - the family id.
846  *  \return bool - \c true the family with the id \a famId exists in \a this mesh.
847  */
848 bool MEDFileMesh::existsFamily(int famId) const
849 {
850   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
851     if((*it2).second==famId)
852       return true;
853   return false;
854 }
855
856 /*!
857  * Checks if a family with a given name exists in \a this mesh.
858  *  \param [in] familyName - the family name.
859  *  \return bool - \c true the family \a familyName exists in \a this mesh.
860  */
861 bool MEDFileMesh::existsFamily(const std::string& familyName) const
862 {
863   std::string fname(familyName);
864   return _families.find(fname)!=_families.end();
865 }
866
867 /*!
868  * Sets an id of a family.
869  *  \param [in] familyName - the family name.
870  *  \param [in] id - a new id of the family.
871  */
872 void MEDFileMesh::setFamilyId(const std::string& familyName, int id)
873 {
874   std::string fname(familyName);
875   _families[fname]=id;
876 }
877
878 void MEDFileMesh::setFamilyIdUnique(const std::string& familyName, int id)
879 {
880   std::string fname(familyName);
881   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
882     if((*it).second==id)
883       {
884         if((*it).first!=familyName)
885           {
886             std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::setFamilyIdUnique : Family id #" << id << " is already belonging to family with name \"" << (*it).first << "\" !";
887             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
888           }
889       }
890   _families[fname]=id;
891 }
892
893 /*!
894  * Adds a family to \a this mesh.
895  *  \param [in] familyName - a name of the family.
896  *  \param [in] famId - an id of the family.
897  *  \throw If a family with the same name or id already exists in \a this mesh.
898  */
899 void MEDFileMesh::addFamily(const std::string& familyName, int famId)
900 {
901   std::string fname(familyName);
902   std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.find(fname);
903   if(it==_families.end())
904     {
905        for(std::map<std::string,int>::const_iterator it2=_families.begin();it2!=_families.end();it2++)
906          if((*it2).second==famId)
907            {
908              std::ostringstream oss;
909              oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << (*it2).first << "\" already exists with specified id : " << famId << " !";
910              throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
911            }
912        _families[fname]=famId;
913     }
914   else
915     {
916       if((*it).second!=famId)
917         {
918           std::ostringstream oss;
919           oss << "MEDFileMesh::addFamily : Family \"" << fname << "\" already exists but has id set to " << (*it).second << " different from asked famId " << famId << " !";
920           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
921         }
922     }
923 }
924
925 /*!
926  * Creates a group including all mesh entities of given dimension.
927  * \warning This method does \b not guarantee that the created group includes mesh
928  * entities of only \a meshDimRelToMaxExt dimension in the case if some family id is
929  * present in family fields of different dimensions. To assure this, call
930  * ensureDifferentFamIdsPerLevel() \b before calling this method.
931  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of mesh entities to include to
932  *          the group.
933  *  \param [in] groupName - a name of the new group.
934  *  \throw If a group named \a groupName already exists.
935  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt exist in \a this mesh.
936  *  \throw If no family field of dimension \a meshDimRelToMaxExt is present in \a this mesh.
937  */
938 void MEDFileMesh::createGroupOnAll(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& groupName)
939 {
940   std::string grpName(groupName);
941   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
942   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
943     {
944       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The relative ext dimension " << meshDimRelToMaxExt << " is not available !" << std::endl;
945       oss << "Available relative ext levels are : ";
946       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
947       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
948     }
949   if(existsGroup(groupName))
950     {
951       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::createGroupOnAll : The groups \"" << grpName << "\" already exists in this !" << std::endl;
952       oss << "Already existing groups are : ";
953       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," "));
954       oss << std::endl << "Please choose an another group name or call removeGroup(\"" << grpName << "\") method !";
955       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
956     }
957   const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
958   if(fieldFamIds==0)
959     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::createGroupOnAll : Family field arr ids is not defined for this level !");
960   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=fieldFamIds->getDifferentValues();
961   std::vector<std::string> familiesOnWholeGroup;
962   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
963     {
964       bool tmp;
965       familiesOnWholeGroup.push_back(findOrCreateAndGiveFamilyWithId(*it,tmp));
966     }
967   _groups[grpName]=familiesOnWholeGroup;
968 }
969
970 /*!
971  * Ensures that given family ids do not present in family fields of dimensions different
972  * than given ones. If a family id is present in the family fields of dimensions different
973  * than the given ones, a new family is created and the whole data is updated accordingly.
974  *  \param [in] famIds - a sequence of family ids to check.
975  *  \param [in] vMeshDimRelToMaxExt - a sequence of relative dimensions to which the \a
976  *          famIds should exclusively belong.
977  *  \return bool - \c true if no modification is done in \a this mesh by this method.
978  */
979 bool MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs(const std::vector<int>& famIds, const std::vector<int>& vMeshDimRelToMaxExt)
980 {
981   std::set<int> levsInput(vMeshDimRelToMaxExt.begin(),vMeshDimRelToMaxExt.end());
982   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
983   std::set<int> levs2(levs.begin(),levs.end());
984   std::vector<int> levsToTest;
985   std::set_difference(levs2.begin(),levs2.end(),levsInput.begin(),levsInput.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(levsToTest));
986   std::set<int> famIds2(famIds.begin(),famIds.end());
987   bool ret=true;
988   int maxFamId=1;
989   if(!_families.empty())
990     maxFamId=getMaxFamilyId()+1;
991   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
992   for(std::vector<int>::const_iterator it=levsToTest.begin();it!=levsToTest.end();it++)
993     {
994       const DataArrayInt *fieldFamIds=getFamilyFieldAtLevel(*it);
995       if(fieldFamIds)
996         {
997           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds3=fieldFamIds->getDifferentValues();
998           std::vector<int> tmp;
999           std::set_intersection(famIds3->begin(),famIds3->end(),famIds2.begin(),famIds2.end(),std::back_insert_iterator< std::vector<int> >(tmp));
1000           for(std::vector<int>::const_iterator it2=tmp.begin();it2!=tmp.end();it2++)
1001             {
1002               ret=false;
1003               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it2);
1004               std::ostringstream oss; oss << "Family_" << maxFamId;
1005               std::string zeName=CreateNameNotIn(oss.str(),allFams);
1006               addFamilyOnAllGroupsHaving(famName,zeName);
1007               _families[zeName]=maxFamId;
1008               (const_cast<DataArrayInt *>(fieldFamIds))->changeValue(*it2,maxFamId);
1009               maxFamId++;
1010             }
1011         }
1012     }
1013   return ret;
1014 }
1015
1016 /*!
1017  * Adds a family to a given group in \a this mesh. If the group with a given name does
1018  * not exist, it is created.
1019  *  \param [in] grpName - the name of the group to add the family in.
1020  *  \param [in] famName - the name of the family to add to the group named \a grpName.
1021  *  \throw If \a grpName or \a famName is an empty string.
1022  *  \throw If no family named \a famName is present in \a this mesh.
1023  */
1024 void MEDFileMesh::addFamilyOnGrp(const std::string& grpName, const std::string& famName)
1025 {
1026   std::string grpn(grpName);
1027   std::string famn(famName);
1028   if(grpn.empty() || famn.empty())
1029     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : input strings must be non null !");
1030   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1031   if(std::find(fams.begin(),fams.end(),famn)==fams.end())
1032     {
1033       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::addFamilyOnGrp : Family \"" << famn << "\" does not exist !" << std::endl;
1034       oss << "Create this family or choose an existing one ! Existing fams are : ";
1035       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," ")); oss << ".";
1036       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1037     }
1038   std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.find(grpn);
1039   if(it==_groups.end())
1040     {
1041       _groups[grpn].push_back(famn);
1042     }
1043   else
1044     {
1045       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find((*it).second.begin(),(*it).second.end(),famn);
1046       if(it2==(*it).second.end())
1047         (*it).second.push_back(famn);
1048     }
1049 }
1050
1051 /*!
1052  * This method adds to all groups lying on family with name 'famName' the other family name 'otherFamName'.
1053  * This method is quite underground because it can lead to unconsistency because family 'otherFamName' is \b not added into _families.
1054  * This method is used by MEDFileMesh::keepFamIdsOnlyOnLevs method.
1055  */
1056 void MEDFileMesh::addFamilyOnAllGroupsHaving(const std::string& famName, const std::string& otherFamName)
1057 {
1058   std::string famNameCpp(famName);
1059   std::string otherCpp(otherFamName);
1060   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
1061     {
1062       std::vector<std::string>& v=(*it).second;
1063       if(std::find(v.begin(),v.end(),famNameCpp)!=v.end())
1064         {
1065           v.push_back(otherCpp);
1066         }
1067     }
1068 }
1069
1070 void MEDFileMesh::changeAllGroupsContainingFamily(const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1071 {
1072   ChangeAllGroupsContainingFamily(_groups,familyNameToChange,newFamiliesNames);
1073 }
1074
1075 void MEDFileMesh::ChangeAllGroupsContainingFamily(std::map<std::string, std::vector<std::string> >& groups, const std::string& familyNameToChange, const std::vector<std::string>& newFamiliesNames)
1076 {
1077   std::string fam(familyNameToChange);
1078   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=groups.begin();it!=groups.end();it++)
1079     {
1080       std::vector<std::string>& fams((*it).second);
1081       std::vector<std::string>::iterator it2=std::find(fams.begin(),fams.end(),fam);
1082       if(it2!=fams.end())
1083         {
1084           fams.erase(it2);
1085           fams.insert(fams.end(),newFamiliesNames.begin(),newFamiliesNames.end());
1086         }
1087     }
1088 }
1089
1090 /*!
1091  * Returns a name of the family having a given id or, if no such a family exists, creates
1092  * a new uniquely named family and returns its name.
1093  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1094  *  \param [out] created - returns \c true if the new family has been created, \c false, else.
1095  *  \return std::string - the name of the existing or the created family.
1096  *  \throw If it is not possible to create a unique family name.
1097  */
1098 std::string MEDFileMesh::findOrCreateAndGiveFamilyWithId(int id, bool& created)
1099 {
1100   return FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(_families,id,created);
1101 }
1102
1103 /*!
1104  * If it exists a family whose family id is equal to 'id' this method behaves as MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId.
1105  * In this case, 'this' internal states remains unchanged and 'created' out parameter will be set to false.
1106  * If there is no family whose family id is equal to 'id' a family is created with a name different from those
1107  * already existing. In this case 'created' will be returned with a value set to true, and internal state
1108  * will be modified.
1109  * This method will throws an exception if it is not possible to create a unique family name.
1110  */
1111 std::string MEDFileMesh::FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(std::map<std::string,int>& families, int id, bool& created)
1112 {
1113   std::vector<std::string> famAlreadyExisting(families.size());
1114   int ii=0;
1115   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=families.begin();it!=families.end();it++,ii++)
1116     {
1117       if((*it).second!=id)
1118         {
1119           famAlreadyExisting[ii]=(*it).first;
1120         }
1121       else
1122         {
1123           created=false;
1124           return (*it).first;
1125         }
1126     }
1127   created=true;
1128   std::ostringstream oss; oss << "Family_" << id;
1129   std::string ret=CreateNameNotIn(oss.str(),famAlreadyExisting);
1130   families[ret]=id;
1131   return ret;
1132 }
1133
1134 /*!
1135  * Sets names and ids of all families in \a this mesh.
1136  *  \param [in] info - a map of a family name to a family id.
1137  */
1138 void MEDFileMesh::setFamilyInfo(const std::map<std::string,int>& info)
1139 {
1140   _families=info;
1141 }
1142
1143 /*!
1144  * Sets names of all groups and families constituting them in \a this mesh.
1145  *  \param [in] info - a map of a group name to a vector of names of families
1146  *          constituting the group.
1147  */
1148 void MEDFileMesh::setGroupInfo(const std::map<std::string, std::vector<std::string> >&info)
1149 {
1150   _groups=info;
1151 }
1152
1153 /*!
1154  * Returns an id of the family having a given name.
1155  *  \param [in] name - the name of the family of interest.
1156  *  \return int - the id of the family of interest.
1157  *  \throw If no family with such a \a name exists.
1158  */
1159 int MEDFileMesh::getFamilyId(const std::string& name) const
1160 {
1161   std::string oname(name);
1162   std::map<std::string, int>::const_iterator it=_families.find(oname);
1163   std::vector<std::string> fams=getFamiliesNames();
1164   if(it==_families.end())
1165     {
1166       std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << name << "\" !\nAvailable families are :";
1167       std::copy(fams.begin(),fams.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1168       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1169     }
1170   return (*it).second;
1171 }
1172
1173 /*!
1174  * Returns ids of the families having given names.
1175  *  \param [in] fams - a sequence of the names of families of interest.
1176  *  \return std::vector<int> - a sequence of the ids of families of interest.
1177  *  \throw If \a fams contains a name of an inexistent family.
1178  */
1179 std::vector<int> MEDFileMesh::getFamiliesIds(const std::vector<std::string>& fams) const
1180 {
1181   std::vector<int> ret(fams.size());
1182   int i=0;
1183   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=fams.begin();it!=fams.end();it++,i++)
1184     {
1185       std::map<std::string, int>::const_iterator it2=_families.find(*it);
1186       if(it2==_families.end())
1187         {
1188           std::vector<std::string> fams2=getFamiliesNames();
1189           std::ostringstream oss; oss << "No such familyname \"" << *it << "\" in input list !\nAvailable families are :";
1190           std::copy(fams2.begin(),fams2.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1191           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1192         }
1193       ret[i]=(*it2).second;
1194     }
1195   return ret;
1196 }
1197
1198 /*!
1199  * Returns a maximal abs(id) of families in \a this mesh.
1200  *  \return int - the maximal norm of family id.
1201  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1202  */
1203 int MEDFileMesh::getMaxAbsFamilyId() const
1204 {
1205   if(_families.empty())
1206     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1207   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1208   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1209     {
1210       ret=std::max(std::abs((*it).second),ret);
1211     }
1212   return ret;
1213 }
1214
1215 /*!
1216  * Returns a maximal id of families in \a this mesh.
1217  *  \return int - the maximal family id.
1218  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1219  */
1220 int MEDFileMesh::getMaxFamilyId() const
1221 {
1222   if(_families.empty())
1223     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMaxFamilyId : no families set !");
1224   int ret=-std::numeric_limits<int>::max();
1225   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1226     {
1227       ret=std::max((*it).second,ret);
1228     }
1229   return ret;
1230 }
1231
1232 /*!
1233  * Returns a minimal id of families in \a this mesh.
1234  *  \return int - the minimal family id.
1235  *  \throw If there are no families in \a this mesh.
1236  */
1237 int MEDFileMesh::getMinFamilyId() const
1238 {
1239   if(_families.empty())
1240     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::getMinFamilyId : no families set !");
1241   int ret=std::numeric_limits<int>::max();
1242   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1243     {
1244       ret=std::min((*it).second,ret);
1245     }
1246   return ret;
1247 }
1248
1249 /*!
1250  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1251  * considered but all family fields as well.
1252  *  \return int - the maximal family id.
1253  */
1254 int MEDFileMesh::getTheMaxAbsFamilyId() const
1255 {
1256   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1257   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1258     m1=std::max(std::abs((*it).second),m1);
1259   int m2=getMaxAbsFamilyIdInArrays();
1260   return std::max(m1,m2);
1261 }
1262
1263 /*!
1264  * Returns a maximal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1265  * considered but all family fields as well.
1266  *  \return int - the maximal family id.
1267  */
1268 int MEDFileMesh::getTheMaxFamilyId() const
1269 {
1270   int m1=-std::numeric_limits<int>::max();
1271   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1272     m1=std::max((*it).second,m1);
1273   int m2=getMaxFamilyIdInArrays();
1274   return std::max(m1,m2);
1275 }
1276
1277 /*!
1278  * Returns a minimal id of families in \a this mesh. Not only named families are
1279  * considered but all family fields as well.
1280  *  \return int - the minimal family id.
1281  */
1282 int MEDFileMesh::getTheMinFamilyId() const
1283 {
1284   int m1=std::numeric_limits<int>::max();
1285   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1286     m1=std::min((*it).second,m1);
1287   int m2=getMinFamilyIdInArrays();
1288   return std::min(m1,m2);
1289 }
1290
1291 /*!
1292  * This method only considers the maps. The contain of family array is ignored here.
1293  * 
1294  * \sa MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse
1295  */
1296 DataArrayInt *MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced() const
1297 {
1298   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1299   std::set<int> v;
1300   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1301     v.insert((*it).second);
1302   ret->alloc((int)v.size(),1);
1303   std::copy(v.begin(),v.end(),ret->getPointer());
1304   return ret.retn();
1305 }
1306
1307 /*!
1308  * This method does not consider map of family name, family id. Only family field array on different levels is considered.
1309  * 
1310  * \sa MEDFileMesh::getAllFamiliesIdsReferenced
1311  */
1312 DataArrayInt *MEDFileMesh::computeAllFamilyIdsInUse() const
1313 {
1314   std::vector<int> famLevs=getFamArrNonEmptyLevelsExt();
1315   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret;
1316   for(std::vector<int>::const_iterator it=famLevs.begin();it!=famLevs.end();it++)
1317     {
1318       const DataArrayInt *arr=getFamilyFieldAtLevel(*it);//arr not null due to spec of getFamArrNonEmptyLevelsExt
1319       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> dv=arr->getDifferentValues();
1320       if((DataArrayInt *) ret)
1321         ret=dv->buildUnion(ret);
1322       else
1323         ret=dv;
1324     }
1325   return ret.retn();
1326 }
1327
1328 /*!
1329  * true is returned if no modification has been needed. false if family
1330  * renumbering has been needed.       
1331  */
1332 bool MEDFileMesh::ensureDifferentFamIdsPerLevel()
1333 {
1334   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1335   std::set<int> allFamIds;
1336   int maxId=getMaxFamilyId()+1;
1337   std::map<int,std::vector<int> > famIdsToRenum;
1338   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1339     {
1340       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it);
1341       if(fam)
1342         {
1343           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1344           std::set<int> r2;
1345           std::set_intersection(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r2,r2.end()));
1346           if(!r2.empty())
1347             famIdsToRenum[*it].insert(famIdsToRenum[*it].end(),r2.begin(),r2.end());
1348           std::set<int> r3;
1349           std::set_union(tmp->begin(),tmp->end(),allFamIds.begin(),allFamIds.end(),std::inserter(r3,r3.end()));
1350         }
1351     }
1352   if(famIdsToRenum.empty())
1353     return true;
1354   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1355   for(std::map<int,std::vector<int> >::const_iterator it2=famIdsToRenum.begin();it2!=famIdsToRenum.end();it2++)
1356     {
1357       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt *>(getFamilyFieldAtLevel((*it2).first));
1358       int *famIdsToChange=fam->getPointer();
1359       std::map<int,int> ren;
1360       for(std::vector<int>::const_iterator it3=(*it2).second.begin();it3!=(*it2).second.end();it3++,maxId++)
1361         {
1362           if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1363             {
1364               std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1365               std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily(famName);
1366               ren[*it3]=maxId;
1367               bool dummy;
1368               std::string newFam=findOrCreateAndGiveFamilyWithId(maxId,dummy);
1369               for(std::vector<std::string>::const_iterator it4=grps.begin();it4!=grps.end();it4++)
1370                 addFamilyOnGrp((*it4),newFam);
1371             }
1372         }
1373       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getIdsEqualList(&(*it2).second[0],&(*it2).second[0]+(*it2).second.size());
1374       for(const int *id=ids->begin();id!=ids->end();id++)
1375         famIdsToChange[*id]=ren[famIdsToChange[*id]];
1376     }
1377   return false;
1378 }
1379
1380 /*!
1381  * This method normalizes fam id with the policy explained underneath. This policy is close to those implemented in SMESH.
1382  * Level #0 famids > 0, Level #-1 famids < 0, Level #-2 famids=0, Level #1 famids=0
1383  * This policy is those used by SMESH and Trio and that is the opposite of those in MED file.
1384  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1385  * \warning This policy is the opposite of those in MED file documentation ...
1386  */
1387 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsTrio()
1388 {
1389   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1390   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1391   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1392   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1393   std::set<std::string> famsFetched;
1394   std::map<std::string,int> families;
1395   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)!=levs.end())
1396     {
1397       levsS.erase(0);
1398       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(0);
1399       if(fam)
1400         {
1401           int refId=1;
1402           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1403           std::map<int,int> ren;
1404           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1405             ren[*it]=refId;
1406           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1407           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1408           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1409             *w=ren[*w];
1410           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1411             {
1412               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1413                 {
1414                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1415                   families[famName]=ren[*it];
1416                   famsFetched.insert(famName);
1417                 }
1418             }
1419         }
1420     }
1421   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)!=levs.end())
1422     {
1423       levsS.erase(-1);
1424       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
1425       if(fam)
1426         {
1427           int refId=-1;
1428           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1429           std::map<int,int> ren;
1430           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1431             ren[*it]=refId;
1432           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1433           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1434           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1435             *w=ren[*w];
1436           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1437             {
1438               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1439                 {
1440                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1441                   families[famName]=ren[*it];
1442                   famsFetched.insert(famName);
1443                 }
1444             }
1445         }
1446     }
1447   for(std::set<int>::const_iterator it2=levsS.begin();it2!=levsS.end();it2++)
1448     {
1449       DataArrayInt *fam=const_cast<DataArrayInt*>(getFamilyFieldAtLevel(*it2));
1450       if(fam)
1451         {
1452           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1453           fam->fillWithZero();
1454           for(const int *it3=tmp->begin();it3!=tmp->end();it3++)
1455             if(allIds->presenceOfValue(*it3))
1456               {
1457                 std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it3);
1458                 families[famName]=0;
1459                 famsFetched.insert(famName);
1460               }
1461         }
1462     }
1463   //
1464   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1465   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1466   std::set<std::string> unFetchedIds;
1467   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1468   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1469     families[*it4]=_families[*it4];
1470   _families=families;
1471 }
1472
1473 /*!
1474  * This method normalizes fam id with the following policy.
1475  * Level #0 famids < 0, Level #-1 famids < 0 and for Level #1 famids >= 0
1476  * This policy is those defined in the MED file format but is the opposite of those implemented in SMESH and Trio.
1477  * This method will throw an exception if a same family id is detected in different level.
1478  */
1479 void MEDFileMesh::normalizeFamIdsMEDFile()
1480 {
1481   ensureDifferentFamIdsPerLevel();
1482   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> allIds=getAllFamiliesIdsReferenced();
1483   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
1484   std::set<int> levsS(levs.begin(),levs.end());
1485   std::set<std::string> famsFetched;
1486   std::map<std::string,int> families;
1487   int refId=1;
1488   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),1)!=levs.end())
1489     {
1490       levsS.erase(1);
1491       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(1);
1492       if(fam)
1493         {
1494           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1495           std::map<int,int> ren;
1496           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId++)
1497             ren[*it]=refId;
1498           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1499           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1500           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1501             *w=ren[*w];
1502           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1503             {
1504               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1505                 {
1506                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1507                   families[famName]=ren[*it];
1508                   famsFetched.insert(famName);
1509                 }
1510             }
1511         }
1512     }
1513   refId=-1;
1514   for(std::set<int>::const_reverse_iterator it2=levsS.rbegin();it2!=levsS.rend();it2++)
1515     {
1516       const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(*it2);
1517       if(fam)
1518         {
1519           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=fam->getDifferentValues();
1520           std::map<int,int> ren;
1521           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++,refId--)
1522             ren[*it]=refId;
1523           int nbOfTuples=fam->getNumberOfTuples();
1524           int *start=const_cast<DataArrayInt *>(fam)->getPointer();
1525           for(int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
1526             *w=ren[*w];
1527           for(const int *it=tmp->begin();it!=tmp->end();it++)
1528             {
1529               if(allIds->presenceOfValue(*it))
1530                 {
1531                   std::string famName=getFamilyNameGivenId(*it);
1532                   families[famName]=ren[*it];
1533                   famsFetched.insert(famName);
1534                 }
1535             }
1536         }
1537     }
1538   //
1539   std::vector<std::string> allFams=getFamiliesNames();
1540   std::set<std::string> allFamsS(allFams.begin(),allFams.end());
1541   std::set<std::string> unFetchedIds;
1542   std::set_difference(allFamsS.begin(),allFamsS.end(),famsFetched.begin(),famsFetched.end(),std::inserter(unFetchedIds,unFetchedIds.end()));
1543   for(std::set<std::string>::const_iterator it4=unFetchedIds.begin();it4!=unFetchedIds.end();it4++)
1544     families[*it4]=_families[*it4];
1545   _families=families;
1546 }
1547
1548 /*!
1549  * Returns a name of the family by its id. If there are several families having the given
1550  * id, the name first in lexical order is returned.
1551  *  \param [in] id - the id of the family whose name is required.
1552  *  \return std::string - the name of the found family.
1553  *  \throw If no family with the given \a id exists.
1554  */
1555 std::string MEDFileMesh::getFamilyNameGivenId(int id) const
1556 {
1557   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1558     if((*it).second==id)
1559       return (*it).first;
1560   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::getFamilyNameGivenId : no such family id : " << id;
1561   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1562 }
1563
1564 /*!
1565  * Returns a string describing \a this mesh. This description includes the mesh name and
1566  * the mesh description string.
1567  *  \return std::string - the mesh information string.
1568  */
1569 std::string MEDFileMesh::simpleRepr() const
1570 {
1571   std::ostringstream oss;
1572   oss << "(*************************************)\n(* GENERAL INFORMATION ON THE MESH : *)\n(*************************************)\n";
1573   oss << "- Name of the mesh : <<" << getName() << ">>\n";
1574   oss << "- Description associated to the mesh : " << getDescription() << std::endl;
1575   return oss.str();
1576 }
1577
1578 /*!
1579  * Returns ids of mesh entities contained in a given group of a given dimension.
1580  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1581  *          are required.
1582  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1583  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1584  *          returned instead of ids. 
1585  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1586  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the group. The caller
1587  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1588  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1589  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1590  */
1591 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
1592 {
1593   std::vector<std::string> tmp(1);
1594   tmp[0]=grp;
1595   DataArrayInt *ret=getGroupsArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1596   ret->setName(grp);
1597   return ret;
1598 }
1599
1600 /*!
1601  * Returns ids of mesh entities contained in given groups of a given dimension.
1602  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1603  *          are required.
1604  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1605  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1606  *          returned instead of ids.
1607  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1608  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the groups. The caller
1609  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1610  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1611  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1612  */
1613 DataArrayInt *MEDFileMesh::getGroupsArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1614 {
1615   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
1616   return getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
1617 }
1618
1619 /*!
1620  * Returns ids of mesh entities contained in a given family of a given dimension.
1621  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
1622  *          are required.
1623  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
1624  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
1625  *          returned instead of ids. 
1626  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1627  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the family. The caller
1628  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1629  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
1630  */
1631 DataArrayInt *MEDFileMesh::getFamilyArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
1632 {
1633   std::vector<std::string> tmp(1);
1634   tmp[0]=fam;
1635   DataArrayInt *ret=getFamiliesArr(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
1636   ret->setName(fam);
1637   return ret;
1638 }
1639
1640 /*!
1641  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1642  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1643  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1644  *          returned instead of ids. 
1645  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1646  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1647  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1648  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1649  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1650  */
1651 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupArr(const std::string& grp, bool renum) const
1652 {
1653   std::vector<std::string> tmp(1);
1654   tmp[0]=grp;
1655   DataArrayInt *ret=getNodeGroupsArr(tmp,renum);
1656   ret->setName(grp);
1657   return ret;
1658 }
1659
1660 /*!
1661  * Returns ids of nodes contained in given groups.
1662  *  \param [in] grps - the names of the groups of interest.
1663  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1664  *          returned instead of ids. 
1665  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1666  *          numbers, if available and required, of nodes of the groups. The caller
1667  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1668  *  \throw If the name of a nonexistent group is present in \a grps.
1669  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1670  */
1671 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeGroupsArr(const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
1672 {
1673   return getGroupsArr(1,grps,renum);
1674 }
1675
1676 /*!
1677  * Returns ids of nodes contained in a given group.
1678  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
1679  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1680  *          returned instead of ids. 
1681  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1682  *          numbers, if available and required, of nodes of the group. The caller
1683  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1684  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
1685  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1686  */
1687 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamilyArr(const std::string& fam, bool renum) const
1688 {
1689   std::vector<std::string> tmp(1);
1690   tmp[0]=fam;
1691   DataArrayInt *ret=getNodeFamiliesArr(tmp,renum);
1692   ret->setName(fam);
1693   return ret;
1694 }
1695
1696 /*!
1697  * Returns ids of nodes contained in given families.
1698  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
1699  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of nodes, if available, are
1700  *          returned instead of ids. 
1701  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
1702  *          numbers, if available and required, of nodes of the families. The caller
1703  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
1704  *  \throw If the family field is missing for nodes.
1705  */
1706 DataArrayInt *MEDFileMesh::getNodeFamiliesArr(const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
1707 {
1708   return getFamiliesArr(1,fams,renum);
1709 }
1710
1711 /*!
1712  * Adds groups of given dimension and creates corresponding families and family fields
1713  * given ids of mesh entities of each group.
1714  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative mesh dimension of given mesh entities.
1715  *  \param [in] grps - a sequence of arrays of ids each describing a group.
1716  *  \param [in] renum - \c true means that \a grps contains not ids but optional numbers
1717  *          of mesh entities.
1718  *  \throw If names of some groups in \a grps are equal.
1719  *  \throw If \a grps includes a group with an empty name.
1720  *  \throw If \a grps includes invalid ids (or numbers if \a renum == \c true ).
1721  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
1722  */
1723 void MEDFileMesh::setGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<const DataArrayInt *>& grps, bool renum)
1724 {
1725   if(grps.empty())
1726     return ;
1727   std::set<std::string> grpsName;
1728   std::vector<std::string> grpsName2(grps.size());
1729   int i=0;
1730
1731   for(std::vector<const DataArrayInt *>::const_iterator it=grps.begin();it!=grps.end();it++,i++)
1732     {
1733       grpsName.insert((*it)->getName());
1734       grpsName2[i]=(*it)->getName();
1735     }
1736   if(grpsName.size()!=grps.size())
1737     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different each other !");
1738   if(grpsName.find(std::string(""))!=grpsName.end())
1739     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsAtLevel : groups name must be different empty string !");
1740   int sz=getSizeAtLevel(meshDimRelToMaxExt);
1741   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> fam;
1742   std::vector< std::vector<int> > fidsOfGroups;
1743   if(!renum)
1744     {
1745       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps,sz,fidsOfGroups);
1746     }
1747   else
1748     {
1749       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > grps2(grps.size());
1750       for(unsigned int ii=0;ii<grps.size();ii++)
1751         {
1752           grps2[ii]=MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(getRevNumberFieldAtLevel(meshDimRelToMaxExt),grps[ii]);
1753           grps2[ii]->setName(grps[ii]->getName());
1754         }
1755       std::vector<const DataArrayInt *> grps3(grps2.begin(),grps2.end());
1756       fam=DataArrayInt::MakePartition(grps3,sz,fidsOfGroups);
1757     }
1758   int offset=1;
1759   if(!_families.empty())
1760     offset=getMaxAbsFamilyId()+1;
1761   TranslateFamilyIds(meshDimRelToMaxExt==1?offset:-offset,fam,fidsOfGroups);
1762   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=fam->getDifferentValues();
1763   appendFamilyEntries(ids,fidsOfGroups,grpsName2);
1764   setFamilyFieldArr(meshDimRelToMaxExt,fam);
1765 }
1766
1767 /*!
1768  * This method append into '_families' attribute the families whose ids are in 'famIds'. Warning 'famIds' are expected to be ids
1769  * not in '_families'. Groups information are given in parameters in order to give to families representative names.
1770  * For the moment, the two last input parameters are not taken into account.
1771  */
1772 void MEDFileMesh::appendFamilyEntries(const DataArrayInt *famIds, const std::vector< std::vector<int> >& fidsOfGrps, const std::vector<std::string>& grpNames)
1773 {
1774   std::map<int,std::string> famInv;
1775   for(const int *it=famIds->begin();it!=famIds->end();it++)
1776     {
1777       std::ostringstream oss;
1778       oss << "Family_" << (*it);
1779       _families[oss.str()]=(*it);
1780       famInv[*it]=oss.str();
1781     }
1782   int i=0;
1783   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=fidsOfGrps.begin();it1!=fidsOfGrps.end();it1++,i++)
1784     {
1785       for(std::vector<int>::const_iterator it2=(*it1).begin();it2!=(*it1).end();it2++)
1786         {
1787           _groups[grpNames[i]].push_back(famInv[*it2]);
1788         }
1789     }
1790 }
1791
1792 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileMesh::getAllGeoTypes() const
1793 {
1794   std::vector<int> levs(getNonEmptyLevels());
1795   std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
1796   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
1797     {
1798       std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> elts(getGeoTypesAtLevel(*it));
1799       ret.insert(ret.end(),elts.begin(),elts.end());
1800     }
1801   return ret;
1802 }
1803
1804 std::vector<int> MEDFileMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
1805 {
1806   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> mLev(getGenMeshAtLevel(meshDimRelToMax));
1807   return mLev->getDistributionOfTypes();
1808 }
1809
1810 void MEDFileMesh::TranslateFamilyIds(int offset, DataArrayInt *famArr, std::vector< std::vector<int> >& famIdsPerGrp)
1811 {
1812   famArr->applyLin(offset>0?1:-1,offset,0);
1813   for(std::vector< std::vector<int> >::iterator it1=famIdsPerGrp.begin();it1!=famIdsPerGrp.end();it1++)
1814     {
1815       if(offset<0)
1816         std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::negate<int>());
1817       std::transform((*it1).begin(),(*it1).end(),(*it1).begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),offset));
1818     }
1819 }
1820
1821 /*!
1822  * Warning no check is done on 'nameTry' in parameter. It should be non empty.
1823  * This method returns a name close to 'nameTry' so that it is not already into 'namesToAvoid'.
1824  * If this method fails to find such a name it will throw an exception.
1825  */
1826 std::string MEDFileMesh::CreateNameNotIn(const std::string& nameTry, const std::vector<std::string>& namesToAvoid)
1827 {
1828   //attempt #0
1829   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),nameTry)==namesToAvoid.end())
1830     return nameTry;
1831   //attempt #1
1832   std::size_t len=nameTry.length();
1833   for(std::size_t ii=1;ii<len;ii++)
1834     {
1835       std::string tmp=nameTry.substr(ii,len-ii);
1836       if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp)==namesToAvoid.end())
1837         return tmp;
1838     }
1839   //attempt #2
1840   if(len>=1)
1841     {
1842       for(std::size_t i=1;i<30;i++)
1843         {
1844           std::string tmp1(nameTry.at(0),i);
1845           tmp1+=nameTry;
1846           if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp1)==namesToAvoid.end())
1847             return tmp1;
1848         }
1849     }
1850   //attempt #3
1851   std::string tmp2;
1852   for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=namesToAvoid.begin();it2!=namesToAvoid.end();it2++)
1853     tmp2+=(*it2);
1854   if(std::find(namesToAvoid.begin(),namesToAvoid.end(),tmp2)==namesToAvoid.end())
1855     return tmp2;
1856   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::CreateNameNotIn : impossible to find a not already used name !");
1857 }
1858
1859 int MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset(std::vector<int>& code, int strt)
1860 {
1861   std::size_t nbOfChunks=code.size()/3;
1862   if(code.size()%3!=0)
1863     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::PutInThirdComponentOfCodeOffset : code has invalid size : should be of size 3*x !");
1864   int ret=strt;
1865   for(std::size_t i=0;i<nbOfChunks;i++)
1866     {
1867       code[3*i+2]=ret;
1868       ret+=code[3*i+1];
1869     }
1870   return ret;
1871 }
1872
1873 /*!
1874  * This method should be called by any set* method of subclasses to deal automatically with _name attribute.
1875  * If _name attribute is empty the name of 'm' if taken as _name attribute.
1876  * If _name is not empty and that 'm' has the same name nothing is done.
1877  * If _name is not emplt and that 'm' has \b NOT the same name an exception is thrown.
1878  */
1879 void MEDFileMesh::dealWithTinyInfo(const MEDCouplingMesh *m)
1880 {
1881   if(!m)
1882     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : input mesh in NULL !");
1883   if(_name.empty())
1884     _name=m->getName();
1885   else
1886     {
1887       std::string name(m->getName());
1888       if(!name.empty())
1889         {
1890           if(_name!=name)
1891             {
1892               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : name of current MEDfile mesh is '" << _name << "' whereas name of input mesh is : '";
1893               oss << name << "' ! Names must match !";
1894               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1895             }
1896         }
1897     }
1898   if(_desc_name.empty())
1899     _desc_name=m->getDescription();
1900   else
1901     {
1902       std::string name(m->getDescription());
1903       if(!name.empty())
1904         {
1905           if(_desc_name!=name)
1906             {
1907               std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh::dealWithTinyInfo : description of current MEDfile mesh is '" << _desc_name << "' whereas name of input mesh is : '";
1908               oss << name << "' ! Names must match !";
1909               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1910             }
1911         }
1912     }
1913 }
1914
1915 void MEDFileMesh::getFamilyRepr(std::ostream& oss) const
1916 {
1917   oss << "(**************************)\n(* FAMILIES OF THE MESH : *)\n(**************************)\n";
1918   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
1919     {
1920       oss << "- Family with name \"" << (*it).first << "\" with number " << (*it).second << std::endl;
1921       oss << "  - Groups lying on this family : ";
1922       std::vector<std::string> grps=getGroupsOnFamily((*it).first);
1923       std::copy(grps.begin(),grps.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
1924       oss << std::endl << std::endl;
1925     }
1926 }
1927
1928 /*!
1929  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1930  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
1931  * iteration.
1932  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1933  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
1934  *  \param [in] dt - the number of a time step.
1935  *  \param [in] it - the number of an iteration.
1936  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1937  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1938  *  \throw If the file is not readable.
1939  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
1940  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1941  */
1942 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1943 {
1944   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1945   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1946   return new MEDFileUMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
1947 }
1948
1949 /*!
1950  * Returns a new MEDFileUMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
1951  * file. The first mesh in the file is loaded.
1952  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
1953  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1954  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1955  *  \throw If the file is not readable.
1956  *  \throw If there is no meshes in the file.
1957  *  \throw If the mesh in the file is not an unstructured one.
1958  */
1959 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
1960 {
1961   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
1962   if(ms.empty())
1963     {
1964       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
1965       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1966     }
1967   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
1968   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
1969   int dt,it;
1970   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
1971   std::string dummy2;
1972   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
1973   return new MEDFileUMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
1974 }
1975
1976 /*!
1977  * Returns an empty instance of MEDFileUMesh.
1978  *  \return MEDFileUMesh * - a new instance of MEDFileUMesh. The caller is to delete this
1979  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
1980  */
1981 MEDFileUMesh *MEDFileUMesh::New()
1982 {
1983   return new MEDFileUMesh;
1984 }
1985
1986 std::size_t MEDFileUMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1987 {
1988   std::size_t ret(MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren());
1989   ret+=_ms.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>));
1990   return ret;
1991 }
1992
1993 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileUMesh::getDirectChildren() const
1994 {
1995   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildren());
1996   if((const DataArrayDouble*)_coords)
1997     ret.push_back((const DataArrayDouble*)_coords);
1998   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
1999     ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_coords);
2000   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
2001     ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_coords);
2002   if((const DataArrayInt *)_rev_num_coords)
2003     ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_coords);
2004   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
2005     ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords);
2006   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2007     if((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it)
2008       ret.push_back((const MEDFileUMeshSplitL1*) *it);
2009   return ret;
2010 }
2011
2012 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::shallowCpy() const
2013 {
2014   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2015   return ret.retn();
2016 }
2017
2018 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::createNewEmpty() const
2019 {
2020   return new MEDFileUMesh;
2021 }
2022
2023 MEDFileMesh *MEDFileUMesh::deepCpy() const
2024 {
2025   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMesh> ret=new MEDFileUMesh(*this);
2026   if((const DataArrayDouble*)_coords)
2027     ret->_coords=_coords->deepCpy();
2028   if((const DataArrayInt*)_fam_coords)
2029     ret->_fam_coords=_fam_coords->deepCpy();
2030   if((const DataArrayInt*)_num_coords)
2031     ret->_num_coords=_num_coords->deepCpy();
2032   if((const DataArrayInt*)_rev_num_coords)
2033     ret->_rev_num_coords=_rev_num_coords->deepCpy();
2034   if((const DataArrayAsciiChar*)_name_coords)
2035     ret->_name_coords=_name_coords->deepCpy();
2036   std::size_t i=0;
2037   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
2038     {
2039       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2040         ret->_ms[i]=(*it)->deepCpy(ret->_coords);
2041     }
2042   return ret.retn();
2043 }
2044
2045 /*!
2046  * Checks if \a this and another mesh are equal.
2047  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
2048  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
2049  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
2050  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
2051  */
2052 bool MEDFileUMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
2053 {
2054   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
2055     return false;
2056   const MEDFileUMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(other);
2057   if(!otherC)
2058     {
2059       what="Mesh types differ ! This is unstructured and other is NOT !";
2060       return false;
2061     }
2062   clearNonDiscrAttributes();
2063   otherC->clearNonDiscrAttributes();
2064   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2065   const DataArrayDouble *coo2=otherC->_coords;
2066   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
2067     {
2068       what="Mismatch of coordinates ! One is defined and not other !";
2069       return false;
2070     }
2071   if(coo1)
2072     {
2073       bool ret=coo1->isEqual(*coo2,eps);
2074       if(!ret)
2075         {
2076           what="Coords differ !";
2077           return false;
2078         }
2079     }
2080   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2081   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_coords;
2082   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
2083     {
2084       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
2085       return false;
2086     }
2087   if(famc1)
2088     {
2089       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
2090       if(!ret)
2091         {
2092           what="Families arr on node differ !";
2093           return false;
2094         }
2095     }
2096   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2097   const DataArrayInt *numc2=otherC->_num_coords;
2098   if((numc1==0 && numc2!=0) || (numc1!=0 && numc2==0))
2099     {
2100       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
2101       return false;
2102     }
2103   if(numc1)
2104     {
2105       bool ret=numc1->isEqual(*numc2);
2106       if(!ret)
2107         {
2108           what="Numbering arr on node differ !";
2109           return false;
2110         }
2111     }
2112   const DataArrayAsciiChar *namec1=_name_coords;
2113   const DataArrayAsciiChar *namec2=otherC->_name_coords;
2114   if((namec1==0 && namec2!=0) || (namec1!=0 && namec2==0))
2115     {
2116       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
2117       return false;
2118     }
2119   if(namec1)
2120     {
2121       bool ret=namec1->isEqual(*namec2);
2122       if(!ret)
2123         {
2124           what="Names arr on node differ !";
2125           return false;
2126         }
2127     }
2128   if(_ms.size()!=otherC->_ms.size())
2129     {
2130       what="Number of levels differs !";
2131       return false;
2132     }
2133   std::size_t sz=_ms.size();
2134   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2135     {
2136       const MEDFileUMeshSplitL1 *s1=_ms[i];
2137       const MEDFileUMeshSplitL1 *s2=otherC->_ms[i];
2138       if((s1==0 && s2!=0) || (s1!=0 && s2==0))
2139         {
2140           what="Mismatch of presence of sub levels !";
2141           return false;
2142         }
2143       if(s1)
2144         {
2145           bool ret=s1->isEqual(s2,eps,what);
2146           if(!ret)
2147             return false;
2148         }
2149     }
2150   return true;
2151 }
2152
2153 /*!
2154  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
2155  */
2156 void MEDFileUMesh::clearNonDiscrAttributes() const
2157 {
2158   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
2159   const DataArrayDouble *coo1=_coords;
2160   if(coo1)
2161     (const_cast<DataArrayDouble *>(coo1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2162   const DataArrayInt *famc1=_fam_coords;
2163   if(famc1)
2164     (const_cast<DataArrayInt *>(famc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2165   const DataArrayInt *numc1=_num_coords;
2166   if(numc1)
2167     (const_cast<DataArrayInt *>(numc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2168   const DataArrayAsciiChar *namc1=_name_coords;
2169   if(namc1)
2170     (const_cast<DataArrayAsciiChar *>(namc1))->setName("");//This parameter is not discriminant for comparison
2171   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2172     {
2173       const MEDFileUMeshSplitL1 *tmp=(*it);
2174       if(tmp)
2175         tmp->clearNonDiscrAttributes();
2176     }
2177 }
2178
2179 void MEDFileUMesh::setName(const std::string& name)
2180 {
2181   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2182     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2183       (*it)->setName(name);
2184   MEDFileMesh::setName(name);
2185 }
2186
2187 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh()
2188 {
2189 }
2190
2191 MEDFileUMesh::MEDFileUMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2192 try
2193   {
2194     loadUMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
2195   }
2196 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2197   {
2198     throw e;
2199   }
2200
2201 void MEDFileUMesh::loadUMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
2202 {
2203   MEDFileUMeshL2 loaderl2;
2204   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
2205   int dummy0,dummy1;
2206   std::string dummy2;
2207   int mid=MEDFileUMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dummy2);
2208   if(meshType!=UNSTRUCTURED)
2209     {
2210       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as unstructured an existing mesh with name '" << mName << "' !";
2211       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2212     }
2213   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it,mrs);
2214   int lev=loaderl2.getNumberOfLevels();
2215   _ms.resize(lev);
2216   for(int i=0;i<lev;i++)
2217     {
2218       if(!loaderl2.emptyLev(i))
2219         _ms[i]=new MEDFileUMeshSplitL1(loaderl2,mName,i);
2220       else
2221         _ms[i]=0;
2222     }
2223   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
2224   //
2225   setName(loaderl2.getName());
2226   setDescription(loaderl2.getDescription());
2227   setUnivName(loaderl2.getUnivName());
2228   setIteration(loaderl2.getIteration());
2229   setOrder(loaderl2.getOrder());
2230   setTimeValue(loaderl2.getTime());
2231   setTimeUnit(loaderl2.getTimeUnit());
2232   _coords=loaderl2.getCoords();
2233   if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
2234     _fam_coords=loaderl2.getCoordsFamily();
2235   if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
2236     _num_coords=loaderl2.getCoordsNum();
2237   if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
2238     _name_coords=loaderl2.getCoordsName();
2239   computeRevNum();
2240 }
2241
2242 MEDFileUMesh::~MEDFileUMesh()
2243 {
2244 }
2245
2246 void MEDFileUMesh::writeLL(med_idt fid) const
2247 {
2248   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2249   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
2250   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
2251   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
2252   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
2253   int spaceDim=coo?coo->getNumberOfComponents():0;
2254   int mdim=getMeshDimension();
2255   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2256   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
2257   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
2258     {
2259       std::string info=coo->getInfoOnComponent(i);
2260       std::string c,u;
2261       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
2262       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2263       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
2264     }
2265   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,mdim,MED_UNSTRUCTURED_MESH,desc,"",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
2266   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
2267   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
2268   MEDFileUMeshL2::WriteCoords(fid,meshName,_iteration,_order,_time,_coords,_fam_coords,_num_coords,_name_coords);
2269   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2270     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2271       (*it)->write(fid,meshName,mdim);
2272   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,meshName,_families,_groups,_too_long_str);
2273 }
2274
2275 /*!
2276  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
2277  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2278  */
2279 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevels() const
2280 {
2281   std::vector<int> ret;
2282   int lev=0;
2283   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2284     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2285       if(!(*it)->empty())
2286         ret.push_back(lev);
2287   return ret;
2288 }
2289
2290 /*!
2291  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
2292  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2293  */
2294 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
2295 {
2296   std::vector<int> ret0=getNonEmptyLevels();
2297   if((const DataArrayDouble *) _coords)
2298     {
2299       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2300       ret[0]=1;
2301       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2302       return ret;
2303     }
2304   return ret0;
2305 }
2306
2307 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
2308 {
2309   std::vector<int> ret;
2310   const DataArrayInt *famCoo(_fam_coords);
2311   if(famCoo)
2312     ret.push_back(1);
2313   int lev=0;
2314   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2315     {
2316       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2317       if(cur)
2318         if(cur->getFamilyField())
2319           ret.push_back(lev);
2320     }
2321   return ret;
2322 }
2323
2324 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
2325 {
2326   std::vector<int> ret;
2327   const DataArrayInt *numCoo(_num_coords);
2328   if(numCoo)
2329     ret.push_back(1);
2330   int lev=0;
2331   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2332     {
2333       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2334       if(cur)
2335         if(cur->getNumberField())
2336           ret.push_back(lev);
2337     }
2338   return ret;
2339 }
2340
2341 std::vector<int> MEDFileUMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
2342 {
2343   std::vector<int> ret;
2344   const DataArrayAsciiChar *nameCoo(_name_coords);
2345   if(nameCoo)
2346     ret.push_back(1);
2347   int lev=0;
2348   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev--)
2349     {
2350       const MEDFileUMeshSplitL1 *cur(*it);
2351       if(cur)
2352         if(cur->getNameField())
2353           ret.push_back(lev);
2354     }
2355   return ret;
2356 }
2357
2358 /*!
2359  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given group is defined.
2360  * To include nodes, call getGrpNonEmptyLevelsExt() method.
2361  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2362  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2363  */
2364 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevels(const std::string& grp) const
2365 {
2366   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2367   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2368 }
2369
2370 /*!
2371  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given group is defined.
2372  *  \param [in] grp - the name of the group of interest.
2373  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2374  */
2375 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpNonEmptyLevelsExt(const std::string& grp) const
2376 {
2377   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroup(grp);
2378   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2379 }
2380
2381 /*!
2382  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where a given family is defined.
2383  * To include nodes, call getFamNonEmptyLevelsExt() method.
2384  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2385  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2386  */
2387 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevels(const std::string& fam) const
2388 {
2389   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2390   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2391 }
2392
2393 /*!
2394  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where a given family is defined.
2395  *  \param [in] fam - the name of the family of interest.
2396  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2397  */
2398 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamNonEmptyLevelsExt(const std::string& fam) const
2399 {
2400   std::vector<std::string> fams(1,std::string(fam));
2401   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2402 }
2403
2404 /*!
2405  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given groups are defined.
2406  * To include nodes, call getGrpsNonEmptyLevelsExt() method.
2407  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2408  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2409  */
2410 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& grps) const
2411 {
2412   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2413   return getFamsNonEmptyLevels(fams);
2414 }
2415
2416 /*!
2417  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given groups are defined.
2418  *  \param [in] grps - a sequence of names of the groups of interest.
2419  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2420  */
2421 std::vector<int> MEDFileUMesh::getGrpsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& grps) const
2422 {
2423   std::vector<std::string> fams=getFamiliesOnGroups(grps);
2424   return getFamsNonEmptyLevelsExt(fams);
2425 }
2426
2427 /*!
2428  * Returns all relative mesh levels (**excluding nodes**) where given families are defined.
2429  * To include nodes, call getFamsNonEmptyLevelsExt() method.
2430  *  \param [in] fams - the name of the family of interest.
2431  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2432  */
2433 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevels(const std::vector<std::string>& fams) const
2434 {
2435   std::vector<int> ret;
2436   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
2437   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2438   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
2439     if(_ms[-(*it)]->presenceOfOneFams(famIds))
2440       ret.push_back(*it);
2441   return ret;
2442 }
2443
2444 /*!
2445  * Returns all relative mesh levels (including nodes) where given families are defined.
2446  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2447  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions.
2448  */
2449 std::vector<int> MEDFileUMesh::getFamsNonEmptyLevelsExt(const std::vector<std::string>& fams) const
2450 {
2451   std::vector<int> ret0=getFamsNonEmptyLevels(fams);
2452   const DataArrayInt *famCoords=_fam_coords;
2453   if(!famCoords)
2454     return ret0;
2455   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2456   if(famCoords->presenceOfValue(famIds))
2457     {
2458       std::vector<int> ret(ret0.size()+1);
2459       ret[0]=1;
2460       std::copy(ret0.begin(),ret0.end(),ret.begin()+1);
2461       return ret;
2462     }
2463   else
2464     return ret0;
2465 }
2466
2467 /*!
2468  * Returns names of groups that partly or fully appear on the level \a meshDimRelToMaxExt.
2469  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of interest.
2470  *  \return std::vector<std::string> - a sequence of group names at \a meshDimRelToMaxExt
2471  *          level. 
2472  */
2473 std::vector<std::string> MEDFileUMesh::getGroupsOnSpecifiedLev(int meshDimRelToMaxExt) const
2474 {
2475   std::vector<std::string> ret;
2476   std::vector<std::string> allGrps=getGroupsNames();
2477   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=allGrps.begin();it!=allGrps.end();it++)
2478     {
2479       std::vector<int> levs=getGrpNonEmptyLevelsExt((*it));
2480       if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)!=levs.end())
2481         ret.push_back(*it);
2482     }
2483   return ret;
2484 }
2485
2486 int MEDFileUMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
2487 {
2488   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2489   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2490     {
2491       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2492       ret=std::max(ret,std::abs(val));
2493     }
2494   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2495     {
2496       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2497         {
2498           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2499           if(da)
2500             {
2501               int val=da->getMaxValue(tmp);
2502               ret=std::max(ret,std::abs(val));
2503             }
2504         }
2505     }
2506   return ret;
2507 }
2508
2509 int MEDFileUMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
2510 {
2511   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2512   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2513     {
2514       int val=_fam_coords->getMaxValue(tmp);
2515       ret=std::max(ret,val);
2516     }
2517   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2518     {
2519       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2520         {
2521           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2522           if(da)
2523             {
2524               int val=da->getMaxValue(tmp);
2525               ret=std::max(ret,val);
2526             }
2527         }
2528     }
2529   return ret;
2530 }
2531
2532 int MEDFileUMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
2533 {
2534   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
2535   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2536     {
2537       int val=_fam_coords->getMinValue(tmp);
2538       ret=std::min(ret,val);
2539     }
2540   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
2541     {
2542       if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
2543         {
2544           const DataArrayInt *da=(*it)->getFamilyField();
2545           if(da)
2546             {
2547               int val=da->getMinValue(tmp);
2548               ret=std::min(ret,val);
2549             }
2550         }
2551     }
2552   return ret;
2553 }
2554
2555 /*!
2556  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
2557  *  \return int - the mesh dimension.
2558  *  \throw If there are no cells in this mesh.
2559  */
2560 int MEDFileUMesh::getMeshDimension() const
2561 {
2562   int lev=0;
2563   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,lev++)
2564     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it)!=0)
2565       return (*it)->getMeshDimension()+lev;
2566   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getMeshDimension : impossible to find a mesh dimension !");
2567 }
2568
2569 /*!
2570  * Returns the space dimension of \a this mesh that is equal to number of components in
2571  * the node coordinates array.
2572  *  \return int - the space dimension of \a this mesh.
2573  *  \throw If the node coordinates array is not available.
2574  */
2575 int MEDFileUMesh::getSpaceDimension() const
2576 {
2577   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2578   if(!coo)
2579     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getSpaceDimension : no coords set !");
2580   return coo->getNumberOfComponents();
2581 }
2582
2583 /*!
2584  * Returns a string describing \a this mesh.
2585  *  \return std::string - the mesh information string.
2586  */
2587 std::string MEDFileUMesh::simpleRepr() const
2588 {
2589   std::ostringstream oss;
2590   oss << MEDFileMesh::simpleRepr();
2591   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2592   oss << "- The dimension of the space is ";
2593   static const char MSG1[]= "*** NO COORDS SET ***";
2594   static const char MSG2[]= "*** NO CONNECTIVITY SET FOR THIS LEVEL***";
2595   if(coo)
2596     oss << _coords->getNumberOfComponents() << std::endl;
2597   else
2598     oss << MSG1 << std::endl;
2599   oss << "- Type of the mesh : UNSTRUCTURED\n";
2600   oss << "- Number of nodes : ";
2601   if(coo)
2602     oss << _coords->getNumberOfTuples() << std::endl;
2603   else
2604     oss << MSG1 << std::endl;
2605   std::size_t nbOfLev=_ms.size();
2606   oss << "- Number of levels allocated : " << nbOfLev << std::endl;
2607   for(std::size_t i=0;i<nbOfLev;i++)
2608     {
2609       const MEDFileUMeshSplitL1 *lev=_ms[i];
2610       oss << "  - Level #" << -((int) i) << " has dimension : ";
2611       if(lev)
2612         {
2613           oss << lev->getMeshDimension() << std::endl;
2614           lev->simpleRepr(oss);
2615         }
2616       else
2617         oss << MSG2 << std::endl;
2618     }
2619   oss << "- Number of families : " << _families.size() << std::endl << std::endl;
2620   if(coo)
2621     {
2622       oss << "(***********************)\n(* NODES OF THE MESH : *)\n(***********************)\n";
2623       oss << "- Names of coordinates :" << std::endl;
2624       std::vector<std::string> vars=coo->getVarsOnComponent();
2625       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2626       oss << std::endl << "- Units of coordinates : " << std::endl;
2627       std::vector<std::string> units=coo->getUnitsOnComponent();
2628       std::copy(units.begin(),units.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2629     }
2630   oss << std::endl << std::endl;
2631   getFamilyRepr(oss);
2632   return oss.str();
2633 }
2634
2635 /*!
2636  * Returns a full textual description of \a this mesh.
2637  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
2638  */
2639 std::string MEDFileUMesh::advancedRepr() const
2640 {
2641   return simpleRepr();
2642 }
2643
2644 /*!
2645  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
2646  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
2647  *  \return int - the number of entities.
2648  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
2649  */
2650 int MEDFileUMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2651 {
2652   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2653     {
2654       if(!((const DataArrayDouble *)_coords))
2655         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getSizeAtLevel : no coordinates specified !");
2656       return _coords->getNumberOfTuples();
2657     }
2658   return getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt)->getSize();
2659 }
2660
2661 /*!
2662  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
2663  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2664  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
2665  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
2666  */
2667 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2668 {
2669   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2670     return _fam_coords;
2671   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2672   return l1->getFamilyField();
2673 }
2674
2675 /*!
2676  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
2677  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2678  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
2679  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2680  */
2681 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2682 {
2683   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2684     return _num_coords;
2685   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2686   return l1->getNumberField();
2687 }
2688
2689 const DataArrayAsciiChar *MEDFileUMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2690 {
2691   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2692     return _name_coords;
2693   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2694   return l1->getNameField();
2695 }
2696
2697 int MEDFileUMesh::getNumberOfNodes() const
2698 {
2699   const DataArrayDouble *coo=_coords;
2700   if(!coo)
2701     throw INTERP_KERNEL::Exception(" MEDFileUMesh::getNumberOfNodes : no coords set !");
2702   return coo->getNumberOfTuples();
2703 }
2704
2705 void MEDFileUMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
2706 {
2707   std::size_t sz(st.getNumberOfItems());
2708   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
2709     {
2710       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType curGt(st[i].getGeo());
2711       const MEDCoupling1GTUMesh *m(getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(curGt));
2712       if(st[i].getPflName().empty())
2713         m->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2714       else
2715         {
2716           const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[i].getPflName()));
2717           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m2(dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(m->buildPartOfMySelf(arr->begin(),arr->end(),true)));
2718           m2->computeNodeIdsAlg(nodesFetched);
2719         }
2720     }
2721 }
2722
2723 /*!
2724  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
2725  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2726  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
2727  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
2728  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
2729  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2730  */
2731 const DataArrayInt *MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
2732 {
2733   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2734     {
2735       if(!((const DataArrayInt *)_num_coords))
2736         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no coordinates renum specified !");
2737       return _rev_num_coords;
2738     }
2739   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2740   return l1->getRevNumberField();
2741 }
2742
2743 /*!
2744  * Returns a pointer to the node coordinates array of \a this mesh \b without
2745  * incrementing its reference counter, thus there is no need to decrRef() it by the caller.
2746  */
2747 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::getCoords() const
2748 {
2749   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> tmp(_coords);
2750   if((DataArrayDouble *)tmp)
2751     {
2752       return tmp;
2753     }
2754   return 0;
2755 }
2756
2757 /*!
2758  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2759  * group of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2760  * new mesh.
2761  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2762  *  \param [in] grp - the name of the group whose mesh entities are included in the
2763  *          new mesh.
2764  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2765  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2766  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2767  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2768  *  \throw If the name of a nonexistent group is specified.
2769  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2770  */
2771 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroup(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& grp, bool renum) const
2772 {
2773   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2774   std::vector<std::string> tmp(1);
2775   tmp[0]=grp;
2776   return getGroups(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2777 }
2778
2779 /*!
2780  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2781  * groups of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2782  * new mesh.
2783  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2784  *  \param [in] grps - a sequence of group names whose mesh entities are included in the
2785  *          new mesh.
2786  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2787  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2788  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2789  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2790  *  \throw If a name of a nonexistent group is present in \a grps.
2791  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2792  */
2793 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getGroups(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& grps, bool renum) const
2794 {
2795   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2796   std::vector<std::string> fams2=getFamiliesOnGroups(grps);
2797   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet=getFamilies(meshDimRelToMaxExt,fams2,renum);
2798   if(grps.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2799     zeRet->setName(grps[0]);
2800   return zeRet.retn();
2801 }
2802
2803 /*!
2804  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in a given
2805  * family of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2806  * new mesh.
2807  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2808  *  \param [in] fam - the name of the family whose mesh entities are included in the
2809  *          new mesh.
2810  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2811  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2812  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2813  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2814  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a grps.
2815  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2816  */
2817 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamily(int meshDimRelToMaxExt, const std::string& fam, bool renum) const
2818 {
2819   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2820   std::vector<std::string> tmp(1);
2821   tmp[0]=fam;
2822   return getFamilies(meshDimRelToMaxExt,tmp,renum);
2823 }
2824
2825 /*!
2826  * Returns a new MEDCouplingUMesh corresponding to mesh entities included in given
2827  * families of \a this mesh. Only mesh entities of a given dimension are included in the
2828  * new mesh.
2829  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities of interest.
2830  *  \param [in] fams - a sequence of family names whose mesh entities are included in the
2831  *          new mesh.
2832  *  \param [in] renum - if \c true, cells and nodes of the result mesh are permuted
2833  *          according to the optional numbers of entities, if available.
2834  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
2835  *          delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
2836  *  \throw If a name of a nonexistent family is present in \a fams.
2837  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2838  */
2839 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getFamilies(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2840 {
2841   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2842   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2843     {
2844       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr=getFamiliesArr(1,fams,renum);
2845       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New();
2846       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> c=_coords->selectByTupleId(arr->getConstPointer(),arr->getConstPointer()+arr->getNbOfElems());
2847       ret->setCoords(c);
2848       return ret.retn();
2849     }
2850   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2851   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2852   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> zeRet;
2853   if(!famIds.empty())
2854     zeRet=l1->getFamilyPart(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2855   else
2856     zeRet=l1->getFamilyPart(0,0,renum);
2857   if(fams.size()==1 && ((MEDCouplingUMesh *)zeRet))
2858     zeRet->setName(fams[0]);
2859   return zeRet.retn();
2860 }
2861
2862 /*!
2863  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
2864  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
2865  *          are required.
2866  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
2867  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
2868  *          returned instead of ids.
2869  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
2870  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
2871  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
2872  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
2873  */
2874 DataArrayInt *MEDFileUMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
2875 {
2876   std::vector<int> famIds=getFamiliesIds(fams);
2877   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2878     {
2879       if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
2880         {
2881           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
2882           if(!famIds.empty())
2883             da=_fam_coords->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
2884           else
2885             da=_fam_coords->getIdsEqualList(0,0);
2886           if(renum)
2887             return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_coords,da);
2888           else
2889             return da.retn();
2890         }
2891       else
2892         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
2893     }
2894   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2895   if(!famIds.empty())
2896     return l1->getFamilyPartArr(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size(),renum);
2897   else
2898     return l1->getFamilyPartArr(0,0,renum);
2899 }
2900
2901 /*!
2902  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2903  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2904  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2905  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
2906  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
2907  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
2908  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2909  *          optional numbers of mesh entities.
2910  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2911  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2912  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
2913  * \sa getGenMeshAtLevel()
2914  */
2915 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getMeshAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, bool renum) const
2916 {
2917   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
2918   if(meshDimRelToMaxExt==1)
2919     {
2920       if(!renum)
2921         {
2922           MEDCouplingUMesh *umesh=MEDCouplingUMesh::New();
2923           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> cc=_coords->deepCpy();
2924           umesh->setCoords(cc);
2925           MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(umesh);
2926           umesh->setName(getName());
2927           return umesh;
2928         }
2929     }
2930   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
2931   return l1->getWholeMesh(renum);
2932 }
2933
2934 /*!
2935  * Returns a MEDCouplingUMesh of a given relative dimension.
2936  * \warning If \a meshDimRelToMaxExt == 1 (which means nodes), the returned mesh **is not
2937  * valid**. This is a feature, because MEDLoader does not create cells that do not exist! 
2938  * To build a valid MEDCouplingUMesh from the returned one in this case,
2939  * call MEDCouplingUMesh::Build0DMeshFromCoords().
2940  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
2941  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2942  *          optional numbers of mesh entities.
2943  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2944  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2945  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMax dimension in \a this mesh.
2946  * \sa getMeshAtLevel()
2947  */
2948 MEDCouplingMesh *MEDFileUMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
2949 {
2950   return getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
2951 }
2952
2953 std::vector<int> MEDFileUMesh::getDistributionOfTypes(int meshDimRelToMax) const
2954 {
2955   const MEDFileUMeshSplitL1 *l1(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
2956   return l1->getDistributionOfTypes();
2957 }
2958
2959 /*!
2960  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == 0.
2961  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2962  *          optional numbers of mesh entities.
2963  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2964  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2965  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == 0 in \a this mesh.
2966  */
2967 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevel0Mesh(bool renum) const
2968 {
2969   return getMeshAtLevel(0,renum);
2970 }
2971
2972 /*!
2973  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -1.
2974  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2975  *          optional numbers of mesh entities.
2976  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2977  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2978  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -1 in \a this mesh.
2979  */
2980 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM1Mesh(bool renum) const
2981 {
2982   return getMeshAtLevel(-1,renum);
2983 }
2984
2985 /*!
2986  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -2.
2987  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
2988  *          optional numbers of mesh entities.
2989  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
2990  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
2991  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -2 in \a this mesh.
2992  */
2993 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM2Mesh(bool renum) const
2994 {
2995   return getMeshAtLevel(-2,renum);
2996 }
2997
2998 /*!
2999  * Returns a MEDCouplingUMesh of a relative dimension == -3.
3000  *  \param [in] renum - if \c true, the returned mesh is permuted according to the
3001  *          optional numbers of mesh entities.
3002  *  \return MEDCouplingUMesh * - a pointer to MEDCouplingUMesh that the caller is to
3003  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
3004  *  \throw If there are no mesh entities of the relative dimension == -3 in \a this mesh.
3005  */
3006 MEDCouplingUMesh *MEDFileUMesh::getLevelM3Mesh(bool renum) const
3007 {
3008   return getMeshAtLevel(-3,renum);
3009 }
3010
3011 /*!
3012  * This method is for advanced users. There is two storing strategy of mesh in \a this.
3013  * Either MEDCouplingUMesh, or vector of MEDCoupling1GTUMesh instances.
3014  * When assignement is done the first one is done, which is not optimal in write mode for MED file.
3015  * This method allows to switch from MEDCouplingUMesh mode to MEDCoupling1GTUMesh mode.
3016  */
3017 void MEDFileUMesh::forceComputationOfParts() const
3018 {
3019   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3020     {
3021       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3022       if(elt)
3023         elt->forceComputationOfParts();
3024     }
3025 }
3026
3027 /*!
3028  * This method returns a vector of mesh parts containing each exactly one geometric type.
3029  * This method will never launch an automatic computation of split by type (an INTERP_KERNEL::Exception will be then thrown).
3030  * This method is only for memory aware users.
3031  * The returned pointers are **NOT** new object pointer. No need to mange them.
3032  */
3033 std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(int meshDimRelToMax) const
3034 {
3035   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3036   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes();
3037 }
3038
3039 /*!
3040  * This method returns the part of \a this having the geometric type \a gt.
3041  * If such part is not existing an exception will be thrown.
3042  * The returned pointer is **NOT** new object pointer. No need to mange it.
3043  */
3044 MEDCoupling1GTUMesh *MEDFileUMesh::getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3045 {
3046   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3047   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3048   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3049   return sp->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(gt);
3050 }
3051
3052 /*!
3053  * Given a relative level \a meshDimRelToMax it returns the sorted vector of geometric types present in \a this.
3054  * \throw if the reqsuested \a meshDimRelToMax does not exist.
3055  */
3056 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileUMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
3057 {
3058   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMax));
3059   return sp->getGeoTypes();
3060 }
3061
3062 /*!
3063  * This method extracts from whole family field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3064  * \param [in] gt - the geometric type for which the family field is asked.
3065  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3066  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3067  * \sa MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType
3068  */
3069 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3070 {
3071   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3072   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3073   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3074   return sp->extractFamilyFieldOnGeoType(gt);
3075 }
3076
3077 /*!
3078  * This method extracts from whole number field ids the part relative to the input parameter \a gt.
3079  * \param [in] gt - the geometric type for which the number field is asked.
3080  * \return DataArrayInt * - a pointer to DataArrayInt that the caller is to
3081  *          delete using decrRef() as it is no more needed.
3082  * \sa MEDFileUMesh::extractFamilyFieldOnGeoType
3083  */
3084 DataArrayInt *MEDFileUMesh::extractNumberFieldOnGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt) const
3085 {
3086   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(gt);
3087   int lev=(int)cm.getDimension()-getMeshDimension();
3088   const MEDFileUMeshSplitL1 *sp(getMeshAtLevSafe(lev));
3089   return sp->extractNumberFieldOnGeoType(gt);
3090 }
3091
3092 const MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt) const
3093 {
3094   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3095     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3096   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3097     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3098   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3099   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3100     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3101   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3102     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3103   return _ms[tracucedRk];
3104 }
3105
3106 MEDFileUMeshSplitL1 *MEDFileUMesh::getMeshAtLevSafe(int meshDimRelToMaxExt)
3107 {
3108    if(meshDimRelToMaxExt==1)
3109     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid : asking for node level (1) !");
3110   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3111     throw INTERP_KERNEL::Exception("Dimension request is invalid (>1) !");
3112   int tracucedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3113   if(tracucedRk>=(int)_ms.size())
3114     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3115   if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[tracucedRk]==0)
3116     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3117   return _ms[tracucedRk];
3118 }
3119
3120 void MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency(int meshDim, int meshDimRelToMax) const
3121 {
3122   if(-meshDimRelToMax>=(int)_ms.size())
3123     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : The meshdim of mesh is not managed by 'this' !");
3124   int i=0;
3125   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++,i++)
3126     {
3127       if(((const MEDFileUMeshSplitL1*) (*it))!=0)
3128         {
3129           int ref=(*it)->getMeshDimension();
3130           if(ref+i!=meshDim-meshDimRelToMax)
3131             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMeshDimCoherency : no coherency between levels !");
3132         }
3133     }
3134 }
3135
3136 /*!
3137  * Sets the node coordinates array of \a this mesh.
3138  *  \param [in] coords - the new node coordinates array.
3139  *  \throw If \a coords == \c NULL.
3140  */
3141 void MEDFileUMesh::setCoords(DataArrayDouble *coords)
3142 {
3143   if(!coords)
3144     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setCoords : null pointer in input !");
3145   coords->checkAllocated();
3146   int nbOfTuples=coords->getNumberOfTuples();
3147   _coords=coords;
3148   coords->incrRef();
3149   _fam_coords=DataArrayInt::New();
3150   _fam_coords->alloc(nbOfTuples,1);
3151   _fam_coords->fillWithZero();
3152   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3153     if((MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3154       (*it)->setCoords(coords);
3155 }
3156
3157 /*!
3158  * Removes all groups of a given dimension in \a this mesh.
3159  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
3160  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3161  */
3162 void MEDFileUMesh::eraseGroupsAtLevel(int meshDimRelToMaxExt)
3163 {
3164   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3165     {
3166       if((DataArrayInt *)_fam_coords)
3167         _fam_coords->fillWithZero();
3168       return ;
3169     }
3170   MEDFileUMeshSplitL1 *l1=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3171   l1->eraseFamilyField();
3172   optimizeFamilies();
3173 }
3174
3175 /*!
3176  * Removes all families with ids not present in the family fields of \a this mesh.
3177  */
3178 void MEDFileUMesh::optimizeFamilies()
3179 {
3180   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3181   std::set<int> allFamsIds;
3182   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
3183     {
3184       const DataArrayInt *ffield=getFamilyFieldAtLevel(*it);
3185       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=ffield->getDifferentValues();
3186       std::set<int> res;
3187       std::set_union(ids->begin(),ids->end(),allFamsIds.begin(),allFamsIds.end(),std::inserter(res,res.begin()));
3188       allFamsIds=res;
3189     }
3190   std::set<std::string> famNamesToKill;
3191   for(std::map<std::string,int>::const_iterator it=_families.begin();it!=_families.end();it++)
3192     {
3193       if(allFamsIds.find((*it).second)!=allFamsIds.end())
3194         famNamesToKill.insert((*it).first);
3195     }
3196   for(std::set<std::string>::const_iterator it=famNamesToKill.begin();it!=famNamesToKill.end();it++)
3197     _families.erase(*it);
3198   std::vector<std::string> grpNamesToKill;
3199   for(std::map<std::string, std::vector<std::string> >::iterator it=_groups.begin();it!=_groups.end();it++)
3200     {
3201       std::vector<std::string> tmp;
3202       for(std::vector<std::string>::const_iterator it2=(*it).second.begin();it2!=(*it).second.end();it2++)
3203         {
3204           if(famNamesToKill.find(*it2)==famNamesToKill.end())
3205             tmp.push_back(*it2);
3206         }
3207       if(!tmp.empty())
3208         (*it).second=tmp;
3209       else
3210         tmp.push_back((*it).first);
3211     }
3212   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=grpNamesToKill.begin();it!=grpNamesToKill.end();it++)
3213     _groups.erase(*it);
3214 }
3215
3216 void MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group(const std::string& grpNameM1, DataArrayInt *&nodesDuplicated, DataArrayInt *&cellsModified, DataArrayInt *&cellsNotModified)
3217 {
3218   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3219   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),0)==levs.end() || std::find(levs.begin(),levs.end(),-1)==levs.end())
3220     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : This method works only for mesh definied on level 0 and -1 !");
3221   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m0=getMeshAtLevel(0);
3222   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1=getMeshAtLevel(-1);
3223   int nbNodes=m0->getNumberOfNodes();
3224   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m11=getGroup(-1,grpNameM1);
3225   DataArrayInt *tmp00=0,*tmp11=0,*tmp22=0;
3226   m0->findNodesToDuplicate(*m11,tmp00,tmp11,tmp22);
3227   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nodeIdsToDuplicate(tmp00);
3228   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn0(tmp11);
3229   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsToModifyConn1(tmp22);
3230   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m0->buildPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),true));
3231   // node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group 'grpNameM1' on level -1
3232   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> descTmp0=DataArrayInt::New(),descITmp0=DataArrayInt::New(),revDescTmp0=DataArrayInt::New(),revDescITmp0=DataArrayInt::New();
3233   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> tmp0Desc=tmp0->buildDescendingConnectivity(descTmp0,descITmp0,revDescTmp0,revDescITmp0);
3234   descTmp0=0; descITmp0=0; revDescTmp0=0; revDescITmp0=0;
3235   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW2=tmp0Desc->getCellIdsLyingOnNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),false);
3236   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> cellsInM1ToRenumW3=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(tmp0Desc->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenumW2->begin(),cellsInM1ToRenumW2->end(),true));
3237   DataArrayInt *cellsInM1ToRenumW4Tmp=0;
3238   m1->areCellsIncludedIn(cellsInM1ToRenumW3,2,cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3239   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW4(cellsInM1ToRenumW4Tmp);
3240   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenumW5=cellsInM1ToRenumW4->getIdsInRange(0,m1->getNumberOfCells());
3241   cellsInM1ToRenumW5->transformWithIndArr(cellsInM1ToRenumW4->begin(),cellsInM1ToRenumW4->end());
3242   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> grpIds=getGroupArr(-1,grpNameM1);
3243   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellsInM1ToRenum=cellsInM1ToRenumW5->buildSubstraction(grpIds);
3244   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m1Part=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(m1->buildPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),true));
3245   m1Part->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes);
3246   m1->setPartOfMySelf(cellsInM1ToRenum->begin(),cellsInM1ToRenum->end(),*m1Part);
3247   // end of node renumbering of cells in m1 impacted by duplication of node but not in group of level -1 'grpNameM1'
3248   tmp0->duplicateNodes(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end());
3249   m0->setCoords(tmp0->getCoords());
3250   m0->setPartOfMySelf(cellsToModifyConn0->begin(),cellsToModifyConn0->end(),*tmp0);
3251   m1->setCoords(m0->getCoords());
3252   _coords=m0->getCoords(); _coords->incrRef();
3253   // duplication of cells in group 'grpNameM1' on level -1
3254   m11->duplicateNodesInConn(nodeIdsToDuplicate->begin(),nodeIdsToDuplicate->end(),nbNodes); m11->setCoords(m0->getCoords());
3255   std::vector<const MEDCouplingUMesh *> v(2); v[0]=m1; v[1]=m11;
3256   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> newm1=MEDCouplingUMesh::AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(v,tmp00,tmp11);
3257   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> szOfCellGrpOfSameType(tmp00);
3258   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idInMsOfCellGrpOfSameType(tmp11);
3259   //
3260   newm1->setName(getName());
3261   const DataArrayInt *fam=getFamilyFieldAtLevel(-1);
3262   if(!fam)
3263     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::duplicateNodesOnM1Group : internal problem !");
3264   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFam=DataArrayInt::New();
3265   newFam->alloc(newm1->getNumberOfCells(),1);
3266   int idd=getMaxFamilyId()+1;
3267   int globStart=0,start=0,end,globEnd;
3268   int nbOfChunks=szOfCellGrpOfSameType->getNumberOfTuples();
3269   for(int i=0;i<nbOfChunks;i++)
3270     {
3271       globEnd=globStart+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3272       if(idInMsOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0)==0)
3273         {
3274           end=start+szOfCellGrpOfSameType->getIJ(i,0);
3275           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> part=fam->selectByTupleId2(start,end,1);
3276           newFam->setPartOfValues1(part,globStart,globEnd,1,0,1,1,true);
3277           start=end;
3278         }
3279       else
3280         {
3281           newFam->setPartOfValuesSimple1(idd,globStart,globEnd,1,0,1,1);
3282         }
3283       globStart=globEnd;
3284     }
3285   newm1->setCoords(getCoords());
3286   setMeshAtLevel(-1,newm1);
3287   setFamilyFieldArr(-1,newFam);
3288   std::string grpName2(grpNameM1); grpName2+="_dup";
3289   addFamily(grpName2,idd);
3290   addFamilyOnGrp(grpName2,grpName2);
3291   //
3292   fam=_fam_coords;
3293   if(fam)
3294     {
3295       int newNbOfNodes=getCoords()->getNumberOfTuples();
3296       newFam=DataArrayInt::New(); newFam->alloc(newNbOfNodes,1);
3297       newFam->setPartOfValues1(fam,0,nbNodes,1,0,1,1,true);
3298       newFam->setPartOfValuesSimple1(0,nbNodes,newNbOfNodes,1,0,1,1);
3299       _fam_coords=newFam;
3300     }
3301   nodesDuplicated=nodeIdsToDuplicate.retn();
3302   cellsModified=cellsToModifyConn0.retn();
3303   cellsNotModified=cellsToModifyConn1.retn();
3304 }
3305
3306 /*!
3307  * \param [out] oldCode retrieves the distribution of types before the call if true is returned
3308  * \param [out] newCode etrieves the distribution of types after the call if true is returned
3309  * \param [out] o2nRenumCell tells for **all levels** the old 2 new renumbering of cells.
3310  * 
3311  * \return false if no modification has been performed linked to the unpolyzation. Neither cell type, not cell numbers. When false is returned no need of field on cells or on gauss renumbering.
3312  * Inversely, if true is returned, it means that distribution of cell by geometric type has changed and field on cell and field on gauss point must be renumbered.
3313  */
3314 bool MEDFileUMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
3315 {
3316   o2nRenumCell=0; oldCode.clear(); newCode.clear();
3317   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevels();
3318   bool ret=false;
3319   std::vector< const DataArrayInt* > renumCellsSplited;//same than memorySaverIfThrow
3320   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > memorySaverIfThrow;//same than renumCellsSplited only in case of throw
3321   int start=0;
3322   int end=0;
3323   for(std::vector<int>::reverse_iterator it=levs.rbegin();it!=levs.rend();it++)
3324     {
3325       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*it);
3326       std::vector<int> code1=m->getDistributionOfTypes();
3327       end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code1,start);
3328       oldCode.insert(oldCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3329       bool hasChanged=m->unPolyze();
3330       DataArrayInt *fake=0;
3331       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart=m->getLevArrPerCellTypes(MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER,
3332                                                                                            MEDCouplingUMesh::MEDMEM_ORDER+MEDCouplingUMesh::N_MEDMEM_ORDER,fake);
3333       fake->decrRef();
3334       renumCellsSplited.push_back(o2nCellsPart); memorySaverIfThrow.push_back(o2nCellsPart);
3335       if(hasChanged)
3336         {
3337           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nCellsPart2=o2nCellsPart->buildPermArrPerLevel();
3338           m->renumberCells(o2nCellsPart2->getConstPointer(),false);
3339           ret=true;
3340           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famField2,numField2;
3341           const DataArrayInt *famField=getFamilyFieldAtLevel(*it); if(famField) { famField->incrRef(); famField2=const_cast<DataArrayInt *>(famField); }
3342           const DataArrayInt *numField=getNumberFieldAtLevel(*it); if(numField) { numField->incrRef(); numField2=const_cast<DataArrayInt *>(numField); }
3343           setMeshAtLevel(*it,m);
3344           std::vector<int> code2=m->getDistributionOfTypes();
3345           end=PutInThirdComponentOfCodeOffset(code2,start);
3346           newCode.insert(newCode.end(),code2.begin(),code2.end());
3347           //
3348           if(o2nCellsPart2->isIdentity())
3349             continue;
3350           if(famField)
3351             {
3352               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamField=famField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3353               setFamilyFieldArr(*it,newFamField);
3354             }
3355           if(numField)
3356             {
3357               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumField=numField->renumber(o2nCellsPart2->getConstPointer());
3358               setRenumFieldArr(*it,newNumField);
3359             }
3360         }
3361       else
3362         {
3363           newCode.insert(newCode.end(),code1.begin(),code1.end());
3364         }
3365       start=end;
3366     }
3367   if(ret)
3368     {
3369       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> renumCells=DataArrayInt::Aggregate(renumCellsSplited);
3370       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2nRenumCellRet=renumCells->buildPermArrPerLevel();
3371       o2nRenumCell=o2nRenumCellRet.retn();
3372     }
3373   return ret;
3374 }
3375
3376 struct MEDLoaderAccVisit1
3377 {
3378   MEDLoaderAccVisit1():_new_nb_of_nodes(0) { }
3379   int operator()(bool val) { return val?_new_nb_of_nodes++:-1; }
3380   int _new_nb_of_nodes;
3381 };
3382
3383 /*!
3384  * Array returned is the correspondance in \b old \b to \b new format. The returned array is newly created and should be dealt by the caller.
3385  * The maximum value stored in returned array is the number of nodes of \a this minus 1 after call of this method.
3386  * The size of returned array is the number of nodes of the old (previous to the call of this method) number of nodes.
3387  * -1 values in returned array means that the corresponding old node is no more used.
3388  *
3389  * \return newly allocated array containing correspondance in \b old \b to \b new format. If all nodes in \a this are fetched \c NULL pointer is returned and nothing
3390  *         is modified in \a this.
3391  * \throw If no coordinates are set in \a this or if there is in any available mesh in \a this a cell having a nodal connectivity containing a node id not in the range of
3392  *  set coordinates.
3393  */
3394 DataArrayInt *MEDFileUMesh::zipCoords()
3395 {
3396   const DataArrayDouble *coo=getCoords();
3397   if(!coo)
3398     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::zipCoords : no coordinates set in this !");
3399   int nbOfNodes=coo->getNumberOfTuples();
3400   std::vector<bool> nodeIdsInUse(nbOfNodes,false);
3401   std::vector<int> neLevs=getNonEmptyLevels();
3402   for(std::vector<int>::const_iterator lev=neLevs.begin();lev!=neLevs.end();lev++)
3403     {
3404       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=getMeshAtLevel(*lev);
3405       m->computeNodeIdsAlg(nodeIdsInUse);
3406     }
3407   int nbrOfNodesInUse=(int)std::count(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),true);
3408   if(nbrOfNodesInUse==nbOfNodes)
3409     return 0;
3410   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New(); ret->alloc(nbOfNodes,1);
3411   std::transform(nodeIdsInUse.begin(),nodeIdsInUse.end(),ret->getPointer(),MEDLoaderAccVisit1());
3412   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2=ret->invertArrayO2N2N2OBis(nbrOfNodesInUse);
3413   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> newCoords=coo->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3414   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newFamCoords;
3415   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar> newNameCoords;
3416   if((const DataArrayInt *)_fam_coords)
3417     newFamCoords=_fam_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3418   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> newNumCoords;
3419   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3420     newNumCoords=_num_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end());
3421   if((const DataArrayAsciiChar *)_name_coords)
3422     newNameCoords=static_cast<DataArrayAsciiChar *>(_name_coords->selectByTupleIdSafe(ret2->begin(),ret2->end()));
3423   _coords=newCoords; _fam_coords=newFamCoords; _num_coords=newNumCoords; _name_coords=newNameCoords; _rev_num_coords=0;
3424   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3425     {
3426       if((MEDFileUMeshSplitL1*)*it)
3427         (*it)->renumberNodesInConn(ret->begin());
3428     }
3429   return ret.retn();
3430 }
3431
3432 /*!
3433  * Adds a group of nodes to \a this mesh.
3434  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3435  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3436  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3437  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3438  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3439  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3440  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3441  */
3442 void MEDFileUMesh::addNodeGroup(const DataArrayInt *ids)
3443 {
3444   const DataArrayDouble *coords=_coords;
3445   if(!coords)
3446     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addNodeGroup : no coords set !");
3447   int nbOfNodes=coords->getNumberOfTuples();
3448   if(!((DataArrayInt *)_fam_coords))
3449     { _fam_coords=DataArrayInt::New(); _fam_coords->alloc(nbOfNodes,1); _fam_coords->fillWithZero(); }
3450   //
3451   addGroupUnderground(true,ids,_fam_coords);
3452 }
3453
3454 /*!
3455  * Adds a group of nodes/cells/faces/edges to \a this mesh.
3456  *  \param [in] ids - a DataArrayInt providing ids and a name of the group to add.
3457  *          The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3458  *  \throw If the node coordinates array is not set.
3459  *  \throw If \a ids == \c NULL.
3460  *  \throw If \a ids->getName() == "".
3461  *  \throw If \a ids does not respect the MED file norm.
3462  *  \throw If a group with name \a ids->getName() already exists.
3463  */
3464 void MEDFileUMesh::addGroup(int meshDimRelToMaxExt, const DataArrayInt *ids)
3465 {
3466   std::vector<int> levs=getNonEmptyLevelsExt();
3467   if(std::find(levs.begin(),levs.end(),meshDimRelToMaxExt)==levs.end())
3468     { 
3469       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : level " << meshDimRelToMaxExt << " not available ! Should be in ";
3470       std::copy(levs.begin(),levs.end(),std::ostream_iterator<int>(oss," ")); oss << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3471     }
3472   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3473     { addNodeGroup(ids); return ; }
3474   MEDFileUMeshSplitL1 *lev=getMeshAtLevSafe(meshDimRelToMaxExt);
3475   DataArrayInt *fam=lev->getOrCreateAndGetFamilyField();
3476   addGroupUnderground(false,ids,fam);
3477 }
3478
3479 /*!
3480  * \param [in] ids ids and group name of the new group to add. The ids should be sorted and different each other (MED file norm).
3481  * \parma [in,out] famArr family array on level of interest to be renumbered. The input pointer should be not \c NULL (no check of that will be performed)
3482  */
3483 void MEDFileUMesh::addGroupUnderground(bool isNodeGroup, const DataArrayInt *ids, DataArrayInt *famArr)
3484 {
3485   if(!ids)
3486     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : NULL pointer in input !");
3487   std::string grpName(ids->getName());
3488   if(grpName.empty())
3489     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::addGroup : empty group name ! MED file format do not accept empty group name !");
3490   ids->checkStrictlyMonotonic(true);
3491   famArr->incrRef(); MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famArrTmp(famArr);
3492   std::vector<std::string> grpsNames=getGroupsNames();
3493   if(std::find(grpsNames.begin(),grpsNames.end(),grpName)!=grpsNames.end())
3494     {
3495       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::addGroup : Group with name \"" << grpName << "\" already exists ! Destroy it before calling this method !";
3496       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3497     }
3498   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > allFamIds=getAllNonNullFamilyIds();
3499   allFamIds.erase(std::find(allFamIds.begin(),allFamIds.end(),famArrTmp));
3500   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> famIds=famArr->selectByTupleIdSafe(ids->begin(),ids->end());
3501   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diffFamIds=famIds->getDifferentValues();
3502   std::vector<int> familyIds;
3503   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > idsPerfamiliyIds;
3504   int maxVal=getTheMaxAbsFamilyId()+1;
3505   std::map<std::string,int> families(_families);
3506   std::map<std::string, std::vector<std::string> > groups(_groups);
3507   std::vector<std::string> fams;
3508   bool created(false);
3509   for(const int *famId=diffFamIds->begin();famId!=diffFamIds->end();famId++)
3510     {
3511       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2Tmp=famIds->getIdsEqual(*famId);
3512       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->selectByTupleId(ids2Tmp->begin(),ids2Tmp->end());
3513       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids1=famArr->getIdsEqual(*famId);
3514       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret0(ids1->buildSubstractionOptimized(ids2));
3515       if(ret0->empty())
3516         {
3517           bool isFamPresent=false;
3518           for(std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> >::const_iterator itl=allFamIds.begin();itl!=allFamIds.end() && !isFamPresent;itl++)
3519             isFamPresent=(*itl)->presenceOfValue(*famId);
3520           if(!isFamPresent)
3521             { familyIds.push_back(*famId); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); fams.push_back(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,*famId,created)); } // adding *famId in grp
3522           else
3523             {
3524               familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);
3525               std::string locFamName=FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created);
3526               fams.push_back(locFamName);
3527               if(existsFamily(*famId))
3528                 {
3529                   std::string locFamName2=getFamilyNameGivenId(*famId); std::vector<std::string> v(2); v[0]=locFamName2; v[1]=locFamName;
3530                   ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3531                 }
3532               maxVal++;
3533             } // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and lie the grp on maxVal
3534         }
3535       else
3536         {
3537           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal:-maxVal); idsPerfamiliyIds.push_back(ret0); // modifying all other groups on *famId to lie on maxVal and on maxVal+1
3538           familyIds.push_back(isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1); idsPerfamiliyIds.push_back(ids2);//grp lie only on maxVal+1
3539           std::string n2(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal+1:-maxVal-1,created)); fams.push_back(n2);
3540           if(existsFamily(*famId))
3541             {
3542               std::string n1(FindOrCreateAndGiveFamilyWithId(families,isNodeGroup?maxVal:-maxVal,created)); std::vector<std::string> v(2); v[0]=n1; v[1]=n2;
3543               ChangeAllGroupsContainingFamily(groups,getFamilyNameGivenId(*famId),v);
3544             }
3545           maxVal+=2;
3546         }
3547     }
3548   for(std::size_t i=0;i<familyIds.size();i++)
3549     {
3550       DataArrayInt *da=idsPerfamiliyIds[i];
3551       famArr->setPartOfValuesSimple3(familyIds[i],da->begin(),da->end(),0,1,1);
3552     }
3553   _families=families;
3554   _groups=groups;
3555   _groups[grpName]=fams;
3556 }
3557
3558 /*!
3559  * Changes a name of a family specified by its id.
3560  *  \param [in] id - the id of the family of interest.
3561  *  \param [in] newFamName - the new family name.
3562  *  \throw If no family with the given \a id exists.
3563  */
3564 void MEDFileUMesh::setFamilyNameAttachedOnId(int id, const std::string& newFamName)
3565 {
3566   std::string oldName=getFamilyNameGivenId(id);
3567   _families.erase(oldName);
3568   _families[newFamName]=id;
3569 }
3570
3571 /*!
3572  * Removes a mesh of a given dimension.
3573  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension of interest.
3574  *  \throw If there is no mesh at level \a meshDimRelToMax in \a this mesh.
3575  */
3576 void MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel(int meshDimRelToMax)
3577 {
3578   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3579   std::vector<int>::const_iterator it=std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax);
3580   if(it==levSet.end())
3581     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::removeMeshAtLevel : the requested level is not existing !");
3582   int pos=(-meshDimRelToMax);
3583   _ms[pos]=0;
3584 }
3585
3586 /*!
3587  * Sets a new MEDCoupling1GTUMesh at a given level in \a this mesh.
3588  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3589  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3590  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3591  *         different. 
3592  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3593  *         another node coordinates array.
3594  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3595  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3596  */
3597 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCoupling1GTUMesh *m)
3598 {
3599   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m));
3600   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3601 }
3602
3603 /*!
3604  * Sets a new MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh.
3605  *  \param [in] meshDimRelToMax - a relative level to set the mesh at.
3606  *  \param [in] m - the new mesh to set.
3607  *  \param [in] newOrOld - if \c true, cells in \a m are sorted by type to be ready for 
3608  *         writing \a this mesh in a MED file.
3609  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
3610  *         different. 
3611  *  \throw If the node coordinates array is set \a this in mesh and \a m refers to
3612  *         another node coordinates array.
3613  *  \throw If the mesh dimension of \a m does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3614  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3615  */
3616 void MEDFileUMesh::setMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, MEDCouplingUMesh *m, bool newOrOld)
3617 {
3618   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> elt(new MEDFileUMeshSplitL1(m,newOrOld));
3619   checkAndGiveEntryInSplitL1(meshDimRelToMax,m)=elt;
3620 }
3621
3622 MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1>& MEDFileUMesh::checkAndGiveEntryInSplitL1(int meshDimRelToMax, MEDCouplingPointSet *m)
3623 {
3624   dealWithTinyInfo(m);
3625   std::vector<int> levSet=getNonEmptyLevels();
3626   if(std::find(levSet.begin(),levSet.end(),meshDimRelToMax)==levSet.end())
3627     {
3628       if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3629         {
3630           DataArrayDouble *c=m->getCoords();
3631           if(c)
3632             c->incrRef();
3633           _coords=c;
3634         }
3635       if(m->getCoords()!=_coords)
3636         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshAtLevel : Invalid Given Mesh ! The coordinates are not the same ! try to use tryToShareSameCoords !");
3637       int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3638       if(sz>=(int)_ms.size())
3639         _ms.resize(sz);
3640       checkMeshDimCoherency(m->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3641       return _ms[sz-1];
3642     }
3643   else
3644     return _ms[-meshDimRelToMax];
3645 }
3646
3647 /*!
3648  * This method allows to set at once the content of different levels in \a this.
3649  * This method is equivalent to a series of call to MEDFileUMesh::setMeshAtLevel.
3650  *
3651  * \param [in] ms - List of unstructured meshes lying on the same coordinates and having different mesh dimesnion.
3652  * \param [in] renum - the parameter (set to false by default) that tells the beheviour if there is a mesh on \a ms that is not geo type sorted.
3653  *                     If false, an exception ois thrown. If true the mesh is reordered automatically. It is highly recommanded to let this parameter to false.
3654  *
3655  * \throw If \a there is a null pointer in \a ms.
3656  * \sa MEDFileUMesh::setMeshAtLevel
3657  */
3658 void MEDFileUMesh::setMeshes(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3659 {
3660   if(ms.empty())
3661     return ;
3662   const MEDCouplingUMesh *mRef=ms[0];
3663   if(!mRef)
3664     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in the first element of input meshes !");
3665   std::string name(mRef->getName());
3666   const DataArrayDouble *coo(mRef->getCoords());
3667   std::set<int> s;
3668   int zeDim=-1;
3669   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3670     {
3671       const MEDCouplingUMesh *cur(*it);
3672       if(!cur)
3673         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : null instance in input vector of meshes !");
3674       if(coo!=cur->getCoords())
3675         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes do not share the same coordinates !");
3676       int mdim=cur->getMeshDimension();
3677       zeDim=std::max(zeDim,mdim);
3678       if(s.find(mdim)!=s.end())
3679         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setMeshes : The input meshes must share the same coordinates pointer, and should have different mesh dimension each other !");
3680     }
3681   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++)
3682     {
3683       int mdim=(*it)->getMeshDimension();
3684       setName((*it)->getName());
3685       setMeshAtLevel(mdim-zeDim,const_cast<MEDCouplingUMesh *>(*it),renum);
3686     }
3687   setName(name);
3688 }
3689
3690 /*!
3691  * Creates one MEDCouplingUMesh at a given level in \a this mesh from a sequence of
3692  * meshes each representing a group, and creates corresponding groups in \a this mesh.
3693  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3694  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the mesh and groups at.
3695  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3696  *          create in \a this mesh.
3697  *  \throw If \a ms is empty.
3698  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3699  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3700  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3701  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3702  *         of the given meshes.
3703  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3704  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3705  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3706  */
3707 void MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3708 {
3709   if(ms.empty())
3710     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : expecting a non empty vector !");
3711   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3712   if(sz>=(int)_ms.size())
3713     _ms.resize(sz);
3714   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3715   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3716   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3717     {
3718       coo->incrRef();
3719       _coords=coo;
3720     }
3721   else
3722     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3723       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsFromScratch : coordinates mismatches !");
3724   std::vector<DataArrayInt *> corr;
3725   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=MEDCouplingUMesh::FuseUMeshesOnSameCoords(ms,_zipconn_pol,corr);
3726   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr3(corr.begin(),corr.end());
3727   setMeshAtLevel(meshDimRelToMax,m,renum);
3728   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3729   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,true);
3730 }
3731
3732 /*!
3733  * Creates groups at a given level in \a this mesh from a sequence of
3734  * meshes each representing a group.
3735  * The given meshes must share the same node coordinates array.
3736  *  \param [in] meshDimRelToMax - the relative dimension to create the groups at.
3737  *  \param [in] ms - the sequence of meshes. Each mesh in \a ms represents a group to
3738  *         create in \a this mesh.
3739  *  \param [in] renum - if \c true, then the optional numbers of entities are taken into
3740  *         account. 
3741  *  \throw If \a ms is empty.
3742  *  \throw If dimension of meshes in \a ms does not correspond to \a meshDimRelToMax or
3743  *         to the existing meshes of other levels of \a this mesh.
3744  *  \throw If the meshes in \a ms do not share the same node coordinates array.
3745  *  \throw If the node coordinates array of \a this mesh (if any) is not the same as that
3746  *         of the given meshes.
3747  *  \throw If \a ms[ i ] is not well defined (MEDCouplingUMesh::checkCoherency()).
3748  *  \throw If names of some meshes in \a ms are equal.
3749  *  \throw If \a ms includes a mesh with an empty name.
3750  */
3751 void MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh(int meshDimRelToMax, const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms, bool renum)
3752 {
3753   if(ms.empty())
3754     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : expecting a non empty vector !");
3755   int sz=(-meshDimRelToMax)+1;
3756   if(sz>=(int)_ms.size())
3757     _ms.resize(sz);
3758   checkMeshDimCoherency(ms[0]->getMeshDimension(),meshDimRelToMax);
3759   DataArrayDouble *coo=checkMultiMesh(ms);
3760   if((DataArrayDouble *)_coords==0)
3761     {
3762       coo->incrRef();
3763       _coords=coo;
3764     }
3765   else
3766     if((DataArrayDouble *)_coords!=coo)
3767       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : coordinates mismatches !");
3768   MEDCouplingUMesh *m=getMeshAtLevel(meshDimRelToMax,renum);
3769   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > corr(ms.size());
3770   int i=0;
3771   for(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
3772     {
3773       DataArrayInt *arr=0;
3774       bool test=m->areCellsIncludedIn(*it,_zipconn_pol,arr);
3775       corr[i]=arr;
3776       if(!test)
3777         {
3778           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::setGroupsOnSetMesh : mesh #" << i << " is not part of whole mesh !";
3779           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3780         }
3781     }
3782   std::vector<const DataArrayInt *> corr2(corr.begin(),corr.end());
3783   setGroupsAtLevel(meshDimRelToMax,corr2,renum);
3784 }
3785
3786 DataArrayDouble *MEDFileUMesh::checkMultiMesh(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms) const
3787 {
3788   const DataArrayDouble *ret=ms[0]->getCoords();
3789   int mdim=ms[0]->getMeshDimension();
3790   for(unsigned int i=1;i<ms.size();i++)
3791     {
3792       ms[i]->checkCoherency();
3793       if(ms[i]->getCoords()!=ret)
3794         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes must share the same coords !");
3795       if(ms[i]->getMeshDimension()!=mdim)
3796         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::checkMultiMesh : meshes have not same mesh dimension !");
3797     }
3798   return const_cast<DataArrayDouble *>(ret);
3799 }
3800
3801 /*!
3802  * Sets the family field of a given relative dimension.
3803  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
3804  *          the family field is set.
3805  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
3806  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3807  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
3808  */
3809 void MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
3810 {
3811   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3812     {
3813       if(!famArr)
3814         {
3815           _fam_coords=0;
3816           return ;
3817         }
3818       DataArrayDouble *coo(_coords);
3819       if(!coo)
3820         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : the coordinates have not been set !");
3821       famArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of node family arr ! ");
3822       famArr->incrRef();
3823       _fam_coords=famArr;
3824       return ;
3825     }
3826   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3827     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setFamilyFieldArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3828   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3829   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3830     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3831   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3832     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3833   return _ms[traducedRk]->setFamilyArr(famArr);
3834 }
3835
3836 /*!
3837  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
3838  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3839  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
3840  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3841  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
3842  */
3843 void MEDFileUMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
3844 {
3845   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3846     {
3847       if(!renumArr)
3848         {
3849           _num_coords=0;
3850           _rev_num_coords=0;
3851           return ;
3852         }
3853       DataArrayDouble *coo(_coords);
3854       if(!coo)
3855         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumFieldArr : the coordinates have not been set !");
3856       renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),1,"MEDFileUMesh::setRenumArr : Problem in size of node numbering arr ! ");
3857       renumArr->incrRef();
3858       _num_coords=renumArr;
3859       computeRevNum();
3860       return ;
3861     }
3862   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3863     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setRenumArr : Dimension request is invalid (>1) !");
3864   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3865   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3866     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3867   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3868     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3869   return _ms[traducedRk]->setRenumArr(renumArr);
3870 }
3871
3872 /*!
3873  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
3874  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
3875  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
3876  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
3877  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
3878  */
3879 void MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
3880 {
3881   if(meshDimRelToMaxExt==1)
3882     {
3883       if(!nameArr)
3884         {
3885           _name_coords=0;
3886           return ;
3887         }
3888       DataArrayDouble *coo(_coords);
3889       if(!coo)
3890         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : the coordinates have not been set !");
3891       nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(coo->getNumberOfTuples(),MED_SNAME_SIZE,"MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of node numbering arr ! ");
3892       nameArr->incrRef();
3893       _name_coords=nameArr;
3894       return ;
3895     }
3896   if(meshDimRelToMaxExt>1)
3897     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileUMesh::setNameFieldAtLevel : Dimension request is invalid (>1) !");
3898   int traducedRk=-meshDimRelToMaxExt;
3899   if(traducedRk>=(int)_ms.size())
3900     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid mesh dim relative to max given ! To low !");
3901   if((MEDFileUMeshSplitL1 *)_ms[traducedRk]==0)
3902     throw INTERP_KERNEL::Exception("On specified lev (or entity) no cells exists !");
3903   return _ms[traducedRk]->setNameArr(nameArr);
3904 }
3905
3906 void MEDFileUMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
3907 {
3908   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3909     if((const MEDFileUMeshSplitL1 *)(*it))
3910       (*it)->synchronizeTinyInfo(*this);
3911 }
3912
3913 /*!
3914  * This method is called by MEDFileMesh::changeFamilyId. It performs only one part of the family id modification.
3915  */
3916 void MEDFileUMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
3917 {
3918   DataArrayInt *arr=_fam_coords;
3919   if(arr)
3920     arr->changeValue(oldId,newId);
3921   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3922     {
3923       MEDFileUMeshSplitL1 *sp=(*it);
3924       if(sp)
3925         {
3926           sp->changeFamilyIdArr(oldId,newId);
3927         }
3928     }
3929 }
3930
3931 std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > MEDFileUMesh::getAllNonNullFamilyIds() const
3932 {
3933   std::list< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ret;
3934   const DataArrayInt *da(_fam_coords);
3935   if(da)
3936     { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
3937   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileUMeshSplitL1> >::const_iterator it=_ms.begin();it!=_ms.end();it++)
3938     {
3939       const MEDFileUMeshSplitL1 *elt(*it);
3940       if(elt)
3941         {
3942           da=elt->getFamilyField();
3943           if(da)
3944             { da->incrRef(); ret.push_back(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>(const_cast<DataArrayInt *>(da))); }
3945         }
3946     }
3947   return ret;
3948 }
3949
3950 void MEDFileUMesh::computeRevNum() const
3951 {
3952   if((const DataArrayInt *)_num_coords)
3953     {
3954       int pos;
3955       int maxValue=_num_coords->getMaxValue(pos);
3956       _rev_num_coords=_num_coords->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
3957     }
3958 }
3959
3960 std::size_t MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
3961 {
3962   return MEDFileMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
3963 }
3964
3965 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileStructuredMesh::getDirectChildren() const
3966 {
3967   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileMesh::getDirectChildren());
3968   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3969     ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_nodes);
3970   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
3971     ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_nodes);
3972   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
3973     ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes);
3974   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
3975     ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_cells);
3976   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
3977     ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_cells);
3978   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
3979     ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells);
3980   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
3981     ret.push_back((const DataArrayInt *)_fam_faces);
3982   if((const DataArrayInt *)_num_faces)
3983     ret.push_back((const DataArrayInt *)_num_faces);
3984   if((const DataArrayInt *)_rev_num_nodes)
3985     if((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces)
3986     ret.push_back((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces);
3987     ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_nodes);
3988   if((const DataArrayInt *)_rev_num_cells)
3989     ret.push_back((const DataArrayInt *)_rev_num_cells);
3990   return ret;
3991 }
3992
3993 int MEDFileStructuredMesh::getMaxAbsFamilyIdInArrays() const
3994 {
3995   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
3996   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
3997     {
3998       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
3999       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4000     }
4001   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4002     {
4003       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4004       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4005     }
4006   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4007     {
4008       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4009       ret=std::max(ret,std::abs(val));
4010     }
4011   return ret;
4012 }
4013
4014 int MEDFileStructuredMesh::getMaxFamilyIdInArrays() const
4015 {
4016   int ret=-std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4017   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4018     {
4019       int val=_fam_nodes->getMaxValue(tmp);
4020       ret=std::max(ret,val);
4021     }
4022   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4023     {
4024       int val=_fam_cells->getMaxValue(tmp);
4025       ret=std::max(ret,val);
4026     }
4027   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4028     {
4029       int val=_fam_faces->getMaxValue(tmp);
4030       ret=std::max(ret,val);
4031     }
4032   return ret;
4033 }
4034
4035 int MEDFileStructuredMesh::getMinFamilyIdInArrays() const
4036 {
4037   int ret=std::numeric_limits<int>::max(),tmp=-1;
4038   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4039     {
4040       int val=_fam_nodes->getMinValue(tmp);
4041       ret=std::min(ret,val);
4042     }
4043   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4044     {
4045       int val=_fam_cells->getMinValue(tmp);
4046       ret=std::min(ret,val);
4047     }
4048   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4049     {
4050       int val=_fam_faces->getMinValue(tmp);
4051       ret=std::min(ret,val);
4052     }
4053   return ret;
4054 }
4055
4056 bool MEDFileStructuredMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
4057 {
4058   if(!MEDFileMesh::isEqual(other,eps,what))
4059     return false;
4060   const MEDFileStructuredMesh *otherC=dynamic_cast<const  MEDFileStructuredMesh *>(other);
4061   if(!otherC)
4062     {
4063       what="Mesh types differ ! This is structured and other is NOT !";
4064       return false;
4065     }
4066   const DataArrayInt *famc1=_fam_nodes;
4067   const DataArrayInt *famc2=otherC->_fam_nodes;
4068   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4069     {
4070       what="Mismatch of families arr on nodes ! One is defined and not other !";
4071       return false;
4072     }
4073   if(famc1)
4074     {
4075       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4076       if(!ret)
4077         {
4078           what="Families arr on nodes differ !";
4079           return false;
4080         }
4081     }
4082   famc1=_fam_cells;
4083   famc2=otherC->_fam_cells;
4084   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4085     {
4086       what="Mismatch of families arr on cells ! One is defined and not other !";
4087       return false;
4088     }
4089   if(famc1)
4090     {
4091       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4092       if(!ret)
4093         {
4094           what="Families arr on cells differ !";
4095           return false;
4096         }
4097     }
4098   famc1=_fam_faces;
4099   famc2=otherC->_fam_faces;
4100   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4101     {
4102       what="Mismatch of families arr on faces ! One is defined and not other !";
4103       return false;
4104     }
4105   if(famc1)
4106     {
4107       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4108       if(!ret)
4109         {
4110           what="Families arr on faces differ !";
4111           return false;
4112         }
4113     }
4114   famc1=_num_nodes;
4115   famc2=otherC->_num_nodes;
4116   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4117     {
4118       what="Mismatch of numbering arr on nodes ! One is defined and not other !";
4119       return false;
4120     }
4121   if(famc1)
4122     {
4123       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4124       if(!ret)
4125         {
4126           what="Numbering arr on nodes differ !";
4127           return false;
4128         }
4129     }
4130   famc1=_num_cells;
4131   famc2=otherC->_num_cells;
4132   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4133     {
4134       what="Mismatch of numbering arr on cells ! One is defined and not other !";
4135       return false;
4136     }
4137   if(famc1)
4138     {
4139       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4140       if(!ret)
4141         {
4142           what="Numbering arr on cells differ !";
4143           return false;
4144         }
4145     }
4146   famc1=_num_faces;
4147   famc2=otherC->_num_faces;
4148   if((famc1==0 && famc2!=0) || (famc1!=0 && famc2==0))
4149     {
4150       what="Mismatch of numbering arr on faces ! One is defined and not other !";
4151       return false;
4152     }
4153   if(famc1)
4154     {
4155       bool ret=famc1->isEqual(*famc2);
4156       if(!ret)
4157         {
4158           what="Numbering arr on faces differ !";
4159           return false;
4160         }
4161     }
4162   const DataArrayAsciiChar *d1=_names_cells;
4163   const DataArrayAsciiChar *d2=otherC->_names_cells;
4164   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4165     {
4166       what="Mismatch of naming arr on cells ! One is defined and not other !";
4167       return false;
4168     }
4169   if(d1)
4170     {
4171       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4172       if(!ret)
4173         {
4174           what="Naming arr on cells differ !";
4175           return false;
4176         }
4177     }
4178   d1=_names_faces;
4179   d2=otherC->_names_faces;
4180   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4181     {
4182       what="Mismatch of naming arr on faces ! One is defined and not other !";
4183       return false;
4184     }
4185   if(d1)
4186     {
4187       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4188       if(!ret)
4189         {
4190           what="Naming arr on faces differ !";
4191           return false;
4192         }
4193     }
4194   d1=_names_nodes;
4195   d2=otherC->_names_nodes;
4196   if((d1==0 && d2!=0) || (d1!=0 && d2==0))
4197     {
4198       what="Mismatch of naming arr on nodes ! One is defined and not other !";
4199       return false;
4200     }
4201   if(d1)
4202     {
4203       bool ret=d1->isEqual(*d2);
4204       if(!ret)
4205         {
4206           what="Naming arr on nodes differ !";
4207           return false;
4208         }
4209     }
4210   return true;
4211 }
4212
4213 void MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes() const
4214 {
4215   MEDFileMesh::clearNonDiscrAttributes();
4216   const DataArrayInt *tmp=_fam_nodes;
4217   if(tmp)
4218     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4219   tmp=_num_nodes;
4220   if(tmp)
4221     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4222   tmp=_fam_cells;
4223   if(tmp)
4224     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4225   tmp=_num_cells;
4226   if(tmp)
4227     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4228   tmp=_fam_faces;
4229   if(tmp)
4230     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4231   tmp=_num_faces;
4232   if(tmp)
4233     (const_cast<DataArrayInt *>(tmp))->setName("");
4234 }
4235
4236 /*!
4237  * Returns ids of mesh entities contained in given families of a given dimension.
4238  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - a relative dimension of the mesh entities whose ids
4239  *          are required.
4240  *  \param [in] fams - the names of the families of interest.
4241  *  \param [in] renum - if \c true, the optional numbers of entities, if available, are
4242  *          returned instead of ids.
4243  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt holding either ids or
4244  *          numbers, if available and required, of mesh entities of the families. The caller
4245  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
4246  *  \throw If the family field is missing for \a meshDimRelToMaxExt.
4247  */
4248 DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr(int meshDimRelToMaxExt, const std::vector<std::string>& fams, bool renum) const
4249 {
4250   std::vector<int> famIds(getFamiliesIds(fams));
4251   switch(meshDimRelToMaxExt)
4252     {
4253     case 1:
4254       {
4255         if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4256           {
4257             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4258             if(!famIds.empty())
4259               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4260             else
4261               da=_fam_nodes->getIdsEqualList(0,0);
4262             if(renum)
4263               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_nodes,da);
4264             else
4265               return da.retn();
4266           }
4267         else
4268           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on nodes !");
4269         break;
4270       }
4271     case 0:
4272       {
4273         if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4274           {
4275             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4276             if(!famIds.empty())
4277               da=_fam_cells->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4278             else
4279               da=_fam_cells->getIdsEqualList(0,0);
4280             if(renum)
4281               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_cells,da);
4282             else
4283               return da.retn();
4284           }
4285         else
4286           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on cells !");
4287         break;
4288       }
4289     case -1:
4290       {
4291         if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4292           {
4293             MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da;
4294             if(!famIds.empty())
4295               da=_fam_faces->getIdsEqualList(&famIds[0],&famIds[0]+famIds.size());
4296             else
4297               da=_fam_faces->getIdsEqualList(0,0);
4298             if(renum)
4299               return MEDFileUMeshSplitL1::Renumber(_num_faces,da);
4300             else
4301               return da.retn();
4302           }
4303         else
4304           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : no family array specified on faces !");
4305         break;
4306       }
4307     default:
4308       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamiliesArr : input meshDimRelative must be in [0,1,-1] !");
4309     }
4310 }
4311
4312 /*!
4313  * Sets the family field of a given relative dimension.
4314  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of entities for which
4315  *          the family field is set.
4316  *  \param [in] famArr - the array of the family field.
4317  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4318  *  \throw If \a famArr has an invalid size.
4319  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1 and \a meshDimRelToMaxExt != -1.
4320  */
4321 void MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *famArr)
4322 {
4323   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4324   if(!mesh)
4325     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set family array !");
4326   switch(meshDimRelToMaxExt)
4327     {
4328     case 0:
4329       {
4330         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4331         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4332         _fam_cells=famArr;
4333         break;
4334       }
4335     case 1:
4336       {
4337         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4338         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4339         _fam_nodes=famArr;
4340         break;
4341       }
4342     case -1:
4343       {
4344         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4345         famArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4346         _fam_faces=famArr;
4347         break;
4348       }
4349     default:
4350       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setFamilyFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4351     }
4352   if(famArr)
4353     famArr->incrRef();
4354 }
4355
4356 /*!
4357  * Sets the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4358  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4359  *  \param [in] renumArr - the array of the numbers.
4360  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4361  *  \throw If \a renumArr has an invalid size.
4362  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4363  */
4364 void MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayInt *renumArr)
4365 {
4366   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh=getStructuredMesh();
4367   if(!mesh)
4368     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : no structured mesh specified ! Impossible to set number array !");
4369   switch(meshDimRelToMaxExt)
4370     {
4371     case 0:
4372       {
4373         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4374         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4375         _num_cells=renumArr;
4376         break;
4377       }
4378     case 1:
4379       {
4380         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4381         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Family arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4382         _num_nodes=renumArr;
4383         break;
4384       }
4385     case -1:
4386       {
4387         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4388         renumArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,1,"MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Problem in size of Renum arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4389         _num_faces=renumArr;
4390         break;
4391       }
4392     default:
4393       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setRenumFieldArr : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4394     }
4395   if(renumArr)
4396     renumArr->incrRef();
4397 }
4398
4399 /*!
4400  * Sets the optional names of mesh entities of a given dimension.
4401  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4402  *  \param [in] nameArr - the array of the names.
4403  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4404  *  \throw If \a nameArr has an invalid size.
4405  */
4406 void MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt, DataArrayAsciiChar *nameArr)
4407 {
4408   const MEDCouplingStructuredMesh *mesh(getStructuredMesh());
4409   if(!mesh)
4410     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : no structured mesh specified ! Impossible to set names array !");
4411   switch(meshDimRelToMaxExt)
4412     {
4413     case 0:
4414       {
4415         int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
4416         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of cells of mesh !");
4417         _names_cells=nameArr;
4418         break;
4419       }
4420     case 1:
4421       {
4422         int nbNodes=mesh->getNumberOfNodes();
4423         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbNodes,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of nodes of mesh !");
4424         _names_nodes=nameArr;
4425         break;
4426       }
4427     case -1:
4428       {
4429         int nbCells=mesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4430         nameArr->checkNbOfTuplesAndComp(nbCells,MED_SNAME_SIZE,"MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Problem in size of names arr ! Mismatch with number of faces of mesh !");
4431         _names_cells=nameArr;
4432       }
4433     default:
4434       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::setNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4435     }
4436   if(nameArr)
4437     nameArr->incrRef();
4438 }
4439
4440 /*!
4441  * Returns the family field for mesh entities of a given dimension.
4442  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4443  *  \return const DataArrayInt * - the family field. It is an array of ids of families
4444  *          each mesh entity belongs to. It can be \c NULL.
4445  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4446  */
4447 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4448 {
4449   switch(meshDimRelToMaxExt)
4450     {
4451     case 0:
4452       return _fam_cells;
4453     case 1:
4454       return _fam_nodes;
4455     case -1:
4456       return _fam_faces;
4457     default:
4458       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getFamilyFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4459     }
4460 }
4461
4462 /*!
4463  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension.
4464  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4465  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers.
4466  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4467  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4468  */
4469 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4470 {
4471   switch(meshDimRelToMaxExt)
4472     {
4473     case 0:
4474       return _num_cells;
4475     case 1:
4476       return _num_nodes;
4477     case -1:
4478       return _num_faces;
4479     default:
4480       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4481     }
4482 }
4483
4484 /*!
4485  * Returns the optional numbers of mesh entities of a given dimension transformed using
4486  * DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4487  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of mesh entities.
4488  *  \return const DataArrayInt * - the array of the entity numbers transformed using
4489  *          DataArrayInt::invertArrayN2O2O2N().
4490  *  \throw If \a meshDimRelToMaxExt != 0 and \a meshDimRelToMaxExt != 1.
4491  *  \throw If there are no mesh entities of \a meshDimRelToMaxExt dimension in \a this mesh.
4492  */
4493 const DataArrayInt *MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4494 {
4495   if(meshDimRelToMaxExt!=0 && meshDimRelToMaxExt!=1)
4496     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getRevNumberFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 !");
4497   if(meshDimRelToMaxExt==0)
4498     {
4499       if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4500         {
4501           int pos;
4502           int maxValue=_num_cells->getMaxValue(pos);
4503           _rev_num_cells=_num_cells->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4504           return _rev_num_cells;
4505         }
4506       else
4507         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no cell renumbering for a request on reverse numbering !");
4508     }
4509   else
4510     {
4511       if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4512         {
4513           int pos;
4514           int maxValue=_num_nodes->getMaxValue(pos);
4515           _rev_num_nodes=_num_nodes->invertArrayN2O2O2N(maxValue+1);
4516           return _rev_num_nodes;
4517         }
4518       else
4519         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getRevNumberFieldAtLevel : no node renumbering for a request on reverse numbering !");
4520     }
4521 }
4522
4523 const DataArrayAsciiChar *MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4524 {
4525   switch(meshDimRelToMaxExt)
4526     {
4527     case 0:
4528       return _names_cells;
4529     case 1:
4530       return _names_nodes;
4531     case -1:
4532       return _names_faces;
4533     default:
4534       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNameFieldAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4535     }
4536 }
4537
4538 /*!
4539  * Returns relative dimensions of mesh entities (excluding nodes) present in \a this mesh.
4540  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [0].
4541  */
4542 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevels() const
4543 {
4544   std::vector<int> ret(1);
4545   return ret;
4546 }
4547
4548 /*!
4549  * Returns relative dimensions of mesh entities (including nodes) present in \a this mesh.
4550  *  \return std::vector<int> - a sequence of the relative dimensions: [1,0].
4551  */
4552 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNonEmptyLevelsExt() const
4553 {
4554   std::vector<int> ret(2);
4555   ret[0]=1;
4556   return ret;
4557 }
4558
4559 /*!
4560  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL family arr are defined.
4561  */
4562 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getFamArrNonEmptyLevelsExt() const
4563 {
4564   std::vector<int> ret;
4565   const DataArrayInt *famNodes(_fam_nodes),*famCells(_fam_cells),*famFaces(_fam_faces);
4566   if(famNodes)
4567     ret.push_back(1);
4568   if(famCells)
4569     ret.push_back(0);
4570   if(famFaces)
4571     ret.push_back(-1);
4572   return ret;
4573 }
4574
4575 /*!
4576  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL numbering arr are defined.
4577  */
4578 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNumArrNonEmptyLevelsExt() const
4579 {
4580   std::vector<int> ret;
4581   const DataArrayInt *numNodes(_num_nodes),*numCells(_num_cells),*numFaces(_num_faces);
4582   if(numNodes)
4583     ret.push_back(1);
4584   if(numCells)
4585     ret.push_back(0);
4586   if(numFaces)
4587     ret.push_back(-1);
4588   return ret;
4589 }
4590
4591 /*!
4592  * Returns the set of extensive levels (nodes included) where not NULL naming arr are defined.
4593  */
4594 std::vector<int> MEDFileStructuredMesh::getNameArrNonEmptyLevelsExt() const
4595 {
4596   std::vector<int> ret;
4597   const DataArrayAsciiChar *namesNodes(_names_nodes),*namesCells(_names_cells),*namesFaces(_names_faces);
4598   if(namesNodes)
4599     ret.push_back(1);
4600   if(namesCells)
4601     ret.push_back(0);
4602   if(namesFaces)
4603     ret.push_back(-1);
4604   return ret;
4605 }
4606
4607 /*!
4608  * no implementation here, it is not a bug, but intresically no polyhedra in \a this.
4609  */
4610 bool MEDFileStructuredMesh::unPolyze(std::vector<int>& oldCode, std::vector<int>& newCode, DataArrayInt *& o2nRenumCell)
4611 {
4612   oldCode.clear(); newCode.clear(); o2nRenumCell=0;
4613   return false;
4614 }
4615
4616 void MEDFileStructuredMesh::changeFamilyIdArr(int oldId, int newId)
4617 {
4618   DataArrayInt *arr=_fam_nodes;
4619   if(arr)
4620     arr->changeValue(oldId,newId);
4621   arr=_fam_cells;
4622   if(arr)
4623     arr->changeValue(oldId,newId);
4624   arr=_fam_faces;
4625   if(arr)
4626     arr->changeValue(oldId,newId);
4627 }
4628
4629 void MEDFileStructuredMesh::deepCpyAttributes()
4630 {
4631   if((const DataArrayInt*)_fam_nodes)
4632     _fam_nodes=_fam_nodes->deepCpy();
4633   if((const DataArrayInt*)_num_nodes)
4634     _num_nodes=_num_nodes->deepCpy();
4635   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_nodes)
4636     _names_nodes=_names_nodes->deepCpy();
4637   if((const DataArrayInt*)_fam_cells)
4638     _fam_cells=_fam_cells->deepCpy();
4639   if((const DataArrayInt*)_num_cells)
4640     _num_cells=_num_cells->deepCpy();
4641   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_cells)
4642     _names_cells=_names_cells->deepCpy();
4643   if((const DataArrayInt*)_fam_faces)
4644     _fam_faces=_fam_faces->deepCpy();
4645   if((const DataArrayInt*)_num_faces)
4646     _num_faces=_num_faces->deepCpy();
4647   if((const DataArrayAsciiChar*)_names_faces)
4648     _names_faces=_names_faces->deepCpy();
4649   if((const DataArrayInt*)_rev_num_nodes)
4650     _rev_num_nodes=_rev_num_nodes->deepCpy();
4651   if((const DataArrayInt*)_rev_num_cells)
4652     _rev_num_cells=_rev_num_cells->deepCpy();
4653 }
4654
4655 /*!
4656  * Returns a pointer to mesh at the specified level (here 0 is compulsary for cartesian mesh).
4657  * 
4658  * \return a pointer to cartesian mesh that need to be managed by the caller.
4659  * \warning the returned pointer has to be managed by the caller.
4660  */
4661
4662 /*!
4663  * Returns a pointer to MEDCouplingStructuredMesh held by \a this. 
4664  *  \param [in] meshDimRelToMax - it must be \c 0 or \c -1.
4665  *  \param [in] renum - it must be \c false.
4666  *  \return MEDCouplingMesh * - a pointer to MEDCouplingMesh that the caller is to
4667  *          delete using decrRef() as it is no more needed. 
4668  */
4669 MEDCouplingMesh *MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel(int meshDimRelToMax, bool renum) const
4670 {
4671   if(renum)
4672     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support renumbering ! To do it perform request of renum array directly !");
4673   const MEDCouplingStructuredMesh *m(getStructuredMesh());
4674   switch(meshDimRelToMax)
4675     {
4676     case 0:
4677       {
4678         if(m)
4679           m->incrRef();
4680         return const_cast<MEDCouplingStructuredMesh *>(m);
4681       }
4682     case -1:
4683       {
4684         if(!m)
4685           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGenMeshAtLevel : level -1 requested must be non empty to be able to compute unstructured sub mesh !");
4686         return m->build1SGTSubLevelMesh();
4687       }
4688     default:
4689       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh does not support multi level for mesh 0 expected as input !");
4690     }
4691 }
4692
4693 /*!
4694  * Returns number of mesh entities of a given relative dimension in \a this mesh.
4695  *  \param [in] meshDimRelToMaxExt - the relative dimension of interest.
4696  *  \return int - the number of entities.
4697  *  \throw If no mesh entities of dimension \a meshDimRelToMaxExt are available in \a this mesh.
4698  */
4699 int MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel(int meshDimRelToMaxExt) const
4700 {
4701   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4702   if(!cmesh)
4703     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : No structured mesh set !");
4704   switch(meshDimRelToMaxExt)
4705     {
4706     case 0:
4707       return cmesh->getNumberOfCells();
4708     case 1:
4709       return cmesh->getNumberOfNodes();
4710     case -1:
4711       return cmesh->getNumberOfCellsOfSubLevelMesh();
4712     default:
4713       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getSizeAtLevel : Only available for levels 0 or 1 or -1 !");
4714     }
4715 }
4716
4717 int MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes() const
4718 {
4719   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4720   if(!cmesh)
4721     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getNumberOfNodes : no cartesian mesh set !");
4722   return cmesh->getNumberOfNodes();
4723 }
4724
4725 std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel(int meshDimRelToMax) const
4726 {
4727   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh(getStructuredMesh());
4728   if(!cmesh)
4729     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : No structured mesh set !");
4730   switch(meshDimRelToMax)
4731     {
4732     case 0:
4733       {
4734         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,cmesh->getTypeOfCell(0));
4735         return ret;
4736       }
4737     case -1:
4738       {
4739         int mdim(cmesh->getMeshDimension());
4740         if(mdim<1)
4741           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only one level available for structured meshes ! Input 0 is mandatory or 0D mesh !");
4742         std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret(1,MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(mdim-1));
4743         return ret;
4744       }
4745     default:
4746       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::getGeoTypesAtLevel : only 2 levels available at most : 0 and -1 !");
4747     }
4748 }
4749
4750 void MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched(const MEDFileField1TSStructItem& st, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, std::vector<bool>& nodesFetched) const
4751 {
4752   if(st.getNumberOfItems()!=1)
4753     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on single geo type ! it is not managed yet for structured mesh !");
4754   if(st[0].getGeo()!=MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension()))
4755     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : The sturture of field is not lying on expected geo type !");
4756   if(getNumberOfNodes()!=(int)nodesFetched.size())
4757     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : invalid size of array !");
4758   if(st[0].getPflName().empty())
4759     {
4760       std::fill(nodesFetched.begin(),nodesFetched.end(),true);
4761       return ;
4762     }
4763   const DataArrayInt *arr(globs->getProfile(st[0].getPflName()));
4764   const MEDCouplingStructuredMesh *cmesh=getStructuredMesh();//cmesh not null because getNumberOfNodes called before
4765   int sz(nodesFetched.size());
4766   for(const int *work=arr->begin();work!=arr->end();work++)
4767     {
4768       std::vector<int> conn;
4769       cmesh->getNodeIdsOfCell(*work,conn);
4770       for(std::vector<int>::const_iterator it=conn.begin();it!=conn.end();it++)
4771         if(*it>=0 && *it<sz)
4772           nodesFetched[*it]=true;
4773         else
4774           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::whichAreNodesFetched : internal error !");
4775     }
4776 }
4777
4778 med_geometry_type MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(int meshDim)
4779 {
4780   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ct(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim));
4781   return typmai3[ct];
4782 }
4783
4784 void MEDFileStructuredMesh::LoadStrMeshDAFromFile(med_idt fid, int meshDim, int dt, int it, const std::string& mName, MEDFileMeshReadSelector *mrs,
4785                                                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& famCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt>& numCells, MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayAsciiChar>& namesCells)
4786 {
4787   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
4788   med_geometry_type geoTypeReq=MEDFileStructuredMesh::GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim);
4789   int nbOfElt(0);
4790   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4791   if(nbOfElt>0)
4792     {
4793       if(!mrs || mrs->isCellFamilyFieldReading())
4794         {
4795           famCells=DataArrayInt::New();
4796           famCells->alloc(nbOfElt,1);
4797           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,famCells->getPointer());
4798         }
4799     }
4800   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4801   if(nbOfElt>0)
4802     {
4803       if(!mrs || mrs->isCellNumFieldReading())
4804         {
4805           numCells=DataArrayInt::New();
4806           numCells->alloc(nbOfElt,1);
4807           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,numCells->getPointer());
4808         }
4809     }
4810   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4811   if(nbOfElt>0)
4812     {
4813       if(!mrs || mrs->isCellNameFieldReading())
4814         {
4815           namesCells=DataArrayAsciiChar::New();
4816           namesCells->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4817           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_CELL,geoTypeReq,namesCells->getPointer());
4818           namesCells->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4819         }
4820     }
4821 }
4822
4823 void MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile(MEDFileStrMeshL2 *strm, med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
4824 {
4825   setName(strm->getName());
4826   setDescription(strm->getDescription());
4827   setUnivName(strm->getUnivName());
4828   setIteration(strm->getIteration());
4829   setOrder(strm->getOrder());
4830   setTimeValue(strm->getTime());
4831   setTimeUnit(strm->getTimeUnit());
4832   MEDFileMeshL2::ReadFamiliesAndGrps(fid,mName,_families,_groups,mrs);
4833   med_bool chgt=MED_FALSE,trsf=MED_FALSE;
4834   int nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_FAMILY_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4835   if(nbOfElt>0)
4836     {
4837       if(!mrs || mrs->isNodeFamilyFieldReading())
4838         {
4839           int nbNodes(getNumberOfNodes());
4840           if(nbOfElt>nbNodes)
4841             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileStructuredMesh::loadStrMeshFromFile : invalid size of family node array regarding number of nodes in this ! File seems to be corrupted !");
4842           _fam_nodes=DataArrayInt::New();
4843           _fam_nodes->alloc(nbNodes,1);//yes nbNodes and not nbOfElt see next line.
4844           if(nbNodes>nbOfElt)//yes it appends some times... It explains surely the mdump implementation. Bug revealed by PARAVIS EDF #2475 on structured.med file where only 12 first nodes are !=0 so nbOfElt=12 and nbOfNodes=378...
4845             _fam_nodes->fillWithZero();
4846           MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getPointer());
4847         }
4848     }
4849   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NUMBER,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4850   if(nbOfElt>0)
4851     {
4852       if(!mrs || mrs->isNodeNumFieldReading())
4853         {
4854           _num_nodes=DataArrayInt::New();
4855           _num_nodes->alloc(nbOfElt,1);
4856           MEDmeshEntityNumberRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getPointer());
4857         }
4858     }
4859   nbOfElt=MEDmeshnEntity(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,MED_NAME,MED_NODAL,&chgt,&trsf);
4860   if(nbOfElt>0)
4861     {
4862       if(!mrs || mrs->isNodeNameFieldReading())
4863         {
4864           _names_nodes=DataArrayAsciiChar::New();
4865           _names_nodes->alloc(nbOfElt+1,MED_SNAME_SIZE);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4866           MEDmeshEntityNameRd(fid,mName.c_str(),dt,it,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getPointer());
4867           _names_nodes->reAlloc(nbOfElt);//not a bug to avoid the memory corruption due to last \0 at the end
4868         }
4869     }
4870   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
4871   LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim,dt,it,mName,mrs,_fam_cells,_num_cells,_names_cells);
4872   if(meshDim>=1)
4873     LoadStrMeshDAFromFile(fid,meshDim-1,dt,it,mName,mrs,_fam_faces,_num_faces,_names_faces);
4874 }
4875
4876 void MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(med_idt fid, const std::string& maa) const
4877 {
4878   int meshDim(getStructuredMesh()->getMeshDimension());
4879   med_geometry_type geoTypeReq(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim)),geoTypeReq2(GetGeoTypeFromMeshDim(meshDim-1));
4880   //
4881   if((const DataArrayInt *)_fam_cells)
4882     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_fam_cells->getNumberOfTuples(),_fam_cells->getConstPointer());
4883   if((const DataArrayInt *)_fam_faces)
4884     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_fam_faces->getNumberOfTuples(),_fam_faces->getConstPointer());
4885   if((const DataArrayInt *)_fam_nodes)
4886     MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_fam_nodes->getNumberOfTuples(),_fam_nodes->getConstPointer());
4887   if((const DataArrayInt *)_num_cells)
4888     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_num_cells->getNumberOfTuples(),_num_cells->getConstPointer());
4889   if((const DataArrayInt *)_num_faces)
4890     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_num_faces->getNumberOfTuples(),_num_faces->getConstPointer());
4891   if((const DataArrayInt *)_num_nodes)
4892     MEDmeshEntityNumberWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_num_nodes->getNumberOfTuples(),_num_nodes->getConstPointer());
4893   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_cells)
4894     {
4895       if(_names_cells->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4896         {
4897           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on cells with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4898           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
4899           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4900         }
4901       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq,_names_cells->getNumberOfTuples(),_names_cells->getConstPointer());
4902     }
4903   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_faces)
4904     {
4905       if(_names_faces->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4906         {
4907           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on faces with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4908           oss << " ! The array has " << _names_faces->getNumberOfComponents() << " components !";
4909           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4910         }
4911       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_CELL,geoTypeReq2,_names_faces->getNumberOfTuples(),_names_faces->getConstPointer());
4912     }
4913   if((const DataArrayAsciiChar *)_names_nodes)
4914     {
4915       if(_names_nodes->getNumberOfComponents()!=MED_SNAME_SIZE)
4916         {
4917           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL : expected a name field on nodes with number of components set to " << MED_SNAME_SIZE;
4918           oss << " ! The array has " << _names_cells->getNumberOfComponents() << " components !";
4919           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4920         }
4921       MEDmeshEntityNameWr(fid,maa.c_str(),_iteration,_order,MED_NODE,MED_NONE,_names_nodes->getNumberOfTuples(),_names_nodes->getConstPointer());
4922     }
4923   //
4924   MEDFileUMeshL2::WriteFamiliesAndGrps(fid,maa.c_str(),_families,_groups,_too_long_str);
4925 }
4926
4927 /*!
4928  * Returns an empty instance of MEDFileCMesh.
4929  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4930  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4931  */
4932 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New()
4933 {
4934   return new MEDFileCMesh;
4935 }
4936
4937 /*!
4938  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
4939  * file. The first mesh in the file is loaded.
4940  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
4941  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4942  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4943  *  \throw If the file is not readable.
4944  *  \throw If there is no meshes in the file.
4945  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
4946  */
4947 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
4948 {
4949   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
4950   if(ms.empty())
4951     {
4952       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
4953       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
4954     }
4955   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4956   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
4957   int dt,it;
4958   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
4959   std::string dummy2;
4960   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
4961   return new MEDFileCMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
4962 }
4963
4964 /*!
4965  * Returns a new MEDFileCMesh holding the mesh data that has been read from a given MED
4966  * file. The mesh to load is specified by its name and numbers of a time step and an
4967  * iteration.
4968  *  \param [in] fileName - the name of MED file to read.
4969  *  \param [in] mName - the name of the mesh to read.
4970  *  \param [in] dt - the number of a time step.
4971  *  \param [in] it - the number of an iteration.
4972  *  \return MEDFileCMesh * - a new instance of MEDFileCMesh. The caller is to delete this
4973  *          mesh using decrRef() as it is no more needed. 
4974  *  \throw If the file is not readable.
4975  *  \throw If there is no mesh with given attributes in the file.
4976  *  \throw If the mesh in the file is not a Cartesian one.
4977  */
4978 MEDFileCMesh *MEDFileCMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
4979 {
4980   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
4981   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
4982   return new MEDFileCMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
4983 }
4984
4985 std::size_t MEDFileCMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
4986 {
4987   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
4988 }
4989
4990 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCMesh::getDirectChildren() const
4991 {
4992   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildren());
4993   if((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh)
4994     ret.push_back((const MEDCouplingCMesh *)_cmesh);
4995   return ret;
4996 }
4997
4998 /*!
4999  * Returns the dimension on cells in \a this mesh.
5000  *  \return int - the mesh dimension.
5001  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5002  */
5003 int MEDFileCMesh::getMeshDimension() const
5004 {
5005   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5006     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5007   return _cmesh->getMeshDimension();
5008 }
5009
5010 /*!
5011  * Returns the dimension on nodes in \a this mesh.
5012  *  \return int - the space dimension.
5013  *  \throw If there are no cells in this mesh.
5014  */
5015 int MEDFileCMesh::getSpaceDimension() const
5016 {
5017   if(!((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh))
5018     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCMesh::getSpaceDimension : unable to get spacedimension because no mesh set !");
5019   return _cmesh->getSpaceDimension();
5020 }
5021
5022 /*!
5023  * Returns a string describing \a this mesh.
5024  *  \return std::string - the mesh information string.
5025  */
5026 std::string MEDFileCMesh::simpleRepr() const
5027 {
5028   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5029 }
5030
5031 /*!
5032  * Returns a full textual description of \a this mesh.
5033  *  \return std::string - the string holding the mesh description.
5034  */
5035 std::string MEDFileCMesh::advancedRepr() const
5036 {
5037   return simpleRepr();
5038 }
5039
5040 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::shallowCpy() const
5041 {
5042   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5043   return ret.retn();
5044 }
5045
5046 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::createNewEmpty() const
5047 {
5048   return new MEDFileCMesh;
5049 }
5050
5051 MEDFileMesh *MEDFileCMesh::deepCpy() const
5052 {
5053   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCMesh> ret=new MEDFileCMesh(*this);
5054   if((const MEDCouplingCMesh*)_cmesh)
5055     ret->_cmesh=static_cast<MEDCouplingCMesh*>(_cmesh->deepCpy());
5056   ret->deepCpyAttributes();
5057   return ret.retn();
5058 }
5059
5060 /*!
5061  * Checks if \a this and another mesh are equal.
5062  *  \param [in] other - the mesh to compare with.
5063  *  \param [in] eps - a precision used to compare real values.
5064  *  \param [in,out] what - the string returning description of unequal data.
5065  *  \return bool - \c true if the meshes are equal, \c false, else.
5066  */
5067 bool MEDFileCMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5068 {
5069   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5070     return false;
5071   const MEDFileCMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(other);
5072   if(!otherC)
5073     {
5074       what="Mesh types differ ! This is cartesian and other is NOT !";
5075       return false;
5076     }
5077   clearNonDiscrAttributes();
5078   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5079   const MEDCouplingCMesh *coo1=_cmesh;
5080   const MEDCouplingCMesh *coo2=otherC->_cmesh;
5081   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5082     {
5083       what="Mismatch of cartesian meshes ! One is defined and not other !";
5084       return false;
5085     }
5086   if(coo1)
5087     {
5088       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5089       if(!ret)
5090         {
5091           what="cartesian meshes differ !";
5092           return false;
5093         }
5094     }
5095   return true;
5096 }
5097
5098 /*!
5099  * Clears redundant attributes of incorporated data arrays.
5100  */
5101 void MEDFileCMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5102 {
5103   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5104   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_cmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5105 }
5106
5107 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh()
5108 {
5109 }
5110
5111 MEDFileCMesh::MEDFileCMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5112 try
5113   {
5114     loadCMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5115   }
5116 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5117   {
5118     throw e;
5119   }
5120
5121 void MEDFileCMesh::loadCMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5122 {
5123   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5124   int dummy0,dummy1;
5125   std::string dtunit;
5126   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5127   if(meshType!=CARTESIAN)
5128     {
5129       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as cartesian an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT cartesian !";
5130       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5131     }
5132   MEDFileCMeshL2 loaderl2;
5133   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5134   MEDCouplingCMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5135   mesh->incrRef();
5136   _cmesh=mesh;
5137   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5138 }
5139
5140 /*!
5141  * Returns a const pointer to MEDCouplingCMesh held by \a this mesh.
5142  *  \return const MEDCouplingCMesh * - a pointer to the held MEDCouplingCMesh.
5143  */
5144 const MEDCouplingCMesh *MEDFileCMesh::getMesh() const
5145 {
5146   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5147   return _cmesh;
5148 }
5149
5150 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCMesh::getStructuredMesh() const
5151 {
5152   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5153   return _cmesh;
5154 }
5155
5156 /*!
5157  * Sets the MEDCouplingCMesh holding the data of \a this mesh.
5158  *  \param [in] m - the new MEDCouplingCMesh to refer to.
5159  *  \throw If the name or the description of \a this mesh and \a m are not empty and are
5160  *         different. 
5161  */
5162 void MEDFileCMesh::setMesh(MEDCouplingCMesh *m)
5163 {
5164   dealWithTinyInfo(m);
5165   if(m)
5166     m->incrRef();
5167   _cmesh=m;
5168 }
5169
5170 void MEDFileCMesh::writeLL(med_idt fid) const
5171 {
5172   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5173   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5174   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5175   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5176   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5177   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5178   int spaceDim(_cmesh->getSpaceDimension());
5179   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5180   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5181   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5182     {
5183       std::string info(_cmesh->getCoordsAt(i)->getInfoOnComponent(0));
5184       std::string c,u;
5185       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5186       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5187       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5188     }
5189   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,spaceDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5190   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5191   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CARTESIAN_GRID);
5192   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5193     {
5194       const DataArrayDouble *da=_cmesh->getCoordsAt(i);
5195       MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,i+1,da->getNumberOfTuples(),da->getConstPointer());
5196     }
5197   //
5198   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5199   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5200 }
5201
5202 void MEDFileCMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5203 {
5204   const MEDCouplingCMesh *cmesh=_cmesh;
5205   if(!cmesh)
5206     return;
5207   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setName(_name);
5208   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setDescription(_desc_name);
5209   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5210   (const_cast<MEDCouplingCMesh *>(cmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5211 }
5212
5213 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New()
5214 {
5215   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5216 }
5217
5218 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5219 {
5220   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5221   if(ms.empty())
5222     {
5223       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5224       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5225     }
5226   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5227   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5228   int dt,it;
5229   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5230   std::string dummy2;
5231   MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5232   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,ms.front(),dt,it,mrs);
5233 }
5234
5235 MEDFileCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::New(const std::string& fileName, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5236 {
5237   MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5238   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5239   return new MEDFileCurveLinearMesh(fid,mName,dt,it,mrs);
5240 }
5241
5242 std::size_t MEDFileCurveLinearMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5243 {
5244   return MEDFileStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
5245 }
5246
5247 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileCurveLinearMesh::getDirectChildren() const
5248 {
5249   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDFileStructuredMesh::getDirectChildren());
5250   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh)
5251     ret.push_back((const MEDCouplingCurveLinearMesh *)_clmesh);
5252   return ret;
5253 }
5254
5255 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::shallowCpy() const
5256 {
5257   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5258   return ret.retn();
5259 }
5260
5261 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::createNewEmpty() const
5262 {
5263   return new MEDFileCurveLinearMesh;
5264 }
5265
5266 MEDFileMesh *MEDFileCurveLinearMesh::deepCpy() const
5267 {
5268   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileCurveLinearMesh> ret=new MEDFileCurveLinearMesh(*this);
5269   if((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh)
5270     ret->_clmesh=static_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh*>(_clmesh->deepCpy());
5271   ret->deepCpyAttributes();
5272   return ret.retn();
5273 }
5274
5275 int MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension() const
5276 {
5277   if(!((const MEDCouplingCurveLinearMesh*)_clmesh))
5278     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::getMeshDimension : unable to get meshdimension because no mesh set !");
5279   return _clmesh->getMeshDimension();
5280 }
5281
5282 std::string MEDFileCurveLinearMesh::simpleRepr() const
5283 {
5284   return MEDFileStructuredMesh::simpleRepr();
5285 }
5286
5287 std::string MEDFileCurveLinearMesh::advancedRepr() const
5288 {
5289   return simpleRepr();
5290 }
5291
5292 bool MEDFileCurveLinearMesh::isEqual(const MEDFileMesh *other, double eps, std::string& what) const
5293 {
5294   if(!MEDFileStructuredMesh::isEqual(other,eps,what))
5295     return false;
5296   const MEDFileCurveLinearMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(other);
5297   if(!otherC)
5298     {
5299       what="Mesh types differ ! This is curve linear and other is NOT !";
5300       return false;
5301     }
5302   clearNonDiscrAttributes();
5303   otherC->clearNonDiscrAttributes();
5304   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo1=_clmesh;
5305   const MEDCouplingCurveLinearMesh *coo2=otherC->_clmesh;
5306   if((coo1==0 && coo2!=0) || (coo1!=0 && coo2==0))
5307     {
5308       what="Mismatch of curve linear meshes ! One is defined and not other !";
5309       return false;
5310     }
5311   if(coo1)
5312     {
5313       bool ret=coo1->isEqual(coo2,eps);
5314       if(!ret)
5315         {
5316           what="curve linear meshes differ !";
5317           return false;
5318         }
5319     }
5320   return true;
5321 }
5322
5323 void MEDFileCurveLinearMesh::clearNonDiscrAttributes() const
5324 {
5325   MEDFileStructuredMesh::clearNonDiscrAttributes();
5326   MEDFileUMeshSplitL1::ClearNonDiscrAttributes(_clmesh);//to it is not a bug umeshsplit have already the method implemented
5327 }
5328
5329 void MEDFileCurveLinearMesh::synchronizeTinyInfoOnLeaves() const
5330 {
5331   const MEDCouplingCurveLinearMesh *clmesh=_clmesh;
5332   if(!clmesh)
5333     return;
5334   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setName(_name);
5335   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setDescription(_desc_name);
5336   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTime(_time,_iteration,_order);
5337   (const_cast<MEDCouplingCurveLinearMesh *>(clmesh))->setTimeUnit(_dt_unit);
5338 }
5339
5340 const MEDCouplingCurveLinearMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getMesh() const
5341 {
5342   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5343   return _clmesh;
5344 }
5345
5346 void MEDFileCurveLinearMesh::setMesh(MEDCouplingCurveLinearMesh *m)
5347 {
5348   dealWithTinyInfo(m);
5349   if(m)
5350     m->incrRef();
5351   _clmesh=m;
5352 }
5353
5354 const MEDCouplingStructuredMesh *MEDFileCurveLinearMesh::getStructuredMesh() const
5355 {
5356   synchronizeTinyInfoOnLeaves();
5357   return _clmesh;
5358 }
5359
5360 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh()
5361 {
5362 }
5363
5364 MEDFileCurveLinearMesh::MEDFileCurveLinearMesh(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5365 try
5366   {
5367     loadCLMeshFromFile(fid,mName,dt,it,mrs);
5368   }
5369 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5370   {
5371     throw e;
5372   }
5373
5374 void MEDFileCurveLinearMesh::writeLL(med_idt fid) const
5375 {
5376   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> maa=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_NAME_SIZE);
5377   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> desc=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_COMMENT_SIZE);
5378   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> dtunit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(MED_LNAME_SIZE);
5379   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_name.c_str(),MED_NAME_SIZE,maa,_too_long_str);
5380   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_desc_name.c_str(),MED_COMMENT_SIZE,desc,_too_long_str);
5381   MEDLoaderBase::safeStrCpy(_dt_unit.c_str(),MED_LNAME_SIZE,dtunit,_too_long_str);
5382   int spaceDim=_clmesh->getSpaceDimension();
5383   int meshDim=_clmesh->getMeshDimension();
5384   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> comp=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5385   INTERP_KERNEL::AutoPtr<char> unit=MEDLoaderBase::buildEmptyString(spaceDim*MED_SNAME_SIZE);
5386   const DataArrayDouble *coords=_clmesh->getCoords();
5387   if(!coords)
5388     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileCurveLinearMesh::writeLL : no coordinates set !");
5389   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
5390     {
5391       std::string info(_clmesh->getCoords()->getInfoOnComponent(i));
5392       std::string c,u;
5393       MEDLoaderBase::splitIntoNameAndUnit(info,c,u);
5394       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(c.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,comp+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5395       MEDLoaderBase::safeStrCpy2(u.c_str(),MED_SNAME_SIZE-1,unit+i*MED_SNAME_SIZE,_too_long_str);//MED_TAILLE_PNOM-1 to avoid to write '\0' on next compo
5396     }
5397   MEDmeshCr(fid,maa,spaceDim,meshDim,MED_STRUCTURED_MESH,desc,dtunit,MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN,comp,unit);
5398   MEDmeshUniversalNameWr(fid,maa);
5399   MEDmeshGridTypeWr(fid,maa,MED_CURVILINEAR_GRID);
5400   std::vector<int> nodeGridSt=_clmesh->getNodeGridStructure();
5401   MEDmeshGridStructWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,&nodeGridSt[0]);
5402   
5403   MEDmeshNodeCoordinateWr(fid,maa,_iteration,_order,_time,MED_FULL_INTERLACE,coords->getNumberOfTuples(),coords->begin());
5404   //
5405   std::string meshName(MEDLoaderBase::buildStringFromFortran(maa,MED_NAME_SIZE));
5406   MEDFileStructuredMesh::writeStructuredLL(fid,meshName);
5407 }
5408
5409 void MEDFileCurveLinearMesh::loadCLMeshFromFile(med_idt fid, const std::string& mName, int dt, int it, MEDFileMeshReadSelector *mrs)
5410 {
5411   ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5412   int dummy0,dummy1;
5413   std::string dtunit;
5414   int mid=MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,mName,meshType,dummy0,dummy1,dtunit);
5415   if(meshType!=CURVE_LINEAR)
5416     {
5417       std::ostringstream oss; oss << "Trying to load as curve linear an existing mesh with name '" << mName << "' that is NOT curve linear !";
5418       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5419     }
5420   MEDFileCLMeshL2 loaderl2;
5421   loaderl2.loadAll(fid,mid,mName,dt,it);
5422   MEDCouplingCurveLinearMesh *mesh=loaderl2.getMesh();
5423   mesh->incrRef();
5424   _clmesh=mesh;
5425   loadStrMeshFromFile(&loaderl2,fid,mName,dt,it,mrs);
5426 }
5427
5428 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New()
5429 {
5430   return new MEDFileMeshMultiTS;
5431 }
5432
5433 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName)
5434 {
5435   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName);
5436 }
5437
5438 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::New(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5439 {
5440   return new MEDFileMeshMultiTS(fileName,mName);
5441 }
5442
5443 MEDFileMeshMultiTS *MEDFileMeshMultiTS::deepCpy() const
5444 {
5445   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> ret=MEDFileMeshMultiTS::New();
5446   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> > meshOneTs(_mesh_one_ts.size());
5447   std::size_t i=0;
5448   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++,i++)
5449     if((const MEDFileMesh *)*it)
5450       meshOneTs[i]=(*it)->deepCpy();
5451   ret->_mesh_one_ts=meshOneTs;
5452   return ret.retn();
5453 }
5454
5455 std::size_t MEDFileMeshMultiTS::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5456 {
5457   return _mesh_one_ts.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh>);
5458 }
5459
5460 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshMultiTS::getDirectChildren() const
5461 {
5462   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5463   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5464     {
5465       const MEDFileMesh *cur(*it);
5466       if(cur)
5467         ret.push_back(cur);
5468     }
5469   return ret;
5470 }
5471
5472 std::string MEDFileMeshMultiTS::getName() const
5473 {
5474   if(_mesh_one_ts.empty())
5475     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getName : no time steps set !");
5476   return _mesh_one_ts[0]->getName();
5477 }
5478
5479 void MEDFileMeshMultiTS::setName(const std::string& newMeshName)
5480 {
5481   std::string oldName(getName());
5482   std::vector< std::pair<std::string,std::string> > v(1);
5483   v[0].first=oldName; v[0].second=newMeshName;
5484   changeNames(v);
5485 }
5486
5487 bool MEDFileMeshMultiTS::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5488 {
5489   bool ret=false;
5490   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5491     {
5492       MEDFileMesh *cur(*it);
5493       if(cur)
5494         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5495     }
5496   return ret;
5497 }
5498
5499 MEDFileMesh *MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep() const
5500 {
5501   if(_mesh_one_ts.empty())
5502     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::getOneTimeStep : empty time step set !");
5503   return const_cast<MEDFileMesh *>(static_cast<const MEDFileMesh *>(_mesh_one_ts[0]));
5504 }
5505
5506 void MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep(MEDFileMesh *mesh1TimeStep)
5507 {
5508   if(!mesh1TimeStep)
5509     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshMultiTS::setOneTimeStep : input pointer should be different from 0 !");
5510   _mesh_one_ts.resize(1);
5511   mesh1TimeStep->incrRef();
5512   //MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> toto=mesh1TimeStep;
5513   _mesh_one_ts[0]=mesh1TimeStep;
5514 }
5515
5516 void MEDFileMeshMultiTS::write(med_idt fid) const
5517 {
5518   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMesh> >::const_iterator it=_mesh_one_ts.begin();it!=_mesh_one_ts.end();it++)
5519     {
5520       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5521       (*it)->write(fid);
5522     }
5523 }
5524
5525 void MEDFileMeshMultiTS::write(const std::string& fileName, int mode) const
5526 {
5527   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5528   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5529   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5530   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5531   write(fid);
5532 }
5533
5534 void MEDFileMeshMultiTS::loadFromFile(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5535 {//for the moment to be improved
5536   _mesh_one_ts.resize(1);
5537   _mesh_one_ts[0]=MEDFileMesh::New(fileName,mName,-1,-1);
5538 }
5539
5540 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS()
5541 {
5542 }
5543
5544 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName)
5545 try
5546   {
5547     std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5548     if(ms.empty())
5549     {
5550       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileUMesh::New : no meshes in file \"" << fileName << "\" !";
5551       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5552     }
5553     MEDFileUtilities::CheckFileForRead(fileName);
5554     MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),MED_ACC_RDONLY);
5555     int dt,it;
5556     ParaMEDMEM::MEDCouplingMeshType meshType;
5557     std::string dummy2;
5558     MEDFileMeshL2::GetMeshIdFromName(fid,ms.front(),meshType,dt,it,dummy2);
5559     loadFromFile(fileName,ms.front());
5560   }
5561 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5562   {
5563     throw e;
5564   }
5565
5566 MEDFileMeshMultiTS::MEDFileMeshMultiTS(const std::string& fileName, const std::string& mName)
5567 try
5568   {
5569     loadFromFile(fileName,mName);
5570   }
5571 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
5572   {
5573     throw e;
5574   }
5575
5576 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New()
5577 {
5578   return new MEDFileMeshes;
5579 }
5580
5581 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::New(const std::string& fileName)
5582 {
5583   return new MEDFileMeshes(fileName);
5584 }
5585
5586 void MEDFileMeshes::write(med_idt fid) const
5587 {
5588   checkCoherency();
5589   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5590     {
5591       (*it)->copyOptionsFrom(*this);
5592       (*it)->write(fid);
5593     }
5594 }
5595
5596 void MEDFileMeshes::write(const std::string& fileName, int mode) const
5597 {
5598   med_access_mode medmod=MEDFileUtilities::TraduceWriteMode(mode);
5599   MEDFileUtilities::AutoFid fid=MEDfileOpen(fileName.c_str(),medmod);
5600   std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMesh : error on attempt to write in file : \"" << fileName << "\""; 
5601   MEDFileUtilities::CheckMEDCode(fid,fid,oss.str());
5602   checkCoherency();
5603   write(fid);
5604 }
5605
5606 int MEDFileMeshes::getNumberOfMeshes() const
5607 {
5608   return _meshes.size();
5609 }
5610
5611 MEDFileMeshesIterator *MEDFileMeshes::iterator()
5612 {
5613   return new MEDFileMeshesIterator(this);
5614 }
5615
5616 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshAtPos(int i) const
5617 {
5618   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5619     {
5620       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshAtPos : invalid mesh id given in parameter ! Should be in [0;" << _meshes.size() << ") !";
5621       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5622     }
5623   return _meshes[i]->getOneTimeStep();
5624 }
5625
5626 MEDFileMesh *MEDFileMeshes::getMeshWithName(const std::string& mname) const
5627 {
5628   std::vector<std::string> ms=getMeshesNames();
5629   std::vector<std::string>::iterator it=std::find(ms.begin(),ms.end(),mname);
5630   if(it==ms.end())
5631     {
5632       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshWithName : Mesh  \"" << mname << "\" does not exist in this ! Existing are : ";
5633       std::copy(ms.begin(),ms.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
5634       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5635     }
5636   return getMeshAtPos((int)std::distance(ms.begin(),it));
5637 }
5638
5639 std::vector<std::string> MEDFileMeshes::getMeshesNames() const
5640 {
5641   std::vector<std::string> ret(_meshes.size());
5642   int i=0;
5643   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5644     {
5645       const MEDFileMeshMultiTS *f=(*it);
5646       if(f)
5647         {
5648           ret[i]=f->getName();
5649         }
5650       else
5651         {
5652           std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::getMeshesNames : At rank #" << i << " mesh is not defined !";
5653           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5654         }
5655     }
5656   return ret;
5657 }
5658
5659 bool MEDFileMeshes::changeNames(const std::vector< std::pair<std::string,std::string> >& modifTab)
5660 {
5661   bool ret=false;
5662   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5663     {
5664       MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5665       if(cur)
5666         ret=cur->changeNames(modifTab) || ret;
5667     }
5668   return ret;
5669 }
5670
5671 void MEDFileMeshes::resize(int newSize)
5672 {
5673   _meshes.resize(newSize);
5674 }
5675
5676 void MEDFileMeshes::pushMesh(MEDFileMesh *mesh)
5677 {
5678   if(!mesh)
5679     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::pushMesh : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5680   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5681   elt->setOneTimeStep(mesh);
5682   _meshes.push_back(elt);
5683 }
5684
5685 void MEDFileMeshes::setMeshAtPos(int i, MEDFileMesh *mesh)
5686 {
5687   if(!mesh)
5688     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshes::setMeshAtPos : invalid input pointer ! should be different from 0 !");
5689   if(i>=(int)_meshes.size())
5690     _meshes.resize(i+1);
5691   MEDFileMeshMultiTS *elt=MEDFileMeshMultiTS::New();
5692   elt->setOneTimeStep(mesh);
5693   _meshes[i]=elt;
5694 }
5695
5696 void MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos(int i)
5697 {
5698   if(i<0 || i>=(int)_meshes.size())
5699     {
5700       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileMeshes::destroyMeshAtPos : Invalid given id in input (" << i << ") should be in [0," << _meshes.size() << ") !";
5701       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5702     }
5703   _meshes.erase(_meshes.begin()+i);
5704 }
5705
5706 void MEDFileMeshes::loadFromFile(const std::string& fileName)
5707 {
5708   std::vector<std::string> ms=MEDLoader::GetMeshNames(fileName);
5709   int i=0;
5710   _meshes.resize(ms.size());
5711   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=ms.begin();it!=ms.end();it++,i++)
5712     _meshes[i]=MEDFileMeshMultiTS::New(fileName,(*it));
5713 }
5714
5715 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes()
5716 {
5717 }
5718
5719 MEDFileMeshes::MEDFileMeshes(const std::string& fileName)
5720 try
5721   {
5722     loadFromFile(fileName);
5723   }
5724 catch(INTERP_KERNEL::Exception& /*e*/)
5725   {
5726   }
5727
5728 MEDFileMeshes *MEDFileMeshes::deepCpy() const
5729 {
5730   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> > meshes(_meshes.size());
5731   std::size_t i=0;
5732   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5733     if((const MEDFileMeshMultiTS *)*it)
5734       meshes[i]=(*it)->deepCpy();
5735   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshes> ret=MEDFileMeshes::New();
5736   ret->_meshes=meshes;
5737   return ret.retn();
5738 }
5739
5740 std::size_t MEDFileMeshes::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
5741 {
5742   return _meshes.capacity()*(sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS>));
5743 }
5744
5745 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshes::getDirectChildren() const
5746 {
5747   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
5748   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++)
5749     {
5750       const MEDFileMeshMultiTS *cur(*it);
5751       if(cur)
5752         ret.push_back(cur);
5753     }
5754   return ret;
5755 }
5756
5757 std::string MEDFileMeshes::simpleRepr() const
5758 {
5759   std::ostringstream oss;
5760   oss << "(*****************)\n(* MEDFileMeshes *)\n(*****************)\n\n";
5761   simpleReprWithoutHeader(oss);
5762   return oss.str();
5763 }
5764
5765 void MEDFileMeshes::simpleReprWithoutHeader(std::ostream& oss) const
5766 {
5767   int nbOfMeshes=getNumberOfMeshes();
5768   oss << "There are " << nbOfMeshes << " meshes with the following names : \n";
5769   std::vector<std::string> mns=getMeshesNames();
5770   for(int i=0;i<nbOfMeshes;i++)
5771     oss << "  - #" << i << " \"" << mns[i] << "\"\n";
5772 }
5773
5774 void MEDFileMeshes::checkCoherency() const
5775 {
5776   static const char MSG[]="MEDFileMeshes::checkCoherency : mesh at rank ";
5777   int i=0;
5778   std::set<std::string> s;
5779   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileMeshMultiTS> >::const_iterator it=_meshes.begin();it!=_meshes.end();it++,i++)
5780     {
5781       const MEDFileMeshMultiTS *elt=(*it);
5782       if(!elt)
5783         {
5784           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << "/" << _meshes.size() << " is empty !";
5785           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5786         }
5787       std::size_t sz=s.size();
5788       s.insert(std::string((*it)->getName()));
5789       if(s.size()==sz)
5790         {
5791           std::ostringstream oss; oss << MSG << i << " has a name (\"" << (*it)->getName() << "\") already used by an another mesh in list !";
5792           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
5793         }
5794     }
5795 }
5796
5797 MEDFileMeshesIterator::MEDFileMeshesIterator(MEDFileMeshes *ms):_ms(ms),_iter_id(0),_nb_iter(0)
5798 {
5799   if(ms)
5800     {
5801       ms->incrRef();
5802       _nb_iter=ms->getNumberOfMeshes();
5803     }
5804 }
5805
5806 MEDFileMeshesIterator::~MEDFileMeshesIterator()
5807 {
5808 }
5809
5810 MEDFileMesh *MEDFileMeshesIterator::nextt()
5811 {
5812   if(_iter_id<_nb_iter)
5813     {
5814       MEDFileMeshes *ms(_ms);
5815       if(ms)
5816         return ms->getMeshAtPos(_iter_id++);
5817       else
5818         return 0;
5819     }
5820   else
5821     return 0;
5822 }