src/MEDLoader/MEDFileFieldOverView.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDFileFieldOverView.hxx"
  22 #include "MEDFileField.hxx"
  23 #include "MEDFileMesh.hxx"
  24
  25 #include "CellModel.hxx"
  26
  27 using namespace ParaMEDMEM;
  28
  29 const unsigned char MEDMeshMultiLev::PARAMEDMEM_2_VTKTYPE[MEDMeshMultiLev::PARAMEDMEM_2_VTKTYPE_LGTH]=
  30   {1,3,21,5,9,7,22,34,23,28,255,255,255,255,10,14,13,255,12,255,24,255,16,27,255,26,255,29,255,255,25,42,255,4};
  31
  32 const char MEDFileField1TSStructItem2::NEWLY_CREATED_PFL_NAME[]="???";
  33
  34 MEDFileMeshStruct *MEDFileMeshStruct::New(const MEDFileMesh *mesh)
  35 {
  36   return new MEDFileMeshStruct(mesh);
  37 }
  38
  39 std::size_t MEDFileMeshStruct::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  40 {
  41   std::size_t ret(0);
  42   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it0=_geo_types_distrib.begin();it0!=_geo_types_distrib.end();it0++)
  43     ret+=(*it0).capacity()*sizeof(int);
  44   ret+=_geo_types_distrib.capacity()*sizeof(std::vector<int>);
  45   return ret;
  46 }
  47
  48 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileMeshStruct::getDirectChildren() const
  49 {
  50   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
  51 }
  52
  53 MEDFileMeshStruct::MEDFileMeshStruct(const MEDFileMesh *mesh):_mesh(mesh)
  54 {
  55   std::vector<int> levs=mesh->getNonEmptyLevels();
  56   _name=mesh->getName();
  57   _nb_nodes=mesh->getNumberOfNodes();
  58   _geo_types_distrib.resize(levs.size());
  59   for(std::vector<int>::const_iterator lev=levs.begin();lev!=levs.end();lev++)
  60     _geo_types_distrib[-(*lev)]=mesh->getDistributionOfTypes(*lev);
  61 }
  62
  63 int MEDFileMeshStruct::getLevelOfGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t) const
  64 {
  65   int j=0;
  66   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=_geo_types_distrib.begin();it1!=_geo_types_distrib.end();it1++,j--)
  67     {
  68       std::size_t sz=(*it1).size();
  69       if(sz%3!=0)
  70         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::getLevelOfGeoType : internal error in code !");
  71       std::size_t nbGeo=sz/3;
  72       for(std::size_t i=0;i<nbGeo;i++)
  73         if((*it1)[3*i]==(int)t)
  74           return j;
  75     }
  76   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::getLevelOfGeoType : The specified geometric type is not present in the mesh structure !");
  77 }
  78
  79 int MEDFileMeshStruct::getNumberOfElemsOfGeoType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t) const
  80 {
  81   for(std::vector< std::vector<int> >::const_iterator it1=_geo_types_distrib.begin();it1!=_geo_types_distrib.end();it1++)
  82     {
  83       std::size_t sz=(*it1).size();
  84       if(sz%3!=0)
  85         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::getNumberOfElemsOfGeoType : internal error in code !");
  86       std::size_t nbGeo=sz/3;
  87       for(std::size_t i=0;i<nbGeo;i++)
  88         if((*it1)[3*i]==(int)t)
  89           return (*it1)[3*i+1];
  90     }
  91   throw INTERP_KERNEL::Exception("The specified geometric type is not present in the mesh structure !");
  92 }
  93
  94 int MEDFileMeshStruct::getNumberOfLevs() const
  95 {
  96   return (int)_geo_types_distrib.size();
  97 }
  98
  99 int MEDFileMeshStruct::getNumberOfGeoTypesInLev(int relativeLev) const
 100 {
 101   int pos(-relativeLev);
 102   if(pos<0 || pos>=(int)_geo_types_distrib.size())
 103     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::getNumberOfGeoTypesInLev : invalid level specified !");
 104   std::size_t sz=_geo_types_distrib[pos].size();
 105   if(sz%3!=0)
 106     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileMeshStruct::getNumberOfGeoTypesInLev : internal error in code !");
 107   return (int)(sz/3);
 108 }
 109
 110 //=
 111
 112 std::size_t MEDMeshMultiLev::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 113 {
 114   return 0;
 115 }
 116
 117 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDMeshMultiLev::getDirectChildren() const
 118 {
 119   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
 120 }
 121
 122 MEDMeshMultiLev *MEDMeshMultiLev::New(const MEDFileMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 123 {
 124   if(!m)
 125     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::New : null input pointer !");
 126   const MEDFileUMesh *um(dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(m));
 127   if(um)
 128     return MEDUMeshMultiLev::New(um,levs);
 129   const MEDFileCMesh *cm(dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(m));
 130   if(cm)
 131     return MEDCMeshMultiLev::New(cm,levs);
 132   const MEDFileCurveLinearMesh *clm(dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(m));
 133   if(clm)
 134     return MEDCurveLinearMeshMultiLev::New(clm,levs);
 135   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::New : unrecognized type of mesh ! Must be in [MEDFileUMesh,MEDFileCMesh,MEDFileCurveLinearMesh] !");
 136 }
 137
 138 MEDMeshMultiLev *MEDMeshMultiLev::New(const MEDFileMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities)
 139 {
 140   if(!m)
 141     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::New 2 : null input pointer !");
 142   const MEDFileUMesh *um(dynamic_cast<const MEDFileUMesh *>(m));
 143   if(um)
 144     return MEDUMeshMultiLev::New(um,gts,pfls,nbEntities);
 145   const MEDFileCMesh *cm(dynamic_cast<const MEDFileCMesh *>(m));
 146   if(cm)
 147     return MEDCMeshMultiLev::New(cm,gts,pfls,nbEntities);
 148   const MEDFileCurveLinearMesh *clm(dynamic_cast<const MEDFileCurveLinearMesh *>(m));
 149   if(clm)
 150     return MEDCurveLinearMeshMultiLev::New(clm,gts,pfls,nbEntities);
 151   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::New 2 : unrecognized type of mesh ! Must be in [MEDFileUMesh,MEDFileCMesh,MEDFileCurveLinearMesh] !");
 152 }
 153
 154 MEDMeshMultiLev *MEDMeshMultiLev::NewOnlyOnNode(const MEDFileMesh *m, const DataArrayInt *pflOnNode)
 155 {
 156   std::vector<int> levs(1,0);
 157   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDMeshMultiLev> ret(MEDMeshMultiLev::New(m,levs));
 158   ret->selectPartOfNodes(pflOnNode);
 159   return ret.retn();
 160 }
 161
 162 void MEDMeshMultiLev::setNodeReduction(const DataArrayInt *nr)
 163 {
 164   if(nr)
 165     nr->incrRef();
 166   _node_reduction=const_cast<DataArrayInt*>(nr);
 167 }
 168
 169 bool MEDMeshMultiLev::isFastlyTheSameStruct(const MEDFileField1TSStructItem& fst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
 170 {
 171   if(fst.getType()==ON_NODES)
 172     {
 173       if(fst.getNumberOfItems()!=1)
 174         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::isFastlyTheSameStruct : unexpected situation for nodes !");
 175       const MEDFileField1TSStructItem2& p(fst[0]);
 176       std::string pflName(p.getPflName());
 177       const DataArrayInt *nr(_node_reduction);
 178       if(pflName.empty() && !nr)
 179         return true;
 180       if(pflName==nr->getName())
 181         return true;
 182       return false;
 183     }
 184   else
 185     {
 186       std::size_t sz(fst.getNumberOfItems());
 187       if(sz!=_geo_types.size())
 188         return false;
 189       int strt(0);
 190       for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 191         {
 192           const MEDFileField1TSStructItem2& p(fst[i]);
 193           if(!p.isFastlyEqual(strt,_geo_types[i],getPflNameOfId(i).c_str()))
 194             return false;
 195         }
 196       return true;
 197     }
 198 }
 199
 200 DataArray *MEDMeshMultiLev::buildDataArray(const MEDFileField1TSStructItem& fst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, const DataArray *vals) const
 201 {
 202   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> ret(const_cast<DataArray *>(vals)); ret->incrRef();
 203   if(isFastlyTheSameStruct(fst,globs))
 204     return ret.retn();
 205   else
 206     return constructDataArray(fst,globs,vals);
 207 }
 208
 209 std::string MEDMeshMultiLev::getPflNameOfId(int id) const
 210 {
 211   std::size_t sz(_pfls.size());
 212   if(id<0 || id>=(int)sz)
 213     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::getPflNameOfId : invalid input id !");
 214   const DataArrayInt *pfl(_pfls[id]);
 215   if(!pfl)
 216     return std::string("");
 217   return pfl->getName();
 218 }
 219
 220 /*!
 221  * Returns the number of cells having geometric type \a t.
 222  * The profiles are **NOT** taken into account here.
 223  */
 224 int MEDMeshMultiLev::getNumberOfCells(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t) const
 225 {
 226   std::size_t sz(_nb_entities.size());
 227   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 228     if(_geo_types[i]==t)
 229         return _nb_entities[i];
 230   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::getNumberOfCells : not existing geometric type in this !");
 231 }
 232
 233 int MEDMeshMultiLev::getNumberOfNodes() const
 234 {
 235   return _nb_nodes;
 236 }
 237
 238 DataArray *MEDMeshMultiLev::constructDataArray(const MEDFileField1TSStructItem& fst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs, const DataArray *vals) const
 239 {
 240   if(fst.getType()==ON_NODES)
 241     {
 242       if(fst.getNumberOfItems()!=1)
 243         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for nodes !");
 244       const MEDFileField1TSStructItem2& p(fst[0]);
 245       std::string pflName(p.getPflName());
 246       const DataArrayInt *nr(_node_reduction);
 247       if(pflName.empty() && !nr)
 248         return vals->deepCpy();
 249       if(pflName.empty() && nr)
 250          throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for nodes 2 !");
 251       if(!pflName.empty() && nr)
 252         {
 253           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p1(globs->getProfile(pflName.c_str())->deepCpy());
 254           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p2(nr->deepCpy());
 255           p1->sort(true); p2->sort(true);
 256           if(!p1->isEqualWithoutConsideringStr(*p2))
 257             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for nodes 3 !");
 258           p1=DataArrayInt::FindPermutationFromFirstToSecond(globs->getProfile(pflName.c_str()),nr);
 259           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> ret(vals->deepCpy());
 260           ret->renumberInPlace(p1->begin());
 261           return ret.retn();
 262         }
 263       if(!pflName.empty() && !nr)
 264         {
 265           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p1(globs->getProfile(pflName.c_str())->deepCpy());
 266           p1->sort(true);
 267           if(!p1->isIdentity() || p1->getNumberOfTuples()!=getNumberOfNodes())
 268             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for nodes 4 !");
 269           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> ret(vals->deepCpy());
 270           ret->renumberInPlace(globs->getProfile(pflName.c_str())->begin());
 271           return ret.retn();
 272         }
 273       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for nodes 5 !");
 274     }
 275   else
 276     {
 277       std::size_t sz(fst.getNumberOfItems());
 278       std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> s(_geo_types.begin(),_geo_types.end());
 279       if(s.size()!=_geo_types.size())
 280         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for cells 2 !");
 281       std::vector< const DataArray *> arr(s.size());
 282       std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> > arrSafe(s.size());
 283       int iii(0);
 284       int nc(vals->getNumberOfComponents());
 285       std::vector<std::string> compInfo(vals->getInfoOnComponents());
 286       for(std::vector< INTERP_KERNEL::NormalizedCellType >::const_iterator it=_geo_types.begin();it!=_geo_types.end();it++,iii++)
 287         {
 288           const DataArrayInt *thisP(_pfls[iii]);
 289           std::vector<const MEDFileField1TSStructItem2 *> ps;
 290           for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 291             {
 292               const MEDFileField1TSStructItem2& p(fst[i]);
 293               if(p.getGeo()==*it)
 294                 ps.push_back(&p);
 295             }
 296           if(ps.empty())
 297             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for cells 1 !");
 298           if(ps.size()==1)
 299             {
 300               int nbi(ps[0]->getNbOfIntegrationPts(globs));
 301               const DataArrayInt *otherP(ps[0]->getPfl(globs));
 302               const std::pair<int,int>& strtStop(ps[0]->getStartStop());
 303               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> ret(vals->selectByTupleId2(strtStop.first,strtStop.second,1));
 304               if(!thisP && !otherP)
 305                 {
 306                   arrSafe[iii]=ret; arr[iii]=ret;
 307                   continue;
 308                 }
 309               if(thisP && otherP)
 310                 {
 311                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p1(otherP->invertArrayN2O2O2N(getNumberOfCells(ps[0]->getGeo())));
 312                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p2(thisP->deepCpy());
 313                   p2->transformWithIndArr(p1->begin(),p1->end());
 314                   //p1=p2->getIdsNotEqual(-1);
 315                   //p1=p2->selectByTupleIdSafe(p1->begin(),p1->end());
 316                   ret->rearrange(nbi*nc); ret=ret->selectByTupleIdSafe(p2->begin(),p2->end()); ret->rearrange(nc); ret->setInfoOnComponents(compInfo);
 317                   arrSafe[iii]=ret; arr[iii]=ret;
 318                   continue;
 319                 }
 320               if(!thisP && otherP)
 321                 {
 322                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p1(otherP->deepCpy());
 323                   p1->sort(true);
 324                   p1->checkAllIdsInRange(0,getNumberOfCells(ps[0]->getGeo()));
 325                   p1=DataArrayInt::FindPermutationFromFirstToSecond(otherP,p1);
 326                   ret->rearrange(nbi*nc); ret->renumberInPlace(p1->begin()); ret->rearrange(nc); ret->setInfoOnComponents(compInfo);
 327                   arrSafe[iii]=ret; arr[iii]=ret;
 328                   continue;
 329                 }
 330               throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for cells 3 !");
 331             }
 332           else
 333             {
 334               std::vector< const DataArrayInt * >otherPS(ps.size());
 335               std::vector< const DataArray * > arr2(ps.size());
 336               std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> > arr2Safe(ps.size());
 337               std::vector< const DataArrayInt * > nbis(ps.size());
 338               std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > nbisSafe(ps.size());
 339               int jj(0);
 340               for(std::vector<const MEDFileField1TSStructItem2 *>::const_iterator it2=ps.begin();it2!=ps.end();it2++,jj++)
 341                 {
 342                   int nbi((*it2)->getNbOfIntegrationPts(globs));
 343                   const DataArrayInt *otherPfl((*it2)->getPfl(globs));
 344                   const std::pair<int,int>& strtStop((*it2)->getStartStop());
 345                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> ret2(vals->selectByTupleId2(strtStop.first,strtStop.second,1));
 346                   if(!otherPfl)
 347                     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::constructDataArray : unexpected situation for cells 4 !");
 348                   arr2[jj]=ret2; arr2Safe[jj]=ret2; otherPS[jj]=otherPfl;
 349                   nbisSafe[jj]=DataArrayInt::New(); nbisSafe[jj]->alloc(otherPfl->getNumberOfTuples(),1); nbisSafe[jj]->fillWithValue(nbi);
 350                   nbis[jj]=nbisSafe[jj];
 351                 }
 352               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> arr3(DataArray::Aggregate(arr2));
 353               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> otherP(DataArrayInt::Aggregate(otherPS));
 354               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> zenbis(DataArrayInt::Aggregate(nbis));
 355               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> otherPN(otherP->invertArrayN2O2O2N(getNumberOfCells(*it)));
 356               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p1;
 357               if(thisP)
 358                 p1=DataArrayInt::FindPermutationFromFirstToSecond(otherP,thisP);
 359               else
 360                 p1=otherP->deepCpy();
 361               MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> zenbisN(zenbis->renumber(p1->begin()));
 362               zenbisN->computeOffsets2();
 363               jj=0;
 364               for(std::vector<const MEDFileField1TSStructItem2 *>::const_iterator it2=ps.begin();it2!=ps.end();it2++,jj++)
 365                 {
 366                   //int nbi((*it2)->getNbOfIntegrationPts(globs));
 367                   const DataArrayInt *otherPfl((*it2)->getPfl(globs));
 368                   const std::pair<int,int>& strtStop((*it2)->getStartStop());
 369                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArray> ret2(vals->selectByTupleId2(strtStop.first,strtStop.second,1));
 370                   //
 371                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p2(otherPfl->deepCpy());
 372                   p2->transformWithIndArr(otherPN->begin(),otherPN->end());
 373                   p2->transformWithIndArr(p1->begin(),p1->end());
 374                   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> idsN(p2->buildExplicitArrByRanges(zenbisN));
 375                   arr3->setPartOfValuesBase3(ret2,idsN->begin(),idsN->end(),0,nc,1);
 376                 }
 377               arrSafe[iii]=arr3; arr[iii]=arr3;
 378               continue;
 379             }
 380         }
 381       return DataArray::Aggregate(arr);
 382     }
 383 }
 384
 385 MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev()
 386 {
 387 }
 388
 389 MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(int nbNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):_geo_types(gts),_nb_entities(nbEntities),_nb_nodes(nbNodes)
 390 {
 391   std::size_t sz(_geo_types.size());
 392   if(sz!=pfls.size() || sz!=nbEntities.size())
 393     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev : input vector must have the same size !");
 394   _pfls.resize(sz);
 395   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 396     {
 397       if(pfls[i])
 398         pfls[i]->incrRef();
 399       _pfls[i]=const_cast<DataArrayInt *>(pfls[i]);
 400     }
 401 }
 402
 403 MEDMeshMultiLev::MEDMeshMultiLev(const MEDMeshMultiLev& other):RefCountObject(other),_pfls(other._pfls),_geo_types(other._geo_types),_nb_entities(other._nb_entities),_node_reduction(other._node_reduction),_nb_nodes(other._nb_nodes)
 404 {
 405 }
 406
 407 //=
 408
 409 MEDUMeshMultiLev *MEDUMeshMultiLev::New(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 410 {
 411   return new MEDUMeshMultiLev(m,levs);
 412 }
 413
 414 MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 415 {
 416   if(!m)
 417     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev constructor : null input pointer !");
 418   std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> v;
 419   for(std::vector<int>::const_iterator it=levs.begin();it!=levs.end();it++)
 420     {
 421       std::vector<MEDCoupling1GTUMesh *> vTmp(m->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMeshes(*it));
 422       v.insert(v.end(),vTmp.begin(),vTmp.end());
 423     }
 424   std::size_t sz(v.size());
 425   _parts.resize(sz);
 426   _pfls.resize(sz);
 427   _geo_types.resize(sz);
 428   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 429     {
 430       MEDCoupling1GTUMesh *obj(v[i]);
 431       if(obj)
 432         obj->incrRef();
 433       else
 434         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev constructor : presence of a null pointer !");
 435       _parts[i]=obj;
 436       _geo_types[i]=obj->getCellModelEnum();
 437     }
 438 }
 439
 440 MEDUMeshMultiLev *MEDUMeshMultiLev::New(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities)
 441 {
 442   return new MEDUMeshMultiLev(m,gts,pfls,nbEntities);
 443 }
 444
 445 MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDFileUMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDMeshMultiLev(m->getNumberOfNodes(),gts,pfls,nbEntities)
 446 {
 447   std::size_t sz(gts.size());
 448   _parts.resize(sz);
 449   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 450     {
 451       MEDCoupling1GTUMesh *elt(m->getDirectUndergroundSingleGeoTypeMesh(gts[i]));
 452       if(elt)
 453         elt->incrRef();
 454       _parts[i]=elt;
 455     }
 456 }
 457
 458 void MEDUMeshMultiLev::selectPartOfNodes(const DataArrayInt *pflNodes)
 459 {
 460    if(!pflNodes || !pflNodes->isAllocated())
 461      return ;
 462    std::size_t sz(_parts.size());
 463    std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > a(sz);
 464    std::vector< const DataArrayInt *> aa(sz);
 465    for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 466      {
 467
 468        const DataArrayInt *pfl(_pfls[i]);
 469        MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m(_parts[i]);
 470        if(pfl)
 471          m=dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(_parts[i]->buildPartOfMySelfKeepCoords(pfl->begin(),pfl->end()));
 472        DataArrayInt *cellIds=0;
 473        m->fillCellIdsToKeepFromNodeIds(pflNodes->begin(),pflNodes->end(),true,cellIds);
 474        MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellIdsSafe(cellIds);
 475        MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingPointSet> m2(m->buildPartOfMySelfKeepCoords(cellIds->begin(),cellIds->end()));
 476        int tmp=-1;
 477        MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2n(m2->getNodeIdsInUse(tmp));
 478        a[i]=o2n->invertArrayO2N2N2O(tmp); aa[i]=a[i];
 479        if(pfl)
 480          _pfls[i]=pfl->selectByTupleIdSafe(cellIds->begin(),cellIds->end());
 481        else
 482          _pfls[i]=cellIdsSafe;
 483      }
 484    _node_reduction=DataArrayInt::Aggregate(aa);
 485    _node_reduction->sort(true);
 486    _node_reduction=_node_reduction->buildUnique();
 487 }
 488
 489 MEDMeshMultiLev *MEDUMeshMultiLev::prepare() const
 490 {
 491   return new MEDUMeshMultiLev(*this);
 492 }
 493
 494 MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDUMeshMultiLev& other):MEDMeshMultiLev(other),_parts(other._parts)
 495 {
 496 }
 497
 498 MEDUMeshMultiLev::MEDUMeshMultiLev(const MEDStructuredMeshMultiLev& other, const MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh>& part):MEDMeshMultiLev(other)
 499 {
 500   _parts.resize(1);
 501   _parts[0]=part;
 502   _geo_types.resize(1); _geo_types[0]=part->getCellModelEnum();
 503   _nb_entities.resize(1); _nb_entities[0]=part->getNumberOfCells();
 504   _pfls.resize(1); _pfls[0]=0;
 505 }
 506
 507 void MEDUMeshMultiLev::buildVTUArrays(DataArrayDouble *& coords, DataArrayByte *&types, DataArrayInt *&cellLocations, DataArrayInt *& cells, DataArrayInt *&faceLocations, DataArrayInt *&faces) const
 508 {
 509   if(_parts.empty())
 510     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : empty array !");
 511   if(!(const MEDCoupling1GTUMesh *)_parts[0])
 512     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : first part is null !");
 513   const DataArrayDouble *tmp(_parts[0]->getCoords());
 514   if(!tmp)
 515     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : the coordinates are null !");
 516   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> a(const_cast<DataArrayDouble *>(tmp)); tmp->incrRef();
 517   int szBCE(0),szD(0),szF(0);
 518   bool isPolyh(false);
 519   int iii(0);
 520   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_parts.begin();it!=_parts.end();it++,iii++)
 521     {
 522       const MEDCoupling1GTUMesh *cur(*it);
 523       if(!cur)
 524         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : a part is null !");
 525       //
 526       const DataArrayInt *pfl(_pfls[iii]);
 527       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> cur2;
 528       if(!pfl)
 529         { cur2=const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(cur); cur2->incrRef(); }
 530       else
 531         { cur2=dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(cur->buildPartOfMySelfKeepCoords(pfl->begin(),pfl->end())); cur=cur2; }
 532       //
 533       int curNbCells(cur->getNumberOfCells());
 534       szBCE+=curNbCells;
 535       if((*it)->getCellModelEnum()!=INTERP_KERNEL::NORM_POLYHED)
 536         szD+=cur->getNodalConnectivity()->getNumberOfTuples()+curNbCells;
 537       else
 538         {
 539           isPolyh=true;
 540           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp2(cur->computeEffectiveNbOfNodesPerCell());
 541           szD+=tmp2->accumulate(0)+curNbCells;
 542           szF+=2*curNbCells+cur->getNodalConnectivity()->getNumberOfTuples();
 543         }
 544     }
 545   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayByte> b(DataArrayByte::New()); b->alloc(szBCE,1); char *bPtr(b->getPointer());
 546   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> c(DataArrayInt::New()); c->alloc(szBCE,1); int *cPtr(c->getPointer());
 547   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> d(DataArrayInt::New()); d->alloc(szD,1); int *dPtr(d->getPointer());
 548   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> e(DataArrayInt::New()),f(DataArrayInt::New()); int *ePtr(0),*fPtr(0);
 549   if(isPolyh)
 550     { e->alloc(szBCE,1); ePtr=e->getPointer(); f->alloc(szF,1); fPtr=f->getPointer(); }
 551   int k(0);
 552   iii=0;
 553   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> >::const_iterator it=_parts.begin();it!=_parts.end();it++,iii++)
 554     {
 555       const MEDCoupling1GTUMesh *cur(*it);
 556       //
 557       const DataArrayInt *pfl(_pfls[iii]);
 558       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> cur2;
 559       if(!pfl)
 560         { cur2=const_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(cur); cur2->incrRef(); }
 561       else
 562         { cur2=dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(cur->buildPartOfMySelfKeepCoords(pfl->begin(),pfl->end())); cur=cur2; }
 563       //
 564       int curNbCells(cur->getNumberOfCells());
 565       int gt((int)cur->getCellModelEnum());
 566       if(gt<0 || gt>=PARAMEDMEM_2_VTKTYPE_LGTH)
 567         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : invalid geometric type !");
 568       unsigned char gtvtk(PARAMEDMEM_2_VTKTYPE[gt]);
 569       if(gtvtk==255)
 570         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : no VTK type for the requested INTERP_KERNEL geometric type !");
 571       std::fill(bPtr,bPtr+curNbCells,gtvtk); bPtr+=curNbCells;
 572       const MEDCoupling1SGTUMesh *scur(dynamic_cast<const MEDCoupling1SGTUMesh *>(cur));
 573       const MEDCoupling1DGTUMesh *dcur(dynamic_cast<const MEDCoupling1DGTUMesh *>(cur));
 574       const int *connPtr(cur->getNodalConnectivity()->begin());
 575       if(!scur && !dcur)
 576         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::getVTUArrays : internal error !");
 577       if(scur)
 578         {
 579           int nnpc(scur->getNumberOfNodesPerCell());
 580           for(int i=0;i<curNbCells;i++,connPtr+=nnpc)
 581             {
 582               *dPtr++=nnpc;
 583               dPtr=std::copy(connPtr,connPtr+nnpc,dPtr);
 584               *cPtr=k+nnpc; k=*cPtr++;
 585             }
 586           if(isPolyh)
 587             { std::fill(ePtr,ePtr+curNbCells,-1); ePtr+=curNbCells; }
 588         }
 589       else
 590         {
 591           const int *connIPtr(dcur->getNodalConnectivityIndex()->begin());
 592           if(cur->getCellModelEnum()!=INTERP_KERNEL::NORM_POLYHED)
 593             {
 594               for(int i=0;i<curNbCells;i++,connIPtr++)
 595                 {
 596                   *dPtr++=connIPtr[1]-connIPtr[0];
 597                   dPtr=std::copy(connPtr+connIPtr[0],connPtr+connIPtr[1],dPtr);
 598                   *cPtr=k+connIPtr[1]-connIPtr[0]; k=*cPtr++;
 599                 }
 600             }
 601           else
 602             {
 603               for(int i=0;i<curNbCells;i++,connIPtr++)
 604                 {
 605                   std::set<int> s(connPtr+connIPtr[0],connPtr+connIPtr[1]); s.erase(-1);
 606                   *dPtr++=(int)s.size();
 607                   dPtr=std::copy(s.begin(),s.end(),dPtr);
 608                   *cPtr=k+(int)s.size(); k=*cPtr++;
 609                 }
 610             }
 611           if(isPolyh)
 612             {
 613               connIPtr=dcur->getNodalConnectivityIndex()->begin();
 614               if(cur->getCellModelEnum()!=INTERP_KERNEL::NORM_POLYHED)
 615                 { std::fill(ePtr,ePtr+curNbCells,-1); ePtr+=curNbCells; }
 616               else
 617                 {
 618                   int kk(0);
 619                   for(int i=0;i<curNbCells;i++,connIPtr++)
 620                     {
 621                       int nbFace(std::count(connPtr+connIPtr[0],connPtr+connIPtr[1],-1)+1);
 622                       *fPtr++=nbFace;
 623                       const int *work(connPtr+connIPtr[0]);
 624                       for(int j=0;j<nbFace;j++)
 625                         {
 626                           const int *work2=std::find(work,connPtr+connIPtr[1],-1);
 627                           *fPtr++=std::distance(work,work2);
 628                           fPtr=std::copy(work,work2,fPtr);
 629                           work=work2+1;
 630                         }
 631                       *ePtr++=kk; kk+=connIPtr[1]-connIPtr[0]+2;
 632                     }
 633                 }
 634             }
 635         }
 636     }
 637   if(!isPolyh)
 638     reorderNodesIfNecessary(a,d,0);
 639   else
 640     reorderNodesIfNecessary(a,d,f);
 641   coords=a.retn(); types=b.retn(); cellLocations=c.retn(); cells=d.retn();
 642   if(!isPolyh)
 643     { faceLocations=0; faces=0; }
 644   else
 645     { faceLocations=e.retn(); faces=f.retn(); }
 646 }
 647
 648 void MEDUMeshMultiLev::reorderNodesIfNecessary(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble>& coords, DataArrayInt *nodalConnVTK, DataArrayInt *polyhedNodalConnVTK) const
 649 {
 650   const DataArrayInt *nr(_node_reduction);
 651   if(!nr)
 652     return ;
 653   int sz(coords->getNumberOfTuples());
 654   std::vector<bool> b(sz,false);
 655   const int *work(nodalConnVTK->begin()),*endW(nodalConnVTK->end());
 656   while(work!=endW)
 657     {
 658       int nb(*work++);
 659       for(int i=0;i<nb && work!=endW;i++,work++)
 660         {
 661           if(*work>=0 && *work<sz)
 662             b[*work]=true;
 663           else
 664             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::reorderNodesIfNecessary : internal error !");
 665         }
 666     }
 667   if(polyhedNodalConnVTK)
 668     {
 669       work=polyhedNodalConnVTK->begin(); endW=polyhedNodalConnVTK->end();
 670       while(work!=endW)
 671         {
 672           int nb(*work++);
 673           for(int i=0;i<nb && work!=endW;i++)
 674             {
 675               int nb2(*work++);
 676               for(int j=0;j<nb2 && work!=endW;j++,work++)
 677                 {
 678                   if(*work>=0 && *work<sz)
 679                     b[*work]=true;
 680                   else
 681                     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::reorderNodesIfNecessary : internal error #2 !");
 682                 }
 683             }
 684         }
 685     }
 686   int szExp(std::count(b.begin(),b.end(),true));
 687   if(szExp!=nr->getNumberOfTuples())
 688     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDUMeshMultiLev::reorderNodesIfNecessary : internal error #3 !");
 689   // Go renumbering !
 690   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> o2n(DataArrayInt::New()); o2n->alloc(sz,1);
 691   int *o2nPtr(o2n->getPointer());
 692   int newId(0);
 693   for(int i=0;i<sz;i++,o2nPtr++)
 694     if(b[i]) *o2nPtr=newId++; else *o2nPtr=-1;
 695   const int *o2nPtrc(o2n->begin());
 696   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> n2o(o2n->invertArrayO2N2N2O(nr->getNumberOfTuples()));
 697   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> perm(DataArrayInt::FindPermutationFromFirstToSecond(n2o,nr));
 698   const int *permPtr(perm->begin());
 699   int *work2(nodalConnVTK->getPointer()),*endW2(nodalConnVTK->getPointer()+nodalConnVTK->getNumberOfTuples());
 700   while(work2!=endW2)
 701     {
 702       int nb(*work2++);
 703       for(int i=0;i<nb && work2!=endW2;i++,work2++)
 704         *work2=permPtr[o2nPtrc[*work2]];
 705     }
 706   if(polyhedNodalConnVTK)
 707     {
 708       work2=polyhedNodalConnVTK->getPointer(); endW2=polyhedNodalConnVTK->getPointer()+polyhedNodalConnVTK->getNumberOfTuples();
 709       while(work2!=endW2)
 710         {
 711           int nb(*work2++);
 712           for(int i=0;i<nb && work2!=endW2;i++)
 713             {
 714               int nb2(*work2++);
 715               for(int j=0;j<nb2 && work2!=endW2;j++,work2++)
 716                 *work2=permPtr[o2nPtrc[*work2]];
 717             }
 718         }
 719     }
 720   coords=(coords->selectByTupleIdSafe(nr->begin(),nr->end()));
 721 }
 722
 723 //=
 724
 725 MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev()
 726 {
 727 }
 728
 729 MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(int nbOfNodes, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDMeshMultiLev(nbOfNodes,gts,pfls,nbEntities)
 730 {
 731 }
 732
 733 void MEDStructuredMeshMultiLev::selectPartOfNodes(const DataArrayInt *pflNodes)
 734 {
 735   if(!pflNodes || !pflNodes->isAllocated())
 736     return ;
 737   std::vector<int> ngs(getNodeGridStructure());
 738   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity(&ngs[0],&ngs[0]+ngs.size()));
 739   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> m(MEDCoupling1SGTUMesh::New("",MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(ngs.size())));
 740   m->setNodalConnectivity(conn);
 741   const DataArrayInt *pfl(_pfls[0]);
 742   if(pfl)
 743     {
 744       m=dynamic_cast<MEDCoupling1SGTUMesh *>(m->buildPartOfMySelfKeepCoords(pfl->begin(),pfl->end()));
 745     }
 746   DataArrayInt *cellIds=0;
 747   m->fillCellIdsToKeepFromNodeIds(pflNodes->begin(),pflNodes->end(),true,cellIds);
 748   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cellIdsSafe(cellIds);
 749   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingPointSet> m2(m->buildPartOfMySelfKeepCoords(cellIds->begin(),cellIds->end()));
 750   int tmp=-1;
 751   _node_reduction=m2->getNodeIdsInUse(tmp);
 752   if(pfl)
 753     _pfls[0]=pfl->selectByTupleIdSafe(cellIds->begin(),cellIds->end());
 754   else
 755     _pfls[0]=cellIdsSafe;
 756 }
 757
 758 MEDStructuredMeshMultiLev::MEDStructuredMeshMultiLev(const MEDStructuredMeshMultiLev& other):MEDMeshMultiLev(other)
 759 {
 760 }
 761
 762 //=
 763
 764 MEDCMeshMultiLev *MEDCMeshMultiLev::New(const MEDFileCMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 765 {
 766   return new MEDCMeshMultiLev(m,levs);
 767 }
 768
 769 MEDCMeshMultiLev *MEDCMeshMultiLev::New(const MEDFileCMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities)
 770 {
 771   return new MEDCMeshMultiLev(m,gts,pfls,nbEntities);
 772 }
 773
 774 MEDCMeshMultiLev::MEDCMeshMultiLev(const MEDFileCMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 775 {
 776   if(!m)
 777     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor : null input pointer !");
 778   if(levs.size()!=1 || levs[0]!=0)
 779     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor : levels supported is 0 only !");
 780   int mdim(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(m->getMeshDimension()));
 781   _coords.resize(mdim);
 782   for(int i=0;i<mdim;i++)
 783     {
 784       DataArrayDouble *elt(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoordsAt(i)));
 785       if(!elt)
 786         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : presence of null pointer for an vector of double along an axis !");
 787       _coords[i]=elt;
 788     }
 789 }
 790
 791 MEDCMeshMultiLev::MEDCMeshMultiLev(const MEDFileCMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDStructuredMeshMultiLev(m->getNumberOfNodes(),gts,pfls,nbEntities)
 792 {
 793   if(!m)
 794     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : null input pointer !");
 795   if(gts.size()!=1 || pfls.size()!=1)
 796     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : lengthes of gts and pfls must be equal to one !");
 797   int mdim(m->getMeshDimension());
 798   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(mdim));
 799   if(gt!=gts[0])
 800     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : the unique geo type is invalid regarding meshdim !");
 801   _coords.resize(mdim);
 802   for(int i=0;i<mdim;i++)
 803     {
 804       DataArrayDouble *elt(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoordsAt(i)));
 805       if(!elt)
 806         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCMeshMultiLev constructor 2 : presence of null pointer for an vector of double along an axis !");
 807       _coords[i]=elt; _coords[i]->incrRef();
 808     }
 809 }
 810
 811 MEDCMeshMultiLev::MEDCMeshMultiLev(const MEDCMeshMultiLev& other):MEDStructuredMeshMultiLev(other),_coords(other._coords)
 812 {
 813 }
 814
 815 std::vector<int> MEDCMeshMultiLev::getNodeGridStructure() const
 816 {
 817   std::vector<int> ret(_coords.size());
 818   for(std::size_t i=0;i<_coords.size();i++)
 819     ret[i]=_coords[i]->getNumberOfTuples();
 820   return ret;
 821 }
 822
 823 MEDMeshMultiLev *MEDCMeshMultiLev::prepare() const
 824 {
 825   const DataArrayInt *pfl(_pfls[0]),*nr(_node_reduction);
 826   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nnr;
 827   std::vector<int> cgs,ngs(getNodeGridStructure());
 828   cgs.resize(ngs.size());
 829   std::transform(ngs.begin(),ngs.end(),cgs.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),-1));
 830   if(pfl)
 831     {
 832       std::vector< std::pair<int,int> > cellParts;
 833       if(MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured(pfl->begin(),pfl->end(),cgs,cellParts))
 834         {
 835           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCMeshMultiLev> ret(new MEDCMeshMultiLev(*this));
 836           if(nr)
 837             { nnr=nr->deepCpy(); nnr->sort(true); ret->setNodeReduction(nnr); }
 838           ret->_nb_entities[0]=pfl->getNumberOfTuples();
 839           ret->_pfls[0]=0;
 840           std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> > coords(_coords.size());
 841           for(std::size_t i=0;i<_coords.size();i++)
 842             coords[i]=_coords[i]->selectByTupleId2(cellParts[i].first,cellParts[i].second+1,1);
 843           ret->_coords=coords;
 844           return ret.retn();
 845         }
 846       else
 847         {
 848           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCMesh> m(MEDCouplingCMesh::New());
 849           for(std::size_t i=0;i<ngs.size();i++)
 850             m->setCoordsAt(i,_coords[i]);
 851           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> m2(m->build1SGTUnstructured());
 852           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m3=dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(m2->buildPartOfMySelfKeepCoords(pfl->begin(),pfl->end()));
 853           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDUMeshMultiLev> ret(new MEDUMeshMultiLev(*this,m3));
 854           if(nr)
 855             { m3->zipCoords(); nnr=nr->deepCpy(); nnr->sort(true); ret->setNodeReduction(nnr); }
 856           return ret.retn();
 857         }
 858     }
 859   else
 860     {
 861       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCMeshMultiLev> ret(new MEDCMeshMultiLev(*this));
 862       if(nr)
 863         { nnr=nr->deepCpy(); nnr->sort(true); ret->setNodeReduction(nnr); }
 864       return ret.retn();
 865     }
 866 }
 867
 868 std::vector< DataArrayDouble * > MEDCMeshMultiLev::buildVTUArrays() const
 869 {
 870   std::size_t sz(_coords.size());
 871   std::vector< DataArrayDouble * > ret(sz);
 872   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
 873     {
 874       ret[i]=const_cast<DataArrayDouble *>((const DataArrayDouble *)_coords[i]);
 875       ret[i]->incrRef();
 876     }
 877   return ret;
 878 }
 879
 880 //=
 881
 882 MEDCurveLinearMeshMultiLev *MEDCurveLinearMeshMultiLev::New(const MEDFileCurveLinearMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 883 {
 884   return new MEDCurveLinearMeshMultiLev(m,levs);
 885 }
 886
 887 MEDCurveLinearMeshMultiLev *MEDCurveLinearMeshMultiLev::New(const MEDFileCurveLinearMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities)
 888 {
 889   return new MEDCurveLinearMeshMultiLev(m,gts,pfls,nbEntities);
 890 }
 891
 892 MEDCurveLinearMeshMultiLev::MEDCurveLinearMeshMultiLev(const MEDFileCurveLinearMesh *m, const std::vector<int>& levs)
 893 {
 894   if(!m)
 895     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor : null input pointer !");
 896   if(levs.size()!=1 || levs[0]!=0)
 897     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor : levels supported is 0 only !");
 898   DataArrayDouble *coords(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoords()));
 899   if(!coords)
 900     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : no coords set !");
 901   coords->incrRef();
 902   _coords=coords;
 903   _structure=m->getMesh()->getNodeGridStructure();
 904 }
 905
 906 MEDCurveLinearMeshMultiLev::MEDCurveLinearMeshMultiLev(const MEDFileCurveLinearMesh *m, const std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& gts, const std::vector<const DataArrayInt *>& pfls, const std::vector<int>& nbEntities):MEDStructuredMeshMultiLev(m->getNumberOfNodes(),gts,pfls,nbEntities)
 907 {
 908   if(!m)
 909     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : null input pointer !");
 910   if(gts.size()!=1 || pfls.size()!=1)
 911     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : lengthes of gts and pfls must be equal to one !");
 912   int mdim(MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(m->getMeshDimension()));
 913   if(mdim!=gts[0])
 914     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : the unique geo type is invalid regarding meshdim !");
 915   DataArrayDouble *coords(const_cast<DataArrayDouble *>(m->getMesh()->getCoords()));
 916   if(!coords)
 917     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev constructor 2 : no coords set !");
 918   coords->incrRef();
 919   _coords=coords;
 920   _structure=m->getMesh()->getNodeGridStructure();
 921 }
 922
 923 MEDCurveLinearMeshMultiLev::MEDCurveLinearMeshMultiLev(const MEDCurveLinearMeshMultiLev& other):MEDStructuredMeshMultiLev(other),_coords(other._coords),_structure(other._structure)
 924 {
 925 }
 926
 927 std::vector<int> MEDCurveLinearMeshMultiLev::getNodeGridStructure() const
 928 {
 929   return _structure;
 930 }
 931
 932 MEDMeshMultiLev *MEDCurveLinearMeshMultiLev::prepare() const
 933 {
 934   const DataArrayInt *pfl(_pfls[0]),*nr(_node_reduction);
 935   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nnr;
 936   std::vector<int> cgs,ngs(getNodeGridStructure());
 937   cgs.resize(ngs.size());
 938   std::transform(ngs.begin(),ngs.end(),cgs.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),-1));
 939   if(pfl)
 940     {
 941       std::vector< std::pair<int,int> > cellParts,nodeParts;
 942       if(MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured(pfl->begin(),pfl->end(),cgs,cellParts))
 943         {
 944           nodeParts=cellParts;
 945           std::vector<int> st(ngs.size());
 946           for(std::size_t i=0;i<ngs.size();i++)
 947             {
 948               nodeParts[i].second++;
 949               st[i]=nodeParts[i].second-nodeParts[i].first;
 950             }
 951           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> p(MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom(ngs,nodeParts));
 952           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCurveLinearMeshMultiLev> ret(new MEDCurveLinearMeshMultiLev(*this));
 953           if(nr)
 954             { nnr=nr->deepCpy(); nnr->sort(true); ret->setNodeReduction(nnr); }
 955           ret->_nb_entities[0]=pfl->getNumberOfTuples();
 956           ret->_pfls[0]=0;
 957           ret->_coords=_coords->selectByTupleIdSafe(p->begin(),p->end());
 958           ret->_structure=st;
 959           return ret.retn();
 960         }
 961       else
 962         {
 963           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingCurveLinearMesh> m(MEDCouplingCurveLinearMesh::New());
 964           m->setCoords(_coords); m->setNodeGridStructure(&_structure[0],&_structure[0]+_structure.size());
 965           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> m2(m->build1SGTUnstructured());
 966           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1GTUMesh> m3=dynamic_cast<MEDCoupling1GTUMesh *>(m2->buildPartOfMySelfKeepCoords(pfl->begin(),pfl->end()));
 967           MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDUMeshMultiLev> ret(new MEDUMeshMultiLev(*this,m3));
 968           if(nr)
 969             { m3->zipCoords(); nnr=nr->deepCpy(); nnr->sort(true); ret->setNodeReduction(nnr); }
 970           return ret.retn();
 971         }
 972     }
 973   else
 974     {
 975       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCurveLinearMeshMultiLev> ret(new MEDCurveLinearMeshMultiLev(*this));
 976       if(nr)
 977         { nnr=nr->deepCpy(); nnr->sort(true); ret->setNodeReduction(nnr); }
 978       return ret.retn();
 979     }
 980 }
 981
 982 void MEDCurveLinearMeshMultiLev::buildVTUArrays(DataArrayDouble *&coords, std::vector<int>& nodeStrct) const
 983 {
 984   nodeStrct=_structure;
 985   const DataArrayDouble *coo(_coords);
 986   if(!coo)
 987     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCurveLinearMeshMultiLev::buildVTUArrays : null pointer on coordinates !");
 988   coords=const_cast<DataArrayDouble *>(coo); coords->incrRef();
 989 }
 990
 991 //=
 992
 993 MEDFileField1TSStructItem2::MEDFileField1TSStructItem2()
 994 {
 995 }
 996
 997 MEDFileField1TSStructItem2::MEDFileField1TSStructItem2(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType a, const std::pair<int,int>& b, const std::string& c, const std::string& d):_geo_type(a),_start_end(b),_pfl(DataArrayInt::New()),_loc(d),_nb_of_entity(-1)
 998 {
 999   _pfl->setName(c.c_str());
1000 }
1001
1002 void MEDFileField1TSStructItem2::checkWithMeshStructForCells(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1003 {
1004   int nbOfEnt=mst->getNumberOfElemsOfGeoType(_geo_type);
1005   checkInRange(nbOfEnt,1,globs);
1006 }
1007
1008 void MEDFileField1TSStructItem2::checkWithMeshStructForGaussNE(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1009 {
1010   int nbOfEnt=mst->getNumberOfElemsOfGeoType(_geo_type);
1011   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(_geo_type);
1012   checkInRange(nbOfEnt,(int)cm.getNumberOfNodes(),globs);
1013 }
1014
1015 void MEDFileField1TSStructItem2::checkWithMeshStructForGaussPT(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1016 {
1017   if(!globs)
1018     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::checkWithMeshStructForGaussPT : no globals specified !");
1019   if(_loc.empty())
1020     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::checkWithMeshStructForGaussPT : no localization specified !");
1021   const MEDFileFieldLoc& loc=globs->getLocalization(_loc.c_str());
1022   int nbOfEnt=mst->getNumberOfElemsOfGeoType(_geo_type);
1023   checkInRange(nbOfEnt,loc.getNumberOfGaussPoints(),globs);
1024 }
1025
1026 int MEDFileField1TSStructItem2::getNbOfIntegrationPts(const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1027 {
1028   if(_loc.empty())
1029     {
1030       if(getPflName().empty())
1031         return (_start_end.second-_start_end.first)/_nb_of_entity;
1032       else
1033         return (_start_end.second-_start_end.first)/getPfl(globs)->getNumberOfTuples();
1034     }
1035   else
1036     {
1037       const MEDFileFieldLoc& loc(globs->getLocalization(_loc.c_str()));
1038       return loc.getNumberOfGaussPoints();
1039     }
1040 }
1041
1042 std::string MEDFileField1TSStructItem2::getPflName() const
1043 {
1044   return _pfl->getName();
1045 }
1046
1047 const DataArrayInt *MEDFileField1TSStructItem2::getPfl(const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1048 {
1049   if(!_pfl->isAllocated())
1050     {
1051       if(_pfl->getName().empty())
1052         return 0;
1053       else
1054         return globs->getProfile(_pfl->getName().c_str());
1055     }
1056   else
1057     return _pfl;
1058 }
1059
1060 /*!
1061  * \param [in] nbOfEntity - number of entity that can be either cells or nodes. Not other possiblity.
1062  * \param [in] nip - number of integration points. 1 for ON_CELLS and NO_NODES
1063  */
1064 void MEDFileField1TSStructItem2::checkInRange(int nbOfEntity, int nip, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1065 {
1066   _nb_of_entity=nbOfEntity;
1067   if(_pfl->getName().empty())
1068     {
1069       if(nbOfEntity!=(_start_end.second-_start_end.first)/nip)
1070         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::checkInRange : Mismatch between number of entities and size of node field !");
1071       return ;
1072     }
1073   else
1074     {
1075       if(!globs)
1076         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::checkInRange : Presence of a profile on field whereas no globals found in file !");
1077       const DataArrayInt *pfl=globs->getProfile(_pfl->getName().c_str());
1078       if(!pfl)
1079         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::checkInRange : Presence of a profile on field whereas no such profile found in file !");
1080       pfl->checkAllIdsInRange(0,nbOfEntity);
1081     }
1082 }
1083
1084 bool MEDFileField1TSStructItem2::isFastlyEqual(int& startExp, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt, const char *pflName) const
1085 {
1086   if(startExp!=_start_end.first)
1087     return false;
1088   if(gt!=_geo_type)
1089     return false;
1090   if(getPflName()!=pflName)
1091     return false;
1092   startExp=_start_end.second;
1093   return true;
1094 }
1095
1096 bool MEDFileField1TSStructItem2::operator==(const MEDFileField1TSStructItem2& other) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1097 {
1098   //_nb_of_entity is not taken into account here. It is not a bug, because no mesh consideration needed here to perform fast compare.
1099   //idem for _loc. It is not an effective attribute for support comparison.
1100   return _geo_type==other._geo_type && _start_end==other._start_end && _pfl->getName()==other._pfl->getName();
1101 }
1102
1103 bool MEDFileField1TSStructItem2::isCellSupportEqual(const MEDFileField1TSStructItem2& other, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1104 {
1105   if(_geo_type!=other._geo_type)
1106     return false;
1107   if(_nb_of_entity!=other._nb_of_entity)
1108     return false;
1109   if((_pfl->getName().empty() && !other._pfl->getName().empty()) || (!_pfl->getName().empty() && other._pfl->getName().empty()))
1110     return false;
1111   if(_pfl->getName().empty() && other._pfl->getName().empty())
1112     return true;
1113   const DataArrayInt *pfl1(getPfl(globs)),*pfl2(other.getPfl(globs));
1114   return pfl1->isEqualWithoutConsideringStr(*pfl2);
1115 }
1116
1117 bool MEDFileField1TSStructItem2::isNodeSupportEqual(const MEDFileField1TSStructItem2& other, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1118 {
1119   return isCellSupportEqual(other,globs);
1120 }
1121
1122 /*!
1123  * \a objs must be non empty. \a objs should contain items having same geometric type.
1124  */
1125 MEDFileField1TSStructItem2 MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf(const std::vector<const MEDFileField1TSStructItem2 *>& objs, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1126 {
1127   if(objs.empty())
1128     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf : empty input !");
1129   if(objs.size()==1)
1130     return MEDFileField1TSStructItem2(*objs[0]);
1131   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt(objs[0]->_geo_type);
1132   int nbEntityRef(objs[0]->_nb_of_entity);
1133   std::size_t sz(objs.size());
1134   std::vector<const DataArrayInt *> arrs(sz);
1135   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1136     {
1137       const MEDFileField1TSStructItem2 *obj(objs[i]);
1138       if(gt!=obj->_geo_type)
1139         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf : invalid situation ! All input must have the same geo type !");
1140       if(nbEntityRef!=obj->_nb_of_entity)
1141         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf : invalid situation ! All input must have the global nb of entity !");
1142       if(obj->_pfl->getName().empty())
1143         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf : invalid situation ! Several same geo type chunk must all lie on profiles !");
1144       arrs[i]=globs->getProfile(obj->_pfl->getName().c_str());
1145     }
1146   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> arr(DataArrayInt::Aggregate(arrs));
1147   arr->sort();
1148   int oldNbTuples(arr->getNumberOfTuples());
1149   arr=arr->buildUnique();
1150   if(oldNbTuples!=arr->getNumberOfTuples())
1151     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf : some entities are present several times !");
1152   if(arr->isIdentity() && oldNbTuples==nbEntityRef)
1153     {
1154       std::pair<int,int> p(0,nbEntityRef);
1155       std::string a,b;
1156       MEDFileField1TSStructItem2 ret(gt,p,a,b);
1157       ret._nb_of_entity=nbEntityRef;
1158       return ret;
1159     }
1160   else
1161     {
1162       arr->setName(NEWLY_CREATED_PFL_NAME);
1163       std::pair<int,int> p(0,oldNbTuples);
1164       std::string a,b;
1165       MEDFileField1TSStructItem2 ret(gt,p,a,b);
1166       ret._nb_of_entity=nbEntityRef;
1167       ret._pfl=arr;
1168       return ret;
1169     }
1170 }
1171
1172 std::size_t MEDFileField1TSStructItem2::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1173 {
1174   std::size_t ret(_loc.capacity());
1175   return ret;
1176 }
1177
1178 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileField1TSStructItem2::getDirectChildren() const
1179 {
1180   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
1181   const DataArrayInt *pfl(_pfl);
1182   if(pfl)
1183     ret.push_back(pfl);
1184   return ret;
1185 }
1186
1187 //=
1188
1189 MEDFileField1TSStructItem::MEDFileField1TSStructItem(TypeOfField a, const std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >& b):_computed(false),_type(a),_items(b)
1190 {
1191 }
1192
1193 void MEDFileField1TSStructItem::checkWithMeshStruct(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1194 {
1195   switch(_type)
1196     {
1197     case ON_NODES:
1198       {
1199         int nbOfEnt=mst->getNumberOfNodes();
1200         if(_items.size()!=1)
1201           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::checkWithMeshStruct : for nodes field only one subdivision supported !");
1202         _items[0].checkInRange(nbOfEnt,1,globs);
1203         break ;
1204       }
1205     case ON_CELLS:
1206       {
1207         for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++)
1208           (*it).checkWithMeshStructForCells(mst,globs);
1209         break;
1210       }
1211     case ON_GAUSS_NE:
1212       {
1213         for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++)
1214           (*it).checkWithMeshStructForGaussNE(mst,globs);
1215         break;
1216       }
1217     case ON_GAUSS_PT:
1218       {
1219         for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++)
1220           (*it).checkWithMeshStructForGaussPT(mst,globs);
1221         break;
1222       }
1223     default:
1224       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::checkWithMeshStruct : not managed field type !");
1225     }
1226 }
1227
1228 bool MEDFileField1TSStructItem::operator==(const MEDFileField1TSStructItem& other) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1229 {
1230   if(_type!=other._type)
1231     return false;
1232   if(_items.size()!=other._items.size())
1233     return false;
1234   for(std::size_t i=0;i<_items.size();i++)
1235     if(!(_items[i]==other._items[i]))
1236       return false;
1237   return true;
1238 }
1239
1240 bool MEDFileField1TSStructItem::isCellSupportEqual(const MEDFileField1TSStructItem& other, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1241 {
1242   if(_type!=other._type)
1243     return false;
1244   if(_items.size()!=other._items.size())
1245     return false;
1246   for(std::size_t i=0;i<_items.size();i++)
1247     if(!(_items[i].isCellSupportEqual(other._items[i],globs)))
1248       return false;
1249   return true;
1250 }
1251
1252 bool MEDFileField1TSStructItem::isNodeSupportEqual(const MEDFileField1TSStructItem& other, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1253 {
1254   if(_type!=other._type)
1255     return false;
1256   if(_items.size()!=other._items.size())
1257     return false;
1258   for(std::size_t i=0;i<_items.size();i++)
1259     if(!(_items[i].isNodeSupportEqual(other._items[i],globs)))
1260       return false;
1261   return true;
1262 }
1263
1264 bool MEDFileField1TSStructItem::isEntityCell() const
1265 {
1266   if(_type==ON_NODES)
1267     return false;
1268   else
1269     return true;
1270 }
1271
1272 class CmpGeo
1273 {
1274 public:
1275   CmpGeo(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType geoTyp):_geo_type(geoTyp) { }
1276   bool operator()(const std::pair< INTERP_KERNEL::NormalizedCellType, std::vector<std::size_t> > & v) const { return _geo_type==v.first; }
1277 private:
1278   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType _geo_type;
1279 };
1280
1281 MEDFileField1TSStructItem MEDFileField1TSStructItem::simplifyMeOnCellEntity(const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1282 {
1283   if(!isEntityCell())
1284     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::simplifyMeOnCellEntity : must be on ON_CELLS, ON_GAUSS_NE or ON_GAUSS_PT !");
1285   std::vector< std::pair< INTERP_KERNEL::NormalizedCellType, std::vector<std::size_t> > > m;
1286   std::size_t i=0;
1287   for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::const_iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++,i++)
1288     {
1289       std::vector< std::pair< INTERP_KERNEL::NormalizedCellType, std::vector<std::size_t> > >::iterator it0(std::find_if(m.begin(),m.end(),CmpGeo((*it).getGeo())));
1290       if(it0==m.end())
1291         m.push_back(std::pair< INTERP_KERNEL::NormalizedCellType, std::vector<std::size_t> >((*it).getGeo(),std::vector<std::size_t>(1,i)));
1292       else
1293         (*it0).second.push_back(i);
1294     }
1295   if(m.size()==_items.size())
1296     {
1297       MEDFileField1TSStructItem ret(*this);
1298       ret._type=ON_CELLS;
1299       return ret;
1300     }
1301   std::size_t sz(m.size());
1302   std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 > items(sz);
1303   for(i=0;i<sz;i++)
1304     {
1305       const std::vector<std::size_t>& ids=m[i].second;
1306       std::vector<const MEDFileField1TSStructItem2 *>objs(ids.size());
1307       for(std::size_t j=0;j<ids.size();j++)
1308         objs[j]=&_items[ids[j]];
1309       items[i]=MEDFileField1TSStructItem2::BuildAggregationOf(objs,globs);
1310     }
1311   MEDFileField1TSStructItem ret(ON_CELLS,items);
1312   ret._computed=true;
1313   return ret;
1314 }
1315
1316 /*!
1317  * \a this is expected to be ON_CELLS and simplified.
1318  */
1319 bool MEDFileField1TSStructItem::isCompatibleWithNodesDiscr(const MEDFileField1TSStructItem& other, const MEDFileMeshStruct *meshSt, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1320 {
1321   if(other._type!=ON_NODES)
1322     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::isCompatibleWithNodesDiscr : other must be on nodes !");
1323   if(other._items.size()!=1)
1324     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::isCompatibleWithNodesDiscr : other is on nodes but number of subparts !");
1325   int theFirstLevFull;
1326   bool ret0=isFullyOnOneLev(meshSt,theFirstLevFull);
1327   const MEDFileField1TSStructItem2& otherNodeIt(other._items[0]);
1328   if(otherNodeIt.getPflName().empty())
1329     {//on all nodes
1330       if(!ret0)
1331         return false;
1332       return theFirstLevFull==0;
1333     }
1334   else
1335     {
1336       const DataArrayInt *pfl=globs->getProfile(otherNodeIt.getPflName().c_str());
1337       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> cpyPfl(pfl->deepCpy());
1338       cpyPfl->sort();
1339       int nbOfNodes(meshSt->getNumberOfNodes());
1340       if(cpyPfl->isIdentity() && cpyPfl->getNumberOfTuples()==nbOfNodes)
1341         {//on all nodes also !
1342           if(!ret0)
1343             return false;
1344           return theFirstLevFull==0;
1345         }
1346       std::vector<bool> nodesFetched(nbOfNodes,false);
1347       meshSt->getTheMesh()->whichAreNodesFetched(*this,globs,nodesFetched);
1348       return cpyPfl->isFittingWith(nodesFetched);
1349     }
1350 }
1351
1352 bool MEDFileField1TSStructItem::isFullyOnOneLev(const MEDFileMeshStruct *meshSt, int& theFirstLevFull) const
1353 {
1354   if(_type!=ON_CELLS)
1355     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::isFullyOnOneLev : works only for ON_CELLS discretization !");
1356   if(_items.empty())
1357     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::isFullyOnOneLev : items vector is empty !");
1358   int nbOfLevs(meshSt->getNumberOfLevs());
1359   if(nbOfLevs==0)
1360     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::isFullyOnOneLev : no levels in input mesh structure !");
1361   std::vector<int> levs(nbOfLevs);
1362   theFirstLevFull=1;
1363   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> gts;
1364   for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::const_iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++)
1365     {
1366       if(!(*it).getPflName().empty())
1367         return false;
1368       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt((*it).getGeo());
1369       if(gts.find(gt)!=gts.end())
1370         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::isFullyOnOneLev : internal error !");
1371       gts.insert(gt);
1372       int pos(meshSt->getLevelOfGeoType((*it).getGeo()));
1373       levs[-pos]++;
1374     }
1375   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++)
1376     if(meshSt->getNumberOfGeoTypesInLev(-i)==levs[i])
1377       { theFirstLevFull=-i; return true; }
1378   return false;
1379 }
1380
1381 const MEDFileField1TSStructItem2& MEDFileField1TSStructItem::operator[](std::size_t i) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
1382 {
1383   if(i>=_items.size())
1384     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStructItem::operator[] : input is not in valid range !");
1385   return _items[i];
1386 }
1387
1388 std::size_t MEDFileField1TSStructItem::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1389 {
1390   std::size_t ret(_items.size()*sizeof(MEDFileField1TSStructItem2));
1391   return ret;
1392 }
1393
1394 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileField1TSStructItem::getDirectChildren() const
1395 {
1396   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
1397   for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::const_iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++)
1398     ret.push_back(&(*it));
1399   return ret;
1400 }
1401
1402 MEDMeshMultiLev *MEDFileField1TSStructItem::buildFromScratchDataSetSupportOnCells(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1403 {
1404   std::size_t sz(_items.size());
1405   std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> a0(sz);
1406   std::vector<const DataArrayInt *> a1(sz);
1407   std::vector<int> a2(sz);
1408   std::size_t i(0);
1409   for(std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 >::const_iterator it=_items.begin();it!=_items.end();it++,i++)
1410     {
1411       a0[i]=(*it).getGeo();
1412       a1[i]=(*it).getPfl(globs);
1413       a2[i]=mst->getNumberOfElemsOfGeoType((*it).getGeo());
1414     }
1415   return MEDMeshMultiLev::New(mst->getTheMesh(),a0,a1,a2);
1416 }
1417
1418 MEDFileField1TSStructItem MEDFileField1TSStructItem::BuildItemFrom(const MEDFileAnyTypeField1TS *ref, const MEDFileMeshStruct *meshSt)
1419 {
1420   TypeOfField atype;
1421   std::vector< MEDFileField1TSStructItem2 > anItems;
1422   //
1423   std::vector< std::vector<std::string> > pfls,locs;
1424   std::vector< std::vector<TypeOfField> > typesF;
1425   std::vector<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> geoTypes;
1426   std::vector< std::vector<std::pair<int,int> > > strtEnds=ref->getFieldSplitedByType(0,geoTypes,typesF,pfls,locs);
1427   std::size_t nbOfGeoTypes(geoTypes.size());
1428   if(nbOfGeoTypes==0)
1429     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct : not null by empty ref  !");
1430   bool isFirst=true;
1431   for(std::size_t i=0;i<nbOfGeoTypes;i++)
1432     {
1433       std::size_t sz=typesF[i].size();
1434       if(strtEnds[i].size()<1 || sz<1 || pfls[i].size()<1)
1435         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct : internal error #1 !");
1436       //
1437       if(isFirst)
1438         atype=typesF[i][0];
1439       isFirst=false;
1440       //
1441       for(std::size_t j=0;j<sz;j++)
1442         {
1443           if(atype==typesF[i][j])
1444             anItems.push_back(MEDFileField1TSStructItem2(geoTypes[i],strtEnds[i][j],pfls[i][j],locs[i][j]));
1445           else
1446             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct : can be applied only on single spatial discretization fields ! Call SplitPerDiscretization method !");
1447         }
1448     }
1449   MEDFileField1TSStructItem ret(atype,anItems);
1450   ret.checkWithMeshStruct(meshSt,ref);
1451   return ret;
1452 }
1453
1454 //=
1455
1456 MEDFileField1TSStruct *MEDFileField1TSStruct::New(const MEDFileAnyTypeField1TS *ref, MEDFileMeshStruct *mst)
1457 {
1458   return new MEDFileField1TSStruct(ref,mst);
1459 }
1460
1461 MEDFileField1TSStruct::MEDFileField1TSStruct(const MEDFileAnyTypeField1TS *ref, MEDFileMeshStruct *mst)
1462 {
1463   _already_checked.push_back(MEDFileField1TSStructItem::BuildItemFrom(ref,mst));
1464 }
1465
1466 void MEDFileField1TSStruct::checkWithMeshStruct(MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs)
1467 {
1468   if(_already_checked.empty())
1469     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::checkWithMeshStruct : not correctly initialized !");
1470   _already_checked.back().checkWithMeshStruct(mst,globs);
1471 }
1472
1473 bool MEDFileField1TSStruct::isEqualConsideringThePast(const MEDFileAnyTypeField1TS *other, const MEDFileMeshStruct *mst) const
1474 {
1475   MEDFileField1TSStructItem b(MEDFileField1TSStructItem::BuildItemFrom(other,mst));
1476   for(std::vector<MEDFileField1TSStructItem>::const_iterator it=_already_checked.begin();it!=_already_checked.end();it++)
1477     {
1478       if((*it)==b)
1479         return true;
1480     }
1481   return false;
1482 }
1483
1484 /*!
1485  * Not const because \a other structure will be added to the \c _already_checked attribute in case of success.
1486  */
1487 bool MEDFileField1TSStruct::isSupportSameAs(const MEDFileAnyTypeField1TS *other, const MEDFileMeshStruct *meshSt)
1488 {
1489   if(_already_checked.empty())
1490     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::isSupportSameAs : no ref !");
1491   MEDFileField1TSStructItem b(MEDFileField1TSStructItem::BuildItemFrom(other,meshSt));
1492   if(!_already_checked[0].isEntityCell() || !b.isEntityCell())
1493     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::isSupportSameAs : only available on cell entities !");
1494   MEDFileField1TSStructItem other1(b.simplifyMeOnCellEntity(other));
1495   int found=-1,i=0;
1496   for(std::vector<MEDFileField1TSStructItem>::const_iterator it=_already_checked.begin();it!=_already_checked.end();it++,i++)
1497     if((*it).isComputed())
1498       { found=i; break; }
1499   bool ret(false);
1500   if(found==-1)
1501     {
1502       MEDFileField1TSStructItem this1(_already_checked[0].simplifyMeOnCellEntity(other));
1503       ret=this1.isCellSupportEqual(other1,other);
1504       if(ret)
1505         _already_checked.push_back(this1);
1506     }
1507   else
1508     ret=_already_checked[found].isCellSupportEqual(other1,other);
1509   if(ret)
1510     _already_checked.push_back(b);
1511   return ret;
1512 }
1513
1514 /*!
1515  * \param [in] other - a field with only one spatial discretization : ON_NODES.
1516  */
1517 bool MEDFileField1TSStruct::isCompatibleWithNodesDiscr(const MEDFileAnyTypeField1TS *other, const MEDFileMeshStruct *meshSt)
1518 {
1519   if(_already_checked.empty())
1520     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::isCompatibleWithNodesDiscr : no ref !");
1521   MEDFileField1TSStructItem other1(MEDFileField1TSStructItem::BuildItemFrom(other,meshSt));
1522   if(_already_checked[0].isEntityCell())
1523     {
1524       int found=-1,i=0;
1525       for(std::vector<MEDFileField1TSStructItem>::const_iterator it=_already_checked.begin();it!=_already_checked.end();it++,i++)
1526         if((*it).isComputed())
1527           { found=i; break; }
1528       bool ret(false);
1529       if(found==-1)
1530         {
1531           MEDFileField1TSStructItem this1(_already_checked[0].simplifyMeOnCellEntity(other));
1532           ret=this1.isCompatibleWithNodesDiscr(other1,meshSt,other);
1533           if(ret)
1534             _already_checked.push_back(this1);
1535         }
1536       else
1537         ret=_already_checked[found].isCompatibleWithNodesDiscr(other1,meshSt,other);
1538       if(ret)
1539         _already_checked.push_back(other1);
1540       return ret;
1541     }
1542   else
1543     return _already_checked[0].isNodeSupportEqual(other1,other);
1544 }
1545
1546 std::size_t MEDFileField1TSStruct::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1547 {
1548   std::size_t ret(_already_checked.capacity()*sizeof(MEDFileField1TSStructItem));
1549   return ret;
1550 }
1551
1552 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileField1TSStruct::getDirectChildren() const
1553 {
1554   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
1555   for(std::vector<MEDFileField1TSStructItem>::const_iterator it=_already_checked.begin();it!=_already_checked.end();it++)
1556     ret.push_back(&(*it));
1557   return ret;
1558 }
1559
1560 MEDMeshMultiLev *MEDFileField1TSStruct::buildFromScratchDataSetSupport(const MEDFileMeshStruct *mst, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1561 {
1562   if(_already_checked.empty())
1563     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::buildFromScratchDataSetSupport : No outline structure in this !");
1564   int pos0(-1),pos1(-1);
1565   if(presenceOfCellDiscr(pos0))
1566     {
1567       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDMeshMultiLev> ret(_already_checked[pos0].buildFromScratchDataSetSupportOnCells(mst,globs));
1568       if(presenceOfPartialNodeDiscr(pos1))
1569         ret->setNodeReduction(_already_checked[pos1][0].getPfl(globs));
1570       return ret.retn();
1571     }
1572   else
1573     {
1574       if(!presenceOfPartialNodeDiscr(pos1))
1575         {//we have only all nodes, no cell definition info -> level 0;
1576           std::vector<int> levs(1,0);
1577           return MEDMeshMultiLev::New(mst->getTheMesh(),levs);
1578         }
1579       else
1580         return MEDMeshMultiLev::NewOnlyOnNode(mst->getTheMesh(),_already_checked[pos1][0].getPfl(globs));
1581     }
1582 }
1583
1584 bool MEDFileField1TSStruct::isDataSetSupportFastlyEqualTo(const MEDFileField1TSStruct& other, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1585 {
1586   int b0,b1;
1587   bool a0(presenceOfCellDiscr(b0)),a1(presenceOfPartialNodeDiscr(b1));
1588   int d0,d1;
1589   bool c0(other.presenceOfCellDiscr(d0)),c1(other.presenceOfPartialNodeDiscr(d1));
1590   if(a0!=c0 || a1!=c1)
1591     return false;
1592   if(a0)
1593     if(!_already_checked[b0].isCellSupportEqual(other._already_checked[d0],globs))
1594       return false;
1595   if(a1)
1596     if(!_already_checked[b1].isNodeSupportEqual(other._already_checked[d1],globs))
1597       return false;
1598   return true;
1599 }
1600
1601 /*!
1602  * Returns true if presence in \a this of discretization ON_CELLS, ON_GAUSS_PT, ON_GAUSS_NE.
1603  * If true is returned the pos of the easiest is returned. The easiest is the first element in \a this having the less splitted subparts.
1604  */
1605 bool MEDFileField1TSStruct::presenceOfCellDiscr(int& pos) const
1606 {
1607   std::size_t refSz(std::numeric_limits<std::size_t>::max());
1608   bool ret(false);
1609   int i(0);
1610   for(std::vector<MEDFileField1TSStructItem>::const_iterator it=_already_checked.begin();it!=_already_checked.end();it++,i++)
1611     {
1612       if((*it).getType()!=ON_NODES)
1613         {
1614           ret=true;
1615           std::size_t sz((*it).getNumberOfItems());
1616           if(refSz>sz)
1617             { pos=i; refSz=sz; }
1618         }
1619     }
1620   if(refSz==0)
1621     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::presenceOfCellDiscr : an element in this on entity CELL is empty !");
1622   return ret;
1623 }
1624
1625 /*!
1626  * Returns true if presence in \a this of discretization ON_NODES.
1627  * If true is returned the pos of the first element containing the single subpart.
1628  */
1629 bool MEDFileField1TSStruct::presenceOfPartialNodeDiscr(int& pos) const
1630 {
1631   int i(0);
1632   for(std::vector<MEDFileField1TSStructItem>::const_iterator it=_already_checked.begin();it!=_already_checked.end();it++,i++)
1633     {
1634       if((*it).getType()==ON_NODES)
1635         {
1636           std::size_t sz((*it).getNumberOfItems());
1637           if(sz==1)
1638             {
1639               if(!(*it)[0].getPflName().empty())
1640                 { pos=i; return true; }
1641             }
1642           else
1643             throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileField1TSStruct::presenceOfPartialNodeDiscr : an element in this on entity NODE is split into several parts !");
1644         }
1645     }
1646   return false;
1647 }
1648
1649 //=
1650
1651 MEDFileFastCellSupportComparator *MEDFileFastCellSupportComparator::New(const MEDFileMeshStruct *m, const MEDFileAnyTypeFieldMultiTS *ref)
1652 {
1653   return new MEDFileFastCellSupportComparator(m,ref);
1654 }
1655
1656 MEDFileFastCellSupportComparator::MEDFileFastCellSupportComparator(const MEDFileMeshStruct *m, const MEDFileAnyTypeFieldMultiTS *ref)
1657 {
1658   if(!m)
1659     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDFileFastCellSupportComparator constructor : null input mesh struct !");
1660   _mesh_comp=const_cast<MEDFileMeshStruct *>(m); _mesh_comp->incrRef();
1661   int nbPts=ref->getNumberOfTS();
1662   _f1ts_cmps.resize(nbPts);
1663   for(int i=0;i<nbPts;i++)
1664     {
1665       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileAnyTypeField1TS> elt=ref->getTimeStepAtPos(i);
1666       _f1ts_cmps[i]=MEDFileField1TSStruct::New(elt,_mesh_comp);
1667       _f1ts_cmps[i]->checkWithMeshStruct(_mesh_comp,elt);
1668     }
1669 }
1670
1671 std::size_t MEDFileFastCellSupportComparator::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1672 {
1673   std::size_t ret(_f1ts_cmps.capacity()*sizeof(MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileField1TSStruct>));
1674   return ret;
1675 }
1676
1677 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDFileFastCellSupportComparator::getDirectChildren() const
1678 {
1679   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
1680   const MEDFileMeshStruct *mst(_mesh_comp);
1681   if(mst)
1682     ret.push_back(mst);
1683   for(std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileField1TSStruct> >::const_iterator it=_f1ts_cmps.begin();it!=_f1ts_cmps.end();it++)
1684     {
1685       const MEDFileField1TSStruct *cur(*it);
1686       if(cur)
1687         ret.push_back(cur);
1688     }
1689   return ret;
1690 }
1691
1692 bool MEDFileFastCellSupportComparator::isEqual(const MEDFileAnyTypeFieldMultiTS *other)
1693 {
1694   int nbPts=other->getNumberOfTS();
1695   if(nbPts!=(int)_f1ts_cmps.size())
1696     {
1697       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileFastCellSupportComparator::isEqual : unexpected nb of time steps in  input ! Should be " << _f1ts_cmps.size() << " it is in reality " << nbPts << " !";
1698       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1699     }
1700   for(int i=0;i<nbPts;i++)
1701     {
1702       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileAnyTypeField1TS> elt=other->getTimeStepAtPos(i);
1703       if(!_f1ts_cmps[i]->isEqualConsideringThePast(elt,_mesh_comp))
1704         if(!_f1ts_cmps[i]->isSupportSameAs(elt,_mesh_comp))
1705           return false;
1706     }
1707   return true;
1708 }
1709
1710 bool MEDFileFastCellSupportComparator::isCompatibleWithNodesDiscr(const MEDFileAnyTypeFieldMultiTS *other)
1711 {
1712   int nbPts=other->getNumberOfTS();
1713   if(nbPts!=(int)_f1ts_cmps.size())
1714     {
1715       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileFastCellSupportComparator::isCompatibleWithNodesDiscr : unexpected nb of time steps in  input ! Should be " << _f1ts_cmps.size() << " it is in reality " << nbPts << " !";
1716       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1717     }
1718   for(int i=0;i<nbPts;i++)
1719     {
1720       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDFileAnyTypeField1TS> elt=other->getTimeStepAtPos(i);
1721       if(!_f1ts_cmps[i]->isCompatibleWithNodesDiscr(elt,_mesh_comp))
1722         return false;
1723     }
1724   return true;
1725 }
1726
1727 MEDMeshMultiLev *MEDFileFastCellSupportComparator::buildFromScratchDataSetSupport(int timeStepId, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1728 {
1729   if(timeStepId<0 || timeStepId>=(int)_f1ts_cmps.size())
1730     {
1731       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileFastCellSupportComparator::buildFromScratchDataSetSupport : requested time step id #" << timeStepId << " is not in [0," << _f1ts_cmps.size() << ") !";
1732       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1733     }
1734   const MEDFileField1TSStruct *obj(_f1ts_cmps[timeStepId]);
1735   if(!obj)
1736     {
1737       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileFastCellSupportComparator::buildFromScratchDataSetSupport : at time step id #" << timeStepId << " no field structure overview defined !";
1738       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1739     }
1740   return obj->buildFromScratchDataSetSupport(_mesh_comp,globs);
1741 }
1742
1743 bool MEDFileFastCellSupportComparator::isDataSetSupportEqualToThePreviousOne(int timeStepId, const MEDFileFieldGlobsReal *globs) const
1744 {
1745   if(timeStepId<=0 || timeStepId>=(int)_f1ts_cmps.size())
1746     {
1747       std::ostringstream oss; oss << "MEDFileFastCellSupportComparator::isDataSetSupportEqualToThePreviousOne : requested time step id #" << timeStepId << " is not in [1," << _f1ts_cmps.size() << ") !";
1748       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1749     }
1750   const MEDFileField1TSStruct *obj(_f1ts_cmps[timeStepId]);
1751   const MEDFileField1TSStruct *objRef(_f1ts_cmps[timeStepId-1]);
1752   return objRef->isDataSetSupportFastlyEqualTo(*obj,globs);
1753 }