src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh_internal.hxx

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  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (EdF)
  20
  21 using namespace MEDCoupling;
  22
  23 class MinusOneSonsGenerator
  24 {
  25 public:
  26   MinusOneSonsGenerator(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  27   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfSons2(conn,lgth); }
  28   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillSonCellNodalConnectivity2(sonId,nodalConn,lgth,sonNodalConn,typeOfSon); }
  29   static const int DELTA=1;
  30 private:
  31   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  32 };
  33
  34 class MinusOneSonsGeneratorBiQuadratic
  35 {
  36 public:
  37   MinusOneSonsGeneratorBiQuadratic(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  38   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfSons2(conn,lgth); }
  39   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillSonCellNodalConnectivity4(sonId,nodalConn,lgth,sonNodalConn,typeOfSon); }
  40   static const int DELTA=1;
  41 private:
  42   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  43 };
  44
  45 class MinusTwoSonsGenerator
  46 {
  47 public:
  48   MinusTwoSonsGenerator(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  49   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfEdgesIn3D(conn,lgth); }
  50   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillSonEdgesNodalConnectivity3D(sonId,nodalConn,lgth,sonNodalConn,typeOfSon); }
  51   static const int DELTA=2;
  52 private:
  53   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  54 };
  55
  56 class MicroEdgesGenerator2D
  57 {
  58 public:
  59   MicroEdgesGenerator2D(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  60   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfMicroEdges(); }
  61   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillMicroEdgeNodalConnectivity(sonId,nodalConn,sonNodalConn,typeOfSon); }
  62   static const int DELTA=1;
  63 private:
  64   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  65 };
  66
  67 class MicroEdgesGenerator3D
  68 {
  69 public:
  70   MicroEdgesGenerator3D(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  71   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfMicroEdges(); }
  72   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillMicroEdgeNodalConnectivity(sonId,nodalConn,sonNodalConn,typeOfSon); }
  73   static const int DELTA=2;
  74 private:
  75   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  76 };
  77
  78 int MEDCouplingFastNbrer(int id, unsigned nb, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm, bool compute, const int *conn1, const int *conn2);
  79 int MEDCouplingOrientationSensitiveNbrer(int id, unsigned nb, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm, bool compute, const int *conn1, const int *conn2);
  80
  81 namespace MEDCoupling
  82 {
  83   template<const int SPACEDIMM>
  84   class DummyClsMCUG
  85   {
  86   public:
  87     static const int MY_SPACEDIM=SPACEDIMM;
  88     static const int MY_MESHDIM=8;
  89     typedef int MyConnType;
  90     static const INTERP_KERNEL::NumberingPolicy My_numPol=INTERP_KERNEL::ALL_C_MODE;
  91     // begin
  92     // useless, but for windows compilation ...
  93     const double* getCoordinatesPtr() const { return 0; }
  94     const int* getConnectivityPtr() const { return 0; }
  95     const int* getConnectivityIndexPtr() const { return 0; }
  96     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getTypeOfElement(int) const { return (INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)0; }
  97     // end
  98   };
  99 }
 100
 101 template<int SPACEDIM>
 102 void MEDCouplingUMesh::getCellsContainingPointsAlg(const double *coords, const double *pos, int nbOfPoints,
 103                                                    double eps, MCAuto<DataArrayInt>& elts, MCAuto<DataArrayInt>& eltsIndex) const
 104 {
 105   elts=DataArrayInt::New(); eltsIndex=DataArrayInt::New(); eltsIndex->alloc(nbOfPoints+1,1); eltsIndex->setIJ(0,0,0); elts->alloc(0,1);
 106   int *eltsIndexPtr(eltsIndex->getPointer());
 107   MCAuto<DataArrayDouble> bboxArr(getBoundingBoxForBBTree(eps));
 108   const double *bbox(bboxArr->begin());
 109   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 110   const int *conn=_nodal_connec->getConstPointer();
 111   const int *connI=_nodal_connec_index->getConstPointer();
 112   double bb[2*SPACEDIM];
 113   BBTree<SPACEDIM,int> myTree(&bbox[0],0,0,nbOfCells,-eps);
 114   for(int i=0;i<nbOfPoints;i++)
 115     {
 116       eltsIndexPtr[i+1]=eltsIndexPtr[i];
 117       for(int j=0;j<SPACEDIM;j++)
 118         {
 119           bb[2*j]=pos[SPACEDIM*i+j];
 120           bb[2*j+1]=pos[SPACEDIM*i+j];
 121         }
 122       std::vector<int> candidates;
 123       myTree.getIntersectingElems(bb,candidates);
 124       for(std::vector<int>::const_iterator iter=candidates.begin();iter!=candidates.end();iter++)
 125         {
 126           int sz(connI[(*iter)+1]-connI[*iter]-1);
 127           INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ct((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)conn[connI[*iter]]);
 128           bool status(false);
 129           if(ct!=INTERP_KERNEL::NORM_POLYGON && ct!=INTERP_KERNEL::NORM_QPOLYG)
 130             status=INTERP_KERNEL::PointLocatorAlgos<DummyClsMCUG<SPACEDIM> >::isElementContainsPoint(pos+i*SPACEDIM,ct,coords,conn+connI[*iter]+1,sz,eps);
 131           else
 132             {
 133               if(SPACEDIM!=2)
 134                 throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::getCellsContainingPointsAlg : not implemented yet for POLYGON and QPOLYGON in spaceDim 3 !");
 135               INTERP_KERNEL::QUADRATIC_PLANAR::_precision=eps;
 136               INTERP_KERNEL::QUADRATIC_PLANAR::_arc_detection_precision=eps;
 137               std::vector<INTERP_KERNEL::Node *> nodes(sz);
 138               INTERP_KERNEL::QuadraticPolygon *pol(0);
 139               for(int j=0;j<sz;j++)
 140                 {
 141                   int nodeId(conn[connI[*iter]+1+j]);
 142                   nodes[j]=new INTERP_KERNEL::Node(coords[nodeId*SPACEDIM],coords[nodeId*SPACEDIM+1]);
 143                 }
 144               if(!INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(ct).isQuadratic())
 145                 pol=INTERP_KERNEL::QuadraticPolygon::BuildLinearPolygon(nodes);
 146               else
 147                 pol=INTERP_KERNEL::QuadraticPolygon::BuildArcCirclePolygon(nodes);
 148               INTERP_KERNEL::Node *n(new INTERP_KERNEL::Node(pos[i*SPACEDIM],pos[i*SPACEDIM+1]));
 149               double a(0.),b(0.),c(0.);
 150               a=pol->normalizeMe(b,c); n->applySimilarity(b,c,a);
 151               status=pol->isInOrOut2(n);
 152               delete pol; n->decrRef();
 153             }
 154           if(status)
 155             {
 156               eltsIndexPtr[i+1]++;
 157               elts->pushBackSilent(*iter);
 158             }
 159         }
 160     }
 161 }
 162
 163 /*!
 164  * \b WARNING this method do the assumption that connectivity lies on the coordinates set.
 165  * For speed reasons no check of this will be done.
 166  */
 167 template<class SonsGenerator>
 168 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingUMesh::buildDescendingConnectivityGen(DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *revDesc, DataArrayInt *revDescIndx, DimM1DescNbrer nbrer) const
 169 {
 170   if(!desc || !descIndx || !revDesc || !revDescIndx)
 171     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::buildDescendingConnectivityGen : present of a null pointer in input !");
 172   checkConnectivityFullyDefined();
 173   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 174   int nbOfNodes=getNumberOfNodes();
 175   MCAuto<DataArrayInt> revNodalIndx=DataArrayInt::New(); revNodalIndx->alloc(nbOfNodes+1,1); revNodalIndx->fillWithZero();
 176   int *revNodalIndxPtr=revNodalIndx->getPointer();
 177   const int *conn=_nodal_connec->getConstPointer();
 178   const int *connIndex=_nodal_connec_index->getConstPointer();
 179   std::string name="Mesh constituent of "; name+=getName();
 180   MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New(name,getMeshDimension()-SonsGenerator::DELTA);
 181   ret->setCoords(getCoords());
 182   ret->allocateCells(2*nbOfCells);
 183   descIndx->alloc(nbOfCells+1,1);
 184   MCAuto<DataArrayInt> revDesc2(DataArrayInt::New()); revDesc2->reserve(2*nbOfCells);
 185   int *descIndxPtr=descIndx->getPointer(); *descIndxPtr++=0;
 186   for(int eltId=0;eltId<nbOfCells;eltId++,descIndxPtr++)
 187     {
 188       int pos=connIndex[eltId];
 189       int posP1=connIndex[eltId+1];
 190       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)conn[pos]);
 191       SonsGenerator sg(cm);
 192       unsigned nbOfSons=sg.getNumberOfSons2(conn+pos+1,posP1-pos-1);
 193       INTERP_KERNEL::AutoPtr<int> tmp=new int[posP1-pos];
 194       for(unsigned i=0;i<nbOfSons;i++)
 195         {
 196           INTERP_KERNEL::NormalizedCellType cmsId;
 197           unsigned nbOfNodesSon=sg.fillSonCellNodalConnectivity2(i,conn+pos+1,posP1-pos-1,tmp,cmsId);
 198           for(unsigned k=0;k<nbOfNodesSon;k++)
 199             if(tmp[k]>=0)
 200               revNodalIndxPtr[tmp[k]+1]++;
 201           ret->insertNextCell(cmsId,nbOfNodesSon,tmp);
 202           revDesc2->pushBackSilent(eltId);
 203         }
 204       descIndxPtr[0]=descIndxPtr[-1]+(int)nbOfSons;
 205     }
 206   int nbOfCellsM1=ret->getNumberOfCells();
 207   std::transform(revNodalIndxPtr+1,revNodalIndxPtr+nbOfNodes+1,revNodalIndxPtr,revNodalIndxPtr+1,std::plus<int>());
 208   MCAuto<DataArrayInt> revNodal=DataArrayInt::New(); revNodal->alloc(revNodalIndx->back(),1);
 209   std::fill(revNodal->getPointer(),revNodal->getPointer()+revNodalIndx->back(),-1);
 210   int *revNodalPtr=revNodal->getPointer();
 211   const int *connM1=ret->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
 212   const int *connIndexM1=ret->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
 213   for(int eltId=0;eltId<nbOfCellsM1;eltId++)
 214     {
 215       const int *strtNdlConnOfCurCell=connM1+connIndexM1[eltId]+1;
 216       const int *endNdlConnOfCurCell=connM1+connIndexM1[eltId+1];
 217       for(const int *iter=strtNdlConnOfCurCell;iter!=endNdlConnOfCurCell;iter++)
 218         if(*iter>=0)//for polyhedrons
 219           *std::find_if(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1],std::bind2nd(std::equal_to<int>(),-1))=eltId;
 220     }
 221   //
 222   DataArrayInt *commonCells=0,*commonCellsI=0;
 223   FindCommonCellsAlg(3,0,ret->getNodalConnectivity(),ret->getNodalConnectivityIndex(),revNodal,revNodalIndx,commonCells,commonCellsI);
 224   MCAuto<DataArrayInt> commonCellsTmp(commonCells),commonCellsITmp(commonCellsI);
 225   const int *commonCellsPtr(commonCells->getConstPointer()),*commonCellsIPtr(commonCellsI->getConstPointer());
 226   int newNbOfCellsM1=-1;
 227   MCAuto<DataArrayInt> o2nM1=DataArrayInt::ConvertIndexArrayToO2N(nbOfCellsM1,commonCells->begin(),
 228                                                                                                             commonCellsI->begin(),commonCellsI->end(),newNbOfCellsM1);
 229   std::vector<bool> isImpacted(nbOfCellsM1,false);
 230   for(const int *work=commonCellsI->begin();work!=commonCellsI->end()-1;work++)
 231     for(int work2=work[0];work2!=work[1];work2++)
 232       isImpacted[commonCellsPtr[work2]]=true;
 233   const int *o2nM1Ptr=o2nM1->getConstPointer();
 234   MCAuto<DataArrayInt> n2oM1=o2nM1->invertArrayO2N2N2OBis(newNbOfCellsM1);
 235   const int *n2oM1Ptr=n2oM1->getConstPointer();
 236   MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret2=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(ret->buildPartOfMySelf(n2oM1->begin(),n2oM1->end(),true));
 237   ret2->copyTinyInfoFrom(this);
 238   desc->alloc(descIndx->back(),1);
 239   int *descPtr=desc->getPointer();
 240   const INTERP_KERNEL::CellModel& cmsDft=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(INTERP_KERNEL::NORM_POINT1);
 241   for(int i=0;i<nbOfCellsM1;i++,descPtr++)
 242     {
 243       if(!isImpacted[i])
 244         *descPtr=nbrer(o2nM1Ptr[i],0,cmsDft,false,0,0);
 245       else
 246         {
 247           if(i!=n2oM1Ptr[o2nM1Ptr[i]])
 248             {
 249               const INTERP_KERNEL::CellModel& cms=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)connM1[connIndexM1[i]]);
 250               *descPtr=nbrer(o2nM1Ptr[i],connIndexM1[i+1]-connIndexM1[i]-1,cms,true,connM1+connIndexM1[n2oM1Ptr[o2nM1Ptr[i]]]+1,connM1+connIndexM1[i]+1);
 251             }
 252           else
 253             *descPtr=nbrer(o2nM1Ptr[i],0,cmsDft,false,0,0);
 254         }
 255     }
 256   revDesc->reserve(newNbOfCellsM1);
 257   revDescIndx->alloc(newNbOfCellsM1+1,1);
 258   int *revDescIndxPtr=revDescIndx->getPointer(); *revDescIndxPtr++=0;
 259   const int *revDesc2Ptr=revDesc2->getConstPointer();
 260   for(int i=0;i<newNbOfCellsM1;i++,revDescIndxPtr++)
 261     {
 262       int oldCellIdM1=n2oM1Ptr[i];
 263       if(!isImpacted[oldCellIdM1])
 264         {
 265           revDesc->pushBackSilent(revDesc2Ptr[oldCellIdM1]);
 266           revDescIndxPtr[0]=revDescIndxPtr[-1]+1;
 267         }
 268       else
 269         {
 270           for(int j=commonCellsIPtr[0];j<commonCellsIPtr[1];j++)
 271             revDesc->pushBackSilent(revDesc2Ptr[commonCellsPtr[j]]);
 272           revDescIndxPtr[0]=revDescIndxPtr[-1]+commonCellsIPtr[1]-commonCellsIPtr[0];
 273           commonCellsIPtr++;
 274         }
 275     }
 276   //
 277   return ret2.retn();
 278 }
 279
 280