src/MEDCoupling/MEDCouplingUMesh_internal.hxx

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  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (EdF)
  20
  21 using namespace MEDCoupling;
  22
  23 class MinusOneSonsGenerator
  24 {
  25 public:
  26   MinusOneSonsGenerator(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  27   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfSons2(conn,lgth); }
  28   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillSonCellNodalConnectivity2(sonId,nodalConn,lgth,sonNodalConn,typeOfSon); }
  29   static const int DELTA=1;
  30 private:
  31   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  32 };
  33
  34 class MinusOneSonsGeneratorBiQuadratic
  35 {
  36 public:
  37   MinusOneSonsGeneratorBiQuadratic(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  38   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfSons2(conn,lgth); }
  39   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillSonCellNodalConnectivity4(sonId,nodalConn,lgth,sonNodalConn,typeOfSon); }
  40   static const int DELTA=1;
  41 private:
  42   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  43 };
  44
  45 class MinusTwoSonsGenerator
  46 {
  47 public:
  48   MinusTwoSonsGenerator(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  49   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfEdgesIn3D(conn,lgth); }
  50   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillSonEdgesNodalConnectivity3D(sonId,nodalConn,lgth,sonNodalConn,typeOfSon); }
  51   static const int DELTA=2;
  52 private:
  53   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  54 };
  55
  56 class MicroEdgesGenerator2D
  57 {
  58 public:
  59   MicroEdgesGenerator2D(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  60   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfMicroEdges(); }
  61   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillMicroEdgeNodalConnectivity(sonId,nodalConn,sonNodalConn,typeOfSon); }
  62   static const int DELTA=1;
  63 private:
  64   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  65 };
  66
  67 class MicroEdgesGenerator3D
  68 {
  69 public:
  70   MicroEdgesGenerator3D(const INTERP_KERNEL::CellModel& cm):_cm(cm) { }
  71   unsigned getNumberOfSons2(const int *conn, int lgth) const { return _cm.getNumberOfMicroEdges(); }
  72   unsigned fillSonCellNodalConnectivity2(int sonId, const int *nodalConn, int lgth, int *sonNodalConn, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType& typeOfSon) const { return _cm.fillMicroEdgeNodalConnectivity(sonId,nodalConn,sonNodalConn,typeOfSon); }
  73   static const int DELTA=2;
  74 private:
  75   const INTERP_KERNEL::CellModel& _cm;
  76 };
  77
  78 int MEDCouplingFastNbrer(int id, unsigned nb, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm, bool compute, const int *conn1, const int *conn2);
  79 int MEDCouplingOrientationSensitiveNbrer(int id, unsigned nb, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm, bool compute, const int *conn1, const int *conn2);
  80
  81 namespace MEDCoupling
  82 {
  83   template<const int SPACEDIMM>
  84   class DummyClsMCUG
  85   {
  86   public:
  87     static const int MY_SPACEDIM=SPACEDIMM;
  88     static const int MY_MESHDIM=8;
  89     typedef int MyConnType;
  90     static const INTERP_KERNEL::NumberingPolicy My_numPol=INTERP_KERNEL::ALL_C_MODE;
  91     // begin
  92     // useless, but for windows compilation ...
  93     const double* getCoordinatesPtr() const { return 0; }
  94     const int* getConnectivityPtr() const { return 0; }
  95     const int* getConnectivityIndexPtr() const { return 0; }
  96     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getTypeOfElement(int) const { return (INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)0; }
  97     // end
  98   };
  99 }
 100
 101 template<int SPACEDIM>
 102 void MEDCouplingUMesh::getCellsContainingPointsAlg(const double *coords, const double *pos, int nbOfPoints,
 103                                                    double eps, MCAuto<DataArrayInt>& elts, MCAuto<DataArrayInt>& eltsIndex) const
 104 {
 105   // Override precision for this method only:
 106   INTERP_KERNEL::QuadraticPlanarPrecision prec(eps);
 107
 108   elts=DataArrayInt::New(); eltsIndex=DataArrayInt::New(); eltsIndex->alloc(nbOfPoints+1,1); eltsIndex->setIJ(0,0,0); elts->alloc(0,1);
 109   int *eltsIndexPtr(eltsIndex->getPointer());
 110   MCAuto<DataArrayDouble> bboxArr(getBoundingBoxForBBTree(eps));
 111   const double *bbox(bboxArr->begin());
 112   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 113   const int *conn=_nodal_connec->getConstPointer();
 114   const int *connI=_nodal_connec_index->getConstPointer();
 115   double bb[2*SPACEDIM];
 116   BBTree<SPACEDIM,int> myTree(&bbox[0],0,0,nbOfCells,-eps);
 117   for(int i=0;i<nbOfPoints;i++)
 118     {
 119       eltsIndexPtr[i+1]=eltsIndexPtr[i];
 120       for(int j=0;j<SPACEDIM;j++)
 121         {
 122           bb[2*j]=pos[SPACEDIM*i+j];
 123           bb[2*j+1]=pos[SPACEDIM*i+j];
 124         }
 125       std::vector<int> candidates;
 126       myTree.getIntersectingElems(bb,candidates);
 127       for(std::vector<int>::const_iterator iter=candidates.begin();iter!=candidates.end();iter++)
 128         {
 129           int sz(connI[(*iter)+1]-connI[*iter]-1);
 130           INTERP_KERNEL::NormalizedCellType ct((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)conn[connI[*iter]]);
 131           bool status(false);
 132           if(ct!=INTERP_KERNEL::NORM_POLYGON && ct!=INTERP_KERNEL::NORM_QPOLYG)
 133             status=INTERP_KERNEL::PointLocatorAlgos<DummyClsMCUG<SPACEDIM> >::isElementContainsPoint(pos+i*SPACEDIM,ct,coords,conn+connI[*iter]+1,sz,eps);
 134           else
 135             {
 136               if(SPACEDIM!=2)
 137                 throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::getCellsContainingPointsAlg : not implemented yet for POLYGON and QPOLYGON in spaceDim 3 !");
 138               std::vector<INTERP_KERNEL::Node *> nodes(sz);
 139               INTERP_KERNEL::QuadraticPolygon *pol(0);
 140               for(int j=0;j<sz;j++)
 141                 {
 142                   int nodeId(conn[connI[*iter]+1+j]);
 143                   nodes[j]=new INTERP_KERNEL::Node(coords[nodeId*SPACEDIM],coords[nodeId*SPACEDIM+1]);
 144                 }
 145               if(!INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(ct).isQuadratic())
 146                 pol=INTERP_KERNEL::QuadraticPolygon::BuildLinearPolygon(nodes);
 147               else
 148                 pol=INTERP_KERNEL::QuadraticPolygon::BuildArcCirclePolygon(nodes);
 149               INTERP_KERNEL::Node *n(new INTERP_KERNEL::Node(pos[i*SPACEDIM],pos[i*SPACEDIM+1]));
 150               double a(0.),b(0.),c(0.);
 151               a=pol->normalizeMe(b,c); n->applySimilarity(b,c,a);
 152               status=pol->isInOrOut2(n);
 153               delete pol; n->decrRef();
 154             }
 155           if(status)
 156             {
 157               eltsIndexPtr[i+1]++;
 158               elts->pushBackSilent(*iter);
 159             }
 160         }
 161     }
 162 }
 163
 164 /*!
 165  * \b WARNING this method do the assumption that connectivity lies on the coordinates set.
 166  * For speed reasons no check of this will be done.
 167  */
 168 template<class SonsGenerator>
 169 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingUMesh::buildDescendingConnectivityGen(DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *revDesc, DataArrayInt *revDescIndx, DimM1DescNbrer nbrer) const
 170 {
 171   if(!desc || !descIndx || !revDesc || !revDescIndx)
 172     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingUMesh::buildDescendingConnectivityGen : present of a null pointer in input !");
 173   checkConnectivityFullyDefined();
 174   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 175   int nbOfNodes=getNumberOfNodes();
 176   MCAuto<DataArrayInt> revNodalIndx=DataArrayInt::New(); revNodalIndx->alloc(nbOfNodes+1,1); revNodalIndx->fillWithZero();
 177   int *revNodalIndxPtr=revNodalIndx->getPointer();
 178   const int *conn=_nodal_connec->getConstPointer();
 179   const int *connIndex=_nodal_connec_index->getConstPointer();
 180   std::string name="Mesh constituent of "; name+=getName();
 181   MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret=MEDCouplingUMesh::New(name,getMeshDimension()-SonsGenerator::DELTA);
 182   ret->setCoords(getCoords());
 183   ret->allocateCells(2*nbOfCells);
 184   descIndx->alloc(nbOfCells+1,1);
 185   MCAuto<DataArrayInt> revDesc2(DataArrayInt::New()); revDesc2->reserve(2*nbOfCells);
 186   int *descIndxPtr=descIndx->getPointer(); *descIndxPtr++=0;
 187   for(int eltId=0;eltId<nbOfCells;eltId++,descIndxPtr++)
 188     {
 189       int pos=connIndex[eltId];
 190       int posP1=connIndex[eltId+1];
 191       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)conn[pos]);
 192       SonsGenerator sg(cm);
 193       unsigned nbOfSons=sg.getNumberOfSons2(conn+pos+1,posP1-pos-1);
 194       INTERP_KERNEL::AutoPtr<int> tmp=new int[posP1-pos];
 195       for(unsigned i=0;i<nbOfSons;i++)
 196         {
 197           INTERP_KERNEL::NormalizedCellType cmsId;
 198           unsigned nbOfNodesSon=sg.fillSonCellNodalConnectivity2(i,conn+pos+1,posP1-pos-1,tmp,cmsId);
 199           for(unsigned k=0;k<nbOfNodesSon;k++)
 200             if(tmp[k]>=0)
 201               revNodalIndxPtr[tmp[k]+1]++;
 202           ret->insertNextCell(cmsId,nbOfNodesSon,tmp);
 203           revDesc2->pushBackSilent(eltId);
 204         }
 205       descIndxPtr[0]=descIndxPtr[-1]+(int)nbOfSons;
 206     }
 207   int nbOfCellsM1=ret->getNumberOfCells();
 208   std::transform(revNodalIndxPtr+1,revNodalIndxPtr+nbOfNodes+1,revNodalIndxPtr,revNodalIndxPtr+1,std::plus<int>());
 209   MCAuto<DataArrayInt> revNodal=DataArrayInt::New(); revNodal->alloc(revNodalIndx->back(),1);
 210   std::fill(revNodal->getPointer(),revNodal->getPointer()+revNodalIndx->back(),-1);
 211   int *revNodalPtr=revNodal->getPointer();
 212   const int *connM1=ret->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
 213   const int *connIndexM1=ret->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
 214   for(int eltId=0;eltId<nbOfCellsM1;eltId++)
 215     {
 216       const int *strtNdlConnOfCurCell=connM1+connIndexM1[eltId]+1;
 217       const int *endNdlConnOfCurCell=connM1+connIndexM1[eltId+1];
 218       for(const int *iter=strtNdlConnOfCurCell;iter!=endNdlConnOfCurCell;iter++)
 219         if(*iter>=0)//for polyhedrons
 220           *std::find_if(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1],std::bind2nd(std::equal_to<int>(),-1))=eltId;
 221     }
 222   //
 223   DataArrayInt *commonCells=0,*commonCellsI=0;
 224   FindCommonCellsAlg(3,0,ret->getNodalConnectivity(),ret->getNodalConnectivityIndex(),revNodal,revNodalIndx,commonCells,commonCellsI);
 225   MCAuto<DataArrayInt> commonCellsTmp(commonCells),commonCellsITmp(commonCellsI);
 226   const int *commonCellsPtr(commonCells->getConstPointer()),*commonCellsIPtr(commonCellsI->getConstPointer());
 227   int newNbOfCellsM1=-1;
 228   MCAuto<DataArrayInt> o2nM1=DataArrayInt::ConvertIndexArrayToO2N(nbOfCellsM1,commonCells->begin(),
 229                                                                                                             commonCellsI->begin(),commonCellsI->end(),newNbOfCellsM1);
 230   std::vector<bool> isImpacted(nbOfCellsM1,false);
 231   for(const int *work=commonCellsI->begin();work!=commonCellsI->end()-1;work++)
 232     for(int work2=work[0];work2!=work[1];work2++)
 233       isImpacted[commonCellsPtr[work2]]=true;
 234   const int *o2nM1Ptr=o2nM1->getConstPointer();
 235   MCAuto<DataArrayInt> n2oM1=o2nM1->invertArrayO2N2N2OBis(newNbOfCellsM1);
 236   const int *n2oM1Ptr=n2oM1->getConstPointer();
 237   MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret2=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(ret->buildPartOfMySelf(n2oM1->begin(),n2oM1->end(),true));
 238   ret2->copyTinyInfoFrom(this);
 239   desc->alloc(descIndx->back(),1);
 240   int *descPtr=desc->getPointer();
 241   const INTERP_KERNEL::CellModel& cmsDft=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(INTERP_KERNEL::NORM_POINT1);
 242   for(int i=0;i<nbOfCellsM1;i++,descPtr++)
 243     {
 244       if(!isImpacted[i])
 245         *descPtr=nbrer(o2nM1Ptr[i],0,cmsDft,false,0,0);
 246       else
 247         {
 248           if(i!=n2oM1Ptr[o2nM1Ptr[i]])
 249             {
 250               const INTERP_KERNEL::CellModel& cms=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)connM1[connIndexM1[i]]);
 251               *descPtr=nbrer(o2nM1Ptr[i],connIndexM1[i+1]-connIndexM1[i]-1,cms,true,connM1+connIndexM1[n2oM1Ptr[o2nM1Ptr[i]]]+1,connM1+connIndexM1[i]+1);
 252             }
 253           else
 254             *descPtr=nbrer(o2nM1Ptr[i],0,cmsDft,false,0,0);
 255         }
 256     }
 257   revDesc->reserve(newNbOfCellsM1);
 258   revDescIndx->alloc(newNbOfCellsM1+1,1);
 259   int *revDescIndxPtr=revDescIndx->getPointer(); *revDescIndxPtr++=0;
 260   const int *revDesc2Ptr=revDesc2->getConstPointer();
 261   for(int i=0;i<newNbOfCellsM1;i++,revDescIndxPtr++)
 262     {
 263       int oldCellIdM1=n2oM1Ptr[i];
 264       if(!isImpacted[oldCellIdM1])
 265         {
 266           revDesc->pushBackSilent(revDesc2Ptr[oldCellIdM1]);
 267           revDescIndxPtr[0]=revDescIndxPtr[-1]+1;
 268         }
 269       else
 270         {
 271           for(int j=commonCellsIPtr[0];j<commonCellsIPtr[1];j++)
 272             revDesc->pushBackSilent(revDesc2Ptr[commonCellsPtr[j]]);
 273           revDescIndxPtr[0]=revDescIndxPtr[-1]+commonCellsIPtr[1]-commonCellsIPtr[0];
 274           commonCellsIPtr++;
 275         }
 276     }
 277   //
 278   return ret2.retn();
 279 }
 280
 281