Salome HOME
Merge from V6_main 01/04/2013
[modules/med.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingUMesh.hxx
1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #ifndef __PARAMEDMEM_MEDCOUPLINGUMESH_HXX__
22 #define __PARAMEDMEM_MEDCOUPLINGUMESH_HXX__
23
24 #include "MEDCoupling.hxx"
25 #include "MEDCouplingPointSet.hxx"
26 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
27
28 #include "CellModel.hxx"
29
30 #include <set>
31
32 namespace ParaMEDMEM
33 {
34   class MEDCouplingUMeshCellIterator;
35   class MEDCouplingUMeshCellByTypeEntry;
36
37   class MEDCouplingUMesh : public MEDCouplingPointSet
38   {
39   public:
40     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *New();
41     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *New(const char *meshName, int meshDim);
42     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
43     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
44     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
45     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySize() const;
46     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return UNSTRUCTURED; }
47     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
48     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
49     MEDCOUPLING_EXPORT void checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
50                                                  DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
51     MEDCOUPLING_EXPORT void checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
52                                                             DataArrayInt *&cellCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
53     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
54     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
55     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
56     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
57     MEDCOUPLING_EXPORT void setMeshDimension(int meshDim);
58     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells);
59     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type, int size, const int *nodalConnOfCell) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
60     MEDCOUPLING_EXPORT void finishInsertingCells();
61     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCellIterator *cellIterator();
62     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCellByTypeEntry *cellsByType() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
63     MEDCOUPLING_EXPORT const std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& getAllTypes() const { return _types; }
64     MEDCOUPLING_EXPORT std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getAllGeoTypes() const;
65     MEDCOUPLING_EXPORT std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getTypesOfPart(const int *begin, const int *end) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
66     MEDCOUPLING_EXPORT void setConnectivity(DataArrayInt *conn, DataArrayInt *connIndex, bool isComputingTypes=true);
67     MEDCOUPLING_EXPORT const DataArrayInt *getNodalConnectivity() const { return _nodal_connec; }
68     MEDCOUPLING_EXPORT const DataArrayInt *getNodalConnectivityIndex() const { return _nodal_connec_index; }
69     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() { return _nodal_connec; }
70     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivityIndex() { return _nodal_connec_index; }
71     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getTypeOfCell(int cellId) const;
72     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
73     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const;
74     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
75     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsFullyIncludedInNodeIds(const int *partBg, const int *partEnd) const;
76     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
77     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
78     MEDCOUPLING_EXPORT std::string cppRepr() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
79     MEDCOUPLING_EXPORT std::string reprConnectivityOfThis() const;
80     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
81     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const;
82     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
83     MEDCOUPLING_EXPORT int getMeshDimension() const;
84     MEDCOUPLING_EXPORT int getMeshLength() const;
85     MEDCOUPLING_EXPORT void computeTypes();
86     //! size of returned tinyInfo must be always the same.
87     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
88     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
89     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
90     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
91     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, const std::vector<std::string>& littleStrings);
92     MEDCOUPLING_EXPORT std::string getVTKDataSetType() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
93     MEDCOUPLING_EXPORT void writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
94     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
95     //tools
96     MEDCOUPLING_EXPORT static int AreCellsEqual(const int *conn, const int *connI, int cell1, int cell2, int compType);
97     MEDCOUPLING_EXPORT static int AreCellsEqual0(const int *conn, const int *connI, int cell1, int cell2);
98     MEDCOUPLING_EXPORT static int AreCellsEqual1(const int *conn, const int *connI, int cell1, int cell2);
99     MEDCOUPLING_EXPORT static int AreCellsEqual2(const int *conn, const int *connI, int cell1, int cell2);
100     MEDCOUPLING_EXPORT static int AreCellsEqual3(const int *conn, const int *connI, int cell1, int cell2);
101     MEDCOUPLING_EXPORT static int AreCellsEqual7(const int *conn, const int *connI, int cell1, int cell2);
102     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCellsFrom2MeshEqual(const MEDCouplingUMesh *other, int cellId, double prec) const;
103     MEDCOUPLING_EXPORT void convertToPolyTypes(const int *cellIdsToConvertBg, const int *cellIdsToConvertEnd);
104     MEDCOUPLING_EXPORT void convertAllToPoly();
105     MEDCOUPLING_EXPORT void convertExtrudedPolyhedra() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
106     MEDCOUPLING_EXPORT bool unPolyze();
107     MEDCOUPLING_EXPORT void simplifyPolyhedra(double eps) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
108     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildSpreadZonesWithPoly() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
109     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<DataArrayInt *> partitionBySpreadZone() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
110     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeFetchedNodeIds() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
111     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
112     MEDCOUPLING_EXPORT void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
113     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
114     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *zipCoordsTraducer() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
115     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *zipConnectivityTraducer(int compType, int startCellId=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
116     MEDCOUPLING_EXPORT void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
117     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCellsIncludedIn(const MEDCouplingUMesh *other, int compType, DataArrayInt *& arr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
118     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCellsIncludedIn2(const MEDCouplingUMesh *other, DataArrayInt *& arr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
119     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
120     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *explode3DMeshTo1D(DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *revDesc, DataArrayInt *revDescIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
121     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildDescendingConnectivity(DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *revDesc, DataArrayInt *revDescIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
122     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildDescendingConnectivity2(DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *revDesc, DataArrayInt *revDescIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
123     MEDCOUPLING_EXPORT void computeNeighborsOfCells(DataArrayInt *&neighbors, DataArrayInt *&neighborsIdx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
124     MEDCOUPLING_EXPORT static void ComputeNeighborsOfCellsAdv(const DataArrayInt *desc, const DataArrayInt *descI, const DataArrayInt *revDesc, const DataArrayInt *revDescI,
125                                                               DataArrayInt *&neighbors, DataArrayInt *&neighborsIdx) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
126     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *mergeNodes(double precision, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes);
127     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *mergeNodes2(double precision, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes);
128     MEDCOUPLING_EXPORT void tryToShareSameCoordsPermute(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
129     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelf(const int *begin, const int *end, bool keepCoords=true) const;
130     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelf2(int start, int end, int step, bool keepCoords=true) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
131     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfNode(const int *begin, const int *end, bool fullyIn) const;
132     MEDCOUPLING_EXPORT void setPartOfMySelf(const int *cellIdsBg, const int *cellIdsEnd, const MEDCouplingUMesh& otherOnSameCoordsThanThis) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
133     MEDCOUPLING_EXPORT void setPartOfMySelf2(int start, int end, int step, const MEDCouplingUMesh& otherOnSameCoordsThanThis) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
134     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsLyingOnNodes(const int *begin, const int *end, bool fullyIn) const;
135     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildFacePartOfMySelfNode(const int *begin, const int *end, bool fullyIn) const;
136     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
137     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findBoundaryNodes() const;
138     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildBoundaryMesh(bool keepCoords) const;
139     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findCellIdsOnBoundary() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
140     MEDCOUPLING_EXPORT void findCellIdsLyingOn(const MEDCouplingUMesh& otherDimM1OnSameCoords, DataArrayInt *&cellIdsRk0, DataArrayInt *&cellIdsRk1) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
141     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *computeSkin() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
142     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodes(const int *newNodeNumbers, int newNbOfNodes);
143     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodes2(const int *newNodeNumbers, int newNbOfNodes);
144     MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesToDuplicate(const MEDCouplingUMesh& otherDimM1OnSameCoords, DataArrayInt *& nodeIdsToDuplicate,
145                                                  DataArrayInt *& cellIdsNeededToBeRenum, DataArrayInt *& cellIdsNotModified) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
146     MEDCOUPLING_EXPORT void duplicateNodes(const int *nodeIdsToDuplicateBg, const int *nodeIdsToDuplicateEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
147     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
148     MEDCOUPLING_EXPORT void shiftNodeNumbersInConn(int delta) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
149     MEDCOUPLING_EXPORT void duplicateNodesInConn(const int *nodeIdsToDuplicateBg, const int *nodeIdsToDuplicateEnd, int offset) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
150     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
151     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const double *bbox, double eps) const;
152     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bbox, double eps);
153     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureField(bool isAbs) const;
154     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getPartMeasureField(bool isAbs, const int *begin, const int *end) const;
155     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const;
156     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *buildOrthogonalField() const;
157     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *buildPartOrthogonalField(const int *begin, const int *end) const;
158     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *buildDirectionVectorField() const;
159     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildSlice3D(const double *origin, const double *vec, double eps, DataArrayInt *&cellIds) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
160     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildSlice3DSurf(const double *origin, const double *vec, double eps, DataArrayInt *&cellIds) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
161     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsCrossingPlane(const double *origin, const double *vec, double eps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
162     MEDCOUPLING_EXPORT bool isContiguous1D() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
163     MEDCOUPLING_EXPORT void project1D(const double *pt, const double *v, double eps, double *res) const;
164     MEDCOUPLING_EXPORT double distanceToPoint(const double *ptBg, const double *ptEnd, int& cellId, int& nodeId) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
165     MEDCOUPLING_EXPORT int getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const;
166     MEDCOUPLING_EXPORT void getCellsContainingPoint(const double *pos, double eps, std::vector<int>& elts) const;
167     MEDCOUPLING_EXPORT void getCellsContainingPoints(const double *pos, int nbOfPoints, double eps, std::vector<int>& elts, std::vector<int>& eltsIndex) const;
168     MEDCOUPLING_EXPORT void checkButterflyCells(std::vector<int>& cells, double eps=1e-12) const;
169     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *convexEnvelop2D() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
170     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findAndCorrectBadOriented3DExtrudedCells() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
171     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findAndCorrectBadOriented3DCells() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
172     MEDCOUPLING_EXPORT void getBoundingBoxForBBTree(std::vector<double>& bbox) const;
173     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildExtrudedMesh(const MEDCouplingUMesh *mesh1D, int policy);
174     MEDCOUPLING_EXPORT bool isFullyQuadratic() const;
175     MEDCOUPLING_EXPORT bool isPresenceOfQuadratic() const;
176     MEDCOUPLING_EXPORT void convertQuadraticCellsToLinear() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
177     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic(int conversionType=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
178     MEDCOUPLING_EXPORT void tessellate2D(double eps) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
179     MEDCOUPLING_EXPORT void tessellate2DCurve(double eps) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
180     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
181     MEDCOUPLING_EXPORT bool areOnlySimplexCells() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
182     MEDCOUPLING_EXPORT void convertDegeneratedCells() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
183     MEDCOUPLING_EXPORT void are2DCellsNotCorrectlyOriented(const double *vec, bool polyOnly, std::vector<int>& cells) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
184     MEDCOUPLING_EXPORT void orientCorrectly2DCells(const double *vec, bool polyOnly) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
185     MEDCOUPLING_EXPORT void arePolyhedronsNotCorrectlyOriented(std::vector<int>& cells) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
186     MEDCOUPLING_EXPORT void orientCorrectlyPolyhedrons() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
187     MEDCOUPLING_EXPORT void getFastAveragePlaneOfThis(double *vec, double *pos) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
188     //Mesh quality
189     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getEdgeRatioField() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
190     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getAspectRatioField() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
191     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getWarpField() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
192     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getSkewField() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
193     //utilities for MED File RW
194     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<int> getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
195     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
196     MEDCOUPLING_EXPORT void splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
197     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *emulateMEDMEMBDC(const MEDCouplingUMesh *nM1LevMesh, DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *&revDesc, DataArrayInt *&revDescIndx, DataArrayInt *& nM1LevMeshIds, DataArrayInt *&meshnM1Old2New) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
198     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *sortCellsInMEDFileFrmt() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
199     MEDCOUPLING_EXPORT bool checkConsecutiveCellTypes() const;
200     MEDCOUPLING_EXPORT bool checkConsecutiveCellTypesForMEDFileFrmt() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
201     MEDCOUPLING_EXPORT bool checkConsecutiveCellTypesAndOrder(const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType *orderBg, const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType *orderEnd) const;
202     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getLevArrPerCellTypes(const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType *orderBg, const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType *orderEnd, DataArrayInt *&nbPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
203     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getRenumArrForConsecutiveCellTypesSpec(const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType *orderBg, const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType *orderEnd) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
204     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *rearrange2ConsecutiveCellTypes();
205     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<MEDCouplingUMesh *> splitByType() const;
206     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *AggregateSortedByTypeMeshesOnSameCoords(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& ms,
207                                                                                         DataArrayInt *&szOfCellGrpOfSameType,
208                                                                                         DataArrayInt *&idInMsOfCellGrpOfSameType) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
209     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *keepCellIdsByType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type, const int *begin, const int *end) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
210     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *convertCellArrayPerGeoType(const DataArrayInt *da) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
211     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *keepSpecifiedCells(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type, const int *idsPerGeoTypeBg, const int *idsPerGeoTypeEnd) const;
212     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<bool> getQuadraticStatus() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
213     //
214     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
215     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBarycenterAndOwner() const;
216     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
217     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getPartBarycenterAndOwner(const int *begin, const int *end) const;
218     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *Build0DMeshFromCoords(DataArrayDouble *da) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
219     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *MergeUMeshes(const MEDCouplingUMesh *mesh1, const MEDCouplingUMesh *mesh2) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
220     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *MergeUMeshes(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
221     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *MergeUMeshesOnSameCoords(const MEDCouplingUMesh *mesh1, const MEDCouplingUMesh *mesh2) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
222     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *MergeUMeshesOnSameCoords(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& meshes);
223     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *FuseUMeshesOnSameCoords(const std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& meshes, int compType, std::vector<DataArrayInt *>& corr);
224     MEDCOUPLING_EXPORT static void PutUMeshesOnSameAggregatedCoords(const std::vector<MEDCouplingUMesh *>& meshes) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
225     MEDCOUPLING_EXPORT static void MergeNodesOnUMeshesSharingSameCoords(const std::vector<MEDCouplingUMesh *>& meshes, double eps) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
226     MEDCOUPLING_EXPORT static bool IsPolygonWellOriented(bool isQuadratic, const double *vec, const int *begin, const int *end, const double *coords);
227     MEDCOUPLING_EXPORT static bool IsPolyhedronWellOriented(const int *begin, const int *end, const double *coords);
228     MEDCOUPLING_EXPORT static bool Is3DExtrudedStaticCellWellOriented(const int *begin, const int *end, const double *coords);
229     MEDCOUPLING_EXPORT static void CorrectExtrudedStaticCell(int *begin, int *end);
230     MEDCOUPLING_EXPORT static bool IsTetra4WellOriented(const int *begin, const int *end, const double *coords);
231     MEDCOUPLING_EXPORT static bool IsPyra5WellOriented(const int *begin, const int *end, const double *coords);
232     MEDCOUPLING_EXPORT static void SimplifyPolyhedronCell(double eps, const DataArrayDouble *coords, const int *begin, const int *end, DataArrayInt *res) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
233     MEDCOUPLING_EXPORT static void ComputeVecAndPtOfFace(double eps, const double *coords, const int *begin, const int *end, double *v, double *p) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
234     MEDCOUPLING_EXPORT static void TryToCorrectPolyhedronOrientation(int *begin, int *end, const double *coords) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
235     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *Intersect2DMeshes(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, double eps, DataArrayInt *&cellNb1, DataArrayInt *&cellNb2) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
236     MEDCOUPLING_EXPORT static bool BuildConvexEnvelopOf2DCellJarvis(const double *coords, const int *nodalConnBg, const int *nodalConnEnd, DataArrayInt *nodalConnecOut) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
237     MEDCOUPLING_EXPORT static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(const int *idsToRemoveBg, const int *idsToRemoveEnd, DataArrayInt *arr, DataArrayInt *arrIndx, int offsetForRemoval=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
238     MEDCOUPLING_EXPORT static void ExtractFromIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
239                                                             DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
240     MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArrays(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
241                                                           const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
242                                                           DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
243     MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const int *idsOfSelectBg, const int *idsOfSelectEnd, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
244                                                                  const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
245     MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArrays2(int start, int end, int step, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn,
246                                                            const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex,
247                                                            DataArrayInt* &arrOut, DataArrayInt* &arrIndexOut) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
248     MEDCOUPLING_EXPORT static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx2(int start, int end, int step, DataArrayInt *arrInOut, const DataArrayInt *arrIndxIn,
249                                                                   const DataArrayInt *srcArr, const DataArrayInt *srcArrIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
250     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeSpreadZoneGradually(const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
251     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeSpreadZoneGraduallyFromSeed(const int *seedBg, const int *seedEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn, int nbOfDepthPeeling, int& nbOfDepthPeelingPerformed) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
252     MEDCOUPLING_EXPORT static void FindCommonCellsAlg(int compType, int startCellId, const DataArrayInt *nodal, const DataArrayInt *nodalI, const DataArrayInt *revNodal, const DataArrayInt *revNodalI,
253                                                       DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
254   private:
255     MEDCouplingUMesh();
256     MEDCouplingUMesh(const MEDCouplingUMesh& other, bool deepCopy);
257     ~MEDCouplingUMesh();
258     void checkFullyDefined() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
259     void checkConnectivityFullyDefined() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
260     void reprConnectivityOfThisLL(std::ostringstream& stream) const;
261     //tools
262     DataArrayInt *simplexizePol0() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
263     DataArrayInt *simplexizePol1() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
264     DataArrayInt *simplexizePlanarFace5() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
265     DataArrayInt *simplexizePlanarFace6() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
266     void subDivide2DMesh(const int *nodeSubdived, const int *nodeIndxSubdived, const int *desc, const int *descIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
267     void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
268     void split3DCurveWithPlane(const double *origin, const double *vec, double eps, std::vector<int>& cut3DCurve) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
269     MEDCouplingUMesh *buildExtrudedMeshFromThisLowLev(int nbOfNodesOf1Lev, bool isQuad) const;
270     DataArrayDouble *fillExtCoordsUsingTranslation(const MEDCouplingUMesh *mesh1D, bool isQuad) const;
271     DataArrayDouble *fillExtCoordsUsingTranslAndAutoRotation(const MEDCouplingUMesh *mesh1D, bool isQuad) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
272     DataArrayDouble *fillExtCoordsUsingTranslAndAutoRotation2D(const MEDCouplingUMesh *mesh1D, bool isQuad) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
273     DataArrayDouble *fillExtCoordsUsingTranslAndAutoRotation3D(const MEDCouplingUMesh *mesh1D, bool isQuad) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
274     static bool AreCellsEqualInPool(const std::vector<int>& candidates, int compType, const int *conn, const int *connI, DataArrayInt *result) ;
275     MEDCouplingUMesh *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
276     MEDCouplingUMesh *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
277     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic1D0(DataArrayInt *&conn, DataArrayInt *&connI, DataArrayDouble *& coords, std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
278     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic2DAnd3D0(const MEDCouplingUMesh *m1D, const DataArrayInt *desc, const DataArrayInt *descI, DataArrayInt *&conn, DataArrayInt *&connI, DataArrayDouble *& coords, std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
279     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic2D0(DataArrayInt *&conn, DataArrayInt *&connI, DataArrayDouble *& coords, std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
280     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic2D1(DataArrayInt *&conn, DataArrayInt *&connI, DataArrayDouble *& coords, std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
281     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic3D0(DataArrayInt *&conn, DataArrayInt *&connI, DataArrayDouble *& coords, std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
282     DataArrayInt *convertLinearCellsToQuadratic3D1(DataArrayInt *&conn, DataArrayInt *&connI, DataArrayDouble *& coords, std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& types) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
283     template<int SPACEDIM>
284     void getCellsContainingPointsAlg(const double *coords, const double *pos, int nbOfPoints,
285                                      double eps, std::vector<int>& elts, std::vector<int>& eltsIndex) const;
286 /// @cond INTERNAL
287     static MEDCouplingUMesh *MergeUMeshesLL(std::vector<const MEDCouplingUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
288     typedef int (*DimM1DescNbrer)(int id, unsigned nb, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm, bool compute, const int *conn1, const int *conn2);
289     template<class SonsGenerator>
290     MEDCouplingUMesh *buildDescendingConnectivityGen(DataArrayInt *desc, DataArrayInt *descIndx, DataArrayInt *revDesc, DataArrayInt *revDescIndx, DimM1DescNbrer nbrer) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
291     DataArrayInt *buildUnionOf2DMesh() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
292     DataArrayInt *buildUnionOf3DMesh() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
293     void distanceToPoint3DSurfAlg(const double *pt, const DataArrayInt *cellIds, double& ret0, int& cellId) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
294     void distanceToPoint2DCurveAlg(const double *pt, const DataArrayInt *cellIds, double& ret0, int& cellId) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
295     static DataArrayInt *ComputeSpreadZoneGraduallyFromSeedAlg(std::vector<bool>& fetched, const int *seedBg, const int *seedEnd, const DataArrayInt *arrIn, const DataArrayInt *arrIndxIn, int nbOfDepthPeeling, int& nbOfDepthPeelingPerformed) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
296     static void FillInCompact3DMode(int spaceDim, int nbOfNodesInCell, const int *conn, const double *coo, double *zipFrmt) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
297     static void AppendExtrudedCell(const int *connBg, const int *connEnd, int nbOfNodesPerLev, bool isQuad, std::vector<int>& ret);
298     static void IntersectDescending2DMeshes(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, double eps,
299                                             std::vector< std::vector<int> >& intersectEdge1, std::vector< std::vector<int> >& colinear2, std::vector< std::vector<int> >& subDiv2,
300                                             MEDCouplingUMesh *& m1Desc, DataArrayInt *&desc1, DataArrayInt *&descIndx1, DataArrayInt *&revDesc1, DataArrayInt *&revDescIndx1,
301                                             MEDCouplingUMesh *& m2Desc, DataArrayInt *&desc2, DataArrayInt *&descIndx2, DataArrayInt *&revDesc2, DataArrayInt *&revDescIndx2,
302                                             std::vector<double>& addCoo) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
303     static void BuildIntersectEdges(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, const std::vector<double>& addCoo, const std::vector< std::vector<int> >& subDiv, std::vector< std::vector<int> >& intersectEdge) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
304     static void BuildIntersecting2DCellsFromEdges(double eps, const MEDCouplingUMesh *m1, const int *desc1, const int *descIndx1, const std::vector<std::vector<int> >& intesctEdges1, const std::vector< std::vector<int> >& colinear2,
305                                                   const MEDCouplingUMesh *m2, const int *desc2, const int *descIndx2, const std::vector<std::vector<int> >& intesctEdges2,
306                                                   const std::vector<double>& addCoords,
307                                                   std::vector<double>& addCoordsQuadratic, std::vector<int>& cr, std::vector<int>& crI, std::vector<int>& cNb1, std::vector<int>& cNb2);
308     static void AssemblyForSplitFrom3DCurve(const std::vector<int>& cut3DCurve, std::vector<int>& nodesOnPlane, const int *nodal3DSurf, const int *nodalIndx3DSurf,
309                                               const int *nodal3DCurve, const int *nodalIndx3DCurve,
310                                               const int *desc, const int *descIndx, std::vector< std::pair<int,int> >& cut3DSurf) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
311     void assemblyForSplitFrom3DSurf(const std::vector< std::pair<int,int> >& cut3DSurf,
312                                     const int *desc, const int *descIndx, DataArrayInt *nodalRes, DataArrayInt *nodalResIndx, DataArrayInt *cellIds) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
313   public:
314     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeRangesFromTypeDistribution(const std::vector<int>& code) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
315     MEDCOUPLING_EXPORT static const int N_MEDMEM_ORDER=24;
316     MEDCOUPLING_EXPORT static const INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDMEM_ORDER[N_MEDMEM_ORDER];
317     /// @endcond
318   private:
319     int _mesh_dim;
320     DataArrayInt *_nodal_connec;
321     DataArrayInt *_nodal_connec_index;
322     std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> _types;
323   public:
324     static double EPS_FOR_POLYH_ORIENTATION;
325   };
326
327   class MEDCouplingUMeshCell;
328
329   class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCellIterator
330   {
331   public:
332     MEDCouplingUMeshCellIterator(MEDCouplingUMesh *mesh);
333     MEDCouplingUMeshCellIterator(MEDCouplingUMesh *mesh, MEDCouplingUMeshCell *itc, int bg, int end);
334     ~MEDCouplingUMeshCellIterator();
335     MEDCouplingUMeshCell *nextt();
336   private:
337     MEDCouplingUMesh *_mesh;
338     MEDCouplingUMeshCell *_cell;
339     bool _own_cell;
340     int _cell_id;
341     int _nb_cell;
342   };
343
344   class MEDCouplingUMeshCellByTypeIterator;
345
346   class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCellByTypeEntry
347   {
348   public:
349     MEDCouplingUMeshCellByTypeEntry(MEDCouplingUMesh *mesh);
350     MEDCouplingUMeshCellByTypeIterator *iterator();
351     ~MEDCouplingUMeshCellByTypeEntry();
352   private:
353     MEDCouplingUMesh *_mesh;
354   };
355
356   class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCellEntry
357   {
358   public:
359     MEDCouplingUMeshCellEntry(MEDCouplingUMesh *mesh,  INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type, MEDCouplingUMeshCell *itc, int bg, int end);
360     ~MEDCouplingUMeshCellEntry();
361     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getType() const;
362     int getNumberOfElems() const;
363     MEDCouplingUMeshCellIterator *iterator();
364   private:
365     MEDCouplingUMesh *_mesh;
366     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType _type;
367     MEDCouplingUMeshCell *_itc;
368     int _bg;
369     int _end;
370   };
371
372   class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCellByTypeIterator
373   {
374   public:
375     MEDCouplingUMeshCellByTypeIterator(MEDCouplingUMesh *mesh);
376     ~MEDCouplingUMeshCellByTypeIterator();
377     MEDCouplingUMeshCellEntry *nextt();
378   private:
379     MEDCouplingUMesh *_mesh;
380     MEDCouplingUMeshCell *_cell;
381     int _cell_id;
382     int _nb_cell;
383   };
384
385   class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMeshCell
386   {
387   public:
388     MEDCouplingUMeshCell(MEDCouplingUMesh *mesh);
389     void next();
390     std::string repr() const;
391     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getType() const;
392     const int *getAllConn(int& lgth) const;
393   private:
394     int *_conn;
395     int *_conn_indx;
396     int _conn_lgth;
397     static const int NOTICABLE_FIRST_VAL=-7;
398   };
399 }
400
401 #endif