Salome HOME
ebc71739d87730d4fed275aaa67c844d2047bc7c
[modules/med.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingStructuredMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDCouplingStructuredMesh.hxx"
22 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
23 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
24 #include "MEDCoupling1GTUMesh.hxx"
25 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
26
27 #include <numeric>
28
29 using namespace ParaMEDMEM;
30
31 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh()
32 {
33 }
34
35 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh(const MEDCouplingStructuredMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other)
36 {
37 }
38
39 MEDCouplingStructuredMesh::~MEDCouplingStructuredMesh()
40 {
41 }
42
43 std::size_t MEDCouplingStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
44 {
45   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
46 }
47
48 void MEDCouplingStructuredMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other)
49 {
50   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
51 }
52
53 bool MEDCouplingStructuredMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const
54 {
55   return MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason);
56 }
57
58 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
59 {
60   return GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension());
61 }
62
63 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(int meshDim)
64 {
65   switch(meshDim)
66   {
67     case 3:
68       return INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8;
69     case 2:
70       return INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4;
71     case 1:
72       return INTERP_KERNEL::NORM_SEG2;
73     case 0:
74       return INTERP_KERNEL::NORM_POINT1;
75     default:
76       throw INTERP_KERNEL::Exception("Unexpected dimension for MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension !");
77   }
78 }
79
80 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingStructuredMesh::getAllGeoTypes() const
81 {
82   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret2;
83   ret2.insert(getTypeOfCell(0));
84   return ret2;
85 }
86
87 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
88 {
89   int ret=getNumberOfCells();
90   if(type==getTypeOfCell(0))
91     return ret;
92   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
93   std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType : no specified type ! Type available is " << cm.getRepr() << " !";
94   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
95 }
96
97 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
98 {
99   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
100   if(getTypeOfCell(0)==type)
101     {
102       ret->alloc(getNumberOfCells(),1);
103       ret->iota(0);
104     }
105   else
106     ret->alloc(0,1);
107   return ret.retn();
108 }
109
110 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell() const
111 {
112   int nbCells=getNumberOfCells();
113   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
114   ret->alloc(nbCells,1);
115   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
116   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfNodes());
117   return ret.retn();
118 }
119
120 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfFacesPerCell() const
121 {
122   int nbCells=getNumberOfCells();
123   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
124   ret->alloc(nbCells,1);
125   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
126   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfSons());
127   return ret.retn();
128 }
129
130 /*!
131  * This method computes effective number of nodes per cell. That is to say nodes appearing several times in nodal connectivity of a cell,
132  * will be counted only once here whereas it will be counted several times in MEDCouplingMesh::computeNbOfNodesPerCell method.
133  * Here for structured mesh it returns exactly as MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell does.
134  *
135  * \return DataArrayInt * - new object to be deallocated by the caller.
136  */
137 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const
138 {
139   return computeNbOfNodesPerCell();
140 }
141
142 void MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
143 {
144   int meshDim=getMeshDimension();
145   int tmpCell[3],tmpNode[3];
146   getSplitCellValues(tmpCell);
147   getSplitNodeValues(tmpNode);
148   int tmp2[3];
149   GetPosFromId(cellId,meshDim,tmpCell,tmp2);
150   switch(meshDim)
151   {
152     case 1:
153       conn.push_back(tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[0]+1);
154       break;
155     case 2:
156       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1);
157       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]);
158       break;
159     case 3:
160       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]);
161       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]);
162       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
163       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
164       break;
165     default:
166       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell : big problem spacedim must be in 1,2 or 3 !");
167   };
168 }
169
170 /*!
171  * This method returns the mesh dimension of \a this. It can be different from space dimension in case of a not null dimension contains only one node.
172  */
173 int MEDCouplingStructuredMesh::getMeshDimension() const
174 {
175   std::vector<int> ngs(getNodeGridStructure());
176   int ret(0),pos(0);
177   for(std::vector<int>::const_iterator it=ngs.begin();it!=ngs.end();it++,pos++)
178     {
179       if(*it<=0)
180         {
181           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getMeshDimension : At pos #" << pos << " number of nodes is " << *it << " ! Must be > 0 !";
182           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
183         }
184       if(*it>1)
185         ret++;
186     }
187   return ret;
188 }
189
190 /*!
191  * This method returns the space dimension by only considering the node grid structure.
192  * For cartesian mesh the returned value is equal to those returned by getSpaceDimension.
193  * But for curvelinear is could be different !
194  */
195 int MEDCouplingStructuredMesh::getSpaceDimensionOnNodeStruct() const
196 {
197   std::vector<int> nodeStr(getNodeGridStructure());
198   int spd1(0),pos(0);
199   for(std::vector<int>::const_iterator it=nodeStr.begin();it!=nodeStr.end();it++,pos++)
200     {
201       int elt(*it);
202       if(elt<=0)
203         {
204           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getSpaceDimensionOnNodeStruct : At pos #" << pos << " value of node grid structure is " << *it << " ! must be >=1 !";
205           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
206         }
207       spd1++;
208     }
209   return spd1;
210 }
211
212 void MEDCouplingStructuredMesh::getSplitCellValues(int *res) const
213 {
214   std::vector<int> strct(getCellGridStructure());
215   std::vector<int> ret(MEDCouplingStructuredMesh::GetSplitVectFromStruct(strct));
216   std::copy(ret.begin(),ret.end(),res);
217 }
218
219 void MEDCouplingStructuredMesh::getSplitNodeValues(int *res) const
220 {
221   std::vector<int> strct(getNodeGridStructure());
222   std::vector<int> ret(MEDCouplingStructuredMesh::GetSplitVectFromStruct(strct));
223   std::copy(ret.begin(),ret.end(),res);
224 }
225
226 /*!
227  * This method returns the number of cells of unstructured sub level mesh, without building it.
228  */
229 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsOfSubLevelMesh() const
230 {
231   std::vector<int> cgs(getCellGridStructure());
232   return GetNumberOfCellsOfSubLevelMesh(cgs,getMeshDimension());
233 }
234
235 /*!
236  * See MEDCouplingUMesh::getDistributionOfTypes for more information
237  */
238 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getDistributionOfTypes() const
239 {
240   //only one type of cell
241   std::vector<int> ret(3);
242   ret[0]=getTypeOfCell(0);
243   ret[1]=getNumberOfCells();
244   ret[2]=-1; //ret[3*k+2]==-1 because it has no sense here
245   return ret;
246 }
247
248 /*!
249  * This method tries to minimize at most the number of deep copy.
250  * So if \a idsPerType is not empty it can be returned directly (without copy, but with ref count incremented) in return.
251  * 
252  * See MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig for more information
253  */
254 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
255 {
256   int nbOfCells=getNumberOfCells();
257   if(code.size()!=3)
258     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : invalid input code should be exactly of size 3 !");
259   if(code[0]!=(int)getTypeOfCell(0))
260     {
261       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : Mismatch of geometric type ! Asking for " << code[0] << " whereas the geometric type is \a this is " << getTypeOfCell(0) << " !";
262       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
263     }
264   if(code[2]==-1)
265     {
266       if(code[1]==nbOfCells)
267         return 0;
268       else
269         {
270           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : mismatch between the number of cells in this (" << nbOfCells << ") and the number of non profile (" << code[1] << ") !";
271           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
272         }
273     }
274   if(code[2]!=0)
275     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : single geo type mesh ! 0 or -1 is expected at pos #2 of input code !");
276   if(idsPerType.size()!=1)
277     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input code points to DataArrayInt #0 whereas the size of idsPerType is not equal to 1 !");
278   const DataArrayInt *pfl=idsPerType[0];
279   if(!pfl)
280     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : the input code points to a NULL DataArrayInt at rank 0 !");
281   if(pfl->getNumberOfComponents()!=1)
282     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input profile should have exactly one component !");
283   pfl->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
284   pfl->incrRef();
285   return const_cast<DataArrayInt *>(pfl);
286 }
287
288 /*!
289  * This method is the opposite of MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method. Given a list of cells in \a profile it returns a list of sub-profiles sorted by geo type.
290  * The result is put in the array \a idsPerType. In the returned parameter \a code, foreach i \a code[3*i+2] refers (if different from -1) to a location into the \a idsPerType.
291  * This method has 1 input \a profile and 3 outputs \a code \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
292  * 
293  * \param [out] code is a vector of size 3*n where n is the number of different geometric type in \a this \b reduced to the profile \a profile. \a code has exactly the same semantic than in MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method.
294  * \param [out] idsInPflPerType is a vector of size of different geometric type in the subpart defined by \a profile of \a this ( equal to \a code.size()/3). For each i,
295  *              \a idsInPflPerType[i] stores the tuple ids in \a profile that correspond to the geometric type code[3*i+0]
296  * \param [out] idsPerType is a vector of size of different sub profiles needed to be defined to represent the profile \a profile for a given geometric type.
297  *              This vector can be empty in case of all geometric type cells are fully covered in ascending in the given input \a profile.
298  * 
299  * \warning for performance reasons no deep copy will be performed, if \a profile can been used as this in output parameters \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
300  *
301  * \throw if \a profile has not exactly one component. It throws too, if \a profile contains some values not in [0,getNumberOfCells()) or if \a this is not fully defined
302  *
303  *  \b Example1: <br>
304  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [0,1,2]
305  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,-1], \a idsInPflPerType [[0,1,2]] and \a idsPerType is empty <br>
306  * 
307  *  \b Example2: <br>
308  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [1,2]
309  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,0], \a idsInPflPerType [[0,1]] and \a idsPerType is [[1,2]] <br>
310
311  */
312 void MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const
313 {
314   if(!profile || !profile->isAllocated())
315     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile is NULL or not allocated !");
316   if(profile->getNumberOfComponents()!=1)
317     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile should have exactly one component !");
318   int nbTuples=profile->getNumberOfTuples();
319   int nbOfCells=getNumberOfCells();
320   code.resize(3); idsInPflPerType.resize(1);
321   code[0]=(int)getTypeOfCell(0); code[1]=nbOfCells;
322   idsInPflPerType.resize(1);
323   if(profile->isIdentity() && nbTuples==nbOfCells)
324     {
325       code[2]=-1;
326       idsInPflPerType[0]=0;
327       idsPerType.clear();
328       return ;
329     }
330   code[1]=profile->getNumberOfTuples();
331   code[2]=0;
332   profile->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
333   idsPerType.resize(1);
334   idsPerType[0]=profile->deepCpy();
335   idsInPflPerType[0]=DataArrayInt::Range(0,nbTuples,1);
336 }
337
338 /*!
339  * Creates a new unstructured mesh (MEDCoupling1SGTUMesh) from \a this structured one.
340  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
341  * delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
342  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
343  */
344 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured() const
345 {
346   int meshDim(getMeshDimension()),spaceDim(getSpaceDimensionOnNodeStruct());
347   if((meshDim<0 || meshDim>3) || (spaceDim<0 || spaceDim>3))
348     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured : meshdim and spacedim must be in [1,2,3] !");
349   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords(getCoordinatesAndOwner());
350   int ns[3];
351   getNodeGridStructure(ns);
352   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(Build1GTNodalConnectivity(ns,ns+spaceDim));
353   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret(MEDCoupling1SGTUMesh::New(getName(),GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim)));
354   ret->setNodalConnectivity(conn); ret->setCoords(coords);
355   try
356     { ret->copyTinyInfoFrom(this); }
357   catch(INTERP_KERNEL::Exception&) { }
358   return ret.retn();
359 }
360
361 /*!
362  * This method returns the unstructured mesh (having single geometric type) of the sub level mesh of \a this.
363  * This method is equivalent to computing MEDCouplingUMesh::buildDescendingConnectivity on the unstructurized \a this mesh.
364  * 
365  * The caller is to delete the returned mesh using decrRef() as it is no more needed. 
366  */
367 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTSubLevelMesh() const
368 {
369   int meshDim(getMeshDimension());
370   if(meshDim<1 || meshDim>3)
371     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTSubLevelMesh : meshdim must be in [2,3] !");
372   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords(getCoordinatesAndOwner());
373   int ns[3];
374   getNodeGridStructure(ns);
375   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh(ns,ns+meshDim));
376   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret(MEDCoupling1SGTUMesh::New(getName(),GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim-1)));
377   ret->setNodalConnectivity(conn); ret->setCoords(coords);
378   return ret.retn();
379 }
380
381 /*!
382  * Creates a new unstructured mesh (MEDCouplingUMesh) from \a this structured one.
383  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
384  * delete this array using decrRef() as it is no more needed. 
385  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
386  */
387 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildUnstructured() const
388 {
389   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret0(build1SGTUnstructured());
390   return ret0->buildUnstructured();
391 }
392
393 /*!
394  * Creates a new MEDCouplingUMesh containing a part of cells of \a this mesh.
395  * The cells to include to the
396  * result mesh are specified by an array of cell ids.
397  *  \param [in] start - an array of cell ids to include to the result mesh.
398  *  \param [in] end - specifies the end of the array \a start, so that
399  *              the last value of \a start is \a end[ -1 ].
400  *  \return MEDCouplingMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
401  *         delete this mesh using decrRef() as it is no more needed. 
402  */
403 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
404 {
405   MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
406   MEDCouplingMesh *ret=um->buildPart(start,end);
407   um->decrRef();
408   return ret;
409 }
410
411 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
412 {
413   std::vector<int> cgs(getCellGridStructure());
414   std::vector< std::pair<int,int> > cellPartFormat,nodePartFormat;
415   if(IsPartStructured(start,end,cgs,cellPartFormat))
416     {
417       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingStructuredMesh> ret(buildStructuredSubPart(cellPartFormat));
418       nodePartFormat=cellPartFormat;
419       for(std::vector< std::pair<int,int> >::iterator it=nodePartFormat.begin();it!=nodePartFormat.end();it++)
420         (*it).second++;
421       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp1(BuildExplicitIdsFrom(getNodeGridStructure(),nodePartFormat));
422       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp2(DataArrayInt::New()); tmp2->alloc(getNumberOfNodes(),1);
423       tmp2->fillWithValue(-1);
424       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp3(DataArrayInt::New()); tmp3->alloc(tmp1->getNumberOfTuples(),1); tmp3->iota(0);
425       tmp2->setPartOfValues3(tmp3,tmp1->begin(),tmp1->end(),0,1,1);
426       arr=tmp2.retn();
427       return ret.retn();
428     }
429   else
430     {
431       MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
432       MEDCouplingMesh *ret=um->buildPartAndReduceNodes(start,end,arr);
433       um->decrRef();
434       return ret;
435     }
436 }
437
438 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::simplexize(int policy)
439 {
440   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::simplexize : not available for Cartesian mesh !");
441 }
442
443 /*!
444  * Returns a new MEDCouplingFieldDouble holding normal vectors to cells of \a this
445  * 2D mesh. The computed vectors have 3 components and are normalized.
446  *  \return MEDCouplingFieldDouble * - a new instance of MEDCouplingFieldDouble on
447  *          cells and one time. The caller is to delete this field using decrRef() as
448  *          it is no more needed.
449  *  \throw If \a this->getMeshDimension() != 2.
450  */
451 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingStructuredMesh::buildOrthogonalField() const
452 {
453   if(getMeshDimension()!=2)
454     throw INTERP_KERNEL::Exception("Expected a MEDCouplingStructuredMesh with meshDim == 2 !");
455   MEDCouplingFieldDouble *ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,NO_TIME);
456   DataArrayDouble *array=DataArrayDouble::New();
457   int nbOfCells=getNumberOfCells();
458   array->alloc(nbOfCells,3);
459   double *vals=array->getPointer();
460   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
461     { vals[3*i]=0.; vals[3*i+1]=0.; vals[3*i+2]=1.; }
462   ret->setArray(array);
463   array->decrRef();
464   ret->setMesh(this);
465   return ret;
466 }
467
468 void MEDCouplingStructuredMesh::getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const
469 {
470   std::vector<int> ngs(getNodeGridStructure());
471   int dim(getSpaceDimension());
472   switch(dim)
473   {
474     case 1:
475       return GetReverseNodalConnectivity1(ngs,revNodal,revNodalIndx);
476     case 2:
477       return GetReverseNodalConnectivity2(ngs,revNodal,revNodalIndx);
478     case 3:
479       return GetReverseNodalConnectivity3(ngs,revNodal,revNodalIndx);
480     default:
481       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::getReverseNodalConnectivity : only dimensions 1, 2 and 3 are supported !");
482   }
483 }
484
485 void MEDCouplingStructuredMesh::GetReverseNodalConnectivity1(const std::vector<int>& ngs, DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx)
486 {
487   int nbNodes(ngs[0]);
488   revNodalIndx->alloc(nbNodes+1,1);
489   if(nbNodes==0)
490     { revNodal->alloc(0,1); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); return ; }
491   if(nbNodes==1)
492     { revNodal->alloc(1,1); revNodal->setIJ(0,0,0); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); revNodalIndx->setIJ(1,0,1); return ; }
493   revNodal->alloc(2*(nbNodes-1),1);
494   int *rn(revNodal->getPointer()),*rni(revNodalIndx->getPointer());
495   *rni++=0; *rni=1; *rn++=0;
496   for(int i=1;i<nbNodes-1;i++,rni++)
497     {
498       rn[0]=i-1; rn[1]=i;
499       rni[1]=rni[0]+2;
500       rn+=2;
501     }
502   rn[0]=nbNodes-2; rni[1]=rni[0]+1;
503 }
504
505 void MEDCouplingStructuredMesh::GetReverseNodalConnectivity2(const std::vector<int>& ngs, DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx)
506 {
507   int nbNodesX(ngs[0]),nbNodesY(ngs[1]);
508   int nbNodes(nbNodesX*nbNodesY);
509   if(nbNodesX==0 || nbNodesY==0)
510     { revNodal->alloc(0,1); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); return ; }
511   if(nbNodesX==1 || nbNodesY==1)
512     { std::vector<int> ngs2(1); ngs2[0]=std::max(nbNodesX,nbNodesY); return GetReverseNodalConnectivity1(ngs2,revNodal,revNodalIndx); }
513   revNodalIndx->alloc(nbNodes+1,1);
514   int nbCellsX(nbNodesX-1),nbCellsY(nbNodesY-1);
515   revNodal->alloc(4*(nbNodesX-2)*(nbNodesY-2)+2*2*(nbNodesX-2)+2*2*(nbNodesY-2)+4,1);
516   int *rn(revNodal->getPointer()),*rni(revNodalIndx->getPointer());
517   *rni++=0; *rni=1; *rn++=0;
518   for(int i=1;i<nbNodesX-1;i++,rni++,rn+=2)
519     {
520       rn[0]=i-1; rn[1]=i;
521       rni[1]=rni[0]+2;
522     }
523   rni[1]=rni[0]+1; *rn++=nbCellsX-1;
524   rni++;
525   for(int j=1;j<nbNodesY-1;j++)
526     {
527       int off(nbCellsX*(j-1)),off2(nbCellsX*j);
528       rni[1]=rni[0]+2; rn[0]=off; rn[1]=off2;
529       rni++; rn+=2;
530       for(int i=1;i<nbNodesX-1;i++,rni++,rn+=4)
531         {
532           rn[0]=i-1+off; rn[1]=i+off; rn[2]=i-1+off2; rn[3]=i+off2;
533           rni[1]=rni[0]+4;
534         }
535       rni[1]=rni[0]+2; rn[0]=off+nbCellsX-1; rn[1]=off2+nbCellsX-1;
536       rni++; rn+=2;
537     }
538   int off3(nbCellsX*(nbCellsY-1));
539   rni[1]=rni[0]+1;
540   rni++; *rn++=off3;
541   for(int i=1;i<nbNodesX-1;i++,rni++,rn+=2)
542     {
543       rn[0]=i-1+off3; rn[1]=i+off3;
544       rni[1]=rni[0]+2;
545     }
546   rni[1]=rni[0]+1; rn[0]=nbCellsX*nbCellsY-1;
547 }
548
549 void MEDCouplingStructuredMesh::GetReverseNodalConnectivity3(const std::vector<int>& ngs, DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx)
550 {
551   int nbNodesX(ngs[0]),nbNodesY(ngs[1]),nbNodesZ(ngs[2]);
552   int nbNodes(nbNodesX*nbNodesY*nbNodesZ);
553   if(nbNodesX==0 || nbNodesY==0 || nbNodesZ==0)
554     { revNodal->alloc(0,1); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); return ; }
555   if(nbNodesX==1 || nbNodesY==1 || nbNodesZ==1)
556     {
557       std::vector<int> ngs2(2);
558       int pos(0);
559       bool pass(false);
560       for(int i=0;i<3;i++)
561         {
562           if(pass)
563             { ngs2[pos++]=ngs[i]; }
564           else
565             {
566               pass=ngs[i]==1;
567               if(!pass)
568                 { ngs2[pos++]=ngs[i]; }
569             }
570         }
571       return GetReverseNodalConnectivity2(ngs2,revNodal,revNodalIndx);
572     }
573   revNodalIndx->alloc(nbNodes+1,1);
574   int nbCellsX(nbNodesX-1),nbCellsY(nbNodesY-1),nbCellsZ(nbNodesZ-1);
575   revNodal->alloc(8*(nbNodesX-2)*(nbNodesY-2)*(nbNodesZ-2)+4*(2*(nbNodesX-2)*(nbNodesY-2)+2*(nbNodesX-2)*(nbNodesZ-2)+2*(nbNodesY-2)*(nbNodesZ-2))+2*4*(nbNodesX-2)+2*4*(nbNodesY-2)+2*4*(nbNodesZ-2)+8,1);
576   int *rn(revNodal->getPointer()),*rni(revNodalIndx->getPointer());
577   *rni=0;
578   for(int k=0;k<nbNodesZ;k++)
579     {
580       bool factZ(k!=0 && k!=nbNodesZ-1);
581       int offZ0((k-1)*nbCellsX*nbCellsY),offZ1(k*nbCellsX*nbCellsY);
582       for(int j=0;j<nbNodesY;j++)
583         {
584           bool factYZ(factZ && (j!=0 && j!=nbNodesY-1));
585           int off00((j-1)*nbCellsX+offZ0),off01(j*nbCellsX+offZ0),off10((j-1)*nbCellsX+offZ1),off11(j*nbCellsX+offZ1);
586           for(int i=0;i<nbNodesX;i++,rni++)
587             {
588               int fact(factYZ && (i!=0 && i!=nbNodesX-1));
589               if(fact)
590                 {//most of points fall in this part of code
591                   rn[0]=off00+i-1; rn[1]=off00+i; rn[2]=off01+i-1; rn[3]=off01+i;
592                   rn[4]=off10+i-1; rn[5]=off10+i; rn[6]=off11+i-1; rn[7]=off11+i;
593                   rni[1]=rni[0]+8;
594                   rn+=8;
595                 }
596               else
597                 {
598                   int *rnRef(rn);
599                   if(k>=1 && j>=1 && i>=1)
600                     *rn++=off00+i-1;
601                   if(k>=1 && j>=1 && i<nbCellsX)
602                     *rn++=off00+i;
603                   if(k>=1 && j<nbCellsY && i>=1)
604                     *rn++=off01+i-1;
605                   if(k>=1 && j<nbCellsY && i<nbCellsX)
606                     *rn++=off01+i;
607                   //
608                   if(k<nbCellsZ && j>=1 && i>=1)
609                     *rn++=off10+i-1;
610                   if(k<nbCellsZ && j>=1 && i<nbCellsX)
611                     *rn++=off10+i;
612                   if(k<nbCellsZ && j<nbCellsY && i>=1)
613                     *rn++=off11+i-1;
614                   if(k<nbCellsZ && j<nbCellsY && i<nbCellsX)
615                     *rn++=off11+i;
616                   rni[1]=rni[0]+(int)(std::distance(rnRef,rn));
617                 }
618             }
619         }
620     }
621 }
622
623 /*!
624  * \return DataArrayInt * - newly allocated instance of nodal connectivity compatible for MEDCoupling1SGTMesh instance
625  */
626 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity(const int *nodeStBg, const int *nodeStEnd)
627 {
628   int zippedNodeSt[3];
629   int dim(ZipNodeStructure(nodeStBg,nodeStEnd,zippedNodeSt));
630   switch(dim)
631   {
632     case 0:
633       {
634         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
635         conn->alloc(1,1); conn->setIJ(0,0,0);
636         return conn.retn();
637       }
638     case 1:
639       return Build1GTNodalConnectivity1D(zippedNodeSt);
640     case 2:
641       return Build1GTNodalConnectivity2D(zippedNodeSt);
642     case 3:
643       return Build1GTNodalConnectivity3D(zippedNodeSt);
644     default:
645       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity : only dimension in [0,1,2,3] supported !");
646   }
647 }
648
649 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh(const int *nodeStBg, const int *nodeStEnd)
650 {
651   std::size_t dim(std::distance(nodeStBg,nodeStEnd));
652   switch(dim)
653   {
654     case 3:
655       return Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh3D(nodeStBg);
656     case 2:
657       return Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh2D(nodeStBg);
658     default:
659       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh: only dimension in [2,3] supported !");
660   }
661 }
662
663 /*!
664  * This method returns the list of ids sorted ascendingly of entities that are in the corner in ghost zone.
665  * The ids are returned in a newly created DataArrayInt having a single component.
666  *
667  * \param [in] st - The structure \b without ghost cells.
668  * \param [in] ghostLev - The size of the ghost zone (>=0)
669  * \return DataArrayInt * - The DataArray containing all the ids the caller is to deallocate.
670  */
671 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::ComputeCornersGhost(const std::vector<int>& st, int ghostLev)
672 {
673   if(ghostLev<0)
674     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ComputeCornersGhost : ghost lev must be >= 0 !");
675   std::size_t dim(st.size());
676   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
677   switch(dim)
678   {
679     case 1:
680       {
681         ret->alloc(2*ghostLev,1);
682         int *ptr(ret->getPointer());
683         for(int i=0;i<ghostLev;i++,ptr++)
684           *ptr=i;
685         int offset(st[0]);
686         if(offset<0)
687           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ComputeCornersGhost : element in 1D structure must be >= 0 !");
688         for(int i=0;i<ghostLev;i++,ptr++)
689           *ptr=offset+ghostLev+i;
690         break;
691       }
692     case 2:
693       {
694         int offsetX(st[0]),offsetY(st[1]);
695         if(offsetX<0 || offsetY<0)
696           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ComputeCornersGhost : elements in 2D structure must be >= 0 !");
697         ret->alloc(4*ghostLev,1);
698         int *ptr(ret->getPointer());
699         for(int i=0;i<ghostLev;i++)
700           {
701             *ptr++=i*(2*ghostLev+offsetX+1);
702             *ptr++=offsetX+2*ghostLev-1+i*(2*ghostLev+offsetX-1);
703           }
704         for(int i=0;i<ghostLev;i++)
705           {
706             *ptr++=(2*ghostLev+offsetX)*(offsetY+ghostLev)+ghostLev-1+i*(2*ghostLev+offsetX-1);
707             *ptr++=(2*ghostLev+offsetX)*(offsetY+ghostLev)+offsetX+ghostLev+i*(2*ghostLev+offsetX+1);
708           }
709         break;
710       }
711     case 3:
712       {
713         int offsetX(st[0]),offsetY(st[1]),offsetZ(st[2]);
714         if(offsetX<0 || offsetY<0 || offsetZ<0)
715           throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ComputeCornersGhost : elements in 3D structure must be >= 0 !");
716         ret->alloc(8*ghostLev,1);
717         int *ptr(ret->getPointer());
718         int zeOffsetZ((offsetX+2*ghostLev)*(offsetY+2*ghostLev));
719         for(int i=0;i<ghostLev;i++)
720           {
721             *ptr++=i*(2*ghostLev+offsetX+1)+i*zeOffsetZ;
722             *ptr++=offsetX+2*ghostLev-1+i*(2*ghostLev+offsetX-1)+i*zeOffsetZ;
723             *ptr++=(2*ghostLev+offsetX)*(offsetY+ghostLev)+ghostLev-1+(ghostLev-i-1)*(2*ghostLev+offsetX-1)+i*zeOffsetZ;
724             *ptr++=(2*ghostLev+offsetX)*(offsetY+ghostLev)+offsetX+ghostLev+(ghostLev-i-1)*(2*ghostLev+offsetX+1)+i*zeOffsetZ;
725           }
726         int j(0),zeOffsetZ2(zeOffsetZ*(offsetZ+ghostLev));
727         for(int i=ghostLev-1;i>=0;i--,j++)
728           {
729             *ptr++=i*(2*ghostLev+offsetX+1)+j*zeOffsetZ+zeOffsetZ2;
730             *ptr++=offsetX+2*ghostLev-1+i*(2*ghostLev+offsetX-1)+j*zeOffsetZ+zeOffsetZ2;
731             *ptr++=(2*ghostLev+offsetX)*(offsetY+ghostLev)+ghostLev-1+(ghostLev-i-1)*(2*ghostLev+offsetX-1)+j*zeOffsetZ+zeOffsetZ2;
732             *ptr++=(2*ghostLev+offsetX)*(offsetY+ghostLev)+offsetX+ghostLev+(ghostLev-i-1)*(2*ghostLev+offsetX+1)+j*zeOffsetZ+zeOffsetZ2;
733           }
734         break;
735       }
736     default:
737       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ComputeCornersGhost : Only dimensions 1, 2 and 3 are supported actually !");
738   }
739   return ret.retn();
740 }
741
742 /*!
743  * This method retrieves the number of entities (it can be cells or nodes) given a range in compact standard format
744  * used in methods like BuildExplicitIdsFrom,IsPartStructured.
745  *
746  * \sa BuildExplicitIdsFrom,IsPartStructured
747  */
748 int MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenRangeInCompactFrmt(const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
749 {
750   int ret(1);
751   bool isFetched(false);
752   std::size_t ii(0);
753   for(std::vector< std::pair<int,int> >::const_iterator it=partCompactFormat.begin();it!=partCompactFormat.end();it++,ii++)
754     {
755       int a((*it).first),b((*it).second);
756       if(a<0 || b<0 || b-a<0)
757         {
758           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenRangeInCompactFrmt : invalid input at dimension " << ii << " !";
759           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
760         }
761       if(b-a>0)
762         {
763           isFetched=true;
764           ret*=(b-a);
765         }
766     }
767   return isFetched?ret:0;
768 }
769
770 int MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenStructure(const std::vector<int>& st)
771 {
772   int ret(1);
773   bool isFetched(false);
774   for(std::size_t i=0;i<st.size();i++)
775     {
776       if(st[i]<0)
777         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenStructure : presence of a negative value in structure !");
778       ret*=st[i];
779       isFetched=true;
780     }
781   return isFetched?ret:0;
782 }
783
784 void MEDCouplingStructuredMesh::FindTheWidestAxisOfGivenRangeInCompactFrmt(const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat, int& axisId, int& sizeOfRange)
785 {
786     int dim((int)partCompactFormat.size());
787     int ret(-1);
788     for(int i=0;i<dim;i++)
789       {
790         int curDelta(partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first);
791         if(curDelta<0)
792           {
793             std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::FindTheWidestAxisOfGivenRangeInCompactFrmt : at axis #" << i << " the range is invalid (first value < second value) !";
794             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
795           }
796         if(curDelta>ret)
797           {
798             axisId=i; sizeOfRange=curDelta;
799             ret=curDelta;
800           }
801       }
802 }
803
804 /*!
805  * This method is \b NOT wrapped in python because it has no sense in python (for performance reasons).
806  * This method starts from a structured mesh with structure \a st on which a boolean field \a crit is set.
807  * This method find for such minimalist information of mesh and field which is the part of the mesh, given by the range per axis in output parameter
808  * \a partCompactFormat that contains all the True in \a crit. The returned vector of boolean is the field reduced to that part.
809  * So the number of True is equal in \a st and in returned vector of boolean.
810  *
811  * \param [in] st - The structure per axis of the structured mesh considered.
812  * \param [in] crit - The field of boolean (for performance reasons) lying on the mesh defined by \a st.
813  * \param [out] partCompactFormat - The minimal part of \a st containing all the true of \a crit.
814  * \param [out] reducedCrit - The reduction of \a criterion on \a partCompactFormat.
815  * \return - The number of True in \a st (that is equal to those in \a reducedCrit)
816  */
817 int MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf(const std::vector<int>& st, const std::vector<bool>& crit, std::vector<bool>& reducedCrit, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
818 {
819   if((int)crit.size()!=DeduceNumberOfGivenStructure(st))
820     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf : size of vector of boolean is invalid regarding the declared structure !");
821   int ret(-1);
822   switch((int)st.size())
823   {
824     case 1:
825       {
826         ret=FindMinimalPartOf1D(st,crit,partCompactFormat);
827         break;
828       }
829     case 2:
830       {
831         ret=FindMinimalPartOf2D(st,crit,partCompactFormat);
832         break;
833       }
834     case 3:
835       {
836         ret=FindMinimalPartOf3D(st,crit,partCompactFormat);
837         break;
838       }
839     default:
840       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf : only dimension 1, 2 and 3 are supported actually !");
841   }
842   ExtractFieldOfBoolFrom(st,crit,partCompactFormat,reducedCrit);
843   return ret;
844 }
845
846 /*!
847  * This method is \b NOT wrapped in python.
848  * This method considers \a crit input parameter as a matrix having dimensions specified by \a st. This method returns for each axis
849  * the signature, that is to say the number of elems equal to true in \a crit along this axis.
850  */
851 std::vector< std::vector<int> > MEDCouplingStructuredMesh::ComputeSignaturePerAxisOf(const std::vector<int>& st, const std::vector<bool>& crit)
852 {
853   int dim((int)st.size());
854   std::vector< std::vector<int> > ret(dim);
855   switch(dim)
856   {
857     case 1:
858       {
859         int nx(st[0]);
860         ret[0].resize(nx);
861         std::vector<int>& retX(ret[0]);
862         for(int i=0;i<nx;i++)
863           retX[i]=crit[i]?1:0;
864         break;
865       }
866     case 2:
867       {
868         int nx(st[0]),ny(st[1]);
869         ret[0].resize(nx); ret[1].resize(ny);
870         std::vector<int>& retX(ret[0]);
871         for(int i=0;i<nx;i++)
872           {
873             int cnt(0);
874             for(int j=0;j<ny;j++)
875               if(crit[j*nx+i])
876                 cnt++;
877             retX[i]=cnt;
878           }
879         std::vector<int>& retY(ret[1]);
880         for(int j=0;j<ny;j++)
881           {
882             int cnt(0);
883             for(int i=0;i<nx;i++)
884               if(crit[j*nx+i])
885                 cnt++;
886             retY[j]=cnt;
887           }
888         break;
889       }
890     case 3:
891       {
892         int nx(st[0]),ny(st[1]),nz(st[2]);
893         ret[0].resize(nx); ret[1].resize(ny); ret[2].resize(nz);
894         std::vector<int>& retX(ret[0]);
895         for(int i=0;i<nx;i++)
896           {
897             int cnt(0);
898             for(int k=0;k<nz;k++)
899               {
900                 int offz(k*nx*ny+i);
901                 for(int j=0;j<ny;j++)
902                   if(crit[offz+j*nx])
903                     cnt++;
904               }
905             retX[i]=cnt;
906           }
907         std::vector<int>& retY(ret[1]);
908         for(int j=0;j<ny;j++)
909           {
910             int cnt(0),offy(j*nx);
911             for(int k=0;k<nz;k++)
912               {
913                 int offz(k*nx*ny+offy);
914                 for(int i=0;i<nx;i++)
915                   if(crit[offz+i])
916                     cnt++;
917               }
918             retY[j]=cnt;
919           }
920         std::vector<int>& retZ(ret[2]);
921         for(int k=0;k<nz;k++)
922           {
923             int cnt(0),offz(k*nx*ny);
924             for(int j=0;j<ny;j++)
925               {
926                 int offy(offz+j*nx);
927                 for(int i=0;i<nx;i++)
928                   if(crit[offy+i])
929                     cnt++;
930               }
931             retZ[k]=cnt;
932           }
933         break;
934       }
935     default:
936        throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ComputeSignatureOf : only dimensions 1, 2 and 3 are supported !");
937   }
938   return ret;
939 }
940
941 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity1D(const int *nodeStBg)
942 {
943   int nbOfCells(*nodeStBg-1);
944   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
945   conn->alloc(2*nbOfCells,1);
946   int *cp=conn->getPointer();
947   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
948     {
949       cp[2*i+0]=i;
950       cp[2*i+1]=i+1;
951     }
952   return conn.retn();
953 }
954
955 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity2D(const int *nodeStBg)
956 {
957   int n1=nodeStBg[0]-1;
958   int n2=nodeStBg[1]-1;
959   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
960   conn->alloc(4*n1*n2,1);
961   int *cp=conn->getPointer();
962   int pos=0;
963   for(int j=0;j<n2;j++)
964     for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
965       {
966         cp[4*pos+0]=i+1+j*(n1+1);
967         cp[4*pos+1]=i+j*(n1+1);
968         cp[4*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1);
969         cp[4*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1);
970       }
971   return conn.retn();
972 }
973
974 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity3D(const int *nodeStBg)
975 {
976   int n1=nodeStBg[0]-1;
977   int n2=nodeStBg[1]-1;
978   int n3=nodeStBg[2]-1;
979   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
980   conn->alloc(8*n1*n2*n3,1);
981   int *cp=conn->getPointer();
982   int pos=0;
983   for(int k=0;k<n3;k++)
984     for(int j=0;j<n2;j++)
985       for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
986         {
987           int tmp=(n1+1)*(n2+1);
988           cp[8*pos+0]=i+1+j*(n1+1)+k*tmp;
989           cp[8*pos+1]=i+j*(n1+1)+k*tmp;
990           cp[8*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
991           cp[8*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
992           cp[8*pos+4]=i+1+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
993           cp[8*pos+5]=i+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
994           cp[8*pos+6]=i+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
995           cp[8*pos+7]=i+1+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
996         }
997   return conn.retn();
998 }
999
1000 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh3D(const int *nodeStBg)
1001 {
1002   std::vector<int> ngs(3);
1003   int n0(nodeStBg[0]-1),n1(nodeStBg[1]-1),n2(nodeStBg[2]-1); ngs[0]=n0; ngs[1]=n1; ngs[2]=n2;
1004   int off0(nodeStBg[0]),off1(nodeStBg[0]*nodeStBg[1]);
1005   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
1006   conn->alloc(4*GetNumberOfCellsOfSubLevelMesh(ngs,3));
1007   int *cp(conn->getPointer());
1008   //X
1009   for(int i=0;i<nodeStBg[0];i++)
1010     for(int j=0;j<n1;j++)
1011       for(int k=0;k<n2;k++,cp+=4)
1012         { cp[0]=k*off1+j*off0+i; cp[1]=(k+1)*off1+j*off0+i; cp[2]=(k+1)*off1+(j+1)*off0+i; cp[3]=k*off1+(j+1)*off0+i; }
1013   //Y
1014   for(int j=0;j<nodeStBg[1];j++)
1015     for(int i=0;i<n0;i++)
1016       for(int k=0;k<n2;k++,cp+=4)
1017         { cp[0]=k*off1+j*off0+i; cp[1]=(k+1)*off1+j*off0+i; cp[2]=(k+1)*off1+j*off0+(i+1); cp[3]=k*off1+j*off0+(i+1); }
1018   //Z
1019   for(int k=0;k<nodeStBg[2];k++)
1020     for(int i=0;i<n0;i++)
1021       for(int j=0;j<n1;j++,cp+=4)
1022         { cp[0]=k*off1+j*off0+i; cp[1]=k*off1+j*off0+(i+1); cp[2]=k*off1+(j+1)*off0+(i+1); cp[3]=k*off1+(j+1)*off0+i; }
1023   return conn.retn();
1024 }
1025
1026 /*!
1027  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf
1028  */
1029 int MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf1D(const std::vector<int>& st, const std::vector<bool>& crit, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1030 {
1031   if(st.size()!=1)
1032     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf1D : the input size of st must be equal to 1 !");
1033   int nxMin(std::numeric_limits<int>::max()),nxMax(-std::numeric_limits<int>::max());
1034   int nx(st[0]),ret(0);
1035   for(int i=0;i<nx;i++)
1036     {
1037       if(crit[i])
1038         {
1039           nxMin=std::min(nxMin,i); nxMax=std::max(nxMax,i);
1040           ret++;
1041         }
1042     }
1043   if(ret==0)
1044     return ret;
1045   partCompactFormat.resize(1);
1046   partCompactFormat[0].first=nxMin; partCompactFormat[0].second=nxMax+1;
1047   return ret;
1048 }
1049
1050 /*!
1051  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf
1052  */
1053 int MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf2D(const std::vector<int>& st, const std::vector<bool>& crit, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1054 {
1055   if(st.size()!=2)
1056     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf2D : the input size of st must be equal to 2 !");
1057   int nxMin(std::numeric_limits<int>::max()),nxMax(-std::numeric_limits<int>::max()),nyMin(std::numeric_limits<int>::max()),nyMax(-std::numeric_limits<int>::max());
1058   int it(0),nx(st[0]),ny(st[1]);
1059   int ret(0);
1060   for(int i=0;i<ny;i++)
1061     for(int j=0;j<nx;j++,it++)
1062       {
1063         if(crit[it])
1064           {
1065             nxMin=std::min(nxMin,j); nxMax=std::max(nxMax,j);
1066             nyMin=std::min(nyMin,i); nyMax=std::max(nyMax,i);
1067             ret++;
1068           }
1069       }
1070   if(ret==0)
1071     return ret;
1072   partCompactFormat.resize(2);
1073   partCompactFormat[0].first=nxMin; partCompactFormat[0].second=nxMax+1;
1074   partCompactFormat[1].first=nyMin; partCompactFormat[1].second=nyMax+1;
1075   return ret;
1076 }
1077
1078 /*!
1079  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf
1080  */
1081 int MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf3D(const std::vector<int>& st, const std::vector<bool>& crit, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1082 {
1083   if(st.size()!=3)
1084     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::FindMinimalPartOf3D : the input size of st must be equal to 3 !");
1085   int nxMin(std::numeric_limits<int>::max()),nxMax(-std::numeric_limits<int>::max()),nyMin(std::numeric_limits<int>::max()),nyMax(-std::numeric_limits<int>::max()),nzMin(std::numeric_limits<int>::max()),nzMax(-std::numeric_limits<int>::max());
1086   int it(0),nx(st[0]),ny(st[1]),nz(st[2]);
1087   int ret(0);
1088   for(int i=0;i<nz;i++)
1089     for(int j=0;j<ny;j++)
1090       for(int k=0;k<nx;k++,it++)
1091         {
1092           if(crit[it])
1093             {
1094               nxMin=std::min(nxMin,k); nxMax=std::max(nxMax,k);
1095               nyMin=std::min(nyMin,j); nyMax=std::max(nyMax,j);
1096               nzMin=std::min(nzMin,i); nzMax=std::max(nzMax,i);
1097               ret++;
1098             }
1099         }
1100   if(ret==0)
1101     return ret;
1102   partCompactFormat.resize(3);
1103   partCompactFormat[0].first=nxMin; partCompactFormat[0].second=nxMax+1;
1104   partCompactFormat[1].first=nyMin; partCompactFormat[1].second=nyMax+1;
1105   partCompactFormat[2].first=nzMin; partCompactFormat[2].second=nzMax+1;
1106   return ret;
1107 }
1108
1109 /*!
1110  * This method computes given the nodal structure defined by [ \a nodeStBg , \a nodeStEnd ) the zipped form.
1111  * std::distance( \a nodeStBg, \a nodeStEnd ) is equal to the space dimension. The returned value is equal to
1112  * the meshDimension (or the zipped spaceDimension).
1113  *
1114  * \param [out] zipNodeSt - The zipped node strucutre
1115  * \return int - the
1116  */
1117 int MEDCouplingStructuredMesh::ZipNodeStructure(const int *nodeStBg, const int *nodeStEnd, int zipNodeSt[3])
1118 {
1119   int spaceDim((int)std::distance(nodeStBg,nodeStEnd));
1120   if(spaceDim>3 || spaceDim<1)
1121     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ZipNodeStructure : spaceDim must in [1,2,3] !");
1122   zipNodeSt[0]=0; zipNodeSt[1]=0; zipNodeSt[2]=0;
1123   int zippedI(0);
1124   for(int i=0;i<spaceDim;i++)
1125     {
1126       int elt(nodeStBg[i]);
1127       if(elt<1)
1128         {
1129           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ZipNodeStructure : the input nodal structure at pos#" << i << "(" << nodeStBg[i] << ") is invalid !";
1130           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1131         }
1132       if(elt>=2)
1133         zipNodeSt[zippedI++]=elt;
1134     }
1135   return zippedI;
1136 }
1137
1138 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivityOfSubLevelMesh2D(const int *nodeStBg)
1139 {
1140   std::vector<int> ngs(2);
1141   int n0(nodeStBg[0]-1),n1(nodeStBg[1]-1); ngs[0]=n0; ngs[1]=n1;
1142   int off0(nodeStBg[0]);
1143   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
1144   conn->alloc(2*GetNumberOfCellsOfSubLevelMesh(ngs,2));
1145   int *cp(conn->getPointer());
1146   //X
1147   for(int i=0;i<nodeStBg[0];i++)
1148     for(int j=0;j<n1;j++,cp+=2)
1149       { cp[0]=j*off0+i; cp[1]=(j+1)*off0+i; }
1150   //Y
1151   for(int j=0;j<nodeStBg[1];j++)
1152     for(int i=0;i<n0;i++,cp+=2)
1153       { cp[0]=j*off0+i; cp[1]=j*off0+(i+1); }
1154   return conn.retn();
1155 }
1156
1157 /*!
1158  * Returns a cell id by its (i,j,k) index. The cell is located between the i-th and
1159  * ( i + 1 )-th nodes along X axis etc.
1160  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
1161  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
1162  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
1163  *  \return int - a cell id in \a this mesh.
1164  */
1165 int MEDCouplingStructuredMesh::getCellIdFromPos(int i, int j, int k) const
1166 {
1167   int tmp[3]={i,j,k};
1168   int tmp2[3];
1169   int meshDim(getMeshDimension());
1170   getSplitCellValues(tmp2);
1171   std::transform(tmp,tmp+meshDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
1172   return std::accumulate(tmp,tmp+meshDim,0);
1173 }
1174
1175 /*!
1176  * Returns a node id by its (i,j,k) index.
1177  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
1178  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
1179  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
1180  *  \return int - a node id in \a this mesh.
1181  */
1182 int MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdFromPos(int i, int j, int k) const
1183 {
1184   int tmp[3]={i,j,k};
1185   int tmp2[3];
1186   int spaceDim(getSpaceDimension());
1187   getSplitNodeValues(tmp2);
1188   std::transform(tmp,tmp+spaceDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
1189   return std::accumulate(tmp,tmp+spaceDim,0);
1190 }
1191
1192
1193 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCells() const
1194 {
1195   std::vector<int> ngs(getNodeGridStructure());
1196   int ret(1);
1197   bool isCatched(false);
1198   std::size_t ii(0);
1199   for(std::vector<int>::const_iterator it=ngs.begin();it!=ngs.end();it++,ii++)
1200     {
1201       int elt(*it);
1202       if(elt<=0)
1203         {
1204           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCells : at pos #" << ii << " the number of nodes in nodeStructure is " << *it << " ! Must be > 0 !";
1205           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1206         }
1207       if(elt>1)
1208         {
1209           ret*=elt-1;
1210           isCatched=true;
1211         }
1212     }
1213   return isCatched?ret:0;
1214 }
1215
1216 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfNodes() const
1217 {
1218   std::vector<int> ngs(getNodeGridStructure());
1219   int ret(1);
1220   for(std::vector<int>::const_iterator it=ngs.begin();it!=ngs.end();it++)
1221     ret*=*it;
1222   return ret;
1223 }
1224
1225 void MEDCouplingStructuredMesh::GetPosFromId(int nodeId, int meshDim, const int *split, int *res)
1226 {
1227   int work=nodeId;
1228   for(int i=meshDim-1;i>=0;i--)
1229     {
1230       int pos=work/split[i];
1231       work=work%split[i];
1232       res[i]=pos;
1233     }
1234 }
1235
1236 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getCellGridStructure() const
1237 {
1238   std::vector<int> ret(getNodeGridStructure());
1239   std::transform(ret.begin(),ret.end(),ret.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),-1));
1240   return ret;
1241 }
1242
1243 /*!
1244  * Given a struct \a strct it returns a split vector [1,strct[0],strct[0]*strct[1]...]
1245  * This decomposition allows to quickly find i,j,k given a global id.
1246  */
1247 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::GetSplitVectFromStruct(const std::vector<int>& strct)
1248 {
1249   int spaceDim((int)strct.size());
1250   std::vector<int> res(spaceDim);
1251   for(int l=0;l<spaceDim;l++)
1252     {
1253       int val=1;
1254       for(int p=0;p<spaceDim-l-1;p++)
1255         val*=strct[p];
1256       res[spaceDim-l-1]=val;
1257     }
1258   return res;
1259 }
1260
1261 /*!
1262  * This method states if given part ids [ \a startIds, \a stopIds) and a structure \a st returns if it can be considered as a structured dataset.
1263  * If true is returned \a partCompactFormat will contain the information to build the corresponding part.
1264  *
1265  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom, MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenRangeInCompactFrmt
1266  */
1267 bool MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured(const int *startIds, const int *stopIds, const std::vector<int>& st, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1268 {
1269   int dim((int)st.size());
1270   partCompactFormat.resize(dim);
1271   if(dim<1 || dim>3)
1272     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::isPartStructured : input structure must be of dimension in [1,2,3] !");
1273   std::vector<int> tmp2(dim),tmp(dim),tmp3(dim),tmp4(dim); tmp2[0]=1;
1274   for(int i=1;i<dim;i++)
1275     tmp2[i]=tmp2[i-1]*st[i-1];
1276   std::size_t sz(std::distance(startIds,stopIds));
1277   if(sz==0)
1278     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : empty input !");
1279   GetPosFromId(*startIds,dim,&tmp2[0],&tmp[0]);
1280   partCompactFormat.resize(dim);
1281   for(int i=0;i<dim;i++)
1282     partCompactFormat[i].first=tmp[i];
1283   if(tmp[dim-1]<0 || tmp[dim-1]>=st[dim-1])
1284     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : first id in input is not in valid range !");
1285   if(sz==1)
1286     {
1287       for(int i=0;i<dim;i++)
1288         partCompactFormat[i].second=tmp[i]+1;
1289       return true;
1290     }
1291   GetPosFromId(startIds[sz-1],dim,&tmp2[0],&tmp3[0]);
1292   int szExp(1);
1293   for(int i=0;i<dim;i++)
1294     {
1295       if(tmp3[i]<0 || tmp3[i]>=st[i])
1296         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : last id in input is not in valid range !");
1297       partCompactFormat[i].second=tmp3[i]+1;
1298       tmp4[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
1299       if(tmp4[i]<=0)
1300         return false;
1301       szExp*=tmp4[i];
1302     }
1303   if(szExp!=(int)sz)
1304     return false;
1305   const int *w(startIds);
1306   switch(dim)
1307   {
1308     case 3:
1309       {
1310         for(int i=0;i<tmp4[2];i++)
1311           {
1312             int a=tmp2[2]*(partCompactFormat[2].first+i);
1313             for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
1314               {
1315                 int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
1316                 for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
1317                   {
1318                     if(partCompactFormat[0].first+k+b+a!=*w)
1319                       return false;
1320                   }
1321               }
1322           }
1323         return true;
1324       }
1325     case 2:
1326       {
1327         for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
1328           {
1329             int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
1330             for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
1331               {
1332                 if(partCompactFormat[0].first+k+b!=*w)
1333                   return false;
1334               }
1335           }
1336         return true;
1337       }
1338     case 1:
1339       {
1340         for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
1341           {
1342             if(partCompactFormat[0].first+k!=*w)
1343               return false;
1344           }
1345         return true;
1346       }
1347     default:
1348       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : internal error !");
1349   }
1350 }
1351
1352 /*!
1353  * This method takes in input a compact format [[Xmax,Xmin),[Ymin,Ymax)] and returns the corresponding dimensions for each axis that is to say
1354  * [Xmax-Xmin,Ymax-Ymin].
1355  *
1356  * \throw if an axis range is so that max<min
1357  * \sa GetCompactFrmtFromDimensions
1358  */
1359 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::GetDimensionsFromCompactFrmt(const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1360 {
1361   std::vector<int> ret(partCompactFormat.size());
1362   for(std::size_t i=0;i<partCompactFormat.size();i++)
1363     {
1364       if(partCompactFormat[i].first>partCompactFormat[i].second)
1365         {
1366           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::GetDimensionsFromCompactFrmt : For axis #" << i << " end is before start !";
1367           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1368         }
1369       ret[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
1370     }
1371   return ret;
1372 }
1373
1374 /*!
1375  * This method takes in input a vector giving the number of entity per axis and returns for each axis a range starting from [0,0...]
1376  *
1377  * \throw if there is an axis in \a dims that is < 0.
1378  * \sa GetDimensionsFromCompactFrmt, ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt, ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt
1379  */
1380 std::vector< std::pair<int,int> > MEDCouplingStructuredMesh::GetCompactFrmtFromDimensions(const std::vector<int>& dims)
1381 {
1382   std::size_t sz(dims.size());
1383   std::vector< std::pair<int,int> > ret(sz);
1384   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1385     {
1386       if(dims[i]<0)
1387         {
1388           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::GetDimensionsFromCompactFrmt : For axis #" << i << " dimension < 0 !";
1389           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1390         }
1391       ret[i].first=0;
1392       ret[i].second=dims[i];
1393     }
1394   return ret;
1395 }
1396
1397 /*!
1398  * This method returns the intersection zone of two ranges (in compact format) \a r1 and \a r2.
1399  * This method will throw exception if on one axis the intersection is empty.
1400  */
1401 std::vector< std::pair<int,int> > MEDCouplingStructuredMesh::IntersectRanges(const std::vector< std::pair<int,int> >& r1, const std::vector< std::pair<int,int> >& r2)
1402 {
1403   std::size_t sz(r1.size());
1404   if(sz!=r2.size())
1405     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IntersectRanges : the two ranges must have the same dimension !");
1406   std::vector< std::pair<int,int> > ret(sz);
1407   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1408     {
1409       if(r1[i].first>r1[i].second)
1410         {
1411           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::IntersectRanges : On axis " << i << " of range r1, end is before start !";
1412           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1413         }
1414       if(r2[i].first>r2[i].second)
1415         {
1416           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::IntersectRanges : On axis " << i << " of range r2, end is before start !";
1417           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1418         }
1419       ret[i].first=std::max(r1[i].first,r2[i].first);
1420       ret[i].second=std::min(r1[i].second,r2[i].second);
1421       if(ret[i].first>ret[i].second)
1422         {
1423           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::IntersectRanges : On axis " << i << " the intersection of r1 and r2 is empty !";
1424           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1425         }
1426     }
1427   return ret;
1428 }
1429
1430 /*!
1431  * This method is close to BuildExplicitIdsFrom except that instead of returning a DataArrayInt instance containing explicit ids it
1432  * enable elems in the vector of booleans (for performance reasons). As it is method for performance, this method is \b not
1433  * available in python.
1434  *
1435  * \param [in] st The entity structure.
1436  * \param [in] partCompactFormat The compact subpart to be enabled.
1437  * \param [in,out] vectToSwitchOn Vector which fetched items are enabled.
1438  *
1439  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom, ExtractFieldOfBoolFrom
1440  */
1441 void MEDCouplingStructuredMesh::SwitchOnIdsFrom(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat, std::vector<bool>& vectToSwitchOn)
1442 {
1443   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
1444     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::SwitchOnIdsFrom : input arrays must have the same size !");
1445   if((int)vectToSwitchOn.size()!=DeduceNumberOfGivenStructure(st))
1446     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::SwitchOnIdsFrom : invalid size of input vector of boolean regarding the structure !");
1447   std::vector<int> dims(GetDimensionsFromCompactFrmt(partCompactFormat));
1448   switch(st.size())
1449   {
1450     case 3:
1451       {
1452         for(int i=0;i<dims[2];i++)
1453           {
1454             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
1455             for(int j=0;j<dims[1];j++)
1456               {
1457                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1458                 for(int k=0;k<dims[0];k++)
1459                   vectToSwitchOn[partCompactFormat[0].first+k+b+a]=true;
1460               }
1461           }
1462         break;
1463       }
1464     case 2:
1465       {
1466         for(int j=0;j<dims[1];j++)
1467           {
1468             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1469             for(int k=0;k<dims[0];k++)
1470               vectToSwitchOn[partCompactFormat[0].first+k+b]=true;
1471           }
1472         break;
1473       }
1474     case 1:
1475       {
1476         for(int k=0;k<dims[0];k++)
1477           vectToSwitchOn[partCompactFormat[0].first+k]=true;
1478         break;
1479       }
1480     default:
1481       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::SwitchOnIdsFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
1482   }
1483 }
1484
1485 /*!
1486  * Obviously this method is \b NOT wrapped in python.
1487  * This method is close to SwitchOnIdsFrom except that here, a sub field \a fieldOut is built starting from the input field \a fieldOfBool having the structure \a st.
1488  * The extraction is defined by \a partCompactFormat.
1489  *
1490  * \param [in] st The entity structure.
1491  * \param [in] fieldOfBool field of booleans having the size equal to \c MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenStructure(st).
1492  * \param [in] partCompactFormat The compact subpart to be enabled.
1493  * \param [out] fieldOut the result of the extraction.
1494  *
1495  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom, SwitchOnIdsFrom, ExtractFieldOfDoubleFrom
1496  */
1497 void MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfBoolFrom(const std::vector<int>& st, const std::vector<bool>& fieldOfBool, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat, std::vector<bool>& fieldOut)
1498 {
1499   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
1500     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfBoolFrom : input arrays must have the same size !");
1501   if((int)fieldOfBool.size()!=DeduceNumberOfGivenStructure(st))
1502     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfBoolFrom : invalid size of input field of boolean regarding the structure !");
1503   std::vector<int> dims(GetDimensionsFromCompactFrmt(partCompactFormat));
1504   int nbOfTuplesOfOutField(DeduceNumberOfGivenStructure(dims));
1505   fieldOut.resize(nbOfTuplesOfOutField);
1506   int it(0);
1507   switch(st.size())
1508   {
1509     case 3:
1510       {
1511         for(int i=0;i<dims[2];i++)
1512           {
1513             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
1514             for(int j=0;j<dims[1];j++)
1515               {
1516                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1517                 for(int k=0;k<dims[0];k++)
1518                   fieldOut[it++]=fieldOfBool[partCompactFormat[0].first+k+b+a];
1519               }
1520           }
1521         break;
1522       }
1523     case 2:
1524       {
1525         for(int j=0;j<dims[1];j++)
1526           {
1527             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1528             for(int k=0;k<dims[0];k++)
1529               fieldOut[it++]=fieldOfBool[partCompactFormat[0].first+k+b];
1530           }
1531         break;
1532       }
1533     case 1:
1534       {
1535         for(int k=0;k<dims[0];k++)
1536           fieldOut[it++]=fieldOfBool[partCompactFormat[0].first+k];
1537         break;
1538       }
1539     default:
1540       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfBoolFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
1541   }
1542 }
1543
1544 /*!
1545  * This method is close to SwitchOnIdsFrom except that here, a sub field \a fieldOut is built starting from the input field \a fieldOfDbl having the structure \a st.
1546  * The extraction is defined by \a partCompactFormat.
1547  *
1548  * \param [in] st The entity structure.
1549  * \param [in] fieldOfDbl field of doubles having a number of tuples equal to \c MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenStructure(st).
1550  * \param [in] partCompactFormat The compact subpart to be enabled.
1551  * \return DataArrayDouble * -the result of the extraction.
1552  *
1553  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom, SwitchOnIdsFrom, ExtractFieldOfBoolFrom
1554  */
1555 DataArrayDouble *MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfDoubleFrom(const std::vector<int>& st, const DataArrayDouble *fieldOfDbl, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1556 {
1557   if(!fieldOfDbl || !fieldOfDbl->isAllocated())
1558     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfDoubleFrom : input array of double is NULL or not allocated!");
1559   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
1560     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfDoubleFrom : input arrays must have the same size !");
1561   if(fieldOfDbl->getNumberOfTuples()!=DeduceNumberOfGivenStructure(st))
1562     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfDoubleFrom : invalid size of input array of double regarding the structure !");
1563   std::vector<int> dims(GetDimensionsFromCompactFrmt(partCompactFormat));
1564   int nbOfTuplesOfOutField(DeduceNumberOfGivenStructure(dims)),nbComp(fieldOfDbl->getNumberOfComponents());
1565   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New()); ret->alloc(nbOfTuplesOfOutField,nbComp);
1566   ret->copyStringInfoFrom(*fieldOfDbl);
1567   double *ptRet(ret->getPointer());
1568   const double *fieldOfDblPtr(fieldOfDbl->begin());
1569   switch(st.size())
1570   {
1571     case 3:
1572       {
1573         for(int i=0;i<dims[2];i++)
1574           {
1575             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
1576             for(int j=0;j<dims[1];j++)
1577               {
1578                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1579                 for(int k=0;k<dims[0];k++)
1580                   ptRet=std::copy(fieldOfDblPtr+(partCompactFormat[0].first+k+b+a)*nbComp,fieldOfDblPtr+(partCompactFormat[0].first+k+b+a+1)*nbComp,ptRet);
1581               }
1582           }
1583         break;
1584       }
1585     case 2:
1586       {
1587         for(int j=0;j<dims[1];j++)
1588           {
1589             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1590             for(int k=0;k<dims[0];k++)
1591               ptRet=std::copy(fieldOfDblPtr+(partCompactFormat[0].first+k+b)*nbComp,fieldOfDblPtr+(partCompactFormat[0].first+k+b+1)*nbComp,ptRet);
1592           }
1593         break;
1594       }
1595     case 1:
1596       {
1597         for(int k=0;k<dims[0];k++)
1598           ptRet=std::copy(fieldOfDblPtr+(partCompactFormat[0].first+k)*nbComp,fieldOfDblPtr+(partCompactFormat[0].first+k+1)*nbComp,ptRet);
1599         break;
1600       }
1601     default:
1602       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ExtractFieldOfDoubleFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
1603   }
1604   return ret.retn();
1605 }
1606
1607 /*!
1608  * This method changes the reference of a part of structured mesh \a partOfBigInAbs define in absolute reference to a new reference \a bigInAbs.
1609  * So this method only performs a translation by doing \a partOfBigRelativeToBig = \a partOfBigInAbs - \a bigInAbs
1610  * This method also checks (if \a check=true) that \a partOfBigInAbs is included in \a bigInAbs.
1611  * This method is useful to extract a part from a field lying on a big mesh.
1612  *
1613  * \sa ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt, BuildExplicitIdsFrom, SwitchOnIdsFrom, ExtractFieldOfBoolFrom, ExtractFieldOfDoubleFrom
1614  */
1615 void MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt(const std::vector< std::pair<int,int> >& bigInAbs, const std::vector< std::pair<int,int> >& partOfBigInAbs, std::vector< std::pair<int,int> >& partOfBigRelativeToBig, bool check)
1616 {
1617   std::size_t dim(bigInAbs.size());
1618   if(dim!=partOfBigInAbs.size())
1619     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt : The size of parts (dimension) must be the same !");
1620   partOfBigRelativeToBig.resize(dim);
1621   for(std::size_t i=0;i<dim;i++)
1622     {
1623       if(check)
1624         {
1625           if(bigInAbs[i].first>bigInAbs[i].second)
1626             {
1627               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt : Error at axis #" << i << " the input big part invalid, end before start !";
1628               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1629             }
1630           if(partOfBigInAbs[i].first<bigInAbs[i].first || partOfBigInAbs[i].first>=bigInAbs[i].second)
1631             {
1632               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt : Error at axis #" << i << " the part is not included in the big one (start) !";
1633               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1634             }
1635         }
1636       partOfBigRelativeToBig[i].first=partOfBigInAbs[i].first-bigInAbs[i].first;
1637       if(check)
1638         {
1639           if(partOfBigInAbs[i].second<partOfBigInAbs[i].first || partOfBigInAbs[i].second>bigInAbs[i].second)
1640             {
1641               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt : Error at axis #" << i << " the part is not included in the big one (end) !";
1642               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1643             }
1644         }
1645       partOfBigRelativeToBig[i].second=partOfBigInAbs[i].second-bigInAbs[i].first;
1646     }
1647 }
1648
1649 /*
1650  * This method is performs the opposite reference modification than explained in ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt.
1651  *
1652  * \sa ChangeReferenceFromGlobalOfCompactFrmt
1653  */
1654 void MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt(const std::vector< std::pair<int,int> >& bigInAbs, const std::vector< std::pair<int,int> >& partOfBigRelativeToBig, std::vector< std::pair<int,int> >& partOfBigInAbs, bool check)
1655 {
1656   std::size_t dim(bigInAbs.size());
1657   if(dim!=partOfBigRelativeToBig.size())
1658     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt : The size of parts (dimension) must be the same !");
1659   partOfBigInAbs.resize(dim);
1660   for(std::size_t i=0;i<dim;i++)
1661     {
1662       if(check)
1663         {
1664           if(bigInAbs[i].first>bigInAbs[i].second)
1665             {
1666               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt : Error at axis #" << i << " the input big part invalid, end before start !";
1667               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1668             }
1669           if(partOfBigRelativeToBig[i].first<0 || partOfBigRelativeToBig[i].first>=bigInAbs[i].second-bigInAbs[i].first)
1670             {
1671               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt : Error at axis #" << i << " the start of part is not in the big one !";
1672               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1673             }
1674         }
1675       partOfBigInAbs[i].first=partOfBigRelativeToBig[i].first+bigInAbs[i].first;
1676       if(check)
1677         {
1678           if(partOfBigRelativeToBig[i].second<partOfBigRelativeToBig[i].first || partOfBigRelativeToBig[i].second>bigInAbs[i].second-bigInAbs[i].first)
1679             {
1680               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::ChangeReferenceToGlobalOfCompactFrmt : Error at axis #" << i << " the end of part is not in the big one !";
1681               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1682             }
1683         }
1684       partOfBigInAbs[i].second=partOfBigRelativeToBig[i].second+bigInAbs[i].first;
1685     }
1686 }
1687
1688 /*!
1689  * This method performs a translation (defined by \a translation) of \a part and returns the result of translated part.
1690  *
1691  * \sa FindTranslationFrom
1692  */
1693 std::vector< std::pair<int,int> > MEDCouplingStructuredMesh::TranslateCompactFrmt(const std::vector< std::pair<int,int> >& part, const std::vector<int>& translation)
1694 {
1695   std::size_t sz(part.size());
1696   if(translation.size()!=sz)
1697     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::TranslateCompactFrmt : the sizes are not equal !");
1698   std::vector< std::pair<int,int> > ret(sz);
1699   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1700     {
1701       ret[i].first=part[i].first+translation[i];
1702       ret[i].second=part[i].second+translation[i];
1703     }
1704   return ret;
1705 }
1706
1707 /*!
1708  * \sa TranslateCompactFrmt
1709  */
1710 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::FindTranslationFrom(const std::vector< std::pair<int,int> >& startingFrom, const std::vector< std::pair<int,int> >& goingTo)
1711 {
1712   std::size_t sz(startingFrom.size());
1713   if(goingTo.size()!=sz)
1714     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::FindTranslationFrom : the sizes are not equal !");
1715   std::vector< int > ret(sz);
1716   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1717     {
1718       ret[i]=goingTo[i].first-startingFrom[i].first;
1719     }
1720   return ret;
1721 }
1722
1723 /*!
1724  * This method builds the explicit entity array from the structure in \a st and the range in \a partCompactFormat.
1725  * If the range contains invalid values regarding sructure an exception will be thrown.
1726  *
1727  * \return DataArrayInt * - a new object.
1728  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured, MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenRangeInCompactFrmt, SwitchOnIdsFrom, ExtractFieldOfBoolFrom, ExtractFieldOfDoubleFrom, MultiplyPartOf
1729  */
1730 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
1731 {
1732   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
1733     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : input arrays must have the same size !");
1734   int nbOfItems(1);
1735   std::vector<int> dims(st.size());
1736   for(std::size_t i=0;i<st.size();i++)
1737     {
1738       if(partCompactFormat[i].first<0 || partCompactFormat[i].first>st[i])
1739         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 1 !");
1740       if(partCompactFormat[i].second<0 || partCompactFormat[i].second>st[i])
1741         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 2 !");
1742       if(partCompactFormat[i].second<partCompactFormat[i].first)
1743         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 3 !");
1744       dims[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
1745       nbOfItems*=dims[i];
1746     }
1747   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
1748   ret->alloc(nbOfItems,1);
1749   int *pt(ret->getPointer());
1750   switch(st.size())
1751   {
1752     case 3:
1753       {
1754         for(int i=0;i<dims[2];i++)
1755           {
1756             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
1757             for(int j=0;j<dims[1];j++)
1758               {
1759                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1760                 for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
1761                   *pt=partCompactFormat[0].first+k+b+a;
1762               }
1763           }
1764         break;
1765       }
1766     case 2:
1767       {
1768         for(int j=0;j<dims[1];j++)
1769           {
1770             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
1771             for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
1772               *pt=partCompactFormat[0].first+k+b;
1773           }
1774         break;
1775       }
1776     case 1:
1777       {
1778         for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
1779           *pt=partCompactFormat[0].first+k;
1780         break;
1781       }
1782     default:
1783       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
1784   }
1785   return ret.retn();
1786 }
1787
1788 /*!
1789  * This method multiplies by \a factor values in tuples located by \a part in \a da.
1790  *
1791  * \param [in] st - the structure of grid ( \b without considering ghost cells).
1792  * \param [in] part - the part in the structure ( \b without considering ghost cells) contained in grid whose structure is defined by \a st.
1793  * \param [in] factor - the factor, the tuples in \a da will be multiply by.
1794  * \param [in,out] da - The DataArray in wich only tuples specified by \a part will be modified.
1795  *
1796  * \sa BuildExplicitIdsFrom
1797  */
1798 void MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& part, double factor, DataArrayDouble *da)
1799 {
1800   if(!da || !da->isAllocated())
1801     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : DataArrayDouble instance must be not NULL and allocated !");
1802   if(st.size()!=part.size())
1803     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : input arrays must have the same size !");
1804   std::vector<int> dims(st.size());
1805   for(std::size_t i=0;i<st.size();i++)
1806     {
1807       if(part[i].first<0 || part[i].first>st[i])
1808         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : invalid input range 1 !");
1809       if(part[i].second<0 || part[i].second>st[i])
1810         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : invalid input range 2 !");
1811       if(part[i].second<part[i].first)
1812         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : invalid input range 3 !");
1813       dims[i]=part[i].second-part[i].first;
1814     }
1815   int nbOfTuplesExp(MEDCouplingStructuredMesh::DeduceNumberOfGivenStructure(st)),nbCompo(da->getNumberOfComponents());
1816   if(da->getNumberOfTuples()!=nbOfTuplesExp)
1817     {
1818       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : invalid nb of tuples ! Expected " << nbOfTuplesExp << " having " << da->getNumberOfTuples() << " !";
1819       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1820     }
1821   double *pt(da->getPointer());
1822   switch(st.size())
1823   {
1824     case 3:
1825       {
1826         for(int i=0;i<dims[2];i++)
1827           {
1828             int a=(part[2].first+i)*st[0]*st[1];
1829             for(int j=0;j<dims[1];j++)
1830               {
1831                 int b=(part[1].first+j)*st[0];
1832                 for(int k=0;k<dims[0];k++)
1833                   {
1834                     int offset(part[0].first+k+b+a);
1835                     std::transform(pt+nbCompo*offset,pt+nbCompo*(offset+1),pt+nbCompo*offset,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),factor));
1836                   }
1837               }
1838           }
1839         break;
1840       }
1841     case 2:
1842       {
1843         for(int j=0;j<dims[1];j++)
1844           {
1845             int b=(part[1].first+j)*st[0];
1846             for(int k=0;k<dims[0];k++)
1847               {
1848                 int offset(part[0].first+k+b);
1849                 std::transform(pt+nbCompo*offset,pt+nbCompo*(offset+1),pt+nbCompo*offset,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),factor));
1850               }
1851           }
1852         break;
1853       }
1854     case 1:
1855       {
1856         for(int k=0;k<dims[0];k++)
1857           {
1858             int offset(part[0].first+k);
1859             std::transform(pt+nbCompo*offset,pt+nbCompo*(offset+1),pt+nbCompo*offset,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),factor));
1860           }
1861         break;
1862       }
1863     default:
1864       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOf : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
1865   }
1866 }
1867
1868 /*!
1869  * This method multiplies by \a factor values in tuples located by \a part in \a da.
1870  *
1871  * \param [in] st - the structure of grid ( \b without considering ghost cells).
1872  * \param [in] part - the part in the structure ( \b without considering ghost cells) contained in grid whose structure is defined by \a st.
1873  * \param [in] ghostSize - \a ghostSize must be >= 0.
1874  * \param [in] factor - the factor, the tuples in \a da will be multiply by.
1875  * \param [in,out] da - The DataArray in wich only tuples specified by \a part will be modified.
1876  *
1877  * \sa MultiplyPartOf, PutInGhostFormat
1878  */
1879 void MEDCouplingStructuredMesh::MultiplyPartOfByGhost(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& part, int ghostSize, double factor, DataArrayDouble *da)
1880 {
1881   std::vector<int> stWG;
1882   std::vector< std::pair<int,int> > partWG;
1883   PutInGhostFormat(ghostSize,st,part,stWG,partWG);
1884   MultiplyPartOf(stWG,partWG,factor,da);
1885 }
1886
1887 /*!
1888  * This method multiplies by \a factor values in tuples located by \a part in \a da.
1889  *
1890  * \param [in] st - the structure of grid ( \b without considering ghost cells).
1891  * \param [in] part - the part in the structure ( \b without considering ghost cells) contained in grid whose structure is defined by \a st.
1892  * \param [in] ghostSize - \a ghostSize must be >= 0.
1893  * \param [out] stWithGhost - the structure considering ghost cells.
1894  * \param [out] partWithGhost - the part considering the ghost cells.
1895  *
1896  * \sa MultiplyPartOf, PutInGhostFormat
1897  */
1898 void MEDCouplingStructuredMesh::PutInGhostFormat(int ghostSize, const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& part, std::vector<int>& stWithGhost, std::vector< std::pair<int,int> >&partWithGhost)
1899 {
1900   if(ghostSize<0)
1901     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::PutInGhostFormat : ghost size must be >= 0 !");
1902   std::size_t dim(part.size());
1903   if(st.size()!=dim)
1904     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::PutInGhostFormat : the dimension of input vectors must be the same !");
1905   for(std::size_t i=0;i<dim;i++)
1906     if(part[i].first<0 || part[i].first>part[i].second || part[i].second>st[i])
1907       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::PutInGhostFormat : the specified part is invalid ! The begin must be >= 0 and <= end ! The end must be <= to the size at considered dimension !");
1908   stWithGhost.resize(st.size());
1909   std::transform(st.begin(),st.end(),stWithGhost.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),2*ghostSize));
1910   partWithGhost=part;
1911   ApplyGhostOnCompactFrmt(partWithGhost,ghostSize);
1912 }
1913
1914 /*!
1915  * \param [in,out] partBeforeFact - the part of a image mesh in compact format that will be put in ghost reference.
1916  * \param [in] ghostSize - the ghost size of zone for all axis.
1917  */
1918 void MEDCouplingStructuredMesh::ApplyGhostOnCompactFrmt(std::vector< std::pair<int,int> >& partBeforeFact, int ghostSize)
1919 {
1920   if(ghostSize<0)
1921     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::ApplyGhostOnCompactFrmt : ghost size must be >= 0 !");
1922   std::size_t sz(partBeforeFact.size());
1923   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1924     {
1925       partBeforeFact[i].first+=ghostSize;
1926       partBeforeFact[i].second+=ghostSize;
1927     }
1928 }
1929
1930 int MEDCouplingStructuredMesh::GetNumberOfCellsOfSubLevelMesh(const std::vector<int>& cgs, int mdim)
1931 {
1932   int ret(0);
1933   for(int i=0;i<mdim;i++)
1934     {
1935       int locRet(1);
1936       for(int j=0;j<mdim;j++)
1937         if(j!=i)
1938           locRet*=cgs[j];
1939         else
1940           locRet*=cgs[j]+1;
1941       ret+=locRet;
1942     }
1943   return ret;
1944 }