src/MEDCoupling/MEDCouplingStructuredMesh.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingStructuredMesh.hxx"
  22 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  23 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  24 #include "MEDCoupling1GTUMesh.hxx"
  25 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  26
  27 #include <numeric>
  28
  29 using namespace ParaMEDMEM;
  30
  31 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh()
  32 {
  33 }
  34
  35 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh(const MEDCouplingStructuredMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other)
  36 {
  37 }
  38
  39 MEDCouplingStructuredMesh::~MEDCouplingStructuredMesh()
  40 {
  41 }
  42
  43 std::size_t MEDCouplingStructuredMesh::getHeapMemorySize() const
  44 {
  45   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySize();
  46 }
  47
  48 void MEDCouplingStructuredMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  49 {
  50   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
  51 }
  52
  53 bool MEDCouplingStructuredMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  54 {
  55   return MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason);
  56 }
  57
  58 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
  59 {
  60   return GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension());
  61 }
  62
  63 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(int meshDim) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  64 {
  65   switch(meshDim)
  66     {
  67     case 3:
  68       return INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8;
  69     case 2:
  70       return INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4;
  71     case 1:
  72       return INTERP_KERNEL::NORM_SEG2;
  73     default:
  74       throw INTERP_KERNEL::Exception("Unexpected dimension for MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension !");
  75     }
  76 }
  77
  78 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingStructuredMesh::getAllGeoTypes() const
  79 {
  80   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret2;
  81   ret2.insert(getTypeOfCell(0));
  82   return ret2;
  83 }
  84
  85 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
  86 {
  87   int ret=getNumberOfCells();
  88   if(type==getTypeOfCell(0))
  89     return ret;
  90   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
  91   std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType : no specified type ! Type available is " << cm.getRepr() << " !";
  92   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
  93 }
  94
  95 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  96 {
  97   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
  98   if(getTypeOfCell(0)==type)
  99     {
 100       ret->alloc(getNumberOfCells(),1);
 101       ret->iota(0);
 102     }
 103   else
 104     ret->alloc(0,1);
 105   return ret.retn();
 106 }
 107
 108 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 109 {
 110   int nbCells=getNumberOfCells();
 111   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 112   ret->alloc(nbCells,1);
 113   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
 114   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfNodes());
 115   return ret.retn();
 116 }
 117
 118 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfFacesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 119 {
 120   int nbCells=getNumberOfCells();
 121   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 122   ret->alloc(nbCells,1);
 123   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
 124   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfSons());
 125   return ret.retn();
 126 }
 127
 128 /*!
 129  * This method computes effective number of nodes per cell. That is to say nodes appearing several times in nodal connectivity of a cell,
 130  * will be counted only once here whereas it will be counted several times in MEDCouplingMesh::computeNbOfNodesPerCell method.
 131  * Here for structured mesh it returns exactly as MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell does.
 132  *
 133  * \return DataArrayInt * - new object to be deallocated by the caller.
 134  */
 135 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 136 {
 137   return computeNbOfNodesPerCell();
 138 }
 139
 140 void MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
 141 {
 142   int meshDim=getMeshDimension();
 143   int tmpCell[3],tmpNode[3];
 144   getSplitCellValues(tmpCell);
 145   getSplitNodeValues(tmpNode);
 146   int tmp2[3];
 147   GetPosFromId(cellId,meshDim,tmpCell,tmp2);
 148   switch(meshDim)
 149     {
 150     case 1:
 151       conn.push_back(tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[0]+1);
 152       break;
 153     case 2:
 154       conn.push_back(tmp2[1]*tmpCell[1]+tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpCell[1]+tmp2[0]+1);
 155       conn.push_back((tmp2[1]+1)*(tmpCell[1]+1)+tmp2[0]+1); conn.push_back((tmp2[1]+1)*(tmpCell[1]+1)+tmp2[0]);
 156       break;
 157     case 3:
 158       conn.push_back(tmp2[1]*tmpCell[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpCell[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]);
 159       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]);
 160       conn.push_back(tmp2[1]*tmpCell[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpCell[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
 161       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
 162       break;
 163     default:
 164       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell : big problem spacedim must be in 1,2 or 3 !");
 165     };
 166 }
 167
 168 /*!
 169  * See MEDCouplingUMesh::getDistributionOfTypes for more information
 170  */
 171 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 172 {
 173   //only one type of cell
 174   std::vector<int> ret(3);
 175   ret[0]=getTypeOfCell(0);
 176   ret[1]=getNumberOfCells();
 177   ret[2]=-1; //ret[3*k+2]==-1 because it has no sense here
 178   return ret;
 179 }
 180
 181 /*!
 182  * This method tries to minimize at most the number of deep copy.
 183  * So if \a idsPerType is not empty it can be returned directly (without copy, but with ref count incremented) in return.
 184  *
 185  * See MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig for more information
 186  */
 187 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 188 {
 189   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 190   if(code.size()!=3)
 191     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : invalid input code should be exactly of size 3 !");
 192   if(code[0]!=(int)getTypeOfCell(0))
 193     {
 194       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : Mismatch of geometric type ! Asking for " << code[0] << " whereas the geometric type is \a this is " << getTypeOfCell(0) << " !";
 195       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 196     }
 197   if(code[2]==-1)
 198     {
 199       if(code[1]==nbOfCells)
 200         return 0;
 201       else
 202         {
 203           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : mismatch between the number of cells in this (" << nbOfCells << ") and the number of non profile (" << code[1] << ") !";
 204           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 205         }
 206     }
 207   if(code[2]!=0)
 208     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : single geo type mesh ! 0 or -1 is expected at pos #2 of input code !");
 209   if(idsPerType.size()!=1)
 210     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input code points to DataArrayInt #0 whereas the size of idsPerType is not equal to 1 !");
 211   const DataArrayInt *pfl=idsPerType[0];
 212   if(!pfl)
 213     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : the input code points to a NULL DataArrayInt at rank 0 !");
 214   if(pfl->getNumberOfComponents()!=1)
 215     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input profile should have exactly one component !");
 216   pfl->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
 217   pfl->incrRef();
 218   return const_cast<DataArrayInt *>(pfl);
 219 }
 220
 221 /*!
 222  * This method is the opposite of MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method. Given a list of cells in \a profile it returns a list of sub-profiles sorted by geo type.
 223  * The result is put in the array \a idsPerType. In the returned parameter \a code, foreach i \a code[3*i+2] refers (if different from -1) to a location into the \a idsPerType.
 224  * This method has 1 input \a profile and 3 outputs \a code \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
 225  *
 226  * \param [out] code is a vector of size 3*n where n is the number of different geometric type in \a this \b reduced to the profile \a profile. \a code has exactly the same semantic than in MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method.
 227  * \param [out] idsInPflPerType is a vector of size of different geometric type in the subpart defined by \a profile of \a this ( equal to \a code.size()/3). For each i,
 228  *              \a idsInPflPerType[i] stores the tuple ids in \a profile that correspond to the geometric type code[3*i+0]
 229  * \param [out] idsPerType is a vector of size of different sub profiles needed to be defined to represent the profile \a profile for a given geometric type.
 230  *              This vector can be empty in case of all geometric type cells are fully covered in ascending in the given input \a profile.
 231  *
 232  * \warning for performance reasons no deep copy will be performed, if \a profile can been used as this in output parameters \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
 233  *
 234  * \throw if \a profile has not exactly one component. It throws too, if \a profile contains some values not in [0,getNumberOfCells()) or if \a this is not fully defined
 235  *
 236  *  \b Example1: <br>
 237  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [0,1,2]
 238  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,-1], \a idsInPflPerType [[0,1,2]] and \a idsPerType is empty <br>
 239  *
 240  *  \b Example2: <br>
 241  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [1,2]
 242  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,0], \a idsInPflPerType [[0,1]] and \a idsPerType is [[1,2]] <br>
 243
 244  */
 245 void MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 246 {
 247   if(!profile)
 248     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile is NULL !");
 249   if(profile->getNumberOfComponents()!=1)
 250     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile should have exactly one component !");
 251   int nbTuples=profile->getNumberOfTuples();
 252   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 253   code.resize(3); idsInPflPerType.resize(1);
 254   code[0]=(int)getTypeOfCell(0); code[1]=nbOfCells;
 255   idsInPflPerType.resize(1);
 256   if(profile->isIdentity() && nbTuples==nbOfCells)
 257     {
 258       code[2]=-1;
 259       idsInPflPerType[0]=const_cast<DataArrayInt *>(profile); idsInPflPerType[0]->incrRef();
 260       idsPerType.clear();
 261     }
 262   code[2]=0;
 263   profile->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
 264   idsPerType.resize(1);
 265   idsPerType[0]=const_cast<DataArrayInt *>(profile); idsPerType[0]->incrRef();
 266   idsInPflPerType[0]=DataArrayInt::Range(0,nbTuples,1);
 267 }
 268
 269 /*!
 270  * Creates a new unstructured mesh (MEDCoupling1SGTUMesh) from \a this structured one.
 271  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 272  * delete this array using decrRef() as it is no more needed.
 273  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
 274  */
 275 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 276 {
 277   int meshDim=getMeshDimension();
 278   if(meshDim<0 || meshDim>3)
 279     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured : meshdim must be in [1,2,3] !");
 280   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords(getCoordinatesAndOwner());
 281   int ns[3];
 282   getNodeGridStructure(ns);
 283   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(Build1GTNodalConnectivity(ns,ns+meshDim));
 284   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret(MEDCoupling1SGTUMesh::New(getName().c_str(),GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim)));
 285   ret->setNodalConnectivity(conn); ret->setCoords(coords);
 286   return ret.retn();
 287 }
 288
 289 /*!
 290  * Creates a new unstructured mesh (MEDCouplingUMesh) from \a this structured one.
 291  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 292  * delete this array using decrRef() as it is no more needed.
 293  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
 294  */
 295 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 296 {
 297   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret0(build1SGTUnstructured());
 298   return ret0->buildUnstructured();
 299 }
 300
 301 /*!
 302  * Creates a new MEDCouplingUMesh containing a part of cells of \a this mesh.
 303  * The cells to include to the
 304  * result mesh are specified by an array of cell ids.
 305  *  \param [in] start - an array of cell ids to include to the result mesh.
 306  *  \param [in] end - specifies the end of the array \a start, so that
 307  *              the last value of \a start is \a end[ -1 ].
 308  *  \return MEDCouplingMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 309  *         delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
 310  */
 311 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
 312 {
 313   MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
 314   MEDCouplingMesh *ret=um->buildPart(start,end);
 315   um->decrRef();
 316   return ret;
 317 }
 318
 319 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
 320 {
 321   std::vector<int> cgs(getCellGridStructure());
 322   std::vector< std::pair<int,int> > cellPartFormat,nodePartFormat;
 323   if(IsPartStructured(start,end,cgs,cellPartFormat))
 324     {
 325       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingStructuredMesh> ret(buildStructuredSubPart(cellPartFormat));
 326       nodePartFormat=cellPartFormat;
 327       for(std::vector< std::pair<int,int> >::iterator it=nodePartFormat.begin();it!=nodePartFormat.end();it++)
 328         (*it).second++;
 329       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp1(BuildExplicitIdsFrom(getNodeGridStructure(),nodePartFormat));
 330       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp2(DataArrayInt::New()); tmp2->alloc(getNumberOfNodes(),1);
 331       tmp2->fillWithValue(-1);
 332       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp3(DataArrayInt::New()); tmp3->alloc(tmp1->getNumberOfTuples(),1); tmp3->iota(0);
 333       tmp2->setPartOfValues3(tmp3,tmp1->begin(),tmp1->end(),0,1,1);
 334       arr=tmp2.retn();
 335       return ret.retn();
 336     }
 337   else
 338     {
 339       MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
 340       MEDCouplingMesh *ret=um->buildPartAndReduceNodes(start,end,arr);
 341       um->decrRef();
 342       return ret;
 343     }
 344 }
 345
 346 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 347 {
 348   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::simplexize : not available for Cartesian mesh !");
 349 }
 350
 351 /*!
 352  * Returns a new MEDCouplingFieldDouble holding normal vectors to cells of \a this
 353  * 2D mesh. The computed vectors have 3 components and are normalized.
 354  *  \return MEDCouplingFieldDouble * - a new instance of MEDCouplingFieldDouble on
 355  *          cells and one time. The caller is to delete this field using decrRef() as
 356  *          it is no more needed.
 357  *  \throw If \a this->getMeshDimension() != 2.
 358  */
 359 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingStructuredMesh::buildOrthogonalField() const
 360 {
 361   if(getMeshDimension()!=2)
 362     throw INTERP_KERNEL::Exception("Expected a MEDCouplingStructuredMesh with meshDim == 2 !");
 363   MEDCouplingFieldDouble *ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,NO_TIME);
 364   DataArrayDouble *array=DataArrayDouble::New();
 365   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 366   array->alloc(nbOfCells,3);
 367   double *vals=array->getPointer();
 368   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
 369     { vals[3*i]=0.; vals[3*i+1]=0.; vals[3*i+2]=1.; }
 370   ret->setArray(array);
 371   array->decrRef();
 372   ret->setMesh(this);
 373   return ret;
 374 }
 375
 376 /*!
 377  * \return DataArrayInt * - newly allocated instance of nodal connectivity compatible for MEDCoupling1SGTMesh instance
 378  */
 379 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity(const int *nodeStBg, const int *nodeStEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 380 {
 381   std::size_t dim=std::distance(nodeStBg,nodeStEnd);
 382   switch(dim)
 383     {
 384     case 1:
 385       return Build1GTNodalConnectivity1D(nodeStBg);
 386     case 2:
 387       return Build1GTNodalConnectivity2D(nodeStBg);
 388     case 3:
 389       return Build1GTNodalConnectivity3D(nodeStBg);
 390     default:
 391       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity : only dimension in [1,2,3] supported !");
 392     }
 393 }
 394
 395 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity1D(const int *nodeStBg) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 396 {
 397   int nbOfCells(*nodeStBg-1);
 398   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 399   conn->alloc(2*nbOfCells,1);
 400   int *cp=conn->getPointer();
 401   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
 402     {
 403       cp[2*i+0]=i;
 404       cp[2*i+1]=i+1;
 405     }
 406   return conn.retn();
 407 }
 408
 409 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity2D(const int *nodeStBg) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 410 {
 411   int n1=nodeStBg[0]-1;
 412   int n2=nodeStBg[1]-1;
 413   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 414   conn->alloc(4*n1*n2,1);
 415   int *cp=conn->getPointer();
 416   int pos=0;
 417   for(int j=0;j<n2;j++)
 418     for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
 419       {
 420         cp[4*pos+0]=i+1+j*(n1+1);
 421         cp[4*pos+1]=i+j*(n1+1);
 422         cp[4*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1);
 423         cp[4*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1);
 424     }
 425   return conn.retn();
 426 }
 427
 428 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity3D(const int *nodeStBg) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 429 {
 430   int n1=nodeStBg[0]-1;
 431   int n2=nodeStBg[1]-1;
 432   int n3=nodeStBg[2]-1;
 433   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 434   conn->alloc(8*n1*n2*n3,1);
 435   int *cp=conn->getPointer();
 436   int pos=0;
 437   for(int k=0;k<n3;k++)
 438     for(int j=0;j<n2;j++)
 439       for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
 440         {
 441           int tmp=(n1+1)*(n2+1);
 442           cp[8*pos+0]=i+1+j*(n1+1)+k*tmp;
 443           cp[8*pos+1]=i+j*(n1+1)+k*tmp;
 444           cp[8*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
 445           cp[8*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
 446           cp[8*pos+4]=i+1+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 447           cp[8*pos+5]=i+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 448           cp[8*pos+6]=i+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 449           cp[8*pos+7]=i+1+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 450         }
 451   return conn.retn();
 452 }
 453
 454 /*!
 455  * Returns a cell id by its (i,j,k) index. The cell is located between the i-th and
 456  * ( i + 1 )-th nodes along X axis etc.
 457  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
 458  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
 459  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
 460  *  \return int - a cell id in \a this mesh.
 461  */
 462 int MEDCouplingStructuredMesh::getCellIdFromPos(int i, int j, int k) const
 463 {
 464   int tmp[3]={i,j,k};
 465   int tmp2[3];
 466   int meshDim=getMeshDimension();
 467   getSplitCellValues(tmp2);
 468   std::transform(tmp,tmp+meshDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
 469   return std::accumulate(tmp,tmp+meshDim,0);
 470 }
 471
 472 /*!
 473  * Returns a node id by its (i,j,k) index.
 474  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
 475  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
 476  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
 477  *  \return int - a node id in \a this mesh.
 478  */
 479 int MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdFromPos(int i, int j, int k) const
 480 {
 481   int tmp[3]={i,j,k};
 482   int tmp2[3];
 483   int meshDim=getMeshDimension();
 484   getSplitNodeValues(tmp2);
 485   std::transform(tmp,tmp+meshDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
 486   return std::accumulate(tmp,tmp+meshDim,0);
 487 }
 488
 489 void MEDCouplingStructuredMesh::GetPosFromId(int nodeId, int meshDim, const int *split, int *res)
 490 {
 491   int work=nodeId;
 492   for(int i=meshDim-1;i>=0;i--)
 493     {
 494       int pos=work/split[i];
 495       work=work%split[i];
 496       res[i]=pos;
 497     }
 498 }
 499
 500 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getCellGridStructure() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 501 {
 502   std::vector<int> ret(getNodeGridStructure());
 503   std::transform(ret.begin(),ret.end(),ret.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),-1));
 504   return ret;
 505 }
 506
 507 /*!
 508  * This method states if given part ids [ \a startIds, \a stopIds) and a structure \a st returns if it can be considered as a structured dataset.
 509  * If true is returned \a partCompactFormat will contain the information to build the corresponding part.
 510  *
 511  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom
 512  */
 513 bool MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured(const int *startIds, const int *stopIds, const std::vector<int>& st, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 514 {
 515   int dim((int)st.size());
 516   partCompactFormat.resize(dim);
 517   if(dim<1 || dim>3)
 518     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::isPartStructured : input structure must be of dimension in [1,2,3] !");
 519   std::vector<int> tmp2(dim),tmp(dim),tmp3(dim),tmp4(dim); tmp2[0]=1;
 520   for(int i=1;i<dim;i++)
 521     tmp2[i]=tmp2[i-1]*st[i-1];
 522   std::size_t sz(std::distance(startIds,stopIds));
 523   if(sz==0)
 524     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : empty input !");
 525   GetPosFromId(*startIds,dim,&tmp2[0],&tmp[0]);
 526   partCompactFormat.resize(dim);
 527   for(int i=0;i<dim;i++)
 528     partCompactFormat[i].first=tmp[i];
 529   if(tmp[dim-1]<0 || tmp[dim-1]>=st[dim-1])
 530     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : first id in input is not in valid range !");
 531   if(sz==1)
 532     {
 533       for(int i=0;i<dim;i++)
 534         partCompactFormat[i].second=tmp[i]+1;
 535       return true;
 536     }
 537   GetPosFromId(startIds[sz-1],dim,&tmp2[0],&tmp3[0]);
 538   int szExp(1);
 539   for(int i=0;i<dim;i++)
 540     {
 541       if(tmp3[i]<0 || tmp3[i]>=st[i])
 542         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : last id in input is not in valid range !");
 543       partCompactFormat[i].second=tmp3[i]+1;
 544       tmp4[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
 545       if(tmp4[i]<=0)
 546         return false;
 547       szExp*=tmp4[i];
 548     }
 549   if(szExp!=(int)sz)
 550     return false;
 551   const int *w(startIds);
 552   switch(dim)
 553     {
 554     case 3:
 555       {
 556         for(int i=0;i<tmp4[2];i++)
 557           {
 558             int a=tmp2[2]*(partCompactFormat[2].first+i);
 559             for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
 560               {
 561                 int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
 562                 for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 563                   {
 564                     if(partCompactFormat[0].first+k+b+a!=*w)
 565                       return false;
 566                   }
 567               }
 568           }
 569         return true;
 570       }
 571     case 2:
 572       {
 573         for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
 574           {
 575             int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
 576             for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 577               {
 578                 if(partCompactFormat[0].first+k+b!=*w)
 579                   return false;
 580               }
 581           }
 582         return true;
 583       }
 584     case 1:
 585       {
 586         for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 587           {
 588             if(partCompactFormat[0].first+k!=*w)
 589               return false;
 590           }
 591         return true;
 592       }
 593     default:
 594       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : internal error !");
 595     }
 596 }
 597
 598 /*!
 599  * This method builds the explicit entity array from the structure in \a st and the range in \a partCompactFormat.
 600  *If the range contains invalid values regarding sructure an exception will be thrown.
 601  *
 602  * \return DataArrayInt * - a new object.
 603  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured
 604  */
 605 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 606 {
 607   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
 608     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : input arrays must have the same size !");
 609   int nbOfItems(1);
 610   std::vector<int> dims(st.size());
 611   for(std::size_t i=0;i<st.size();i++)
 612     {
 613       if(partCompactFormat[i].first<0 || partCompactFormat[i].first>st[i])
 614         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 1 !");
 615       if(partCompactFormat[i].second<0 || partCompactFormat[i].second>st[i])
 616         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 2 !");
 617       if(partCompactFormat[i].second<=partCompactFormat[i].first)
 618         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 3 !");
 619       dims[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
 620       nbOfItems*=dims[i];
 621     }
 622   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
 623   ret->alloc(nbOfItems,1);
 624   int *pt(ret->getPointer());
 625   switch(st.size())
 626     {
 627     case 3:
 628       {
 629         for(int i=0;i<dims[2];i++)
 630           {
 631             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
 632             for(int j=0;j<dims[1];j++)
 633               {
 634                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
 635                 for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 636                   *pt=partCompactFormat[0].first+k+b+a;
 637               }
 638           }
 639         break;
 640       }
 641     case 2:
 642       {
 643         for(int j=0;j<dims[1];j++)
 644           {
 645             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
 646             for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 647               *pt=partCompactFormat[0].first+k+b;
 648           }
 649         break;
 650       }
 651     case 1:
 652       {
 653         for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 654           *pt=partCompactFormat[0].first+k;
 655         break;
 656       }
 657     default:
 658       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
 659     }
 660   return ret.retn();
 661 }