src/MEDCoupling/MEDCouplingStructuredMesh.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingStructuredMesh.hxx"
  22 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  23 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  24 #include "MEDCoupling1GTUMesh.hxx"
  25 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  26
  27 #include <numeric>
  28
  29 using namespace ParaMEDMEM;
  30
  31 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh()
  32 {
  33 }
  34
  35 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh(const MEDCouplingStructuredMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other)
  36 {
  37 }
  38
  39 MEDCouplingStructuredMesh::~MEDCouplingStructuredMesh()
  40 {
  41 }
  42
  43 std::size_t MEDCouplingStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  44 {
  45   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
  46 }
  47
  48 void MEDCouplingStructuredMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  49 {
  50   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
  51 }
  52
  53 bool MEDCouplingStructuredMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  54 {
  55   return MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason);
  56 }
  57
  58 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
  59 {
  60   return GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension());
  61 }
  62
  63 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(int meshDim) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  64 {
  65   switch(meshDim)
  66     {
  67     case 3:
  68       return INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8;
  69     case 2:
  70       return INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4;
  71     case 1:
  72       return INTERP_KERNEL::NORM_SEG2;
  73     default:
  74       throw INTERP_KERNEL::Exception("Unexpected dimension for MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension !");
  75     }
  76 }
  77
  78 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingStructuredMesh::getAllGeoTypes() const
  79 {
  80   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret2;
  81   ret2.insert(getTypeOfCell(0));
  82   return ret2;
  83 }
  84
  85 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
  86 {
  87   int ret=getNumberOfCells();
  88   if(type==getTypeOfCell(0))
  89     return ret;
  90   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
  91   std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType : no specified type ! Type available is " << cm.getRepr() << " !";
  92   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
  93 }
  94
  95 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  96 {
  97   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
  98   if(getTypeOfCell(0)==type)
  99     {
 100       ret->alloc(getNumberOfCells(),1);
 101       ret->iota(0);
 102     }
 103   else
 104     ret->alloc(0,1);
 105   return ret.retn();
 106 }
 107
 108 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 109 {
 110   int nbCells=getNumberOfCells();
 111   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 112   ret->alloc(nbCells,1);
 113   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
 114   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfNodes());
 115   return ret.retn();
 116 }
 117
 118 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfFacesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 119 {
 120   int nbCells=getNumberOfCells();
 121   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 122   ret->alloc(nbCells,1);
 123   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
 124   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfSons());
 125   return ret.retn();
 126 }
 127
 128 /*!
 129  * This method computes effective number of nodes per cell. That is to say nodes appearing several times in nodal connectivity of a cell,
 130  * will be counted only once here whereas it will be counted several times in MEDCouplingMesh::computeNbOfNodesPerCell method.
 131  * Here for structured mesh it returns exactly as MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell does.
 132  *
 133  * \return DataArrayInt * - new object to be deallocated by the caller.
 134  */
 135 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 136 {
 137   return computeNbOfNodesPerCell();
 138 }
 139
 140 void MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
 141 {
 142   int meshDim=getMeshDimension();
 143   int tmpCell[3],tmpNode[3];
 144   getSplitCellValues(tmpCell);
 145   getSplitNodeValues(tmpNode);
 146   int tmp2[3];
 147   GetPosFromId(cellId,meshDim,tmpCell,tmp2);
 148   switch(meshDim)
 149     {
 150     case 1:
 151       conn.push_back(tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[0]+1);
 152       break;
 153     case 2:
 154       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1);
 155       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]);
 156       break;
 157     case 3:
 158       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]);
 159       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]);
 160       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
 161       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
 162       break;
 163     default:
 164       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell : big problem spacedim must be in 1,2 or 3 !");
 165     };
 166 }
 167
 168 /*!
 169  * See MEDCouplingUMesh::getDistributionOfTypes for more information
 170  */
 171 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 172 {
 173   //only one type of cell
 174   std::vector<int> ret(3);
 175   ret[0]=getTypeOfCell(0);
 176   ret[1]=getNumberOfCells();
 177   ret[2]=-1; //ret[3*k+2]==-1 because it has no sense here
 178   return ret;
 179 }
 180
 181 /*!
 182  * This method tries to minimize at most the number of deep copy.
 183  * So if \a idsPerType is not empty it can be returned directly (without copy, but with ref count incremented) in return.
 184  *
 185  * See MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig for more information
 186  */
 187 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 188 {
 189   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 190   if(code.size()!=3)
 191     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : invalid input code should be exactly of size 3 !");
 192   if(code[0]!=(int)getTypeOfCell(0))
 193     {
 194       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : Mismatch of geometric type ! Asking for " << code[0] << " whereas the geometric type is \a this is " << getTypeOfCell(0) << " !";
 195       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 196     }
 197   if(code[2]==-1)
 198     {
 199       if(code[1]==nbOfCells)
 200         return 0;
 201       else
 202         {
 203           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : mismatch between the number of cells in this (" << nbOfCells << ") and the number of non profile (" << code[1] << ") !";
 204           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 205         }
 206     }
 207   if(code[2]!=0)
 208     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : single geo type mesh ! 0 or -1 is expected at pos #2 of input code !");
 209   if(idsPerType.size()!=1)
 210     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input code points to DataArrayInt #0 whereas the size of idsPerType is not equal to 1 !");
 211   const DataArrayInt *pfl=idsPerType[0];
 212   if(!pfl)
 213     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : the input code points to a NULL DataArrayInt at rank 0 !");
 214   if(pfl->getNumberOfComponents()!=1)
 215     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input profile should have exactly one component !");
 216   pfl->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
 217   pfl->incrRef();
 218   return const_cast<DataArrayInt *>(pfl);
 219 }
 220
 221 /*!
 222  * This method is the opposite of MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method. Given a list of cells in \a profile it returns a list of sub-profiles sorted by geo type.
 223  * The result is put in the array \a idsPerType. In the returned parameter \a code, foreach i \a code[3*i+2] refers (if different from -1) to a location into the \a idsPerType.
 224  * This method has 1 input \a profile and 3 outputs \a code \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
 225  *
 226  * \param [out] code is a vector of size 3*n where n is the number of different geometric type in \a this \b reduced to the profile \a profile. \a code has exactly the same semantic than in MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method.
 227  * \param [out] idsInPflPerType is a vector of size of different geometric type in the subpart defined by \a profile of \a this ( equal to \a code.size()/3). For each i,
 228  *              \a idsInPflPerType[i] stores the tuple ids in \a profile that correspond to the geometric type code[3*i+0]
 229  * \param [out] idsPerType is a vector of size of different sub profiles needed to be defined to represent the profile \a profile for a given geometric type.
 230  *              This vector can be empty in case of all geometric type cells are fully covered in ascending in the given input \a profile.
 231  *
 232  * \warning for performance reasons no deep copy will be performed, if \a profile can been used as this in output parameters \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
 233  *
 234  * \throw if \a profile has not exactly one component. It throws too, if \a profile contains some values not in [0,getNumberOfCells()) or if \a this is not fully defined
 235  *
 236  *  \b Example1: <br>
 237  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [0,1,2]
 238  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,-1], \a idsInPflPerType [[0,1,2]] and \a idsPerType is empty <br>
 239  *
 240  *  \b Example2: <br>
 241  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [1,2]
 242  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,0], \a idsInPflPerType [[0,1]] and \a idsPerType is [[1,2]] <br>
 243
 244  */
 245 void MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 246 {
 247   if(!profile || !profile->isAllocated())
 248     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile is NULL or not allocated !");
 249   if(profile->getNumberOfComponents()!=1)
 250     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile should have exactly one component !");
 251   int nbTuples=profile->getNumberOfTuples();
 252   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 253   code.resize(3); idsInPflPerType.resize(1);
 254   code[0]=(int)getTypeOfCell(0); code[1]=nbOfCells;
 255   idsInPflPerType.resize(1);
 256   if(profile->isIdentity() && nbTuples==nbOfCells)
 257     {
 258       code[2]=-1;
 259       idsInPflPerType[0]=0;
 260       idsPerType.clear();
 261       return ;
 262     }
 263   code[1]=profile->getNumberOfTuples();
 264   code[2]=0;
 265   profile->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
 266   idsPerType.resize(1);
 267   idsPerType[0]=profile->deepCpy();
 268   idsInPflPerType[0]=DataArrayInt::Range(0,nbTuples,1);
 269 }
 270
 271 /*!
 272  * Creates a new unstructured mesh (MEDCoupling1SGTUMesh) from \a this structured one.
 273  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 274  * delete this array using decrRef() as it is no more needed.
 275  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
 276  */
 277 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 278 {
 279   int meshDim=getMeshDimension();
 280   if(meshDim<0 || meshDim>3)
 281     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured : meshdim must be in [1,2,3] !");
 282   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords(getCoordinatesAndOwner());
 283   int ns[3];
 284   getNodeGridStructure(ns);
 285   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(Build1GTNodalConnectivity(ns,ns+meshDim));
 286   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret(MEDCoupling1SGTUMesh::New(getName().c_str(),GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim)));
 287   ret->setNodalConnectivity(conn); ret->setCoords(coords);
 288   return ret.retn();
 289 }
 290
 291 /*!
 292  * Creates a new unstructured mesh (MEDCouplingUMesh) from \a this structured one.
 293  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 294  * delete this array using decrRef() as it is no more needed.
 295  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
 296  */
 297 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 298 {
 299   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret0(build1SGTUnstructured());
 300   return ret0->buildUnstructured();
 301 }
 302
 303 /*!
 304  * Creates a new MEDCouplingUMesh containing a part of cells of \a this mesh.
 305  * The cells to include to the
 306  * result mesh are specified by an array of cell ids.
 307  *  \param [in] start - an array of cell ids to include to the result mesh.
 308  *  \param [in] end - specifies the end of the array \a start, so that
 309  *              the last value of \a start is \a end[ -1 ].
 310  *  \return MEDCouplingMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 311  *         delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
 312  */
 313 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
 314 {
 315   MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
 316   MEDCouplingMesh *ret=um->buildPart(start,end);
 317   um->decrRef();
 318   return ret;
 319 }
 320
 321 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
 322 {
 323   std::vector<int> cgs(getCellGridStructure());
 324   std::vector< std::pair<int,int> > cellPartFormat,nodePartFormat;
 325   if(IsPartStructured(start,end,cgs,cellPartFormat))
 326     {
 327       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingStructuredMesh> ret(buildStructuredSubPart(cellPartFormat));
 328       nodePartFormat=cellPartFormat;
 329       for(std::vector< std::pair<int,int> >::iterator it=nodePartFormat.begin();it!=nodePartFormat.end();it++)
 330         (*it).second++;
 331       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp1(BuildExplicitIdsFrom(getNodeGridStructure(),nodePartFormat));
 332       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp2(DataArrayInt::New()); tmp2->alloc(getNumberOfNodes(),1);
 333       tmp2->fillWithValue(-1);
 334       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp3(DataArrayInt::New()); tmp3->alloc(tmp1->getNumberOfTuples(),1); tmp3->iota(0);
 335       tmp2->setPartOfValues3(tmp3,tmp1->begin(),tmp1->end(),0,1,1);
 336       arr=tmp2.retn();
 337       return ret.retn();
 338     }
 339   else
 340     {
 341       MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
 342       MEDCouplingMesh *ret=um->buildPartAndReduceNodes(start,end,arr);
 343       um->decrRef();
 344       return ret;
 345     }
 346 }
 347
 348 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 349 {
 350   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::simplexize : not available for Cartesian mesh !");
 351 }
 352
 353 /*!
 354  * Returns a new MEDCouplingFieldDouble holding normal vectors to cells of \a this
 355  * 2D mesh. The computed vectors have 3 components and are normalized.
 356  *  \return MEDCouplingFieldDouble * - a new instance of MEDCouplingFieldDouble on
 357  *          cells and one time. The caller is to delete this field using decrRef() as
 358  *          it is no more needed.
 359  *  \throw If \a this->getMeshDimension() != 2.
 360  */
 361 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingStructuredMesh::buildOrthogonalField() const
 362 {
 363   if(getMeshDimension()!=2)
 364     throw INTERP_KERNEL::Exception("Expected a MEDCouplingStructuredMesh with meshDim == 2 !");
 365   MEDCouplingFieldDouble *ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,NO_TIME);
 366   DataArrayDouble *array=DataArrayDouble::New();
 367   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 368   array->alloc(nbOfCells,3);
 369   double *vals=array->getPointer();
 370   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
 371     { vals[3*i]=0.; vals[3*i+1]=0.; vals[3*i+2]=1.; }
 372   ret->setArray(array);
 373   array->decrRef();
 374   ret->setMesh(this);
 375   return ret;
 376 }
 377
 378 /*!
 379  * \return DataArrayInt * - newly allocated instance of nodal connectivity compatible for MEDCoupling1SGTMesh instance
 380  */
 381 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity(const int *nodeStBg, const int *nodeStEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 382 {
 383   std::size_t dim=std::distance(nodeStBg,nodeStEnd);
 384   switch(dim)
 385     {
 386     case 1:
 387       return Build1GTNodalConnectivity1D(nodeStBg);
 388     case 2:
 389       return Build1GTNodalConnectivity2D(nodeStBg);
 390     case 3:
 391       return Build1GTNodalConnectivity3D(nodeStBg);
 392     default:
 393       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity : only dimension in [1,2,3] supported !");
 394     }
 395 }
 396
 397 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity1D(const int *nodeStBg) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 398 {
 399   int nbOfCells(*nodeStBg-1);
 400   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 401   conn->alloc(2*nbOfCells,1);
 402   int *cp=conn->getPointer();
 403   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
 404     {
 405       cp[2*i+0]=i;
 406       cp[2*i+1]=i+1;
 407     }
 408   return conn.retn();
 409 }
 410
 411 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity2D(const int *nodeStBg) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 412 {
 413   int n1=nodeStBg[0]-1;
 414   int n2=nodeStBg[1]-1;
 415   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 416   conn->alloc(4*n1*n2,1);
 417   int *cp=conn->getPointer();
 418   int pos=0;
 419   for(int j=0;j<n2;j++)
 420     for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
 421       {
 422         cp[4*pos+0]=i+1+j*(n1+1);
 423         cp[4*pos+1]=i+j*(n1+1);
 424         cp[4*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1);
 425         cp[4*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1);
 426     }
 427   return conn.retn();
 428 }
 429
 430 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity3D(const int *nodeStBg) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 431 {
 432   int n1=nodeStBg[0]-1;
 433   int n2=nodeStBg[1]-1;
 434   int n3=nodeStBg[2]-1;
 435   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 436   conn->alloc(8*n1*n2*n3,1);
 437   int *cp=conn->getPointer();
 438   int pos=0;
 439   for(int k=0;k<n3;k++)
 440     for(int j=0;j<n2;j++)
 441       for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
 442         {
 443           int tmp=(n1+1)*(n2+1);
 444           cp[8*pos+0]=i+1+j*(n1+1)+k*tmp;
 445           cp[8*pos+1]=i+j*(n1+1)+k*tmp;
 446           cp[8*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
 447           cp[8*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
 448           cp[8*pos+4]=i+1+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 449           cp[8*pos+5]=i+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 450           cp[8*pos+6]=i+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 451           cp[8*pos+7]=i+1+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 452         }
 453   return conn.retn();
 454 }
 455
 456 /*!
 457  * Returns a cell id by its (i,j,k) index. The cell is located between the i-th and
 458  * ( i + 1 )-th nodes along X axis etc.
 459  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
 460  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
 461  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
 462  *  \return int - a cell id in \a this mesh.
 463  */
 464 int MEDCouplingStructuredMesh::getCellIdFromPos(int i, int j, int k) const
 465 {
 466   int tmp[3]={i,j,k};
 467   int tmp2[3];
 468   int meshDim=getMeshDimension();
 469   getSplitCellValues(tmp2);
 470   std::transform(tmp,tmp+meshDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
 471   return std::accumulate(tmp,tmp+meshDim,0);
 472 }
 473
 474 /*!
 475  * Returns a node id by its (i,j,k) index.
 476  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
 477  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
 478  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
 479  *  \return int - a node id in \a this mesh.
 480  */
 481 int MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdFromPos(int i, int j, int k) const
 482 {
 483   int tmp[3]={i,j,k};
 484   int tmp2[3];
 485   int meshDim=getMeshDimension();
 486   getSplitNodeValues(tmp2);
 487   std::transform(tmp,tmp+meshDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
 488   return std::accumulate(tmp,tmp+meshDim,0);
 489 }
 490
 491 void MEDCouplingStructuredMesh::GetPosFromId(int nodeId, int meshDim, const int *split, int *res)
 492 {
 493   int work=nodeId;
 494   for(int i=meshDim-1;i>=0;i--)
 495     {
 496       int pos=work/split[i];
 497       work=work%split[i];
 498       res[i]=pos;
 499     }
 500 }
 501
 502 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getCellGridStructure() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 503 {
 504   std::vector<int> ret(getNodeGridStructure());
 505   std::transform(ret.begin(),ret.end(),ret.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),-1));
 506   return ret;
 507 }
 508
 509 /*!
 510  * This method states if given part ids [ \a startIds, \a stopIds) and a structure \a st returns if it can be considered as a structured dataset.
 511  * If true is returned \a partCompactFormat will contain the information to build the corresponding part.
 512  *
 513  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom
 514  */
 515 bool MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured(const int *startIds, const int *stopIds, const std::vector<int>& st, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 516 {
 517   int dim((int)st.size());
 518   partCompactFormat.resize(dim);
 519   if(dim<1 || dim>3)
 520     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::isPartStructured : input structure must be of dimension in [1,2,3] !");
 521   std::vector<int> tmp2(dim),tmp(dim),tmp3(dim),tmp4(dim); tmp2[0]=1;
 522   for(int i=1;i<dim;i++)
 523     tmp2[i]=tmp2[i-1]*st[i-1];
 524   std::size_t sz(std::distance(startIds,stopIds));
 525   if(sz==0)
 526     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : empty input !");
 527   GetPosFromId(*startIds,dim,&tmp2[0],&tmp[0]);
 528   partCompactFormat.resize(dim);
 529   for(int i=0;i<dim;i++)
 530     partCompactFormat[i].first=tmp[i];
 531   if(tmp[dim-1]<0 || tmp[dim-1]>=st[dim-1])
 532     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : first id in input is not in valid range !");
 533   if(sz==1)
 534     {
 535       for(int i=0;i<dim;i++)
 536         partCompactFormat[i].second=tmp[i]+1;
 537       return true;
 538     }
 539   GetPosFromId(startIds[sz-1],dim,&tmp2[0],&tmp3[0]);
 540   int szExp(1);
 541   for(int i=0;i<dim;i++)
 542     {
 543       if(tmp3[i]<0 || tmp3[i]>=st[i])
 544         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : last id in input is not in valid range !");
 545       partCompactFormat[i].second=tmp3[i]+1;
 546       tmp4[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
 547       if(tmp4[i]<=0)
 548         return false;
 549       szExp*=tmp4[i];
 550     }
 551   if(szExp!=(int)sz)
 552     return false;
 553   const int *w(startIds);
 554   switch(dim)
 555     {
 556     case 3:
 557       {
 558         for(int i=0;i<tmp4[2];i++)
 559           {
 560             int a=tmp2[2]*(partCompactFormat[2].first+i);
 561             for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
 562               {
 563                 int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
 564                 for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 565                   {
 566                     if(partCompactFormat[0].first+k+b+a!=*w)
 567                       return false;
 568                   }
 569               }
 570           }
 571         return true;
 572       }
 573     case 2:
 574       {
 575         for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
 576           {
 577             int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
 578             for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 579               {
 580                 if(partCompactFormat[0].first+k+b!=*w)
 581                   return false;
 582               }
 583           }
 584         return true;
 585       }
 586     case 1:
 587       {
 588         for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 589           {
 590             if(partCompactFormat[0].first+k!=*w)
 591               return false;
 592           }
 593         return true;
 594       }
 595     default:
 596       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : internal error !");
 597     }
 598 }
 599
 600 /*!
 601  * This method builds the explicit entity array from the structure in \a st and the range in \a partCompactFormat.
 602  *If the range contains invalid values regarding sructure an exception will be thrown.
 603  *
 604  * \return DataArrayInt * - a new object.
 605  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured
 606  */
 607 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 608 {
 609   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
 610     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : input arrays must have the same size !");
 611   int nbOfItems(1);
 612   std::vector<int> dims(st.size());
 613   for(std::size_t i=0;i<st.size();i++)
 614     {
 615       if(partCompactFormat[i].first<0 || partCompactFormat[i].first>st[i])
 616         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 1 !");
 617       if(partCompactFormat[i].second<0 || partCompactFormat[i].second>st[i])
 618         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 2 !");
 619       if(partCompactFormat[i].second<=partCompactFormat[i].first)
 620         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 3 !");
 621       dims[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
 622       nbOfItems*=dims[i];
 623     }
 624   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
 625   ret->alloc(nbOfItems,1);
 626   int *pt(ret->getPointer());
 627   switch(st.size())
 628     {
 629     case 3:
 630       {
 631         for(int i=0;i<dims[2];i++)
 632           {
 633             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
 634             for(int j=0;j<dims[1];j++)
 635               {
 636                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
 637                 for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 638                   *pt=partCompactFormat[0].first+k+b+a;
 639               }
 640           }
 641         break;
 642       }
 643     case 2:
 644       {
 645         for(int j=0;j<dims[1];j++)
 646           {
 647             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
 648             for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 649               *pt=partCompactFormat[0].first+k+b;
 650           }
 651         break;
 652       }
 653     case 1:
 654       {
 655         for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 656           *pt=partCompactFormat[0].first+k;
 657         break;
 658       }
 659     default:
 660       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
 661     }
 662   return ret.retn();
 663 }