src/MEDCoupling/MEDCouplingStructuredMesh.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingStructuredMesh.hxx"
  22 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  23 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  24 #include "MEDCoupling1GTUMesh.hxx"
  25 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  26
  27 #include <numeric>
  28
  29 using namespace ParaMEDMEM;
  30
  31 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh()
  32 {
  33 }
  34
  35 MEDCouplingStructuredMesh::MEDCouplingStructuredMesh(const MEDCouplingStructuredMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other)
  36 {
  37 }
  38
  39 MEDCouplingStructuredMesh::~MEDCouplingStructuredMesh()
  40 {
  41 }
  42
  43 std::size_t MEDCouplingStructuredMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  44 {
  45   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
  46 }
  47
  48 void MEDCouplingStructuredMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other)
  49 {
  50   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
  51 }
  52
  53 bool MEDCouplingStructuredMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const
  54 {
  55   return MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason);
  56 }
  57
  58 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
  59 {
  60   return GetGeoTypeGivenMeshDimension(getMeshDimension());
  61 }
  62
  63 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension(int meshDim)
  64 {
  65   switch(meshDim)
  66     {
  67     case 3:
  68       return INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8;
  69     case 2:
  70       return INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4;
  71     case 1:
  72       return INTERP_KERNEL::NORM_SEG2;
  73     case 0:
  74       return INTERP_KERNEL::NORM_POINT1;
  75     default:
  76       throw INTERP_KERNEL::Exception("Unexpected dimension for MEDCouplingStructuredMesh::GetGeoTypeGivenMeshDimension !");
  77     }
  78 }
  79
  80 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingStructuredMesh::getAllGeoTypes() const
  81 {
  82   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret2;
  83   ret2.insert(getTypeOfCell(0));
  84   return ret2;
  85 }
  86
  87 int MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
  88 {
  89   int ret=getNumberOfCells();
  90   if(type==getTypeOfCell(0))
  91     return ret;
  92   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
  93   std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::getNumberOfCellsWithType : no specified type ! Type available is " << cm.getRepr() << " !";
  94   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
  95 }
  96
  97 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
  98 {
  99   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 100   if(getTypeOfCell(0)==type)
 101     {
 102       ret->alloc(getNumberOfCells(),1);
 103       ret->iota(0);
 104     }
 105   else
 106     ret->alloc(0,1);
 107   return ret.retn();
 108 }
 109
 110 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell() const
 111 {
 112   int nbCells=getNumberOfCells();
 113   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 114   ret->alloc(nbCells,1);
 115   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
 116   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfNodes());
 117   return ret.retn();
 118 }
 119
 120 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfFacesPerCell() const
 121 {
 122   int nbCells=getNumberOfCells();
 123   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 124   ret->alloc(nbCells,1);
 125   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(getTypeOfCell(0));
 126   ret->fillWithValue((int)cm.getNumberOfSons());
 127   return ret.retn();
 128 }
 129
 130 /*!
 131  * This method computes effective number of nodes per cell. That is to say nodes appearing several times in nodal connectivity of a cell,
 132  * will be counted only once here whereas it will be counted several times in MEDCouplingMesh::computeNbOfNodesPerCell method.
 133  * Here for structured mesh it returns exactly as MEDCouplingStructuredMesh::computeNbOfNodesPerCell does.
 134  *
 135  * \return DataArrayInt * - new object to be deallocated by the caller.
 136  */
 137 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const
 138 {
 139   return computeNbOfNodesPerCell();
 140 }
 141
 142 void MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
 143 {
 144   int meshDim=getMeshDimension();
 145   int tmpCell[3],tmpNode[3];
 146   getSplitCellValues(tmpCell);
 147   getSplitNodeValues(tmpNode);
 148   int tmp2[3];
 149   GetPosFromId(cellId,meshDim,tmpCell,tmp2);
 150   switch(meshDim)
 151     {
 152     case 1:
 153       conn.push_back(tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[0]+1);
 154       break;
 155     case 2:
 156       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1);
 157       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]);
 158       break;
 159     case 3:
 160       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]);
 161       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+tmp2[2]*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+tmp2[2]*tmpNode[2]);
 162       conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back(tmp2[1]*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
 163       conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+1+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]); conn.push_back((tmp2[1]+1)*tmpNode[1]+tmp2[0]+(tmp2[2]+1)*tmpNode[2]);
 164       break;
 165     default:
 166       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdsOfCell : big problem spacedim must be in 1,2 or 3 !");
 167     };
 168 }
 169
 170 /*!
 171  * See MEDCouplingUMesh::getDistributionOfTypes for more information
 172  */
 173 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getDistributionOfTypes() const
 174 {
 175   //only one type of cell
 176   std::vector<int> ret(3);
 177   ret[0]=getTypeOfCell(0);
 178   ret[1]=getNumberOfCells();
 179   ret[2]=-1; //ret[3*k+2]==-1 because it has no sense here
 180   return ret;
 181 }
 182
 183 /*!
 184  * This method tries to minimize at most the number of deep copy.
 185  * So if \a idsPerType is not empty it can be returned directly (without copy, but with ref count incremented) in return.
 186  *
 187  * See MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig for more information
 188  */
 189 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
 190 {
 191   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 192   if(code.size()!=3)
 193     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : invalid input code should be exactly of size 3 !");
 194   if(code[0]!=(int)getTypeOfCell(0))
 195     {
 196       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : Mismatch of geometric type ! Asking for " << code[0] << " whereas the geometric type is \a this is " << getTypeOfCell(0) << " !";
 197       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 198     }
 199   if(code[2]==-1)
 200     {
 201       if(code[1]==nbOfCells)
 202         return 0;
 203       else
 204         {
 205           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : mismatch between the number of cells in this (" << nbOfCells << ") and the number of non profile (" << code[1] << ") !";
 206           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 207         }
 208     }
 209   if(code[2]!=0)
 210     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : single geo type mesh ! 0 or -1 is expected at pos #2 of input code !");
 211   if(idsPerType.size()!=1)
 212     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input code points to DataArrayInt #0 whereas the size of idsPerType is not equal to 1 !");
 213   const DataArrayInt *pfl=idsPerType[0];
 214   if(!pfl)
 215     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : the input code points to a NULL DataArrayInt at rank 0 !");
 216   if(pfl->getNumberOfComponents()!=1)
 217     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::checkTypeConsistencyAndContig : input profile should have exactly one component !");
 218   pfl->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
 219   pfl->incrRef();
 220   return const_cast<DataArrayInt *>(pfl);
 221 }
 222
 223 /*!
 224  * This method is the opposite of MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method. Given a list of cells in \a profile it returns a list of sub-profiles sorted by geo type.
 225  * The result is put in the array \a idsPerType. In the returned parameter \a code, foreach i \a code[3*i+2] refers (if different from -1) to a location into the \a idsPerType.
 226  * This method has 1 input \a profile and 3 outputs \a code \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
 227  *
 228  * \param [out] code is a vector of size 3*n where n is the number of different geometric type in \a this \b reduced to the profile \a profile. \a code has exactly the same semantic than in MEDCouplingUMesh::checkTypeConsistencyAndContig method.
 229  * \param [out] idsInPflPerType is a vector of size of different geometric type in the subpart defined by \a profile of \a this ( equal to \a code.size()/3). For each i,
 230  *              \a idsInPflPerType[i] stores the tuple ids in \a profile that correspond to the geometric type code[3*i+0]
 231  * \param [out] idsPerType is a vector of size of different sub profiles needed to be defined to represent the profile \a profile for a given geometric type.
 232  *              This vector can be empty in case of all geometric type cells are fully covered in ascending in the given input \a profile.
 233  *
 234  * \warning for performance reasons no deep copy will be performed, if \a profile can been used as this in output parameters \a idsInPflPerType and \a idsPerType.
 235  *
 236  * \throw if \a profile has not exactly one component. It throws too, if \a profile contains some values not in [0,getNumberOfCells()) or if \a this is not fully defined
 237  *
 238  *  \b Example1: <br>
 239  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [0,1,2]
 240  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,-1], \a idsInPflPerType [[0,1,2]] and \a idsPerType is empty <br>
 241  *
 242  *  \b Example2: <br>
 243  *          - Before \a this has 3 cells \a profile contains [1,2]
 244  *          - After \a code contains [NORM_...,nbCells,0], \a idsInPflPerType [[0,1]] and \a idsPerType is [[1,2]] <br>
 245
 246  */
 247 void MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const
 248 {
 249   if(!profile || !profile->isAllocated())
 250     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile is NULL or not allocated !");
 251   if(profile->getNumberOfComponents()!=1)
 252     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::splitProfilePerType : input profile should have exactly one component !");
 253   int nbTuples=profile->getNumberOfTuples();
 254   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 255   code.resize(3); idsInPflPerType.resize(1);
 256   code[0]=(int)getTypeOfCell(0); code[1]=nbOfCells;
 257   idsInPflPerType.resize(1);
 258   if(profile->isIdentity() && nbTuples==nbOfCells)
 259     {
 260       code[2]=-1;
 261       idsInPflPerType[0]=0;
 262       idsPerType.clear();
 263       return ;
 264     }
 265   code[1]=profile->getNumberOfTuples();
 266   code[2]=0;
 267   profile->checkAllIdsInRange(0,nbOfCells);
 268   idsPerType.resize(1);
 269   idsPerType[0]=profile->deepCpy();
 270   idsInPflPerType[0]=DataArrayInt::Range(0,nbTuples,1);
 271 }
 272
 273 /*!
 274  * Creates a new unstructured mesh (MEDCoupling1SGTUMesh) from \a this structured one.
 275  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 276  * delete this array using decrRef() as it is no more needed.
 277  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
 278  */
 279 MEDCoupling1SGTUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured() const
 280 {
 281   int meshDim=getMeshDimension();
 282   if(meshDim<0 || meshDim>3)
 283     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::build1SGTUnstructured : meshdim must be in [1,2,3] !");
 284   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords(getCoordinatesAndOwner());
 285   int ns[3];
 286   getNodeGridStructure(ns);
 287   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(Build1GTNodalConnectivity(ns,ns+meshDim));
 288   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret(MEDCoupling1SGTUMesh::New(getName(),GetGeoTypeGivenMeshDimension(meshDim)));
 289   ret->setNodalConnectivity(conn); ret->setCoords(coords);
 290   return ret.retn();
 291 }
 292
 293 /*!
 294  * Creates a new unstructured mesh (MEDCouplingUMesh) from \a this structured one.
 295  *  \return MEDCouplingUMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 296  * delete this array using decrRef() as it is no more needed.
 297  *  \throw If \a this->getMeshDimension() is not among [1,2,3].
 298  */
 299 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildUnstructured() const
 300 {
 301   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCoupling1SGTUMesh> ret0(build1SGTUnstructured());
 302   return ret0->buildUnstructured();
 303 }
 304
 305 /*!
 306  * Creates a new MEDCouplingUMesh containing a part of cells of \a this mesh.
 307  * The cells to include to the
 308  * result mesh are specified by an array of cell ids.
 309  *  \param [in] start - an array of cell ids to include to the result mesh.
 310  *  \param [in] end - specifies the end of the array \a start, so that
 311  *              the last value of \a start is \a end[ -1 ].
 312  *  \return MEDCouplingMesh * - a new instance of MEDCouplingUMesh. The caller is to
 313  *         delete this mesh using decrRef() as it is no more needed.
 314  */
 315 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
 316 {
 317   MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
 318   MEDCouplingMesh *ret=um->buildPart(start,end);
 319   um->decrRef();
 320   return ret;
 321 }
 322
 323 MEDCouplingMesh *MEDCouplingStructuredMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
 324 {
 325   std::vector<int> cgs(getCellGridStructure());
 326   std::vector< std::pair<int,int> > cellPartFormat,nodePartFormat;
 327   if(IsPartStructured(start,end,cgs,cellPartFormat))
 328     {
 329       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingStructuredMesh> ret(buildStructuredSubPart(cellPartFormat));
 330       nodePartFormat=cellPartFormat;
 331       for(std::vector< std::pair<int,int> >::iterator it=nodePartFormat.begin();it!=nodePartFormat.end();it++)
 332         (*it).second++;
 333       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp1(BuildExplicitIdsFrom(getNodeGridStructure(),nodePartFormat));
 334       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp2(DataArrayInt::New()); tmp2->alloc(getNumberOfNodes(),1);
 335       tmp2->fillWithValue(-1);
 336       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp3(DataArrayInt::New()); tmp3->alloc(tmp1->getNumberOfTuples(),1); tmp3->iota(0);
 337       tmp2->setPartOfValues3(tmp3,tmp1->begin(),tmp1->end(),0,1,1);
 338       arr=tmp2.retn();
 339       return ret.retn();
 340     }
 341   else
 342     {
 343       MEDCouplingUMesh *um=buildUnstructured();
 344       MEDCouplingMesh *ret=um->buildPartAndReduceNodes(start,end,arr);
 345       um->decrRef();
 346       return ret;
 347     }
 348 }
 349
 350 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::simplexize(int policy)
 351 {
 352   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::simplexize : not available for Cartesian mesh !");
 353 }
 354
 355 /*!
 356  * Returns a new MEDCouplingFieldDouble holding normal vectors to cells of \a this
 357  * 2D mesh. The computed vectors have 3 components and are normalized.
 358  *  \return MEDCouplingFieldDouble * - a new instance of MEDCouplingFieldDouble on
 359  *          cells and one time. The caller is to delete this field using decrRef() as
 360  *          it is no more needed.
 361  *  \throw If \a this->getMeshDimension() != 2.
 362  */
 363 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingStructuredMesh::buildOrthogonalField() const
 364 {
 365   if(getMeshDimension()!=2)
 366     throw INTERP_KERNEL::Exception("Expected a MEDCouplingStructuredMesh with meshDim == 2 !");
 367   MEDCouplingFieldDouble *ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,NO_TIME);
 368   DataArrayDouble *array=DataArrayDouble::New();
 369   int nbOfCells=getNumberOfCells();
 370   array->alloc(nbOfCells,3);
 371   double *vals=array->getPointer();
 372   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
 373     { vals[3*i]=0.; vals[3*i+1]=0.; vals[3*i+2]=1.; }
 374   ret->setArray(array);
 375   array->decrRef();
 376   ret->setMesh(this);
 377   return ret;
 378 }
 379
 380 void MEDCouplingStructuredMesh::getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const
 381 {
 382   std::vector<int> ngs(getNodeGridStructure());
 383   int dim(getSpaceDimension());
 384   switch(dim)
 385   {
 386     case 1:
 387       return GetReverseNodalConnectivity1(ngs,revNodal,revNodalIndx);
 388     case 2:
 389       return GetReverseNodalConnectivity2(ngs,revNodal,revNodalIndx);
 390     case 3:
 391       return GetReverseNodalConnectivity3(ngs,revNodal,revNodalIndx);
 392     default:
 393       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::getReverseNodalConnectivity : only dimensions 1, 2 and 3 are supported !");
 394   }
 395 }
 396
 397 void MEDCouplingStructuredMesh::GetReverseNodalConnectivity1(const std::vector<int>& ngs, DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx)
 398 {
 399   int nbNodes(ngs[0]);
 400   revNodalIndx->alloc(nbNodes+1,1);
 401   if(nbNodes==0)
 402     { revNodal->alloc(0,1); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); return ; }
 403   if(nbNodes==1)
 404     { revNodal->alloc(1,1); revNodal->setIJ(0,0,0); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); revNodalIndx->setIJ(1,0,1); return ; }
 405   revNodal->alloc(2*(nbNodes-1),1);
 406   int *rn(revNodal->getPointer()),*rni(revNodalIndx->getPointer());
 407   *rni++=0; *rni=1; *rn++=0;
 408   for(int i=1;i<nbNodes-1;i++,rni++)
 409     {
 410       rn[0]=i-1; rn[1]=i;
 411       rni[1]=rni[0]+2;
 412       rn+=2;
 413     }
 414   rn[0]=nbNodes-2; rni[1]=rni[0]+1;
 415 }
 416
 417 void MEDCouplingStructuredMesh::GetReverseNodalConnectivity2(const std::vector<int>& ngs, DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx)
 418 {
 419   int nbNodesX(ngs[0]),nbNodesY(ngs[1]);
 420   int nbNodes(nbNodesX*nbNodesY);
 421   if(nbNodesX==0 || nbNodesY==0)
 422     { revNodal->alloc(0,1); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); return ; }
 423   if(nbNodesX==1 || nbNodesY==1)
 424     { std::vector<int> ngs2(1); ngs2[0]=std::max(nbNodesX,nbNodesY); return GetReverseNodalConnectivity1(ngs2,revNodal,revNodalIndx); }
 425   revNodalIndx->alloc(nbNodes+1,1);
 426   int nbCellsX(nbNodesX-1),nbCellsY(nbNodesY-1);
 427   revNodal->alloc(4*(nbNodesX-2)*(nbNodesY-2)+2*2*(nbNodesX-2)+2*2*(nbNodesY-2)+4,1);
 428   int *rn(revNodal->getPointer()),*rni(revNodalIndx->getPointer());
 429   *rni++=0; *rni=1; *rn++=0;
 430   for(int i=1;i<nbNodesX-1;i++,rni++,rn+=2)
 431     {
 432       rn[0]=i-1; rn[1]=i;
 433       rni[1]=rni[0]+2;
 434     }
 435   rni[1]=rni[0]+1; *rn++=nbCellsX-1;
 436   rni++;
 437   for(int j=1;j<nbNodesY-1;j++)
 438     {
 439       int off(nbCellsX*(j-1)),off2(nbCellsX*j);
 440       rni[1]=rni[0]+2; rn[0]=off; rn[1]=off2;
 441       rni++; rn+=2;
 442       for(int i=1;i<nbNodesX-1;i++,rni++,rn+=4)
 443         {
 444           rn[0]=i-1+off; rn[1]=i+off; rn[2]=i-1+off2; rn[3]=i+off2;
 445           rni[1]=rni[0]+4;
 446         }
 447       rni[1]=rni[0]+2; rn[0]=off+nbCellsX-1; rn[1]=off2+nbCellsX-1;
 448       rni++; rn+=2;
 449     }
 450   int off3(nbCellsX*(nbCellsY-1));
 451   rni[1]=rni[0]+1;
 452   rni++; *rn++=off3;
 453   for(int i=1;i<nbNodesX-1;i++,rni++,rn+=2)
 454     {
 455       rn[0]=i-1+off3; rn[1]=i+off3;
 456       rni[1]=rni[0]+2;
 457     }
 458   rni[1]=rni[0]+1; rn[0]=nbCellsX*nbCellsY-1;
 459 }
 460
 461 void MEDCouplingStructuredMesh::GetReverseNodalConnectivity3(const std::vector<int>& ngs, DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx)
 462 {
 463   int nbNodesX(ngs[0]),nbNodesY(ngs[1]),nbNodesZ(ngs[2]);
 464   int nbNodes(nbNodesX*nbNodesY*nbNodesZ);
 465   if(nbNodesX==0 || nbNodesY==0 || nbNodesZ==0)
 466     { revNodal->alloc(0,1); revNodalIndx->setIJ(0,0,0); return ; }
 467   if(nbNodesX==1 || nbNodesY==1 || nbNodesZ==1)
 468     {
 469       std::vector<int> ngs2(2);
 470       int pos(0);
 471       bool pass(false);
 472       for(int i=0;i<3;i++)
 473         {
 474           if(pass)
 475             { ngs2[pos++]=ngs[i]; }
 476           else
 477             {
 478               pass=ngs[i]==1;
 479               if(!pass)
 480                 { ngs2[pos++]=ngs[i]; }
 481             }
 482         }
 483       return GetReverseNodalConnectivity2(ngs2,revNodal,revNodalIndx);
 484     }
 485   revNodalIndx->alloc(nbNodes+1,1);
 486   int nbCellsX(nbNodesX-1),nbCellsY(nbNodesY-1),nbCellsZ(nbNodesZ-1);
 487   revNodal->alloc(8*(nbNodesX-2)*(nbNodesY-2)*(nbNodesZ-2)+4*(2*(nbNodesX-2)*(nbNodesY-2)+2*(nbNodesX-2)*(nbNodesZ-2)+2*(nbNodesY-2)*(nbNodesZ-2))+2*4*(nbNodesX-2)+2*4*(nbNodesY-2)+2*4*(nbNodesZ-2)+8,1);
 488   int *rn(revNodal->getPointer()),*rni(revNodalIndx->getPointer());
 489   *rni=0;
 490   for(int k=0;k<nbNodesZ;k++)
 491     {
 492       bool factZ(k!=0 && k!=nbNodesZ-1);
 493       int offZ0((k-1)*nbCellsX*nbCellsY),offZ1(k*nbCellsX*nbCellsY);
 494       for(int j=0;j<nbNodesY;j++)
 495         {
 496           bool factYZ(factZ && (j!=0 && j!=nbNodesY-1));
 497           int off00((j-1)*nbCellsX+offZ0),off01(j*nbCellsX+offZ0),off10((j-1)*nbCellsX+offZ1),off11(j*nbCellsX+offZ1);
 498           for(int i=0;i<nbNodesX;i++,rni++)
 499             {
 500               int fact(factYZ && (i!=0 && i!=nbNodesX-1));
 501               if(fact)
 502                 {//most of points fall in this part of code
 503                   rn[0]=off00+i-1; rn[1]=off00+i; rn[2]=off01+i-1; rn[3]=off01+i;
 504                   rn[4]=off10+i-1; rn[5]=off10+i; rn[6]=off11+i-1; rn[7]=off11+i;
 505                   rni[1]=rni[0]+8;
 506                   rn+=8;
 507                 }
 508               else
 509                 {
 510                   int *rnRef(rn);
 511                   if(k>=1 && j>=1 && i>=1)
 512                     *rn++=off00+i-1;
 513                   if(k>=1 && j>=1 && i<nbCellsX)
 514                     *rn++=off00+i;
 515                   if(k>=1 && j<nbCellsY && i>=1)
 516                     *rn++=off01+i-1;
 517                   if(k>=1 && j<nbCellsY && i<nbCellsX)
 518                     *rn++=off01+i;
 519                   //
 520                   if(k<nbCellsZ && j>=1 && i>=1)
 521                     *rn++=off10+i-1;
 522                   if(k<nbCellsZ && j>=1 && i<nbCellsX)
 523                     *rn++=off10+i;
 524                   if(k<nbCellsZ && j<nbCellsY && i>=1)
 525                     *rn++=off11+i-1;
 526                   if(k<nbCellsZ && j<nbCellsY && i<nbCellsX)
 527                     *rn++=off11+i;
 528                   rni[1]=rni[0]+(int)(std::distance(rnRef,rn));
 529                 }
 530             }
 531         }
 532     }
 533 }
 534
 535 /*!
 536  * \return DataArrayInt * - newly allocated instance of nodal connectivity compatible for MEDCoupling1SGTMesh instance
 537  */
 538 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity(const int *nodeStBg, const int *nodeStEnd)
 539 {
 540   std::size_t dim=std::distance(nodeStBg,nodeStEnd);
 541   switch(dim)
 542     {
 543     case 0:
 544       {
 545         MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 546         conn->alloc(1,1); conn->setIJ(0,0,0);
 547         return conn.retn();
 548       }
 549     case 1:
 550       return Build1GTNodalConnectivity1D(nodeStBg);
 551     case 2:
 552       return Build1GTNodalConnectivity2D(nodeStBg);
 553     case 3:
 554       return Build1GTNodalConnectivity3D(nodeStBg);
 555     default:
 556       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity : only dimension in [0,1,2,3] supported !");
 557     }
 558 }
 559
 560 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity1D(const int *nodeStBg)
 561 {
 562   int nbOfCells(*nodeStBg-1);
 563   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 564   conn->alloc(2*nbOfCells,1);
 565   int *cp=conn->getPointer();
 566   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
 567     {
 568       cp[2*i+0]=i;
 569       cp[2*i+1]=i+1;
 570     }
 571   return conn.retn();
 572 }
 573
 574 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity2D(const int *nodeStBg)
 575 {
 576   int n1=nodeStBg[0]-1;
 577   int n2=nodeStBg[1]-1;
 578   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 579   conn->alloc(4*n1*n2,1);
 580   int *cp=conn->getPointer();
 581   int pos=0;
 582   for(int j=0;j<n2;j++)
 583     for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
 584       {
 585         cp[4*pos+0]=i+1+j*(n1+1);
 586         cp[4*pos+1]=i+j*(n1+1);
 587         cp[4*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1);
 588         cp[4*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1);
 589     }
 590   return conn.retn();
 591 }
 592
 593 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::Build1GTNodalConnectivity3D(const int *nodeStBg)
 594 {
 595   int n1=nodeStBg[0]-1;
 596   int n2=nodeStBg[1]-1;
 597   int n3=nodeStBg[2]-1;
 598   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> conn(DataArrayInt::New());
 599   conn->alloc(8*n1*n2*n3,1);
 600   int *cp=conn->getPointer();
 601   int pos=0;
 602   for(int k=0;k<n3;k++)
 603     for(int j=0;j<n2;j++)
 604       for(int i=0;i<n1;i++,pos++)
 605         {
 606           int tmp=(n1+1)*(n2+1);
 607           cp[8*pos+0]=i+1+j*(n1+1)+k*tmp;
 608           cp[8*pos+1]=i+j*(n1+1)+k*tmp;
 609           cp[8*pos+2]=i+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
 610           cp[8*pos+3]=i+1+(j+1)*(n1+1)+k*tmp;
 611           cp[8*pos+4]=i+1+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 612           cp[8*pos+5]=i+j*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 613           cp[8*pos+6]=i+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 614           cp[8*pos+7]=i+1+(j+1)*(n1+1)+(k+1)*tmp;
 615         }
 616   return conn.retn();
 617 }
 618
 619 /*!
 620  * Returns a cell id by its (i,j,k) index. The cell is located between the i-th and
 621  * ( i + 1 )-th nodes along X axis etc.
 622  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
 623  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
 624  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
 625  *  \return int - a cell id in \a this mesh.
 626  */
 627 int MEDCouplingStructuredMesh::getCellIdFromPos(int i, int j, int k) const
 628 {
 629   int tmp[3]={i,j,k};
 630   int tmp2[3];
 631   int meshDim(getMeshDimension());
 632   getSplitCellValues(tmp2);
 633   std::transform(tmp,tmp+meshDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
 634   return std::accumulate(tmp,tmp+meshDim,0);
 635 }
 636
 637 /*!
 638  * Returns a node id by its (i,j,k) index.
 639  *  \param [in] i - a index of node coordinates array along X axis.
 640  *  \param [in] j - a index of node coordinates array along Y axis.
 641  *  \param [in] k - a index of node coordinates array along Z axis.
 642  *  \return int - a node id in \a this mesh.
 643  */
 644 int MEDCouplingStructuredMesh::getNodeIdFromPos(int i, int j, int k) const
 645 {
 646   int tmp[3]={i,j,k};
 647   int tmp2[3];
 648   int spaceDim(getSpaceDimension());
 649   getSplitNodeValues(tmp2);
 650   std::transform(tmp,tmp+spaceDim,tmp2,tmp,std::multiplies<int>());
 651   return std::accumulate(tmp,tmp+spaceDim,0);
 652 }
 653
 654 void MEDCouplingStructuredMesh::GetPosFromId(int nodeId, int meshDim, const int *split, int *res)
 655 {
 656   int work=nodeId;
 657   for(int i=meshDim-1;i>=0;i--)
 658     {
 659       int pos=work/split[i];
 660       work=work%split[i];
 661       res[i]=pos;
 662     }
 663 }
 664
 665 std::vector<int> MEDCouplingStructuredMesh::getCellGridStructure() const
 666 {
 667   std::vector<int> ret(getNodeGridStructure());
 668   std::transform(ret.begin(),ret.end(),ret.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),-1));
 669   return ret;
 670 }
 671
 672 /*!
 673  * This method states if given part ids [ \a startIds, \a stopIds) and a structure \a st returns if it can be considered as a structured dataset.
 674  * If true is returned \a partCompactFormat will contain the information to build the corresponding part.
 675  *
 676  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom
 677  */
 678 bool MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured(const int *startIds, const int *stopIds, const std::vector<int>& st, std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
 679 {
 680   int dim((int)st.size());
 681   partCompactFormat.resize(dim);
 682   if(dim<1 || dim>3)
 683     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::isPartStructured : input structure must be of dimension in [1,2,3] !");
 684   std::vector<int> tmp2(dim),tmp(dim),tmp3(dim),tmp4(dim); tmp2[0]=1;
 685   for(int i=1;i<dim;i++)
 686     tmp2[i]=tmp2[i-1]*st[i-1];
 687   std::size_t sz(std::distance(startIds,stopIds));
 688   if(sz==0)
 689     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : empty input !");
 690   GetPosFromId(*startIds,dim,&tmp2[0],&tmp[0]);
 691   partCompactFormat.resize(dim);
 692   for(int i=0;i<dim;i++)
 693     partCompactFormat[i].first=tmp[i];
 694   if(tmp[dim-1]<0 || tmp[dim-1]>=st[dim-1])
 695     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : first id in input is not in valid range !");
 696   if(sz==1)
 697     {
 698       for(int i=0;i<dim;i++)
 699         partCompactFormat[i].second=tmp[i]+1;
 700       return true;
 701     }
 702   GetPosFromId(startIds[sz-1],dim,&tmp2[0],&tmp3[0]);
 703   int szExp(1);
 704   for(int i=0;i<dim;i++)
 705     {
 706       if(tmp3[i]<0 || tmp3[i]>=st[i])
 707         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : last id in input is not in valid range !");
 708       partCompactFormat[i].second=tmp3[i]+1;
 709       tmp4[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
 710       if(tmp4[i]<=0)
 711         return false;
 712       szExp*=tmp4[i];
 713     }
 714   if(szExp!=(int)sz)
 715     return false;
 716   const int *w(startIds);
 717   switch(dim)
 718     {
 719     case 3:
 720       {
 721         for(int i=0;i<tmp4[2];i++)
 722           {
 723             int a=tmp2[2]*(partCompactFormat[2].first+i);
 724             for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
 725               {
 726                 int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
 727                 for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 728                   {
 729                     if(partCompactFormat[0].first+k+b+a!=*w)
 730                       return false;
 731                   }
 732               }
 733           }
 734         return true;
 735       }
 736     case 2:
 737       {
 738         for(int j=0;j<tmp4[1];j++)
 739           {
 740             int b=tmp2[1]*(partCompactFormat[1].first+j);
 741             for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 742               {
 743                 if(partCompactFormat[0].first+k+b!=*w)
 744                   return false;
 745               }
 746           }
 747         return true;
 748       }
 749     case 1:
 750       {
 751         for(int k=0;k<tmp4[0];k++,w++)
 752           {
 753             if(partCompactFormat[0].first+k!=*w)
 754               return false;
 755           }
 756         return true;
 757       }
 758     default:
 759       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured : internal error !");
 760     }
 761 }
 762
 763 /*!
 764  * This method builds the explicit entity array from the structure in \a st and the range in \a partCompactFormat.
 765  *If the range contains invalid values regarding sructure an exception will be thrown.
 766  *
 767  * \return DataArrayInt * - a new object.
 768  * \sa MEDCouplingStructuredMesh::IsPartStructured
 769  */
 770 DataArrayInt *MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom(const std::vector<int>& st, const std::vector< std::pair<int,int> >& partCompactFormat)
 771 {
 772   if(st.size()!=partCompactFormat.size())
 773     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : input arrays must have the same size !");
 774   int nbOfItems(1);
 775   std::vector<int> dims(st.size());
 776   for(std::size_t i=0;i<st.size();i++)
 777     {
 778       if(partCompactFormat[i].first<0 || partCompactFormat[i].first>st[i])
 779         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 1 !");
 780       if(partCompactFormat[i].second<0 || partCompactFormat[i].second>st[i])
 781         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 2 !");
 782       if(partCompactFormat[i].second<=partCompactFormat[i].first)
 783         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : invalid input range 3 !");
 784       dims[i]=partCompactFormat[i].second-partCompactFormat[i].first;
 785       nbOfItems*=dims[i];
 786     }
 787   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
 788   ret->alloc(nbOfItems,1);
 789   int *pt(ret->getPointer());
 790   switch(st.size())
 791     {
 792     case 3:
 793       {
 794         for(int i=0;i<dims[2];i++)
 795           {
 796             int a=(partCompactFormat[2].first+i)*st[0]*st[1];
 797             for(int j=0;j<dims[1];j++)
 798               {
 799                 int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
 800                 for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 801                   *pt=partCompactFormat[0].first+k+b+a;
 802               }
 803           }
 804         break;
 805       }
 806     case 2:
 807       {
 808         for(int j=0;j<dims[1];j++)
 809           {
 810             int b=(partCompactFormat[1].first+j)*st[0];
 811             for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 812               *pt=partCompactFormat[0].first+k+b;
 813           }
 814         break;
 815       }
 816     case 1:
 817       {
 818         for(int k=0;k<dims[0];k++,pt++)
 819           *pt=partCompactFormat[0].first+k;
 820         break;
 821       }
 822     default:
 823       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingStructuredMesh::BuildExplicitIdsFrom : Dimension supported are 1,2 or 3 !");
 824     }
 825   return ret.retn();
 826 }