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[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingPointSet.hxx
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2 //
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9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #ifndef __PARAMEDMEM_MEDCOUPLINGPOINTSET_HXX__
22 #define __PARAMEDMEM_MEDCOUPLINGPOINTSET_HXX__
23
24 #include "MEDCoupling.hxx"
25 #include "MEDCouplingMesh.hxx"
26
27 #include "InterpKernelHashMap.hxx"
28
29 #include <vector>
30
31 namespace INTERP_KERNEL
32 {
33   class DirectedBoundingBox;
34 }
35
36 namespace MEDCoupling
37 {
38   class DataArrayInt;
39   class DataArrayDouble;
40   
41   /*!
42    * This class is abstract and not instanciable.
43    * MEDCoupling::MEDCouplingUMesh class inherits from this class.
44    * This class aggregates an array '_coords' containing nodes coordinates.
45    * So all operations on coordinates are managed by this class.
46    * This is the case for example for following methods :
47    * rotation, translation, scaling, getNodeIdsNearPoint, boundingbox...
48    */
49   class MEDCouplingPointSet : public MEDCouplingMesh
50   {
51   protected:
52     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet();
53     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet(const MEDCouplingPointSet& other, bool deepCpy);
54     MEDCOUPLING_EXPORT ~MEDCouplingPointSet();
55   public:
56     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
57     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
58     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
59     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodes() const;
60     MEDCOUPLING_EXPORT int getSpaceDimension() const;
61     MEDCOUPLING_EXPORT void setCoords(const DataArrayDouble *coords);
62     MEDCOUPLING_EXPORT const DataArrayDouble *getCoords() const { return _coords; }
63     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getCoords() { return _coords; }
64     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getCoordinatesAndOwner() const;
65     MEDCOUPLING_EXPORT const DataArrayDouble *getDirectAccessOfCoordsArrIfInStructure() const { return _coords; }
66     MEDCOUPLING_EXPORT void copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other);
67     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
68     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
69     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
70     MEDCOUPLING_EXPORT void checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
71                                                  DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const;
72     MEDCOUPLING_EXPORT void checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
73                                                             DataArrayInt *&cellCor) const;
74     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCoordsEqualIfNotWhy(const MEDCouplingPointSet& other, double prec, std::string& reason) const;
75     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCoordsEqual(const MEDCouplingPointSet& other, double prec) const;
76     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCoordsEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingPointSet& other, double prec) const;
77     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *deepCopyConnectivityOnly() const = 0;
78     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other) = 0;
79     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *mergeNodes(double precision, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes);
80     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *mergeNodesCenter(double precision, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes);
81     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const = 0;
82     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const = 0;
83     MEDCOUPLING_EXPORT void getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const;
84     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *buildPermArrayForMergeNode(double precision, int limitNodeId, bool& areNodesMerged, int& newNbOfNodes) const;
85     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsNearPoint(const double *pos, double eps) const;
86     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsNearPoints(const double *pos, int nbOfPoints, double eps, DataArrayInt *& c, DataArrayInt *& cI) const;
87     MEDCOUPLING_EXPORT void findCommonNodes(double prec, int limitNodeId, DataArrayInt *&comm, DataArrayInt *&commIndex) const;
88     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const = 0;
89     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *buildNewNumberingFromCommonNodesFormat(const DataArrayInt *comm, const DataArrayInt *commIndex,
90                                                                             int& newNbOfNodes) const;
91     MEDCOUPLING_EXPORT void getBoundingBox(double *bbox) const;
92     MEDCOUPLING_EXPORT void zipCoords();
93     MEDCOUPLING_EXPORT double getCaracteristicDimension() const;
94     MEDCOUPLING_EXPORT void recenterForMaxPrecision(double eps);
95     MEDCOUPLING_EXPORT void rotate(const double *center, const double *vector, double angle);
96     MEDCOUPLING_EXPORT void translate(const double *vector);
97     MEDCOUPLING_EXPORT void scale(const double *point, double factor);
98     MEDCOUPLING_EXPORT void changeSpaceDimension(int newSpaceDim, double dftVal=0.);
99     MEDCOUPLING_EXPORT void tryToShareSameCoords(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon);
100     MEDCOUPLING_EXPORT void duplicateNodesInCoords(const int *nodeIdsToDuplicateBg, const int *nodeIdsToDuplicateEnd);
101     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void tryToShareSameCoordsPermute(const MEDCouplingPointSet& other, double epsilon);
102     MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesOnPlane(const double *pt, const double *vec, double eps, std::vector<int>& nodes) const;
103     MEDCOUPLING_EXPORT void findNodesOnLine(const double *pt, const double *vec, double eps, std::vector<int>& nodes) const;
104     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MergeNodesArray(const MEDCouplingPointSet *m1, const MEDCouplingPointSet *m2);
105     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MergeNodesArray(const std::vector<const MEDCouplingPointSet *>& ms);
106     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingPointSet *BuildInstanceFromMeshType(MEDCouplingMeshType type);
107     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *ComputeNbOfInteractionsWithSrcCells(const MEDCouplingPointSet *srcMesh, const MEDCouplingPointSet *trgMesh, double eps);
108     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPart(const int *start, const int *end) const;
109     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const;
110     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const;
111     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *buildPartRangeAndReduceNodes(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt*& arr) const;
112     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsFullyIncludedInNodeIds(const int *partBg, const int *partEnd) const;
113     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellIdsLyingOnNodes(const int *begin, const int *end, bool fullyIn) const;
114     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelf(const int *start, const int *end, bool keepCoords=true) const;
115     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfSlice(int start, int end, int step, bool keepCoords=true) const;
116     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const = 0;
117     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoordsSlice(int start, int end, int step) const = 0;
118     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfNode(const int *start, const int *end, bool fullyIn) const;
119     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildFacePartOfMySelfNode(const int *start, const int *end, bool fullyIn) const = 0;
120     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *findBoundaryNodes() const = 0;
121     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingPointSet *buildBoundaryMesh(bool keepCoords) const = 0;
122     MEDCOUPLING_EXPORT virtual int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const = 0;
123     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *computeFetchedNodeIds() const = 0;
124     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const = 0;
125     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const = 0;
126     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N) = 0;
127     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodesInConn(const INTERP_KERNEL::HashMap<int,int>& newNodeNumbersO2N) = 0;
128     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodesInConn(const std::map<int,int>& newNodeNumbersO2N) = 0;
129     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodesWithOffsetInConn(int offset) = 0;
130     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodes(const int *newNodeNumbers, int newNbOfNodes);
131     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void renumberNodesCenter(const int *newNodeNumbers, int newNbOfNodes);
132     MEDCOUPLING_EXPORT virtual bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const = 0;
133     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void invertOrientationOfAllCells() = 0;
134     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void checkFullyDefined() const = 0;
135     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
136     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
137     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
138     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2,
139                                             const std::vector<std::string>& littleStrings);
140     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree(double arcDetEps=1e-12) const = 0;
141     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const double *bbox, double eps) const = 0;
142     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bbox, double eps) = 0;
143     MEDCOUPLING_EXPORT virtual MEDCouplingFieldDouble *computeDiameterField() const = 0;
144     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *zipCoordsTraducer();
145     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *zipConnectivityTraducer(int compType, int startCellId=0);
146     MEDCOUPLING_EXPORT virtual bool areAllNodesFetched() const;
147     //tools
148   public:
149     MEDCOUPLING_EXPORT bool areCellsFrom2MeshEqual(const MEDCouplingPointSet *other, int cellId, double prec) const;
150   protected:
151     MEDCOUPLING_EXPORT void checkConsistencyLight() const;
152     MEDCOUPLING_EXPORT static bool intersectsBoundingBox(const double* bb1, const double* bb2, int dim, double eps);
153     MEDCOUPLING_EXPORT static bool intersectsBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bb1, const double* bb2, int dim, double eps);
154     MEDCOUPLING_EXPORT void rotate2D(const double *center, double angle);
155     MEDCOUPLING_EXPORT void rotate3D(const double *center, const double *vect, double angle);
156     MEDCOUPLING_EXPORT void project2DCellOnXY(const int *startConn, const int *endConn, std::vector<double>& res) const;
157     MEDCOUPLING_EXPORT static bool isButterfly2DCell(const std::vector<double>& res, bool isQuad, double eps);
158   protected:
159     DataArrayDouble *_coords;
160   };
161 }
162
163 #endif