src/MEDCoupling/MEDCouplingMemArray.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2020  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (EDF R&D)
  20
  21 #pragma once
  22
  23 #include "MEDCoupling.hxx"
  24 #include "MCType.hxx"
  25 #include "MCAuto.hxx"
  26 #include "MEDCouplingTimeLabel.hxx"
  27 #include "MEDCouplingRefCountObject.hxx"
  28 #include "InterpKernelException.hxx"
  29 #include "MEDCouplingTraits.hxx"
  30 #include "MEDCouplingMap.hxx"
  31 #include "BBTreePts.txx"
  32
  33 #include <string>
  34 #include <vector>
  35 #include <iterator>
  36
  37 namespace MEDCoupling
  38 {
  39   typedef enum
  40     {
  41       AX_CART = 3,
  42       AX_CYL = 4,
  43       AX_SPHER = 5
  44     } MEDCouplingAxisType;
  45   // -- WARNING this enum must be synchronized with MEDCouplingCommon.i file ! --
  46
  47   class PartDefinition;
  48
  49   template<class T>
  50   class MEDCouplingPointer
  51   {
  52   public:
  53     MEDCouplingPointer():_internal(0),_external(0) { }
  54     void null() { _internal=0; _external=0; }
  55     bool isNull() const { return _internal==0 && _external==0; }
  56     void setInternal(T *pointer);
  57     void setExternal(const T *pointer);
  58     const T *getConstPointer() const { if(_internal) return _internal; else return _external; }
  59     const T *getConstPointerLoc(std::size_t offset) const { if(_internal) return _internal+offset; else return _external+offset; }
  60     T *getPointer() { if(_internal) return _internal; if(_external) throw INTERP_KERNEL::Exception("Trying to write on an external pointer."); else return 0; }
  61   private:
  62     T *_internal;
  63     const T *_external;
  64   };
  65
  66   template<class T>
  67   class MemArray
  68   {
  69   public:
  70     typedef void (*Deallocator)(void *,void *);
  71   public:
  72     MemArray():_nb_of_elem(0),_nb_of_elem_alloc(0),_ownership(false),_dealloc(0),_param_for_deallocator(0) { }
  73     MemArray(const MemArray<T>& other);
  74     bool isNull() const { return _pointer.isNull(); }
  75     const T *getConstPointerLoc(std::size_t offset) const { return _pointer.getConstPointerLoc(offset); }
  76     const T *getConstPointer() const { return _pointer.getConstPointer(); }
  77     std::size_t getNbOfElem() const { return _nb_of_elem; }
  78     std::size_t getNbOfElemAllocated() const { return _nb_of_elem_alloc; }
  79     T *getPointer() { return _pointer.getPointer(); }
  80     MemArray<T> &operator=(const MemArray<T>& other);
  81     T operator[](std::size_t id) const { return _pointer.getConstPointer()[id]; }
  82     T& operator[](std::size_t id) { return _pointer.getPointer()[id]; }
  83     bool isEqual(const MemArray<T>& other, T prec, std::string& reason) const;
  84     void repr(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  85     bool reprHeader(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  86     void reprZip(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  87     void reprNotTooLong(mcIdType sl, std::ostream& stream) const;
  88     void fillWithValue(const T& val);
  89     T *fromNoInterlace(std::size_t nbOfComp) const;
  90     T *toNoInterlace(std::size_t nbOfComp) const;
  91     void sort(bool asc);
  92     void reverse(std::size_t nbOfComp);
  93     void alloc(std::size_t nbOfElements);
  94     void reserve(std::size_t newNbOfElements);
  95     void reAlloc(std::size_t newNbOfElements);
  96     void useArray(const T *array, bool ownership, DeallocType type, std::size_t nbOfElem);
  97     void useExternalArrayWithRWAccess(const T *array, std::size_t nbOfElem);
  98     void writeOnPlace(std::size_t id, T element0, const T *others, std::size_t sizeOfOthers);
  99     template<class InputIterator>
 100     void insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last);
 101     void pushBack(T elem);
 102     T popBack();
 103     void pack() const;
 104     bool isDeallocatorCalled() const { return _ownership; }
 105     Deallocator getDeallocator() const { return _dealloc; }
 106     void setSpecificDeallocator(Deallocator dealloc) { _dealloc=dealloc; }
 107     void setParameterForDeallocator(void *param) { _param_for_deallocator=param; }
 108     void *getParameterForDeallocator() const { return _param_for_deallocator; }
 109     void destroy();
 110     ~MemArray() { destroy(); }
 111   public:
 112     static void CPPDeallocator(void *pt, void *param);
 113     static void CDeallocator(void *pt, void *param);
 114     static void COffsetDeallocator(void *pt, void *param);
 115   private:
 116     static void DestroyPointer(T *pt, Deallocator dealloc, void *param);
 117     static Deallocator BuildFromType(DeallocType type);
 118   private:
 119     std::size_t _nb_of_elem;
 120     std::size_t _nb_of_elem_alloc;
 121     bool _ownership;
 122     MEDCouplingPointer<T> _pointer;
 123     Deallocator _dealloc;
 124     void *_param_for_deallocator;
 125   };
 126
 127   template <class T> class DataArrayTools
 128   {
 129   public:
 130     static void GetSlice(T start, T stop, T step, mcIdType sliceId, mcIdType nbOfSlices, T& startSlice, T& stopSlice);
 131     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBES(T begin, T end, T step, const std::string& msg);
 132     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBESRelative(T begin, T end, T step, const std::string& msg);
 133     static mcIdType GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(T value, T begin, T end, T step);
 134   };
 135
 136   class DataArray;
 137   class DataArrayByte;
 138
 139   MEDCOUPLING_EXPORT void DACheckNbOfTuplesAndComp(const DataArray *da, mcIdType nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg);
 140
 141   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArray : public RefCountObject, public TimeLabel
 142   {
 143   public:
 144     std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 145     std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
 146     void setName(const std::string& name);
 147     void copyStringInfoFrom(const DataArray& other);
 148     void copyPartOfStringInfoFrom(const DataArray& other, const std::vector<std::size_t>& compoIds);
 149     void copyPartOfStringInfoFrom2(const std::vector<std::size_t>& compoIds, const DataArray& other);
 150     bool areInfoEqualsIfNotWhy(const DataArray& other, std::string& reason) const;
 151     bool areInfoEquals(const DataArray& other) const;
 152     std::string cppRepr(const std::string& varName) const;
 153     std::string getName() const { return _name; }
 154     const std::vector<std::string> &getInfoOnComponents() const { return _info_on_compo; }
 155     std::vector<std::string> &getInfoOnComponents() { return _info_on_compo; }
 156     void setInfoOnComponents(const std::vector<std::string>& info);
 157     void setInfoAndChangeNbOfCompo(const std::vector<std::string>& info);
 158     std::vector<std::string> getVarsOnComponent() const;
 159     std::vector<std::string> getUnitsOnComponent() const;
 160     std::string getInfoOnComponent(std::size_t i) const;
 161     std::string getVarOnComponent(std::size_t i) const;
 162     std::string getUnitOnComponent(std::size_t i) const;
 163     void setInfoOnComponent(std::size_t i, const std::string& info);
 164     std::size_t getNumberOfComponents() const { return _info_on_compo.size(); }
 165     void setPartOfValuesBase3(const DataArray *aBase, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare=true);
 166     virtual void *getVoidStarPointer() = 0;
 167     virtual DataArray *deepCopy() const = 0;
 168     virtual DataArray *copySorted(bool asc=true) const = 0;
 169     virtual DataArray *buildNewEmptyInstance() const = 0;
 170     virtual bool isAllocated() const = 0;
 171     virtual void checkAllocated() const = 0;
 172     virtual void desallocate() = 0;
 173     virtual mcIdType getNumberOfTuples() const = 0;
 174     virtual mcIdType getNbOfElems() const = 0;
 175     virtual std::size_t getNbOfElemAllocated() const = 0;
 176     virtual void alloc(std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo=1) = 0;
 177     virtual void reAlloc(std::size_t newNbOfTuple) = 0;
 178     virtual void renumberInPlace(const mcIdType *old2New) = 0;
 179     virtual void renumberInPlaceR(const mcIdType *new2Old) = 0;
 180     virtual void setContigPartOfSelectedValues(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, const DataArrayIdType *tuplesSelec) = 0;
 181     virtual void setContigPartOfSelectedValuesSlice(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) = 0;
 182     virtual DataArray *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const = 0;
 183     virtual DataArray *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const = 0;
 184     virtual DataArray *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const = 0;
 185     virtual DataArray *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const = 0;
 186     virtual DataArray *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const = 0;
 187     virtual void rearrange(std::size_t newNbOfCompo) = 0;
 188     virtual void circularPermutation(mcIdType nbOfShift=1) = 0;
 189     virtual void circularPermutationPerTuple(mcIdType nbOfShift=1) = 0;
 190     virtual void reversePerTuple() = 0;
 191     void checkNbOfTuples(mcIdType nbOfTuples, const std::string& msg) const;
 192     void checkNbOfComps(std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg) const;
 193     void checkNbOfTuplesAndComp(const DataArray& other, const std::string& msg) const;
 194     void checkNbOfTuplesAndComp(mcIdType nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg) const;
 195     void checkNbOfElems(mcIdType nbOfElems, const std::string& msg) const;
 196     static void GetSlice(mcIdType start, mcIdType stop, mcIdType step, mcIdType sliceId, mcIdType nbOfSlices, mcIdType& startSlice, mcIdType& stopSlice);
 197     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBES(mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step, const std::string& msg);
 198     static mcIdType GetNumberOfItemGivenBESRelative(mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step, const std::string& msg);
 199     static mcIdType GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(mcIdType value, mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step);
 200     static std::string GetVarNameFromInfo(const std::string& info);
 201     static std::string GetUnitFromInfo(const std::string& info);
 202     static std::string BuildInfoFromVarAndUnit(const std::string& var, const std::string& unit);
 203     static std::string GetAxisTypeRepr(MEDCouplingAxisType at);
 204     static DataArray *Aggregate(const std::vector<const DataArray *>& arrs);
 205     virtual void reprStream(std::ostream& stream) const = 0;
 206     virtual void reprZipStream(std::ostream& stream) const = 0;
 207     virtual void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 208     virtual void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const = 0;
 209     virtual void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const = 0;
 210     virtual void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const = 0;
 211     virtual void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const = 0;
 212   protected:
 213     DataArray() { }
 214     ~DataArray() { }
 215   protected:
 216     static void CheckValueInRange(mcIdType ref, mcIdType value, const std::string& msg);
 217     static void CheckValueInRangeEx(mcIdType value, mcIdType start, mcIdType end, const std::string& msg);
 218     static void CheckClosingParInRange(mcIdType ref, mcIdType value, const std::string& msg);
 219     static mcIdType EffectiveCircPerm(mcIdType nbOfShift, mcIdType nbOfTuples);
 220   protected:
 221     std::string _name;
 222     std::vector<std::string> _info_on_compo;
 223   };
 224 }
 225
 226 namespace MEDCoupling
 227 {
 228   template<class T>
 229   class DataArrayTemplate : public DataArray
 230   {
 231   public:
 232     typedef T Type;
 233   public:
 234     static MCAuto< typename Traits<T>::ArrayTypeCh > NewFromStdVector(const typename std::vector<T>& v);
 235     static MCAuto< typename Traits<T>::ArrayTypeCh > NewFromArray(const T *arrBegin, const T *arrEnd);
 236     std::vector< MCAuto< typename Traits<T>::ArrayTypeCh > > explodeComponents() const;
 237     //
 238     std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 239     void updateTime() const { }
 240     //
 241     mcIdType getNumberOfTuples() const { return ToIdType(_info_on_compo.empty()?0:_mem.getNbOfElem()/getNumberOfComponents()); }
 242     mcIdType getNbOfElems() const { return ToIdType(_mem.getNbOfElem()); }
 243     bool empty() const;
 244     void *getVoidStarPointer() { return getPointer(); }
 245     const T *getConstPointer() const { return _mem.getConstPointer(); }
 246     const T *begin() const { return getConstPointer(); }
 247     const T *end() const { return getConstPointer()+getNbOfElems(); }
 248     T *rwBegin() { return getPointer(); }
 249     T *rwEnd() { return getPointer()+getNbOfElems(); }
 250     void alloc(std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo=1);
 251     void useArray(const T *array, bool ownership, DeallocType type, std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo);
 252     void useExternalArrayWithRWAccess(const T *array, std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo);
 253     T getIJSafe(std::size_t tupleId, std::size_t compoId) const;
 254     T getIJ(std::size_t tupleId, std::size_t compoId) const { return _mem[tupleId*_info_on_compo.size()+compoId]; }
 255     void setIJ(std::size_t tupleId, std::size_t compoId, T newVal) { _mem[tupleId*_info_on_compo.size()+compoId]=newVal; declareAsNew(); }
 256     void setIJSilent(std::size_t tupleId, std::size_t compoId, T newVal) { _mem[tupleId*_info_on_compo.size()+compoId]=newVal; }
 257     T *getPointer() { return _mem.getPointer(); declareAsNew(); }
 258     void pack() const;
 259     bool isAllocated() const override;
 260     void checkAllocated() const;
 261     void desallocate();
 262     void reserve(std::size_t nbOfElems);
 263     void rearrange(std::size_t newNbOfCompo);
 264     void transpose();
 265     void pushBackSilent(T val);
 266     void pushBackValsSilent(const T *valsBg, const T *valsEnd);
 267     T popBackSilent();
 268     T front() const;
 269     T back() const;
 270     std::size_t getNbOfElemAllocated() const { return _mem.getNbOfElemAllocated(); }
 271     void allocIfNecessary(std::size_t nbOfTuple, std::size_t nbOfCompo);
 272     void deepCopyFrom(const DataArrayTemplate<T>& other);
 273     void reverse();
 274     void fillWithValue(T val);
 275     void reAlloc(std::size_t newNbOfTuple);
 276     void renumberInPlace(const mcIdType *old2New);
 277     void renumberInPlaceR(const mcIdType *new2Old);
 278     void sort(bool asc=true);
 279     typename Traits<T>::ArrayType *renumber(const mcIdType *old2New) const;
 280     typename Traits<T>::ArrayType *renumberR(const mcIdType *new2Old) const;
 281     typename Traits<T>::ArrayType *renumberAndReduce(const mcIdType *old2New, mcIdType newNbOfTuple) const;
 282     typename Traits<T>::ArrayType *changeNbOfComponents(std::size_t newNbOfComp, T dftValue) const;
 283     typename Traits<T>::ArrayType *subArray(mcIdType tupleIdBg, mcIdType tupleIdEnd=-1) const;
 284     MCAuto<typename Traits<T>::ArrayTypeCh> selectPartDef(const PartDefinition* pd) const;
 285     void circularPermutation(mcIdType nbOfShift=1);
 286     void circularPermutationPerTuple(mcIdType nbOfShift=1);
 287     void reversePerTuple();
 288     void setPartOfValues1(const typename Traits<T>::ArrayType *a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare=true);
 289     void setPartOfValuesSimple1(T a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp);
 290     void setPartOfValues2(const typename Traits<T>::ArrayType *a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp, bool strictCompoCompare=true);
 291     void setPartOfValuesSimple2(T a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp);
 292     void setPartOfValues3(const typename Traits<T>::ArrayType *a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare=true);
 293     void setPartOfValuesSimple3(T a, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp);
 294     void setPartOfValues4(const typename Traits<T>::ArrayType *a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp, bool strictCompoCompare=true);
 295     void setPartOfValuesSimple4(T a, mcIdType bgTuples, mcIdType endTuples, mcIdType stepTuples, const mcIdType *bgComp, const mcIdType *endComp);
 296     void setPartOfValuesAdv(const typename Traits<T>::ArrayType *a, const DataArrayIdType *tuplesSelec);
 297     void setContigPartOfSelectedValues(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, const DataArrayIdType *tuplesSelec);
 298     void setContigPartOfSelectedValuesSlice(mcIdType tupleIdStart, const DataArray *aBase, mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step);
 299     T getMaxValue(mcIdType& tupleId) const;
 300     T getMaxValueInArray() const;
 301     T getMaxAbsValue(std::size_t& tupleId) const;
 302     T getMaxAbsValueInArray() const;
 303     T getMinValue(mcIdType& tupleId) const;
 304     T getMinValueInArray() const;
 305     void getTuple(mcIdType tupleId, T *res) const { std::copy(_mem.getConstPointerLoc(tupleId*_info_on_compo.size()),_mem.getConstPointerLoc((tupleId+1)*_info_on_compo.size()),res); }
 306     template<class InputIterator>
 307     void insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last);
 308     static void SetArrayIn(typename Traits<T>::ArrayType *newArray, typename Traits<T>::ArrayType* &arrayToSet);
 309     void writeOnPlace(std::size_t id, T element0, const T *others, mcIdType sizeOfOthers) { _mem.writeOnPlace(id,element0,others,sizeOfOthers); }
 310     void fillWithZero();
 311   public:
 312     MemArray<T>& accessToMemArray() { return _mem; }
 313     const MemArray<T>& accessToMemArray() const { return _mem; }
 314   protected:
 315     typename Traits<T>::ArrayTypeCh *copySortedImpl(bool asc) const;
 316     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const;
 317     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const;
 318     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const;
 319     typename Traits<T>::ArrayType *myKeepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const;
 320     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const;
 321     typename Traits<T>::ArrayType *mySelectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const;
 322   protected:
 323     MemArray<T> _mem;
 324   };
 325
 326   template<class T>
 327   class DataArrayTemplateClassic : public DataArrayTemplate<T>
 328   {
 329   public:
 330     MCAuto<DataArrayDouble> convertToDblArr() const;
 331     MCAuto<DataArrayInt> convertToIntArr() const;
 332     MCAuto<DataArrayFloat> convertToFloatArr() const;
 333     void applyLin(T a, T b, std::size_t compoId);
 334     void applyLin(T a, T b);
 335     typename Traits<T>::ArrayType *negate() const;
 336     void addEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 337     void substractEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 338     void multiplyEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 339     void divideEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 340     static typename Traits<T>::ArrayType *Substract(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 341     static typename Traits<T>::ArrayType *Divide(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 342     static typename Traits<T>::ArrayType *Add(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 343     static typename Traits<T>::ArrayType *Multiply(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 344     static typename Traits<T>::ArrayType *Meld(const typename Traits<T>::ArrayType *a1, const typename Traits<T>::ArrayType *a2);
 345     static typename Traits<T>::ArrayType *Meld(const std::vector<const typename Traits<T>::ArrayType *>& arr);
 346     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsGreaterOrEqualTo(T val) const;
 347     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsGreaterThan(T val) const;
 348     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsLowerOrEqualTo(T val) const;
 349     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsLowerThan(T val) const;
 350     DataArrayIdType *findIdsStrictlyNegative() const;
 351     typename Traits<T>::ArrayType *fromNoInterlace() const;
 352     typename Traits<T>::ArrayType *toNoInterlace() const;
 353     void meldWith(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 354     typename Traits<T>::ArrayType *duplicateEachTupleNTimes(mcIdType nbTimes) const;
 355     void aggregate(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 356     void abs();
 357     typename Traits<T>::ArrayType *computeAbs() const;
 358     typename Traits<T>::ArrayType *performCopyOrIncrRef(bool dCpy) const;
 359     typename Traits<T>::ArrayType *sumPerTuple() const;
 360     void iota(T init=(T)0);
 361     void reprStream(std::ostream& stream) const;
 362     void reprZipStream(std::ostream& stream) const;
 363     void reprNotTooLongStream(std::ostream& stream) const;
 364     void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 365     void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 366     void reprNotTooLongWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 367     std::string repr() const;
 368     std::string reprZip() const;
 369     std::string reprNotTooLong() const;
 370     template<class U>
 371     MCAuto< typename Traits<U>::ArrayType > convertToOtherTypeOfArr() const;
 372   protected:
 373     static typename Traits<T>::ArrayType *PerformCopyOrIncrRef(bool dCpy, const typename Traits<T>::ArrayType& self);
 374     template<class OP>
 375     MCAuto<DataArrayIdType> findIdsAdv(const OP& op) const;
 376   private:
 377     template<class FCT>
 378     void somethingEqual(const typename Traits<T>::ArrayType *other);
 379   };
 380
 381   template<class T>
 382   class DataArrayTemplateFP : public DataArrayTemplateClassic<T>
 383   {
 384   public:
 385     bool isUniform(T val, T eps) const;
 386   };
 387 }
 388
 389 namespace MEDCoupling
 390 {
 391   class DataArrayFloatIterator;
 392   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayFloat : public DataArrayTemplateFP<float>
 393   {
 394   public:
 395     static DataArrayFloat *New();
 396   public:// abstract method overload
 397     DataArrayFloat *deepCopy() const;
 398     DataArrayFloat *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 399     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayFloat"); }
 400     DataArrayFloat *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayFloat::New(); }
 401     DataArrayFloat *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplateFP<float>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 402     DataArrayFloat *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplateFP<float>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 403     DataArrayFloat *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 404     DataArrayFloat *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplateFP<float>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 405     DataArrayFloat *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplateFP<float>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 406     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 407     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 408     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 409   public:// non abstract but essential
 410     bool isEqual(const DataArrayFloat& other, float prec) const;
 411     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayFloat& other, float prec, std::string& reason) const;
 412     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayFloat& other, float prec) const;
 413   public:
 414     DataArrayFloatIterator *iterator();
 415   private:
 416     ~DataArrayFloat() { }
 417     DataArrayFloat() { }
 418   };
 419 }
 420
 421 namespace MEDCoupling
 422 {
 423   class DataArrayDoubleIterator;
 424   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble : public DataArrayTemplateFP<double>
 425   {
 426   public:
 427     static DataArrayDouble *New();
 428     double doubleValue() const;
 429     DataArrayDouble *deepCopy() const;
 430     DataArrayDouble *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 431     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayDouble"); }
 432     DataArrayDouble *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayDouble::New(); }
 433     void checkMonotonic(bool increasing, double eps) const;
 434     bool isMonotonic(bool increasing, double eps) const;
 435     void writeVTK(std::ostream& ofs, mcIdType indent, const std::string& nameInFile, DataArrayByte *byteArr) const;
 436     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 437     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 438     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 439     bool isEqual(const DataArrayDouble& other, double prec) const;
 440     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayDouble& other, double prec, std::string& reason) const;
 441     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayDouble& other, double prec) const;
 442     DataArrayDouble *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 443     DataArrayDouble *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 444     DataArrayDouble *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplateFP<double>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 445     DataArrayDouble *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplateFP<double>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 446     DataArrayDouble *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplateFP<double>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 447     DataArrayDouble *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplateFP<double>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 448     bool areIncludedInMe(const DataArrayDouble *other, double prec, DataArrayIdType *&tupleIds) const;
 449     void findCommonTuples(double prec, mcIdType limitTupleId, DataArrayIdType *&comm, DataArrayIdType *&commIndex) const;
 450     double minimalDistanceTo(const DataArrayDouble *other, mcIdType& thisTupleId, mcIdType& otherTupleId) const;
 451     DataArrayDouble *getDifferentValues(double prec, mcIdType limitTupleId=-1) const;
 452     DataArrayIdType *findClosestTupleId(const DataArrayDouble *other) const;
 453     DataArrayIdType *computeNbOfInteractionsWith(const DataArrayDouble *otherBBoxFrmt, double eps) const;
 454     void setSelectedComponents(const DataArrayDouble *a, const std::vector<std::size_t>& compoIds);
 455     DataArrayDoubleIterator *iterator();
 456     void checkNoNullValues() const;
 457     void getMinMaxPerComponent(double *bounds) const;
 458     DataArrayDouble *computeBBoxPerTuple(double epsilon=0.0) const;
 459     void computeTupleIdsNearTuples(const DataArrayDouble *other, double eps, DataArrayIdType *& c, DataArrayIdType *& cI) const;
 460     void recenterForMaxPrecision(double eps);
 461     double getMaxValue2(DataArrayIdType*& tupleIds) const;
 462     double getMinValue2(DataArrayIdType*& tupleIds) const;
 463     mcIdType count(double value, double eps) const;
 464     double getAverageValue() const;
 465     double norm2() const;
 466     double normMax() const;
 467     void normMaxPerComponent(double * res) const;
 468     double normMin() const;
 469     void accumulate(double *res) const;
 470     double accumulate(std::size_t compId) const;
 471     DataArrayDouble *accumulatePerChunck(const mcIdType *bgOfIndex, const mcIdType *endOfIndex) const;
 472     MCAuto<DataArrayDouble> cumSum() const;
 473     double distanceToTuple(const double *tupleBg, const double *tupleEnd, mcIdType& tupleId) const;
 474     DataArrayDouble *fromPolarToCart() const;
 475     DataArrayDouble *fromCylToCart() const;
 476     DataArrayDouble *fromSpherToCart() const;
 477     DataArrayDouble *cartesianize(MEDCouplingAxisType atOfThis) const;
 478     DataArrayDouble *fromCartToPolar() const;
 479     DataArrayDouble *fromCartToCyl() const;
 480     DataArrayDouble *fromCartToSpher() const;
 481     DataArrayDouble *fromCartToCylGiven(const DataArrayDouble *coords, const double center[3], const double vect[3]) const;
 482     DataArrayDouble *doublyContractedProduct() const;
 483     DataArrayDouble *determinant() const;
 484     DataArrayDouble *eigenValues() const;
 485     DataArrayDouble *eigenVectors() const;
 486     DataArrayDouble *inverse() const;
 487     DataArrayDouble *trace() const;
 488     DataArrayDouble *deviator() const;
 489     DataArrayDouble *magnitude() const;
 490     DataArrayDouble *maxPerTuple() const;
 491     DataArrayDouble *maxPerTupleWithCompoId(DataArrayIdType* &compoIdOfMaxPerTuple) const;
 492     DataArrayDouble *buildEuclidianDistanceDenseMatrix() const;
 493     DataArrayDouble *buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith(const DataArrayDouble *other) const;
 494     void asArcOfCircle(double center[2], double& radius, double& ang) const;
 495     void sortPerTuple(bool asc);
 496     void applyInv(double numerator);
 497     void applyPow(double val);
 498     void applyRPow(double val);
 499     DataArrayDouble *applyFunc(std::size_t nbOfComp, FunctionToEvaluate func) const;
 500     DataArrayDouble *applyFunc(std::size_t nbOfComp, const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 501     DataArrayDouble *applyFunc(const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 502     void applyFuncOnThis(const std::string& func, bool isSafe=true);
 503     DataArrayDouble *applyFuncCompo(std::size_t nbOfComp, const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 504     DataArrayDouble *applyFuncNamedCompo(std::size_t nbOfComp, const std::vector<std::string>& varsOrder, const std::string& func, bool isSafe=true) const;
 505     void applyFuncFast32(const std::string& func);
 506     void applyFuncFast64(const std::string& func);
 507     MCAuto<DataArrayDouble> symmetry3DPlane(const double point[3], const double normalVector[3]) const;
 508     DataArrayIdType *findIdsInRange(double vmin, double vmax) const;
 509     DataArrayIdType *findIdsNotInRange(double vmin, double vmax) const;
 510     static DataArrayDouble *Aggregate(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 511     static DataArrayDouble *Aggregate(const std::vector<const DataArrayDouble *>& arr);
 512     static DataArrayDouble *Dot(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 513     static DataArrayDouble *CrossProduct(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 514     static DataArrayDouble *Max(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 515     static DataArrayDouble *Min(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 516     static DataArrayDouble *Pow(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2);
 517     void powEqual(const DataArrayDouble *other);
 518     std::vector<bool> toVectorOfBool(double eps) const;
 519     static void Rotate2DAlg(const double *center, double angle, mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut);
 520     static void Rotate3DAlg(const double *center, const double *vect, double angle, mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut);
 521     static void Symmetry3DPlane(const double point[3], const double normalVector[3], mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut);
 522     static void GiveBaseForPlane(const double normalVector[3], double baseOfPlane[9]);
 523     static void ComputeIntegralOfSeg2IntoTri3(const double seg2[4], const double tri3[6], double coeffs[3], double& length);
 524   public:
 525     void getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const;
 526     void getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const;
 527     bool resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI);
 528     void finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS);
 529   public:
 530     template<mcIdType SPACEDIM>
 531     void findCommonTuplesAlg(const double *bbox, mcIdType nbNodes, mcIdType limitNodeId, double prec, DataArrayIdType *c, DataArrayIdType *cI) const;
 532     template<mcIdType SPACEDIM>
 533     static void FindClosestTupleIdAlg(const BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType>& myTree, double dist, const double *pos, mcIdType nbOfTuples, const double *thisPt, mcIdType thisNbOfTuples, mcIdType *res);
 534     template<mcIdType SPACEDIM>
 535     static void FindTupleIdsNearTuplesAlg(const BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType>& myTree, const double *pos, mcIdType nbOfTuples, double eps,
 536                                           DataArrayIdType *c, DataArrayIdType *cI);
 537   private:
 538     ~DataArrayDouble() { }
 539     DataArrayDouble() { }
 540   };
 541 }
 542
 543 namespace MEDCoupling
 544 {
 545   template<class T>
 546   class DataArrayDiscrete : public DataArrayTemplateClassic<T>
 547   {
 548   public:
 549     using DataArrayType = typename Traits<T>::ArrayType;
 550   public:
 551     static DataArrayType *New();
 552     T intValue() const;
 553     bool isEqual(const DataArrayDiscrete<T>& other) const;
 554     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayDiscrete<T>& other, std::string& reason) const;
 555     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayDiscrete<T>& other) const;
 556     bool isEqualWithoutConsideringStrAndOrder(const typename Traits<T>::ArrayType& other) const;
 557     void switchOnTupleEqualTo(T val, std::vector<bool>& vec) const;
 558     void switchOnTupleNotEqualTo(T val, std::vector<bool>& vec) const;
 559     DataArrayIdType *occurenceRankInThis() const;
 560     DataArrayIdType *buildPermutationArr(const DataArrayDiscrete<T>& other) const;
 561     DataArrayIdType *indicesOfSubPart(const DataArrayDiscrete<T>& partOfThis) const;
 562     void checkMonotonic(bool increasing) const;
 563     bool isMonotonic(bool increasing) const;
 564     void checkStrictlyMonotonic(bool increasing) const;
 565     bool isStrictlyMonotonic(bool increasing) const;
 566     mcIdType getHashCode() const;
 567     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 568     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 569     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 570     void writeVTK(std::ostream& ofs, mcIdType indent, const std::string& type, const std::string& nameInFile, DataArrayByte *byteArr) const;
 571     void transformWithIndArr(const T *indArrBg, const T *indArrEnd);
 572     void transformWithIndArr(const MapKeyVal<T, T>& m);
 573     DataArrayIdType *findIdsEqual(T val) const;
 574     DataArrayIdType *transformWithIndArrR(const T *indArr2Bg, const T *indArrEnd) const;
 575     void splitByValueRange(const T *arrBg, const T *arrEnd,
 576                            DataArrayType *& castArr, DataArrayType *& rankInsideCast, DataArrayType *& castsPresent) const;
 577     bool isRange(T& strt, T& sttoopp, T& stteepp) const;
 578     DataArrayIdType *invertArrayO2N2N2O(mcIdType newNbOfElem) const;
 579     DataArrayIdType *invertArrayN2O2O2N(mcIdType oldNbOfElem) const;
 580     DataArrayIdType *invertArrayO2N2N2OBis(mcIdType newNbOfElem) const;
 581     MCAuto< MapKeyVal<T, mcIdType> > invertArrayN2O2O2NOptimized() const;
 582     MCAuto< MapKeyVal<mcIdType, T> > giveN2OOptimized() const;
 583     MCAuto<DataArrayIdType> findIdForEach(const T *valsBg, const T *valsEnd) const;
 584     DataArrayIdType *checkAndPreparePermutation() const;
 585     void changeSurjectiveFormat(T targetNb, DataArrayIdType *&arr, DataArrayIdType *&arrI) const;
 586     DataArrayIdType *buildPermArrPerLevel() const;
 587     bool isIota(mcIdType sizeExpected) const;
 588     bool isUniform(T val) const;
 589     T checkUniformAndGuess() const;
 590     bool hasUniqueValues() const;
 591     void setSelectedComponents(const DataArrayType *a, const std::vector<std::size_t>& compoIds);
 592     DataArrayIdType *findIdsNotEqual(T val) const;
 593     DataArrayIdType *findIdsEqualTuple(const T *tupleBg, const T *tupleEnd) const;
 594     DataArrayIdType *findIdsEqualList(const T *valsBg, const T *valsEnd) const;
 595     DataArrayIdType *findIdsNotEqualList(const T *valsBg, const T *valsEnd) const;
 596     mcIdType findIdFirstEqual(T value) const;
 597     mcIdType findIdFirstEqual(const std::vector<T>& vals) const;
 598     mcIdType findIdFirstEqualTuple(const std::vector<T>& tupl) const;
 599     mcIdType findIdSequence(const std::vector<T>& vals) const;
 600     mcIdType changeValue(T oldValue, T newValue);
 601     mcIdType count(T value) const;
 602     bool presenceOfTuple(const std::vector<T>& tupl) const;
 603     bool presenceOfValue(T value) const;
 604     bool presenceOfValue(const std::vector<T>& vals) const;
 605     void accumulate(T *res) const;
 606     T accumulate(std::size_t compId) const;
 607     DataArrayType *accumulatePerChunck(const mcIdType *bgOfIndex, const mcIdType *endOfIndex) const;
 608     void getMinMaxValues(T& minValue, T& maxValue) const;
 609     void applyInv(T numerator);
 610     void applyDivideBy(T val);
 611     void applyModulus(T val);
 612     void applyRModulus(T val);
 613     void applyPow(T val);
 614     void applyRPow(T val);
 615     DataArrayIdType *findIdsInRange(T vmin, T vmax) const;
 616     DataArrayIdType *findIdsNotInRange(T vmin, T vmax) const;
 617     bool checkAllIdsInRange(T vmin, T vmax) const;
 618     static DataArrayType *Aggregate(const DataArrayType *a1, const DataArrayType *a2, T offsetA2);
 619     static DataArrayType *Aggregate(const std::vector<const DataArrayType *>& arr);
 620     static DataArrayType *AggregateIndexes(const std::vector<const DataArrayType *>& arrs);
 621     static DataArrayType *BuildUnion(const std::vector<const DataArrayType *>& arr);
 622     static DataArrayType *BuildIntersection(const std::vector<const DataArrayType *>& arr);
 623     static void PutIntoToSkylineFrmt(const std::vector< std::vector<T> >& v, DataArrayType *& data, DataArrayIdType *& dataIndex);
 624     DataArrayIdType *buildComplement(mcIdType nbOfElement) const;
 625     DataArrayType *buildSubstraction(const DataArrayType *other) const;
 626     DataArrayType *buildSubstractionOptimized(const DataArrayType *other) const;
 627     DataArrayType *buildUnion(const DataArrayType *other) const;
 628     DataArrayType *buildIntersection(const DataArrayType *other) const;
 629     DataArrayIdType *indexOfSameConsecutiveValueGroups() const;
 630     DataArrayType *buildUnique() const;
 631     DataArrayType *buildUniqueNotSorted() const;
 632     DataArrayType *deltaShiftIndex() const;
 633     void computeOffsets();
 634     void computeOffsetsFull();
 635     void findIdsRangesInListOfIds(const DataArrayType *listOfIds, DataArrayIdType *& rangeIdsFetched, DataArrayType *& idsInInputListThatFetch) const;
 636     DataArrayType *buildExplicitArrByRanges(const DataArrayType *offsets) const;
 637     DataArrayType *buildExplicitArrOfSliceOnScaledArr(T begin, T stop, T step) const;
 638     DataArrayIdType *findRangeIdForEachTuple(const DataArrayType *ranges) const;
 639     DataArrayType *findIdInRangeForEachTuple(const DataArrayType *ranges) const;
 640     void sortEachPairToMakeALinkedList();
 641     MCAuto<DataArrayType> fromLinkedListOfPairToList() const;
 642     DataArrayType *getDifferentValues() const;
 643     std::vector<DataArrayIdType *> partitionByDifferentValues(std::vector<T>& differentIds) const;
 644     std::vector< std::pair<mcIdType,mcIdType> > splitInBalancedSlices(mcIdType nbOfSlices) const;
 645     static DataArrayType *Modulus(const DataArrayType *a1, const DataArrayType *a2);
 646     void modulusEqual(const DataArrayType *other);
 647     static DataArrayType *Pow(const DataArrayType *a1, const DataArrayType *a2);
 648     void powEqual(const DataArrayType *other);
 649     //MemArray<T>& accessToMemArray() { return _mem; }
 650     //const MemArray<T>& accessToMemArray() const { return _mem; }
 651   public:
 652     static DataArrayIdType *FindPermutationFromFirstToSecond(const DataArrayType *ids1, const DataArrayType *ids2);
 653     static DataArrayIdType *FindPermutationFromFirstToSecondDuplicate(const DataArrayType *ids1, const DataArrayType *ids2);
 654     static mcIdType *CheckAndPreparePermutation(const T *start, const T *end);
 655     static DataArrayType *BuildListOfSwitchedOn(const std::vector<bool>& v);
 656     static DataArrayType *BuildListOfSwitchedOff(const std::vector<bool>& v);
 657     static DataArrayIdType *ConvertIndexArrayToO2N(mcIdType nbOfOldTuples, const mcIdType *arr, const mcIdType *arrIBg, const mcIdType *arrIEnd, mcIdType &newNbOfTuples);
 658     static DataArrayIdType *MakePartition(const std::vector<const DataArrayType *>& groups, mcIdType newNb, std::vector< std::vector<mcIdType> >& fidsOfGroups);
 659   public:
 660     static void ExtractFromIndexedArrays(const mcIdType *idsOfSelectBg, const mcIdType *idsOfSelectEnd,
 661                                                             const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 662                                                             DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 663     static void ExtractFromIndexedArraysSlice(mcIdType idsOfSelectStart, mcIdType idsOfSelectStop, mcIdType idsOfSelectStep,
 664                                                                  const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 665                                                                  DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 666     static void SetPartOfIndexedArrays(const mcIdType *idsOfSelectBg, const mcIdType *idsOfSelectEnd,
 667                                                           const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 668                                                           const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex,
 669                                                           DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 670     static void SetPartOfIndexedArraysSlice(mcIdType start, mcIdType end, mcIdType step,
 671                                                                const DataArrayType *arrIn, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 672                                                                const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex,
 673                                                                DataArrayType* &arrOut, DataArrayIdType* &arrIndexOut);
 674     static void SetPartOfIndexedArraysSameIdx(const mcIdType *idsOfSelectBg, const mcIdType *idsOfSelectEnd,
 675                                                                  DataArrayType *arrInOut, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 676                                                                  const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex);
 677     static void SetPartOfIndexedArraysSameIdxSlice(mcIdType start, mcIdType end, mcIdType step,
 678                                                                       DataArrayType *arrInOut, const DataArrayIdType *arrIndxIn,
 679                                                                       const DataArrayType *srcArr, const DataArrayIdType *srcArrIndex);
 680     static bool RemoveIdsFromIndexedArrays(const T *idsToRemoveBg, const T *idsToRemoveEnd,
 681                                                               DataArrayType *arr, DataArrayIdType *arrIndx, mcIdType offsetForRemoval=0);
 682     static DataArrayType *Range(T begin, T end, T step);
 683   public:
 684     void getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const;
 685     void getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const;
 686     bool resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI);
 687     void finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS);
 688   protected:
 689     template<class ALG>
 690     void switchOnTupleAlg(T val, std::vector<bool>& vec, ALG algo) const;
 691   protected:
 692     ~DataArrayDiscrete() { }
 693   };
 694
 695   template<class T>
 696   class DataArrayDiscreteSigned : public DataArrayDiscrete<T>
 697   {
 698   public:
 699     bool isFittingWith(const std::vector<bool>& v) const;
 700   protected:
 701     ~DataArrayDiscreteSigned() { }
 702   };
 703
 704   class DataArrayInt32Iterator;
 705
 706   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt32 : public DataArrayDiscreteSigned<Int32>
 707   {
 708     friend class DataArrayDiscrete<Int32>;
 709   public:
 710     DataArrayInt32 *deepCopy() const;
 711     DataArrayInt32 *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 712     DataArrayInt32 *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayInt32::New(); }
 713   public:
 714     DataArrayInt32 *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 715     DataArrayInt32 *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 716     DataArrayInt32 *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 717     DataArrayInt32 *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return this->myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 718     DataArrayInt32 *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return this->mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 719     DataArrayInt32 *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return this->mySelectByTupleRanges(ranges); }
 720     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayInt32"); }
 721   public:
 722     DataArrayInt32Iterator *iterator();
 723   private:
 724     ~DataArrayInt32() { }
 725     DataArrayInt32() { }
 726   };
 727
 728   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt64 : public DataArrayDiscreteSigned<Int64>
 729   {
 730     friend class DataArrayDiscrete<Int64>;
 731   public:
 732     DataArrayInt64 *deepCopy() const;
 733     DataArrayInt64 *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 734     DataArrayInt64 *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayInt64::New(); }//ok
 735   public:
 736     DataArrayInt64 *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 737     DataArrayInt64 *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 738     DataArrayInt64 *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplate<Int64>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 739     DataArrayInt64 *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplate<Int64>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 740     DataArrayInt64 *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplate<Int64>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 741     DataArrayInt64 *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplate<Int64>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 742     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayInt64"); }
 743   public:
 744     DataArrayInt64Iterator *iterator();
 745   private:
 746     ~DataArrayInt64() { }
 747     DataArrayInt64() { }
 748   };
 749 }
 750
 751 namespace MEDCoupling
 752 {
 753
 754   template<class T>
 755   template<class OP>
 756   MCAuto<DataArrayIdType> DataArrayTemplateClassic<T>::findIdsAdv(const OP& op) const
 757   {
 758     this->checkAllocated();
 759     if(this->getNumberOfComponents()!=1)
 760       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayInt::findIdsAdv : this must have exactly one component !");
 761     const T *cptr(this->begin());
 762     MCAuto<DataArrayIdType> ret(DataArrayIdType::New()); ret->alloc(0,1);
 763     mcIdType nbOfTuples=this->getNumberOfTuples();
 764     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,cptr++)
 765       if(op(*cptr))
 766         ret->pushBackSilent(i);
 767     return ret;
 768   }
 769
 770   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayChar : public DataArrayTemplate<char>
 771   {
 772   public:
 773     virtual DataArrayChar *buildEmptySpecializedDAChar() const = 0;
 774     mcIdType getHashCode() const;
 775     bool isEqual(const DataArrayChar& other) const;
 776     virtual bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayChar& other, std::string& reason) const;
 777     bool isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayChar& other) const;
 778     std::string repr() const;
 779     std::string reprZip() const;
 780     DataArrayInt *convertToIntArr() const;
 781     DataArrayChar *selectByTupleId(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return this->mySelectByTupleId(new2OldBg,new2OldEnd); }
 782     DataArrayChar *selectByTupleId(const DataArrayIdType& di) const { return this->mySelectByTupleId(di); }
 783     DataArrayChar *selectByTupleIdSafe(const mcIdType *new2OldBg, const mcIdType *new2OldEnd) const { return DataArrayTemplate<char>::mySelectByTupleIdSafe(new2OldBg,new2OldEnd); }
 784     DataArrayChar *keepSelectedComponents(const std::vector<std::size_t>& compoIds) const { return DataArrayTemplate<char>::myKeepSelectedComponents(compoIds); }
 785     DataArrayChar *selectByTupleIdSafeSlice(mcIdType bg, mcIdType end2, mcIdType step) const { return DataArrayTemplate<char>::mySelectByTupleIdSafeSlice(bg,end2,step); }
 786     bool isUniform(char val) const;
 787     void meldWith(const DataArrayChar *other);
 788     DataArray *selectByTupleRanges(const std::vector<std::pair<mcIdType,mcIdType> >& ranges) const { return DataArrayTemplate<char>::mySelectByTupleRanges(ranges); }
 789     DataArrayIdType *findIdsEqual(char val) const;
 790     DataArrayIdType *findIdsNotEqual(char val) const;
 791     mcIdType findIdSequence(const std::vector<char>& vals) const;
 792     mcIdType findIdFirstEqualTuple(const std::vector<char>& tupl) const;
 793     mcIdType findIdFirstEqual(char value) const;
 794     mcIdType findIdFirstEqual(const std::vector<char>& vals) const;
 795     bool presenceOfTuple(const std::vector<char>& tupl) const;
 796     bool presenceOfValue(char value) const;
 797     bool presenceOfValue(const std::vector<char>& vals) const;
 798     DataArrayIdType *findIdsInRange(char vmin, char vmax) const;
 799     static DataArrayChar *Aggregate(const DataArrayChar *a1, const DataArrayChar *a2);
 800     static DataArrayChar *Aggregate(const std::vector<const DataArrayChar *>& arr);
 801     static DataArrayChar *Meld(const DataArrayChar *a1, const DataArrayChar *a2);
 802     static DataArrayChar *Meld(const std::vector<const DataArrayChar *>& arr);
 803     MemArray<char>& accessToMemArray() { return _mem; }
 804     const MemArray<char>& accessToMemArray() const { return _mem; }
 805   public:
 806     //void getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const;
 807     //void getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const;
 808     //bool resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI);
 809     //void finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS);
 810   protected:
 811     DataArrayChar() { }
 812   };
 813
 814   class DataArrayByteIterator;
 815
 816   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayByte : public DataArrayChar
 817   {
 818   public:
 819     static DataArrayByte *New();
 820     DataArrayChar *buildEmptySpecializedDAChar() const;
 821     DataArrayByteIterator *iterator();
 822     DataArrayByte *deepCopy() const;
 823     DataArrayByte *copySorted(bool asc=true) const override { return this->copySortedImpl(asc); }
 824     DataArrayByte *performCopyOrIncrRef(bool deepCopy) const;
 825     DataArrayByte *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayByte::New(); }
 826     char byteValue() const;
 827     void reprStream(std::ostream& stream) const;
 828     void reprZipStream(std::ostream& stream) const;
 829     void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 830     void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 831     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 832     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 833     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 834     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayChar& other, std::string& reason) const;
 835     std::vector<bool> toVectorOfBool() const;
 836     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayByte"); }
 837   private:
 838     ~DataArrayByte() { }
 839     DataArrayByte() { }
 840   };
 841
 842   class DataArrayAsciiCharIterator;
 843
 844   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayAsciiChar : public DataArrayChar
 845   {
 846   public:
 847     static DataArrayAsciiChar *New();
 848     static DataArrayAsciiChar *New(const std::string& st);
 849     static DataArrayAsciiChar *New(const std::vector<std::string>& vst, char defaultChar);
 850     DataArrayChar *buildEmptySpecializedDAChar() const;
 851     DataArrayAsciiCharIterator *iterator();
 852     DataArrayAsciiChar *deepCopy() const;
 853     DataArrayAsciiChar *copySorted(bool asc=true) const override { throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayAsciiChar::copySorted : not implemented for DataArrayByte"); }
 854     DataArrayAsciiChar *performCopyOrIncrRef(bool deepCopy) const;
 855     DataArrayAsciiChar *buildNewEmptyInstance() const { return DataArrayAsciiChar::New(); }
 856     char asciiCharValue() const;
 857     void reprStream(std::ostream& stream) const;
 858     void reprZipStream(std::ostream& stream) const;
 859     void reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 860     void reprZipWithoutNameStream(std::ostream& stream) const;
 861     void reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const;
 862     void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 863     void reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const;
 864     bool isEqualIfNotWhy(const DataArrayChar& other, std::string& reason) const;
 865     std::string getClassName() const override { return std::string("DataArrayAsciiChar"); }
 866   private:
 867     ~DataArrayAsciiChar() { }
 868     DataArrayAsciiChar() { }
 869     DataArrayAsciiChar(const std::string& st);
 870     DataArrayAsciiChar(const std::vector<std::string>& vst, char defaultChar);
 871   };
 872
 873   template<class T>
 874   class DataArrayIterator
 875   {
 876   public:
 877     DataArrayIterator(typename Traits<T>::ArrayType *da);
 878     ~DataArrayIterator();
 879     typename Traits<T>::ArrayTuple *nextt();
 880   private:
 881     typename Traits<T>::ArrayType *_da;
 882     T *_pt;
 883     mcIdType _tuple_id;
 884     std::size_t _nb_comp;
 885     mcIdType _nb_tuple;
 886   };
 887
 888   template<class T>
 889   class DataArrayTuple
 890   {
 891   public:
 892     DataArrayTuple(T *pt, std::size_t nbOfComp);
 893     std::string repr() const;
 894     std::size_t getNumberOfCompo() const { return _nb_of_compo; }
 895     const T *getConstPointer() const { return  _pt; }
 896     T *getPointer() { return _pt; }
 897     typename Traits<T>::ArrayType *buildDA(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 898   protected:
 899     T zeValue() const;
 900   protected:
 901     T *_pt;
 902     std::size_t _nb_of_compo;
 903   };
 904
 905   class DataArrayDoubleTuple;
 906
 907   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDoubleIterator : public DataArrayIterator<double>
 908   {
 909   public:
 910     DataArrayDoubleIterator(DataArrayDouble *da);
 911     ~DataArrayDoubleIterator() { }
 912   };
 913
 914   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDoubleTuple : public DataArrayTuple<double>
 915   {
 916   public:
 917     DataArrayDoubleTuple(double *pt, std::size_t nbOfComp);
 918     std::string repr() const;
 919     double doubleValue() const;
 920     DataArrayDouble *buildDADouble(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 921   };
 922
 923   class DataArrayFloatTuple;
 924
 925   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayFloatIterator : public DataArrayIterator<float>
 926   {
 927   public:
 928     DataArrayFloatIterator(DataArrayFloat *da);
 929     ~DataArrayFloatIterator() { }
 930   };
 931
 932   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayFloatTuple : public DataArrayTuple<float>
 933   {
 934   public:
 935     DataArrayFloatTuple(float *pt, std::size_t nbOfComp);
 936     std::string repr() const;
 937     float floatValue() const;
 938     DataArrayFloat *buildDAFloat(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 939   };
 940
 941   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt32Iterator : public DataArrayIterator<Int32>
 942   {
 943   public:
 944     DataArrayInt32Iterator(DataArrayInt32 *da);
 945     ~DataArrayInt32Iterator() { }
 946   };
 947
 948   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt64Iterator : public DataArrayIterator<Int64>
 949   {
 950   public:
 951     DataArrayInt64Iterator(DataArrayInt64 *da);
 952     ~DataArrayInt64Iterator() { }
 953   };
 954
 955   class MEDCOUPLING_EXPORT  DataArrayInt32Tuple : public DataArrayTuple<Int32>
 956   {
 957   public:
 958      DataArrayInt32Tuple(Int32 *pt, std::size_t nbOfComp);
 959     std::string repr() const;
 960     Int32 intValue() const;
 961     DataArrayInt32 *buildDAInt(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 962   };
 963
 964   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt64Tuple : public DataArrayTuple<Int64>
 965   {
 966   public:
 967      DataArrayInt64Tuple(Int64 *pt, std::size_t nbOfComp);
 968     std::string repr() const;
 969     Int64 intValue() const;
 970     DataArrayInt64 *buildDAInt(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
 971   };
 972
 973   typedef DataArrayInt32Tuple DataArrayIntTuple;
 974
 975   class DataArrayAsciiCharTuple;
 976
 977   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayAsciiCharIterator
 978   {
 979   public:
 980     DataArrayAsciiCharIterator(DataArrayAsciiChar *da);
 981     ~DataArrayAsciiCharIterator();
 982     DataArrayAsciiCharTuple *nextt();
 983   private:
 984     DataArrayAsciiChar *_da;
 985     char *_pt;
 986     mcIdType _tuple_id;
 987     std::size_t _nb_comp;
 988     mcIdType _nb_tuple;
 989   };
 990
 991   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayAsciiCharTuple
 992   {
 993   public:
 994     DataArrayAsciiCharTuple(char *pt, std::size_t nbOfComp);
 995     std::string repr() const;
 996     std::size_t getNumberOfCompo() const { return _nb_of_compo; }
 997     const char *getConstPointer() const { return  _pt; }
 998     char *getPointer() { return _pt; }
 999     char asciiCharValue() const;
1000     DataArrayAsciiChar *buildDAAsciiChar(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
1001   private:
1002     char *_pt;
1003     std::size_t _nb_of_compo;
1004   };
1005
1006   class DataArrayByteTuple;
1007
1008   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayByteIterator
1009   {
1010   public:
1011      DataArrayByteIterator(DataArrayByte *da);
1012     ~DataArrayByteIterator();
1013     DataArrayByteTuple *nextt();
1014   private:
1015     DataArrayByte *_da;
1016     char *_pt;
1017     mcIdType _tuple_id;
1018     std::size_t _nb_comp;
1019     mcIdType _nb_tuple;
1020   };
1021
1022   class MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayByteTuple
1023   {
1024   public:
1025     DataArrayByteTuple(char *pt, std::size_t nbOfComp);
1026     std::string repr() const;
1027     std::size_t getNumberOfCompo() const { return _nb_of_compo; }
1028     const char *getConstPointer() const { return  _pt; }
1029     char *getPointer() { return _pt; }
1030     char byteValue() const;
1031     DataArrayByte *buildDAByte(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const;
1032   private:
1033     char *_pt;
1034     std::size_t _nb_of_compo;
1035   };
1036 }
1037
1038 namespace MEDCoupling
1039 {
1040   template<class T>
1041   template<class InputIterator>
1042   void MemArray<T>::insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last)
1043   {
1044     T *pointer=_pointer.getPointer();
1045     while(first!=last)
1046       {
1047         if(_nb_of_elem>=_nb_of_elem_alloc)
1048           {
1049             reserve(_nb_of_elem_alloc>0?2*_nb_of_elem_alloc:1);
1050             pointer=_pointer.getPointer();
1051           }
1052         pointer[_nb_of_elem++]=*first++;
1053       }
1054   }
1055
1056   template<class T>
1057   template<class InputIterator>
1058   void DataArrayTemplate<T>::insertAtTheEnd(InputIterator first, InputIterator last)
1059   {
1060     std::size_t nbCompo(this->getNumberOfComponents());
1061     if(nbCompo==1)
1062       this->_mem.insertAtTheEnd(first,last);
1063     else if(nbCompo==0)
1064       {
1065         this->_info_on_compo.resize(1);
1066         this->_mem.insertAtTheEnd(first,last);
1067       }
1068     else
1069       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::insertAtTheEnd : not available for DataArrayDouble with number of components different than 1 !");
1070   }
1071 }