Salome HOME
Copyright update 2020
[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingMemArray.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2020  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (EDF R&D)
20
21 #include "MEDCouplingMemArray.txx"
22
23 #include "BBTree.txx"
24 #include "GenMathFormulae.hxx"
25 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
26 #include "InterpKernelExprParser.hxx"
27
28 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
29 #include "InterpKernelGeo2DEdgeArcCircle.hxx"
30 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
31 #include "InterpKernelGeo2DNode.hxx"
32 #include "InterpKernelGeo2DEdgeLin.hxx"
33
34 #include <set>
35 #include <cmath>
36 #include <limits>
37 #include <numeric>
38 #include <algorithm>
39 #include <functional>
40
41 typedef double (*MYFUNCPTR)(double);
42
43 using namespace MEDCoupling;
44
45 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::MemArray<mcIdType>;
46 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::MemArray<double>;
47 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTemplate<mcIdType>;
48 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTemplate<double>;
49 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTemplateClassic<Int32>;
50 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTemplateClassic<Int64>;
51 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTemplateClassic<double>;
52 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTemplateFP<double>;
53 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayIterator<double>;
54 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayIterator<mcIdType>;
55 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayDiscrete<Int32>;
56 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayDiscreteSigned<Int32>;
57 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayDiscrete<Int64>;
58 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayDiscreteSigned<Int64>;
59 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTuple<mcIdType>;
60 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTuple<double>;
61 template class MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling::DataArrayTuple<float>;
62
63 void MEDCoupling::DACheckNbOfTuplesAndComp(const DataArray *da, mcIdType nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg)
64 {
65   if(!da)
66     throw INTERP_KERNEL::Exception("DACheckNbOfTuplesAndComp : null input object !");
67   da->checkNbOfTuplesAndComp(nbOfTuples,nbOfCompo,msg);
68 }
69
70 template<mcIdType SPACEDIM>
71 void DataArrayDouble::findCommonTuplesAlg(const double *bbox, mcIdType nbNodes, mcIdType limitNodeId, double prec, DataArrayIdType *c, DataArrayIdType *cI) const
72 {
73   const double *coordsPtr=getConstPointer();
74   BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType> myTree(bbox,0,0,nbNodes,prec);
75   std::vector<bool> isDone(nbNodes);
76   for(mcIdType i=0;i<nbNodes;i++)
77     {
78       if(!isDone[i])
79         {
80           std::vector<mcIdType> intersectingElems;
81           myTree.getElementsAroundPoint(coordsPtr+i*SPACEDIM,intersectingElems);
82           if(intersectingElems.size()>1)
83             {
84               std::vector<mcIdType> commonNodes;
85               for(std::vector<mcIdType>::const_iterator it=intersectingElems.begin();it!=intersectingElems.end();it++)
86                 if(*it!=i)
87                   if(*it>=limitNodeId)
88                     {
89                       commonNodes.push_back(*it);
90                       isDone[*it]=true;
91                     }
92               if(!commonNodes.empty())
93                 {
94                   cI->pushBackSilent(cI->back()+ToIdType(commonNodes.size())+1);
95                   c->pushBackSilent(i);
96                   c->insertAtTheEnd(commonNodes.begin(),commonNodes.end());
97                 }
98             }
99         }
100     }
101 }
102
103 template<mcIdType SPACEDIM>
104 void DataArrayDouble::FindTupleIdsNearTuplesAlg(const BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType>& myTree, const double *pos, mcIdType nbOfTuples, double eps,
105                                                 DataArrayIdType *c, DataArrayIdType *cI)
106 {
107   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
108     {
109       std::vector<mcIdType> intersectingElems;
110       myTree.getElementsAroundPoint(pos+i*SPACEDIM,intersectingElems);
111       std::vector<mcIdType> commonNodes;
112       for(std::vector<mcIdType>::const_iterator it=intersectingElems.begin();it!=intersectingElems.end();it++)
113         commonNodes.push_back(*it);
114       cI->pushBackSilent(cI->back()+ToIdType(commonNodes.size()));
115       c->insertAtTheEnd(commonNodes.begin(),commonNodes.end());
116     }
117 }
118
119 template<mcIdType SPACEDIM>
120 void DataArrayDouble::FindClosestTupleIdAlg(const BBTreePts<SPACEDIM,mcIdType>& myTree, double dist, const double *pos, mcIdType nbOfTuples, const double *thisPt, mcIdType thisNbOfTuples, mcIdType *res)
121 {
122   double distOpt(dist);
123   const double *p(pos);
124   mcIdType *r(res);
125   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,p+=SPACEDIM,r++)
126     {
127       while(true)
128         {
129           mcIdType elem=-1;
130           double ret=myTree.getElementsAroundPoint2(p,distOpt,elem);
131           if(ret!=std::numeric_limits<double>::max())
132             {
133               distOpt=std::max(ret,1e-4);
134               *r=elem;
135               break;
136             }
137           else
138             { distOpt=2*distOpt; continue; }
139         }
140     }
141 }
142
143 mcIdType DataArray::EffectiveCircPerm(mcIdType nbOfShift, mcIdType nbOfTuples)
144 {
145   if(nbOfTuples<=0)
146     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::EffectiveCircPerm : number of tuples is expected to be > 0 !");
147   if(nbOfShift>=0)
148     {
149       return nbOfShift%nbOfTuples;
150     }
151   else
152     {
153       mcIdType tmp(-nbOfShift);
154       tmp=tmp%nbOfTuples;
155       return nbOfTuples-tmp;
156     }
157 }
158
159 std::size_t DataArray::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
160 {
161   std::size_t sz1=_name.capacity();
162   std::size_t sz2=_info_on_compo.capacity();
163   std::size_t sz3=0;
164   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=_info_on_compo.begin();it!=_info_on_compo.end();it++)
165     sz3+=(*it).capacity();
166   return sz1+sz2+sz3;
167 }
168
169 std::vector<const BigMemoryObject *> DataArray::getDirectChildrenWithNull() const
170 {
171   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
172 }
173
174 /*!
175  * Sets the attribute \a _name of \a this array.
176  * See \ref MEDCouplingArrayBasicsName "DataArrays infos" for more information.
177  *  \param [in] name - new array name
178  */
179 void DataArray::setName(const std::string& name)
180 {
181   _name=name;
182 }
183
184 /*!
185  * Copies textual data from an \a other DataArray. The copied data are
186  * - the name attribute,
187  * - the information of components.
188  *
189  * For more information on these data see \ref MEDCouplingArrayBasicsName "DataArrays infos".
190  *
191  *  \param [in] other - another instance of DataArray to copy the textual data from.
192  *  \throw If number of components of \a this array differs from that of the \a other.
193  */
194 void DataArray::copyStringInfoFrom(const DataArray& other)
195 {
196   if(_info_on_compo.size()!=other._info_on_compo.size())
197     throw INTERP_KERNEL::Exception("Size of arrays mismatches on copyStringInfoFrom !");
198   _name=other._name;
199   _info_on_compo=other._info_on_compo;
200 }
201
202 void DataArray::copyPartOfStringInfoFrom(const DataArray& other, const std::vector<std::size_t>& compoIds)
203 {
204   std::size_t nbOfCompoOth=other.getNumberOfComponents();
205   std::size_t newNbOfCompo=compoIds.size();
206   for(std::size_t i=0;i<newNbOfCompo;i++)
207     if(compoIds[i]>=nbOfCompoOth || compoIds[i]<0)
208       {
209         std::ostringstream oss; oss << "Specified component id is out of range (" << compoIds[i] << ") compared with nb of actual components (" << nbOfCompoOth << ")";
210         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
211       }
212   for(std::size_t i=0;i<newNbOfCompo;i++)
213     setInfoOnComponent(i,other.getInfoOnComponent(compoIds[i]));
214 }
215
216 void DataArray::copyPartOfStringInfoFrom2(const std::vector<std::size_t>& compoIds, const DataArray& other)
217 {
218   if(compoIds.size()!=other.getNumberOfComponents())
219     throw INTERP_KERNEL::Exception("Given compoIds has not the same size as number of components of given array !");
220   std::size_t partOfCompoToSet=compoIds.size();
221   std::size_t nbOfCompo=getNumberOfComponents();
222   for(std::size_t i=0;i<partOfCompoToSet;i++)
223     if(compoIds[i]>=nbOfCompo || compoIds[i]<0)
224       {
225         std::ostringstream oss; oss << "Specified component id is out of range (" << compoIds[i] << ") compared with nb of actual components (" << nbOfCompo << ")";
226         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
227       }
228   for(std::size_t i=0;i<partOfCompoToSet;i++)
229     setInfoOnComponent(compoIds[i],other.getInfoOnComponent(i));
230 }
231
232 bool DataArray::areInfoEqualsIfNotWhy(const DataArray& other, std::string& reason) const
233 {
234   std::ostringstream oss;
235   if(_name!=other._name)
236     {
237       oss << "Names DataArray mismatch : this name=\"" << _name << " other name=\"" << other._name << "\" !";
238       reason=oss.str();
239       return false;
240     }
241   if(_info_on_compo!=other._info_on_compo)
242     {
243       oss << "Components DataArray mismatch : \nThis components=";
244       for(std::vector<std::string>::const_iterator it=_info_on_compo.begin();it!=_info_on_compo.end();it++)
245         oss << "\"" << *it << "\",";
246       oss << "\nOther components=";
247       for(std::vector<std::string>::const_iterator it=other._info_on_compo.begin();it!=other._info_on_compo.end();it++)
248         oss << "\"" << *it << "\",";
249       reason=oss.str();
250       return false;
251     }
252   return true;
253 }
254
255 /*!
256  * Compares textual information of \a this DataArray with that of an \a other one.
257  * The compared data are
258  * - the name attribute,
259  * - the information of components.
260  *
261  * For more information on these data see \ref MEDCouplingArrayBasicsName "DataArrays infos".
262  *  \param [in] other - another instance of DataArray to compare the textual data of.
263  *  \return bool - \a true if the textual information is same, \a false else.
264  */
265 bool DataArray::areInfoEquals(const DataArray& other) const
266 {
267   std::string tmp;
268   return areInfoEqualsIfNotWhy(other,tmp);
269 }
270
271 void DataArray::reprWithoutNameStream(std::ostream& stream) const
272 {
273   stream << "Number of components : "<< getNumberOfComponents() << "\n";
274   stream << "Info of these components : ";
275   for(std::vector<std::string>::const_iterator iter=_info_on_compo.begin();iter!=_info_on_compo.end();iter++)
276     stream << "\"" << *iter << "\"   ";
277   stream << "\n";
278 }
279
280 std::string DataArray::cppRepr(const std::string& varName) const
281 {
282   std::ostringstream ret;
283   reprCppStream(varName,ret);
284   return ret.str();
285 }
286
287 /*!
288  * Sets information on all components. To know more on format of this information
289  * see \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
290  *  \param [in] info - a vector of strings.
291  *  \throw If size of \a info differs from the number of components of \a this.
292  */
293 void DataArray::setInfoOnComponents(const std::vector<std::string>& info)
294 {
295   if(getNumberOfComponents()!=info.size())
296     {
297       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::setInfoOnComponents : input is of size " << info.size() << " whereas number of components is equal to " << getNumberOfComponents() << " !";
298       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
299     }
300   _info_on_compo=info;
301 }
302
303 /*!
304  * This method is only a dispatcher towards DataArrayDouble::setPartOfValues3, DataArrayInt::setPartOfValues3, DataArrayChar::setPartOfValues3 depending on the true
305  * type of \a this and \a aBase.
306  *
307  * \throw If \a aBase and \a this do not have the same type.
308  *
309  * \sa DataArrayDouble::setPartOfValues3, DataArrayInt::setPartOfValues3, DataArrayChar::setPartOfValues3.
310  */
311 void DataArray::setPartOfValuesBase3(const DataArray *aBase, const mcIdType *bgTuples, const mcIdType *endTuples, mcIdType bgComp, mcIdType endComp, mcIdType stepComp, bool strictCompoCompare)
312 {
313   if(!aBase)
314     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::setPartOfValuesBase3 : input aBase object is NULL !");
315   DataArrayDouble *this1(dynamic_cast<DataArrayDouble *>(this));
316   DataArrayIdType *this2(dynamic_cast<DataArrayIdType *>(this));
317   DataArrayChar *this3(dynamic_cast<DataArrayChar *>(this));
318   const DataArrayDouble *a1(dynamic_cast<const DataArrayDouble *>(aBase));
319   const DataArrayIdType *a2(dynamic_cast<const DataArrayIdType *>(aBase));
320   const DataArrayChar *a3(dynamic_cast<const DataArrayChar *>(aBase));
321   if(this1 && a1)
322     {
323       this1->setPartOfValues3(a1,bgTuples,endTuples,bgComp,endComp,stepComp,strictCompoCompare);
324       return ;
325     }
326   if(this2 && a2)
327     {
328       this2->setPartOfValues3(a2,bgTuples,endTuples,bgComp,endComp,stepComp,strictCompoCompare);
329       return ;
330     }
331   if(this3 && a3)
332     {
333       this3->setPartOfValues3(a3,bgTuples,endTuples,bgComp,endComp,stepComp,strictCompoCompare);
334       return ;
335     }
336   throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::setPartOfValuesBase3 : input aBase object and this do not have the same type !");
337 }
338
339 std::vector<std::string> DataArray::getVarsOnComponent() const
340 {
341   std::size_t nbOfCompo=_info_on_compo.size();
342   std::vector<std::string> ret(nbOfCompo);
343   for(std::size_t i=0;i<nbOfCompo;i++)
344     ret[i]=getVarOnComponent(i);
345   return ret;
346 }
347
348 std::vector<std::string> DataArray::getUnitsOnComponent() const
349 {
350   std::size_t nbOfCompo=_info_on_compo.size();
351   std::vector<std::string> ret(nbOfCompo);
352   for(std::size_t i=0;i<nbOfCompo;i++)
353     ret[i]=getUnitOnComponent(i);
354   return ret;
355 }
356
357 /*!
358  * Returns information on a component specified by an index.
359  * To know more on format of this information
360  * see \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
361  *  \param [in] i - the index (zero based) of the component of interest.
362  *  \return std::string - a string containing the information on \a i-th component.
363  *  \throw If \a i is not a valid component index.
364  */
365 std::string DataArray::getInfoOnComponent(std::size_t i) const
366 {
367   if(i<_info_on_compo.size())
368     return _info_on_compo[i];
369   else
370     {
371       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::getInfoOnComponent : Specified component id is out of range (" << i << ") compared with nb of actual components (" << _info_on_compo.size();
372       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
373     }
374 }
375
376 /*!
377  * Returns the var part of the full information of the \a i-th component.
378  * For example, if \c getInfoOnComponent(0) returns "SIGXY [N/m^2]", then
379  * \c getVarOnComponent(0) returns "SIGXY".
380  * If a unit part of information is not detected by presence of
381  * two square brackets, then the full information is returned.
382  * To read more about the component information format, see
383  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
384  *  \param [in] i - the index (zero based) of the component of interest.
385  *  \return std::string - a string containing the var information, or the full info.
386  *  \throw If \a i is not a valid component index.
387  */
388 std::string DataArray::getVarOnComponent(std::size_t i) const
389 {
390   if(i<_info_on_compo.size())
391     {
392       return GetVarNameFromInfo(_info_on_compo[i]);
393     }
394   else
395     {
396       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::getVarOnComponent : Specified component id is out of range  (" << i << ") compared with nb of actual components (" << _info_on_compo.size();
397       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
398     }
399 }
400
401 /*!
402  * Returns the unit part of the full information of the \a i-th component.
403  * For example, if \c getInfoOnComponent(0) returns "SIGXY [ N/m^2]", then
404  * \c getUnitOnComponent(0) returns " N/m^2".
405  * If a unit part of information is not detected by presence of
406  * two square brackets, then an empty string is returned.
407  * To read more about the component information format, see
408  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
409  *  \param [in] i - the index (zero based) of the component of interest.
410  *  \return std::string - a string containing the unit information, if any, or "".
411  *  \throw If \a i is not a valid component index.
412  */
413 std::string DataArray::getUnitOnComponent(std::size_t i) const
414 {
415   if(i<_info_on_compo.size())
416     {
417       return GetUnitFromInfo(_info_on_compo[i]);
418     }
419   else
420     {
421       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::getUnitOnComponent : Specified component id is out of range  (" << i << ") compared with nb of actual components (" << _info_on_compo.size();
422       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
423     }
424 }
425
426 /*!
427  * Returns the var part of the full component information.
428  * For example, if \a info == "SIGXY [N/m^2]", then this method returns "SIGXY".
429  * If a unit part of information is not detected by presence of
430  * two square brackets, then the whole \a info is returned.
431  * To read more about the component information format, see
432  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
433  *  \param [in] info - the full component information.
434  *  \return std::string - a string containing only var information, or the \a info.
435  */
436 std::string DataArray::GetVarNameFromInfo(const std::string& info)
437 {
438   std::size_t p1=info.find_last_of('[');
439   std::size_t p2=info.find_last_of(']');
440   if(p1==std::string::npos || p2==std::string::npos)
441     return info;
442   if(p1>p2)
443     return info;
444   if(p1==0)
445     return std::string();
446   std::size_t p3=info.find_last_not_of(' ',p1-1);
447   return info.substr(0,p3+1);
448 }
449
450 /*!
451  * Returns the unit part of the full component information.
452  * For example, if \a info == "SIGXY [ N/m^2]", then this method returns " N/m^2".
453  * If a unit part of information is not detected by presence of
454  * two square brackets, then an empty string is returned.
455  * To read more about the component information format, see
456  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
457  *  \param [in] info - the full component information.
458  *  \return std::string - a string containing only unit information, if any, or "".
459  */
460 std::string DataArray::GetUnitFromInfo(const std::string& info)
461 {
462   std::size_t p1=info.find_last_of('[');
463   std::size_t p2=info.find_last_of(']');
464   if(p1==std::string::npos || p2==std::string::npos)
465     return std::string();
466   if(p1>p2)
467     return std::string();
468   return info.substr(p1+1,p2-p1-1);
469 }
470
471 /*!
472  * This method put in info format the result of the merge of \a var and \a unit.
473  * The standard format for that is "var [unit]".
474  * Inversely you can retrieve the var part or the unit part of info string using resp. GetVarNameFromInfo and GetUnitFromInfo.
475  */
476 std::string DataArray::BuildInfoFromVarAndUnit(const std::string& var, const std::string& unit)
477 {
478   std::ostringstream oss;
479   oss << var << " [" << unit << "]";
480   return oss.str();
481 }
482
483 std::string DataArray::GetAxisTypeRepr(MEDCouplingAxisType at)
484 {
485   switch(at)
486     {
487     case AX_CART:
488       return std::string("AX_CART");
489     case AX_CYL:
490       return std::string("AX_CYL");
491     case AX_SPHER:
492       return std::string("AX_SPHER");
493     default:
494       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::GetAxisTypeRepr : unrecognized axis type enum !");
495     }
496 }
497
498 /*!
499  * Returns a new DataArray by concatenating all given arrays, so that (1) the number
500  * of tuples in the result array is a sum of the number of tuples of given arrays and (2)
501  * the number of component in the result array is same as that of each of given arrays.
502  * Info on components is copied from the first of the given arrays. Number of components
503  * in the given arrays must be  the same.
504  *  \param [in] arrs - a sequence of arrays to include in the result array. All arrays must have the same type.
505  *  \return DataArray * - the new instance of DataArray (that can be either DataArrayInt, DataArrayDouble, DataArrayChar).
506  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
507  *          needed.
508  *  \throw If all arrays within \a arrs are NULL.
509  *  \throw If all not null arrays in \a arrs have not the same type.
510  *  \throw If getNumberOfComponents() of arrays within \a arrs.
511  */
512 DataArray *DataArray::Aggregate(const std::vector<const DataArray *>& arrs)
513 {
514   std::vector<const DataArray *> arr2;
515   for(std::vector<const DataArray *>::const_iterator it=arrs.begin();it!=arrs.end();it++)
516     if(*it)
517       arr2.push_back(*it);
518   if(arr2.empty())
519     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::Aggregate : only null instance in input vector !");
520   std::vector<const DataArrayDouble *> arrd;
521   std::vector<const DataArrayIdType *> arri;
522   std::vector<const DataArrayChar *> arrc;
523   for(std::vector<const DataArray *>::const_iterator it=arr2.begin();it!=arr2.end();it++)
524     {
525       const DataArrayDouble *a=dynamic_cast<const DataArrayDouble *>(*it);
526       if(a)
527         { arrd.push_back(a); continue; }
528       const DataArrayIdType *b=dynamic_cast<const DataArrayIdType *>(*it);
529       if(b)
530         { arri.push_back(b); continue; }
531       const DataArrayChar *c=dynamic_cast<const DataArrayChar *>(*it);
532       if(c)
533         { arrc.push_back(c); continue; }
534       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::Aggregate : presence of not null instance in inuput that is not in [DataArrayDouble, DataArrayInt, DataArrayChar] !");
535     }
536   if(arr2.size()==arrd.size())
537     return DataArrayDouble::Aggregate(arrd);
538   if(arr2.size()==arri.size())
539     return DataArrayIdType::Aggregate(arri);
540   if(arr2.size()==arrc.size())
541     return DataArrayChar::Aggregate(arrc);
542   throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArray::Aggregate : all input arrays must have the same type !");
543 }
544
545 /*!
546  * Sets information on a component specified by an index.
547  * To know more on format of this information
548  * see \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
549  *  \warning Don't pass NULL as \a info!
550  *  \param [in] i - the index (zero based) of the component of interest.
551  *  \param [in] info - the string containing the information.
552  *  \throw If \a i is not a valid component index.
553  */
554 void DataArray::setInfoOnComponent(std::size_t i, const std::string& info)
555 {
556   if(i<_info_on_compo.size())
557     _info_on_compo[i]=info;
558   else
559     {
560       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::setInfoOnComponent : Specified component id is out of range  (" << i << ") compared with nb of actual components (" << _info_on_compo.size();
561       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
562     }
563 }
564
565 /*!
566  * Sets information on all components. This method can change number of components
567  * at certain conditions; if the conditions are not respected, an exception is thrown.
568  * The number of components can be changed in \a this only if \a this is not allocated.
569  * The condition of number of components must not be changed.
570  *
571  * To know more on format of the component information see
572  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompoName "DataArrays infos".
573  *  \param [in] info - a vector of component infos.
574  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != \a info.size() && \a this->isAllocated()
575  */
576 void DataArray::setInfoAndChangeNbOfCompo(const std::vector<std::string>& info)
577 {
578   if(getNumberOfComponents()!=info.size())
579     {
580       if(!isAllocated())
581         _info_on_compo=info;
582       else
583         {
584           std::ostringstream oss; oss << "DataArray::setInfoAndChangeNbOfCompo : input is of size " << info.size() << " whereas number of components is equal to " << getNumberOfComponents() << "  and this is already allocated !";
585           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
586         }
587     }
588   else
589     _info_on_compo=info;
590 }
591
592 void DataArray::checkNbOfTuples(mcIdType nbOfTuples, const std::string& msg) const
593 {
594   if(getNumberOfTuples()!=nbOfTuples)
595     {
596       std::ostringstream oss; oss << msg << " : mismatch number of tuples : expected " <<  nbOfTuples << " having " << getNumberOfTuples() << " !";
597       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
598     }
599 }
600
601 void DataArray::checkNbOfComps(std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg) const
602 {
603   if (getNumberOfComponents()!=nbOfCompo)
604     {
605       std::ostringstream oss; oss << msg << " : mismatch number of components : expected " << nbOfCompo << " having " << getNumberOfComponents() << " !";
606       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
607     }
608 }
609
610 void DataArray::checkNbOfElems(mcIdType nbOfElems, const std::string& msg) const
611 {
612   if(getNbOfElems()!=nbOfElems)
613     {
614       std::ostringstream oss; oss << msg << " : mismatch number of elems : Expected " << nbOfElems << " having " << getNbOfElems() << " !";
615       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
616     }
617 }
618
619 void DataArray::checkNbOfTuplesAndComp(const DataArray& other, const std::string& msg) const
620 {
621   if(getNumberOfTuples()!=other.getNumberOfTuples())
622     {
623       std::ostringstream oss; oss << msg << " : mismatch number of tuples : expected " <<  other.getNumberOfTuples() << " having " << getNumberOfTuples() << " !";
624       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
625     }
626   if(getNumberOfComponents()!=other.getNumberOfComponents())
627     {
628       std::ostringstream oss; oss << msg << " : mismatch number of components : expected " << other.getNumberOfComponents() << " having " << getNumberOfComponents() << " !";
629       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
630     }
631 }
632
633 void DataArray::checkNbOfTuplesAndComp(mcIdType nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo, const std::string& msg) const
634 {
635   checkNbOfTuples(nbOfTuples,msg);
636   checkNbOfComps(nbOfCompo,msg);
637 }
638
639 /*!
640  * Simply this method checks that \b value is in [0,\b ref).
641  */
642 void DataArray::CheckValueInRange(mcIdType ref, mcIdType value, const std::string& msg)
643 {
644   if(value<0 || value>=ref)
645     {
646       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::CheckValueInRange : " << msg  << " ! Expected in range [0," << ref << "[ having " << value << " !";
647       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
648     }
649 }
650
651 /*!
652  * This method checks that [\b start, \b end) is compliant with ref length \b value.
653  * typically start in [0,\b value) and end in [0,\b value). If value==start and start==end, it is supported.
654  */
655 void DataArray::CheckValueInRangeEx(mcIdType value, mcIdType start, mcIdType end, const std::string& msg)
656 {
657   if(start<0 || start>=value)
658     {
659       if(value!=start || end!=start)
660         {
661           std::ostringstream oss; oss << "DataArray::CheckValueInRangeEx : " << msg  << " ! Expected start " << start << " of input range, in [0," << value << "[ !";
662           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
663         }
664     }
665   if(end<0 || end>value)
666     {
667       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::CheckValueInRangeEx : " << msg  << " ! Expected end " << end << " of input range, in [0," << value << "] !";
668       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
669     }
670 }
671
672 void DataArray::CheckClosingParInRange(mcIdType ref, mcIdType value, const std::string& msg)
673 {
674   if(value<0 || value>ref)
675     {
676       std::ostringstream oss; oss << "DataArray::CheckClosingParInRange : " << msg  << " ! Expected input range in [0," << ref << "] having closing open parenthesis " << value << " !";
677       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
678     }
679 }
680
681 /*!
682  * This method is useful to slice work among a pool of threads or processes. \a begin, \a end \a step is the input whole slice of work to perform,
683  * typically it is a whole slice of tuples of DataArray or cells, nodes of a mesh...
684  *
685  * The input \a sliceId should be an id in [0, \a nbOfSlices) that specifies the slice of work.
686  *
687  * \param [in] start - the start of the input slice of the whole work to perform split into slices.
688  * \param [in] stop - the stop of the input slice of the whole work to perform split into slices.
689  * \param [in] step - the step (that can be <0) of the input slice of the whole work to perform split into slices.
690  * \param [in] sliceId - the slice id considered
691  * \param [in] nbOfSlices - the number of slices (typically the number of cores on which the work is expected to be sliced)
692  * \param [out] startSlice - the start of the slice considered
693  * \param [out] stopSlice - the stop of the slice consided
694  *
695  * \throw If \a step == 0
696  * \throw If \a nbOfSlices not > 0
697  * \throw If \a sliceId not in [0,nbOfSlices)
698  */
699 void DataArray::GetSlice(mcIdType start, mcIdType stop, mcIdType step, mcIdType sliceId, mcIdType nbOfSlices, mcIdType& startSlice, mcIdType& stopSlice)
700 {
701   DataArrayTools<mcIdType>::GetSlice(start, stop, step, sliceId, nbOfSlices, startSlice, stopSlice);
702 }
703
704 mcIdType DataArray::GetNumberOfItemGivenBES(mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step, const std::string& msg)
705 {
706   return DataArrayTools<mcIdType>::GetNumberOfItemGivenBES(begin, end, step, msg);
707 }
708
709 mcIdType DataArray::GetNumberOfItemGivenBESRelative(mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step, const std::string& msg)
710 {
711   return DataArrayTools<mcIdType>::GetNumberOfItemGivenBESRelative(begin, end, step, msg);
712 }
713
714 mcIdType DataArray::GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(mcIdType value, mcIdType begin, mcIdType end, mcIdType step)
715 {
716   return DataArrayTools<mcIdType>::GetPosOfItemGivenBESRelativeNoThrow(value, begin, end, step);
717 }
718
719 /*!
720  * Returns a new instance of DataArrayDouble. The caller is to delete this array
721  * using decrRef() as it is no more needed.
722  */
723 DataArrayDouble *DataArrayDouble::New()
724 {
725   return new DataArrayDouble;
726 }
727
728 /*!
729  * Returns the only one value in \a this, if and only if number of elements
730  * (nb of tuples * nb of components) is equal to 1, and that \a this is allocated.
731  *  \return double - the sole value stored in \a this array.
732  *  \throw If at least one of conditions stated above is not fulfilled.
733  */
734 double DataArrayDouble::doubleValue() const
735 {
736   if(isAllocated())
737     {
738       if(getNbOfElems()==1)
739         {
740           return *getConstPointer();
741         }
742       else
743         throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::doubleValue : DataArrayDouble instance is allocated but number of elements is not equal to 1 !");
744     }
745   else
746     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::doubleValue : DataArrayDouble instance is not allocated !");
747 }
748
749 /*!
750  * Returns a full copy of \a this. For more info on copying data arrays see
751  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyDeep.
752  *  \return DataArrayDouble * - a new instance of DataArrayDouble. The caller is to
753  *          delete this array using decrRef() as it is no more needed.
754  */
755 DataArrayDouble *DataArrayDouble::deepCopy() const
756 {
757   return new DataArrayDouble(*this);
758 }
759
760 /*!
761  * Checks that \a this array is consistently **increasing** or **decreasing** in value,
762  * with at least absolute difference value of |\a eps| at each step.
763  * If not an exception is thrown.
764  *  \param [in] increasing - if \a true, the array values should be increasing.
765  *  \param [in] eps - minimal absolute difference between the neighbor values at which
766  *                    the values are considered different.
767  *  \throw If sequence of values is not strictly monotonic in agreement with \a
768  *         increasing arg.
769  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
770  *  \throw If \a this is not allocated.
771  */
772 void DataArrayDouble::checkMonotonic(bool increasing, double eps) const
773 {
774   if(!isMonotonic(increasing,eps))
775     {
776       if (increasing)
777         throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::checkMonotonic : 'this' is not INCREASING monotonic !");
778       else
779         throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::checkMonotonic : 'this' is not DECREASING monotonic !");
780     }
781 }
782
783 /*!
784  * Checks that \a this array is consistently **increasing** or **decreasing** in value,
785  * with at least absolute difference value of |\a eps| at each step.
786  *  \param [in] increasing - if \a true, array values should be increasing.
787  *  \param [in] eps - minimal absolute difference between the neighbor values at which
788  *                    the values are considered different.
789  *  \return bool - \a true if values change in accordance with \a increasing arg.
790  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
791  *  \throw If \a this is not allocated.
792  */
793 bool DataArrayDouble::isMonotonic(bool increasing, double eps) const
794 {
795   checkAllocated();
796   if(getNumberOfComponents()!=1)
797     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::isMonotonic : only supported with 'this' array with ONE component !");
798   mcIdType nbOfElements(getNumberOfTuples());
799   const double *ptr=getConstPointer();
800   if(nbOfElements==0)
801     return true;
802   double ref=ptr[0];
803   double absEps=fabs(eps);
804   if(increasing)
805     {
806       for(mcIdType i=1;i<nbOfElements;i++)
807         {
808           if(ptr[i]<(ref+absEps))
809             return false;
810           ref=ptr[i];
811         }
812       return true;
813     }
814   else
815     {
816       for(mcIdType i=1;i<nbOfElements;i++)
817         {
818           if(ptr[i]>(ref-absEps))
819             return false;
820           ref=ptr[i];
821         }
822       return true;
823     }
824 }
825
826 void DataArrayDouble::writeVTK(std::ostream& ofs, mcIdType indent, const std::string& nameInFile, DataArrayByte *byteArr) const
827 {
828   static const char SPACE[4]={' ',' ',' ',' '};
829   checkAllocated();
830   std::string idt(indent,' ');
831   ofs.precision(17);
832   ofs << idt << "<DataArray type=\"Float32\" Name=\"" << nameInFile << "\" NumberOfComponents=\"" << getNumberOfComponents() << "\"";
833   //
834   bool areAllEmpty(true);
835   for(std::vector<std::string>::const_iterator it=_info_on_compo.begin();it!=_info_on_compo.end();it++)
836     if(!(*it).empty())
837       areAllEmpty=false;
838   if(!areAllEmpty)
839     for(std::size_t i=0;i<_info_on_compo.size();i++)
840       ofs << " ComponentName" << i << "=\"" << _info_on_compo[i] << "\"";
841   //
842   if(byteArr)
843     {
844       ofs << " format=\"appended\" offset=\"" << byteArr->getNumberOfTuples() << "\">";
845       INTERP_KERNEL::AutoPtr<float> tmp(new float[getNbOfElems()]);
846       float *pt(tmp);
847       // to make Visual C++ happy : instead of std::copy(begin(),end(),(float *)tmp);
848       for(const double *src=begin();src!=end();src++,pt++)
849         *pt=float(*src);
850       const char *data(reinterpret_cast<const char *>((float *)tmp));
851       std::size_t sz(getNbOfElems()*sizeof(float));
852       byteArr->insertAtTheEnd(data,data+sz);
853       byteArr->insertAtTheEnd(SPACE,SPACE+4);
854     }
855   else
856     {
857       ofs << " RangeMin=\"" << getMinValueInArray() << "\" RangeMax=\"" << getMaxValueInArray() << "\" format=\"ascii\">\n" << idt;
858       std::copy(begin(),end(),std::ostream_iterator<double>(ofs," "));
859     }
860   ofs << std::endl << idt << "</DataArray>\n";
861 }
862
863 void DataArrayDouble::reprCppStream(const std::string& varName, std::ostream& stream) const
864 {
865   mcIdType nbTuples=getNumberOfTuples();
866   std::size_t nbComp=getNumberOfComponents();
867   const double *data(getConstPointer());
868   stream.precision(17);
869   stream << "DataArrayDouble *" << varName << "=DataArrayDouble::New();" << std::endl;
870   if(nbTuples*nbComp>=1)
871     {
872       stream << "const double " << varName << "Data[" << nbTuples*nbComp << "]={";
873       std::copy(data,data+nbTuples*nbComp-1,std::ostream_iterator<double>(stream,","));
874       stream << data[nbTuples*nbComp-1] << "};" << std::endl;
875       stream << varName << "->useArray(" << varName << "Data,false,CPP_DEALLOC," << nbTuples << "," << nbComp << ");" << std::endl;
876     }
877   else
878     stream << varName << "->alloc(" << nbTuples << "," << nbComp << ");" << std::endl;
879   stream << varName << "->setName(\"" << getName() << "\");" << std::endl;
880 }
881
882 /*!
883  * Method that gives a quick overvien of \a this for python.
884  */
885 void DataArrayDouble::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
886 {
887   static const std::size_t MAX_NB_OF_BYTE_IN_REPR=300;
888   stream << "DataArrayDouble C++ instance at " << this << ". ";
889   if(isAllocated())
890     {
891       std::size_t nbOfCompo(_info_on_compo.size());
892       if(nbOfCompo>=1)
893         {
894           mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
895           stream << "Number of tuples : " << nbOfTuples << ". Number of components : " << nbOfCompo << "." << std::endl;
896           reprQuickOverviewData(stream,MAX_NB_OF_BYTE_IN_REPR);
897         }
898       else
899         stream << "Number of components : 0.";
900     }
901   else
902     stream << "*** No data allocated ****";
903 }
904
905 void DataArrayDouble::reprQuickOverviewData(std::ostream& stream, std::size_t maxNbOfByteInRepr) const
906 {
907   const double *data=begin();
908   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
909   std::size_t nbOfCompo(_info_on_compo.size());
910   std::ostringstream oss2; oss2 << "[";
911   oss2.precision(17);
912   std::string oss2Str(oss2.str());
913   bool isFinished=true;
914   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples && isFinished;i++)
915     {
916       if(nbOfCompo>1)
917         {
918           oss2 << "(";
919           for(std::size_t j=0;j<nbOfCompo;j++,data++)
920             {
921               oss2 << *data;
922               if(j!=nbOfCompo-1) oss2 << ", ";
923             }
924           oss2 << ")";
925         }
926       else
927         oss2 << *data++;
928       if(i!=nbOfTuples-1) oss2 << ", ";
929       std::string oss3Str(oss2.str());
930       if(oss3Str.length()<maxNbOfByteInRepr)
931         oss2Str=oss3Str;
932       else
933         isFinished=false;
934     }
935   stream << oss2Str;
936   if(!isFinished)
937     stream << "... ";
938   stream << "]";
939 }
940
941 /*!
942  * Equivalent to DataArrayDouble::isEqual except that if false the reason of
943  * mismatch is given.
944  *
945  * \param [in] other the instance to be compared with \a this
946  * \param [in] prec the precision to compare numeric data of the arrays.
947  * \param [out] reason In case of inequality returns the reason.
948  * \sa DataArrayDouble::isEqual
949  */
950 bool DataArrayDouble::isEqualIfNotWhy(const DataArrayDouble& other, double prec, std::string& reason) const
951 {
952   if(!areInfoEqualsIfNotWhy(other,reason))
953     return false;
954   return _mem.isEqual(other._mem,prec,reason);
955 }
956
957 /*!
958  * Checks if \a this and another DataArrayDouble are fully equal. For more info see
959  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompare.
960  *  \param [in] other - an instance of DataArrayDouble to compare with \a this one.
961  *  \param [in] prec - precision value to compare numeric data of the arrays.
962  *  \return bool - \a true if the two arrays are equal, \a false else.
963  */
964 bool DataArrayDouble::isEqual(const DataArrayDouble& other, double prec) const
965 {
966   std::string tmp;
967   return isEqualIfNotWhy(other,prec,tmp);
968 }
969
970 /*!
971  * Checks if values of \a this and another DataArrayDouble are equal. For more info see
972  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCompare.
973  *  \param [in] other - an instance of DataArrayDouble to compare with \a this one.
974  *  \param [in] prec - precision value to compare numeric data of the arrays.
975  *  \return bool - \a true if the values of two arrays are equal, \a false else.
976  */
977 bool DataArrayDouble::isEqualWithoutConsideringStr(const DataArrayDouble& other, double prec) const
978 {
979   std::string tmp;
980   return _mem.isEqual(other._mem,prec,tmp);
981 }
982
983 /*!
984  * This method checks that all tuples in \a other are in \a this.
985  * If true, the output param \a tupleIds contains the tuples ids of \a this that correspond to tupes in \a this.
986  * For each i in [ 0 , other->getNumberOfTuples() ) tuple #i in \a other is equal ( regarding input precision \a prec ) to tuple tupleIds[i] in \a this.
987  *
988  * \param [in] other - the array having the same number of components than \a this.
989  * \param [out] tupleIds - the tuple ids containing the same number of tuples than \a other has.
990  * \sa DataArrayDouble::findCommonTuples
991  */
992 bool DataArrayDouble::areIncludedInMe(const DataArrayDouble *other, double prec, DataArrayIdType *&tupleIds) const
993 {
994   if(!other)
995     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::areIncludedInMe : input array is NULL !");
996   checkAllocated(); other->checkAllocated();
997   if(getNumberOfComponents()!=other->getNumberOfComponents())
998     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::areIncludedInMe : the number of components does not match !");
999   MCAuto<DataArrayDouble> a=DataArrayDouble::Aggregate(this,other);
1000   DataArrayIdType *c=0,*ci=0;
1001   a->findCommonTuples(prec,getNumberOfTuples(),c,ci);
1002   MCAuto<DataArrayIdType> cSafe(c),ciSafe(ci);
1003   mcIdType newNbOfTuples=-1;
1004   MCAuto<DataArrayIdType> ids=DataArrayIdType::ConvertIndexArrayToO2N(a->getNumberOfTuples(),c->begin(),ci->begin(),ci->end(),newNbOfTuples);
1005   MCAuto<DataArrayIdType> ret1=ids->selectByTupleIdSafeSlice(getNumberOfTuples(),a->getNumberOfTuples(),1);
1006   tupleIds=ret1.retn();
1007   return newNbOfTuples==getNumberOfTuples();
1008 }
1009
1010 /*!
1011  * Searches for tuples coincident within \a prec tolerance. Each tuple is considered
1012  * as coordinates of a point in getNumberOfComponents()-dimensional space. The
1013  * distance separating two points is computed with the infinite norm.
1014  *
1015  * Indices of coincident tuples are stored in output arrays.
1016  * A pair of arrays (\a comm, \a commIndex) is called "Surjective Format 2".
1017  *
1018  * This method is typically used by MEDCouplingPointSet::findCommonNodes() and
1019  * MEDCouplingUMesh::mergeNodes().
1020  *  \param [in] prec - minimal absolute distance between two tuples (infinite norm) at which they are
1021  *              considered not coincident.
1022  *  \param [in] limitTupleId - limit tuple id. If all tuples within a group of coincident
1023  *              tuples have id strictly lower than \a limitTupleId then they are not returned.
1024  *  \param [out] comm - the array holding ids (== indices) of coincident tuples.
1025  *               \a comm->getNumberOfComponents() == 1.
1026  *               \a comm->getNumberOfTuples() == \a commIndex->back().
1027  *  \param [out] commIndex - the array dividing all indices stored in \a comm into
1028  *               groups of (indices of) coincident tuples. Its every value is a tuple
1029  *               index where a next group of tuples begins. For example the second
1030  *               group of tuples in \a comm is described by following range of indices:
1031  *               [ \a commIndex[1], \a commIndex[2] ). \a commIndex->getNumberOfTuples()-1
1032  *               gives the number of groups of coincident tuples.
1033  *  \throw If \a this is not allocated.
1034  *  \throw If the number of components is not in [1,2,3,4].
1035  *
1036  *  \if ENABLE_EXAMPLES
1037  *  \ref cpp_mcdataarraydouble_findcommontuples "Here is a C++ example".
1038  *
1039  *  \ref py_mcdataarraydouble_findcommontuples  "Here is a Python example".
1040  *  \endif
1041  *  \sa DataArrayInt::ConvertIndexArrayToO2N(), DataArrayDouble::areIncludedInMe
1042  */
1043 void DataArrayDouble::findCommonTuples(double prec, mcIdType limitTupleId, DataArrayIdType *&comm, DataArrayIdType *&commIndex) const
1044 {
1045   checkAllocated();
1046   std::size_t nbOfCompo=getNumberOfComponents();
1047   if ((nbOfCompo<1) || (nbOfCompo>4)) //test before work
1048     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findCommonTuples : Unexpected spacedim of coords. Must be 1, 2, 3 or 4.");
1049
1050   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
1051   //
1052   MCAuto<DataArrayIdType> c(DataArrayIdType::New()),cI(DataArrayIdType::New()); c->alloc(0,1); cI->pushBackSilent(0);
1053   switch(nbOfCompo)
1054   {
1055     case 4:
1056       findCommonTuplesAlg<4>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
1057       break;
1058     case 3:
1059       findCommonTuplesAlg<3>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
1060       break;
1061     case 2:
1062       findCommonTuplesAlg<2>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
1063       break;
1064     case 1:
1065       findCommonTuplesAlg<1>(begin(),nbOfTuples,limitTupleId,prec,c,cI);
1066       break;
1067     default:
1068       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findCommonTuples : nb of components managed are 1,2,3 and 4 ! not implemented for other number of components !");
1069   }
1070   comm=c.retn();
1071   commIndex=cI.retn();
1072 }
1073
1074 /*!
1075  * This methods returns the minimal distance between the two set of points \a this and \a other.
1076  * So \a this and \a other have to have the same number of components. If not an INTERP_KERNEL::Exception will be thrown.
1077  * This method works only if number of components of \a this (equal to those of \a other) is in 1, 2 or 3.
1078  *
1079  * \param [out] thisTupleId the tuple id in \a this corresponding to the returned minimal distance
1080  * \param [out] otherTupleId the tuple id in \a other corresponding to the returned minimal distance
1081  * \return the minimal distance between the two set of points \a this and \a other.
1082  * \sa DataArrayDouble::findClosestTupleId
1083  */
1084 double DataArrayDouble::minimalDistanceTo(const DataArrayDouble *other, mcIdType& thisTupleId, mcIdType& otherTupleId) const
1085 {
1086   MCAuto<DataArrayIdType> part1=findClosestTupleId(other);
1087   std::size_t nbOfCompo=getNumberOfComponents();
1088   mcIdType otherNbTuples=other->getNumberOfTuples();
1089   const double *thisPt(begin()),*otherPt(other->begin());
1090   const mcIdType *part1Pt(part1->begin());
1091   double ret=std::numeric_limits<double>::max();
1092   for(mcIdType i=0;i<otherNbTuples;i++,part1Pt++,otherPt+=nbOfCompo)
1093     {
1094       double tmp(0.);
1095       for(std::size_t j=0;j<nbOfCompo;j++)
1096         tmp+=(otherPt[j]-thisPt[nbOfCompo*(*part1Pt)+j])*(otherPt[j]-thisPt[nbOfCompo*(*part1Pt)+j]);
1097       if(tmp<ret)
1098         { ret=tmp; thisTupleId=*part1Pt; otherTupleId=i; }
1099     }
1100   return sqrt(ret);
1101 }
1102
1103 /*!
1104  * This methods returns for each tuple in \a other which tuple in \a this is the closest.
1105  * So \a this and \a other have to have the same number of components. If not an INTERP_KERNEL::Exception will be thrown.
1106  * This method works only if number of components of \a this (equal to those of \a other) is in 1, 2 or 3.
1107  *
1108  * \return a newly allocated (new object to be dealt by the caller) DataArrayInt having \c other->getNumberOfTuples() tuples and one components.
1109  * \sa DataArrayDouble::minimalDistanceTo
1110  */
1111 DataArrayIdType *DataArrayDouble::findClosestTupleId(const DataArrayDouble *other) const
1112 {
1113   if(!other)
1114     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findClosestTupleId : other instance is NULL !");
1115   checkAllocated(); other->checkAllocated();
1116   std::size_t nbOfCompo(getNumberOfComponents());
1117   if(nbOfCompo!=other->getNumberOfComponents())
1118     {
1119       std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::findClosestTupleId : number of components in this is " << nbOfCompo;
1120       oss << ", whereas number of components in other is " << other->getNumberOfComponents() << "! Should be equal !";
1121       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1122     }
1123   mcIdType nbOfTuples(other->getNumberOfTuples());
1124   mcIdType thisNbOfTuples(getNumberOfTuples());
1125   MCAuto<DataArrayIdType> ret=DataArrayIdType::New(); ret->alloc(nbOfTuples,1);
1126   double bounds[6];
1127   getMinMaxPerComponent(bounds);
1128   switch(nbOfCompo)
1129   {
1130     case 3:
1131       {
1132         double xDelta(fabs(bounds[1]-bounds[0])),yDelta(fabs(bounds[3]-bounds[2])),zDelta(fabs(bounds[5]-bounds[4]));
1133         double delta=std::max(xDelta,yDelta); delta=std::max(delta,zDelta);
1134         double characSize=pow((delta*delta*delta)/((double)thisNbOfTuples),1./3.);
1135         BBTreePts<3,mcIdType> myTree(begin(),0,0,getNumberOfTuples(),characSize*1e-12);
1136         FindClosestTupleIdAlg<3>(myTree,3.*characSize*characSize,other->begin(),nbOfTuples,begin(),thisNbOfTuples,ret->getPointer());
1137         break;
1138       }
1139     case 2:
1140       {
1141         double xDelta(fabs(bounds[1]-bounds[0])),yDelta(fabs(bounds[3]-bounds[2]));
1142         double delta=std::max(xDelta,yDelta);
1143         double characSize=sqrt(delta/(double)thisNbOfTuples);
1144         BBTreePts<2,mcIdType> myTree(begin(),0,0,getNumberOfTuples(),characSize*1e-12);
1145         FindClosestTupleIdAlg<2>(myTree,2.*characSize*characSize,other->begin(),nbOfTuples,begin(),thisNbOfTuples,ret->getPointer());
1146         break;
1147       }
1148     case 1:
1149       {
1150         double characSize=fabs(bounds[1]-bounds[0])/FromIdType<double>(thisNbOfTuples);
1151         BBTreePts<1,mcIdType> myTree(begin(),0,0,getNumberOfTuples(),characSize*1e-12);
1152         FindClosestTupleIdAlg<1>(myTree,1.*characSize*characSize,other->begin(),nbOfTuples,begin(),thisNbOfTuples,ret->getPointer());
1153         break;
1154       }
1155     default:
1156       throw INTERP_KERNEL::Exception("Unexpected spacedim of coords for findClosestTupleId. Must be 1, 2 or 3.");
1157   }
1158   return ret.retn();
1159 }
1160
1161 /*!
1162  * This method expects that \a this and \a otherBBoxFrmt arrays are bounding box arrays ( as the output of MEDCouplingPointSet::getBoundingBoxForBBTree method ).
1163  * This method will return a DataArrayInt array having the same number of tuples than \a this. This returned array tells for each cell in \a this
1164  * how many bounding boxes in \a otherBBoxFrmt.
1165  * So, this method expects that \a this and \a otherBBoxFrmt have the same number of components.
1166  *
1167  * \param [in] otherBBoxFrmt - It is an array .
1168  * \param [in] eps - the absolute precision of the detection. when eps < 0 the bboxes are enlarged so more interactions are detected. Inversely when > 0 the bboxes are stretched.
1169  * \sa MEDCouplingPointSet::getBoundingBoxForBBTree
1170  * \throw If \a this and \a otherBBoxFrmt have not the same number of components.
1171  * \throw If \a this and \a otherBBoxFrmt number of components is not even (BBox format).
1172  */
1173 DataArrayIdType *DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith(const DataArrayDouble *otherBBoxFrmt, double eps) const
1174 {
1175   if(!otherBBoxFrmt)
1176     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith : input array is NULL !");
1177   if(!isAllocated() || !otherBBoxFrmt->isAllocated())
1178     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith : this and input array must be allocated !");
1179   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1180   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
1181   if(nbOfComp!=otherBBoxFrmt->getNumberOfComponents())
1182     {
1183       std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith : this number of components (" << nbOfComp << ") must be equal to the number of components of input array (" << otherBBoxFrmt->getNumberOfComponents() << ") !";
1184       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1185     }
1186   if(nbOfComp%2!=0)
1187     {
1188       std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith : Number of components (" << nbOfComp << ") is not even ! It should be to be compatible with bbox format !";
1189       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1190     }
1191   MCAuto<DataArrayIdType> ret(DataArrayIdType::New()); ret->alloc(nbOfTuples,1);
1192   const double *thisBBPtr(begin());
1193   mcIdType *retPtr(ret->getPointer());
1194   switch(nbOfComp/2)
1195   {
1196     case 3:
1197       {
1198         BBTree<3,mcIdType> bbt(otherBBoxFrmt->begin(),0,0,otherBBoxFrmt->getNumberOfTuples(),eps);
1199         for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,retPtr++,thisBBPtr+=nbOfComp)
1200           *retPtr=bbt.getNbOfIntersectingElems(thisBBPtr);
1201         break;
1202       }
1203     case 2:
1204       {
1205         BBTree<2,mcIdType> bbt(otherBBoxFrmt->begin(),0,0,otherBBoxFrmt->getNumberOfTuples(),eps);
1206         for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,retPtr++,thisBBPtr+=nbOfComp)
1207           *retPtr=bbt.getNbOfIntersectingElems(thisBBPtr);
1208         break;
1209       }
1210     case 1:
1211       {
1212         BBTree<1,mcIdType> bbt(otherBBoxFrmt->begin(),0,0,otherBBoxFrmt->getNumberOfTuples(),eps);
1213         for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,retPtr++,thisBBPtr+=nbOfComp)
1214           *retPtr=bbt.getNbOfIntersectingElems(thisBBPtr);
1215         break;
1216       }
1217     default:
1218       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::computeNbOfInteractionsWith : space dimension supported are [1,2,3] !");
1219   }
1220
1221   return ret.retn();
1222 }
1223
1224 /*!
1225  * Returns a copy of \a this array by excluding coincident tuples. Each tuple is
1226  * considered as coordinates of a point in getNumberOfComponents()-dimensional
1227  * space. The distance between tuples is computed using norm2. If several tuples are
1228  * not far each from other than \a prec, only one of them remains in the result
1229  * array. The order of tuples in the result array is same as in \a this one except
1230  * that coincident tuples are excluded.
1231  *  \param [in] prec - minimal absolute distance between two tuples at which they are
1232  *              considered not coincident.
1233  *  \param [in] limitTupleId - limit tuple id. If all tuples within a group of coincident
1234  *              tuples have id strictly lower than \a limitTupleId then they are not excluded.
1235  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble that the caller
1236  *          is to delete using decrRef() as it is no more needed.
1237  *  \throw If \a this is not allocated.
1238  *  \throw If the number of components is not in [1,2,3,4].
1239  *
1240  *  \if ENABLE_EXAMPLES
1241  *  \ref py_mcdataarraydouble_getdifferentvalues "Here is a Python example".
1242  *  \endif
1243  */
1244 DataArrayDouble *DataArrayDouble::getDifferentValues(double prec, mcIdType limitTupleId) const
1245 {
1246   checkAllocated();
1247   DataArrayIdType *c0=0,*cI0=0;
1248   findCommonTuples(prec,limitTupleId,c0,cI0);
1249   MCAuto<DataArrayIdType> c(c0),cI(cI0);
1250   mcIdType newNbOfTuples=-1;
1251   MCAuto<DataArrayIdType> o2n=DataArrayIdType::ConvertIndexArrayToO2N(getNumberOfTuples(),c0->begin(),cI0->begin(),cI0->end(),newNbOfTuples);
1252   return renumberAndReduce(o2n->getConstPointer(),newNbOfTuples);
1253 }
1254
1255 /*!
1256  * Copy all components in a specified order from another DataArrayDouble.
1257  * Both numerical and textual data is copied. The number of tuples in \a this and
1258  * the other array can be different.
1259  *  \param [in] a - the array to copy data from.
1260  *  \param [in] compoIds - sequence of zero based indices of components, data of which is
1261  *              to be copied.
1262  *  \throw If \a a is NULL.
1263  *  \throw If \a compoIds.size() != \a a->getNumberOfComponents().
1264  *  \throw If \a compoIds[i] < 0 or \a compoIds[i] > \a this->getNumberOfComponents().
1265  *
1266  *  \if ENABLE_EXAMPLES
1267  *  \ref py_mcdataarraydouble_setselectedcomponents "Here is a Python example".
1268  *  \endif
1269  */
1270 void DataArrayDouble::setSelectedComponents(const DataArrayDouble *a, const std::vector<std::size_t>& compoIds)
1271 {
1272   if(!a)
1273     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::setSelectedComponents : input DataArrayDouble is NULL !");
1274   checkAllocated();
1275   copyPartOfStringInfoFrom2(compoIds,*a);
1276   std::size_t partOfCompoSz=compoIds.size();
1277   std::size_t nbOfCompo=getNumberOfComponents();
1278   mcIdType nbOfTuples=std::min(getNumberOfTuples(),a->getNumberOfTuples());
1279   const double *ac=a->getConstPointer();
1280   double *nc=getPointer();
1281   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
1282     for(std::size_t j=0;j<partOfCompoSz;j++,ac++)
1283       nc[nbOfCompo*i+compoIds[j]]=*ac;
1284 }
1285 /*!
1286  * Checks if 0.0 value is present in \a this array. If it is the case, an exception
1287  * is thrown.
1288  * \throw If zero is found in \a this array.
1289  */
1290 void DataArrayDouble::checkNoNullValues() const
1291 {
1292   const double *tmp=getConstPointer();
1293   mcIdType nbOfElems=getNbOfElems();
1294   const double *where=std::find(tmp,tmp+nbOfElems,0.);
1295   if(where!=tmp+nbOfElems)
1296     throw INTERP_KERNEL::Exception("A value 0.0 have been detected !");
1297 }
1298
1299 /*!
1300  * Computes minimal and maximal value in each component. An output array is filled
1301  * with \c 2 * \a this->getNumberOfComponents() values, so the caller is to allocate
1302  * enough memory before calling this method.
1303  *  \param [out] bounds - array of size at least 2 *\a this->getNumberOfComponents().
1304  *               It is filled as follows:<br>
1305  *               \a bounds[0] = \c min_of_component_0 <br>
1306  *               \a bounds[1] = \c max_of_component_0 <br>
1307  *               \a bounds[2] = \c min_of_component_1 <br>
1308  *               \a bounds[3] = \c max_of_component_1 <br>
1309  *               ...
1310  */
1311 void DataArrayDouble::getMinMaxPerComponent(double *bounds) const
1312 {
1313   checkAllocated();
1314   std::size_t dim=getNumberOfComponents();
1315   for (std::size_t idim=0; idim<dim; idim++)
1316     {
1317       bounds[idim*2]=std::numeric_limits<double>::max();
1318       bounds[idim*2+1]=-std::numeric_limits<double>::max();
1319     }
1320   const double *ptr=getConstPointer();
1321   mcIdType nbOfTuples=getNumberOfTuples();
1322   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
1323     {
1324       for(std::size_t idim=0;idim<dim;idim++)
1325         {
1326           if(bounds[idim*2]>ptr[i*dim+idim])
1327             {
1328               bounds[idim*2]=ptr[i*dim+idim];
1329             }
1330           if(bounds[idim*2+1]<ptr[i*dim+idim])
1331             {
1332               bounds[idim*2+1]=ptr[i*dim+idim];
1333             }
1334         }
1335     }
1336 }
1337
1338 /*!
1339  * This method retrieves a newly allocated DataArrayDouble instance having same number of tuples than \a this and twice number of components than \a this
1340  * to store both the min and max per component of each tuples.
1341  * \param [in] epsilon the width of the bbox (identical in each direction) - 0.0 by default
1342  *
1343  * \return a newly created DataArrayDouble instance having \c this->getNumberOfTuples() tuples and 2 * \c this->getNumberOfComponent() components
1344  *
1345  * \throw If \a this is not allocated yet.
1346  */
1347 DataArrayDouble *DataArrayDouble::computeBBoxPerTuple(double epsilon) const
1348 {
1349   checkAllocated();
1350   const double *dataPtr=getConstPointer();
1351   std::size_t nbOfCompo=getNumberOfComponents();
1352   mcIdType nbTuples=getNumberOfTuples();
1353   MCAuto<DataArrayDouble> bbox=DataArrayDouble::New();
1354   bbox->alloc(nbTuples,2*nbOfCompo);
1355   double *bboxPtr=bbox->getPointer();
1356   for(mcIdType i=0;i<nbTuples;i++)
1357     {
1358       for(std::size_t j=0;j<nbOfCompo;j++)
1359         {
1360           bboxPtr[2*nbOfCompo*i+2*j]=dataPtr[nbOfCompo*i+j]-epsilon;
1361           bboxPtr[2*nbOfCompo*i+2*j+1]=dataPtr[nbOfCompo*i+j]+epsilon;
1362         }
1363     }
1364   return bbox.retn();
1365 }
1366
1367 /*!
1368  * For each tuples **t** in \a other, this method retrieves tuples in \a this that are equal to **t**.
1369  * Two tuples are considered equal if the euclidian distance between the two tuples is lower than \a eps.
1370  *
1371  * \param [in] other a DataArrayDouble having same number of components than \a this.
1372  * \param [in] eps absolute precision representing distance (using infinite norm) between 2 tuples behind which 2 tuples are considered equal.
1373  * \param [out] c will contain the set of tuple ids in \a this that are equal to to the tuple ids in \a other contiguously.
1374  *             \a cI allows to extract information in \a c.
1375  * \param [out] cI is an indirection array that allows to extract the data contained in \a c.
1376  *
1377  * \throw In case of:
1378  *  - \a this is not allocated
1379  *  - \a other is not allocated or null
1380  *  - \a this and \a other do not have the same number of components
1381  *  - if number of components of \a this is not in [1,2,3]
1382  *
1383  * \sa MEDCouplingPointSet::getNodeIdsNearPoints, DataArrayDouble::getDifferentValues
1384  */
1385 void DataArrayDouble::computeTupleIdsNearTuples(const DataArrayDouble *other, double eps, DataArrayIdType *& c, DataArrayIdType *& cI) const
1386 {
1387   if(!other)
1388     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::computeTupleIdsNearTuples : input pointer other is null !");
1389   checkAllocated();
1390   other->checkAllocated();
1391   std::size_t nbOfCompo=getNumberOfComponents();
1392   std::size_t otherNbOfCompo=other->getNumberOfComponents();
1393   if(nbOfCompo!=otherNbOfCompo)
1394     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::computeTupleIdsNearTuples : number of components should be equal between this and other !");
1395   mcIdType nbOfTuplesOther=other->getNumberOfTuples();
1396   mcIdType nbOfTuples=getNumberOfTuples();
1397   MCAuto<DataArrayIdType> cArr(DataArrayIdType::New()),cIArr(DataArrayIdType::New()); cArr->alloc(0,1); cIArr->pushBackSilent(0);
1398   switch(nbOfCompo)
1399   {
1400     case 3:
1401       {
1402         BBTreePts<3,mcIdType> myTree(begin(),0,0,nbOfTuples,eps);
1403         FindTupleIdsNearTuplesAlg<3>(myTree,other->getConstPointer(),nbOfTuplesOther,eps,cArr,cIArr);
1404         break;
1405       }
1406     case 2:
1407       {
1408         BBTreePts<2,mcIdType> myTree(begin(),0,0,nbOfTuples,eps);
1409         FindTupleIdsNearTuplesAlg<2>(myTree,other->getConstPointer(),nbOfTuplesOther,eps,cArr,cIArr);
1410         break;
1411       }
1412     case 1:
1413       {
1414         BBTreePts<1,mcIdType> myTree(begin(),0,0,nbOfTuples,eps);
1415         FindTupleIdsNearTuplesAlg<1>(myTree,other->getConstPointer(),nbOfTuplesOther,eps,cArr,cIArr);
1416         break;
1417       }
1418     default:
1419       throw INTERP_KERNEL::Exception("Unexpected spacedim of coords for computeTupleIdsNearTuples. Must be 1, 2 or 3.");
1420   }
1421   c=cArr.retn(); cI=cIArr.retn();
1422 }
1423
1424 /*!
1425  * This method recenter tuples in \b this in order to be centered at the origin to benefit about the advantages of maximal precision to be around the box
1426  * around origin of 'radius' 1.
1427  *
1428  * \param [in] eps absolute epsilon. under that value of delta between max and min no scale is performed.
1429  */
1430 void DataArrayDouble::recenterForMaxPrecision(double eps)
1431 {
1432   checkAllocated();
1433   std::size_t dim=getNumberOfComponents();
1434   std::vector<double> bounds(2*dim);
1435   getMinMaxPerComponent(&bounds[0]);
1436   for(std::size_t i=0;i<dim;i++)
1437     {
1438       double delta=bounds[2*i+1]-bounds[2*i];
1439       double offset=(bounds[2*i]+bounds[2*i+1])/2.;
1440       if(delta>eps)
1441         applyLin(1./delta,-offset/delta,i);
1442       else
1443         applyLin(1.,-offset,i);
1444     }
1445 }
1446
1447 /*!
1448  * Returns the maximal value and all its locations within \a this one-dimensional array.
1449  *  \param [out] tupleIds - a new instance of DataArrayInt containing indices of
1450  *               tuples holding the maximal value. The caller is to delete it using
1451  *               decrRef() as it is no more needed.
1452  *  \return double - the maximal value among all values of \a this array.
1453  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1
1454  *  \throw If \a this->getNumberOfTuples() < 1
1455  */
1456 double DataArrayDouble::getMaxValue2(DataArrayIdType*& tupleIds) const
1457 {
1458   mcIdType tmp;
1459   tupleIds=0;
1460   double ret=getMaxValue(tmp);
1461   tupleIds=findIdsInRange(ret,ret);
1462   return ret;
1463 }
1464
1465 /*!
1466  * Returns the minimal value and all its locations within \a this one-dimensional array.
1467  *  \param [out] tupleIds - a new instance of DataArrayInt containing indices of
1468  *               tuples holding the minimal value. The caller is to delete it using
1469  *               decrRef() as it is no more needed.
1470  *  \return double - the minimal value among all values of \a this array.
1471  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1
1472  *  \throw If \a this->getNumberOfTuples() < 1
1473  */
1474 double DataArrayDouble::getMinValue2(DataArrayIdType*& tupleIds) const
1475 {
1476   mcIdType tmp;
1477   tupleIds=0;
1478   double ret=getMinValue(tmp);
1479   tupleIds=findIdsInRange(ret,ret);
1480   return ret;
1481 }
1482
1483 /*!
1484  * This method returns the number of values in \a this that are equals ( within an absolute precision of \a eps ) to input parameter \a value.
1485  * This method only works for single component array.
1486  *
1487  * \return a value in [ 0, \c this->getNumberOfTuples() )
1488  *
1489  * \throw If \a this is not allocated
1490  *
1491  */
1492 mcIdType DataArrayDouble::count(double value, double eps) const
1493 {
1494   mcIdType ret=0;
1495   checkAllocated();
1496   if(getNumberOfComponents()!=1)
1497     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::count : must be applied on DataArrayDouble with only one component, you can call 'rearrange' method before !");
1498   const double *vals=begin();
1499   mcIdType nbOfTuples=getNumberOfTuples();
1500   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,vals++)
1501     if(fabs(*vals-value)<=eps)
1502       ret++;
1503   return ret;
1504 }
1505
1506 /*!
1507  * Returns the average value of \a this one-dimensional array.
1508  *  \return double - the average value over all values of \a this array.
1509  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1
1510  *  \throw If \a this->getNumberOfTuples() < 1
1511  */
1512 double DataArrayDouble::getAverageValue() const
1513 {
1514   if(getNumberOfComponents()!=1)
1515     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::getAverageValue : must be applied on DataArrayDouble with only one component, you can call 'rearrange' method before !");
1516   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
1517   if(nbOfTuples<=0)
1518     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::getAverageValue : array exists but number of tuples must be > 0 !");
1519   const double *vals=getConstPointer();
1520   double ret=std::accumulate(vals,vals+nbOfTuples,0.);
1521   return ret/FromIdType<double>(nbOfTuples);
1522 }
1523
1524 /*!
1525  * Returns the Euclidean norm of the vector defined by \a this array.
1526  *  \return double - the value of the Euclidean norm, i.e.
1527  *          the square root of the inner product of vector.
1528  *  \throw If \a this is not allocated.
1529  */
1530 double DataArrayDouble::norm2() const
1531 {
1532   checkAllocated();
1533   double ret=0.;
1534   std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
1535   const double *pt=getConstPointer();
1536   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,pt++)
1537     ret+=(*pt)*(*pt);
1538   return sqrt(ret);
1539 }
1540
1541 /*!
1542  * Returns the maximum norm of the vector defined by \a this array.
1543  * This method works even if the number of components is different from one.
1544  * If the number of elements in \a this is 0, -1. is returned.
1545  *  \return double - the value of the maximum norm, i.e.
1546  *          the maximal absolute value among values of \a this array (whatever its number of components).
1547  *  \throw If \a this is not allocated.
1548  */
1549 double DataArrayDouble::normMax() const
1550 {
1551   checkAllocated();
1552   double ret(-1.);
1553   std::size_t nbOfElems(getNbOfElems());
1554   const double *pt(getConstPointer());
1555   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,pt++)
1556     {
1557       double val(std::abs(*pt));
1558       if(val>ret)
1559         ret=val;
1560     }
1561   return ret;
1562 }
1563
1564 /*!
1565  * Returns the maximum norm of for each component of \a this array.
1566  * If the number of elements in \a this is 0, -1. is returned.
1567 *  \param [out] res - pointer to an array of result values, of size at least \a
1568  *         this->getNumberOfComponents(), that is to be allocated by the caller.
1569  *  \throw If \a this is not allocated.
1570  */
1571 void DataArrayDouble::normMaxPerComponent(double * res) const
1572 {
1573   checkAllocated();
1574   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
1575   std::size_t nbOfCompos(getNumberOfComponents());
1576   std::fill(res, res+nbOfCompos, -1.0);
1577   const double *pt(getConstPointer());
1578   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
1579     for (std::size_t j=0; j<nbOfCompos; j++, pt++)
1580       {
1581         double val(std::abs(*pt));
1582         if(val>res[j])
1583           res[j]=val;
1584       }
1585 }
1586
1587
1588 /*!
1589  * Returns the minimum norm (absolute value) of the vector defined by \a this array.
1590  * This method works even if the number of components is different from one.
1591  * If the number of elements in \a this is 0, std::numeric_limits<double>::max() is returned.
1592  *  \return double - the value of the minimum norm, i.e.
1593  *          the minimal absolute value among values of \a this array (whatever its number of components).
1594  *  \throw If \a this is not allocated.
1595  */
1596 double DataArrayDouble::normMin() const
1597 {
1598   checkAllocated();
1599   double ret(std::numeric_limits<double>::max());
1600   std::size_t nbOfElems(getNbOfElems());
1601   const double *pt(getConstPointer());
1602   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,pt++)
1603     {
1604       double val(std::abs(*pt));
1605       if(val<ret)
1606         ret=val;
1607     }
1608   return ret;
1609 }
1610
1611 /*!
1612  * Accumulates values of each component of \a this array.
1613  *  \param [out] res - an array of length \a this->getNumberOfComponents(), allocated
1614  *         by the caller, that is filled by this method with sum value for each
1615  *         component.
1616  *  \throw If \a this is not allocated.
1617  */
1618 void DataArrayDouble::accumulate(double *res) const
1619 {
1620   checkAllocated();
1621   const double *ptr=getConstPointer();
1622   mcIdType nbTuple(getNumberOfTuples());
1623   std::size_t nbComps(getNumberOfComponents());
1624   std::fill(res,res+nbComps,0.);
1625   for(mcIdType i=0;i<nbTuple;i++)
1626     std::transform(ptr+i*nbComps,ptr+(i+1)*nbComps,res,res,std::plus<double>());
1627 }
1628
1629 /*!
1630  * This method returns the min distance from an external tuple defined by [ \a tupleBg , \a tupleEnd ) to \a this and
1631  * the first tuple in \a this that matches the returned distance. If there is no tuples in \a this an exception will be thrown.
1632  *
1633  *
1634  * \a this is expected to be allocated and expected to have a number of components equal to the distance from \a tupleBg to
1635  * \a tupleEnd. If not an exception will be thrown.
1636  *
1637  * \param [in] tupleBg start pointer (included) of input external tuple
1638  * \param [in] tupleEnd end pointer (not included) of input external tuple
1639  * \param [out] tupleId the tuple id in \a this that matches the min of distance between \a this and input external tuple
1640  * \return the min distance.
1641  * \sa MEDCouplingUMesh::distanceToPoint
1642  */
1643 double DataArrayDouble::distanceToTuple(const double *tupleBg, const double *tupleEnd, mcIdType& tupleId) const
1644 {
1645   checkAllocated();
1646   mcIdType nbTuple(getNumberOfTuples());
1647   std::size_t nbComps(getNumberOfComponents());
1648   if(nbComps!=(std::size_t)std::distance(tupleBg,tupleEnd))
1649     { std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::distanceToTuple : size of input tuple is " << std::distance(tupleBg,tupleEnd) << " should be equal to the number of components in this : " << nbComps << " !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str()); }
1650   if(nbTuple==0)
1651     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::distanceToTuple : no tuple in this ! No distance to compute !");
1652   double ret0=std::numeric_limits<double>::max();
1653   tupleId=-1;
1654   const double *work=getConstPointer();
1655   for(mcIdType i=0;i<nbTuple;i++)
1656     {
1657       double val=0.;
1658       for(std::size_t j=0;j<nbComps;j++,work++)
1659         val+=(*work-tupleBg[j])*((*work-tupleBg[j]));
1660       if(val>=ret0)
1661         continue;
1662       else
1663         { ret0=val; tupleId=i; }
1664     }
1665   return sqrt(ret0);
1666 }
1667
1668 /*!
1669  * Accumulate values of the given component of \a this array.
1670  *  \param [in] compId - the index of the component of interest.
1671  *  \return double - a sum value of \a compId-th component.
1672  *  \throw If \a this is not allocated.
1673  *  \throw If \a the condition ( 0 <= \a compId < \a this->getNumberOfComponents() ) is
1674  *         not respected.
1675  */
1676 double DataArrayDouble::accumulate(std::size_t compId) const
1677 {
1678   checkAllocated();
1679   const double *ptr=getConstPointer();
1680   mcIdType nbTuple(getNumberOfTuples());
1681   std::size_t nbComps(getNumberOfComponents());
1682   if(compId>=nbComps)
1683     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::accumulate : Invalid compId specified : No such nb of components !");
1684   double ret=0.;
1685   for(mcIdType i=0;i<nbTuple;i++)
1686     ret+=ptr[i*nbComps+compId];
1687   return ret;
1688 }
1689
1690 /*!
1691  * This method accumulate using addition tuples in \a this using input index array [ \a bgOfIndex, \a endOfIndex ).
1692  * The returned array will have same number of components than \a this and number of tuples equal to
1693  * \c std::distance(bgOfIndex,endOfIndex) \b minus \b one.
1694  *
1695  * The input index array is expected to be ascendingly sorted in which the all referenced ids should be in [0, \c this->getNumberOfTuples).
1696  * This method is quite useful for users that need to put a field on cells to field on nodes on the same mesh without a need of conservation.
1697  *
1698  * \param [in] bgOfIndex - begin (included) of the input index array.
1699  * \param [in] endOfIndex - end (excluded) of the input index array.
1700  * \return DataArrayDouble * - the new instance having the same number of components than \a this.
1701  *
1702  * \throw If bgOfIndex or end is NULL.
1703  * \throw If input index array is not ascendingly sorted.
1704  * \throw If there is an id in [ \a bgOfIndex, \a endOfIndex ) not in [0, \c this->getNumberOfTuples).
1705  * \throw If std::distance(bgOfIndex,endOfIndex)==0.
1706  */
1707 DataArrayDouble *DataArrayDouble::accumulatePerChunck(const mcIdType *bgOfIndex, const mcIdType *endOfIndex) const
1708 {
1709   if(!bgOfIndex || !endOfIndex)
1710     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::accumulatePerChunck : input pointer NULL !");
1711   checkAllocated();
1712   std::size_t nbCompo(getNumberOfComponents());
1713   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
1714   std::size_t sz=std::distance(bgOfIndex,endOfIndex);
1715   if(sz<1)
1716     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::accumulatePerChunck : invalid size of input index array !");
1717   sz--;
1718   MCAuto<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New(); ret->alloc(sz,nbCompo);
1719   const mcIdType *w=bgOfIndex;
1720   if(*w<0 || *w>=nbOfTuples)
1721     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::accumulatePerChunck : The first element of the input index not in [0,nbOfTuples) !");
1722   const double *srcPt=begin()+(*w)*nbCompo;
1723   double *tmp=ret->getPointer();
1724   for(std::size_t i=0;i<sz;i++,tmp+=nbCompo,w++)
1725     {
1726       std::fill(tmp,tmp+nbCompo,0.);
1727       if(w[1]>=w[0])
1728         {
1729           for(mcIdType j=w[0];j<w[1];j++,srcPt+=nbCompo)
1730             {
1731               if(j>=0 && j<nbOfTuples)
1732                 std::transform(srcPt,srcPt+nbCompo,tmp,tmp,std::plus<double>());
1733               else
1734                 {
1735                   std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::accumulatePerChunck : At rank #" << i << " the input index array points to id " << j << " should be in [0," << nbOfTuples << ") !";
1736                   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1737                 }
1738             }
1739         }
1740       else
1741         {
1742           std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::accumulatePerChunck : At rank #" << i << " the input index array is not in ascendingly sorted.";
1743           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1744         }
1745     }
1746   ret->copyStringInfoFrom(*this);
1747   return ret.retn();
1748 }
1749
1750 /*!
1751  * This method is close to numpy cumSum except that number of element is equal to \a this->getNumberOfTuples()+1. First element of DataArray returned is equal to 0.
1752  * This method expects that \a this as only one component. The returned array will have \a this->getNumberOfTuples()+1 tuple with also one component.
1753  * The ith element of returned array is equal to the sum of elements in \a this with rank strictly lower than i.
1754  *
1755  * \return DataArrayDouble - A newly built array containing cum sum of \a this.
1756  */
1757 MCAuto<DataArrayDouble> DataArrayDouble::cumSum() const
1758 {
1759   checkAllocated();
1760   checkNbOfComps(1,"DataArrayDouble::cumSum : this is expected to be single component");
1761   mcIdType nbOfTuple(getNumberOfTuples());
1762   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New()); ret->alloc(nbOfTuple+1,1);
1763   double *ptr(ret->getPointer());
1764   ptr[0]=0.;
1765   const double *thisPtr(begin());
1766   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++)
1767     ptr[i+1]=ptr[i]+thisPtr[i];
1768   return ret;
1769 }
1770
1771 /*!
1772  * Converts each 2D point defined by the tuple of \a this array from the Polar to the
1773  * Cartesian coordinate system. The two components of the tuple of \a this array are
1774  * considered to contain (1) radius and (2) angle of the point in the Polar CS.
1775  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble, whose each tuple
1776  *          contains X and Y coordinates of the point in the Cartesian CS. The caller
1777  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed. The array
1778  *          does not contain any textual info on components.
1779  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 2.
1780  * \sa fromCartToPolar
1781  */
1782 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromPolarToCart() const
1783 {
1784   checkAllocated();
1785   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1786   if(nbOfComp!=2)
1787     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromPolarToCart : must be an array with exactly 2 components !");
1788   mcIdType nbOfTuple(getNumberOfTuples());
1789   DataArrayDouble *ret(DataArrayDouble::New());
1790   ret->alloc(nbOfTuple,2);
1791   double *w(ret->getPointer());
1792   const double *wIn(getConstPointer());
1793   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,w+=2,wIn+=2)
1794     {
1795       w[0]=wIn[0]*cos(wIn[1]);
1796       w[1]=wIn[0]*sin(wIn[1]);
1797     }
1798   return ret;
1799 }
1800
1801 /*!
1802  * Converts each 3D point defined by the tuple of \a this array from the Cylindrical to
1803  * the Cartesian coordinate system. The three components of the tuple of \a this array
1804  * are considered to contain (1) radius, (2) azimuth and (3) altitude of the point in
1805  * the Cylindrical CS.
1806  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble, whose each tuple
1807  *          contains X, Y and Z coordinates of the point in the Cartesian CS. The info
1808  *          on the third component is copied from \a this array. The caller
1809  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed.
1810  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 3.
1811  * \sa fromCartToCyl
1812  */
1813 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromCylToCart() const
1814 {
1815   checkAllocated();
1816   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1817   if(nbOfComp!=3)
1818     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCylToCart : must be an array with exactly 3 components !");
1819   mcIdType nbOfTuple(getNumberOfTuples());
1820   DataArrayDouble *ret(DataArrayDouble::New());
1821   ret->alloc(getNumberOfTuples(),3);
1822   double *w(ret->getPointer());
1823   const double *wIn(getConstPointer());
1824   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,w+=3,wIn+=3)
1825     {
1826       w[0]=wIn[0]*cos(wIn[1]);
1827       w[1]=wIn[0]*sin(wIn[1]);
1828       w[2]=wIn[2];
1829     }
1830   ret->setInfoOnComponent(2,getInfoOnComponent(2));
1831   return ret;
1832 }
1833
1834 /*!
1835  * Converts each 3D point defined by the tuple of \a this array from the Spherical to
1836  * the Cartesian coordinate system. The three components of the tuple of \a this array
1837  * are considered to contain (1) radius, (2) polar angle and (3) azimuthal angle of the
1838  * point in the Cylindrical CS.
1839  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble, whose each tuple
1840  *          contains X, Y and Z coordinates of the point in the Cartesian CS. The info
1841  *          on the third component is copied from \a this array. The caller
1842  *          is to delete this array using decrRef() as it is no more needed.
1843  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 3.
1844  * \sa fromCartToSpher
1845  */
1846 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromSpherToCart() const
1847 {
1848   checkAllocated();
1849   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1850   if(nbOfComp!=3)
1851     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromSpherToCart : must be an array with exactly 3 components !");
1852   mcIdType nbOfTuple(getNumberOfTuples());
1853   DataArrayDouble *ret(DataArrayDouble::New());
1854   ret->alloc(getNumberOfTuples(),3);
1855   double *w(ret->getPointer());
1856   const double *wIn(getConstPointer());
1857   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,w+=3,wIn+=3)
1858     {
1859       w[0]=wIn[0]*cos(wIn[2])*sin(wIn[1]);
1860       w[1]=wIn[0]*sin(wIn[2])*sin(wIn[1]);
1861       w[2]=wIn[0]*cos(wIn[1]);
1862     }
1863   return ret;
1864 }
1865
1866 /*!
1867  * This method returns a new array containing the same number of tuples than \a this. To do this, this method needs \a at parameter to specify the convention of \a this.
1868  * All the tuples of the returned array will be in cartesian sense. So if \a at equals to AX_CART the returned array is basically a deep copy of \a this.
1869  * If \a at equals to AX_CYL the returned array will be the result of operation cylindric to cartesian of \a this...
1870  *
1871  * \param [in] atOfThis - The axis type of \a this.
1872  * \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble (that must be dealed by caller) containing the result of the cartesianizification of \a this.
1873  */
1874 DataArrayDouble *DataArrayDouble::cartesianize(MEDCouplingAxisType atOfThis) const
1875 {
1876   checkAllocated();
1877   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1878   MCAuto<DataArrayDouble> ret;
1879   switch(atOfThis)
1880     {
1881     case AX_CART:
1882       ret=deepCopy();
1883     case AX_CYL:
1884       if(nbOfComp==3)
1885         {
1886           ret=fromCylToCart();
1887           break;
1888         }
1889       if(nbOfComp==2)
1890         {
1891           ret=fromPolarToCart();
1892           break;
1893         }
1894       else
1895         throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::cartesianize : For AX_CYL, number of components must be in [2,3] !");
1896     case AX_SPHER:
1897       if(nbOfComp==3)
1898         {
1899           ret=fromSpherToCart();
1900           break;
1901         }
1902       if(nbOfComp==2)
1903         {
1904           ret=fromPolarToCart();
1905           break;
1906         }
1907       else
1908         throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::cartesianize : For AX_CYL, number of components must be in [2,3] !");
1909     default:
1910       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::cartesianize : not recognized axis type ! Only AX_CART, AX_CYL and AX_SPHER supported !");
1911     }
1912   ret->copyStringInfoFrom(*this);
1913   return ret.retn();
1914 }
1915
1916 /*!
1917  * This method returns a newly created array to be deallocated that contains the result of conversion from cartesian to polar.
1918  * This method expects that \a this has exactly 2 components.
1919  * \sa fromPolarToCart
1920  */
1921 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromCartToPolar() const
1922 {
1923   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
1924   checkAllocated();
1925   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1926   mcIdType nbTuples(getNumberOfTuples());
1927   if(nbOfComp!=2)
1928     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToPolar : must be an array with exactly 2 components !");
1929   ret->alloc(nbTuples,2);
1930   double *retPtr(ret->getPointer());
1931   const double *ptr(begin());
1932   for(mcIdType i=0;i<nbTuples;i++,ptr+=2,retPtr+=2)
1933     {
1934       retPtr[0]=sqrt(ptr[0]*ptr[0]+ptr[1]*ptr[1]);
1935       retPtr[1]=atan2(ptr[1],ptr[0]);
1936     }
1937   return ret.retn();
1938 }
1939
1940 /*!
1941  * This method returns a newly created array to be deallocated that contains the result of conversion from cartesian to cylindrical.
1942  * This method expects that \a this has exactly 3 components.
1943  * \sa fromCylToCart
1944  */
1945 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromCartToCyl() const
1946 {
1947   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
1948   checkAllocated();
1949   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1950   mcIdType nbTuples(getNumberOfTuples());
1951   if(nbOfComp!=3)
1952     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToCyl : must be an array with exactly 3 components !");
1953   ret->alloc(nbTuples,3);
1954   double *retPtr(ret->getPointer());
1955   const double *ptr(begin());
1956   for(mcIdType i=0;i<nbTuples;i++,ptr+=3,retPtr+=3)
1957     {
1958       retPtr[0]=sqrt(ptr[0]*ptr[0]+ptr[1]*ptr[1]);
1959       retPtr[1]=atan2(ptr[1],ptr[0]);
1960       retPtr[2]=ptr[2];
1961     }
1962   return ret.retn();
1963 }
1964
1965 /*!
1966  * This method returns a newly created array to be deallocated that contains the result of conversion from cartesian to spherical coordinates.
1967  * \sa fromSpherToCart
1968  */
1969 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromCartToSpher() const
1970 {
1971   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
1972   checkAllocated();
1973   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
1974   mcIdType nbTuples(getNumberOfTuples());
1975   if(nbOfComp!=3)
1976     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToSpher : must be an array with exactly 3 components !");
1977   ret->alloc(nbTuples,3);
1978   double *retPtr(ret->getPointer());
1979   const double *ptr(begin());
1980   for(mcIdType i=0;i<nbTuples;i++,ptr+=3,retPtr+=3)
1981     {
1982       retPtr[0]=sqrt(ptr[0]*ptr[0]+ptr[1]*ptr[1]+ptr[2]*ptr[2]);
1983       retPtr[1]=acos(ptr[2]/retPtr[0]);
1984       retPtr[2]=atan2(ptr[1],ptr[0]);
1985     }
1986   return ret.retn();
1987 }
1988
1989 /*!
1990  * This method returns a newly created array to be deallocated that contains the result of conversion from cartesian to cylindrical relative to the given \a center and a \a vector.
1991  * This method expects that \a this has exactly 3 components.
1992  * \sa MEDCouplingFieldDouble::computeVectorFieldCyl
1993  */
1994 DataArrayDouble *DataArrayDouble::fromCartToCylGiven(const DataArrayDouble *coords, const double center[3], const double vect[3]) const
1995 {
1996   if(!coords)
1997     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToCylGiven : input coords are NULL !");
1998   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
1999   checkAllocated(); coords->checkAllocated();
2000   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2001   mcIdType nbTuples(getNumberOfTuples());
2002   if(nbOfComp!=3)
2003     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToCylGiven : must be an array with exactly 3 components !");
2004   if(coords->getNumberOfComponents()!=3)
2005     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToCylGiven : coords array must have exactly 3 components !");
2006   if(coords->getNumberOfTuples()!=nbTuples)
2007     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToCylGiven : coords array must have the same number of tuples !");
2008   ret->alloc(nbTuples,nbOfComp);
2009   double magOfVect(sqrt(vect[0]*vect[0]+vect[1]*vect[1]+vect[2]*vect[2]));
2010   if(magOfVect<1e-12)
2011     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::fromCartToCylGiven : magnitude of vect is too low !");
2012   double Ur[3],Uteta[3],Uz[3],*retPtr(ret->getPointer());
2013   const double *coo(coords->begin()),*vectField(begin());
2014   std::transform(vect,vect+3,Uz,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./magOfVect));
2015   for(mcIdType i=0;i<nbTuples;i++,vectField+=3,retPtr+=3,coo+=3)
2016     {
2017       std::transform(coo,coo+3,center,Ur,std::minus<double>());
2018       Uteta[0]=Uz[1]*Ur[2]-Uz[2]*Ur[1]; Uteta[1]=Uz[2]*Ur[0]-Uz[0]*Ur[2]; Uteta[2]=Uz[0]*Ur[1]-Uz[1]*Ur[0];
2019       double magOfTeta(sqrt(Uteta[0]*Uteta[0]+Uteta[1]*Uteta[1]+Uteta[2]*Uteta[2]));
2020       std::transform(Uteta,Uteta+3,Uteta,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./magOfTeta));
2021       Ur[0]=Uteta[1]*Uz[2]-Uteta[2]*Uz[1]; Ur[1]=Uteta[2]*Uz[0]-Uteta[0]*Uz[2]; Ur[2]=Uteta[0]*Uz[1]-Uteta[1]*Uz[0];
2022       retPtr[0]=Ur[0]*vectField[0]+Ur[1]*vectField[1]+Ur[2]*vectField[2];
2023       retPtr[1]=Uteta[0]*vectField[0]+Uteta[1]*vectField[1]+Uteta[2]*vectField[2];
2024       retPtr[2]=Uz[0]*vectField[0]+Uz[1]*vectField[1]+Uz[2]*vectField[2];
2025     }
2026   ret->copyStringInfoFrom(*this);
2027   return ret.retn();
2028 }
2029
2030 /*!
2031  * Computes the doubly contracted product of every tensor defined by the tuple of \a this
2032  * array containing 6 components.
2033  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble, whose each tuple
2034  *          is calculated from the tuple <em>(t)</em> of \a this array as follows:
2035  *          \f$ t[0]^2+t[1]^2+t[2]^2+2*t[3]^2+2*t[4]^2+2*t[5]^2\f$.
2036  *         The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more needed. 
2037  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 6.
2038  */
2039 DataArrayDouble *DataArrayDouble::doublyContractedProduct() const
2040 {
2041   checkAllocated();
2042   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2043   if(nbOfComp!=6)
2044     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::doublyContractedProduct : must be an array with exactly 6 components !");
2045   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2046   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2047   ret->alloc(nbOfTuple,1);
2048   const double *src=getConstPointer();
2049   double *dest=ret->getPointer();
2050   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=6)
2051     *dest=src[0]*src[0]+src[1]*src[1]+src[2]*src[2]+2.*src[3]*src[3]+2.*src[4]*src[4]+2.*src[5]*src[5];
2052   return ret;
2053 }
2054
2055 /*!
2056  * Computes the determinant of every square matrix defined by the tuple of \a this
2057  * array, which contains either 4, 6 or 9 components. The case of 6 components
2058  * corresponds to that of the upper triangular matrix.
2059  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble, whose each tuple
2060  *          is the determinant of matrix of the corresponding tuple of \a this array.
2061  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2062  *          needed.
2063  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() is not in [4,6,9].
2064  */
2065 DataArrayDouble *DataArrayDouble::determinant() const
2066 {
2067   checkAllocated();
2068   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2069   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2070   ret->alloc(nbOfTuple,1);
2071   const double *src=getConstPointer();
2072   double *dest=ret->getPointer();
2073   switch(getNumberOfComponents())
2074   {
2075     case 6:
2076       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=6)
2077         *dest=src[0]*src[1]*src[2]+2.*src[4]*src[5]*src[3]-src[0]*src[4]*src[4]-src[2]*src[3]*src[3]-src[1]*src[5]*src[5];
2078       return ret;
2079     case 4:
2080       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=4)
2081         *dest=src[0]*src[3]-src[1]*src[2];
2082       return ret;
2083     case 9:
2084       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=9)
2085         *dest=src[0]*src[4]*src[8]+src[1]*src[5]*src[6]+src[2]*src[3]*src[7]-src[0]*src[5]*src[7]-src[1]*src[3]*src[8]-src[2]*src[4]*src[6];
2086       return ret;
2087     default:
2088       ret->decrRef();
2089       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::determinant : Invalid number of components ! must be in 4,6,9 !");
2090   }
2091 }
2092
2093 /*!
2094  * Computes 3 eigenvalues of every upper triangular matrix defined by the tuple of
2095  * \a this array, which contains 6 components.
2096  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing 3
2097  *          components, whose each tuple contains the eigenvalues of the matrix of
2098  *          corresponding tuple of \a this array.
2099  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2100  *          needed.
2101  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 6.
2102  */
2103 DataArrayDouble *DataArrayDouble::eigenValues() const
2104 {
2105   checkAllocated();
2106   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2107   if(nbOfComp!=6)
2108     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::eigenValues : must be an array with exactly 6 components !");
2109   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2110   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2111   ret->alloc(nbOfTuple,3);
2112   const double *src=getConstPointer();
2113   double *dest=ret->getPointer();
2114   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest+=3,src+=6)
2115     INTERP_KERNEL::computeEigenValues6(src,dest);
2116   return ret;
2117 }
2118
2119 /*!
2120  * Computes 3 eigenvectors of every upper triangular matrix defined by the tuple of
2121  * \a this array, which contains 6 components.
2122  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing 9
2123  *          components, whose each tuple contains 3 eigenvectors of the matrix of
2124  *          corresponding tuple of \a this array.
2125  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2126  *          needed.
2127  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 6.
2128  */
2129 DataArrayDouble *DataArrayDouble::eigenVectors() const
2130 {
2131   checkAllocated();
2132   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2133   if(nbOfComp!=6)
2134     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::eigenVectors : must be an array with exactly 6 components !");
2135   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2136   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2137   ret->alloc(nbOfTuple,9);
2138   const double *src=getConstPointer();
2139   double *dest=ret->getPointer();
2140   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,src+=6)
2141     {
2142       double tmp[3];
2143       INTERP_KERNEL::computeEigenValues6(src,tmp);
2144       for(mcIdType j=0;j<3;j++,dest+=3)
2145         INTERP_KERNEL::computeEigenVectorForEigenValue6(src,tmp[j],1e-12,dest);
2146     }
2147   return ret;
2148 }
2149
2150 /*!
2151  * Computes the inverse matrix of every matrix defined by the tuple of \a this
2152  * array, which contains either 4, 6 or 9 components. The case of 6 components
2153  * corresponds to that of the upper triangular matrix.
2154  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2155  *          same number of components as \a this one, whose each tuple is the inverse
2156  *          matrix of the matrix of corresponding tuple of \a this array.
2157  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2158  *          needed.
2159  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() is not in [4,6,9].
2160  */
2161 DataArrayDouble *DataArrayDouble::inverse() const
2162 {
2163   checkAllocated();
2164   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2165   if(nbOfComp!=6 && nbOfComp!=9 && nbOfComp!=4)
2166     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::inversion : must be an array with 4,6 or 9 components !");
2167   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2168   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2169   ret->alloc(nbOfTuple,nbOfComp);
2170   const double *src=getConstPointer();
2171   double *dest=ret->getPointer();
2172   if(nbOfComp==6)
2173     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest+=6,src+=6)
2174       {
2175         double det=src[0]*src[1]*src[2]+2.*src[4]*src[5]*src[3]-src[0]*src[4]*src[4]-src[2]*src[3]*src[3]-src[1]*src[5]*src[5];
2176         dest[0]=(src[1]*src[2]-src[4]*src[4])/det;
2177         dest[1]=(src[0]*src[2]-src[5]*src[5])/det;
2178         dest[2]=(src[0]*src[1]-src[3]*src[3])/det;
2179         dest[3]=(src[5]*src[4]-src[3]*src[2])/det;
2180         dest[4]=(src[5]*src[3]-src[0]*src[4])/det;
2181         dest[5]=(src[3]*src[4]-src[1]*src[5])/det;
2182       }
2183   else if(nbOfComp==4)
2184     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest+=4,src+=4)
2185       {
2186         double det=src[0]*src[3]-src[1]*src[2];
2187         dest[0]=src[3]/det;
2188         dest[1]=-src[1]/det;
2189         dest[2]=-src[2]/det;
2190         dest[3]=src[0]/det;
2191       }
2192   else
2193     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest+=9,src+=9)
2194       {
2195         double det=src[0]*src[4]*src[8]+src[1]*src[5]*src[6]+src[2]*src[3]*src[7]-src[0]*src[5]*src[7]-src[1]*src[3]*src[8]-src[2]*src[4]*src[6];
2196         dest[0]=(src[4]*src[8]-src[7]*src[5])/det;
2197         dest[1]=(src[7]*src[2]-src[1]*src[8])/det;
2198         dest[2]=(src[1]*src[5]-src[4]*src[2])/det;
2199         dest[3]=(src[6]*src[5]-src[3]*src[8])/det;
2200         dest[4]=(src[0]*src[8]-src[6]*src[2])/det;
2201         dest[5]=(src[2]*src[3]-src[0]*src[5])/det;
2202         dest[6]=(src[3]*src[7]-src[6]*src[4])/det;
2203         dest[7]=(src[6]*src[1]-src[0]*src[7])/det;
2204         dest[8]=(src[0]*src[4]-src[1]*src[3])/det;
2205       }
2206   return ret;
2207 }
2208
2209 /*!
2210  * Computes the trace of every matrix defined by the tuple of \a this
2211  * array, which contains either 4, 6 or 9 components. The case of 6 components
2212  * corresponds to that of the upper triangular matrix.
2213  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing
2214  *          1 component, whose each tuple is the trace of
2215  *          the matrix of corresponding tuple of \a this array.
2216  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2217  *          needed.
2218  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() is not in [4,6,9].
2219  */
2220 DataArrayDouble *DataArrayDouble::trace() const
2221 {
2222   checkAllocated();
2223   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2224   if(nbOfComp!=6 && nbOfComp!=9 && nbOfComp!=4)
2225     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::trace : must be an array with 4,6 or 9 components !");
2226   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2227   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2228   ret->alloc(nbOfTuple,1);
2229   const double *src=getConstPointer();
2230   double *dest=ret->getPointer();
2231   if(nbOfComp==6)
2232     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=6)
2233       *dest=src[0]+src[1]+src[2];
2234   else if(nbOfComp==4)
2235     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=4)
2236       *dest=src[0]+src[3];
2237   else
2238     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=9)
2239       *dest=src[0]+src[4]+src[8];
2240   return ret;
2241 }
2242
2243 /*!
2244  * Computes the stress deviator tensor of every stress tensor defined by the tuple of
2245  * \a this array, which contains 6 components.
2246  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2247  *          same number of components and tuples as \a this array.
2248  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2249  *          needed.
2250  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 6.
2251  */
2252 DataArrayDouble *DataArrayDouble::deviator() const
2253 {
2254   checkAllocated();
2255   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2256   if(nbOfComp!=6)
2257     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::deviator : must be an array with exactly 6 components !");
2258   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2259   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2260   ret->alloc(nbOfTuple,6);
2261   const double *src=getConstPointer();
2262   double *dest=ret->getPointer();
2263   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest+=6,src+=6)
2264     {
2265       double tr=(src[0]+src[1]+src[2])/3.;
2266       dest[0]=src[0]-tr;
2267       dest[1]=src[1]-tr;
2268       dest[2]=src[2]-tr;
2269       dest[3]=src[3];
2270       dest[4]=src[4];
2271       dest[5]=src[5];
2272     }
2273   return ret;
2274 }
2275
2276 /*!
2277  * Computes the magnitude of every vector defined by the tuple of
2278  * \a this array.
2279  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2280  *          same number of tuples as \a this array and one component.
2281  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2282  *          needed.
2283  *  \throw If \a this is not allocated.
2284  */
2285 DataArrayDouble *DataArrayDouble::magnitude() const
2286 {
2287   checkAllocated();
2288   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2289   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
2290   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2291   ret->alloc(nbOfTuple,1);
2292   const double *src=getConstPointer();
2293   double *dest=ret->getPointer();
2294   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++)
2295     {
2296       double sum=0.;
2297       for(std::size_t j=0;j<nbOfComp;j++,src++)
2298         sum+=(*src)*(*src);
2299       *dest=sqrt(sum);
2300     }
2301   return ret;
2302 }
2303
2304 /*!
2305  * Computes the maximal value within every tuple of \a this array.
2306  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2307  *          same number of tuples as \a this array and one component.
2308  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2309  *          needed.
2310  *  \throw If \a this is not allocated.
2311  *  \sa DataArrayDouble::maxPerTupleWithCompoId
2312  */
2313 DataArrayDouble *DataArrayDouble::maxPerTuple() const
2314 {
2315   checkAllocated();
2316   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2317   MCAuto<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
2318   mcIdType nbOfTuple(getNumberOfTuples());
2319   ret->alloc(nbOfTuple,1);
2320   const double *src=getConstPointer();
2321   double *dest=ret->getPointer();
2322   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,src+=nbOfComp)
2323     *dest=*std::max_element(src,src+nbOfComp);
2324   return ret.retn();
2325 }
2326
2327 /*!
2328  * Computes the maximal value within every tuple of \a this array and it returns the first component
2329  * id for each tuple that corresponds to the maximal value within the tuple.
2330  *
2331  *  \param [out] compoIdOfMaxPerTuple - the new new instance of DataArrayInt containing the
2332  *          same number of tuples and only one component.
2333  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2334  *          same number of tuples as \a this array and one component.
2335  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2336  *          needed.
2337  *  \throw If \a this is not allocated.
2338  *  \sa DataArrayDouble::maxPerTuple
2339  */
2340 DataArrayDouble *DataArrayDouble::maxPerTupleWithCompoId(DataArrayIdType* &compoIdOfMaxPerTuple) const
2341 {
2342   checkAllocated();
2343   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2344   MCAuto<DataArrayDouble> ret0=DataArrayDouble::New();
2345   MCAuto<DataArrayIdType> ret1=DataArrayIdType::New();
2346   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
2347   ret0->alloc(nbOfTuple,1); ret1->alloc(nbOfTuple,1);
2348   const double *src=getConstPointer();
2349   double *dest=ret0->getPointer(); mcIdType *dest1=ret1->getPointer();
2350   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,dest++,dest1++,src+=nbOfComp)
2351     {
2352       const double *loc=std::max_element(src,src+nbOfComp);
2353       *dest=*loc;
2354       *dest1=ToIdType(std::distance(src,loc));
2355     }
2356   compoIdOfMaxPerTuple=ret1.retn();
2357   return ret0.retn();
2358 }
2359
2360 /*!
2361  * This method returns a newly allocated DataArrayDouble instance having one component and \c this->getNumberOfTuples() * \c this->getNumberOfTuples() tuples.
2362  * \n This returned array contains the euclidian distance for each tuple in \a this.
2363  * \n So the returned array can be seen as a dense symmetrical matrix whose diagonal elements are equal to 0.
2364  * \n The returned array has only one component (and **not** \c this->getNumberOfTuples() components to avoid the useless memory consumption due to components info in returned DataArrayDouble)
2365  *
2366  * \warning use this method with care because it can leads to big amount of consumed memory !
2367  *
2368  * \return A newly allocated (huge) MEDCoupling::DataArrayDouble instance that the caller should deal with.
2369  *
2370  * \throw If \a this is not allocated.
2371  *
2372  * \sa DataArrayDouble::buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith
2373  */
2374 DataArrayDouble *DataArrayDouble::buildEuclidianDistanceDenseMatrix() const
2375 {
2376   checkAllocated();
2377   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2378   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
2379   const double *inData=getConstPointer();
2380   MCAuto<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
2381   ret->alloc(nbOfTuples*nbOfTuples,1);
2382   double *outData=ret->getPointer();
2383   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
2384     {
2385       outData[i*nbOfTuples+i]=0.;
2386       for(mcIdType j=i+1;j<nbOfTuples;j++)
2387         {
2388           double dist=0.;
2389           for(std::size_t k=0;k<nbOfComp;k++)
2390             { double delta=inData[i*nbOfComp+k]-inData[j*nbOfComp+k]; dist+=delta*delta; }
2391           dist=sqrt(dist);
2392           outData[i*nbOfTuples+j]=dist;
2393           outData[j*nbOfTuples+i]=dist;
2394         }
2395     }
2396   return ret.retn();
2397 }
2398
2399 /*!
2400  * This method returns a newly allocated DataArrayDouble instance having one component and \c this->getNumberOfTuples() * \c other->getNumberOfTuples() tuples.
2401  * \n This returned array contains the euclidian distance for each tuple in \a other with each tuple in \a this.
2402  * \n So the returned array can be seen as a dense rectangular matrix with \c other->getNumberOfTuples() rows and \c this->getNumberOfTuples() columns.
2403  * \n Output rectangular matrix is sorted along rows.
2404  * \n The returned array has only one component (and **not** \c this->getNumberOfTuples() components to avoid the useless memory consumption due to components info in returned DataArrayDouble)
2405  *
2406  * \warning use this method with care because it can leads to big amount of consumed memory !
2407  *
2408  * \param [in] other DataArrayDouble instance having same number of components than \a this.
2409  * \return A newly allocated (huge) MEDCoupling::DataArrayDouble instance that the caller should deal with.
2410  *
2411  * \throw If \a this is not allocated, or if \a other is null or if \a other is not allocated, or if number of components of \a other and \a this differs.
2412  *
2413  * \sa DataArrayDouble::buildEuclidianDistanceDenseMatrix
2414  */
2415 DataArrayDouble *DataArrayDouble::buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith(const DataArrayDouble *other) const
2416 {
2417   if(!other)
2418     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith : input parameter is null !");
2419   checkAllocated();
2420   other->checkAllocated();
2421   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2422   std::size_t otherNbOfComp(other->getNumberOfComponents());
2423   if(nbOfComp!=otherNbOfComp)
2424     {
2425       std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith : this nb of compo=" << nbOfComp << " and other nb of compo=" << otherNbOfComp << ". It should match !";
2426       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2427     }
2428   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
2429   mcIdType otherNbOfTuples(other->getNumberOfTuples());
2430   const double *inData=getConstPointer();
2431   const double *inDataOther=other->getConstPointer();
2432   MCAuto<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
2433   ret->alloc(otherNbOfTuples*nbOfTuples,1);
2434   double *outData=ret->getPointer();
2435   for(mcIdType i=0;i<otherNbOfTuples;i++,inDataOther+=nbOfComp)
2436     {
2437       for(mcIdType j=0;j<nbOfTuples;j++)
2438         {
2439           double dist=0.;
2440           for(std::size_t k=0;k<nbOfComp;k++)
2441             { double delta=inDataOther[k]-inData[j*nbOfComp+k]; dist+=delta*delta; }
2442           dist=sqrt(dist);
2443           outData[i*nbOfTuples+j]=dist;
2444         }
2445     }
2446   return ret.retn();
2447 }
2448
2449 /*!
2450  * This method expects that \a this stores 3 tuples containing 2 components each.
2451  * Each of this tuples represent a point into 2D space.
2452  * This method tries to find an arc of circle starting from first point (tuple) to 2nd and middle point (tuple) along 3nd and last point (tuple).
2453  * If such arc of circle exists, the corresponding center, radius of circle is returned. And additionnaly the length of arc expressed with an \a ang output variable in ]0,2*pi[.
2454  *
2455  *  \throw If \a this is not allocated.
2456  *  \throw If \a this has not 3 tuples of 2 components
2457  *  \throw If tuples/points in \a this are aligned
2458  */
2459 void DataArrayDouble::asArcOfCircle(double center[2], double& radius, double& ang) const
2460 {
2461   checkAllocated();
2462   INTERP_KERNEL::QuadraticPlanarPrecision arcPrec(1e-14);
2463   if(getNumberOfTuples()!=3 && getNumberOfComponents()!=2)
2464     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::asArcCircle : this method expects");
2465   const double *pt(begin());
2466   MCAuto<INTERP_KERNEL::Node> n0(new INTERP_KERNEL::Node(pt[0],pt[1])),n1(new INTERP_KERNEL::Node(pt[2],pt[3])),n2(new INTERP_KERNEL::Node(pt[4],pt[5]));
2467   {
2468     INTERP_KERNEL::AutoCppPtr<INTERP_KERNEL::EdgeLin> e1(new INTERP_KERNEL::EdgeLin(n0,n2)),e2(new INTERP_KERNEL::EdgeLin(n2,n1));
2469     INTERP_KERNEL::SegSegIntersector inters(*e1,*e2);
2470     bool colinearity(inters.areColinears());
2471     if(colinearity)
2472       throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::asArcOfCircle : 3 points in this have been detected as colinear !");
2473   }
2474   INTERP_KERNEL::AutoCppPtr<INTERP_KERNEL::EdgeArcCircle> ret(new INTERP_KERNEL::EdgeArcCircle(n0,n2,n1));
2475   const double *c(ret->getCenter());
2476   center[0]=c[0]; center[1]=c[1];
2477   radius=ret->getRadius();
2478   ang=ret->getAngle();
2479 }
2480
2481 /*!
2482  * Sorts value within every tuple of \a this array.
2483  *  \param [in] asc - if \a true, the values are sorted in ascending order, else,
2484  *              in descending order.
2485  *  \throw If \a this is not allocated.
2486  */
2487 void DataArrayDouble::sortPerTuple(bool asc)
2488 {
2489   checkAllocated();
2490   double *pt=getPointer();
2491   mcIdType nbOfTuple(getNumberOfTuples());
2492   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2493   if(asc)
2494     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,pt+=nbOfComp)
2495       std::sort(pt,pt+nbOfComp);
2496   else
2497     for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,pt+=nbOfComp)
2498       std::sort(pt,pt+nbOfComp,std::greater<double>());
2499   declareAsNew();
2500 }
2501
2502 /*!
2503  * Modify all elements of \a this array, so that
2504  * an element _x_ becomes \f$ numerator / x \f$.
2505  *  \warning If an exception is thrown because of presence of 0.0 element in \a this
2506  *           array, all elements processed before detection of the zero element remain
2507  *           modified.
2508  *  \param [in] numerator - the numerator used to modify array elements.
2509  *  \throw If \a this is not allocated.
2510  *  \throw If there is an element equal to 0.0 in \a this array.
2511  */
2512 void DataArrayDouble::applyInv(double numerator)
2513 {
2514   checkAllocated();
2515   double *ptr=getPointer();
2516   std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
2517   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,ptr++)
2518     {
2519       if(std::abs(*ptr)>std::numeric_limits<double>::min())
2520         {
2521           *ptr=numerator/(*ptr);
2522         }
2523       else
2524         {
2525           std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::applyInv : presence of null value in tuple #" << i/getNumberOfComponents() << " component #" << i%getNumberOfComponents();
2526           oss << " !";
2527           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2528         }
2529     }
2530   declareAsNew();
2531 }
2532
2533 /*!
2534  * Modify all elements of \a this array, so that
2535  * an element _x_ becomes <em> val ^ x </em>. Contrary to DataArrayInt::applyPow
2536  * all values in \a this have to be >= 0 if val is \b not integer.
2537  *  \param [in] val - the value used to apply pow on all array elements.
2538  *  \throw If \a this is not allocated.
2539  *  \warning If an exception is thrown because of presence of 0 element in \a this
2540  *           array and \a val is \b not integer, all elements processed before detection of the zero element remain
2541  *           modified.
2542  */
2543 void DataArrayDouble::applyPow(double val)
2544 {
2545   checkAllocated();
2546   double *ptr=getPointer();
2547   std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
2548   int val2=(int)val;
2549   bool isInt=((double)val2)==val;
2550   if(!isInt)
2551     {
2552       for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,ptr++)
2553         {
2554           if(*ptr>=0)
2555             *ptr=pow(*ptr,val);
2556           else
2557             {
2558               std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::applyPow (double) : At elem # " << i << " value is " << *ptr << " ! must be >=0. !";
2559               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2560             }
2561         }
2562     }
2563   else
2564     {
2565       for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,ptr++)
2566         *ptr=pow(*ptr,val2);
2567     }
2568   declareAsNew();
2569 }
2570
2571 /*!
2572  * Modify all elements of \a this array, so that
2573  * an element _x_ becomes \f$ val ^ x \f$.
2574  *  \param [in] val - the value used to apply pow on all array elements.
2575  *  \throw If \a this is not allocated.
2576  *  \throw If \a val < 0.
2577  *  \warning If an exception is thrown because of presence of 0 element in \a this
2578  *           array, all elements processed before detection of the zero element remain
2579  *           modified.
2580  */
2581 void DataArrayDouble::applyRPow(double val)
2582 {
2583   checkAllocated();
2584   if(val<0.)
2585     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::applyRPow : the input value has to be >= 0 !");
2586   double *ptr=getPointer();
2587   std::size_t nbOfElems=getNbOfElems();
2588   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,ptr++)
2589     *ptr=pow(val,*ptr);
2590   declareAsNew();
2591 }
2592
2593 /*!
2594  * Returns a new DataArrayDouble created from \a this one by applying \a
2595  * FunctionToEvaluate to every tuple of \a this array. Textual data is not copied.
2596  * For more info see \ref MEDCouplingArrayApplyFunc
2597  *  \param [in] nbOfComp - number of components in the result array.
2598  *  \param [in] func - the \a FunctionToEvaluate declared as
2599  *              \c bool (*\a func)(\c const \c double *\a pos, \c double *\a res),
2600  *              where \a pos points to the first component of a tuple of \a this array
2601  *              and \a res points to the first component of a tuple of the result array.
2602  *              Note that length (number of components) of \a pos can differ from
2603  *              that of \a res.
2604  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2605  *          same number of tuples as \a this array.
2606  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2607  *          needed.
2608  *  \throw If \a this is not allocated.
2609  *  \throw If \a func returns \a false.
2610  */
2611 DataArrayDouble *DataArrayDouble::applyFunc(std::size_t nbOfComp, FunctionToEvaluate func) const
2612 {
2613   checkAllocated();
2614   DataArrayDouble *newArr=DataArrayDouble::New();
2615   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
2616   std::size_t oldNbOfComp(getNumberOfComponents());
2617   newArr->alloc(nbOfTuples,nbOfComp);
2618   const double *ptr=getConstPointer();
2619   double *ptrToFill=newArr->getPointer();
2620   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
2621     {
2622       if(!func(ptr+i*oldNbOfComp,ptrToFill+i*nbOfComp))
2623         {
2624           std::ostringstream oss; oss << "For tuple # " << i << " with value (";
2625           std::copy(ptr+oldNbOfComp*i,ptr+oldNbOfComp*(i+1),std::ostream_iterator<double>(oss,", "));
2626           oss << ") : Evaluation of function failed !";
2627           newArr->decrRef();
2628           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2629         }
2630     }
2631   return newArr;
2632 }
2633
2634 /*!
2635  * Returns a new DataArrayDouble created from \a this one by applying a function to every
2636  * tuple of \a this array. Textual data is not copied.
2637  * For more info see \ref MEDCouplingArrayApplyFunc1.
2638  *  \param [in] nbOfComp - number of components in the result array.
2639  *  \param [in] func - the expression defining how to transform a tuple of \a this array.
2640  *              Supported expressions are described \ref MEDCouplingArrayApplyFuncExpr "here".
2641  *  \param [in] isSafe - By default true. If true invalid operation (division by 0. acos of value > 1. ...) leads to a throw of an exception.
2642  *              If false the computation is carried on without any notification. When false the evaluation is a little faster.
2643  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2644  *          same number of tuples as \a this array and \a nbOfComp components.
2645  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2646  *          needed.
2647  *  \throw If \a this is not allocated.
2648  *  \throw If computing \a func fails.
2649  */
2650 DataArrayDouble *DataArrayDouble::applyFunc(std::size_t nbOfComp, const std::string& func, bool isSafe) const
2651 {
2652   INTERP_KERNEL::ExprParser expr(func);
2653   expr.parse();
2654   std::set<std::string> vars;
2655   expr.getTrueSetOfVars(vars);
2656   std::vector<std::string> varsV(vars.begin(),vars.end());
2657   return applyFuncNamedCompo(nbOfComp,varsV,func,isSafe);
2658 }
2659
2660 /*!
2661  * Returns a new DataArrayDouble created from \a this one by applying a function to every
2662  * tuple of \a this array. Textual data is not copied. This method works by tuples (whatever its size).
2663  * If \a this is a one component array, call applyFuncOnThis instead that performs the same work faster.
2664  *
2665  * For more info see \ref MEDCouplingArrayApplyFunc0.
2666  *  \param [in] func - the expression defining how to transform a tuple of \a this array.
2667  *              Supported expressions are described \ref MEDCouplingArrayApplyFuncExpr "here".
2668  *  \param [in] isSafe - By default true. If true invalid operation (division by 0. acos of value > 1. ...) leads to a throw of an exception.
2669  *                       If false the computation is carried on without any notification. When false the evaluation is a little faster.
2670  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2671  *          same number of tuples and components as \a this array.
2672  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2673  *          needed.
2674  *  \sa applyFuncOnThis
2675  *  \throw If \a this is not allocated.
2676  *  \throw If computing \a func fails.
2677  */
2678 DataArrayDouble *DataArrayDouble::applyFunc(const std::string& func, bool isSafe) const
2679 {
2680   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2681   if(nbOfComp<=0)
2682     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::applyFunc : output number of component must be > 0 !");
2683   checkAllocated();
2684   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
2685   MCAuto<DataArrayDouble> newArr(DataArrayDouble::New());
2686   newArr->alloc(nbOfTuples,nbOfComp);
2687   INTERP_KERNEL::ExprParser expr(func);
2688   expr.parse();
2689   std::set<std::string> vars;
2690   expr.getTrueSetOfVars(vars);
2691   if(vars.size()>1)
2692     {
2693       std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::applyFunc : this method works only with at most one var func expression ! If you need to map comps on variables please use applyFuncCompo or applyFuncNamedCompo instead ! Vars in expr are : ";
2694       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2695       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2696     }
2697   if(vars.empty())
2698     {
2699       expr.prepareFastEvaluator();
2700       newArr->rearrange(1);
2701       newArr->fillWithValue(expr.evaluateDouble());
2702       newArr->rearrange(nbOfComp);
2703       return newArr.retn();
2704     }
2705   std::vector<std::string> vars2(vars.begin(),vars.end());
2706   double buff,*ptrToFill(newArr->getPointer());
2707   const double *ptr(begin());
2708   std::vector<double> stck;
2709   expr.prepareExprEvaluationDouble(vars2,1,1,0,&buff,&buff+1);
2710   expr.prepareFastEvaluator();
2711   if(!isSafe)
2712     {
2713       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
2714         {
2715           for(std::size_t iComp=0;iComp<nbOfComp;iComp++,ptr++,ptrToFill++)
2716             {
2717               buff=*ptr;
2718               expr.evaluateDoubleInternal(stck);
2719               *ptrToFill=stck.back();
2720               stck.pop_back();
2721             }
2722         }
2723     }
2724   else
2725     {
2726       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
2727         {
2728           for(std::size_t iComp=0;iComp<nbOfComp;iComp++,ptr++,ptrToFill++)
2729             {
2730               buff=*ptr;
2731               try
2732               {
2733                   expr.evaluateDoubleInternalSafe(stck);
2734               }
2735               catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2736               {
2737                   std::ostringstream oss; oss << "For tuple # " << i << " component # " << iComp << " with value (";
2738                   oss << buff;
2739                   oss << ") : Evaluation of function failed !" << e.what();
2740                   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2741               }
2742               *ptrToFill=stck.back();
2743               stck.pop_back();
2744             }
2745         }
2746     }
2747   return newArr.retn();
2748 }
2749
2750 /*!
2751  * This method is a non const method that modify the array in \a this.
2752  * This method only works on one component array. It means that function \a func must
2753  * contain at most one variable.
2754  * This method is a specialization of applyFunc method with one parameter on one component array.
2755  *
2756  *  \param [in] func - the expression defining how to transform a tuple of \a this array.
2757  *              Supported expressions are described \ref MEDCouplingArrayApplyFuncExpr "here".
2758  *  \param [in] isSafe - By default true. If true invalid operation (division by 0. acos of value > 1. ...) leads to a throw of an exception.
2759  *              If false the computation is carried on without any notification. When false the evaluation is a little faster.
2760  *
2761  * \sa applyFunc
2762  */
2763 void DataArrayDouble::applyFuncOnThis(const std::string& func, bool isSafe)
2764 {
2765   std::size_t nbOfComp(getNumberOfComponents());
2766   if(nbOfComp<=0)
2767     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::applyFuncOnThis : output number of component must be > 0 !");
2768   checkAllocated();
2769   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
2770   INTERP_KERNEL::ExprParser expr(func);
2771   expr.parse();
2772   std::set<std::string> vars;
2773   expr.getTrueSetOfVars(vars);
2774   if(vars.size()>1)
2775     {
2776       std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::applyFuncOnThis : this method works only with at most one var func expression ! If you need to map comps on variables please use applyFuncCompo or applyFuncNamedCompo instead ! Vars in expr are : ";
2777       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2778       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2779     }
2780   if(vars.empty())
2781     {
2782       expr.prepareFastEvaluator();
2783       std::vector<std::string> compInfo(getInfoOnComponents());
2784       rearrange(1);
2785       fillWithValue(expr.evaluateDouble());
2786       rearrange(nbOfComp);
2787       setInfoOnComponents(compInfo);
2788       return ;
2789     }
2790   std::vector<std::string> vars2(vars.begin(),vars.end());
2791   double buff,*ptrToFill(getPointer());
2792   const double *ptr(begin());
2793   std::vector<double> stck;
2794   expr.prepareExprEvaluationDouble(vars2,1,1,0,&buff,&buff+1);
2795   expr.prepareFastEvaluator();
2796   if(!isSafe)
2797     {
2798       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
2799         {
2800           for(std::size_t iComp=0;iComp<nbOfComp;iComp++,ptr++,ptrToFill++)
2801             {
2802               buff=*ptr;
2803               expr.evaluateDoubleInternal(stck);
2804               *ptrToFill=stck.back();
2805               stck.pop_back();
2806             }
2807         }
2808     }
2809   else
2810     {
2811       for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++)
2812         {
2813           for(std::size_t iComp=0;iComp<nbOfComp;iComp++,ptr++,ptrToFill++)
2814             {
2815               buff=*ptr;
2816               try
2817               {
2818                   expr.evaluateDoubleInternalSafe(stck);
2819               }
2820               catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2821               {
2822                   std::ostringstream oss; oss << "For tuple # " << i << " component # " << iComp << " with value (";
2823                   oss << buff;
2824                   oss << ") : Evaluation of function failed !" << e.what();
2825                   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2826               }
2827               *ptrToFill=stck.back();
2828               stck.pop_back();
2829             }
2830         }
2831     }
2832 }
2833
2834 /*!
2835  * Returns a new DataArrayDouble created from \a this one by applying a function to every
2836  * tuple of \a this array. Textual data is not copied.
2837  * For more info see \ref MEDCouplingArrayApplyFunc2.
2838  *  \param [in] nbOfComp - number of components in the result array.
2839  *  \param [in] func - the expression defining how to transform a tuple of \a this array.
2840  *              Supported expressions are described \ref MEDCouplingArrayApplyFuncExpr "here".
2841  *  \param [in] isSafe - By default true. If true invalid operation (division by 0. acos of value > 1. ...) leads to a throw of an exception.
2842  *              If false the computation is carried on without any notification. When false the evaluation is a little faster.
2843  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2844  *          same number of tuples as \a this array.
2845  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2846  *          needed.
2847  *  \throw If \a this is not allocated.
2848  *  \throw If \a func contains vars that are not in \a this->getInfoOnComponent().
2849  *  \throw If computing \a func fails.
2850  */
2851 DataArrayDouble *DataArrayDouble::applyFuncCompo(std::size_t nbOfComp, const std::string& func, bool isSafe) const
2852 {
2853   return applyFuncNamedCompo(nbOfComp,getVarsOnComponent(),func,isSafe);
2854 }
2855
2856 /*!
2857  * Returns a new DataArrayDouble created from \a this one by applying a function to every
2858  * tuple of \a this array. Textual data is not copied.
2859  * For more info see \ref MEDCouplingArrayApplyFunc3.
2860  *  \param [in] nbOfComp - number of components in the result array.
2861  *  \param [in] varsOrder - sequence of vars defining their order.
2862  *  \param [in] func - the expression defining how to transform a tuple of \a this array.
2863  *              Supported expressions are described \ref MEDCouplingArrayApplyFuncExpr "here".
2864  *  \param [in] isSafe - By default true. If true invalid operation (division by 0. acos of value > 1. ...) leads to a throw of an exception.
2865  *              If false the computation is carried on without any notification. When false the evaluation is a little faster.
2866  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble containing the
2867  *          same number of tuples as \a this array.
2868  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
2869  *          needed.
2870  *  \throw If \a this is not allocated.
2871  *  \throw If \a func contains vars not in \a varsOrder.
2872  *  \throw If computing \a func fails.
2873  */
2874 DataArrayDouble *DataArrayDouble::applyFuncNamedCompo(std::size_t nbOfComp, const std::vector<std::string>& varsOrder, const std::string& func, bool isSafe) const
2875 {
2876   if(nbOfComp<=0)
2877     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::applyFuncNamedCompo : output number of component must be > 0 !");
2878   std::vector<std::string> varsOrder2(varsOrder);
2879   std::size_t oldNbOfComp(getNumberOfComponents());
2880   for(std::size_t i=varsOrder.size();i<oldNbOfComp;i++)
2881     varsOrder2.push_back(std::string());
2882   checkAllocated();
2883   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
2884   INTERP_KERNEL::ExprParser expr(func);
2885   expr.parse();
2886   std::set<std::string> vars;
2887   expr.getTrueSetOfVars(vars);
2888   if(vars.size()>oldNbOfComp)
2889     {
2890       std::ostringstream oss; oss << "The field has " << oldNbOfComp << " components and there are ";
2891       oss << vars.size() << " variables : ";
2892       std::copy(vars.begin(),vars.end(),std::ostream_iterator<std::string>(oss," "));
2893       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2894     }
2895   MCAuto<DataArrayDouble> newArr(DataArrayDouble::New());
2896   newArr->alloc(nbOfTuples,nbOfComp);
2897   INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> buff(new double[oldNbOfComp]);
2898   double *buffPtr(buff),*ptrToFill;
2899   std::vector<double> stck;
2900   for(std::size_t iComp=0;iComp<nbOfComp;iComp++)
2901     {
2902       expr.prepareExprEvaluationDouble(varsOrder2,(int)oldNbOfComp,(int)nbOfComp,(int)iComp,buffPtr,buffPtr+oldNbOfComp);
2903       expr.prepareFastEvaluator();
2904       const double *ptr(getConstPointer());
2905       ptrToFill=newArr->getPointer()+iComp;
2906       if(!isSafe)
2907         {
2908           for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,ptrToFill+=nbOfComp,ptr+=oldNbOfComp)
2909             {
2910               std::copy(ptr,ptr+oldNbOfComp,buffPtr);
2911               expr.evaluateDoubleInternal(stck);
2912               *ptrToFill=stck.back();
2913               stck.pop_back();
2914             }
2915         }
2916       else
2917         {
2918           for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,ptrToFill+=nbOfComp,ptr+=oldNbOfComp)
2919             {
2920               std::copy(ptr,ptr+oldNbOfComp,buffPtr);
2921               try
2922               {
2923                   expr.evaluateDoubleInternalSafe(stck);
2924                   *ptrToFill=stck.back();
2925                   stck.pop_back();
2926               }
2927               catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
2928               {
2929                   std::ostringstream oss; oss << "For tuple # " << i << " with value (";
2930                   std::copy(ptr+oldNbOfComp*i,ptr+oldNbOfComp*(i+1),std::ostream_iterator<double>(oss,", "));
2931                   oss << ") : Evaluation of function failed !" << e.what();
2932                   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2933               }
2934             }
2935         }
2936     }
2937   return newArr.retn();
2938 }
2939
2940 void DataArrayDouble::applyFuncFast32(const std::string& func)
2941 {
2942   checkAllocated();
2943   INTERP_KERNEL::ExprParser expr(func);
2944   expr.parse();
2945   char *funcStr=expr.compileX86();
2946   MYFUNCPTR funcPtr;
2947   *((void **)&funcPtr)=funcStr;//he he...
2948   //
2949   double *ptr=getPointer();
2950   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2951   mcIdType nbOfTuples=getNumberOfTuples();
2952   std::size_t nbOfElems=nbOfTuples*nbOfComp;
2953   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,ptr++)
2954     *ptr=funcPtr(*ptr);
2955   declareAsNew();
2956 }
2957
2958 void DataArrayDouble::applyFuncFast64(const std::string& func)
2959 {
2960   checkAllocated();
2961   INTERP_KERNEL::ExprParser expr(func);
2962   expr.parse();
2963   char *funcStr=expr.compileX86_64();
2964   MYFUNCPTR funcPtr;
2965   *((void **)&funcPtr)=funcStr;//he he...
2966   //
2967   double *ptr=getPointer();
2968   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
2969   mcIdType nbOfTuples=getNumberOfTuples();
2970   std::size_t nbOfElems=nbOfTuples*nbOfComp;
2971   for(std::size_t i=0;i<nbOfElems;i++,ptr++)
2972     *ptr=funcPtr(*ptr);
2973   declareAsNew();
2974 }
2975
2976 /*!
2977  * \return a new object that is the result of the symmetry along 3D plane defined by its normal vector \a normalVector and a point \a point.
2978  */
2979 MCAuto<DataArrayDouble> DataArrayDouble::symmetry3DPlane(const double point[3], const double normalVector[3]) const
2980 {
2981   checkAllocated();
2982   if(getNumberOfComponents()!=3)
2983     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::symmetry3DPlane : this is excepted to have 3 components !");
2984   mcIdType nbTuples(getNumberOfTuples());
2985   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
2986   ret->alloc(nbTuples,3);
2987   Symmetry3DPlane(point,normalVector,nbTuples,begin(),ret->getPointer());
2988   return ret;
2989 }
2990
2991 DataArrayDoubleIterator *DataArrayDouble::iterator()
2992 {
2993   return new DataArrayDoubleIterator(this);
2994 }
2995
2996 /*!
2997  * Returns a new DataArrayInt containing indices of tuples of \a this one-dimensional
2998  * array whose values are within a given range. Textual data is not copied.
2999  *  \param [in] vmin - a lowest acceptable value (included).
3000  *  \param [in] vmax - a greatest acceptable value (included).
3001  *  \return DataArrayInt * - the new instance of DataArrayInt.
3002  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3003  *          needed.
3004  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
3005  *
3006  *  \sa DataArrayDouble::findIdsNotInRange
3007  *
3008  *  \if ENABLE_EXAMPLES
3009  *  \ref cpp_mcdataarraydouble_getidsinrange "Here is a C++ example".<br>
3010  *  \ref py_mcdataarraydouble_getidsinrange "Here is a Python example".
3011  *  \endif
3012  */
3013 DataArrayIdType *DataArrayDouble::findIdsInRange(double vmin, double vmax) const
3014 {
3015   checkAllocated();
3016   if(getNumberOfComponents()!=1)
3017     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findIdsInRange : this must have exactly one component !");
3018   const double *cptr(begin());
3019   MCAuto<DataArrayIdType> ret(DataArrayIdType::New()); ret->alloc(0,1);
3020   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
3021   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,cptr++)
3022     if(*cptr>=vmin && *cptr<=vmax)
3023       ret->pushBackSilent(i);
3024   return ret.retn();
3025 }
3026
3027 /*!
3028  * Returns a new DataArrayInt containing indices of tuples of \a this one-dimensional
3029  * array whose values are not within a given range. Textual data is not copied.
3030  *  \param [in] vmin - a lowest not acceptable value (excluded).
3031  *  \param [in] vmax - a greatest not acceptable value (excluded).
3032  *  \return DataArrayInt * - the new instance of DataArrayInt.
3033  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3034  *          needed.
3035  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1.
3036  *
3037  *  \sa DataArrayDouble::findIdsInRange
3038  */
3039 DataArrayIdType *DataArrayDouble::findIdsNotInRange(double vmin, double vmax) const
3040 {
3041   checkAllocated();
3042   if(getNumberOfComponents()!=1)
3043     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::findIdsNotInRange : this must have exactly one component !");
3044   const double *cptr(begin());
3045   MCAuto<DataArrayIdType> ret(DataArrayIdType::New()); ret->alloc(0,1);
3046   mcIdType nbOfTuples(getNumberOfTuples());
3047   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuples;i++,cptr++)
3048     if(*cptr<vmin || *cptr>vmax)
3049       ret->pushBackSilent(i);
3050   return ret.retn();
3051 }
3052
3053 /*!
3054  * Returns a new DataArrayDouble by concatenating two given arrays, so that (1) the number
3055  * of tuples in the result array is a sum of the number of tuples of given arrays and (2)
3056  * the number of component in the result array is same as that of each of given arrays.
3057  * Info on components is copied from the first of the given arrays. Number of components
3058  * in the given arrays must be  the same.
3059  *  \param [in] a1 - an array to include in the result array.
3060  *  \param [in] a2 - another array to include in the result array.
3061  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3062  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3063  *          needed.
3064  *  \throw If both \a a1 and \a a2 are NULL.
3065  *  \throw If \a a1->getNumberOfComponents() != \a a2->getNumberOfComponents().
3066  */
3067 DataArrayDouble *DataArrayDouble::Aggregate(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2)
3068 {
3069   std::vector<const DataArrayDouble *> tmp(2);
3070   tmp[0]=a1; tmp[1]=a2;
3071   return Aggregate(tmp);
3072 }
3073
3074 /*!
3075  * Returns a new DataArrayDouble by concatenating all given arrays, so that (1) the number
3076  * of tuples in the result array is a sum of the number of tuples of given arrays and (2)
3077  * the number of component in the result array is same as that of each of given arrays.
3078  * Info on components is copied from the first of the given arrays. Number of components
3079  * in the given arrays must be  the same.
3080  * If the number of non null of elements in \a arr is equal to one the returned object is a copy of it
3081  * not the object itself.
3082  *  \param [in] arr - a sequence of arrays to include in the result array.
3083  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3084  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3085  *          needed.
3086  *  \throw If all arrays within \a arr are NULL.
3087  *  \throw If getNumberOfComponents() of arrays within \a arr.
3088  */
3089 DataArrayDouble *DataArrayDouble::Aggregate(const std::vector<const DataArrayDouble *>& arr)
3090 {
3091   std::vector<const DataArrayDouble *> a;
3092   for(std::vector<const DataArrayDouble *>::const_iterator it4=arr.begin();it4!=arr.end();it4++)
3093     if(*it4)
3094       a.push_back(*it4);
3095   if(a.empty())
3096     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Aggregate : input list must contain at least one NON EMPTY DataArrayDouble !");
3097   std::vector<const DataArrayDouble *>::const_iterator it=a.begin();
3098   std::size_t nbOfComp((*it)->getNumberOfComponents());
3099   mcIdType nbt=(*it++)->getNumberOfTuples();
3100   for(mcIdType i=1;it!=a.end();it++,i++)
3101     {
3102       if((*it)->getNumberOfComponents()!=nbOfComp)
3103         throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Aggregate : Nb of components mismatch for array aggregation !");
3104       nbt+=(*it)->getNumberOfTuples();
3105     }
3106   MCAuto<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
3107   ret->alloc(nbt,nbOfComp);
3108   double *pt=ret->getPointer();
3109   for(it=a.begin();it!=a.end();it++)
3110     pt=std::copy((*it)->getConstPointer(),(*it)->getConstPointer()+(*it)->getNbOfElems(),pt);
3111   ret->copyStringInfoFrom(*(a[0]));
3112   return ret.retn();
3113 }
3114
3115 /*!
3116  * Returns a new DataArrayDouble containing a dot product of two given arrays, so that
3117  * the i-th tuple of the result array is a sum of products of j-th components of i-th
3118  * tuples of given arrays (\f$ a_i = \sum_{j=1}^n a1_j * a2_j \f$).
3119  * Info on components and name is copied from the first of the given arrays.
3120  * Number of tuples and components in the given arrays must be the same.
3121  *  \param [in] a1 - a given array.
3122  *  \param [in] a2 - another given array.
3123  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3124  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3125  *          needed.
3126  *  \throw If either \a a1 or \a a2 is NULL.
3127  *  \throw If any given array is not allocated.
3128  *  \throw If \a a1->getNumberOfTuples() != \a a2->getNumberOfTuples()
3129  *  \throw If \a a1->getNumberOfComponents() != \a a2->getNumberOfComponents()
3130  */
3131 DataArrayDouble *DataArrayDouble::Dot(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2)
3132 {
3133   if(!a1 || !a2)
3134     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Dot : input DataArrayDouble instance is NULL !");
3135   a1->checkAllocated();
3136   a2->checkAllocated();
3137   std::size_t nbOfComp(a1->getNumberOfComponents());
3138   if(nbOfComp!=a2->getNumberOfComponents())
3139     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of components mismatch for array Dot !");
3140   mcIdType nbOfTuple(a1->getNumberOfTuples());
3141   if(nbOfTuple!=a2->getNumberOfTuples())
3142     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of tuples mismatch for array Dot !");
3143   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
3144   ret->alloc(nbOfTuple,1);
3145   double *retPtr=ret->getPointer();
3146   const double *a1Ptr=a1->begin(),*a2Ptr(a2->begin());
3147   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++)
3148     {
3149       double sum=0.;
3150       for(std::size_t j=0;j<nbOfComp;j++)
3151         sum+=a1Ptr[i*nbOfComp+j]*a2Ptr[i*nbOfComp+j];
3152       retPtr[i]=sum;
3153     }
3154   ret->setInfoOnComponent(0,a1->getInfoOnComponent(0));
3155   ret->setName(a1->getName());
3156   return ret;
3157 }
3158
3159 /*!
3160  * Returns a new DataArrayDouble containing a cross product of two given arrays, so that
3161  * the i-th tuple of the result array contains 3 components of a vector which is a cross
3162  * product of two vectors defined by the i-th tuples of given arrays.
3163  * Info on components is copied from the first of the given arrays.
3164  * Number of tuples in the given arrays must be the same.
3165  * Number of components in the given arrays must be 3.
3166  *  \param [in] a1 - a given array.
3167  *  \param [in] a2 - another given array.
3168  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3169  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3170  *          needed.
3171  *  \throw If either \a a1 or \a a2 is NULL.
3172  *  \throw If \a a1->getNumberOfTuples() != \a a2->getNumberOfTuples()
3173  *  \throw If \a a1->getNumberOfComponents() != 3
3174  *  \throw If \a a2->getNumberOfComponents() != 3
3175  */
3176 DataArrayDouble *DataArrayDouble::CrossProduct(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2)
3177 {
3178   if(!a1 || !a2)
3179     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::CrossProduct : input DataArrayDouble instance is NULL !");
3180   std::size_t nbOfComp(a1->getNumberOfComponents());
3181   if(nbOfComp!=a2->getNumberOfComponents())
3182     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of components mismatch for array crossProduct !");
3183   if(nbOfComp!=3)
3184     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of components must be equal to 3 for array crossProduct !");
3185   mcIdType nbOfTuple(a1->getNumberOfTuples());
3186   if(nbOfTuple!=a2->getNumberOfTuples())
3187     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of tuples mismatch for array crossProduct !");
3188   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
3189   ret->alloc(nbOfTuple,3);
3190   double *retPtr=ret->getPointer();
3191   const double *a1Ptr(a1->begin()),*a2Ptr(a2->begin());
3192   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++)
3193     {
3194       retPtr[3*i]=a1Ptr[3*i+1]*a2Ptr[3*i+2]-a1Ptr[3*i+2]*a2Ptr[3*i+1];
3195       retPtr[3*i+1]=a1Ptr[3*i+2]*a2Ptr[3*i]-a1Ptr[3*i]*a2Ptr[3*i+2];
3196       retPtr[3*i+2]=a1Ptr[3*i]*a2Ptr[3*i+1]-a1Ptr[3*i+1]*a2Ptr[3*i];
3197     }
3198   ret->copyStringInfoFrom(*a1);
3199   return ret;
3200 }
3201
3202 /*!
3203  * Returns a new DataArrayDouble containing maximal values of two given arrays.
3204  * Info on components is copied from the first of the given arrays.
3205  * Number of tuples and components in the given arrays must be the same.
3206  *  \param [in] a1 - an array to compare values with another one.
3207  *  \param [in] a2 - another array to compare values with the first one.
3208  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3209  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3210  *          needed.
3211  *  \throw If either \a a1 or \a a2 is NULL.
3212  *  \throw If \a a1->getNumberOfTuples() != \a a2->getNumberOfTuples()
3213  *  \throw If \a a1->getNumberOfComponents() != \a a2->getNumberOfComponents()
3214  */
3215 DataArrayDouble *DataArrayDouble::Max(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2)
3216 {
3217   if(!a1 || !a2)
3218     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Max : input DataArrayDouble instance is NULL !");
3219   std::size_t nbOfComp(a1->getNumberOfComponents());
3220   if(nbOfComp!=a2->getNumberOfComponents())
3221     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of components mismatch for array Max !");
3222   mcIdType nbOfTuple(a1->getNumberOfTuples());
3223   if(nbOfTuple!=a2->getNumberOfTuples())
3224     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of tuples mismatch for array Max !");
3225   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
3226   ret->alloc(nbOfTuple,nbOfComp);
3227   double *retPtr(ret->getPointer());
3228   const double *a1Ptr(a1->begin()),*a2Ptr(a2->begin());
3229   std::size_t nbElem(nbOfTuple*nbOfComp);
3230   for(std::size_t i=0;i<nbElem;i++)
3231     retPtr[i]=std::max(a1Ptr[i],a2Ptr[i]);
3232   ret->copyStringInfoFrom(*a1);
3233   return ret.retn();
3234 }
3235
3236 /*!
3237  * Returns a new DataArrayDouble containing minimal values of two given arrays.
3238  * Info on components is copied from the first of the given arrays.
3239  * Number of tuples and components in the given arrays must be the same.
3240  *  \param [in] a1 - an array to compare values with another one.
3241  *  \param [in] a2 - another array to compare values with the first one.
3242  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3243  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3244  *          needed.
3245  *  \throw If either \a a1 or \a a2 is NULL.
3246  *  \throw If \a a1->getNumberOfTuples() != \a a2->getNumberOfTuples()
3247  *  \throw If \a a1->getNumberOfComponents() != \a a2->getNumberOfComponents()
3248  */
3249 DataArrayDouble *DataArrayDouble::Min(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2)
3250 {
3251   if(!a1 || !a2)
3252     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Min : input DataArrayDouble instance is NULL !");
3253   std::size_t nbOfComp(a1->getNumberOfComponents());
3254   if(nbOfComp!=a2->getNumberOfComponents())
3255     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of components mismatch for array min !");
3256   mcIdType nbOfTuple(a1->getNumberOfTuples());
3257   if(nbOfTuple!=a2->getNumberOfTuples())
3258     throw INTERP_KERNEL::Exception("Nb of tuples mismatch for array min !");
3259   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
3260   ret->alloc(nbOfTuple,nbOfComp);
3261   double *retPtr(ret->getPointer());
3262   const double *a1Ptr(a1->begin()),*a2Ptr(a2->begin());
3263   std::size_t nbElem(nbOfTuple*nbOfComp);
3264   for(std::size_t i=0;i<nbElem;i++)
3265     retPtr[i]=std::min(a1Ptr[i],a2Ptr[i]);
3266   ret->copyStringInfoFrom(*a1);
3267   return ret.retn();
3268 }
3269
3270 /*!
3271  * Returns a new DataArrayDouble that is the result of pow of two given arrays. There are 3
3272  * valid cases.
3273  *
3274  *  \param [in] a1 - an array to pow up.
3275  *  \param [in] a2 - another array to sum up.
3276  *  \return DataArrayDouble * - the new instance of DataArrayDouble.
3277  *          The caller is to delete this result array using decrRef() as it is no more
3278  *          needed.
3279  *  \throw If either \a a1 or \a a2 is NULL.
3280  *  \throw If \a a1->getNumberOfTuples() != \a a2->getNumberOfTuples()
3281  *  \throw If \a a1->getNumberOfComponents() != 1 or \a a2->getNumberOfComponents() != 1.
3282  *  \throw If there is a negative value in \a a1.
3283  */
3284 DataArrayDouble *DataArrayDouble::Pow(const DataArrayDouble *a1, const DataArrayDouble *a2)
3285 {
3286   if(!a1 || !a2)
3287     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Pow : at least one of input instances is null !");
3288   mcIdType nbOfTuple=a1->getNumberOfTuples();
3289   mcIdType nbOfTuple2=a2->getNumberOfTuples();
3290   std::size_t nbOfComp=a1->getNumberOfComponents();
3291   std::size_t nbOfComp2=a2->getNumberOfComponents();
3292   if(nbOfTuple!=nbOfTuple2)
3293     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Pow : number of tuples mismatches !");
3294   if(nbOfComp!=1 || nbOfComp2!=1)
3295     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Pow : number of components of both arrays must be equal to 1 !");
3296   MCAuto<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New(); ret->alloc(nbOfTuple,1);
3297   const double *ptr1(a1->begin()),*ptr2(a2->begin());
3298   double *ptr=ret->getPointer();
3299   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,ptr1++,ptr2++,ptr++)
3300     {
3301       if(*ptr1>=0)
3302         {
3303           *ptr=pow(*ptr1,*ptr2);
3304         }
3305       else
3306         {
3307           std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::Pow : on tuple #" << i << " of a1 value is < 0 (" << *ptr1 << ") !";
3308           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3309         }
3310     }
3311   return ret.retn();
3312 }
3313
3314 /*!
3315  * Apply pow on values of another DataArrayDouble to values of \a this one.
3316  *
3317  *  \param [in] other - an array to pow to \a this one.
3318  *  \throw If \a other is NULL.
3319  *  \throw If \a this->getNumberOfTuples() != \a other->getNumberOfTuples()
3320  *  \throw If \a this->getNumberOfComponents() != 1 or \a other->getNumberOfComponents() != 1
3321  *  \throw If there is a negative value in \a this.
3322  */
3323 void DataArrayDouble::powEqual(const DataArrayDouble *other)
3324 {
3325   if(!other)
3326     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::powEqual : input instance is null !");
3327   mcIdType nbOfTuple=getNumberOfTuples();
3328   mcIdType nbOfTuple2=other->getNumberOfTuples();
3329   std::size_t nbOfComp=getNumberOfComponents();
3330   std::size_t nbOfComp2=other->getNumberOfComponents();
3331   if(nbOfTuple!=nbOfTuple2)
3332     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::powEqual : number of tuples mismatches !");
3333   if(nbOfComp!=1 || nbOfComp2!=1)
3334     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::powEqual : number of components of both arrays must be equal to 1 !");
3335   double *ptr=getPointer();
3336   const double *ptrc=other->begin();
3337   for(mcIdType i=0;i<nbOfTuple;i++,ptrc++,ptr++)
3338     {
3339       if(*ptr>=0)
3340         *ptr=pow(*ptr,*ptrc);
3341       else
3342         {
3343           std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::powEqual : on tuple #" << i << " of this value is < 0 (" << *ptr << ") !";
3344           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3345         }
3346     }
3347   declareAsNew();
3348 }
3349
3350 /*!
3351  * This method is \b NOT wrapped into python because it can be useful only for performance reasons in C++ context.
3352  * All values in \a this must be 0. or 1. within eps error. 0 means false, 1 means true.
3353  * If an another value than 0 or 1 appear (within eps precision) an INTERP_KERNEL::Exception will be thrown.
3354  *
3355  * \throw if \a this is not allocated.
3356  * \throw if \a this has not exactly one component.
3357  */
3358 std::vector<bool> DataArrayDouble::toVectorOfBool(double eps) const
3359 {
3360   checkAllocated();
3361   if(getNumberOfComponents()!=1)
3362     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::toVectorOfBool : must be applied on single component array !");
3363   mcIdType nbt(getNumberOfTuples());
3364   std::vector<bool> ret(nbt);
3365   const double *pt(begin());
3366   for(mcIdType i=0;i<nbt;i++)
3367     {
3368       if(fabs(pt[i])<eps)
3369         ret[i]=false;
3370       else if(fabs(pt[i]-1.)<eps)
3371         ret[i]=true;
3372       else
3373         {
3374           std::ostringstream oss; oss << "DataArrayDouble::toVectorOfBool : the tuple #" << i << " has value " << pt[i] << " is invalid ! must be 0. or 1. !";
3375           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
3376         }
3377     }
3378   return ret;
3379 }
3380
3381 /*!
3382  * Useless method for end user. Only for MPI/Corba/File serialsation for multi arrays class.
3383  * Server side.
3384  */
3385 void DataArrayDouble::getTinySerializationIntInformation(std::vector<mcIdType>& tinyInfo) const
3386 {
3387   tinyInfo.resize(2);
3388   if(isAllocated())
3389     {
3390       tinyInfo[0]=getNumberOfTuples();
3391       tinyInfo[1]=ToIdType(getNumberOfComponents());
3392     }
3393   else
3394     {
3395       tinyInfo[0]=-1;
3396       tinyInfo[1]=-1;
3397     }
3398 }
3399
3400 /*!
3401  * Useless method for end user. Only for MPI/Corba/File serialsation for multi arrays class.
3402  * Server side.
3403  */
3404 void DataArrayDouble::getTinySerializationStrInformation(std::vector<std::string>& tinyInfo) const
3405 {
3406   if(isAllocated())
3407     {
3408       std::size_t nbOfCompo(getNumberOfComponents());
3409       tinyInfo.resize(nbOfCompo+1);
3410       tinyInfo[0]=getName();
3411       for(std::size_t i=0;i<nbOfCompo;i++)
3412         tinyInfo[i+1]=getInfoOnComponent(i);
3413     }
3414   else
3415     {
3416       tinyInfo.resize(1);
3417       tinyInfo[0]=getName();
3418     }
3419 }
3420
3421 /*!
3422  * Useless method for end user. Only for MPI/Corba/File serialsation for multi arrays class.
3423  * This method returns if a feeding is needed.
3424  */
3425 bool DataArrayDouble::resizeForUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI)
3426 {
3427   mcIdType nbOfTuple=tinyInfoI[0];
3428   mcIdType nbOfComp=tinyInfoI[1];
3429   if(nbOfTuple!=-1 || nbOfComp!=-1)
3430     {
3431       alloc(nbOfTuple,nbOfComp);
3432       return true;
3433     }
3434   return false;
3435 }
3436
3437 /*!
3438  * Useless method for end user. Only for MPI/Corba/File serialsation for multi arrays class.
3439  */
3440 void DataArrayDouble::finishUnserialization(const std::vector<mcIdType>& tinyInfoI, const std::vector<std::string>& tinyInfoS)
3441 {
3442   setName(tinyInfoS[0]);
3443   if(isAllocated())
3444     {
3445       std::size_t nbOfCompo(getNumberOfComponents());
3446       for(std::size_t i=0;i<nbOfCompo;i++)
3447         setInfoOnComponent(i,tinyInfoS[i+1]);
3448     }
3449 }
3450
3451 /*!
3452  * Low static method that operates 3D rotation of 'nbNodes' 3D nodes whose coordinates are arranged in \a coordsIn
3453  * around an axe ( \a center, \a vect) and with angle \a angle.
3454  */
3455 void DataArrayDouble::Rotate3DAlg(const double *center, const double *vect, double angle, mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut)
3456 {
3457   if(!center || !vect)
3458     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Rotate3DAlg : null vector in input !");
3459   double sina(sin(angle));
3460   double cosa(cos(angle));
3461   double vectorNorm[3];
3462   double matrix[9];
3463   double matrixTmp[9];
3464   double norm(sqrt(vect[0]*vect[0]+vect[1]*vect[1]+vect[2]*vect[2]));
3465   if(norm<std::numeric_limits<double>::min())
3466     throw INTERP_KERNEL::Exception("DataArrayDouble::Rotate3DAlg : magnitude of input vector is too close of 0. !");
3467   std::transform(vect,vect+3,vectorNorm,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1/norm));
3468   //rotation matrix computation
3469   matrix[0]=cosa; matrix[1]=0.; matrix[2]=0.; matrix[3]=0.; matrix[4]=cosa; matrix[5]=0.; matrix[6]=0.; matrix[7]=0.; matrix[8]=cosa;
3470   matrixTmp[0]=vectorNorm[0]*vectorNorm[0]; matrixTmp[1]=vectorNorm[0]*vectorNorm[1]; matrixTmp[2]=vectorNorm[0]*vectorNorm[2];
3471   matrixTmp[3]=vectorNorm[1]*vectorNorm[0]; matrixTmp[4]=vectorNorm[1]*vectorNorm[1]; matrixTmp[5]=vectorNorm[1]*vectorNorm[2];
3472   matrixTmp[6]=vectorNorm[2]*vectorNorm[0]; matrixTmp[7]=vectorNorm[2]*vectorNorm[1]; matrixTmp[8]=vectorNorm[2]*vectorNorm[2];
3473   std::transform(matrixTmp,matrixTmp+9,matrixTmp,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1-cosa));
3474   std::transform(matrix,matrix+9,matrixTmp,matrix,std::plus<double>());
3475   matrixTmp[0]=0.; matrixTmp[1]=-vectorNorm[2]; matrixTmp[2]=vectorNorm[1];
3476   matrixTmp[3]=vectorNorm[2]; matrixTmp[4]=0.; matrixTmp[5]=-vectorNorm[0];
3477   matrixTmp[6]=-vectorNorm[1]; matrixTmp[7]=vectorNorm[0]; matrixTmp[8]=0.;
3478   std::transform(matrixTmp,matrixTmp+9,matrixTmp,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),sina));
3479   std::transform(matrix,matrix+9,matrixTmp,matrix,std::plus<double>());
3480   //rotation matrix computed.
3481   double tmp[3];
3482   for(mcIdType i=0; i<nbNodes; i++)
3483     {
3484       std::transform(coordsIn+i*3,coordsIn+(i+1)*3,center,tmp,std::minus<double>());
3485       coordsOut[i*3]=matrix[0]*tmp[0]+matrix[1]*tmp[1]+matrix[2]*tmp[2]+center[0];
3486       coordsOut[i*3+1]=matrix[3]*tmp[0]+matrix[4]*tmp[1]+matrix[5]*tmp[2]+center[1];
3487       coordsOut[i*3+2]=matrix[6]*tmp[0]+matrix[7]*tmp[1]+matrix[8]*tmp[2]+center[2];
3488     }
3489 }
3490
3491 void DataArrayDouble::Symmetry3DPlane(const double point[3], const double normalVector[3], mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut)
3492 {
3493   double matrix[9],matrix2[9],matrix3[9];
3494   double vect[3],crossVect[3];
3495   INTERP_KERNEL::orthogonalVect3(normalVector,vect);
3496   crossVect[0]=normalVector[1]*vect[2]-normalVector[2]*vect[1];
3497   crossVect[1]=normalVector[2]*vect[0]-normalVector[0]*vect[2];
3498   crossVect[2]=normalVector[0]*vect[1]-normalVector[1]*vect[0];
3499   double nv(INTERP_KERNEL::norm<3>(vect)),ni(INTERP_KERNEL::norm<3>(normalVector)),nc(INTERP_KERNEL::norm<3>(crossVect));
3500   matrix[0]=vect[0]/nv; matrix[1]=crossVect[0]/nc; matrix[2]=-normalVector[0]/ni;
3501   matrix[3]=vect[1]/nv; matrix[4]=crossVect[1]/nc; matrix[5]=-normalVector[1]/ni;
3502   matrix[6]=vect[2]/nv; matrix[7]=crossVect[2]/nc; matrix[8]=-normalVector[2]/ni;
3503   matrix2[0]=vect[0]/nv; matrix2[1]=vect[1]/nv; matrix2[2]=vect[2]/nv;
3504   matrix2[3]=crossVect[0]/nc; matrix2[4]=crossVect[1]/nc; matrix2[5]=crossVect[2]/nc;
3505   matrix2[6]=normalVector[0]/ni; matrix2[7]=normalVector[1]/ni; matrix2[8]=normalVector[2]/ni;
3506   for(mcIdType i=0;i<3;i++)
3507     for(mcIdType j=0;j<3;j++)
3508       {
3509         double val(0.);
3510         for(mcIdType k=0;k<3;k++)
3511           val+=matrix[3*i+k]*matrix2[3*k+j];
3512         matrix3[3*i+j]=val;
3513       }
3514   //rotation matrix computed.
3515   double tmp[3];
3516   for(mcIdType i=0; i<nbNodes; i++)
3517     {
3518       std::transform(coordsIn+i*3,coordsIn+(i+1)*3,point,tmp,std::minus<double>());
3519       coordsOut[i*3]=matrix3[0]*tmp[0]+matrix3[1]*tmp[1]+matrix3[2]*tmp[2]+point[0];
3520       coordsOut[i*3+1]=matrix3[3]*tmp[0]+matrix3[4]*tmp[1]+matrix3[5]*tmp[2]+point[1];
3521       coordsOut[i*3+2]=matrix3[6]*tmp[0]+matrix3[7]*tmp[1]+matrix3[8]*tmp[2]+point[2];
3522     }
3523 }
3524
3525 void DataArrayDouble::GiveBaseForPlane(const double normalVector[3], double baseOfPlane[9])
3526 {
3527   double vect[3],crossVect[3];
3528   INTERP_KERNEL::orthogonalVect3(normalVector,vect);
3529   crossVect[0]=normalVector[1]*vect[2]-normalVector[2]*vect[1];
3530   crossVect[1]=normalVector[2]*vect[0]-normalVector[0]*vect[2];
3531   crossVect[2]=normalVector[0]*vect[1]-normalVector[1]*vect[0];
3532   double nv(INTERP_KERNEL::norm<3>(vect)),ni(INTERP_KERNEL::norm<3>(normalVector)),nc(INTERP_KERNEL::norm<3>(crossVect));
3533   baseOfPlane[0]=vect[0]/nv; baseOfPlane[1]=vect[1]/nv; baseOfPlane[2]=vect[2]/nv;
3534   baseOfPlane[3]=crossVect[0]/nc; baseOfPlane[4]=crossVect[1]/nc; baseOfPlane[5]=crossVect[2]/nc;
3535   baseOfPlane[6]=normalVector[0]/ni; baseOfPlane[7]=normalVector[1]/ni; baseOfPlane[8]=normalVector[2]/ni;
3536 }
3537
3538 /*!
3539  * \param [in] seg2 : coordinates of input seg2 expected to have spacedim==2
3540  * \param [in] tri3 : coordinates of input tri3 also expected to have spacedim==2
3541  * \param [out] coeffs : the result of integration normalized to 1. along \a seg2 inside tri3 sorted by the node id of \a tri3
3542  * \param [out] length : the length of seg2. That is too say the length of integration
3543  */
3544 void DataArrayDouble::ComputeIntegralOfSeg2IntoTri3(const double seg2[4], const double tri3[6], double coeffs[3], double& length)
3545 {
3546   length=INTERP_KERNEL::norme_vecteur(seg2,seg2+2);
3547   double mid[2];
3548   INTERP_KERNEL::mid_of_seg2(seg2,seg2+2,mid);
3549   INTERP_KERNEL::barycentric_coords<2>(tri3,mid,coeffs); // integral along seg2 is equal to value at the center of SEG2 !
3550 }
3551
3552 /*!
3553  * Low static method that operates 3D rotation of \a nbNodes 3D nodes whose coordinates are arranged in \a coords
3554  * around the center point \a center and with angle \a angle.
3555  */
3556 void DataArrayDouble::Rotate2DAlg(const double *center, double angle, mcIdType nbNodes, const double *coordsIn, double *coordsOut)
3557 {
3558   double cosa=cos(angle);
3559   double sina=sin(angle);
3560   double matrix[4];
3561   matrix[0]=cosa; matrix[1]=-sina; matrix[2]=sina; matrix[3]=cosa;
3562   double tmp[2];
3563   for(mcIdType i=0; i<nbNodes; i++)
3564     {
3565       std::transform(coordsIn+i*2,coordsIn+(i+1)*2,center,tmp,std::minus<double>());
3566       coordsOut[i*2]=matrix[0]*tmp[0]+matrix[1]*tmp[1]+center[0];
3567       coordsOut[i*2+1]=matrix[2]*tmp[0]+matrix[3]*tmp[1]+center[1];
3568     }
3569 }
3570
3571 DataArrayDoubleIterator::DataArrayDoubleIterator(DataArrayDouble *da):DataArrayIterator<double>(da)
3572 {
3573 }
3574
3575 DataArrayDoubleTuple::DataArrayDoubleTuple(double *pt, std::size_t nbOfComp):DataArrayTuple<double>(pt,nbOfComp)
3576 {
3577 }
3578
3579
3580 std::string DataArrayDoubleTuple::repr() const
3581 {
3582   std::ostringstream oss; oss.precision(17); oss << "(";
3583   for(std::size_t i=0;i<_nb_of_compo-1;i++)
3584     oss << _pt[i] << ", ";
3585   oss << _pt[_nb_of_compo-1] << ")";
3586   return oss.str();
3587 }
3588
3589 double DataArrayDoubleTuple::doubleValue() const
3590 {
3591   return this->zeValue();
3592 }
3593
3594 /*!
3595  * This method returns a newly allocated instance the caller should dealed with by a MEDCoupling::DataArrayDouble::decrRef.
3596  * This method performs \b no copy of data. The content is only referenced using MEDCoupling::DataArrayDouble::useArray with ownership set to \b false.
3597  * This method throws an INTERP_KERNEL::Exception is it is impossible to match sizes of \b this that is too say \b nbOfCompo=this->_nb_of_elem and \bnbOfTuples==1 or
3598  * \b nbOfCompo=1 and \bnbOfTuples==this->_nb_of_elem.
3599  */
3600 DataArrayDouble *DataArrayDoubleTuple::buildDADouble(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const
3601 {
3602   return this->buildDA(nbOfTuples,nbOfCompo);
3603 }
3604
3605 /*!
3606  * Returns a full copy of \a this. For more info on copying data arrays see
3607  * \ref MEDCouplingArrayBasicsCopyDeep.
3608  *  \return DataArrayInt * - a new instance of DataArrayInt.
3609  */
3610 DataArrayInt32 *DataArrayInt32::deepCopy() const
3611 {
3612   return new DataArrayInt32(*this);
3613 }
3614
3615 DataArrayInt32Iterator *DataArrayInt32::iterator()
3616 {
3617   return new DataArrayInt32Iterator(this);
3618 }
3619
3620
3621 DataArrayInt32Iterator::DataArrayInt32Iterator(DataArrayInt32 *da):DataArrayIterator<Int32>(da)
3622 {
3623 }
3624
3625 DataArrayInt32Tuple::DataArrayInt32Tuple(Int32 *pt, std::size_t nbOfComp):DataArrayTuple<Int32>(pt,nbOfComp)
3626 {
3627 }
3628
3629 std::string DataArrayInt32Tuple::repr() const
3630 {
3631   std::ostringstream oss; oss << "(";
3632   for(std::size_t i=0;i<_nb_of_compo-1;i++)
3633     oss << _pt[i] << ", ";
3634   oss << _pt[_nb_of_compo-1] << ")";
3635   return oss.str();
3636 }
3637
3638 Int32 DataArrayInt32Tuple::intValue() const
3639 {
3640   return this->zeValue();
3641 }
3642
3643 /*!
3644  * This method returns a newly allocated instance the caller should dealed with by a MEDCoupling::DataArrayInt::decrRef.
3645  * This method performs \b no copy of data. The content is only referenced using MEDCoupling::DataArrayInt::useArray with ownership set to \b false.
3646  * This method throws an INTERP_KERNEL::Exception is it is impossible to match sizes of \b this that is too say \b nbOfCompo=this->_nb_of_elem and \bnbOfTuples==1 or
3647  * \b nbOfCompo=1 and \bnbOfTuples==this->_nb_of_elem.
3648  */
3649 DataArrayInt32 *DataArrayInt32Tuple::buildDAInt(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const
3650 {
3651   return this->buildDA(nbOfTuples,nbOfCompo);
3652 }
3653
3654 DataArrayInt64Iterator *DataArrayInt64::iterator()
3655 {
3656   return new DataArrayInt64Iterator(this);
3657 }
3658
3659
3660 DataArrayInt64Iterator::DataArrayInt64Iterator(DataArrayInt64 *da):DataArrayIterator<Int64>(da)
3661 {
3662 }
3663
3664 DataArrayInt64Tuple::DataArrayInt64Tuple(Int64 *pt, std::size_t nbOfComp):DataArrayTuple<Int64>(pt,nbOfComp)
3665 {
3666 }
3667
3668 std::string DataArrayInt64Tuple::repr() const
3669 {
3670   std::ostringstream oss; oss << "(";
3671   for(std::size_t i=0;i<_nb_of_compo-1;i++)
3672     oss << _pt[i] << ", ";
3673   oss << _pt[_nb_of_compo-1] << ")";
3674   return oss.str();
3675 }
3676
3677 Int64 DataArrayInt64Tuple::intValue() const
3678 {
3679   return this->zeValue();
3680 }
3681
3682 DataArrayInt64 *DataArrayInt64Tuple::buildDAInt(std::size_t nbOfTuples, std::size_t nbOfCompo) const
3683 {
3684   return this->buildDA(nbOfTuples,nbOfCompo);
3685 }
3686
3687
3688 DataArrayInt64 *DataArrayInt64::deepCopy() const
3689 {
3690   return new DataArrayInt64(*this);
3691 }