src/MEDCoupling/MEDCouplingMatrix.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay
  20
  21 #ifndef __PARAMEDMEM_MEDCOUPLINGMATRIX_HXX__
  22 #define __PARAMEDMEM_MEDCOUPLINGMATRIX_HXX__
  23
  24 #include "MEDCoupling.hxx"
  25 #include "MEDCouplingTimeLabel.hxx"
  26 #include "MEDCouplingRefCountObject.hxx"
  27 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  28 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
  29
  30 #include "InterpKernelException.hxx"
  31
  32 namespace ParaMEDMEM
  33 {
  34   /*!
  35    * The aim of this class is \b NOT to reimplement all linear algebra but only to store a dense matrix.
  36    * It only provides basic set/get and basic operations and bindings to linear algebra libraries (numpy/scipy) and a compatible format to Petsc.
  37    */
  38   class DenseMatrix : public RefCountObject, public TimeLabel
  39   {
  40   public:
  41     MEDCOUPLING_EXPORT static DenseMatrix *New(int nbRows, int nbCols);
  42     MEDCOUPLING_EXPORT static DenseMatrix *New(DataArrayDouble *array, int nbRows, int nbCols);
  43     MEDCOUPLING_EXPORT DenseMatrix *deepCpy() const;
  44     MEDCOUPLING_EXPORT DenseMatrix *shallowCpy() const;
  45     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
  46     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
  47     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
  48     //
  49     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfRows() const { return _nb_rows; }
  50     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCols() const { return _nb_cols; }
  51     MEDCOUPLING_EXPORT int getNbOfElems() const { return _nb_rows*_nb_cols; }
  52     MEDCOUPLING_EXPORT void reBuild(DataArrayDouble *array, int nbRows=-1, int nbCols=-1);
  53     MEDCOUPLING_EXPORT void reShape(int nbRows, int nbCols);
  54     MEDCOUPLING_EXPORT void transpose();
  55     //
  56     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqual(const DenseMatrix& other, double eps) const;
  57     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const DenseMatrix& other, double eps, std::string& reason) const;
  58     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *matVecMult(const DataArrayDouble *vec) const;
  59     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayDouble *MatVecMult(const DenseMatrix *mat, const DataArrayDouble *vec);
  60     MEDCOUPLING_EXPORT static DenseMatrix *Add(const DenseMatrix *a1, const DenseMatrix *a2);
  61     MEDCOUPLING_EXPORT void addEqual(const DenseMatrix *other);
  62     MEDCOUPLING_EXPORT static DenseMatrix *Substract(const DenseMatrix *a1, const DenseMatrix *a2);
  63     MEDCOUPLING_EXPORT void substractEqual(const DenseMatrix *other);
  64     MEDCOUPLING_EXPORT static DenseMatrix *Multiply(const DenseMatrix *a1, const DenseMatrix *a2);
  65     MEDCOUPLING_EXPORT static DenseMatrix *Multiply(const DenseMatrix *a1, const DataArrayDouble *a2);
  66     //
  67     MEDCOUPLING_EXPORT const DataArrayDouble *getData() const { return _data; }
  68     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getData() { return _data; }
  69   private:
  70     ~DenseMatrix();
  71     DenseMatrix(int nbRows, int nbCols);
  72     DenseMatrix(DataArrayDouble *array, int nbRows, int nbCols);
  73     int getNumberOfRowsExt(int nbRows) const;
  74     int getNumberOfColsExt(int nbCols) const;
  75     void checkValidData() const;
  76     static void CheckArraySizes(DataArrayDouble *array, int nbRows, int nbCols);
  77     static void CheckSameSize(const DenseMatrix *a1, const DenseMatrix *a2);
  78     static void CheckCompatibleSizeForMul(const DenseMatrix *a1, const DenseMatrix *a2);
  79   private:
  80     int _nb_rows;
  81     int _nb_cols;
  82     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> _data;
  83   };
  84 }
  85
  86 #endif