src/MEDCoupling/MEDCouplingMappedExtrudedMesh.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2016  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingMappedExtrudedMesh.hxx"
  22 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  23 #include "MEDCouplingCMesh.hxx"
  24 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  25 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  26 #include "MCAuto.hxx"
  27 #include "CellModel.hxx"
  28
  29 #include "InterpolationUtils.hxx"
  30
  31 #include <limits>
  32 #include <algorithm>
  33 #include <functional>
  34 #include <iterator>
  35 #include <sstream>
  36 #include <cmath>
  37 #include <list>
  38 #include <set>
  39
  40 using namespace MEDCoupling;
  41
  42 /*!
  43  * Build an extruded mesh instance from 3D and 2D unstructured mesh lying on the \b same \b coords.
  44  * @param mesh3D 3D unstructured mesh.
  45  * @param mesh2D 2D unstructured mesh lying on the same coordinates than mesh3D. \b Warning mesh2D is \b not \b const
  46  * because the mesh is aggregated and potentially modified by rotate or translate method.
  47  * @param cell2DId Id of cell in mesh2D mesh where the computation of 1D mesh will be done.
  48  */
  49 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::New(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId)
  50 {
  51   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh(mesh3D,mesh2D,cell2DId);
  52 }
  53
  54 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::New(const MEDCouplingCMesh *mesh3D)
  55 {
  56   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh(mesh3D);
  57 }
  58
  59 /*!
  60  * This constructor is here only for unserialisation process.
  61  * This constructor is normally completely useless for end user.
  62  */
  63 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::New()
  64 {
  65   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh;
  66 }
  67
  68 MEDCouplingMeshType MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getType() const
  69 {
  70   return EXTRUDED;
  71 }
  72
  73 std::size_t MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  74 {
  75   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
  76 }
  77
  78 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getDirectChildrenWithNull() const
  79 {
  80   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
  81   ret.push_back(_mesh2D);
  82   ret.push_back(_mesh1D);
  83   ret.push_back(_mesh3D_ids);
  84   return ret;
  85 }
  86
  87 /*!
  88  * This method copyies all tiny strings from other (name and components name).
  89  * @throw if other and this have not same mesh type.
  90  */
  91 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other)
  92 {
  93   const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *>(other);
  94   if(!otherC)
  95     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom : meshes have not same type !");
  96   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
  97   _mesh2D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh2D);
  98   _mesh1D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh1D);
  99 }
 100
 101 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId)
 102 try:_mesh2D(const_cast<MEDCouplingUMesh *>(mesh2D)),_mesh1D(MEDCouplingUMesh::New()),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(cell2DId)
 103 {
 104   if(_mesh2D.isNotNull())
 105     _mesh2D->incrRef();
 106   computeExtrusion(mesh3D);
 107   setName(mesh3D->getName()); setDescription(mesh3D->getDescription());
 108 }
 109 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
 110 {
 111     throw e;
 112 }
 113
 114 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh(const MEDCouplingCMesh *mesh3D):_mesh1D(MEDCouplingUMesh::New()),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(0)
 115 {
 116   if(!mesh3D)
 117     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh contrct : null input pointer !");
 118   if(mesh3D->getMeshDimension()!=3)
 119     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh contrct : input cart mesh must have dimension equal to 3 !");
 120   MCAuto<MEDCouplingUMesh> umesh3D(mesh3D->buildUnstructured());
 121   MCAuto<MEDCouplingCMesh> cmesh2D(MEDCouplingCMesh::New()); cmesh2D->setName(mesh3D->getName());
 122   cmesh2D->setCoords(mesh3D->getCoordsAt(0),mesh3D->getCoordsAt(1));
 123   _mesh2D=cmesh2D->buildUnstructured();
 124   _mesh2D->setCoords(umesh3D->getCoords());
 125   computeExtrusion(umesh3D);
 126   setName(mesh3D->getName()); setDescription(mesh3D->getDescription());
 127 }
 128
 129 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh():_mesh2D(0),_mesh1D(0),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(-1)
 130 {
 131 }
 132
 133 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh(const MEDCouplingMappedExtrudedMesh& other, bool deepCpy):MEDCouplingMesh(other),_cell_2D_id(other._cell_2D_id)
 134 {
 135   if(deepCpy)
 136     {
 137       _mesh2D=other._mesh2D->clone(true);
 138       _mesh1D=other._mesh1D->clone(true);
 139       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids->deepCopy();
 140     }
 141   else
 142     {
 143       _mesh2D=other._mesh2D;
 144       _mesh1D=other._mesh1D;
 145       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids;
 146     }
 147 }
 148
 149 std::size_t MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNumberOfCells() const
 150 {
 151   return _mesh2D->getNumberOfCells()*_mesh1D->getNumberOfCells();
 152 }
 153
 154 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNumberOfNodes() const
 155 {
 156   return _mesh2D->getNumberOfNodes();
 157 }
 158
 159 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getSpaceDimension() const
 160 {
 161   return 3;
 162 }
 163
 164 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMeshDimension() const
 165 {
 166   return 3;
 167 }
 168
 169 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::deepCopy() const
 170 {
 171   return clone(true);
 172 }
 173
 174 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::clone(bool recDeepCpy) const
 175 {
 176   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh(*this,recDeepCpy);
 177 }
 178
 179 const DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getDirectAccessOfCoordsArrIfInStructure() const
 180 {
 181   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getDirectAccessOfCoordsArrIfInStructure : no direct acess of DataArrayDouble holding nodes !");
 182 }
 183
 184 bool MEDCouplingMappedExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const
 185 {
 186   if(!other)
 187     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy : input other pointer is null !");
 188   const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *>(other);
 189   std::ostringstream oss;
 190   if(!otherC)
 191     {
 192       reason="mesh given in input is not castable in MEDCouplingMappedExtrudedMesh !";
 193       return false;
 194     }
 195   if(!MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason))
 196     return false;
 197   if(!_mesh2D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh2D,prec,reason))
 198     {
 199       reason.insert(0,"Mesh2D unstructured meshes differ : ");
 200       return false;
 201     }
 202   if(!_mesh1D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh1D,prec,reason))
 203     {
 204       reason.insert(0,"Mesh1D unstructured meshes differ : ");
 205       return false;
 206     }
 207   if(!_mesh3D_ids->isEqualIfNotWhy(*otherC->_mesh3D_ids,reason))
 208     {
 209       reason.insert(0,"Mesh3D ids DataArrayInt instances differ : ");
 210       return false;
 211     }
 212   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
 213     {
 214       oss << "Cell 2D id of the two extruded mesh differ : this = " << _cell_2D_id << " other = " <<  otherC->_cell_2D_id;
 215       reason=oss.str();
 216       return false;
 217     }
 218   return true;
 219 }
 220
 221 bool MEDCouplingMappedExtrudedMesh::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const
 222 {
 223   const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *>(other);
 224   if(!otherC)
 225     return false;
 226   if(!_mesh2D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh2D,prec))
 227     return false;
 228   if(!_mesh1D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh1D,prec))
 229     return false;
 230   if(!_mesh3D_ids->isEqualWithoutConsideringStr(*otherC->_mesh3D_ids))
 231     return false;
 232   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
 233     return false;
 234   return true;
 235 }
 236
 237 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
 238                                                    DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const
 239 {
 240   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith : not implemented yet !");
 241 }
 242
 243 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
 244                                                               DataArrayInt *&cellCor) const
 245 {
 246   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith : not implemented yet !");
 247 }
 248
 249 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getTypeOfCell(std::size_t cellId) const
 250 {
 251   const int *ids(_mesh3D_ids->begin());
 252   std::size_t nbOf3DCells(_mesh3D_ids->getNumberOfTuples());
 253   const int *where(std::find(ids,ids+nbOf3DCells,cellId));
 254   if(where==ids+nbOf3DCells)
 255     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid cellId specified >= getNumberOfCells() !");
 256   std::size_t nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 257   std::size_t locId((std::distance(ids,where))%nbOfCells2D);
 258   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType tmp(_mesh2D->getTypeOfCell(locId));
 259   return INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(tmp).getExtrudedType();
 260 }
 261
 262 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getAllGeoTypes() const
 263 {
 264   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret2D(_mesh2D->getAllGeoTypes());
 265   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
 266   for(std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator it=ret2D.begin();it!=ret2D.end();it++)
 267     ret.insert(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*it).getExtrudedType());
 268   return ret;
 269 }
 270
 271 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 272 {
 273   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type));
 274   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType revExtTyp(cm.getReverseExtrudedType());
 275   MCAuto<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
 276   if(revExtTyp==INTERP_KERNEL::NORM_ERROR)
 277     {
 278       ret->alloc(0,1);
 279       return ret.retn();
 280     }
 281   MCAuto<DataArrayInt> tmp(_mesh2D->giveCellsWithType(revExtTyp));
 282   int nbOfLevs(_mesh1D->getNumberOfCells());
 283   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 284   int nbOfTuples(tmp->getNumberOfTuples());
 285   ret->alloc(nbOfLevs*nbOfTuples,1);
 286   int *pt(ret->getPointer());
 287   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfTuples)
 288     std::transform(tmp->begin(),tmp->end(),pt,std::bind2nd(std::plus<int>(),i*nbOfCells2D));
 289   MCAuto<DataArrayInt> ret2(ret->renumberR(_mesh3D_ids->begin()));
 290   ret2->sort();
 291   return ret2.retn();
 292 }
 293
 294 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeNbOfNodesPerCell() const
 295 {
 296   MCAuto<DataArrayInt> ret2D(_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell());
 297   int nbOfLevs(_mesh1D->getNumberOfCells());
 298   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 299   MCAuto<DataArrayInt> ret3D(DataArrayInt::New()); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
 300   int *pt(ret3D->getPointer());
 301   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
 302     std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
 303   ret3D->applyLin(2,0,0);
 304   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 305 }
 306
 307 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeNbOfFacesPerCell() const
 308 {
 309   MCAuto<DataArrayInt> ret2D(_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell());
 310   int nbOfLevs(_mesh1D->getNumberOfCells());
 311   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 312   MCAuto<DataArrayInt> ret3D(DataArrayInt::New()); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
 313   int *pt(ret3D->getPointer());
 314   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
 315     std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
 316   ret3D->applyLin(2,2,0);
 317   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 318 }
 319
 320 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const
 321 {
 322   return computeNbOfNodesPerCell();
 323 }
 324
 325 std::size_t MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 326 {
 327   std::size_t ret(0);
 328   std::size_t nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 329   for(std::size_t i=0;i<nbOfCells2D;i++)
 330     {
 331       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t(_mesh2D->getTypeOfCell(i));
 332       if(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(t).getExtrudedType()==type)
 333         ret++;
 334     }
 335   return ret*_mesh1D->getNumberOfCells();
 336 }
 337
 338 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
 339 {
 340   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 341   int nbOfNodes2D(_mesh2D->getNumberOfNodes());
 342   int locId(cellId%nbOfCells2D);
 343   int lev(cellId/nbOfCells2D);
 344   std::vector<int> tmp,tmp2;
 345   _mesh2D->getNodeIdsOfCell(locId,tmp);
 346   tmp2=tmp;
 347   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),tmp.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*lev));
 348   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),tmp2.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*(lev+1)));
 349   conn.insert(conn.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 350   conn.insert(conn.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 351 }
 352
 353 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const
 354 {
 355   int nbOfNodes2D(_mesh2D->getNumberOfNodes());
 356   int locId(nodeId%nbOfNodes2D);
 357   int lev(nodeId/nbOfNodes2D);
 358   std::vector<double> tmp,tmp2;
 359   _mesh2D->getCoordinatesOfNode(locId,tmp);
 360   tmp2=tmp;
 361   int spaceDim(_mesh1D->getSpaceDimension());
 362   const double *z(_mesh1D->getCoords()->begin());
 363   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),z+lev*spaceDim,tmp.begin(),std::plus<double>());
 364   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),z+(lev+1)*spaceDim,tmp2.begin(),std::plus<double>());
 365   coo.insert(coo.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 366   coo.insert(coo.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 367 }
 368
 369 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::simpleRepr() const
 370 {
 371   std::ostringstream ret;
 372   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
 373   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
 374   int tmpp1,tmpp2;
 375   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
 376   ret << "Time attached to the mesh [unit] : " << tt << " [" << getTimeUnit() << "]\n";
 377   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
 378   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
 379   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
 380   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
 381   ret << _mesh1D->simpleRepr();
 382   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->simpleRepr() << "\n\n\n";
 383   return ret.str();
 384 }
 385
 386 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::advancedRepr() const
 387 {
 388   std::ostringstream ret;
 389   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
 390   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
 391   int tmpp1,tmpp2;
 392   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
 393   ret << "Time attached to the mesh (unit) : " << tt << " (" << getTimeUnit() << ")\n";
 394   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
 395   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
 396   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
 397   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
 398   ret << _mesh1D->advancedRepr();
 399   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->advancedRepr() << "\n\n\n";
 400   ret << "3D cell ids per level :\n";
 401   return ret.str();
 402 }
 403
 404 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkConsistencyLight() const
 405 {
 406 }
 407
 408 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkConsistency(double eps) const
 409 {
 410   checkConsistencyLight();
 411 }
 412
 413 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getBoundingBox(double *bbox) const
 414 {
 415   double bbox2D[6];
 416   _mesh2D->getBoundingBox(bbox2D);
 417   const double *nodes1D(_mesh1D->getCoords()->begin());
 418   int nbOfNodes1D(_mesh1D->getNumberOfNodes());
 419   double bbox1DMin[3],bbox1DMax[3],tmp[3];
 420   std::fill(bbox1DMin,bbox1DMin+3,std::numeric_limits<double>::max());
 421   std::fill(bbox1DMax,bbox1DMax+3,-(std::numeric_limits<double>::max()));
 422   for(int i=0;i<nbOfNodes1D;i++)
 423     {
 424       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMin,bbox1DMin,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::min<double>));
 425       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMax,bbox1DMax,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::max<double>));
 426     }
 427   std::transform(bbox1DMax,bbox1DMax+3,bbox1DMin,tmp,std::minus<double>());
 428   int id=(int)std::distance(tmp,std::max_element(tmp,tmp+3));
 429   bbox[0]=bbox1DMin[0]; bbox[1]=bbox1DMax[0];
 430   bbox[2]=bbox1DMin[1]; bbox[3]=bbox1DMax[1];
 431   bbox[4]=bbox1DMin[2]; bbox[5]=bbox1DMax[2];
 432   bbox[2*id+1]+=tmp[id];
 433 }
 434
 435 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::updateTime() const
 436 {
 437   if(_mesh2D.isNotNull())
 438     updateTimeWith(*_mesh2D);
 439   if(_mesh1D.isNotNull())
 440     updateTimeWith(*_mesh1D);
 441 }
 442
 443 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::renumberCells(const int *old2NewBg, bool check)
 444 {
 445   throw INTERP_KERNEL::Exception("Functionnality of renumbering cells unavailable for ExtrudedMesh");
 446 }
 447
 448 /*!
 449  * \b WARNING in case of modif think to update MEDFileUMesh::New implementation !
 450  * \sa MEDFileUMesh::New
 451  */
 452 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::build3DUnstructuredMesh() const
 453 {
 454   MCAuto<MEDCouplingUMesh> mesh2DZC(_mesh2D->deepCopyConnectivityOnly());
 455   mesh2DZC->zipCoords();
 456   MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret(mesh2DZC->buildExtrudedMesh(_mesh1D,0));
 457   const int *renum(_mesh3D_ids->begin());
 458   ret->renumberCells(renum,false);
 459   ret->setName(getName());
 460   return ret.retn();
 461 }
 462
 463 /*!
 464  * \b WARNING in case of modif think to update MEDFileUMesh::New implementation !
 465  * \sa MEDFileUMesh::New
 466  */
 467 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildUnstructured() const
 468 {
 469   return build3DUnstructuredMesh();
 470 }
 471
 472 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMeasureField(bool) const
 473 {
 474   std::string name="MeasureOfMesh_";
 475   name+=getName();
 476   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> ret2D(_mesh2D->getMeasureField(true)),ret1D(_mesh1D->getMeasureField(true));
 477   const double *ret2DPtr(ret2D->getArray()->begin());
 478   const double *ret1DPtr(ret1D->getArray()->begin());
 479   int nbOf2DCells(_mesh2D->getNumberOfCells()),nbOf1DCells(_mesh1D->getNumberOfCells()),nbOf3DCells(nbOf2DCells*nbOf1DCells);
 480   const int *renum(_mesh3D_ids->begin());
 481   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> ret(MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,ONE_TIME));
 482   ret->setMesh(this);
 483   ret->synchronizeTimeWithMesh();
 484   MCAuto<DataArrayDouble> da(DataArrayDouble::New());
 485   da->alloc(nbOf3DCells,1);
 486   double *retPtr(da->getPointer());
 487   for(int i=0;i<nbOf1DCells;i++)
 488     for(int j=0;j<nbOf2DCells;j++)
 489       retPtr[renum[i*nbOf2DCells+j]]=ret2DPtr[j]*ret1DPtr[i];
 490   ret->setArray(da);
 491   ret->setName(name);
 492   return ret.retn();
 493 }
 494
 495 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const
 496 {
 497   //not implemented yet
 498   return 0;
 499 }
 500
 501 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildOrthogonalField() const
 502 {
 503   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildOrthogonalField : This method has no sense for MEDCouplingMappedExtrudedMesh that is 3D !");
 504 }
 505
 506 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const
 507 {
 508   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCellContainingPoint : not implemented yet !");
 509 }
 510
 511 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCellsContainingPoint(const double *pos, double eps, std::vector<int>& elts) const
 512 {
 513   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCellsContainingPoint : not implemented yet !");
 514 }
 515
 516 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::~MEDCouplingMappedExtrudedMesh()
 517 {
 518 }
 519
 520 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeExtrusion(const MEDCouplingUMesh *mesh3D)
 521 {
 522   const char errMsg1[]="2D mesh is empty unable to compute extrusion !";
 523   const char errMsg2[]="Coords between 2D and 3D meshes are not the same ! Try MEDCouplingPointSet::tryToShareSameCoords method";
 524   const char errMsg3[]="No chance to find extrusion pattern in mesh3D,mesh2D couple because nbCells3D%nbCells2D!=0 !";
 525   if(_mesh2D.isNull() || mesh3D==0)
 526     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg1);
 527   if(_mesh2D->getCoords()!=mesh3D->getCoords())
 528     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg2);
 529   if(mesh3D->getNumberOfCells()%_mesh2D->getNumberOfCells()!=0)
 530     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg3);
 531   if(_mesh3D_ids.isNull())
 532     _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
 533   if(_mesh1D.isNull())
 534     _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
 535   computeExtrusionAlg(mesh3D);
 536 }
 537
 538 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::build1DExtrusion(int idIn3DDesc, int newId, int nbOf1DLev, MEDCouplingUMesh *subMesh,
 539                                                const int *desc3D, const int *descIndx3D,
 540                                                const int *revDesc3D, const int *revDescIndx3D,
 541                                                bool computeMesh1D)
 542 {
 543   int nbOf2DCells(_mesh2D->getNumberOfCells());
 544   int start(revDescIndx3D[idIn3DDesc]);
 545   int end(revDescIndx3D[idIn3DDesc+1]);
 546   if(end-start!=1)
 547     {
 548       std::ostringstream ost; ost << "Invalid bases 2D mesh specified : 2D cell # " <<  idIn3DDesc;
 549       ost << " shared by more than 1 3D cell !!!";
 550       throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 551     }
 552   int current3DCell(revDesc3D[start]);
 553   int current2DCell(idIn3DDesc);
 554   int *mesh3DIDs(_mesh3D_ids->getPointer());
 555   mesh3DIDs[newId]=current3DCell;
 556   const int *conn2D(subMesh->getNodalConnectivity()->begin());
 557   const int *conn2DIndx(subMesh->getNodalConnectivityIndex()->begin());
 558   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
 559     {
 560       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 561       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 562       if(computeMesh1D)
 563         computeBaryCenterOfFace(conn,i-1);
 564       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
 565           desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
 566       start=revDescIndx3D[current2DCell];
 567       end=revDescIndx3D[current2DCell+1];
 568       if(end-start!=2)
 569         {
 570           std::ostringstream ost; ost << "Expecting to have 2 3D cells attached to 2D cell " << current2DCell << "!";
 571           ost << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
 572           throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 573         }
 574       if(revDesc3D[start]!=current3DCell)
 575         current3DCell=revDesc3D[start];
 576       else
 577         current3DCell=revDesc3D[start+1];
 578       mesh3DIDs[i*nbOf2DCells+newId]=current3DCell;
 579     }
 580   if(computeMesh1D)
 581     {
 582       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 583       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 584       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev-1);
 585       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
 586           desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
 587       conn.clear();
 588       conn.insert(conn.end(),conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 589       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 590       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev);
 591     }
 592 }
 593
 594 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::findOppositeFaceOf(int current2DCell, int current3DCell, const std::vector<int>& connSorted,
 595                                                 const int *desc3D, const int *descIndx3D,
 596                                                 const int *conn2D, const int *conn2DIndx)
 597 {
 598   int start(descIndx3D[current3DCell]);
 599   int end(descIndx3D[current3DCell+1]);
 600   bool found=false;
 601   for(const int *candidate2D=desc3D+start;candidate2D!=desc3D+end && !found;candidate2D++)
 602     {
 603       if(*candidate2D!=current2DCell)
 604         {
 605           std::vector<int> conn2(conn2D+conn2DIndx[*candidate2D]+1,conn2D+conn2DIndx[*candidate2D+1]);
 606           std::sort(conn2.begin(),conn2.end());
 607           std::list<int> intersect;
 608           std::set_intersection(connSorted.begin(),connSorted.end(),conn2.begin(),conn2.end(),
 609                                 std::insert_iterator< std::list<int> >(intersect,intersect.begin()));
 610           if(intersect.empty())
 611             return *candidate2D;
 612         }
 613     }
 614   std::ostringstream ost; ost << "Impossible to find an opposite 2D face of face # " <<  current2DCell;
 615   ost << " in 3D cell # " << current3DCell << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
 616   throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 617 }
 618
 619 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeBaryCenterOfFace(const std::vector<int>& nodalConnec, int lev1DId)
 620 {
 621   double *zoneToUpdate(_mesh1D->getCoords()->getPointer()+lev1DId*3);
 622   std::fill(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,0.);
 623   const double *coords(_mesh2D->getCoords()->begin());
 624   for(std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();iter!=nodalConnec.end();iter++)
 625     std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,coords+3*(*iter),zoneToUpdate,std::plus<double>());
 626   std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,zoneToUpdate,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),(double)(1./(int)nodalConnec.size())));
 627 }
 628
 629 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::FindCorrespCellByNodalConn(const std::vector<int>& nodalConnec, const int *revNodalPtr, const int *revNodalIndxPtr)
 630 {
 631   std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();
 632   std::set<int> s1(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
 633   iter++;
 634   for(;iter!=nodalConnec.end();iter++)
 635     {
 636       std::set<int> s2(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
 637       std::set<int> s3;
 638       std::set_intersection(s1.begin(),s1.end(),s2.begin(),s2.end(),std::insert_iterator< std::set<int> >(s3,s3.end()));
 639       s1=s3;
 640     }
 641   if(s1.size()==1)
 642     return *(s1.begin());
 643   std::ostringstream ostr;
 644   ostr << "Cell with nodal connec : ";
 645   std::copy(nodalConnec.begin(),nodalConnec.end(),std::ostream_iterator<int>(ostr," "));
 646   ostr << " is not part of mesh";
 647   throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
 648 }
 649
 650 /*!
 651  * This method is callable on 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) returned by MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMesh1D typically.
 652  * These 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) have a special semantic because these meshes do not specify a static location but a translation along a path.
 653  * This method checks that 'm1' and 'm2' are compatible, if not an exception is thrown. In case these meshes ('m1' and 'm2') are compatible 2 corresponding meshes
 654  * are created ('m1r' and 'm2r') that can be used for interpolation.
 655  * @param m1 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
 656  * @param m2 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
 657  * @param eps tolerance acceptable to determine compatibility
 658  * @param m1r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
 659  * @param m2r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
 660  * @param v is the output normalized vector of the common direction of 'm1' and 'm2'
 661  * @throw in case that m1 and m2 are not compatible each other.
 662  */
 663 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::Project1DMeshes(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, double eps,
 664                                               MEDCouplingUMesh *&m1r, MEDCouplingUMesh *&m2r, double *v)
 665 {
 666   if(m1->getSpaceDimension()!=3 || m1->getSpaceDimension()!=3)
 667     throw INTERP_KERNEL::Exception("Input meshes are expected to have a spaceDim==3 for Projec1D !");
 668   m1r=m1->clone(true);
 669   m2r=m2->clone(true);
 670   m1r->changeSpaceDimension(1);
 671   m2r->changeSpaceDimension(1);
 672   std::vector<int> c;
 673   std::vector<double> ref,ref2;
 674   m1->getNodeIdsOfCell(0,c);
 675   m1->getCoordinatesOfNode(c[0],ref);
 676   m1->getCoordinatesOfNode(c[1],ref2);
 677   std::transform(ref2.begin(),ref2.end(),ref.begin(),v,std::minus<double>());
 678   double n=INTERP_KERNEL::norm<3>(v);
 679   std::transform(v,v+3,v,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1/n));
 680   m1->project1D(&ref[0],v,eps,m1r->getCoords()->getPointer());
 681   m2->project1D(&ref[0],v,eps,m2r->getCoords()->getPointer());
 682 }
 683
 684 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::rotate(const double *center, const double *vector, double angle)
 685 {
 686   _mesh2D->rotate(center,vector,angle);
 687   _mesh1D->rotate(center,vector,angle);
 688 }
 689
 690 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::translate(const double *vector)
 691 {
 692   _mesh2D->translate(vector);
 693   _mesh1D->translate(vector);
 694 }
 695
 696 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::scale(const double *point, double factor)
 697 {
 698   _mesh2D->scale(point,factor);
 699   _mesh1D->scale(point,factor);
 700 }
 701
 702 std::vector<int> MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getDistributionOfTypes() const
 703 {
 704   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 705 }
 706
 707 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
 708 {
 709   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 710 }
 711
 712 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const
 713 {
 714   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 715 }
 716
 717 MEDCouplingMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
 718 {
 719   // not implemented yet !
 720   return 0;
 721 }
 722
 723 MEDCouplingMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
 724 {
 725   // not implemented yet !
 726   return 0;
 727 }
 728
 729 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::simplexize(int policy)
 730 {
 731   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::simplexize : unavailable for such a type of mesh : Extruded !");
 732 }
 733
 734 MEDCouplingMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const
 735 {
 736   // not implemented yet !
 737   return 0;
 738 }
 739
 740 DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCoordinatesAndOwner() const
 741 {
 742   const DataArrayDouble *arr2D(_mesh2D->getCoords());
 743   const DataArrayDouble *arr1D(_mesh1D->getCoords());
 744   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
 745   ret->alloc(getNumberOfNodes(),3);
 746   int nbOf1DLev(_mesh1D->getNumberOfNodes());
 747   int nbOf2DNodes(_mesh2D->getNumberOfNodes());
 748   const double *ptSrc(arr2D->begin());
 749   double *pt(ret->getPointer());
 750   std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt);
 751   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
 752     {
 753       std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt+3*i*nbOf2DNodes);
 754       double vec[3];
 755       std::copy(arr1D->begin()+3*i,arr1D->begin()+3*(i+1),vec);
 756       std::transform(arr1D->begin()+3*(i-1),arr1D->begin()+3*i,vec,vec,std::minus<double>());
 757       for(int j=0;j<nbOf2DNodes;j++)
 758         std::transform(vec,vec+3,pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),std::plus<double>());
 759     }
 760   return ret.retn();
 761 }
 762
 763 DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeCellCenterOfMass() const
 764 {
 765   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeCellCenterOfMass : not yet implemented !");
 766 }
 767
 768 DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const
 769 {
 770   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell: not yet implemented !");
 771 }
 772
 773 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const
 774 {
 775   MCAuto<MEDCouplingUMesh> m(buildUnstructured());
 776   m->getReverseNodalConnectivity(revNodal,revNodalIndx);
 777 }
 778
 779 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeExtrusionAlg(const MEDCouplingUMesh *mesh3D)
 780 {
 781   _mesh3D_ids->alloc(mesh3D->getNumberOfCells(),1);
 782   int nbOf1DLev(mesh3D->getNumberOfCells()/_mesh2D->getNumberOfCells());
 783   _mesh1D->setMeshDimension(1);
 784   _mesh1D->allocateCells(nbOf1DLev);
 785   int tmpConn[2];
 786   for(int i=0;i<nbOf1DLev;i++)
 787     {
 788       tmpConn[0]=i;
 789       tmpConn[1]=i+1;
 790       _mesh1D->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_SEG2,2,tmpConn);
 791     }
 792   _mesh1D->finishInsertingCells();
 793   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 794   myCoords->alloc(nbOf1DLev+1,3);
 795   _mesh1D->setCoords(myCoords);
 796   myCoords->decrRef();
 797   MCAuto<DataArrayInt> desc(DataArrayInt::New()),descIndx(DataArrayInt::New()),revDesc(DataArrayInt::New()),revDescIndx(DataArrayInt::New());
 798   MCAuto<MEDCouplingUMesh> subMesh(mesh3D->buildDescendingConnectivity(desc,descIndx,revDesc,revDescIndx));
 799   MCAuto<DataArrayInt> revNodal2D(DataArrayInt::New()),revNodalIndx2D(DataArrayInt::New());
 800   subMesh->getReverseNodalConnectivity(revNodal2D,revNodalIndx2D);
 801   const int *nodal2D(_mesh2D->getNodalConnectivity()->begin());
 802   const int *nodal2DIndx(_mesh2D->getNodalConnectivityIndex()->begin());
 803   const int *revNodal2DPtr(revNodal2D->begin());
 804   const int *revNodalIndx2DPtr(revNodalIndx2D->begin());
 805   const int *descP(desc->begin()),*descIndxP(descIndx->begin()),*revDescP(revDesc->begin()),*revDescIndxP(revDescIndx->begin());
 806   //
 807   int nbOf2DCells(_mesh2D->getNumberOfCells());
 808   for(int i=0;i<nbOf2DCells;i++)
 809     {
 810       int idInSubMesh;
 811       std::vector<int> nodalConnec(nodal2D+nodal2DIndx[i]+1,nodal2D+nodal2DIndx[i+1]);
 812       try
 813       {
 814           idInSubMesh=FindCorrespCellByNodalConn(nodalConnec,revNodal2DPtr,revNodalIndx2DPtr);
 815       }
 816       catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
 817       {
 818           std::ostringstream ostr; ostr << "mesh2D cell # " << i << " is not part of any cell of 3D mesh !\n";
 819           ostr << e.what();
 820           throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
 821       }
 822       build1DExtrusion(idInSubMesh,i,nbOf1DLev,subMesh,descP,descIndxP,revDescP,revDescIndxP,i==_cell_2D_id);
 823     }
 824 }
 825
 826 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const
 827 {
 828   std::vector<int> tinyInfo1;
 829   std::vector<std::string> ls1;
 830   std::vector<double> ls3;
 831   _mesh2D->getTinySerializationInformation(ls3,tinyInfo1,ls1);
 832   std::vector<int> tinyInfo2;
 833   std::vector<std::string> ls2;
 834   std::vector<double> ls4;
 835   _mesh1D->getTinySerializationInformation(ls4,tinyInfo2,ls2);
 836   tinyInfo.clear(); littleStrings.clear();
 837   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo1.begin(),tinyInfo1.end());
 838   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls1.begin(),ls1.end());
 839   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo2.begin(),tinyInfo2.end());
 840   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls2.begin(),ls2.end());
 841   tinyInfo.push_back(_cell_2D_id);
 842   tinyInfo.push_back((int)tinyInfo1.size());
 843   tinyInfo.push_back(_mesh3D_ids->getNbOfElems());
 844   littleStrings.push_back(getName());
 845   littleStrings.push_back(getDescription());
 846 }
 847
 848 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const
 849 {
 850   std::size_t sz=tinyInfo.size();
 851   int sz1=tinyInfo[sz-2];
 852   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
 853   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
 854   MEDCouplingUMesh *um=MEDCouplingUMesh::New();
 855   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
 856   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
 857   int la1=0,la2=0;
 858   std::vector<std::string> ls1,ls2;
 859   um->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
 860   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
 861   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 862   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
 863   um->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
 864   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
 865   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 866   um->decrRef();
 867   //
 868   a1->alloc(la1+tinyInfo[sz-1],1);
 869   a2->alloc(la2,1);
 870   littleStrings.resize(ls1.size()+ls2.size()+2);
 871 }
 872
 873 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const
 874 {
 875   a1=DataArrayInt::New(); a2=DataArrayDouble::New();
 876   DataArrayInt *a1_1=0,*a1_2=0;
 877   DataArrayDouble *a2_1=0,*a2_2=0;
 878   _mesh2D->serialize(a1_1,a2_1);
 879   _mesh1D->serialize(a1_2,a2_2);
 880   a1->alloc(a1_1->getNbOfElems()+a1_2->getNbOfElems()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),1);
 881   int *ptri=a1->getPointer();
 882   ptri=std::copy(a1_1->begin(),a1_1->begin()+a1_1->getNbOfElems(),ptri);
 883   a1_1->decrRef();
 884   ptri=std::copy(a1_2->begin(),a1_2->begin()+a1_2->getNbOfElems(),ptri);
 885   a1_2->decrRef();
 886   std::copy(_mesh3D_ids->begin(),_mesh3D_ids->begin()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),ptri);
 887   a2->alloc(a2_1->getNbOfElems()+a2_2->getNbOfElems(),1);
 888   double *ptrd=a2->getPointer();
 889   ptrd=std::copy(a2_1->begin(),a2_1->begin()+a2_1->getNbOfElems(),ptrd);
 890   a2_1->decrRef();
 891   std::copy(a2_2->begin(),a2_2->begin()+a2_2->getNbOfElems(),ptrd);
 892   a2_2->decrRef();
 893 }
 894
 895 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, const std::vector<std::string>& littleStrings)
 896 {
 897   setName(littleStrings[littleStrings.size()-2]);
 898   setDescription(littleStrings.back());
 899   std::size_t sz=tinyInfo.size();
 900   int sz1=tinyInfo[sz-2];
 901   _cell_2D_id=tinyInfo[sz-3];
 902   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
 903   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
 904   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
 905   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
 906   const int *a1Ptr=a1->begin();
 907   const double *a2Ptr=a2->begin();
 908   _mesh2D=MEDCouplingUMesh::New();
 909   std::vector<std::string> ls1,ls2;
 910   _mesh2D->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
 911   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
 912   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
 913   a2Ptr+=a2tmp->getNbOfElems();
 914   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
 915   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin(),littleStrings.begin()+ls1.size());
 916   std::vector<double> d1(1);
 917   _mesh2D->unserialization(d1,ti1,a1tmp,a2tmp,ls2);
 918   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 919   //
 920   ls2.clear();
 921   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin()+ls1.size(),littleStrings.end()-2);
 922   _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
 923   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
 924   _mesh1D->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls1);
 925   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
 926   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
 927   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
 928   _mesh1D->unserialization(d1,ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
 929   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 930   //
 931   _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
 932   int szIds=(int)std::distance(a1Ptr,a1->begin()+a1->getNbOfElems());
 933   _mesh3D_ids->alloc(szIds,1);
 934   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+szIds,_mesh3D_ids->getPointer());
 935 }
 936
 937 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData, DataArrayByte *byteData) const
 938 {
 939   MCAuto<MEDCouplingUMesh> m=buildUnstructured();
 940   m->writeVTKLL(ofs,cellData,pointData,byteData);
 941 }
 942
 943 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
 944 {
 945   stream << "MEDCouplingMappedExtrudedMesh C++ instance at " << this << ". Name : \"" << getName() << "\".";
 946 }
 947
 948 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getVTKFileExtension() const
 949 {
 950   return _mesh2D->getVTKFileExtension();
 951 }
 952
 953 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getVTKDataSetType() const
 954 {
 955   return _mesh2D->getVTKDataSetType();
 956 }