src/MEDCoupling/MEDCouplingMappedExtrudedMesh.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2016  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingMappedExtrudedMesh.hxx"
  22 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  23 #include "MEDCouplingCMesh.hxx"
  24 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  25 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  26 #include "MCAuto.hxx"
  27 #include "CellModel.hxx"
  28
  29 #include "InterpolationUtils.hxx"
  30
  31 #include <limits>
  32 #include <algorithm>
  33 #include <functional>
  34 #include <iterator>
  35 #include <sstream>
  36 #include <cmath>
  37 #include <list>
  38 #include <set>
  39
  40 using namespace MEDCoupling;
  41
  42 /*!
  43  * Build an extruded mesh instance from 3D and 2D unstructured mesh lying on the \b same \b coords.
  44  * @param mesh3D 3D unstructured mesh.
  45  * @param mesh2D 2D unstructured mesh lying on the same coordinates than mesh3D. \b Warning mesh2D is \b not \b const
  46  * because the mesh is aggregated and potentially modified by rotate or translate method.
  47  * @param cell2DId Id of cell in mesh2D mesh where the computation of 1D mesh will be done.
  48  */
  49 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::New(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId)
  50 {
  51   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh(mesh3D,mesh2D,cell2DId);
  52 }
  53
  54 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::New(const MEDCouplingCMesh *mesh3D)
  55 {
  56   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh(mesh3D);
  57 }
  58
  59 /*!
  60  * This constructor is here only for unserialisation process.
  61  * This constructor is normally completely useless for end user.
  62  */
  63 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::New()
  64 {
  65   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh;
  66 }
  67
  68 MEDCouplingMeshType MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getType() const
  69 {
  70   return EXTRUDED;
  71 }
  72
  73 std::size_t MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
  74 {
  75   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySizeWithoutChildren();
  76 }
  77
  78 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getDirectChildrenWithNull() const
  79 {
  80   std::vector<const BigMemoryObject *> ret;
  81   ret.push_back(_mesh2D);
  82   ret.push_back(_mesh1D);
  83   ret.push_back(_mesh3D_ids);
  84   return ret;
  85 }
  86
  87 /*!
  88  * This method copyies all tiny strings from other (name and components name).
  89  * @throw if other and this have not same mesh type.
  90  */
  91 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other)
  92 {
  93   const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *>(other);
  94   if(!otherC)
  95     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom : meshes have not same type !");
  96   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
  97   _mesh2D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh2D);
  98   _mesh1D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh1D);
  99 }
 100
 101 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId)
 102 try:_mesh2D(const_cast<MEDCouplingUMesh *>(mesh2D)),_mesh1D(MEDCouplingUMesh::New()),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(cell2DId)
 103 {
 104   if(_mesh2D.isNotNull())
 105     _mesh2D->incrRef();
 106   computeExtrusion(mesh3D);
 107   setName(mesh3D->getName()); setDescription(mesh3D->getDescription());
 108 }
 109 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
 110 {
 111     throw e;
 112 }
 113
 114 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh(const MEDCouplingCMesh *mesh3D):_mesh1D(MEDCouplingUMesh::New()),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(0)
 115 {
 116   if(!mesh3D)
 117     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh contrct : null input pointer !");
 118   if(mesh3D->getMeshDimension()!=3)
 119     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh contrct : input cart mesh must have dimension equal to 3 !");
 120   MCAuto<MEDCouplingUMesh> umesh3D(mesh3D->buildUnstructured());
 121   MCAuto<MEDCouplingCMesh> cmesh2D(MEDCouplingCMesh::New()); cmesh2D->setName(mesh3D->getName());
 122   cmesh2D->setCoords(mesh3D->getCoordsAt(0),mesh3D->getCoordsAt(1));
 123   _mesh2D=cmesh2D->buildUnstructured();
 124   _mesh2D->setCoords(umesh3D->getCoords());
 125   computeExtrusion(umesh3D);
 126   setName(mesh3D->getName()); setDescription(mesh3D->getDescription());
 127 }
 128
 129 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh():_mesh2D(0),_mesh1D(0),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(-1)
 130 {
 131 }
 132
 133 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::MEDCouplingMappedExtrudedMesh(const MEDCouplingMappedExtrudedMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other),_cell_2D_id(other._cell_2D_id)
 134 {
 135   if(deepCopy)
 136     {
 137       _mesh2D=other._mesh2D->clone(true);
 138       _mesh1D=other._mesh1D->clone(true);
 139       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids->deepCopy();
 140     }
 141   else
 142     {
 143       _mesh2D=other._mesh2D;
 144       _mesh1D=other._mesh1D;
 145       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids;
 146     }
 147 }
 148
 149 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNumberOfCells() const
 150 {
 151   return _mesh2D->getNumberOfCells()*_mesh1D->getNumberOfCells();
 152 }
 153
 154 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNumberOfNodes() const
 155 {
 156   return _mesh2D->getNumberOfNodes();
 157 }
 158
 159 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getSpaceDimension() const
 160 {
 161   return 3;
 162 }
 163
 164 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMeshDimension() const
 165 {
 166   return 3;
 167 }
 168
 169 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::deepCopy() const
 170 {
 171   return clone(true);
 172 }
 173
 174 MEDCouplingMappedExtrudedMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::clone(bool recDeepCpy) const
 175 {
 176   return new MEDCouplingMappedExtrudedMesh(*this,recDeepCpy);
 177 }
 178
 179 bool MEDCouplingMappedExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const
 180 {
 181   if(!other)
 182     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy : input other pointer is null !");
 183   const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *>(other);
 184   std::ostringstream oss;
 185   if(!otherC)
 186     {
 187       reason="mesh given in input is not castable in MEDCouplingMappedExtrudedMesh !";
 188       return false;
 189     }
 190   if(!MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason))
 191     return false;
 192   if(!_mesh2D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh2D,prec,reason))
 193     {
 194       reason.insert(0,"Mesh2D unstructured meshes differ : ");
 195       return false;
 196     }
 197   if(!_mesh1D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh1D,prec,reason))
 198     {
 199       reason.insert(0,"Mesh1D unstructured meshes differ : ");
 200       return false;
 201     }
 202   if(!_mesh3D_ids->isEqualIfNotWhy(*otherC->_mesh3D_ids,reason))
 203     {
 204       reason.insert(0,"Mesh3D ids DataArrayInt instances differ : ");
 205       return false;
 206     }
 207   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
 208     {
 209       oss << "Cell 2D id of the two extruded mesh differ : this = " << _cell_2D_id << " other = " <<  otherC->_cell_2D_id;
 210       reason=oss.str();
 211       return false;
 212     }
 213   return true;
 214 }
 215
 216 bool MEDCouplingMappedExtrudedMesh::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const
 217 {
 218   const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingMappedExtrudedMesh *>(other);
 219   if(!otherC)
 220     return false;
 221   if(!_mesh2D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh2D,prec))
 222     return false;
 223   if(!_mesh1D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh1D,prec))
 224     return false;
 225   if(!_mesh3D_ids->isEqualWithoutConsideringStr(*otherC->_mesh3D_ids))
 226     return false;
 227   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
 228     return false;
 229   return true;
 230 }
 231
 232 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
 233                                                    DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const
 234 {
 235   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith : not implemented yet !");
 236 }
 237
 238 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
 239                                                               DataArrayInt *&cellCor) const
 240 {
 241   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith : not implemented yet !");
 242 }
 243
 244 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
 245 {
 246   const int *ids(_mesh3D_ids->begin());
 247   int nbOf3DCells(_mesh3D_ids->getNumberOfTuples());
 248   const int *where(std::find(ids,ids+nbOf3DCells,cellId));
 249   if(where==ids+nbOf3DCells)
 250     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid cellId specified >= getNumberOfCells() !");
 251   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 252   int locId(((int)std::distance(ids,where))%nbOfCells2D);
 253   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType tmp(_mesh2D->getTypeOfCell(locId));
 254   return INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(tmp).getExtrudedType();
 255 }
 256
 257 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getAllGeoTypes() const
 258 {
 259   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret2D(_mesh2D->getAllGeoTypes());
 260   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
 261   for(std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator it=ret2D.begin();it!=ret2D.end();it++)
 262     ret.insert(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*it).getExtrudedType());
 263   return ret;
 264 }
 265
 266 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 267 {
 268   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type));
 269   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType revExtTyp(cm.getReverseExtrudedType());
 270   MCAuto<DataArrayInt> ret(DataArrayInt::New());
 271   if(revExtTyp==INTERP_KERNEL::NORM_ERROR)
 272     {
 273       ret->alloc(0,1);
 274       return ret.retn();
 275     }
 276   MCAuto<DataArrayInt> tmp(_mesh2D->giveCellsWithType(revExtTyp));
 277   int nbOfLevs(_mesh1D->getNumberOfCells());
 278   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 279   int nbOfTuples(tmp->getNumberOfTuples());
 280   ret->alloc(nbOfLevs*nbOfTuples,1);
 281   int *pt(ret->getPointer());
 282   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfTuples)
 283     std::transform(tmp->begin(),tmp->end(),pt,std::bind2nd(std::plus<int>(),i*nbOfCells2D));
 284   MCAuto<DataArrayInt> ret2(ret->renumberR(_mesh3D_ids->begin()));
 285   ret2->sort();
 286   return ret2.retn();
 287 }
 288
 289 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeNbOfNodesPerCell() const
 290 {
 291   MCAuto<DataArrayInt> ret2D(_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell());
 292   int nbOfLevs(_mesh1D->getNumberOfCells());
 293   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 294   MCAuto<DataArrayInt> ret3D(DataArrayInt::New()); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
 295   int *pt(ret3D->getPointer());
 296   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
 297     std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
 298   ret3D->applyLin(2,0,0);
 299   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 300 }
 301
 302 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeNbOfFacesPerCell() const
 303 {
 304   MCAuto<DataArrayInt> ret2D(_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell());
 305   int nbOfLevs(_mesh1D->getNumberOfCells());
 306   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 307   MCAuto<DataArrayInt> ret3D(DataArrayInt::New()); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
 308   int *pt(ret3D->getPointer());
 309   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
 310     std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
 311   ret3D->applyLin(2,2,0);
 312   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 313 }
 314
 315 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const
 316 {
 317   return computeNbOfNodesPerCell();
 318 }
 319
 320 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 321 {
 322   int ret(0);
 323   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 324   for(int i=0;i<nbOfCells2D;i++)
 325     {
 326       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t(_mesh2D->getTypeOfCell(i));
 327       if(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(t).getExtrudedType()==type)
 328         ret++;
 329     }
 330   return ret*_mesh1D->getNumberOfCells();
 331 }
 332
 333 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
 334 {
 335   int nbOfCells2D(_mesh2D->getNumberOfCells());
 336   int nbOfNodes2D(_mesh2D->getNumberOfNodes());
 337   int locId(cellId%nbOfCells2D);
 338   int lev(cellId/nbOfCells2D);
 339   std::vector<int> tmp,tmp2;
 340   _mesh2D->getNodeIdsOfCell(locId,tmp);
 341   tmp2=tmp;
 342   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),tmp.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*lev));
 343   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),tmp2.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*(lev+1)));
 344   conn.insert(conn.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 345   conn.insert(conn.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 346 }
 347
 348 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const
 349 {
 350   int nbOfNodes2D(_mesh2D->getNumberOfNodes());
 351   int locId(nodeId%nbOfNodes2D);
 352   int lev(nodeId/nbOfNodes2D);
 353   std::vector<double> tmp,tmp2;
 354   _mesh2D->getCoordinatesOfNode(locId,tmp);
 355   tmp2=tmp;
 356   int spaceDim(_mesh1D->getSpaceDimension());
 357   const double *z(_mesh1D->getCoords()->begin());
 358   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),z+lev*spaceDim,tmp.begin(),std::plus<double>());
 359   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),z+(lev+1)*spaceDim,tmp2.begin(),std::plus<double>());
 360   coo.insert(coo.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 361   coo.insert(coo.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 362 }
 363
 364 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::simpleRepr() const
 365 {
 366   std::ostringstream ret;
 367   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
 368   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
 369   int tmpp1,tmpp2;
 370   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
 371   ret << "Time attached to the mesh [unit] : " << tt << " [" << getTimeUnit() << "]\n";
 372   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
 373   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
 374   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
 375   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
 376   ret << _mesh1D->simpleRepr();
 377   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->simpleRepr() << "\n\n\n";
 378   return ret.str();
 379 }
 380
 381 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::advancedRepr() const
 382 {
 383   std::ostringstream ret;
 384   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
 385   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
 386   int tmpp1,tmpp2;
 387   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
 388   ret << "Time attached to the mesh (unit) : " << tt << " (" << getTimeUnit() << ")\n";
 389   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
 390   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
 391   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
 392   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
 393   ret << _mesh1D->advancedRepr();
 394   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->advancedRepr() << "\n\n\n";
 395   ret << "3D cell ids per level :\n";
 396   return ret.str();
 397 }
 398
 399 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkConsistencyLight() const
 400 {
 401 }
 402
 403 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkConsistency(double eps) const
 404 {
 405   checkConsistencyLight();
 406 }
 407
 408 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getBoundingBox(double *bbox) const
 409 {
 410   double bbox2D[6];
 411   _mesh2D->getBoundingBox(bbox2D);
 412   const double *nodes1D(_mesh1D->getCoords()->begin());
 413   int nbOfNodes1D(_mesh1D->getNumberOfNodes());
 414   double bbox1DMin[3],bbox1DMax[3],tmp[3];
 415   std::fill(bbox1DMin,bbox1DMin+3,std::numeric_limits<double>::max());
 416   std::fill(bbox1DMax,bbox1DMax+3,-(std::numeric_limits<double>::max()));
 417   for(int i=0;i<nbOfNodes1D;i++)
 418     {
 419       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMin,bbox1DMin,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::min<double>));
 420       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMax,bbox1DMax,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::max<double>));
 421     }
 422   std::transform(bbox1DMax,bbox1DMax+3,bbox1DMin,tmp,std::minus<double>());
 423   int id=(int)std::distance(tmp,std::max_element(tmp,tmp+3));
 424   bbox[0]=bbox1DMin[0]; bbox[1]=bbox1DMax[0];
 425   bbox[2]=bbox1DMin[1]; bbox[3]=bbox1DMax[1];
 426   bbox[4]=bbox1DMin[2]; bbox[5]=bbox1DMax[2];
 427   bbox[2*id+1]+=tmp[id];
 428 }
 429
 430 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::updateTime() const
 431 {
 432   if(_mesh2D.isNotNull())
 433     updateTimeWith(*_mesh2D);
 434   if(_mesh1D.isNotNull())
 435     updateTimeWith(*_mesh1D);
 436 }
 437
 438 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::renumberCells(const int *old2NewBg, bool check)
 439 {
 440   throw INTERP_KERNEL::Exception("Functionnality of renumbering cells unavailable for ExtrudedMesh");
 441 }
 442
 443 /*!
 444  * \b WARNING in case of modif think to update MEDFileUMesh::New implementation !
 445  * \sa MEDFileUMesh::New
 446  */
 447 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::build3DUnstructuredMesh() const
 448 {
 449   MCAuto<MEDCouplingUMesh> mesh2DZC(_mesh2D->deepCopyConnectivityOnly());
 450   mesh2DZC->zipCoords();
 451   MCAuto<MEDCouplingUMesh> ret(mesh2DZC->buildExtrudedMesh(_mesh1D,0));
 452   const int *renum(_mesh3D_ids->begin());
 453   ret->renumberCells(renum,false);
 454   ret->setName(getName());
 455   return ret.retn();
 456 }
 457
 458 /*!
 459  * \b WARNING in case of modif think to update MEDFileUMesh::New implementation !
 460  * \sa MEDFileUMesh::New
 461  */
 462 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildUnstructured() const
 463 {
 464   return build3DUnstructuredMesh();
 465 }
 466
 467 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMeasureField(bool) const
 468 {
 469   std::string name="MeasureOfMesh_";
 470   name+=getName();
 471   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> ret2D(_mesh2D->getMeasureField(true)),ret1D(_mesh1D->getMeasureField(true));
 472   const double *ret2DPtr(ret2D->getArray()->begin());
 473   const double *ret1DPtr(ret1D->getArray()->begin());
 474   int nbOf2DCells(_mesh2D->getNumberOfCells()),nbOf1DCells(_mesh1D->getNumberOfCells()),nbOf3DCells(nbOf2DCells*nbOf1DCells);
 475   const int *renum(_mesh3D_ids->begin());
 476   MCAuto<MEDCouplingFieldDouble> ret(MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,ONE_TIME));
 477   ret->setMesh(this);
 478   ret->synchronizeTimeWithMesh();
 479   MCAuto<DataArrayDouble> da(DataArrayDouble::New());
 480   da->alloc(nbOf3DCells,1);
 481   double *retPtr(da->getPointer());
 482   for(int i=0;i<nbOf1DCells;i++)
 483     for(int j=0;j<nbOf2DCells;j++)
 484       retPtr[renum[i*nbOf2DCells+j]]=ret2DPtr[j]*ret1DPtr[i];
 485   ret->setArray(da);
 486   ret->setName(name);
 487   return ret.retn();
 488 }
 489
 490 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const
 491 {
 492   //not implemented yet
 493   return 0;
 494 }
 495
 496 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildOrthogonalField() const
 497 {
 498   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildOrthogonalField : This method has no sense for MEDCouplingMappedExtrudedMesh that is 3D !");
 499 }
 500
 501 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const
 502 {
 503   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCellContainingPoint : not implemented yet !");
 504 }
 505
 506 MEDCouplingMappedExtrudedMesh::~MEDCouplingMappedExtrudedMesh()
 507 {
 508 }
 509
 510 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeExtrusion(const MEDCouplingUMesh *mesh3D)
 511 {
 512   const char errMsg1[]="2D mesh is empty unable to compute extrusion !";
 513   const char errMsg2[]="Coords between 2D and 3D meshes are not the same ! Try MEDCouplingPointSet::tryToShareSameCoords method";
 514   const char errMsg3[]="No chance to find extrusion pattern in mesh3D,mesh2D couple because nbCells3D%nbCells2D!=0 !";
 515   if(_mesh2D.isNull() || mesh3D==0)
 516     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg1);
 517   if(_mesh2D->getCoords()!=mesh3D->getCoords())
 518     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg2);
 519   if(mesh3D->getNumberOfCells()%_mesh2D->getNumberOfCells()!=0)
 520     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg3);
 521   if(_mesh3D_ids.isNull())
 522     _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
 523   if(_mesh1D.isNull())
 524     _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
 525   computeExtrusionAlg(mesh3D);
 526 }
 527
 528 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::build1DExtrusion(int idIn3DDesc, int newId, int nbOf1DLev, MEDCouplingUMesh *subMesh,
 529                                                const int *desc3D, const int *descIndx3D,
 530                                                const int *revDesc3D, const int *revDescIndx3D,
 531                                                bool computeMesh1D)
 532 {
 533   int nbOf2DCells(_mesh2D->getNumberOfCells());
 534   int start(revDescIndx3D[idIn3DDesc]);
 535   int end(revDescIndx3D[idIn3DDesc+1]);
 536   if(end-start!=1)
 537     {
 538       std::ostringstream ost; ost << "Invalid bases 2D mesh specified : 2D cell # " <<  idIn3DDesc;
 539       ost << " shared by more than 1 3D cell !!!";
 540       throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 541     }
 542   int current3DCell(revDesc3D[start]);
 543   int current2DCell(idIn3DDesc);
 544   int *mesh3DIDs(_mesh3D_ids->getPointer());
 545   mesh3DIDs[newId]=current3DCell;
 546   const int *conn2D(subMesh->getNodalConnectivity()->begin());
 547   const int *conn2DIndx(subMesh->getNodalConnectivityIndex()->begin());
 548   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
 549     {
 550       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 551       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 552       if(computeMesh1D)
 553         computeBaryCenterOfFace(conn,i-1);
 554       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
 555           desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
 556       start=revDescIndx3D[current2DCell];
 557       end=revDescIndx3D[current2DCell+1];
 558       if(end-start!=2)
 559         {
 560           std::ostringstream ost; ost << "Expecting to have 2 3D cells attached to 2D cell " << current2DCell << "!";
 561           ost << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
 562           throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 563         }
 564       if(revDesc3D[start]!=current3DCell)
 565         current3DCell=revDesc3D[start];
 566       else
 567         current3DCell=revDesc3D[start+1];
 568       mesh3DIDs[i*nbOf2DCells+newId]=current3DCell;
 569     }
 570   if(computeMesh1D)
 571     {
 572       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 573       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 574       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev-1);
 575       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
 576           desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
 577       conn.clear();
 578       conn.insert(conn.end(),conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 579       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 580       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev);
 581     }
 582 }
 583
 584 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::findOppositeFaceOf(int current2DCell, int current3DCell, const std::vector<int>& connSorted,
 585                                                 const int *desc3D, const int *descIndx3D,
 586                                                 const int *conn2D, const int *conn2DIndx)
 587 {
 588   int start(descIndx3D[current3DCell]);
 589   int end(descIndx3D[current3DCell+1]);
 590   bool found=false;
 591   for(const int *candidate2D=desc3D+start;candidate2D!=desc3D+end && !found;candidate2D++)
 592     {
 593       if(*candidate2D!=current2DCell)
 594         {
 595           std::vector<int> conn2(conn2D+conn2DIndx[*candidate2D]+1,conn2D+conn2DIndx[*candidate2D+1]);
 596           std::sort(conn2.begin(),conn2.end());
 597           std::list<int> intersect;
 598           std::set_intersection(connSorted.begin(),connSorted.end(),conn2.begin(),conn2.end(),
 599                                 std::insert_iterator< std::list<int> >(intersect,intersect.begin()));
 600           if(intersect.empty())
 601             return *candidate2D;
 602         }
 603     }
 604   std::ostringstream ost; ost << "Impossible to find an opposite 2D face of face # " <<  current2DCell;
 605   ost << " in 3D cell # " << current3DCell << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
 606   throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 607 }
 608
 609 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeBaryCenterOfFace(const std::vector<int>& nodalConnec, int lev1DId)
 610 {
 611   double *zoneToUpdate(_mesh1D->getCoords()->getPointer()+lev1DId*3);
 612   std::fill(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,0.);
 613   const double *coords(_mesh2D->getCoords()->begin());
 614   for(std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();iter!=nodalConnec.end();iter++)
 615     std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,coords+3*(*iter),zoneToUpdate,std::plus<double>());
 616   std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,zoneToUpdate,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),(double)(1./(int)nodalConnec.size())));
 617 }
 618
 619 int MEDCouplingMappedExtrudedMesh::FindCorrespCellByNodalConn(const std::vector<int>& nodalConnec, const int *revNodalPtr, const int *revNodalIndxPtr)
 620 {
 621   std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();
 622   std::set<int> s1(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
 623   iter++;
 624   for(;iter!=nodalConnec.end();iter++)
 625     {
 626       std::set<int> s2(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
 627       std::set<int> s3;
 628       std::set_intersection(s1.begin(),s1.end(),s2.begin(),s2.end(),std::insert_iterator< std::set<int> >(s3,s3.end()));
 629       s1=s3;
 630     }
 631   if(s1.size()==1)
 632     return *(s1.begin());
 633   std::ostringstream ostr;
 634   ostr << "Cell with nodal connec : ";
 635   std::copy(nodalConnec.begin(),nodalConnec.end(),std::ostream_iterator<int>(ostr," "));
 636   ostr << " is not part of mesh";
 637   throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
 638 }
 639
 640 /*!
 641  * This method is callable on 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) returned by MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getMesh1D typically.
 642  * These 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) have a special semantic because these meshes do not specify a static location but a translation along a path.
 643  * This method checks that 'm1' and 'm2' are compatible, if not an exception is thrown. In case these meshes ('m1' and 'm2') are compatible 2 corresponding meshes
 644  * are created ('m1r' and 'm2r') that can be used for interpolation.
 645  * @param m1 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
 646  * @param m2 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
 647  * @param eps tolerance acceptable to determine compatibility
 648  * @param m1r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
 649  * @param m2r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
 650  * @param v is the output normalized vector of the common direction of 'm1' and 'm2'
 651  * @throw in case that m1 and m2 are not compatible each other.
 652  */
 653 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::Project1DMeshes(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, double eps,
 654                                               MEDCouplingUMesh *&m1r, MEDCouplingUMesh *&m2r, double *v)
 655 {
 656   if(m1->getSpaceDimension()!=3 || m1->getSpaceDimension()!=3)
 657     throw INTERP_KERNEL::Exception("Input meshes are expected to have a spaceDim==3 for Projec1D !");
 658   m1r=m1->clone(true);
 659   m2r=m2->clone(true);
 660   m1r->changeSpaceDimension(1);
 661   m2r->changeSpaceDimension(1);
 662   std::vector<int> c;
 663   std::vector<double> ref,ref2;
 664   m1->getNodeIdsOfCell(0,c);
 665   m1->getCoordinatesOfNode(c[0],ref);
 666   m1->getCoordinatesOfNode(c[1],ref2);
 667   std::transform(ref2.begin(),ref2.end(),ref.begin(),v,std::minus<double>());
 668   double n=INTERP_KERNEL::norm<3>(v);
 669   std::transform(v,v+3,v,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1/n));
 670   m1->project1D(&ref[0],v,eps,m1r->getCoords()->getPointer());
 671   m2->project1D(&ref[0],v,eps,m2r->getCoords()->getPointer());
 672 }
 673
 674 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::rotate(const double *center, const double *vector, double angle)
 675 {
 676   _mesh2D->rotate(center,vector,angle);
 677   _mesh1D->rotate(center,vector,angle);
 678 }
 679
 680 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::translate(const double *vector)
 681 {
 682   _mesh2D->translate(vector);
 683   _mesh1D->translate(vector);
 684 }
 685
 686 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::scale(const double *point, double factor)
 687 {
 688   _mesh2D->scale(point,factor);
 689   _mesh1D->scale(point,factor);
 690 }
 691
 692 std::vector<int> MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getDistributionOfTypes() const
 693 {
 694   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 695 }
 696
 697 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
 698 {
 699   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 700 }
 701
 702 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const
 703 {
 704   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 705 }
 706
 707 MEDCouplingMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
 708 {
 709   // not implemented yet !
 710   return 0;
 711 }
 712
 713 MEDCouplingMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
 714 {
 715   // not implemented yet !
 716   return 0;
 717 }
 718
 719 DataArrayInt *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::simplexize(int policy)
 720 {
 721   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::simplexize : unavailable for such a type of mesh : Extruded !");
 722 }
 723
 724 MEDCouplingMesh *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const
 725 {
 726   // not implemented yet !
 727   return 0;
 728 }
 729
 730 DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getCoordinatesAndOwner() const
 731 {
 732   const DataArrayDouble *arr2D(_mesh2D->getCoords());
 733   const DataArrayDouble *arr1D(_mesh1D->getCoords());
 734   MCAuto<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
 735   ret->alloc(getNumberOfNodes(),3);
 736   int nbOf1DLev(_mesh1D->getNumberOfNodes());
 737   int nbOf2DNodes(_mesh2D->getNumberOfNodes());
 738   const double *ptSrc(arr2D->begin());
 739   double *pt(ret->getPointer());
 740   std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt);
 741   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
 742     {
 743       std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt+3*i*nbOf2DNodes);
 744       double vec[3];
 745       std::copy(arr1D->begin()+3*i,arr1D->begin()+3*(i+1),vec);
 746       std::transform(arr1D->begin()+3*(i-1),arr1D->begin()+3*i,vec,vec,std::minus<double>());
 747       for(int j=0;j<nbOf2DNodes;j++)
 748         std::transform(vec,vec+3,pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),std::plus<double>());
 749     }
 750   return ret.retn();
 751 }
 752
 753 DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeCellCenterOfMass() const
 754 {
 755   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeCellCenterOfMass : not yet implemented !");
 756 }
 757
 758 DataArrayDouble *MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const
 759 {
 760   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell: not yet implemented !");
 761 }
 762
 763 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const
 764 {
 765   MCAuto<MEDCouplingUMesh> m(buildUnstructured());
 766   m->getReverseNodalConnectivity(revNodal,revNodalIndx);
 767 }
 768
 769 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::computeExtrusionAlg(const MEDCouplingUMesh *mesh3D)
 770 {
 771   _mesh3D_ids->alloc(mesh3D->getNumberOfCells(),1);
 772   int nbOf1DLev(mesh3D->getNumberOfCells()/_mesh2D->getNumberOfCells());
 773   _mesh1D->setMeshDimension(1);
 774   _mesh1D->allocateCells(nbOf1DLev);
 775   int tmpConn[2];
 776   for(int i=0;i<nbOf1DLev;i++)
 777     {
 778       tmpConn[0]=i;
 779       tmpConn[1]=i+1;
 780       _mesh1D->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_SEG2,2,tmpConn);
 781     }
 782   _mesh1D->finishInsertingCells();
 783   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 784   myCoords->alloc(nbOf1DLev+1,3);
 785   _mesh1D->setCoords(myCoords);
 786   myCoords->decrRef();
 787   MCAuto<DataArrayInt> desc(DataArrayInt::New()),descIndx(DataArrayInt::New()),revDesc(DataArrayInt::New()),revDescIndx(DataArrayInt::New());
 788   MCAuto<MEDCouplingUMesh> subMesh(mesh3D->buildDescendingConnectivity(desc,descIndx,revDesc,revDescIndx));
 789   MCAuto<DataArrayInt> revNodal2D(DataArrayInt::New()),revNodalIndx2D(DataArrayInt::New());
 790   subMesh->getReverseNodalConnectivity(revNodal2D,revNodalIndx2D);
 791   const int *nodal2D(_mesh2D->getNodalConnectivity()->begin());
 792   const int *nodal2DIndx(_mesh2D->getNodalConnectivityIndex()->begin());
 793   const int *revNodal2DPtr(revNodal2D->begin());
 794   const int *revNodalIndx2DPtr(revNodalIndx2D->begin());
 795   const int *descP(desc->begin()),*descIndxP(descIndx->begin()),*revDescP(revDesc->begin()),*revDescIndxP(revDescIndx->begin());
 796   //
 797   int nbOf2DCells(_mesh2D->getNumberOfCells());
 798   for(int i=0;i<nbOf2DCells;i++)
 799     {
 800       int idInSubMesh;
 801       std::vector<int> nodalConnec(nodal2D+nodal2DIndx[i]+1,nodal2D+nodal2DIndx[i+1]);
 802       try
 803       {
 804           idInSubMesh=FindCorrespCellByNodalConn(nodalConnec,revNodal2DPtr,revNodalIndx2DPtr);
 805       }
 806       catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
 807       {
 808           std::ostringstream ostr; ostr << "mesh2D cell # " << i << " is not part of any cell of 3D mesh !\n";
 809           ostr << e.what();
 810           throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
 811       }
 812       build1DExtrusion(idInSubMesh,i,nbOf1DLev,subMesh,descP,descIndxP,revDescP,revDescIndxP,i==_cell_2D_id);
 813     }
 814 }
 815
 816 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const
 817 {
 818   std::vector<int> tinyInfo1;
 819   std::vector<std::string> ls1;
 820   std::vector<double> ls3;
 821   _mesh2D->getTinySerializationInformation(ls3,tinyInfo1,ls1);
 822   std::vector<int> tinyInfo2;
 823   std::vector<std::string> ls2;
 824   std::vector<double> ls4;
 825   _mesh1D->getTinySerializationInformation(ls4,tinyInfo2,ls2);
 826   tinyInfo.clear(); littleStrings.clear();
 827   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo1.begin(),tinyInfo1.end());
 828   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls1.begin(),ls1.end());
 829   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo2.begin(),tinyInfo2.end());
 830   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls2.begin(),ls2.end());
 831   tinyInfo.push_back(_cell_2D_id);
 832   tinyInfo.push_back((int)tinyInfo1.size());
 833   tinyInfo.push_back(_mesh3D_ids->getNbOfElems());
 834   littleStrings.push_back(getName());
 835   littleStrings.push_back(getDescription());
 836 }
 837
 838 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const
 839 {
 840   std::size_t sz=tinyInfo.size();
 841   int sz1=tinyInfo[sz-2];
 842   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
 843   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
 844   MEDCouplingUMesh *um=MEDCouplingUMesh::New();
 845   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
 846   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
 847   int la1=0,la2=0;
 848   std::vector<std::string> ls1,ls2;
 849   um->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
 850   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
 851   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 852   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
 853   um->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
 854   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
 855   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 856   um->decrRef();
 857   //
 858   a1->alloc(la1+tinyInfo[sz-1],1);
 859   a2->alloc(la2,1);
 860   littleStrings.resize(ls1.size()+ls2.size()+2);
 861 }
 862
 863 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const
 864 {
 865   a1=DataArrayInt::New(); a2=DataArrayDouble::New();
 866   DataArrayInt *a1_1=0,*a1_2=0;
 867   DataArrayDouble *a2_1=0,*a2_2=0;
 868   _mesh2D->serialize(a1_1,a2_1);
 869   _mesh1D->serialize(a1_2,a2_2);
 870   a1->alloc(a1_1->getNbOfElems()+a1_2->getNbOfElems()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),1);
 871   int *ptri=a1->getPointer();
 872   ptri=std::copy(a1_1->begin(),a1_1->begin()+a1_1->getNbOfElems(),ptri);
 873   a1_1->decrRef();
 874   ptri=std::copy(a1_2->begin(),a1_2->begin()+a1_2->getNbOfElems(),ptri);
 875   a1_2->decrRef();
 876   std::copy(_mesh3D_ids->begin(),_mesh3D_ids->begin()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),ptri);
 877   a2->alloc(a2_1->getNbOfElems()+a2_2->getNbOfElems(),1);
 878   double *ptrd=a2->getPointer();
 879   ptrd=std::copy(a2_1->begin(),a2_1->begin()+a2_1->getNbOfElems(),ptrd);
 880   a2_1->decrRef();
 881   std::copy(a2_2->begin(),a2_2->begin()+a2_2->getNbOfElems(),ptrd);
 882   a2_2->decrRef();
 883 }
 884
 885 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, const std::vector<std::string>& littleStrings)
 886 {
 887   setName(littleStrings[littleStrings.size()-2]);
 888   setDescription(littleStrings.back());
 889   std::size_t sz=tinyInfo.size();
 890   int sz1=tinyInfo[sz-2];
 891   _cell_2D_id=tinyInfo[sz-3];
 892   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
 893   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
 894   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
 895   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
 896   const int *a1Ptr=a1->begin();
 897   const double *a2Ptr=a2->begin();
 898   _mesh2D=MEDCouplingUMesh::New();
 899   std::vector<std::string> ls1,ls2;
 900   _mesh2D->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
 901   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
 902   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
 903   a2Ptr+=a2tmp->getNbOfElems();
 904   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
 905   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin(),littleStrings.begin()+ls1.size());
 906   std::vector<double> d1(1);
 907   _mesh2D->unserialization(d1,ti1,a1tmp,a2tmp,ls2);
 908   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 909   //
 910   ls2.clear();
 911   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin()+ls1.size(),littleStrings.end()-2);
 912   _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
 913   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
 914   _mesh1D->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls1);
 915   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
 916   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
 917   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
 918   _mesh1D->unserialization(d1,ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
 919   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 920   //
 921   _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
 922   int szIds=(int)std::distance(a1Ptr,a1->begin()+a1->getNbOfElems());
 923   _mesh3D_ids->alloc(szIds,1);
 924   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+szIds,_mesh3D_ids->getPointer());
 925 }
 926
 927 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData, DataArrayByte *byteData) const
 928 {
 929   MCAuto<MEDCouplingUMesh> m=buildUnstructured();
 930   m->writeVTKLL(ofs,cellData,pointData,byteData);
 931 }
 932
 933 void MEDCouplingMappedExtrudedMesh::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
 934 {
 935   stream << "MEDCouplingMappedExtrudedMesh C++ instance at " << this << ". Name : \"" << getName() << "\".";
 936 }
 937
 938 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getVTKFileExtension() const
 939 {
 940   return _mesh2D->getVTKFileExtension();
 941 }
 942
 943 std::string MEDCouplingMappedExtrudedMesh::getVTKDataSetType() const
 944 {
 945   return _mesh2D->getVTKDataSetType();
 946 }