src/MEDCoupling/MEDCouplingFieldDiscretization.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
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  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingFieldDiscretization.hxx"
  22 #include "MEDCouplingCMesh.hxx"
  23 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  24 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  25 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
  26
  27 #include "CellModel.hxx"
  28 #include "InterpolationUtils.hxx"
  29 #include "InterpKernelAutoPtr.hxx"
  30 #include "InterpKernelGaussCoords.hxx"
  31 #include "InterpKernelMatrixTools.hxx"
  32
  33 #include <set>
  34 #include <list>
  35 #include <limits>
  36 #include <sstream>
  37 #include <numeric>
  38 #include <algorithm>
  39 #include <functional>
  40
  41 using namespace ParaMEDMEM;
  42
  43 const double MEDCouplingFieldDiscretization::DFLT_PRECISION=1.e-12;
  44
  45 const char MEDCouplingFieldDiscretizationP0::REPR[]="P0";
  46
  47 const TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationP0::TYPE=ON_CELLS;
  48
  49 const char MEDCouplingFieldDiscretizationP1::REPR[]="P1";
  50
  51 const TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationP1::TYPE=ON_NODES;
  52
  53 const int MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::DFT_INVALID_LOCID_VALUE=-1;
  54
  55 const char MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::REPR[]="GAUSS";
  56
  57 const TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::TYPE=ON_GAUSS_PT;
  58
  59 const char MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REPR[]="GSSNE";
  60
  61 const TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::TYPE=ON_GAUSS_NE;
  62
  63 const char MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::REPR[]="KRIGING";
  64
  65 const TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::TYPE=ON_NODES_KR;
  66
  67 // doc is here http://www.code-aster.org/V2/doc/default/fr/man_r/r3/r3.01.01.pdf
  68 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_POINT1[1]={0.};
  69 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_SEG2[2]={1.,1.};
  70 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_SEG3[3]={0.5555555555555556,0.8888888888888888,0.5555555555555556};
  71 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_SEG4[4]={0.347854845137454,0.347854845137454,0.652145154862546,0.652145154862546};
  72 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_TRI3[3]={0.16666666666666666,0.16666666666666666,0.16666666666666666};
  73 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_TRI6[6]={0.0549758718227661,0.0549758718227661,0.0549758718227661,0.11169079483905,0.11169079483905,0.11169079483905};
  74 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_TRI7[7]={0.062969590272413,0.062969590272413,0.062969590272413,0.066197076394253,0.066197076394253,0.066197076394253,0.1125};
  75 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_QUAD4[4]={1.,1.,1.,1.};
  76 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_QUAD8[8]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};
  77 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_QUAD9[9]={0.30864197530864196,0.30864197530864196,0.30864197530864196,0.30864197530864196,0.49382716049382713,0.49382716049382713,0.49382716049382713,0.49382716049382713,0.7901234567901234};
  78 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_TETRA4[4]={0.041666666666666664,0.041666666666666664,0.041666666666666664,0.041666666666666664};
  79 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_TETRA10[10]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};//to check
  80 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_PENTA6[6]={0.16666666666666666,0.16666666666666666,0.16666666666666666,0.16666666666666666,0.16666666666666666,0.16666666666666666};
  81 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_PENTA15[15]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};//to check
  82 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_HEXA8[8]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};
  83 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_HEXA20[20]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};
  84 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_HEXA27[27]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};
  85 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_PYRA5[5]={0.13333333333333333,0.13333333333333333,0.13333333333333333,0.13333333333333333,0.13333333333333333};
  86 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::FGP_PYRA13[13]={1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.};//to check
  87 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_SEG2[2]={-1.,1.};
  88 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_SEG3[3]={-1.,1.,0.};
  89 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_SEG4[4]={-1.,1.,-0.3333333333333333,0.3333333333333333};
  90 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_TRI3[6]={0.,0.,1.,0.,0.,1.};
  91 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_TRI6[12]={0.,0.,1.,0.,0.,1.,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.5};
  92 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_TRI7[14]={0.,0.,1.,0.,0.,1.,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.5,0.3333333333333333,0.3333333333333333};
  93 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_QUAD4[8]={-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,-1.,1.};
  94 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_QUAD8[16]={-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,0.,-1.,1.,0.,0.,1.,-1.,0.};
  95 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_QUAD9[18]={-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,0.,-1.,1.,0.,0.,1.,-1.,0.,0.,0.};
  96 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_TETRA4[12]={0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.};
  97 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_TETRA10[30]={0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,0.5,0.5,0.,0.,0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.};
  98 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_PENTA6[18]={-1.,1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,0.,0.,1.,1.,0.,1.,0.,1.,1.,0.,0.};
  99 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_PENTA15[45]={-1.,1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,0.,0.,1.,1.,0.,1.,0.,1.,1.,0.,0.,-1.,0.5,0.5,-1.,0.,0.5,-1.,0.5,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.5,0.5,1.,0.,0.5,1.,0.5,0.};
 100 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_HEXA8[24]={-1.,-1.,-1.,1.,-1.,-1.,1.,1.,-1.,-1.,1.,-1.,-1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,1.,1.,1.,-1.,1.,1.};
 101 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_HEXA20[60]={-1.,-1.,-1.,1.,-1.,-1.,1.,1.,-1.,-1.,1.,-1.,-1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,1.,1.,1.,-1.,1.,1.,0.,-1.,-1.,1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,-1.,0.,-1.,-1.,-1.,0.,1.,-1.,0.,1.,1.,0.,-1.,1.,0.,0.,-1.,1.,1.,0.,1.,0.,1.,1.,-1.,0.,1.};
 102 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_HEXA27[81]={-1.,-1.,-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,-1.,-1.,-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,-1.,1.,-1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,1.,0.,-1.,0.,-1.,-1.,-1.,0.,1.,0.,1.,1.,1.,0.,1.,0.,-1.,1.,-1.,-1.,0.,-1.,1.,0.,1.,1.,0.,1.,-1.,0.,0.,0.,-1.,-1.,0.,0.,0.,1.,0.,1.,0.,0.,0.,-1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.};
 103 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_PYRA5[15]={1.,0.,0.,0.,1.,0.,-1.,0.,0.,0.,-1.,0.,0.,0.,1.};
 104 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REF_PYRA13[39]={1.,0.,0.,0.,-1.,0.,-1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.5,-0.5,0.,-0.5,-0.5,0.,-0.5,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.,-0.5,0.5,-0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.5};
 105 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_SEG2[2]={0.577350269189626,-0.577350269189626};
 106 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_SEG3[3]={-0.774596669241,0.,0.774596669241};
 107 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_SEG4[4]={0.339981043584856,-0.339981043584856,0.861136311594053,-0.861136311594053};
 108 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_TRI3[6]={0.16666666666666667,0.16666666666666667,0.6666666666666667,0.16666666666666667,0.16666666666666667,0.6666666666666667};
 109 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_TRI6[12]={0.091576213509771,0.091576213509771,0.816847572980458,0.091576213509771,0.091576213509771,0.816847572980458,0.445948490915965,0.10810301816807,0.445948490915965,0.445948490915965,0.10810301816807,0.445948490915965};
 110 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_TRI7[14]={0.3333333333333333,0.3333333333333333,0.470142064105115,0.470142064105115,0.05971587178977,0.470142064105115,0.470142064105115,0.05971587178977,0.101286507323456,0.101286507323456,0.797426985353088,0.101286507323456,0.101286507323456,0.797426985353088};
 111 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_QUAD4[8]={-0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483};
 112 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_QUAD8[16]={-0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.,0.,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.};
 113 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_QUAD9[18]={-0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.,-0.774596669241483,0.774596669241483,0.,0.,0.774596669241483,-0.774596669241483,0.,0.,0.};
 114 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_TETRA4[12]={0.1381966011250105,0.1381966011250105,0.1381966011250105,0.1381966011250105,0.1381966011250105,0.5854101966249685,0.1381966011250105,0.5854101966249685,0.1381966011250105,0.5854101966249685,0.1381966011250105,0.1381966011250105};
 115 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_TETRA10[30]={0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,0.5,0.5,0.,0.,0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.};//to check
 116 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_PENTA6[18]={-0.5773502691896258,0.5,0.5,-0.5773502691896258,0.,0.5,-0.5773502691896258,0.5,0.,0.5773502691896258,0.5,0.5,0.5773502691896258,0.,0.5,0.5773502691896258,0.5,0.};
 117 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_PENTA15[45]={-1.,1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,0.,0.,1.,1.,0.,1.,0.,1.,1.,0.,0.,-1.,0.5,0.5,-1.,0.,0.5,-1.,0.5,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,1.,0.5,0.5,1.,0.,0.5,1.,0.5,0.};//to check
 118 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_HEXA8[24]={-0.5773502691896258,-0.5773502691896258,-0.5773502691896258,-0.5773502691896258,-0.5773502691896258,0.5773502691896258,-0.5773502691896258,0.5773502691896258,-0.5773502691896258,-0.5773502691896258,0.5773502691896258,0.5773502691896258,0.5773502691896258,-0.5773502691896258,-0.5773502691896258,0.5773502691896258,-0.5773502691896258,0.5773502691896258,0.5773502691896258,0.5773502691896258,-0.5773502691896258,0.5773502691896258,0.5773502691896258,0.5773502691896258};
 119 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_HEXA20[60]={-1.,-1.,-1.,1.,-1.,-1.,1.,1.,-1.,-1.,1.,-1.,-1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,1.,1.,1.,-1.,1.,1.,0.,-1.,-1.,1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,-1.,0.,-1.,-1.,-1.,0.,1.,-1.,0.,1.,1.,0.,-1.,1.,0.,0.,-1.,1.,1.,0.,1.,0.,1.,1.,-1.,0.,1.};//to check
 120 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_HEXA27[81]={-1.,-1.,-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,-1.,1.,-1.,-1.,-1.,-1.,1.,-1.,1.,1.,1.,1.,1.,1.,-1.,1.,-1.,0.,-1.,0.,1.,-1.,1.,0.,-1.,0.,-1.,-1.,-1.,0.,1.,0.,1.,1.,1.,0.,1.,0.,-1.,1.,-1.,-1.,0.,-1.,1.,0.,1.,1.,0.,1.,-1.,0.,0.,0.,-1.,-1.,0.,0.,0.,1.,0.,1.,0.,0.,0.,-1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.};
 121 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_PYRA5[15]={0.5,0.,0.1531754163448146,0.,0.5,0.1531754163448146,-0.5,0.,0.1531754163448146,0.,-0.5,0.1531754163448146,0.,0.,0.6372983346207416};
 122 const double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::LOC_PYRA13[39]={1.,0.,0.,0.,-1.,0.,-1.,0.,0.,0.,1.,0.,0.,0.,0.999999999999,0.5,-0.5,0.,-0.5,-0.5,0.,-0.5,0.5,0.,0.5,0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.,-0.5,0.5,-0.5,0.,0.5,0.,0.5,0.5};//to check 0.99999... to avoid nan ! on node #4 of PYRA13
 123
 124 MEDCouplingFieldDiscretization::MEDCouplingFieldDiscretization():_precision(DFLT_PRECISION)
 125 {
 126 }
 127
 128 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretization::New(TypeOfField type)
 129 {
 130   switch(type)
 131   {
 132     case MEDCouplingFieldDiscretizationP0::TYPE:
 133       return new MEDCouplingFieldDiscretizationP0;
 134     case MEDCouplingFieldDiscretizationP1::TYPE:
 135       return new MEDCouplingFieldDiscretizationP1;
 136     case MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::TYPE:
 137       return new MEDCouplingFieldDiscretizationGauss;
 138     case MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::TYPE:
 139       return new MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE;
 140     case MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::TYPE:
 141       return new MEDCouplingFieldDiscretizationKriging;
 142     default:
 143       throw INTERP_KERNEL::Exception("Choosen discretization is not implemented yet.");
 144   }
 145 }
 146
 147 TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretization::GetTypeOfFieldFromStringRepr(const std::string& repr)
 148 {
 149   if(repr==MEDCouplingFieldDiscretizationP0::REPR)
 150     return MEDCouplingFieldDiscretizationP0::TYPE;
 151   if(repr==MEDCouplingFieldDiscretizationP1::REPR)
 152     return MEDCouplingFieldDiscretizationP1::TYPE;
 153   if(repr==MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::REPR)
 154     return MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::TYPE;
 155   if(repr==MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REPR)
 156     return MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::TYPE;
 157   if(repr==MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::REPR)
 158     return MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::TYPE;
 159   throw INTERP_KERNEL::Exception("Representation does not match with any field discretization !");
 160 }
 161
 162 std::string MEDCouplingFieldDiscretization::GetTypeOfFieldRepr(TypeOfField type)
 163 {
 164   if(type==MEDCouplingFieldDiscretizationP0::TYPE)
 165     return MEDCouplingFieldDiscretizationP0::REPR;
 166   if(type==MEDCouplingFieldDiscretizationP1::TYPE)
 167     return MEDCouplingFieldDiscretizationP1::REPR;
 168   if(type==MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::TYPE)
 169     return MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::REPR;
 170   if(type==MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::TYPE)
 171     return MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::REPR;
 172   if(type==MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::TYPE)
 173     return MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::REPR;
 174   throw INTERP_KERNEL::Exception("GetTypeOfFieldRepr : Representation does not match with any field discretization !");
 175 }
 176
 177 bool MEDCouplingFieldDiscretization::isEqual(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps) const
 178 {
 179   std::string reason;
 180   return isEqualIfNotWhy(other,eps,reason);
 181 }
 182
 183 bool MEDCouplingFieldDiscretization::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps) const
 184 {
 185   return isEqual(other,eps);
 186 }
 187
 188 /*!
 189  * This method is an alias of MEDCouplingFieldDiscretization::clone. It is only here for coherency with all the remaining of MEDCoupling.
 190  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::clone.
 191  */
 192 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy() const
 193 {
 194   return clone();
 195 }
 196
 197 /*!
 198  * For all field discretization excepted GaussPts the [ \a startCellIds, \a endCellIds ) has no impact on the cloned instance.
 199  */
 200 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretization::clonePart(const int *startCellIds, const int *endCellIds) const
 201 {
 202   return clone();
 203 }
 204
 205 /*!
 206  * For all field discretization excepted GaussPts the slice( \a beginCellId, \a endCellIds, \a stepCellId ) has no impact on the cloned instance.
 207  */
 208 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretization::clonePartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const
 209 {
 210   return clone();
 211 }
 212
 213 /*!
 214  * Excepted for MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell no underlying TimeLabel object : nothing to do in generally.
 215  */
 216 void MEDCouplingFieldDiscretization::updateTime() const
 217 {
 218 }
 219
 220 std::size_t MEDCouplingFieldDiscretization::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
 221 {
 222   return 0;
 223 }
 224
 225 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDCouplingFieldDiscretization::getDirectChildrenWithNull() const
 226 {
 227   return std::vector<const BigMemoryObject *>();
 228 }
 229
 230 /*!
 231  * Computes normL1 of DataArrayDouble instance arr.
 232  * @param res output parameter expected to be of size arr->getNumberOfComponents();
 233  * @throw when the field discretization fails on getMeasure fields (gauss points for example)
 234  */
 235 void MEDCouplingFieldDiscretization::normL1(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *arr, double *res) const
 236 {
 237   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> vol=getMeasureField(mesh,true);
 238   int nbOfCompo=arr->getNumberOfComponents();
 239   int nbOfElems=getNumberOfTuples(mesh);
 240   std::fill(res,res+nbOfCompo,0.);
 241   const double *arrPtr=arr->getConstPointer();
 242   const double *volPtr=vol->getArray()->getConstPointer();
 243   double deno=0.;
 244   for(int i=0;i<nbOfElems;i++)
 245     {
 246       double v=fabs(volPtr[i]);
 247       for(int j=0;j<nbOfCompo;j++)
 248         res[j]+=fabs(arrPtr[i*nbOfCompo+j])*v;
 249       deno+=v;
 250     }
 251   std::transform(res,res+nbOfCompo,res,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./deno));
 252 }
 253
 254 /*!
 255  * Computes normL2 of DataArrayDouble instance arr.
 256  * @param res output parameter expected to be of size arr->getNumberOfComponents();
 257  * @throw when the field discretization fails on getMeasure fields (gauss points for example)
 258  */
 259 void MEDCouplingFieldDiscretization::normL2(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *arr, double *res) const
 260 {
 261   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> vol=getMeasureField(mesh,true);
 262   int nbOfCompo=arr->getNumberOfComponents();
 263   int nbOfElems=getNumberOfTuples(mesh);
 264   std::fill(res,res+nbOfCompo,0.);
 265   const double *arrPtr=arr->getConstPointer();
 266   const double *volPtr=vol->getArray()->getConstPointer();
 267   double deno=0.;
 268   for(int i=0;i<nbOfElems;i++)
 269     {
 270       double v=fabs(volPtr[i]);
 271       for(int j=0;j<nbOfCompo;j++)
 272         res[j]+=arrPtr[i*nbOfCompo+j]*arrPtr[i*nbOfCompo+j]*v;
 273       deno+=v;
 274     }
 275   std::transform(res,res+nbOfCompo,res,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./deno));
 276   std::transform(res,res+nbOfCompo,res,std::ptr_fun<double,double>(std::sqrt));
 277 }
 278
 279 /*!
 280  * Computes integral of DataArrayDouble instance arr.
 281  * @param res output parameter expected to be of size arr->getNumberOfComponents();
 282  * @throw when the field discretization fails on getMeasure fields (gauss points for example)
 283  */
 284 void MEDCouplingFieldDiscretization::integral(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *arr, bool isWAbs, double *res) const
 285 {
 286   if(!mesh)
 287     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretization::integral : mesh is NULL !");
 288   if(!arr)
 289     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretization::integral : input array is NULL !");
 290   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> vol=getMeasureField(mesh,isWAbs);
 291   int nbOfCompo=arr->getNumberOfComponents();
 292   int nbOfElems=getNumberOfTuples(mesh);
 293   if(nbOfElems!=arr->getNumberOfTuples())
 294     {
 295       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretization::integral : field is not correct ! number of tuples in array is " << arr->getNumberOfTuples();
 296       oss << " whereas number of tuples expected is " << nbOfElems << " !";
 297       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 298     }
 299   std::fill(res,res+nbOfCompo,0.);
 300   const double *arrPtr=arr->getConstPointer();
 301   const double *volPtr=vol->getArray()->getConstPointer();
 302   INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> tmp=new double[nbOfCompo];
 303   for (int i=0;i<nbOfElems;i++)
 304     {
 305       std::transform(arrPtr+i*nbOfCompo,arrPtr+(i+1)*nbOfCompo,(double *)tmp,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),volPtr[i]));
 306       std::transform((double *)tmp,(double *)tmp+nbOfCompo,res,res,std::plus<double>());
 307     }
 308 }
 309
 310 /*!
 311  * This method is strictly equivalent to MEDCouplingFieldDiscretization::buildSubMeshData except that it is optimized for input defined as a range of cell ids.
 312  *
 313  * \param [out] beginOut Valid only if \a di is NULL
 314  * \param [out] endOut Valid only if \a di is NULL
 315  * \param [out] stepOut Valid only if \a di is NULL
 316  * \param [out] di is an array returned that specifies entity ids (nodes, cells, Gauss points... ) in array if no output range is foundable.
 317  *
 318  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::buildSubMeshData
 319  */
 320 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretization::buildSubMeshDataRange(const MEDCouplingMesh *mesh, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt *&di) const
 321 {
 322   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> da=DataArrayInt::Range(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
 323   return buildSubMeshData(mesh,da->begin(),da->end(),di);
 324 }
 325
 326 void MEDCouplingFieldDiscretization::getSerializationIntArray(DataArrayInt *& arr) const
 327 {
 328   arr=0;
 329 }
 330
 331 /*!
 332  * Empty : Not a bug
 333  */
 334 void MEDCouplingFieldDiscretization::getTinySerializationIntInformation(std::vector<int>& tinyInfo) const
 335 {
 336 }
 337
 338 /*!
 339  * Empty : Not a bug
 340  */
 341 void MEDCouplingFieldDiscretization::getTinySerializationDbleInformation(std::vector<double>& tinyInfo) const
 342 {
 343 }
 344
 345 void MEDCouplingFieldDiscretization::resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *& arr)
 346 {
 347   arr=0;
 348 }
 349
 350 /*!
 351  * Empty : Not a bug
 352  */
 353 void MEDCouplingFieldDiscretization::checkForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *arr)
 354 {
 355 }
 356
 357 /*!
 358  * Empty : Not a bug
 359  */
 360 void MEDCouplingFieldDiscretization::finishUnserialization(const std::vector<double>& tinyInfo)
 361 {
 362 }
 363
 364 /*!
 365  * This method is typically the first step of renumbering. The implementation is empty it is not a bug only gauss is impacted
 366  * virtualy by this method.
 367  */
 368 void MEDCouplingFieldDiscretization::renumberCells(const int *old2NewBg, bool check)
 369 {
 370 }
 371
 372 double MEDCouplingFieldDiscretization::getIJK(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *da, int cellId, int nodeIdInCell, int compoId) const
 373 {
 374   throw INTERP_KERNEL::Exception("getIJK Invalid ! only for GaussPoint and GaussNE discretizations !");
 375 }
 376
 377 void MEDCouplingFieldDiscretization::setGaussLocalizationOnType(const MEDCouplingMesh *m, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type, const std::vector<double>& refCoo,
 378                                                                 const std::vector<double>& gsCoo, const std::vector<double>& wg)
 379 {
 380   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 381 }
 382
 383 void MEDCouplingFieldDiscretization::setGaussLocalizationOnCells(const MEDCouplingMesh *m, const int *begin, const int *end, const std::vector<double>& refCoo,
 384                                                                  const std::vector<double>& gsCoo, const std::vector<double>& wg)
 385 {
 386   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 387 }
 388
 389 void MEDCouplingFieldDiscretization::clearGaussLocalizations()
 390 {
 391   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 392 }
 393
 394 MEDCouplingGaussLocalization& MEDCouplingFieldDiscretization::getGaussLocalization(int locId)
 395 {
 396   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 397 }
 398
 399 const MEDCouplingGaussLocalization& MEDCouplingFieldDiscretization::getGaussLocalization(int locId) const
 400 {
 401   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 402 }
 403
 404 int MEDCouplingFieldDiscretization::getNbOfGaussLocalization() const
 405 {
 406   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 407 }
 408
 409 int MEDCouplingFieldDiscretization::getGaussLocalizationIdOfOneCell(int cellId) const
 410 {
 411   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 412 }
 413
 414 int MEDCouplingFieldDiscretization::getGaussLocalizationIdOfOneType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 415 {
 416   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 417 }
 418
 419 std::set<int> MEDCouplingFieldDiscretization::getGaussLocalizationIdsOfOneType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 420 {
 421   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 422 }
 423
 424 void MEDCouplingFieldDiscretization::getCellIdsHavingGaussLocalization(int locId, std::vector<int>& cellIds) const
 425 {
 426   throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid method for the corresponding field discretization : available only for GaussPoint discretization !");
 427 }
 428
 429 void MEDCouplingFieldDiscretization::RenumberEntitiesFromO2NArr(double eps, const int *old2NewPtr, int newNbOfEntity, DataArrayDouble *arr, const std::string& msg)
 430 {
 431   if(!arr)
 432     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretization::RenumberEntitiesFromO2NArr : input array is NULL !");
 433   int oldNbOfElems=arr->getNumberOfTuples();
 434   int nbOfComp=arr->getNumberOfComponents();
 435   int newNbOfTuples=newNbOfEntity;
 436   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arrCpy=arr->deepCpy();
 437   const double *ptSrc=arrCpy->getConstPointer();
 438   arr->reAlloc(newNbOfTuples);
 439   double *ptToFill=arr->getPointer();
 440   std::fill(ptToFill,ptToFill+nbOfComp*newNbOfTuples,std::numeric_limits<double>::max());
 441   INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> tmp=new double[nbOfComp];
 442   for(int i=0;i<oldNbOfElems;i++)
 443     {
 444       int newNb=old2NewPtr[i];
 445       if(newNb>=0)//if newNb<0 the node is considered as out.
 446         {
 447           if(std::find_if(ptToFill+newNb*nbOfComp,ptToFill+(newNb+1)*nbOfComp,std::bind2nd(std::not_equal_to<double>(),std::numeric_limits<double>::max()))
 448           ==ptToFill+(newNb+1)*nbOfComp)
 449             std::copy(ptSrc+i*nbOfComp,ptSrc+(i+1)*nbOfComp,ptToFill+newNb*nbOfComp);
 450           else
 451             {
 452               std::transform(ptSrc+i*nbOfComp,ptSrc+(i+1)*nbOfComp,ptToFill+newNb*nbOfComp,(double *)tmp,std::minus<double>());
 453               std::transform((double *)tmp,((double *)tmp)+nbOfComp,(double *)tmp,std::ptr_fun<double,double>(fabs));
 454               //if(!std::equal(ptSrc+i*nbOfComp,ptSrc+(i+1)*nbOfComp,ptToFill+newNb*nbOfComp))
 455               if(*std::max_element((double *)tmp,((double *)tmp)+nbOfComp)>eps)
 456                 {
 457                   std::ostringstream oss;
 458                   oss << msg << " " << i << " and " << std::find(old2NewPtr,old2NewPtr+i,newNb)-old2NewPtr
 459                       << " have been merged and " << msg << " field on them are different !";
 460                   throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 461                 }
 462             }
 463         }
 464     }
 465 }
 466
 467 void MEDCouplingFieldDiscretization::RenumberEntitiesFromN2OArr(const int *new2OldPtr, int new2OldSz, DataArrayDouble *arr, const std::string& msg)
 468 {
 469   int nbOfComp=arr->getNumberOfComponents();
 470   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arrCpy=arr->deepCpy();
 471   const double *ptSrc=arrCpy->getConstPointer();
 472   arr->reAlloc(new2OldSz);
 473   double *ptToFill=arr->getPointer();
 474   for(int i=0;i<new2OldSz;i++)
 475     {
 476       int oldNb=new2OldPtr[i];
 477       std::copy(ptSrc+oldNb*nbOfComp,ptSrc+(oldNb+1)*nbOfComp,ptToFill+i*nbOfComp);
 478     }
 479 }
 480
 481 MEDCouplingFieldDiscretization::~MEDCouplingFieldDiscretization()
 482 {
 483 }
 484
 485 TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getEnum() const
 486 {
 487   return TYPE;
 488 }
 489
 490 /*!
 491  * This method is simply called by MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy. It performs the deep copy of \a this.
 492  *
 493  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy.
 494  */
 495 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::clone() const
 496 {
 497   return new MEDCouplingFieldDiscretizationP0;
 498 }
 499
 500 std::string MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getStringRepr() const
 501 {
 502   return std::string(REPR);
 503 }
 504
 505 const char *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getRepr() const
 506 {
 507   return REPR;
 508 }
 509
 510 bool MEDCouplingFieldDiscretizationP0::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps, std::string& reason) const
 511 {
 512   if(!other)
 513     {
 514       reason="other spatial discretization is NULL, and this spatial discretization (P0) is defined.";
 515       return false;
 516     }
 517   const MEDCouplingFieldDiscretizationP0 *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationP0 *>(other);
 518   bool ret=otherC!=0;
 519   if(!ret)
 520     reason="Spatial discrtization of this is ON_CELLS, which is not the case of other.";
 521   return ret;
 522 }
 523
 524 int MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuples(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 525 {
 526   if(!mesh)
 527     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuples : NULL input mesh !");
 528   return mesh->getNumberOfCells();
 529 }
 530
 531 /*!
 532  * This method returns the number of tuples regarding exclusively the input code \b without \b using \b a \b mesh \b in \b input.
 533  * The input code coherency is also checked regarding spatial discretization of \a this.
 534  * If an incoherency is detected, an exception will be thrown. If the input code is coherent, the number of tuples expected is returned.
 535  * The number of tuples expected is equal to those to have a valid field lying on \a this and having a mesh fitting perfectly the input code (geometric type distribution).
 536  */
 537 int MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
 538 {
 539   if(code.size()%3!=0)
 540     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code !");
 541   int nbOfSplit=(int)idsPerType.size();
 542   int nbOfTypes=(int)code.size()/3;
 543   int ret=0;
 544   for(int i=0;i<nbOfTypes;i++)
 545     {
 546       int nbOfEltInChunk=code[3*i+1];
 547       if(nbOfEltInChunk<0)
 548         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code ! presence of negative value in a type !");
 549       int pos=code[3*i+2];
 550       if(pos!=-1)
 551         {
 552           if(pos<0 || pos>=nbOfSplit)
 553             {
 554               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input code points to pos " << pos << " in typeid " << i << " ! Should be in [0," << nbOfSplit << ") !";
 555               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 556             }
 557           const DataArrayInt *ids(idsPerType[pos]);
 558           if(!ids || !ids->isAllocated() || ids->getNumberOfComponents()!=1 || ids->getNumberOfTuples()!=nbOfEltInChunk || ids->getMinValueInArray()<0)
 559             {
 560               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input pfl chunck at pos " << pos << " should have " << i << " tuples and one component and with ids all >=0 !";
 561               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 562             }
 563         }
 564       ret+=nbOfEltInChunk;
 565     }
 566   return ret;
 567 }
 568
 569 int MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfMeshPlaces(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 570 {
 571   if(!mesh)
 572     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getNumberOfMeshPlaces : NULL input mesh !");
 573   return mesh->getNumberOfCells();
 574 }
 575
 576 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getOffsetArr(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 577 {
 578   if(!mesh)
 579     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getOffsetArr : NULL input mesh !");
 580   int nbOfTuples=mesh->getNumberOfCells();
 581   DataArrayInt *ret=DataArrayInt::New();
 582   ret->alloc(nbOfTuples+1,1);
 583   ret->iota(0);
 584   return ret;
 585 }
 586
 587 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::renumberArraysForCell(const MEDCouplingMesh *mesh, const std::vector<DataArray *>& arrays,
 588                                                              const int *old2NewBg, bool check)
 589 {
 590   if(!mesh)
 591     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::renumberArraysForCell : NULL input mesh !");
 592   const int *array=old2NewBg;
 593   if(check)
 594     array=DataArrayInt::CheckAndPreparePermutation(old2NewBg,old2NewBg+mesh->getNumberOfCells());
 595   for(std::vector<DataArray *>::const_iterator it=arrays.begin();it!=arrays.end();it++)
 596     {
 597       if(*it)
 598         (*it)->renumberInPlace(array);
 599     }
 600   if(check)
 601     free(const_cast<int *>(array));
 602 }
 603
 604 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getLocalizationOfDiscValues(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 605 {
 606   if(!mesh)
 607     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getLocalizationOfDiscValues : NULL input mesh !");
 608   return mesh->getBarycenterAndOwner();
 609 }
 610
 611 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::computeMeshRestrictionFromTupleIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *tupleIdsBg, const int *tupleIdsEnd,
 612                                                                           DataArrayInt *&cellRestriction, DataArrayInt *&trueTupleRestriction) const
 613 {
 614   if(!mesh)
 615     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::computeMeshRestrictionFromTupleIds : NULL input mesh !");
 616   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=DataArrayInt::New();
 617   tmp->alloc((int)std::distance(tupleIdsBg,tupleIdsEnd),1);
 618   std::copy(tupleIdsBg,tupleIdsEnd,tmp->getPointer());
 619   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp2(tmp->deepCpy());
 620   cellRestriction=tmp.retn();
 621   trueTupleRestriction=tmp2.retn();
 622 }
 623
 624 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
 625 {
 626   stream << "P0 spatial discretization.";
 627 }
 628
 629 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::checkCompatibilityWithNature(NatureOfField nat) const
 630 {
 631 }
 632
 633 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::checkCoherencyBetween(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArray *da) const
 634 {
 635   if(!mesh || !da)
 636     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::checkCoherencyBetween : NULL input mesh or DataArray !");
 637   if(mesh->getNumberOfCells()!=da->getNumberOfTuples())
 638     {
 639       std::ostringstream message;
 640       message << "Field on cells invalid because there are " << mesh->getNumberOfCells();
 641       message << " cells in mesh and " << da->getNumberOfTuples() << " tuples in field !";
 642       throw INTERP_KERNEL::Exception(message.str().c_str());
 643     }
 644 }
 645
 646 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getMeasureField(const MEDCouplingMesh *mesh, bool isAbs) const
 647 {
 648   if(!mesh)
 649     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getMeasureField : mesh instance specified is NULL !");
 650   return mesh->getMeasureField(isAbs);
 651 }
 652
 653 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getValueOn(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, double *res) const
 654 {
 655   if(!mesh)
 656     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getValueOn : NULL input mesh !");
 657   int id=mesh->getCellContainingPoint(loc,_precision);
 658   if(id==-1)
 659     throw INTERP_KERNEL::Exception("Specified point is detected outside of mesh : unable to apply P0::getValueOn !");
 660   arr->getTuple(id,res);
 661 }
 662
 663 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getValueOnPos(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, int i, int j, int k, double *res) const
 664 {
 665   const MEDCouplingCMesh *meshC=dynamic_cast<const MEDCouplingCMesh *>(mesh);
 666   if(!meshC)
 667     throw INTERP_KERNEL::Exception("P0::getValueOnPos is only accessible for structured meshes !");
 668   int id=meshC->getCellIdFromPos(i,j,k);
 669   arr->getTuple(id,res);
 670 }
 671
 672 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getValueOnMulti(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, int nbOfPoints) const
 673 {
 674   if(!mesh)
 675     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::getValueOnMulti : NULL input mesh !");
 676   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> eltsArr,eltsIndexArr;
 677   mesh->getCellsContainingPoints(loc,nbOfPoints,_precision,eltsArr,eltsIndexArr);
 678   const int *elts(eltsArr->begin()),*eltsIndex(eltsIndexArr->begin());
 679   int spaceDim=mesh->getSpaceDimension();
 680   int nbOfComponents=arr->getNumberOfComponents();
 681   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
 682   ret->alloc(nbOfPoints,nbOfComponents);
 683   double *ptToFill=ret->getPointer();
 684   for(int i=0;i<nbOfPoints;i++,ptToFill+=nbOfComponents)
 685     if(eltsIndex[i+1]-eltsIndex[i]>=1)
 686       arr->getTuple(elts[eltsIndex[i]],ptToFill);
 687     else
 688       {
 689         std::ostringstream oss; oss << "Point #" << i << " with coordinates : (";
 690         std::copy(loc+i*spaceDim,loc+(i+1)*spaceDim,std::ostream_iterator<double>(oss,", "));
 691         oss << ") detected outside mesh : unable to apply P0::getValueOnMulti ! ";
 692         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 693       }
 694   return ret.retn();
 695 }
 696
 697 /*!
 698  * Nothing to do. It's not a bug.
 699  */
 700 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::renumberValuesOnNodes(double , const int *, int newNbOfNodes, DataArrayDouble *) const
 701 {
 702 }
 703
 704 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::renumberValuesOnCells(double epsOnVals, const MEDCouplingMesh *mesh, const int *old2New, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
 705 {
 706   RenumberEntitiesFromO2NArr(epsOnVals,old2New,newSz,arr,"Cell");
 707 }
 708
 709 void MEDCouplingFieldDiscretizationP0::renumberValuesOnCellsR(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *new2old, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
 710 {
 711   RenumberEntitiesFromN2OArr(new2old,newSz,arr,"Cell");
 712 }
 713
 714 /*!
 715  * This method returns a tuple ids selection from cell ids selection [start;end).
 716  * This method is called by MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshData to return parameter \b di.
 717  * Here for P0 it's very simple !
 718  *
 719  * \return a newly allocated array containing ids to select into the DataArrayDouble of the field.
 720  *
 721  */
 722 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::computeTupleIdsToSelectFromCellIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *startCellIds, const int *endCellIds) const
 723 {
 724   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 725   ret->alloc((int)std::distance(startCellIds,endCellIds),1);
 726   std::copy(startCellIds,endCellIds,ret->getPointer());
 727   return ret.retn();
 728 }
 729
 730 /*!
 731  * This method returns a submesh of 'mesh' instance constituting cell ids contained in array defined as an interval [start;end).
 732  * @param di is an array returned that specifies entity ids (here cells ids) in mesh 'mesh' of entity in returned submesh.
 733  * Example : The first cell id of returned mesh has the (*di)[0] id in 'mesh'
 734  *
 735  * \sa MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshDataRange
 736  */
 737 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshData(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *start, const int *end, DataArrayInt *&di) const
 738 {
 739   if(!mesh)
 740     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshData : NULL input mesh !");
 741   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPart(start,end);
 742   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diSafe=DataArrayInt::New();
 743   diSafe->alloc((int)std::distance(start,end),1);
 744   std::copy(start,end,diSafe->getPointer());
 745   di=diSafe.retn();
 746   return ret.retn();
 747 }
 748
 749 /*!
 750  * This method is strictly equivalent to MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshData except that it is optimized for input defined as a range of cell ids.
 751  *
 752  * \param [out] beginOut Valid only if \a di is NULL
 753  * \param [out] endOut Valid only if \a di is NULL
 754  * \param [out] stepOut Valid only if \a di is NULL
 755  * \param [out] di is an array returned that specifies entity ids (nodes, cells, Gauss points... ) in array if no output range is foundable.
 756  *
 757  * \sa MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshData
 758  */
 759 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshDataRange(const MEDCouplingMesh *mesh, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt *&di) const
 760 {
 761   if(!mesh)
 762     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP0::buildSubMeshDataRange : NULL input mesh !");
 763   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPartRange(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
 764   di=0; beginOut=beginCellIds; endOut=endCellIds; stepOut=stepCellIds;
 765   return ret.retn();
 766 }
 767
 768 int MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfTuples(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 769 {
 770   if(!mesh)
 771     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::getNumberOfTuples : NULL input mesh !");
 772   return mesh->getNumberOfNodes();
 773 }
 774
 775 /*!
 776  * This method returns the number of tuples regarding exclusively the input code \b without \b using \b a \b mesh \b in \b input.
 777  * The input code coherency is also checked regarding spatial discretization of \a this.
 778  * If an incoherency is detected, an exception will be thrown. If the input code is coherent, the number of tuples expected is returned.
 779  * The number of tuples expected is equal to those to have a valid field lying on \a this and having a mesh fitting perfectly the input code (geometric type distribution).
 780  */
 781 int MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
 782 {
 783   if(code.size()%3!=0)
 784     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code !");
 785   int nbOfSplit=(int)idsPerType.size();
 786   int nbOfTypes=(int)code.size()/3;
 787   int ret=0;
 788   for(int i=0;i<nbOfTypes;i++)
 789     {
 790       int nbOfEltInChunk=code[3*i+1];
 791       if(nbOfEltInChunk<0)
 792         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code ! presence of negative value in a type !");
 793       int pos=code[3*i+2];
 794       if(pos!=-1)
 795         {
 796           if(pos<0 || pos>=nbOfSplit)
 797             {
 798               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input code points to pos " << pos << " in typeid " << i << " ! Should be in [0," << nbOfSplit << ") !";
 799               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 800             }
 801           const DataArrayInt *ids(idsPerType[pos]);
 802           if(!ids || !ids->isAllocated() || ids->getNumberOfComponents()!=1 || ids->getNumberOfTuples()!=nbOfEltInChunk || ids->getMinValueInArray()<0)
 803             {
 804               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input pfl chunck at pos " << pos << " should have " << i << " tuples and one component and with ids all >=0 !";
 805               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
 806             }
 807         }
 808       ret+=nbOfEltInChunk;
 809     }
 810   return ret;
 811 }
 812
 813 int MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getNumberOfMeshPlaces(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 814 {
 815   if(!mesh)
 816     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::getNumberOfMeshPlaces : NULL input mesh !");
 817   return mesh->getNumberOfNodes();
 818 }
 819
 820 /*!
 821  * Nothing to do here.
 822  */
 823 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::renumberArraysForCell(const MEDCouplingMesh *, const std::vector<DataArray *>& arrays,
 824                                                                   const int *old2NewBg, bool check)
 825 {
 826 }
 827
 828 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getOffsetArr(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 829 {
 830   if(!mesh)
 831     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::getOffsetArr : NULL input mesh !");
 832   int nbOfTuples=mesh->getNumberOfNodes();
 833   DataArrayInt *ret=DataArrayInt::New();
 834   ret->alloc(nbOfTuples+1,1);
 835   ret->iota(0);
 836   return ret;
 837 }
 838
 839 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getLocalizationOfDiscValues(const MEDCouplingMesh *mesh) const
 840 {
 841   if(!mesh)
 842     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::getLocalizationOfDiscValues : NULL input mesh !");
 843   return mesh->getCoordinatesAndOwner();
 844 }
 845
 846 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::computeMeshRestrictionFromTupleIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *tupleIdsBg, const int *tupleIdsEnd,
 847                                                                                DataArrayInt *&cellRestriction, DataArrayInt *&trueTupleRestriction) const
 848 {
 849   if(!mesh)
 850     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::computeMeshRestrictionFromTupleIds : NULL input mesh !");
 851   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret1=mesh->getCellIdsFullyIncludedInNodeIds(tupleIdsBg,tupleIdsEnd);
 852   const MEDCouplingUMesh *meshc=dynamic_cast<const MEDCouplingUMesh *>(mesh);
 853   if(!meshc)
 854     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::computeMeshRestrictionFromTupleIds : trying to subpart field on nodes by node ids ! Your mesh has to be unstructured !");
 855   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> meshPart=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(meshc->buildPartOfMySelf(ret1->begin(),ret1->end(),true));
 856   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2=meshPart->computeFetchedNodeIds();
 857   cellRestriction=ret1.retn();
 858   trueTupleRestriction=ret2.retn();
 859 }
 860
 861 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::checkCoherencyBetween(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArray *da) const
 862 {
 863   if(!mesh || !da)
 864     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::checkCoherencyBetween : NULL input mesh or DataArray !");
 865   if(mesh->getNumberOfNodes()!=da->getNumberOfTuples())
 866     {
 867       std::ostringstream message;
 868       message << "Field on nodes invalid because there are " << mesh->getNumberOfNodes();
 869       message << " nodes in mesh and " << da->getNumberOfTuples() << " tuples in field !";
 870       throw INTERP_KERNEL::Exception(message.str().c_str());
 871     }
 872 }
 873
 874 /*!
 875  * This method returns a submesh of 'mesh' instance constituting cell ids contained in array defined as an interval [start;end).
 876  * @param di is an array returned that specifies entity ids (here nodes ids) in mesh 'mesh' of entity in returned submesh.
 877  * Example : The first node id of returned mesh has the (*di)[0] id in 'mesh'
 878  */
 879 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::buildSubMeshData(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *start, const int *end, DataArrayInt *&di) const
 880 {
 881   if(!mesh)
 882     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::buildSubMeshData : NULL input mesh !");
 883   DataArrayInt *diTmp=0;
 884   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPartAndReduceNodes(start,end,diTmp);
 885   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diTmpSafe(diTmp);
 886   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> di2=diTmpSafe->invertArrayO2N2N2O(ret->getNumberOfNodes());
 887   di=di2.retn();
 888   return ret.retn();
 889 }
 890
 891 /*!
 892  * This method is strictly equivalent to MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::buildSubMeshData except that it is optimized for input defined as a range of cell ids.
 893  *
 894  * \param [out] beginOut Valid only if \a di is NULL
 895  * \param [out] endOut Valid only if \a di is NULL
 896  * \param [out] stepOut Valid only if \a di is NULL
 897  * \param [out] di is an array returned that specifies entity ids (nodes, cells, Gauss points... ) in array if no output range is foundable.
 898  *
 899  * \sa MEDCouplingFieldDiscretizationNodes::buildSubMeshData
 900  */
 901 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::buildSubMeshDataRange(const MEDCouplingMesh *mesh, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt *&di) const
 902 {
 903   if(!mesh)
 904     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::buildSubMeshDataRange : NULL input mesh !");
 905   DataArrayInt *diTmp=0;
 906   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPartRangeAndReduceNodes(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds,beginOut,endOut,stepOut,diTmp);
 907   if(diTmp)
 908     {
 909       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diTmpSafe(diTmp);
 910       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> di2=diTmpSafe->invertArrayO2N2N2O(ret->getNumberOfNodes());
 911       di=di2.retn();
 912     }
 913   return ret.retn();
 914 }
 915
 916 /*!
 917  * This method returns a tuple ids selection from cell ids selection [start;end).
 918  * This method is called by MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::buildSubMeshData to return parameter \b di.
 919  * Here for P1 only nodes fetched by submesh of mesh[startCellIds:endCellIds) is returned !
 920  *
 921  * \return a newly allocated array containing ids to select into the DataArrayDouble of the field.
 922  *
 923  */
 924 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::computeTupleIdsToSelectFromCellIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *startCellIds, const int *endCellIds) const
 925 {
 926   if(!mesh)
 927     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP1::computeTupleIdsToSelectFromCellIds : NULL input mesh !");
 928   const MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> umesh=mesh->buildUnstructured();
 929   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> umesh2=static_cast<MEDCouplingUMesh *>(umesh->buildPartOfMySelf(startCellIds,endCellIds,true));
 930   return umesh2->computeFetchedNodeIds();
 931 }
 932
 933 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::renumberValuesOnNodes(double epsOnVals, const int *old2NewPtr, int newNbOfNodes, DataArrayDouble *arr) const
 934 {
 935   RenumberEntitiesFromO2NArr(epsOnVals,old2NewPtr,newNbOfNodes,arr,"Node");
 936 }
 937
 938 /*!
 939  * Nothing to do it's not a bug.
 940  */
 941 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::renumberValuesOnCells(double epsOnVals, const MEDCouplingMesh *mesh, const int *old2New, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
 942 {
 943 }
 944
 945 /*!
 946  * Nothing to do it's not a bug.
 947  */
 948 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::renumberValuesOnCellsR(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *new2old, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
 949 {
 950 }
 951
 952 void MEDCouplingFieldDiscretizationOnNodes::getValueOnPos(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, int i, int j, int k, double *res) const
 953 {
 954   const MEDCouplingCMesh *meshC=dynamic_cast<const MEDCouplingCMesh *>(mesh);
 955   if(!meshC)
 956     throw INTERP_KERNEL::Exception("OnNodes::getValueOnPos(i,j,k) is only accessible for structured meshes !");
 957   int id=meshC->getNodeIdFromPos(i,j,k);
 958   arr->getTuple(id,res);
 959 }
 960
 961 TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getEnum() const
 962 {
 963   return TYPE;
 964 }
 965
 966 /*!
 967  * This method is simply called by MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy. It performs the deep copy of \a this.
 968  *
 969  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy.
 970  */
 971 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationP1::clone() const
 972 {
 973   return new MEDCouplingFieldDiscretizationP1;
 974 }
 975
 976 std::string MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getStringRepr() const
 977 {
 978   return std::string(REPR);
 979 }
 980
 981 const char *MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getRepr() const
 982 {
 983   return REPR;
 984 }
 985
 986 bool MEDCouplingFieldDiscretizationP1::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps, std::string& reason) const
 987 {
 988   if(!other)
 989     {
 990       reason="other spatial discretization is NULL, and this spatial discretization (P1) is defined.";
 991       return false;
 992     }
 993   const MEDCouplingFieldDiscretizationP1 *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationP1 *>(other);
 994   bool ret=otherC!=0;
 995   if(!ret)
 996     reason="Spatial discrtization of this is ON_NODES, which is not the case of other.";
 997   return ret;
 998 }
 999
1000 void MEDCouplingFieldDiscretizationP1::checkCompatibilityWithNature(NatureOfField nat) const
1001 {
1002   if(nat!=ConservativeVolumic)
1003     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid nature for P1 field  : expected ConservativeVolumic !");
1004 }
1005
1006 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getMeasureField(const MEDCouplingMesh *mesh, bool isAbs) const
1007 {
1008   if(!mesh)
1009     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getMeasureField : mesh instance specified is NULL !");
1010   return mesh->getMeasureFieldOnNode(isAbs);
1011 }
1012
1013 void MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getValueOn(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, double *res) const
1014 {
1015   if(!mesh)
1016     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getValueOn : NULL input mesh !");
1017   int id=mesh->getCellContainingPoint(loc,_precision);
1018   if(id==-1)
1019     throw INTERP_KERNEL::Exception("Specified point is detected outside of mesh : unable to apply P1::getValueOn !");
1020   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(id);
1021   if(type!=INTERP_KERNEL::NORM_SEG2 && type!=INTERP_KERNEL::NORM_TRI3 && type!=INTERP_KERNEL::NORM_TETRA4)
1022     throw INTERP_KERNEL::Exception("P1 getValueOn is not specified for not simplex cells !");
1023   getValueInCell(mesh,id,arr,loc,res);
1024 }
1025
1026 /*!
1027  * This method localizes a point defined by 'loc' in a cell with id 'cellId' into mesh 'mesh'.
1028  * The result is put into res expected to be of size at least arr->getNumberOfComponents()
1029  */
1030 void MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getValueInCell(const MEDCouplingMesh *mesh, int cellId, const DataArrayDouble *arr, const double *loc, double *res) const
1031 {
1032   if(!mesh)
1033     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getValueInCell : NULL input mesh !");
1034   std::vector<int> conn;
1035   std::vector<double> coo;
1036   mesh->getNodeIdsOfCell(cellId,conn);
1037   for(std::vector<int>::const_iterator iter=conn.begin();iter!=conn.end();iter++)
1038     mesh->getCoordinatesOfNode(*iter,coo);
1039   int spaceDim=mesh->getSpaceDimension();
1040   std::size_t nbOfNodes=conn.size();
1041   std::vector<const double *> vec(nbOfNodes);
1042   for(std::size_t i=0;i<nbOfNodes;i++)
1043     vec[i]=&coo[i*spaceDim];
1044   INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> tmp=new double[nbOfNodes];
1045   INTERP_KERNEL::barycentric_coords(vec,loc,tmp);
1046   int sz=arr->getNumberOfComponents();
1047   INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> tmp2=new double[sz];
1048   std::fill(res,res+sz,0.);
1049   for(std::size_t i=0;i<nbOfNodes;i++)
1050     {
1051       arr->getTuple(conn[i],(double *)tmp2);
1052       std::transform((double *)tmp2,((double *)tmp2)+sz,(double *)tmp2,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),tmp[i]));
1053       std::transform(res,res+sz,(double *)tmp2,res,std::plus<double>());
1054     }
1055 }
1056
1057 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getValueOnMulti(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, int nbOfPoints) const
1058 {
1059   if(!mesh)
1060     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationP1::getValueOnMulti : NULL input mesh !");
1061   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> eltsArr,eltsIndexArr;
1062   mesh->getCellsContainingPoints(loc,nbOfPoints,_precision,eltsArr,eltsIndexArr);
1063   const int *elts(eltsArr->begin()),*eltsIndex(eltsIndexArr->begin());
1064   int spaceDim=mesh->getSpaceDimension();
1065   int nbOfComponents=arr->getNumberOfComponents();
1066   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
1067   ret->alloc(nbOfPoints,nbOfComponents);
1068   double *ptToFill=ret->getPointer();
1069   for(int i=0;i<nbOfPoints;i++)
1070     if(eltsIndex[i+1]-eltsIndex[i]>=1)
1071       getValueInCell(mesh,elts[eltsIndex[i]],arr,loc+i*spaceDim,ptToFill+i*nbOfComponents);
1072     else
1073       {
1074         std::ostringstream oss; oss << "Point #" << i << " with coordinates : (";
1075         std::copy(loc+i*spaceDim,loc+(i+1)*spaceDim,std::ostream_iterator<double>(oss,", "));
1076         oss << ") detected outside mesh : unable to apply P1::getValueOnMulti ! ";
1077         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1078       }
1079   return ret.retn();
1080 }
1081
1082 void MEDCouplingFieldDiscretizationP1::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
1083 {
1084   stream << "P1 spatial discretization.";
1085 }
1086
1087 MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell():_discr_per_cell(0)
1088 {
1089 }
1090
1091 MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::~MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell()
1092 {
1093   if(_discr_per_cell)
1094     _discr_per_cell->decrRef();
1095 }
1096
1097 /*!
1098  * This constructor deep copies ParaMEDMEM::DataArrayInt instance from other (if any).
1099  */
1100 MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell(const MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell& other, const int *startCellIds, const int *endCellIds):_discr_per_cell(0)
1101 {
1102   DataArrayInt *arr=other._discr_per_cell;
1103   if(arr)
1104     {
1105       if(startCellIds==0 && endCellIds==0)
1106         _discr_per_cell=arr->deepCpy();
1107       else
1108         _discr_per_cell=arr->selectByTupleIdSafe(startCellIds,endCellIds);
1109     }
1110 }
1111
1112 MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell(const MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell& other, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds):_discr_per_cell(0)
1113 {
1114   DataArrayInt *arr=other._discr_per_cell;
1115   if(arr)
1116     {
1117       _discr_per_cell=arr->selectByTupleId2(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
1118     }
1119 }
1120
1121 void MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::updateTime() const
1122 {
1123   if(_discr_per_cell)
1124     updateTimeWith(*_discr_per_cell);
1125 }
1126
1127 std::size_t MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1128 {
1129   std::size_t ret(MEDCouplingFieldDiscretization::getHeapMemorySizeWithoutChildren());
1130   return ret;
1131 }
1132
1133 std::vector<const BigMemoryObject *> MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::getDirectChildrenWithNull() const
1134 {
1135   std::vector<const BigMemoryObject *> ret(MEDCouplingFieldDiscretization::getDirectChildrenWithNull());
1136   ret.push_back(_discr_per_cell);
1137   return ret;
1138 }
1139
1140 void MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::checkCoherencyBetween(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArray *da) const
1141 {
1142   if(!_discr_per_cell)
1143     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell has no discretization per cell !");
1144   if(!mesh)
1145     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::checkCoherencyBetween : NULL input mesh or DataArray !");
1146   int nbOfTuples=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1147   if(nbOfTuples!=mesh->getNumberOfCells())
1148     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell has a discretization per cell but it's not matching the underlying mesh !");
1149 }
1150
1151 bool MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps, std::string& reason) const
1152 {
1153   if(!other)
1154     {
1155       reason="other spatial discretization is NULL, and this spatial discretization (PerCell) is defined.";
1156       return false;
1157     }
1158   const MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell *>(other);
1159   if(!otherC)
1160     {
1161       reason="Spatial discretization of this is ON_GAUSS, which is not the case of other.";
1162       return false;
1163     }
1164   if(_discr_per_cell==0)
1165     return otherC->_discr_per_cell==0;
1166   if(otherC->_discr_per_cell==0)
1167     return false;
1168   bool ret=_discr_per_cell->isEqualIfNotWhy(*otherC->_discr_per_cell,reason);
1169   if(!ret)
1170     reason.insert(0,"Field discretization per cell DataArrayInt given the discid per cell :");
1171   return ret;
1172 }
1173
1174 bool MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps) const
1175 {
1176   const MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell *>(other);
1177   if(!otherC)
1178     return false;
1179   if(_discr_per_cell==0)
1180     return otherC->_discr_per_cell==0;
1181   if(otherC->_discr_per_cell==0)
1182     return false;
1183   return _discr_per_cell->isEqualWithoutConsideringStr(*otherC->_discr_per_cell);
1184 }
1185
1186 /*!
1187  * This method is typically the first step of renumbering. The impact on _discr_per_cell is necessary here.
1188  * virtualy by this method.
1189  */
1190 void MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::renumberCells(const int *old2NewBg, bool check)
1191 {
1192   int nbCells=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1193   const int *array=old2NewBg;
1194   if(check)
1195     array=DataArrayInt::CheckAndPreparePermutation(old2NewBg,old2NewBg+nbCells);
1196   //
1197   DataArrayInt *dpc=_discr_per_cell->renumber(array);
1198   _discr_per_cell->decrRef();
1199   _discr_per_cell=dpc;
1200   //
1201   if(check)
1202     free(const_cast<int *>(array));
1203 }
1204
1205 void MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::buildDiscrPerCellIfNecessary(const MEDCouplingMesh *mesh)
1206 {
1207   if(!mesh)
1208     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::buildDiscrPerCellIfNecessary : NULL input mesh !");
1209   if(!_discr_per_cell)
1210     {
1211       _discr_per_cell=DataArrayInt::New();
1212       int nbTuples=mesh->getNumberOfCells();
1213       _discr_per_cell->alloc(nbTuples,1);
1214       int *ptr=_discr_per_cell->getPointer();
1215       std::fill(ptr,ptr+nbTuples,DFT_INVALID_LOCID_VALUE);
1216     }
1217 }
1218
1219 void MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::checkNoOrphanCells() const
1220 {
1221   if(!_discr_per_cell)
1222     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::checkNoOrphanCells : no discretization defined !");
1223   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> test=_discr_per_cell->getIdsEqual(DFT_INVALID_LOCID_VALUE);
1224   if(test->getNumberOfTuples()!=0)
1225     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::checkNoOrphanCells : presence of orphan cells !");
1226 }
1227
1228 /*!
1229  * This method is useful when 'this' describes a field discretization with several gauss discretization on a \b same cell type.
1230  * For example same NORM_TRI3 cells having 6 gauss points and others with 12 gauss points.
1231  * This method returns 2 arrays with same size : the return value and 'locIds' output parameter.
1232  * For a given i into [0,locIds.size) ret[i] represents the set of cell ids of i_th set an locIds[i] represents the set of discretisation of the set.
1233  * The return vector contains a set of newly created instance to deal with.
1234  * The returned vector represents a \b partition of cells ids with a gauss discretization set.
1235  *
1236  * If no descretization is set in 'this' and exception will be thrown.
1237  */
1238 std::vector<DataArrayInt *> MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::splitIntoSingleGaussDicrPerCellType(std::vector<int>& locIds) const
1239 {
1240   if(!_discr_per_cell)
1241     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::splitIntoSingleGaussDicrPerCellType : no descretization set !");
1242   return _discr_per_cell->partitionByDifferentValues(locIds);
1243 }
1244
1245 const DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::getArrayOfDiscIds() const
1246 {
1247   return _discr_per_cell;
1248 }
1249
1250 void MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::setArrayOfDiscIds(const DataArrayInt *adids)
1251 {
1252   if(adids!=_discr_per_cell)
1253     {
1254       if(_discr_per_cell)
1255         _discr_per_cell->decrRef();
1256       _discr_per_cell=const_cast<DataArrayInt *>(adids);
1257       if(_discr_per_cell)
1258         _discr_per_cell->incrRef();
1259       declareAsNew();
1260     }
1261 }
1262
1263 MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::MEDCouplingFieldDiscretizationGauss()
1264 {
1265 }
1266
1267 MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::MEDCouplingFieldDiscretizationGauss(const MEDCouplingFieldDiscretizationGauss& other, const int *startCellIds, const int *endCellIds):MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell(other,startCellIds,endCellIds),_loc(other._loc)
1268 {
1269 }
1270
1271 MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::MEDCouplingFieldDiscretizationGauss(const MEDCouplingFieldDiscretizationGauss& other, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds):MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell(other,beginCellIds,endCellIds,stepCellIds),_loc(other._loc)
1272 {
1273 }
1274
1275 TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getEnum() const
1276 {
1277   return TYPE;
1278 }
1279
1280 bool MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps, std::string& reason) const
1281 {
1282   if(!other)
1283     {
1284       reason="other spatial discretization is NULL, and this spatial discretization (Gauss) is defined.";
1285       return false;
1286     }
1287   const MEDCouplingFieldDiscretizationGauss *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationGauss *>(other);
1288   if(!otherC)
1289     {
1290       reason="Spatial discrtization of this is ON_GAUSS, which is not the case of other.";
1291       return false;
1292     }
1293   if(!MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::isEqualIfNotWhy(other,eps,reason))
1294     return false;
1295   if(_loc.size()!=otherC->_loc.size())
1296     {
1297       reason="Gauss spatial discretization : localization sizes differ";
1298       return false;
1299     }
1300   std::size_t sz=_loc.size();
1301   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1302     if(!_loc[i].isEqual(otherC->_loc[i],eps))
1303       {
1304         std::ostringstream oss; oss << "Gauss spatial discretization : Localization #" << i << " differ from this to other.";
1305         reason=oss.str();
1306         return false;
1307       }
1308   return true;
1309 }
1310
1311 bool MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps) const
1312 {
1313   const MEDCouplingFieldDiscretizationGauss *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationGauss *>(other);
1314   if(!otherC)
1315     return false;
1316   if(!MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::isEqualWithoutConsideringStr(other,eps))
1317     return false;
1318   if(_loc.size()!=otherC->_loc.size())
1319     return false;
1320   std::size_t sz=_loc.size();
1321   for(std::size_t i=0;i<sz;i++)
1322     if(!_loc[i].isEqual(otherC->_loc[i],eps))
1323       return false;
1324   return true;
1325 }
1326
1327 /*!
1328  * This method is simply called by MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy. It performs the deep copy of \a this.
1329  *
1330  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy.
1331  */
1332 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::clone() const
1333 {
1334   return new MEDCouplingFieldDiscretizationGauss(*this);
1335 }
1336
1337 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::clonePart(const int *startCellIds, const int *endCellIds) const
1338 {
1339   return new MEDCouplingFieldDiscretizationGauss(*this,startCellIds,endCellIds);
1340 }
1341
1342 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::clonePartRange(int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds) const
1343 {
1344   return new MEDCouplingFieldDiscretizationGauss(*this,beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
1345 }
1346
1347 std::string MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getStringRepr() const
1348 {
1349   std::ostringstream oss; oss << REPR << "." << std::endl;
1350   if(_discr_per_cell)
1351     {
1352       if(_discr_per_cell->isAllocated())
1353         {
1354           oss << "Discretization per cell : ";
1355           std::copy(_discr_per_cell->begin(),_discr_per_cell->end(),std::ostream_iterator<int>(oss,", "));
1356           oss << std::endl;
1357         }
1358     }
1359   oss << "Presence of " << _loc.size() << " localizations." << std::endl;
1360   int i=0;
1361   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::const_iterator it=_loc.begin();it!=_loc.end();it++,i++)
1362     {
1363       oss << "+++++ Localization #" << i << " +++++" << std::endl;
1364       oss << (*it).getStringRepr();
1365       oss << "++++++++++" << std::endl;
1366     }
1367   return oss.str();
1368 }
1369
1370 std::size_t MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getHeapMemorySizeWithoutChildren() const
1371 {
1372   std::size_t ret(MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::getHeapMemorySizeWithoutChildren());
1373   ret+=_loc.capacity()*sizeof(MEDCouplingGaussLocalization);
1374   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::const_iterator it=_loc.begin();it!=_loc.end();it++)
1375     ret+=(*it).getMemorySize();
1376   return ret;
1377 }
1378
1379 const char *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getRepr() const
1380 {
1381   return REPR;
1382 }
1383
1384 /*!
1385  * This method returns the number of tuples regarding exclusively the input code \b without \b using \b a \b mesh \b in \b input.
1386  * The input code coherency is also checked regarding spatial discretization of \a this.
1387  * If an incoherency is detected, an exception will be thrown. If the input code is coherent, the number of tuples expected is returned.
1388  * The number of tuples expected is equal to those to have a valid field lying on \a this and having a mesh fitting perfectly the input code (geometric type distribution).
1389  */
1390 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
1391 {
1392   if(!_discr_per_cell || !_discr_per_cell->isAllocated() || _discr_per_cell->getNumberOfComponents()!=1)
1393     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode");
1394   if(code.size()%3!=0)
1395     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code !");
1396   int nbOfSplit=(int)idsPerType.size();
1397   int nbOfTypes=(int)code.size()/3;
1398   int ret=0;
1399   for(int i=0;i<nbOfTypes;i++)
1400     {
1401       int nbOfEltInChunk=code[3*i+1];
1402       if(nbOfEltInChunk<0)
1403         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code ! presence of negative value in a type !");
1404       int pos=code[3*i+2];
1405       if(pos!=-1)
1406         {
1407           if(pos<0 || pos>=nbOfSplit)
1408             {
1409               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input code points to pos " << pos << " in typeid " << i << " ! Should be in [0," << nbOfSplit << ") !";
1410               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1411             }
1412           const DataArrayInt *ids(idsPerType[pos]);
1413           if(!ids || !ids->isAllocated() || ids->getNumberOfComponents()!=1 || ids->getNumberOfTuples()!=nbOfEltInChunk || ids->getMinValueInArray()<0)
1414             {
1415               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input pfl chunck at pos " << pos << " should have " << i << " tuples and one component and with ids all >=0 !";
1416               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1417             }
1418         }
1419       ret+=nbOfEltInChunk;
1420     }
1421   if(ret!=_discr_per_cell->getNumberOfTuples())
1422     {
1423       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input code points to " << ret << " cells whereas discretization percell array lgth is " <<  _discr_per_cell->getNumberOfTuples() << " !";
1424       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1425     }
1426   return getNumberOfTuples(0);//0 is not an error ! It is to be sure that input mesh is not used
1427 }
1428
1429 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuples(const MEDCouplingMesh *) const
1430 {
1431   int ret=0;
1432   if (_discr_per_cell == 0)
1433     throw INTERP_KERNEL::Exception("Discretization is not initialized!");
1434   const int *dcPtr=_discr_per_cell->getConstPointer();
1435   int nbOfTuples=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1436   int maxSz=(int)_loc.size();
1437   for(const int *w=dcPtr;w!=dcPtr+nbOfTuples;w++)
1438     {
1439       if(*w>=0 && *w<maxSz)
1440         ret+=_loc[*w].getNumberOfGaussPt();
1441       else
1442         {
1443           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfTuples : At cell #" << std::distance(dcPtr,w) << " localization id is " << *w << " should be in [0," << maxSz << ") !";
1444           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1445         }
1446     }
1447   return ret;
1448 }
1449
1450 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfMeshPlaces(const MEDCouplingMesh *mesh) const
1451 {
1452   if(!mesh)
1453     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNumberOfMeshPlaces : NULL input mesh !");
1454   return mesh->getNumberOfCells();
1455 }
1456
1457 /*!
1458  * This method is redevelopped for performance reasons, but it is equivalent to a call to MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildNbOfGaussPointPerCellField
1459  * and a call to DataArrayDouble::computeOffsets2 on the returned array.
1460  */
1461 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getOffsetArr(const MEDCouplingMesh *mesh) const
1462 {
1463   if(!mesh)
1464     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getOffsetArr : NULL input mesh !");
1465   int nbOfTuples=mesh->getNumberOfCells();
1466   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
1467   ret->alloc(nbOfTuples+1,1);
1468   int *retPtr=ret->getPointer();
1469   const int *start=_discr_per_cell->getConstPointer();
1470   if(_discr_per_cell->getNumberOfTuples()!=nbOfTuples)
1471     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getOffsetArr : mismatch between the mesh and the discretization ids array length !");
1472   int maxPossible=(int)_loc.size();
1473   retPtr[0]=0;
1474   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++,start++)
1475     {
1476       if(*start>=0 && *start<maxPossible)
1477         retPtr[i+1]=retPtr[i]+_loc[*start].getNumberOfGaussPt();
1478       else
1479         {
1480           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getOffsetArr : At position #" << i << " the locid = " << *start << " whereas it should be in [0," << maxPossible << ") !";
1481           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1482         }
1483     }
1484   return ret.retn();
1485 }
1486
1487 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::renumberArraysForCell(const MEDCouplingMesh *mesh, const std::vector<DataArray *>& arrays,
1488                                                                 const int *old2NewBg, bool check)
1489 {
1490   if(!mesh)
1491     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::renumberArraysForCell : NULL input mesh !");
1492   const int *array=old2NewBg;
1493   if(check)
1494     array=DataArrayInt::CheckAndPreparePermutation(old2NewBg,old2NewBg+mesh->getNumberOfCells());
1495   int nbOfCells=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1496   int nbOfTuples=getNumberOfTuples(0);
1497   const int *dcPtr=_discr_per_cell->getConstPointer();
1498   int *array2=new int[nbOfTuples];//stores the final conversion array old2New to give to arrays in renumberInPlace.
1499   int *array3=new int[nbOfCells];//store for each cell in present dcp array (already renumbered) the offset needed by each cell in new numbering.
1500   array3[0]=0;
1501   for(int i=1;i<nbOfCells;i++)
1502     array3[i]=array3[i-1]+_loc[dcPtr[i-1]].getNumberOfGaussPt();
1503   int j=0;
1504   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
1505     {
1506       int nbOfGaussPt=_loc[dcPtr[array[i]]].getNumberOfGaussPt();
1507       for(int k=0;k<nbOfGaussPt;k++,j++)
1508         array2[j]=array3[array[i]]+k;
1509     }
1510   delete [] array3;
1511   for(std::vector<DataArray *>::const_iterator it=arrays.begin();it!=arrays.end();it++)
1512     if(*it)
1513       (*it)->renumberInPlace(array2);
1514   delete [] array2;
1515   if(check)
1516     free(const_cast<int*>(array));
1517 }
1518
1519 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getLocalizationOfDiscValues(const MEDCouplingMesh *mesh) const
1520 {
1521   if(!mesh)
1522     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getLocalizationOfDiscValues : NULL input mesh !");
1523   checkNoOrphanCells();
1524   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> umesh=mesh->buildUnstructured();//in general do nothing
1525   int nbOfTuples=getNumberOfTuples(mesh);
1526   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
1527   int spaceDim=mesh->getSpaceDimension();
1528   ret->alloc(nbOfTuples,spaceDim);
1529   std::vector< int > locIds;
1530   std::vector<DataArrayInt *> parts=splitIntoSingleGaussDicrPerCellType(locIds);
1531   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > parts2(parts.size());
1532   std::copy(parts.begin(),parts.end(),parts2.begin());
1533   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> offsets=buildNbOfGaussPointPerCellField();
1534   offsets->computeOffsets();
1535   const int *ptrOffsets=offsets->getConstPointer();
1536   const double *coords=umesh->getCoords()->getConstPointer();
1537   const int *connI=umesh->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
1538   const int *conn=umesh->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
1539   double *valsToFill=ret->getPointer();
1540   for(std::size_t i=0;i<parts2.size();i++)
1541     {
1542       INTERP_KERNEL::GaussCoords calculator;
1543       //
1544       const MEDCouplingGaussLocalization& cli=_loc[locIds[i]];//curLocInfo
1545       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType typ=cli.getType();
1546       const std::vector<double>& wg=cli.getWeights();
1547       calculator.addGaussInfo(typ,INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(typ).getDimension(),
1548           &cli.getGaussCoords()[0],(int)wg.size(),&cli.getRefCoords()[0],
1549           INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(typ).getNumberOfNodes());
1550       //
1551       int nbt=parts2[i]->getNumberOfTuples();
1552       for(const int *w=parts2[i]->getConstPointer();w!=parts2[i]->getConstPointer()+nbt;w++)
1553         calculator.calculateCoords(cli.getType(),coords,spaceDim,conn+connI[*w]+1,valsToFill+spaceDim*(ptrOffsets[*w]));
1554     }
1555   ret->copyStringInfoFrom(*umesh->getCoords());
1556   return ret.retn();
1557 }
1558
1559 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::computeMeshRestrictionFromTupleIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *tupleIdsBg, const int *tupleIdsEnd,
1560                                                                              DataArrayInt *&cellRestriction, DataArrayInt *&trueTupleRestriction) const
1561 {
1562   if(!mesh)
1563     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::computeMeshRestrictionFromTupleIds : NULL input mesh !");
1564   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=DataArrayInt::New(); tmp->alloc((int)std::distance(tupleIdsBg,tupleIdsEnd),1);
1565   std::copy(tupleIdsBg,tupleIdsEnd,tmp->getPointer());
1566   tmp->sort(true);
1567   tmp=tmp->buildUnique();
1568   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nbOfNodesPerCell=buildNbOfGaussPointPerCellField();
1569   nbOfNodesPerCell->computeOffsets2();
1570   nbOfNodesPerCell->searchRangesInListOfIds(tmp,cellRestriction,trueTupleRestriction);
1571 }
1572
1573 /*!
1574  * Empty : not a bug
1575  */
1576 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::checkCompatibilityWithNature(NatureOfField nat) const
1577 {
1578 }
1579
1580 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getTinySerializationIntInformation(std::vector<int>& tinyInfo) const
1581 {
1582   int val=-1;
1583   if(_discr_per_cell)
1584     val=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1585   tinyInfo.push_back(val);
1586   tinyInfo.push_back((int)_loc.size());
1587   if(_loc.empty())
1588     tinyInfo.push_back(-1);
1589   else
1590     tinyInfo.push_back(_loc[0].getDimension());
1591   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::const_iterator iter=_loc.begin();iter!=_loc.end();iter++)
1592     (*iter).pushTinySerializationIntInfo(tinyInfo);
1593 }
1594
1595 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getTinySerializationDbleInformation(std::vector<double>& tinyInfo) const
1596 {
1597   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::const_iterator iter=_loc.begin();iter!=_loc.end();iter++)
1598     (*iter).pushTinySerializationDblInfo(tinyInfo);
1599 }
1600
1601 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getSerializationIntArray(DataArrayInt *& arr) const
1602 {
1603   arr=0;
1604   if(_discr_per_cell)
1605     arr=_discr_per_cell;
1606 }
1607
1608 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *& arr)
1609 {
1610   int val=tinyInfo[0];
1611   if(val>=0)
1612     {
1613       _discr_per_cell=DataArrayInt::New();
1614       _discr_per_cell->alloc(val,1);
1615     }
1616   else
1617     _discr_per_cell=0;
1618   arr=_discr_per_cell;
1619   commonUnserialization(tinyInfo);
1620 }
1621
1622 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::checkForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *arr)
1623 {
1624   static const char MSG[]="MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::checkForUnserialization : expect to have one not null DataArrayInt !";
1625   int val=tinyInfo[0];
1626   if(val>=0)
1627     {
1628       if(!arr)
1629         throw INTERP_KERNEL::Exception(MSG);
1630       arr->checkNbOfTuplesAndComp(val,1,MSG);
1631       _discr_per_cell=const_cast<DataArrayInt *>(arr);
1632       _discr_per_cell->incrRef();
1633     }
1634   else
1635     _discr_per_cell=0;
1636   commonUnserialization(tinyInfo);
1637 }
1638
1639 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::finishUnserialization(const std::vector<double>& tinyInfo)
1640 {
1641   double *tmp=new double[tinyInfo.size()];
1642   std::copy(tinyInfo.begin(),tinyInfo.end(),tmp);
1643   const double *work=tmp;
1644   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::iterator iter=_loc.begin();iter!=_loc.end();iter++)
1645     work=(*iter).fillWithValues(work);
1646   delete [] tmp;
1647 }
1648
1649 double MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getIJK(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *da, int cellId, int nodeIdInCell, int compoId) const
1650 {
1651   int offset=getOffsetOfCell(cellId);
1652   return da->getIJ(offset+nodeIdInCell,compoId);
1653 }
1654
1655 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::checkCoherencyBetween(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArray *da) const
1656 {
1657   if(!mesh || !da)
1658     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::checkCoherencyBetween : NULL input mesh or DataArray !");
1659   MEDCouplingFieldDiscretizationPerCell::checkCoherencyBetween(mesh,da);
1660   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::const_iterator iter=_loc.begin();iter!=_loc.end();iter++)
1661     (*iter).checkCoherency();
1662   int nbOfDesc=(int)_loc.size();
1663   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
1664   const int *dc=_discr_per_cell->getConstPointer();
1665   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
1666     {
1667       if(dc[i]>=nbOfDesc)
1668         {
1669           std::ostringstream oss; oss << "Cell # " << i << " of mesh \"" << mesh->getName() << "\" has an undefined gauss location ! Should never happend !";
1670           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1671         }
1672       if(dc[i]<0)
1673         {
1674           std::ostringstream oss; oss << "Cell # " << i << " of mesh \"" << mesh->getName() << "\" has no gauss location !";
1675           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1676         }
1677       if(mesh->getTypeOfCell(i)!=_loc[dc[i]].getType())
1678         {
1679           std::ostringstream oss; oss << "Types of mesh and gauss location mismatch for cell # " << i;
1680           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1681         }
1682     }
1683   int nbOfTuples=getNumberOfTuples(mesh);
1684   if(nbOfTuples!=da->getNumberOfTuples())
1685     {
1686       std::ostringstream oss; oss << "Invalid number of tuples in the array : expecting " << nbOfTuples << " !";
1687       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1688     }
1689 }
1690
1691 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getMeasureField(const MEDCouplingMesh *mesh, bool isAbs) const
1692 {
1693   if(!mesh)
1694     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getMeasureField : mesh instance specified is NULL !");
1695   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> vol=mesh->getMeasureField(isAbs);
1696   const double *volPtr=vol->getArray()->begin();
1697   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_GAUSS_PT);
1698   ret->setMesh(mesh);
1699   ret->setDiscretization(const_cast<MEDCouplingFieldDiscretizationGauss *>(this));
1700   if(!_discr_per_cell)
1701     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getMeasureField : no discr per cell array not defined ! spatial localization is incorrect !");
1702   _discr_per_cell->checkAllocated();
1703   if(_discr_per_cell->getNumberOfComponents()!=1)
1704     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getMeasureField : no discr per cell array defined but with nb of components different from 1 !");
1705   if(_discr_per_cell->getNumberOfTuples()!=vol->getNumberOfTuples())
1706     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getMeasureField : no discr per cell array defined but mismatch between nb of cells of mesh and size of spatial disr array !");
1707   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> offset=getOffsetArr(mesh);
1708   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arr=DataArrayDouble::New(); arr->alloc(getNumberOfTuples(mesh),1);
1709   ret->setArray(arr);
1710   double *arrPtr=arr->getPointer();
1711   const int *offsetPtr=offset->getConstPointer();
1712   int maxGaussLoc=(int)_loc.size();
1713   std::vector<int> locIds;
1714   std::vector<DataArrayInt *> ids=splitIntoSingleGaussDicrPerCellType(locIds);
1715   std::vector< MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> > ids2(ids.size()); std::copy(ids.begin(),ids.end(),ids2.begin());
1716   for(std::size_t i=0;i<locIds.size();i++)
1717     {
1718       const DataArrayInt *curIds=ids[i];
1719       int locId=locIds[i];
1720       if(locId>=0 && locId<maxGaussLoc)
1721         {
1722           const MEDCouplingGaussLocalization& loc=_loc[locId];
1723           int nbOfGaussPt=loc.getNumberOfGaussPt();
1724           INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> weights=new double[nbOfGaussPt];
1725           double sum=std::accumulate(loc.getWeights().begin(),loc.getWeights().end(),0.);
1726           std::transform(loc.getWeights().begin(),loc.getWeights().end(),(double *)weights,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./sum));
1727           for(const int *cellId=curIds->begin();cellId!=curIds->end();cellId++)
1728             for(int j=0;j<nbOfGaussPt;j++)
1729               arrPtr[offsetPtr[*cellId]+j]=weights[j]*volPtr[*cellId];
1730         }
1731       else
1732         {
1733           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getMeasureField : Presence of localization id " << locId << " in cell #" << curIds->getIJ(0,0) << " ! Must be in [0," << maxGaussLoc << ") !";
1734           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1735         }
1736     }
1737   ret->synchronizeTimeWithSupport();
1738   return ret.retn();
1739 }
1740
1741 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getValueOn(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, double *res) const
1742 {
1743   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
1744 }
1745
1746 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getValueOnPos(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, int i, int j, int k, double *res) const
1747 {
1748   throw INTERP_KERNEL::Exception("getValueOnPos(i,j,k) : Not applyable for Gauss points !");
1749 }
1750
1751 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getValueOnMulti(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, int nbOfPoints) const
1752 {
1753   throw INTERP_KERNEL::Exception("getValueOnMulti : Not implemented yet for gauss points !");
1754 }
1755
1756 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *start, const int *end, DataArrayInt *&di) const
1757 {
1758   if(!mesh)
1759     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData : NULL input mesh !");
1760   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diSafe=computeTupleIdsToSelectFromCellIds(mesh,start,end);
1761   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPart(start,end);
1762   di=diSafe.retn();
1763   return ret.retn();
1764 }
1765
1766 /*!
1767  * This method is strictly equivalent to MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData except that it is optimized for input defined as a range of cell ids.
1768  *
1769  * \param [out] beginOut Valid only if \a di is NULL
1770  * \param [out] endOut Valid only if \a di is NULL
1771  * \param [out] stepOut Valid only if \a di is NULL
1772  * \param [out] di is an array returned that specifies entity ids (nodes, cells, Gauss points... ) in array if no output range is foundable.
1773  *
1774  * \sa MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData
1775  */
1776 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshDataRange(const MEDCouplingMesh *mesh, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt *&di) const
1777 {
1778   if(stepCellIds!=1)//even for stepCellIds==-1 the output will not be a range
1779     return MEDCouplingFieldDiscretization::buildSubMeshDataRange(mesh,beginCellIds,endCellIds,stepCellIds,beginOut,endOut,stepOut,di);
1780   if(!mesh)
1781     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshDataRange : NULL input mesh !");
1782   if(!_discr_per_cell)
1783     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshDataRange : no discretization array set !");
1784   di=0; beginOut=0; endOut=0; stepOut=stepCellIds;
1785   const char msg[]="MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshDataRange : cell #";
1786   int nbOfTuples=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1787   const int *w=_discr_per_cell->begin();
1788   int nbMaxOfLocId=(int)_loc.size();
1789   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++,w++)
1790     {
1791       if(*w!=DFT_INVALID_LOCID_VALUE)
1792         {
1793           if(*w>=0 && *w<nbMaxOfLocId)
1794             {
1795               int delta=_loc[*w].getNumberOfGaussPt();
1796               if(i<beginCellIds)
1797                 beginOut+=delta;
1798               endOut+=delta;
1799               if(i>=endCellIds)
1800                 break;
1801             }
1802           else
1803             { std::ostringstream oss; oss << msg << i << " has invalid id (" << *w << ") ! Should be in [0," << nbMaxOfLocId << ") !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str()); }
1804         }
1805       else
1806         { std::ostringstream oss; oss << msg << i << " is detected as orphan !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str()); }
1807     }
1808   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPartRange(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
1809   return ret.retn();
1810 }
1811
1812 /*!
1813  * This method returns a tuple ids selection from cell ids selection [start;end).
1814  * This method is called by MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData to return parameter \b di.
1815  *
1816  * \return a newly allocated array containing ids to select into the DataArrayDouble of the field.
1817  *
1818  */
1819 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::computeTupleIdsToSelectFromCellIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *startCellIds, const int *endCellIds) const
1820 {
1821   if(!mesh)
1822     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::computeTupleIdsToSelectFromCellIds : null mesh !");
1823   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nbOfNodesPerCell=buildNbOfGaussPointPerCellField();//check of _discr_per_cell not NULL pointer
1824   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
1825   if(_discr_per_cell->getNumberOfTuples()!=nbOfCells)
1826     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::computeTupleIdsToSelectFromCellIds : mismatch of nb of tuples of cell ids array and number of cells !");
1827   nbOfNodesPerCell->computeOffsets2();
1828   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> sel=DataArrayInt::New(); sel->useArray(startCellIds,false,CPP_DEALLOC,(int)std::distance(startCellIds,endCellIds),1);
1829   return sel->buildExplicitArrByRanges(nbOfNodesPerCell);
1830 }
1831
1832 /*!
1833  * No implementation needed !
1834  */
1835 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::renumberValuesOnNodes(double , const int *, int newNbOfNodes, DataArrayDouble *) const
1836 {
1837 }
1838
1839 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::renumberValuesOnCells(double epsOnVals, const MEDCouplingMesh *mesh, const int *old2New, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
1840 {
1841   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
1842 }
1843
1844 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::renumberValuesOnCellsR(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *new2old, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
1845 {
1846   throw INTERP_KERNEL::Exception("Number of cells has changed and becomes higher with some cells that have been split ! Unable to conserve the Gauss field !");
1847 }
1848
1849 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalizationOnType(const MEDCouplingMesh *mesh, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type, const std::vector<double>& refCoo,
1850                                                                      const std::vector<double>& gsCoo, const std::vector<double>& wg)
1851 {
1852   if(!mesh)
1853     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalizationOnType : NULL input mesh !");
1854   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
1855   if((int)cm.getDimension()!=mesh->getMeshDimension())
1856     {
1857       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalizationOnType : mismatch of dimensions ! MeshDim==" << mesh->getMeshDimension();
1858       oss << " whereas Type '" << cm.getRepr() << "' has dimension " << cm.getDimension() << " !";
1859       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1860     }
1861   buildDiscrPerCellIfNecessary(mesh);
1862   int id=(int)_loc.size();
1863   MEDCouplingGaussLocalization elt(type,refCoo,gsCoo,wg);
1864   _loc.push_back(elt);
1865   int *ptr=_discr_per_cell->getPointer();
1866   int nbCells=mesh->getNumberOfCells();
1867   for(int i=0;i<nbCells;i++)
1868     if(mesh->getTypeOfCell(i)==type)
1869       ptr[i]=id;
1870   zipGaussLocalizations();
1871 }
1872
1873 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalizationOnCells(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *begin, const int *end, const std::vector<double>& refCoo,
1874                                                                       const std::vector<double>& gsCoo, const std::vector<double>& wg)
1875 {
1876   if(!mesh)
1877     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalizationOnCells : NULL input mesh !");
1878   buildDiscrPerCellIfNecessary(mesh);
1879   if(std::distance(begin,end)<1)
1880     throw INTERP_KERNEL::Exception("Size of [begin,end) must be equal or greater than 1 !");
1881   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(*begin);
1882   MEDCouplingGaussLocalization elt(type,refCoo,gsCoo,wg);
1883   int id=(int)_loc.size();
1884   int *ptr=_discr_per_cell->getPointer();
1885   for(const int *w=begin+1;w!=end;w++)
1886     {
1887       if(mesh->getTypeOfCell(*w)!=type)
1888         {
1889           std::ostringstream oss; oss << "The cell with id " << *w << " has been detected to be incompatible in the [begin,end) array specified !";
1890           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
1891         }
1892     }
1893   //
1894   for(const int *w2=begin;w2!=end;w2++)
1895     ptr[*w2]=id;
1896   //
1897   _loc.push_back(elt);
1898   zipGaussLocalizations();
1899 }
1900
1901 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::clearGaussLocalizations()
1902 {
1903   if(_discr_per_cell)
1904     {
1905       _discr_per_cell->decrRef();
1906       _discr_per_cell=0;
1907     }
1908   _loc.clear();
1909 }
1910
1911 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalization(int locId, const MEDCouplingGaussLocalization& loc)
1912 {
1913   if(locId<0)
1914     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::setGaussLocalization : localization id has to be >=0 !");
1915   int sz=(int)_loc.size();
1916   MEDCouplingGaussLocalization gLoc(INTERP_KERNEL::NORM_ERROR);
1917   if(locId>=sz)
1918     _loc.resize(locId+1,gLoc);
1919   _loc[locId]=loc;
1920 }
1921
1922 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::resizeLocalizationVector(int newSz)
1923 {
1924   if(newSz<0)
1925     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::resizeLocalizationVector : new size has to be >=0 !");
1926   MEDCouplingGaussLocalization gLoc(INTERP_KERNEL::NORM_ERROR);
1927   _loc.resize(newSz,gLoc);
1928 }
1929
1930 MEDCouplingGaussLocalization& MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getGaussLocalization(int locId)
1931 {
1932   checkLocalizationId(locId);
1933   return _loc[locId];
1934 }
1935
1936 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getNbOfGaussLocalization() const
1937 {
1938   return (int)_loc.size();
1939 }
1940
1941 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getGaussLocalizationIdOfOneCell(int cellId) const
1942 {
1943   if(!_discr_per_cell)
1944     throw INTERP_KERNEL::Exception("No Gauss localization still set !");
1945   int locId=_discr_per_cell->begin()[cellId];
1946   if(locId<0)
1947     throw INTERP_KERNEL::Exception("No Gauss localization set for the specified cell !");
1948   return locId;
1949 }
1950
1951 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getGaussLocalizationIdOfOneType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
1952 {
1953   std::set<int> ret=getGaussLocalizationIdsOfOneType(type);
1954   if(ret.empty())
1955     throw INTERP_KERNEL::Exception("No gauss discretization found for the specified type !");
1956   if(ret.size()>1)
1957     throw INTERP_KERNEL::Exception("Several gauss discretizations have been found for the specified type !");
1958   return *ret.begin();
1959 }
1960
1961 std::set<int> MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getGaussLocalizationIdsOfOneType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
1962 {
1963   if(!_discr_per_cell)
1964     throw INTERP_KERNEL::Exception("No Gauss localization still set !");
1965   std::set<int> ret;
1966   int id=0;
1967   for(std::vector<MEDCouplingGaussLocalization>::const_iterator iter=_loc.begin();iter!=_loc.end();iter++,id++)
1968     if((*iter).getType()==type)
1969       ret.insert(id);
1970   return ret;
1971 }
1972
1973 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getCellIdsHavingGaussLocalization(int locId, std::vector<int>& cellIds) const
1974 {
1975   if(locId<0 || locId>=(int)_loc.size())
1976     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid locId given : must be in range [0:getNbOfGaussLocalization()) !");
1977   int nbOfTuples=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
1978   const int *ptr=_discr_per_cell->getConstPointer();
1979   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++)
1980     if(ptr[i]==locId)
1981       cellIds.push_back(i);
1982 }
1983
1984 const MEDCouplingGaussLocalization& MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getGaussLocalization(int locId) const
1985 {
1986   checkLocalizationId(locId);
1987   return _loc[locId];
1988 }
1989
1990 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::checkLocalizationId(int locId) const
1991 {
1992   if(locId<0 || locId>=(int)_loc.size())
1993     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid locId given : must be in range [0:getNbOfGaussLocalization()) !");
1994 }
1995
1996 int MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::getOffsetOfCell(int cellId) const
1997 {
1998   int ret=0;
1999   const int *start=_discr_per_cell->getConstPointer();
2000   for(const int *w=start;w!=start+cellId;w++)
2001     ret+=_loc[*w].getNumberOfGaussPt();
2002   return ret;
2003 }
2004
2005 /*!
2006  * This method do the assumption that there is no orphan cell. If there is an exception is thrown.
2007  * This method makes the assumption too that '_discr_per_cell' is defined. If not an exception is thrown.
2008  * This method returns a newly created array with number of tuples equals to '_discr_per_cell->getNumberOfTuples' and number of components equal to 1.
2009  * The i_th tuple in returned array is the number of gauss point if the corresponding cell.
2010  */
2011 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildNbOfGaussPointPerCellField() const
2012 {
2013   if(!_discr_per_cell)
2014     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildNbOfGaussPointPerCellField : no discretization array set !");
2015   int nbOfTuples=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
2016   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
2017   const int *w=_discr_per_cell->begin();
2018   ret->alloc(nbOfTuples,1);
2019   int *valsToFill=ret->getPointer();
2020   int nbMaxOfLocId=(int)_loc.size();
2021   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++,w++)
2022     if(*w!=DFT_INVALID_LOCID_VALUE)
2023       {
2024         if(*w>=0 && *w<nbMaxOfLocId)
2025           valsToFill[i]=_loc[*w].getNumberOfGaussPt();
2026         else
2027           {
2028             std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildNbOfGaussPointPerCellField : cell #" << i << " has invalid id (" << *w << ") ! Should be in [0," << nbMaxOfLocId << ") !";
2029             throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2030           }
2031       }
2032     else
2033       {
2034         std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildNbOfGaussPointPerCellField : cell #" << i << " is detected as orphan !";
2035         throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2036       }
2037   return ret.retn();
2038 }
2039
2040 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
2041 {
2042   stream << "Gauss points spatial discretization.";
2043 }
2044
2045 /*!
2046  * This method makes the assumption that _discr_per_cell is set.
2047  * This method reduces as much as possible number size of _loc.
2048  * This method is useful when several set on same cells has been done and that some Gauss Localization are no more used.
2049  */
2050 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::zipGaussLocalizations()
2051 {
2052   const int *start=_discr_per_cell->begin();
2053   int nbOfTuples=_discr_per_cell->getNumberOfTuples();
2054   INTERP_KERNEL::AutoPtr<int> tmp=new int[_loc.size()];
2055   std::fill((int *)tmp,(int *)tmp+_loc.size(),-2);
2056   for(const int *w=start;w!=start+nbOfTuples;w++)
2057     if(*w>=0)
2058       tmp[*w]=1;
2059   int fid=0;
2060   for(int i=0;i<(int)_loc.size();i++)
2061     if(tmp[i]!=-2)
2062       tmp[i]=fid++;
2063   if(fid==(int)_loc.size())
2064     return;
2065   // zip needed
2066   int *start2=_discr_per_cell->getPointer();
2067   for(int *w2=start2;w2!=start2+nbOfTuples;w2++)
2068     if(*w2>=0)
2069       *w2=tmp[*w2];
2070   std::vector<MEDCouplingGaussLocalization> tmpLoc;
2071   for(int i=0;i<(int)_loc.size();i++)
2072     if(tmp[i]!=-2)
2073       tmpLoc.push_back(_loc[i]);
2074   _loc=tmpLoc;
2075 }
2076
2077 void MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::commonUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo)
2078 {
2079   int nbOfLoc=tinyInfo[1];
2080   _loc.clear();
2081   int dim=tinyInfo[2];
2082   int delta=-1;
2083   if(nbOfLoc>0)
2084     delta=((int)tinyInfo.size()-3)/nbOfLoc;
2085   for(int i=0;i<nbOfLoc;i++)
2086     {
2087       std::vector<int> tmp(tinyInfo.begin()+3+i*delta,tinyInfo.begin()+3+(i+1)*delta);
2088       MEDCouplingGaussLocalization elt=MEDCouplingGaussLocalization::BuildNewInstanceFromTinyInfo(dim,tmp);
2089       _loc.push_back(elt);
2090     }
2091 }
2092
2093 MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE()
2094 {
2095 }
2096
2097 TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getEnum() const
2098 {
2099   return TYPE;
2100 }
2101
2102 /*!
2103  * This method is simply called by MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy. It performs the deep copy of \a this.
2104  *
2105  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy.
2106  */
2107 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::clone() const
2108 {
2109   return new MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE(*this);
2110 }
2111
2112 std::string MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getStringRepr() const
2113 {
2114   return std::string(REPR);
2115 }
2116
2117 const char *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getRepr() const
2118 {
2119   return REPR;
2120 }
2121
2122 bool MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps, std::string& reason) const
2123 {
2124   if(!other)
2125     {
2126       reason="other spatial discretization is NULL, and this spatial discretization (GaussNE) is defined.";
2127       return false;
2128     }
2129   const MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE *>(other);
2130   bool ret=otherC!=0;
2131   if(!ret)
2132     reason="Spatial discrtization of this is ON_GAUSS_NE, which is not the case of other.";
2133   return ret;
2134 }
2135
2136 /*!
2137  * This method returns the number of tuples regarding exclusively the input code \b without \b using \b a \b mesh \b in \b input.
2138  * The input code coherency is also checked regarding spatial discretization of \a this.
2139  * If an incoherency is detected, an exception will be thrown. If the input code is coherent, the number of tuples expected is returned.
2140  * The number of tuples expected is equal to those to have a valid field lying on \a this and having a mesh fitting perfectly the input code (geometric type distribution).
2141  */
2142 int MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const
2143 {
2144   if(code.size()%3!=0)
2145     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code !");
2146   int nbOfSplit=(int)idsPerType.size();
2147   int nbOfTypes=(int)code.size()/3;
2148   int ret(0);
2149   for(int i=0;i<nbOfTypes;i++)
2150     {
2151       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel((INTERP_KERNEL::NormalizedCellType)code[3*i]));
2152       if(cm.isDynamic())
2153         {
2154           std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : At pos #" << i << " the geometric type " << cm.getRepr() << " is dynamic ! There are not managed by GAUSS_NE field discretization !";
2155           throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2156         }
2157       int nbOfEltInChunk=code[3*i+1];
2158       if(nbOfEltInChunk<0)
2159         throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : invalid input code ! presence of negative value in a type !");
2160       int pos=code[3*i+2];
2161       if(pos!=-1)
2162         {
2163           if(pos<0 || pos>=nbOfSplit)
2164             {
2165               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input code points to pos " << pos << " in typeid " << i << " ! Should be in [0," << nbOfSplit << ") !";
2166               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2167             }
2168           const DataArrayInt *ids(idsPerType[pos]);
2169           if(!ids || !ids->isAllocated() || ids->getNumberOfComponents()!=1 || ids->getNumberOfTuples()!=nbOfEltInChunk || ids->getMinValueInArray()<0)
2170             {
2171               std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuplesExpectedRegardingCode : input pfl chunck at pos " << pos << " should have " << i << " tuples and one component and with ids all >=0 !";
2172               throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2173             }
2174         }
2175       ret+=nbOfEltInChunk*(int)cm.getNumberOfNodes();
2176     }
2177   return ret;
2178 }
2179
2180 int MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuples(const MEDCouplingMesh *mesh) const
2181 {
2182   if(!mesh)
2183     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfTuples : NULL input mesh !");
2184   int ret=0;
2185   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
2186   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
2187     {
2188       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(i);
2189       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
2190       if(cm.isDynamic())
2191         throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet Gauss node on elements for polygons and polyedrons !");
2192       ret+=cm.getNumberOfNodes();
2193     }
2194   return ret;
2195 }
2196
2197 int MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfMeshPlaces(const MEDCouplingMesh *mesh) const
2198 {
2199   if(!mesh)
2200     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getNumberOfMeshPlaces : NULL input mesh !");
2201   return mesh->getNumberOfCells();
2202 }
2203
2204 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getOffsetArr(const MEDCouplingMesh *mesh) const
2205 {
2206   if(!mesh)
2207     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getOffsetArr : NULL input mesh !");
2208   int nbOfTuples=mesh->getNumberOfCells();
2209   DataArrayInt *ret=DataArrayInt::New();
2210   ret->alloc(nbOfTuples+1,1);
2211   int *retPtr=ret->getPointer();
2212   retPtr[0]=0;
2213   for(int i=0;i<nbOfTuples;i++)
2214     {
2215       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(i);
2216       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
2217       if(cm.isDynamic())
2218         throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet Gauss node on elements for polygons and polyedrons !");
2219       retPtr[i+1]=retPtr[i]+cm.getNumberOfNodes();
2220     }
2221   return ret;
2222 }
2223
2224 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::renumberArraysForCell(const MEDCouplingMesh *mesh, const std::vector<DataArray *>& arrays,
2225                                                                   const int *old2NewBg, bool check)
2226 {
2227   if(!mesh)
2228     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::renumberArraysForCell : NULL input mesh !");
2229   const int *array=old2NewBg;
2230   if(check)
2231     array=DataArrayInt::CheckAndPreparePermutation(old2NewBg,old2NewBg+mesh->getNumberOfCells());
2232   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
2233   int nbOfTuples=getNumberOfTuples(mesh);
2234   int *array2=new int[nbOfTuples];//stores the final conversion array old2New to give to arrays in renumberInPlace.
2235   int *array3=new int[nbOfCells];//store for each cell in after renumbering the offset needed by each cell in new numbering.
2236   array3[0]=0;
2237   for(int i=1;i<nbOfCells;i++)
2238     {
2239       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell((int)std::distance(array,std::find(array,array+nbOfCells,i-1)));
2240       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
2241       array3[i]=array3[i-1]+cm.getNumberOfNodes();
2242     }
2243   int j=0;
2244   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
2245     {
2246       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(i);
2247       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
2248       for(int k=0;k<(int)cm.getNumberOfNodes();k++,j++)
2249         array2[j]=array3[array[i]]+k;
2250     }
2251   delete [] array3;
2252   for(std::vector<DataArray *>::const_iterator it=arrays.begin();it!=arrays.end();it++)
2253     if(*it)
2254       (*it)->renumberInPlace(array2);
2255   delete [] array2;
2256   if(check)
2257     free(const_cast<int *>(array));
2258 }
2259
2260 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getLocalizationOfDiscValues(const MEDCouplingMesh *mesh) const
2261 {
2262   if(!mesh)
2263     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getLocalizationOfDiscValues : NULL input mesh !");
2264   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
2265   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> umesh=mesh->buildUnstructured();//in general do nothing
2266   int nbOfTuples=getNumberOfTuples(umesh);
2267   int spaceDim=mesh->getSpaceDimension();
2268   ret->alloc(nbOfTuples,spaceDim);
2269   const double *coords=umesh->getCoords()->begin();
2270   const int *connI=umesh->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
2271   const int *conn=umesh->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
2272   int nbCells=umesh->getNumberOfCells();
2273   double *retPtr=ret->getPointer();
2274   for(int i=0;i<nbCells;i++,connI++)
2275     for(const int *w=conn+connI[0]+1;w!=conn+connI[1];w++)
2276       if(*w>=0)
2277         retPtr=std::copy(coords+(*w)*spaceDim,coords+((*w)+1)*spaceDim,retPtr);
2278   return ret.retn();
2279 }
2280
2281 /*!
2282  * Reimplemented from MEDCouplingFieldDiscretization::integral for performance reason. The default implementation is valid too for GAUSS_NE spatial discretization.
2283  */
2284 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::integral(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *arr, bool isWAbs, double *res) const
2285 {
2286   if(!mesh || !arr)
2287     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::integral : input mesh or array is null !");
2288   int nbOfCompo=arr->getNumberOfComponents();
2289   std::fill(res,res+nbOfCompo,0.);
2290   //
2291   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> vol=mesh->getMeasureField(isWAbs);
2292   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> types=mesh->getAllGeoTypes();
2293   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nbOfNodesPerCell=mesh->computeNbOfNodesPerCell();
2294   nbOfNodesPerCell->computeOffsets2();
2295   const double *arrPtr=arr->begin(),*volPtr=vol->getArray()->begin();
2296   for(std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator it=types.begin();it!=types.end();it++)
2297     {
2298       std::size_t wArrSz=-1;
2299       const double *wArr=GetWeightArrayFromGeometricType(*it,wArrSz);
2300       INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> wArr2=new double[wArrSz];
2301       double sum=std::accumulate(wArr,wArr+wArrSz,0.);
2302       std::transform(wArr,wArr+wArrSz,(double *)wArr2,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./sum));
2303       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=mesh->giveCellsWithType(*it);
2304       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->buildExplicitArrByRanges(nbOfNodesPerCell);
2305       const int *ptIds2=ids2->begin(),*ptIds=ids->begin();
2306       int nbOfCellsWithCurGeoType=ids->getNumberOfTuples();
2307       for(int i=0;i<nbOfCellsWithCurGeoType;i++,ptIds++,ptIds2+=wArrSz)
2308         {
2309           for(int k=0;k<nbOfCompo;k++)
2310             {
2311               double tmp=0.;
2312               for(std::size_t j=0;j<wArrSz;j++)
2313                 tmp+=arrPtr[nbOfCompo*ptIds2[j]+k]*wArr2[j];
2314               res[k]+=tmp*volPtr[*ptIds];
2315             }
2316         }
2317     }
2318 }
2319
2320 const double *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::GetWeightArrayFromGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType geoType, std::size_t& lgth)
2321 {
2322   switch(geoType)
2323   {
2324     case INTERP_KERNEL::NORM_POINT1:
2325       lgth=(int)sizeof(FGP_POINT1)/sizeof(double);
2326       return FGP_POINT1;
2327     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG2:
2328       lgth=(int)sizeof(FGP_SEG2)/sizeof(double);
2329       return FGP_SEG2;
2330     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG3:
2331       lgth=(int)sizeof(FGP_SEG3)/sizeof(double);
2332       return FGP_SEG3;
2333     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG4:
2334       lgth=(int)sizeof(FGP_SEG4)/sizeof(double);
2335       return FGP_SEG4;
2336     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI3:
2337       lgth=(int)sizeof(FGP_TRI3)/sizeof(double);
2338       return FGP_TRI3;
2339     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI6:
2340       lgth=(int)sizeof(FGP_TRI6)/sizeof(double);
2341       return FGP_TRI6;
2342     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI7:
2343       lgth=(int)sizeof(FGP_TRI7)/sizeof(double);
2344       return FGP_TRI7;
2345     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4:
2346       lgth=(int)sizeof(FGP_QUAD4)/sizeof(double);
2347       return FGP_QUAD4;
2348     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD8:
2349       lgth=(int)sizeof(FGP_QUAD8)/sizeof(double);
2350       return FGP_QUAD8;
2351     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD9:
2352       lgth=(int)sizeof(FGP_QUAD9)/sizeof(double);
2353       return FGP_QUAD9;
2354     case INTERP_KERNEL::NORM_TETRA4:
2355       lgth=(int)sizeof(FGP_TETRA4)/sizeof(double);
2356       return FGP_TETRA4;
2357     case INTERP_KERNEL::NORM_TETRA10:
2358       lgth=(int)sizeof(FGP_TETRA10)/sizeof(double);
2359       return FGP_TETRA10;
2360     case INTERP_KERNEL::NORM_PENTA6:
2361       lgth=(int)sizeof(FGP_PENTA6)/sizeof(double);
2362       return FGP_PENTA6;
2363     case INTERP_KERNEL::NORM_PENTA15:
2364       lgth=(int)sizeof(FGP_PENTA15)/sizeof(double);
2365       return FGP_PENTA15;
2366     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8:
2367       lgth=(int)sizeof(FGP_HEXA8)/sizeof(double);
2368       return FGP_HEXA8;
2369     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA20:
2370       lgth=(int)sizeof(FGP_HEXA20)/sizeof(double);
2371       return FGP_HEXA20;
2372     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA27:
2373       lgth=(int)sizeof(FGP_HEXA27)/sizeof(double);
2374       return FGP_HEXA27;
2375     case INTERP_KERNEL::NORM_PYRA5:
2376       lgth=(int)sizeof(FGP_PYRA5)/sizeof(double);
2377       return FGP_PYRA5;
2378     case INTERP_KERNEL::NORM_PYRA13:
2379       lgth=(int)sizeof(FGP_PYRA13)/sizeof(double);
2380       return FGP_PYRA13;
2381     default:
2382       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::GetWeightArrayFromGeometricType : only SEG[2,3,4], TRI[3,6,7], QUAD[4,9], TETRA[4,10], PENTA[6,15], HEXA[8,20,27], PYRA[5,13] supported !");
2383   }
2384 }
2385
2386 const double *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::GetRefCoordsFromGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType geoType, std::size_t& lgth)
2387 {
2388   switch(geoType)
2389   {
2390     case INTERP_KERNEL::NORM_POINT1:
2391       lgth=0;
2392       return 0;
2393     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG2:
2394       lgth=(int)sizeof(REF_SEG2)/sizeof(double);
2395       return REF_SEG2;
2396     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG3:
2397       lgth=(int)sizeof(REF_SEG3)/sizeof(double);
2398       return REF_SEG3;
2399     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG4:
2400       lgth=(int)sizeof(REF_SEG4)/sizeof(double);
2401       return REF_SEG4;
2402     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI3:
2403       lgth=(int)sizeof(REF_TRI3)/sizeof(double);
2404       return REF_TRI3;
2405     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI6:
2406       lgth=(int)sizeof(REF_TRI6)/sizeof(double);
2407       return REF_TRI6;
2408     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI7:
2409       lgth=(int)sizeof(REF_TRI7)/sizeof(double);
2410       return REF_TRI7;
2411     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4:
2412       lgth=(int)sizeof(REF_QUAD4)/sizeof(double);
2413       return REF_QUAD4;
2414     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD8:
2415       lgth=(int)sizeof(REF_QUAD8)/sizeof(double);
2416       return REF_QUAD8;
2417     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD9:
2418       lgth=(int)sizeof(REF_QUAD9)/sizeof(double);
2419       return REF_QUAD9;
2420     case INTERP_KERNEL::NORM_TETRA4:
2421       lgth=(int)sizeof(REF_TETRA4)/sizeof(double);
2422       return REF_TETRA4;
2423     case INTERP_KERNEL::NORM_TETRA10:
2424       lgth=(int)sizeof(REF_TETRA10)/sizeof(double);
2425       return REF_TETRA10;
2426     case INTERP_KERNEL::NORM_PENTA6:
2427       lgth=(int)sizeof(REF_PENTA6)/sizeof(double);
2428       return REF_PENTA6;
2429     case INTERP_KERNEL::NORM_PENTA15:
2430       lgth=(int)sizeof(REF_PENTA15)/sizeof(double);
2431       return REF_PENTA15;
2432     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8:
2433       lgth=(int)sizeof(REF_HEXA8)/sizeof(double);
2434       return REF_HEXA8;
2435     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA20:
2436       lgth=(int)sizeof(REF_HEXA20)/sizeof(double);
2437       return REF_HEXA20;
2438     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA27:
2439       lgth=(int)sizeof(REF_HEXA27)/sizeof(double);
2440       return REF_HEXA27;
2441     case INTERP_KERNEL::NORM_PYRA5:
2442       lgth=(int)sizeof(REF_PYRA5)/sizeof(double);
2443       return REF_PYRA5;
2444     case INTERP_KERNEL::NORM_PYRA13:
2445       lgth=(int)sizeof(REF_PYRA13)/sizeof(double);
2446       return REF_PYRA13;
2447     default:
2448       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::GetRefCoordsFromGeometricType : only SEG[2,3,4], TRI[3,6,7], QUAD[4,8,9], TETRA[4,10], PENTA[6,15], HEXA[8,20,27], PYRA[5,13] supported !");
2449   }
2450 }
2451
2452 const double *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::GetLocsFromGeometricType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType geoType, std::size_t& lgth)
2453 {
2454   switch(geoType)
2455   {
2456     case INTERP_KERNEL::NORM_POINT1:
2457       {
2458         lgth=0;
2459         return 0;
2460       }
2461     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG2:
2462       {
2463         lgth=(int)sizeof(LOC_SEG2)/sizeof(double);
2464         return LOC_SEG2;
2465       }
2466     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG3:
2467       {
2468         lgth=(int)sizeof(LOC_SEG3)/sizeof(double);
2469         return LOC_SEG3;
2470       }
2471     case INTERP_KERNEL::NORM_SEG4:
2472       {
2473         lgth=(int)sizeof(LOC_SEG4)/sizeof(double);
2474         return LOC_SEG4;
2475       }
2476     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI3:
2477       {
2478         lgth=(int)sizeof(LOC_TRI3)/sizeof(double);
2479         return LOC_TRI3;
2480       }
2481     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI6:
2482       {
2483         lgth=(int)sizeof(LOC_TRI6)/sizeof(double);
2484         return LOC_TRI6;
2485       }
2486     case INTERP_KERNEL::NORM_TRI7:
2487       {
2488         lgth=(int)sizeof(LOC_TRI7)/sizeof(double);
2489         return LOC_TRI7;
2490       }
2491     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD4:
2492       {
2493         lgth=(int)sizeof(LOC_QUAD4)/sizeof(double);
2494         return LOC_QUAD4;
2495       }
2496     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD8:
2497       {
2498         lgth=(int)sizeof(LOC_QUAD8)/sizeof(double);
2499         return LOC_QUAD8;
2500       }
2501     case INTERP_KERNEL::NORM_QUAD9:
2502       {
2503         lgth=(int)sizeof(LOC_QUAD9)/sizeof(double);
2504         return LOC_QUAD9;
2505       }
2506     case INTERP_KERNEL::NORM_TETRA4:
2507       {
2508         lgth=(int)sizeof(LOC_TETRA4)/sizeof(double);
2509         return LOC_TETRA4;
2510       }
2511     case INTERP_KERNEL::NORM_TETRA10:
2512       {
2513         lgth=(int)sizeof(LOC_TETRA10)/sizeof(double);
2514         return LOC_TETRA10;
2515       }
2516     case INTERP_KERNEL::NORM_PENTA6:
2517       {
2518         lgth=(int)sizeof(LOC_PENTA6)/sizeof(double);
2519         return LOC_PENTA6;
2520       }
2521     case INTERP_KERNEL::NORM_PENTA15:
2522       {
2523         lgth=(int)sizeof(LOC_PENTA15)/sizeof(double);
2524         return LOC_PENTA15;
2525       }
2526     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA8:
2527       {
2528         lgth=(int)sizeof(LOC_HEXA8)/sizeof(double);
2529         return LOC_HEXA8;
2530       }
2531     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA20:
2532       {
2533         lgth=(int)sizeof(LOC_HEXA20)/sizeof(double);
2534         return LOC_HEXA20;
2535       }
2536     case INTERP_KERNEL::NORM_HEXA27:
2537       {
2538         lgth=(int)sizeof(LOC_HEXA27)/sizeof(double);
2539         return LOC_HEXA27;
2540       }
2541     case INTERP_KERNEL::NORM_PYRA5:
2542       {
2543         lgth=(int)sizeof(LOC_PYRA5)/sizeof(double);
2544         return LOC_PYRA5;
2545       }
2546     case INTERP_KERNEL::NORM_PYRA13:
2547       {
2548         lgth=(int)sizeof(LOC_PYRA13)/sizeof(double);
2549         return LOC_PYRA13;
2550       }
2551     default:
2552       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::GetLocsFromGeometricType : only SEG[2,3,4], TRI[3,6,7], QUAD[4,8,9], TETRA[4,10], PENTA[6,15], HEXA[8,20,27], PYRA[5,13] supported !");
2553   }
2554 }
2555
2556 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::computeMeshRestrictionFromTupleIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *tupleIdsBg, const int *tupleIdsEnd,
2557                                                                                DataArrayInt *&cellRestriction, DataArrayInt *&trueTupleRestriction) const
2558 {
2559   if(!mesh)
2560     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::computeMeshRestrictionFromTupleIds : NULL input mesh !");
2561   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=DataArrayInt::New(); tmp->alloc((int)std::distance(tupleIdsBg,tupleIdsEnd),1);
2562   std::copy(tupleIdsBg,tupleIdsEnd,tmp->getPointer());
2563   tmp->sort(true);
2564   tmp=tmp->buildUnique();
2565   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nbOfNodesPerCell=mesh->computeNbOfNodesPerCell();
2566   nbOfNodesPerCell->computeOffsets2();
2567   nbOfNodesPerCell->searchRangesInListOfIds(tmp,cellRestriction,trueTupleRestriction);
2568 }
2569
2570 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::checkCompatibilityWithNature(NatureOfField nat) const
2571 {
2572 }
2573
2574 double MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getIJK(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *da, int cellId, int nodeIdInCell, int compoId) const
2575 {
2576   if(!mesh)
2577     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getIJK : NULL input mesh !");
2578   int offset=0;
2579   for(int i=0;i<cellId;i++)
2580     {
2581       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(i);
2582       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
2583       offset+=cm.getNumberOfNodes();
2584     }
2585   return da->getIJ(offset+nodeIdInCell,compoId);
2586 }
2587
2588 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::checkCoherencyBetween(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArray *da) const
2589 {
2590   int nbOfTuples=getNumberOfTuples(mesh);
2591   if(nbOfTuples!=da->getNumberOfTuples())
2592     {
2593       std::ostringstream oss; oss << "Invalid number of tuples in the array : expecting " << nbOfTuples << " !";
2594       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2595     }
2596 }
2597
2598 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getMeasureField(const MEDCouplingMesh *mesh, bool isAbs) const
2599 {
2600   if(!mesh)
2601     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getMeasureField : mesh instance specified is NULL !");
2602   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> vol=mesh->getMeasureField(isAbs);
2603   const double *volPtr=vol->getArray()->begin();
2604   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingFieldDouble> ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_GAUSS_NE);
2605   ret->setMesh(mesh);
2606   //
2607   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> types=mesh->getAllGeoTypes();
2608   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nbOfNodesPerCell=mesh->computeNbOfNodesPerCell();
2609   int nbTuples=nbOfNodesPerCell->accumulate(0);
2610   nbOfNodesPerCell->computeOffsets2();
2611   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arr=DataArrayDouble::New(); arr->alloc(nbTuples,1);
2612   ret->setArray(arr);
2613   double *arrPtr=arr->getPointer();
2614   for(std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator it=types.begin();it!=types.end();it++)
2615     {
2616       std::size_t wArrSz=-1;
2617       const double *wArr=GetWeightArrayFromGeometricType(*it,wArrSz);
2618       INTERP_KERNEL::AutoPtr<double> wArr2=new double[wArrSz];
2619       double sum=std::accumulate(wArr,wArr+wArrSz,0.);
2620       std::transform(wArr,wArr+wArrSz,(double *)wArr2,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1./sum));
2621       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids=mesh->giveCellsWithType(*it);
2622       MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ids2=ids->buildExplicitArrByRanges(nbOfNodesPerCell);
2623       const int *ptIds2=ids2->begin(),*ptIds=ids->begin();
2624       int nbOfCellsWithCurGeoType=ids->getNumberOfTuples();
2625       for(int i=0;i<nbOfCellsWithCurGeoType;i++,ptIds++)
2626         for(std::size_t j=0;j<wArrSz;j++,ptIds2++)
2627           arrPtr[*ptIds2]=wArr2[j]*volPtr[*ptIds];
2628     }
2629   ret->synchronizeTimeWithSupport();
2630   return ret.retn();
2631 }
2632
2633 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getValueOn(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, double *res) const
2634 {
2635   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
2636 }
2637
2638 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getValueOnPos(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, int i, int j, int k, double *res) const
2639 {
2640   throw INTERP_KERNEL::Exception("getValueOnPos(i,j,k) : Not applyable for Gauss points !");
2641 }
2642
2643 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::getValueOnMulti(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, int nbOfPoints) const
2644 {
2645   throw INTERP_KERNEL::Exception("getValueOnMulti : Not implemented for Gauss NE !");
2646 }
2647
2648 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::buildSubMeshData(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *start, const int *end, DataArrayInt *&di) const
2649 {
2650   if(!mesh)
2651     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::buildSubMeshData : NULL input mesh !");
2652   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> diSafe=computeTupleIdsToSelectFromCellIds(mesh,start,end);
2653   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPart(start,end);
2654   di=diSafe.retn();
2655   return ret.retn();
2656 }
2657
2658 /*!
2659  * This method is strictly equivalent to MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData except that it is optimized for input defined as a range of cell ids.
2660  *
2661  * \param [out] beginOut Valid only if \a di is NULL
2662  * \param [out] endOut Valid only if \a di is NULL
2663  * \param [out] stepOut Valid only if \a di is NULL
2664  * \param [out] di is an array returned that specifies entity ids (nodes, cells, Gauss points... ) in array if no output range is foundable.
2665  *
2666  * \sa MEDCouplingFieldDiscretizationGauss::buildSubMeshData
2667  */
2668 MEDCouplingMesh *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::buildSubMeshDataRange(const MEDCouplingMesh *mesh, int beginCellIds, int endCellIds, int stepCellIds, int& beginOut, int& endOut, int& stepOut, DataArrayInt *&di) const
2669 {
2670   if(stepCellIds!=1)//even for stepCellIds==-1 the output will not be a range
2671     return MEDCouplingFieldDiscretization::buildSubMeshDataRange(mesh,beginCellIds,endCellIds,stepCellIds,beginOut,endOut,stepOut,di);
2672   if(!mesh)
2673     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::buildSubMeshDataRange : NULL input mesh !");
2674   int nbOfCells=mesh->getNumberOfCells();
2675   di=0; beginOut=0; endOut=0; stepOut=stepCellIds;
2676   const char msg[]="MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::buildSubMeshDataRange : cell #";
2677   for(int i=0;i<nbOfCells;i++)
2678     {
2679       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type=mesh->getTypeOfCell(i);
2680       const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
2681       if(cm.isDynamic())
2682         { std::ostringstream oss; oss << msg << i << " presence of dynamic cell (polygons and polyedrons) ! Not implemented !"; throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str()); }
2683       int delta=cm.getNumberOfNodes();
2684       if(i<beginCellIds)
2685         beginOut+=delta;
2686       endOut+=delta;
2687       if(i>=endCellIds)
2688         break;
2689     }
2690   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingMesh> ret=mesh->buildPartRange(beginCellIds,endCellIds,stepCellIds);
2691   return ret.retn();
2692 }
2693
2694
2695 /*!
2696  * This method returns a tuple ids selection from cell ids selection [start;end).
2697  * This method is called by MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::buildSubMeshData to return parameter \b di.
2698  *
2699  * \return a newly allocated array containing ids to select into the DataArrayDouble of the field.
2700  *
2701  */
2702 DataArrayInt *MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::computeTupleIdsToSelectFromCellIds(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *startCellIds, const int *endCellIds) const
2703 {
2704   if(!mesh)
2705     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::computeTupleIdsToSelectFromCellIds : null mesh !");
2706   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> nbOfNodesPerCell=mesh->computeNbOfNodesPerCell();
2707   nbOfNodesPerCell->computeOffsets2();
2708   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> sel=DataArrayInt::New(); sel->useArray(startCellIds,false,CPP_DEALLOC,(int)std::distance(startCellIds,endCellIds),1);
2709   return sel->buildExplicitArrByRanges(nbOfNodesPerCell);
2710 }
2711
2712 /*!
2713  * No implementation needed !
2714  */
2715 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::renumberValuesOnNodes(double , const int *, int newNbOfNodes, DataArrayDouble *) const
2716 {
2717 }
2718
2719 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::renumberValuesOnCells(double epsOnVals, const MEDCouplingMesh *mesh, const int *old2New, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
2720 {
2721   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
2722 }
2723
2724 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::renumberValuesOnCellsR(const MEDCouplingMesh *mesh, const int *new2old, int newSz, DataArrayDouble *arr) const
2725 {
2726   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
2727 }
2728
2729 void MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
2730 {
2731   stream << "Gauss points on nodes per element spatial discretization.";
2732 }
2733
2734 MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE::MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE(const MEDCouplingFieldDiscretizationGaussNE& other):MEDCouplingFieldDiscretization(other)
2735 {
2736 }
2737
2738 TypeOfField MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getEnum() const
2739 {
2740   return TYPE;
2741 }
2742
2743 const char *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getRepr() const
2744 {
2745   return REPR;
2746 }
2747
2748 /*!
2749  * This method is simply called by MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy. It performs the deep copy of \a this.
2750  *
2751  * \sa MEDCouplingFieldDiscretization::deepCpy.
2752  */
2753 MEDCouplingFieldDiscretization *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::clone() const
2754 {
2755   return new MEDCouplingFieldDiscretizationKriging;
2756 }
2757
2758 std::string MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getStringRepr() const
2759 {
2760   return std::string(REPR);
2761 }
2762
2763 void MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::checkCompatibilityWithNature(NatureOfField nat) const
2764 {
2765   if(nat!=ConservativeVolumic)
2766     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid nature for Kriging field : expected ConservativeVolumic !");
2767 }
2768
2769 bool MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingFieldDiscretization *other, double eps, std::string& reason) const
2770 {
2771   if(!other)
2772     {
2773       reason="other spatial discretization is NULL, and this spatial discretization (Kriginig) is defined.";
2774       return false;
2775     }
2776   const MEDCouplingFieldDiscretizationKriging *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingFieldDiscretizationKriging *>(other);
2777   bool ret=otherC!=0;
2778   if(!ret)
2779     reason="Spatial discrtization of this is ON_NODES_KR, which is not the case of other.";
2780   return ret;
2781 }
2782
2783 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getMeasureField(const MEDCouplingMesh *mesh, bool isAbs) const
2784 {
2785   if(!mesh)
2786     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getMeasureField : mesh instance specified is NULL !");
2787   throw INTERP_KERNEL::Exception("getMeasureField on FieldDiscretizationKriging : not implemented yet !");
2788 }
2789
2790 void MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getValueOn(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, double *res) const
2791 {
2792   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> res2=MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getValueOnMulti(arr,mesh,loc,1);
2793   std::copy(res2->begin(),res2->end(),res);
2794 }
2795
2796 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getValueOnMulti(const DataArrayDouble *arr, const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, int nbOfTargetPoints) const
2797 {
2798   if(!arr || !arr->isAllocated())
2799     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getValueOnMulti : input array is null or not allocated !");
2800   int nbOfRows(getNumberOfMeshPlaces(mesh));
2801   if(arr->getNumberOfTuples()!=nbOfRows)
2802     {
2803       std::ostringstream oss; oss << "MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::getValueOnMulti : input array does not have correct number of tuples ! Excepted " << nbOfRows << " having " << arr->getNumberOfTuples() << " !";
2804       throw INTERP_KERNEL::Exception(oss.str().c_str());
2805     }
2806   int nbCols(-1),nbCompo(arr->getNumberOfComponents());
2807   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> m(computeEvaluationMatrixOnGivenPts(mesh,loc,nbOfTargetPoints,nbCols));
2808   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
2809   ret->alloc(nbOfTargetPoints,nbCompo);
2810   INTERP_KERNEL::matrixProduct(m->begin(),nbOfTargetPoints,nbCols,arr->begin(),nbOfRows,nbCompo,ret->getPointer());
2811   return ret.retn();
2812 }
2813
2814 void MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const
2815 {
2816   stream << "Kriging spatial discretization.";
2817 }
2818
2819 /*!
2820  * Returns the matrix of size nbRows = \a nbOfTargetPoints and \a nbCols = \a nbCols. This matrix is useful if
2821  *
2822  * \return the new result matrix to be deallocated by the caller.
2823  */
2824 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::computeEvaluationMatrixOnGivenPts(const MEDCouplingMesh *mesh, const double *loc, int nbOfTargetPoints, int& nbCols) const
2825 {
2826   int isDrift(-1),nbRows(-1);
2827   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrixInv(computeInverseMatrix(mesh,isDrift,nbRows));
2828   //
2829   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords=getLocalizationOfDiscValues(mesh);
2830   int nbOfPts(coords->getNumberOfTuples()),dimension(coords->getNumberOfComponents());
2831   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> locArr=DataArrayDouble::New();
2832   locArr->useArray(loc,false,CPP_DEALLOC,nbOfTargetPoints,dimension);
2833   nbCols=nbOfPts;
2834   //
2835   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrix2=coords->buildEuclidianDistanceDenseMatrixWith(locArr);
2836   operateOnDenseMatrix(mesh->getSpaceDimension(),nbOfTargetPoints*nbOfPts,matrix2->getPointer());
2837   //
2838   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrix3=DataArrayDouble::New();
2839   matrix3->alloc(nbOfTargetPoints*nbRows,1);
2840   double *work=matrix3->getPointer();
2841   const double *workCst(matrix2->begin()),*workCst2(loc);
2842   for(int i=0;i<nbOfTargetPoints;i++,workCst+=nbOfPts,workCst2+=isDrift-1)
2843     {
2844       for(int j=0;j<nbOfPts;j++)
2845         work[i*nbRows+j]=workCst[j];
2846       work[i*nbRows+nbOfPts]=1.0;
2847       for(int j=0;j<isDrift-1;j++)
2848         work[i*nbRows+(nbOfPts+1+j)]=workCst2[j];
2849     }
2850   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New());
2851   ret->alloc(nbOfTargetPoints,nbRows);
2852   INTERP_KERNEL::matrixProduct(matrix3->begin(),nbOfTargetPoints,nbRows,matrixInv->begin(),nbRows,nbRows,ret->getPointer());
2853   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret2(DataArrayDouble::New());
2854   ret2->alloc(nbOfTargetPoints*nbOfPts,1);
2855   workCst=ret->begin(); work=ret2->getPointer();
2856   for(int i=0;i<nbOfTargetPoints;i++,workCst+=nbRows)
2857     work=std::copy(workCst,workCst+nbOfPts,work);
2858   return ret2.retn();
2859 }
2860
2861 /*!
2862  * This method returns the square matrix of size \a matSz that is the inverse of the kriging matrix. The returned matrix can returned all the coeffs of kriging
2863  * when multiplied by the vector of values attached to each point.
2864  *
2865  * \param [out] isDrift return if drift coefficients are present in the returned vector of coefficients. If different from 0 there is presence of drift coefficients.
2866  * \param [out] matSz the size of returned square matrix
2867  * \return the new result matrix to be deallocated by the caller.
2868  * \sa computeMatrix
2869  */
2870 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::computeInverseMatrix(const MEDCouplingMesh *mesh, int& isDrift, int& matSz) const
2871 {
2872   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrixWithDrift(computeMatrix(mesh,isDrift,matSz));
2873   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrixInv(DataArrayDouble::New());
2874   matrixInv->alloc(matSz*matSz,1);
2875   INTERP_KERNEL::inverseMatrix(matrixWithDrift->getConstPointer(),matSz,matrixInv->getPointer());
2876   return matrixInv.retn();
2877 }
2878
2879 /*!
2880  * This method computes the kriging matrix.
2881  * \return the new result matrix to be deallocated by the caller.
2882  * \sa computeInverseMatrix
2883  */
2884 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::computeMatrix(const MEDCouplingMesh *mesh, int& isDrift, int& matSz) const
2885 {
2886   if(!mesh)
2887       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::computeMatrix : NULL input mesh !");
2888     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> coords(getLocalizationOfDiscValues(mesh));
2889     int nbOfPts(coords->getNumberOfTuples());
2890     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrix(coords->buildEuclidianDistanceDenseMatrix());
2891     operateOnDenseMatrix(mesh->getSpaceDimension(),nbOfPts*nbOfPts,matrix->getPointer());
2892     // Drift
2893     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrixWithDrift(performDrift(matrix,coords,isDrift));
2894     matSz=nbOfPts+isDrift;
2895     return matrixWithDrift.retn();
2896 }
2897
2898 /*!
2899  * This method computes coefficients to apply to each representing points of \a mesh, that is to say the nodes of \a mesh given a field array \a arr whose
2900  * number of tuples should be equal to the number of representing points in \a mesh.
2901  *
2902  * \param [in] mesh is the sources of nodes on which kriging will be done regarding the parameters and the value of \c this->getSpaceDimension()
2903  * \param [in] arr input field DataArrayDouble whose number of tuples must be equal to the number of nodes in \a mesh
2904  * \param [out] isDrift return if drift coefficients are present in the returned vector of coefficients. If different from 0 there is presence of drift coefficients.
2905  *              Whatever the value of \a isDrift the number of tuples of returned DataArrayDouble  will be equal to \c arr->getNumberOfTuples() + \a isDrift.
2906  * \return a newly allocated array containing coefficients including or not drift coefficient at the end depending the value of \a isDrift parameter.
2907  */
2908 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::computeVectorOfCoefficients(const MEDCouplingMesh *mesh, const DataArrayDouble *arr, int& isDrift) const
2909 {
2910   int nbRows(-1);
2911   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> matrixInv(computeInverseMatrix(mesh,isDrift,nbRows));
2912   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> KnewiK(DataArrayDouble::New());
2913   KnewiK->alloc(nbRows*1,1);
2914   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arr2(PerformDriftOfVec(arr,isDrift));
2915   INTERP_KERNEL::matrixProduct(matrixInv->getConstPointer(),nbRows,nbRows,arr2->getConstPointer(),arr2->getNumberOfTuples(),1,KnewiK->getPointer());
2916   return KnewiK.retn();
2917 }
2918
2919 /*!
2920  * Apply \f f(x) on each element x in \a matrixPtr. \a matrixPtr is expected to be a dense matrix represented by a chunck of memory of size at least equal to \a nbOfElems.
2921  *
2922  * \param [in] spaceDimension space dimension of the input mesh on which the Kriging has to be performed
2923  * \param [in] nbOfElems is the result of the product of nb of rows and the nb of columns of matrix \a matrixPtr
2924  * \param [in,out] matrixPtr is the dense matrix whose on each values the operation will be applied
2925  */
2926 void MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::operateOnDenseMatrix(int spaceDimension, int nbOfElems, double *matrixPtr) const
2927 {
2928   switch(spaceDimension)
2929   {
2930     case 1:
2931       {
2932         OperateOnDenseMatrixH3(nbOfElems,matrixPtr);
2933         break;
2934       }
2935     case 2:
2936       {
2937         OperateOnDenseMatrixH2Ln(nbOfElems,matrixPtr);
2938         break;
2939       }
2940     case 3:
2941       {
2942         //nothing here : it is not a bug g(h)=h with spaceDim 3.
2943         break;
2944       }
2945     default:
2946       throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::operateOnDenseMatrix : only dimension 1, 2 and 3 implemented !");
2947   }
2948 }
2949
2950 void MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::OperateOnDenseMatrixH3(int nbOfElems, double *matrixPtr)
2951 {
2952   for(int i=0;i<nbOfElems;i++)
2953     {
2954       double val=matrixPtr[i];
2955       matrixPtr[i]=val*val*val;
2956     }
2957 }
2958
2959 void MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::OperateOnDenseMatrixH2Ln(int nbOfElems, double *matrixPtr)
2960 {
2961   for(int i=0;i<nbOfElems;i++)
2962     {
2963       double val=matrixPtr[i];
2964       if(val!=0.)
2965         matrixPtr[i]=val*val*log(val);
2966     }
2967 }
2968
2969 /*!
2970  * Performs a drift to the rectangular input matrix \a matr.
2971  * This method generate a dense matrix starting from an input dense matrix \a matr and input array \a arr.
2972  * \param [in] matr The rectangular dense matrix (with only one component). The number of rows of \a matr must be equal to the number of tuples of \a arr
2973  * \param [in] arr The array of coords to be appended in the input dense matrix \a matr. Typically arr is an array of coordinates.
2974  * \param [out] delta the delta of number of columns between returned dense matrix and input dense matrix \a matr. \a delta is equal to number of components of \a arr + 1.
2975  * \sa performDrift
2976  */
2977 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftRect(const DataArrayDouble *matr, const DataArrayDouble *arr, int& delta)
2978 {
2979   if(!matr || !matr->isAllocated() || matr->getNumberOfComponents()!=1)
2980     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftRect : invalid input dense matrix ! Must be allocated not NULL and with exactly one component !");
2981   if(!arr || !arr->isAllocated())
2982     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftRect : invalid input array of coordiantes ! Must be allocated and not NULL !");
2983   int spaceDimension(arr->getNumberOfComponents()),nbOfPts(arr->getNumberOfTuples()),nbOfEltInMatrx(matr->getNumberOfTuples());
2984   delta=spaceDimension+1;
2985   int nbOfCols(nbOfEltInMatrx/nbOfPts);
2986   if(nbOfEltInMatrx%nbOfPts!=0)
2987     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftRect : size of input dense matrix and input arrays mismatch ! NbOfElems in matrix % nb of tuples in array must be equal to 0 !");
2988   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret(DataArrayDouble::New()); ret->alloc(nbOfPts*(nbOfCols+delta));
2989   double *retPtr(ret->getPointer());
2990   const double *mPtr(matr->begin()),*aPtr(arr->begin());
2991   for(int i=0;i<nbOfPts;i++,aPtr+=spaceDimension,mPtr+=nbOfCols)
2992     {
2993       retPtr=std::copy(mPtr,mPtr+nbOfCols,retPtr);
2994       *retPtr++=1.;
2995       retPtr=std::copy(aPtr,aPtr+spaceDimension,retPtr);
2996     }
2997   return ret.retn();
2998 }
2999
3000 /*!
3001  * \return a newly allocated array having \a isDrift more tuples than \a arr.
3002  * \sa computeVectorOfCoefficients
3003  */
3004 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftOfVec(const DataArrayDouble *arr, int isDrift)
3005 {
3006   if(!arr || !arr->isAllocated() || arr->getNumberOfComponents()!=1)
3007     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftOfVec : input array must be not NULL allocated and with one component !");
3008   if(isDrift<0)
3009     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftOfVec : isDrift parameter must be >=0 !");
3010   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arr2(DataArrayDouble::New());
3011   arr2->alloc((arr->getNumberOfTuples()+isDrift)*1,1);
3012   double *work(std::copy(arr->begin(),arr->end(),arr2->getPointer()));
3013   std::fill(work,work+isDrift,0.);
3014   return arr2.retn();
3015 }
3016
3017 /*!
3018  * Starting from a square matrix \a matr, this method returns a newly allocated dense square matrix whose \a matr is included in returned matrix
3019  * in the top left corner, and in the remaining returned matrix the parameters to take into account about the kriging drift.
3020  * For the moment only linear srift is implemented.
3021  *
3022  * \param [in] arr the position of points were input mesh geometry is considered for Kriging
3023  * \param [in] matr input matrix whose drift part will be added
3024  * \param [out] delta the difference between the size of the output matrix and the input matrix \a matr.
3025  * \return a newly allocated matrix bigger than input matrix \a matr.
3026  * \sa MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::PerformDriftRect
3027  */
3028 DataArrayDouble *MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::performDrift(const DataArrayDouble *matr, const DataArrayDouble *arr, int& delta) const
3029 {
3030   int spaceDimension=arr->getNumberOfComponents();
3031   delta=spaceDimension+1;
3032   int szOfMatrix=arr->getNumberOfTuples();
3033   if(szOfMatrix*szOfMatrix!=matr->getNumberOfTuples())
3034     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingFieldDiscretizationKriging::performDrift : invalid size");
3035   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> ret=DataArrayDouble::New();
3036   ret->alloc((szOfMatrix+delta)*(szOfMatrix+delta),1);
3037   const double *srcWork=matr->getConstPointer();
3038   const double *srcWork2=arr->getConstPointer();
3039   double *destWork=ret->getPointer();
3040   for(int i=0;i<szOfMatrix;i++)
3041     {
3042       destWork=std::copy(srcWork,srcWork+szOfMatrix,destWork);
3043       srcWork+=szOfMatrix;
3044       *destWork++=1.;
3045       destWork=std::copy(srcWork2,srcWork2+spaceDimension,destWork);
3046       srcWork2+=spaceDimension;
3047     }
3048   std::fill(destWork,destWork+szOfMatrix,1.); destWork+=szOfMatrix;
3049   std::fill(destWork,destWork+spaceDimension+1,0.); destWork+=spaceDimension+1;
3050   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayDouble> arrNoI=arr->toNoInterlace();
3051   srcWork2=arrNoI->getConstPointer();
3052   for(int i=0;i<spaceDimension;i++)
3053     {
3054       destWork=std::copy(srcWork2,srcWork2+szOfMatrix,destWork);
3055       srcWork2+=szOfMatrix;
3056       std::fill(destWork,destWork+spaceDimension+1,0.);
3057       destWork+=spaceDimension+1;
3058     }
3059   //
3060   return ret.retn();
3061 }