Salome HOME
Merge from V6_main 12/04/2013
[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling / MEDCouplingExtrudedMesh.cxx
1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #include "MEDCouplingExtrudedMesh.hxx"
22 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
23 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
24 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
25 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
26 #include "CellModel.hxx"
27
28 #include "InterpolationUtils.hxx"
29
30 #include <limits>
31 #include <algorithm>
32 #include <functional>
33 #include <iterator>
34 #include <sstream>
35 #include <cmath>
36 #include <list>
37 #include <set>
38
39 using namespace ParaMEDMEM;
40
41 /*!
42  * Build an extruded mesh instance from 3D and 2D unstructured mesh lying on the \b same \b coords.
43  * @param mesh3D 3D unstructured mesh.
44  * @param mesh2D 2D unstructured mesh lying on the same coordinates than mesh3D. \b Warning mesh2D is \b not \b const
45  * because the mesh is aggregated and potentially modified by rotate or translate method.
46  * @param cell2DId Id of cell in mesh2D mesh where the computation of 1D mesh will be done.
47  */
48 MEDCouplingExtrudedMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::New(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
49 {
50   return new MEDCouplingExtrudedMesh(mesh3D,mesh2D,cell2DId);
51 }
52
53 /*!
54  * This constructor is here only for unserialisation process.
55  * This constructor is normally completely useless for end user.
56  */
57 MEDCouplingExtrudedMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::New()
58 {
59   return new MEDCouplingExtrudedMesh;
60 }
61
62 MEDCouplingMeshType MEDCouplingExtrudedMesh::getType() const
63 {
64   return EXTRUDED;
65 }
66
67 std::size_t MEDCouplingExtrudedMesh::getHeapMemorySize() const
68 {
69   std::size_t ret=0;
70   if(_mesh2D)
71     ret+=_mesh2D->getHeapMemorySize();
72   if(_mesh1D)
73     ret+=_mesh1D->getHeapMemorySize();
74   if(_mesh3D_ids)
75     ret+=_mesh3D_ids->getHeapMemorySize();
76   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySize()+ret;
77 }
78
79 /*!
80  * This method copyies all tiny strings from other (name and components name).
81  * @throw if other and this have not same mesh type.
82  */
83 void MEDCouplingExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
84 {
85   const MEDCouplingExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingExtrudedMesh *>(other);
86   if(!otherC)
87     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom : meshes have not same type !");
88   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
89   _mesh2D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh2D);
90   _mesh1D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh1D);
91 }
92
93 MEDCouplingExtrudedMesh::MEDCouplingExtrudedMesh(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
94 try:_mesh2D(const_cast<MEDCouplingUMesh *>(mesh2D)),_mesh1D(MEDCouplingUMesh::New()),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(cell2DId)
95 {
96   if(_mesh2D!=0)
97     _mesh2D->incrRef();
98   computeExtrusion(mesh3D);
99   setName(mesh3D->getName());
100 }
101 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
102   {
103     if(_mesh2D)
104       _mesh2D->decrRef();
105     if(_mesh1D)
106       _mesh1D->decrRef();
107     if(_mesh3D_ids)
108       _mesh3D_ids->decrRef();
109     throw e;
110   }
111
112 MEDCouplingExtrudedMesh::MEDCouplingExtrudedMesh():_mesh2D(0),_mesh1D(0),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(-1)
113 {
114 }
115
116 MEDCouplingExtrudedMesh::MEDCouplingExtrudedMesh(const MEDCouplingExtrudedMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other),_cell_2D_id(other._cell_2D_id)
117 {
118   if(deepCopy)
119     {
120       _mesh2D=other._mesh2D->clone(true);
121       _mesh1D=other._mesh1D->clone(true);
122       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids->deepCpy();
123     }
124   else
125     {
126       _mesh2D=other._mesh2D;
127       if(_mesh2D)
128         _mesh2D->incrRef();
129       _mesh1D=other._mesh1D;
130       if(_mesh1D)
131         _mesh1D->incrRef();
132       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids;
133       if(_mesh3D_ids)
134         _mesh3D_ids->incrRef();
135     }
136 }
137
138 int MEDCouplingExtrudedMesh::getNumberOfCells() const
139 {
140   return _mesh2D->getNumberOfCells()*_mesh1D->getNumberOfCells();
141 }
142
143 int MEDCouplingExtrudedMesh::getNumberOfNodes() const
144 {
145   return _mesh2D->getNumberOfNodes();
146 }
147
148 int MEDCouplingExtrudedMesh::getSpaceDimension() const
149 {
150   return 3;
151 }
152
153 int MEDCouplingExtrudedMesh::getMeshDimension() const
154 {
155   return 3;
156 }
157
158 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::deepCpy() const
159 {
160   return clone(true);
161 }
162
163 MEDCouplingExtrudedMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::clone(bool recDeepCpy) const
164 {
165   return new MEDCouplingExtrudedMesh(*this,recDeepCpy);
166 }
167
168 bool MEDCouplingExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
169 {
170   if(!other)
171     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy : input other pointer is null !");
172   const MEDCouplingExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingExtrudedMesh *>(other);
173   std::ostringstream oss;
174   if(!otherC)
175     {
176       reason="mesh given in input is not castable in MEDCouplingExtrudedMesh !";
177       return false;
178     }
179   if(!MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason))
180     return false;
181   if(!_mesh2D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh2D,prec,reason))
182     {
183       reason.insert(0,"Mesh2D unstructured meshes differ : ");
184       return false;
185     }
186   if(!_mesh1D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh1D,prec,reason))
187     {
188       reason.insert(0,"Mesh1D unstructured meshes differ : ");
189       return false;
190     }
191   if(!_mesh3D_ids->isEqualIfNotWhy(*otherC->_mesh3D_ids,reason))
192     {
193       reason.insert(0,"Mesh3D ids DataArrayInt instances differ : ");
194       return false;
195     }
196   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
197     {
198       oss << "Cell 2D id of the two extruded mesh differ : this = " << _cell_2D_id << " other = " <<  otherC->_cell_2D_id;
199       reason=oss.str();
200       return false;
201     }
202   return true;
203 }
204
205 bool MEDCouplingExtrudedMesh::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const
206 {
207   const MEDCouplingExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingExtrudedMesh *>(other);
208   if(!otherC)
209     return false;
210   if(!_mesh2D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh2D,prec))
211     return false;
212   if(!_mesh1D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh1D,prec))
213     return false;
214   if(!_mesh3D_ids->isEqualWithoutConsideringStr(*otherC->_mesh3D_ids))
215     return false;
216   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
217     return false;
218   return true;
219 }
220
221 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
222                                                    DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
223 {
224   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith : not implemented yet !");
225 }
226
227 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
228                                                               DataArrayInt *&cellCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
229 {
230   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith : not implemented yet !");
231 }
232
233 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingExtrudedMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
234 {
235   const int *ids=_mesh3D_ids->getConstPointer();
236   int nbOf3DCells=_mesh3D_ids->getNumberOfTuples();
237   const int *where=std::find(ids,ids+nbOf3DCells,cellId);
238   if(where==ids+nbOf3DCells)
239     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid cellId specified >= getNumberOfCells() !");
240   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
241   int locId=((int)std::distance(ids,where))%nbOfCells2D;
242   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType tmp=_mesh2D->getTypeOfCell(locId);
243   return INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(tmp).getExtrudedType();
244 }
245
246 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingExtrudedMesh::getAllGeoTypes() const
247 {
248   const std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& ret2D=_mesh2D->getAllTypes();
249   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
250   for(std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator it=ret2D.begin();it!=ret2D.end();it++)
251     ret.insert(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*it).getExtrudedType());
252   return ret;
253 }
254
255 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
256 {
257   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
258   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType revExtTyp=cm.getReverseExtrudedType();
259   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
260   if(revExtTyp==INTERP_KERNEL::NORM_ERROR)
261     {
262       ret->alloc(0,1);
263       return ret.retn();
264     }
265   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=_mesh2D->giveCellsWithType(revExtTyp);
266   int nbOfLevs=_mesh1D->getNumberOfCells();
267   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
268   int nbOfTuples=tmp->getNumberOfTuples();
269   ret->alloc(nbOfLevs*nbOfTuples,1);
270   int *pt=ret->getPointer();
271   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfTuples)
272     std::transform(tmp->begin(),tmp->end(),pt,std::bind2nd(std::plus<double>(),i*nbOfCells2D));
273   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2=ret->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
274   ret2->sort();
275   return ret2.retn();
276 }
277
278 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
279 {
280   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2D=_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell();
281   int nbOfLevs=_mesh1D->getNumberOfCells();
282   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
283   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret3D=DataArrayInt::New(); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
284   int *pt=ret3D->getPointer();
285   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
286      std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
287   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
288 }
289
290 int MEDCouplingExtrudedMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
291 {
292   int ret=0;
293   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
294   for(int i=0;i<nbOfCells2D;i++)
295     {
296       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t=_mesh2D->getTypeOfCell(i);
297       if(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(t).getExtrudedType()==type)
298         ret++;
299     }
300   return ret*_mesh1D->getNumberOfCells();
301 }
302
303 void MEDCouplingExtrudedMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
304 {
305   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
306   int nbOfNodes2D=_mesh2D->getNumberOfNodes();
307   int locId=cellId%nbOfCells2D;
308   int lev=cellId/nbOfCells2D;
309   std::vector<int> tmp,tmp2;
310   _mesh2D->getNodeIdsOfCell(locId,tmp);
311   tmp2=tmp;
312   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),tmp.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*lev));
313   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),tmp2.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*(lev+1)));
314   conn.insert(conn.end(),tmp.begin(),tmp.end());
315   conn.insert(conn.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
316 }
317
318 void MEDCouplingExtrudedMesh::getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
319 {
320   int nbOfNodes2D=_mesh2D->getNumberOfNodes();
321   int locId=nodeId%nbOfNodes2D;
322   int lev=nodeId/nbOfNodes2D;
323   std::vector<double> tmp,tmp2;
324   _mesh2D->getCoordinatesOfNode(locId,tmp);
325   tmp2=tmp;
326   int spaceDim=_mesh1D->getSpaceDimension();
327   const double *z=_mesh1D->getCoords()->getConstPointer();
328   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),z+lev*spaceDim,tmp.begin(),std::plus<double>());
329   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),z+(lev+1)*spaceDim,tmp2.begin(),std::plus<double>());
330   coo.insert(coo.end(),tmp.begin(),tmp.end());
331   coo.insert(coo.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
332 }
333
334 std::string MEDCouplingExtrudedMesh::simpleRepr() const
335 {
336   std::ostringstream ret;
337   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
338   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
339   int tmpp1,tmpp2;
340   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
341   ret << "Time attached to the mesh [unit] : " << tt << " [" << getTimeUnit() << "]\n";
342   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
343   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
344   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
345   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
346   ret << _mesh1D->simpleRepr();
347   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->simpleRepr() << "\n\n\n";
348   return ret.str();
349 }
350
351 std::string MEDCouplingExtrudedMesh::advancedRepr() const
352 {
353   std::ostringstream ret;
354   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
355   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
356   int tmpp1,tmpp2;
357   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
358   ret << "Time attached to the mesh (unit) : " << tt << " (" << getTimeUnit() << ")\n";
359   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
360   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
361   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
362   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
363   ret << _mesh1D->advancedRepr();
364   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->advancedRepr() << "\n\n\n";
365   ret << "3D cell ids per level :\n";
366   return ret.str();
367 }
368
369 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkCoherency() const throw (INTERP_KERNEL::Exception)
370 {
371 }
372
373 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkCoherency1(double eps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
374 {
375   checkCoherency();
376 }
377
378 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkCoherency2(double eps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
379 {
380   checkCoherency1(eps);
381 }
382
383 void MEDCouplingExtrudedMesh::getBoundingBox(double *bbox) const
384 {
385   double bbox2D[6];
386   _mesh2D->getBoundingBox(bbox2D);
387   const double *nodes1D=_mesh1D->getCoords()->getConstPointer();
388   int nbOfNodes1D=_mesh1D->getNumberOfNodes();
389   double bbox1DMin[3],bbox1DMax[3],tmp[3];
390   std::fill(bbox1DMin,bbox1DMin+3,std::numeric_limits<double>::max());
391   std::fill(bbox1DMax,bbox1DMax+3,-(std::numeric_limits<double>::max()));
392   for(int i=0;i<nbOfNodes1D;i++)
393     {
394       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMin,bbox1DMin,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::min<double>));
395       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMax,bbox1DMax,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::max<double>));
396     }
397   std::transform(bbox1DMax,bbox1DMax+3,bbox1DMin,tmp,std::minus<double>());
398   int id=(int)std::distance(tmp,std::max_element(tmp,tmp+3));
399   bbox[0]=bbox1DMin[0]; bbox[1]=bbox1DMax[0];
400   bbox[2]=bbox1DMin[1]; bbox[3]=bbox1DMax[1];
401   bbox[4]=bbox1DMin[2]; bbox[5]=bbox1DMax[2];
402   bbox[2*id+1]+=tmp[id];
403 }
404
405 void MEDCouplingExtrudedMesh::updateTime() const
406 {
407   if(_mesh2D)
408     {
409       updateTimeWith(*_mesh2D);
410     }
411   if(_mesh1D)
412     {
413       updateTimeWith(*_mesh1D);
414     }
415 }
416
417 void MEDCouplingExtrudedMesh::renumberCells(const int *old2NewBg, bool check) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
418 {
419   throw INTERP_KERNEL::Exception("Functionnality of renumbering cells unavailable for ExtrudedMesh");
420 }
421
422 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::build3DUnstructuredMesh() const
423 {
424   MEDCouplingUMesh *ret=_mesh2D->buildExtrudedMesh(_mesh1D,0);
425   const int *renum=_mesh3D_ids->getConstPointer();
426   ret->renumberCells(renum,false);
427   ret->setName(getName());
428   return ret;
429 }
430
431 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
432 {
433   return build3DUnstructuredMesh();
434 }
435
436 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getMeasureField(bool) const
437 {
438   std::string name="MeasureOfMesh_";
439   name+=getName();
440   MEDCouplingFieldDouble *ret2D=_mesh2D->getMeasureField(true);
441   MEDCouplingFieldDouble *ret1D=_mesh1D->getMeasureField(true);
442   const double *ret2DPtr=ret2D->getArray()->getConstPointer();
443   const double *ret1DPtr=ret1D->getArray()->getConstPointer();
444   int nbOf2DCells=_mesh2D->getNumberOfCells();
445   int nbOf1DCells=_mesh1D->getNumberOfCells();
446   int nbOf3DCells=nbOf2DCells*nbOf1DCells;
447   const int *renum=_mesh3D_ids->getConstPointer();
448   MEDCouplingFieldDouble *ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,ONE_TIME);
449   ret->setMesh(this);
450   ret->synchronizeTimeWithMesh();
451   DataArrayDouble *da=DataArrayDouble::New();
452   da->alloc(nbOf3DCells,1);
453   double *retPtr=da->getPointer();
454   for(int i=0;i<nbOf1DCells;i++)
455     for(int j=0;j<nbOf2DCells;j++)
456       retPtr[renum[i*nbOf2DCells+j]]=ret2DPtr[j]*ret1DPtr[i];
457   ret->setArray(da);
458   da->decrRef();
459   ret->setName(name.c_str());
460   ret2D->decrRef();
461   ret1D->decrRef();
462   return ret;
463 }
464
465 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const
466 {
467   //not implemented yet
468   return 0;
469 }
470
471 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::buildOrthogonalField() const
472 {
473   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::buildOrthogonalField : This method has no sense for MEDCouplingExtrudedMesh that is 3D !");
474 }
475
476 int MEDCouplingExtrudedMesh::getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const
477 {
478   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::getCellContainingPoint : not implemented yet !");
479 }
480
481 MEDCouplingExtrudedMesh::~MEDCouplingExtrudedMesh()
482 {
483   if(_mesh2D)
484     _mesh2D->decrRef();
485   if(_mesh1D)
486     _mesh1D->decrRef();
487   if(_mesh3D_ids)
488     _mesh3D_ids->decrRef();
489 }
490
491 void MEDCouplingExtrudedMesh::computeExtrusion(const MEDCouplingUMesh *mesh3D) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
492 {
493   const char errMsg1[]="2D mesh is empty unable to compute extrusion !";
494   const char errMsg2[]="Coords between 2D and 3D meshes are not the same ! Try MEDCouplingPointSet::tryToShareSameCoords method";
495   const char errMsg3[]="No chance to find extrusion pattern in mesh3D,mesh2D couple because nbCells3D%nbCells2D!=0 !";
496   if(_mesh2D==0 || mesh3D==0)
497     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg1);
498   if(_mesh2D->getCoords()!=mesh3D->getCoords())
499     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg2);
500   if(mesh3D->getNumberOfCells()%_mesh2D->getNumberOfCells()!=0)
501     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg3);
502   if(!_mesh3D_ids)
503     _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
504   if(!_mesh1D)
505     _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
506   computeExtrusionAlg(mesh3D);
507 }
508
509 void MEDCouplingExtrudedMesh::build1DExtrusion(int idIn3DDesc, int newId, int nbOf1DLev, MEDCouplingUMesh *subMesh,
510                                                const int *desc3D, const int *descIndx3D,
511                                                const int *revDesc3D, const int *revDescIndx3D,
512                                                bool computeMesh1D) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
513 {
514   int nbOf2DCells=_mesh2D->getNumberOfCells();
515   int start=revDescIndx3D[idIn3DDesc];
516   int end=revDescIndx3D[idIn3DDesc+1];
517   if(end-start!=1)
518     {
519       std::ostringstream ost; ost << "Invalid bases 2D mesh specified : 2D cell # " <<  idIn3DDesc;
520       ost << " shared by more than 1 3D cell !!!";
521       throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
522     }
523   int current3DCell=revDesc3D[start];
524   int current2DCell=idIn3DDesc;
525   int *mesh3DIDs=_mesh3D_ids->getPointer();
526   mesh3DIDs[newId]=current3DCell;
527   const int *conn2D=subMesh->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
528   const int *conn2DIndx=subMesh->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
529   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
530     {
531       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
532       std::sort(conn.begin(),conn.end());
533       if(computeMesh1D)
534         computeBaryCenterOfFace(conn,i-1);
535       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
536                                        desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
537       start=revDescIndx3D[current2DCell];
538       end=revDescIndx3D[current2DCell+1];
539       if(end-start!=2)
540         {
541           std::ostringstream ost; ost << "Expecting to have 2 3D cells attached to 2D cell " << current2DCell << "!";
542           ost << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
543           throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
544         }
545       if(revDesc3D[start]!=current3DCell)
546         current3DCell=revDesc3D[start];
547       else
548         current3DCell=revDesc3D[start+1];
549       mesh3DIDs[i*nbOf2DCells+newId]=current3DCell;
550     }
551   if(computeMesh1D)
552     {
553       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
554       std::sort(conn.begin(),conn.end());
555       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev-1);
556       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
557                                        desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
558       conn.clear();
559       conn.insert(conn.end(),conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
560       std::sort(conn.begin(),conn.end());
561       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev);
562     }
563 }
564
565 int MEDCouplingExtrudedMesh::findOppositeFaceOf(int current2DCell, int current3DCell, const std::vector<int>& connSorted,
566                                                 const int *desc3D, const int *descIndx3D,
567                                                 const int *conn2D, const int *conn2DIndx) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
568 {
569   int start=descIndx3D[current3DCell];
570   int end=descIndx3D[current3DCell+1];
571   bool found=false;
572   for(const int *candidate2D=desc3D+start;candidate2D!=desc3D+end && !found;candidate2D++)
573     {
574       if(*candidate2D!=current2DCell)
575         {
576           std::vector<int> conn2(conn2D+conn2DIndx[*candidate2D]+1,conn2D+conn2DIndx[*candidate2D+1]);
577           std::sort(conn2.begin(),conn2.end());
578           std::list<int> intersect;
579           std::set_intersection(connSorted.begin(),connSorted.end(),conn2.begin(),conn2.end(),
580                                 std::insert_iterator< std::list<int> >(intersect,intersect.begin()));
581           if(intersect.empty())
582             return *candidate2D;
583         }
584     }
585   std::ostringstream ost; ost << "Impossible to find an opposite 2D face of face # " <<  current2DCell;
586   ost << " in 3D cell # " << current3DCell << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
587   throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
588 }
589
590 void MEDCouplingExtrudedMesh::computeBaryCenterOfFace(const std::vector<int>& nodalConnec, int lev1DId)
591 {
592   double *zoneToUpdate=_mesh1D->getCoords()->getPointer()+lev1DId*3;
593   std::fill(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,0.);
594   const double *coords=_mesh2D->getCoords()->getConstPointer();
595   for(std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();iter!=nodalConnec.end();iter++)
596     std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,coords+3*(*iter),zoneToUpdate,std::plus<double>());
597   std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,zoneToUpdate,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),(double)(1./(int)nodalConnec.size())));
598 }
599
600 int MEDCouplingExtrudedMesh::FindCorrespCellByNodalConn(const std::vector<int>& nodalConnec, const int *revNodalPtr, const int *revNodalIndxPtr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
601 {
602   std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();
603   std::set<int> s1(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
604   iter++;
605   for(;iter!=nodalConnec.end();iter++)
606     {
607       std::set<int> s2(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
608       std::set<int> s3;
609       std::set_intersection(s1.begin(),s1.end(),s2.begin(),s2.end(),std::insert_iterator< std::set<int> >(s3,s3.end()));
610       s1=s3;
611     }
612   if(s1.size()==1)
613     return *(s1.begin());
614   std::ostringstream ostr;
615   ostr << "Cell with nodal connec : ";
616   std::copy(nodalConnec.begin(),nodalConnec.end(),std::ostream_iterator<int>(ostr," "));
617   ostr << " is not part of mesh";
618   throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
619 }
620
621 /*!
622  * This method is callable on 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) returned by MEDCouplingExtrudedMesh::getMesh1D typically.
623  * These 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) have a special semantic because these meshes do not specify a static location but a translation along a path.
624  * This method checks that 'm1' and 'm2' are compatible, if not an exception is thrown. In case these meshes ('m1' and 'm2') are compatible 2 corresponding meshes
625  * are created ('m1r' and 'm2r') that can be used for interpolation.
626  * @param m1 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
627  * @param m2 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
628  * @param eps tolerance acceptable to determine compatibility
629  * @param m1r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
630  * @param m2r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
631  * @param v is the output normalized vector of the common direction of 'm1' and 'm2'  
632  * @throw in case that m1 and m2 are not compatible each other.
633  */
634 void MEDCouplingExtrudedMesh::Project1DMeshes(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, double eps,
635                                               MEDCouplingUMesh *&m1r, MEDCouplingUMesh *&m2r, double *v) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
636 {
637   if(m1->getSpaceDimension()!=3 || m1->getSpaceDimension()!=3)
638     throw INTERP_KERNEL::Exception("Input meshes are expected to have a spaceDim==3 for Projec1D !");
639   m1r=m1->clone(true);
640   m2r=m2->clone(true);
641   m1r->changeSpaceDimension(1);
642   m2r->changeSpaceDimension(1);
643   std::vector<int> c;
644   std::vector<double> ref,ref2;
645   m1->getNodeIdsOfCell(0,c);
646   m1->getCoordinatesOfNode(c[0],ref);
647   m1->getCoordinatesOfNode(c[1],ref2);
648   std::transform(ref2.begin(),ref2.end(),ref.begin(),v,std::minus<double>());
649   double n=INTERP_KERNEL::norm<3>(v);
650   std::transform(v,v+3,v,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1/n));
651   m1->project1D(&ref[0],v,eps,m1r->getCoords()->getPointer());
652   m2->project1D(&ref[0],v,eps,m2r->getCoords()->getPointer());
653   
654 }
655
656 void MEDCouplingExtrudedMesh::rotate(const double *center, const double *vector, double angle)
657 {
658   _mesh2D->rotate(center,vector,angle);
659   _mesh1D->rotate(center,vector,angle);
660 }
661
662 void MEDCouplingExtrudedMesh::translate(const double *vector)
663 {
664   _mesh2D->translate(vector);
665   _mesh1D->translate(vector);
666 }
667
668 void MEDCouplingExtrudedMesh::scale(const double *point, double factor)
669 {
670   _mesh2D->scale(point,factor);
671   _mesh1D->scale(point,factor);
672 }
673
674 std::vector<int> MEDCouplingExtrudedMesh::getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
675 {
676   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
677 }
678
679 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
680 {
681   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
682 }
683
684 void MEDCouplingExtrudedMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
685 {
686   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
687 }
688
689 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
690 {
691   // not implemented yet !
692   return 0;
693 }
694
695 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
696 {
697   // not implemented yet !
698   return 0;
699 }
700
701 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
702 {
703   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::simplexize : unavailable for such a type of mesh : Extruded !");
704 }
705
706 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const
707 {
708   // not implemented yet !
709   return 0;
710 }
711
712 DataArrayDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getCoordinatesAndOwner() const
713 {
714   DataArrayDouble *arr2D=_mesh2D->getCoords();
715   DataArrayDouble *arr1D=_mesh1D->getCoords();
716   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
717   ret->alloc(getNumberOfNodes(),3);
718   int nbOf1DLev=_mesh1D->getNumberOfNodes();
719   int nbOf2DNodes=_mesh2D->getNumberOfNodes();
720   const double *ptSrc=arr2D->getConstPointer();
721   double *pt=ret->getPointer();
722   std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt);
723   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
724     {
725       std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt+3*i*nbOf2DNodes);
726       double vec[3];
727       std::copy(arr1D->getConstPointer()+3*i,arr1D->getConstPointer()+3*(i+1),vec);
728       std::transform(arr1D->getConstPointer()+3*(i-1),arr1D->getConstPointer()+3*i,vec,vec,std::minus<double>());
729       for(int j=0;j<nbOf2DNodes;j++)
730         std::transform(vec,vec+3,pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),std::plus<double>());
731     }
732   return ret;
733 }
734
735 DataArrayDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getBarycenterAndOwner() const
736 {
737   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::getBarycenterAndOwner : not yet implemented !");
738 }
739
740 DataArrayDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
741 {
742   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell: not yet implemented !");
743 }
744
745 void MEDCouplingExtrudedMesh::computeExtrusionAlg(const MEDCouplingUMesh *mesh3D) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
746 {
747   _mesh3D_ids->alloc(mesh3D->getNumberOfCells(),1);
748   int nbOf1DLev=mesh3D->getNumberOfCells()/_mesh2D->getNumberOfCells();
749   _mesh1D->setMeshDimension(1);
750   _mesh1D->allocateCells(nbOf1DLev);
751   int tmpConn[2];
752   for(int i=0;i<nbOf1DLev;i++)
753     {
754       tmpConn[0]=i;
755       tmpConn[1]=i+1;
756       _mesh1D->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_SEG2,2,tmpConn);
757     }
758   _mesh1D->finishInsertingCells();
759   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
760   myCoords->alloc(nbOf1DLev+1,3);
761   _mesh1D->setCoords(myCoords);
762   myCoords->decrRef();
763   DataArrayInt *desc,*descIndx,*revDesc,*revDescIndx;
764   desc=DataArrayInt::New(); descIndx=DataArrayInt::New(); revDesc=DataArrayInt::New(); revDescIndx=DataArrayInt::New();
765   MEDCouplingUMesh *subMesh=mesh3D->buildDescendingConnectivity(desc,descIndx,revDesc,revDescIndx);
766   DataArrayInt *revNodal2D,*revNodalIndx2D;
767   revNodal2D=DataArrayInt::New(); revNodalIndx2D=DataArrayInt::New();
768   subMesh->getReverseNodalConnectivity(revNodal2D,revNodalIndx2D);
769   const int *nodal2D=_mesh2D->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
770   const int *nodal2DIndx=_mesh2D->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
771   const int *revNodal2DPtr=revNodal2D->getConstPointer();
772   const int *revNodalIndx2DPtr=revNodalIndx2D->getConstPointer();
773   const int *descP=desc->getConstPointer();
774   const int *descIndxP=descIndx->getConstPointer();
775   const int *revDescP=revDesc->getConstPointer();
776   const int *revDescIndxP=revDescIndx->getConstPointer();
777   //
778   int nbOf2DCells=_mesh2D->getNumberOfCells();
779   for(int i=0;i<nbOf2DCells;i++)
780     {
781       int idInSubMesh;
782        std::vector<int> nodalConnec(nodal2D+nodal2DIndx[i]+1,nodal2D+nodal2DIndx[i+1]);
783        try
784         {
785           idInSubMesh=FindCorrespCellByNodalConn(nodalConnec,revNodal2DPtr,revNodalIndx2DPtr);
786         }
787        catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
788          {
789            std::ostringstream ostr; ostr << "mesh2D cell # " << i << " is not part of any cell of 3D mesh !\n";
790            ostr << e.what();
791            throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
792          }
793        build1DExtrusion(idInSubMesh,i,nbOf1DLev,subMesh,descP,descIndxP,revDescP,revDescIndxP,i==_cell_2D_id);
794     }
795   //
796   revNodal2D->decrRef();
797   revNodalIndx2D->decrRef();
798   subMesh->decrRef();
799   desc->decrRef();
800   descIndx->decrRef();
801   revDesc->decrRef();
802   revDescIndx->decrRef();
803 }
804
805 void MEDCouplingExtrudedMesh::getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const
806 {
807   std::vector<int> tinyInfo1;
808   std::vector<std::string> ls1;
809   std::vector<double> ls3;
810   _mesh2D->getTinySerializationInformation(ls3,tinyInfo1,ls1);
811   std::vector<int> tinyInfo2;
812   std::vector<std::string> ls2;
813   std::vector<double> ls4;
814   _mesh1D->getTinySerializationInformation(ls4,tinyInfo2,ls2);
815   tinyInfo.clear(); littleStrings.clear();
816   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo1.begin(),tinyInfo1.end());
817   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls1.begin(),ls1.end());
818   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo2.begin(),tinyInfo2.end());
819   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls2.begin(),ls2.end());
820   tinyInfo.push_back(_cell_2D_id);
821   tinyInfo.push_back((int)tinyInfo1.size());
822   tinyInfo.push_back(_mesh3D_ids->getNbOfElems());
823   littleStrings.push_back(getName());
824   littleStrings.push_back(getDescription());
825 }
826
827 void MEDCouplingExtrudedMesh::resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const
828 {
829   std::size_t sz=tinyInfo.size();
830   int sz1=tinyInfo[sz-2];
831   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
832   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
833   MEDCouplingUMesh *um=MEDCouplingUMesh::New();
834   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
835   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
836   int la1=0,la2=0;
837   std::vector<std::string> ls1,ls2;
838   um->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
839   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
840   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
841   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
842   um->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
843   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
844   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
845   um->decrRef();
846   //
847   a1->alloc(la1+tinyInfo[sz-1],1);
848   a2->alloc(la2,1);
849   littleStrings.resize(ls1.size()+ls2.size()+2);
850 }
851
852 void MEDCouplingExtrudedMesh::serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const
853 {
854   a1=DataArrayInt::New(); a2=DataArrayDouble::New();
855   DataArrayInt *a1_1=0,*a1_2=0;
856   DataArrayDouble *a2_1=0,*a2_2=0;
857   _mesh2D->serialize(a1_1,a2_1);
858   _mesh1D->serialize(a1_2,a2_2);
859   a1->alloc(a1_1->getNbOfElems()+a1_2->getNbOfElems()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),1);
860   int *ptri=a1->getPointer();
861   ptri=std::copy(a1_1->getConstPointer(),a1_1->getConstPointer()+a1_1->getNbOfElems(),ptri);
862   a1_1->decrRef();
863   ptri=std::copy(a1_2->getConstPointer(),a1_2->getConstPointer()+a1_2->getNbOfElems(),ptri);
864   a1_2->decrRef();
865   std::copy(_mesh3D_ids->getConstPointer(),_mesh3D_ids->getConstPointer()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),ptri);
866   a2->alloc(a2_1->getNbOfElems()+a2_2->getNbOfElems(),1);
867   double *ptrd=a2->getPointer();
868   ptrd=std::copy(a2_1->getConstPointer(),a2_1->getConstPointer()+a2_1->getNbOfElems(),ptrd);
869   a2_1->decrRef();
870   std::copy(a2_2->getConstPointer(),a2_2->getConstPointer()+a2_2->getNbOfElems(),ptrd);
871   a2_2->decrRef();
872 }
873
874 void MEDCouplingExtrudedMesh::unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, const std::vector<std::string>& littleStrings)
875 {
876   setName(littleStrings[littleStrings.size()-2].c_str());
877   setDescription(littleStrings.back().c_str());
878   std::size_t sz=tinyInfo.size();
879   int sz1=tinyInfo[sz-2];
880   _cell_2D_id=tinyInfo[sz-3];
881   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
882   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
883   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
884   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
885   const int *a1Ptr=a1->getConstPointer();
886   const double *a2Ptr=a2->getConstPointer();
887   _mesh2D=MEDCouplingUMesh::New();
888   std::vector<std::string> ls1,ls2;
889   _mesh2D->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
890   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
891   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
892   a2Ptr+=a2tmp->getNbOfElems();
893   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
894   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin(),littleStrings.begin()+ls1.size());
895   std::vector<double> d1(1);
896   _mesh2D->unserialization(d1,ti1,a1tmp,a2tmp,ls2);
897   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
898   //
899   ls2.clear();
900   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin()+ls1.size(),littleStrings.end()-2);
901   _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
902   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
903   _mesh1D->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls1);
904   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
905   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
906   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
907   _mesh1D->unserialization(d1,ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
908   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
909   //
910   _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
911   int szIds=(int)std::distance(a1Ptr,a1->getConstPointer()+a1->getNbOfElems());
912   _mesh3D_ids->alloc(szIds,1);
913   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+szIds,_mesh3D_ids->getPointer());
914 }
915
916 void MEDCouplingExtrudedMesh::writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
917 {
918   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=buildUnstructured();
919   m->writeVTKLL(ofs,cellData,pointData);
920 }
921
922 void MEDCouplingExtrudedMesh::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
923 {
924   stream << "MEDCouplingExtrudedMesh C++ instance at " << this << ". Name : \"" << getName() << "\".";
925 }
926
927 std::string MEDCouplingExtrudedMesh::getVTKDataSetType() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
928 {
929   return _mesh2D->getVTKDataSetType();
930 }