src/MEDCoupling/MEDCouplingExtrudedMesh.cxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #include "MEDCouplingExtrudedMesh.hxx"
  22 #include "MEDCouplingUMesh.hxx"
  23 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  24 #include "MEDCouplingFieldDouble.hxx"
  25 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
  26 #include "CellModel.hxx"
  27
  28 #include "InterpolationUtils.hxx"
  29
  30 #include <limits>
  31 #include <algorithm>
  32 #include <functional>
  33 #include <iterator>
  34 #include <sstream>
  35 #include <cmath>
  36 #include <list>
  37 #include <set>
  38
  39 using namespace ParaMEDMEM;
  40
  41 /*!
  42  * Build an extruded mesh instance from 3D and 2D unstructured mesh lying on the \b same \b coords.
  43  * @param mesh3D 3D unstructured mesh.
  44  * @param mesh2D 2D unstructured mesh lying on the same coordinates than mesh3D. \b Warning mesh2D is \b not \b const
  45  * because the mesh is aggregated and potentially modified by rotate or translate method.
  46  * @param cell2DId Id of cell in mesh2D mesh where the computation of 1D mesh will be done.
  47  */
  48 MEDCouplingExtrudedMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::New(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  49 {
  50   return new MEDCouplingExtrudedMesh(mesh3D,mesh2D,cell2DId);
  51 }
  52
  53 /*!
  54  * This constructor is here only for unserialisation process.
  55  * This constructor is normally completely useless for end user.
  56  */
  57 MEDCouplingExtrudedMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::New()
  58 {
  59   return new MEDCouplingExtrudedMesh;
  60 }
  61
  62 MEDCouplingMeshType MEDCouplingExtrudedMesh::getType() const
  63 {
  64   return EXTRUDED;
  65 }
  66
  67 std::size_t MEDCouplingExtrudedMesh::getHeapMemorySize() const
  68 {
  69   std::size_t ret=0;
  70   if(_mesh2D)
  71     ret+=_mesh2D->getHeapMemorySize();
  72   if(_mesh1D)
  73     ret+=_mesh1D->getHeapMemorySize();
  74   if(_mesh3D_ids)
  75     ret+=_mesh3D_ids->getHeapMemorySize();
  76   return MEDCouplingMesh::getHeapMemorySize()+ret;
  77 }
  78
  79 /*!
  80  * This method copyies all tiny strings from other (name and components name).
  81  * @throw if other and this have not same mesh type.
  82  */
  83 void MEDCouplingExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom(const MEDCouplingMesh *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  84 {
  85   const MEDCouplingExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingExtrudedMesh *>(other);
  86   if(!otherC)
  87     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::copyTinyStringsFrom : meshes have not same type !");
  88   MEDCouplingMesh::copyTinyStringsFrom(other);
  89   _mesh2D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh2D);
  90   _mesh1D->copyTinyStringsFrom(otherC->_mesh1D);
  91 }
  92
  93 MEDCouplingExtrudedMesh::MEDCouplingExtrudedMesh(const MEDCouplingUMesh *mesh3D, const MEDCouplingUMesh *mesh2D, int cell2DId) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
  94 try:_mesh2D(const_cast<MEDCouplingUMesh *>(mesh2D)),_mesh1D(MEDCouplingUMesh::New()),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(cell2DId)
  95 {
  96   if(_mesh2D!=0)
  97     _mesh2D->incrRef();
  98   computeExtrusion(mesh3D);
  99   setName(mesh3D->getName().c_str());
 100 }
 101 catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
 102   {
 103     if(_mesh2D)
 104       _mesh2D->decrRef();
 105     if(_mesh1D)
 106       _mesh1D->decrRef();
 107     if(_mesh3D_ids)
 108       _mesh3D_ids->decrRef();
 109     throw e;
 110   }
 111
 112 MEDCouplingExtrudedMesh::MEDCouplingExtrudedMesh():_mesh2D(0),_mesh1D(0),_mesh3D_ids(0),_cell_2D_id(-1)
 113 {
 114 }
 115
 116 MEDCouplingExtrudedMesh::MEDCouplingExtrudedMesh(const MEDCouplingExtrudedMesh& other, bool deepCopy):MEDCouplingMesh(other),_cell_2D_id(other._cell_2D_id)
 117 {
 118   if(deepCopy)
 119     {
 120       _mesh2D=other._mesh2D->clone(true);
 121       _mesh1D=other._mesh1D->clone(true);
 122       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids->deepCpy();
 123     }
 124   else
 125     {
 126       _mesh2D=other._mesh2D;
 127       if(_mesh2D)
 128         _mesh2D->incrRef();
 129       _mesh1D=other._mesh1D;
 130       if(_mesh1D)
 131         _mesh1D->incrRef();
 132       _mesh3D_ids=other._mesh3D_ids;
 133       if(_mesh3D_ids)
 134         _mesh3D_ids->incrRef();
 135     }
 136 }
 137
 138 int MEDCouplingExtrudedMesh::getNumberOfCells() const
 139 {
 140   return _mesh2D->getNumberOfCells()*_mesh1D->getNumberOfCells();
 141 }
 142
 143 int MEDCouplingExtrudedMesh::getNumberOfNodes() const
 144 {
 145   return _mesh2D->getNumberOfNodes();
 146 }
 147
 148 int MEDCouplingExtrudedMesh::getSpaceDimension() const
 149 {
 150   return 3;
 151 }
 152
 153 int MEDCouplingExtrudedMesh::getMeshDimension() const
 154 {
 155   return 3;
 156 }
 157
 158 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::deepCpy() const
 159 {
 160   return clone(true);
 161 }
 162
 163 MEDCouplingExtrudedMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::clone(bool recDeepCpy) const
 164 {
 165   return new MEDCouplingExtrudedMesh(*this,recDeepCpy);
 166 }
 167
 168 bool MEDCouplingExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 169 {
 170   if(!other)
 171     throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::isEqualIfNotWhy : input other pointer is null !");
 172   const MEDCouplingExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingExtrudedMesh *>(other);
 173   std::ostringstream oss;
 174   if(!otherC)
 175     {
 176       reason="mesh given in input is not castable in MEDCouplingExtrudedMesh !";
 177       return false;
 178     }
 179   if(!MEDCouplingMesh::isEqualIfNotWhy(other,prec,reason))
 180     return false;
 181   if(!_mesh2D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh2D,prec,reason))
 182     {
 183       reason.insert(0,"Mesh2D unstructured meshes differ : ");
 184       return false;
 185     }
 186   if(!_mesh1D->isEqualIfNotWhy(otherC->_mesh1D,prec,reason))
 187     {
 188       reason.insert(0,"Mesh1D unstructured meshes differ : ");
 189       return false;
 190     }
 191   if(!_mesh3D_ids->isEqualIfNotWhy(*otherC->_mesh3D_ids,reason))
 192     {
 193       reason.insert(0,"Mesh3D ids DataArrayInt instances differ : ");
 194       return false;
 195     }
 196   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
 197     {
 198       oss << "Cell 2D id of the two extruded mesh differ : this = " << _cell_2D_id << " other = " <<  otherC->_cell_2D_id;
 199       reason=oss.str();
 200       return false;
 201     }
 202   return true;
 203 }
 204
 205 bool MEDCouplingExtrudedMesh::isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const
 206 {
 207   const MEDCouplingExtrudedMesh *otherC=dynamic_cast<const MEDCouplingExtrudedMesh *>(other);
 208   if(!otherC)
 209     return false;
 210   if(!_mesh2D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh2D,prec))
 211     return false;
 212   if(!_mesh1D->isEqualWithoutConsideringStr(otherC->_mesh1D,prec))
 213     return false;
 214   if(!_mesh3D_ids->isEqualWithoutConsideringStr(*otherC->_mesh3D_ids))
 215     return false;
 216   if(_cell_2D_id!=otherC->_cell_2D_id)
 217     return false;
 218   return true;
 219 }
 220
 221 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
 222                                                    DataArrayInt *&cellCor, DataArrayInt *&nodeCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 223 {
 224   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalWith : not implemented yet !");
 225 }
 226
 227 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith(const MEDCouplingMesh *other, int cellCompPol, double prec,
 228                                                               DataArrayInt *&cellCor) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 229 {
 230   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::checkDeepEquivalOnSameNodesWith : not implemented yet !");
 231 }
 232
 233 INTERP_KERNEL::NormalizedCellType MEDCouplingExtrudedMesh::getTypeOfCell(int cellId) const
 234 {
 235   const int *ids=_mesh3D_ids->getConstPointer();
 236   int nbOf3DCells=_mesh3D_ids->getNumberOfTuples();
 237   const int *where=std::find(ids,ids+nbOf3DCells,cellId);
 238   if(where==ids+nbOf3DCells)
 239     throw INTERP_KERNEL::Exception("Invalid cellId specified >= getNumberOfCells() !");
 240   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
 241   int locId=((int)std::distance(ids,where))%nbOfCells2D;
 242   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType tmp=_mesh2D->getTypeOfCell(locId);
 243   return INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(tmp).getExtrudedType();
 244 }
 245
 246 std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> MEDCouplingExtrudedMesh::getAllGeoTypes() const
 247 {
 248   const std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>& ret2D=_mesh2D->getAllTypes();
 249   std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> ret;
 250   for(std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType>::const_iterator it=ret2D.begin();it!=ret2D.end();it++)
 251     ret.insert(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(*it).getExtrudedType());
 252   return ret;
 253 }
 254
 255 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 256 {
 257   const INTERP_KERNEL::CellModel& cm=INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(type);
 258   INTERP_KERNEL::NormalizedCellType revExtTyp=cm.getReverseExtrudedType();
 259   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret=DataArrayInt::New();
 260   if(revExtTyp==INTERP_KERNEL::NORM_ERROR)
 261     {
 262       ret->alloc(0,1);
 263       return ret.retn();
 264     }
 265   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> tmp=_mesh2D->giveCellsWithType(revExtTyp);
 266   int nbOfLevs=_mesh1D->getNumberOfCells();
 267   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
 268   int nbOfTuples=tmp->getNumberOfTuples();
 269   ret->alloc(nbOfLevs*nbOfTuples,1);
 270   int *pt=ret->getPointer();
 271   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfTuples)
 272     std::transform(tmp->begin(),tmp->end(),pt,std::bind2nd(std::plus<double>(),i*nbOfCells2D));
 273   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2=ret->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 274   ret2->sort();
 275   return ret2.retn();
 276 }
 277
 278 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 279 {
 280   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2D=_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell();
 281   int nbOfLevs=_mesh1D->getNumberOfCells();
 282   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
 283   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret3D=DataArrayInt::New(); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
 284   int *pt=ret3D->getPointer();
 285   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
 286      std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
 287   ret3D->applyLin(2,0,0);
 288   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 289 }
 290
 291 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::computeNbOfFacesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 292 {
 293   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret2D=_mesh2D->computeNbOfNodesPerCell();
 294   int nbOfLevs=_mesh1D->getNumberOfCells();
 295   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
 296   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> ret3D=DataArrayInt::New(); ret3D->alloc(nbOfLevs*nbOfCells2D,1);
 297   int *pt=ret3D->getPointer();
 298   for(int i=0;i<nbOfLevs;i++,pt+=nbOfCells2D)
 299      std::copy(ret2D->begin(),ret2D->end(),pt);
 300   ret3D->applyLin(2,2,0);
 301   return ret3D->renumberR(_mesh3D_ids->begin());
 302 }
 303
 304 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 305 {
 306   return computeNbOfNodesPerCell();
 307 }
 308
 309 int MEDCouplingExtrudedMesh::getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const
 310 {
 311   int ret=0;
 312   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
 313   for(int i=0;i<nbOfCells2D;i++)
 314     {
 315       INTERP_KERNEL::NormalizedCellType t=_mesh2D->getTypeOfCell(i);
 316       if(INTERP_KERNEL::CellModel::GetCellModel(t).getExtrudedType()==type)
 317         ret++;
 318     }
 319   return ret*_mesh1D->getNumberOfCells();
 320 }
 321
 322 void MEDCouplingExtrudedMesh::getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const
 323 {
 324   int nbOfCells2D=_mesh2D->getNumberOfCells();
 325   int nbOfNodes2D=_mesh2D->getNumberOfNodes();
 326   int locId=cellId%nbOfCells2D;
 327   int lev=cellId/nbOfCells2D;
 328   std::vector<int> tmp,tmp2;
 329   _mesh2D->getNodeIdsOfCell(locId,tmp);
 330   tmp2=tmp;
 331   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),tmp.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*lev));
 332   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),tmp2.begin(),std::bind2nd(std::plus<int>(),nbOfNodes2D*(lev+1)));
 333   conn.insert(conn.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 334   conn.insert(conn.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 335 }
 336
 337 void MEDCouplingExtrudedMesh::getCoordinatesOfNode(int nodeId, std::vector<double>& coo) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 338 {
 339   int nbOfNodes2D=_mesh2D->getNumberOfNodes();
 340   int locId=nodeId%nbOfNodes2D;
 341   int lev=nodeId/nbOfNodes2D;
 342   std::vector<double> tmp,tmp2;
 343   _mesh2D->getCoordinatesOfNode(locId,tmp);
 344   tmp2=tmp;
 345   int spaceDim=_mesh1D->getSpaceDimension();
 346   const double *z=_mesh1D->getCoords()->getConstPointer();
 347   std::transform(tmp.begin(),tmp.end(),z+lev*spaceDim,tmp.begin(),std::plus<double>());
 348   std::transform(tmp2.begin(),tmp2.end(),z+(lev+1)*spaceDim,tmp2.begin(),std::plus<double>());
 349   coo.insert(coo.end(),tmp.begin(),tmp.end());
 350   coo.insert(coo.end(),tmp2.begin(),tmp2.end());
 351 }
 352
 353 std::string MEDCouplingExtrudedMesh::simpleRepr() const
 354 {
 355   std::ostringstream ret;
 356   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
 357   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
 358   int tmpp1,tmpp2;
 359   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
 360   ret << "Time attached to the mesh [unit] : " << tt << " [" << getTimeUnit() << "]\n";
 361   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
 362   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
 363   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
 364   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
 365   ret << _mesh1D->simpleRepr();
 366   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->simpleRepr() << "\n\n\n";
 367   return ret.str();
 368 }
 369
 370 std::string MEDCouplingExtrudedMesh::advancedRepr() const
 371 {
 372   std::ostringstream ret;
 373   ret << "3D Extruded mesh from a 2D Surf Mesh with name : \"" << getName() << "\"\n";
 374   ret << "Description of mesh : \"" << getDescription() << "\"\n";
 375   int tmpp1,tmpp2;
 376   double tt=getTime(tmpp1,tmpp2);
 377   ret << "Time attached to the mesh (unit) : " << tt << " (" << getTimeUnit() << ")\n";
 378   ret << "Iteration : " << tmpp1  << " Order : " << tmpp2 << "\n";
 379   ret << "Cell id where 1D mesh has been deduced : " << _cell_2D_id << "\n";
 380   ret << "Number of cells : " << getNumberOfCells() << "(" << _mesh2D->getNumberOfCells() << "x" << _mesh1D->getNumberOfCells() << ")\n";
 381   ret << "1D Mesh info : _____________________\n\n\n";
 382   ret << _mesh1D->advancedRepr();
 383   ret << "\n\n\n2D Mesh info : _____________________\n\n\n" << _mesh2D->advancedRepr() << "\n\n\n";
 384   ret << "3D cell ids per level :\n";
 385   return ret.str();
 386 }
 387
 388 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkCoherency() const throw (INTERP_KERNEL::Exception)
 389 {
 390 }
 391
 392 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkCoherency1(double eps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 393 {
 394   checkCoherency();
 395 }
 396
 397 void MEDCouplingExtrudedMesh::checkCoherency2(double eps) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 398 {
 399   checkCoherency1(eps);
 400 }
 401
 402 void MEDCouplingExtrudedMesh::getBoundingBox(double *bbox) const
 403 {
 404   double bbox2D[6];
 405   _mesh2D->getBoundingBox(bbox2D);
 406   const double *nodes1D=_mesh1D->getCoords()->getConstPointer();
 407   int nbOfNodes1D=_mesh1D->getNumberOfNodes();
 408   double bbox1DMin[3],bbox1DMax[3],tmp[3];
 409   std::fill(bbox1DMin,bbox1DMin+3,std::numeric_limits<double>::max());
 410   std::fill(bbox1DMax,bbox1DMax+3,-(std::numeric_limits<double>::max()));
 411   for(int i=0;i<nbOfNodes1D;i++)
 412     {
 413       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMin,bbox1DMin,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::min<double>));
 414       std::transform(nodes1D+3*i,nodes1D+3*(i+1),bbox1DMax,bbox1DMax,static_cast<const double& (*)(const double&, const double&)>(std::max<double>));
 415     }
 416   std::transform(bbox1DMax,bbox1DMax+3,bbox1DMin,tmp,std::minus<double>());
 417   int id=(int)std::distance(tmp,std::max_element(tmp,tmp+3));
 418   bbox[0]=bbox1DMin[0]; bbox[1]=bbox1DMax[0];
 419   bbox[2]=bbox1DMin[1]; bbox[3]=bbox1DMax[1];
 420   bbox[4]=bbox1DMin[2]; bbox[5]=bbox1DMax[2];
 421   bbox[2*id+1]+=tmp[id];
 422 }
 423
 424 void MEDCouplingExtrudedMesh::updateTime() const
 425 {
 426   if(_mesh2D)
 427     {
 428       updateTimeWith(*_mesh2D);
 429     }
 430   if(_mesh1D)
 431     {
 432       updateTimeWith(*_mesh1D);
 433     }
 434 }
 435
 436 void MEDCouplingExtrudedMesh::renumberCells(const int *old2NewBg, bool check) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 437 {
 438   throw INTERP_KERNEL::Exception("Functionnality of renumbering cells unavailable for ExtrudedMesh");
 439 }
 440
 441 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::build3DUnstructuredMesh() const
 442 {
 443   MEDCouplingUMesh *ret=_mesh2D->buildExtrudedMesh(_mesh1D,0);
 444   const int *renum=_mesh3D_ids->getConstPointer();
 445   ret->renumberCells(renum,false);
 446   ret->setName(getName().c_str());
 447   return ret;
 448 }
 449
 450 MEDCouplingUMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 451 {
 452   return build3DUnstructuredMesh();
 453 }
 454
 455 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getMeasureField(bool) const
 456 {
 457   std::string name="MeasureOfMesh_";
 458   name+=getName();
 459   MEDCouplingFieldDouble *ret2D=_mesh2D->getMeasureField(true);
 460   MEDCouplingFieldDouble *ret1D=_mesh1D->getMeasureField(true);
 461   const double *ret2DPtr=ret2D->getArray()->getConstPointer();
 462   const double *ret1DPtr=ret1D->getArray()->getConstPointer();
 463   int nbOf2DCells=_mesh2D->getNumberOfCells();
 464   int nbOf1DCells=_mesh1D->getNumberOfCells();
 465   int nbOf3DCells=nbOf2DCells*nbOf1DCells;
 466   const int *renum=_mesh3D_ids->getConstPointer();
 467   MEDCouplingFieldDouble *ret=MEDCouplingFieldDouble::New(ON_CELLS,ONE_TIME);
 468   ret->setMesh(this);
 469   ret->synchronizeTimeWithMesh();
 470   DataArrayDouble *da=DataArrayDouble::New();
 471   da->alloc(nbOf3DCells,1);
 472   double *retPtr=da->getPointer();
 473   for(int i=0;i<nbOf1DCells;i++)
 474     for(int j=0;j<nbOf2DCells;j++)
 475       retPtr[renum[i*nbOf2DCells+j]]=ret2DPtr[j]*ret1DPtr[i];
 476   ret->setArray(da);
 477   da->decrRef();
 478   ret->setName(name.c_str());
 479   ret2D->decrRef();
 480   ret1D->decrRef();
 481   return ret;
 482 }
 483
 484 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const
 485 {
 486   //not implemented yet
 487   return 0;
 488 }
 489
 490 MEDCouplingFieldDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::buildOrthogonalField() const
 491 {
 492   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::buildOrthogonalField : This method has no sense for MEDCouplingExtrudedMesh that is 3D !");
 493 }
 494
 495 int MEDCouplingExtrudedMesh::getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const
 496 {
 497   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::getCellContainingPoint : not implemented yet !");
 498 }
 499
 500 MEDCouplingExtrudedMesh::~MEDCouplingExtrudedMesh()
 501 {
 502   if(_mesh2D)
 503     _mesh2D->decrRef();
 504   if(_mesh1D)
 505     _mesh1D->decrRef();
 506   if(_mesh3D_ids)
 507     _mesh3D_ids->decrRef();
 508 }
 509
 510 void MEDCouplingExtrudedMesh::computeExtrusion(const MEDCouplingUMesh *mesh3D) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 511 {
 512   const char errMsg1[]="2D mesh is empty unable to compute extrusion !";
 513   const char errMsg2[]="Coords between 2D and 3D meshes are not the same ! Try MEDCouplingPointSet::tryToShareSameCoords method";
 514   const char errMsg3[]="No chance to find extrusion pattern in mesh3D,mesh2D couple because nbCells3D%nbCells2D!=0 !";
 515   if(_mesh2D==0 || mesh3D==0)
 516     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg1);
 517   if(_mesh2D->getCoords()!=mesh3D->getCoords())
 518     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg2);
 519   if(mesh3D->getNumberOfCells()%_mesh2D->getNumberOfCells()!=0)
 520     throw INTERP_KERNEL::Exception(errMsg3);
 521   if(!_mesh3D_ids)
 522     _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
 523   if(!_mesh1D)
 524     _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
 525   computeExtrusionAlg(mesh3D);
 526 }
 527
 528 void MEDCouplingExtrudedMesh::build1DExtrusion(int idIn3DDesc, int newId, int nbOf1DLev, MEDCouplingUMesh *subMesh,
 529                                                const int *desc3D, const int *descIndx3D,
 530                                                const int *revDesc3D, const int *revDescIndx3D,
 531                                                bool computeMesh1D) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 532 {
 533   int nbOf2DCells=_mesh2D->getNumberOfCells();
 534   int start=revDescIndx3D[idIn3DDesc];
 535   int end=revDescIndx3D[idIn3DDesc+1];
 536   if(end-start!=1)
 537     {
 538       std::ostringstream ost; ost << "Invalid bases 2D mesh specified : 2D cell # " <<  idIn3DDesc;
 539       ost << " shared by more than 1 3D cell !!!";
 540       throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 541     }
 542   int current3DCell=revDesc3D[start];
 543   int current2DCell=idIn3DDesc;
 544   int *mesh3DIDs=_mesh3D_ids->getPointer();
 545   mesh3DIDs[newId]=current3DCell;
 546   const int *conn2D=subMesh->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
 547   const int *conn2DIndx=subMesh->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
 548   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
 549     {
 550       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 551       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 552       if(computeMesh1D)
 553         computeBaryCenterOfFace(conn,i-1);
 554       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
 555                                        desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
 556       start=revDescIndx3D[current2DCell];
 557       end=revDescIndx3D[current2DCell+1];
 558       if(end-start!=2)
 559         {
 560           std::ostringstream ost; ost << "Expecting to have 2 3D cells attached to 2D cell " << current2DCell << "!";
 561           ost << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
 562           throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 563         }
 564       if(revDesc3D[start]!=current3DCell)
 565         current3DCell=revDesc3D[start];
 566       else
 567         current3DCell=revDesc3D[start+1];
 568       mesh3DIDs[i*nbOf2DCells+newId]=current3DCell;
 569     }
 570   if(computeMesh1D)
 571     {
 572       std::vector<int> conn(conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 573       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 574       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev-1);
 575       current2DCell=findOppositeFaceOf(current2DCell,current3DCell,conn,
 576                                        desc3D,descIndx3D,conn2D,conn2DIndx);
 577       conn.clear();
 578       conn.insert(conn.end(),conn2D+conn2DIndx[current2DCell]+1,conn2D+conn2DIndx[current2DCell+1]);
 579       std::sort(conn.begin(),conn.end());
 580       computeBaryCenterOfFace(conn,nbOf1DLev);
 581     }
 582 }
 583
 584 int MEDCouplingExtrudedMesh::findOppositeFaceOf(int current2DCell, int current3DCell, const std::vector<int>& connSorted,
 585                                                 const int *desc3D, const int *descIndx3D,
 586                                                 const int *conn2D, const int *conn2DIndx) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 587 {
 588   int start=descIndx3D[current3DCell];
 589   int end=descIndx3D[current3DCell+1];
 590   bool found=false;
 591   for(const int *candidate2D=desc3D+start;candidate2D!=desc3D+end && !found;candidate2D++)
 592     {
 593       if(*candidate2D!=current2DCell)
 594         {
 595           std::vector<int> conn2(conn2D+conn2DIndx[*candidate2D]+1,conn2D+conn2DIndx[*candidate2D+1]);
 596           std::sort(conn2.begin(),conn2.end());
 597           std::list<int> intersect;
 598           std::set_intersection(connSorted.begin(),connSorted.end(),conn2.begin(),conn2.end(),
 599                                 std::insert_iterator< std::list<int> >(intersect,intersect.begin()));
 600           if(intersect.empty())
 601             return *candidate2D;
 602         }
 603     }
 604   std::ostringstream ost; ost << "Impossible to find an opposite 2D face of face # " <<  current2DCell;
 605   ost << " in 3D cell # " << current3DCell << " : Impossible or call tryToShareSameCoords method !";
 606   throw INTERP_KERNEL::Exception(ost.str().c_str());
 607 }
 608
 609 void MEDCouplingExtrudedMesh::computeBaryCenterOfFace(const std::vector<int>& nodalConnec, int lev1DId)
 610 {
 611   double *zoneToUpdate=_mesh1D->getCoords()->getPointer()+lev1DId*3;
 612   std::fill(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,0.);
 613   const double *coords=_mesh2D->getCoords()->getConstPointer();
 614   for(std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();iter!=nodalConnec.end();iter++)
 615     std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,coords+3*(*iter),zoneToUpdate,std::plus<double>());
 616   std::transform(zoneToUpdate,zoneToUpdate+3,zoneToUpdate,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),(double)(1./(int)nodalConnec.size())));
 617 }
 618
 619 int MEDCouplingExtrudedMesh::FindCorrespCellByNodalConn(const std::vector<int>& nodalConnec, const int *revNodalPtr, const int *revNodalIndxPtr) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 620 {
 621   std::vector<int>::const_iterator iter=nodalConnec.begin();
 622   std::set<int> s1(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
 623   iter++;
 624   for(;iter!=nodalConnec.end();iter++)
 625     {
 626       std::set<int> s2(revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter],revNodalPtr+revNodalIndxPtr[*iter+1]);
 627       std::set<int> s3;
 628       std::set_intersection(s1.begin(),s1.end(),s2.begin(),s2.end(),std::insert_iterator< std::set<int> >(s3,s3.end()));
 629       s1=s3;
 630     }
 631   if(s1.size()==1)
 632     return *(s1.begin());
 633   std::ostringstream ostr;
 634   ostr << "Cell with nodal connec : ";
 635   std::copy(nodalConnec.begin(),nodalConnec.end(),std::ostream_iterator<int>(ostr," "));
 636   ostr << " is not part of mesh";
 637   throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
 638 }
 639
 640 /*!
 641  * This method is callable on 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) returned by MEDCouplingExtrudedMesh::getMesh1D typically.
 642  * These 1Dmeshes (meshDim==1 && spaceDim==3) have a special semantic because these meshes do not specify a static location but a translation along a path.
 643  * This method checks that 'm1' and 'm2' are compatible, if not an exception is thrown. In case these meshes ('m1' and 'm2') are compatible 2 corresponding meshes
 644  * are created ('m1r' and 'm2r') that can be used for interpolation.
 645  * @param m1 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
 646  * @param m2 input mesh with meshDim==1 and spaceDim==3
 647  * @param eps tolerance acceptable to determine compatibility
 648  * @param m1r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
 649  * @param m2r output mesh with ref count equal to 1 with meshDim==1 and spaceDim==1
 650  * @param v is the output normalized vector of the common direction of 'm1' and 'm2'
 651  * @throw in case that m1 and m2 are not compatible each other.
 652  */
 653 void MEDCouplingExtrudedMesh::Project1DMeshes(const MEDCouplingUMesh *m1, const MEDCouplingUMesh *m2, double eps,
 654                                               MEDCouplingUMesh *&m1r, MEDCouplingUMesh *&m2r, double *v) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 655 {
 656   if(m1->getSpaceDimension()!=3 || m1->getSpaceDimension()!=3)
 657     throw INTERP_KERNEL::Exception("Input meshes are expected to have a spaceDim==3 for Projec1D !");
 658   m1r=m1->clone(true);
 659   m2r=m2->clone(true);
 660   m1r->changeSpaceDimension(1);
 661   m2r->changeSpaceDimension(1);
 662   std::vector<int> c;
 663   std::vector<double> ref,ref2;
 664   m1->getNodeIdsOfCell(0,c);
 665   m1->getCoordinatesOfNode(c[0],ref);
 666   m1->getCoordinatesOfNode(c[1],ref2);
 667   std::transform(ref2.begin(),ref2.end(),ref.begin(),v,std::minus<double>());
 668   double n=INTERP_KERNEL::norm<3>(v);
 669   std::transform(v,v+3,v,std::bind2nd(std::multiplies<double>(),1/n));
 670   m1->project1D(&ref[0],v,eps,m1r->getCoords()->getPointer());
 671   m2->project1D(&ref[0],v,eps,m2r->getCoords()->getPointer());
 672
 673 }
 674
 675 void MEDCouplingExtrudedMesh::rotate(const double *center, const double *vector, double angle)
 676 {
 677   _mesh2D->rotate(center,vector,angle);
 678   _mesh1D->rotate(center,vector,angle);
 679 }
 680
 681 void MEDCouplingExtrudedMesh::translate(const double *vector)
 682 {
 683   _mesh2D->translate(vector);
 684   _mesh1D->translate(vector);
 685 }
 686
 687 void MEDCouplingExtrudedMesh::scale(const double *point, double factor)
 688 {
 689   _mesh2D->scale(point,factor);
 690   _mesh1D->scale(point,factor);
 691 }
 692
 693 std::vector<int> MEDCouplingExtrudedMesh::getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 694 {
 695   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 696 }
 697
 698 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 699 {
 700   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 701 }
 702
 703 void MEDCouplingExtrudedMesh::splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 704 {
 705   throw INTERP_KERNEL::Exception("Not implemented yet !");
 706 }
 707
 708 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::buildPart(const int *start, const int *end) const
 709 {
 710   // not implemented yet !
 711   return 0;
 712 }
 713
 714 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::buildPartAndReduceNodes(const int *start, const int *end, DataArrayInt*& arr) const
 715 {
 716   // not implemented yet !
 717   return 0;
 718 }
 719
 720 DataArrayInt *MEDCouplingExtrudedMesh::simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 721 {
 722   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::simplexize : unavailable for such a type of mesh : Extruded !");
 723 }
 724
 725 MEDCouplingMesh *MEDCouplingExtrudedMesh::mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const
 726 {
 727   // not implemented yet !
 728   return 0;
 729 }
 730
 731 DataArrayDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getCoordinatesAndOwner() const
 732 {
 733   DataArrayDouble *arr2D=_mesh2D->getCoords();
 734   DataArrayDouble *arr1D=_mesh1D->getCoords();
 735   DataArrayDouble *ret=DataArrayDouble::New();
 736   ret->alloc(getNumberOfNodes(),3);
 737   int nbOf1DLev=_mesh1D->getNumberOfNodes();
 738   int nbOf2DNodes=_mesh2D->getNumberOfNodes();
 739   const double *ptSrc=arr2D->getConstPointer();
 740   double *pt=ret->getPointer();
 741   std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt);
 742   for(int i=1;i<nbOf1DLev;i++)
 743     {
 744       std::copy(ptSrc,ptSrc+3*nbOf2DNodes,pt+3*i*nbOf2DNodes);
 745       double vec[3];
 746       std::copy(arr1D->getConstPointer()+3*i,arr1D->getConstPointer()+3*(i+1),vec);
 747       std::transform(arr1D->getConstPointer()+3*(i-1),arr1D->getConstPointer()+3*i,vec,vec,std::minus<double>());
 748       for(int j=0;j<nbOf2DNodes;j++)
 749         std::transform(vec,vec+3,pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),pt+3*(i*nbOf2DNodes+j),std::plus<double>());
 750     }
 751   return ret;
 752 }
 753
 754 DataArrayDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::getBarycenterAndOwner() const
 755 {
 756   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::getBarycenterAndOwner : not yet implemented !");
 757 }
 758
 759 DataArrayDouble *MEDCouplingExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 760 {
 761   throw INTERP_KERNEL::Exception("MEDCouplingExtrudedMesh::computeIsoBarycenterOfNodesPerCell: not yet implemented !");
 762 }
 763
 764 void MEDCouplingExtrudedMesh::computeExtrusionAlg(const MEDCouplingUMesh *mesh3D) throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 765 {
 766   _mesh3D_ids->alloc(mesh3D->getNumberOfCells(),1);
 767   int nbOf1DLev=mesh3D->getNumberOfCells()/_mesh2D->getNumberOfCells();
 768   _mesh1D->setMeshDimension(1);
 769   _mesh1D->allocateCells(nbOf1DLev);
 770   int tmpConn[2];
 771   for(int i=0;i<nbOf1DLev;i++)
 772     {
 773       tmpConn[0]=i;
 774       tmpConn[1]=i+1;
 775       _mesh1D->insertNextCell(INTERP_KERNEL::NORM_SEG2,2,tmpConn);
 776     }
 777   _mesh1D->finishInsertingCells();
 778   DataArrayDouble *myCoords=DataArrayDouble::New();
 779   myCoords->alloc(nbOf1DLev+1,3);
 780   _mesh1D->setCoords(myCoords);
 781   myCoords->decrRef();
 782   DataArrayInt *desc,*descIndx,*revDesc,*revDescIndx;
 783   desc=DataArrayInt::New(); descIndx=DataArrayInt::New(); revDesc=DataArrayInt::New(); revDescIndx=DataArrayInt::New();
 784   MEDCouplingUMesh *subMesh=mesh3D->buildDescendingConnectivity(desc,descIndx,revDesc,revDescIndx);
 785   DataArrayInt *revNodal2D,*revNodalIndx2D;
 786   revNodal2D=DataArrayInt::New(); revNodalIndx2D=DataArrayInt::New();
 787   subMesh->getReverseNodalConnectivity(revNodal2D,revNodalIndx2D);
 788   const int *nodal2D=_mesh2D->getNodalConnectivity()->getConstPointer();
 789   const int *nodal2DIndx=_mesh2D->getNodalConnectivityIndex()->getConstPointer();
 790   const int *revNodal2DPtr=revNodal2D->getConstPointer();
 791   const int *revNodalIndx2DPtr=revNodalIndx2D->getConstPointer();
 792   const int *descP=desc->getConstPointer();
 793   const int *descIndxP=descIndx->getConstPointer();
 794   const int *revDescP=revDesc->getConstPointer();
 795   const int *revDescIndxP=revDescIndx->getConstPointer();
 796   //
 797   int nbOf2DCells=_mesh2D->getNumberOfCells();
 798   for(int i=0;i<nbOf2DCells;i++)
 799     {
 800       int idInSubMesh;
 801        std::vector<int> nodalConnec(nodal2D+nodal2DIndx[i]+1,nodal2D+nodal2DIndx[i+1]);
 802        try
 803         {
 804           idInSubMesh=FindCorrespCellByNodalConn(nodalConnec,revNodal2DPtr,revNodalIndx2DPtr);
 805         }
 806        catch(INTERP_KERNEL::Exception& e)
 807          {
 808            std::ostringstream ostr; ostr << "mesh2D cell # " << i << " is not part of any cell of 3D mesh !\n";
 809            ostr << e.what();
 810            throw INTERP_KERNEL::Exception(ostr.str().c_str());
 811          }
 812        build1DExtrusion(idInSubMesh,i,nbOf1DLev,subMesh,descP,descIndxP,revDescP,revDescIndxP,i==_cell_2D_id);
 813     }
 814   //
 815   revNodal2D->decrRef();
 816   revNodalIndx2D->decrRef();
 817   subMesh->decrRef();
 818   desc->decrRef();
 819   descIndx->decrRef();
 820   revDesc->decrRef();
 821   revDescIndx->decrRef();
 822 }
 823
 824 void MEDCouplingExtrudedMesh::getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const
 825 {
 826   std::vector<int> tinyInfo1;
 827   std::vector<std::string> ls1;
 828   std::vector<double> ls3;
 829   _mesh2D->getTinySerializationInformation(ls3,tinyInfo1,ls1);
 830   std::vector<int> tinyInfo2;
 831   std::vector<std::string> ls2;
 832   std::vector<double> ls4;
 833   _mesh1D->getTinySerializationInformation(ls4,tinyInfo2,ls2);
 834   tinyInfo.clear(); littleStrings.clear();
 835   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo1.begin(),tinyInfo1.end());
 836   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls1.begin(),ls1.end());
 837   tinyInfo.insert(tinyInfo.end(),tinyInfo2.begin(),tinyInfo2.end());
 838   littleStrings.insert(littleStrings.end(),ls2.begin(),ls2.end());
 839   tinyInfo.push_back(_cell_2D_id);
 840   tinyInfo.push_back((int)tinyInfo1.size());
 841   tinyInfo.push_back(_mesh3D_ids->getNbOfElems());
 842   littleStrings.push_back(getName());
 843   littleStrings.push_back(getDescription());
 844 }
 845
 846 void MEDCouplingExtrudedMesh::resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const
 847 {
 848   std::size_t sz=tinyInfo.size();
 849   int sz1=tinyInfo[sz-2];
 850   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
 851   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
 852   MEDCouplingUMesh *um=MEDCouplingUMesh::New();
 853   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
 854   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
 855   int la1=0,la2=0;
 856   std::vector<std::string> ls1,ls2;
 857   um->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
 858   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
 859   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 860   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
 861   um->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
 862   la1+=a1tmp->getNbOfElems(); la2+=a2tmp->getNbOfElems();
 863   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 864   um->decrRef();
 865   //
 866   a1->alloc(la1+tinyInfo[sz-1],1);
 867   a2->alloc(la2,1);
 868   littleStrings.resize(ls1.size()+ls2.size()+2);
 869 }
 870
 871 void MEDCouplingExtrudedMesh::serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const
 872 {
 873   a1=DataArrayInt::New(); a2=DataArrayDouble::New();
 874   DataArrayInt *a1_1=0,*a1_2=0;
 875   DataArrayDouble *a2_1=0,*a2_2=0;
 876   _mesh2D->serialize(a1_1,a2_1);
 877   _mesh1D->serialize(a1_2,a2_2);
 878   a1->alloc(a1_1->getNbOfElems()+a1_2->getNbOfElems()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),1);
 879   int *ptri=a1->getPointer();
 880   ptri=std::copy(a1_1->getConstPointer(),a1_1->getConstPointer()+a1_1->getNbOfElems(),ptri);
 881   a1_1->decrRef();
 882   ptri=std::copy(a1_2->getConstPointer(),a1_2->getConstPointer()+a1_2->getNbOfElems(),ptri);
 883   a1_2->decrRef();
 884   std::copy(_mesh3D_ids->getConstPointer(),_mesh3D_ids->getConstPointer()+_mesh3D_ids->getNbOfElems(),ptri);
 885   a2->alloc(a2_1->getNbOfElems()+a2_2->getNbOfElems(),1);
 886   double *ptrd=a2->getPointer();
 887   ptrd=std::copy(a2_1->getConstPointer(),a2_1->getConstPointer()+a2_1->getNbOfElems(),ptrd);
 888   a2_1->decrRef();
 889   std::copy(a2_2->getConstPointer(),a2_2->getConstPointer()+a2_2->getNbOfElems(),ptrd);
 890   a2_2->decrRef();
 891 }
 892
 893 void MEDCouplingExtrudedMesh::unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, const std::vector<std::string>& littleStrings)
 894 {
 895   setName(littleStrings[littleStrings.size()-2].c_str());
 896   setDescription(littleStrings.back().c_str());
 897   std::size_t sz=tinyInfo.size();
 898   int sz1=tinyInfo[sz-2];
 899   _cell_2D_id=tinyInfo[sz-3];
 900   std::vector<int> ti1(tinyInfo.begin(),tinyInfo.begin()+sz1);
 901   std::vector<int> ti2(tinyInfo.begin()+sz1,tinyInfo.end()-3);
 902   DataArrayInt *a1tmp=DataArrayInt::New();
 903   DataArrayDouble *a2tmp=DataArrayDouble::New();
 904   const int *a1Ptr=a1->getConstPointer();
 905   const double *a2Ptr=a2->getConstPointer();
 906   _mesh2D=MEDCouplingUMesh::New();
 907   std::vector<std::string> ls1,ls2;
 908   _mesh2D->resizeForUnserialization(ti1,a1tmp,a2tmp,ls1);
 909   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
 910   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
 911   a2Ptr+=a2tmp->getNbOfElems();
 912   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
 913   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin(),littleStrings.begin()+ls1.size());
 914   std::vector<double> d1(1);
 915   _mesh2D->unserialization(d1,ti1,a1tmp,a2tmp,ls2);
 916   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 917   //
 918   ls2.clear();
 919   ls2.insert(ls2.end(),littleStrings.begin()+ls1.size(),littleStrings.end()-2);
 920   _mesh1D=MEDCouplingUMesh::New();
 921   a1tmp=DataArrayInt::New(); a2tmp=DataArrayDouble::New();
 922   _mesh1D->resizeForUnserialization(ti2,a1tmp,a2tmp,ls1);
 923   std::copy(a2Ptr,a2Ptr+a2tmp->getNbOfElems(),a2tmp->getPointer());
 924   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+a1tmp->getNbOfElems(),a1tmp->getPointer());
 925   a1Ptr+=a1tmp->getNbOfElems();
 926   _mesh1D->unserialization(d1,ti2,a1tmp,a2tmp,ls2);
 927   a1tmp->decrRef(); a2tmp->decrRef();
 928   //
 929   _mesh3D_ids=DataArrayInt::New();
 930   int szIds=(int)std::distance(a1Ptr,a1->getConstPointer()+a1->getNbOfElems());
 931   _mesh3D_ids->alloc(szIds,1);
 932   std::copy(a1Ptr,a1Ptr+szIds,_mesh3D_ids->getPointer());
 933 }
 934
 935 void MEDCouplingExtrudedMesh::writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 936 {
 937   MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<MEDCouplingUMesh> m=buildUnstructured();
 938   m->writeVTKLL(ofs,cellData,pointData);
 939 }
 940
 941 void MEDCouplingExtrudedMesh::reprQuickOverview(std::ostream& stream) const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 942 {
 943   stream << "MEDCouplingExtrudedMesh C++ instance at " << this << ". Name : \"" << getName() << "\".";
 944 }
 945
 946 std::string MEDCouplingExtrudedMesh::getVTKDataSetType() const throw(INTERP_KERNEL::Exception)
 947 {
 948   return _mesh2D->getVTKDataSetType();
 949 }