src/MEDCoupling/MEDCoupling1GTUMesh.hxx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
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   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
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   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #ifndef __PARAMEDMEM_MEDCOUPLING1GTUMESH_HXX__
  22 #define __PARAMEDMEM_MEDCOUPLING1GTUMESH_HXX__
  23
  24 #include "MEDCoupling.hxx"
  25 #include "MEDCouplingPointSet.hxx"
  26 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  27 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
  28
  29 #include "CellModel.hxx"
  30
  31 namespace ParaMEDMEM
  32 {
  33   class MEDCoupling1GTUUMeshCellIterator;
  34
  35   class MEDCoupling1GTUMesh : public MEDCouplingPointSet
  36   {
  37   public:
  38     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1GTUMesh *New(const char *name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  39     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1GTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  40     MEDCOUPLING_EXPORT const INTERP_KERNEL::CellModel& getCellModel() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  41     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getCellModelEnum() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  42     MEDCOUPLING_EXPORT int getMeshDimension() const;
  43     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  44     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const;
  45     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getTypeOfCell(int cellId) const;
  46     MEDCOUPLING_EXPORT std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getAllGeoTypes() const;
  47     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<int> getDistributionOfTypes() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  48     MEDCOUPLING_EXPORT void splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  49     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  50     MEDCOUPLING_EXPORT void writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  51     MEDCOUPLING_EXPORT std::string getVTKDataSetType() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  52     //
  53     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySize() const;
  54     MEDCOUPLING_EXPORT int getNodalConnectivityLength() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  55     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  56     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
  57     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  58     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBarycenterAndOwner() const;
  59     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureField(bool isAbs) const;
  60     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const;
  61     MEDCOUPLING_EXPORT int getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const;
  62     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *buildOrthogonalField() const;
  63     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const double *bbox, double eps) const;
  64     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bbox, double eps);
  65     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildFacePartOfMySelfNode(const int *start, const int *end, bool fullyIn) const;
  66     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findBoundaryNodes() const;
  67     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildBoundaryMesh(bool keepCoords) const;
  68     MEDCOUPLING_EXPORT void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  69     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *AggregateOnSameCoordsToUMesh(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh *>& parts) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  70   public:
  71     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void allocateCells(int nbOfCells=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
  72     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
  73     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodalConnectivity() const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
  74     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void checkCoherencyOfConnectivity() const throw(INTERP_KERNEL::Exception) = 0;
  75   protected:
  76     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1GTUMesh(const char *name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
  77     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1GTUMesh(const MEDCoupling1GTUMesh& other, bool recDeepCpy);
  78   protected:
  79     const INTERP_KERNEL::CellModel *_cm;
  80   };
  81
  82   class MEDCoupling1SGTUMesh : public MEDCoupling1GTUMesh
  83   {
  84   public:
  85     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New(const char *name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  86     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  87     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
  88     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  89     // overload of TimeLabel and RefCountObject
  90     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
  91     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySize() const;
  92     // overload of MEDCouplingMesh
  93     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return SINGLE_STATIC_GEO_TYPE_UNSTRUCTURED; }
  94     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
  95     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  96     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
  97     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  98     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
  99     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 100     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 101     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
 102     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 103     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfFacesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 104     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 105     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
 106     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 107     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 108     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 109     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 110     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
 111     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 112     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 113     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 114     // overload of MEDCouplingPointSet
 115     MEDCOUPLING_EXPORT void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 116     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const;
 117     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
 118     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
 119     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 120     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFullyDefined() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 121     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
 122     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 123     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
 124     MEDCOUPLING_EXPORT void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
 125     // overload of MEDCoupling1GTUMesh
 126     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherencyOfConnectivity() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 127     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 128     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 129   public://specific
 130     MEDCOUPLING_EXPORT void setNodalConnectivity(DataArrayInt *nodalConn) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 131     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 132     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 133     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshes(const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh1, const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh2) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 134     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshes(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 135     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshesOnSameCoords(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 136     MEDCoupling1SGTUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 137   private:
 138     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh(const char *name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
 139     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh(const MEDCoupling1SGTUMesh& other, bool recDeepCpy);
 140   private:
 141     void checkNonDynamicGeoType() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 142     static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshesLL(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 143     DataArrayInt *simplexizePol0() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 144     DataArrayInt *simplexizePol1() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 145     DataArrayInt *simplexizePlanarFace5() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 146     DataArrayInt *simplexizePlanarFace6() throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 147   private:
 148     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn;
 149   };
 150
 151   class MEDCoupling1DGTUMesh : public MEDCoupling1GTUMesh
 152   {
 153   public:
 154     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New(const char *name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 155     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 156     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
 157     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 158     // overload of TimeLabel and RefCountObject
 159     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
 160     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySize() const;
 161     // overload of MEDCouplingMesh
 162     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return SINGLE_DYNAMIC_GEO_TYPE_UNSTRUCTURED; }
 163     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
 164     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 165     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
 166     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 167     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 168     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 169     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 170     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
 171     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 172     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfFacesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 173     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 174     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
 175     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 176     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 177     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 178     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 179     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
 180     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 181     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 182     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 183     // overload of MEDCouplingPointSet
 184     MEDCOUPLING_EXPORT void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 185     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const;
 186     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
 187     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
 188     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 189     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFullyDefined() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 190     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
 191     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 192     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
 193     MEDCOUPLING_EXPORT void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
 194     // overload of MEDCoupling1GTUMesh
 195     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherencyOfConnectivity() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 196     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells=0) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 197     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 198   public://specific
 199     MEDCOUPLING_EXPORT void setNodalConnectivity(DataArrayInt *nodalConn, DataArrayInt *nodalConnIndex) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 200     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 201     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivityIndex() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 202     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *copyWithNodalConnectivityPacked(bool& isShallowCpyOfNodalConnn) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 203     MEDCOUPLING_EXPORT bool retrievePackedNodalConnectivity(DataArrayInt *&nodalConn, DataArrayInt *&nodalConnIndx) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 204     MEDCOUPLING_EXPORT bool isPacked() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 205     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshes(const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh1, const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh2) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 206     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshes(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 207     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshesOnSameCoords(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 208     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *AggregateNodalConnAndShiftNodeIds(const std::vector<const DataArrayInt *>& nodalConns, const std::vector<int>& offsetInNodeIdsPerElt) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 209     MEDCoupling1DGTUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 210   private:
 211     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh(const char *name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
 212     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh(const MEDCoupling1DGTUMesh& other, bool recDeepCpy);
 213   private:
 214     void checkDynamicGeoT2ype() const throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 215     static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshesLL(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a) throw(INTERP_KERNEL::Exception);
 216   private:
 217     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn_indx;
 218     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn;
 219   };
 220 }
 221
 222 #endif