]> SALOME platform Git repositories - tools/medcoupling.git/blob - src/MEDCoupling/MEDCoupling1GTUMesh.hxx
Salome HOME
Little refactoring of progeny mechanism to avoid if.
[tools/medcoupling.git] / src / MEDCoupling / MEDCoupling1GTUMesh.hxx
1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20
21 #ifndef __PARAMEDMEM_MEDCOUPLING1GTUMESH_HXX__
22 #define __PARAMEDMEM_MEDCOUPLING1GTUMESH_HXX__
23
24 #include "MEDCoupling.hxx"
25 #include "MEDCouplingPointSet.hxx"
26 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
27 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
28
29 #include "CellModel.hxx"
30
31 namespace ParaMEDMEM
32 {
33   class MEDCoupling1GTUUMeshCellIterator;
34
35   class MEDCoupling1GTUMesh : public MEDCouplingPointSet
36   {
37   public:
38     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1GTUMesh *New(const std::string& name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type);
39     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1GTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m);
40     MEDCOUPLING_EXPORT const INTERP_KERNEL::CellModel& getCellModel() const;
41     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getCellModelEnum() const;
42     MEDCOUPLING_EXPORT int getMeshDimension() const;
43     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const;
44     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const;
45     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getTypeOfCell(int cellId) const;
46     MEDCOUPLING_EXPORT std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getAllGeoTypes() const;
47     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<int> getDistributionOfTypes() const;
48     MEDCOUPLING_EXPORT void splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const;
49     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const;
50     MEDCOUPLING_EXPORT void writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData, DataArrayByte *byteData) const;
51     MEDCOUPLING_EXPORT std::string getVTKDataSetType() const;
52     MEDCOUPLING_EXPORT std::string getVTKFileExtension() const;
53     //
54     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
55     MEDCOUPLING_EXPORT int getNodalConnectivityLength() const;
56     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
57     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
58     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
59     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBarycenterAndOwner() const;
60     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureField(bool isAbs) const;
61     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const;
62     MEDCOUPLING_EXPORT int getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const;
63     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *buildOrthogonalField() const;
64     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const double *bbox, double eps) const;
65     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bbox, double eps);
66     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildFacePartOfMySelfNode(const int *start, const int *end, bool fullyIn) const;
67     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findBoundaryNodes() const;
68     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildBoundaryMesh(bool keepCoords) const;
69     MEDCOUPLING_EXPORT void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const;
70     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *AggregateOnSameCoordsToUMesh(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh *>& parts);
71   public:
72     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void allocateCells(int nbOfCells=0) = 0;
73     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd) = 0;
74     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodalConnectivity() const = 0;
75     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void checkCoherencyOfConnectivity() const = 0;
76   protected:
77     MEDCoupling1GTUMesh(const std::string& name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
78     MEDCoupling1GTUMesh(const MEDCoupling1GTUMesh& other, bool recDeepCpy);
79     MEDCoupling1GTUMesh();
80   protected:
81     const INTERP_KERNEL::CellModel *_cm;
82   };
83
84   class MEDCoupling1DGTUMesh;
85   class MEDCouplingCMesh;
86
87   class MEDCoupling1SGTUMesh : public MEDCoupling1GTUMesh
88   {
89   public:
90     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New(const std::string& name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type);
91     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m);
92     //! useless constructor only for CORBA -> not swigged
93     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New();
94     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
95     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const;
96     // overload of TimeLabel and RefCountObject
97     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
98     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
99     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
100     // overload of MEDCouplingMesh
101     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return SINGLE_STATIC_GEO_TYPE_UNSTRUCTURED; }
102     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
103     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
104     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
105     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
106     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
107     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const;
108     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const;
109     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
110     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const;
111     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfFacesPerCell() const;
112     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const;
113     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
114     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
115     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
116     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const;
117     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true);
118     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
119     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const;
120     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy);
121     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
122     // overload of MEDCouplingPointSet
123     MEDCOUPLING_EXPORT void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other);
124     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const;
125     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
126     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
127     MEDCOUPLING_EXPORT void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const;
128     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const;
129     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFullyDefined() const;
130     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
131     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const;
132     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
133     MEDCOUPLING_EXPORT void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
134     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const;
135     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree(double arcDetEps=1e-12) const;
136     // overload of MEDCoupling1GTUMesh
137     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherencyOfConnectivity() const;
138     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells=0);
139     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd);
140   public://specific
141     MEDCOUPLING_EXPORT void setNodalConnectivity(DataArrayInt *nodalConn);
142     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() const;
143     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesPerCell() const;
144     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshes(const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh1, const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh2);
145     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshes(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a);
146     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshesOnSameCoords(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a);
147     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const;
148     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1GTUMesh *computeDualMesh() const;
149     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *sortHexa8EachOther();
150     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *explodeEachHexa8To6Quad4() const;
151     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingCMesh *structurizeMe(DataArrayInt *& cellPerm, DataArrayInt *& nodePerm, double eps=1e-12) const;
152   public://serialization
153     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
154     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
155     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
156     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2,
157                                             const std::vector<std::string>& littleStrings);
158   private:
159     MEDCoupling1SGTUMesh(const std::string& name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
160     MEDCoupling1SGTUMesh(const MEDCoupling1SGTUMesh& other, bool recDeepCpy);
161     MEDCoupling1SGTUMesh();
162   private:
163     void checkNonDynamicGeoType() const;
164     static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshesLL(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a);
165     DataArrayInt *simplexizePol0();
166     DataArrayInt *simplexizePol1();
167     DataArrayInt *simplexizePlanarFace5();
168     DataArrayInt *simplexizePlanarFace6();
169     MEDCoupling1DGTUMesh *computeDualMesh3D() const;
170     MEDCoupling1DGTUMesh *computeDualMesh2D() const;
171   private:
172     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn;
173   public:
174     static const int HEXA8_FACE_PAIRS[6];
175   };
176
177   class MEDCoupling1DGTUMesh : public MEDCoupling1GTUMesh
178   {
179   public:
180     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New(const std::string& name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type);
181     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m);
182     //! useless constructor only for CORBA -> not swigged
183     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New();
184     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
185     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const;
186     // overload of TimeLabel and RefCountObject
187     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
188     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
189     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
190     // overload of MEDCouplingMesh
191     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return SINGLE_DYNAMIC_GEO_TYPE_UNSTRUCTURED; }
192     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
193     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
194     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
195     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
196     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
197     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const;
198     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const;
199     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
200     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const;
201     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfFacesPerCell() const;
202     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const;
203     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
204     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
205     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
206     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const;
207     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true);
208     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
209     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const;
210     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy);
211     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
212     // overload of MEDCouplingPointSet
213     MEDCOUPLING_EXPORT void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other);
214     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const;
215     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
216     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
217     MEDCOUPLING_EXPORT void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const;
218     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const;
219     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFullyDefined() const;
220     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
221     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const;
222     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
223     MEDCOUPLING_EXPORT void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
224     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const;
225     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree(double arcDetEps=1e-12) const;
226     // overload of MEDCoupling1GTUMesh
227     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherencyOfConnectivity() const;
228     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells=0);
229     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd);
230   public://specific
231     MEDCOUPLING_EXPORT void setNodalConnectivity(DataArrayInt *nodalConn, DataArrayInt *nodalConnIndex);
232     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() const;
233     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivityIndex() const;
234     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *copyWithNodalConnectivityPacked(bool& isShallowCpyOfNodalConnn) const;
235     MEDCOUPLING_EXPORT bool retrievePackedNodalConnectivity(DataArrayInt *&nodalConn, DataArrayInt *&nodalConnIndx) const;
236     MEDCOUPLING_EXPORT bool isPacked() const;
237     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshes(const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh1, const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh2);
238     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshes(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a);
239     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshesOnSameCoords(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a);
240     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *AggregateNodalConnAndShiftNodeIds(const std::vector<const DataArrayInt *>& nodalConns, const std::vector<int>& offsetInNodeIdsPerElt);
241     MEDCOUPLING_EXPORT static std::vector<int> BuildAPolygonFromParts(const std::vector< std::vector<int> >& parts);
242     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const;
243   public://serialization
244     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
245     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
246     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
247     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2,
248                                             const std::vector<std::string>& littleStrings);
249   private:
250     MEDCoupling1DGTUMesh(const std::string& name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
251     MEDCoupling1DGTUMesh(const MEDCoupling1DGTUMesh& other, bool recDeepCpy);
252     MEDCoupling1DGTUMesh();
253   private:
254     void checkDynamicGeoT2ype() const;
255     static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshesLL(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a);
256   private:
257     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn_indx;
258     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn;
259   };
260 }
261
262 #endif