src/MEDCoupling/MEDCoupling1GTUMesh.hxx

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   2 //
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   7 //
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   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
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  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
  20
  21 #ifndef __PARAMEDMEM_MEDCOUPLING1GTUMESH_HXX__
  22 #define __PARAMEDMEM_MEDCOUPLING1GTUMESH_HXX__
  23
  24 #include "MEDCoupling.hxx"
  25 #include "MEDCouplingPointSet.hxx"
  26 #include "MEDCouplingMemArray.hxx"
  27 #include "MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr.hxx"
  28
  29 #include "CellModel.hxx"
  30
  31 namespace ParaMEDMEM
  32 {
  33   class MEDCoupling1GTUUMeshCellIterator;
  34
  35   class MEDCoupling1GTUMesh : public MEDCouplingPointSet
  36   {
  37   public:
  38     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1GTUMesh *New(const std::string& name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type);
  39     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1GTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m);
  40     MEDCOUPLING_EXPORT const INTERP_KERNEL::CellModel& getCellModel() const;
  41     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getCellModelEnum() const;
  42     MEDCOUPLING_EXPORT int getMeshDimension() const;
  43     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *giveCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const;
  44     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCellsWithType(INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type) const;
  45     MEDCOUPLING_EXPORT INTERP_KERNEL::NormalizedCellType getTypeOfCell(int cellId) const;
  46     MEDCOUPLING_EXPORT std::set<INTERP_KERNEL::NormalizedCellType> getAllGeoTypes() const;
  47     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<int> getDistributionOfTypes() const;
  48     MEDCOUPLING_EXPORT void splitProfilePerType(const DataArrayInt *profile, std::vector<int>& code, std::vector<DataArrayInt *>& idsInPflPerType, std::vector<DataArrayInt *>& idsPerType) const;
  49     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *checkTypeConsistencyAndContig(const std::vector<int>& code, const std::vector<const DataArrayInt *>& idsPerType) const;
  50     MEDCOUPLING_EXPORT void writeVTKLL(std::ostream& ofs, const std::string& cellData, const std::string& pointData, DataArrayByte *byteData) const;
  51     MEDCOUPLING_EXPORT std::string getVTKDataSetType() const;
  52     MEDCOUPLING_EXPORT std::string getVTKFileExtension() const;
  53     //
  54     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
  55     MEDCOUPLING_EXPORT int getNodalConnectivityLength() const;
  56     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
  57     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
  58     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
  59     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBarycenterAndOwner() const;
  60     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureField(bool isAbs) const;
  61     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *getMeasureFieldOnNode(bool isAbs) const;
  62     MEDCOUPLING_EXPORT int getCellContainingPoint(const double *pos, double eps) const;
  63     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingFieldDouble *buildOrthogonalField() const;
  64     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const double *bbox, double eps) const;
  65     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getCellsInBoundingBox(const INTERP_KERNEL::DirectedBoundingBox& bbox, double eps);
  66     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildFacePartOfMySelfNode(const int *start, const int *end, bool fullyIn) const;
  67     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *findBoundaryNodes() const;
  68     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildBoundaryMesh(bool keepCoords) const;
  69     MEDCOUPLING_EXPORT void findCommonCells(int compType, int startCellId, DataArrayInt *& commonCellsArr, DataArrayInt *& commonCellsIArr) const;
  70     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCouplingUMesh *AggregateOnSameCoordsToUMesh(const std::vector< const MEDCoupling1GTUMesh *>& parts);
  71   public:
  72     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void allocateCells(int nbOfCells=0) = 0;
  73     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd) = 0;
  74     MEDCOUPLING_EXPORT virtual DataArrayInt *getNodalConnectivity() const = 0;
  75     MEDCOUPLING_EXPORT virtual void checkCoherencyOfConnectivity() const = 0;
  76   protected:
  77     MEDCoupling1GTUMesh(const std::string& name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
  78     MEDCoupling1GTUMesh(const MEDCoupling1GTUMesh& other, bool recDeepCpy);
  79     MEDCoupling1GTUMesh();
  80   protected:
  81     const INTERP_KERNEL::CellModel *_cm;
  82   };
  83
  84   class MEDCoupling1DGTUMesh;
  85   class MEDCouplingCMesh;
  86
  87   class MEDCoupling1SGTUMesh : public MEDCoupling1GTUMesh
  88   {
  89   public:
  90     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New(const std::string& name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type);
  91     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m);
  92     //! useless constructor only for CORBA -> not swigged
  93     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *New();
  94     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
  95     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const;
  96     // overload of TimeLabel and RefCountObject
  97     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
  98     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
  99     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
 100     // overload of MEDCouplingMesh
 101     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return SINGLE_STATIC_GEO_TYPE_UNSTRUCTURED; }
 102     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
 103     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
 104     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
 105     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
 106     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
 107     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const;
 108     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const;
 109     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
 110     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const;
 111     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfFacesPerCell() const;
 112     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const;
 113     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
 114     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 115     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 116     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const;
 117     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true);
 118     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
 119     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const;
 120     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy);
 121     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 122     // overload of MEDCouplingPointSet
 123     MEDCOUPLING_EXPORT void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other);
 124     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const;
 125     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
 126     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
 127     MEDCOUPLING_EXPORT void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const;
 128     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const;
 129     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFullyDefined() const;
 130     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
 131     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const;
 132     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
 133     MEDCOUPLING_EXPORT void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
 134     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const;
 135     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree(double arcDetEps=1e-12) const;
 136     // overload of MEDCoupling1GTUMesh
 137     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherencyOfConnectivity() const;
 138     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells=0);
 139     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd);
 140   public://specific
 141     MEDCOUPLING_EXPORT void setNodalConnectivity(DataArrayInt *nodalConn);
 142     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() const;
 143     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesPerCell() const;
 144     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshes(const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh1, const MEDCoupling1SGTUMesh *mesh2);
 145     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshes(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a);
 146     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshesOnSameCoords(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a);
 147     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const;
 148     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1GTUMesh *computeDualMesh() const;
 149     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *sortHexa8EachOther();
 150     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1SGTUMesh *explodeEachHexa8To6Quad4() const;
 151     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingCMesh *structurizeMe(DataArrayInt *& cellPerm, DataArrayInt *& nodePerm, double eps=1e-12) const;
 152   public://serialization
 153     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
 154     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
 155     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
 156     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2,
 157                                             const std::vector<std::string>& littleStrings);
 158   private:
 159     MEDCoupling1SGTUMesh(const std::string& name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
 160     MEDCoupling1SGTUMesh(const MEDCoupling1SGTUMesh& other, bool recDeepCpy);
 161     MEDCoupling1SGTUMesh();
 162   private:
 163     void checkNonDynamicGeoType() const;
 164     static MEDCoupling1SGTUMesh *Merge1SGTUMeshesLL(std::vector<const MEDCoupling1SGTUMesh *>& a);
 165     DataArrayInt *simplexizePol0();
 166     DataArrayInt *simplexizePol1();
 167     DataArrayInt *simplexizePlanarFace5();
 168     DataArrayInt *simplexizePlanarFace6();
 169     MEDCoupling1DGTUMesh *computeDualMesh3D() const;
 170     MEDCoupling1DGTUMesh *computeDualMesh2D() const;
 171   private:
 172     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn;
 173   public:
 174     static const int HEXA8_FACE_PAIRS[6];
 175   };
 176
 177   class MEDCoupling1DGTUMesh : public MEDCoupling1GTUMesh
 178   {
 179   public:
 180     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New(const std::string& name, INTERP_KERNEL::NormalizedCellType type);
 181     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New(const MEDCouplingUMesh *m);
 182     //! useless constructor only for CORBA -> not swigged
 183     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *New();
 184     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *clone(bool recDeepCpy) const;
 185     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *deepCpyConnectivityOnly() const;
 186     // overload of TimeLabel and RefCountObject
 187     MEDCOUPLING_EXPORT void updateTime() const;
 188     MEDCOUPLING_EXPORT std::size_t getHeapMemorySizeWithoutChildren() const;
 189     MEDCOUPLING_EXPORT std::vector<const BigMemoryObject *> getDirectChildrenWithNull() const;
 190     // overload of MEDCouplingMesh
 191     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMeshType getType() const { return SINGLE_DYNAMIC_GEO_TYPE_UNSTRUCTURED; }
 192     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *deepCpy() const;
 193     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualIfNotWhy(const MEDCouplingMesh *other, double prec, std::string& reason) const;
 194     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEqualWithoutConsideringStr(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
 195     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFastEquivalWith(const MEDCouplingMesh *other, double prec) const;
 196     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency() const;
 197     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency1(double eps=1e-12) const;
 198     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherency2(double eps=1e-12) const;
 199     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfCells() const;
 200     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfNodesPerCell() const;
 201     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeNbOfFacesPerCell() const;
 202     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *computeEffectiveNbOfNodesPerCell() const;
 203     MEDCOUPLING_EXPORT void getNodeIdsOfCell(int cellId, std::vector<int>& conn) const;
 204     MEDCOUPLING_EXPORT std::string simpleRepr() const;
 205     MEDCOUPLING_EXPORT std::string advancedRepr() const;
 206     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *computeIsoBarycenterOfNodesPerCell() const;
 207     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberCells(const int *old2NewBg, bool check=true);
 208     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingMesh *mergeMyselfWith(const MEDCouplingMesh *other) const;
 209     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingUMesh *buildUnstructured() const;
 210     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *simplexize(int policy);
 211     MEDCOUPLING_EXPORT void reprQuickOverview(std::ostream& stream) const;
 212     // overload of MEDCouplingPointSet
 213     MEDCOUPLING_EXPORT void shallowCopyConnectivityFrom(const MEDCouplingPointSet *other);
 214     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *mergeMyselfWithOnSameCoords(const MEDCouplingPointSet *other) const;
 215     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords(const int *begin, const int *end) const;
 216     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCouplingPointSet *buildPartOfMySelfKeepCoords2(int start, int end, int step) const;
 217     MEDCOUPLING_EXPORT void computeNodeIdsAlg(std::vector<bool>& nodeIdsInUse) const;
 218     MEDCOUPLING_EXPORT void getReverseNodalConnectivity(DataArrayInt *revNodal, DataArrayInt *revNodalIndx) const;
 219     MEDCOUPLING_EXPORT void checkFullyDefined() const;
 220     MEDCOUPLING_EXPORT bool isEmptyMesh(const std::vector<int>& tinyInfo) const;
 221     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodeIdsInUse(int& nbrOfNodesInUse) const;
 222     MEDCOUPLING_EXPORT void renumberNodesInConn(const int *newNodeNumbersO2N);
 223     MEDCOUPLING_EXPORT void fillCellIdsToKeepFromNodeIds(const int *begin, const int *end, bool fullyIn, DataArrayInt *&cellIdsKeptArr) const;
 224     MEDCOUPLING_EXPORT int getNumberOfNodesInCell(int cellId) const;
 225     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayDouble *getBoundingBoxForBBTree(double arcDetEps=1e-12) const;
 226     // overload of MEDCoupling1GTUMesh
 227     MEDCOUPLING_EXPORT void checkCoherencyOfConnectivity() const;
 228     MEDCOUPLING_EXPORT void allocateCells(int nbOfCells=0);
 229     MEDCOUPLING_EXPORT void insertNextCell(const int *nodalConnOfCellBg, const int *nodalConnOfCellEnd);
 230   public://specific
 231     MEDCOUPLING_EXPORT void setNodalConnectivity(DataArrayInt *nodalConn, DataArrayInt *nodalConnIndex);
 232     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivity() const;
 233     MEDCOUPLING_EXPORT DataArrayInt *getNodalConnectivityIndex() const;
 234     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *copyWithNodalConnectivityPacked(bool& isShallowCpyOfNodalConnn) const;
 235     MEDCOUPLING_EXPORT bool retrievePackedNodalConnectivity(DataArrayInt *&nodalConn, DataArrayInt *&nodalConnIndx) const;
 236     MEDCOUPLING_EXPORT bool isPacked() const;
 237     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshes(const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh1, const MEDCoupling1DGTUMesh *mesh2);
 238     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshes(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a);
 239     MEDCOUPLING_EXPORT static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshesOnSameCoords(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a);
 240     MEDCOUPLING_EXPORT static DataArrayInt *AggregateNodalConnAndShiftNodeIds(const std::vector<const DataArrayInt *>& nodalConns, const std::vector<int>& offsetInNodeIdsPerElt);
 241     MEDCOUPLING_EXPORT static std::vector<int> BuildAPolygonFromParts(const std::vector< std::vector<int> >& parts);
 242     MEDCOUPLING_EXPORT MEDCoupling1DGTUMesh *buildSetInstanceFromThis(int spaceDim) const;
 243   public://serialization
 244     MEDCOUPLING_EXPORT void getTinySerializationInformation(std::vector<double>& tinyInfoD, std::vector<int>& tinyInfo, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
 245     MEDCOUPLING_EXPORT void resizeForUnserialization(const std::vector<int>& tinyInfo, DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2, std::vector<std::string>& littleStrings) const;
 246     MEDCOUPLING_EXPORT void serialize(DataArrayInt *&a1, DataArrayDouble *&a2) const;
 247     MEDCOUPLING_EXPORT void unserialization(const std::vector<double>& tinyInfoD, const std::vector<int>& tinyInfo, const DataArrayInt *a1, DataArrayDouble *a2,
 248                                             const std::vector<std::string>& littleStrings);
 249   private:
 250     MEDCoupling1DGTUMesh(const std::string& name, const INTERP_KERNEL::CellModel& cm);
 251     MEDCoupling1DGTUMesh(const MEDCoupling1DGTUMesh& other, bool recDeepCpy);
 252     MEDCoupling1DGTUMesh();
 253   private:
 254     void checkDynamicGeoT2ype() const;
 255     static MEDCoupling1DGTUMesh *Merge1DGTUMeshesLL(std::vector<const MEDCoupling1DGTUMesh *>& a);
 256   private:
 257     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn_indx;
 258     MEDCouplingAutoRefCountObjectPtr<DataArrayInt> _conn;
 259   };
 260 }
 261
 262 #endif