src/LoadLeveler/Batch_BatchManager_eLL.cxx

   1 //  Copyright (C) 2007-2010  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
   2 //
   3 //  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
   4 //  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
   5 //
   6 //  This library is free software; you can redistribute it and/or
   7 //  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   8 //  License as published by the Free Software Foundation; either
   9 //  version 2.1 of the License.
  10 //
  11 //  This library is distributed in the hope that it will be useful,
  12 //  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13 //  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  14 //  Lesser General Public License for more details.
  15 //
  16 //  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  17 //  License along with this library; if not, write to the Free Software
  18 //  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  19 //
  20 //  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  21 //
  22 /*
  23  *  Batch_BatchManager_eLL.cxx :
  24  *
  25  *  Created on: 25 nov. 2010
  26  *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
  27  */
  28
  29 #include <cstdlib>
  30 #include <iostream>
  31 #include <fstream>
  32
  33 #include <Batch_NotYetImplementedException.hxx>
  34
  35 #include "Batch_BatchManager_eLL.hxx"
  36 #include "Batch_JobInfo_eLL.hxx"
  37
  38 using namespace std;
  39
  40 namespace Batch {
  41
  42   BatchManager_eLL::BatchManager_eLL(const FactBatchManager * parent, const char * host,
  43                                      const char * username,
  44                                      CommunicationProtocolType protocolType, const char * mpiImpl,
  45                                      int nb_proc_per_node)
  46     : BatchManager(parent, host),
  47       BatchManager_eClient(parent, host, username, protocolType, mpiImpl)
  48   {
  49     // Nothing to do
  50   }
  51
  52   BatchManager_eLL::~BatchManager_eLL()
  53   {
  54     // Nothing to do
  55   }
  56
  57   // Method to submit a job to the batch manager
  58   const JobId BatchManager_eLL::submitJob(const Job & job)
  59   {
  60     int status;
  61     Parametre params = job.getParametre();
  62     const string workDir = params[WORKDIR];
  63
  64     // export input files on cluster
  65     exportInputFiles(job);
  66
  67     // build command file to submit the job and copy it on the server
  68     string cmdFile = buildCommandFile(job);
  69
  70     // define name of log file (local)
  71     string logFile = generateTemporaryFileName("LL-submitlog");
  72
  73     // define command to submit batch
  74     string subCommand = string("cd ") + workDir + "; llsubmit " + cmdFile;
  75     string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
  76     command += " > ";
  77     command += logFile;
  78     cerr << command.c_str() << endl;
  79     status = system(command.c_str());
  80     if (status)
  81     {
  82       ifstream error_message(logFile.c_str());
  83       string mess;
  84       string temp;
  85       while(getline(error_message, temp))
  86         mess += temp;
  87       error_message.close();
  88       throw EmulationException("Error of connection on remote host, error was: " + mess);
  89     }
  90
  91     // read id of submitted job in log file
  92     string jobref;
  93     ifstream idfile(logFile.c_str());
  94     string line;
  95     while (idfile && line.compare(0, 9, "llsubmit:") != 0)
  96       getline(idfile, line);
  97     idfile.close();
  98     if (line.compare(0, 9, "llsubmit:") == 0)
  99     {
 100       string::size_type p1 = line.find_first_of("\"");
 101       string::size_type p2 = line.find_last_of("\"");
 102       if (p1 != p2)
 103         jobref = line.substr(p1 + 1, p2 - p1 - 1);
 104     }
 105     if (jobref.size() == 0)
 106       throw EmulationException("Error in the submission of the job on the remote host");
 107
 108     JobId id(this, jobref);
 109     return id;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * Create LoadLeveler command file and copy it on the server.
 114    * Return the name of the remote file.
 115    */
 116   string BatchManager_eLL::buildCommandFile(const Job & job)
 117   {
 118     Parametre params = job.getParametre();
 119
 120     // Job Parameters
 121     string workDir = "";
 122     string fileToExecute = "";
 123     string queue = "";
 124
 125     // Mandatory parameters
 126     if (params.find(WORKDIR) != params.end())
 127       workDir = params[WORKDIR].str();
 128     else
 129       throw EmulationException("params[WORKDIR] is not defined. Please define it, cannot submit this job.");
 130     if (params.find(EXECUTABLE) != params.end())
 131       fileToExecute = params[EXECUTABLE].str();
 132     else
 133       throw EmulationException("params[EXECUTABLE] is not defined. Please define it, cannot submit this job.");
 134
 135     string::size_type p1 = fileToExecute.find_last_of("/");
 136     string::size_type p2 = fileToExecute.find_last_of(".");
 137     string rootNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1,p2-p1-1);
 138     string fileNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1);
 139
 140     // Create batch submit file
 141     ofstream tempOutputFile;
 142     string tmpFileName = createAndOpenTemporaryFile("LL-script", tempOutputFile);
 143
 144     tempOutputFile << "#!/bin/bash" << endl;
 145     tempOutputFile << "# @ output = " << workDir << "/logs/output.log." << rootNameToExecute << endl;
 146     tempOutputFile << "# @ error = " << workDir << "/logs/error.log." << rootNameToExecute << endl;
 147
 148     // Optional parameters
 149     if (params.find(MAXWALLTIME) != params.end())
 150       tempOutputFile << "# @ wall_clock_limit = " << params[MAXWALLTIME] << ":00" << endl;
 151     if (params.find(MAXRAMSIZE) != params.end())
 152       tempOutputFile << "# @ as_limit = " << params[MAXRAMSIZE] << "mb" << endl;
 153     if (params.find(QUEUE) != params.end())
 154       tempOutputFile << "# @ class = " << params[QUEUE] << endl;
 155
 156     // Define environment for the job
 157     Environnement env = job.getEnvironnement();
 158     if (!env.empty()) {
 159       tempOutputFile << "# @ environment = ";
 160       Environnement::const_iterator iter;
 161       for (iter = env.begin() ; iter != env.end() ; ++iter) {
 162         tempOutputFile << iter->first << "=" << iter->second << "; ";
 163       }
 164       tempOutputFile << endl;
 165     }
 166
 167     tempOutputFile << "# @ job_type = bluegene" << endl;
 168     tempOutputFile << "# @ queue" << endl;
 169
 170     // generate nodes file
 171     tempOutputFile << "NODEFILE=`mktemp nodefile-XXXXXXXXXX` || exit 1" << endl;
 172     tempOutputFile << "for node in $LOADL_PROCESSOR_LIST; do" << endl;
 173     tempOutputFile << "  echo $node >> $NODEFILE" << endl;
 174     tempOutputFile << "done" << endl;
 175     tempOutputFile << "export LIBBATCH_NODEFILE=$NODEFILE" << endl;
 176
 177     // Launch the executable
 178     tempOutputFile << "cd " << workDir << endl;
 179     tempOutputFile << "./" + fileNameToExecute << endl;
 180
 181     tempOutputFile.flush();
 182     tempOutputFile.close();
 183
 184     cerr << "Batch script file generated is: " << tmpFileName << endl;
 185
 186     string remoteFileName = rootNameToExecute + "_LL.cmd";
 187     int status = _protocol.copyFile(tmpFileName, "", "",
 188                                     workDir + "/" + remoteFileName,
 189                                     _hostname, _username);
 190     if (status)
 191       throw EmulationException("Cannot copy command file on host " + _hostname);
 192
 193     return remoteFileName;
 194   }
 195
 196   void BatchManager_eLL::deleteJob(const JobId & jobid)
 197   {
 198     // define command to delete job
 199     string subCommand = "llcancel " + jobid.getReference();
 200     string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
 201     cerr << command.c_str() << endl;
 202
 203     int status = system(command.c_str());
 204     if (status)
 205       throw EmulationException("Can't delete job " + jobid.getReference());
 206
 207     cerr << "job " << jobid.getReference() << " killed" << endl;
 208   }
 209
 210   void BatchManager_eLL::holdJob(const JobId & jobid)
 211   {
 212     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::holdJob");
 213   }
 214
 215   void BatchManager_eLL::releaseJob(const JobId & jobid)
 216   {
 217     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::releaseJob");
 218   }
 219
 220   void BatchManager_eLL::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param, const Environnement & env)
 221   {
 222     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::alterJob");
 223   }
 224
 225   void BatchManager_eLL::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param)
 226   {
 227     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::alterJob");
 228   }
 229
 230   void BatchManager_eLL::alterJob(const JobId & jobid, const Environnement & env)
 231   {
 232     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::alterJob");
 233   }
 234
 235   JobInfo BatchManager_eLL::queryJob(const JobId & jobid)
 236   {
 237     // define name of log file (local)
 238     string logFile = generateTemporaryFileName("LL-querylog-" + jobid.getReference());
 239
 240     // define command to query batch
 241     string subCommand = "llq -f %st " + jobid.getReference();
 242     string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
 243     command += " > ";
 244     command += logFile;
 245     cerr << command.c_str() << endl;
 246     int status = system(command.c_str());
 247     if (status != 0)
 248       throw EmulationException("Can't query job " + jobid.getReference());
 249
 250     JobInfo_eLL jobinfo = JobInfo_eLL(jobid.getReference(), logFile);
 251     return jobinfo;
 252   }
 253
 254   const JobId BatchManager_eLL::addJob(const Job & job, const string reference)
 255   {
 256     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::addJob");
 257   }
 258
 259 }