src/LoadLeveler/Batch_BatchManager_eLL.cxx

   1 //  Copyright (C) 2007-2010  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
   2 //
   3 //  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
   4 //  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
   5 //
   6 //  This library is free software; you can redistribute it and/or
   7 //  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   8 //  License as published by the Free Software Foundation; either
   9 //  version 2.1 of the License.
  10 //
  11 //  This library is distributed in the hope that it will be useful,
  12 //  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  13 //  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  14 //  Lesser General Public License for more details.
  15 //
  16 //  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  17 //  License along with this library; if not, write to the Free Software
  18 //  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  19 //
  20 //  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  21 //
  22 /*
  23  *  Batch_BatchManager_eLL.cxx :
  24  *
  25  *  Created on: 25 nov. 2010
  26  *  Author : Renaud BARATE - EDF R&D
  27  */
  28
  29 #include <cstdlib>
  30 #include <iostream>
  31 #include <fstream>
  32
  33 #include <Batch_NotYetImplementedException.hxx>
  34
  35 #include "Batch_BatchManager_eLL.hxx"
  36 #include "Batch_JobInfo_eLL.hxx"
  37
  38 using namespace std;
  39
  40 namespace Batch {
  41
  42   BatchManager_eLL::BatchManager_eLL(const FactBatchManager * parent, const char * host,
  43                                      const char * username,
  44                                      CommunicationProtocolType protocolType, const char * mpiImpl,
  45                                      int nb_proc_per_node)
  46     : BatchManager(parent, host),
  47       BatchManager_eClient(parent, host, username, protocolType, mpiImpl)
  48   {
  49     // Nothing to do
  50   }
  51
  52   BatchManager_eLL::~BatchManager_eLL()
  53   {
  54     // Nothing to do
  55   }
  56
  57   // Method to submit a job to the batch manager
  58   const JobId BatchManager_eLL::submitJob(const Job & job)
  59   {
  60     int status;
  61     Parametre params = job.getParametre();
  62     const string workDir = params[WORKDIR];
  63
  64     // export input files on cluster
  65     exportInputFiles(job);
  66
  67     // build command file to submit the job and copy it on the server
  68     string cmdFile = buildCommandFile(job);
  69
  70     // define name of log file (local)
  71     string logFile = generateTemporaryFileName("LL-submitlog");
  72
  73     // define command to submit batch
  74     string subCommand = string("cd ") + workDir + "; llsubmit " + cmdFile;
  75     string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
  76     command += " > ";
  77     command += logFile;
  78     cerr << command.c_str() << endl;
  79     status = system(command.c_str());
  80     if (status)
  81     {
  82       ifstream error_message(logFile.c_str());
  83       string mess;
  84       string temp;
  85       while(getline(error_message, temp))
  86         mess += temp;
  87       error_message.close();
  88       throw EmulationException("Error of connection on remote host, error was: " + mess);
  89     }
  90
  91     // read id of submitted job in log file
  92     string jobref;
  93     ifstream idfile(logFile.c_str());
  94     string line;
  95     while (idfile && line.compare(0, 9, "llsubmit:") != 0)
  96       getline(idfile, line);
  97     idfile.close();
  98     if (line.compare(0, 9, "llsubmit:") == 0)
  99     {
 100       string::size_type p1 = line.find_first_of("\"");
 101       string::size_type p2 = line.find_last_of("\"");
 102       if (p1 != p2)
 103         jobref = line.substr(p1 + 1, p2 - p1 - 1);
 104     }
 105     if (jobref.size() == 0)
 106       throw EmulationException("Error in the submission of the job on the remote host");
 107
 108     JobId id(this, jobref);
 109     return id;
 110   }
 111
 112   /**
 113    * Create LoadLeveler command file and copy it on the server.
 114    * Return the name of the remote file.
 115    */
 116   string BatchManager_eLL::buildCommandFile(const Job & job)
 117   {
 118     Parametre params = job.getParametre();
 119
 120     // Job Parameters
 121     string workDir = "";
 122     string fileToExecute = "";
 123     string queue = "";
 124
 125     // Mandatory parameters
 126     if (params.find(WORKDIR) != params.end())
 127       workDir = params[WORKDIR].str();
 128     else
 129       throw EmulationException("params[WORKDIR] is not defined. Please define it, cannot submit this job.");
 130     if (params.find(EXECUTABLE) != params.end())
 131       fileToExecute = params[EXECUTABLE].str();
 132     else
 133       throw EmulationException("params[EXECUTABLE] is not defined. Please define it, cannot submit this job.");
 134
 135     string::size_type p1 = fileToExecute.find_last_of("/");
 136     string::size_type p2 = fileToExecute.find_last_of(".");
 137     string rootNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1,p2-p1-1);
 138     string fileNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1);
 139
 140     // Create batch submit file
 141     ofstream tempOutputFile;
 142     string tmpFileName = createAndOpenTemporaryFile("LL-script", tempOutputFile);
 143
 144     tempOutputFile << "#!/bin/bash" << endl;
 145     tempOutputFile << "# @ output = " << workDir << "/logs/output.log." << rootNameToExecute << endl;
 146     tempOutputFile << "# @ error = " << workDir << "/logs/error.log." << rootNameToExecute << endl;
 147     tempOutputFile << "# @ node_usage = not_shared" << endl;
 148
 149     if (params.find(NAME) != params.end())
 150       tempOutputFile << "# @ job_name = " << params[NAME] << endl;
 151
 152     // Optional parameters
 153     int nbproc = 1;
 154     if (params.find(NBPROC) != params.end())
 155       nbproc = params[NBPROC];
 156     //if (nbproc == 1)
 157     //  tempOutputFile << "# @ job_type = serial" << endl;
 158     //else {
 159       //  tempOutputFile << "# @ job_type = parallel" << endl;
 160       tempOutputFile << "# @ job_type = mpich" << endl;
 161       tempOutputFile << "# @ node = " << nbproc << endl;
 162       tempOutputFile << "# @ tasks_per_node = 1" << endl;
 163     //}
 164     //tempOutputFile << "# @ job_type = bluegene" << endl;
 165
 166     if (params.find(MAXWALLTIME) != params.end())
 167       tempOutputFile << "# @ wall_clock_limit = " << params[MAXWALLTIME] << ":00" << endl;
 168     if (params.find(MAXRAMSIZE) != params.end())
 169       tempOutputFile << "# @ as_limit = " << params[MAXRAMSIZE] << "mb" << endl;
 170     if (params.find(QUEUE) != params.end())
 171       tempOutputFile << "# @ class = " << params[QUEUE] << endl;
 172
 173     // Define environment for the job
 174     Environnement env = job.getEnvironnement();
 175     if (!env.empty()) {
 176       tempOutputFile << "# @ environment = ";
 177       Environnement::const_iterator iter;
 178       for (iter = env.begin() ; iter != env.end() ; ++iter) {
 179         tempOutputFile << iter->first << "=" << iter->second << "; ";
 180       }
 181       tempOutputFile << endl;
 182     }
 183
 184     tempOutputFile << "# @ queue" << endl;
 185
 186     // generate nodes file
 187     tempOutputFile << "NODEFILE=`mktemp nodefile-XXXXXXXXXX` || exit 1" << endl;
 188     tempOutputFile << "for node in $LOADL_PROCESSOR_LIST; do" << endl;
 189     tempOutputFile << "  echo $node >> $NODEFILE" << endl;
 190     tempOutputFile << "done" << endl;
 191     tempOutputFile << "export LIBBATCH_NODEFILE=$NODEFILE" << endl;
 192
 193     // Launch the executable
 194     tempOutputFile << "cd " << workDir << endl;
 195     tempOutputFile << "./" + fileNameToExecute << endl;
 196
 197     tempOutputFile.flush();
 198     tempOutputFile.close();
 199
 200     cerr << "Batch script file generated is: " << tmpFileName << endl;
 201
 202     string remoteFileName = rootNameToExecute + "_LL.cmd";
 203     int status = _protocol.copyFile(tmpFileName, "", "",
 204                                     workDir + "/" + remoteFileName,
 205                                     _hostname, _username);
 206     if (status)
 207       throw EmulationException("Cannot copy command file on host " + _hostname);
 208
 209     return remoteFileName;
 210   }
 211
 212   void BatchManager_eLL::deleteJob(const JobId & jobid)
 213   {
 214     // define command to delete job
 215     string subCommand = "llcancel " + jobid.getReference();
 216     string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
 217     cerr << command.c_str() << endl;
 218
 219     int status = system(command.c_str());
 220     if (status)
 221       throw EmulationException("Can't delete job " + jobid.getReference());
 222
 223     cerr << "job " << jobid.getReference() << " killed" << endl;
 224   }
 225
 226   void BatchManager_eLL::holdJob(const JobId & jobid)
 227   {
 228     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::holdJob");
 229   }
 230
 231   void BatchManager_eLL::releaseJob(const JobId & jobid)
 232   {
 233     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::releaseJob");
 234   }
 235
 236   void BatchManager_eLL::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param, const Environnement & env)
 237   {
 238     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::alterJob");
 239   }
 240
 241   void BatchManager_eLL::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param)
 242   {
 243     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::alterJob");
 244   }
 245
 246   void BatchManager_eLL::alterJob(const JobId & jobid, const Environnement & env)
 247   {
 248     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::alterJob");
 249   }
 250
 251   JobInfo BatchManager_eLL::queryJob(const JobId & jobid)
 252   {
 253     // define name of log file (local)
 254     string logFile = generateTemporaryFileName("LL-querylog-" + jobid.getReference());
 255
 256     // define command to query batch
 257     string subCommand = "llq -f %st " + jobid.getReference();
 258     string command = _protocol.getExecCommand(subCommand, _hostname, _username);
 259     command += " > ";
 260     command += logFile;
 261     cerr << command.c_str() << endl;
 262     int status = system(command.c_str());
 263     if (status != 0)
 264       throw EmulationException("Can't query job " + jobid.getReference());
 265
 266     JobInfo_eLL jobinfo = JobInfo_eLL(jobid.getReference(), logFile);
 267     return jobinfo;
 268   }
 269
 270   const JobId BatchManager_eLL::addJob(const Job & job, const string reference)
 271   {
 272     throw NotYetImplementedException("BatchManager_eLL::addJob");
 273   }
 274
 275 }