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Patch for new version of LIBBATCH
[modules/kernel.git] / src / Launcher / Launcher.cxx
1 //  Copyright (C) 2007-2010  CEA/DEN, EDF R&D, OPEN CASCADE
2 //
3 //  Copyright (C) 2003-2007  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
4 //  CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
5 //
6 //  This library is free software; you can redistribute it and/or
7 //  modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
8 //  License as published by the Free Software Foundation; either
9 //  version 2.1 of the License.
10 //
11 //  This library is distributed in the hope that it will be useful,
12 //  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13 //  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
14 //  Lesser General Public License for more details.
15 //
16 //  You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
17 //  License along with this library; if not, write to the Free Software
18 //  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
19 //
20 //  See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
21 //
22
23 #ifdef WITH_LIBBATCH
24 #include <Batch/Batch_Date.hxx>
25 #include <Batch/Batch_BatchManagerCatalog.hxx>
26 #include <Batch/Batch_FactBatchManager_eClient.hxx>
27 #include <Batch/Batch_BatchManager_eClient.hxx>
28 #endif
29
30 #include "Basics_Utils.hxx"
31 #include "Basics_DirUtils.hxx"
32 #include "SALOME_Launcher_Handler.hxx"
33 #include "Launcher.hxx"
34 #include "Launcher_Job_Command.hxx"
35 #include <iostream>
36 #include <sstream>
37 #include <sys/stat.h>
38 #include <time.h>
39
40 //=============================================================================
41 /*! 
42  *  Constructor
43  *  \param orb
44  *  Define a CORBA single thread policy for the server, which avoid to deal
45  *  with non thread-safe usage like Change_Directory in SALOME naming service
46  */
47 //=============================================================================
48 Launcher_cpp::Launcher_cpp()
49 {
50   LAUNCHER_MESSAGE("Launcher_cpp constructor");
51   _job_cpt = 0;
52   _job_cpt_mutex = new pthread_mutex_t();
53   pthread_mutex_init(_job_cpt_mutex, NULL);
54 }
55
56 //=============================================================================
57 /*! 
58  * destructor
59  */
60 //=============================================================================
61 Launcher_cpp::~Launcher_cpp()
62 {
63   LAUNCHER_MESSAGE("Launcher_cpp destructor");
64 #ifdef WITH_LIBBATCH
65   std::map<int, Launcher::Job *>::const_iterator it_job;
66   for(it_job = _launcher_job_map.begin(); it_job != _launcher_job_map.end(); it_job++)
67     delete it_job->second;
68   std::map < std::string, Batch::BatchManager_eClient * >::const_iterator it1;
69   for(it1=_batchmap.begin();it1!=_batchmap.end();it1++)
70     delete it1->second;
71 #endif
72
73   pthread_mutex_destroy(_job_cpt_mutex);
74   delete _job_cpt_mutex;
75 }
76
77 #ifdef WITH_LIBBATCH
78
79 //=============================================================================
80 /*!
81  * Add a job into the launcher - check resource and choose one 
82  */ 
83 //=============================================================================
84 void 
85 Launcher_cpp::createJob(Launcher::Job * new_job)
86 {
87   LAUNCHER_MESSAGE("Creating a new job");
88   
89   // First step take a resource
90   std::vector<std::string> ResourceList;
91   resourceParams params = new_job->getResourceRequiredParams();
92   try{
93     ResourceList = _ResManager->GetFittingResources(params);
94   }
95   catch(const ResourcesException &ex){
96     throw LauncherException(ex.msg.c_str());
97   }
98   if (ResourceList.size() == 0)
99   {
100     LAUNCHER_INFOS("No adequate resource found for the job, number " << new_job->getNumber() << " - deleting it");
101     delete new_job;
102     throw LauncherException("No resource found the job");
103   }
104
105   // Second step configure the job with the resource selected - the first of the list
106   ParserResourcesType resource_definition = _ResManager->GetResourcesDescr(ResourceList[0]);
107
108   // Set resource definition to the job
109   // The job will check if the definitions needed
110   try 
111   {
112     new_job->setResourceDefinition(resource_definition);
113   }
114   catch(const LauncherException &ex)
115   {
116     LAUNCHER_INFOS("Error in the definition of the resource, mess: " << ex.msg);
117     delete new_job;
118     throw ex;
119   }
120
121   // Third step search batch manager for the resource into the map -> instanciate one if does not exist
122 #ifdef WITH_LIBBATCH
123   std::string resource_name = resource_definition.Name;
124   std::map<std::string, Batch::BatchManager_eClient *>::const_iterator it = _batchmap.find(resource_name);
125   if(it == _batchmap.end())
126   {
127     try 
128     {
129       // Warning cannot write on one line like this, because map object is constructed before
130       // the method is called...
131       //_batchmap.[resource_name] = FactoryBatchManager(resource_definition);
132       Batch::BatchManager_eClient * batch_client = FactoryBatchManager(resource_definition);
133       _batchmap[resource_name] = batch_client;
134     }
135     catch(const LauncherException &ex)
136     {
137       LAUNCHER_INFOS("Error during creation of the batch manager of the resource, mess: " << ex.msg);
138       delete new_job;
139       throw ex;
140     }
141     catch(const Batch::EmulationException &ex)
142     {
143       LAUNCHER_INFOS("Error during creation of the batch manager of the resource, mess: " << ex.message);
144       delete new_job;
145       throw LauncherException(ex.message);
146     }
147     catch(const Batch::InvalidArgumentException &ex)
148     {
149       LAUNCHER_INFOS("Error during creation of the batch manager of the resource, mess: " << ex.message);
150       throw LauncherException(ex.message);
151     }
152   }
153 #endif
154
155   // Final step - add job to the jobs map
156   pthread_mutex_lock(_job_cpt_mutex);
157   new_job->setNumber(_job_cpt);
158   _job_cpt++;
159   pthread_mutex_unlock(_job_cpt_mutex);
160   std::map<int, Launcher::Job *>::const_iterator it_job = _launcher_job_map.find(new_job->getNumber());
161   if (it_job == _launcher_job_map.end())
162     _launcher_job_map[new_job->getNumber()] = new_job;
163   else
164   {
165     LAUNCHER_INFOS("A job as already the same id: " << new_job->getNumber());
166     delete new_job;
167     throw LauncherException("A job as already the same id - job is not created !");
168   }
169   LAUNCHER_MESSAGE("New Job created");
170 }
171
172 //=============================================================================
173 /*!
174  * Launch a job 
175  */ 
176 //=============================================================================
177 void 
178 Launcher_cpp::launchJob(int job_id)
179 {
180   LAUNCHER_MESSAGE("Launch a job");
181
182   // Check if job exist
183   std::map<int, Launcher::Job *>::const_iterator it_job = _launcher_job_map.find(job_id);
184   if (it_job == _launcher_job_map.end())
185   {
186     LAUNCHER_INFOS("Cannot find the job, is it created ? job number: " << job_id);
187     throw LauncherException("Cannot find the job, is it created ?");
188   }
189
190   Launcher::Job * job = it_job->second;
191
192   // Check job state (cannot launch a job already launched...)
193   if (job->getState() != "CREATED")
194   {
195     LAUNCHER_INFOS("Bad state of the job: " << job->getState());
196     throw LauncherException("Bad state of the job: " + job->getState());
197   }
198
199   std::string resource_name = job->getResourceDefinition().Name;
200   try {
201     Batch::JobId batch_manager_job_id = _batchmap[resource_name]->submitJob(*(job->getBatchJob()));
202     job->setBatchManagerJobId(batch_manager_job_id);
203     job->setState("QUEUED");
204   }
205   catch(const Batch::EmulationException &ex)
206   {
207     LAUNCHER_INFOS("Job is not launched, exception in submitJob: " << ex.message);
208     throw LauncherException(ex.message.c_str());
209   }
210   LAUNCHER_MESSAGE("Job launched");
211 }
212
213 //=============================================================================
214 /*!
215  * Get job state
216  */ 
217 //=============================================================================
218 const char *
219 Launcher_cpp::getJobState(int job_id)
220 {
221   LAUNCHER_MESSAGE("Get job state");
222
223   // Check if job exist
224   std::map<int, Launcher::Job *>::const_iterator it_job = _launcher_job_map.find(job_id);
225   if (it_job == _launcher_job_map.end())
226   {
227     LAUNCHER_INFOS("Cannot find the job, is it created ? job number: " << job_id);
228     throw LauncherException("Cannot find the job, is it created ?");
229   }
230
231   Launcher::Job * job = it_job->second;
232   std::string state = job->updateJobState();
233
234   return state.c_str();
235 }
236
237 //=============================================================================
238 /*!
239  * Get Job result - the result directory could be changed
240  */ 
241 //=============================================================================
242 void
243 Launcher_cpp::getJobResults(int job_id, std::string directory)
244 {
245   LAUNCHER_MESSAGE("Get Job results");
246
247   // Check if job exist
248   std::map<int, Launcher::Job *>::const_iterator it_job = _launcher_job_map.find(job_id);
249   if (it_job == _launcher_job_map.end())
250   {
251     LAUNCHER_INFOS("Cannot find the job, is it created ? job number: " << job_id);
252     throw LauncherException("Cannot find the job, is it created ?");
253   }
254
255   Launcher::Job * job = it_job->second;
256   std::string resource_name = job->getResourceDefinition().Name;
257   try 
258   {
259     if (directory != "")
260       _batchmap[resource_name]->importOutputFiles(*(job->getBatchJob()), directory);
261     else
262       _batchmap[resource_name]->importOutputFiles(*(job->getBatchJob()), job->getResultDirectory());
263   }
264   catch(const Batch::EmulationException &ex)
265   {
266     LAUNCHER_INFOS("getJobResult is maybe incomplete, exception: " << ex.message);
267     throw LauncherException(ex.message.c_str());
268   }
269   LAUNCHER_MESSAGE("getJobResult ended");
270 }
271
272 //=============================================================================
273 /*!
274  * Remove the job - into the Launcher and its batch manager
275  */ 
276 //=============================================================================
277 void
278 Launcher_cpp::removeJob(int job_id)
279 {
280   LAUNCHER_MESSAGE("Remove Job");
281
282   // Check if job exist
283   std::map<int, Launcher::Job *>::iterator it_job = _launcher_job_map.find(job_id);
284   if (it_job == _launcher_job_map.end())
285   {
286     LAUNCHER_INFOS("Cannot find the job, is it created ? job number: " << job_id);
287     throw LauncherException("Cannot find the job, is it created ?");
288   }
289
290   delete it_job->second;
291   _launcher_job_map.erase(it_job);
292 }
293
294 //=============================================================================
295 /*! 
296  *  create a launcher job based on a file
297  *  \param xmlExecuteFile     : to define the execution on the batch cluster
298  */
299 //=============================================================================
300 long 
301 Launcher_cpp::createJobWithFile(const std::string xmlExecuteFile, 
302                                 const std::string clusterName)
303 {
304   LAUNCHER_MESSAGE("Begin of Launcher_cpp::createJobWithFile");
305
306   // Parsing xml file
307   ParserLauncherType job_params = ParseXmlFile(xmlExecuteFile);
308
309   // Creating a new job
310   Launcher::Job_Command * new_job = new Launcher::Job_Command();
311
312   std::string cmdFile = Kernel_Utils::GetTmpFileName();  
313 #ifndef WIN32
314   cmdFile += ".sh";
315 #else
316   cmdFile += ".bat";
317 #endif
318   std::ofstream os;
319   os.open(cmdFile.c_str(), std::ofstream::out );
320   os << "#! /bin/sh" << std::endl;
321   os << job_params.Command;
322   os.close();
323
324   new_job->setJobFile(cmdFile);
325   new_job->setLocalDirectory(job_params.RefDirectory);
326   new_job->setWorkDirectory(job_params.MachinesList[clusterName].WorkDirectory);
327   new_job->setEnvFile(job_params.MachinesList[clusterName].EnvFile);
328
329   for(int i=0; i < job_params.InputFile.size(); i++)
330     new_job->add_in_file(job_params.InputFile[i]);
331   for(int i=0; i < job_params.OutputFile.size();i++)
332     new_job->add_out_file(job_params.OutputFile[i]);
333
334   resourceParams p;
335   p.hostname = clusterName;
336   p.name = "";
337   p.OS = "";
338   p.nb_proc = job_params.NbOfProcesses;
339   p.nb_node = 0;
340   p.nb_proc_per_node = 0;
341   p.cpu_clock = 0;
342   p.mem_mb = 0;
343   new_job->setResourceRequiredParams(p);
344
345   createJob(new_job);
346   return new_job->getNumber();
347 }
348
349 //=============================================================================
350 /*!
351  *  Factory to instanciate the good batch manager for choosen cluster.
352  */ 
353 //=============================================================================
354 Batch::BatchManager_eClient *
355 Launcher_cpp::FactoryBatchManager(ParserResourcesType& params)
356 {
357   std::string mpi;
358   Batch::CommunicationProtocolType protocol;
359   Batch::FactBatchManager_eClient* fact;
360
361   int nb_proc_per_node = params.DataForSort._nbOfProcPerNode;
362   std::string hostname = params.HostName;
363
364   switch(params.Protocol)
365   {
366     case rsh:
367       protocol = Batch::RSH;
368       break;
369     case ssh:
370       protocol = Batch::SSH;
371       break;
372     default:
373       throw LauncherException("Unknown protocol for this resource");
374       break;
375   }
376
377   switch(params.mpi)
378   {
379     case lam:
380       mpi = "lam";
381       break;
382     case mpich1:
383       mpi = "mpich1";
384       break;
385     case mpich2:
386       mpi = "mpich2";
387       break;
388     case openmpi:
389       mpi = "openmpi";
390       break;
391     case slurm:
392       mpi = "slurm";
393       break;
394     case prun:
395       mpi = "prun";
396       break;
397     default:
398       mpi = "nompi";
399   }
400
401   const char * bmType;
402   switch( params.Batch )
403   {
404     case pbs:
405       bmType = "ePBS";
406       break;
407     case lsf:
408       bmType = "eLSF";
409       break;
410     case sge:
411       bmType = "eSGE";
412       break;
413     case ccc:
414       bmType = "eCCC";
415       break;
416     case ssh_batch:
417       bmType = "eSSH";
418       break;
419     default:
420       LAUNCHER_MESSAGE("Bad batch description of the resource: Batch = " << params.Batch);
421       throw LauncherException("No batchmanager for that cluster - Bad batch description of the resource");
422   }
423   Batch::BatchManagerCatalog & cata = Batch::BatchManagerCatalog::getInstance();
424   fact = dynamic_cast<Batch::FactBatchManager_eClient*>(cata(bmType));
425   if (fact == NULL) {
426     LAUNCHER_MESSAGE("Cannot find batch manager factory for " << bmType << ". Check your version of libBatch.");
427     throw LauncherException("Cannot find batch manager factory");
428   }
429   LAUNCHER_MESSAGE("Instanciation of batch manager of type: " << bmType);
430   Batch::BatchManager_eClient * batch_client = (*fact)(hostname.c_str(), params.UserName.c_str(),
431                                                        protocol, mpi.c_str(), nb_proc_per_node);
432   return batch_client;
433 }
434
435 //----------------------------------------------------------
436 // Without LIBBATCH - Launcher_cpp do nothing...
437 //----------------------------------------------------------
438 #else
439
440 void 
441 Launcher_cpp::createJob(Launcher::Job * new_job)
442 {
443   LAUNCHER_INFOS("Launcher compiled without LIBBATCH - cannot create a job !!!");
444   delete new_job;
445   throw LauncherException("Method Launcher_cpp::createJob is not available "
446                           "(libBatch was not present at compilation time)");
447 }
448
449 void 
450 Launcher_cpp::launchJob(int job_id)
451 {
452   LAUNCHER_INFOS("Launcher compiled without LIBBATCH - cannot launch a job !!!");
453   throw LauncherException("Method Launcher_cpp::launchJob is not available "
454                           "(libBatch was not present at compilation time)");
455 }
456
457 const char *
458 Launcher_cpp::getJobState(int job_id)
459 {
460   LAUNCHER_INFOS("Launcher compiled without LIBBATCH - cannot get job state!!!");
461   throw LauncherException("Method Launcher_cpp::getJobState is not available "
462                           "(libBatch was not present at compilation time)");
463 }
464
465 void
466 Launcher_cpp::getJobResults(int job_id, std::string directory)
467 {
468   LAUNCHER_INFOS("Launcher compiled without LIBBATCH - cannot get job results!!!");
469   throw LauncherException("Method Launcher_cpp::getJobResults is not available "
470                           "(libBatch was not present at compilation time)");
471 }
472
473 void
474 Launcher_cpp::removeJob(int job_id)
475 {
476   LAUNCHER_INFOS("Launcher compiled without LIBBATCH - cannot remove job!!!");
477   throw LauncherException("Method Launcher_cpp::removeJob is not available "
478                           "(libBatch was not present at compilation time)");
479 }
480
481 long 
482 Launcher_cpp::createJobWithFile( const std::string xmlExecuteFile, std::string clusterName)
483 {
484   throw LauncherException("Method Launcher_cpp::createJobWithFile is not available "
485                           "(libBatch was not present at compilation time)");
486   return 0;
487 }
488
489 #endif
490
491 ParserLauncherType 
492 Launcher_cpp::ParseXmlFile(std::string xmlExecuteFile)
493 {
494   ParserLauncherType job_params;
495   SALOME_Launcher_Handler * handler = new SALOME_Launcher_Handler(job_params);
496
497   const char* aFilePath = xmlExecuteFile.c_str();
498   FILE* aFile = fopen(aFilePath, "r");
499   if (aFile != NULL)
500   {
501     xmlDocPtr aDoc = xmlReadFile(aFilePath, NULL, 0);
502     if (aDoc != NULL)
503       handler->ProcessXmlDocument(aDoc);
504     else
505     {
506       std::string message = "ResourcesManager_cpp: could not parse file: " + xmlExecuteFile;
507       LAUNCHER_MESSAGE(message);
508       delete handler;
509       throw LauncherException(message);
510     }
511     // Free the document
512     xmlFreeDoc(aDoc);
513     fclose(aFile);
514   }
515   else
516   {
517     std::string message = "ResourcesManager_cpp: file is not readable: " + xmlExecuteFile;
518     LAUNCHER_MESSAGE(message);
519     delete handler;
520     throw LauncherException(message);
521   }
522
523   // Return
524   delete handler;
525   return job_params;
526 }
527
528 std::map<int, Launcher::Job *>
529 Launcher_cpp::getJobs()
530 {
531   return _launcher_job_map;
532 }
533
534 void 
535 Launcher_cpp::checkFactoryForResource(const std::string & resource_name)
536 {
537   // Step 1: Check if resource exist in the resource manager
538   ParserResourcesType resource_definition;
539   try
540   {
541     resource_definition = _ResManager->GetResourcesDescr(resource_name);
542   }
543   catch(const ResourcesException &ex)
544   {
545     LAUNCHER_INFOS(ex.msg);
546     throw LauncherException(ex.msg);
547   }
548
549   // Step 2: We can now add a Factory is the resource is correctly define
550 #ifdef WITH_LIBBATCH
551   std::map<std::string, Batch::BatchManager_eClient *>::const_iterator it = _batchmap.find(resource_name);
552   if(it == _batchmap.end())
553   {
554     try
555     {
556       // Warning cannot write on one line like this, because map object is constructed before
557       // the method is called...
558       //_batchmap.[resource_name] = FactoryBatchManager(resource_definition);
559       Batch::BatchManager_eClient * batch_client = FactoryBatchManager(resource_definition);
560       _batchmap[resource_name] = batch_client;
561     }
562     catch(const LauncherException &ex)
563     {
564       LAUNCHER_INFOS("Error during creation of the batch manager of the resource, mess: " << ex.msg);
565       throw ex;
566     }
567     catch(const Batch::EmulationException &ex)
568     {
569       LAUNCHER_INFOS("Error during creation of the batch manager of the resource, mess: " << ex.message);
570       throw LauncherException(ex.message);
571     }
572     catch(const Batch::InvalidArgumentException &ex)
573     {
574       LAUNCHER_INFOS("Error during creation of the batch manager of the resource, mess: " << ex.message);
575       throw LauncherException(ex.message);
576     }
577   }
578 #endif
579 }
580
581 void 
582 Launcher_cpp::addJobDirectlyToMap(Launcher::Job * new_job, const std::string job_reference)
583 {
584   // Step 1: check if resource is already in the map
585   std::string resource_name = new_job->getResourceDefinition().Name;
586   checkFactoryForResource(resource_name);
587   ParserResourcesType resource_definition = _ResManager->GetResourcesDescr(resource_name);
588   new_job->setResourceDefinition(resource_definition);
589
590   // Step 2: add the job to the batch manager
591 #ifdef WITH_LIBBATCH
592   try
593   {
594     Batch::JobId batch_manager_job_id = _batchmap[resource_name]->addJob(*(new_job->getBatchJob()), 
595                                                                          job_reference);
596     new_job->setBatchManagerJobId(batch_manager_job_id);
597   }
598   catch(const Batch::EmulationException &ex)
599   {
600     LAUNCHER_INFOS("Job is not launched, exception in submitJob: " << ex.message);
601     throw LauncherException(ex.message.c_str());
602   }
603
604   // Step 3: add job to launcher map
605   pthread_mutex_lock(_job_cpt_mutex);
606   new_job->setNumber(_job_cpt);
607   _job_cpt++;
608   pthread_mutex_unlock(_job_cpt_mutex);
609   std::map<int, Launcher::Job *>::const_iterator it_job = _launcher_job_map.find(new_job->getNumber());
610   if (it_job == _launcher_job_map.end())
611     _launcher_job_map[new_job->getNumber()] = new_job;
612   else
613   {
614     LAUNCHER_INFOS("A job as already the same id: " << new_job->getNumber());
615     delete new_job;
616     throw LauncherException("A job as already the same id - job is not created !");
617   }
618   LAUNCHER_MESSAGE("New job added");
619 #endif
620 }