Salome HOME
ce0136d99360f1b9c708b70eadd3b703e77ac738
[tools/medcoupling.git] / src / INTERP_KERNEL / SplitterTetra.txx
1 // Copyright (C) 2007-2019  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 #ifndef __SPLITTERTETRA_TXX__
20 #define __SPLITTERTETRA_TXX__
21
22 #include "SplitterTetra.hxx"
23
24 #include "TetraAffineTransform.hxx"
25 #include "TransformedTriangle.hxx"
26 #include "MeshUtils.hxx"
27 #include "VectorUtils.hxx"
28 #include "CellModel.hxx"
29 #include "Log.hxx"
30 #include "UnitTetraIntersectionBary.hxx"
31 #include "VolSurfFormulae.hxx"
32
33 #include <cmath>
34 #include <cassert>
35 #include <string>
36 #include <sstream>
37 #include <vector>
38
39 namespace INTERP_KERNEL
40 {
41   template<class MyMeshType> 
42   const double SplitterTetra<MyMeshType>::SPARSE_TRUNCATION_LIMIT=1.0e-14;
43
44   /*!
45    * output is expected to be allocated with 24*sizeof(void*) in order to store the 24 tetras.
46    * These tetras have to be deallocated.
47    */
48   template<class MyMeshType>
49   void SplitterTetra<MyMeshType>::splitIntoDualCells(SplitterTetra<MyMeshType> **output)
50   {
51     double tmp[12];
52     const double *tmp2[4]={tmp,tmp+3,tmp+6,tmp+9};
53     typename MyMeshType::MyConnType conn[4]={-1,-1,-1,-1};
54     for(int i=0;i<24;i++)
55       {
56         splitMySelfForDual(tmp,i,conn[0]);
57         output[i]=new SplitterTetra<MyMeshType>(_src_mesh,tmp2,conn);
58       }
59   }
60
61   /**
62    * SplitterTetra class computes for a list of cell ids of a given mesh \a srcMesh (badly named) the intersection with a 
63    * single TETRA4 cell given by \a tetraCorners (of length 4) and \a nodesId (of length 4 too). \a nodedIds is given only to establish
64    * if a partial computation of a triangle has already been performed (to increase performance).
65    *
66    * The \a srcMesh can contain polyhedron cells.
67    * 
68    * 
69    * Constructor creating object from the four corners of the tetrahedron.
70    *
71    * @param srcMesh       mesh containing the source elements
72    * @param tetraCorners  array of four pointers to double[3] arrays containing the coordinates of the
73    *                      corners of the tetrahedron
74    */
75   template<class MyMeshType>
76   SplitterTetra<MyMeshType>::SplitterTetra(const MyMeshType& srcMesh, const double** tetraCorners, const typename MyMeshType::MyConnType *nodesId)
77     : _t(0), _src_mesh(srcMesh)
78   {
79     std::copy(nodesId,nodesId+4,_conn);
80     _coords[0]=tetraCorners[0][0]; _coords[1]=tetraCorners[0][1]; _coords[2]=tetraCorners[0][2];
81     _coords[3]=tetraCorners[1][0]; _coords[4]=tetraCorners[1][1]; _coords[5]=tetraCorners[1][2];
82     _coords[6]=tetraCorners[2][0]; _coords[7]=tetraCorners[2][1]; _coords[8]=tetraCorners[2][2];
83     _coords[9]=tetraCorners[3][0]; _coords[10]=tetraCorners[3][1]; _coords[11]=tetraCorners[3][2];
84     // create the affine transform
85     _t=new TetraAffineTransform(_coords);
86   }
87
88   /**
89    * SplitterTetra class computes for a list of cell ids of a given mesh \a srcMesh (badly named) the intersection with a 
90    * single TETRA4 cell given by \a tetraCorners (of length 4) and \a nodesId (of length 4 too). \a nodedIds is given only to establish
91    * if a partial computation of a triangle has already been performed (to increase performance).
92    *
93    * The \a srcMesh can contain polyhedron cells.
94    * 
95    * 
96    * Constructor creating object from the four corners of the tetrahedron.
97    *
98    * \param [in] srcMesh       mesh containing the source elements
99    * \param [in] tetraCorners  array 4*3 doubles containing corners of input tetrahedron (P0X,P0Y,P0Y,P1X,P1Y,P1Z,P2X,P2Y,P2Z,P3X,P3Y,P3Z).
100    */
101   template<class MyMeshType>
102   SplitterTetra<MyMeshType>::SplitterTetra(const MyMeshType& srcMesh, const double tetraCorners[12], const ConnType *conn): _t(0),_src_mesh(srcMesh)
103   {
104     if(!conn)
105       { _conn[0]=0; _conn[1]=1; _conn[2]=2; _conn[3]=3; }
106     else
107       { _conn[0]=conn[0]; _conn[1]=conn[1]; _conn[2]=conn[2]; _conn[3]=conn[3]; }
108     _coords[0]=tetraCorners[0]; _coords[1]=tetraCorners[1]; _coords[2]=tetraCorners[2]; _coords[3]=tetraCorners[3]; _coords[4]=tetraCorners[4]; _coords[5]=tetraCorners[5];
109     _coords[6]=tetraCorners[6]; _coords[7]=tetraCorners[7]; _coords[8]=tetraCorners[8]; _coords[9]=tetraCorners[9]; _coords[10]=tetraCorners[10]; _coords[11]=tetraCorners[11];
110     // create the affine transform
111     _t=new TetraAffineTransform(_coords);
112   }
113   
114   /**
115    * Destructor
116    *
117    * Deletes _t and the coordinates (double[3] vectors) in _nodes
118    *
119    */
120   template<class MyMeshType>
121   SplitterTetra<MyMeshType>::~SplitterTetra()
122   {
123     delete _t;
124     for(typename HashMap< ConnType, double* >::iterator iter = _nodes.begin(); iter != _nodes.end() ; ++iter)
125       delete[] iter->second;
126   }
127
128   /*!
129    * \Forget already calculated triangles, which is crucial for calculation of barycenter of intersection
130    */
131   template<class MyMeshType>
132   void SplitterTetra<MyMeshType>::clearVolumesCache()
133   {
134     _volumes.clear();
135   }
136
137   /*!
138    * This method destroys the 4 pointers pointed by tetraCorners[0],tetraCorners[1],tetraCorners[2] and tetraCorners[3]
139    * @param i is in 0..23 included.
140    * @param output is expected to be sized of 12 in order to.
141    */
142   template<class MyMeshType>
143   void SplitterTetra<MyMeshType>::splitMySelfForDual(double* output, int i, typename MyMeshType::MyConnType& nodeId)
144   {
145     double *tmp[4];
146     int offset=i/6;
147     nodeId=_conn[offset];
148     tmp[0]=_coords+3*offset; tmp[1]=_coords+((offset+1)%4)*3; tmp[2]=_coords+((offset+2)%4)*3; tmp[3]=_coords+((offset+3)%4)*3;
149     int caseToTreat=i%6;
150     int case1=caseToTreat/2;
151     int case2=caseToTreat%2;
152     const int tab[3][2]={{1,2},{3,2},{1,3}};
153     const int *curTab=tab[case1];
154     double pt0[3]; pt0[0]=(tmp[curTab[case2]][0]+tmp[0][0])/2.; pt0[1]=(tmp[curTab[case2]][1]+tmp[0][1])/2.; pt0[2]=(tmp[curTab[case2]][2]+tmp[0][2])/2.;
155     double pt1[3]; pt1[0]=(tmp[0][0]+tmp[curTab[0]][0]+tmp[curTab[1]][0])/3.; pt1[1]=(tmp[0][1]+tmp[curTab[0]][1]+tmp[curTab[1]][1])/3.; pt1[2]=(tmp[0][2]+tmp[curTab[0]][2]+tmp[curTab[1]][2])/3.;
156     double pt2[3]; pt2[0]=(tmp[0][0]+tmp[1][0]+tmp[2][0]+tmp[3][0])/4.; pt2[1]=(tmp[0][1]+tmp[1][1]+tmp[2][1]+tmp[3][1])/4.; pt2[2]=(tmp[0][2]+tmp[1][2]+tmp[2][2]+tmp[3][2])/4.;
157     std::copy(pt1,pt1+3,output+case2*3);
158     std::copy(pt0,pt0+3,output+(abs(case2-1))*3);
159     std::copy(pt2,pt2+3,output+2*3);
160     std::copy(tmp[0],tmp[0]+3,output+3*3);
161   }
162   
163   /**
164    * Calculates the volume of intersection of an element in the source mesh and the target element.
165    * It first calculates the transformation that takes the target tetrahedron into the unit tetrahedron. After that, the 
166    * faces of the source element are triangulated and the calculated transformation is applied 
167    * to each triangle. The algorithm of Grandy, implemented in INTERP_KERNEL::TransformedTriangle is used
168    * to calculate the contribution to the volume from each triangle. The volume returned is the sum of these contributions
169    * divided by the determinant of the transformation.
170    *
171    * The class will cache the intermediary calculations of transformed nodes of source cells and volumes associated 
172    * with triangulated faces to avoid having to recalculate these.
173    *
174    * @param element      global number of the source element in C mode.
175    */
176   template<class MyMeshType>
177   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectSourceCell(typename MyMeshType::MyConnType element,
178                                                         double*                         baryCentre)
179   {
180     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
181     const NumberingPolicy numPol=MyMeshType::My_numPol;
182     //{ could be done on outside?
183     // check if we have planar tetra element
184     if(_t->determinant() == 0.0)
185       {
186         // tetra is planar
187         LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
188         return 0.0;
189       }
190
191     // get type of cell
192     NormalizedCellType normCellType=_src_mesh.getTypeOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(element));
193     const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(normCellType);
194     ConnType nbOfNodes4Type=cellModelCell.isDynamic() ? _src_mesh.getNumberOfNodesOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(element)) : cellModelCell.getNumberOfNodes();
195     // halfspace filtering
196     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
197     bool isTargetOutside = false;
198
199     // calculate the coordinates of the nodes
200     ConnType *cellNodes=new ConnType[nbOfNodes4Type];
201     for(ConnType i = 0;i<nbOfNodes4Type;++i)
202       {
203         // we could store mapping local -> global numbers too, but not sure it is worth it
204         const ConnType globalNodeNum = getGlobalNumberOfNode(i, OTT<ConnType,numPol>::indFC(element), _src_mesh);
205         cellNodes[i]=globalNodeNum;
206         if(_nodes.find(globalNodeNum) == _nodes.end()) 
207           {
208             //for(HashMap< int , double* >::iterator iter3=_nodes.begin();iter3!=_nodes.end();iter3++)
209             //  std::cout << (*iter3).first << " ";
210             //std::cout << std::endl << "*** " << globalNodeNum << std::endl;
211             calculateNode(globalNodeNum);
212           }
213         CheckIsOutside(_nodes[globalNodeNum], isOutside);       
214       }
215
216     // halfspace filtering check
217     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
218     for(int i = 0; i < 8; ++i)
219       {
220         if(isOutside[i])
221           {
222             isTargetOutside = true;
223           }
224       }
225
226     double totalVolume = 0.0;
227
228     if(!isTargetOutside)
229       {
230         /// calculator of intersection barycentre
231         UnitTetraIntersectionBary baryCalculator( _t->determinant() < 0.);
232
233         // get nb of sons of a cell
234         const ConnType* rawCellConn = _src_mesh.getConnectivityPtr() + OTT<ConnType,numPol>::conn2C( _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element ]);
235         const ConnType rawNbCellNodes = _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element+1 ] - _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element ];
236         unsigned nbOfSons = cellModelCell.getNumberOfSons2(rawCellConn, rawNbCellNodes);
237
238         for(unsigned ii = 0 ; ii < nbOfSons; ++ii)
239           {
240             // get sons connectivity
241             NormalizedCellType faceType;
242             ConnType *faceNodes, nbFaceNodes=-1;
243             if ( cellModelCell.isDynamic() )
244               {
245                 faceNodes=new ConnType[nbOfNodes4Type];
246                 nbFaceNodes = cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity2(ii,rawCellConn,rawNbCellNodes,faceNodes,faceType);
247                 for ( ConnType i = 0; i < nbFaceNodes; ++i )
248                   faceNodes[i] = OTT<ConnType,numPol>::coo2C(faceNodes[i]);
249               }
250             else
251               {
252                 faceType = cellModelCell.getSonType(ii);
253                 const CellModel& faceModel=CellModel::GetCellModel(faceType);
254                 assert(faceModel.getDimension() == 2);
255                 nbFaceNodes = cellModelCell.getNumberOfNodesConstituentTheSon(ii);
256                 faceNodes = new ConnType[nbFaceNodes];
257                 cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,cellNodes,faceNodes);
258               }
259             // intersect a son with the unit tetra
260             switch(faceType)
261               {
262               case NORM_TRI3:
263                 {
264                   // create the face key
265                   TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1], faceNodes[2]);
266
267                   // calculate the triangle if needed
268                   if(_volumes.find(key) == _volumes.end())
269                     {
270                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1]], _nodes[faceNodes[2]]);
271                       calculateVolume(tri, key);
272                       totalVolume += _volumes[key];
273                       if ( baryCentre )
274                         baryCalculator.addSide( tri );
275                     } else {    
276                       // count negative as face has reversed orientation
277                       totalVolume -= _volumes[key];
278                     }
279                 }
280                 break;
281
282               case NORM_QUAD4:
283
284                 // simple triangulation of faces along a diagonal :
285                 //
286                 // 2 ------ 3
287                 // |      / |
288                 // |     /  |
289                 // |    /   |
290                 // |   /    |
291                 // |  /     |
292                 // | /      |
293                 // 1 ------ 4
294                 //
295                 //? not sure if this always works 
296                 {
297                   // calculate the triangles if needed
298
299                   // local nodes 1, 2, 3
300                   TriangleFaceKey key1 = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1], faceNodes[2]);
301                   if(_volumes.find(key1) == _volumes.end())
302                     {
303                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1]], _nodes[faceNodes[2]]);
304                       calculateVolume(tri, key1);
305                       totalVolume += _volumes[key1];
306                     } else {
307                       // count negative as face has reversed orientation
308                       totalVolume -= _volumes[key1];
309                     }
310
311                   // local nodes 1, 3, 4
312                   TriangleFaceKey key2 = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[2], faceNodes[3]);
313                   if(_volumes.find(key2) == _volumes.end())
314                     {
315                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[2]], _nodes[faceNodes[3]]);
316                       calculateVolume(tri, key2);
317                       totalVolume += _volumes[key2];
318                     }
319                   else
320                     { 
321                       // count negative as face has reversed orientation
322                       totalVolume -= _volumes[key2];
323                     }
324                 }
325                 break;
326
327               case NORM_POLYGON:
328                 {
329                   ConnType nbTria = nbFaceNodes - 2; // split polygon into nbTria triangles
330                   for ( ConnType iTri = 0; iTri < nbTria; ++iTri )
331                     {
332                       TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1+iTri], faceNodes[2+iTri]);
333                       if(_volumes.find(key) == _volumes.end())
334                         {
335                           TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1+iTri]], _nodes[faceNodes[2+iTri]]);
336                           calculateVolume(tri, key);
337                           totalVolume += _volumes[key];
338                         }
339                       else
340                         {
341                           totalVolume -= _volumes[key];
342                         }
343                     }
344                 }
345                 break;
346
347               default:
348                 std::cout << "+++ Error : Only elements with triangular and quadratilateral faces are supported at the moment." << std::endl;
349                 assert(false);
350               }
351             delete [] faceNodes;
352           }
353
354         if ( baryCentre ) {
355           baryCalculator.getBary( baryCentre );
356           _t->reverseApply( baryCentre, baryCentre );
357         }
358       }
359     delete [] cellNodes;
360     // reset if it is very small to keep the matrix sparse
361     // is this a good idea?
362     if(epsilonEqual(totalVolume, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
363       {
364         totalVolume = 0.0;
365       }
366
367     LOG(2, "Volume = " << totalVolume << ", det= " << _t->determinant());
368
369     // NB : fault in article, Grandy, [8] : it is the determinant of the inverse transformation
370     // that should be used (which is equivalent to dividing by the determinant)
371     return std::fabs(1.0 / _t->determinant() * totalVolume) ;
372   }
373
374   /**
375    * Calculates the intersection surface of two coplanar triangles.
376    *
377    * @param palneNormal normal of the plane for the first triangle
378    * @param planeConstant constant of the equation of the plane for the first triangle
379    * @param p1 coordinates of the first  node of the first  triangle
380    * @param p2 coordinates of the second node of the first  triangle
381    * @param p3 coordinates of the third  node of the first  triangle
382    * @param p4 coordinates of the first  node of the second triangle
383    * @param p5 coordinates of the second node of the second triangle
384    * @param p6 coordinates of the third  node of the second triangle
385    * @param dimCaracteristic characteristic size of the meshes containing the triangles
386    * @param precision precision for double float data used for comparison
387    */
388   template<class MyMeshType>
389   double SplitterTetra<MyMeshType>::CalculateIntersectionSurfaceOfCoplanarTriangles(const double *const planeNormal,
390                                                                                     const double planeConstant,
391                                                                                     const double *const p1, const double *const p2, const double *const p3,
392                                                                                     const double *const p4, const double *const p5, const double *const p6,
393                                                                                     const double dimCaracteristic, const double precision)
394   {
395     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
396     typedef double Vect2[2];
397     typedef double Triangle2[3][2];
398
399     const double *const tri0[3] = {p1, p2, p3};
400     const double *const tri1[3] = {p4, p5, p6};
401
402     // Plane of the first triangle defined by the normal of the triangle and the constant
403     // Project triangles onto coordinate plane most aligned with plane normal
404     int maxNormal = 0;
405     double fmax = std::abs(planeNormal[0]);
406     double absMax = std::abs(planeNormal[1]);
407     if (absMax > fmax)
408       {
409         maxNormal = 1;
410         fmax = absMax;
411       }
412     absMax = std::abs(planeNormal[2]);
413     if (absMax > fmax)
414       {
415         maxNormal = 2;
416       }
417
418     Triangle2 projTri0, projTri1;
419     int i;
420
421     if (maxNormal == 0)
422       {
423         // Project onto yz-plane.
424         for (i = 0; i < 3; ++i)
425           {
426             projTri0[i][0] = tri0[i][1];
427             projTri0[i][1] = tri0[i][2];
428             projTri1[i][0] = tri1[i][1];
429             projTri1[i][1] = tri1[i][2];
430           }
431       }
432     else if (maxNormal == 1)
433       {
434         // Project onto xz-plane.
435         for (i = 0; i < 3; ++i)
436           {
437             projTri0[i][0] = tri0[i][0];
438             projTri0[i][1] = tri0[i][2];
439             projTri1[i][0] = tri1[i][0];
440             projTri1[i][1] = tri1[i][2];
441           }
442       }
443     else
444       {
445         // Project onto xy-plane.
446         for (i = 0; i < 3; ++i)
447           {
448             projTri0[i][0] = tri0[i][0];
449             projTri0[i][1] = tri0[i][1];
450             projTri1[i][0] = tri1[i][0];
451             projTri1[i][1] = tri1[i][1];
452           }
453       }
454
455     // 2D triangle intersection routines require counterclockwise ordering.
456     Vect2 save;
457     Vect2 edge0;
458     Vect2 edge1;
459     for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
460       {
461         edge0[ii] = projTri0[1][ii] - projTri0[0][ii];
462         edge1[ii] = projTri0[2][ii] - projTri0[0][ii];
463       }
464     if ((edge0[0] * edge1[1] - edge0[1] * edge1[0]) < (double) 0.)
465       {
466         // Triangle is clockwise, reorder it.
467         for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
468           {
469             save[ii] = projTri0[1][ii];
470             projTri0[1][ii] = projTri0[2][ii];
471             projTri0[2][ii] = save[ii];
472           }
473       }
474
475     for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
476       {
477         edge0[ii] = projTri1[1][ii] - projTri1[0][ii];
478         edge1[ii] = projTri1[2][ii] - projTri1[0][ii];
479       }
480     if ((edge0[0] * edge1[1] - edge0[1] * edge1[0]) < (double) 0.)
481       {
482         // Triangle is clockwise, reorder it.
483       for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
484         {
485           save[ii] = projTri1[1][ii];
486           projTri1[1][ii] = projTri1[2][ii];
487           projTri1[2][ii] = save[ii];
488         }
489       }
490
491     std::vector<double> inter2;
492     intersec_de_triangle(projTri0[0], projTri0[1], projTri0[2],
493                          projTri1[0], projTri1[1], projTri1[2],
494                          inter2,
495                          dimCaracteristic, precision);
496     ConnType nb_inter=((ConnType)inter2.size())/2;
497     double surface = 0.;
498     if(nb_inter >3) inter2=reconstruct_polygon(inter2);
499     if (nb_inter > 0)
500       {
501         std::vector<double> inter3;
502         inter3.resize(3 * nb_inter);
503         // Map 2D intersections back to the 3D triangle space.
504         if (maxNormal == 0)
505           {
506             double invNX = ((double) 1.) / planeNormal[0];
507             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
508               {
509                 inter3[3 * i + 1] = inter2[2 * i];
510                 inter3[3 * i + 2] = inter2[2 * i + 1];
511                 inter3[3 * i] = invNX * (planeConstant - planeNormal[1] * inter3[3 * i + 1] - planeNormal[2] * inter3[3 * i + 2]);
512               }
513           }
514         else if (maxNormal == 1)
515           {
516             double invNY = ((double) 1.) / planeNormal[1];
517             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
518               {
519                 inter3[3 * i] = inter2[2 * i];
520                 inter3[3 * i + 2] = inter2[2 * i + 1];
521                 inter3[3 * i + 1] = invNY * (planeConstant - planeNormal[0] * inter3[3 * i] - planeNormal[2] * inter3[3 * i + 2]);
522               }
523           }
524         else
525           {
526             double invNZ = ((double) 1.) / planeNormal[2];
527             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
528               {
529                 inter3[3 * i] = inter2[2 * i];
530                 inter3[3 * i + 1] = inter2[2 * i + 1];
531                 inter3[3 * i + 2] = invNZ * (planeConstant - planeNormal[0] * inter3[3 * i] - planeNormal[1] * inter3[3 * i + 1]);
532               }
533           }
534         surface = polygon_area<3>(inter3);
535       }
536     return surface;
537   }
538
539   /**
540    * Determine if a face is coplanar with a triangle.
541    * The first face is characterized by the equation of her plane
542    *
543    * @param palneNormal normal of the plane for the first triangle
544    * @param planeConstant constant of the equation of the plane for the first triangle
545    * @param coordsFace coordinates of the triangle face
546    * @param precision precision for double float data used for comparison
547    */
548   template<class MyMeshType>
549   bool SplitterTetra<MyMeshType>::IsFacesCoplanar(const double *const planeNormal,
550                                                   const double planeConstant,
551                                                   const double *const *const coordsFace,
552                                                   const double precision)
553   {
554       // Compute the signed distances of triangle vertices to the plane. Use an epsilon-thick plane test.
555       // For faces not left
556       int counter = 0;
557       for (int i = 0; i < 3; ++i)
558         {
559           const double distance = dot(planeNormal, coordsFace[i]) - planeConstant;
560           if (epsilonEqual(distance, precision))
561             {
562               counter++;
563             }
564         }
565       return counter == 3;
566   }
567
568   /**
569    * Calculates the surface of intersection of a polygon face in the source mesh and a cell of the target mesh.
570    * It first calculates the transformation that takes the target tetrahedron into the unit tetrahedron. After that, the
571    * faces of the source element are triangulated and the calculated transformation is applied
572    * to each triangle.
573    * The algorithm is based on the algorithm of Grandy used in intersectSourceCell to compute
574    * the volume of intersection of two cell elements.
575    * The case with a source face colinear to one of the face of tetrahedrons is taking into account:
576    * the contribution of the face must not be counted two times.
577    *
578    * The class will cache the intermediary calculations of transformed nodes of source faces and surfaces associated
579    * with triangulated faces to avoid having to recalculate these.
580    *
581    * @param polyType type of the polygon source face
582    * @param polyNodesNbr number of the nodes of the polygon source face
583    * @param polyNodes numbers of the nodes of the polygon source face
584    * @param polyCoords coordinates of the nodes of the polygon source face
585    * @param dimCaracteristic characteristic size of the meshes containing the triangles
586    * @param precision precision for double float data used for comparison
587    * @param listOfTetraFacesTreated list of tetra faces treated
588    * @param listOfTetraFacesColinear list of tetra faces colinear with the polygon source faces
589    */
590   template<class MyMeshType>
591   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectSourceFace(const NormalizedCellType polyType,
592                                                         const ConnType polyNodesNbr,
593                                                         const ConnType *const polyNodes,
594                                                         const double *const *const polyCoords,
595                                                         const double dimCaracteristic,
596                                                         const double precision,
597                                                         std::multiset<TriangleFaceKey>& listOfTetraFacesTreated,
598                                                         std::set<TriangleFaceKey>& listOfTetraFacesColinear)
599   {
600     double totalSurface = 0.0;
601
602     // check if we have planar tetra element
603     if(_t->determinant() == 0.0)
604       {
605         // tetra is planar
606         LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
607         return 0.0;
608       }
609
610     // halfspace filtering
611     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
612     bool isStrictlyOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
613     bool isTargetStrictlyOutside = false;
614     bool isTargetOutside = false;
615
616     // calculate the coordinates of the nodes
617     for(ConnType i = 0;i<polyNodesNbr;++i)
618       {
619         const ConnType globalNodeNum = polyNodes[i];
620         if(_nodes.find(globalNodeNum) == _nodes.end())
621           {
622             calculateNode2(globalNodeNum, polyCoords[i]);
623           }
624
625         CheckIsStrictlyOutside(_nodes[globalNodeNum], isStrictlyOutside, precision);
626         CheckIsOutside(_nodes[globalNodeNum], isOutside, precision);
627       }
628
629     // halfspace filtering check
630     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
631     for(int i = 0; i < 8; ++i)
632       {
633         if(isStrictlyOutside[i])
634           {
635             isTargetStrictlyOutside = true;
636             break;
637           }
638         else if (isOutside[i])
639           {
640             isTargetOutside = true;
641           }
642       }
643
644     if (!isTargetStrictlyOutside)
645       {
646
647         if (isTargetOutside)
648           {
649             // Faces are parallel
650             const int tetraFacesNodesConn[4][3] = {
651                 { 0, 1, 2 },
652                 { 0, 2, 3 },
653                 { 0, 3, 1 },
654                 { 1, 2, 3 } };
655             double planeNormal[3];
656             for (int iTetraFace = 0; iTetraFace < 4; ++iTetraFace)
657               {
658                 const int * const tetraFaceNodesConn = tetraFacesNodesConn[iTetraFace];
659                 TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(_conn[tetraFaceNodesConn[0]],
660                                                       _conn[tetraFaceNodesConn[1]],
661                                                       _conn[tetraFaceNodesConn[2]]);
662                 if (listOfTetraFacesTreated.find(key) == listOfTetraFacesTreated.end())
663                   {
664                     const double * const coordsTetraTriNode1 = _coords + tetraFaceNodesConn[0] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
665                     const double * const coordsTetraTriNode2 = _coords + tetraFaceNodesConn[1] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
666                     const double * const coordsTetraTriNode3 = _coords + tetraFaceNodesConn[2] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
667                     calculateNormalForTria(coordsTetraTriNode1, coordsTetraTriNode2, coordsTetraTriNode3, planeNormal);
668                     const double normOfTetraTriNormal = norm(planeNormal);
669                     if (epsilonEqual(normOfTetraTriNormal, 0.))
670                       {
671                         for (int i = 0; i < 3; ++i)
672                           {
673                             planeNormal[i] = 0.;
674                           }
675                       }
676                     else
677                       {
678                         const double invNormOfTetraTriNormal = 1. / normOfTetraTriNormal;
679                         for (int i = 0; i < 3; ++i)
680                           {
681                             planeNormal[i] *= invNormOfTetraTriNormal;
682                           }
683                       }
684                     double planeConstant = dot(planeNormal, coordsTetraTriNode1);
685                     if (IsFacesCoplanar(planeNormal, planeConstant, polyCoords, precision))
686                       {
687                         ConnType nbrPolyTri = polyNodesNbr - 2; // split polygon into nbrPolyTri triangles
688                         for (ConnType iTri = 0; iTri < nbrPolyTri; ++iTri)
689                           {
690                             double volume = CalculateIntersectionSurfaceOfCoplanarTriangles(planeNormal,
691                                                                                             planeConstant,
692                                                                                             polyCoords[0],
693                                                                                             polyCoords[1 + iTri],
694                                                                                             polyCoords[2 + iTri],
695                                                                                             coordsTetraTriNode1,
696                                                                                             coordsTetraTriNode2,
697                                                                                             coordsTetraTriNode3,
698                                                                                             dimCaracteristic,
699                                                                                             precision);
700                             if (!epsilonEqual(volume, 0.))
701                               {
702                                 totalSurface += volume;
703                                 listOfTetraFacesColinear.insert(key);
704                               }
705                           }
706                       }
707                   }
708                 listOfTetraFacesTreated.insert(key);
709               }
710           }
711         else
712           {
713               // intersect a son with the unit tetra
714               switch (polyType)
715                 {
716                 case NORM_TRI3:
717                   {
718                     // create the face key
719                     TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1], polyNodes[2]);
720
721                     // calculate the triangle if needed
722                     if (_volumes.find(key) == _volumes.end())
723                       {
724                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1]], _nodes[polyNodes[2]]);
725                         calculateSurface(tri, key);
726                         totalSurface += _volumes[key];
727                       }
728                     else
729                       {
730                         // count negative as face has reversed orientation
731                         totalSurface -= _volumes[key];
732                       }
733                   }
734                   break;
735
736                 case NORM_QUAD4:
737
738                   // simple triangulation of faces along a diagonal :
739                   //
740                   // 2 ------ 3
741                   // |      / |
742                   // |     /  |
743                   // |    /   |
744                   // |   /    |
745                   // |  /     |
746                   // | /      |
747                   // 1 ------ 4
748                   //
749                   //? not sure if this always works
750                   {
751                     // calculate the triangles if needed
752
753                     // local nodes 1, 2, 3
754                     TriangleFaceKey key1 = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1], polyNodes[2]);
755                     if (_volumes.find(key1) == _volumes.end())
756                       {
757                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1]], _nodes[polyNodes[2]]);
758                         calculateSurface(tri, key1);
759                         totalSurface += _volumes[key1];
760                       }
761                     else
762                       {
763                         // count negative as face has reversed orientation
764                         totalSurface -= _volumes[key1];
765                       }
766
767                     // local nodes 1, 3, 4
768                     TriangleFaceKey key2 = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[2], polyNodes[3]);
769                     if (_volumes.find(key2) == _volumes.end())
770                       {
771                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[2]], _nodes[polyNodes[3]]);
772                         calculateSurface(tri, key2);
773                         totalSurface += _volumes[key2];
774                       }
775                     else
776                       {
777                         // count negative as face has reversed orientation
778                         totalSurface -= _volumes[key2];
779                       }
780                   }
781                   break;
782
783                 case NORM_POLYGON:
784                   {
785                     ConnType nbrPolyTri = polyNodesNbr - 2; // split polygon into nbrPolyTri triangles
786                     for (ConnType iTri = 0; iTri < nbrPolyTri; ++iTri)
787                       {
788                         TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1 + iTri], polyNodes[2 + iTri]);
789                         if (_volumes.find(key) == _volumes.end())
790                           {
791                             TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1 + iTri]],
792                                 _nodes[polyNodes[2 + iTri]]);
793                             calculateSurface(tri, key);
794                             totalSurface += _volumes[key];
795                           }
796                         else
797                           {
798                             totalSurface -= _volumes[key];
799                           }
800                       }
801                   }
802                   break;
803
804                 default:
805                   std::cout
806                       << "+++ Error : Only elements with triangular and quadratilateral faces are supported at the moment."
807                       << std::endl;
808                   assert(false);
809                 }
810
811           }
812       }
813
814     // reset if it is very small to keep the matrix sparse
815     // is this a good idea?
816     if(epsilonEqual(totalSurface, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
817       {
818         totalSurface = 0.0;
819       }
820     
821     LOG(2, "Volume = " << totalSurface << ", det= " << _t->determinant());
822
823     return totalSurface;
824   }
825
826   /**
827    * Calculates the volume of intersection of this tetrahedron with another one.
828    */
829   template<class MyMeshType>
830   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectTetra(const double** tetraCorners)
831   {
832     //{ could be done on outside?
833     // check if we have planar tetra element
834     if(_t->determinant() == 0.0)
835     {
836       // tetra is planar
837       LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
838       return 0.0;
839     }
840
841     const unsigned nbOfNodes4Type=4;
842     // halfspace filtering
843     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
844     bool isTargetOutside = false;
845
846     // calculate the transformed coordinates of the nodes
847     double nodes[nbOfNodes4Type][3];
848     for(int i = 0;i<(int)nbOfNodes4Type;++i)
849     {
850       _t->apply(nodes[i], tetraCorners[i]);
851       CheckIsOutside(nodes[i], isOutside);
852     }
853
854     // halfspace filtering check
855     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
856     for(int i = 0; i < 8; ++i)
857     {
858       if(isOutside[i])
859       {
860         isTargetOutside = true;
861       }
862     }
863
864     double totalVolume = 0.0;
865
866     if(!isTargetOutside)
867     {
868       const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(NORM_TETRA4);
869       ConnType cellNodes[4] = { 0, 1, 2, 3 }, faceNodes[3];
870
871       for(unsigned ii = 0 ; ii < 4 ; ++ii)
872       {
873         cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,cellNodes,faceNodes);
874         
875         TransformedTriangle tri(nodes[faceNodes[0]], nodes[faceNodes[1]], nodes[faceNodes[2]]);
876         double vol = tri.calculateIntersectionVolume();
877         totalVolume += vol;
878       }
879       
880       // reset if it is very small to keep the matrix sparse
881       // is this a good idea?
882       if(epsilonEqual(totalVolume, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
883       {
884         totalVolume = 0.0;
885       }
886     }
887     LOG(2, "Volume = " << totalVolume << ", det= " << _t->determinant());
888
889     // NB : fault in article, Grandy, [8] : it is the determinant of the inverse transformation 
890     // that should be used (which is equivalent to dividing by the determinant)
891     return std::fabs(1.0 / _t->determinant() * totalVolume) ;
892   }
893
894   ////////////////////////////////////////////////////////
895
896   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
897   SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::SplitterTetra2(const MyMeshTypeT& targetMesh, const MyMeshTypeS& srcMesh, SplittingPolicy policy)
898     :_target_mesh(targetMesh),_src_mesh(srcMesh),_splitting_pol(policy)
899   {
900   }
901
902   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
903   SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::~SplitterTetra2()
904   {
905     releaseArrays();
906   }
907
908   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
909   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::releaseArrays()
910   {
911     // free potential sub-mesh nodes that have been allocated
912     if(_nodes.size()>=/*8*/_node_ids.size())
913       {
914         typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT = static_cast<typename MyMeshTypeT::MyConnType>(_node_ids.size());
915         std::vector<const double*>::iterator iter = _nodes.begin() + /*8*/nbOfNodesT;
916         while(iter != _nodes.end())
917           {
918             delete[] *iter;
919             ++iter;
920           }
921       }
922     _nodes.clear();
923   }
924   
925   /*!
926    * \param [in] targetCell in C mode.
927    * \param [out] tetra is the output result tetra containers.
928    */
929   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
930   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitTargetCell2(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
931   {
932     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType TConnType;
933     const TConnType *refConn(_target_mesh.getConnectivityPtr());
934     const TConnType *cellConn(refConn+_target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[targetCell]);
935     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt(_target_mesh.getTypeOfElement(targetCell));
936     std::vector<TConnType> tetrasNodalConn;
937     std::vector<double> addCoords;
938     const double *coords(_target_mesh.getCoordinatesPtr());
939     SplitIntoTetras(_splitting_pol,gt,cellConn,refConn+_target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[targetCell+1],coords,tetrasNodalConn,addCoords);
940     std::size_t nbTetras(tetrasNodalConn.size()/4); tetra.resize(nbTetras);
941     double tmp[12];
942     typename MyMeshTypeS::MyConnType tmp2[4];
943     for(std::size_t i=0;i<nbTetras;i++)
944       {
945         for(int j=0;j<4;j++)
946           {
947             TConnType cellId(tetrasNodalConn[4*i+j]);
948             tmp2[j]=cellId;
949             if(cellId>=0)
950               {
951                 tmp[j*3+0]=coords[3*cellId+0];
952                 tmp[j*3+1]=coords[3*cellId+1];
953                 tmp[j*3+2]=coords[3*cellId+2];
954               }
955             else
956               {
957                 tmp[j*3+0]=addCoords[3*(-cellId-1)+0];
958                 tmp[j*3+1]=addCoords[3*(-cellId-1)+1];
959                 tmp[j*3+2]=addCoords[3*(-cellId-1)+2];
960               }
961           }
962         tetra[i]=new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh,tmp,tmp2);
963       }
964   }
965
966   /*!
967    * @param targetCell in C mode.
968    * @param tetra is the output result tetra containers.
969    */
970   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
971   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitTargetCell(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell,
972                                                                  typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT,
973                                                                  typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
974   {
975     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType ConnType;
976     const NumberingPolicy numPol=MyMeshTypeT::My_numPol;
977     const int numTetra = static_cast<int>(_splitting_pol);
978     if(nbOfNodesT==4)
979       {
980         _nodes.resize(8);
981         _node_ids.resize(8);
982         tetra.reserve(1);
983         const double *nodes[4];
984         ConnType conn[4];
985         for(int node = 0; node < 4 ; ++node)
986           {
987             nodes[node]=getCoordsOfNode2(node, OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell),_target_mesh,conn[node]);
988           }
989         std::copy(conn,conn+4,_node_ids.begin());
990         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
991         tetra.push_back(t);
992         return ;
993       }
994     // Issue 0020634. To pass nbOfNodesT to calculateSubNodes (don't want to add an arg)
995     _node_ids.resize(nbOfNodesT);
996
997     // pre-calculate nodes
998     calculateSubNodes(_target_mesh, OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell));
999
1000     tetra.reserve(numTetra);
1001     _nodes.reserve(30); // we never have more than this
1002
1003     switch ( nbOfNodesT )
1004       {
1005       case 8:
1006         {
1007           switch(_splitting_pol)
1008             {
1009             case PLANAR_FACE_5:
1010               {
1011                 const int subZone[8] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 };
1012                 fiveSplit(subZone,tetra);
1013               }
1014               break;
1015
1016             case PLANAR_FACE_6:
1017               {
1018                 const int subZone[8] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 };
1019                 sixSplit(subZone,tetra);
1020               }
1021               break;
1022
1023             case GENERAL_24:
1024               {
1025                 calculateGeneral24Tetra(tetra);
1026               }
1027               break;
1028
1029             case GENERAL_48:
1030               {
1031                 calculateGeneral48Tetra(tetra);
1032               }
1033               break;
1034             default:
1035               assert(false);
1036             }
1037           break;
1038         }
1039       case 5:
1040         {
1041           splitPyram5(tetra);
1042           break;
1043         }
1044       default:
1045         {
1046           splitConvex(targetCell, tetra);
1047         }
1048       }
1049   }
1050
1051   /**
1052    * Splits the hexahedron into five tetrahedra.
1053    * This method adds five SplitterTetra objects to the vector tetra. 
1054    *
1055    * @param subZone  the local node numbers corresponding to the hexahedron corners - these are mapped onto {0,..,7}. Providing this allows the 
1056    *                 splitting to be reused on the subzones of the GENERAL_* types of splitting
1057    */
1058   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1059   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::fiveSplit(const int* const subZone, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1060   { 
1061     // create tetrahedra
1062     for(int i = 0; i < 5; ++i)
1063       {
1064         const double* nodes[4];
1065         typename MyMeshTypeS::MyConnType conn[4];
1066         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1067           {
1068             conn[j] = subZone[ SPLIT_NODES_5[4*i+j] ];
1069             nodes[j] = getCoordsOfSubNode(conn[j]);
1070           }
1071         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1072         tetra.push_back(t);
1073       }
1074   }
1075
1076   /**
1077    * Splits the hexahedron into six tetrahedra.
1078    * This method adds six SplitterTetra objects to the vector tetra. 
1079    *
1080    * @param subZone  the local node numbers corresponding to the hexahedron corners - these are mapped onto {0,..,7}. Providing this allows the 
1081    *                 splitting to be reused on the subzones of the GENERAL_* types of splitting
1082    */
1083   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1084   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::sixSplit(const int* const subZone, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1085   {
1086     for(int i = 0; i < 6; ++i)
1087       {
1088         const double* nodes[4];
1089         typename MyMeshTypeS::MyConnType conn[4];
1090         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1091           {
1092             conn[j] = subZone[SPLIT_NODES_6[4*i+j]];
1093             nodes[j] = getCoordsOfSubNode(conn[j]);
1094           }
1095         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1096         tetra.push_back(t);
1097       }
1098   }
1099
1100   /**
1101    * Splits the hexahedron into 24 tetrahedra.
1102    * The splitting is done by combining the barycenter of the tetrahedron, the barycenter of each face 
1103    * and the nodes of each edge of the face. This creates 6 faces * 4 edges / face = 24 tetrahedra.
1104    * The submesh nodes introduced are the barycenters of the faces and the barycenter of the cell.
1105    * 
1106    */
1107   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1108   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateGeneral24Tetra(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1109   {
1110     // The two nodes of the original mesh cell used in each tetrahedron.
1111     // The tetrahedra all have nodes (cellCenter, faceCenter, edgeNode1, edgeNode2)
1112     // For the correspondence of the nodes, see the GENERAL_48_SUB_NODES table in calculateSubNodes
1113     
1114     // nodes to use for tetrahedron
1115     const double* nodes[4];
1116     typename MyMeshTypeS::MyConnType conn[4];
1117     // get the cell center
1118     conn[0] = 14;
1119     nodes[0] = getCoordsOfSubNode(conn[0]);
1120
1121     for(int faceCenterNode = 8; faceCenterNode < 14; ++faceCenterNode)
1122       {
1123         // get the face center
1124         conn[1] = faceCenterNode;
1125         nodes[1] = getCoordsOfSubNode(conn[1]);
1126         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1127           {
1128             const int row = 4*(faceCenterNode - 8) + j;
1129             conn[2] = TETRA_EDGES_GENERAL_24[2*row];
1130             conn[3] = TETRA_EDGES_GENERAL_24[2*row + 1];
1131             nodes[2] = getCoordsOfSubNode(conn[2]);
1132             nodes[3] = getCoordsOfSubNode(conn[3]);
1133
1134             SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes, conn);
1135             tetra.push_back(t);
1136           }
1137       }
1138   }
1139
1140
1141   /**
1142    * Splits the hexahedron into 48 tetrahedra.
1143    * The splitting is done by introducing the midpoints of all the edges 
1144    * and the barycenter of the element as submesh nodes. The 8 hexahedral subzones thus defined
1145    * are then split into 6 tetrahedra each, as in Grandy, p. 449. The division of the subzones 
1146    * is done by calling sixSplit().
1147    * 
1148    */
1149   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1150   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateGeneral48Tetra(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1151   { 
1152     for(int i = 0; i < 8; ++i)
1153       {
1154         sixSplit(GENERAL_48_SUBZONES+8*i,tetra);
1155       }
1156   }
1157   
1158   /**
1159    * Splits the NORM_PYRA5 into 2 tetrahedra.
1160    */
1161   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1162   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitPyram5(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1163   {
1164     static const int SPLIT_PYPA5[2][4] = 
1165       {
1166         {
1167           0, 1, 2, 4
1168         },
1169         {
1170           0, 2, 3, 4
1171         }
1172       };
1173     
1174     // create tetrahedra
1175     const double* nodes[4];
1176     typename MyMeshTypeS::MyConnType conn[4];
1177     for(int i = 0; i < 2; ++i)
1178       {
1179         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1180           nodes[j] = getCoordsOfSubNode2(SPLIT_PYPA5[i][j],conn[j]);
1181         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1182         tetra.push_back(t);
1183       }
1184   }
1185   
1186   /**
1187    * Splits a convex cell into tetrahedra.
1188    */
1189   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1190   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitConvex(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell,
1191                                                              typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1192   {
1193     // Each face of a cell is split into triangles and
1194     // each of triangles and a cell barycenter form a tetrahedron.
1195
1196     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType ConnType;
1197     const NumberingPolicy numPol=MyMeshTypeT::My_numPol;
1198
1199     // get type of cell and nb of cell nodes
1200     NormalizedCellType normCellType=_target_mesh.getTypeOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell));
1201     const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(normCellType);
1202     ConnType nbOfCellNodes=cellModelCell.isDynamic() ? _target_mesh.getNumberOfNodesOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell)) : cellModelCell.getNumberOfNodes();
1203
1204     // get nb of cell sons (faces)
1205     const ConnType* rawCellConn = _target_mesh.getConnectivityPtr() + OTT<ConnType,numPol>::conn2C( _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell ]);
1206     const ConnType rawNbCellNodes = _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell+1 ] - _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell ];
1207     unsigned nbOfSons = cellModelCell.getNumberOfSons2(rawCellConn, rawNbCellNodes);
1208
1209     // indices of nodes of a son
1210     static std::vector<ConnType> allNodeIndices; // == 0,1,2,...,nbOfCellNodes-1
1211     while ( allNodeIndices.size() < (std::size_t)nbOfCellNodes )
1212       allNodeIndices.push_back( static_cast<ConnType>(allNodeIndices.size()) );
1213     std::vector<ConnType> classicFaceNodes(4);
1214     if(cellModelCell.isQuadratic())
1215       throw INTERP_KERNEL::Exception("SplitterTetra2::splitConvex : quadratic 3D cells are not implemented yet !");
1216     ConnType* faceNodes = cellModelCell.isDynamic() ? &allNodeIndices[0] : &classicFaceNodes[0];
1217
1218     // nodes of tetrahedron
1219     typename MyMeshTypeS::MyConnType conn[4];
1220     const double* nodes[4];
1221     nodes[3] = getCoordsOfSubNode2( nbOfCellNodes,conn[3]); // barycenter
1222
1223     for(unsigned ii = 0 ; ii < nbOfSons; ++ii)
1224       {
1225         // get indices of son's nodes: it's just next portion of allNodeIndices for polyhedron
1226         // and some of allNodeIndices accodring to cell model for a classsic cell 
1227         unsigned nbFaceNodes = cellModelCell.getNumberOfNodesConstituentTheSon2(ii, rawCellConn, rawNbCellNodes);
1228         if ( normCellType != NORM_POLYHED )
1229           cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,&allNodeIndices[0],faceNodes);
1230
1231         int nbTetra = nbFaceNodes - 2; // split polygon into nbTetra triangles
1232
1233         // create tetrahedra
1234         for(int i = 0; i < nbTetra; ++i)
1235           {
1236             nodes[0] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[0],  conn[0]);
1237             nodes[1] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[1+i],conn[1]);
1238             nodes[2] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[2+i],conn[2]);
1239             SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1240             tetra.push_back(t);
1241           }
1242
1243         if ( normCellType == NORM_POLYHED )
1244           faceNodes += nbFaceNodes; // go to the next face
1245       }
1246   }
1247   
1248   /**
1249    * Precalculates all the nodes.
1250    * Retrieves the mesh nodes and allocates the necessary sub-mesh 
1251    * nodes according to the splitting policy used.
1252    * This method is meant to be called once by the constructor.
1253    *
1254    * @param targetMesh  the target mesh
1255    * @param targetCell  the global number of the cell that the object represents, in targetMesh mode.
1256    * @param policy      the splitting policy of the object
1257    *
1258    */
1259   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1260   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateSubNodes(const MyMeshTypeT& targetMesh, typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell)
1261   {
1262     // retrieve real mesh nodes
1263     
1264     typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT = static_cast<typename MyMeshTypeT::MyConnType>(_node_ids.size());// Issue 0020634. _node_ids.resize(8);
1265     for(int node = 0; node < nbOfNodesT ; ++node)
1266       {
1267         // calculate only normal nodes
1268         _nodes.push_back(getCoordsOfNode2(node, targetCell, targetMesh,_node_ids[node]));
1269       }
1270
1271     switch ( nbOfNodesT )
1272       {
1273       case 8:
1274
1275         // create sub-mesh nodes if needed
1276         switch(_splitting_pol)
1277           {
1278           case GENERAL_24:
1279             {
1280               for(int i = 0; i < 7; ++i)
1281                 {
1282                   double* barycenter = new double[3];
1283                   calcBarycenter(4, barycenter, &GENERAL_24_SUB_NODES[4*i]);
1284                   _nodes.push_back(barycenter);
1285                 }
1286             }
1287             break;
1288
1289           case GENERAL_48:
1290             {
1291               for(int i = 0; i < 19; ++i)
1292                 {
1293                   double* barycenter = new double[3];
1294                   calcBarycenter(2, barycenter, &GENERAL_48_SUB_NODES[2*i]);
1295                   _nodes.push_back(barycenter);
1296                 }
1297             }
1298             break;
1299
1300           default:
1301             break;
1302           }
1303
1304       case 5: // NORM_PYRA5
1305         break;
1306
1307       default: // convex 3d cell
1308         {
1309           // add barycenter of a cell
1310           std::vector<int> allIndices(nbOfNodesT);
1311           for ( int i = 0; i < nbOfNodesT; ++i ) allIndices[i] = i;
1312           double* barycenter = new double[3];
1313           calcBarycenter(nbOfNodesT, barycenter, &allIndices[0]);
1314           _nodes.push_back(barycenter);
1315         }
1316       }
1317
1318   }
1319 }
1320
1321 #endif