src/INTERP_KERNEL/SplitterTetra.txx

   1 // Copyright (C) 2007-2014  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 #ifndef __SPLITTERTETRA_TXX__
  20 #define __SPLITTERTETRA_TXX__
  21
  22 #include "SplitterTetra.hxx"
  23
  24 #include "TetraAffineTransform.hxx"
  25 #include "TransformedTriangle.hxx"
  26 #include "MeshUtils.hxx"
  27 #include "VectorUtils.hxx"
  28 #include "CellModel.hxx"
  29 #include "Log.hxx"
  30 #include "UnitTetraIntersectionBary.hxx"
  31 #include "VolSurfFormulae.hxx"
  32
  33 #include <cmath>
  34 #include <cassert>
  35 #include <string>
  36 #include <sstream>
  37 #include <vector>
  38
  39 namespace INTERP_KERNEL
  40 {
  41   template<class MyMeshType>
  42   const double SplitterTetra<MyMeshType>::SPARSE_TRUNCATION_LIMIT=1.0e-14;
  43
  44   /*!
  45    * output is expected to be allocated with 24*sizeof(void*) in order to store the 24 tetras.
  46    * These tetras have to be deallocated.
  47    */
  48   template<class MyMeshType>
  49   void SplitterTetra<MyMeshType>::splitIntoDualCells(SplitterTetra<MyMeshType> **output)
  50   {
  51     double tmp[12];
  52     const double *tmp2[4]={tmp,tmp+3,tmp+6,tmp+9};
  53     typename MyMeshType::MyConnType conn[4]={-1,-1,-1,-1};
  54     for(int i=0;i<24;i++)
  55       {
  56         splitMySelfForDual(tmp,i,conn[0]);
  57         output[i]=new SplitterTetra<MyMeshType>(_src_mesh,tmp2,conn);
  58       }
  59   }
  60
  61   /**
  62    * SplitterTetra class computes for a list of cell ids of a given mesh \a srcMesh (badly named) the intersection with a
  63    * single TETRA4 cell given by \a tetraCorners (of length 4) and \a nodesId (of length 4 too). \a nodedIds is given only to establish
  64    * if a partial computation of a triangle has already been performed (to increase performance).
  65    *
  66    * The \a srcMesh can contain polyhedron cells.
  67    *
  68    *
  69    * Constructor creating object from the four corners of the tetrahedron.
  70    *
  71    * @param srcMesh       mesh containing the source elements
  72    * @param tetraCorners  array of four pointers to double[3] arrays containing the coordinates of the
  73    *                      corners of the tetrahedron
  74    */
  75   template<class MyMeshType>
  76   SplitterTetra<MyMeshType>::SplitterTetra(const MyMeshType& srcMesh, const double** tetraCorners, const typename MyMeshType::MyConnType *nodesId)
  77     : _t(0), _src_mesh(srcMesh)
  78   {
  79     std::copy(nodesId,nodesId+4,_conn);
  80     _coords[0]=tetraCorners[0][0]; _coords[1]=tetraCorners[0][1]; _coords[2]=tetraCorners[0][2];
  81     _coords[3]=tetraCorners[1][0]; _coords[4]=tetraCorners[1][1]; _coords[5]=tetraCorners[1][2];
  82     _coords[6]=tetraCorners[2][0]; _coords[7]=tetraCorners[2][1]; _coords[8]=tetraCorners[2][2];
  83     _coords[9]=tetraCorners[3][0]; _coords[10]=tetraCorners[3][1]; _coords[11]=tetraCorners[3][2];
  84     // create the affine transform
  85     _t=new TetraAffineTransform(_coords);
  86   }
  87
  88   /**
  89    * SplitterTetra class computes for a list of cell ids of a given mesh \a srcMesh (badly named) the intersection with a
  90    * single TETRA4 cell given by \a tetraCorners (of length 4) and \a nodesId (of length 4 too). \a nodedIds is given only to establish
  91    * if a partial computation of a triangle has already been performed (to increase performance).
  92    *
  93    * The \a srcMesh can contain polyhedron cells.
  94    *
  95    *
  96    * Constructor creating object from the four corners of the tetrahedron.
  97    *
  98    * \param [in] srcMesh       mesh containing the source elements
  99    * \param [in] tetraCorners  array 4*3 doubles containing corners of input tetrahedron (P0X,P0Y,P0Y,P1X,P1Y,P1Z,P2X,P2Y,P2Z,P3X,P3Y,P3Z).
 100    */
 101   template<class MyMeshType>
 102   SplitterTetra<MyMeshType>::SplitterTetra(const MyMeshType& srcMesh, const double tetraCorners[12], const int *conn): _t(0),_src_mesh(srcMesh)
 103   {
 104     if(!conn)
 105       { _conn[0]=0; _conn[1]=1; _conn[2]=2; _conn[3]=3; }
 106     else
 107       { _conn[0]=conn[0]; _conn[1]=conn[1]; _conn[2]=conn[2]; _conn[3]=conn[3]; }
 108     _coords[0]=tetraCorners[0]; _coords[1]=tetraCorners[1]; _coords[2]=tetraCorners[2]; _coords[3]=tetraCorners[3]; _coords[4]=tetraCorners[4]; _coords[5]=tetraCorners[5];
 109     _coords[6]=tetraCorners[6]; _coords[7]=tetraCorners[7]; _coords[8]=tetraCorners[8]; _coords[9]=tetraCorners[9]; _coords[10]=tetraCorners[10]; _coords[11]=tetraCorners[11];
 110     // create the affine transform
 111     _t=new TetraAffineTransform(_coords);
 112   }
 113
 114   /**
 115    * Destructor
 116    *
 117    * Deletes _t and the coordinates (double[3] vectors) in _nodes
 118    *
 119    */
 120   template<class MyMeshType>
 121   SplitterTetra<MyMeshType>::~SplitterTetra()
 122   {
 123     delete _t;
 124     for(HashMap< int, double* >::iterator iter = _nodes.begin(); iter != _nodes.end() ; ++iter)
 125       delete[] iter->second;
 126   }
 127
 128   /*!
 129    * \Forget already calculated triangles, which is crucial for calculation of barycenter of intersection
 130    */
 131   template<class MyMeshType>
 132   void SplitterTetra<MyMeshType>::clearVolumesCache()
 133   {
 134     _volumes.clear();
 135   }
 136
 137   /*!
 138    * This method destroys the 4 pointers pointed by tetraCorners[0],tetraCorners[1],tetraCorners[2] and tetraCorners[3]
 139    * @param i is in 0..23 included.
 140    * @param output is expected to be sized of 12 in order to.
 141    */
 142   template<class MyMeshType>
 143   void SplitterTetra<MyMeshType>::splitMySelfForDual(double* output, int i, typename MyMeshType::MyConnType& nodeId)
 144   {
 145     double *tmp[4];
 146     int offset=i/6;
 147     nodeId=_conn[offset];
 148     tmp[0]=_coords+3*offset; tmp[1]=_coords+((offset+1)%4)*3; tmp[2]=_coords+((offset+2)%4)*3; tmp[3]=_coords+((offset+3)%4)*3;
 149     int caseToTreat=i%6;
 150     int case1=caseToTreat/2;
 151     int case2=caseToTreat%2;
 152     const int tab[3][2]={{1,2},{3,2},{1,3}};
 153     const int *curTab=tab[case1];
 154     double pt0[3]; pt0[0]=(tmp[curTab[case2]][0]+tmp[0][0])/2.; pt0[1]=(tmp[curTab[case2]][1]+tmp[0][1])/2.; pt0[2]=(tmp[curTab[case2]][2]+tmp[0][2])/2.;
 155     double pt1[3]; pt1[0]=(tmp[0][0]+tmp[curTab[0]][0]+tmp[curTab[1]][0])/3.; pt1[1]=(tmp[0][1]+tmp[curTab[0]][1]+tmp[curTab[1]][1])/3.; pt1[2]=(tmp[0][2]+tmp[curTab[0]][2]+tmp[curTab[1]][2])/3.;
 156     double pt2[3]; pt2[0]=(tmp[0][0]+tmp[1][0]+tmp[2][0]+tmp[3][0])/4.; pt2[1]=(tmp[0][1]+tmp[1][1]+tmp[2][1]+tmp[3][1])/4.; pt2[2]=(tmp[0][2]+tmp[1][2]+tmp[2][2]+tmp[3][2])/4.;
 157     std::copy(pt1,pt1+3,output+case2*3);
 158     std::copy(pt0,pt0+3,output+(abs(case2-1))*3);
 159     std::copy(pt2,pt2+3,output+2*3);
 160     std::copy(tmp[0],tmp[0]+3,output+3*3);
 161   }
 162
 163   /**
 164    * Calculates the volume of intersection of an element in the source mesh and the target element.
 165    * It first calculates the transformation that takes the target tetrahedron into the unit tetrahedron. After that, the
 166    * faces of the source element are triangulated and the calculated transformation is applied
 167    * to each triangle. The algorithm of Grandy, implemented in INTERP_KERNEL::TransformedTriangle is used
 168    * to calculate the contribution to the volume from each triangle. The volume returned is the sum of these contributions
 169    * divided by the determinant of the transformation.
 170    *
 171    * The class will cache the intermediary calculations of transformed nodes of source cells and volumes associated
 172    * with triangulated faces to avoid having to recalculate these.
 173    *
 174    * @param element      global number of the source element in C mode.
 175    */
 176   template<class MyMeshType>
 177   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectSourceCell(typename MyMeshType::MyConnType element,
 178                                                         double*                         baryCentre)
 179   {
 180     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
 181     const NumberingPolicy numPol=MyMeshType::My_numPol;
 182     //{ could be done on outside?
 183     // check if we have planar tetra element
 184     if(_t->determinant() == 0.0)
 185       {
 186         // tetra is planar
 187         LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
 188         return 0.0;
 189       }
 190
 191     // get type of cell
 192     NormalizedCellType normCellType=_src_mesh.getTypeOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(element));
 193     const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(normCellType);
 194     unsigned nbOfNodes4Type=cellModelCell.isDynamic() ? _src_mesh.getNumberOfNodesOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(element)) : cellModelCell.getNumberOfNodes();
 195     // halfspace filtering
 196     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 197     bool isTargetOutside = false;
 198
 199     // calculate the coordinates of the nodes
 200     int *cellNodes=new int[nbOfNodes4Type];
 201     for(int i = 0;i<(int)nbOfNodes4Type;++i)
 202       {
 203         // we could store mapping local -> global numbers too, but not sure it is worth it
 204         const int globalNodeNum = getGlobalNumberOfNode(i, OTT<ConnType,numPol>::indFC(element), _src_mesh);
 205         cellNodes[i]=globalNodeNum;
 206         if(_nodes.find(globalNodeNum) == _nodes.end())
 207           {
 208             //for(HashMap< int , double* >::iterator iter3=_nodes.begin();iter3!=_nodes.end();iter3++)
 209             //  std::cout << (*iter3).first << " ";
 210             //std::cout << std::endl << "*** " << globalNodeNum << std::endl;
 211             calculateNode(globalNodeNum);
 212           }
 213         CheckIsOutside(_nodes[globalNodeNum], isOutside);
 214       }
 215
 216     // halfspace filtering check
 217     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
 218     for(int i = 0; i < 8; ++i)
 219       {
 220         if(isOutside[i])
 221           {
 222             isTargetOutside = true;
 223           }
 224       }
 225
 226     double totalVolume = 0.0;
 227
 228     if(!isTargetOutside)
 229       {
 230         /// calculator of intersection barycentre
 231         UnitTetraIntersectionBary baryCalculator( _t->determinant() < 0.);
 232
 233         // get nb of sons of a cell
 234         const ConnType* rawCellConn = _src_mesh.getConnectivityPtr() + OTT<ConnType,numPol>::conn2C( _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element ]);
 235         const int rawNbCellNodes = _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element+1 ] - _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element ];
 236         unsigned nbOfSons = cellModelCell.getNumberOfSons2(rawCellConn, rawNbCellNodes);
 237
 238         for(unsigned ii = 0 ; ii < nbOfSons; ++ii)
 239           {
 240             // get sons connectivity
 241             NormalizedCellType faceType;
 242             int *faceNodes, nbFaceNodes=-1;
 243             if ( cellModelCell.isDynamic() )
 244               {
 245                 faceNodes=new int[nbOfNodes4Type];
 246                 nbFaceNodes = cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity2(ii,rawCellConn,rawNbCellNodes,faceNodes,faceType);
 247                 for ( int i = 0; i < nbFaceNodes; ++i )
 248                   faceNodes[i] = OTT<ConnType,numPol>::coo2C(faceNodes[i]);
 249               }
 250             else
 251               {
 252                 faceType = cellModelCell.getSonType(ii);
 253                 const CellModel& faceModel=CellModel::GetCellModel(faceType);
 254                 assert(faceModel.getDimension() == 2);
 255                 faceNodes=new int[faceModel.getNumberOfNodes()];
 256                 cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,cellNodes,faceNodes);
 257               }
 258             // intersect a son with the unit tetra
 259             switch(faceType)
 260               {
 261               case NORM_TRI3:
 262                 {
 263                   // create the face key
 264                   TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1], faceNodes[2]);
 265
 266                   // calculate the triangle if needed
 267                   if(_volumes.find(key) == _volumes.end())
 268                     {
 269                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1]], _nodes[faceNodes[2]]);
 270                       calculateVolume(tri, key);
 271                       totalVolume += _volumes[key];
 272                       if ( baryCentre )
 273                         baryCalculator.addSide( tri );
 274                     } else {
 275                       // count negative as face has reversed orientation
 276                       totalVolume -= _volumes[key];
 277                     }
 278                 }
 279                 break;
 280
 281               case NORM_QUAD4:
 282
 283                 // simple triangulation of faces along a diagonal :
 284                 //
 285                 // 2 ------ 3
 286                 // |      / |
 287                 // |     /  |
 288                 // |    /   |
 289                 // |   /    |
 290                 // |  /     |
 291                 // | /      |
 292                 // 1 ------ 4
 293                 //
 294                 //? not sure if this always works
 295                 {
 296                   // calculate the triangles if needed
 297
 298                   // local nodes 1, 2, 3
 299                   TriangleFaceKey key1 = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1], faceNodes[2]);
 300                   if(_volumes.find(key1) == _volumes.end())
 301                     {
 302                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1]], _nodes[faceNodes[2]]);
 303                       calculateVolume(tri, key1);
 304                       totalVolume += _volumes[key1];
 305                     } else {
 306                       // count negative as face has reversed orientation
 307                       totalVolume -= _volumes[key1];
 308                     }
 309
 310                   // local nodes 1, 3, 4
 311                   TriangleFaceKey key2 = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[2], faceNodes[3]);
 312                   if(_volumes.find(key2) == _volumes.end())
 313                     {
 314                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[2]], _nodes[faceNodes[3]]);
 315                       calculateVolume(tri, key2);
 316                       totalVolume += _volumes[key2];
 317                     }
 318                   else
 319                     {
 320                       // count negative as face has reversed orientation
 321                       totalVolume -= _volumes[key2];
 322                     }
 323                 }
 324                 break;
 325
 326               case NORM_POLYGON:
 327                 {
 328                   int nbTria = nbFaceNodes - 2; // split polygon into nbTria triangles
 329                   for ( int iTri = 0; iTri < nbTria; ++iTri )
 330                     {
 331                       TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1+iTri], faceNodes[2+iTri]);
 332                       if(_volumes.find(key) == _volumes.end())
 333                         {
 334                           TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1+iTri]], _nodes[faceNodes[2+iTri]]);
 335                           calculateVolume(tri, key);
 336                           totalVolume += _volumes[key];
 337                         }
 338                       else
 339                         {
 340                           totalVolume -= _volumes[key];
 341                         }
 342                     }
 343                 }
 344                 break;
 345
 346               default:
 347                 std::cout << "+++ Error : Only elements with triangular and quadratilateral faces are supported at the moment." << std::endl;
 348                 assert(false);
 349               }
 350             delete [] faceNodes;
 351           }
 352
 353         if ( baryCentre ) {
 354           baryCalculator.getBary( baryCentre );
 355           _t->reverseApply( baryCentre, baryCentre );
 356         }
 357       }
 358     delete [] cellNodes;
 359     // reset if it is very small to keep the matrix sparse
 360     // is this a good idea?
 361     if(epsilonEqual(totalVolume, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
 362       {
 363         totalVolume = 0.0;
 364       }
 365
 366     LOG(2, "Volume = " << totalVolume << ", det= " << _t->determinant());
 367
 368     // NB : fault in article, Grandy, [8] : it is the determinant of the inverse transformation
 369     // that should be used (which is equivalent to dividing by the determinant)
 370     return std::fabs(1.0 / _t->determinant() * totalVolume) ;
 371   }
 372
 373   /**
 374    * Calculates the intersection surface of two coplanar triangles.
 375    *
 376    * @param palneNormal normal of the plane for the first triangle
 377    * @param planeConstant constant of the equation of the plane for the first triangle
 378    * @param p1 coordinates of the first  node of the first  triangle
 379    * @param p2 coordinates of the second node of the first  triangle
 380    * @param p3 coordinates of the third  node of the first  triangle
 381    * @param p4 coordinates of the first  node of the second triangle
 382    * @param p5 coordinates of the second node of the second triangle
 383    * @param p6 coordinates of the third  node of the second triangle
 384    * @param dimCaracteristic characteristic size of the meshes containing the triangles
 385    * @param precision precision for double float data used for comparison
 386    */
 387   template<class MyMeshType>
 388   double SplitterTetra<MyMeshType>::CalculateIntersectionSurfaceOfCoplanarTriangles(const double *const planeNormal,
 389                                                                                     const double planeConstant,
 390                                                                                     const double *const p1, const double *const p2, const double *const p3,
 391                                                                                     const double *const p4, const double *const p5, const double *const p6,
 392                                                                                     const double dimCaracteristic, const double precision)
 393   {
 394     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
 395     typedef double Vect2[2];
 396     typedef double Vect3[3];
 397     typedef double Triangle2[3][2];
 398
 399     const double *const tri0[3] = {p1, p2, p3};
 400     const double *const tri1[3] = {p4, p5, p6};
 401
 402     // Plane of the first triangle defined by the normal of the triangle and the constant
 403     // Project triangles onto coordinate plane most aligned with plane normal
 404     int maxNormal = 0;
 405     double fmax = std::abs(planeNormal[0]);
 406     double absMax = std::abs(planeNormal[1]);
 407     if (absMax > fmax)
 408       {
 409         maxNormal = 1;
 410         fmax = absMax;
 411       }
 412     absMax = std::abs(planeNormal[2]);
 413     if (absMax > fmax)
 414       {
 415         maxNormal = 2;
 416       }
 417
 418     Triangle2 projTri0, projTri1;
 419     int i;
 420
 421     if (maxNormal == 0)
 422       {
 423         // Project onto yz-plane.
 424         for (i = 0; i < 3; ++i)
 425           {
 426             projTri0[i][0] = tri0[i][1];
 427             projTri0[i][1] = tri0[i][2];
 428             projTri1[i][0] = tri1[i][1];
 429             projTri1[i][1] = tri1[i][2];
 430           }
 431       }
 432     else if (maxNormal == 1)
 433       {
 434         // Project onto xz-plane.
 435         for (i = 0; i < 3; ++i)
 436           {
 437             projTri0[i][0] = tri0[i][0];
 438             projTri0[i][1] = tri0[i][2];
 439             projTri1[i][0] = tri1[i][0];
 440             projTri1[i][1] = tri1[i][2];
 441           }
 442       }
 443     else
 444       {
 445         // Project onto xy-plane.
 446         for (i = 0; i < 3; ++i)
 447           {
 448             projTri0[i][0] = tri0[i][0];
 449             projTri0[i][1] = tri0[i][1];
 450             projTri1[i][0] = tri1[i][0];
 451             projTri1[i][1] = tri1[i][1];
 452           }
 453       }
 454
 455     // 2D triangle intersection routines require counterclockwise ordering.
 456     Vect2 save;
 457     Vect2 edge0;
 458     Vect2 edge1;
 459     for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 460       {
 461         edge0[ii] = projTri0[1][ii] - projTri0[0][ii];
 462         edge1[ii] = projTri0[2][ii] - projTri0[0][ii];
 463       }
 464     if ((edge0[0] * edge1[1] - edge0[1] * edge1[0]) < (double) 0.)
 465       {
 466         // Triangle is clockwise, reorder it.
 467         for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 468           {
 469             save[ii] = projTri0[1][ii];
 470             projTri0[1][ii] = projTri0[2][ii];
 471             projTri0[2][ii] = save[ii];
 472           }
 473       }
 474
 475     for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 476       {
 477         edge0[ii] = projTri1[1][ii] - projTri1[0][ii];
 478         edge1[ii] = projTri1[2][ii] - projTri1[0][ii];
 479       }
 480     if ((edge0[0] * edge1[1] - edge0[1] * edge1[0]) < (double) 0.)
 481       {
 482         // Triangle is clockwise, reorder it.
 483       for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 484         {
 485           save[ii] = projTri1[1][ii];
 486           projTri1[1][ii] = projTri1[2][ii];
 487           projTri1[2][ii] = save[ii];
 488         }
 489       }
 490
 491     std::vector<double> inter2;
 492     intersec_de_triangle(projTri0[0], projTri0[1], projTri0[2],
 493                          projTri1[0], projTri1[1], projTri1[2],
 494                          inter2,
 495                          dimCaracteristic, precision);
 496     ConnType nb_inter=((ConnType)inter2.size())/2;
 497     double surface = 0.;
 498     if(nb_inter >3) inter2=reconstruct_polygon(inter2);
 499     if (nb_inter > 0)
 500       {
 501         std::vector<double> inter3;
 502         inter3.resize(3 * nb_inter);
 503         // Map 2D intersections back to the 3D triangle space.
 504         if (maxNormal == 0)
 505           {
 506             double invNX = ((double) 1.) / planeNormal[0];
 507             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
 508               {
 509                 inter3[3 * i + 1] = inter2[2 * i];
 510                 inter3[3 * i + 2] = inter2[2 * i + 1];
 511                 inter3[3 * i] = invNX * (planeConstant - planeNormal[1] * inter3[3 * i + 1] - planeNormal[2] * inter3[3 * i + 2]);
 512               }
 513           }
 514         else if (maxNormal == 1)
 515           {
 516             double invNY = ((double) 1.) / planeNormal[1];
 517             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
 518               {
 519                 inter3[3 * i] = inter2[2 * i];
 520                 inter3[3 * i + 2] = inter2[2 * i + 1];
 521                 inter3[3 * i + 1] = invNY * (planeConstant - planeNormal[0] * inter3[3 * i] - planeNormal[2] * inter3[3 * i + 2]);
 522               }
 523           }
 524         else
 525           {
 526             double invNZ = ((double) 1.) / planeNormal[2];
 527             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
 528               {
 529                 inter3[3 * i] = inter2[2 * i];
 530                 inter3[3 * i + 1] = inter2[2 * i + 1];
 531                 inter3[3 * i + 2] = invNZ * (planeConstant - planeNormal[0] * inter3[3 * i] - planeNormal[1] * inter3[3 * i + 1]);
 532               }
 533           }
 534         surface = polygon_area<3>(inter3);
 535       }
 536     return surface;
 537   }
 538
 539   /**
 540    * Determine if a face is coplanar with a triangle.
 541    * The first face is characterized by the equation of her plane
 542    *
 543    * @param palneNormal normal of the plane for the first triangle
 544    * @param planeConstant constant of the equation of the plane for the first triangle
 545    * @param coordsFace coordinates of the triangle face
 546    * @param precision precision for double float data used for comparison
 547    */
 548   template<class MyMeshType>
 549   bool SplitterTetra<MyMeshType>::IsFacesCoplanar(const double *const planeNormal,
 550                                                   const double planeConstant,
 551                                                   const double *const *const coordsFace,
 552                                                   const double precision)
 553   {
 554       // Compute the signed distances of triangle vertices to the plane. Use an epsilon-thick plane test.
 555       // For faces not left
 556       int counter = 0;
 557       for (int i = 0; i < 3; ++i)
 558         {
 559           const double distance = dot(planeNormal, coordsFace[i]) - planeConstant;
 560           if (epsilonEqual(distance, precision))
 561             {
 562               counter++;
 563             }
 564         }
 565       return counter == 3;
 566   }
 567
 568   /**
 569    * Calculates the surface of intersection of a polygon face in the source mesh and a cell of the target mesh.
 570    * It first calculates the transformation that takes the target tetrahedron into the unit tetrahedron. After that, the
 571    * faces of the source element are triangulated and the calculated transformation is applied
 572    * to each triangle.
 573    * The algorithm is based on the algorithm of Grandy used in intersectSourceCell to compute
 574    * the volume of intersection of two cell elements.
 575    * The case with a source face colinear to one of the face of tetrahedrons is taking into account:
 576    * the contribution of the face must not be counted two times.
 577    *
 578    * The class will cache the intermediary calculations of transformed nodes of source faces and surfaces associated
 579    * with triangulated faces to avoid having to recalculate these.
 580    *
 581    * @param polyType type of the polygon source face
 582    * @param polyNodesNbr number of the nodes of the polygon source face
 583    * @param polyNodes numbers of the nodes of the polygon source face
 584    * @param polyCoords coordinates of the nodes of the polygon source face
 585    * @param dimCaracteristic characteristic size of the meshes containing the triangles
 586    * @param precision precision for double float data used for comparison
 587    * @param listOfTetraFacesTreated list of tetra faces treated
 588    * @param listOfTetraFacesColinear list of tetra faces colinear with the polygon source faces
 589    */
 590   template<class MyMeshType>
 591   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectSourceFace(const NormalizedCellType polyType,
 592                                                         const int polyNodesNbr,
 593                                                         const int *const polyNodes,
 594                                                         const double *const *const polyCoords,
 595                                                         const double dimCaracteristic,
 596                                                         const double precision,
 597                                                         std::multiset<TriangleFaceKey>& listOfTetraFacesTreated,
 598                                                         std::set<TriangleFaceKey>& listOfTetraFacesColinear)
 599   {
 600     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
 601
 602     double totalSurface = 0.0;
 603
 604     // check if we have planar tetra element
 605     if(_t->determinant() == 0.0)
 606       {
 607         // tetra is planar
 608         LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
 609         return 0.0;
 610       }
 611
 612     // halfspace filtering
 613     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 614     bool isStrictlyOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 615     bool isTargetStrictlyOutside = false;
 616     bool isTargetOutside = false;
 617
 618     // calculate the coordinates of the nodes
 619     for(int i = 0;i<(int)polyNodesNbr;++i)
 620       {
 621         const int globalNodeNum = polyNodes[i];
 622         if(_nodes.find(globalNodeNum) == _nodes.end())
 623           {
 624             calculateNode2(globalNodeNum, polyCoords[i]);
 625           }
 626
 627         CheckIsStrictlyOutside(_nodes[globalNodeNum], isStrictlyOutside, precision);
 628         CheckIsOutside(_nodes[globalNodeNum], isOutside, precision);
 629       }
 630
 631     // halfspace filtering check
 632     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
 633     for(int i = 0; i < 8; ++i)
 634       {
 635         if(isStrictlyOutside[i])
 636           {
 637             isTargetStrictlyOutside = true;
 638             break;
 639           }
 640         else if (isOutside[i])
 641           {
 642             isTargetOutside = true;
 643           }
 644       }
 645
 646     if (!isTargetStrictlyOutside)
 647       {
 648
 649         if (isTargetOutside)
 650           {
 651             // Faces are parallel
 652             const int tetraFacesNodesConn[4][3] = {
 653                 { 0, 1, 2 },
 654                 { 0, 2, 3 },
 655                 { 0, 3, 1 },
 656                 { 1, 2, 3 } };
 657             double planeNormal[3];
 658             for (int iTetraFace = 0; iTetraFace < 4; ++iTetraFace)
 659               {
 660                 const int * const tetraFaceNodesConn = tetraFacesNodesConn[iTetraFace];
 661                 TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(_conn[tetraFaceNodesConn[0]],
 662                                                       _conn[tetraFaceNodesConn[1]],
 663                                                       _conn[tetraFaceNodesConn[2]]);
 664                 if (listOfTetraFacesTreated.find(key) == listOfTetraFacesTreated.end())
 665                   {
 666                     const double * const coordsTetraTriNode1 = _coords + tetraFaceNodesConn[0] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
 667                     const double * const coordsTetraTriNode2 = _coords + tetraFaceNodesConn[1] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
 668                     const double * const coordsTetraTriNode3 = _coords + tetraFaceNodesConn[2] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
 669                     calculateNormalForTria(coordsTetraTriNode1, coordsTetraTriNode2, coordsTetraTriNode3, planeNormal);
 670                     const double normOfTetraTriNormal = norm(planeNormal);
 671                     if (epsilonEqual(normOfTetraTriNormal, 0.))
 672                       {
 673                         for (int i = 0; i < 3; ++i)
 674                           {
 675                             planeNormal[i] = 0.;
 676                           }
 677                       }
 678                     else
 679                       {
 680                         const double invNormOfTetraTriNormal = 1. / normOfTetraTriNormal;
 681                         for (int i = 0; i < 3; ++i)
 682                           {
 683                             planeNormal[i] *= invNormOfTetraTriNormal;
 684                           }
 685                       }
 686                     double planeConstant = dot(planeNormal, coordsTetraTriNode1);
 687                     if (IsFacesCoplanar(planeNormal, planeConstant, polyCoords, precision))
 688                       {
 689                         int nbrPolyTri = polyNodesNbr - 2; // split polygon into nbrPolyTri triangles
 690                         for (int iTri = 0; iTri < nbrPolyTri; ++iTri)
 691                           {
 692                             double volume = CalculateIntersectionSurfaceOfCoplanarTriangles(planeNormal,
 693                                                                                             planeConstant,
 694                                                                                             polyCoords[0],
 695                                                                                             polyCoords[1 + iTri],
 696                                                                                             polyCoords[2 + iTri],
 697                                                                                             coordsTetraTriNode1,
 698                                                                                             coordsTetraTriNode2,
 699                                                                                             coordsTetraTriNode3,
 700                                                                                             dimCaracteristic,
 701                                                                                             precision);
 702                             if (!epsilonEqual(volume, 0.))
 703                               {
 704                                 totalSurface += volume;
 705                                 listOfTetraFacesColinear.insert(key);
 706                               }
 707                           }
 708                       }
 709                   }
 710                 listOfTetraFacesTreated.insert(key);
 711               }
 712           }
 713         else
 714           {
 715               // intersect a son with the unit tetra
 716               switch (polyType)
 717                 {
 718                 case NORM_TRI3:
 719                   {
 720                     // create the face key
 721                     TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1], polyNodes[2]);
 722
 723                     // calculate the triangle if needed
 724                     if (_volumes.find(key) == _volumes.end())
 725                       {
 726                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1]], _nodes[polyNodes[2]]);
 727                         calculateSurface(tri, key);
 728                         totalSurface += _volumes[key];
 729                       }
 730                     else
 731                       {
 732                         // count negative as face has reversed orientation
 733                         totalSurface -= _volumes[key];
 734                       }
 735                   }
 736                   break;
 737
 738                 case NORM_QUAD4:
 739
 740                   // simple triangulation of faces along a diagonal :
 741                   //
 742                   // 2 ------ 3
 743                   // |      / |
 744                   // |     /  |
 745                   // |    /   |
 746                   // |   /    |
 747                   // |  /     |
 748                   // | /      |
 749                   // 1 ------ 4
 750                   //
 751                   //? not sure if this always works
 752                   {
 753                     // calculate the triangles if needed
 754
 755                     // local nodes 1, 2, 3
 756                     TriangleFaceKey key1 = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1], polyNodes[2]);
 757                     if (_volumes.find(key1) == _volumes.end())
 758                       {
 759                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1]], _nodes[polyNodes[2]]);
 760                         calculateSurface(tri, key1);
 761                         totalSurface += _volumes[key1];
 762                       }
 763                     else
 764                       {
 765                         // count negative as face has reversed orientation
 766                         totalSurface -= _volumes[key1];
 767                       }
 768
 769                     // local nodes 1, 3, 4
 770                     TriangleFaceKey key2 = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[2], polyNodes[3]);
 771                     if (_volumes.find(key2) == _volumes.end())
 772                       {
 773                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[2]], _nodes[polyNodes[3]]);
 774                         calculateSurface(tri, key2);
 775                         totalSurface += _volumes[key2];
 776                       }
 777                     else
 778                       {
 779                         // count negative as face has reversed orientation
 780                         totalSurface -= _volumes[key2];
 781                       }
 782                   }
 783                   break;
 784
 785                 case NORM_POLYGON:
 786                   {
 787                     int nbrPolyTri = polyNodesNbr - 2; // split polygon into nbrPolyTri triangles
 788                     for (int iTri = 0; iTri < nbrPolyTri; ++iTri)
 789                       {
 790                         TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1 + iTri], polyNodes[2 + iTri]);
 791                         if (_volumes.find(key) == _volumes.end())
 792                           {
 793                             TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1 + iTri]],
 794                                 _nodes[polyNodes[2 + iTri]]);
 795                             calculateSurface(tri, key);
 796                             totalSurface += _volumes[key];
 797                           }
 798                         else
 799                           {
 800                             totalSurface -= _volumes[key];
 801                           }
 802                       }
 803                   }
 804                   break;
 805
 806                 default:
 807                   std::cout
 808                       << "+++ Error : Only elements with triangular and quadratilateral faces are supported at the moment."
 809                       << std::endl;
 810                   assert(false);
 811                 }
 812
 813           }
 814       }
 815
 816     // reset if it is very small to keep the matrix sparse
 817     // is this a good idea?
 818     if(epsilonEqual(totalSurface, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
 819       {
 820         totalSurface = 0.0;
 821       }
 822
 823     LOG(2, "Volume = " << totalSurface << ", det= " << _t->determinant());
 824
 825     return totalSurface;
 826   }
 827
 828   /**
 829    * Calculates the volume of intersection of this tetrahedron with another one.
 830    */
 831   template<class MyMeshType>
 832   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectTetra(const double** tetraCorners)
 833   {
 834     //{ could be done on outside?
 835     // check if we have planar tetra element
 836     if(_t->determinant() == 0.0)
 837     {
 838       // tetra is planar
 839       LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
 840       return 0.0;
 841     }
 842
 843     const unsigned nbOfNodes4Type=4;
 844     // halfspace filtering
 845     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 846     bool isTargetOutside = false;
 847
 848     // calculate the transformed coordinates of the nodes
 849     double nodes[nbOfNodes4Type][3];
 850     for(int i = 0;i<(int)nbOfNodes4Type;++i)
 851     {
 852       _t->apply(nodes[i], tetraCorners[i]);
 853       CheckIsOutside(nodes[i], isOutside);
 854     }
 855
 856     // halfspace filtering check
 857     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
 858     for(int i = 0; i < 8; ++i)
 859     {
 860       if(isOutside[i])
 861       {
 862         isTargetOutside = true;
 863       }
 864     }
 865
 866     double totalVolume = 0.0;
 867
 868     if(!isTargetOutside)
 869     {
 870       const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(NORM_TETRA4);
 871       int cellNodes[4] = { 0, 1, 2, 3 }, faceNodes[3];
 872
 873       for(unsigned ii = 0 ; ii < 4 ; ++ii)
 874       {
 875         cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,cellNodes,faceNodes);
 876
 877         TransformedTriangle tri(nodes[faceNodes[0]], nodes[faceNodes[1]], nodes[faceNodes[2]]);
 878         double vol = tri.calculateIntersectionVolume();
 879         totalVolume += vol;
 880       }
 881
 882       // reset if it is very small to keep the matrix sparse
 883       // is this a good idea?
 884       if(epsilonEqual(totalVolume, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
 885       {
 886         totalVolume = 0.0;
 887       }
 888     }
 889     LOG(2, "Volume = " << totalVolume << ", det= " << _t->determinant());
 890
 891     // NB : fault in article, Grandy, [8] : it is the determinant of the inverse transformation
 892     // that should be used (which is equivalent to dividing by the determinant)
 893     return std::fabs(1.0 / _t->determinant() * totalVolume) ;
 894   }
 895
 896   ////////////////////////////////////////////////////////
 897
 898   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 899   SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::SplitterTetra2(const MyMeshTypeT& targetMesh, const MyMeshTypeS& srcMesh, SplittingPolicy policy)
 900     :_target_mesh(targetMesh),_src_mesh(srcMesh),_splitting_pol(policy)
 901   {
 902   }
 903
 904   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 905   SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::~SplitterTetra2()
 906   {
 907     releaseArrays();
 908   }
 909
 910   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 911   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::releaseArrays()
 912   {
 913     // free potential sub-mesh nodes that have been allocated
 914     typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT = _node_ids.size();// Issue 0020634.
 915     if((int)_nodes.size()>=/*8*/nbOfNodesT)
 916       {
 917         std::vector<const double*>::iterator iter = _nodes.begin() + /*8*/nbOfNodesT;
 918         while(iter != _nodes.end())
 919           {
 920             delete[] *iter;
 921             ++iter;
 922           }
 923       }
 924     _nodes.clear();
 925   }
 926
 927   /*!
 928    * \param [in] targetCell in C mode.
 929    * \param [out] tetra is the output result tetra containers.
 930    */
 931   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 932   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitTargetCell2(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
 933   {
 934     const int *refConn(_target_mesh.getConnectivityPtr());
 935     const int *cellConn(refConn+_target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[targetCell]);
 936     INTERP_KERNEL::NormalizedCellType gt(_target_mesh.getTypeOfElement(targetCell));
 937     std::vector<int> tetrasNodalConn;
 938     std::vector<double> addCoords;
 939     const double *coords(_target_mesh.getCoordinatesPtr());
 940     SplitIntoTetras(_splitting_pol,gt,cellConn,refConn+_target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[targetCell+1],coords,tetrasNodalConn,addCoords);
 941     std::size_t nbTetras(tetrasNodalConn.size()/4); tetra.resize(nbTetras);
 942     double tmp[12];
 943     int tmp2[4];
 944     for(std::size_t i=0;i<nbTetras;i++)
 945       {
 946         for(int j=0;j<4;j++)
 947           {
 948             int cellId(tetrasNodalConn[4*i+j]);
 949             tmp2[j]=cellId;
 950             if(cellId>=0)
 951               {
 952                 tmp[j*3+0]=coords[3*cellId+0];
 953                 tmp[j*3+1]=coords[3*cellId+1];
 954                 tmp[j*3+2]=coords[3*cellId+2];
 955               }
 956             else
 957               {
 958                 tmp[j*3+0]=addCoords[3*(-cellId-1)+0];
 959                 tmp[j*3+1]=addCoords[3*(-cellId-1)+1];
 960                 tmp[j*3+2]=addCoords[3*(-cellId-1)+2];
 961               }
 962           }
 963         tetra[i]=new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh,tmp,tmp2);
 964       }
 965   }
 966
 967   /*!
 968    * @param targetCell in C mode.
 969    * @param tetra is the output result tetra containers.
 970    */
 971   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 972   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitTargetCell(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell,
 973                                                                  typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT,
 974                                                                  typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
 975   {
 976     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType ConnType;
 977     const NumberingPolicy numPol=MyMeshTypeT::My_numPol;
 978     const int numTetra = static_cast<int>(_splitting_pol);
 979     if(nbOfNodesT==4)
 980       {
 981         _nodes.resize(8);
 982         _node_ids.resize(8);
 983         tetra.reserve(1);
 984         const double *nodes[4];
 985         int conn[4];
 986         for(int node = 0; node < 4 ; ++node)
 987           {
 988             nodes[node]=getCoordsOfNode2(node, OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell),_target_mesh,conn[node]);
 989           }
 990         std::copy(conn,conn+4,_node_ids.begin());
 991         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
 992         tetra.push_back(t);
 993         return ;
 994       }
 995     // Issue 0020634. To pass nbOfNodesT to calculateSubNodes (don't want to add an arg)
 996     _node_ids.resize(nbOfNodesT);
 997
 998     // pre-calculate nodes
 999     calculateSubNodes(_target_mesh, OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell));
1000
1001     tetra.reserve(numTetra);
1002     _nodes.reserve(30); // we never have more than this
1003
1004     switch ( nbOfNodesT )
1005       {
1006       case 8:
1007         {
1008           switch(_splitting_pol)
1009             {
1010             case PLANAR_FACE_5:
1011               {
1012                 const int subZone[8] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 };
1013                 fiveSplit(subZone,tetra);
1014               }
1015               break;
1016
1017             case PLANAR_FACE_6:
1018               {
1019                 const int subZone[8] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 };
1020                 sixSplit(subZone,tetra);
1021               }
1022               break;
1023
1024             case GENERAL_24:
1025               {
1026                 calculateGeneral24Tetra(tetra);
1027               }
1028               break;
1029
1030             case GENERAL_48:
1031               {
1032                 calculateGeneral48Tetra(tetra);
1033               }
1034               break;
1035             default:
1036               assert(false);
1037             }
1038           break;
1039         }
1040       case 5:
1041         {
1042           splitPyram5(tetra);
1043           break;
1044         }
1045       default:
1046         {
1047           splitConvex(targetCell, tetra);
1048         }
1049       }
1050   }
1051
1052   /**
1053    * Splits the hexahedron into five tetrahedra.
1054    * This method adds five SplitterTetra objects to the vector tetra.
1055    *
1056    * @param subZone  the local node numbers corresponding to the hexahedron corners - these are mapped onto {0,..,7}. Providing this allows the
1057    *                 splitting to be reused on the subzones of the GENERAL_* types of splitting
1058    */
1059   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1060   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::fiveSplit(const int* const subZone, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1061   {
1062     // create tetrahedra
1063     for(int i = 0; i < 5; ++i)
1064       {
1065         const double* nodes[4];
1066         int conn[4];
1067         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1068           {
1069             conn[j] = subZone[ SPLIT_NODES_5[4*i+j] ];
1070             nodes[j] = getCoordsOfSubNode(conn[j]);
1071           }
1072         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1073         tetra.push_back(t);
1074       }
1075   }
1076
1077   /**
1078    * Splits the hexahedron into six tetrahedra.
1079    * This method adds six SplitterTetra objects to the vector tetra.
1080    *
1081    * @param subZone  the local node numbers corresponding to the hexahedron corners - these are mapped onto {0,..,7}. Providing this allows the
1082    *                 splitting to be reused on the subzones of the GENERAL_* types of splitting
1083    */
1084   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1085   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::sixSplit(const int* const subZone, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1086   {
1087     for(int i = 0; i < 6; ++i)
1088       {
1089         const double* nodes[4];
1090         int conn[4];
1091         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1092           {
1093             conn[j] = subZone[SPLIT_NODES_6[4*i+j]];
1094             nodes[j] = getCoordsOfSubNode(conn[j]);
1095           }
1096         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1097         tetra.push_back(t);
1098       }
1099   }
1100
1101   /**
1102    * Splits the hexahedron into 24 tetrahedra.
1103    * The splitting is done by combining the barycenter of the tetrahedron, the barycenter of each face
1104    * and the nodes of each edge of the face. This creates 6 faces * 4 edges / face = 24 tetrahedra.
1105    * The submesh nodes introduced are the barycenters of the faces and the barycenter of the cell.
1106    *
1107    */
1108   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1109   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateGeneral24Tetra(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1110   {
1111     // The two nodes of the original mesh cell used in each tetrahedron.
1112     // The tetrahedra all have nodes (cellCenter, faceCenter, edgeNode1, edgeNode2)
1113     // For the correspondance of the nodes, see the GENERAL_48_SUB_NODES table in calculateSubNodes
1114
1115     // nodes to use for tetrahedron
1116     const double* nodes[4];
1117     int conn[4];
1118     // get the cell center
1119     conn[0] = 14;
1120     nodes[0] = getCoordsOfSubNode(conn[0]);
1121
1122     for(int faceCenterNode = 8; faceCenterNode < 14; ++faceCenterNode)
1123       {
1124         // get the face center
1125         conn[1] = faceCenterNode;
1126         nodes[1] = getCoordsOfSubNode(conn[1]);
1127         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1128           {
1129             const int row = 4*(faceCenterNode - 8) + j;
1130             conn[2] = TETRA_EDGES_GENERAL_24[2*row];
1131             conn[3] = TETRA_EDGES_GENERAL_24[2*row + 1];
1132             nodes[2] = getCoordsOfSubNode(conn[2]);
1133             nodes[3] = getCoordsOfSubNode(conn[3]);
1134
1135             SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes, conn);
1136             tetra.push_back(t);
1137           }
1138       }
1139   }
1140
1141
1142   /**
1143    * Splits the hexahedron into 48 tetrahedra.
1144    * The splitting is done by introducing the midpoints of all the edges
1145    * and the barycenter of the element as submesh nodes. The 8 hexahedral subzones thus defined
1146    * are then split into 6 tetrahedra each, as in Grandy, p. 449. The division of the subzones
1147    * is done by calling sixSplit().
1148    *
1149    */
1150   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1151   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateGeneral48Tetra(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1152   {
1153     for(int i = 0; i < 8; ++i)
1154       {
1155         sixSplit(GENERAL_48_SUBZONES+8*i,tetra);
1156       }
1157   }
1158
1159   /**
1160    * Splits the NORM_PYRA5 into 2 tetrahedra.
1161    */
1162   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1163   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitPyram5(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1164   {
1165     static const int SPLIT_PYPA5[2][4] =
1166       {
1167         {
1168           0, 1, 2, 4
1169         },
1170         {
1171           0, 2, 3, 4
1172         }
1173       };
1174
1175     // create tetrahedra
1176     const double* nodes[4];
1177     int conn[4];
1178     for(int i = 0; i < 2; ++i)
1179       {
1180         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1181           nodes[j] = getCoordsOfSubNode2(SPLIT_PYPA5[i][j],conn[j]);
1182         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1183         tetra.push_back(t);
1184       }
1185   }
1186
1187   /**
1188    * Splits a convex cell into tetrahedra.
1189    */
1190   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1191   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitConvex(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell,
1192                                                              typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1193   {
1194     // Each face of a cell is split into triangles and
1195     // each of triangles and a cell barycenter form a tetrahedron.
1196
1197     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType ConnType;
1198     const NumberingPolicy numPol=MyMeshTypeT::My_numPol;
1199
1200     // get type of cell and nb of cell nodes
1201     NormalizedCellType normCellType=_target_mesh.getTypeOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell));
1202     const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(normCellType);
1203     unsigned nbOfCellNodes=cellModelCell.isDynamic() ? _target_mesh.getNumberOfNodesOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell)) : cellModelCell.getNumberOfNodes();
1204
1205     // get nb of cell sons (faces)
1206     const ConnType* rawCellConn = _target_mesh.getConnectivityPtr() + OTT<ConnType,numPol>::conn2C( _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell ]);
1207     const int rawNbCellNodes = _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell+1 ] - _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell ];
1208     unsigned nbOfSons = cellModelCell.getNumberOfSons2(rawCellConn, rawNbCellNodes);
1209
1210     // indices of nodes of a son
1211     static std::vector<int> allNodeIndices; // == 0,1,2,...,nbOfCellNodes-1
1212     while ( allNodeIndices.size() < nbOfCellNodes )
1213       allNodeIndices.push_back( allNodeIndices.size() );
1214     std::vector<int> classicFaceNodes(4);
1215     int* faceNodes = cellModelCell.isDynamic() ? &allNodeIndices[0] : &classicFaceNodes[0];
1216
1217     // nodes of tetrahedron
1218     int conn[4];
1219     const double* nodes[4];
1220     nodes[3] = getCoordsOfSubNode2( nbOfCellNodes,conn[3]); // barycenter
1221
1222     for(unsigned ii = 0 ; ii < nbOfSons; ++ii)
1223       {
1224         // get indices of son's nodes: it's just next portion of allNodeIndices for polyhedron
1225         // and some of allNodeIndices accodring to cell model for a classsic cell
1226         unsigned nbFaceNodes = cellModelCell.getNumberOfNodesConstituentTheSon2(ii, rawCellConn, rawNbCellNodes);
1227         if ( normCellType != NORM_POLYHED )
1228           cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,&allNodeIndices[0],faceNodes);
1229
1230         int nbTetra = nbFaceNodes - 2; // split polygon into nbTetra triangles
1231
1232         // create tetrahedra
1233         for(int i = 0; i < nbTetra; ++i)
1234           {
1235             nodes[0] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[0],  conn[0]);
1236             nodes[1] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[1+i],conn[1]);
1237             nodes[2] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[2+i],conn[2]);
1238             SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1239             tetra.push_back(t);
1240           }
1241
1242         if ( normCellType == NORM_POLYHED )
1243           faceNodes += nbFaceNodes; // go to the next face
1244       }
1245   }
1246
1247   /**
1248    * Precalculates all the nodes.
1249    * Retrieves the mesh nodes and allocates the necessary sub-mesh
1250    * nodes according to the splitting policy used.
1251    * This method is meant to be called once by the constructor.
1252    *
1253    * @param targetMesh  the target mesh
1254    * @param targetCell  the global number of the cell that the object represents, in targetMesh mode.
1255    * @param policy      the splitting policy of the object
1256    *
1257    */
1258   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1259   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateSubNodes(const MyMeshTypeT& targetMesh, typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell)
1260   {
1261     // retrieve real mesh nodes
1262
1263     typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT = _node_ids.size();// Issue 0020634. _node_ids.resize(8);
1264     for(int node = 0; node < nbOfNodesT ; ++node)
1265       {
1266         // calculate only normal nodes
1267         _nodes.push_back(getCoordsOfNode2(node, targetCell, targetMesh,_node_ids[node]));
1268       }
1269
1270     switch ( nbOfNodesT )
1271       {
1272       case 8:
1273
1274         // create sub-mesh nodes if needed
1275         switch(_splitting_pol)
1276           {
1277           case GENERAL_24:
1278             {
1279               for(int i = 0; i < 7; ++i)
1280                 {
1281                   double* barycenter = new double[3];
1282                   calcBarycenter(4, barycenter, &GENERAL_24_SUB_NODES[4*i]);
1283                   _nodes.push_back(barycenter);
1284                 }
1285             }
1286             break;
1287
1288           case GENERAL_48:
1289             {
1290               for(int i = 0; i < 19; ++i)
1291                 {
1292                   double* barycenter = new double[3];
1293                   calcBarycenter(2, barycenter, &GENERAL_48_SUB_NODES[2*i]);
1294                   _nodes.push_back(barycenter);
1295                 }
1296             }
1297             break;
1298
1299           default:
1300             break;
1301           }
1302
1303       case 5: // NORM_PYRA5
1304         break;
1305
1306       default: // convex 3d cell
1307         {
1308           // add barycenter of a cell
1309           std::vector<int> allIndices(nbOfNodesT);
1310           for ( int i = 0; i < nbOfNodesT; ++i ) allIndices[i] = i;
1311           double* barycenter = new double[3];
1312           calcBarycenter(nbOfNodesT, barycenter, &allIndices[0]);
1313           _nodes.push_back(barycenter);
1314         }
1315       }
1316
1317   }
1318 }
1319
1320 #endif