src/INTERP_KERNEL/SplitterTetra.txx

   1 // Copyright (C) 2007-2013  CEA/DEN, EDF R&D
   2 //
   3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   5 // License as published by the Free Software Foundation; either
   6 // version 2.1 of the License.
   7 //
   8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
   9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  11 // Lesser General Public License for more details.
  12 //
  13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  16 //
  17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  18 //
  19 #ifndef __SPLITTERTETRA_TXX__
  20 #define __SPLITTERTETRA_TXX__
  21
  22 #include "SplitterTetra.hxx"
  23
  24 #include "TetraAffineTransform.hxx"
  25 #include "TransformedTriangle.hxx"
  26 #include "MeshUtils.hxx"
  27 #include "VectorUtils.hxx"
  28 #include "CellModel.hxx"
  29 #include "Log.hxx"
  30 #include "UnitTetraIntersectionBary.hxx"
  31 #include "VolSurfFormulae.hxx"
  32
  33 #include <cmath>
  34 #include <cassert>
  35 #include <string>
  36 #include <sstream>
  37 #include <vector>
  38
  39 namespace INTERP_KERNEL
  40 {
  41   /*!
  42    * output is expected to be allocated with 24*sizeof(void*) in order to store the 24 tetras.
  43    * These tetras have to be deallocated.
  44    */
  45   template<class MyMeshType>
  46   void SplitterTetra<MyMeshType>::splitIntoDualCells(SplitterTetra<MyMeshType> **output)
  47   {
  48     double tmp[12];
  49     const double *tmp2[4]={tmp,tmp+3,tmp+6,tmp+9};
  50     typename MyMeshType::MyConnType conn[4]={-1,-1,-1,-1};
  51     for(int i=0;i<24;i++)
  52       {
  53         splitMySelfForDual(tmp,i,conn[0]);
  54         output[i]=new SplitterTetra<MyMeshType>(_src_mesh,tmp2,conn);
  55       }
  56   }
  57
  58   /**
  59    * Constructor creating object from the four corners of the tetrahedron.
  60    *
  61    * @param srcMesh       mesh containing the source elements
  62    * @param tetraCorners  array of four pointers to double[3] arrays containing the coordinates of the
  63    *                      corners of the tetrahedron
  64    */
  65   template<class MyMeshType>
  66   SplitterTetra<MyMeshType>::SplitterTetra(const MyMeshType& srcMesh, const double** tetraCorners, const typename MyMeshType::MyConnType *nodesId)
  67     : _t(0), _src_mesh(srcMesh)
  68   {
  69     std::copy(nodesId,nodesId+4,_conn);
  70     _coords[0]=tetraCorners[0][0]; _coords[1]=tetraCorners[0][1]; _coords[2]=tetraCorners[0][2];
  71     _coords[3]=tetraCorners[1][0]; _coords[4]=tetraCorners[1][1]; _coords[5]=tetraCorners[1][2];
  72     _coords[6]=tetraCorners[2][0]; _coords[7]=tetraCorners[2][1]; _coords[8]=tetraCorners[2][2];
  73     _coords[9]=tetraCorners[3][0]; _coords[10]=tetraCorners[3][1]; _coords[11]=tetraCorners[3][2];
  74     // create the affine transform
  75     createAffineTransform(tetraCorners);
  76   }
  77
  78   /**
  79    * Destructor
  80    *
  81    * Deletes _t and the coordinates (double[3] vectors) in _nodes
  82    *
  83    */
  84   template<class MyMeshType>
  85   SplitterTetra<MyMeshType>::~SplitterTetra()
  86   {
  87     delete _t;
  88     for(HashMap< int, double* >::iterator iter = _nodes.begin(); iter != _nodes.end() ; ++iter)
  89       delete[] iter->second;
  90   }
  91
  92   /*!
  93    * \Forget already calculated triangles, which is crucial for calculation of barycenter of intersection
  94    */
  95   template<class MyMeshType>
  96   void SplitterTetra<MyMeshType>::clearVolumesCache()
  97   {
  98     _volumes.clear();
  99   }
 100
 101   /*!
 102    * This method destroys the 4 pointers pointed by tetraCorners[0],tetraCorners[1],tetraCorners[2] and tetraCorners[3]
 103    * @param i is in 0..23 included.
 104    * @param output is expected to be sized of 12 in order to.
 105    */
 106   template<class MyMeshType>
 107   void SplitterTetra<MyMeshType>::splitMySelfForDual(double* output, int i, typename MyMeshType::MyConnType& nodeId)
 108   {
 109     double *tmp[4];
 110     int offset=i/6;
 111     nodeId=_conn[offset];
 112     tmp[0]=_coords+3*offset; tmp[1]=_coords+((offset+1)%4)*3; tmp[2]=_coords+((offset+2)%4)*3; tmp[3]=_coords+((offset+3)%4)*3;
 113     int caseToTreat=i%6;
 114     int case1=caseToTreat/2;
 115     int case2=caseToTreat%2;
 116     const int tab[3][2]={{1,2},{3,2},{1,3}};
 117     const int *curTab=tab[case1];
 118     double pt0[3]; pt0[0]=(tmp[curTab[case2]][0]+tmp[0][0])/2.; pt0[1]=(tmp[curTab[case2]][1]+tmp[0][1])/2.; pt0[2]=(tmp[curTab[case2]][2]+tmp[0][2])/2.;
 119     double pt1[3]; pt1[0]=(tmp[0][0]+tmp[curTab[0]][0]+tmp[curTab[1]][0])/3.; pt1[1]=(tmp[0][1]+tmp[curTab[0]][1]+tmp[curTab[1]][1])/3.; pt1[2]=(tmp[0][2]+tmp[curTab[0]][2]+tmp[curTab[1]][2])/3.;
 120     double pt2[3]; pt2[0]=(tmp[0][0]+tmp[1][0]+tmp[2][0]+tmp[3][0])/4.; pt2[1]=(tmp[0][1]+tmp[1][1]+tmp[2][1]+tmp[3][1])/4.; pt2[2]=(tmp[0][2]+tmp[1][2]+tmp[2][2]+tmp[3][2])/4.;
 121     std::copy(pt1,pt1+3,output+case2*3);
 122     std::copy(pt0,pt0+3,output+(abs(case2-1))*3);
 123     std::copy(pt2,pt2+3,output+2*3);
 124     std::copy(tmp[0],tmp[0]+3,output+3*3);
 125   }
 126
 127   /**
 128    * Calculates the volume of intersection of an element in the source mesh and the target element.
 129    * It first calculates the transformation that takes the target tetrahedron into the unit tetrahedron. After that, the
 130    * faces of the source element are triangulated and the calculated transformation is applied
 131    * to each triangle. The algorithm of Grandy, implemented in INTERP_KERNEL::TransformedTriangle is used
 132    * to calculate the contribution to the volume from each triangle. The volume returned is the sum of these contributions
 133    * divided by the determinant of the transformation.
 134    *
 135    * The class will cache the intermediary calculations of transformed nodes of source cells and volumes associated
 136    * with triangulated faces to avoid having to recalculate these.
 137    *
 138    * @param element      global number of the source element in C mode.
 139    */
 140   template<class MyMeshType>
 141   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectSourceCell(typename MyMeshType::MyConnType element,
 142                                                         double*                         baryCentre)
 143   {
 144     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
 145     const NumberingPolicy numPol=MyMeshType::My_numPol;
 146     //{ could be done on outside?
 147     // check if we have planar tetra element
 148     if(_t->determinant() == 0.0)
 149       {
 150         // tetra is planar
 151         LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
 152         return 0.0;
 153       }
 154
 155     // get type of cell
 156     NormalizedCellType normCellType=_src_mesh.getTypeOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(element));
 157     const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(normCellType);
 158     unsigned nbOfNodes4Type=cellModelCell.isDynamic() ? _src_mesh.getNumberOfNodesOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(element)) : cellModelCell.getNumberOfNodes();
 159     // halfspace filtering
 160     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 161     bool isTargetOutside = false;
 162
 163     // calculate the coordinates of the nodes
 164     int *cellNodes=new int[nbOfNodes4Type];
 165     for(int i = 0;i<(int)nbOfNodes4Type;++i)
 166       {
 167         // we could store mapping local -> global numbers too, but not sure it is worth it
 168         const int globalNodeNum = getGlobalNumberOfNode(i, OTT<ConnType,numPol>::indFC(element), _src_mesh);
 169         cellNodes[i]=globalNodeNum;
 170         if(_nodes.find(globalNodeNum) == _nodes.end())
 171           {
 172             //for(HashMap< int , double* >::iterator iter3=_nodes.begin();iter3!=_nodes.end();iter3++)
 173             //  std::cout << (*iter3).first << " ";
 174             //std::cout << std::endl << "*** " << globalNodeNum << std::endl;
 175             calculateNode(globalNodeNum);
 176           }
 177
 178         checkIsOutside(_nodes[globalNodeNum], isOutside);
 179       }
 180
 181     // halfspace filtering check
 182     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
 183     for(int i = 0; i < 8; ++i)
 184       {
 185         if(isOutside[i])
 186           {
 187             isTargetOutside = true;
 188           }
 189       }
 190
 191     double totalVolume = 0.0;
 192
 193     if(!isTargetOutside)
 194       {
 195         /// calculator of intersection barycentre
 196         UnitTetraIntersectionBary baryCalculator( _t->determinant() < 0.);
 197
 198         // get nb of sons of a cell
 199         const ConnType* rawCellConn = _src_mesh.getConnectivityPtr() + OTT<ConnType,numPol>::conn2C( _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element ]);
 200         const int rawNbCellNodes = _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element+1 ] - _src_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ element ];
 201         unsigned nbOfSons = cellModelCell.getNumberOfSons2(rawCellConn, rawNbCellNodes);
 202
 203         for(unsigned ii = 0 ; ii < nbOfSons; ++ii)
 204           {
 205             // get sons connectivity
 206             NormalizedCellType faceType;
 207             int *faceNodes, nbFaceNodes=-1;
 208             if ( cellModelCell.isDynamic() )
 209               {
 210                 faceNodes=new int[nbOfNodes4Type];
 211                 nbFaceNodes = cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity2(ii,rawCellConn,rawNbCellNodes,faceNodes,faceType);
 212                 for ( int i = 0; i < nbFaceNodes; ++i )
 213                   faceNodes[i] = OTT<ConnType,numPol>::coo2C(faceNodes[i]);
 214               }
 215             else
 216               {
 217                 faceType = cellModelCell.getSonType(ii);
 218                 const CellModel& faceModel=CellModel::GetCellModel(faceType);
 219                 assert(faceModel.getDimension() == 2);
 220                 faceNodes=new int[faceModel.getNumberOfNodes()];
 221                 cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,cellNodes,faceNodes);
 222               }
 223             // intersect a son with the unit tetra
 224             switch(faceType)
 225               {
 226               case NORM_TRI3:
 227                 {
 228                   // create the face key
 229                   TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1], faceNodes[2]);
 230
 231                   // calculate the triangle if needed
 232                   if(_volumes.find(key) == _volumes.end())
 233                     {
 234                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1]], _nodes[faceNodes[2]]);
 235                       calculateVolume(tri, key);
 236                       totalVolume += _volumes[key];
 237                       if ( baryCentre )
 238                         baryCalculator.addSide( tri );
 239                     } else {
 240                       // count negative as face has reversed orientation
 241                       totalVolume -= _volumes[key];
 242                     }
 243                 }
 244                 break;
 245
 246               case NORM_QUAD4:
 247
 248                 // simple triangulation of faces along a diagonal :
 249                 //
 250                 // 2 ------ 3
 251                 // |      / |
 252                 // |     /  |
 253                 // |    /   |
 254                 // |   /    |
 255                 // |  /     |
 256                 // | /      |
 257                 // 1 ------ 4
 258                 //
 259                 //? not sure if this always works
 260                 {
 261                   // calculate the triangles if needed
 262
 263                   // local nodes 1, 2, 3
 264                   TriangleFaceKey key1 = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1], faceNodes[2]);
 265                   if(_volumes.find(key1) == _volumes.end())
 266                     {
 267                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1]], _nodes[faceNodes[2]]);
 268                       calculateVolume(tri, key1);
 269                       totalVolume += _volumes[key1];
 270                     } else {
 271                       // count negative as face has reversed orientation
 272                       totalVolume -= _volumes[key1];
 273                     }
 274
 275                   // local nodes 1, 3, 4
 276                   TriangleFaceKey key2 = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[2], faceNodes[3]);
 277                   if(_volumes.find(key2) == _volumes.end())
 278                     {
 279                       TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[2]], _nodes[faceNodes[3]]);
 280                       calculateVolume(tri, key2);
 281                       totalVolume += _volumes[key2];
 282                     }
 283                   else
 284                     {
 285                       // count negative as face has reversed orientation
 286                       totalVolume -= _volumes[key2];
 287                     }
 288                 }
 289                 break;
 290
 291               case NORM_POLYGON:
 292                 {
 293                   int nbTria = nbFaceNodes - 2; // split polygon into nbTria triangles
 294                   for ( int iTri = 0; iTri < nbTria; ++iTri )
 295                     {
 296                       TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(faceNodes[0], faceNodes[1+iTri], faceNodes[2+iTri]);
 297                       if(_volumes.find(key) == _volumes.end())
 298                         {
 299                           TransformedTriangle tri(_nodes[faceNodes[0]], _nodes[faceNodes[1+iTri]], _nodes[faceNodes[2+iTri]]);
 300                           calculateVolume(tri, key);
 301                           totalVolume += _volumes[key];
 302                         }
 303                       else
 304                         {
 305                           totalVolume -= _volumes[key];
 306                         }
 307                     }
 308                 }
 309                 break;
 310
 311               default:
 312                 std::cout << "+++ Error : Only elements with triangular and quadratilateral faces are supported at the moment." << std::endl;
 313                 assert(false);
 314               }
 315             delete [] faceNodes;
 316           }
 317
 318         if ( baryCentre ) {
 319           baryCalculator.getBary( baryCentre );
 320           _t->reverseApply( baryCentre, baryCentre );
 321         }
 322       }
 323     delete [] cellNodes;
 324     // reset if it is very small to keep the matrix sparse
 325     // is this a good idea?
 326     if(epsilonEqual(totalVolume, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
 327       {
 328         totalVolume = 0.0;
 329       }
 330
 331     LOG(2, "Volume = " << totalVolume << ", det= " << _t->determinant());
 332
 333     // NB : fault in article, Grandy, [8] : it is the determinant of the inverse transformation
 334     // that should be used (which is equivalent to dividing by the determinant)
 335     return std::fabs(1.0 / _t->determinant() * totalVolume) ;
 336   }
 337
 338   /**
 339    * Calculates the intersection surface of two coplanar triangles.
 340    *
 341    * @param palneNormal normal of the plane for the first triangle
 342    * @param planeConstant constant of the equation of the plane for the first triangle
 343    * @param p1 coordinates of the first  node of the first  triangle
 344    * @param p2 coordinates of the second node of the first  triangle
 345    * @param p3 coordinates of the third  node of the first  triangle
 346    * @param p4 coordinates of the first  node of the second triangle
 347    * @param p5 coordinates of the second node of the second triangle
 348    * @param p6 coordinates of the third  node of the second triangle
 349    * @param dimCaracteristic characteristic size of the meshes containing the triangles
 350    * @param precision precision for double float data used for comparison
 351    */
 352   template<class MyMeshType>
 353   double SplitterTetra<MyMeshType>::CalculateIntersectionSurfaceOfCoplanarTriangles(const double *const planeNormal,
 354                                                                                     const double planeConstant,
 355                                                                                     const double *const p1, const double *const p2, const double *const p3,
 356                                                                                     const double *const p4, const double *const p5, const double *const p6,
 357                                                                                     const double dimCaracteristic, const double precision)
 358   {
 359     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
 360     typedef double Vect2[2];
 361     typedef double Vect3[3];
 362     typedef double Triangle2[3][2];
 363
 364     const double *const tri0[3] = {p1, p2, p3};
 365     const double *const tri1[3] = {p4, p5, p6};
 366
 367     // Plane of the first triangle defined by the normal of the triangle and the constant
 368     // Project triangles onto coordinate plane most aligned with plane normal
 369     int maxNormal = 0;
 370     double fmax = std::abs(planeNormal[0]);
 371     double absMax = std::abs(planeNormal[1]);
 372     if (absMax > fmax)
 373       {
 374         maxNormal = 1;
 375         fmax = absMax;
 376       }
 377     absMax = std::abs(planeNormal[2]);
 378     if (absMax > fmax)
 379       {
 380         maxNormal = 2;
 381       }
 382
 383     Triangle2 projTri0, projTri1;
 384     int i;
 385
 386     if (maxNormal == 0)
 387       {
 388         // Project onto yz-plane.
 389         for (i = 0; i < 3; ++i)
 390           {
 391             projTri0[i][0] = tri0[i][1];
 392             projTri0[i][1] = tri0[i][2];
 393             projTri1[i][0] = tri1[i][1];
 394             projTri1[i][1] = tri1[i][2];
 395           }
 396       }
 397     else if (maxNormal == 1)
 398       {
 399         // Project onto xz-plane.
 400         for (i = 0; i < 3; ++i)
 401           {
 402             projTri0[i][0] = tri0[i][0];
 403             projTri0[i][1] = tri0[i][2];
 404             projTri1[i][0] = tri1[i][0];
 405             projTri1[i][1] = tri1[i][2];
 406           }
 407       }
 408     else
 409       {
 410         // Project onto xy-plane.
 411         for (i = 0; i < 3; ++i)
 412           {
 413             projTri0[i][0] = tri0[i][0];
 414             projTri0[i][1] = tri0[i][1];
 415             projTri1[i][0] = tri1[i][0];
 416             projTri1[i][1] = tri1[i][1];
 417           }
 418       }
 419
 420     // 2D triangle intersection routines require counterclockwise ordering.
 421     Vect2 save;
 422     Vect2 edge0;
 423     Vect2 edge1;
 424     for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 425       {
 426         edge0[ii] = projTri0[1][ii] - projTri0[0][ii];
 427         edge1[ii] = projTri0[2][ii] - projTri0[0][ii];
 428       }
 429     if ((edge0[0] * edge1[1] - edge0[1] * edge1[0]) < (double) 0.)
 430       {
 431         // Triangle is clockwise, reorder it.
 432         for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 433           {
 434             save[ii] = projTri0[1][ii];
 435             projTri0[1][ii] = projTri0[2][ii];
 436             projTri0[2][ii] = save[ii];
 437           }
 438       }
 439
 440     for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 441       {
 442         edge0[ii] = projTri1[1][ii] - projTri1[0][ii];
 443         edge1[ii] = projTri1[2][ii] - projTri1[0][ii];
 444       }
 445     if ((edge0[0] * edge1[1] - edge0[1] * edge1[0]) < (double) 0.)
 446       {
 447         // Triangle is clockwise, reorder it.
 448       for (int ii = 0; ii < 2; ++ii)
 449         {
 450           save[ii] = projTri1[1][ii];
 451           projTri1[1][ii] = projTri1[2][ii];
 452           projTri1[2][ii] = save[ii];
 453         }
 454       }
 455
 456     std::vector<double> inter2;
 457     intersec_de_triangle(projTri0[0], projTri0[1], projTri0[2],
 458                          projTri1[0], projTri1[1], projTri1[2],
 459                          inter2,
 460                          dimCaracteristic, precision);
 461     ConnType nb_inter=((ConnType)inter2.size())/2;
 462     double surface = 0.;
 463     if(nb_inter >3) inter2=reconstruct_polygon(inter2);
 464     if (nb_inter > 0)
 465       {
 466         std::vector<double> inter3;
 467         inter3.resize(3 * nb_inter);
 468         // Map 2D intersections back to the 3D triangle space.
 469         if (maxNormal == 0)
 470           {
 471             double invNX = ((double) 1.) / planeNormal[0];
 472             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
 473               {
 474                 inter3[3 * i + 1] = inter2[2 * i];
 475                 inter3[3 * i + 2] = inter2[2 * i + 1];
 476                 inter3[3 * i] = invNX * (planeConstant - planeNormal[1] * inter3[3 * i + 1] - planeNormal[2] * inter3[3 * i + 2]);
 477               }
 478           }
 479         else if (maxNormal == 1)
 480           {
 481             double invNY = ((double) 1.) / planeNormal[1];
 482             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
 483               {
 484                 inter3[3 * i] = inter2[2 * i];
 485                 inter3[3 * i + 2] = inter2[2 * i + 1];
 486                 inter3[3 * i + 1] = invNY * (planeConstant - planeNormal[0] * inter3[3 * i] - planeNormal[2] * inter3[3 * i + 2]);
 487               }
 488           }
 489         else
 490           {
 491             double invNZ = ((double) 1.) / planeNormal[2];
 492             for (i = 0; i < nb_inter; i++)
 493               {
 494                 inter3[3 * i] = inter2[2 * i];
 495                 inter3[3 * i + 1] = inter2[2 * i + 1];
 496                 inter3[3 * i + 2] = invNZ * (planeConstant - planeNormal[0] * inter3[3 * i] - planeNormal[1] * inter3[3 * i + 1]);
 497               }
 498           }
 499         surface = polygon_area<3>(inter3);
 500       }
 501     return surface;
 502   }
 503
 504   /**
 505    * Determine if a face is coplanar with a triangle.
 506    * The first face is characterized by the equation of her plane
 507    *
 508    * @param palneNormal normal of the plane for the first triangle
 509    * @param planeConstant constant of the equation of the plane for the first triangle
 510    * @param coordsFace coordinates of the triangle face
 511    * @param precision precision for double float data used for comparison
 512    */
 513   template<class MyMeshType>
 514   bool SplitterTetra<MyMeshType>::IsFacesCoplanar(const double *const planeNormal,
 515                                                   const double planeConstant,
 516                                                   const double *const *const coordsFace,
 517                                                   const double precision)
 518   {
 519       // Compute the signed distances of triangle vertices to the plane. Use an epsilon-thick plane test.
 520       // For faces not left
 521       int counter = 0;
 522       for (int i = 0; i < 3; ++i)
 523         {
 524           const double distance = dot(planeNormal, coordsFace[i]) - planeConstant;
 525           if (epsilonEqual(distance, precision))
 526             {
 527               counter++;
 528             }
 529         }
 530       return counter == 3;
 531   }
 532
 533   /**
 534    * Calculates the surface of intersection of a polygon face in the source mesh and a cell of the target mesh.
 535    * It first calculates the transformation that takes the target tetrahedron into the unit tetrahedron. After that, the
 536    * faces of the source element are triangulated and the calculated transformation is applied
 537    * to each triangle.
 538    * The algorithm is based on the algorithm of Grandy used in intersectSourceCell to compute
 539    * the volume of intersection of two cell elements.
 540    * The case with a source face colinear to one of the face of tetrahedrons is taking into account:
 541    * the contribution of the face must not be counted two times.
 542    *
 543    * The class will cache the intermediary calculations of transformed nodes of source faces and surfaces associated
 544    * with triangulated faces to avoid having to recalculate these.
 545    *
 546    * @param polyType type of the polygon source face
 547    * @param polyNodesNbr number of the nodes of the polygon source face
 548    * @param polyNodes numbers of the nodes of the polygon source face
 549    * @param polyCoords coordinates of the nodes of the polygon source face
 550    * @param polyCoords coordinates of the nodes of the polygon source face
 551    * @param dimCaracteristic characteristic size of the meshes containing the triangles
 552    * @param precision precision for double float data used for comparison
 553    * @param listOfTetraFacesTreated list of tetra faces treated
 554    * @param listOfTetraFacesColinear list of tetra faces colinear with the polygon source faces
 555    */
 556   template<class MyMeshType>
 557   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectSourceFace(const NormalizedCellType polyType,
 558                                                         const int polyNodesNbr,
 559                                                         const int *const polyNodes,
 560                                                         const double *const *const polyCoords,
 561                                                         const double dimCaracteristic,
 562                                                         const double precision,
 563                                                         std::multiset<TriangleFaceKey>& listOfTetraFacesTreated,
 564                                                         std::set<TriangleFaceKey>& listOfTetraFacesColinear)
 565   {
 566     typedef typename MyMeshType::MyConnType ConnType;
 567
 568     double totalSurface = 0.0;
 569
 570     // check if we have planar tetra element
 571     if(_t->determinant() == 0.0)
 572       {
 573         // tetra is planar
 574         LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
 575         return 0.0;
 576       }
 577
 578     // halfspace filtering
 579     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 580     bool isStrictlyOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 581     bool isTargetStrictlyOutside = false;
 582     bool isTargetOutside = false;
 583
 584     // calculate the coordinates of the nodes
 585     for(int i = 0;i<(int)polyNodesNbr;++i)
 586       {
 587         const int globalNodeNum = polyNodes[i];
 588         if(_nodes.find(globalNodeNum) == _nodes.end())
 589           {
 590             calculateNode2(globalNodeNum, polyCoords[i]);
 591           }
 592
 593         checkIsStrictlyOutside(_nodes[globalNodeNum], isStrictlyOutside, precision);
 594         checkIsOutside(_nodes[globalNodeNum], isOutside, precision);
 595       }
 596
 597     // halfspace filtering check
 598     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
 599     for(int i = 0; i < 8; ++i)
 600       {
 601         if(isStrictlyOutside[i])
 602           {
 603             isTargetStrictlyOutside = true;
 604             break;
 605           }
 606         else if (isOutside[i])
 607           {
 608             isTargetOutside = true;
 609           }
 610       }
 611
 612     if (!isTargetStrictlyOutside)
 613       {
 614
 615         if (isTargetOutside)
 616           {
 617             // Faces are parallel
 618             const int tetraFacesNodesConn[4][3] = {
 619                 { 0, 1, 2 },
 620                 { 0, 2, 3 },
 621                 { 0, 3, 1 },
 622                 { 1, 2, 3 } };
 623             double planeNormal[3];
 624             for (int iTetraFace = 0; iTetraFace < 4; ++iTetraFace)
 625               {
 626                 const int * const tetraFaceNodesConn = tetraFacesNodesConn[iTetraFace];
 627                 TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(_conn[tetraFaceNodesConn[0]],
 628                                                       _conn[tetraFaceNodesConn[1]],
 629                                                       _conn[tetraFaceNodesConn[2]]);
 630                 if (listOfTetraFacesTreated.find(key) == listOfTetraFacesTreated.end())
 631                   {
 632                     const double * const coordsTetraTriNode1 = _coords + tetraFaceNodesConn[0] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
 633                     const double * const coordsTetraTriNode2 = _coords + tetraFaceNodesConn[1] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
 634                     const double * const coordsTetraTriNode3 = _coords + tetraFaceNodesConn[2] * MyMeshType::MY_SPACEDIM;
 635                     calculateNormalForTria(coordsTetraTriNode1, coordsTetraTriNode2, coordsTetraTriNode3, planeNormal);
 636                     const double normOfTetraTriNormal = norm(planeNormal);
 637                     if (epsilonEqual(normOfTetraTriNormal, 0.))
 638                       {
 639                         for (int i = 0; i < 3; ++i)
 640                           {
 641                             planeNormal[i] = 0.;
 642                           }
 643                       }
 644                     else
 645                       {
 646                         const double invNormOfTetraTriNormal = 1. / normOfTetraTriNormal;
 647                         for (int i = 0; i < 3; ++i)
 648                           {
 649                             planeNormal[i] *= invNormOfTetraTriNormal;
 650                           }
 651                       }
 652                     double planeConstant = dot(planeNormal, coordsTetraTriNode1);
 653                     if (IsFacesCoplanar(planeNormal, planeConstant, polyCoords, precision))
 654                       {
 655                         int nbrPolyTri = polyNodesNbr - 2; // split polygon into nbrPolyTri triangles
 656                         for (int iTri = 0; iTri < nbrPolyTri; ++iTri)
 657                           {
 658                             double volume = CalculateIntersectionSurfaceOfCoplanarTriangles(planeNormal,
 659                                                                                             planeConstant,
 660                                                                                             polyCoords[0],
 661                                                                                             polyCoords[1 + iTri],
 662                                                                                             polyCoords[2 + iTri],
 663                                                                                             coordsTetraTriNode1,
 664                                                                                             coordsTetraTriNode2,
 665                                                                                             coordsTetraTriNode3,
 666                                                                                             dimCaracteristic,
 667                                                                                             precision);
 668                             if (!epsilonEqual(volume, 0.))
 669                               {
 670                                 totalSurface += volume;
 671                                 listOfTetraFacesColinear.insert(key);
 672                               }
 673                           }
 674                       }
 675                   }
 676                 listOfTetraFacesTreated.insert(key);
 677               }
 678           }
 679         else
 680           {
 681               // intersect a son with the unit tetra
 682               switch (polyType)
 683                 {
 684                 case NORM_TRI3:
 685                   {
 686                     // create the face key
 687                     TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1], polyNodes[2]);
 688
 689                     // calculate the triangle if needed
 690                     if (_volumes.find(key) == _volumes.end())
 691                       {
 692                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1]], _nodes[polyNodes[2]]);
 693                         calculateSurface(tri, key);
 694                         totalSurface += _volumes[key];
 695                       }
 696                     else
 697                       {
 698                         // count negative as face has reversed orientation
 699                         totalSurface -= _volumes[key];
 700                       }
 701                   }
 702                   break;
 703
 704                 case NORM_QUAD4:
 705
 706                   // simple triangulation of faces along a diagonal :
 707                   //
 708                   // 2 ------ 3
 709                   // |      / |
 710                   // |     /  |
 711                   // |    /   |
 712                   // |   /    |
 713                   // |  /     |
 714                   // | /      |
 715                   // 1 ------ 4
 716                   //
 717                   //? not sure if this always works
 718                   {
 719                     // calculate the triangles if needed
 720
 721                     // local nodes 1, 2, 3
 722                     TriangleFaceKey key1 = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1], polyNodes[2]);
 723                     if (_volumes.find(key1) == _volumes.end())
 724                       {
 725                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1]], _nodes[polyNodes[2]]);
 726                         calculateSurface(tri, key1);
 727                         totalSurface += _volumes[key1];
 728                       }
 729                     else
 730                       {
 731                         // count negative as face has reversed orientation
 732                         totalSurface -= _volumes[key1];
 733                       }
 734
 735                     // local nodes 1, 3, 4
 736                     TriangleFaceKey key2 = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[2], polyNodes[3]);
 737                     if (_volumes.find(key2) == _volumes.end())
 738                       {
 739                         TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[2]], _nodes[polyNodes[3]]);
 740                         calculateSurface(tri, key2);
 741                         totalSurface += _volumes[key2];
 742                       }
 743                     else
 744                       {
 745                         // count negative as face has reversed orientation
 746                         totalSurface -= _volumes[key2];
 747                       }
 748                   }
 749                   break;
 750
 751                 case NORM_POLYGON:
 752                   {
 753                     int nbrPolyTri = polyNodesNbr - 2; // split polygon into nbrPolyTri triangles
 754                     for (int iTri = 0; iTri < nbrPolyTri; ++iTri)
 755                       {
 756                         TriangleFaceKey key = TriangleFaceKey(polyNodes[0], polyNodes[1 + iTri], polyNodes[2 + iTri]);
 757                         if (_volumes.find(key) == _volumes.end())
 758                           {
 759                             TransformedTriangle tri(_nodes[polyNodes[0]], _nodes[polyNodes[1 + iTri]],
 760                                 _nodes[polyNodes[2 + iTri]]);
 761                             calculateSurface(tri, key);
 762                             totalSurface += _volumes[key];
 763                           }
 764                         else
 765                           {
 766                             totalSurface -= _volumes[key];
 767                           }
 768                       }
 769                   }
 770                   break;
 771
 772                 default:
 773                   std::cout
 774                       << "+++ Error : Only elements with triangular and quadratilateral faces are supported at the moment."
 775                       << std::endl;
 776                   assert(false);
 777                 }
 778
 779           }
 780       }
 781
 782     // reset if it is very small to keep the matrix sparse
 783     // is this a good idea?
 784     if(epsilonEqual(totalSurface, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
 785       {
 786         totalSurface = 0.0;
 787       }
 788
 789     LOG(2, "Volume = " << totalSurface << ", det= " << _t->determinant());
 790
 791     return totalSurface;
 792   }
 793
 794   /**
 795    * Calculates the volume of intersection of this tetrahedron with another one.
 796    */
 797   template<class MyMeshType>
 798   double SplitterTetra<MyMeshType>::intersectTetra(const double** tetraCorners)
 799   {
 800     //{ could be done on outside?
 801     // check if we have planar tetra element
 802     if(_t->determinant() == 0.0)
 803     {
 804       // tetra is planar
 805       LOG(2, "Planar tetra -- volume 0");
 806       return 0.0;
 807     }
 808
 809     const unsigned nbOfNodes4Type=4;
 810     // halfspace filtering
 811     bool isOutside[8] = {true, true, true, true, true, true, true, true};
 812     bool isTargetOutside = false;
 813
 814     // calculate the transformed coordinates of the nodes
 815     double nodes[nbOfNodes4Type][3];
 816     for(int i = 0;i<(int)nbOfNodes4Type;++i)
 817     {
 818       _t->apply(nodes[i], tetraCorners[i]);
 819       checkIsOutside(nodes[i], isOutside);
 820     }
 821
 822     // halfspace filtering check
 823     // NB : might not be beneficial for caching of triangles
 824     for(int i = 0; i < 8; ++i)
 825     {
 826       if(isOutside[i])
 827       {
 828         isTargetOutside = true;
 829       }
 830     }
 831
 832     double totalVolume = 0.0;
 833
 834     if(!isTargetOutside)
 835     {
 836       const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(NORM_TETRA4);
 837       int cellNodes[4] = { 0, 1, 2, 3 }, faceNodes[3];
 838
 839       for(unsigned ii = 0 ; ii < 4 ; ++ii)
 840       {
 841         cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,cellNodes,faceNodes);
 842
 843         TransformedTriangle tri(nodes[faceNodes[0]], nodes[faceNodes[1]], nodes[faceNodes[2]]);
 844         double vol = tri.calculateIntersectionVolume();
 845         totalVolume += vol;
 846       }
 847
 848       // reset if it is very small to keep the matrix sparse
 849       // is this a good idea?
 850       if(epsilonEqual(totalVolume, 0.0, SPARSE_TRUNCATION_LIMIT))
 851       {
 852         totalVolume = 0.0;
 853       }
 854     }
 855     LOG(2, "Volume = " << totalVolume << ", det= " << _t->determinant());
 856
 857     // NB : fault in article, Grandy, [8] : it is the determinant of the inverse transformation
 858     // that should be used (which is equivalent to dividing by the determinant)
 859     return std::fabs(1.0 / _t->determinant() * totalVolume) ;
 860   }
 861
 862   ////////////////////////////////////////////////////////
 863
 864   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 865   SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::SplitterTetra2(const MyMeshTypeT& targetMesh, const MyMeshTypeS& srcMesh, SplittingPolicy policy)
 866     :_target_mesh(targetMesh),_src_mesh(srcMesh),_splitting_pol(policy)
 867   {
 868   }
 869
 870   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 871   SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::~SplitterTetra2()
 872   {
 873     releaseArrays();
 874   }
 875
 876   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 877   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::releaseArrays()
 878   {
 879     // free potential sub-mesh nodes that have been allocated
 880     typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT = _node_ids.size();// Issue 0020634.
 881     if((int)_nodes.size()>=/*8*/nbOfNodesT)
 882       {
 883         std::vector<const double*>::iterator iter = _nodes.begin() + /*8*/nbOfNodesT;
 884         while(iter != _nodes.end())
 885           {
 886             delete[] *iter;
 887             ++iter;
 888           }
 889       }
 890     _nodes.clear();
 891   }
 892
 893   /*!
 894    * @param targetCell in C mode.
 895    * @param tetra is the output result tetra containers.
 896    */
 897   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 898   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitTargetCell(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell,
 899                                                                  typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT,
 900                                                                  typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
 901   {
 902     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType ConnType;
 903     const NumberingPolicy numPol=MyMeshTypeT::My_numPol;
 904     const int numTetra = static_cast<int>(_splitting_pol);
 905     if(nbOfNodesT==4)
 906       {
 907         _nodes.resize(8);
 908         _node_ids.resize(8);
 909         tetra.reserve(1);
 910         const double *nodes[4];
 911         int conn[4];
 912         for(int node = 0; node < 4 ; ++node)
 913           {
 914             nodes[node]=getCoordsOfNode2(node, OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell),_target_mesh,conn[node]);
 915           }
 916         std::copy(conn,conn+4,_node_ids.begin());
 917         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
 918         tetra.push_back(t);
 919         return ;
 920       }
 921     // Issue 0020634. To pass nbOfNodesT to calculateSubNodes (don't want to add an arg)
 922     _node_ids.resize(nbOfNodesT);
 923
 924     // pre-calculate nodes
 925     calculateSubNodes(_target_mesh, OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell));
 926
 927     tetra.reserve(numTetra);
 928     _nodes.reserve(30); // we never have more than this
 929
 930     switch ( nbOfNodesT )
 931       {
 932       case 8:
 933         {
 934           switch(_splitting_pol)
 935             {
 936             case PLANAR_FACE_5:
 937               {
 938                 const int subZone[8] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 };
 939                 fiveSplit(subZone,tetra);
 940               }
 941               break;
 942
 943             case PLANAR_FACE_6:
 944               {
 945                 const int subZone[8] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 };
 946                 sixSplit(subZone,tetra);
 947               }
 948               break;
 949
 950             case GENERAL_24:
 951               {
 952                 calculateGeneral24Tetra(tetra);
 953               }
 954               break;
 955
 956             case GENERAL_48:
 957               {
 958                 calculateGeneral48Tetra(tetra);
 959               }
 960               break;
 961             default:
 962               assert(false);
 963             }
 964           break;
 965         }
 966       case 5:
 967         {
 968           splitPyram5(tetra);
 969           break;
 970         }
 971       default:
 972         {
 973           splitConvex(targetCell, tetra);
 974         }
 975       }
 976   }
 977
 978   /**
 979    * Splits the hexahedron into five tetrahedra.
 980    * This method adds five SplitterTetra objects to the vector tetra.
 981    *
 982    * @param subZone  the local node numbers corresponding to the hexahedron corners - these are mapped onto {0,..,7}. Providing this allows the
 983    *                 splitting to be reused on the subzones of the GENERAL_* types of splitting
 984    */
 985   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
 986   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::fiveSplit(const int* const subZone, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
 987   {
 988     // create tetrahedra
 989     for(int i = 0; i < 5; ++i)
 990       {
 991         const double* nodes[4];
 992         int conn[4];
 993         for(int j = 0; j < 4; ++j)
 994           {
 995             conn[j] = subZone[ SPLIT_NODES_5[4*i+j] ];
 996             nodes[j] = getCoordsOfSubNode(conn[j]);
 997           }
 998         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
 999         tetra.push_back(t);
1000       }
1001   }
1002
1003   /**
1004    * Splits the hexahedron into six tetrahedra.
1005    * This method adds six SplitterTetra objects to the vector tetra.
1006    *
1007    * @param subZone  the local node numbers corresponding to the hexahedron corners - these are mapped onto {0,..,7}. Providing this allows the
1008    *                 splitting to be reused on the subzones of the GENERAL_* types of splitting
1009    */
1010   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1011   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::sixSplit(const int* const subZone, typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1012   {
1013     for(int i = 0; i < 6; ++i)
1014       {
1015         const double* nodes[4];
1016         int conn[4];
1017         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1018           {
1019             conn[j] = subZone[SPLIT_NODES_6[4*i+j]];
1020             nodes[j] = getCoordsOfSubNode(conn[j]);
1021           }
1022         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1023         tetra.push_back(t);
1024       }
1025   }
1026
1027   /**
1028    * Splits the hexahedron into 24 tetrahedra.
1029    * The splitting is done by combining the barycenter of the tetrahedron, the barycenter of each face
1030    * and the nodes of each edge of the face. This creates 6 faces * 4 edges / face = 24 tetrahedra.
1031    * The submesh nodes introduced are the barycenters of the faces and the barycenter of the cell.
1032    *
1033    */
1034   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1035   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateGeneral24Tetra(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1036   {
1037     // The two nodes of the original mesh cell used in each tetrahedron.
1038     // The tetrahedra all have nodes (cellCenter, faceCenter, edgeNode1, edgeNode2)
1039     // For the correspondance of the nodes, see the GENERAL_48_SUB_NODES table in calculateSubNodes
1040
1041     // nodes to use for tetrahedron
1042     const double* nodes[4];
1043     int conn[4];
1044     // get the cell center
1045     conn[0] = 14;
1046     nodes[0] = getCoordsOfSubNode(conn[0]);
1047
1048     for(int faceCenterNode = 8; faceCenterNode < 14; ++faceCenterNode)
1049       {
1050         // get the face center
1051         conn[1] = faceCenterNode;
1052         nodes[1] = getCoordsOfSubNode(conn[1]);
1053         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1054           {
1055             const int row = 4*(faceCenterNode - 8) + j;
1056             conn[2] = TETRA_EDGES_GENERAL_24[2*row];
1057             conn[3] = TETRA_EDGES_GENERAL_24[2*row + 1];
1058             nodes[2] = getCoordsOfSubNode(conn[2]);
1059             nodes[3] = getCoordsOfSubNode(conn[3]);
1060
1061             SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes, conn);
1062             tetra.push_back(t);
1063           }
1064       }
1065   }
1066
1067
1068   /**
1069    * Splits the hexahedron into 48 tetrahedra.
1070    * The splitting is done by introducing the midpoints of all the edges
1071    * and the barycenter of the element as submesh nodes. The 8 hexahedral subzones thus defined
1072    * are then split into 6 tetrahedra each, as in Grandy, p. 449. The division of the subzones
1073    * is done by calling sixSplit().
1074    *
1075    */
1076   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1077   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateGeneral48Tetra(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1078   {
1079     // Define 8 hexahedral subzones as in Grandy, p449
1080     // the values correspond to the nodes that correspond to nodes 1,2,3,4,5,6,7,8 in the subcell
1081     // For the correspondance of the nodes, see the GENERAL_48_SUB_NODES table in calculateSubNodes
1082     static const int subZones[64] =
1083       {
1084         0,8,21,12,9,20,26,22,
1085         8,1,13,21,20,10,23,26,
1086         12,21,16,3,22,26,25,17,
1087         21,13,2,16,26,23,18,25,
1088         9,20,26,22,4,11,24,14,
1089         20,10,23,26,11,5,15,24,
1090         22,26,25,17,14,24,19,7,
1091         26,23,18,25,24,15,6,19
1092       };
1093
1094     for(int i = 0; i < 8; ++i)
1095       {
1096         sixSplit(&subZones[8*i],tetra);
1097       }
1098   }
1099
1100   /**
1101    * Splits the NORM_PYRA5 into 2 tetrahedra.
1102    */
1103   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1104   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitPyram5(typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1105   {
1106     static const int SPLIT_PYPA5[2][4] =
1107       {
1108         {
1109           0, 1, 2, 4
1110         },
1111         {
1112           0, 2, 3, 4
1113         }
1114       };
1115
1116     // create tetrahedra
1117     const double* nodes[4];
1118     int conn[4];
1119     for(int i = 0; i < 2; ++i)
1120       {
1121         for(int j = 0; j < 4; ++j)
1122           nodes[j] = getCoordsOfSubNode2(SPLIT_PYPA5[i][j],conn[j]);
1123         SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1124         tetra.push_back(t);
1125       }
1126   }
1127
1128   /**
1129    * Splits a convex cell into tetrahedra.
1130    */
1131   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1132   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::splitConvex(typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell,
1133                                                              typename std::vector< SplitterTetra<MyMeshTypeS>* >& tetra)
1134   {
1135     // Each face of a cell is split into triangles and
1136     // each of triangles and a cell barycenter form a tetrahedron.
1137
1138     typedef typename MyMeshTypeT::MyConnType ConnType;
1139     const NumberingPolicy numPol=MyMeshTypeT::My_numPol;
1140
1141     // get type of cell and nb of cell nodes
1142     NormalizedCellType normCellType=_target_mesh.getTypeOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell));
1143     const CellModel& cellModelCell=CellModel::GetCellModel(normCellType);
1144     unsigned nbOfCellNodes=cellModelCell.isDynamic() ? _target_mesh.getNumberOfNodesOfElement(OTT<ConnType,numPol>::indFC(targetCell)) : cellModelCell.getNumberOfNodes();
1145
1146     // get nb of cell sons (faces)
1147     const ConnType* rawCellConn = _target_mesh.getConnectivityPtr() + OTT<ConnType,numPol>::conn2C( _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell ]);
1148     const int rawNbCellNodes = _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell+1 ] - _target_mesh.getConnectivityIndexPtr()[ targetCell ];
1149     unsigned nbOfSons = cellModelCell.getNumberOfSons2(rawCellConn, rawNbCellNodes);
1150
1151     // indices of nodes of a son
1152     static std::vector<int> allNodeIndices; // == 0,1,2,...,nbOfCellNodes-1
1153     while ( allNodeIndices.size() < nbOfCellNodes )
1154       allNodeIndices.push_back( allNodeIndices.size() );
1155     std::vector<int> classicFaceNodes(4);
1156     int* faceNodes = cellModelCell.isDynamic() ? &allNodeIndices[0] : &classicFaceNodes[0];
1157
1158     // nodes of tetrahedron
1159     int conn[4];
1160     const double* nodes[4];
1161     nodes[3] = getCoordsOfSubNode2( nbOfCellNodes,conn[3]); // barycenter
1162
1163     for(unsigned ii = 0 ; ii < nbOfSons; ++ii)
1164       {
1165         // get indices of son's nodes: it's just next portion of allNodeIndices for polyhedron
1166         // and some of allNodeIndices accodring to cell model for a classsic cell
1167         unsigned nbFaceNodes = cellModelCell.getNumberOfNodesConstituentTheSon2(ii, rawCellConn, rawNbCellNodes);
1168         if ( normCellType != NORM_POLYHED )
1169           cellModelCell.fillSonCellNodalConnectivity(ii,&allNodeIndices[0],faceNodes);
1170
1171         int nbTetra = nbFaceNodes - 2; // split polygon into nbTetra triangles
1172
1173         // create tetrahedra
1174         for(int i = 0; i < nbTetra; ++i)
1175           {
1176             nodes[0] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[0],  conn[0]);
1177             nodes[1] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[1+i],conn[1]);
1178             nodes[2] = getCoordsOfSubNode2( faceNodes[2+i],conn[2]);
1179             SplitterTetra<MyMeshTypeS>* t = new SplitterTetra<MyMeshTypeS>(_src_mesh, nodes,conn);
1180             tetra.push_back(t);
1181           }
1182
1183         if ( normCellType == NORM_POLYHED )
1184           faceNodes += nbFaceNodes; // go to the next face
1185       }
1186   }
1187
1188   /**
1189    * Precalculates all the nodes.
1190    * Retrieves the mesh nodes and allocates the necessary sub-mesh
1191    * nodes according to the splitting policy used.
1192    * This method is meant to be called once by the constructor.
1193    *
1194    * @param targetMesh  the target mesh
1195    * @param targetCell  the global number of the cell that the object represents, in targetMesh mode.
1196    * @param policy      the splitting policy of the object
1197    *
1198    */
1199   template<class MyMeshTypeT, class MyMeshTypeS>
1200   void SplitterTetra2<MyMeshTypeT, MyMeshTypeS>::calculateSubNodes(const MyMeshTypeT& targetMesh, typename MyMeshTypeT::MyConnType targetCell)
1201   {
1202     // retrieve real mesh nodes
1203
1204     typename MyMeshTypeT::MyConnType nbOfNodesT = _node_ids.size();// Issue 0020634. _node_ids.resize(8);
1205     for(int node = 0; node < nbOfNodesT ; ++node)
1206       {
1207         // calculate only normal nodes
1208         _nodes.push_back(getCoordsOfNode2(node, targetCell, targetMesh,_node_ids[node]));
1209       }
1210
1211     switch ( nbOfNodesT )
1212       {
1213       case 8:
1214
1215         // create sub-mesh nodes if needed
1216         switch(_splitting_pol)
1217           {
1218           case GENERAL_24:
1219             {
1220               for(int i = 0; i < 7; ++i)
1221                 {
1222                   double* barycenter = new double[3];
1223                   calcBarycenter(4, barycenter, &GENERAL_24_SUB_NODES[4*i]);
1224                   _nodes.push_back(barycenter);
1225                 }
1226             }
1227             break;
1228
1229           case GENERAL_48:
1230             {
1231               // Each sub-node is the barycenter of two other nodes.
1232               // For the edges, these lie on the original mesh.
1233               // For the faces, these are the edge sub-nodes.
1234               // For the cell these are two face sub-nodes.
1235               static const int GENERAL_48_SUB_NODES[38] =
1236                 {
1237                   0,1,   // sub-node 9 (edge)
1238                   0,4,   // sub-node 10 (edge)
1239                   1,5,   // sub-node 11 (edge)
1240                   4,5,   // sub-node 12 (edge)
1241                   0,3,   // sub-node 13 (edge)
1242                   1,2,   // sub-node 14 (edge)
1243                   4,7,   // sub-node 15 (edge)
1244                   5,6,   // sub-node 16 (edge)
1245                   2,3,   // sub-node 17 (edge)
1246                   3,7,   // sub-node 18 (edge)
1247                   2,6,   // sub-node 19 (edge)
1248                   6,7,   // sub-node 20 (edge)
1249                   8,11,  // sub-node 21 (face)
1250                   12,13, // sub-node 22 (face)
1251                   9,17,  // sub-node 23 (face)
1252                   10,18, // sub-node 24 (face)
1253                   14,15, // sub-node 25 (face)
1254                   16,19, // sub-node 26 (face)
1255                   20,25  // sub-node 27 (cell)
1256                 };
1257
1258               for(int i = 0; i < 19; ++i)
1259                 {
1260                   double* barycenter = new double[3];
1261                   calcBarycenter(2, barycenter, &GENERAL_48_SUB_NODES[2*i]);
1262                   _nodes.push_back(barycenter);
1263                 }
1264             }
1265             break;
1266
1267           default:
1268             break;
1269           }
1270
1271       case 5: // NORM_PYRA5
1272         break;
1273
1274       default: // convex 3d cell
1275         {
1276           // add barycenter of a cell
1277           std::vector<int> allIndices(nbOfNodesT);
1278           for ( int i = 0; i < nbOfNodesT; ++i ) allIndices[i] = i;
1279           double* barycenter = new double[3];
1280           calcBarycenter(nbOfNodesT, barycenter, &allIndices[0]);
1281           _nodes.push_back(barycenter);
1282         }
1283       }
1284
1285   }
1286 }
1287
1288 #endif