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fix conflict: ctest requires SUBDIRS, not ADD_SUBDIRECTORY directives
[tools/medcoupling.git] / src / INTERP_KERNEL / CurveIntersector.txx
1 // Copyright (C) 2007-2015  CEA/DEN, EDF R&D
2 //
3 // This library is free software; you can redistribute it and/or
4 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
5 // License as published by the Free Software Foundation; either
6 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
7 //
8 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
9 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
10 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
11 // Lesser General Public License for more details.
12 //
13 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
14 // License along with this library; if not, write to the Free Software
15 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
16 //
17 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
18 //
19 // Author : Anthony Geay (CEA/DEN)
20 #ifndef __CURVEINTERSECTOR_TXX__
21 #define __CURVEINTERSECTOR_TXX__
22
23 #include "CurveIntersector.hxx"
24 #include "InterpolationUtils.hxx"
25
26 #include <limits>
27
28 namespace INTERP_KERNEL
29 {
30   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
31   CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>
32   ::CurveIntersector(const MyMeshType& meshT, const MyMeshType& meshS,
33                      double precision, double tolerance, double medianLine, int printLevel):
34     _meshT(meshT),
35     _meshS(meshS),
36     _tolerance(tolerance),
37     _precision(precision),
38     _median_line(medianLine),
39     _print_level(printLevel)
40   {
41     if ( SPACEDIM != 1 && SPACEDIM != 2 )
42       throw Exception("CurveIntersector(): space dimension of mesh must be 1 or 2");
43     if ( MESHDIM != 1 )
44       throw Exception("CurveIntersector(): mesh dimension must be 1");
45
46     _connectT = meshT.getConnectivityPtr();
47     _connectS = meshS.getConnectivityPtr();
48     _connIndexT = meshT.getConnectivityIndexPtr();
49     _connIndexS = meshS.getConnectivityIndexPtr();
50     _coordsT = meshT.getCoordinatesPtr();
51     _coordsS = meshS.getCoordinatesPtr();
52   }
53
54   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
55   CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::~CurveIntersector()
56   {
57   }
58
59   //================================================================================
60   /*!
61     \brief creates the bounding boxes for all the cells of mesh \a mesh
62
63     \param mesh structure pointing to the mesh
64     \param bbox vector containing the bounding boxes
65   */
66   //================================================================================
67
68   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
69   void CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::createBoundingBoxes (const MyMeshType&    mesh,
70                                                                    std::vector<double>& bbox)
71   {
72     long nbelems = mesh.getNumberOfElements();
73     bbox.resize(2*SPACEDIM* nbelems);
74     const double* coords = mesh.getCoordinatesPtr();
75     const ConnType* conn = mesh.getConnectivityPtr();
76     const ConnType* conn_index = mesh.getConnectivityIndexPtr();  
77     int ibox=0;
78     for(long icell=0; icell<nbelems; icell++)
79       {
80         int nb_nodes_per_elem = conn_index[icell+1]-conn_index[icell];
81         //initializing bounding box limits
82         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
83           {
84             bbox[2*SPACEDIM*ibox+2*idim]   =  std::numeric_limits<double>::max();
85             bbox[2*SPACEDIM*ibox+2*idim+1] = -std::numeric_limits<double>::max();
86           }
87         //updating the bounding box with each node of the element
88         for (int j=0; j<nb_nodes_per_elem; j++)
89           {
90             const double* coord_node = coords + 
91               SPACEDIM*OTT<ConnType,numPol>
92               ::coo2C(conn[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(conn_index[icell]+j)]);
93             for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
94               {
95                 double x = *(coord_node+idim);
96                 bbox[ibox*2*SPACEDIM + 2*idim]   =
97                   ( bbox[ibox*2*SPACEDIM + 2*idim] < x ) ? bbox[ibox*2*SPACEDIM + 2*idim] : x;
98                 bbox[ibox*2*SPACEDIM + 2*idim+1] =
99                   ( bbox[ibox*2*SPACEDIM + 2*idim+1] > x ) ? bbox[ibox*2*SPACEDIM + 2*idim+1] : x;
100               }
101           }
102         ibox++;
103       }
104   }
105
106   /*!
107     Computes the bouding box of a given element. iP in numPol mode.
108   */
109   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
110   void CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::getElemBB (double*           bb,
111                                                          const MyMeshType& mesh,
112                                                          ConnType          iP,
113                                                          ConnType          nb_nodes)
114   {
115     const double* coords = mesh.getCoordinatesPtr();
116     const ConnType* conn_index = mesh.getConnectivityIndexPtr();
117     const ConnType* conn = mesh.getConnectivityPtr();
118     //initializing bounding box limits
119     for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
120       {
121         bb[2*idim  ] =  std::numeric_limits<double>::max();
122         bb[2*idim+1] = -std::numeric_limits<double>::max();
123       }
124
125     for (ConnType i=0; i<nb_nodes; i++)
126       {
127         //MN: iP= cell index, not node index, use of connectivity array ?
128         const double* coord_node = coords +
129           SPACEDIM*(OTT<ConnType,numPol>::coo2C(conn[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(conn_index[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(iP)]+i)]));
130         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
131           {
132             double x = *(coord_node+idim);
133             bb[2*idim  ] = (x<bb[2*idim  ]) ? x : bb[2*idim  ];
134             bb[2*idim+1] = (x>bb[2*idim+1]) ? x : bb[2*idim+1];
135           }
136       }
137   }
138   
139   /*!
140    * \param [in] startOfSeg - input coming from intersectSegments or intersectSegmentsInternal
141    * \param [in] endOfSeg - input coming from intersectSegments or intersectSegmentsInternal. Assume that endOfSeg>startOfSeg.
142    * \param [in] pt - position of point that the method computes the bary coords for.
143    */
144   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
145   bool CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::ComputeBaryCoordsOf(double startOfSeg, double endOfSeg, double pt, double& startPos, double& endPos)
146   {
147     double deno(endOfSeg-startOfSeg);
148     startPos=(endOfSeg-pt)/deno;
149     endPos=1.-startPos;
150     return startPos>=0. && endPos>=0.;
151   }
152
153   /*! Readjusts a set of bounding boxes so that they are extended
154     in all dimensions for avoiding missing interesting intersections
155
156     \param bbox vector containing the bounding boxes
157   */
158   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
159   void CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::adjustBoundingBoxes (std::vector<double>& bbox,
160                                                                    double adjustmentEpsAbs)
161   {
162     long size = bbox.size()/(2*SPACEDIM);
163     for (int i=0; i<size; i++)
164       {
165         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
166           {
167             bbox[i*2*SPACEDIM+2*idim  ] -= adjustmentEpsAbs;
168             bbox[i*2*SPACEDIM+2*idim+1] += adjustmentEpsAbs;
169           }
170       }
171   }
172
173   /*!
174    * @param icellT id in target mesh in format of MyMeshType.
175    * @param coordsT output val that stores coordinates of the target cell
176    * automatically resized to the right length.
177    * @return true if segment is quadratic and in this case coordinates of medium node
178    * are placed in the middle of coordsT
179    */
180   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
181   bool CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::getRealTargetCoordinates(ConnType icellT, std::vector<double>& coordsT) const
182   {
183     int nbNodesT(_connIndexT[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellT)+1] - _connIndexT[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellT)]);
184     coordsT.resize(SPACEDIM*nbNodesT);
185     for (ConnType iT=0; iT<nbNodesT; iT++)
186       {
187         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
188           {
189             coordsT[SPACEDIM*iT+idim] =
190               _coordsT[SPACEDIM*OTT<ConnType,numPol>::coo2C(_connectT[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(_connIndexT[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellT)]+iT)])+idim];
191           }
192       }
193     if ( nbNodesT > 2 )
194       {
195         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
196           std::swap( coordsT[SPACEDIM*1+idim], coordsT[SPACEDIM*2+idim]);
197         return true;
198       }
199     return false;
200   }
201   
202   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
203   typename MyMeshType::MyConnType CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::getNodeIdOfTargetCellAt(ConnType icellT, ConnType nodeIdInCellT) const
204   {
205     int nbNodesT(_connIndexT[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellT)+1] - _connIndexT[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellT)]);
206     if(nodeIdInCellT>=0 && nodeIdInCellT<nbNodesT)
207       return OTT<ConnType,numPol>::coo2C(_connectT[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(_connIndexT[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellT)]+nodeIdInCellT)]);
208     else
209       throw Exception("getNodeIdOfTargetCellAt : error in nodeId in cell");
210   }
211
212   /*!
213    * @param icellS id in source mesh in format of MyMeshType.
214    * @param coordsS output val that stores coordinates of the source cell automatically resized to the right length.
215    * @return true if segment is quadratic and in this case coordinates of medium node
216    * are placed in the middle of coordsS
217    */
218   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
219   bool CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::getRealSourceCoordinates(ConnType icellS, std::vector<double>& coordsS) const
220   {
221     int nbNodesS = _connIndexS[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellS)+1] - _connIndexS[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellS)];
222     coordsS.resize(SPACEDIM*nbNodesS);
223     for(ConnType iS=0; iS<nbNodesS; iS++)
224       {
225         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
226           {
227             coordsS[SPACEDIM*iS+idim] =
228               _coordsS[SPACEDIM*OTT<ConnType,numPol>::coo2C(_connectS[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(_connIndexS[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellS)]+iS)])+idim];
229           }
230       }
231     if ( nbNodesS > 2 )
232       {
233         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
234           std::swap( coordsS[SPACEDIM*1+idim], coordsS[SPACEDIM*2+idim]);
235         return true;
236       }
237     return false;
238   }
239
240   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
241   typename MyMeshType::MyConnType CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::getNodeIdOfSourceCellAt(ConnType icellS, ConnType nodeIdInCellS) const
242   {
243     int nbNodesS(_connIndexS[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellS)+1] - _connIndexS[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellS)]);
244     if(nodeIdInCellS>=0 && nodeIdInCellS<nbNodesS)
245       return OTT<ConnType,numPol>::coo2C(_connectS[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(_connIndexS[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icellS)]+nodeIdInCellS)]);
246     else
247       throw Exception("getNodeIdOfSourceCellAt : error in nodeId in cell");
248   }
249
250   /*!
251    * \brief Return dual segments of given segment
252    *  \param icell - given segment in C mode
253    *  \param mesh - mesh
254    *  \param segments - dual segments
255    */
256   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
257   void CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::getDualSegments(ConnType                   icell,
258                                                               const MyMeshType&          mesh,
259                                                               std::vector<TDualSegment>& segments)
260   {
261     // get coordinates of cell nodes
262     int nbNodes;
263     std::vector<double> ncoords;
264     std::vector<int>    nodeIds;
265     {
266       const ConnType *connect   = mesh.getConnectivityPtr();
267       const ConnType *connIndex = mesh.getConnectivityIndexPtr();
268       const double *coords      = mesh.getCoordinatesPtr();
269
270       nbNodes = connIndex[icell+1] - connIndex[icell];
271
272       ncoords.resize(SPACEDIM*nbNodes);
273       nodeIds.resize(nbNodes);
274
275       for(int i=0; i<nbNodes; i++)
276         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
277           {
278             nodeIds[i] = connect[OTT<ConnType,numPol>::conn2C(connIndex[OTT<ConnType,numPol>::ind2C(icell)]+i)];
279             ncoords[SPACEDIM*i+idim] = coords[SPACEDIM*OTT<ConnType,numPol>::coo2C(nodeIds[i])+idim];
280           }
281       if ( nbNodes > 2 ) // quadratic segment, put medium node in the middle
282         {
283           for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
284             std::swap( ncoords[SPACEDIM*1+idim], ncoords[SPACEDIM*2+idim]);
285           std::swap( nodeIds[1], nodeIds[2] );
286         }
287     }
288
289     // fill segments
290     segments.clear();
291     segments.reserve( 2*nbNodes );
292     for(int i=0; i<nbNodes-1; i++)
293       {
294         segments.push_back(TDualSegment());
295         TDualSegment& seg1 = segments.back();
296         segments.push_back(TDualSegment());
297         TDualSegment& seg2 = segments.back();
298
299         seg1._nodeId = nodeIds[i];
300         seg2._nodeId = nodeIds[i+1];
301
302         seg1._coords.resize( SPACEDIM * 2 );
303         seg2._coords.resize( SPACEDIM * 2 );
304
305         for(int idim=0; idim<SPACEDIM; idim++)
306           {
307             double c1 = ncoords[SPACEDIM*i+idim];
308             double c2 = ncoords[SPACEDIM*(i+1)+idim];
309             double m = 0.5 * ( c1 + c2 );
310             seg1._coords[ idim ] = c1;
311             seg1._coords[ SPACEDIM + idim ] = m;
312             seg2._coords[ idim ] = m;
313             seg2._coords[ SPACEDIM + idim ] = c2;
314           }
315       }
316   }
317
318   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
319   bool CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::projectionThis(const double *coordsT, const double *coordsS,
320                                                              double& xs0, double& xs1, double& xt0, double& xt1) const
321   {
322     xt0 = coordsT[0]; xt1 = coordsT[1];
323     xs0 = coordsS[0]; xs1 = coordsS[1];
324     if ( SPACEDIM == 2 )
325       {
326         // Pass 2D->1D
327
328         enum { X=0, Y };
329
330         // check if two segments overlap in 2D within tolerance
331
332         const double* t0 = coordsT;
333         const double* t1 = coordsT + 2;
334         double t01[2] = { t1[X]-t0[X], t1[Y]-t0[Y] }; // tgt segment direction
335         double tSize = sqrt( t01[X]*t01[X] + t01[Y]*t01[Y] ); // tgt segment size
336         if ( tSize < _precision )
337           return false; // degenerated segment
338         t01[X] /= tSize, t01[Y] /= tSize; // normalize t01
339
340         const double* s0 = coordsS;
341         const double* s1 = coordsS + 2;
342         double t0s0[2] = { s0[X]-t0[X], s0[Y]-t0[Y] };
343         double t0s1[2] = { s1[X]-t0[X], s1[Y]-t0[Y] };
344         double nt01_x_t0s0 = t0s0[X] * t01[Y] - t0s0[Y] * t01[X]; // t0s0 dot norm of t01
345         double nt01_x_t0s1 = t0s1[X] * t01[Y] - t0s1[Y] * t01[X]; // t0s1 dot norm of t01
346         double dist_ts0 = fabs( nt01_x_t0s0 ); // dist from tgt seg to s0
347         double dist_ts1 = fabs( nt01_x_t0s1 ); // dist from tgt seg to s1
348         bool s0_out_of_tol = ( dist_ts0 > _tolerance );
349         bool s1_out_of_tol = ( dist_ts1 > _tolerance );
350         if ( nt01_x_t0s0 * nt01_x_t0s1 > 0 && ( s0_out_of_tol || s1_out_of_tol ))
351           return false; // tgt segment is to far from src segment
352
353         double S0[2] = { s0[X], s0[Y] };
354         double S1[2] = { s1[X], s1[Y] };
355         if ( s0_out_of_tol ) // put s0 within tolerance
356           {
357             double t = _tolerance * nt01_x_t0s0 / dist_ts0; // signed tolerance
358             double r = ( nt01_x_t0s0 - t ) / ( nt01_x_t0s0 - nt01_x_t0s1 );
359             S0[X] = s0[X] * ( 1.-r ) + s1[X] * r;
360             S0[Y] = s0[Y] * ( 1.-r ) + s1[Y] * r;
361           }
362         if ( s1_out_of_tol ) // put s1 within tolerance
363           {
364             double t = _tolerance * nt01_x_t0s1 / dist_ts1; // signed tolerance
365             double r = ( nt01_x_t0s1 - t ) / ( nt01_x_t0s1 - nt01_x_t0s0 );
366             S1[X] = s1[X] * ( 1.-r ) + s0[X] * r;
367             S1[Y] = s1[Y] * ( 1.-r ) + s0[Y] * r;
368           }
369
370         // project tgt and src segments to median line
371
372         double s01[2] = { S1[X]-S0[X], S1[Y]-S0[Y] }; // src segment direction
373         double sSize = sqrt( s01[X]*s01[X] + s01[Y]*s01[Y] ); // src segment size
374         if ( sSize < _precision )
375           return false; // degenerated segment
376         s01[X] /= sSize, s01[Y] /= sSize; // normalize s01
377
378         // make t01 and s01 codirected
379         double t01_x_s01 = t01[X] * s01[X] + t01[Y] * s01[Y]; // t01 dot s01
380         if ( t01_x_s01 < 0 )
381           s01[X] = -s01[X], s01[Y] = -s01[Y];
382
383         double medianDir[2] = {
384           t01[X] * ( 1.-_median_line) + s01[X] * _median_line, 
385           t01[Y] * ( 1.-_median_line) + s01[Y] * _median_line
386         };
387         double medianSize = sqrt( medianDir[X]*medianDir[X] + medianDir[Y]*medianDir[Y] );
388         if ( medianSize < std::numeric_limits<double>::min() )
389           return false; // strange...
390         medianDir[X] /= medianSize, medianDir[Y] /= medianSize;
391
392         xt0 = t0[X] * medianDir[X] + t0[Y] * medianDir[Y];
393         xt1 = t1[X] * medianDir[X] + t1[Y] * medianDir[Y];
394         xs0 = S0[X] * medianDir[X] + S0[Y] * medianDir[Y];
395         xs1 = S1[X] * medianDir[X] + S1[Y] * medianDir[Y];
396
397       } // if ( SPACEDIM == 2 )
398     return true;
399   }
400   
401   /*!
402    * \brief Return length of intersection of two segments
403    */
404   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
405   double CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::intersectSegmentsInternal(const double *coordsT, const double *coordsS, double& xs0, double& xs1, double& xt0, double& xt1) const
406   {
407     if(!projectionThis(coordsT,coordsS,xs0,xs1,xt0,xt1))
408       return 0.;
409     
410     if ( xt0 > xt1 ) std::swap( xt0, xt1 );
411     if ( xs0 > xs1 ) std::swap( xs0, xs1 );
412
413     double x0 = std::max( xt0, xs0 );
414     double x1 = std::min( xt1, xs1 );
415     return ( x0 < x1 ) ? ( x1 - x0 ) : 0.;
416   }
417   
418   /*!
419    * \brief Return length of intersection of two segments
420    */
421   template<class MyMeshType, class MyMatrix>
422   double CurveIntersector<MyMeshType,MyMatrix>::intersectSegments(const double *coordsT, const double *coordsS) const
423   {
424     double xs0,xs1,xt0,xt1;
425     return intersectSegmentsInternal(coordsT,coordsS,xs0,xs1,xt0,xt1);
426   }
427
428 }
429
430 #endif