src/Batch/Batch_BatchManager_eLSF.cxx

   1 // Copyright (C) 2005  OPEN CASCADE, EADS/CCR, LIP6, CEA/DEN,
   2 // CEDRAT, EDF R&D, LEG, PRINCIPIA R&D, BUREAU VERITAS
   3 //
   4 // This library is free software; you can redistribute it and/or
   5 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
   6 // License as published by the Free Software Foundation; either
   7 // version 2.1 of the License.
   8 //
   9 // This library is distributed in the hope that it will be useful
  10 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  11 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  12 // Lesser General Public License for more details.
  13 //
  14 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  15 // License along with this library; if not, write to the Free Software
  16 // Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307 USA
  17 //
  18 // See http://www.salome-platform.org/ or email : webmaster.salome@opencascade.com
  19 //
  20 /*
  21  * BatchManager_eLSF.cxx : emulation of LSF client
  22  *
  23  * Auteur : Bernard SECHER - CEA DEN
  24  * Mail   : mailto:bernard.secher@cea.fr
  25  * Date   : Thu Apr 24 10:17:22 2008
  26  * Projet : PAL Salome
  27  *
  28  */
  29
  30 #include <iostream>
  31 #include <fstream>
  32 #include <sstream>
  33 #include <sys/stat.h>
  34 #include "Batch_BatchManager_eLSF.hxx"
  35
  36 namespace Batch {
  37
  38   BatchManager_eLSF::BatchManager_eLSF(const FactBatchManager * parent, const char * host, const char * protocol, const char * mpiImpl) throw(InvalidArgumentException,ConnexionFailureException) : BatchManager_eClient(parent,host,protocol,mpiImpl)
  39   {
  40     // Nothing to do
  41   }
  42
  43   // Destructeur
  44   BatchManager_eLSF::~BatchManager_eLSF()
  45   {
  46     // Nothing to do
  47   }
  48
  49   // Methode pour le controle des jobs : soumet un job au gestionnaire
  50   const JobId BatchManager_eLSF::submitJob(const Job & job)
  51   {
  52     int status;
  53     Parametre params = job.getParametre();
  54     const std::string dirForTmpFiles = params[TMPDIR];
  55     const string fileToExecute = params[EXECUTABLE];
  56     string::size_type p1 = fileToExecute.find_last_of("/");
  57     string::size_type p2 = fileToExecute.find_last_of(".");
  58     std::string fileNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1,p2-p1-1);
  59
  60     // export input files on cluster
  61     exportInputFiles(job);
  62
  63     // build batch script for job
  64     buildBatchScript(job);
  65
  66     // define name of log file
  67     string logFile="/tmp/logs/";
  68     logFile += getenv("USER");
  69     logFile += "/batchSalome_";
  70     srand ( time(NULL) );
  71     int ir = rand();
  72     ostringstream oss;
  73     oss << ir;
  74     logFile += oss.str();
  75     logFile += ".log";
  76
  77     string command;
  78
  79     // define command to submit batch
  80     command = _protocol;
  81     command += " ";
  82
  83     if(_username != ""){
  84       command += _username;
  85       command += "@";
  86     }
  87
  88     command += _hostname;
  89     command += " \"cd " ;
  90     command += dirForTmpFiles ;
  91     command += "; bsub < " ;
  92     command += fileNameToExecute ;
  93     command += "_Batch.sh\" > ";
  94     command += logFile;
  95     cerr << command.c_str() << endl;
  96     status = system(command.c_str());
  97     if(status)
  98       throw EmulationException("Error of connection on remote host");
  99
 100     // read id of submitted job in log file
 101     char line[128];
 102     FILE *fp = fopen(logFile.c_str(),"r");
 103     fgets( line, 128, fp);
 104     fclose(fp);
 105
 106     string sline(line);
 107     int p10 = sline.find("<");
 108     int p20 = sline.find(">");
 109     string strjob = sline.substr(p10+1,p20-p10-1);
 110
 111     JobId id(this, strjob);
 112     return id;
 113   }
 114
 115   // Methode pour le controle des jobs : retire un job du gestionnaire
 116   void BatchManager_eLSF::deleteJob(const JobId & jobid)
 117   {
 118     int status;
 119     int ref;
 120     istringstream iss(jobid.getReference());
 121     iss >> ref;
 122
 123     // define command to submit batch
 124     string command;
 125     command = _protocol;
 126     command += " ";
 127
 128     if (_username != ""){
 129       command += _username;
 130       command += "@";
 131     }
 132
 133     command += _hostname;
 134     command += " \"bkill " ;
 135     command += iss.str();
 136     command += "\"";
 137     cerr << command.c_str() << endl;
 138     status = system(command.c_str());
 139     if(status)
 140       throw EmulationException("Error of connection on remote host");
 141
 142     cerr << "jobId = " << ref << "killed" << endl;
 143   }
 144
 145   // Methode pour le controle des jobs : suspend un job en file d'attente
 146   void BatchManager_eLSF::holdJob(const JobId & jobid)
 147   {
 148     throw EmulationException("Not yet implemented");
 149   }
 150
 151   // Methode pour le controle des jobs : relache un job suspendu
 152   void BatchManager_eLSF::releaseJob(const JobId & jobid)
 153   {
 154     throw EmulationException("Not yet implemented");
 155   }
 156
 157
 158   // Methode pour le controle des jobs : modifie un job en file d'attente
 159   void BatchManager_eLSF::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param, const Environnement & env)
 160   {
 161     throw EmulationException("Not yet implemented");
 162   }
 163
 164   // Methode pour le controle des jobs : modifie un job en file d'attente
 165   void BatchManager_eLSF::alterJob(const JobId & jobid, const Parametre & param)
 166   {
 167     alterJob(jobid, param, Environnement());
 168   }
 169
 170   // Methode pour le controle des jobs : modifie un job en file d'attente
 171   void BatchManager_eLSF::alterJob(const JobId & jobid, const Environnement & env)
 172   {
 173     alterJob(jobid, Parametre(), env);
 174   }
 175
 176   // Methode pour le controle des jobs : renvoie l'etat du job
 177   JobInfo BatchManager_eLSF::queryJob(const JobId & jobid)
 178   {
 179     int id;
 180     istringstream iss(jobid.getReference());
 181     iss >> id;
 182
 183     // define name of log file
 184     string logFile="/tmp/logs/";
 185     logFile += getenv("USER");
 186     logFile += "/batchSalome_";
 187
 188     srand ( time(NULL) );
 189     int ir = rand();
 190     ostringstream oss;
 191     oss << ir;
 192     logFile += oss.str();
 193     logFile += ".log";
 194
 195     string command;
 196     int status;
 197
 198     // define command to submit batch
 199     command = _protocol;
 200     command += " ";
 201
 202     if (_username != ""){
 203       command += _username;
 204       command += "@";
 205     }
 206
 207     command += _hostname;
 208     command += " \"bjobs " ;
 209     command += iss.str();
 210     command += "\" > ";
 211     command += logFile;
 212     cerr << command.c_str() << endl;
 213     status = system(command.c_str());
 214     if(status)
 215       throw EmulationException("Error of connection on remote host");
 216
 217     JobInfo_eLSF ji = JobInfo_eLSF(id,logFile);
 218     return ji;
 219   }
 220
 221
 222
 223   // Methode pour le controle des jobs : teste si un job est present en machine
 224   bool BatchManager_eLSF::isRunning(const JobId & jobid)
 225   {
 226     throw EmulationException("Not yet implemented");
 227   }
 228
 229   void BatchManager_eLSF::buildBatchScript(const Job & job) throw(EmulationException)
 230   {
 231     int status;
 232     Parametre params = job.getParametre();
 233     const int nbproc = params[NBPROC];
 234     const long edt = params[MAXWALLTIME];
 235     const long mem = params[MAXRAMSIZE];
 236     const string workDir = params[WORKDIR];
 237     const std::string dirForTmpFiles = params[TMPDIR];
 238     const string fileToExecute = params[EXECUTABLE];
 239     string::size_type p1 = fileToExecute.find_last_of("/");
 240     string::size_type p2 = fileToExecute.find_last_of(".");
 241     std::string rootNameToExecute = fileToExecute.substr(p1+1,p2-p1-1);
 242     std::string fileNameToExecute = "~/" + dirForTmpFiles + "/" + string(basename(fileToExecute.c_str()));
 243
 244     int idx = dirForTmpFiles.find("Batch/");
 245     std::string filelogtemp = dirForTmpFiles.substr(idx+6, dirForTmpFiles.length());
 246
 247     std::string TmpFileName = BuildTemporaryFileName();
 248     ofstream tempOutputFile;
 249     tempOutputFile.open(TmpFileName.c_str(), ofstream::out );
 250
 251     tempOutputFile << "#! /bin/sh -f" << endl ;
 252     if( edt > 0 )
 253       tempOutputFile << "#BSUB -W " << getWallTime(edt) << endl ;
 254     if( mem > 0 )
 255       tempOutputFile << "#BSUB -M " << mem*1024 << endl ;
 256     tempOutputFile << "#BSUB -n " << nbproc << endl ;
 257     tempOutputFile << "#BSUB -o runSalome.output.log." << filelogtemp << endl ;
 258     tempOutputFile << "#BSUB -e runSalome.error.log." << filelogtemp << endl ;
 259     if( workDir.size() > 0 )
 260       tempOutputFile << "cd " << workDir << endl ;
 261     tempOutputFile << _mpiImpl->boot("",nbproc);
 262     tempOutputFile << _mpiImpl->run("",nbproc,fileNameToExecute);
 263     tempOutputFile << _mpiImpl->halt();
 264     tempOutputFile.flush();
 265     tempOutputFile.close();
 266     chmod(TmpFileName.c_str(), 0x1ED);
 267     cerr << TmpFileName.c_str() << endl;
 268
 269     string command;
 270     if( _protocol == "rsh" )
 271       command = "rcp ";
 272     else if( _protocol == "ssh" )
 273       command = "scp ";
 274     else
 275       throw EmulationException("Unknown protocol");
 276     command += TmpFileName;
 277     command += " ";
 278     if(_username != ""){
 279       command +=  _username;
 280       command += "@";
 281     }
 282     command += _hostname;
 283     command += ":";
 284     command += dirForTmpFiles ;
 285     command += "/" ;
 286     command += rootNameToExecute ;
 287     command += "_Batch.sh" ;
 288     cerr << command.c_str() << endl;
 289     status = system(command.c_str());
 290     if(status)
 291       throw EmulationException("Error of connection on remote host");
 292
 293     RmTmpFile(TmpFileName);
 294
 295   }
 296
 297   std::string BatchManager_eLSF::getWallTime(const long edt)
 298   {
 299     long h, m;
 300     h = edt / 60;
 301     m = edt - h*60;
 302     ostringstream oss;
 303     if( m >= 10 )
 304       oss << h << ":" << m;
 305     else
 306       oss << h << ":0" << m;
 307     return oss.str();
 308   }
 309
 310 }