products/patches/openturns-1.16.0001.patch

   1 diff -Naur openturns_ref openturns_new
   2 diff -Naur openturns_ref/cmake/FindNLopt.cmake openturns_new/cmake/FindNLopt.cmake
   3 --- openturns_ref/cmake/FindNLopt.cmake 2020-11-09 14:06:44.000000000 +0100
   4 +++ openturns_new/cmake/FindNLopt.cmake 2021-06-01 10:23:26.144409150 +0200
   5 @@ -11,10 +11,21 @@
   6  #  NLOPT_ROOT_DIR - root dir (ex. /usr/local)
   7
   8  # set NLOPT_INCLUDE_DIR
   9 +SET(NLOPT_ROOT_DIR $ENV{NLOPT_ROOT_DIR})
  10 +
  11 +IF(NLOPT_ROOT_DIR)
  12 +  LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${NLOPT_ROOT_DIR}")
  13 +  LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${NLOPT_ROOT_DIR}/include")
  14 +  LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${NLOPT_ROOT_DIR}/lib")
  15 +ELSE(NLOPT_ROOT_DIR)
  16 +  MESSAGE(FATAL_ERROR "PLEASE SET ENVIRONMENT VARIABLE NLOPT_ROOT_DIR")
  17 +ENDIF(NLOPT_ROOT_DIR)
  18 +
  19  find_path (NLOPT_INCLUDE_DIR
  20    NAMES nlopt.hpp
  21 +  HINTS ${NLOPT_ROOT_DIR}/include
  22    DOC
  23 -    "Nlopt include directory"
  24 +  "Nlopt include directory"
  25  )
  26
  27  # set NLOPT_INCLUDE_DIRS
  28 @@ -22,9 +33,10 @@
  29
  30  # set NLOPT_LIBRARY
  31  find_library (NLOPT_LIBRARY
  32 -  NAMES nlopt_cxx nlopt
  33 +  NAMES nlopt
  34 +  HINTS ${NLOPT_ROOT_DIR}/lib
  35    DOC
  36 -    "Nlopt library location"
  37 +  "Nlopt library location"
  38  )
  39
  40  # set NLOPT_LIBRARIES
  41 diff -Naur openturns_ref/cmake/FindTBB.cmake openturns_new/cmake/FindTBB.cmake
  42 --- openturns_ref/cmake/FindTBB.cmake   2020-11-10 13:21:21.000000000 +0100
  43 +++ openturns_new/cmake/FindTBB.cmake   2021-06-01 10:23:26.144409150 +0200
  44 @@ -27,6 +27,11 @@
  45  # (To distributed this file outside of CMake, substitute the full
  46  #  License text for the above reference.)
  47
  48 +SET(TBB_ROOT_DIR $ENV{TBB_ROOT_DIR})
  49 +IF(TBB_ROOT_DIR)
  50 +  LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${TBB_ROOT_DIR}")
  51 +ENDIF(TBB_ROOT_DIR)
  52 +
  53  find_path (TBB_INCLUDE_DIR NAMES tbb/tbb.h DOC "TBB include directory")
  54
  55  set (TBB_INCLUDE_DIRS ${TBB_INCLUDE_DIR})
  56 diff -Naur openturns_ref/CMakeLists.txt openturns_new/CMakeLists.txt
  57 --- openturns_ref/CMakeLists.txt        2020-11-18 16:33:36.000000000 +0100
  58 +++ openturns_new/CMakeLists.txt        2021-06-01 10:26:34.647699757 +0200
  59 @@ -125,6 +125,10 @@
  60  set (TEMPDIR ${OPENTURNS_TEMPDIR})
  61
  62  set (CMAKE_CXX_STANDARD 11)
  63 +SET(LAPACK_ROOT_DIR $ENV{LAPACK_ROOT_DIR})
  64 +IF(LAPACK_ROOT_DIR)
  65 +  LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${LAPACK_ROOT_DIR}")
  66 +ENDIF(LAPACK_ROOT_DIR)
  67
  68  if (NOT DEFINED LAPACK_LIBRARIES)
  69    find_package (LAPACK REQUIRED)
  70 @@ -156,7 +160,11 @@
  71    endif ()
  72  endif ()
  73
  74 -if (USE_TBB)
  75 +if (USE_TBB)
  76 +  SET(TBB_ROOT_DIR $ENV{TBB_ROOT_DIR})
  77 +  if(TBB_ROOT_DIR)
  78 +    LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${TBB_ROOT_DIR}")
  79 +  endif(TBB_ROOT_DIR)
  80    find_package (TBB)
  81  endif ()
  82  if (TBB_FOUND)
  83 @@ -200,6 +208,10 @@
  84  endif ()
  85
  86  if (USE_LIBXML2)
  87 +  SET(LIBXML2_ROOT_DIR $ENV{LIBXLM2_ROOT_DIR})
  88 +  if(LIBXML2_ROOT_DIR)
  89 +    LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${LIBXML2_ROOT_DIR}")
  90 +  endif(LIBXML2_ROOT_DIR)
  91    find_package (LibXml2)
  92  endif ()
  93  if (LIBXML2_FOUND)
  94 @@ -210,15 +222,25 @@
  95  endif ()
  96
  97  if (USE_HDF5)
  98 -  find_package(HDF5 COMPONENTS CXX)
  99 -endif ()
 100 +  SET(HDF5_ROOT_DIR $ENV{HDF5_ROOT_DIR} CACHE PATH "Path to the HDF5.")
 101 +  IF(HDF5_ROOT_DIR)
 102 +    LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${HDF5_ROOT_DIR}")
 103 +  ENDIF(HDF5_ROOT_DIR)
 104 +  find_package(HDF5 COMPONENTS CXX HL)
 105 +endif ()
 106 +SET(MPI_ROOT_DIR $ENV{MPI_ROOT_DIR} CACHE PATH "Path to the MPI.")
 107 +IF(MPI_ROOT_DIR)
 108 + LIST(APPEND CMAKE_PREFIX_PATH "${MPI_ROOT_DIR}")
 109 + find_package(MPI)
 110 + list (APPEND OPENTURNS_PRIVATE_INCLUDE_DIRS ${MPI_INCLUDE_DIRS})
 111 + list (APPEND OPENTURNS_PRIVATE_LIBRARIES ${MPI_LIBRARIES})
 112 +ENDIF(MPI_ROOT_DIR)
 113  if (HDF5_FOUND)
 114    set (OPENTURNS_HAVE_HDF5 TRUE)
 115    list (APPEND OPENTURNS_DEFINITIONS ${HDF5_DEFINITIONS})
 116    list (APPEND OPENTURNS_PRIVATE_INCLUDE_DIRS ${HDF5_INCLUDE_DIRS})
 117    list (APPEND OPENTURNS_PRIVATE_LIBRARIES ${HDF5_LIBRARIES})
 118  endif ()
 119 -
 120  if (MSVC OR WINTEL)
 121    set (CMAKE_REQUIRED_INCLUDES ${CMAKE_REQUIRED_INCLUDES} ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/lib/include/pthread_win32 ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/lib/include)
 122    include_directories (${PROJECT_SOURCE_DIR}/lib/include/pthread_win32 ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/lib/include)
 123 @@ -257,7 +279,7 @@
 124  endif ()
 125
 126  if (USE_NLOPT)
 127 -  find_package (NLopt CONFIG QUIET)
 128 +#  find_package (NLopt CONFIG QUIET)
 129    if (NLopt_FOUND)
 130      message(STATUS "Found NLopt: ${NLopt_DIR}")
 131    else ()
 132 diff -Naur openturns_ref/lib/src/Base/Common/openturns/TBB.hxx openturns_new/lib/src/Base/Common/openturns/TBB.hxx
 133 --- openturns_ref/lib/src/Base/Common/openturns/TBB.hxx 2020-11-10 13:21:21.000000000 +0100
 134 +++ openturns_new/lib/src/Base/Common/openturns/TBB.hxx 2021-06-01 10:23:26.145409141 +0200
 135 @@ -35,6 +35,7 @@
 136  #  define __TBBMALLOC_NO_IMPLICIT_LINKAGE 1
 137  # endif
 138  #endif
 139 +#define TBB_PREVIEW_TASK_ARENA 1
 140  #include <tbb/task_arena.h>
 141  #include <tbb/parallel_sort.h>
 142  #include <tbb/parallel_reduce.h>
 143 diff -Naur openturns_ref/lib/src/CMakeLists.txt openturns_new/lib/src/CMakeLists.txt
 144 --- openturns_ref/lib/src/CMakeLists.txt        2020-11-10 13:21:21.000000000 +0100
 145 +++ openturns_new/lib/src/CMakeLists.txt        2021-06-01 10:23:26.144409150 +0200
 146 @@ -80,15 +80,15 @@
 147    add_dependencies (OT generate_csv_parser)
 148  endif ()
 149
 150 -target_link_libraries (OT PUBLIC ${OPENTURNS_LIBRARIES})
 151 -target_link_libraries (OT PRIVATE ${OPENTURNS_PRIVATE_LIBRARIES})
 152 +target_link_libraries (OT PUBLIC ${OPENTURNS_LIBRARIES} ${HDF5_LIBRARIES} ${TBB_LIBRARIES})
 153 +target_link_libraries (OT PRIVATE ${OPENTURNS_PRIVATE_LIBRARIES}  ${HDF5_LIBRARIES} ${TBB_LIBRARIES})
 154
 155  target_include_directories (OT INTERFACE $<INSTALL_INTERFACE:include>)
 156  target_include_directories (OT PUBLIC ${OPENTURNS_INCLUDE_DIRS})
 157
 158  # Build an empty executable to check link dependencies and completeness
 159  add_executable (linktest main.cxx)
 160 -target_link_libraries (linktest OT)
 161 +target_link_libraries (linktest OT ${TBB_LIBRARIES} ${HDF5_LIBRARIES})
 162  set_target_properties (linktest PROPERTIES
 163                                   INSTALL_RPATH "${CMAKE_INSTALL_RPATH};${CMAKE_BINARY_DIR}/lib/src")
 164
 165 @@ -109,5 +109,5 @@
 166  if (UNIX AND BUILD_SHARED_LIBS)
 167    set (OT_GDB_PY ${CMAKE_SHARED_LIBRARY_PREFIX}OT${CMAKE_SHARED_LIBRARY_SUFFIX}.${LIB_VERSION}-gdb.py)
 168    execute_process (COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E create_symlink ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/libOT-gdb.py ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/${OT_GDB_PY})
 169 -  install (FILES libOT-gdb.py DESTINATION ${OPENTURNS_DATA_PATH}/gdb/auto-load/${LIBRARY_PATH} RENAME ${OT_GDB_PY})
 170 +  install (FILES libOT-gdb.py DESTINATION ${OPENTURNS_DATA_PATH}/gdb/auto-load RENAME ${OT_GDB_PY})
 171  endif ()