products/patches/medfile-4.1.0-hdf5.patch

   1 --- med-4.1.0_ref/configure     2020-03-11 12:53:46.000000000 +0100
   2 +++ med-4.1.0_dev/configure     2023-02-24 13:55:54.089750280 +0100
   3 @@ -7577,12 +7577,12 @@
   4           H5_VER_MINOR=`  grep '#define *H5_VERS_MINOR' $HDF5_ABS_PATH | sed  's/^.*H5_VERS_MINOR[[ \t]]*\([0-9]*\)[[ \t]]*.*$/\1/g' `
   5           H5_VER_RELEASE=`grep '#define *H5_VERS_RELEASE' $HDF5_ABS_PATH | sed  's/^.*H5_VERS_RELEASE[[ \t]]*\([0-9]*\)[[ \t]]*.*$/\1/g' `
   6           HDF5_VERSION=`  expr 10000 \* ${H5_VER_MAJOR} + 100 \* ${H5_VER_MINOR} + ${H5_VER_RELEASE} `
   7 -         test "0${HDF5_VERSION}" -gt "11100" || test "0${HDF5_VERSION}" -lt "11002" && as_fn_error $? "
   8 -This HDF5 version ${H5_VER_MAJOR}.${H5_VER_MINOR}.${H5_VER_RELEASE} must not be used with med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE}.
   9 -The HDF5 library version used by med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.y.z MUST NOT be > 1.10 and have to be at least HDF${HDF_VERSION_REF}.
  10 -DO NOT TRY TO COMPILE med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE} version with an HDF5 library which would generate an hdf5 file not compliant with HDF5-${HDF_VERSION_MAJOR_REF}.${HDF_VERSION_MINOR_REF}.z library.
  11 -This would BREAK med-fichier compatibility between files with the same revision number !
  12 -      " "$LINENO" 5
  13 +#          test "0${HDF5_VERSION}" -gt "11100" || test "0${HDF5_VERSION}" -lt "11002" && as_fn_error $? "
  14 +# This HDF5 version ${H5_VER_MAJOR}.${H5_VER_MINOR}.${H5_VER_RELEASE} must not be used with med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE}.
  15 +# The HDF5 library version used by med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.y.z MUST NOT be > 1.10 and have to be at least HDF${HDF_VERSION_REF}.
  16 +# DO NOT TRY TO COMPILE med-fichier${MED_NUM_MAJEUR}.${MED_NUM_MINEUR}.${MED_NUM_RELEASE} version with an HDF5 library which would generate an hdf5 file not compliant with HDF5-${HDF_VERSION_MAJOR_REF}.${HDF_VERSION_MINOR_REF}.z library.
  17 +# This would BREAK med-fichier compatibility between files with the same revision number !
  18 +#       " "$LINENO" 5
  19       else
  20  ## In case user explicitly ask to not use hdf5 !
  21        { $as_echo "$as_me:${as_lineno-$LINENO}: WARNING: Can't compile MED without hdf5" >&5
  22 @@ -31697,7 +31697,8 @@
  23       case $am_cv_python_pythondir in
  24       $am_py_prefix*)
  25         am__strip_prefix=`echo "$am_py_prefix" | sed 's|.|.|g'`
  26 -       am_cv_python_pythondir=`echo "$am_cv_python_pythondir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_PREFIX,"`
  27 +       # am_cv_python_pythondir=`echo "$am_cv_python_pythondir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_PREFIX,"`
  28 +       am_cv_python_pythondir="\${PYTHON_PREFIX}/lib/python$PYTHON_VERSION/site-packages"
  29         ;;
  30       *)
  31         case $am_py_prefix in
  32 @@ -31741,7 +31742,8 @@
  33       case $am_cv_python_pyexecdir in
  34       $am_py_exec_prefix*)
  35         am__strip_prefix=`echo "$am_py_exec_prefix" | sed 's|.|.|g'`
  36 -       am_cv_python_pyexecdir=`echo "$am_cv_python_pyexecdir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_EXEC_PREFIX,"`
  37 +       # am_cv_python_pyexecdir=`echo "$am_cv_python_pyexecdir" | sed "s,^$am__strip_prefix,$PYTHON_EXEC_PREFIX,"`
  38 +       am_cv_python_pyexecdir="\${PYTHON_EXEC_PREFIX}/lib/python$PYTHON_VERSION/site-packages"
  39         ;;
  40       *)
  41         case $am_py_exec_prefix in